View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12348_high_1 (Length: 576)

Name: NF12348_high_1
Description: NF12348
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12348_high_1
NF12348_high_1
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (11-376)||(16726198-16726563)
chr6 (43-554)||(14652627-14653135)
chr6 (43-134)||(12760067-12760158)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (11-557)||(137474-138020)
scaffold0011 (11-557)||(142698-143244)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (11-557)||(20748601-20749147)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (43-554)||(6772829-6773337)
chr8 (43-554)||(34211043-34211551)
chr8 (11-58)||(25040381-25040428)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (43-515)||(129741-130210)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16726563 - 16726198
Alignment:
Q  11 gaacctgtgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgc 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16726563 gaacctatgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgcattttatttcgaaatgagtatgc 16726464  T
Q  111 atcattagataagtgtcctaaatgcggtgcatcacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagattt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16726463 atcattagataagtgtgctaaatgcggtgcatcacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtgctatggtactttccaatagtaccaagattt 16726364  T
Q  211 aggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaagcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726363 aggcgcatgtatcttaatgcagaagatgcaaagcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 16726264  T
Q  311 aatgggaaaaaattgatcatgattaccaagattttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726263 aatgggaaaaaattgatcatgattaccaagattttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcat 16726198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14653135 - 14652627
Alignment:
Q  43 attggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgcatcattagataagtgtcctaaatgcggtgcat 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||| || |||||||||||||   ||  |    
T  14653135 attggcatgagttatgaaaagatacacgcttgtcctaacgattgcattttgtttcgaaatgaatacgcattgttaaatgagtgtcctaaatgtaatgtct 14653036  T
Q  143 cacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagatttaggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaa 242  Q
    | ||||||||   |||||||      || || |||||  |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||  ||||||||    
T  14653035 ctcgatataa---gaaagaatttattcctgcgaaagtcgtatggtatcttcctataataccgagattcaggcgcatgtttagtagtgaagttgatgcaaa 14652939  T
Q  243 gcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctcaatgggaaaaaattgatcatgattaccaagat 342  Q
     || |||||||||||  ||||||  ||  ||  |||||| | | |||| || ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |  |||    
T  14652938 acatttgacatggcacaaatatgatagaattagagatgggaagtttcggcaccctgcagattcgccacagtgggctaaaattgatcatgattatcctgat 14652839  T
Q  343 tttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattcagagtagtaagcacactacttggccggtgatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||      | ||    ||||| ||||||     
T  14652838 tttgggaaagaagcaagaaatctacgcttggcactgtctactgatggaatgaacccacatggttttcaaagtatcccaaataccgtatggcctgtgattt 14652739  T
Q  443 tgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatctctggtccctctgaaccggggaatgatataga 542  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||| || | |||||||| ||||| | |  | |||| ||||||||||| ||    
T  14652738 tggtgatttataacttgcctccatggttatgtatgaagcgtaagttcatgatgttgtcgatgttaatttctgggcgcaatcaaccagggaatgatattga 14652639  T
Q  543 catatacttggc 554  Q
    | | ||||||||    
T  14652638 cgtgtacttggc 14652627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 134
Target Start/End: Original strand, 12760067 - 12760158
Alignment:
Q  43 attggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgcatcattagataagtgtcctaaatg 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  12760067 attggcatgagttatgaaaaaatacacgcttgtcctaacgattgcattctgttttgaaatgaatacgcatcgttagatgagtgtcctaaatg 12760158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 557
Target Start/End: Original strand, 137474 - 138020
Alignment:
Q  11 gaacctgtgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgc 110  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  137474 gaacctatgaggctaaacgattgttatgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtccaaatgattgcattttatttcaaaatgagtatgc 137573  T
Q  111 atcattagataagtgtcctaaatgcggtgcatcacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagattt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  137574 atcattaaatatgtgtcctaaatgtagcgcttcacgatataagaagaaagaaacaggtccatccaaagtgctatggtattttccaataataccaagattt 137673  T
Q  211 aggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaagcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137674 aggcgcatgtatcgtaatgcggaagatgcaaagaacttaacatggcatgcaaatgaaagggttaatgatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 137773  T
Q  311 aatgggaaaaaattgatcatgattaccaagattttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattca 410  Q
    ||||||  ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  137774 aatgggccaaaattgataatgactactcagattttgggaaagaaacaagaaacctacgtcttgcattgtctactgacggaataaaccctcatggtcttca 137873  T
Q  411 gagtagtaagcacactacttggccggtgattatgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatc 510  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  137874 aagtggtaagcacactacttggccagtgattttgctgatttataacctacctccatggctatgcatgaagcgcaagttcatgatgttgactatgttaatt 137973  T
Q  511 tctggtccctctgaaccggggaatgatatagacatatacttggctcc 557  Q
    ||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  137974 tctgggcccacacaaccaggaaatgatatagacatatacttggctcc 138020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 557
Target Start/End: Original strand, 142698 - 143244
Alignment:
Q  11 gaacctgtgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgc 110  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  142698 gaacctatgaggctaaacgattgttatgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtccaaatgattgcattttatttcgaaaggagtatgc 142797  T
Q  111 atcattagataagtgtcctaaatgcggtgcatcacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagattt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  142798 atcattaaatatgtgtcctaaatgtagcgcttcacgatataagaagaaagaaacaggtccatcaaaagtgctatggtattttccaataataccaagattt 142897  T
Q  211 aggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaagcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  142898 aggcgcatgtatcgtaatgcggaagatgcaaagaacttaacatggcatgcaaatgaaagggttaatgatggaatacttcgacatcctacagattctcctc 142997  T
Q  311 aatgggaaaaaattgatcatgattaccaagattttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattca 410  Q
    ||||||  | ||||||| |||| |||   |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  142998 aatgggccataattgataatgactactcggattttgggaaagaaacaagaaacctacgtcttacattgtctactgatggaataaaccctcatggtcttca 143097  T
Q  411 gagtagtaagcacactacttggccggtgattatgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatc 510  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  143098 aagtggtaagcacactacttggccagtgattttgctgatttataacctacctccatggctatgcatgaagtgcaagttcatgatgttgactatgttaatt 143197  T
Q  511 tctggtccctctgaaccggggaatgatatagacatatacttggctcc 557  Q
    ||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  143198 tctgggcccacacaaccaggaaatgatatagacatatacttggctcc 143244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 557
Target Start/End: Original strand, 20748601 - 20749147
Alignment:
Q  11 gaacctgtgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgc 110  Q
    |||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20748601 gaacctatgaggctaaacgattgttatgttctattggcatgagttatgagaagatacatgcttgtccaaatgattgcattttatttcaaaatgagtatgc 20748700  T
Q  111 atcattagataagtgtcctaaatgcggtgcatcacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagattt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20748701 atcattaaatatgtgtcctaaatgtagcgcttcacgatataagaagaaagaaacaggtccatccaaagtgctatggtattttccaataataccaagattt 20748800  T
Q  211 aggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaagcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20748801 aggcgcatgtatcgtaatgcggaagatgcaaagaacttaacatggcatgcaaatgaaagggttaatgatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctc 20748900  T
Q  311 aatgggaaaaaattgatcatgattaccaagattttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattca 410  Q
    ||||||  ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20748901 aatgggccaaaattgataatgactactcagattttgggaaagaaacaagaaacctacgtcttgcattgtctactgacggaataaaccctcatggtcttca 20749000  T
Q  411 gagtagtaagcacactacttggccggtgattatgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatc 510  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||     
T  20749001 aagtggtaagcacactacttggccagtgattttgctgatttataacctacctccatggctatgcatgaagcgcaagttcatgatgttgactatgttaatt 20749100  T
Q  511 tctggtccctctgaaccggggaatgatatagacatatacttggctcc 557  Q
    ||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20749101 tctgggcccacacaaccaggaaatgatatagacatatacttggctcc 20749147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 554
Target Start/End: Original strand, 6772829 - 6773337
Alignment:
Q  43 attggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgcatcattagataagtgtcctaaatgcggtgcat 142  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   ||  |    
T  6772829 attggcatgagttatgaaaggattcacgcttgtcctaacgattgcattttgtttcgaaatgaatatgcatcattaaatgagtgtcctaaatgtaatgtct 6772928  T
Q  143 cacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagatttaggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaa 242  Q
    | ||||||||   |||| ||      ||||| |||||  |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||  ||||||||    
T  6772929 ctcgatataa---gaaacaatttattccagctaaagtcgtatggtatcttcctataataccgagattcaggcgcatgtttagtagtgaagttgatgcaaa 6773025  T
Q  243 gcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctcaatgggaaaaaattgatcatgattaccaagat 342  Q
     || |||||||||||  ||||||  ||  ||  |||||| | | ||||||| ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |  |||    
T  6773026 acatttgacatggcacaaatatgatagaattagagatgggaagtttcgacaccctgcagattcgccacagtgggctaaaattgatcatgattatcctgat 6773125  T
Q  343 tttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattcagagtagtaagcacactacttggccggtgatta 442  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||      | ||    ||||| ||||||     
T  6773126 tttggaaaagaagcaagaaatctacgtttggcactgtctactgatggaatgaacccacatggttttcaaagtatcccaaataccgtatggcctgtgattt 6773225  T
Q  443 tgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatctctggtccctctgaaccggggaatgatataga 542  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| || | |||||||| ||||| ||   | |||| ||||||||||||||    
T  6773226 tggtgatttataacttgcctccatggctatgtatgaagcgtaagttcatgatgttgtctatgttaatttctgggcctaatcaaccagggaatgatataga 6773325  T
Q  543 catatacttggc 554  Q
    | | ||||||||    
T  6773326 cgtgtacttggc 6773337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34211551 - 34211043
Alignment:
Q  43 attggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgcatcattagataagtgtcctaaatgcggtgcat 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||   ||  |    
T  34211551 attggcatgagttatgaaaagatacacgcttgtcctaacgattgcattttgtttcgaaatgaatacgcatcgttaaatgagtgtcctaaatgtaatgtct 34211452  T
Q  143 cacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagatttaggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaa 242  Q
    | ||||||||   |||||||      || || |||||  |||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||| | ||| || ||  ||||||||    
T  34211451 ctcgatataa---gaaagaatttattcctgcgaaagtcgtatggtatcttcctataataccgagattcgggcgcatgtttagtagtgaagttgatgcaaa 34211355  T
Q  243 gcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctcaatgggaaaaaattgatcatgattaccaagat 342  Q
     || |||||||||||  ||||||  ||  ||  |||||| | | |||| || ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |  |||    
T  34211354 acatttgacatggcacaaatatgatagaattagagatgggaagtttcggcaccctgcagattcgccacagtgggctaaaattgatcatgattatcctgat 34211255  T
Q  343 tttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattcagagtagtaagcacactacttggccggtgatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||      | ||    ||||| ||||||     
T  34211254 tttgggaaagaagcaagaaatctacgcttggcactgtctactgatggaatgaacgcacatggttttcaaagtatcccaaataccgtatggcctgtgattt 34211155  T
Q  443 tgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatctctggtccctctgaaccggggaatgatataga 542  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||| || | |||||||| | ||| | |  | |||| ||||||||||| ||    
T  34211154 tggtgatttataacttgcctccatggttatgtatgaagcgtaagttcatgatgttgtcgatgttaatttatgggcgcaatcaaccagggaatgatattga 34211055  T
Q  543 catatacttggc 554  Q
    | | ||||||||    
T  34211054 cgtgtacttggc 34211043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25040428 - 25040381
Alignment:
Q  11 gaacctgtgaggctaaacagatgttacgttctattggcatgagttatg 58  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25040428 gaacctatgaggctaaacaaatgttacgttctattggcatgagttatg 25040381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 130210 - 129741
Alignment:
Q  43 attggcatgagttatgagaagatacatgcttgtcctaaagattgtattttatttcgaaatgagtatgcatcattagataagtgtcctaaatgcggtgcat 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||   ||  |    
T  130210 attggcatgagttatgaaaagatacacgcttgtcctaacgattgcattttgtttcgaaatgaatacgcatcgttaaatgagtgtcctaaatgtaatgtct 130111  T
Q  143 cacgatataataagaaagaaacagccccagccaaagtactatggtactttccgataataccaagatttaggcgcatgtatcgtaatgcagaagatgcaaa 242  Q
    | ||||||||   |||||||      || || |||||  |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||| || ||  ||||||||    
T  130110 ctcgatataa---gaaagaatttattcctgcgaaagtcgtatggtatcttcctataataccgagattcaggcgcatgtttagtagtgaagttgatgcaaa 130014  T
Q  243 gcacttgacatggcatgaatatggaagggttgcagatggaatgcttcgacatcctgcagattctcctcaatgggaaaaaattgatcatgattaccaagat 342  Q
     || |||||||||||  ||||||  ||  ||  |||||  | | ||||||| ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |   ||    
T  130013 acatttgacatggcacaaatatgatagaattagagatgagaagtttcgacaccctgcagattcgccacagtgggctaaaattgatcatgattatcctaat 129914  T
Q  343 tttgggaaagaagaaagaaatctacgtcttgcattgtctactgatggaataaaccctcatggtattcagagtagtaagcacactacttggccggtgatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||      ||||    ||||| ||||||     
T  129913 tttgggaaagaagcaagaaatctacgcttggcactgtctactgatggaatgaacccacatggttttcaaagtatcccaaacaccgtatggcctgtgattt 129814  T
Q  443 tgatgatttataacctgcctccatggctatatacgaagcgcaagtacatgatgctgacaatgttaatctctgg 515  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||| || | |||||||| |||||    
T  129813 tggtgatttataacttgcctccatggttatgtatgaagcgtaagttcatgatgttgtcgatgttaatttctgg 129741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University