View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12331_high_6 (Length: 424)

Name: NF12331_high_6
Description: NF12331
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12331_high_6
NF12331_high_6
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-414)||(41867723-41868130)
chr2 (1-414)||(4412881-4413289)
chr2 (1-412)||(9685232-9685638)
chr2 (1-413)||(17344522-17344929)
chr2 (1-413)||(18744770-18745177)
chr2 (1-413)||(28224884-28225291)
chr2 (82-409)||(20142560-20142872)
chr2 (53-413)||(27502293-27502652)
chr2 (82-412)||(19161600-19161930)
chr2 (54-413)||(44686348-44686709)
chr2 (76-412)||(23484755-23485089)
chr2 (113-403)||(5532411-5532700)
chr2 (62-412)||(3825666-3826017)
chr2 (86-245)||(34814803-34814961)
chr2 (124-250)||(2888518-2888644)
chr2 (1-179)||(13413235-13413408)
chr2 (120-411)||(10579597-10579888)
chr2 (86-249)||(16351821-16351987)
chr2 (158-239)||(13147087-13147171)
chr2 (118-247)||(29808071-29808199)
chr2 (178-295)||(1295984-1296101)
chr2 (53-285)||(2886563-2886790)
chr2 (155-236)||(3968402-3968483)
chr2 (113-234)||(32029081-32029202)
chr2 (124-263)||(33612513-33612652)
chr2 (157-251)||(5679313-5679407)
chr2 (1-50)||(3208418-3208467)
chr2 (2-221)||(11921218-11921426)
chr2 (173-248)||(44720374-44720449)
chr2 (282-412)||(13146951-13147081)
chr2 (224-413)||(9674946-9675135)
chr2 (9-50)||(20143119-20143160)
chr2 (1-50)||(27494195-27494244)
chr2 (4-50)||(30602376-30602422)
chr2 (1-50)||(41702156-41702205)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-413)||(50000741-50001149)
chr4 (7-378)||(53619476-53619842)
chr4 (1-414)||(30940554-30940955)
chr4 (108-413)||(31847073-31847378)
chr4 (83-412)||(53170474-53170791)
chr4 (1-387)||(55933304-55933683)
chr4 (1-203)||(3329880-3330077)
chr4 (49-410)||(56461926-56462286)
chr4 (49-411)||(26521416-26521777)
chr4 (116-414)||(12918187-12918485)
chr4 (53-411)||(25504226-25504582)
chr4 (160-413)||(16957580-16957827)
chr4 (160-411)||(132423-132676)
chr4 (2-246)||(23255598-23255828)
chr4 (49-286)||(34107637-34107876)
chr4 (1-173)||(39001281-39001448)
chr4 (49-270)||(600651-600872)
chr4 (118-294)||(50462881-50463057)
chr4 (250-414)||(3330078-3330242)
chr4 (1-169)||(4419148-4419310)
chr4 (86-238)||(46440880-46441032)
chr4 (24-271)||(48656868-48657115)
chr4 (160-407)||(12053451-12053696)
chr4 (1-210)||(7536590-7536794)
chr4 (109-214)||(50483211-50483316)
chr4 (79-221)||(6865828-6865970)
chr4 (49-191)||(38535607-38535749)
chr4 (158-297)||(45385993-45386132)
chr4 (47-153)||(16955385-16955491)
chr4 (282-411)||(25706669-25706798)
chr4 (93-260)||(43849317-43849484)
chr4 (196-344)||(1041386-1041533)
chr4 (53-304)||(46391240-46391488)
chr4 (49-177)||(54190903-54191031)
chr4 (62-230)||(28739845-28740014)
chr4 (1-50)||(40392728-40392777)
chr4 (1-137)||(50464388-50464519)
chr4 (113-204)||(53098412-53098503)
chr4 (150-222)||(45760841-45760913)
chr4 (140-230)||(24719952-24720043)
chr4 (1-43)||(31846987-31847029)
chr4 (1-99)||(50442609-50442702)
chr4 (1-47)||(50463120-50463166)
chr4 (307-395)||(18534585-18534673)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (4-407)||(19277178-19277578)
chr7 (5-413)||(28517103-28517506)
chr7 (1-411)||(4501143-4501547)
chr7 (9-355)||(21326712-21327053)
chr7 (7-410)||(982839-983237)
chr7 (10-409)||(24527482-24527877)
chr7 (1-412)||(45613659-45614065)
chr7 (156-414)||(3676673-3676932)
chr7 (49-412)||(5825200-5825561)
chr7 (53-375)||(27521402-27521722)
chr7 (53-397)||(43856805-43857149)
chr7 (59-330)||(22197924-22198194)
chr7 (59-330)||(22239627-22239897)
chr7 (1-337)||(32584484-32584816)
chr7 (1-233)||(40726476-40726703)
chr7 (1-292)||(25186873-25187154)
chr7 (53-251)||(10905049-10905246)
chr7 (49-202)||(48539108-48539261)
chr7 (55-247)||(30216040-30216232)
chr7 (113-270)||(9281091-9281247)
chr7 (113-270)||(9292062-9292218)
chr7 (49-322)||(34772709-34772979)
chr7 (49-247)||(42295166-42295364)
chr7 (119-411)||(47679122-47679414)
chr7 (125-269)||(2904368-2904512)
chr7 (201-327)||(33202368-33202493)
chr7 (194-271)||(1249658-1249735)
chr7 (118-222)||(47251789-47251892)
chr7 (49-152)||(5972293-5972396)
chr7 (1-119)||(45003007-45003120)
chr7 (1-50)||(38766208-38766257)
chr7 (150-355)||(38839352-38839559)
chr7 (161-236)||(7637505-7637579)
chr7 (158-320)||(34067771-34067932)
chr7 (62-199)||(6634993-6635130)
chr7 (21-101)||(27027758-27027833)
chr7 (174-314)||(43383221-43383361)
chr7 (49-104)||(5714967-5715022)
chr7 (1-40)||(38832186-38832225)
chr7 (67-137)||(44525930-44526000)
chr7 (124-182)||(45424755-45424813)
chr7 (179-240)||(26770454-26770515)
chr7 (282-392)||(10905264-10905373)
chr7 (53-133)||(41117866-41117946)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (1-411)||(53785593-53785998)
chr3 (3-411)||(52741329-52741733)
chr3 (67-413)||(44198712-44199058)
chr3 (9-411)||(39583047-39583444)
chr3 (1-269)||(26772642-26772905)
chr3 (53-407)||(13582441-13582796)
chr3 (76-413)||(7900812-7901143)
chr3 (17-360)||(37132869-37133206)
chr3 (109-410)||(49017950-49018251)
chr3 (2-222)||(38670887-38671102)
chr3 (1-228)||(32546679-32546901)
chr3 (53-304)||(38145987-38146238)
chr3 (1-236)||(26856755-26856985)
chr3 (83-222)||(51234577-51234716)
chr3 (49-287)||(3443254-3443492)
chr3 (49-330)||(5338573-5338855)
chr3 (122-362)||(54508252-54508491)
chr3 (147-263)||(46940736-46940852)
chr3 (86-274)||(38978754-38978942)
chr3 (61-217)||(52411903-52412059)
chr3 (118-411)||(37992328-37992621)
chr3 (124-368)||(7501872-7502117)
chr3 (273-411)||(29861948-29862086)
chr3 (1-145)||(44717-44859)
chr3 (49-270)||(4472989-4473209)
chr3 (76-286)||(25324983-25325195)
chr3 (54-134)||(4763888-4763967)
chr3 (53-178)||(42205998-42206124)
chr3 (100-201)||(21552646-21552746)
chr3 (87-236)||(43123110-43123259)
chr3 (122-294)||(3376675-3376848)
chr3 (1-46)||(26276499-26276544)
chr3 (170-329)||(35236249-35236413)
chr3 (164-250)||(13772491-13772577)
chr3 (188-238)||(45676778-45676828)
chr3 (156-237)||(35484684-35484765)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (8-413)||(39434558-39434958)
chr8 (49-412)||(24124955-24125318)
chr8 (94-411)||(500200-500516)
chr8 (1-297)||(38815178-38815469)
chr8 (8-361)||(3187861-3188208)
chr8 (82-413)||(35739803-35740133)
chr8 (193-394)||(37517165-37517366)
chr8 (77-411)||(25021632-25021966)
chr8 (49-292)||(6592503-6592744)
chr8 (1-199)||(37514105-37514298)
chr8 (119-313)||(8619811-8620005)
chr8 (1-171)||(22589395-22589559)
chr8 (6-311)||(4699760-4700057)
chr8 (166-247)||(8882371-8882452)
chr8 (77-249)||(28196147-28196319)
chr8 (1-164)||(18804497-18804654)
chr8 (60-186)||(43823927-43824053)
chr8 (10-221)||(6618178-6618383)
chr8 (53-191)||(3821155-3821293)
chr8 (94-191)||(3863289-3863386)
chr8 (158-355)||(42922001-42922198)
chr8 (147-347)||(10189568-10189768)
chr8 (158-271)||(4073571-4073684)
chr8 (196-247)||(22589336-22589387)
chr8 (126-230)||(36004126-36004230)
chr8 (203-292)||(6792257-6792345)
chr8 (158-411)||(8115847-8116100)
chr8 (118-230)||(10556292-10556404)
chr8 (283-379)||(40839713-40839808)
chr8 (198-355)||(11611123-11611275)
chr8 (76-230)||(39671170-39671325)
chr8 (54-125)||(42659159-42659230)
chr8 (196-245)||(166233-166282)
chr8 (54-191)||(3825567-3825704)
chr8 (122-247)||(8540359-8540484)
chr8 (9-50)||(18596773-18596814)
chr8 (150-233)||(4687001-4687085)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-412)||(28040944-28041350)
chr1 (2-411)||(34644451-34644855)
chr1 (82-413)||(29169610-29169940)
chr1 (161-413)||(19035486-19035738)
chr1 (56-383)||(45659493-45659819)
chr1 (6-360)||(20259667-20260015)
chr1 (1-414)||(22346779-22347169)
chr1 (5-329)||(2764367-2764686)
chr1 (76-296)||(31737256-31737476)
chr1 (1-240)||(21472887-21473121)
chr1 (53-355)||(4861863-4862165)
chr1 (86-362)||(2898666-2898931)
chr1 (53-191)||(47459613-47459751)
chr1 (1-214)||(24177526-24177734)
chr1 (122-271)||(16500034-16500183)
chr1 (158-387)||(25375675-25375904)
chr1 (113-271)||(50161375-50161536)
chr1 (118-407)||(42919856-42920144)
chr1 (74-409)||(37932038-37932372)
chr1 (58-217)||(38731545-38731704)
chr1 (158-355)||(37200019-37200214)
chr1 (108-248)||(50314605-50314745)
chr1 (1-50)||(868575-868624)
chr1 (60-220)||(18616162-18616322)
chr1 (174-250)||(23043929-23044005)
chr1 (2-142)||(48841169-48841304)
chr1 (158-236)||(36486922-36487000)
chr1 (1-50)||(5453979-5454028)
chr1 (1-50)||(7213127-7213176)
chr1 (179-236)||(35387653-35387710)
chr1 (157-236)||(15584909-15584988)
chr1 (1-99)||(30688441-30688534)
chr1 (1-50)||(1114042-1114091)
chr1 (9-50)||(19035371-19035412)
chr1 (2-50)||(21934262-21934310)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-413)||(35310332-35310739)
chr5 (53-413)||(27336626-27336984)
chr5 (1-413)||(13166726-13167133)
chr5 (1-408)||(33691877-33692275)
chr5 (53-404)||(32269622-32269973)
chr5 (21-356)||(14423591-14423913)
chr5 (49-413)||(26212398-26212763)
chr5 (53-413)||(15291842-15292201)
chr5 (53-271)||(37873596-37873814)
chr5 (8-252)||(25663009-25663248)
chr5 (53-399)||(34335268-34335614)
chr5 (53-206)||(430533-430686)
chr5 (1-270)||(42921582-42921845)
chr5 (164-412)||(43129576-43129823)
chr5 (158-413)||(3113981-3114234)
chr5 (129-355)||(35455963-35456189)
chr5 (201-410)||(433371-433580)
chr5 (50-257)||(38875567-38875773)
chr5 (1-130)||(2566194-2566318)
chr5 (118-304)||(43115383-43115568)
chr5 (49-197)||(22188687-22188835)
chr5 (118-304)||(8100548-8100734)
chr5 (158-292)||(32230444-32230578)
chr5 (225-411)||(38446267-38446455)
chr5 (282-409)||(9841146-9841274)
chr5 (175-271)||(8858969-8859065)
chr5 (155-303)||(9829280-9829426)
chr5 (147-230)||(14436525-14436605)
chr5 (1-50)||(11005762-11005811)
chr5 (83-236)||(13307317-13307470)
chr5 (112-204)||(14723269-14723361)
chr5 (1-65)||(2917524-2917584)
chr5 (120-180)||(23423920-23423980)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (87-409)||(45489-45819)
chr6 (53-411)||(34304427-34304785)
chr6 (1-332)||(17249202-17249528)
chr6 (1-387)||(33220553-33220934)
chr6 (49-410)||(4206415-4206776)
chr6 (54-411)||(357535-357891)
chr6 (53-375)||(959512-959833)
chr6 (209-411)||(32115776-32115978)
chr6 (53-409)||(29337903-29338255)
chr6 (94-353)||(34415408-34415667)
chr6 (175-413)||(12401384-12401622)
chr6 (49-232)||(4165919-4166102)
chr6 (160-375)||(28543413-28543628)
chr6 (158-313)||(28008903-28009061)
chr6 (167-271)||(34168913-34169017)
chr6 (86-304)||(34554202-34554420)
chr6 (17-261)||(28625831-28626070)
chr6 (59-222)||(13398189-13398352)
chr6 (219-411)||(20693419-20693610)
chr6 (118-247)||(3714913-3715042)
chr6 (83-296)||(24016298-24016510)
chr6 (53-137)||(32115649-32115733)
chr6 (5-106)||(3137370-3137466)
chr6 (1-50)||(7749365-7749414)
chr6 (158-240)||(6225108-6225190)
chr6 (86-216)||(22985885-22986015)
chr6 (86-216)||(23802379-23802509)
chr6 (17-123)||(28543297-28543398)
chr6 (1-99)||(34168805-34168897)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (2-411)||(2-406)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (67-331)||(6279-6542)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (53-413)||(33181-33541)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-291)||(102990-103274)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (126-304)||(10364-10546)
scaffold0186 (317-409)||(19916-20008)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (155-330)||(49444-49622)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (118-407)||(18187-18475)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (160-385)||(47383-47608)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (179-295)||(16191-16307)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (10-221)||(7496-7701)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (158-220)||(8525-8587)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (1-50)||(6772-6821)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-45)||(5208-5252)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (203-292)||(4278-4366)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41868130 - 41867723
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||||||     
T  41868130 caagcgggcaacaagttgcgccgctagatctttttgg-tggca-----aaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctgggagacatgacattgt 41868037  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41868036 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 41867937  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41867936 agaacatgctttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttaaggctgcctgtcctacgataaaaggtccgacacctaatcccacaagtcgtgaa 41867837  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41867836 atctcagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatctgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtca 41867737  T
Q  401 ggaagttcacaggt 414  Q
    ||||||||||||||    
T  41867736 ggaagttcacaggt 41867723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4413289 - 4412881
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     ||||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||    
T  4413289 caagtgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcatgaacacaacattcatggacctaggagacatgactttgc 4413195  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4413194 tatgcatgaccttttgaaccctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 4413095  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  4413094 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagcttttagggttgcctgtcctacggtaaaaggtctgacacttaatcccacaagtggtgaa 4412995  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4412994 accccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtca 4412895  T
Q  401 ggaagttcacaggt 414  Q
    ||||||||||||||    
T  4412894 ggaagttcacaggt 4412881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9685638 - 9685232
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     || | || || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9685638 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaacaa-----tctttgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgc 9685544  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9685543 tatccatgaccttttgaactctatatagaaggtccacagcctctagtgctagaaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 9685444  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9685443 agaacacgctttttcatgtttggccactttgcttgacgcggattttagggctgcctatcctacggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagtggtgaa 9685344  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||  |  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9685343 accccagtcaagtctacacaatcatgttttccacctacccatatgcacaccataatgtttgcaggcctgagtgttgaccttctatctagtgggtcagtca 9685244  T
Q  401 ggaagttcacag 412  Q
    ||||||||||||    
T  9685243 ggaagttcacag 9685232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 17344522 - 17344929
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||| |||     |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||     
T  17344522 caagccggcaacaagctgcgccgatagacctttttggatcgaaaaatcaa-----tcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgt 17344616  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17344617 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctatggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtg 17344716  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  17344717 aaaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagctttaaggactggctttcctacggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagttgtgaa 17344816  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17344817 accccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatccgcatgcctgagtgttgatcttctttctagcgggtcagtca 17344916  T
Q  401 ggaagttcacagg 413  Q
    | |||||||||||    
T  17344917 gaaagttcacagg 17344929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18745177 - 18744770
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||  |||| |||||| | || || |||||| | || |||||||    
T  18745177 caagcgagcaataagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----tccttataaacacaacattcatagacctaggaaatatgacattgc 18745083  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18745082 tatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggccaacagcctatggtgctagaaaatcgaaaatgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtc 18744983  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||    
T  18744982 agaacacgctttctcgtgtttggccacctaacttgacgctgctttaagggcttcctgtgttacggtaaatggcctgacacctaatcccacaagtggtgaa 18744883  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  18744882 accccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacacccgcaggcctgagtgttgatattctttctagcgggtcagtca 18744783  T
Q  401 ggaagttcacagg 413  Q
    |||| ||||||||    
T  18744782 ggaaattcacagg 18744770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 28224884 - 28225291
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||     || || |||| |||||| | || || ||||||||||||| ||||     
T  28224884 caagcgggcaataagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaacaaa-----tcttcataaacacaacattcattgacctaggagacataatattgt 28224978  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
     ||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28224979 catgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgaagctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 28225078  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||| |||||||  |  || ||||| ||||||||| || ||    
T  28225079 agaatacgctttctcatatttggtcactttgcttgacgcagcttttaaagttgtttgtcctaccgtaaaagccctaactcctaagcccacaagtagtgaa 28225178  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||    
T  28225179 accccattcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacaccataacatccgtaggcctaagtgtcgatattctatctagtgggtaagtca 28225278  T
Q  401 ggaagttcacagg 413  Q
    | |||||||||||    
T  28225279 gaaagttcacagg 28225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20142872 - 20142560
Alignment:
Q  82 ctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggta 181  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  20142872 ctaggagacatgacattgttatgtatgaccttttgaactctatgtataaggtcaacaacctttgatgctagaaaaccaaaagtgtcaaaagaaaatggta 20142773  T
Q  182 taaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacc 281  Q
    |||||||||| |||||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20142772 taaaagcatgttgattgtca---------------tgtttggccactttgcttgacgaagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggtacgacacc 20142688  T
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || ||  ||||||||||||||    
T  20142687 taatcccacaagtggtgaagccccaatcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtacaccataatgtctgcaggtttgagtgttgatctt 20142588  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20142587 ctatctactgggtcagtcaggaagttca 20142560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 27502293 - 27502652
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  27502293 caatcttcgtaaacacaacattcatagatctaggagacatgatattgctatgcataaccctttggattctatgtagaaggtcaacagtatatgatgctag 27502392  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502393 gaagtcgaaagtgtcaaaaagcaattgtataaaagcatgttgtttgtcggaacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttaggg-t 27502491  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
       |||||||  ||||||| || ||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  27502492 tattgtcctatcgtaaaagctctgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccattcaggtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacacca 27502591  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27502592 taacatccgcaggcctaagtgtcgatcttgcatctagtgggtcagtcagaaagttcacagg 27502652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19161930 - 19161600
Alignment:
Q  82 ctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggta 181  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||  || ||   |  | ||||||||||||||||||||||    
T  19161930 ctaggagacatgacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtaaaaggtaagcagcctctagtgttacaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggta 19161831  T
Q  182 taaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacc 281  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||| | |||| |    
T  19161830 taaaaacatgttgattgtcagaacacgctttttcatgtttgcccacttttcttgacgcagattttagggatgtatgtcctaccataaaaggcctgacatc 19161731  T
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  19161730 taatctcacaagtggtgaaaccctattcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccttacatcataacatccgcatgcctgagtgttgatctt 19161631  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    ||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  19161630 ctatctaatgggtcagttaggacgttcacag 19161600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 413
Target Start/End: Original strand, 44686348 - 44686709
Alignment:
Q  54 aatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagg 153  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  44686348 aatcctcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataacattgctatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaacaaactctgatgctagg 44686447  T
Q  154 gagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg----atgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagg 249  Q
     || | |||||||||||||| ||   ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44686448 aagccgaaagtgtcaaaagcgaacaatataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacattgcttgac-cagcttttagg 44686546  T
Q  250 gctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtaca 349  Q
     ||| ||||||||  |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |  |  |||  |||||    
T  44686547 actgtctgtcctatcgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcgtc-caaacatttgtaca 44686645  T
Q  350 ccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||||| || | |||||||  |||||||||||    
T  44686646 ccataacatccgcaggcctaagtgtcaatcttctatctagtagatcagtcacaaagttcacagg 44686709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23485089 - 23484755
Alignment:
Q  76 atggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaa 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||||||||  | ||||  || ||||| ||||||| |  || ||||||||||| |||    
T  23485089 atggacctaggagacatagcattgttatgcatgatcttttgaactctatgtaagaagtcat-tgtctctggtgctaggaaa-cagaagtgtcaaaaacaa 23484992  T
Q  176 atggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtcc 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || || ||||| ||    
T  23484991 atggtataaaagcatgttgattgtcagaacatgctttctcatatttggccactttgtttgacgtagcttttagggctagttgtcccaccgttaaaggccc 23484892  T
Q  276 gacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgtt 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||  ||  || ||||||||    
T  23484891 gacacttaatcccacaagtggtgaaaccccaatcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacatcataacatatgcatgcttgagtgtt 23484792  T
Q  376 gatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  23484791 gatcttctatatagtaggtcaatcaggaagttcacag 23484755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 403
Target Start/End: Original strand, 5532411 - 5532700
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgcttt 212  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  ||| || ||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  5532411 tttgaactctatgtagaagctcaacaacctatggtgctaggaag-ctaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagcatgttgattgtcacaacacgtttt 5532509  T
Q  213 ctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||| |  |||||| |||| |  || |||    
T  5532510 ctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctgcatgtcctaccgtaaaatccccgacccctaatcctatgagtggtgaaactccggttaag 5532609  T
Q  313 tctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcagga 403  Q
    |  ||||| ||||||||| | | ||||  ||| ||||| |||| ||| || | | |   ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5532610 ttcacacatgcatgtttttctcctaccagtccatacactataacatctgcagacttcgatgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagga 5532700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 412
Target Start/End: Original strand, 3825666 - 3826017
Alignment:
Q  62 taaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaa 161  Q
    |||| |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||||  |   |||| |||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||| | |  ||    
T  3825666 taaacacaacatttatggtcctagaagacatgacattgctatgcatgattctttgaactcgatgttgaaggtcaacaacctttgatgctaggaaattgaa 3825765  T
Q  162 agtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcag-aacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcc 260  Q
    ||||||  |||||||||  |||||| ||||  ||||||||| || |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  3825766 agtgtctgaagcaaatgaaataaaaacatgtagattgtcaggaaaaaactttttcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctctctgtca 3825865  T
Q  261 tacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatcc 360  Q
    ||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||||| | | ||| |||  ||||||| ||| ||||    
T  3825866 taccgtaaaagtcctgacccctaatcccacaaggggtgaaacctcaatcaagtccacacatgcatgtttttctcctactcatttgtacaccttaacatcc 3825965  T
Q  361 gctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
     |  || | |  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3825966 acaagcataaaggtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacag 3826017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34814961 - 34814803
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  34814961 gagacataacattgttatgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctggtgttaggaac-cgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaa 34814863  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttt 245  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||    
T  34814862 agcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttgatcactttatttgacgaagcttt 34814803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Original strand, 2888518 - 2888644
Alignment:
Q  124 tgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 223  Q
    ||||||||||||||  |||||  || |||| || ||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2888518 tgtagaaggtcaacaacctcttgtgttaggaagccaaaagtgtcataaacgaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgt 2888617  T
Q  224 ccactttgcttgacgcagcttttaggg 250  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||    
T  2888618 ccactttgctagacgcaacttttaggg 2888644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13413235 - 13413408
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||     | ||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||     
T  13413235 caagcggacaacaagctgagccgttaggcctttttggatggcaaaaccaa-----ttctcataaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgt 13413329  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatgg 179  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |  | |||||||||||| |||||||    
T  13413330 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgctgcttgaaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatgg 13413408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10579888 - 10579597
Alignment:
Q  120 tctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgt 219  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |  | | || |||    
T  10579888 tctatgtagaaggtcaacggtctctagtgacaggaagccaaaagtgtcaaacgcaaatggtataaaggcatgttgatggttagaactccatatatcttgt 10579789  T
Q  220 ttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcct-gtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctaca 318  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||| |||| | ||| |||| || |||||||   ||     |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  10579788 ttggctactttgcttcactcgactttgagggtttcctagtcc-accgtaaaagcatcggtctttaatcatacaagtggtgaaaccccagtcaagtccaca 10579690  T
Q  319 caagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
     | ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  10579689 aatgcatgttttcctcctacccactcgtacaccataacatttgttggcctaagtgtcgatcttccatctggtaggtcagacaagaagttcaca 10579597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16351987 - 16351821
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaa---agtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    ||||||| |||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| ||||   | |||||||||||||   |||    
T  16351987 gagacatgacattgttgtgcatgaccatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgataaagagccaaacaaaatgtcaaaagcaaacaatat 16351888  T
Q  183 aaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagg 249  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  16351887 aaaattatgttgattgtgagaacacattttctcatgtttgaccactttgcttgacacaacttttagg 16351821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13147171 - 13147087
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagc---atgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgc 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13147171 caaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaagtatatgctgattgtcagaacacgctttctcatgtttgaccacttttcttgacgc 13147087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Original strand, 29808071 - 29808199
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| | | || | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  29808071 actctatgtaaaaggtcaacaacctccgatgctaggaaataaataatgtgaaaagcaaatggtataaaa-catgttgattgttataacacgctgtctcat 29808169  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    ||||||  ||||| ||||| ||| ||||||    
T  29808170 gtttggtgactttacttgaggcaactttta 29808199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1296101 - 1295984
Alignment:
Q  178 ggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccga 277  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || || |||||   |||||| |||||    
T  1296101 ggtataaaaacatgtttattgtcagaacatattttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttagcgttgtctctcctattataaaagttccga 1296002  T
Q  278 cacctaatcccacaagtg 295  Q
      |||||||| |||||||    
T  1296001 tccctaatccaacaagtg 1295984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2886790 - 2886563
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| | | |||| || | |||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  2886790 caatcctcataaacacaacatttatggacc-acgagatatgatattgctatgcatgctcttttgaactctatgtaaaagatcaacagcctctgatgcttg 2886692  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  | ||| | |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||     ||||| || ||||| ||||| ||| || |||| |||    
T  2886691 gaaaccgaaaatatcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacactt-----tgtttcgctactttacttgatgcaactattagagct 2886597  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaa-ggtccgacacctaat 285  Q
    || || ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  2886596 gcgtgacctaccgtaaaattgtccgacacctaat 2886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3968483 - 3968402
Alignment:
Q  155 agtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3968483 agtcaaaaatgtcaaacgcaaattgtataaaagcatattgattgtcaaaacatgttttctcatatttgaccactttgcttga 3968402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32029202 - 32029081
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgcttt 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||   |||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| | ||    
T  32029202 tttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctgaagttgggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatgatatgaaagcatgttgattgtctgaacacacatt 32029103  T
Q  213 ctcatgtttggccactttgctt 234  Q
    ||||| |||  ||| |||||||    
T  32029102 ctcatatttaaccaatttgctt 32029081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33612652 - 33612513
Alignment:
Q  124 tgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttgg 223  Q
    ||||||| ||||||  |||| | || |||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  33612652 tgtagaatgtcaacaacctccggtgttaggaagccaaaagtgtcaaatacaaattgtataaaatcatgttgattgtcaaaacacgttttctcatgttt-a 33612554  T
Q  224 ccactttgcttg-acgcagcttttagggctgcctgtcctac 263  Q
    ||| |||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  33612553 ccattttgcttgcacgtggcttttagggttgcatgtcctac 33612513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 5679313 - 5679407
Alignment:
Q  157 tcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggc 251  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||| ||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5679313 tcaaaagtgtcaaacataaatggtatgaaaggatgttgattatcttaacatgttttctcatgtttggccactttgcttgaaacagctttgagggc 5679407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3208467 - 3208418
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3208467 caagcgggcaacaagctgcgccgctaaacctttttggatggcaaaaccaa 3208418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11921426 - 11921218
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||     | |||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||      
T  11921426 aagcgggtaacaagctgcgacgctagatctttttggatgg-----cgaaactaatcctagtaaacacaacattcatggacctagaagatataaaattg-- 11921334  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca 201  Q
        | |||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||| | ||  | |  ||||| | |||| |||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  11921333 ----ataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctatgataccagaaaattgaaagtataaaaaacaaacggtataaaaatatgttgattgtca 11921238  T
Q  202 gaacacgctttctcatgttt 221  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  11921237 gaacacgttttctaatgttt 11921218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 44720374 - 44720449
Alignment:
Q  173 caaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  44720374 caaacggtataaaaacatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttggccatcttacttgacgcggcttttag 44720449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13147081 - 13146951
Alignment:
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||  |||||  | |||||||  | ||||||| |||||||||||| |||  |  |||| | ||| ||||||    
T  13147081 taatcccataagtggtgaaaccacagtcaagttcacacatccgtgttttcttcctacccatgcgtacaccataacatctacatgcctaaatgtcgatctt 13146982  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  13146981 ctatctagtgggttaatcaggaagttcacag 13146951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 413
Target Start/End: Original strand, 9674946 - 9675135
Alignment:
Q  224 ccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagc 323  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||  | ||| ||    
T  9674946 ccactttgtttgacgcatattttagggctatttgtcctaccataaaaggtctgatccctaatcccatgagtggtgaaaccccaatcaagttcatacatgc 9675045  T
Q  324 atgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | || ||||| |||||| ||| |  | |||| ||||| |||||||||||    
T  9675046 atgttttcctcctactcattcgtacatcataacatctgcatgtctaagtgtcgatcttttatttaatcggtcggtcagaaagttcacagg 9675135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20143160 - 20143119
Alignment:
Q  9 caacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20143160 caacaagttgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa 20143119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 27494195 - 27494244
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27494195 caagcaggcaacaagctgcgccgttagacctttttggatggcaaaaccaa 27494244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Original strand, 30602376 - 30602422
Alignment:
Q  4 gcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  30602376 gcgggcaacaagctgcgctgctaggcctttttggatggcaaaaccaa 30602422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 41702156 - 41702205
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  41702156 caagtgggcaacaagctgcgccactaggcctttttggatggcaaaaccaa 41702205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 50001149 - 50000741
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50001149 caagcgggcaacaagctgcgccgctagatctttttggatggcaaaatcaa-----tcttcgtaaacacaacatttatggatctaggagacataacattgc 50001055  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat-aaaagcatgatgattgt 199  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  50001054 tatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaagcaaattgtattaaaagcatgttgattgt 50000955  T
Q  200 cagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  || || ||| | |||||||||||| |    
T  50000954 cagaacacgctttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagcccccaccccttaacccacaagtggtga 50000855  T
Q  300 aacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtc 399  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50000854 aaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtc 50000755  T
Q  400 aggaagttcacagg 413  Q
    || |||||||||||    
T  50000754 agaaagttcacagg 50000741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 378
Target Start/End: Original strand, 53619476 - 53619842
Alignment:
Q  7 ggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgca 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     | |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  53619476 ggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----ttctcgtaaacacaacattcatggacctaagagacataacattgttatgca 53619570  T
Q  107 caaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaaca 206  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53619571 taaccctttagactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 53619670  T
Q  207 cgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaa 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||  |||| |||||||||||| |||||| |    
T  53619671 cgttttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggttgcctgtcctactgtaaaagcccccacctctaaacccacaagtggtgaaacccca 53619770  T
Q  307 gtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgat 378  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||    
T  53619771 gtcaagtccacacatgcatgttttcctccaactcatccgtacaccataacatatgcaggcctaagtgttgat 53619842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30940955 - 30940554
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||     ||||| | || |||||| | || || |||||| | || ||||||     
T  30940955 caagcgggcaacaagctgcgtcgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcatgaacacaacattcatagacctaggatatatgacattgt 30940861  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||      | ||||| | ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30940860 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaa------cagcctcaggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaa-tggtataaaagcatgttgattgtc 30940768  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||    
T  30940767 agaacacgctttctcatgtttgaccactttacttgacgcaacttttagggttgtctgtcctatggtaaaaggtttgacacttaatcccacaagtggcgaa 30940668  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30940667 acctcagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccattcgtacaccataacattcgtaggccttagtgttgatcttctatctagtgggtcagtca 30940568  T
Q  401 ggaagttcacaggt 414  Q
    ||||||||||||||    
T  30940567 ggaagttcacaggt 30940554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 413
Target Start/End: Original strand, 31847073 - 31847378
Alignment:
Q  108 aaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||     
T  31847073 aaccgtttggactctatgtagaaggtcaaccgcttctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtaaaaaaacatgttgactgtcagaacat 31847172  T
Q  208 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaag 307  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  31847173 ggtttctcatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccctag 31847272  T
Q  308 tcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31847273 tcaagtccacacatgcatgttttcctccaatccatctgtacaccataatatctgcaggcctaagtgtcaatcttttatctagtgggtcagtcagaaagtt 31847372  T
Q  408 cacagg 413  Q
    ||||||    
T  31847373 cacagg 31847378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 412
Target Start/End: Original strand, 53170474 - 53170791
Alignment:
Q  83 taggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  | ||||||||||||||||||         
T  53170474 taggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctagcaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatc---- 53170569  T
Q  183 aaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacct 282  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53170570 --aagcatgttgactgtcagaacacgctttctcatgtttggctactttacctaacacgacttttagggctgcctgtcatactgtaaaaggtccgacacct 53170667  T
Q  283 aatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttc 382  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||  || ||  |||| |||||||||||||    
T  53170668 aatcccacgagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccat------accataacgtctgcatgcctaagtgttgatcttc 53170761  T
Q  383 tatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53170762 tatctagtaggtcagtcaggaagttcacag 53170791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 55933683 - 55933304
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||| |||     || ||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| ||||     
T  55933683 caagcggacaacaaactgcgtcgctagacttttttggatggcaaaatcaa-----tcatcgtaaacacaacattcacggacctaggagacataatattgt 55933589  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  55933588 tatgtataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacct--gatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtt 55933491  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||| ||| ||    
T  55933490 agaacaaactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggctgactgtcctaccgtaaaagccctgacccttaaacccacaaggggtgaa 55933391  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatct 387  Q
    ||||  || || |  | |||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||||| ||||||||||||    
T  55933390 accccggttaaattcagacattcatgttttcctccaacccatccgtagaccataacatctgcggacctaagtgtcgatcttctatct 55933304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3329880 - 3330077
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     || ||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  3329880 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----tcatcgtaaacacagcattcatggacctaggagacataacattgc 3329974  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3329975 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaagcatgttgattgtc 3330074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 56462286 - 56461926
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||  |||||  | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  56462286 aaaccaattctcgtaaacacaacatttatggacttaggagacatgacattgtcatgcatgatcctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtg 56462187  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  56462186 ctaggaaaccaaaagtgtctaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttatcatgttt-gccactttgtttgacgcaacttttag 56462088  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtac 348  Q
    ||  | || | | || |||||||   |||| |||||||| |||| |||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56462087 ggtggtctatacaaccgtaaaagtctcgacccctaatccaacaaatggtgaaacctcagtcaagtccacacatgcatgttttccacctactcatccgtac 56461988  T
Q  349 accataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcac 410  Q
    ||||||| || |||  || | ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  56461987 accataacattcgcatgcttaagtgtcgatcttctatctagtggatcagccaggaatttcac 56461926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 411
Target Start/End: Original strand, 26521416 - 26521777
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26521416 aaaccaatcctcgtaaacacaaca-tcatgggcctaggatacatgacattgctacgcatgaccctttgaactgtatgtagaaggtcaacagcctctggtg 26521514  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| |  |||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  26521515 ctaggaaaccaaaagtgttgaaagcatatgatataaaagcatgttgattgtcataacacgttttttcatgtttagccactttgtttgacgcaacttttag 26521614  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtac 348  Q
    || ||  ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||| || ||||    
T  26521615 ggttgtttgtcctaccataaaaggtctgacccctaatcccacaagtgatgaaactccagtcaagtccatacatgcatgttttcctcctacccgtctgtac 26521714  T
Q  349 accataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    |||||||  | ||  ||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  26521715 accataaccttcgtaggcttaaatgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagctcaca 26521777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 116 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12918485 - 12918187
Alignment:
Q  116 ggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||||     
T  12918485 ggactctatctagaaggtcaacaatctctgatgctaggaagtcgaaagtgtcaaaagtaaatagtataaaagtgtgttgattgtcagaacacgatttctt 12918386  T
Q  216 atgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtct 315  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||  | |||||||||||||| | |||| | |||||| |      
T  12918385 atgtttgaccactttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagccccgaatcttaatcccacaagtgatgaaactccagtcaactac 12918286  T
Q  316 acacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacaggt 414  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  12918285 acacatgcatgttttcctcttacccatccatacaccatgacatccacaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagttagaaagttcacaggt 12918187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 411
Target Start/End: Original strand, 25504226 - 25504582
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||||||| |||| |||| | | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||| | ||||  ||||||    
T  25504226 caatcctcataaacacaatattcatggacctatgagacatgacattactatgcatgaccttttaaactctatttaaaaggtcaacagtctctagtgctag 25504325  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |    
T  25504326 gaaaccaaaaatgtcaaaagcaaacggtataaaaacatgtcgattgttagaacacgttttctcatgtttgacca-tttgcttgatgcaacttt-agggtt 25504423  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25504424 gcctgtcataccgtaaaaggcctgacgcctaatcccacaagtggtgaaacctcagtcaagtctatacatgcatgtttttctcctacccatccgtacacca 25504523  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    ||| ||||||  | ||||||||| | ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  25504524 taacatccgcatgtctgagtgttaaacttctatctagtgggtctatcaagaagttcaca 25504582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 413
Target Start/End: Original strand, 16957580 - 16957827
Alignment:
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||| |||||| ||    
T  16957580 aaagtgtcaaaagcaaatggtatataagcatgttgattatcagagcacactttctcatgtttggtcattttgctctacgcaacttttaggactgcctatc 16957679  T
Q  260 ctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatc 359  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||    |||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16957680 ctactgtaagaggcccgacccctaatccaacaagtggt----ccc--gtcaagtccacacatgcatgttttacacctacccatccgtacaccataacatc 16957773  T
Q  360 cgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
     || ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16957774 tgcaggcctaagtgttgatcttttatctagcgggtcagtcaggaagttcacagg 16957827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 411
Target Start/End: Original strand, 132423 - 132676
Alignment:
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 259  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132423 aaagtgtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgatttctcatgttttgccattttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 132522  T
Q  260 ct--acggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaa 357  Q
    ||  || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| | |||  ||| ||||||||||| |    
T  132523 ctacaccgtaaaagtcccgacccctaatccaacaagtggtgaaaccccagtcaagttcacacatgcatattttcctcctacgtatctgtacaccataaca 132622  T
Q  358 tccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    || ||  |||  ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  132623 tctgcatgccgaagtgtcgatcttctatctagtggaccagtcaagaagttcaca 132676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 23255598 - 23255828
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||     |||||||||| |||| | | |||||  ||||||||||||||||| |    
T  23255598 aagcggacaacaagctgcgccgctagacttttctggatggcaaaatcaa-----tcctcgtaaacacaatattcatggacttaggagacataacattgtt 23255692  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca 201  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |         ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23255693 atgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgcctatgatgctaagaa---------gtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttaattgtca 23255783  T
Q  202 gaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23255784 gaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaactttt 23255828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34107876 - 34107637
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34107876 aaaccaatcctcgtgaacacaacattcatggatctaggagacataacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtg 34107777  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcaga--acacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt 246  Q
    ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  34107776 ctaggaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattatctgaacacacgttttctcatgtttggccacttcgtttgacgcaattttt 34107677  T
Q  247 agggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatc 286  Q
    |||  || ||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  34107676 aggattgtctgttatacggtaagagatccgacacctaatc 34107637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 39001281 - 39001448
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||     || ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||||     
T  39001281 caagcgggcaacaaactgcgccgctagacctttttggatg-----acaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgt 39001375  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagc 173  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  39001376 tatgcataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatcctaggaagccaaaagtgtcaaaagc 39001448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 600872 - 600651
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||| |||| ||||||| ||| || | ||||| ||||||||||| |||| | ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  600872 aaactaatcatcgtaaacacagcattaatggacctaggagacatgacatagttatacatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtg 600773  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
     |||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  600772 ttaggaaaccgaaagtgacaaaagcaaatggtataaaagcatgttaattgttagaacacgttttctcatgtttggtcactttgcttgacataacttttag 600673  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaa 270  Q
    || || ||||||||| ||||||    
T  600672 ggttgtctgtcctacagtaaaa 600651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50463057 - 50462881
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  50463057 actctacgtagaaggtcaacagtctctggtgtaaggaaatcaaaagtgtcaaaagcaaatggtatgaaagcatgttgattgtcggaagacactttctcat 50462958  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagt 294  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||    
T  50462957 gtttggtcatcttgcttgacgcaacttttaaggctgtctgtcctaccgtagaagtaccgacacctaatccaacaagt 50462881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Original strand, 3330078 - 3330242
Alignment:
Q  250 gctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtaca 349  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | |||||||||||    
T  3330078 gctgcctgtcctaccgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcacgttttcctccaatccatccgtaca 3330177  T
Q  350 ccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacaggt 414  Q
    |||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3330178 ccataacatctgcatgcctaagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacaggt 3330242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 4419148 - 4419310
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     || ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||     
T  4419148 caagcgggcaacaagctgcgccgctagat-tttttggatggcaaaaccaa-----tcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgt 4419241  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaa 169  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || | ||||||||||    
T  4419242 tatgcataaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctacgaagccgaaagtgtcaa 4419310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46441032 - 46440880
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  46441032 gagacatagcattgctatgcacaaccctttggactctatgtagaaggtcagcagcttctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaa 46440933  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacg 238  Q
    | | || | ||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  46440932 aacgtgttaattgttagaacacacttttttatgtttgaccactttgtttgacg 46440880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48657115 - 48656868
Alignment:
Q  24 ctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactcta 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||     || ||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  48657115 ctagatctttttggacggcaaaatcaa-----tcatcgtaaacacaacattcatagacctatgagacataacattgctatgcataatcatttggactcta 48657021  T
Q  124 tgtagaagg----tcaactgcctctgat-gctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatg 218  Q
    |||||||||    |||||  ||||| || |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| || ||||| ||||||||||    
T  48657020 tgtagaaggaaggtcaacaacctctaatcgctaagaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacattttgattgacataacacactttctcatg 48656921  T
Q  219 tttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    |||| ||| ||| ||||| | | |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  48656920 tttgtccattttacttgatgaaacttttagggctgtctgtcatactgtaaaag 48656868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 407
Target Start/End: Original strand, 12053451 - 12053696
Alignment:
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 259  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| | |  ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||    
T  12053451 aaagagtcgaaagcaaatgatataaaaacgttttgattgttagaacacgatttctcatgtttgacaactttgtttgacgcagcttttagagctgtttgtc 12053550  T
Q  260 ctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatc 359  Q
    |||| |||||||   |||| || ||||| || | |||| |||||| | | | ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||    
T  12053551 ctactgtaaaag--tcgacccccaatccaactaatggtgaaaccccaataatgtccacacatgcatgttttcctcctacccatctgtacaacataacatc 12053648  T
Q  360 cgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
     || | ||  ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12053649 tgcagaccaaagtctcgatcttctatctagtggatcagtcaggaagtt 12053696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7536794 - 7536590
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||     || | ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  7536794 caagcgagcaacaagttgcactgctagatctttttggatcacaaaaccaa-----tcattgtaaacataacattcatggatctacgagacataaaattgc 7536700  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7536699 tatgcacgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaactgaaattgtcaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtc 7536600  T
Q  201 agaacacgct 210  Q
    | ||||||||    
T  7536599 aaaacacgct 7536590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50483316 - 50483211
Alignment:
Q  109 accttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  50483316 accttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcgaaagcaaatggtataaaatcatgttgattgtcagaagacg 50483217  T
Q  209 ctttct 214  Q
    ||||||    
T  50483216 ctttct 50483211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6865970 - 6865828
Alignment:
Q  79 gatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatg 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||| |||  | |||  ||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  6865970 gatctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtaaaaggttaacaacatctagtgctatgaagctcaaagtgtcaaaagcaaatg 6865871  T
Q  179 gtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgttt 221  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  6865870 atataaaagcatgttgatagtcagaacacgttttctcgtgttt 6865828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38535749 - 38535607
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||   ||||| |||  |||||| |||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||| |||  |||||| ||    
T  38535749 aaactaatcctcgtaaacacaacatccatggacctataagacatgacattgctatgcatgactctttgaactctatgtagagggtgaacaacctctggtg 38535650  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 191  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38535649 ctaggaagtcaaaagtgtcaaatgcaaatggtataagagcatg 38535607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45386132 - 45385993
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||    
T  45386132 caaaagtttcaaatgtaaatggtataaaaagaaattgattgtcagaacacgctttcttatgtttgaccactttccttgacttagcttttagggttgcatg 45386033  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggt 297  Q
    |||||| | ||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  45386032 tcctaccgcaaaagtttcgggccctaatcccacaagtggt 45385993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 153
Target Start/End: Original strand, 16955385 - 16955491
Alignment:
Q  47 ccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctga 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||     
T  16955385 ccaaatcaatcctcgtaaacacaacattcatgggcctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcagcaacctctgg 16955484  T
Q  147 tgctagg 153  Q
    |||||||    
T  16955485 tgctagg 16955491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 411
Target Start/End: Original strand, 25706669 - 25706798
Alignment:
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    |||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||| ||||||    
T  25706669 taatccgacaggtagtgaaacccaaatcaagtccacacatgcatgtttttctcctacccatctgtacaccataacatacgtaggcttaagtgtcgatctt 25706768  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25706769 ctatctagtgggtcagtcagaaagttcaca 25706798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43849484 - 43849317
Alignment:
Q  93 aacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatga 192  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| ||||| |||||||| || ||  ||| || | ||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||     
T  43849484 aacattgttatgcatgaccatttgaactctttgtagaagatccacaacctttggttctaggaagccaaaagtgtcaaacacaaatagtataaaagcatgt 43849385  T
Q  193 tgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcc 260  Q
    || || || |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | || ||||| |||||| |||||||    
T  43849384 tggttatctgaacacgctttctcgtgtttggccacactgcttaaagcggctttgagggcttcctgtcc 43849317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 344
Target Start/End: Original strand, 1041386 - 1041533
Alignment:
Q  196 ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggt-aaaaggtccgacacctaatcccacaagt 294  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||| | ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1041386 ttgtcagaacacactttcttatgtttgaccactatgtttgacacaacttttagagttgcttgtcctaccataaaaaggtctgacacctaatcccataagt 1041485  T
Q  295 ggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatcc 344  Q
    ||| ||||  |||||  ||| ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  1041486 ggtgaaacttaagtc--gtccacatatgcatgttttcctcctacccatcc 1041533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46391488 - 46391240
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||| |  |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||  || |||    
T  46391488 caatcttcgtaaatacaacattcatggatttaggagacatgacattgtt--gcatgatcttttgaactttatgtagaaggtcaacaacctctactgatag 46391391  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | | || ||| ||| | |||||| |||||||||| |||| ||  ||| |||||| | |||||| |||||  || ||||| | |||| |||||||||| |     
T  46391390 gaaatcgaaaatgttacaagcaa-tggtataaaaacatgttggctgtgagaacatgttttctcgtgtttaaccgctttgttcgacgtagcttttaggtca 46391292  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
     | | |||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  46391291 acatatcctaccgtaaaagatccgacctctaatcctacaagtggtgaaaccc 46391240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54191031 - 54190903
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||| | ||||| |||| | |||||||  || ||| ||| |||||| ||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  54191031 aaaccaatctttgtaaatacaatatttatggacttaagagtcatgacattgttatgcatggccctttgaactctatgtggaaggtcaacaacctctgata 54190932  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaat 177  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  54190931 ctagaaagtcaaaagtgtcaaaagcaaat 54190903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Original strand, 28739845 - 28740014
Alignment:
Q  62 taaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaa 161  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |   ||| |||||||||| |||||||||  | | || || |||| |||| ||    
T  28739845 taaacacaacatttatggacctaggagacataacattgttatgcattgcacgttgaactctatgtaaaaggtcaacaacttgtggtgttaggaagtcgaa 28739944  T
Q  162 agtgtcaaaagcaaatggtataaaa-gcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacttt 230  Q
    |||||||||   |||||||||||||  |||| | | ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  28739945 agtgtcaaacataaatggtataaaacacatgttaactgtcacaacacaatttctcgtgtttggccacttt 28740014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 40392777 - 40392728
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40392777 caagcggacaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa 40392728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 50464519 - 50464388
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     |||  |||||||||||| |||||| | ||  || | |||||||| ||||||     
T  50464519 caagcggacaacaagctgcgccgctaggtctttttggatggca-----aaataaatcctcgtaaacacaacattcatatatttgggagacatgacattgt 50464425  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaac 137  Q
    ||||||  ||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  50464424 tatgcatgaccctttaaactctacgtagaaggtcaac 50464388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 53098412 - 53098503
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| |||  |||| |||| ||||||||||||    
T  53098412 tttgaactctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaaaccaaaaatgtcaaaaggaaacggttcaaaaacatgttgattgtcagaa 53098503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45760913 - 45760841
Alignment:
Q  150 tagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 222  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45760913 taggaagtcaaaaatgtcaaatgcaaaagatataaaaatatgttgattgtcaaaacacgctttctcatctttg 45760841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 230
Target Start/End: Original strand, 24719952 - 24720043
Alignment:
Q  140 cctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg-ctttctcatgtttggccacttt 230  Q
    |||||| || |||| || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||    
T  24719952 cctctgttgttaggaagacaaaagtgtcaaacacaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacgcgtttttatcatgtttgaccacttt 24720043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 31846987 - 31847029
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggca 43  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31846987 caagcgggcaacaacctgcgccgctagacctttttggatggca 31847029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 50442702 - 50442609
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||     ||||| |||| ||||||   ||| | ||||||||||||||||||    
T  50442702 caagcgggcaacaagctgcgccactaaccctttttggatggcaaaaccaa-----tcctcttaaacacaacatccatgaacctaggagacataacattg 50442609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 50463166 - 50463120
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaac 47  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50463166 caagcggacagcaagctgcgccgctaggtctttttggatggcaaaac 50463120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 395
Target Start/End: Original strand, 18534585 - 18534673
Alignment:
Q  307 gtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtc 395  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||  |  ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  18534585 gtcaagtccacacatgcatgttttccttctacccatccgtataccataacatttgtaggcctaagtgtcgatcttcaatctagtgggtc 18534673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 407
Target Start/End: Original strand, 19277178 - 19277578
Alignment:
Q  4 gcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctat 103  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     | |  || || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19277178 gcgggcaataagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaatt---ttcgtgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctat 19277274  T
Q  104 gcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcaga 203  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19277275 gcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcaga 19277374  T
Q  204 acacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  19277375 acacgctttctcatgtttggctactttgcttgacgcagcttttaggactgcctgtcctacggcaaaaggtctgaaacctaatccgacaagtggtgaaacc 19277474  T
Q  304 caagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcagga 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19277475 ccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtagaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgcgtcagtcagga 19277574  T
Q  404 agtt 407  Q
    ||||    
T  19277575 agtt 19277578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28517506 - 28517103
Alignment:
Q  5 cgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatg 104  Q
    ||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28517506 cgggcaacaagctgtgtcgctagacttttttggatggcaaaaccaa-----tcctcgtaaacacaacattcatggacttaggagacataacattgttatg 28517412  T
Q  105 cacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaa 204  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  28517411 cataaccctttggactctatgtagaaggtcaactgtctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtctaaa 28517312  T
Q  205 cacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  28517311 cacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccc 28517212  T
Q  305 aagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaa 404  Q
     ||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28517211 cagtcaagtccacacatacatgttttcctccaacccatccgtacaccataacatttgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaa 28517112  T
Q  405 gttcacagg 413  Q
    |||||||||    
T  28517111 gttcacagg 28517103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 4501143 - 4501547
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||| | ||     |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4501143 caagcggacaataagatgcgctgctagacctttttagatgacaaagctaa-----tcctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgacattgc 4501237  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  4501238 tatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgcta-gaaaaccaaagtgtcaaaagcaaattatataaaagcatgttgattgtc 4501336  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4501337 agaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgacgcagcttttagggttgtttgtcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccacaagtggtgaa 4501436  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  4501437 accccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacctatccgtacaccataacatccgctggcctgagtgtttatcttctatctagtgggtcattca 4501536  T
Q  401 ggaagttcaca 411  Q
    |||||||||||    
T  4501537 ggaagttcaca 4501547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21327053 - 21326712
Alignment:
Q  9 caacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcaca 108  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     ||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  21327053 caacaagctgcgccgttagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcatg 21326959  T
Q  109 accttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21326958 accttttgaactctatgtaaaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacg 21326859  T
Q  209 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |    
T  21326858 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcggcttttagggctgtttgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaactccaat 21326759  T
Q  309 caagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataa 355  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21326758 caaatctacacaagtatgttttccacctacccatctgtacaccataa 21326712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 410
Target Start/End: Original strand, 982839 - 983237
Alignment:
Q  7 ggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgca 106  Q
    ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||     | |||||||||||| || |||||| | |||||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  982839 ggcaacaagctgtgtcgctagacctttttggatggca-----ataccaatcctcgtgaacacaacattcatggacatagaagacatgacattgatatgca 982933  T
Q  107 caaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaaca 206  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  982934 tgaccttttgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctagaaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 983033  T
Q  207 cgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaa 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  983034 cgatttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttatggctgcctgtcctacaataaaaggtcccacacctaatcccacaagtggttaaacccta 983133  T
Q  307 gtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  983134 gtcaagtctacacaagcatgtttttcacctactcattcgtacatcataacttccggatgcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagttaggaagt 983233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Original strand, 24527482 - 24527877
Alignment:
Q  10 aacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaa 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||| || |||||| | ||||| | |||||| || |||||||||||||  |    
T  24527482 aacaagctgcgccgctagatctttttggatg-----acaaaaccaatcctcgtgaatacaacattcatggaccaaggagaaatgacattgctatgcatga 24527576  T
Q  110 ccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgc 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24527577 ccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctcgtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgt 24527676  T
Q  210 tttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtc 309  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||    
T  24527677 tttctcatgttttcccactttacttgacactgcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaaatgatgagaccctagtc 24527776  T
Q  310 aagtctacacaagcatgttttccacata-cccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttc 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||    
T  24527777 aagtctacacaaacatgttttccacctatcccatccgtacaccatgacattcgcagacctgagtgttgatcttcgacctagtgggccagttaggaagttc 24527876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 45614065 - 45613659
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||     |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  | ||||||     
T  45614065 caagcggacaacaagctgcgccgctagaccttttcggatggcaaaaccaa-----tcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagatttgacattgt 45613971  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  45613970 tatgcatgaacttttgaactctatgtagaaggctaacagcctctggtgcttggaaaccgaaagtgtcaaaatcaaatggtataaaaacatgttgattgtc 45613871  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45613870 agaacacactttcccgtgtttggtcaccttacttgacgcaacttttagggttgtctgtcctacggaaaaaggcccgacacctaatcctacaagtggtgaa 45613771  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  45613770 accccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccattcgtacatcataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctttctagcgggtcagtca 45613671  T
Q  401 ggaagttcacag 412  Q
    ||||||||||||    
T  45613670 ggaagttcacag 45613659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 156 - 414
Target Start/End: Original strand, 3676673 - 3676932
Alignment:
Q  156 gtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctg-c 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3676673 gtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatattgatagtaagaacacgctttctgatgtttgaccactttgcttgacgcagcttttagggctggc 3676772  T
Q  255 ctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccata 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3676773 ctgtcctacggtaaaaggaccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccctacaccata 3676872  T
Q  355 aaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacaggt 414  Q
    | |||  |  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3676873 acatctacaagcctgagtgttgattttctatctattgggtcagtcaggaagttcacaggt 3676932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 5825200 - 5825561
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   || || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  5825200 aaaccaatcctcgtaaacacaacatccatagacctaggagacataacattgctatgcataaccctttcgactctatgtagaaggtcaacaacctctggtg 5825299  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    |||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  5825300 ctaggatgccgaaagtgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacacgcattgtcatgtttg--cactttgcttgatgcagcttttag 5825397  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtac 348  Q
    |||| |||||||| | |||||||   |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||    
T  5825398 ggcttcctgtcctgccgtaaaagcctcgacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccattcgtac 5825497  T
Q  349 accataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  5825498 accataacatccgcaggcctatgtgtcgatcttctatctagtgggtcaatcagaaagttcacag 5825561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 27521402 - 27521722
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27521402 caatcctcgtaaacacaacattcatagacttaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctag 27521501  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| || |    
T  27521502 gaaaccaaaagtgtcaaaagtaaattgtataaatgcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgtttaacgcaacttttaagggt 27521601  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||||| || |    
T  27521602 gcatgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaaatggtgaaatctcagtcaagtctacaca--tatgtttttctcctacccatccgtagacaa 27521699  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgtt 375  Q
    ||| |||||| | ||||||||||    
T  27521700 taacatccgcagacctgagtgtt 27521722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 397
Target Start/End: Original strand, 43856805 - 43857149
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||| |||||||| | |||| | ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  43856805 caattctcgtaaacataacattcatggacctaggagtcatgacattgttgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttag 43856904  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||  | |    
T  43856905 gaaaccaaaaatgtcaaaagcaaattgtataaacgcatgttgattgtcaaaacacgctttctcatgtctagccactttgattgacgcatcttttaatgtt 43857004  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || || | ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  43857005 gtctgtcctactgtaaaagccccgacccctaatcccacaagtggtgaaacccccgtcaagtccacgcatgtatgtttttctcctacccatccgtacacca 43857104  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcag 397  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43857105 taacatctgcaggcctaagtgttgatcttctatctagtgggtcag 43857149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 22197924 - 22198194
Alignment:
Q  59 tcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtc 158  Q
    ||||||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |    
T  22197924 tcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaacc 22198022  T
Q  159 aaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgt 258  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22198023 gaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgacgccgcttttagggctgcgcgt 22198122  T
Q  259 cctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgtttt 330  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  22198123 cctaccataaaaggcccgacacctaatcgcacaagtggcgaaaccccaatcaaatctacacatgcatgtttt 22198194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22239897 - 22239627
Alignment:
Q  59 tcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtc 158  Q
    ||||||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |    
T  22239897 tcgtaaacacaacattcattgacctaggagacatgacgttgctat-cataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaaacc 22239799  T
Q  159 aaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgt 258  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22239798 gaaagtgacaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgttggaacacactttctcatgtttggtcactttgcttgacgccgcttttagggctgcgcgt 22239699  T
Q  259 cctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgtttt 330  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  22239698 cctaccataaaaggcccgacacctaatcgcacaagtggcgaaaccccaatcaaatctacacatgcatgtttt 22239627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 32584484 - 32584816
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||| |||     || | ||||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||     
T  32584484 caagcgggcgacaagttgcgctgctaggcctttttggatggtaaaatcaa-----tctttgtaaacacaacattcatcgatctatgagacataacattga 32584578  T
Q  101 tatgcacaaccttttgga-ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgt 199  Q
    ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  32584579 tatgcatgatcttttggaactctatctagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaacataaagtgtcaaaagcaaatggtgtaaaagcatcttgattgt 32584678  T
Q  200 cagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaa 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| ||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||| |    
T  32584679 cagaacacgttttctcatgtttgaccactttgtttgatgcaatttttagggttgcatgtcctaccgtaaaatccccgacccctaatcccacaagaggtga 32584778  T
Q  300 aacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacata 337  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  32584779 aacccgagtcaagtccacacatgcatgttttcctcata 32584816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40726703 - 40726476
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||  |||||||||||||||| |||     ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||     
T  40726703 caagcgggcaacaagctgcgatgttagacatttttggatggcaaaatcaa-----tcctcataaacacaacattcatggatctaggagacatagcattgt 40726609  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || | |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40726608 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctatgaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtc 40726509  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgct 233  Q
    |||||||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  40726508 agaacacattttattatgtttggccactttgct 40726476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25187154 - 25186873
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||     || | |  || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  25187154 caagcgggcaacaagctgcgccgctagatctttttagatggtaaaatcaa-----tcattgggaacacaacattcatggatctaggagacatgacattgc 25187060  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||  || | || |  | |     |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  25187059 tatgcatgaccttttgaactctatatagaaggtcaacaacctctagtgttcggaaaccga-----tcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattatc 25186965  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25186964 ggaacacgctttctcatgttagaccactttacttgacacaacttttagggttttatgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 25186873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 251
Target Start/End: Original strand, 10905049 - 10905246
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  10905049 caatccttgtaaacacgacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatggctctttgaactctatgtagaaggtcaacatactctggtgctag 10905148  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggc 251  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905149 gcaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa-gcatgttgagtgtcagaacactttttctcatatttggccactttgcttgacgcagcttttagggc 10905246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 48539108 - 48539261
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||    
T  48539108 aaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttggactctatgtagacgatcaacagcctctggtg 48539207  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcag 202  Q
    ||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48539208 ctagaaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 48539261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30216232 - 30216040
Alignment:
Q  55 atcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggg 154  Q
    |||||||| || |||||| | || || |||||||| || |||||||||||||  ||| |||| ||| ||||| |||| |||||   |||||||||||||     
T  30216232 atcctcgtgaacacaacattcatagacctaggagatatgacattgctatgcatgaccatttgaactttatgtggaagatcaacaaactctgatgctagga 30216133  T
Q  155 agtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30216132 aaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccattttgcttgacgcagctttta 30216040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9281247 - 9281091
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgcttt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9281247 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9281148  T
Q  213 ctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaa 270  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  9281147 ctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9292218 - 9292062
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgcttt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||  |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9292218 tttgaactctatgtagaaggtcaacaacatctggtgctaggaagcaaaaaatgtcaaatccaaatagtataaaagcatgttgattgttagaacacgcttt 9292119  T
Q  213 ctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaa 270  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  9292118 ctcatgttt-gctagtttgcttgatgcagcttttagggttgtctgtcctactgtaaaa 9292062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 322
Target Start/End: Original strand, 34772709 - 34772979
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | | ||||| |||| | |||| |||||| ||||||  || ||||| | | ||||||||||||||||  ||||| ||     
T  34772709 aaaccaattatcgtaaacacaatattcatggacctagaaaacatgacattgatatgcatgactttttgaagtttatgtagaaggtcaacaacctctaat- 34772807  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||| | | |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  || |||||||    
T  34772808 ctaagaaattgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaaacatattaattgtccgaacacactttctcatatttggctactttgattga--caacttttag 34772905  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaag 322  Q
     ||||||| || ||| |||||| | || |||| ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||    
T  34772906 agctgcctatcataccgtaaaaagcccaacacataatcccacaaatgataaaacctcaatcaagtctacacaag 34772979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42295364 - 42295166
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||| |||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||| || ||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||    
T  42295364 aaactaatcatcgtaaacacaagattcatggacctaggagacatgacaatgttatgcatgatattttgaacgctatgtagaaggtcaacaacccctggtg 42295265  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
     |||| |  | ||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42295264 ttaggaaaccgaaagtataaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaagaagctttcttatgtttggccattttgcttgacgccgctttta 42295166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 411
Target Start/End: Original strand, 47679122 - 47679414
Alignment:
Q  119 ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatg 218  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |  | ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||     
T  47679122 ctctatttagaaggtcaacaacctgtgatgctaggaaaccgaaaatgtcaaacgcaaatagtataaaagtatattgattgtgagaacacactttctcata 47679221  T
Q  219 tttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaa-tcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctac 317  Q
    ||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |  |||||   |||||||   | || |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  47679222 ttttgtcactttgc-tgacgcaacttttagagatactcgtccttttgtaaaagccgctacccctaacccccacaagtggtgaaaccctagtcaagtctag 47679320  T
Q  318 acaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    ||| | ||||||||| | ||||||| || || |||| | || ||   | |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  47679321 acatgtatgttttcctcctacccattcgcacgccattacattcgtaagtcaaagtgtcgatcttctatctagtgcgtcagtcagaaagttcaca 47679414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Original strand, 2904368 - 2904512
Alignment:
Q  125 gtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggc 224  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||  ||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  2904368 gtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaagccaaacatgtcacaaacaaatgatataaaatcatgttgattgtcggaacatgctttctcatgtttgac 2904467  T
Q  225 cactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaa 269  Q
     | ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||| |||||    
T  2904468 tattttgcttgacgtaacttttaggactgtctatcctaccgtaaa 2904512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33202493 - 33202368
Alignment:
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||  ||||||  || |||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||| ||    
T  33202493 agaacacgcgttctcatgtttggccacttagttggacgcaacttccagggctttctatcctactgtaaaagccccaacccctaatcccacaagcggtgaa 33202394  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgt 327  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  33202393 accc-agtcaagtccacacatgcatgt 33202368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 271
Target Start/End: Original strand, 1249658 - 1249735
Alignment:
Q  194 gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  1249658 gattatcaaaacacgctttctcatgtttgaccactttatttgacgcaggttttagggctgtctatcctaccgtaaaag 1249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47251892 - 47251789
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  47251892 actctatgtaaaatgtcaaccgtctctgatgctaggaagtcgaaaatgtcaaaaacaaat-ttataaaagcatgaggattgtgagaacatgttttctcat 47251794  T
Q  218 gtttg 222  Q
     ||||    
T  47251793 atttg 47251789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5972396 - 5972293
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  5972396 aaactaatcctcgtaaacacaacattcatagatctgggagaaatgacattactatgcatgacattttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgata 5972297  T
Q  149 ctag 152  Q
    ||||    
T  5972296 ctag 5972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45003120 - 45003007
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     || ||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||    
T  45003120 caagcggacaataagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcttcgtaaacacaacattcatggtcctatgagacataacattgc 45003026  T
Q  101 tatgcacaaccttttggac 119  Q
    |||||| |||  |||||||    
T  45003025 tatgcataactctttggac 45003007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 38766208 - 38766257
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38766208 caagcgggcaacaagctgcgcagctagacctttttggatggcaaaaccaa 38766257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 355
Target Start/End: Original strand, 38839352 - 38839559
Alignment:
Q  150 tagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa----gcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttt 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||  || ||||| ||||    
T  38839352 taggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaacatgcatgttgattgacataacatgctttctcatgtttgacgattttattttacgcaacttt 38839451  T
Q  246 tagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccg 345  Q
    ||| | || |||| || | |||||||   |||| || |||||||||| || | ||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | | ||| ||||||    
T  38839452 tagagttgtctgttcttccgtaaaagacacgaccccaaatcccacaa-tgatgaaatctcagtcaagtccacacatgcatgtttt-ctcttacacatccg 38839549  T
Q  346 tacaccataa 355  Q
    ||||||||||    
T  38839550 tacaccataa 38839559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7637579 - 7637505
Alignment:
Q  161 aagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7637579 aagtgtcaaacgcaaatggtataaaagcttattgatcgtcagagcacactttctcatg-ttgaccactttgcttga 7637505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34067932 - 34067771
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||||| |||    
T  34067932 caaaagtgtcaaatacaaatggcatagaaa-atgttgattgtcaaaacacactttctcatgtttggtcacttggcttgaagcgacttcgagggctgtctg 34067834  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccga-cacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacaca 320  Q
    ||| || |||||| |||| |   || |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  34067833 tcccacagtaaaa-gtcctagtccccaatcccacaagtgggaaaaccccggtcaagtccacaca 34067771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6635130 - 6634993
Alignment:
Q  62 taaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaa 161  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |   |||  | | || |||||||||||||  ||||||||||||   | || ||    
T  6635130 taaacacaacatttatggatctaggagacatgacattgttatgcaagattattttaattttacgtagaaggtcaacaacctctgatgctaaaaaatcgaa 6635031  T
Q  162 agtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgt 199  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  6635030 actgtcaaaagcaaatgatataaaaatatgttgattgt 6634993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27027833 - 27027758
Alignment:
Q  21 ccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27027833 ccgctagatctttttggatagcaaaaccaa-----tcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgct 27027758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 43383221 - 43383361
Alignment:
Q  174 aaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggt 273  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |  |||||  ||||||||||||| |  || ||||      
T  43383221 aaatggcataaaagcatgttgattgctggaacatgctttctcatggttggccactttatttgaagtggctttgtgggctgcctgtcccatagttaaagcc 43383320  T
Q  274 ccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtc 314  Q
    ||||  |  ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  43383321 ccgattctcaatcccacaagtggggaaaccccagtcaagtc 43383361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Original strand, 5714967 - 5715022
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatg 104  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5714967 aaaccaatcttcataaacacaacatttatggacctaggagacataacattgttatg 5715022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 38832186 - 38832225
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatg 40  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38832186 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatg 38832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Original strand, 44525930 - 44526000
Alignment:
Q  67 acaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaac 137  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||| |  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  44525930 acaacattcatggatataggagacatgacattgttatgcatattcttttgaactccatgtagaaggtcaac 44526000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45424813 - 45424755
Alignment:
Q  124 tgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45424813 tgtagaaggtcaagggcatctggtgctaggaagtcgaaagtttcaaaagcaaatggtat 45424755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 26770454 - 26770515
Alignment:
Q  179 gtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgca 240  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  26770454 gtataaaagcatatagattgtcagaacacgttttctcatgttttaccactttatttgacgca 26770515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 392
Target Start/End: Original strand, 10905264 - 10905373
Alignment:
Q  282 taatcccacaagtggt-aaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatct 380  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||  || ||| || ||||| ||||| |||||    
T  10905264 taatccaacaagtggtgaaaacctcagtcaagttcacacatgcatgttttcctcctatccatccgtacacc--aacatctgcaggcctaagtgtcgatct 10905361  T
Q  381 tctatctggtgg 392  Q
    | ||||| ||||    
T  10905362 tatatctagtgg 10905373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41117946 - 41117866
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggt 133  Q
    ||||| |||| || |||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||    
T  41117946 caatcatcgtgaacacaacattcatggacctaggaaacatgacattgctatgcatgatcttttaaactctatgtagaaggt 41117866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 53785593 - 53785998
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||     ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  53785593 caagcgggcaacaagctacgccgctggaccttgttggatggcaaaac-----caatcctcgtaaacataacattcatggacctaggagacatgacattgc 53785687  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53785688 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 53785787  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  53785788 agaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgacgcggctttaagggctgcctatcctacggtaaaaggcccgacacctaatcccactagtggtgaa 53785887  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| | ||| | |||||||| |    
T  53785888 accccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccaaaacatccgcatgcctgagtgttgatcttatttctagcgggtcagtta 53785987  T
Q  401 ggaagttcaca 411  Q
    |||||||||||    
T  53785988 ggaagttcaca 53785998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52741733 - 52741329
Alignment:
Q  3 agcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgcta 102  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||     || |||| || |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52741733 agcgggcaataagttgcgtcgctagacctttttggatggcaaaacaaa-----tcttcgtgaatacaagataaatggatctaggagacatgacattgcta 52741639  T
Q  103 tgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcag 202  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52741638 tgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcag 52741539  T
Q  203 aacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagc-ttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  52741538 aacacgctttctcatgtttggtcaatttgtttgactcagctttttagggctgcctgtcctacaataaaaggtcctacatctaatcccacaagtggtgaaa 52741439  T
Q  302 cccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcag 401  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52741438 cctcagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatccgtataccacaacatctgcaagtctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcag 52741339  T
Q  402 gaagttcaca 411  Q
    ||||||||||    
T  52741338 gaagttcaca 52741329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 67 - 413
Target Start/End: Original strand, 44198712 - 44199058
Alignment:
Q  67 acaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgt 166  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | || || | |  | |||||||    
T  44198712 acaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcataaccttctgaactctatgtagaaggtcaacagcctcgggtgttaagaaaccgaaagtgt 44198811  T
Q  167 caaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  44198812 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgattctcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagagctgcctgacctacggt 44198911  T
Q  267 aaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||| |  ||    
T  44198912 aaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacactaacatgttttccacctactcatccatacaccataatgtccacaagc 44199011  T
Q  367 ctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44199012 ctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcacgaagttcacagg 44199058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39583444 - 39583047
Alignment:
Q  9 caacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcaca 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||||||| || ||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||      
T  39583444 caacaagttgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcgtaaacacgacattcatgaacctaggagacatgacattgctatgcatg 39583350  T
Q  109 accttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg 208  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |  | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39583349 accctttgaactctatgcagaaggtcaacaacctatgatgctaggaaaccgaaagtgtcgaaaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacg 39583250  T
Q  209 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39583249 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctatcctaccataaatggcccgacccttaatcccacaagtggtaaaacctaagt 39583150  T
Q  309 caagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttc 408  Q
    |||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39583149 caagtccacgcatgcatgttttcctcctacccatccgtacactataacatccgcatgcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcaatcagaaagttc 39583050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 26772642 - 26772905
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||     
T  26772642 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgt 26772736  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26772737 tatgcataatcctttgtactctatatagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 26772836  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaa 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  26772837 agaacacgttttctgatgtttggccactttgcttgacacaacttttagggatgcatgtcctactgtaaa 26772905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 407
Target Start/End: Original strand, 13582441 - 13582796
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||      || ||||||    
T  13582441 caatcttcgtaaacacaacattcatggtcctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctctgtagaaggtcaacaattgttggtgctag 13582540  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | | |||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13582541 gaaatcaaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacacgttgattgtcagaacacactttcttatgtttgatcactttgattgacgcagcttttagggct 13582639  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13582640 gcttgtcctacggtaaaaggcctgacacctaatcccacaagtgttgaaacctcggtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccatacacca 13582739  T
Q  353 taaa--atccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
    || |  |||||   ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13582740 tatagcatccgtaagccagagtgttgatcttctatctaatggatcagtcaggaagtt 13582796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 413
Target Start/End: Original strand, 7900812 - 7901143
Alignment:
Q  76 atggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaa 175  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | || | ||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||| |||    
T  7900812 atggacctaggaaacataacattgctatgtataatccttcaaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaa 7900911  T
Q  176 atggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtcc 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |  | ||||||| |||||||  ||    
T  7900912 atggtataaaagcatgttgattgtcagaaaacgctttctcatgttcggctattttgcttgacgcagtttttagggatatccgtcctaccgtaaaagaccc 7901011  T
Q  276 gacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgtt 375  Q
     || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||||| ||   |      | |||||    
T  7901012 aacccctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctcctacacatctatacaccataacatatac------gggtgtt 7901105  T
Q  376 gatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  7901106 gatcttctatctagtgagtcagtcagaaagttcacagg 7901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37133206 - 37132869
Alignment:
Q  17 tgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttg 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||     ||||  |||| |||||| | ||  |  |||||||||| |||||||||||||  |||||| |    
T  37133206 tgcgccgctagacctttttggatcgcaaaaccaa-----tccttataaacacaacattcattaacttaggagacatgacattgctatgcatgacctttag 37133112  T
Q  117 gactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctca 216  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |  | ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37133111 aactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctca 37133012  T
Q  217 tgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtcta 316  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  | ||| |||||    
T  37133011 tgtttaaccactttgcttgacgtagcttttagggctgtctgttctccgataaaaggtctgacacttaatcccacaggtggtaaaacctcaatcatgtcta 37132912  T
Q  317 cacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatcc 360  Q
    |||| |||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  37132911 cacatgcatgtttttttc-tacacatccgtacaccataatatcc 37132869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 410
Target Start/End: Original strand, 49017950 - 49018251
Alignment:
Q  109 accttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg 208  Q
    |||||||| ||| || ||||||| |||||  |||| | ||||||| |  | ||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||     
T  49017950 accttttgaactttacgtagaagatcaacaacctcgggtgctaggaaaccgaaagtgtaaaaaaaaaatggtataaaaacatgttgattgttagaacaca 49018049  T
Q  209 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||    
T  49018050 ctttctcatgtttggtcactttgttttacgtaactttcagggttgcttgtcctaccgtaaaaggctcgacacctaattccacaagtggtgaaactccagt 49018149  T
Q  309 caagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttc 408  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49018150 caagtttacacatgcatgttttcctcgtaccaatccgtacaccataacatctgcatgcctgagtgttaatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttc 49018249  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  49018250 ac 49018251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38671102 - 38670887
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||     |||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38671102 aagcggacaacaagctgcgccgctagacttttttagatggcaaaaccaa-----tcctcgtacacacaacattcatggacctaggagacataacattgct 38671008  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca 201  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38671007 atgcataactctttagactctatgtagaaggtcatccgcctctgatgctagaaagccaaaagtgtcaaaaacaaattgtataaaagcatgttgattgtca 38670908  T
Q  202 gaacacgctttctcatgtttg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38670907 gaacacgctttctcatgtttg 38670887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32546679 - 32546901
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  32546679 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----tcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagacatgacattac 32546773  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32546774 tatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctttggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtc 32546873  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccact 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  32546874 cgaacacgctttctcatgtttggccact 32546901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Original strand, 38145987 - 38146238
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||| ||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||| |||||| |||||| || |||  |||||| ||||||    
T  38145987 caatcatcgtaaacacaacgttcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctaagtagaatgtaaacaacctctggtgctag 38146086  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  38146087 gaagtcaaaagtgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcaaaacacgttgtctcgcgtttgaccactttgattgatgccgcttttagggct 38146186  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    || ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  38146187 gcatgtcctaccctcaaagctccgacccctaatcccacaagtcgtgaaaccc 38146238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26856985 - 26856755
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||     |||||| ||  |||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  26856985 caagcgagcaacaagctgcgccgctaggcctttttggatggtaaaaccaa-----tcctcgcaagcacaacattcataaacctaggagacatgacattgc 26856891  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26856890 tatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctagtgctaggaaatcgaaagcgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtc 26856791  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    | |||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||    
T  26856790 acaacacgctttatcatatttgaccattttacttga 26856755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 222
Target Start/End: Original strand, 51234577 - 51234716
Alignment:
Q  83 taggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  51234577 taggagacataacattgttatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctagaaagtcgaaagtgtcaaaaataaatggtat 51234676  T
Q  183 aaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 222  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  51234677 aaaagcatgttggttgtcataacatgctttttcatgtttg 51234716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3443492 - 3443254
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | || ||| |||||||||  ||||| ||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||    
T  3443492 aaaccaatcatcgtaaacacaacattcatagatttaggagacaagacattcctacgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctagtg 3443393  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| |    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3443392 ctaggaaactgaaagtgtcaacagaaaatggtataaaagcatgttgattgttagaatacactttttcatgtttggccattttgcttgacgcaacttttag 3443293  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcc 287  Q
    | ||  ||||||||  |||||||  | ||||||||||||    
T  3443292 gactctctgtcctatcgtaaaagtcctgacacctaatcc 3443254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 330
Target Start/End: Original strand, 5338573 - 5338855
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |    || ||| ||||||  ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||  ||    
T  5338573 aaaccaatcctcgtaaacacaacattc---gacctatgagacaagacattgctacgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaacaatctctagtg 5338669  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca---gaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttt 245  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    ||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||| || |    
T  5338670 ctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagcatgttgactgtcaacgcaacgcactttctcatgtttggcaattttgtttgacgcaactct 5338769  T
Q  246 tagggctgcctgtcctacggtaaaaggtc-cgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgtttt 330  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  5338770 tagggctttctgtcctaccgtaaaagctctaaatccctaatcccacaagtggtgtaacccaaatcaagtccacagatgcatgtttt 5338855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 54508491 - 54508252
Alignment:
Q  122 tatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacg-ctttctcatgtt 220  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |  |||||||||||    
T  54508491 tatgcagaaggtcaacaacctctggtgctagaaaatcaaaaatgtcaaaagcaaatgatataaaaacatgttaattgtcagaacaagtttttctcatgtt 54508392  T
Q  221 tggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacaca 320  Q
    | |||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||| ||  ||||||   | |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||  |||||    
T  54508391 tagccattttgtttgacgcaac-tttatggctgcttgtcttattgtaaaaatcctgacacctaatccaacaagtggtgaaaccccaatcaagtacacaca 54508293  T
Q  321 agcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgc 362  Q
     ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  54508292 tgcatgttttcttc-tacccatccgtacaccataacatccgc 54508252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46940852 - 46940736
Alignment:
Q  147 tgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt 246  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46940852 tgctaggacgtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcggaacatgttttctaatgtttggccactttgcttgacgcatctttt 46940753  T
Q  247 agggctgcctgtcctac 263  Q
    || | || |||||||||    
T  46940752 agagttgtctgtcctac 46940736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38978942 - 38978754
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38978942 gagacatgacattgttatgcatcaccttttgaactatatgtagaaggtcaacggcctcaggtgctaggaaaccaaaagtgtcaaaaacaaatagtataaa 38978843  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtc 274  Q
    | |||  ||||||||| || ||| |||| ||||| |  ||| |||||||||| || ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||    
T  38978842 aacatattgattgtcaaaatacgttttcacatgtctaaccaatttgcttgacacaacttttagggttgtatttcctaccgtaaaaggtc 38978754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52412059 - 52411903
Alignment:
Q  61 gtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaa 160  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||  || |||  ||   |    
T  52412059 gtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacgacatctagtgttagaaagctga 52411960  T
Q  161 aagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52411959 aagtgtcaaaagcaaatggaataaaagcatgttgattgtcagaacacgctctctcat 52411903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 411
Target Start/End: Original strand, 37992328 - 37992621
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||| | || |||||   ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  37992328 actctttgtagaaggtcaacaacctctagtgctatgaagccaaaaccatcaaaagtaaatgatataaaatcatgttgattgtcagaacatgcttcctcat 37992427  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctac 317  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||  ||||||   |||||||| ||||||    ||||  |||||| ||  |||| | ||||||   ||||||| ||    
T  37992428 gtttggtcactttgtttgacacaacttgcagggctatatgtcctaccgtaaaaatctcgacctctaatctcatgagtgatgaaaccccgatcaagtccac 37992527  T
Q  318 acaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  | | ||| |||||  ||||||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  37992528 acacacatgttttcctcctacccatccgtacatcataacatctacagacctaagtgtccatcttctatcaagtgggtcagtgagaaagttcaca 37992621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7502117 - 7501872
Alignment:
Q  124 tgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaag-catgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 222  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7502117 tgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccaaaaatgtcaaaagaaaatggtataaaaaacatgttgattgttcgaacacgctttctcatgtttg 7502018  T
Q  223 gccactttgcttgac-gcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaa 321  Q
     ||||||| ||||||   | |||||| ||  || |||||||  |||| | | ||||| ||||  ||||| |||||| ||||||  || |||||||||||     
T  7502017 accactttacttgacaaaaacttttacggtagcttgtcctatcgtaaca-gcccgacccctagacccacgagtggtgaaaccctggttaagtctacacat 7501919  T
Q  322 gcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcct 368  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||    
T  7501918 gcatgttttccttctaccaatccgtataccataacatctgcaggcct 7501872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 411
Target Start/End: Original strand, 29861948 - 29862086
Alignment:
Q  273 tccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagt 372  Q
    |||||| |||||||  ||||||| | |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||    
T  29861948 tccgacccctaatctaacaagtgtttaaaccccagtcaagttcacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatctgcatgcctaagt 29862047  T
Q  373 gttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    || |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  29862048 gtcgatcttctatctagtgggccagacaagaagttcaca 29862086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 44717 - 44859
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacac---ttatggatctaggagacataacat 97  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||     |||| || || ||||||    | ||||| |||||| |||| ||||    
T  44717 caagcgggcaacaaactgcgccgctagacctttttggatggcaaaacaaa-----tccttgtgaacacaacaacattcatggacctaggaaacatgacat 44811  T
Q  98 tgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctg 145  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44812 tgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctg 44859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 4472989 - 4473209
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||| |||||||| |||| | | || || ||||||||||| | |||||||||||  |   |||| ||| |||||||||||| ||     |||| ||    
T  4472989 aaaccaattctcgtaaacacaatattcatagacctaggagacatgaaattgctatgcatgattctttgaactttatgtagaaggttaagaat-tctggtg 4473087  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||     
T  4473088 ctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaaacatattgatggttagaacacgctttttcatgttttgacactttgcttgacgcaatttttaa 4473187  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaa 270  Q
    ||||  ||||||||| ||||||    
T  4473188 ggctctctgtcctaccgtaaaa 4473209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 286
Target Start/End: Original strand, 25324983 - 25325195
Alignment:
Q  76 atggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaa 175  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||| | || |||||||  |||||||    
T  25324983 atggatttaggaaacttgacattgctatgcatgatcatttgaactctatgtagaaggtcaacaatctatggtgctaggaaatcgaaagtgttgaaagcaa 25325082  T
Q  176 atggtataaaagc--atgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggt 273  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||| || || ||| ||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||  |||||||     
T  25325083 atggtataaaaacatatgttgattgccaaaatacgttttataatgttttgtcactttgcttgacgcaacttttagaactacatgtcctaccataaaaggc 25325182  T
Q  274 ccgacacctaatc 286  Q
    || || |||||||    
T  25325183 ccaacccctaatc 25325195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4763967 - 4763888
Alignment:
Q  54 aatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtc 134  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4763967 aatcctcgtaaacacaacattcatggacc-aggagacatgacattgctatgcataaccttttgaactctatgtagaaggtc 4763888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 42205998 - 42206124
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtc-aactgcctctgatgcta 151  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  42205998 caatcatcgtaaacacaacgtttatggatctaggatacattacatttctatgcatgaccatttaaactctatgtagaatgtcaaattacctttgatgcta 42206097  T
Q  152 gggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatg 178  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||    
T  42206098 gaaagtcaaaagtgtcaaatgcaaatg 42206124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 201
Target Start/End: Original strand, 21552646 - 21552746
Alignment:
Q  100 ctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgt 199  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    ||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  21552646 ctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaaactgaaaatgtcaaaaataaatggtat-aaagcatgttgattgt 21552744  T
Q  200 ca 201  Q
    ||    
T  21552745 ca 21552746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 43123110 - 43123259
Alignment:
Q  87 agacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 186  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| | ||||||| ||||||   || || ||||||  | |||||||||||||  | |||| |||||| |    
T  43123110 agacataatatttctatgcacgaccctttgaactttttgtagaaagtcaacaaactatggtgctagaaaatcaaaagtgtcaatcgtaaatagtataaca 43123209  T
Q  187 gcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
     |||| ||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||    
T  43123210 acatgttgattgtcagaacatcctttatcatgtttagacactttgcttga 43123259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3376848 - 3376675
Alignment:
Q  122 tatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtata-aaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtt 220  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||| |  |||||  |||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| |||| | | ||| |||||||    
T  3376848 tatgtagaaggtcaacaacctctagtgctaggaaaccaaaaaagtcaaaagcaaatggtctataaaatatgttgattgtgagaatatgttttatcatgtt 3376749  T
Q  221 tggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagt 294  Q
    |  ||| ||| |||||||||| ||||| |  ||| | |||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||    
T  3376748 taaccatttttcttgacgcagtttttaagaatgcatatcctaccgtaaaagttgcgacccctaatcctacaagt 3376675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 26276499 - 26276544
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaa 46  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26276499 caagcgggcaacaagctacaccgctagatctttttggatggcaaaa 26276544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 35236249 - 35236413
Alignment:
Q  170 aagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac-----gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacg 264  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||      | ||||| | |||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||     
T  35236249 aagcaaatggtataaaagtattttgattgtcataacataacatgttttcttaagtttggtcattttacttgacgcaacttttagagctacctatcctacc 35236348  T
Q  265 gtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttt 329  Q
     |||||||  |||  |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  35236349 ataaaaggctcgatccctaatcccacaggtggtgaaacctcaatcaagtccacacatgcatgttt 35236413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 13772491 - 13772577
Alignment:
Q  164 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttaggg 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||   ||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||| ||||    
T  13772491 tgtcaaacgcaaatggtataaaagtgtgttgattgatggaacacgttttctcatgtttgatggctttgcttgaagcagctttgaggg 13772577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45676828 - 45676778
Alignment:
Q  188 catgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacg 238  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  45676828 catgttgattgtcagaacacgttttcttatgcttggtcactttgcttgacg 45676778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35484765 - 35484684
Alignment:
Q  156 gtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgac 237  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||  |||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35484765 gtcaaacgtgtcaaatgcaaatagtacaaaaacatgttgattgttggaacatattttctcatgtttgaccactttacttgac 35484684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 413
Target Start/End: Original strand, 39434558 - 39434958
Alignment:
Q  8 gcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcac 107  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||     
T  39434558 gcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcgtaaacacaacattcatggatctaagagacattacattgatatgcat 39434652  T
Q  108 aaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39434653 aaccctttggactctatgtagaagatcaaatgcctctgatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacac 39434752  T
Q  208 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||   | || ||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  39434753 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagagcttcctgtcctactgtaaaagcctccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccag 39434852  T
Q  308 tcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||  | | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39434853 tcaagtacacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacaccataacatcgacagacctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagtt 39434952  T
Q  408 cacagg 413  Q
    ||||||    
T  39434953 cacagg 39434958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 412
Target Start/End: Original strand, 24124955 - 24125318
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  24124955 aaactaatccttgtaaacacaacattcatggacctatgagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactttatgtagaaggccaacaacctctggtg 24125054  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24125055 ctaggaaatcaaaattgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagagcacgctttctcatgtttggccattttgcttgatgcagcttttag 24125154  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtac 348  Q
    |||||| ||||| || ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||     
T  24125155 ggctgcttgtcccaccgtaaaaggcacgacgcataatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcttcctacccgtcagtag 24125254  T
Q  349 accataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
    ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24125255 accataacatatgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttgacag 24125318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Original strand, 500200 - 500516
Alignment:
Q  94 acattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgat 193  Q
    |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  500200 acattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggccaaca-cctctcatactaggaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgtt 500298  T
Q  194 gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaag 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  500299 gattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagggctgtcggtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccacaag 500398  T
Q  294 tggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtggg 393  Q
    |||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  500399 tggtgaaacctcactcaagtctacacatgcatgttttccttctacccatccatacaacataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtggg 500498  T
Q  394 tcagtcaggaagttcaca 411  Q
    | | ||||||||||||||    
T  500499 taaatcaggaagttcaca 500516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 38815178 - 38815469
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |     ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  38815178 caagcgggcaacaagctgcgccgctaagcctttttggatggaa-----aaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgc 38815272  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38815273 tatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaccctctggtgctaggaagcggaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 38815372  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  38815373 agaacacgctttctcatgtttggccactttgtttggcgtggcttttagggctgtctgtcctaccataaaagccccgacccctaatcccacaagtggt 38815469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 3187861 - 3188208
Alignment:
Q  8 gcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcac 107  Q
    |||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||     | |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3187861 gcaataagctgcaccgttagacctttttggatggcaaaaccaa-----ttctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgctatgcat 3187955  T
Q  108 aaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac 207  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3187956 aaccctttg-actctatgtagaaggttaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtttcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacac 3188054  T
Q  208 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag-ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaa 306  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  3188055 gcttcctcatgttttgccactttgcttgatgcaacttttagaggcttcctgtcctaccgtaaaagccccgac-cctaaacccacaagtggtgaaacccca 3188153  T
Q  307 gtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccg 361  Q
      |||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||    
T  3188154 cacaaggccacacatgcatgttttcctccaatccatccgtacaccataacatccg 3188208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35740133 - 35739803
Alignment:
Q  82 ctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggta 181  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |    |||||||||||||| ||| |||    
T  35740133 ctaggggacatgacattgttatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtcaacaatctctggtgctaggaaactgaaagtgtcaaaagctaattgta 35740034  T
Q  182 taaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacc 281  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |     
T  35740033 taaaaacatgttgattgtcagaacccgctttctcatgtttggccactttgcttaacacaacttttagggatgtctgtcctaccgtaaaaggcccgac-ct 35739935  T
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||    
T  35739934 taatcccactagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccattcatacaccataacatctgcatgcctaagtgttgatctt 35739835  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||| |   |||||||||||| |||||||||||    
T  35739834 ctaccaaatgggtcagtcagaaagttcacagg 35739803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 394
Target Start/End: Original strand, 37517165 - 37517366
Alignment:
Q  193 tgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  37517165 tgattgtcggaacaccctttctcatgtttggccactttgcttgatgcagcttttagagctgtctgtcctacggtaaaaggtcctacgcctaatccaacaa 37517264  T
Q  293 gtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgg 392  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||  || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37517265 gtggcgaaaccccagtcaagtctacacaaacatattttccacctacccatccgtacaccatcacatttgcaggcatgagtgttgatcttctatctagtgg 37517364  T
Q  393 gt 394  Q
    ||    
T  37517365 gt 37517366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25021966 - 25021632
Alignment:
Q  77 tggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaa 176  Q
    |||| |||||||| || |||||| | ||||  ||| |||| ||| | ||| || |||||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  25021966 tggacctaggagatatgacattgttgtgcatgaccctttgaactttgtgtggatggtcaacaacctctggtgctaggaagccaaaaatgtcaaaagaaaa 25021867  T
Q  177 tggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccg 276  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||| ||||||    ||    
T  25021866 tggtataaaaacatgttgattgtgagaacacactttctcatatttcaccactttgcttgacacaacttttagggctgtatgtcatactgtaaaaacatcg 25021767  T
Q  277 acacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttg 376  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||  |    
T  25021766 acccctaatcccacaagtggtgaaactccggtcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatctgcaggcctaagtgacg 25021667  T
Q  377 atcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  25021666 atcttctatctagtgggtcagacaagaagttcaca 25021632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 292
Target Start/End: Original strand, 6592503 - 6592744
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||| | ||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||  |    
T  6592503 aaaccaatactcgtaaacacaacattcatgaacctatgagacatgacatta-tatgcatgaccttttgaactctatgcagaaggtcaacaacctctggag 6592601  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6592602 ctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttac 6592701  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
    | ||| || |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6592702 gactgtctatcctatcgtaaaagg-ccgacacctaatcccacaa 6592744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 37514105 - 37514298
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| | |||     ||||||| || |||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||     
T  37514105 caagcgggcaacaagctgcgccgttagacctttttgggtggcaagatcaa-----tcctcgtgaatacaacattcatggacctaagagacgtaacattga 37514199  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgt 199  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37514200 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggcgctaggaaattgaaagtgtcaaaagcaaatagtataaacgcatgttgattgt 37514298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 313
Target Start/End: Original strand, 8619811 - 8620005
Alignment:
Q  119 ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatg 218  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||||| || |||  || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||    
T  8619811 ctctatgtcgaaagtcaacaacctctggtgttagaaagccaaaaatgttaaaaacaaatggtataaaagcacgttgattgtcaaaatacgctttttcatg 8619910  T
Q  219 tttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagt 313  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||   |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8619911 tttgaccattttacttgacgcaacttttagggctgtctgttctatcgtaaaagtcacgatctctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagt 8620005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22589559 - 22589395
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||| | || || ||| ||||||| |||||||    
T  22589559 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaa-----ccaatcctcgtgaacacaacattcatagacctatgagacatgacattgc 22589465  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaa 171  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |  | ||||||||||||    
T  22589464 tatgcatgaccttttgaactctatgta-aaagtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaa 22589395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 311
Target Start/End: Original strand, 4699760 - 4700057
Alignment:
Q  6 gggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgc 105  Q
    |||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||| ||     |||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| |    
T  4699760 gggcaacaagctgcgccactaagcctttttggatggcaaaactaa-----tccttgtaaacacaacattcatggacctaggtgacataatattgctattc 4699854  T
Q  106 acaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaac 205  Q
    |  |||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||| || | |||||||| ||||| |||| | ||||| |||||    
T  4699855 atgaccttt-gaactttatatagaaggtcaacagcctctggtgctatgaagccaaaagtgttaaca-caaatggtgtaaaaacatgttaattgtgagaac 4699952  T
Q  206 acgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccca 305  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || || ||| |  |||||||   |||  | ||| |||||||||||| ||||||     
T  4699953 acgctta-tcatgtttggccactttgcttgacacaactttgagggttgtctatccgattgtaaaagccgcgatccttaaacccacaagtggtgaaacccc 4700051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 247
Target Start/End: Original strand, 8882371 - 8882452
Alignment:
Q  166 tcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8882371 tcaaaaacaaatggtttaaaagcatattgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaggtttta 8882452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Original strand, 28196147 - 28196319
Alignment:
Q  77 tggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaa 176  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||  | | |||| |||||| ||||| |||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  28196147 tggatctaggagacatgacattgttgtgcatgatcctttgaactctacgtagatggtcaacaacctatggtgctaggaagacaaaagtgtcaaaaacaaa 28196246  T
Q  177 tggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagg 249  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  28196247 tggtataaaaacatgtttattatcataacacactttctcatgtttagccgctttacttgatgcagtttttagg 28196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 18804497 - 18804654
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||  || | ||||||| ||| ||||||     
T  18804497 caagcaggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----tcctcgtaaacaaaacactc-tgaacctaggagtcatgacattgt 18804590  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagt 164  Q
    ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18804591 tatgcatgaccttttgaaatctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaatcaaaagt 18804654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 43823927 - 43824053
Alignment:
Q  60 cgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtca 159  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||| || ||    
T  43823927 cgtaaacacaacattaatggatctcggagacatgacattgctatgcatgaccatttgaactctatgtgaaaggtcaatagcctctaatgcaaggaagcca 43824026  T
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43824027 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 43824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 6618178 - 6618383
Alignment:
Q  10 aacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaa 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||     | |||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| |||||  ||||||  |    
T  6618178 aacaagctgtgccgttagatctttttggatgacaaaaccaa-----tactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatga 6618271  T
Q  110 ccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgc 209  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||   |||||  |||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  6618272 ccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgc 6618371  T
Q  210 tttctcatgttt 221  Q
    ||||||||||||    
T  6618372 tttctcatgttt 6618383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 3821155 - 3821293
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||    
T  3821155 caatcctcgtaaacataacatttatgaacctaggagacatgacattgctatgcattaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggttctag 3821254  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 191  Q
    |  | ||||||||||| | | |||||| |||||| ||||    
T  3821255 gatgccaaaagtgtcacatggaaatggaataaaatcatg 3821293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Original strand, 3863289 - 3863386
Alignment:
Q  94 acattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |||||| | ||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  3863289 acattgctatgcactaccctttgaactctatgtagaaggtcaataacctctggtcctaggaagccaaaagtgtcacatgcaaatggaataaaagcatg 3863386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42922198 - 42922001
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||  |||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  42922198 caaaagtgtcaaaggcaaatgatttaaaagcattttgattgtcaaaacacgttttctcaaatttgaccattttgtttgacgcaacttttatggctgcatg 42922099  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataa 355  Q
    || |||  |||||| || |||   ||||| |||   || | |||| | ||||||||| ||||| |  |||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  42922098 tcttaccataaaagctctgaccattaatctcacgtttgatgaaactccagtcaagtccacacatgtttgttttcctcctacccatctgtacaccataa 42922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 10189568 - 10189768
Alignment:
Q  147 tgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt 246  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||| |||| |||||    
T  10189568 tgctaggaagccaaaaatgtcaaatgcaaatgatataaaaacatgttgattgtcagaacatgctttctcttgtttgactactttaattggcgcaactttt 10189667  T
Q  247 agggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgt 346  Q
    |||  ||  ||||||||  ||||||     || ||||||| |||||| ||| ||| || | ||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||||||    
T  10189668 aggaatgtatgtcctaccataaaagccttaacccctaatctcacaagcggtgaaatcccaatcaagtccacacatacatgttttcctcctaccaatccgt 10189767  T
Q  347 a 347  Q
    |    
T  10189768 a 10189768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 271
Target Start/End: Original strand, 4073571 - 4073684
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  | |||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| || |||    
T  4073571 caaaagtgtcaaatgcaaattgtataaaatcatgttgattggtaaaacacgttttctcttgtttgaccactttgtttgatgcaacttttagggttgtctg 4073670  T
Q  258 tcctacggtaaaag 271  Q
    | | || |||||||    
T  4073671 ttccaccgtaaaag 4073684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22589387 - 22589336
Alignment:
Q  196 ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22589387 ttgtcagaacacgctttctcatgttcagccattttgcttgacgcagctttta 22589336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 230
Target Start/End: Original strand, 36004126 - 36004230
Alignment:
Q  126 tagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggcc 225  Q
    |||| |||||||  |||||| || |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||| |||| ||| |||    
T  36004126 tagatggtcaacaacctctggtgataggaagtcaaaaatgtcaaatgtaaatggtataaaaacatgttgattgtcataacgcactttgtcatatttagcc 36004225  T
Q  226 acttt 230  Q
    |||||    
T  36004226 acttt 36004230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 292
Target Start/End: Original strand, 6792257 - 6792345
Alignment:
Q  203 aacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| || ||| || ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  6792257 aacacgttttctcatgtttggccactctgtttgacgtagcttttacgactgtctatccaaccgtaaatgg-ccgacacctaatctcacaa 6792345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 411
Target Start/End: Original strand, 8115847 - 8116100
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| | ||||| | ||||| ||||| || |||||  | |||||||| |||| ||    
T  8115847 caaaagtgtcaaatgcaaatggtataaaagtatattgattattagaacaagatttcttacgtttgaccactctgattgacataacttttaggactgcttg 8115946  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaa 357  Q
    | |||| | ||||     |||   |||||| ||||||||| |||||  ||||||||  ||| | ||||||||| | | ||||||| |||||||| ||| |    
T  8115947 ttctaccgaaaaaatcatgaccattaatcctacaagtggtgaaaccttagtcaagttcacaaatgcatgtttttctcttacccattcgtacaccgtaaca 8116046  T
Q  358 tccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
     |||||||| |  |||| |||||||  | | ||| |||| ||| ||||||||||    
T  8116047 cccgctggcatatgtgtcgatcttccgtttagtgagtcaatcaagaagttcaca 8116100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10556404 - 10556292
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||| |  ||||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||    
T  10556404 actctatgcagaatatcaactgtctctagtgctaggaagtcataagtgtcaaatacaatttatataaaaacatgttgattttcagaatatgttttctcat 10556305  T
Q  218 gtttggccacttt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  10556304 gtttgaccacttt 10556292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Original strand, 40839713 - 40839808
Alignment:
Q  283 aatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatc 379  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||  ||| |||| ||||||||||    
T  40839713 aatcccacaagtgggaaactccaa-tcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccacccgtataccagaacatatgctagcctaagtgttgatc 40839808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11611275 - 11611123
Alignment:
Q  198 gtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggt 297  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||| || || || ||  |||||||  ||  | | ||||||||| ||||||    
T  11611275 gtcagaacatgctttctcatatttggccactttatttgacacaacttttagggatgtctatcttatcgtaaaag--cc--ctcataatcccacgagtggt 11611180  T
Q  298 aaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataa 355  Q
     ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  11611179 gaaacccctgtgaagtccacacatgcatgttttcc-cctacccattcatacaccataa 11611123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39671325 - 39671170
Alignment:
Q  76 atggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagc-a 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||  ||| |||  |||||| ||| ||||| |||  |||||| ||||||| || | ||| ||| ||||   |    
T  39671325 atggatctaggagacatgacatttttattcatgacccttttaactctacgtaaaaggttaacaacctctggtgctaggaagccgaaaatgtaaaaaaata 39671226  T
Q  175 aatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacttt 230  Q
    ||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  39671225 aattgtataaaaacatgttaattgtcaaaacacgctttctctggtttggccacttt 39671170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Original strand, 42659159 - 42659230
Alignment:
Q  54 aatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatg 125  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  42659159 aatcctcgtaaacacaacattcatgaacctagaagacataatattgctatgcataaccctttagactctatg 42659230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 245
Target Start/End: Original strand, 166233 - 166282
Alignment:
Q  196 ttgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||    
T  166233 ttgtcagaacacgctttctcatgattggacactttgtttgaagcggcttt 166282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 191
Target Start/End: Original strand, 3825567 - 3825704
Alignment:
Q  54 aatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagg 153  Q
    |||| ||||||| |||| | | ||||||||| || |||| || ||||||||||  ||  |||| | ||| ||||||||||||||  ||| || | |||||    
T  3825567 aatcatcgtaaacacaatattcatggatctatgaaacatgacgttgctatgcattactctttgaattctgtgtagaaggtcaacaacctatggttctagg 3825666  T
Q  154 gagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 191  Q
     || |||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  3825667 aagccaaaggtgtcacatgcaaatggaataaaagcatg 3825704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8540484 - 8540359
Alignment:
Q  122 tatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgttt 221  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| |||  |||  ||||||||||| ||| |||  |||||| ||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  8540484 tatgtagaaagtcaacaacctctgatgttagaaagttgaaagtgtcaaatgcagatgacataaaaacatgtcgattgttagaacacattttctaatgttt 8540385  T
Q  222 ggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    | | | |||| |||||||| ||||||    
T  8540384 gactattttgtttgacgcaactttta 8540359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18596814 - 18596773
Alignment:
Q  9 caacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18596814 caacaagctgcgccgctagaccttttcggatggcaaaaccaa 18596773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4687085 - 4687001
Alignment:
Q  150 tagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattg-tcagaacacgctttctcatgtttggccactttgct 233  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||  |||||| |  ||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  4687085 taggaagtcaaaagtgtcaaacgcaaaggttattaaagcatattgattgtttggaacatgttttctcatgtttggacactttgct 4687001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28041350 - 28040944
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| |||     ||||| | |  |||||| | |||||  |||  ||||| |||||||    
T  28041350 caagcggacaacaagctccgccgctagacctttttggatggaaaaatcaa-----tcctcatgagcacaacattcatggacttagaggacatgacattgc 28041256  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  28041255 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaaccgcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacctgttgattgtc 28041156  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28041155 agaacacactttctcatgtttggccactttgtttgacgcggattttagagctgcctatcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtagtgaa 28041056  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28041055 accccagtcaagtctacacaagcatgttttccacctacccatctgtacaccataacatctgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggttagtca 28040956  T
Q  401 ggaagttcacag 412  Q
    ||||||||||||    
T  28040955 ggaagttcacag 28040944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 411
Target Start/End: Original strand, 34644451 - 34644855
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| |||     || ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  34644451 aagcgggcaacaaactgcgccgctagacttttttggatggcaaaatcaa-----tcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattgat 34644545  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca 201  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||    
T  34644546 atgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgtaggttgtca 34644645  T
Q  202 gaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  34644646 gaacacgctttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggttgcttgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaaa 34644745  T
Q  302 cccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcag 401  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| |||||||||| ||||||   ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34644746 ccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccagcccatccatacaccataacatccgcatacctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcag 34644845  T
Q  402 gaagttcaca 411  Q
     |||||||||    
T  34644846 aaagttcaca 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29169940 - 29169610
Alignment:
Q  82 ctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggta 181  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  29169940 ctaggagacatgacattgctgtgcatgaccttttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggta 29169841  T
Q  182 taaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacc 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29169840 taaaagcatgttgattgtcagaacacgttttctcgtgtttggccaccttacttgacacaactttaagggctgtctgtcctacggtaaaaggcccgacacc 29169741  T
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatctt 381  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29169740 taatccca-aagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacctatccgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatctt 29169642  T
Q  382 ctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29169641 ctttctagcgggtcagtcaggaagttcacagg 29169610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 161 - 413
Target Start/End: Original strand, 19035486 - 19035738
Alignment:
Q  161 aagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcc 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19035486 aagtgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgccc 19035585  T
Q  261 tacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatcc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||    
T  19035586 tacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaactggtgaaatcccagtcaagtctacacaagcatgtgttccacctacccatccgtacaccaaaacgtcc 19035685  T
Q  361 gctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
     |   |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19035686 acatacctgagtgttgatcttttatctagtgggtcggtcaggaagttcacagg 19035738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 45659819 - 45659493
Alignment:
Q  56 tcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggga 155  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  45659819 tcctcgtaaacacgacatttattgacctaggagacatgacattgctatgcatgatcttttgaactctat--agaaggtcaacagcctctggtgataggaa 45659722  T
Q  156 gtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagctttt-agggctgc 254  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  45659721 atcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcgtgtttggccaccttacttgacgcagcttttaagggctgc 45659622  T
Q  255 ctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccata 354  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||| |||    
T  45659621 atgtcctacggtaaaaggcccgatacctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacgcatgcatgttttcctcctacccatctgtacactata 45659522  T
Q  355 aaatccgctggcctgagtgttgatcttct 383  Q
    | ||  ||  |||||||||||||||||||    
T  45659521 acatgtgcatgcctgagtgttgatcttct 45659493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20260015 - 20259667
Alignment:
Q  6 gggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgc 105  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||| |||||| ||||  |  || ||||||| ||||| ||||||    
T  20260015 gggcaacaaactgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaatccata-----taaacacaacatttattaacttatgagacatgacattactatgc 20259921  T
Q  106 acaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaac 205  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |  | |||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20259920 atgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaacaataaatggtataaaaacatgttgattgtcagaac 20259821  T
Q  206 acgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccca 305  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20259820 acgctttctcatttttaaccactttgcttgacgtagcttttagggctacctgttttccggtaaaaggtctgacacctaatcccacaagcggtaaaaccct 20259721  T
Q  306 agtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatcc 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20259720 agtcatgtctacacatgcatgtttttc-cctacccatctgtacaccataacatcc 20259667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Original strand, 22346779 - 22347169
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||     ||||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  22346779 caagcggacaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaactaa-----tcctcgtgaacacaacattcataaacctaggagacatgacatttc 22346873  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22346874 tatgcatgaccttttgaactctgtgtagaaggtcaacaacctctgctactaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaaaggtataaacgcatgttgattgtc 22346973  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  22346974 agaacacgctttctcatatttggccactttgcttgacataactttta-ggttgtttgtcctacggtaaaaagtccgaaatctaat-ccacaagtggtgaa 22347071  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    || | | ||||||||||| ||||||||||||                ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22347072 acaccaatcaagtctacagaagcatgttttc----------------caccataacgtctgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtca 22347155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Original strand, 2764367 - 2764686
Alignment:
Q  5 cgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatg 104  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| |||     || ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  2764367 cgggtaacaagctgcgccgctaaacctttttggatggtaaaatcaa-----tcatcgtaaacacaacatttatggacctaagagacataacattgatttg 2764461  T
Q  105 cacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaa 204  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  2764462 cataaccctttggactttatgtagaaggtcaacaacctctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagaaaatggcataaaagcatgttgattgtcggaa 2764561  T
Q  205 cacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||| |||||| ||||||  ||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||     
T  2764562 cacgttttctcatgtttgaccactttgtctgacacaacttttaggactgcctatcctaccataaaagcaccaacccctaaacccacaagtggtgaaacct 2764661  T
Q  305 aagtcaagtctacacaagcatgttt 329  Q
     | ||||||  ||||| ||||||||    
T  2764662 caatcaagttcacacatgcatgttt 2764686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31737476 - 31737256
Alignment:
Q  76 atggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaa 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||  | || |||||||||||| |||    
T  31737476 atggatctaggaaacataacattgatatgcatgaccttttgaactctatgtagaatgtcaatagcctctaatgctagaaaatcgaaagtgtcaaaaacaa 31737377  T
Q  176 atggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtcc 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | || ||| ||||||||||     
T  31737376 atggtataaaagcatgttgattgtcagaatatgttttctcatgtttggccactttgcttgacgccgcttttagggccgtttatcttaccgtaaaaggtct 31737277  T
Q  276 gacacctaatcccacaagtgg 296  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  31737276 gacacctaatctcacaagtgg 31737256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21472887 - 21473121
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||| | ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21472887 caagcgggcaataagttgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccag-----tcctcctgaacgcaacattcatggacctaggagacatgacattgc 21472981  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |     |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21472982 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgcaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtc 21473081  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21473082 agaacacgctttctcatgtttggccattttacttgacgca 21473121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4862165 - 4861863
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||| | ||| | |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | || || |||    
T  4862165 caatcctcgtaatcacaacattcatggatctaagggacgtgacattgttatgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacttttggtgttag 4862066  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  4862065 gaaatcgaaagtgtcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgcttgtcagaagacgctttctcatgtttgaccattttacttgacgcaacttttaaggct 4861966  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    | |||||||||  |||| |    ||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||| || ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  4861965 gtctgtcctaccataaatgtcaagacccctaatccaacaagtggtgaaacaccagtcaaatccacacatgcatgtttttctcctacccatccgtacacca 4861866  T
Q  353 taa 355  Q
    |||    
T  4861865 taa 4861863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 362
Target Start/End: Original strand, 2898666 - 2898931
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    ||||||| | |||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2898666 gagacatgatattgttatgcatgatcttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtatcaaaagcaaatggtataaa 2898765  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacg----ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacc 281  Q
    | | |  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |        |||||||| ||||||||    
T  2898766 aac-tattgattgtcagaacacgctcactttctcatgtttggccactttgcttgatgcatcttttagggttgcat--------gtaaaaggcccgacacc 2898856  T
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgc 362  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||      ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2898857 taatcacacaagtggtgaaacccaaatcaagtctaaac------gttttcctcatacccatccgtacaccatgacatccgc 2898931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 47459613 - 47459751
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47459613 caattctcgtaaacacaacatttatagacttaggagacataacattgctatgcatattcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatactag 47459712  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatg 191  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47459713 gaagccaaaagtatcaaaagcaaatggtataaaaacatg 47459751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24177734 - 24177526
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||     ||||||| || |||||| | ||||| |||||||| || |||||||    
T  24177734 caagcgggcaacaagctgcaccgctagacctttttggttggcaaaaccaa-----tcctcgtgaacacaacattcatggacctaggagatatgacattgc 24177640  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  24177639 tatgcatgactttttgaactctatgtagaaggtaaacagcctctgatgctaggaaaccgaaactgtcaaaaacaaatggtataaaaatatgttgattgtc 24177540  T
Q  201 agaacacgctttct 214  Q
     | |||| ||||||    
T  24177539 ggtacacactttct 24177526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 271
Target Start/End: Original strand, 16500034 - 16500183
Alignment:
Q  122 tatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgttt 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||| | ||||| || |||    
T  16500034 tatgtagaaggtcaacagcctctaatgctaggaagtcaaaagtgtcaaaagcaaatagtataaaggcatgttaattgttagaacatgttttcttatattt 16500133  T
Q  222 ggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  16500134 ggccactttacgtgacgcaacttttaggattgtctgtcctaccgtaaaag 16500183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25375904 - 25375675
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | || |||    
T  25375904 caaaagtgtcaatagcaaatggtataaaaacatgttgatggtaagaacatgttttgtcatgtttggtcactttgcttgacgcaacttttggagttgtctg 25375805  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaa 357  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||||||| || ||| || ||||||  ||||| || || |  |||||||||||   |||||||||||| ||||||| |    
T  25375804 tcctaccgtaaaagctctgacccctaatccgacgagtagtgaaaccctggtcaaatccacgcttgcatgttttccttctacccatccgtataccataaca 25375705  T
Q  358 tccgctggcctgagtgttgatcttctatct 387  Q
    || || | ||| |||||  |||||||||||    
T  25375704 tctgcagacctaagtgtcaatcttctatct 25375675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50161536 - 50161375
Alignment:
Q  113 tttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtc---aaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgc 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |  ||| || |||||||||| ||||||| |    ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50161536 tttgaactctatgtagaatgtcatcaacctttggtgctagggagccaaaagtatataaaaaaaaaaatgatataaaagcatgttgattgtgagaacacgc 50161437  T
Q  210 tttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  50161436 tttctcatgtttgtccactttgcttgacgcaacttttagggttgtctgtcctaccgtaaaag 50161375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 407
Target Start/End: Original strand, 42919856 - 42920144
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||  |||| || | |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  42919856 actctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgttgattgtgagaacacg-tttctcat 42919954  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctac 317  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||   |||||| |||||| | ||||||||| ||| || ||| |  | ||||| | ||    
T  42919955 gtttggccgctttgtttgatgcaacttttagggttgtttgtcctatcataaaagctccgacccgtaatcccacgagtagtgaaatctcaatcaagcccac 42920054  T
Q  318 acaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
    ||||  ||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||| | |||||||||| ||| | |||| || |||| ||||||    
T  42920055 acaaatatgttttcctcctacccatctgtacaccttaacatctgcaagcctaaatgttgatcttttatttagtggatcggtcatgaagtt 42920144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 37932372 - 37932038
Alignment:
Q  74 ttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagc 173  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |   |||  |||| || ||||| ||||||  |||||| ||||||| || | ||||||| ||||      
T  37932372 ttatggacctatgagacatgacattactatgcacgaatgtttaaactcaatatagaatgtcaacatcctctggtgctaggaagccgaaagtgtaaaaaaa 37932273  T
Q  174 aaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggt 273  Q
     |||  | ||||| || | ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  37932272 taataatgtaaaaacacgttgattgtcagaacac-ctttctcgtatttgaccattttgcttgacacaacttttagggctgtctgtcttactgtaaaagcc 37932174  T
Q  274 ccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtg 373  Q
      | | |||||||||||||||||| |||||  | ||||||| || || ||||||||||| | |  ||||  ||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  37932173 ttggcccctaatcccacaagtggtgaaacctcaatcaagtccacgcatgcatgttttcctcctgtccatatgtacatcataacatccgcaggcctaagtg 37932074  T
Q  374 ttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    | ||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  37932073 tcgattttctatctaatgggtcggtcagaaagttca 37932038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Original strand, 38731545 - 38731704
Alignment:
Q  58 ctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagt 157  Q
    |||||||| |||| | | ||||| ||||||| ||| |||||  | ||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||| | ||     
T  38731545 ctcgtaaacacaatattcatggacctaggagtcatgacattattgtgcatgaccctttgaactctatgtagaaggttaacaacctctggtgctaagaagc 38731644  T
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38731645 caaaagtttcaaaagcaaattgtataaaagtatgttgattgtcagaacacgctttctcat 38731704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 355
Target Start/End: Original strand, 37200019 - 37200214
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||    
T  37200019 caaaagtgtaaaaa-caaatggtataaaaacatattgattgttagcacatgctttcttatgtttgaccactttacttgacgtaacttttatggctgcatg 37200117  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataa 355  Q
    |||||  ||||||| ||||   | ||||||||| |||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||  |||| ||||||    
T  37200118 tcctattgtaaaagctccggtccttaatcccacgagtggtgaaacatcagtcaagtc-acacatgcatgttttcctcttacccattggtaccccataa 37200214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50314745 - 50314605
Alignment:
Q  108 aaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac 207  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||  | |||  || |||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  50314745 aaccctttgaactctatgtagaaagtcaacaacatcttgtgttaggaaataaaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaagcatgttgattgtgagaacaa 50314646  T
Q  208 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  50314645 gttttgtcatgtttgaccactttgctttatgcagctcttag 50314605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 868624 - 868575
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  868624 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa 868575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18616322 - 18616162
Alignment:
Q  60 cgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtca 159  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||| || |||||| |||||||||||  ||| |||| | | ||||||||| |||||| ||||| | ||||||  ||||     
T  18616322 cgtaaatacaatatttatggacctaagatacataatattgctatgcatgaccctttgaattatatgtagaatgtcaacagcctcgggtgctagaaagtcg 18616223  T
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa-gcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtt 220  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  18616222 aaagtgttaaaaacaaatggtataaaacacatgttgattatc-gaacacgttttctcatgtt 18616162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 250
Target Start/End: Original strand, 23043929 - 23044005
Alignment:
Q  174 aaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttaggg 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23043929 aaatggtataaaagcatgttgattgtgagtacttgttttctcatatttggccactttgcttgatgcagctttgaggg 23044005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 48841304 - 48841169
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||     |||||||||| | || | | || ||| ||||||||||||||||  |    
T  48841304 aagcggacaacaagttgcgctgctagacttttttggattgcaaaatcaa-----tcctcgtaaacataatattcatagatttaggagacataacattatt 48841210  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcct 142  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48841209 atgcataactctttagactctatgtagaaggtcaactgcct 48841169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 236
Target Start/End: Original strand, 36486922 - 36487000
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  36486922 caaaagtgtcaaaagcaaattatataaaaagatattgattgtcaaaacacgctttctcatatttgaccactttacttga 36487000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 5453979 - 5454028
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5453979 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatgacaaaaccaa 5454028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7213127 - 7213176
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7213127 caagcgggcaacaagttgcgccgctagacctttttggatggtaaaaccaa 7213176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35387710 - 35387653
Alignment:
Q  179 gtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35387710 gtataaaagcttgttgatcgtcagaacacactttttcatgtttggccactttgcttga 35387653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Original strand, 15584909 - 15584988
Alignment:
Q  157 tcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||  ||||||||||||    
T  15584909 tcaaaaatgtcaaacgcaaatggtatagaaacatgttgattgtcagaatacgttttccaatgtttgatcactttgcttga 15584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 30688441 - 30688534
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||     ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||| ||||||    
T  30688441 caagcgggcaacaagctgcgccgctaggcctttttggat-----aacaaaaccaatcctcgtaaacacaacattcatggacccaggagtcatgacattg 30688534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 1114091 - 1114042
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1114091 caagcgggcaacaagctgtgccgttagacctttttggatggcaaaaccaa 1114042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 19035371 - 19035412
Alignment:
Q  9 caacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19035371 caacaagctgcgccgctagacctttttggatgacaaaaccaa 19035412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 21934262 - 21934310
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  21934262 aagcaggcaacaagctgcgccgctaaccctttttggatggcaaaaccaa 21934310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 35310332 - 35310739
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || || | || ||||||||||||||||||     | |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||     
T  35310332 caagcgggcaacaagctgcgtcgttaaacctctttggatggcaaaaccaa-----ttctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattga 35310426  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35310427 tatgcaaaaccctttggactctatgtagaaggttaacagcctctgatgccaggaagccgaaagtgtcaaaagcagatggtataaaagcatgttgattgtc 35310526  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  35310527 agaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcatcttttagggttgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaa 35310626  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35310627 accccaatcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacatcataacatccgcaagcctaagtgttgatcttctatctagtgggtcagtta 35310726  T
Q  401 ggaagttcacagg 413  Q
    |||||||||||||    
T  35310727 ggaagttcacagg 35310739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 27336626 - 27336984
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336626 caatccttgtaaaaacaacattcatggacttaggagacataacattgctatacataaccatttt--ctctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 27336723  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27336724 gaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagtatgttgattgtcagaacacgatttctcatgtttgaccactttgcttgacgcaacttttagggct 27336823  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    | ||||||||  |||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  27336824 gtctgtcctattgtaaaagcccccacccctaaacccacaagtggtgaaaccccagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacacca 27336923  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27336924 taacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcacagg 27336984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13167133 - 13166726
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||  || ||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13167133 caagtgggcaacaagctgcgccgctagatctttttggat-----aacagaatcaatcatcgtaaacccaacattcatggacctaggagacataccattgc 13167039  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13167038 tatgcataaccctttggactctatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 13166939  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacct-aatcccacaagtggtaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| || |||||||  |  || | | ||  ||||||||||| |    
T  13166938 agaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgacgcagattttagggttgtctgtcccaccgtaaaagccctaacccataaaatccacaagtggtga 13166839  T
Q  300 aacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtc 399  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13166838 aaccc-agtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtagaccataacatccgcatgcttaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtc 13166740  T
Q  400 aggaagttcacagg 413  Q
    || |||||||||||    
T  13166739 agaaagttcacagg 13166726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33692275 - 33691877
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||| | |||| | ||| | ||| ||||||||||||||     
T  33692275 caagcaggcaacaagctgcgccgctagatctttttggatggaaaaaccaaa-------tcgtaaacagaacattcatgaacctatgagacataacattgt 33692183  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33692182 tatgcatacccttt-ggacactatgtagaaggtcaacagtctctgatgctaagaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtacaaaagcatgttgattgtc 33692084  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  33692083 ataacacgttttgtcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttaggcctgcctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaa 33691984  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  || ||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  33691983 acctcagtcaagtccacacatgcatgttttcctccaacccatccgtacaccataacatttgcaggcttaagtgtcgatcttctatctag-gggtcagtca 33691885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 32269973 - 32269622
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||  ||| |||||||||||  |||||  ||||||    
T  32269973 caatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaacttcatgcagaaggtcaacaacctctagtgctag 32269874  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  32269873 gaaatcgaaagtatcaaaagcaaatggtataaaagcgtgttgattgtcagaacacactttctcatgtttgaccactttggttgatgcagcttttagggtt 32269774  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32269773 gcatgtcctaccataaaaggcccgacacctaattccagaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacacca 32269674  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaa 404  Q
    ||| ||| || |   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32269673 taacatctgcagatttgagtgttgatcttctatctagtgggtcagttaggaa 32269622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 14423591 - 14423913
Alignment:
Q  21 ccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggact 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||| || || ||||   ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |  |||||    |||    
T  14423591 ccgctagatctttttggatggcaaaaccaa-----tccttgtgaacacaat--ttatggacctaagagacatgacattgttatgaattacctta---act 14423680  T
Q  121 ctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423681 ctatgtagaaggtcaacagcctctgatgctagg-ag---aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtt 14423776  T
Q  221 tggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacaca 320  Q
     || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  14423777 cggtcactttgcttgacgcattttttagggttgcctgtcctacggttaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtgaaaccccaatcaagtcttcaca 14423876  T
Q  321 agcatgttttccacat-acccatccgtacaccataaa 356  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14423877 agcatattttccacctaaaccatccgtacaccataaa 14423913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26212763 - 26212398
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||||||| | || |||||| | |||||  |||||||||||| ||||| || ||  || ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  26212763 aaaccaatcctcatgaaaacaacattcatggacttaggagacataatattgccatacatgacattttgaactctatgtagaaggttaatagcctctggtg 26212664  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||| | |    |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26212663 ctaagaaactgaaagggtaaaaaacaaatggtataaaagcatgttgatcgtcagaatacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttag 26212564  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagca-tgttttccacatacccatccgta 347  Q
      |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||| |||||    
T  26212563 aactgccattccaacgataaaaggtccaacacctaatctcacaagtgatgaaaccccagtcaaatctacacatgcatttttttccacctagccacccgta 26212464  T
Q  348 caccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26212463 caccatcacatctgcatgcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagtcaggaagttcacagg 26212398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15292201 - 15291842
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||  | |||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||   |||||  ||||||    
T  15292201 caatcctcataaacacaacattcatggacctaggagatgtgacattgctatgcatgaccttttgaacttt-tgtagaagatcaataacctctagtgctag 15292103  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
      |   |||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |    
T  15292102 aaaactaaaagtgtaaaaaacaaattgtataaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttggccactttgtttgacgccacttttagggtt 15292003  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    | ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  15292002 gtctgtcataccgcaaaaggcccgacacttaatccaacaagtggtgaaacctcattcaagtctacacaaacatgttttcctcctacccagccgtacacca 15291903  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  15291902 taacattcgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtgggtcagttgggaagttcacagg 15291842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37873814 - 37873596
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    |||||||| |||| |||||| | || || |||| || ||| |||||| | ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  37873814 caatcctcttaaacacaacattcatagacctagaagtcatgacattgttctgcatgaccctttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgctag 37873715  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37873714 gaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaacttttagagct 37873615  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  37873614 gtctgtcctaccgtaaaag 37873596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25663248 - 25663009
Alignment:
Q  8 gcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcac 107  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||||     || || ||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||     
T  25663248 gcaacaagctgcgtcgttagacctttttggatg-----acaaagccaatcctcgtaaactcaacattcatggacctaggggacataacattgatatgcat 25663154  T
Q  108 aaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacac 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  25663153 aaccctttggactctatgtagaagatcaacaacttctgatgctaggaagctgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaacatgttgattatcagaacac 25663054  T
Q  208 gctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25663053 gctttctcatgtttggccactttgtttgatgcagcttttagggct 25663009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 399
Target Start/End: Original strand, 34335268 - 34335614
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||| | |||| || |||  | |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  34335268 caatcatcgtaaacacaatatttatgggtctaggagacatgagattgttacgcatgatccgttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgtcag 34335367  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
      |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |    
T  34335368 aaagtcgaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaagcatgttgattgtcaggacacgctttctcatgtttggcccttttgcttgacatggcttttagggtt 34335467  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    | || |||||| ||||||| |  ||| | |||||| ||||||| || ||||| ||| || || ||||| ||||||||||| | ||| |||  ||||||||    
T  34335468 gtctatcctacagtaaaagctttgacccttaatcctacaagtgatagaaccccagtgaattccacacatgcatgttttcctcctactcatttgtacacca 34335567  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtc 399  Q
    ||| ||  ||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34335568 taacatatgcaagcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtc 34335614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 430533 - 430686
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  430533 caatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacataacattactatgcataaccctttggaatctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctat 430632  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaaca 206  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  430633 gaagacaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaaca 430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 42921582 - 42921845
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||| |||| | |||||||  |||||||||| ||||||     
T  42921582 caagtgggaaacaagctgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa-----tccttgtaaacacaata-ttatggacttaggagacatgacattgt 42921675  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42921676 tatgcatgaccttctgaactctatgtagaaggccaacaacctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcataagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 42921775  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaa 270  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||  | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42921776 agaacacgttttctcgtgtttgaccaccatacttaacgtagtttttagggctgcctgtcttacggtaaaa 42921845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 412
Target Start/End: Original strand, 43129576 - 43129823
Alignment:
Q  164 tgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctac 263  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||    
T  43129576 tgtcaaaagcaaatggtagaaaaacatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgaccactttgcttgacgcatcttttaggactgaatgtccaac 43129675  T
Q  264 ggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgct 363  Q
     ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |  ||||| |||| |||||| | || ||||||||||| ||||| ||| ||     
T  43129676 cgtaaaagttccgacccctaatccaacaagtggtgaaaccccagtcaatttcacacatgcat-ttttcctcctatccatccgtacatcataacatctgca 43129774  T
Q  364 ggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacag 412  Q
     |||| ||||| |||||||||||| || | ||||| || ||||||||||    
T  43129775 tgcctaagtgtcgatcttctatctagtagatcagtaagaaagttcacag 43129823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3114234 - 3113981
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  3114234 caaaagtgtcaaaaacaaatggtataaaaacatgttgactgtcagaacatgctttctcatgtttggccactttgtttgatgcaacttttagggctgcctg 3114135  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaa 357  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||| | |  || ||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  3114134 tcctaccgtaaaagccccgacccctaatcccatgagtggtgaaatactggtcaagtctacaaatgagtg-tttcctcttacccatttgtacaccataaca 3114036  T
Q  358 tccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    || ||  | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  3114035 tctgcatgactaagtgttgatcttctatctagtggg-cagtcggcaagttcacagg 3113981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 355
Target Start/End: Original strand, 35455963 - 35456189
Alignment:
Q  129 aaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccact 228  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35455963 aaggtcaacatcctctggtgctaggaagccaaaattgtcaaaagcaaaaggtataaaagcatgttgattgttagaacacgctttctcatgtttgaccatt 35456062  T
Q  229 ttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgtt 328  Q
    || ||| || || ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||    
T  35456063 ttacttaacacaactttttgggctacctaccctaccgtaaaaggccggacccctaatcctacgagtggcaaaaccccggtcaagtccacacatgcatatt 35456162  T
Q  329 ttccacatacccatccgtacaccataa 355  Q
    | || | |||||||| |||||||||||    
T  35456163 tacctcctacccatctgtacaccataa 35456189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 410
Target Start/End: Original strand, 433371 - 433580
Alignment:
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||| |||||||  || || | ||| |||||| ||||| ||    
T  433371 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacacagcttttaaggttgtctatcctaccgtaaaagcccctacccttaaacccacaggtggtgaa 433470  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtca 400  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  433471 accccggtcaagtccacacatgcatattttcctccaacccatctgtacaccataacatccgcatgcctaagtgtggatcttctatttagtgggccagtca 433570  T
Q  401 ggaagttcac 410  Q
    | ||||||||    
T  433571 gaaagttcac 433580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 38875567 - 38875773
Alignment:
Q  50 aaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgc 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||||||  |||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||    
T  38875567 aaccaatcatcgtaaacacaaca-tcattgacctaggagacaagacattgttatgcatgaccttttgaactctacgtagaaggtcagcagcctctggtgc 38875665  T
Q  150 tagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagg 249  Q
    |||| ||   |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||    
T  38875666 taggaagctgaaagtgtcaaaaacaaatggtacaaaaacatgttgattgtcagaacacactttctcatgtttggtcgctttgtttgatgcagtttttagg 38875765  T
Q  250 gctgcctg 257  Q
    | ||||||    
T  38875766 gttgcctg 38875773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2566318 - 2566194
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||     |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  2566318 caagtgggcaacaagttgcgccgctagacctttttggatggcaaaatcaa-----tcctcgtaaacacaacattgatggatctaggagacatgacattgc 2566224  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaa 130  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2566223 tatgcatgaccttttgaactctatgtagaa 2566194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43115568 - 43115383
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||| || || | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43115568 actctacgtagaaggtcaacaatctctggtgttacgaagtcagaagtgtcaaaagcaaatgctatgaaagcatgttgattgtcaaaacacgctttctcat 43115469  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
     |||| || ||||  || ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||  |||||||||  |||||| ||||||    
T  43115468 atttgaccgcttt-atttacgcaacttttagggctgtctatcctaccgtaaaagccccgacctctaatcccatgagtggtgaaaccc 43115383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22188835 - 22188687
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22188835 aaaccaattctcgtaaacacaacattcatgaatctaggagacatgatattgttatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtg 22188736  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgatt 197  Q
    |||   | || |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  22188735 ctaaaaaatcgaaagtgtcaaaaacaaatagtataaaatcatgttgatt 22188687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 304
Target Start/End: Original strand, 8100548 - 8100734
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||  ||  ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||    
T  8100548 actctacgtagaaggtcaacaacctctagtggaaggaagttgaaagtgtcacaaacaaatggtataaaagcatgtaaattgtcacaacacgttttctcat 8100647  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  | ||||  ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  8100648 gtttgaccattttacttgatgcagcgtttagggatgcatgtcctactattaaagtcccgactcttaatcccacaagtggtgaaaccc 8100734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32230578 - 32230444
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctg 257  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||    
T  32230578 caaaagtgtcgaacgcagatggtataaaagcttgttgattgtcagaacacattttctcatgtttggtcactttgcttgacgcaacttttaaagctacttg 32230479  T
Q  258 tcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
    || ||| ||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32230478 tcttaccgtaaaagttctgacccctaatctcacaa 32230444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 411
Target Start/End: Original strand, 38446267 - 38446455
Alignment:
Q  225 cactttgcttgacgcagctttt--agggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||||||  || || ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| |    
T  38446267 cactttgcttgacgcagcttttttagggatgcatgtcataccgtaaaagccccaactcctaaacccacaagtggtgaaacctcagtcaagtccacacatg 38446366  T
Q  323 catgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  38446367 catgttttactccaacccatccgtacaccataacatttgcatgcctaagtgtcgatattctatctagagggtcagtcagaaaattcaca 38446455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9841274 - 9841146
Alignment:
Q  282 taatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatcc-gtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatct 380  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  9841274 taatcccacaagtggtgaaaccctactcaagtttacacacgcatgtttttcttctacccatcccgcacaccataacatccgcaggcctaagtgtcgatct 9841175  T
Q  381 tctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9841174 tctatctagtaggtaagtcaggaagttca 9841146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 8858969 - 8859065
Alignment:
Q  175 aatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaag 271  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| || |||||||    
T  8858969 aatgatataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttgactactttgcttgacgcagttttgtgggttgcttgtcccaccgtaaaag 8859065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9829426 - 9829280
Alignment:
Q  155 agtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgc 254  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||      
T  9829426 agtcaaaagtgtcaaatataaatggtataaaagcatgttgattgtcaaaacacattttatcatg-ttagccactttgctt-acgcaacttttagggctat 9829329  T
Q  255 ctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacc 303  Q
    || || |||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  9829328 ctatcttactataaaagatccgactcctaatcttacaagtggtgaaacc 9829280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Original strand, 14436525 - 14436605
Alignment:
Q  147 tgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccacttt 230  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14436525 tgctaggaagtcaaaggtgtcaaaaacaaatgatataaaaacatgttgatt---agaacacgttttttcatgtttggccacttt 14436605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 11005762 - 11005811
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  11005762 caagcgggcaacaagctgcgccgctaagcctttttggatggcaaaaccaa 11005811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Original strand, 13307317 - 13307470
Alignment:
Q  83 taggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  | || ||| ||||| |||| || ||||||   |||| || |||||  |||||||||||| || ||||| |||||    
T  13307317 taggagaaataacattgttacgcatgatctattgaactctttgtaaaatgtcaacaatctctaattctaggatgtcaaaagtgtcgaacgcaaaaggtat 13307416  T
Q  183 aaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttga 236  Q
    |||| |||| |||| || |||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  13307417 aaaaacatgttgatagtaagaatacactttctcatgtttgaccattttacttga 13307470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14723361 - 14723269
Alignment:
Q  112 ttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaa 204  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||  ||||||||||||   |  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14723361 ttttgaactttaagtataaggtcaacaacctctgatgctaaaaaaccaaaagtgtaaaaaacaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaa 14723269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2917584 - 2917524
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaa 65  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  2917584 caagcaggcaacaaactgcgccgctagacctttttggatggcaa----aaaccaatcctcgtaaa 2917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23423980 - 23423920
Alignment:
Q  120 tctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggt 180  Q
    ||||||||||||||||||  | | ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23423980 tctatgtagaaggtcaacaacatttgatgttaggaagttgaaagtgtcaaaagcaaatggt 23423920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45819 - 45489
Alignment:
Q  87 agacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45819 agacataacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaagaaaccgaaagtgtcaaaaacaaatggaataaaa 45720  T
Q  187 gcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatc 286  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45719 gcatgttgattgtcagaacacgttttctcatgtttgatcactttgcttgatgcagcttttagagctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatc 45620  T
Q  287 ccacaagtggtaaaac-----ccaa---gtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgat 378  Q
    ||||||||||| ||||      |||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  45619 ccacaagtggtgaaacacctgtcaagctgtcaagtctacacaagcatgttttccatctacccatccgtacaccatcacatctgcaggcctgagtgttgat 45520  T
Q  379 cttctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45519 cttctatctagtgggtcagtcagaaagttca 45489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 411
Target Start/End: Original strand, 34304427 - 34304785
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  34304427 caatcctcgtaaatacaacattcatagacctatgagacatgatattgctatgcataactctttggactctatgtagaaggtcaacatcatctgatgctag 34304526  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34304527 gaagcccaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggttattttgcttgacgcagcttttagggct 34304626  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
      |||||| || |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  34304627 agctgtccaaccgtaaaagccccgactcctaaacccacaagtggtgaaaccccaatcaagtccacacatgcatgttttcctccagcccatccgtacacca 34304726  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34304727 taacatccgcaggcctaagtgtcgatcttctatctagtgggtcagtcagaaagttcaca 34304785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17249528 - 17249202
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||| | ||| |  ||||||||||||||||||    
T  17249528 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaaaccaa-----tcctcgtaaacacaacattcatgaacttaggagacataacattgc 17249434  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17249433 tatacataatcctttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctaggaagccaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 17249334  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||  || || || || ||||||| |||| ||    
T  17249333 agaacacactttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagggttgtttgtcctaccgtaaaagcgcccactccgaaacccacaaatggtgaa 17249234  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttcc 332  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17249233 accccagtcaagtccacacatgcatattttcc 17249202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33220934 - 33220553
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||     |  |||||||  ||||| | ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  33220934 caagcggccaacaagctgcgccgctagaccttttaggatggcaaaaccaa-----ttatcgtaaacgcaacattcatggacctagaagacacaacattgc 33220840  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33220839 tatgcataaccctttggactatatgtagaaggtcaacaacctcggatgctaggaagccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 33220740  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaa 300  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  33220739 aacacacgctttctcatgtttggccactttgcttgatgcagcttttagagctgtctgtcctaccgtaaaagccccgacccctaaacccacaagtggtgaa 33220640  T
Q  301 acccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatct 387  Q
    |||| |||||| |  ||||| ||||||||||| |  || |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  33220639 accccagtcaaattcacacatgcatgttttcctccaactcatccgtacatcataacatctgcaggcctgagtgtcaatcttctatct 33220553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 49 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4206776 - 4206415
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| || | | | || || ||||| ||||| ||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  4206776 aaaccaatcctcgtaaacactatattcattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtg 4206677  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttag 248  Q
    ||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  4206676 ctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgacgccacttttaa 4206577  T
Q  249 ggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtac 348  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  ||||    
T  4206576 ggctgcatgtcctaccgtaaaaggtctgatgcctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacatgcatgttttcctccaacccatttgtac 4206477  T
Q  349 accataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcac 410  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  4206476 accataacatccgcaggcttgagtgttgatcttttatctagtgggtcaatcaagaagttcac 4206415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 357891 - 357535
Alignment:
Q  54 aatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagg 153  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||    
T  357891 aatcttcgtaaacacaacattcatggacctaggagagataacattgctatgcttaatcatttggactctatgtagaaggtcatcaacctctaatgttagg 357792  T
Q  154 gagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctg 253  Q
     |  ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  357791 aaa-caaaagtgttaaaaacaaaggttataaaagcatgttcattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgaagcttttagggctg 357693  T
Q  254 cctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccat 353  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||    
T  357692 cctgtcctaccgtaaaagcaccgacccctaaacccacaagtggtgaaactccagtcaagtccacacatgcatgttttgctccaacccatccatacaccat 357593  T
Q  354 aaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
    || ||| ||   ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  357592 aacatctgcatacctaagtgtcgatcttctatctagtgtgtcagtcaaaaagttcaca 357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 959512 - 959833
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  959512 caatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacaacattgctatgcatgaccttttgaact-tacgtagaaggtcaacaacctctggtgctag 959610  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  | ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  959611 gaaaccgaaaatgtcaaaaacaaatggtataaagacatgttgattgtcagaacacgttttctcatggttagccactttgcttgacacaacttttagggtt 959710  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||      
T  959711 gtttgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaacttcaatcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacactg 959810  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgtt 375  Q
    ||| ||||||  |||||||||||    
T  959811 taacatccgcatgcctgagtgtt 959833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 209 - 411
Target Start/End: Original strand, 32115776 - 32115978
Alignment:
Q  209 ctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  32115776 ctttctcatgtttggccactttgtttgacgcaacttttaaggctgcatgtcctaacgtaaaatgcccgacacctaatcccataagtgatgaaaccccggt 32115875  T
Q  309 caagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttc 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32115876 caagtctacacatgcatgttttcctcctactcatctgtacaccataacatccgcaggcctgagtgttgatcttctatctagtaggtcagtcaggaagttc 32115975  T
Q  409 aca 411  Q
    |||    
T  32115976 aca 32115978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29338255 - 29337903
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| | ||||  ||| |||| ||  ||||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  29338255 caatccttgtaaacacaacattcatggacctaggagtcatgacattgatgtgcatgaccctttgaaccatatgtagaaggtcaacgatctctggtgctag 29338156  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| |  |    
T  29338155 gaagtcagaagtgtcaaaagcaaatggtataagagcatgttgattgttagaacacgttttctcatgtttggcagctttgcttgacacatcttttatgatt 29338056  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacacca 352  Q
    |  |||||||| |||||||  |||||  |||||    | ||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  29338055 gtttgtcctaccgtaaaagccccgaccactaat----cgagtggtaaaacctcgatcaagtccacacatgcatgttttcctcctacccatctgcacacca 29337960  T
Q  353 taaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    ||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  29337959 taacatctgcaggcctaagtgtcgaacttctatctagtgggtcaatccagaagttca 29337903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 353
Target Start/End: Original strand, 34415408 - 34415667
Alignment:
Q  94 acattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgat 193  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | || || |||| |  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  34415408 acattgctatgcatgaccatttgaactctatatagaaggtcaactgcatttggtgttaggaaacctaaagtgtcaaaaacaaatggcataaaagcatgtt 34415507  T
Q  194 gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaag 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||| ||  |    
T  34415508 gattgtcagaacacactttctcatgtttcgccattttgcttgacgcagcttgtaaggatgcctatcctaccgtaaaagtcctgacccctaatccaacgtg 34415607  T
Q  294 tggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccat 353  Q
    |||| |||||| | ||||||  ||| | | ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34415608 tggtgaaaccccaatcaagttcacaaatgtatgttttcctcctacccatccatacaccat 34415667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 413
Target Start/End: Original strand, 12401384 - 12401622
Alignment:
Q  175 aatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtc 274  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||  |    
T  12401384 aatggtatataagcatgttgattagcaaaacacgctatcttatgtttggccactttgtttgacgcaacttttagtgctgcttgtcctaccataaaagccc 12401483  T
Q  275 cgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgt 374  Q
     ||  | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  || | | | ||| |    
T  12401484 tgaaccataatcccataagtggtgaaaccccaatcaagtctacacatgcatgttttcctcctacccatccgtacaccataacatttgcagacttaagtct 12401583  T
Q  375 tgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12401584 tgatctgctatctagtaggtcagtcaggaagttcacagg 12401622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4166102 - 4165919
Alignment:
Q  49 aaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatg 148  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||| || ||||| ||||| ||||||  |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  4166102 aaaccaatcctcgtaaacactatatttattgacctaggtgacatgacattgtcatgcatgaccttttaaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtg 4166003  T
Q  149 ctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgc 232  Q
    ||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4166002 ctaggaacccgaaagtgtcaaaagcaaatgatataaaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgc 4165919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 375
Target Start/End: Original strand, 28543413 - 28543628
Alignment:
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 259  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  28543413 aaagtgtcaaaatcaaatagtataagagcatagtgattttcaaaacacgatttctcatgtttggccactttgcttgacgcgacttttaaggctgcctgtc 28543512  T
Q  260 ctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatc 359  Q
     ||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |||    
T  28543513 ttaccgtaaaagtcctgacctctaatcccacaagtggtgaaacctcagtcaaatccacacatgcatgttttcctcctatccatctgtacatcataacatc 28543612  T
Q  360 cgctggcctgagtgtt 375  Q
     ||  |||||||||||    
T  28543613 tgcatgcctgagtgtt 28543628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28009061 - 28008903
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgat---gattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |   |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28009061 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaaccatattcttgattgttagaacaagctttctcatgtttgaccgctttgcttgacgtagcttttagggttgc 28008962  T
Q  255 ctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagt 313  Q
     |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  28008961 atgtcctaccgtaaaagccccgacccctaatcccacgagtggtgaaactccagtcaagt 28008903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 34168913 - 34169017
Alignment:
Q  167 caaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  34168913 caaaagcaaatggtataaaagcatgttgcttgtccaaacatgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcaaattttagggttgcatgtcctacggt 34169012  T
Q  267 aaaag 271  Q
    |||||    
T  34169013 aaaag 34169017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34554420 - 34554202
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    ||||||| | |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||    
T  34554420 gagacatgatattgctatacatgaccttttaaactctatgtagaaagtcaatagcatctggtgctaggaagccgaatgtgtcaaaagtaaatggtataaa 34554321  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaat 285  Q
    | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||  ||||||  | ||  ||||||    
T  34554320 aacatcttgattatcagaacacgctttctcatgtttggtcgttttgcttgacgcaacttttagtgttgtctgacctactttaaaagccctgatccctaat 34554221  T
Q  286 cccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    ||||||| |||| ||||||    
T  34554220 cccacaattggtgaaaccc 34554202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 28625831 - 28626070
Alignment:
Q  17 tgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||     ||  |||||| |||||| | || || ||| |||| || |||| | ||||||  ||||||||    
T  28625831 tgcgccgctagatctttttgaatggcaaaatcaa-----tctccgtaaacacaacattcatagacctatgagatatgacat-gttatgcatgaccttttg 28625924  T
Q  117 gactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagca-tgatgattgtcagaacacgctttctc 215  Q
     ||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||| | |  ||||||| |||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||    
T  28625925 aactttatgtagaagctcaacaacctctggtgctaggaaattgaaagtgtaaaaaacaaatggtataaaaaaaatgttgattgtcagaacacgttttctc 28626024  T
Q  216 atgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcct 261  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28626025 gtgtttagccaccttacttgacgcagctttaagggctgcctatcct 28626070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13398352 - 13398189
Alignment:
Q  59 tcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtc 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| || | | |||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||| ||||    
T  13398352 tcgtaaacacaacatttatgcatctagaagtcgtgacattgttatgcatcatcttttgaactctatgtagaatgtcaacaacttctgatgttaggaagtc 13398253  T
Q  159 aaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttg 222  Q
    |||| | ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  13398252 aaaaatatcaaaagtaaatagtataaaaatatgttgattgtcggaacatgctttttcatatttg 13398189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20693610 - 20693419
Alignment:
Q  219 tttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctaca 318  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |  ||| |||| ||||||| || |||  |||||||||| |||||| ||||||   ||||||  |||    
T  20693610 tttggccactttgtttgatgcaacctttagggccgtatgttctactgtaaaagctcagacctctaatcccacgagtggtgaaaccctgatcaagttcaca 20693511  T
Q  319 caagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcaca 411  Q
      |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||||| || ||||| |||  |||||||||    
T  20693510 -tagcatgttttcctcctacccatctgtacaccataatatctgcaggcctaagtgtggatcttttatctagttggtcaatcaaaaagttcaca 20693419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Original strand, 3714913 - 3715042
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||||||||| ||||  | || || ||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  3714913 actctatgtagaagatcaagagtctttggtgctaagaagtcaaaagtgtcaaaaacagatgatataaaaacatgttaattgtgagaacacgttttctcat 3715012  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagctttta 247  Q
    ||||  ||| |||| ||||| || ||||||    
T  3715013 gtttaaccattttgtttgacacaactttta 3715042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 296
Target Start/End: Original strand, 24016298 - 24016510
Alignment:
Q  83 taggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtat 182  Q
    |||||||||| |||||  | ||||  ||| |||| |||||||||| ||  |||||  | |||| ||||||| |  ||||| | |||| ||||||||||||    
T  24016298 taggagacatgacattcttgtgcatgaccctttgaactctatgtaaaaaatcaacaacatctggtgctaggaaaccaaaactatcaatagcaaatggtat 24016397  T
Q  183 aaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacct 282  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||| ||| |||||| || || |||| || |   |||||  ||||| |||    
T  24016398 aaaaacatgttgattgtgagaacaagctttctcatgtttgactattttacttgatgcaacttttacggttgtctgt-cttcccaaaaagccccgactcct 24016496  T
Q  283 aatcccacaagtgg 296  Q
    ||||||||||||||    
T  24016497 aatcccacaagtgg 24016510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 137
Target Start/End: Original strand, 32115649 - 32115733
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaac 137  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32115649 caatcatcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgttatgcatgaccttttgaactctttgtagaaggtcaac 32115733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3137466 - 3137370
Alignment:
Q  5 cgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatg 104  Q
    ||||||||||| ||| | ||||   |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3137466 cgggcaacaagttgcactgctaagcctttttggatggcaaaa-----ccaatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacatgacattgctatg 3137372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7749365 - 7749414
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7749365 caagcgggcaacaagctgcaccgctagaccttttaggatggcaaaaccaa 7749414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Original strand, 6225108 - 6225190
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgca 240  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  6225108 caaaagtgtcaaacacaaatgacatataagcatgttgattgtcacaacaaaatttctcatgtttgaccactttatttgacgca 6225190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Original strand, 22985885 - 22986015
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    |||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||| || ||||| |||||||  ||| | |||||||    
T  22985885 gagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacacaagtagtataaa 22985984  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctca 216  Q
    || | | |||||| || |||| | |||||||    
T  22985985 agtacgttgattgccataacatgttttctca 22986015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23802509 - 23802379
Alignment:
Q  86 gagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaa 185  Q
    |||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||| || ||||| |||||||  ||| | |||||||    
T  23802509 gagatataacatggctatgtatgaccttttggactctatatagaaggtaaacaacctatgatgttaggtagccaaaaatgtcaaacacaagtagtataaa 23802410  T
Q  186 agcatgatgattgtcagaacacgctttctca 216  Q
    || | | |||||| || |||| | |||||||    
T  23802409 agtacgttgattgccataacatgttttctca 23802379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Original strand, 28543297 - 28543398
Alignment:
Q  17 tgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttg 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||     |||||||| |||| | || | ||||||| |||||| ||||||||||| | | ||  ||||||||    
T  28543297 tgcgccgctagatcttttcagatggcaaaac-----caatcctcttaaacataatatttatggacctaggaaacataacattgttttacatgaccttttg 28543391  T
Q  117 gactcta 123  Q
    |||||||    
T  28543392 gactcta 28543398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 34168805 - 34168897
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattg 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||     |||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34168805 caagcgggcgacaagttgcgccgctaggcctttttggatagcaaaaccaa-----tcctcgtaac-acaacattcatggatctaggagtcatgacattg 34168897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 406 - 2
Alignment:
Q  2 aagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgct 101  Q
    |||| |||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||     |||||||||| |||||  | || |||||||||||||| ||||||||    
T  406 aagccggcaacaagatgcgccacaaagcctttttggatggcaaaactaa-----tcctcgtaaacacaacgttcatcgatctaggagacatgacattgct 312  T
Q  102 atgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtca 201  Q
    ||| |  || ||||| ||| |||| |||||||||||  ||| || | ||||  |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  311 atgtatgactttttgaactttatgcagaaggtcaacaacctttggtactagaaaaccaaaagtgtcaaacacaaatggtataaaagcatgttgatggtca 212  T
Q  202 gaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaa 301  Q
     ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  211 taacccactgtctcatgtttggccactttgcttgacgcagtttttagggctgcctgtcctacagtaaaaggcccgacacttaatcccacaagtggtgaaa 112  T
Q  302 cccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcag 401  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  111 ccccagtcaagtctatacatgcatgttttcctcctacccatccgtacatcataacatccgcgggcctgcgtgttgatcatctatctagtgggtcagtcag 12  T
Q  402 gaagttcaca 411  Q
    ||||||||||    
T  11 gaagttcaca 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 6279 - 6542
Alignment:
Q  67 acaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgt 166  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    |||||||    
T  6279 acaacattcatggacctaggagacatgacattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaactgaaagtgt 6378  T
Q  167 caaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggt 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6379 caaaagcaaatggtatagaagcatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttacttgacgcaacttttagggctgtctgtcctacggt 6478  T
Q  267 aaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttc 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6479 aaaaggtccgac-cctaatcccacaagtggtgaaaccccagtcaagtctacacaagcatgttttc 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 33181 - 33541
Alignment:
Q  53 caatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctag 152  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  33181 caatcctcgtaaacacgacgttcatggacctaggagacataaaattgctatgcatgaccttttgaactctatgtagaaggtcaacaacctctggtgttag 33280  T
Q  153 ggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggct 252  Q
    | |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||| || |    
T  33281 gaaaccgaaaatgtcaaaagtaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacacgctttctcatgtttagccactttgcttgatgccac-tttaaggtt 33379  T
Q  253 gcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagc--atgttttccacatacccatccgtacac 350  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| | |||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  33380 gcctgtcctaccgtaaaaggcccgacacctaatcccataagtggtgaaaccccaatcaagtttgcacatgcatatgttttcctcctacccatccgtacac 33479  T
Q  351 cataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttcacagg 413  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  33480 cataacatccgcatgcctgagtgttgatcttctatctagtagg-cagtcaagaagttcacagg 33541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 102990 - 103274
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||  ||||||     
T  102990 caagcgggcaacaagttgcgccgctagacctttttggatggcaaaac-----caatcctcgtaaacacaacattcatggacctaggagacacgacattgt 103084  T
Q  101 tatgcacaaccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtc 200  Q
    ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  103085 tatgcatgaccttttgagctcgatgtagaaggtcaacagcctctggtgctaggaaaccgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgtc 103184  T
Q  201 agaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccaca 291  Q
    || |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  103185 ag-acacgctttctcgtgtttggccatcttacttgacgcagctttgagggctgcctgtcctacggtaaaaggcccgacaccttatcccaca 103274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Original strand, 10364 - 10546
Alignment:
Q  126 tagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgat----tgtcagaacacgctttctcatgttt 221  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| || ||||||||    
T  10364 tagaaggtcaacaacctctggtgctaggaagccacaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgttgattgattgtcagaacacgcattatcatgttt 10463  T
Q  222 ggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaaccc 304  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  || || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  10464 ggccattttacttgacgcaacttttagggctgcttgtccaactgtaaaagccccaacccctaatcccacgagtggtgaaaccc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 409
Target Start/End: Original strand, 19916 - 20008
Alignment:
Q  317 cacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagttca 409  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||  | || || |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  19916 cacatgcatgttttcctcctacctatccgtacaccataacatctacaggtctaagtgttcatcttctatctagtgggtcagttaagaagttca 20008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 49444 - 49622
Alignment:
Q  155 agtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgc 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  49444 agtcgaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcacgttgattgtcagaacacgatttctcacatttgaccactttgtttgatgcaacttttagggctgc 49543  T
Q  255 ctgtcctacggtaaaag----gtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgtttt 330  Q
     ||||   | | |||||    | ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  49544 ttgtctagctgcaaaagctctgaccgacccctaatcccacaagtagtgaaactcaa-tcaagtccacacatgcatgtttt 49622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18475 - 18187
Alignment:
Q  118 actctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcat 217  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||  |||| || | |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18475 actctatgtagaaggttaacaatctctactgcttggaaatcaaaagtgtcaaaagcagatgacataaaaacatgttgattgtgagaacacg-tttctcat 18377  T
Q  218 gtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctac 317  Q
    |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||   |||||| |||||| | ||||||||| ||| || ||| |  | ||||| | ||    
T  18376 gtttggccgctttgtttgatgcaacttttagggttgtttgtcctatcataaaagctccgacccgtaatcccacgagtagtgaaatctcaatcaagcccac 18277  T
Q  318 acaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatccgctggcctgagtgttgatcttctatctggtgggtcagtcaggaagtt 407  Q
    ||||  ||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||| | |||||||||| ||| | |||| || |||| ||||||    
T  18276 acaaatatgttttcctcctacccatctgtacaccttaacatctgcaagcctaaatgttgatcttttatttagtggatcggtcatgaagtt 18187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47608 - 47383
Alignment:
Q  160 aaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtc 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |   ||||    
T  47608 aaagtgttaaaagcaaatggtataaaaatatgttaactgtcagaacacattttctcatgtttggccattttacttgacgcaacttttaggtttatttgtc 47509  T
Q  260 ctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaagtggtaaaacccaagtcaagtctacacaagcatgttttccacatacccatccgtacaccataaaatc 359  Q
    |||| |||||||   | |  |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||  |||| |||| | ||||| |||  ||||||||||| ||     
T  47508 ctaccgtaaaagtctcaatccctaatcccacaagtggtgaaaccccaatcaagtccacacttgcatttttttctcatactcatttgtacaccataacatt 47409  T
Q  360 cgctggcctgagtgttgatcttctat 385  Q
     ||   ||| ||||||||||||||||    
T  47408 tgcatccctaagtgttgatcttctat 47383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 16191 - 16307
Alignment:
Q  179 gtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgac 278  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||| |||||     
T  16191 gtataaaaacatgtttattgtcagaacatgttttctcatgtttggccattttgtttgacgcagcttttagcgttgtctgtcctactataaaagttccgat 16290  T
Q  279 acctaatcccacaagtg 295  Q
     |||||||| |||||||    
T  16291 ccctaatccaacaagtg 16307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 7496 - 7701
Alignment:
Q  10 aacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaaaccaatcctcgtaaagacaacacttatggatctaggagacataacattgctatgcacaa 109  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||     | |||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| |||||  ||||||  |    
T  7496 aacaagctgtgccgttagatctttttggatgacaaaaccaa-----tactcgtaaacataacattcatggacctatgagacatgacatta-tatgcatga 7589  T
Q  110 ccttttggactctatgtagaaggtcaactgcctctgatgctagggagtcaaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgc 209  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||   |||||  |||||| |    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  7590 ccttttgaacgctatgcaaaaggtcaacaatctctggagctaggaaactgaaagtgtcaaaagcaaatggtttaaaatcatgttgattgtgagaacacgc 7689  T
Q  210 tttctcatgttt 221  Q
    ||||||||||||    
T  7690 tttctcatgttt 7701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8587 - 8525
Alignment:
Q  158 caaaagtgtcaaaagcaaatggtataaaagcatgatgattgtcagaacacgctttctcatgtt 220  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  8587 caaaagtgttaaacgcaaatggtataaaaacatgttgattgtcagaacatgttttctcatgtt 8525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 6772 - 6821
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaaaccaa 50  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6772 caagcgggcaacaagctgcggcgctagacctttttggatggcaaaaccaa 6821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 5208 - 5252
Alignment:
Q  1 caagcgggcaacaagatgcgccgctagatctttttggatggcaaa 45  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5208 caagcgggcaacaagctgcgccgctagacctttttggatggcaaa 5252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4366 - 4278
Alignment:
Q  203 aacacgctttctcatgtttggccactttgcttgacgcagcttttagggctgcctgtcctacggtaaaaggtccgacacctaatcccacaa 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| || ||| || ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  4366 aacacgttttctcatgtttggccactctgtttgacgtagcttttacgactgtctatccaaccgtaaatgg-ccgacacctaatctcacaa 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University