View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF12394_low_1 (Length: 1320)
Name: NF12394_low_1
Description: NF12394
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF12394_low_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 1005; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 1005; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 37641522 - 37640225
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactc---- |
115 |
Q |
| |
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|||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
37641522 |
tttacttcctacactttctcactgtgcaaccaacatgacacctctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctaaaccggacg |
37641423 |
T |
|
| Q |
116 |
-tattttgcgt----gttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtc |
210 |
Q |
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|
| T |
37641422 |
atattttgtctagttgtccctctttttctttcaagacagaatcttggaaaaacaatacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtc |
37641323 |
T |
|
| Q |
211 |
agatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaac |
310 |
Q |
| |
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|
| T |
37641322 |
agatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaccaactcaac |
37641223 |
T |
|
| Q |
311 |
ttggcttttaatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggta |
410 |
Q |
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| T |
37641222 |
ttggcttttaataatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaaatgttacctcaatggta |
37641123 |
T |
|
| Q |
411 |
atattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttg |
510 |
Q |
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| T |
37641122 |
atattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttg |
37641023 |
T |
|
| Q |
511 |
gaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaat |
610 |
Q |
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| T |
37641022 |
gaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagtgtggatatgtcttccattacggagagctctttgtcaatgctaaagaat |
37640923 |
T |
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| Q |
611 |
ttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatt |
710 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
37640922 |
ttgtcatcctctttggtttctcttagtctacgaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatt |
37640823 |
T |
|
| Q |
711 |
tgtcatttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaat |
810 |
Q |
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| T |
37640822 |
tgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttgaacctccgtttatctgctttctcaggtgaaat |
37640723 |
T |
|
| Q |
811 |
tccttattccataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaa |
910 |
Q |
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| T |
37640722 |
tccttattccataggtcaattgaagtctcttactcaattagtcctttcagattgcaatttagatgggatggttcctctatctttgtggaacctcacccaa |
37640623 |
T |
|
| Q |
911 |
ctaacatatttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataata |
1010 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37640622 |
ctaacatatttggacctttcatttaataaacttaatggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgtgatcttggatttaata |
37640523 |
T |
|
| Q |
1011 |
actttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcact |
1110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37640522 |
actttagcggtagcatcccaattgtttatggaaatttaatcaaattggaatatttatcactttactttaacaacctaacaggccaagttccatcatcact |
37640423 |
T |
|
| Q |
1111 |
ttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtg |
1210 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37640422 |
ttttcatctacctcatctttctcatttatatttagcatataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcgcaaaacgttccaaattgagatatgtg |
37640323 |
T |
|
| Q |
1211 |
tttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |
|
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| T |
37640322 |
ggtttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagagttgtacctcagtgacaacaatctcacagg |
37640225 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 953; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 37713265 - 37711977
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactctat- |
118 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
37713265 |
tttacttcccacactttctcactgtgcaacaaacatgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaacccaatc |
37713166 |
T |
|
| Q |
119 |
-----tttgcgtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcaga |
213 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37713165 |
cgtactttggttgttcctctttttctttcaagacagaatcttggcaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcaga |
37713066 |
T |
|
| Q |
214 |
tcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttg |
313 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37713065 |
tcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttg |
37712966 |
T |
|
| Q |
314 |
gcttttaatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaata |
413 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37712965 |
gcttttaatcatttttcttggtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcaatggtaata |
37712866 |
T |
|
| Q |
414 |
ttccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaa |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||| |||| | ||||| |
|
|
| T |
37712865 |
ttccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttttgggg------atgtggaattgaaactaaatccattgacatggaa |
37712772 |
T |
|
| Q |
514 |
gaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttg |
613 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37712771 |
gaaactcattcataatgctactaatttaagggaactttatttggataatgtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttg |
37712672 |
T |
|
| Q |
614 |
tcatcctctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgt |
713 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37712671 |
tcatcctctttggtttctcttagtctacgagacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgt |
37712572 |
T |
|
| Q |
714 |
catttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattcc |
813 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37712571 |
catttaatcaaaaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttggtcctctcttcctctgctttttcaggtgaaattcc |
37712472 |
T |
|
| Q |
814 |
ttattccataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaacta |
913 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
37712471 |
ttattccataggtcaattgaagtctcttactcaattagtcctttcacattgcaattttgatgggatggttcctctatctttgtggaatctcacccaacta |
37712372 |
T |
|
| Q |
914 |
acatatttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataact |
1013 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37712371 |
acacatttggacctttcattgaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgttatcttgcatataataact |
37712272 |
T |
|
| Q |
1014 |
ttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttt |
1113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37712271 |
ttagcggtagcatcccaaatgtttatggaaatttaatcaaattgaaatatttagcactttcctctaacaacctaacaggccaagttccatcatcactttt |
37712172 |
T |
|
| Q |
1114 |
tcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgttt |
1213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37712171 |
tcatctacctcatctttctcatttatatttagcagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttcaaaattgagctatgtgttt |
37712072 |
T |
|
| Q |
1214 |
ttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37712071 |
ttggatgataacatgttaaatggaacaattccacagtggtgttattctttgccttcattgttagagttgggcctcagcgacaaccacctcacagg |
37711977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 949; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 37534741 - 37533453
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactctatt |
119 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534741 |
tttacttcctacactttctcactgtgcaacaaacatgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcagcacttcatctcaactctatt |
37534642 |
T |
|
| Q |
120 |
ttgcgtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgt |
219 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534641 |
ttgcgcgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgt |
37534542 |
T |
|
| Q |
220 |
gattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggctttt |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534541 |
gattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggctttt |
37534442 |
T |
|
| Q |
320 |
aatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattcctt |
419 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534441 |
aatcatttttcttggtcttcaatacctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcatactctgacctcagtggtaatattcctt |
37534342 |
T |
|
| Q |
420 |
ccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaact |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534341 |
ccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgcagaagtgggattgaaactcaattcgttcatttggaagaaact |
37534242 |
T |
|
| Q |
520 |
cattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcc |
619 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534241 |
cattcataatgctactaatttaagggaactttatttggataatgtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcc |
37534142 |
T |
|
| Q |
620 |
tctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcattta |
719 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37534141 |
tctttggtttctcttagtctatcagaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatcta |
37534042 |
T |
|
| Q |
720 |
atgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattccttattc |
819 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37534041 |
atgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttggtcctctctttctctgctttttcaggtgaaattccttattc |
37533942 |
T |
|
| Q |
820 |
cataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatat |
919 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37533941 |
cataggtcaattgaagtctcttactcaattagtcctttcattctgcaattttgatggaatggttcctctatctttgtggaacctcacccaactaacatat |
37533842 |
T |
|
| Q |
920 |
ttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataactttagcg |
1019 |
Q |
| |
|
||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |
|
|
| T |
37533841 |
ttggatctttcacataataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgtgatcttggattgaataactttagtg |
37533742 |
T |
|
| Q |
1020 |
gtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttttcatct |
1119 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37533741 |
ctagcatcccaaatgtttatggaaatttaatcaaattggaatatttatcactttcctctaacaacctaacaggccaagttccatcatcactttttcatct |
37533642 |
T |
|
| Q |
1120 |
acctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgtttttggat |
1219 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
37533641 |
acctcacctttctattttaggtttatcatataacaaactagttgggccaattccaattgaaatcacaaaacgttcaaaattgagctatgtgggtttgagt |
37533542 |
T |
|
| Q |
1220 |
gataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37533541 |
gataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagagttacacctcagcaacaaccacctcacagg |
37533453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 928; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 37595971 - 37594677
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactctat- |
118 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
37595971 |
tttacttcctacactttctcattgtgcaacaaacatgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaacccaatc |
37595872 |
T |
|
| Q |
119 |
-----tttgcgtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcaga |
213 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37595871 |
cgtactttggttgttcctctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcaga |
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Q |
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1113 |
Q |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
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Target Start/End: Complemental strand, 37825425 - 37824248
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|
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Q |
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aattgtttatggaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacaggccaagttccatcatcactttttcatctaccccacctt |
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|
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tctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgtttttggatgataacatgt |
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Q |
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|
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taaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgtta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 37399451 - 37400619
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|
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atctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactcattc |
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| T |
37400036 |
aaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttggtcctctcttcctctgctttttcaggtgaaattccctattccatag |
37400135 |
T |
|
| Q |
825 |
gtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatatttgaa |
924 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
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| T |
37400136 |
gccaattgaagtatcttactcgattagatttttcacggtgcaatttagatgggatggttcctctatctttgtggaacctcacccaactaacatatttgga |
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T |
|
| Q |
925 |
cctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataactttagcggtagc |
1024 |
Q |
| |
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| T |
37400236 |
cctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgtgatcttggatttaataactttagtagtagc |
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T |
|
| Q |
1025 |
atcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttttcatctacctc |
1124 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37400336 |
atcccaattgtttatggaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacaggccaagttccatcatcactttttcatctacctc |
37400435 |
T |
|
| Q |
1125 |
aactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgtttttggatgataa |
1224 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37400436 |
atctttctcatttatatttatcatctaacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttcaaaattgagctatgtgtttttgggtgataa |
37400535 |
T |
|
| Q |
1225 |
catgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagagttgtacctcagcaacaacaatctcacagg |
37400619 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 784; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 1282
Target Start/End: Complemental strand, 37437346 - 37436086
Alignment:
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16 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37437346 |
tcactttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaattcaaaaactcttttcttctcaacacttcatctcaaccc |
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T |
|
| Q |
116 |
tat------tttgcgtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgt |
209 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatccgtactttggttgtttctctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgt |
37437147 |
T |
|
| Q |
210 |
cagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaa |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37437146 |
cagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaa |
37437047 |
T |
|
| Q |
310 |
cttggcttttaatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggt |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37437046 |
cttggcttttaatcatttttctgagtcttcaatacctattggtattagtgatttagtgaaactcacacatctaaacctatcatactgtgacctcagtggt |
37436947 |
T |
|
| Q |
410 |
aatattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcattt |
509 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || | | ||| |||||||| ||||| | |
|
|
| T |
37436946 |
aatattccttccaaaatctctcatttgtcaaaattagtatcccttgatcttaacaatta-tgattct-----------ttggaactcaatccattcgcat |
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T |
|
| Q |
510 |
ggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaa |
609 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37436858 |
ggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatctgaatggagtgaaaatgtcttcaattggagagagctctttgtcgttgttaacgaa |
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T |
|
| Q |
610 |
tttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggat |
709 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37436758 |
tttgtcatcttctttggtttctcttagtctagcatccactcagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggat |
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T |
|
| Q |
710 |
ttgtcatttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaa |
809 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37436658 |
ttgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttgaacctccgtttatctgctttctcaggtgaaa |
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T |
|
| Q |
810 |
ttccttattccataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactca |
909 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ttccttattccataggtcaattgaagtctcttactcaattagaccttttaggttgcaattttgatgggatggttcctctatctttgtggaacctcactca |
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T |
|
| Q |
910 |
actaacatatttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataat |
1009 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37436458 |
actaacatatttggacctttcaagaaataaacttaacagtgagatttcaccattactttcaaacccctcacacctcatttattgtgaccttggatataat |
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T |
|
| Q |
1010 |
aactttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcac |
1109 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37436358 |
aactttagcggtagcattccaaatgtttatcaaaatttaaccaaattggaatatttatcactttcctccaacagcctaacaggccaagttccatcatcac |
37436259 |
T |
|
| Q |
1110 |
tttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgt |
1209 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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tttttcatctaccccacctttctcatttagatttatcatttaacaaactagttggcccaattccaattgaaattacaaaacgtttaaaattgagctatgt |
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T |
|
| Q |
1210 |
gtttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttg |
1282 |
Q |
| |
|
| | | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |
|
|
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 37704309 - 37703021
Alignment:
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20 |
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119 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
37704309 |
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T |
|
| Q |
120 |
ttgcgt------gttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcaga |
213 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
37704209 |
ttctgtctatgtgtttgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctga |
37704110 |
T |
|
| Q |
214 |
tcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttg |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
314 |
gcttttaatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaata |
413 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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T |
|
| Q |
414 |
ttccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtcc--gaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttgg |
511 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||||| || || | ||| | || | ||| |
|
|
| T |
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ctccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaaca--------tggaaattaatccgttgacatgg |
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T |
|
| Q |
512 |
aagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatt |
611 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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aagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagtgtggatatgtcttccattacggagagctcattgtcaatgctaaagaatt |
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T |
|
| Q |
612 |
tgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggattt |
711 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37703717 |
tgtcatcctctttggtttctcttagtctatcagaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggattt |
37703618 |
T |
|
| Q |
712 |
gtcatttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaatt |
811 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37703617 |
gtcattcaattataaccttagtggtcaacttccaaaatccaactggagctctcctctaagatacttgaacctctcttcctctgctttttcaggtgaaatt |
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T |
|
| Q |
812 |
ccttattccataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaac |
911 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
37703517 |
ccttattccataggtcaattgaagtctcttactcaattagacctttcacattgcaatttagatgggatggttcctctatctttgtggaatctcacccaac |
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T |
|
| Q |
912 |
taacatatttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataa |
1011 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37703417 |
taacatatttggacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgtaatcttgcatataataa |
37703318 |
T |
|
| Q |
1012 |
ctttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactt |
1111 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37703317 |
ctttagcggaggcatcccaattgtttatggaaatttaaacaaattggaatatttatcactttcctctaacaagctaacaggccaagttccatcatcactt |
37703218 |
T |
|
| Q |
1112 |
tttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgt |
1211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
37703217 |
tttcatctacctcacctttttattttaggtttatcatttaacaaactagttgggccaattccaattgaaatcacaaaacgttcaaaattgagctatgtgg |
37703118 |
T |
|
| Q |
1212 |
ttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37703117 |
gtttgagggataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcggcgacaaccacctcacagg |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 124 - 1028
Target Start/End: Original strand, 37391584 - 37392485
Alignment:
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223 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
224 |
ggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatg |
323 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |
|
|
| T |
37391684 |
gaactagacctcagttgcaacaatttgaatggtgatttacatcccaatagcactatctttcagcttagacaccttcaacaactcaacttgtctttaaatt |
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T |
|
| Q |
324 |
atttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccttccac |
423 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37391784 |
ttttttttgggtcttcattgcatgttggtattggtgatttagtgaatctcacatatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccctccac |
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T |
|
| Q |
424 |
aatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactgg---tccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactc |
520 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | | ||||| || |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
37391884 |
aatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcaattaccggcacttggaacaa---caactcaaacttgatacattgacatggaagaaactc |
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T |
|
| Q |
521 |
attcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcct |
620 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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attcataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagagtggatatgtattccattagagagagctctttgtctatgctaaagaatgtgtcatcct |
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T |
|
| Q |
621 |
ctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaa |
720 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| | | | || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
37392081 |
ctttggtttctcttaggctaggagaaattgggttgcaaggaaatttgtcaagtgccatcctctctttacctaatcttcaaagactagatttgtca---aa |
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T |
|
| Q |
721 |
tgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacct-ccgtttatctgctttctcaggtgaaattccttattc |
819 |
Q |
| |
|
| || | ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
37392178 |
taatgaacttagcggtaaacttccaaaatcaaactggagcactcctctaaggtacttggacctatctggcatc-actttctcaggtgaaattcccaaatc |
37392276 |
T |
|
| Q |
820 |
cataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatat |
919 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37392277 |
tataggccatttgaagtatcttactcaattagtcctttcatattgcaatttagatgggatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacacat |
37392376 |
T |
|
| Q |
920 |
ttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataactttagcg |
1019 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37392377 |
ttggacctttcacaaaataaacttaacggtgagatctcaccattatttttgaacctcaaacacctcattcattgtgatcttggatataattactttagcg |
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T |
|
| Q |
1020 |
gtagcatcc |
1028 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 1200
Target Start/End: Original strand, 37380842 - 37382034
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20 |
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Q |
| |
|
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| T |
37380842 |
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37380941 |
T |
|
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119 |
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207 |
Q |
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| T |
37380942 |
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37381041 |
T |
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208 |
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307 |
Q |
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| T |
37381042 |
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37381141 |
T |
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| Q |
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407 |
Q |
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| T |
37381142 |
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37381241 |
T |
|
| Q |
408 |
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507 |
Q |
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| T |
37381242 |
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37381341 |
T |
|
| Q |
508 |
ttggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaag |
607 |
Q |
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| T |
37381342 |
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37381441 |
T |
|
| Q |
608 |
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707 |
Q |
| |
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| T |
37381442 |
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37381541 |
T |
|
| Q |
708 |
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807 |
Q |
| |
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| T |
37381542 |
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37381641 |
T |
|
| Q |
808 |
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907 |
Q |
| |
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| T |
37381642 |
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37381741 |
T |
|
| Q |
908 |
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1007 |
Q |
| |
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| T |
37381742 |
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37381841 |
T |
|
| Q |
1008 |
ataactttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatc |
1107 |
Q |
| |
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| T |
37381842 |
ataactttagcggtagcatcccaaatgtttttgaaaatttaatcaaattagaatatttaggattctccggtaataatctaagtggcctagttccatcatc |
37381941 |
T |
|
| Q |
1108 |
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1200 |
Q |
| |
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| T |
37381942 |
actgtttaatctgactgagctttctcatctagatttaacaaataataaattagtaggtcctattccaactgaaatcactaaacattcaaaatt |
37382034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 37430374 - 37429486
Alignment:
| Q |
44 |
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137 |
Q |
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||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |
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| T |
37430374 |
tgcaagcatcatgacagttctgccttgttacaattcaagaattcattttttatcaacacttcatctcaacctggtttttggtctcactgttcctcttttt |
37430275 |
T |
|
| Q |
138 |
ctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcag |
237 |
Q |
| |
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| T |
37430274 |
ctttcaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgctgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacatcatgtacgattatgtgattggtctggaccttag |
37430175 |
T |
|
| Q |
238 |
ttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatgatttttctttgtct |
337 |
Q |
| |
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| T |
37430174 |
ttgcaacaatctgaacggtgaattagcggccaatagcaccatctttcaacttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatgattttttcgggtct |
37430075 |
T |
|
| Q |
338 |
tcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccttccacaatctctcatttgt |
437 |
Q |
| |
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| T |
37430074 |
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37429975 |
T |
|
| Q |
438 |
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529 |
Q |
| |
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| T |
37429974 |
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37429877 |
T |
|
| Q |
530 |
gctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggttt |
629 |
Q |
| |
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| T |
37429876 |
gctactaatttaagggagcttcatttgaatactgtggatatatctttaatcagagagagatctttgtcgctgctaaggaatttatcgtcctctttggtcg |
37429777 |
T |
|
| Q |
630 |
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725 |
Q |
| |
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||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||| |
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| T |
37429776 |
ctcttgatctatcaatcactggcttgcaagaaaattttccaagctagtgacatcctctctttaccaaatcttcaagaactagatttgtcttttaatgagg |
37429677 |
T |
|
| Q |
726 |
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825 |
Q |
| |
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| T |
37429676 |
accttagtgggaaacttccactgtccaactggagcactcccctaaggtacttggacctctcatacaccgccttctcggatgaaattccctattccatagg |
37429577 |
T |
|
| Q |
826 |
tcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaaca |
916 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| | || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37429576 |
caatttgaagtatcttacacatttaggcctttcaaactgtaatttctatgctgttcttcctctatctttgtggaacctcactcaactaaca |
37429486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 125 - 691
Target Start/End: Original strand, 37411939 - 37412504
Alignment:
| Q |
125 |
tgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattg |
224 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
37411939 |
tgttcctctttttctttgaaaacagattcttggaaaaataatacagattgttgcgagtggtatggtgtcatgtgcgacaccgttttggatcatgtgattg |
37412038 |
T |
|
| Q |
225 |
gtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatga |
324 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
37412039 |
gtttggaccttaggtgcaacaatcttaaaggtgaattacatctcaatagcactatcttcaaacttaaacaccttcaacgactcaac-tggcttttaatga |
37412137 |
T |
|
| Q |
325 |
tttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccttccaca |
424 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||| | || | || | ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |
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|
| T |
37412138 |
ttttttcaggtcttcggtgcatgatgatattagtgatttggtgaatctcacacatcttaatttatcaaacactggaatcatttgtaatattccttccaca |
37412237 |
T |
|
| Q |
425 |
atctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtcc---gaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactca |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||| | | ||||| || | |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
37412238 |
atctctcacttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagtaactgatacatggatcaa---aaactcaaacttgatcccttcacatggaaggaactca |
37412334 |
T |
|
| Q |
522 |
ttcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctc |
621 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37412335 |
ttcataatgttacaaatttaagcgagcttcatctgaatagtgttgatatgtcttccatcagagagaattctttgtcgctgctaaagaatttgtcatcctc |
37412434 |
T |
|
| Q |
622 |
tttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacct |
691 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
37412435 |
tctggtctctcttagtctagggaacactagtttgcaaggaaatttagcaagtgacattccctctttacct |
37412504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 738 - 972
Target Start/End: Original strand, 37412513 - 37412747
Alignment:
| Q |
738 |
aacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattccttattccataggtcaattgaagtc |
837 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37412513 |
aacttccaatgttcaactggagcactcctctaaggtacttggatctctctttaacttttttctcaggtgaaattccttattccataggtcagttgaagtc |
37412612 |
T |
|
| Q |
838 |
tcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatatttgaacctttcatttaat |
937 |
Q |
| |
|
||| | || ||| ||| || || |||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37412613 |
tctcaaccagttatcgcttaaagcatgtgatttgcatggattgattcctcaatctttatggaacctcactcaactaacacatttggacctttcatttaac |
37412712 |
T |
|
| Q |
938 |
aaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaa |
972 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
37412713 |
aaacttaacggtgaaatcccatcattactttcaaa |
37412747 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1093 - 1308
Target Start/End: Original strand, 37392484 - 37392699
Alignment:
| Q |
1093 |
ccaagttccatcatcactttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgt |
1192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
37392484 |
ccaagttccatcatcactttttcatctacccaacctttcttttttagatttatcatctaacaaactagttggcccaattccagttcaaatcacaaaacgc |
37392583 |
T |
|
| Q |
1193 |
tccaaattgagttatgtgtttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagca |
1292 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
37392584 |
tcaaaattgagcattgtgaatttaggttctaacatgtttaatggtacaattccgcagtggtgttattctttgccttcattaatagagttggacctcaatg |
37392683 |
T |
|
| Q |
1293 |
acaacaatctcacagg |
1308 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37392684 |
acaaccatctcacagg |
37392699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37825554 - 37825465
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatct |
109 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37825554 |
tttacttcctacactttctcactgtgcaacaaacatgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatct |
37825465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Original strand, 37399332 - 37399410
Alignment:
| Q |
30 |
acactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatc |
108 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
37399332 |
acactttctcactatgcaaccatcatgacacctctgccttgttacaattcaaaaattcattttttgttgacacttcatc |
37399410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1082 - 1274
Target Start/End: Complemental strand, 37429311 - 37429119
Alignment:
| Q |
1082 |
aacctaacgggccaagttccatcatcactttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaa |
1181 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
37429311 |
aacctaacaggccaagttccatcatcattgtttcatctaactcagctttctatgttagatttatcgtttaataaattagatggcccaattccgattcaaa |
37429212 |
T |
|
| Q |
1182 |
tcacaaaacgttccaaattgagttatgtgtttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgt |
1274 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| || | || ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37429211 |
tcaccaaattttccaagttaaattttgttcttttacaatctaacaacttaaacggaacaattccacactggtgttattccttgccttcgttgt |
37429119 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Original strand, 37391476 - 37391548
Alignment:
| Q |
36 |
tctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatc |
108 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37391476 |
tctcattgtgcaaccttcatgatagctctgccttgctacaattcaaaaactcattttttgtcaacacttcatc |
37391548 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1213 - 1270
Target Start/End: Complemental strand, 37343329 - 37343272
Alignment:
| Q |
1213 |
tttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcg |
1270 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
37343329 |
tttggacgataacatgttaaatggaaaaattctaaattggtgttttactttgccttcg |
37343272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37441573 - 37441499
Alignment:
| Q |
32 |
actttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatc |
108 |
Q |
| |
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||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37441573 |
actttctcactgtgaaacaaacatgacacctctgccttgttacaattcaaaaactc--tttcagtcaacacttcatc |
37441499 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Original strand, 37411825 - 37411883
Alignment:
| Q |
20 |
tttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatt |
78 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
37411825 |
tttacttcctacaccttctcattatgcaactatcatgacagctttgccttgttacaatt |
37411883 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1052 - 1170
Target Start/End: Original strand, 37412827 - 37412945
Alignment:
| Q |
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aaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagata |
1151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||||||||| | || || ||| |||| |||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |
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|
| T |
37412827 |
aaattagaatatttagatatttcctctaacaacattacaggtcaaattccctcatcattgttccatctagctcaactttcttatttagatttatcattta |
37412926 |
T |
|
| Q |
1152 |
acaaactagttggcccaat |
1170 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37412927 |
ataaattagttggcccaat |
37412945 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 667; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 667; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 1276
Target Start/End: Original strand, 16841394 - 16842651
Alignment:
| Q |
16 |
tcactttactacccacactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactc |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16841394 |
tcactttacttcacacactttgtcattctgcaaccaacatgacagctctgctttgttacatttcaaaaactcattttctgtcaacacttcatctcaactt |
16841493 |
T |
|
| Q |
116 |
tattttgcgtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatc |
215 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
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|
| T |
16841494 |
gatatt---tgttcctctacttctttcaagacaaaatcttggaaaaacggtacggattgttgcaagtgggatggtgtcacgtgtgacactgaatcagatt |
16841590 |
T |
|
| Q |
216 |
acgtgattggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggc |
315 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16841591 |
acgtggttggtttggacctcagttgcaacaatttgaaaggtgaattacatcccaatagcactatcctccagttaagacaccttcaacaactcaacttggc |
16841690 |
T |
|
| Q |
316 |
ttttaatgatttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatatt |
415 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
16841691 |
ttttaataatttttctgggtcttcaatgcctattggtattagcgatttagtgaatatcacacatctaaatctatcatactgtgacctcaatggtgacatt |
16841790 |
T |
|
| Q |
416 |
ccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaaga |
515 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
16841791 |
cactccacaatctctcatttgtcaaaattagtatctcttgatcttagcggttactcgtacgaaaaagtgggattgaaactcaattcgttcacttggaaga |
16841890 |
T |
|
| Q |
516 |
aactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtc |
615 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16841891 |
aactcattcataatgctactaaattaagggatctttatctaaatggagtgaacatgtcttcaattggagagagctctttgtcaatgctaaacaatttgtc |
16841990 |
T |
|
| Q |
616 |
atcctctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtca |
715 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16841991 |
atcctctttggtttctcttcatctagcaaacactggtttgcaaggaaatttgttaagtgacatactctctttgtcaaatcttcaaagactagatttgtca |
16842090 |
T |
|
| Q |
716 |
tttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattcctt |
815 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | | |
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|
| T |
16842091 |
cataatcaagaccttagtggtcaacttccaaaatccaactggagcactcctctaaggtacttgtacctctctcatactgctttctcaggagaaatctcct |
16842190 |
T |
|
| Q |
816 |
attccataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaac |
915 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16842191 |
attccataggtcaattaaagtctcttactcatttagtcctttcattttgcaattttgatgggatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaac |
16842290 |
T |
|
| Q |
916 |
atatttgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctcattcattgtaatcttgcatataataacttt |
1015 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16842291 |
atatttggatctttcaaataataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacacctcattcattgtgatcttgtatttaataacttt |
16842390 |
T |
|
| Q |
1016 |
agcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttttc |
1115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16842391 |
agcggtagcatcccaattgtttatggaaatttaagcaaattagaatatctatcactttcctctaacagtctaacaggccaagttccatcatcactttttc |
16842490 |
T |
|
| Q |
1116 |
atctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgttttt |
1215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16842491 |
atctaccttatctttctaatttatatttatcatttaacaaactggttggcccaattccaattgaaatcacaaaaacttcaaaattgagctatgtgggttt |
16842590 |
T |
|
| Q |
1216 |
ggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgtta |
1276 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16842591 |
gagtgagaacatgttaaatggaacaattccaaattggtgttattctttgccttcgttgtta |
16842651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 1283
Target Start/End: Original strand, 24216266 - 24217522
Alignment:
| Q |
30 |
acactttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaactctat-tttgc----- |
123 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | || |||| |
|
|
| T |
24216266 |
acacttactcattctgcaaccatcatgacagttctgcattgttacaattcaagaactcatttgttgtcaacacttcatctgaacccgatatttggtctat |
24216365 |
T |
|
| Q |
124 |
gtgttcttctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgatt |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| || |||||||| |
|
|
| T |
24216366 |
gtgttccactttttatttcaggacggaatcctggaaaaatggtgcagattgttgcgagtgggatggggtcatgtgtgacactaggtcaaattacgtgatt |
24216465 |
T |
|
| Q |
224 |
ggtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatg |
323 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24216466 |
ggtctggaccttagttgcaacaatctgaaaggtgagttacatccaaattgcactatcttcaagcttagacaccttcaacaactcaacttggcctttaata |
24216565 |
T |
|
| Q |
324 |
atttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccttccac |
423 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24216566 |
atttttcttggtcttcaatgcatgttgggattggtgatctagtgaatctcacatatctaaatttatcaagctgttaccttactggtaatattccctccac |
24216665 |
T |
|
| Q |
424 |
aatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcag---ttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactc |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24216666 |
aatctctcagttgtcaaaactagtgtcacttgatcttaaaagttattactggccggtggaacaaaaactcaaactcaatatcttcacatggaagaaactc |
24216765 |
T |
|
| Q |
521 |
attcataatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcct |
620 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24216766 |
attcataatgctactaatttaagggagctttacctgaatggagtggacatatcttcaatcagagagagctctt------tgctaaagaatttgtcatcct |
24216859 |
T |
|
| Q |
621 |
ctttggtttctcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaa |
720 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| || |
|
|
| T |
24216860 |
ctttggtttctcttagtctagcatccactggattgcaaggaaatatgtcaagtgacatcctctctttaccaaatcttcaaaaactagatttgtcatcgaa |
24216959 |
T |
|
| Q |
721 |
tgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattccttattcc |
820 |
Q |
| |
|
| | ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
24216960 |
tcaagaccttcgtggtaaatttccaacgtccaactggagcactcccctaaggtacttggacctctctttctctggtttctcaggtgaaatttcatactct |
24217059 |
T |
|
| Q |
821 |
ataggtcaattgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatatt |
920 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||| |||| ||| |||| | | ||||| || |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
24217060 |
attggtcagttgaagtttcttgctcacttatcccttacggggtgcaaatttgatggatttgttccttcatctttgtggaagctcactcaactcacattct |
24217159 |
T |
|
| Q |
921 |
tgaacctttcatttaataaacttaacggtgagatctcaccattactttcaaacctcaaacccctca-ttcattgtaatcttgcatataataactttagcg |
1019 |
Q |
| |
|
| | ||||||| || || ||||| || |||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| | ||||||||||| | |
|
|
| T |
24217160 |
taagcctttcaaacaacaatcttaaaggcgagatcccatcattactttcaaacctcacacacctcacttcctt-agatcttcaaattaataactttaatg |
24217258 |
T |
|
| Q |
1020 |
gtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcatcactttttcatct |
1119 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
24217259 |
gtaacatcccaaatgtttttgaaaatttaatcaaattaaactttttagcactttcttttaatagtctaagtggccaaattccatcatcattgtttaatct |
24217358 |
T |
|
| Q |
1120 |
acctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagttatgtgtttttggat |
1219 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | || | || || | |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| | | | ||||| | |
|
|
| T |
24217359 |
aactcaactttcttctctagaactatctttgaattatttagtaggccccattccatctgaaaacactaaacattcaaaattgaagtttctaaatttgggt |
24217458 |
T |
|
| Q |
1220 |
gataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttgg |
1283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24217459 |
aataacatgttaaatggaacaattccgcaatggtgttattccttgccttcgttgttagagttgg |
24217522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 14554556 - 14553768
Alignment:
| Q |
131 |
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230 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
14554556 |
tctttttctttcaagacagaatcttggaaaaagagtacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatatcaggtcacgtgattgaactag |
14554457 |
T |
|
| Q |
231 |
acctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatgatttttc |
330 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14554456 |
accttagttgcaacaatttgaatggtgaattacatcctaatagcactatcttccagcttagacaccttcaacaactcaacctagcttttaatgatatttt |
14554357 |
T |
|
| Q |
331 |
tttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccttccacaatctct |
430 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14554356 |
tgggtcttcaatgcctcttggtattggcgatttagtgaaactcatgcatctaaatatatccaattgttaccttagtggtaatattccttccacaatctct |
14554257 |
T |
|
| Q |
431 |
catttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcagttactggtccgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactcattcataatg |
530 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| || | ||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14554256 |
catttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcattaactggttc------------ttggaaattaatccatttacatggaataaactcattcataatg |
14554169 |
T |
|
| Q |
531 |
ctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc |
630 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14554168 |
ctactaatttaagggatctttatctgaatggagtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc |
14554069 |
T |
|
| Q |
631 |
tcttagtctaccaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatgataacctt |
730 |
Q |
| |
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| T |
14554068 |
tcttagtctagcaaacaccgggttgcaaggaaatttgtcaagtgacatactctctttgccaaatcttcaaaaactagatttggtaggtaatgatggtctt |
14553969 |
T |
|
| Q |
731 |
agtggtcaacttccaaagtccaactggagcacttctctaaggtacttgtacctccgtttatctgctttctcaggtgaaattccttattccataggtcaat |
830 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14553968 |
agtggtcaacttccaaaatccaactggagtactcctctaaggtacttgtacctccattactctgctttctcaggtgaaattccttattccataggtcaat |
14553869 |
T |
|
| Q |
831 |
tgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatggaatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacatatttgaacctttc |
930 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
14553868 |
tgaagtctcttactcatttagtcctttcagattgcaatttagatgggatggttcctctatctttgtggaacctcactcaactaacacatttggacctttc |
14553769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1007 - 1308
Target Start/End: Complemental strand, 14553764 - 14553463
Alignment:
| Q |
1007 |
aataactttagcggtagcatcccaattgtttatgaaaatttaatcaaattggaatatttagcactttcctctaacaacctaacgggccaagttccatcat |
1106 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14553764 |
aataacttaagctggagcatcccagatgtttgtggaaatttaatcaaattggaatatttataccttttctctaacaacctagcaggccaagttccatcat |
14553665 |
T |
|
| Q |
1107 |
cactttttcatctacctcaactttctcatttatatttaggagataacaaactagttggcccaattccaattgaaatcacaaaacgttccaaattgagtta |
1206 |
Q |
| |
|
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| T |
14553664 |
cactttttaatctacctcagctttcttttttatgtttatcatctaacaaactagttgggccgattgcaattgaaatcacaaaacgttcaaaattgagcta |
14553565 |
T |
|
| Q |
1207 |
tgtgtttttggatgataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagggttggtcctcagcaacaacaatctcaca |
1306 |
Q |
| |
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| T |
14553564 |
tgtggatttaagttataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattctttgccttcgttgttagagttatccctcagcgacaaccacctcaca |
14553465 |
T |
|
| Q |
1307 |
gg |
1308 |
Q |
| |
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|| |
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| T |
14553464 |
gg |
14553463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14554688 - 14554615
Alignment:
| Q |
32 |
actttctcattatgcaaccatcatgacacctctgccttattacaatttaaaaactctttttctgtcaacacttc |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14554688 |
actttctcattgtgcaaccaacatgacacctctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttc |
14554615 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1221 - 1261
Target Start/End: Complemental strand, 23496121 - 23496081
Alignment:
| Q |
1221 |
ataacatgttaaatggaacaattccacattggtgttattct |
1261 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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| T |
23496121 |
ataacatgttaaatggaacaattccacgttggtgtttttct |
23496081 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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