View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12396_high_1 (Length: 989)

Name: NF12396_high_1
Description: NF12396
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12396_high_1
NF12396_high_1
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (606-851)||(11917504-11917750)
chr8 (6-198)||(11909847-11910038)
chr8 (6-198)||(11917912-11918103)
chr8 (424-605)||(32984077-32984258)
chr8 (424-605)||(37956422-37956603)
chr8 (424-605)||(40435153-40435334)
chr8 (424-607)||(10646124-10646307)
chr8 (424-606)||(24079900-24080082)
chr8 (422-605)||(17718722-17718905)
chr8 (424-605)||(33730641-33730822)
chr8 (424-605)||(43328708-43328889)
chr8 (419-605)||(6365982-6366168)
chr8 (424-605)||(5946048-5946229)
chr8 (424-605)||(9303574-9303755)
chr8 (424-601)||(31830959-31831136)
chr8 (424-605)||(41231947-41232128)
chr8 (424-605)||(41862221-41862402)
chr8 (424-607)||(41653896-41654079)
chr8 (424-606)||(2714550-2714731)
chr8 (418-604)||(37301326-37301512)
chr8 (424-605)||(9013685-9013865)
chr8 (424-605)||(9734256-9734435)
chr8 (424-605)||(33981663-33981844)
chr8 (424-607)||(37419941-37420124)
chr8 (248-421)||(11917742-11917913)
chr8 (424-605)||(35628778-35628959)
chr8 (424-605)||(45236565-45236746)
chr8 (424-605)||(13760646-13760829)
chr8 (426-605)||(25185902-25186081)
chr8 (428-603)||(32114254-32114429)
chr8 (424-605)||(13356120-13356301)
chr8 (424-605)||(2275914-2276094)
chr8 (424-604)||(22878392-22878572)
chr8 (424-579)||(29048429-29048584)
chr8 (418-602)||(44088446-44088630)
chr8 (424-604)||(41639915-41640095)
chr8 (424-605)||(25248040-25248215)
chr8 (424-605)||(45066592-45066773)
chr8 (424-605)||(45258511-45258691)
chr8 (248-403)||(11910037-11910180)
chr8 (487-618)||(12032994-12033125)
chr8 (424-593)||(42701301-42701471)
chr8 (489-607)||(41981534-41981652)
chr8 (424-605)||(4447295-4447465)
chr8 (422-606)||(117328-117501)
chr8 (472-606)||(3904126-3904259)
chr8 (424-605)||(10378310-10378480)
chr8 (418-607)||(31940310-31940487)
chr8 (424-606)||(2379141-2379312)
chr8 (424-605)||(3211207-3211376)
chr8 (424-607)||(41843254-41843426)
chr8 (418-618)||(9713684-9713870)
chr8 (424-530)||(39915887-39915993)
chr8 (492-605)||(31336163-31336276)
chr8 (428-599)||(32373733-32373892)
chr8 (424-607)||(40458770-40458942)
chr8 (424-519)||(27243214-27243309)
chr8 (424-519)||(27254789-27254884)
chr8 (425-600)||(4975412-4975576)
chr8 (424-605)||(33896843-33897012)
chr8 (444-525)||(41981454-41981535)
chr8 (424-532)||(31148953-31149060)
chr8 (424-605)||(26196317-26196486)
chr8 (424-519)||(38631653-38631748)
chr8 (424-606)||(33622466-33622635)
chr8 (424-605)||(3490399-3490569)
chr8 (424-519)||(9509475-9509570)
chr8 (435-599)||(40649837-40649990)
chr8 (418-459)||(12032947-12032988)
chr8 (540-609)||(39901674-39901743)
chr8 (286-403)||(40743469-40743586)
chr8 (423-467)||(39901573-39901617)
chr8 (429-492)||(164728-164791)
chr8 (536-605)||(9509400-9509469)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (424-605)||(47257794-47257975)
chr3 (424-605)||(42291843-42292024)
chr3 (424-605)||(49330038-49330219)
chr3 (424-607)||(24100284-24100466)
chr3 (422-605)||(38416724-38416907)
chr3 (418-605)||(40419830-40420017)
chr3 (424-606)||(37313400-37313582)
chr3 (428-606)||(52628959-52629136)
chr3 (424-605)||(27066978-27067159)
chr3 (424-605)||(40130959-40131140)
chr3 (418-605)||(47809596-47809784)
chr3 (424-607)||(22399098-22399280)
chr3 (424-607)||(28048390-28048573)
chr3 (424-606)||(41464353-41464535)
chr3 (424-605)||(7855114-7855295)
chr3 (424-605)||(43612047-43612228)
chr3 (424-604)||(51170034-51170214)
chr3 (424-607)||(46134357-46134540)
chr3 (424-605)||(29625827-29626008)
chr3 (424-605)||(32234398-32234578)
chr3 (424-605)||(37324542-37324723)
chr3 (424-604)||(43021715-43021896)
chr3 (424-605)||(51102378-51102559)
chr3 (424-605)||(51452751-51452931)
chr3 (425-605)||(41293319-41293498)
chr3 (424-607)||(40643801-40643984)
chr3 (422-605)||(40804510-40804693)
chr3 (428-603)||(43183917-43184092)
chr3 (424-606)||(44222830-44223012)
chr3 (424-605)||(2666001-2666182)
chr3 (424-605)||(39053395-39053576)
chr3 (424-605)||(39634572-39634752)
chr3 (424-605)||(48739233-48739414)
chr3 (424-605)||(53943588-53943768)
chr3 (424-604)||(55453245-55453425)
chr3 (424-605)||(20754393-20754574)
chr3 (424-605)||(35748311-35748492)
chr3 (424-588)||(52215077-52215241)
chr3 (432-603)||(48609732-48609903)
chr3 (424-605)||(7755307-7755487)
chr3 (424-605)||(44806685-44806866)
chr3 (424-605)||(52638843-52639024)
chr3 (421-605)||(18946901-18947085)
chr3 (424-579)||(43125832-43125987)
chr3 (424-606)||(41732529-41732711)
chr3 (424-579)||(24376574-24376729)
chr3 (446-605)||(46126010-46126168)
chr3 (424-607)||(51146213-51146396)
chr3 (424-601)||(35594122-35594299)
chr3 (424-603)||(47894822-47895001)
chr3 (424-603)||(53832486-53832665)
chr3 (424-578)||(36368940-36369094)
chr3 (424-571)||(53637842-53637989)
chr3 (424-605)||(5560025-5560213)
chr3 (424-569)||(37758930-37759075)
chr3 (424-605)||(41216456-41216637)
chr3 (424-603)||(54159000-54159169)
chr3 (427-588)||(46949379-46949538)
chr3 (424-602)||(49130579-49130746)
chr3 (424-605)||(38156632-38156802)
chr3 (424-605)||(54707220-54707390)
chr3 (424-607)||(34279719-34279891)
chr3 (419-605)||(42589826-42590001)
chr3 (424-603)||(48546842-48547010)
chr3 (424-605)||(51415970-51416140)
chr3 (421-605)||(31286793-31286966)
chr3 (424-607)||(47510938-47511110)
chr3 (417-616)||(55000167-55000355)
chr3 (424-605)||(25641647-25641817)
chr3 (424-605)||(41635800-41635970)
chr3 (424-607)||(55379986-55380158)
chr3 (424-605)||(54401188-54401358)
chr3 (424-605)||(39141125-39141296)
chr3 (490-605)||(33550467-33550582)
chr3 (424-605)||(53115448-53115618)
chr3 (421-588)||(40022072-40022228)
chr3 (424-605)||(25353555-25353725)
chr3 (424-571)||(17665558-17665694)
chr3 (424-606)||(37028724-37028895)
chr3 (424-605)||(43176738-43176908)
chr3 (487-605)||(52864554-52864671)
chr3 (417-530)||(42998853-42998965)
chr3 (424-603)||(45058884-45059052)
chr3 (422-604)||(51143816-51143987)
chr3 (424-605)||(24688115-24688285)
chr3 (424-605)||(30251501-30251671)
chr3 (424-522)||(28576184-28576282)
chr3 (424-522)||(41882063-41882161)
chr3 (472-554)||(47182049-47182131)
chr3 (424-533)||(2227996-2228105)
chr3 (424-519)||(51224113-51224207)
chr3 (432-533)||(47402811-47402911)
chr3 (424-522)||(21597220-21597318)
chr3 (425-522)||(50731986-50732083)
chr3 (425-522)||(50780773-50780870)
chr3 (424-522)||(48726070-48726168)
chr3 (424-509)||(44946014-44946099)
chr3 (451-607)||(52756065-52756214)
chr3 (425-533)||(8847719-8847827)
chr3 (424-475)||(37741436-37741487)
chr3 (424-475)||(48752086-48752137)
chr3 (424-497)||(52434140-52434214)
chr3 (530-605)||(44945935-44946010)
chr3 (530-605)||(48534007-48534082)
chr3 (424-467)||(51942543-51942586)
chr3 (546-608)||(40165763-40165825)
chr3 (423-475)||(177161-177213)
chr3 (518-605)||(30429227-30429314)
chr3 (554-606)||(50731913-50731965)
chr3 (554-606)||(50780891-50780943)
chr3 (424-530)||(40165653-40165758)
chr3 (763-800)||(31855403-31855440)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (424-607)||(33695819-33696002)
chr7 (424-606)||(20165813-20165995)
chr7 (424-607)||(47740329-47740512)
chr7 (424-606)||(25893916-25894098)
chr7 (424-605)||(47066977-47067158)
chr7 (424-604)||(33423276-33423456)
chr7 (424-607)||(48609675-48609858)
chr7 (422-608)||(23393048-23393234)
chr7 (424-605)||(33839715-33839896)
chr7 (424-608)||(27018118-27018302)
chr7 (424-607)||(22979645-22979828)
chr7 (424-605)||(17855430-17855611)
chr7 (424-605)||(35355890-35356071)
chr7 (424-605)||(49171362-49171543)
chr7 (425-605)||(45690097-45690277)
chr7 (424-605)||(46913111-46913294)
chr7 (424-605)||(35328069-35328250)
chr7 (424-605)||(37846016-37846197)
chr7 (424-607)||(33411262-33411445)
chr7 (424-605)||(2341661-2341843)
chr7 (424-606)||(19563449-19563631)
chr7 (418-615)||(31586844-31587041)
chr7 (424-605)||(40670565-40670746)
chr7 (418-605)||(26579717-26579904)
chr7 (424-605)||(35757020-35757201)
chr7 (443-605)||(36389377-36389539)
chr7 (424-606)||(10028490-10028674)
chr7 (424-605)||(33332791-33332971)
chr7 (424-605)||(45482660-45482841)
chr7 (424-608)||(43499487-43499671)
chr7 (424-607)||(5712170-5712353)
chr7 (425-596)||(15877553-15877724)
chr7 (421-605)||(31625703-31625886)
chr7 (422-593)||(41990870-41991041)
chr7 (424-579)||(33870247-33870402)
chr7 (439-605)||(5183825-5183991)
chr7 (424-607)||(31429473-31429656)
chr7 (424-571)||(33720070-33720217)
chr7 (424-606)||(45063356-45063536)
chr7 (447-605)||(29446863-29447020)
chr7 (424-605)||(10618300-10618474)
chr7 (424-605)||(35767483-35767657)
chr7 (424-605)||(35752034-35752204)
chr7 (474-605)||(30076527-30076658)
chr7 (424-606)||(43489220-43489391)
chr7 (424-605)||(46898016-46898186)
chr7 (468-606)||(28233935-28234073)
chr7 (424-607)||(36816843-36817015)
chr7 (427-605)||(7876328-7876495)
chr7 (418-588)||(26941549-26941708)
chr7 (424-574)||(32556637-32556776)
chr7 (424-605)||(24923024-24923194)
chr7 (424-605)||(46817421-46817591)
chr7 (489-605)||(41904272-41904388)
chr7 (424-570)||(48085860-48085995)
chr7 (424-605)||(37127939-37128109)
chr7 (424-607)||(2332021-2332193)
chr7 (424-605)||(24228543-24228713)
chr7 (424-597)||(25037516-25037678)
chr7 (422-607)||(26371049-26371223)
chr7 (424-605)||(29610637-29610807)
chr7 (424-519)||(39323618-39323713)
chr7 (440-579)||(44564356-44564495)
chr7 (424-605)||(45237533-45237703)
chr7 (424-604)||(33393330-33393499)
chr7 (424-607)||(29098753-29098921)
chr7 (424-606)||(498187-498358)
chr7 (424-606)||(7257383-7257554)
chr7 (424-605)||(21718119-21718288)
chr7 (424-605)||(44003370-44003540)
chr7 (499-605)||(44405425-44405531)
chr7 (428-604)||(46103127-46103291)
chr7 (422-519)||(39866665-39866762)
chr7 (424-605)||(47906758-47906929)
chr7 (424-519)||(33455098-33455193)
chr7 (424-530)||(16482847-16482953)
chr7 (424-604)||(45502817-45502986)
chr7 (424-523)||(29863017-29863116)
chr7 (424-511)||(39453558-39453645)
chr7 (422-607)||(47460770-47460944)
chr7 (424-519)||(44659846-44659940)
chr7 (424-530)||(15644010-15644116)
chr7 (424-482)||(30077048-30077106)
chr7 (424-603)||(35484638-35484807)
chr7 (424-601)||(41855061-41855228)
chr7 (424-483)||(35557732-35557791)
chr7 (424-483)||(35823292-35823351)
chr7 (434-533)||(38448509-38448608)
chr7 (424-523)||(7720574-7720673)
chr7 (546-605)||(37443602-37443661)
chr7 (536-603)||(39453484-39453551)
chr7 (681-734)||(21602378-21602431)
chr7 (470-531)||(26456157-26456218)
chr7 (537-605)||(39323712-39323779)
chr7 (424-459)||(42272153-42272188)
chr7 (540-606)||(42272180-42272245)
chr7 (546-603)||(15643948-15644005)
chr7 (286-327)||(19416375-19416416)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (418-605)||(5882501-5882688)
chr6 (424-607)||(22551059-22551242)
chr6 (424-607)||(28947088-28947271)
chr6 (424-607)||(33452570-33452753)
chr6 (424-601)||(14891383-14891560)
chr6 (424-605)||(24168092-24168273)
chr6 (424-605)||(26377204-26377385)
chr6 (424-603)||(2892189-2892368)
chr6 (424-606)||(8615241-8615423)
chr6 (424-605)||(1970712-1970893)
chr6 (426-607)||(18101493-18101674)
chr6 (424-603)||(7345114-7345293)
chr6 (424-605)||(19415533-19415714)
chr6 (424-605)||(34527862-34528043)
chr6 (424-607)||(599893-600076)
chr6 (424-607)||(959902-960085)
chr6 (419-605)||(10507908-10508094)
chr6 (424-605)||(7393586-7393767)
chr6 (436-605)||(11988974-11989143)
chr6 (424-605)||(2593852-2594033)
chr6 (424-588)||(16703367-16703531)
chr6 (424-604)||(19281056-19281236)
chr6 (421-605)||(30743448-30743632)
chr6 (436-605)||(22341788-22341959)
chr6 (422-605)||(5294801-5294984)
chr6 (422-605)||(5299353-5299536)
chr6 (424-607)||(24224068-24224252)
chr6 (419-552)||(30467656-30467789)
chr6 (424-606)||(28948844-28949015)
chr6 (424-598)||(13329382-13329545)
chr6 (455-605)||(23261929-23262079)
chr6 (424-605)||(7167583-7167753)
chr6 (424-605)||(15965434-15965604)
chr6 (424-605)||(4487528-4487698)
chr6 (424-505)||(929660-929741)
chr6 (424-605)||(3291009-3291179)
chr6 (424-605)||(1398554-1398724)
chr6 (424-606)||(3786750-3786921)
chr6 (424-521)||(375797-375894)
chr6 (434-530)||(13844847-13844943)
chr6 (424-479)||(11743070-11743125)
chr6 (530-605)||(24913096-24913171)
chr6 (429-515)||(1939583-1939669)
chr6 (530-606)||(18661830-18661906)
chr6 (546-605)||(34262342-34262401)
chr6 (546-603)||(375729-375786)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (424-607)||(24253383-24253566)
chr5 (424-605)||(5184973-5185154)
chr5 (424-603)||(6901800-6901979)
chr5 (424-605)||(43326379-43326560)
chr5 (424-604)||(15398483-15398663)
chr5 (424-607)||(18479666-18479849)
chr5 (418-605)||(35626033-35626220)
chr5 (424-607)||(40886026-40886208)
chr5 (424-605)||(3466681-3466862)
chr5 (424-605)||(7722050-7722231)
chr5 (424-605)||(12648798-12648979)
chr5 (424-605)||(39932580-39932761)
chr5 (424-605)||(27938898-27939080)
chr5 (424-605)||(739704-739885)
chr5 (424-605)||(43262183-43262364)
chr5 (424-607)||(27501053-27501236)
chr5 (424-605)||(28424795-28424974)
chr5 (424-605)||(15683792-15683973)
chr5 (424-607)||(2484290-2484473)
chr5 (424-605)||(25831522-25831702)
chr5 (434-606)||(31938908-31939080)
chr5 (424-604)||(27278474-27278658)
chr5 (425-608)||(13504739-13504922)
chr5 (424-605)||(5137716-5137897)
chr5 (434-607)||(40278856-40279029)
chr5 (424-605)||(890907-891087)
chr5 (460-605)||(29789295-29789440)
chr5 (419-605)||(33617581-33617756)
chr5 (465-608)||(34451292-34451435)
chr5 (431-605)||(38756487-38756662)
chr5 (424-605)||(763724-763905)
chr5 (424-587)||(40110235-40110397)
chr5 (424-606)||(27503380-27503551)
chr5 (424-586)||(4149695-4149847)
chr5 (424-605)||(5497274-5497444)
chr5 (424-605)||(6973064-6973234)
chr5 (424-607)||(31293987-31294170)
chr5 (424-605)||(38015514-38015684)
chr5 (424-606)||(19295731-19295902)
chr5 (424-570)||(36365480-36365615)
chr5 (424-605)||(23195248-23195418)
chr5 (418-607)||(24167782-24167960)
chr5 (424-567)||(40632500-40632634)
chr5 (424-604)||(9424593-9424762)
chr5 (424-533)||(12558091-12558199)
chr5 (424-605)||(13957671-13957841)
chr5 (424-588)||(42658679-42658832)
chr5 (418-605)||(2585457-2585633)
chr5 (424-605)||(9374502-9374672)
chr5 (424-519)||(42247857-42247952)
chr5 (450-606)||(3656567-3656712)
chr5 (434-531)||(5120036-5120132)
chr5 (424-606)||(14971979-14972150)
chr5 (424-530)||(36472348-36472454)
chr5 (422-490)||(9527124-9527192)
chr5 (424-605)||(38637910-38638080)
chr5 (424-605)||(40686900-40687069)
chr5 (424-571)||(6206885-6207021)
chr5 (424-607)||(18327171-18327343)
chr5 (424-605)||(1402505-1402675)
chr5 (431-605)||(27390605-27390768)
chr5 (426-508)||(9171111-9171193)
chr5 (428-604)||(33623940-33624105)
chr5 (457-607)||(38492647-38492785)
chr5 (449-605)||(612757-612900)
chr5 (447-514)||(3940411-3940478)
chr5 (449-603)||(36948492-36948633)
chr5 (427-485)||(28756082-28756140)
chr5 (424-484)||(27584386-27584448)
chr5 (434-483)||(15300984-15301033)
chr5 (542-605)||(3940336-3940399)
chr5 (456-522)||(20207088-20207154)
chr5 (286-327)||(13002567-13002608)
chr5 (286-327)||(13077225-13077266)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (424-607)||(23437593-23437776)
chr4 (425-606)||(21366608-21366789)
chr4 (424-605)||(34276548-34276729)
chr4 (424-605)||(43471695-43471876)
chr4 (424-605)||(47344657-47344838)
chr4 (424-616)||(6019929-6020121)
chr4 (424-603)||(41702461-41702640)
chr4 (424-607)||(53854428-53854610)
chr4 (424-606)||(9798466-9798648)
chr4 (424-605)||(3170627-3170808)
chr4 (424-607)||(51363008-51363190)
chr4 (424-606)||(29478361-29478543)
chr4 (424-605)||(146429-146610)
chr4 (424-605)||(237478-237659)
chr4 (424-605)||(2826682-2826862)
chr4 (424-605)||(42085208-42085389)
chr4 (425-606)||(44984763-44984944)
chr4 (424-604)||(32366661-32366841)
chr4 (424-607)||(18462011-18462194)
chr4 (424-607)||(31532133-31532316)
chr4 (423-606)||(42222291-42222474)
chr4 (424-607)||(54574938-54575121)
chr4 (424-605)||(39077546-39077727)
chr4 (424-605)||(42765842-42766022)
chr4 (424-605)||(53461816-53461997)
chr4 (421-605)||(22618514-22618696)
chr4 (424-608)||(26091255-26091439)
chr4 (426-606)||(31972335-31972515)
chr4 (424-603)||(397403-397582)
chr4 (424-607)||(27373077-27373259)
chr4 (419-606)||(41949378-41949567)
chr4 (424-606)||(54607963-54608145)
chr4 (424-605)||(45797480-45797661)
chr4 (424-605)||(55056259-55056440)
chr4 (418-607)||(56022996-56023185)
chr4 (424-607)||(6285308-6285491)
chr4 (424-606)||(23609088-23609270)
chr4 (424-605)||(2243459-2243640)
chr4 (424-605)||(19387688-19387869)
chr4 (424-605)||(29777257-29777438)
chr4 (424-605)||(55776046-55776226)
chr4 (424-605)||(55840224-55840404)
chr4 (424-607)||(407755-407936)
chr4 (424-603)||(50457812-50457991)
chr4 (424-606)||(41560329-41560511)
chr4 (424-607)||(49881057-49881244)
chr4 (424-605)||(31070074-31070254)
chr4 (424-605)||(31914199-31914379)
chr4 (424-605)||(50234001-50234182)
chr4 (424-607)||(41632005-41632187)
chr4 (424-607)||(48313558-48313739)
chr4 (422-601)||(50534630-50534809)
chr4 (424-607)||(55519828-55520011)
chr4 (419-605)||(3692210-3692396)
chr4 (422-604)||(53834055-53834237)
chr4 (424-606)||(54086411-54086591)
chr4 (424-605)||(38591669-38591846)
chr4 (424-605)||(54805614-54805799)
chr4 (424-606)||(35446507-35446688)
chr4 (424-606)||(42033176-42033358)
chr4 (424-605)||(47662102-47662283)
chr4 (424-587)||(22468788-22468951)
chr4 (424-605)||(14017376-14017555)
chr4 (424-605)||(1932764-1932945)
chr4 (425-605)||(48657826-48658000)
chr4 (424-605)||(54424983-54425163)
chr4 (424-605)||(48654815-48655002)
chr4 (419-588)||(39587796-39587965)
chr4 (424-605)||(48259512-48259691)
chr4 (424-601)||(50536628-50536805)
chr4 (425-596)||(33897504-33897675)
chr4 (463-605)||(52728307-52728448)
chr4 (424-608)||(9997928-9998101)
chr4 (422-603)||(51951681-51951861)
chr4 (424-605)||(43890929-43891099)
chr4 (424-605)||(45633779-45633949)
chr4 (424-608)||(54216733-54216906)
chr4 (424-605)||(36532830-36533001)
chr4 (424-605)||(5117438-5117608)
chr4 (424-605)||(20351842-20352012)
chr4 (424-605)||(54715036-54715206)
chr4 (424-606)||(15060288-15060459)
chr4 (424-606)||(49014099-49014270)
chr4 (424-605)||(31881314-31881484)
chr4 (424-605)||(34835178-34835348)
chr4 (424-605)||(37239090-37239260)
chr4 (424-606)||(34552320-34552491)
chr4 (508-607)||(35595772-35595871)
chr4 (424-605)||(47811907-47812077)
chr4 (424-606)||(22620594-22620765)
chr4 (427-605)||(46708741-46708908)
chr4 (424-605)||(4486581-4486751)
chr4 (424-519)||(11972204-11972299)
chr4 (424-601)||(27398607-27398773)
chr4 (424-605)||(38547601-38547771)
chr4 (424-603)||(54216314-54216482)
chr4 (424-605)||(52688350-52688520)
chr4 (424-530)||(14335165-14335271)
chr4 (424-530)||(27580120-27580226)
chr4 (419-607)||(33289699-33289875)
chr4 (424-571)||(27873582-27873718)
chr4 (424-605)||(52461367-52461534)
chr4 (424-519)||(3293098-3293193)
chr4 (424-507)||(42557583-42557666)
chr4 (424-601)||(46720026-46720195)
chr4 (427-607)||(573807-573976)
chr4 (424-530)||(1662323-1662429)
chr4 (424-529)||(49057933-49058038)
chr4 (478-606)||(42509351-42509479)
chr4 (422-571)||(33557976-33558114)
chr4 (535-604)||(33048993-33049062)
chr4 (424-605)||(6371249-6371419)
chr4 (419-522)||(43231499-43231601)
chr4 (471-561)||(52396774-52396865)
chr4 (503-604)||(35344868-35344968)
chr4 (424-474)||(17555617-17555667)
chr4 (528-605)||(48259704-48259780)
chr4 (537-605)||(3291805-3291873)
chr4 (451-606)||(27872607-27872751)
chr4 (530-579)||(51981505-51981554)
chr4 (434-508)||(18206608-18206682)
chr4 (553-605)||(1662261-1662313)
chr4 (500-605)||(42558270-42558367)
chr4 (284-327)||(17433465-17433508)
[»] chr1 (114 HSPs)
chr1 (424-607)||(45538154-45538337)
chr1 (424-605)||(31308002-31308183)
chr1 (424-607)||(3611137-3611320)
chr1 (425-603)||(43251713-43251891)
chr1 (424-605)||(44661971-44662152)
chr1 (424-607)||(21139410-21139593)
chr1 (424-607)||(26277178-26277361)
chr1 (424-605)||(17994951-17995132)
chr1 (424-605)||(31040710-31040891)
chr1 (424-605)||(37620192-37620373)
chr1 (424-607)||(25678257-25678440)
chr1 (424-607)||(26085396-26085578)
chr1 (425-599)||(4068689-4068863)
chr1 (419-605)||(5981166-5981352)
chr1 (424-606)||(25058689-25058871)
chr1 (424-605)||(33884089-33884270)
chr1 (424-605)||(33959982-33960163)
chr1 (424-605)||(38331859-38332040)
chr1 (424-606)||(24245024-24245206)
chr1 (424-606)||(47671587-47671769)
chr1 (424-605)||(6327548-6327728)
chr1 (424-605)||(23984756-23984937)
chr1 (424-605)||(26524889-26525070)
chr1 (424-605)||(33112818-33112998)
chr1 (424-605)||(38790197-38790378)
chr1 (424-605)||(46616550-46616731)
chr1 (418-617)||(36566325-36566524)
chr1 (424-607)||(47317316-47317499)
chr1 (424-605)||(23932509-23932690)
chr1 (424-605)||(24885502-24885683)
chr1 (424-601)||(26794305-26794482)
chr1 (424-605)||(39646569-39646750)
chr1 (424-605)||(5980069-5980250)
chr1 (424-577)||(31844377-31844530)
chr1 (424-605)||(41999816-41999997)
chr1 (424-605)||(49253975-49254156)
chr1 (424-607)||(35273597-35273780)
chr1 (424-605)||(35692663-35692845)
chr1 (424-606)||(46784424-46784606)
chr1 (424-606)||(46967040-46967222)
chr1 (424-606)||(47383731-47383913)
chr1 (424-605)||(50774218-50774399)
chr1 (424-607)||(23220933-23221110)
chr1 (425-587)||(42863867-42864029)
chr1 (424-606)||(51057072-51057254)
chr1 (424-604)||(3285403-3285582)
chr1 (424-602)||(28888582-28888760)
chr1 (424-606)||(49398987-49399169)
chr1 (424-561)||(25518815-25518952)
chr1 (424-605)||(47187106-47187287)
chr1 (424-605)||(42313361-42313546)
chr1 (424-605)||(36003131-36003315)
chr1 (424-605)||(48373505-48373677)
chr1 (424-605)||(10928068-10928238)
chr1 (424-606)||(27983602-27983768)
chr1 (424-607)||(41467630-41467802)
chr1 (424-588)||(51403034-51403188)
chr1 (424-605)||(33073212-33073382)
chr1 (424-605)||(2657304-2657474)
chr1 (464-607)||(51045594-51045737)
chr1 (424-599)||(26472185-26472349)
chr1 (425-542)||(31979998-31980115)
chr1 (458-606)||(2450529-2450677)
chr1 (477-605)||(4808699-4808827)
chr1 (424-604)||(6626025-6626194)
chr1 (424-605)||(29770671-29770841)
chr1 (424-542)||(2556909-2557027)
chr1 (425-579)||(45475869-45476014)
chr1 (424-570)||(13281597-13281732)
chr1 (424-605)||(2954856-2955026)
chr1 (424-605)||(4953053-4953223)
chr1 (424-605)||(26685857-26686027)
chr1 (426-607)||(30289908-30290078)
chr1 (425-606)||(41895163-41895333)
chr1 (424-605)||(42234841-42235010)
chr1 (424-607)||(10920201-10920373)
chr1 (434-605)||(44293455-44293615)
chr1 (501-605)||(4156472-4156576)
chr1 (424-605)||(4243490-4243660)
chr1 (424-605)||(51155590-51155759)
chr1 (424-515)||(13313253-13313346)
chr1 (425-519)||(32448650-32448744)
chr1 (424-530)||(52323939-52324045)
chr1 (426-609)||(1388476-1388648)
chr1 (424-599)||(34752320-34752484)
chr1 (424-605)||(38716247-38716417)
chr1 (424-519)||(44544121-44544216)
chr1 (512-606)||(13312530-13312624)
chr1 (424-514)||(24649802-24649892)
chr1 (424-607)||(33187341-33187507)
chr1 (424-519)||(46428328-46428423)
chr1 (435-605)||(48683330-48683489)
chr1 (424-482)||(4156188-4156246)
chr1 (424-530)||(27924722-27924828)
chr1 (424-533)||(39475844-39475952)
chr1 (424-605)||(5961267-5961437)
chr1 (422-606)||(7561527-7561714)
chr1 (424-513)||(39637901-39637986)
chr1 (418-530)||(52367878-52367990)
chr1 (245-324)||(32044590-32044669)
chr1 (425-570)||(35991634-35991768)
chr1 (424-475)||(10919313-10919364)
chr1 (546-605)||(31286504-31286563)
chr1 (458-607)||(38718165-38718309)
chr1 (544-586)||(39359502-39359544)
chr1 (750-800)||(4365534-4365585)
chr1 (370-413)||(8934062-8934105)
chr1 (425-464)||(12891401-12891440)
chr1 (424-511)||(15611671-15611758)
chr1 (536-571)||(24215865-24215900)
chr1 (424-454)||(23994849-23994879)
chr1 (316-414)||(34049171-34049269)
chr1 (549-602)||(32448754-32448807)
chr1 (553-606)||(52324058-52324111)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (424-605)||(4034592-4034773)
chr2 (424-606)||(746466-746648)
chr2 (424-605)||(6594458-6594639)
chr2 (425-606)||(23901780-23901961)
chr2 (424-605)||(38997101-38997282)
chr2 (424-608)||(45370990-45371174)
chr2 (424-607)||(27400403-27400586)
chr2 (424-602)||(10424595-10424773)
chr2 (424-605)||(2324889-2325070)
chr2 (424-605)||(17600836-17601017)
chr2 (424-607)||(13815216-13815399)
chr2 (418-605)||(27651034-27651221)
chr2 (424-606)||(26710345-26710527)
chr2 (419-605)||(40635213-40635399)
chr2 (424-605)||(11184972-11185153)
chr2 (424-605)||(14660446-14660627)
chr2 (424-605)||(34518367-34518548)
chr2 (424-599)||(6430473-6430648)
chr2 (424-605)||(10244582-10244763)
chr2 (424-606)||(5726129-5726311)
chr2 (424-605)||(1091951-1092132)
chr2 (424-609)||(32327361-32327546)
chr2 (424-581)||(32608380-32608537)
chr2 (421-607)||(2914136-2914322)
chr2 (424-605)||(7892688-7892869)
chr2 (424-605)||(33427647-33427828)
chr2 (424-607)||(14697535-14697718)
chr2 (418-605)||(27024409-27024596)
chr2 (424-607)||(40735464-40735647)
chr2 (424-606)||(4609626-4609808)
chr2 (424-605)||(40037143-40037323)
chr2 (424-607)||(32948446-32948628)
chr2 (424-605)||(9444683-9444874)
chr2 (424-606)||(37620866-37621051)
chr2 (424-579)||(8432942-8433097)
chr2 (424-605)||(37255337-37255513)
chr2 (422-578)||(12842101-12842257)
chr2 (438-605)||(32856436-32856603)
chr2 (427-605)||(11159625-11159802)
chr2 (424-599)||(15925080-15925255)
chr2 (425-571)||(41172459-41172605)
chr2 (424-548)||(42899915-42900039)
chr2 (422-606)||(35158049-35158222)
chr2 (424-604)||(39103047-39103216)
chr2 (424-605)||(21734900-21735070)
chr2 (475-602)||(25294886-25295013)
chr2 (424-606)||(28641291-28641462)
chr2 (424-603)||(145282-145450)
chr2 (499-607)||(447631-447739)
chr2 (424-606)||(12333496-12333665)
chr2 (424-606)||(29687041-29687212)
chr2 (419-607)||(4258485-4258661)
chr2 (424-605)||(1229635-1229809)
chr2 (434-605)||(13543624-13543784)
chr2 (424-605)||(39301197-39301367)
chr2 (421-605)||(27331295-27331472)
chr2 (424-606)||(19428425-19428597)
chr2 (424-570)||(27764897-27765032)
chr2 (424-605)||(2688729-2688899)
chr2 (424-605)||(44481828-44481998)
chr2 (424-608)||(43898968-43899140)
chr2 (424-591)||(8056626-8056782)
chr2 (424-503)||(12814614-12814693)
chr2 (424-600)||(28566703-28566868)
chr2 (422-519)||(3266294-3266391)
chr2 (424-605)||(12730061-12730231)
chr2 (424-519)||(40544151-40544246)
chr2 (503-585)||(12827142-12827223)
chr2 (424-600)||(35126780-35126945)
chr2 (424-606)||(43356099-43356267)
chr2 (499-567)||(28014856-28014924)
chr2 (424-605)||(34249265-34249435)
chr2 (424-519)||(2000412-2000507)
chr2 (455-605)||(3711664-3711803)
chr2 (424-467)||(28019959-28020002)
chr2 (424-512)||(30545821-30545909)
chr2 (431-530)||(38985342-38985439)
chr2 (424-483)||(10176559-10176618)
chr2 (424-462)||(1897130-1897168)
chr2 (506-555)||(17799296-17799345)
chr2 (286-339)||(22116572-22116625)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (424-605)||(39556-39737)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (424-605)||(13762-13943)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (425-606)||(1871-2052)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (425-606)||(11132-11312)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (424-605)||(75244-75425)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (424-606)||(2431-2613)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (435-605)||(176666-176836)
scaffold0007 (424-605)||(278007-278190)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (418-605)||(18854-19041)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (424-577)||(32562-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (422-606)||(4595-4773)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (424-605)||(3089-3261)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (424-606)||(14745-14916)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (424-606)||(7091-7263)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (424-611)||(20471-20647)
[»] scaffold2003 (2 HSPs)
scaffold2003 (424-530)||(103-209)
scaffold2003 (553-606)||(221-273)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (424-530)||(4618-4725)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (424-530)||(3393-3500)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (424-571)||(17907-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (434-508)||(19228-19302)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 606 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 11917750 - 11917504
Alignment:
Q  606 atctctttttgaaccaagtatagt-aggtcaagtcatagggttaggtttgtattaatattcaactatcgagacattgaatcaattatctattttgctcac 704  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11917750 atctctttttgaaccaagtatacttaggcctagtcatagggttaggtttgtattaatattcaactatcgagtcattgaatcaatcatctattttgctcac 11917651  T
Q  705 gatcggaagtcgattgatacaatggatttcatcagtagtgataactaaactaatttgtactaatattaacgaacttgcaactacatttaacaaacttcac 804  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917650 gttcggaagtcgattgatacaatggatttcattagtagtgataactaaacttatttgtactaatattaatgaacttgcaactacatttaacaaacttcac 11917551  T
Q  805 taatattaaataataaaaaaccgcaaataatttaaacattataaact 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917550 taatattaaataataaaaaaccgcaaataatttaaacattataaact 11917504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 11909847 - 11910038
Alignment:
Q  6 aagaggtcgtattattgggattaagcttcgttaaccaatcgtctaatgttttttcttaagttaagaaacatgaaataaagagagaggtgaacaaagataa 105  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11909847 aagagatcatattgttgggattaagcttcgttaaccaatcatctaatgttttttcttaagttaagaaacatgaaataaagagagaggtgaacagagataa 11909946  T
Q  106 gatcatcaatttcaactattggagagatttggagcttgagttcaagcttatggatgcttctggaacaacattcatctcttcttcttttagtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11909947 gatcatcaatttcaactattggagagatttggagcttgagttcaagcttatggatgcttctcgaacaacattcatctcttctt-ttttagtta 11910038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11918103 - 11917912
Alignment:
Q  6 aagaggtcgtattattgggattaagcttcgttaaccaatcgtctaatgttttttcttaagttaagaaacatgaaataaagagagaggtgaacaaagataa 105  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11918103 aagagatcatattgttgggattaagcttcgttaaccaatcatctaatgttttttcttaagttaagaaacatgaaataaagagagaggtgaacagagataa 11918004  T
Q  106 gatcatcaatttcaactattggagagatttggagcttgagttcaagcttatggatgcttctggaacaacattcatctcttcttcttttagtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11918003 gatcatcaatttcaactattggagagatttggagcttgagttcaagcttatggatgcttctcgaacaacattcatctcttctt-ttttagtta 11917912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 32984258 - 32984077
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32984258 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32984159  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32984158 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 37956422 - 37956603
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37956422 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37956521  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37956522 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 40435334 - 40435153
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40435334 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 40435235  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  40435234 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646307
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 10646307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24080082 - 24079900
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24080082 ttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24079983  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24079982 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 24079900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 422 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 17718905 - 17718722
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  17718905 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggatacc 17718806  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  17718805 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33730822 - 33730641
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33730822 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33730723  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33730722 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 43328708 - 43328889
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43328708 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43328807  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  43328808 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Original strand, 6365982 - 6366168
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  6365982 tttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggat 6366081  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  6366082 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 5946048 - 5946229
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5946048 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 5946147  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  5946148 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 9303755 - 9303574
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9303755 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9303656  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9303655 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 41231947 - 41232128
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41231947 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 41232046  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41232047 ttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 41862221 - 41862402
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  41862221 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 41862320  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  41862321 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 41653896 - 41654079
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||    
T  41653896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccac 41653995  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  41653996 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 41654079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714731
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||  ||||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg-tactttagttgtcacca 2714731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 418 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 37301512 - 37301326
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  37301512 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatgga 37301413  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  37301412 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 9013685 - 9013865
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  9013685 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 9013784  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9013785 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 9734256 - 9734435
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  9734256 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 9734354  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9734355 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33981844 - 33981663
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33981844 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33981745  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  33981744 ttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 37419941 - 37420124
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  37419941 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 37420040  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  37420041 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 37420124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 248 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11917913 - 11917742
Alignment:
Q  248 tagctaggaatataatgtattacttttaatctagtcgattgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaatctttacttaatgttttcgtt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |    
T  11917913 tagctaggaatctaatgtattacttttaatctagtcgattgtatatgatttatgtattcaatataacctttggtttaaatctttact--atattttctct 11917816  T
Q  348 gacgtgaactctgtacacaatgttttgaattagcaagtgtgatacatcgacttgttactcaagggatctctttt 421  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11917815 gacgtgcactctgtacccaatgttttgaattagcaagtgtgatacatctacttgttactcaaaggatctctttt 11917742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 35628778 - 35628959
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35628778 ttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccac 35628877  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  35628878 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45236746 - 45236565
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45236746 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 45236647  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| || |||||||||||||    
T  45236646 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 13760829 - 13760646
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  13760829 ttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 13760730  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg--ctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  13760729 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 426 - 605
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186081
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  526 aaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacc 25186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 428 - 603
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 13356301 - 13356120
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13356301 ttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13356202  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  13356201 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 2275914 - 2276094
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2275914 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2276013  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  2276014 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 22878392 - 22878572
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  22878392 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccac 22878491  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22878492 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 29048584 - 29048429
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29048584 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 29048485  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29048484 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 29048429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 44088630 - 44088446
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  44088630 ttttgtttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 44088531  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  44088530 taccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 41639915 - 41640095
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  41639915 ttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgc 41640014  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  41640015 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 25248040 - 25248215
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25248040 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25248133  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25248134 tttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45066773 - 45066592
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45066773 ttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45066674  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||| || |||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  45066673 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacc 45066592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 45258511 - 45258691
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||     
T  45258511 ttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccat 45258610  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  45258611 ttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-tactctagttatcacc 45258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 248 - 403
Target Start/End: Original strand, 11910037 - 11910180
Alignment:
Q  248 tagctaggaatataatgtattacttttaatctagtcgattgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaatctttacttaatgttttcgtt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11910037 tagctaggaatctaatgtattacttttaatctagtcgattgtatatgatttatgtattcaatataacctttgttttaaatctttacttaatgttttcgct 11910136  T
Q  348 gacgtgaactctgtacacaatgttttgaattagcaagtgtgatacatcgacttgtt 403  Q
    ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11910137 gacgtg------------aatgttttgaattagcaagtgtgatacatcgacttgtt 11910180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 487 - 618
Target Start/End: Original strand, 12032994 - 12033125
Alignment:
Q  487 atttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12032994 atttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 12033093  T
Q  587 ggctaccctagttgtcaccatctctttttgaa 618  Q
    || |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  12033094 gggtaccctagttgtcaccttcattttttgaa 12033125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  524 ttaaaaa---tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctacc 593  Q
    |||||||   ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgctt--gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 489 - 607
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981652
Alignment:
Q  489 ttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  589 ctaccctagttgtcaccat 607  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcaccat 41981652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 4447465 - 4447295
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||         
T  4447465 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat----- 4447371  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4447370 ------atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 117501 - 117328
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||       
T  117501 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat--- 117405  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
            |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  117404 --------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 117328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 606
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904259
Alignment:
Q  472 caatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatga-taccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  572 tcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 3904259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 10378310 - 10378480
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||         
T  10378310 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat----- 10378404  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  10378405 ------atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 418 - 607
Target Start/End: Original strand, 31940310 - 31940487
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  31940310 ttttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaa 31940409  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |           |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  31940410 t-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 31940487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 2379141 - 2379312
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||         
T  2379141 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaat----- 2379235  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  2379236 ------atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211376
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||         
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaat----- 3211300  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  3211301 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 41843254 - 41843426
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||| |||||||||||||||         
T  41843254 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaat----- 41843348  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || | ||||| |||||||    
T  41843349 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcaccat 41843426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 418 - 618
Target Start/End: Original strand, 9713684 - 9713870
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  9713684 ttttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaa 9713780  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctctttttga 617  Q
    |           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| |||||| | |||||||    
T  9713781 t-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatgtttttga 9713869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 39915993 - 39915887
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39915993 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 39915894  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
    |||||||    
T  39915893 ttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 492 - 605
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  492 ttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggcta 591  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  592 ccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 428 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||             
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat--------- 32373802  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
      |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||    
T  32373801 --atgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaattac-caccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 40458942 - 40458770
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  40458942 ttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 40458848  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          ||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  40458847 ------atgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 40458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27243309 - 27243214
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  27243309 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaata 27243214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 27254884 - 27254789
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| || ||||||||||||||||||    
T  27254884 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaata 27254789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||          
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat------ 4975483  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttg 600  Q
         |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||| || ||||||||    
T  4975482 -----atgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33897012 - 33896843
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  33897012 ttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccac 33896914  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||       |||     ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  33896913 ctaaaaa------gatg-----aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 444 - 525
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  444 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31149060 - 31148953
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  31149060 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcatg-ataccac 31148962  T
Q  524 ttaaaaatg 532  Q
    |||||||||    
T  31148961 ttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 26196486 - 26196317
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  26196486 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 26196388  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  26196387 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Original strand, 38631653 - 38631748
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38631653 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatgaata 38631748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622466
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||  || |||||| |||||||||||||         
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatg-ggtcaaaatagttcatgaat----- 33622542  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  33622541 ------atgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatgg-tagcctagttgtcacca 33622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 3490569 - 3490399
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| || |||  ||||||    
T  3490569 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccac 3490470  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  3490469 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 9509570 - 9509475
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  9509570 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata 9509475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 435 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649837
Alignment:
Q  435 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgta 534  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| | |||| ||| |||||||||           ||||     
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaat-----------atgtg 40649902  T
Q  535 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||| || |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 418 - 459
Target Start/End: Original strand, 12032947 - 12032988
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 459  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032947 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 540 - 609
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901743
Alignment:
Q  540 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatct 609  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcaccatct 39901743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 403
Target Start/End: Original strand, 40743469 - 40743586
Alignment:
Q  286 ttgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaatctttacttaatgttttcgttgacgtgaactctgtacacaatgttttgaattagcaagt 385  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||| || |||| | |||| ||| || || |||||| |||||||||    
T  40743469 ttgtatatgatctatgcattcaatataatctttgatttaaatatttatttaatgcttttgtcgacgagcactccgtaaacgatattttgatttagcaagt 40743568  T
Q  386 gtgatacatcgacttgtt 403  Q
    | || |||| ||||||||    
T  40743569 gcgagacattgacttgtt 40743586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 467
Target Start/End: Original strand, 39901573 - 39901617
Alignment:
Q  423 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 467  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39901573 attttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccac 39901617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 429 - 492
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  429 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgt 492  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 9509469 - 9509400
Alignment:
Q  536 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  9509469 ttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 47257794 - 47257975
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47257794 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 47257893  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47257894 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 42291843 - 42292024
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  42291843 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 42291942  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  42291943 ttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 49330038 - 49330219
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  49330038 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49330137  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49330138 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 24100284 - 24100466
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24100284 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccac 24100382  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24100383 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 24100466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 422 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38416907 - 38416724
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38416907 gattttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38416808  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38416807 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Original strand, 40419830 - 40420017
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  40419830 ttttggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 40419929  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40419930 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 37313400 - 37313582
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37313400 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 37313499  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  37313500 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacca 37313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 428 - 606
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629136
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacca 52629136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 27067159 - 27066978
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27067159 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 27067060  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27067059 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 40131140 - 40130959
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40131140 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccac 40131041  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  40131040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 47809784 - 47809596
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  47809784 ttttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 47809685  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47809684 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47809596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 22399098 - 22399280
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  22399098 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccac 22399197  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22399198 tt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22399280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28048573 - 28048390
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28048573 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 28048474  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28048473 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28048390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 41464353 - 41464535
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  41464353 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 41464452  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  41464453 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacca 41464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 7855295 - 7855114
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  7855295 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccac 7855196  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7855195 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 43612228 - 43612047
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  43612228 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccac 43612129  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43612128 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 51170214 - 51170034
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51170214 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51170115  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  51170114 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134540
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccat 46134540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 29626008 - 29625827
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29626008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29625909  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| || |||||    
T  29625908 ttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacc 29625827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 32234578 - 32234398
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32234578 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32234479  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32234478 tt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 37324542 - 37324723
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37324542 ttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 37324641  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37324642 ttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021896
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgagg-tcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 51102559 - 51102378
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  51102559 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 51102460  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  51102459 ttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 51452931 - 51452751
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  51452931 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 51452832  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  51452831 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgg-taccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 425 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293319
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 40643801 - 40643984
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||     
T  40643801 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcat 40643900  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40643901 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 40643984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 40804693 - 40804510
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  40804693 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggatacc 40804594  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40804593 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 428 - 603
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 44222830 - 44223012
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44222830 ttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccac 44222929  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44222930 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 2666001 - 2666182
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2666001 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2666100  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  2666101 ttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 39053395 - 39053576
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  39053395 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccac 39053494  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||  |||| ||| ||||||||||||    
T  39053495 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 39634752 - 39634572
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  39634752 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccac 39634654  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39634653 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48739414 - 48739233
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  48739414 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 48739315  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48739314 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 53943768 - 53943588
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  53943768 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 53943669  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  53943668 ttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-tactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 55453425 - 55453245
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55453425 ttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 55453326  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  55453325 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 20754574 - 20754393
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||    
T  20754574 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcac 20754475  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20754474 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 35748492 - 35748311
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35748492 ttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35748393  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35748392 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 588
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215241
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgg 52215241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 603
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  432 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaat 531  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  532 gtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 7755487 - 7755307
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  7755487 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccac 7755388  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  7755387 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 44806685 - 44806866
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  44806685 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccac 44806784  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  44806785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 52638843 - 52639024
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  52638843 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccac 52638942  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52638943 ttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacc 52639024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Original strand, 18946901 - 18947085
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18946901 tgattttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggatac 18947000  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18947001 cagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 579
Target Start/End: Original strand, 43125832 - 43125987
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43125832 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 43125931  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43125932 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 43125987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 41732529 - 41732711
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41732529 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccac 41732628  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  41732629 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacca 41732711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 579
Target Start/End: Original strand, 24376574 - 24376729
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  24376574 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 24376673  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24376674 ttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccatt 24376729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 446 - 605
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126168
Alignment:
Q  446 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggct 545  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 51146396 - 51146213
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51146396 ttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 51146297  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  51146296 ttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccaccat 51146213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Original strand, 35594122 - 35594299
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||    
T  35594122 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35594221  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35594222 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 47895001 - 47894822
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47895001 ttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47894902  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47894901 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 53832665 - 53832486
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||     
T  53832665 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaa 53832566  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  53832565 ttaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 578
Target Start/End: Original strand, 36368940 - 36369094
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36368940 ttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36369039  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 578  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36369040 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccaccat 36369094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Original strand, 53637842 - 53637989
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  53637842 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccac 53637941  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  53637942 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattac 53637989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5560213 - 5560025
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaa-----cgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  5560213 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggat 5560114  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggcta--atgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  5560113 accacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 424 - 569
Target Start/End: Original strand, 37758930 - 37759075
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  37758930 ttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccac 37759029  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759030 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 41216456 - 41216637
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  41216456 ttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccac 41216555  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  41216556 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 54159169 - 54159000
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  54159169 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccac 54159070  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||||||         ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54159069 ttaaaaatgt---------gcttatgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 588
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactta 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  527 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 602
Target Start/End: Original strand, 49130579 - 49130746
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||         
T  49130579 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaat----- 49130673  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  49130674 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38156802 - 38156632
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  38156802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 38156708  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  38156707 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 54707390 - 54707220
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  54707390 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 54707296  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  54707295 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 34279891 - 34279719
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  34279891 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 34279797  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  34279796 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccat 34279719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Original strand, 42589826 - 42590001
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  42589826 tttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 42589925  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
               |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  42589926 -----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 48547010 - 48546842
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  48547010 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaa-atagttcatggataccac 48546913  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||||||         ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48546912 ttaaaaatgt---------gcttatgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 51415970 - 51416140
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||| ||         
T  51415970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 51416064  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  51416065 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31286966 - 31286793
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||      
T  31286966 tgattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-- 31286869  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
             |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || |||||||||||||    
T  31286868 ---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 47511110 - 47510938
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  47511110 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 47511016  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  47511015 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 47510938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 417 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 55000355 - 55000167
Alignment:
Q  417 cttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatga 516  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  55000355 cttttggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatga 55000256  T
Q  517 ataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctctttttg 616  Q
    ||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  55000255 at-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttttctttttg 55000167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 25641647 - 25641817
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||              
T  25641647 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 25641736  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  25641737 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 41635970 - 41635800
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  41635970 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 41635876  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  41635875 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 55379986 - 55380158
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  55379986 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 55380085  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  55380086 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 55380158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 54401188 - 54401358
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  54401188 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 54401282  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||    
T  54401283 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacc 54401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 39141296 - 39141125
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  39141296 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 39141202  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
        | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  39141201 ----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg-taacctagttatcacc 39141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  490 tgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggc 589  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  590 taccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 53115448 - 53115618
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  53115448 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 53115547  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  53115548 ttaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacc 53115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 421 - 588
Target Start/End: Original strand, 40022072 - 40022228
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||      
T  40022072 tgattttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-- 40022169  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
             |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  40022170 ---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgg 40022228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 25353555 - 25353725
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  25353555 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 25353654  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25353655 ctaaaaa-----------ggtgaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 17665694 - 17665558
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  17665694 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 17665600  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
          || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17665599 ------atatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattac 17665558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 37028724 - 37028895
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||  |||||||||||||||||||         
T  37028724 ttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaat----- 37028818  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  37028819 ------atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 37028895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||||        | ||||   |||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43176808 ctaaaa--------aggtgg---atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 487 - 605
Target Start/End: Original strand, 52864554 - 52864671
Alignment:
Q  487 atttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  52864554 atttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattcttccat 52864652  T
Q  587 ggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||||||||||||    
T  52864653 gggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 42998965 - 42998853
Alignment:
Q  417 cttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatga 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||     
T  42998965 cttttggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatgg 42998867  T
Q  517 ataccacttaaaaa 530  Q
    ||||||| ||||||    
T  42998866 ataccacctaaaaa 42998853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 45058884 - 45059052
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  45058884 ttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 45058978  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
          |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| || |||||  | |||||||||||    
T  45058979 ------atgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 422 - 604
Target Start/End: Original strand, 51143816 - 51143987
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  51143816 gattttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacc 51143915  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    || ||||||           ||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51143916 acctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 24688115 - 24688285
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||||         
T  24688115 ttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat----- 24688209  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  24688210 ------atgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 30251671 - 30251501
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  30251671 ttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 30251572  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  |||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30251571 ctaaaaa-----------ggtgaatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28576282 - 28576184
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28576282 ttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 472 - 554
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  472 caatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 554  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 424 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2228105 - 2227996
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  2228105 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcac 2228006  T
Q  524 ttaaaaatgt 533  Q
    || |||||||    
T  2228005 ttcaaaatgt 2227996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 51224207 - 51224113
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  51224207 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 51224113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 432 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402811
Alignment:
Q  432 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaat 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcatg-ataccatttaaaaat 47402813  T
Q  532 gt 533  Q
    ||    
T  47402812 gt 47402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21597318 - 21597220
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  21597318 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731986
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 522
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780870
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 48726168 - 48726070
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||||   ||||||| |||||||| ||||||    
T  48726168 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44946099 - 44946014
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatag 509  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||    
T  44946099 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756065
Alignment:
Q  451 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggc----ta 546  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    ||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  547 atgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 52756065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 425 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847719
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  525 taaaaatgt 533  Q
    |||||||||    
T  8847727 taaaaatgt 8847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 475
Target Start/End: Original strand, 37741436 - 37741487
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 475  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37741436 ttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 475
Target Start/End: Original strand, 48752086 - 48752137
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 475  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48752086 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 48752137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Original strand, 52434140 - 52434214
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtg 497  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||    
T  52434140 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtg 52434214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945935
Alignment:
Q  530 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||  || |||||||||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534007
Alignment:
Q  530 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 51942586 - 51942543
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51942586 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 608
Target Start/End: Original strand, 40165763 - 40165825
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40165763 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcaccatc 40165825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 475
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177213
Alignment:
Q  423 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 475  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  177161 attttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaat 177213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429227
Alignment:
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||  ||||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731913
Alignment:
Q  554 ttggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 606
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780943
Alignment:
Q  554 ttggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165758
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| | |||||   |||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  40165752 ctaaaaa 40165758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 763 - 800
Target Start/End: Original strand, 31855403 - 31855440
Alignment:
Q  763 actaatattaacgaacttgcaactacatttaacaaact 800  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31855403 actaatattaactaacttgtaactacatttaacaaact 31855440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33696002 - 33695819
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33696002 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33695903  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33695902 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 33695819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165813
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 47740512 - 47740329
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47740512 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 47740413  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47740412 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 47740329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 25894098 - 25893916
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25894098 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25893999  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25893998 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 47067158 - 47066977
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47067158 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47067059  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  47067058 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 33423456 - 33423276
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33423456 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33423357  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33423356 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 48609858 - 48609675
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  48609858 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 48609759  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48609758 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 48609675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 422 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23393234 - 23393048
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23393234 gattttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 23393135  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23393134 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatc 23393048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33839896 - 33839715
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33839896 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33839797  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33839796 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Original strand, 27018118 - 27018302
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27018118 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 27018217  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27018218 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatc 27018302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 22979828 - 22979645
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22979828 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 22979729  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22979728 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 22979645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 17855430 - 17855611
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  17855430 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactac 17855529  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17855530 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 35355890 - 35356071
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  35355890 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 35355989  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  35355990 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171362
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 425 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690097
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 46913111 - 46913294
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46913111 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46913210  T
Q  524 ttaaaaa--tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46913211 ttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 35328250 - 35328069
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35328250 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35328151  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  35328150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37846197 - 37846016
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  37846197 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccac 37846098  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37846097 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 33411262 - 33411445
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33411262 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33411361  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  33411362 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccat 33411445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 2341843 - 2341661
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  2341843 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 2341744  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat-ggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  2341743 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 19563449 - 19563631
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19563449 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19563548  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  19563549 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacca 19563631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 418 - 615
Target Start/End: Original strand, 31586844 - 31587041
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  31586844 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgga 31586943  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctcttttt 615  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  31586944 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcaccttctattttt 31587041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 40670565 - 40670746
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40670565 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 40670664  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  40670665 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 26579904 - 26579717
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  26579904 ttttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgta 26579805  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26579804 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 35757201 - 35757020
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35757201 ttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccac 35757103  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35757102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 443 - 605
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389539
Alignment:
Q  443 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtg 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  543 gctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 10028490 - 10028674
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  10028490 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 10028589  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg--ctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  10028590 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacca 10028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 33332791 - 33332971
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33332791 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccac 33332889  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  33332890 ttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 45482660 - 45482841
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  45482660 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 45482759  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  45482760 ttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Original strand, 43499487 - 43499671
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43499487 ttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43499586  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43499587 ttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcaccatc 43499671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 5712170 - 5712353
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  5712170 ttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 5712269  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5712270 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 5712353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 425 - 596
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877724
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctacccta 596  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Original strand, 31625703 - 31625886
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31625703 tgattttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 31625802  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  31625803 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattac-caccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41991041 - 41990870
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  41991041 gattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 41990942  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctacc 593  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41990941 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 579
Target Start/End: Original strand, 33870247 - 33870402
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33870247 ttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccat 33870346  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33870347 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 33870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183825
Alignment:
Q  439 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtactta 538  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  539 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 31429656 - 31429473
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  31429656 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccac 31429557  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  31429556 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 31429473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 33720217 - 33720070
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  33720217 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 33720118  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720117 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 45063536 - 45063356
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  45063536 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccac 45063437  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  45063436 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacca 45063356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 447 - 605
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  447 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggcta 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  547 atgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 10618300 - 10618474
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  10618300 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccac 10618392  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  10618393 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 35767483 - 35767657
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35767483 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35767575  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35767576 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 35752204 - 35752034
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  35752204 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 35752110  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  35752109 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 474 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076527
Alignment:
Q  474 atgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactc 573  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  574 accattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 43489220 - 43489391
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  43489220 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 43489314  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||  |||||||||||||    
T  43489315 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 43489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 46898186 - 46898016
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| | |||| ||| || |||||| ||||||||||||||        
T  46898186 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata---- 46898091  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46898090 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 468 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233935
Alignment:
Q  468 caaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 567  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  568 ttactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 28233935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 36817015 - 36816843
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  36817015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 36816921  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  36816920 ------atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 36816843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 427 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876328
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactta 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||||||||            
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-------- 7876404  T
Q  527 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| | || |||||||||||||    
T  7876403 ---atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 418 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26941708 - 26941549
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26941708 ttttggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaa 26941609  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    |           |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  26941608 t-----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgg 26941549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 32556776 - 32556637
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||         
T  32556776 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatgaat----- 32556682  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 574  Q
          |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556681 ------atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactca 32556637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 24923194 - 24923024
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||| |||||||||         
T  24923194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat----- 24923100  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || || ||||| || |||||||||||||    
T  24923099 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 46817591 - 46817421
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  46817591 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 46817497  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  46817496 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 489 - 605
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904388
Alignment:
Q  489 ttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  589 ctaccctagttgtcacc 605  Q
     || |||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Original strand, 48085860 - 48085995
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||||||||         
T  48085860 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 48085954  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 570  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085955 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 48085995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128109
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 2332021 - 2332193
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||         
T  2332021 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaat----- 2332115  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2332116 ------atgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcaccat 2332193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 24228543 - 24228713
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  24228543 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 24228637  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  24228638 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 25037678 - 25037516
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||         
T  25037678 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat----- 25037584  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctag 597  Q
          |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  25037583 ------atgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 422 - 607
Target Start/End: Original strand, 26371049 - 26371223
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||||       
T  26371049 gattttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat--- 26371145  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
            |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  26371146 --------atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 26371223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 29610637 - 29610807
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||         
T  29610637 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaat----- 29610731  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | |||||| ||||    
T  29610732 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Original strand, 39323618 - 39323713
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  39323618 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39323713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 440 - 579
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564495
Alignment:
Q  440 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttat 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  540 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatt 44564495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237533
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||         
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaat----- 45237609  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| || | |||||||||||    
T  45237608 ------atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 33393330 - 33393499
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  33393330 ttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 33393429  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
     ||||||           || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33393430 ctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 29098753 - 29098921
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||             
T  29098753 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat--------- 29098843  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||| |||||    
T  29098844 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttaccat 29098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 498358 - 498187
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  498358 ttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 498264  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  498263 ------atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacca 498187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 7257383 - 7257554
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7257383 ttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 7257482  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
     ||||||           ||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7257483 ctaaaaa-----------ggtgaatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacca 7257554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 21718119 - 21718288
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  21718119 ttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 21718213  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  21718214 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 44003540 - 44003370
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  44003540 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 44003441  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44003440 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 605
Target Start/End: Original strand, 44405425 - 44405531
Alignment:
Q  499 ggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagt 598  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||  |||||    
T  44405425 ggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttccatgggtattctagt 44405524  T
Q  599 tgtcacc 605  Q
    |||||||    
T  44405525 tgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 428 - 604
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||             
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat--------- 46103216  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  |||||||||||    
T  46103217 --atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 422 - 519
Target Start/End: Original strand, 39866665 - 39866762
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  39866665 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 47906929 - 47906758
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||||||||         
T  47906929 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 47906835  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  47906834 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455193
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 33455193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 16482953 - 16482847
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16482953 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccac 16482854  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  16482853 ctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 45502986 - 45502817
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||  |||||||           ||||||     
T  45502986 ttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaag-----------ataccat 45502898  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||    
T  45502897 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 523
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||   |||| |||||||||| |||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 39453645 - 39453558
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagtt 511  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||    
T  39453645 ttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 47460944 - 47460770
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  47460944 gattttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 47460845  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    || ||||||       |||     ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  47460844 acctaaaaa------gatg-----aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 47460770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Original strand, 44659846 - 44659940
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  44659846 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata 44659940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 15644116 - 15644010
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  15644116 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccac 15644017  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  15644016 ctaaaaa 15644010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30077106 - 30077048
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 482  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30077106 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 30077048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 35484638 - 35484807
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||||||||||        
T  35484638 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaat---- 35484733  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
           |||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| || |||| ||||||    
T  35484734 -------atgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855228
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||  ||||||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctac-cctagttgt 601  Q
     |||| || | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Original strand, 35557732 - 35557791
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 483  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557732 ttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 35557791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Original strand, 35823292 - 35823351
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 483  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35823292 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatga 35823351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448509
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 7720673 - 7720574
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| | | |||| | | |  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7720673 ttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37443661 - 37443602
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  37443661 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 536 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 39453551 - 39453484
Alignment:
Q  536 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||    
T  39453551 ttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 21602431 - 21602378
Alignment:
Q  681 gaatcaattatctattttgctcacgatcggaagtcgattgatacaatggatttc 734  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21602431 gaatcaataatctattttgctcagcaacggaagttgattgatacaatggatttc 21602378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 531
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  470 accaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaat 531  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 605
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323779
Alignment:
Q  537 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||  || |||||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 459
Target Start/End: Original strand, 42272153 - 42272188
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42272153 ttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 540 - 606
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272245
Alignment:
Q  540 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacca 42272245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 546 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 15644005 - 15643948
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  15644005 aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19416416 - 19416375
Alignment:
Q  286 ttgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaat 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19416416 ttgtatatgatttatgtattcaatataatctttagtttaaat 19416375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Original strand, 5882501 - 5882688
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5882501 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 5882600  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5882601 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 22551242 - 22551059
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  22551242 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 22551143  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22551142 ctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22551059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 28947088 - 28947271
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  28947088 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccac 28947187  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28947188 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28947271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452570
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 33452570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 14891560 - 14891383
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14891560 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14891461  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14891460 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 24168092 - 24168273
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24168092 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24168191  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24168192 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 26377385 - 26377204
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26377385 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26377286  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26377285 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 8615241 - 8615423
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8615241 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 8615340  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8615341 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacca 8615423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 1970712 - 1970893
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1970712 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 1970811  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  1970812 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 426 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101493
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  526 aaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 18101493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7345293 - 7345114
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  7345293 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 7345194  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  7345193 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19415714 - 19415533
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19415714 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccac 19415615  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19415614 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 34528043 - 34527862
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  34528043 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 34527944  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34527943 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 599893 - 600076
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  599893 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 599992  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  599993 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 600076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 960085 - 959902
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||    
T  960085 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccac 959986  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  959985 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 959902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 10508094 - 10507908
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10508094 tttggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 10507995  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10507994 accacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 7393767 - 7393586
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7393767 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7393668  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  7393667 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 436 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988974
Alignment:
Q  436 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtac 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  536 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 2594033 - 2593852
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2594033 ttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2593934  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  2593933 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 588
Target Start/End: Original strand, 16703367 - 16703531
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16703367 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 16703466  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16703467 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgg 16703531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 19281236 - 19281056
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19281236 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 19281137  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  19281136 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 30743632 - 30743448
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  30743632 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggatac 30743533  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||| ||||||| || |||||    
T  30743532 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacc 30743448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 436 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341788
Alignment:
Q  436 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  534 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5294984 - 5294801
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  5294984 gattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 5294885  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  5294884 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5299536 - 5299353
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  5299536 gattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 5299437  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  5299436 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24224252 - 24224068
Alignment:
Q  424 ttttttctagatt-acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24224252 ttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 24224153  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| || ||||  || |||||||||||||||    
T  24224152 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcaccat 24224068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30467789 - 30467656
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30467789 tttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 30467690  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgt 552  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30467689 accacttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 28949015 - 28948844
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||| |||||||||         
T  28949015 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat----- 28948921  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  28948920 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28948844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 598
Target Start/End: Original strand, 13329382 - 13329545
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||              
T  13329382 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 13329471  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagt 598  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||    
T  13329472 -taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 455 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261929
Alignment:
Q  455 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  555 tggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||  |||| || || ||| | ||||||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 7167583 - 7167753
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  7167583 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccac 7167682  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7167683 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 15965434 - 15965604
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||| |||||| |||||||||         
T  15965434 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaat----- 15965528  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  15965529 ------atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487698
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 4487622  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  4487623 ------atgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 505
Target Start/End: Original strand, 929660 - 929741
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaag 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  929660 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291179
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 1398554 - 1398724
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||         
T  1398554 ttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaat----- 1398648  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||| | || |||||||||||||    
T  1398649 ------atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 3786750 - 3786921
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| || ||| |||||| |||||||||||||         
T  3786750 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaat----- 3786844  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  3786845 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3786921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 375894 - 375797
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||  | |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  375894 ttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 530
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaa 530  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11743125 - 11743070
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaa 479  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743125 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 530 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913096
Alignment:
Q  530 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || | |||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939583
Alignment:
Q  429 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatg 515  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg 1939583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 606
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661906
Alignment:
Q  530 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 18661906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 605
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 546 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 24253383 - 24253566
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24253383 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24253482  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24253483 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 24253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 5184973 - 5185154
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5184973 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 5185072  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  5185073 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 6901800 - 6901979
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6901800 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 6901899  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6901900 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 43326560 - 43326379
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43326560 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43326461  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  43326460 ttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398483
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479666
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcaccat 18479666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Original strand, 35626033 - 35626220
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  35626033 ttttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgga 35626132  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  35626133 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 40886208 - 40886026
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40886208 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 40886109  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  40886108 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcaccat 40886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 3466862 - 3466681
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3466862 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3466763  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  3466762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 7722050 - 7722231
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7722050 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 7722149  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  7722150 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 12648798 - 12648979
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  12648798 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 12648897  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12648898 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 39932580 - 39932761
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39932580 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39932679  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  39932680 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 27938898 - 27939080
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27938898 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27938997  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat-ggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  27938998 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 739885 - 739704
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  739885 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 739786  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  739785 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 739704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 43262364 - 43262183
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43262364 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 43262265  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43262264 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27501236 - 27501053
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27501236 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27501137  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27501136 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 27501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 28424974 - 28424795
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28424974 ttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgca--atttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 28424877  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  28424876 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 15683792 - 15683973
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15683792 ttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15683891  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  15683892 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484290
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 2484290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 25831522 - 25831702
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||     
T  25831522 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaa 25831620  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| || ||||||||    
T  25831621 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 434 - 606
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939080
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  534 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
      |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacca 31939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 27278658 - 27278474
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatag----ttcatgaata 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    |||||| |||    
T  27278658 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggata 27278559  T
Q  520 ccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  27278558 ccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 425 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504739
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatc 13504739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 5137716 - 5137897
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5137716 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 5137815  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||  ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  5137816 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 434 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278856
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  534 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcaccat 40278856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 890907 - 891087
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  890907 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccac 891006  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  891007 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 460 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  460 ttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  560 ggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Original strand, 33617581 - 33617756
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33617581 tttggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat 33617680  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
               |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  33617681 -----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 465 - 608
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451435
Alignment:
Q  465 caccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggt 564  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  565 aaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatc 34451435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 431 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756487
Alignment:
Q  431 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaa 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  531 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattatt-ccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| || |||| | ||||||||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 763724 - 763905
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||    
T  763724 ttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcac 763823  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||  |||| ||| ||||||||||||    
T  763824 ttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 587
Target Start/End: Original strand, 40110235 - 40110397
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  40110235 ttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatagataccac 40110333  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatg 587  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||   |||||| |||||||    
T  40110334 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatg 40110397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 27503380 - 27503551
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  27503380 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 27503474  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  27503475 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 27503551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 586
Target Start/End: Original strand, 4149695 - 4149847
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |          || |||||||    
T  4149695 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtta----------tggataccac 4149784  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat 586  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4149785 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 5497274 - 5497444
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||         
T  5497274 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat----- 5497368  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  5497369 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 6973064 - 6973234
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  6973064 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 6973158  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  6973159 ------atgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293987
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||  ||||  | |||| ||||||||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| | |||| |||  | |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcaccat 31293987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015514
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 38015590  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  38015589 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 19295731 - 19295902
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||| ||||||||||||| ||         
T  19295731 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat----- 19295825  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  19295826 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 19295902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 36365615 - 36365480
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  36365615 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 36365521  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 570  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36365520 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatta 36365480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 23195418 - 23195248
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  23195418 ttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 23195324  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  23195323 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 418 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24167960 - 24167782
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  24167960 ttttggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatgga 24167861  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||| ||||||           ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24167860 taccacctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 24167782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 567
Target Start/End: Original strand, 40632500 - 40632634
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||      
T  40632500 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc-- 40632597  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 567  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632598 -------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 9424762 - 9424593
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  9424762 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 9424668  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
          || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  9424667 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 12558199 - 12558091
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  12558199 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcatg-ataccac 12558101  T
Q  524 ttaaaaatgt 533  Q
    ||||||||||    
T  12558100 ttaaaaatgt 12558091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 13957671 - 13957841
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  13957671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 13957765  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  13957766 ------atgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 42658832 - 42658679
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  42658832 ttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 42658738  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
          || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  42658737 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 42658679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Original strand, 2585457 - 2585633
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  2585457 ttttggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgga 2585556  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||  ||||||         || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  2585557 taccatctaaaaa---------gttg--aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||||||||||         
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaat----- 9374578  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  9374577 ------atgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 42247952 - 42247857
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  42247952 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata 42247857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656567
Alignment:
Q  450 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  || |||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  550 tgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 531
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaat 531  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972150
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||| ||||||         
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaat----- 14972073  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  14972074 ------atgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 14972150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 36472454 - 36472348
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  36472454 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 36472355  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
    || ||||    
T  36472354 tttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 9527192 - 9527124
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgattt 490  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9527192 gattttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38638080 - 38637910
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||     
T  38638080 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaa 38637981  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38637980 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687069
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||         |||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||    
T  40687000 ctaaaaa---------gtg---aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Original strand, 6206885 - 6207021
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || | | |||||| |||||||||||||         
T  6206885 ttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaat----- 6206979  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206980 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 6207021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18327343 - 18327171
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  18327343 ttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 18327244  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18327243 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcaccat 18327171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 1402675 - 1402505
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  1402675 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
      |||||           ||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  1402575 ccaaaaa-----------ggtgaatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 605
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390768
Alignment:
Q  431 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaa 530  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  531 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
               ||  |||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27390705 -----------ggtgaatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagata 508  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  428 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaa 527  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | |||| ||| ||||||  ||            
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggta-------- 33624014  T
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
       ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33624013 ---tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 457 - 607
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492785
Alignment:
Q  457 aatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattg 556  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||           |||| |||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  557 gttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcatgg-tagcctagttgccaccat 38492785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612757
Alignment:
Q  449 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaat 548  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||  |||             | ||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  549 gtgtattggttggg-gtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  447 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948492
Alignment:
Q  449 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaat 548  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||  ||||||||||||| ||           |||| ||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggt-agggtaagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  549 gtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  36948545 gtgtattgg-tagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 485
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756140
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaac 485  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatgaac 28756140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Original strand, 27584386 - 27584448
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtggg--taatttacccaccaaccaatgaaaatgaa 484  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27584386 ttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatgaa 27584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300984
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 483  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatga 15300984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940336
Alignment:
Q  542 ggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcacc 3940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  456 taatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| || | | ||||||||||||| ||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13002608 - 13002567
Alignment:
Q  286 ttgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaat 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13002608 ttgtatatgatttatgcattcaatataatctttggtttaaat 13002567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13077266 - 13077225
Alignment:
Q  286 ttgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaat 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13077266 ttgtatatgatttatgcattcaatataatctttggtttaaat 13077225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 23437593 - 23437776
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23437593 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23437692  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23437693 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23437776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366608
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21366608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 34276548 - 34276729
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34276548 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 34276647  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34276648 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 43471876 - 43471695
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43471876 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccac 43471777  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43471776 ttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 47344657 - 47344838
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47344657 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47344756  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47344757 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 616
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020121
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctctttttg 616  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacaatttctttttg 6020121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 41702640 - 41702461
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  41702640 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 41702541  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41702540 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 53854610 - 53854428
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53854610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53854511  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53854510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcaccat 53854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 9798466 - 9798648
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9798466 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 9798565  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9798566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9798648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 3170627 - 3170808
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3170627 ttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 3170726  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3170727 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 51363008 - 51363190
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  51363008 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 51363107  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51363108 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcaccat 51363190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 29478361 - 29478543
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29478361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 29478460  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  29478461 ttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 29478543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 146610 - 146429
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  146610 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 146511  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||    
T  146510 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 237478 - 237659
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  237478 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacac 237577  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  237578 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 2826862 - 2826682
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2826862 ttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2826763  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2826762 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 42085208 - 42085389
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42085208 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42085307  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  42085308 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984944
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44984944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 32366841 - 32366661
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32366841 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 32366742  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32366741 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18462194 - 18462011
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  18462194 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcac 18462095  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18462094 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 18462011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 31532316 - 31532133
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31532316 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31532217  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31532216 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 31532133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 423 - 606
Target Start/End: Original strand, 42222291 - 42222474
Alignment:
Q  423 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  42222291 attttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgatacca 42222390  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  42222391 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacca 42222474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 54575121 - 54574938
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54575121 ttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccac 54575022  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54575021 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 54574938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 39077546 - 39077727
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39077546 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 39077645  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39077646 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 42766022 - 42765842
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42766022 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccac 42765924  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  42765923 ttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 53461997 - 53461816
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53461997 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 53461898  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  53461897 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 22618696 - 22618514
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22618696 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggatac 22618598  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22618597 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26091439 - 26091255
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26091439 ttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26091340  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26091339 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatc 26091255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 426 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972335
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  526 aaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacca 31972335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 397403 - 397582
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  397403 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 397502  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  397503 ttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 27373077 - 27373259
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27373077 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 27373176  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27373177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-tactctaattgtcaccat 27373259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 419 - 606
Target Start/End: Original strand, 41949378 - 41949567
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41949378 tttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 41949477  T
Q  519 accacttaaaaatgtact--tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  41949478 accacttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacca 41949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 54607963 - 54608145
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54607963 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 54608062  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  54608063 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacca 54608145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 45797480 - 45797661
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45797480 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45797579  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  45797580 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 45797661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 55056440 - 55056259
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  55056440 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaac 55056341  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  55056340 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 418 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 56023185 - 56022996
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  56023185 ttttggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatgga 56023086  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  56023085 taccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 56022996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 6285308 - 6285491
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  6285308 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6285407  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6285408 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtccccat 6285491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 23609088 - 23609270
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  23609088 ttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccac 23609187  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  23609188 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacca 23609270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 2243459 - 2243640
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2243459 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccac 2243558  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2243559 ttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19387869 - 19387688
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  19387869 ttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 19387770  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19387769 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 29777438 - 29777257
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||| | | |||||||    
T  29777438 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccac 29777339  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29777338 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 55776046 - 55776226
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55776046 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggataccac 55776144  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  55776145 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 55840224 - 55840404
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55840224 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggataccac 55840322  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  55840323 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 407755 - 407936
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  407755 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cac 407853  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  407854 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 407936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 50457991 - 50457812
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  50457991 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 50457892  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  50457891 ttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 41560329 - 41560511
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  41560329 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 41560428  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  41560429 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacca 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 49881244 - 49881057
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  49881244 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 49881145  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggg----taaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49881144 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcaccat 49881057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31070254 - 31070074
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31070254 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccac 31070156  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31070155 ttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 31914199 - 31914379
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31914199 ttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31914298  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31914299 ttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 50234001 - 50234182
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  50234001 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccac 50234100  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  50234101 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41632187 - 41632005
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |    
T  41632187 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggatatcgc 41632089  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  41632088 ttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcaccat 41632005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 48313558 - 48313739
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48313558 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggataccac 48313656  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    || ||||| | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  48313657 tt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 48313739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 601
Target Start/End: Original strand, 50534630 - 50534809
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50534630 gattttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 50534729  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  50534730 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 55519828 - 55520011
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  55519828 ttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccac 55519927  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  55519928 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 55520011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 3692396 - 3692210
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | | ||||||||| ||  ||    
T  3692396 tttggttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgat 3692297  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3692296 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 53834237 - 53834055
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53834237 gattttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggatacc 53834138  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53834137 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 54086411 - 54086591
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  54086411 ttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtg-ggtcaagatagttcatggataccgc 54086508  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  54086509 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 54086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 38591669 - 38591846
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  38591669 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccat 38591768  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38591769 t----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 54805799 - 54805614
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||    
T  54805799 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccac 54805700  T
Q  524 ttaaaaatg----tacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  54805699 ttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 35446507 - 35446688
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||    
T  35446507 ttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35446605  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  35446606 ttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgttacca 35446688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 42033176 - 42033358
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  42033176 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 42033275  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42033276 ttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 42033358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 47662283 - 47662102
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  ||||| |||||| ||| |||||||    
T  47662283 ttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccac 47662184  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  47662183 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatg 587  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 14017555 - 14017376
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14017555 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14017456  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||  || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14017455 tt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 1932764 - 1932945
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  1932764 ttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccac 1932863  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  1932864 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 425 - 605
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48658000
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 54424983 - 54425163
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  54424983 ttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 54425082  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  54425083 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccatgg-tacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655002
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggcta------atgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 419 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 39587965 - 39587796
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39587965 tttggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 39587866  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39587865 accacttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259512
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctacttatcacc 48259512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 50536805 - 50536628
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  50536805 ttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 50536706  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  50536705 ttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 425 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897504
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctacccta 596  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||| || | |||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 463 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  463 cccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggg 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  563 gtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9998101 - 9997928
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| | |||||||||||||||||||        
T  9998101 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata---- 9998006  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9998005 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatc 9997928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 422 - 603
Target Start/End: Original strand, 51951681 - 51951861
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||| ||| |    
T  51951681 gattttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatc 51951780  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  51951781 agttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891099
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  ||||| |||||||||||||         
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaat----- 43891023  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  43891024 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 45633949 - 45633779
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  45633949 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 45633855  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  45633854 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 54216906 - 54216733
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||         
T  54216906 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat----- 54216812  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
          |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  54216811 ------atgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcaccatc 54216733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 36533001 - 36532830
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36533001 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttac------accac----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 36532912  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  36532911 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5117608 - 5117438
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  5117608 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 5117514  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117513 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351842
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||         
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 20351918  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  20351917 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 54715036 - 54715206
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||||         
T  54715036 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaat----- 54715130  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  54715131 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15060459 - 15060288
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  15060459 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 15060365  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15060364 ------atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 15060288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 49014099 - 49014270
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  49014099 ttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 49014193  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  49014194 ------atgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31881484 - 31881314
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  31881484 ttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 31881390  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  31881389 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 34835178 - 34835348
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  34835178 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 34835277  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34835278 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37239260 - 37239090
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  37239260 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 37239166  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  37239165 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 34552320 - 34552491
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||  |||||||||||||||||||         
T  34552320 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaat----- 34552414  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  34552415 ------atgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 34552491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 508 - 607
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595871
Alignment:
Q  508 agttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 35595871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 47811907 - 47812077
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||| |   |||||||||||||||||||         
T  47811907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaat----- 47812001  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  47812002 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 22620594 - 22620765
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  22620594 ttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 22620688  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  |||| || |||||||| |||||    
T  22620689 ------atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacca 22620765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 427 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708741
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactta 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||            
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-------- 46708817  T
Q  527 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
       |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| | || |||||||||||||    
T  46708816 ---atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 4486751 - 4486581
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||| |||||||||         
T  4486751 ttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat----- 4486657  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  4486656 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacc 4486581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11972299 - 11972204
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  11972299 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 11972204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 27398773 - 27398607
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27398773 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27398674  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    |||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  27398673 ttaaaaatgta-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38547771 - 38547601
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38547771 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 38547672  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  38547671 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 54216314 - 54216482
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||||||||         
T  54216314 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 54216408  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
          |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||| || ||||| || |||||||||||    
T  54216409 ------atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 52688350 - 52688520
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| | |||| |||||||||||||         
T  52688350 ttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaat----- 52688444  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  52688445 ------atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580226
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  27580220 ctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 33289699 - 33289875
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| || ||  | ||||||||||||||||||    
T  33289699 tttggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaat 33289798  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||||||||    
T  33289799 ac-----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcaccat 33289875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 27873718 - 27873582
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||| || ||| ||| ||||||||||||||||         
T  27873718 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaat----- 27873624  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873623 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 27873582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 52461367 - 52461534
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  52461367 ttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 52461458  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  52461459 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 3293193 - 3293098
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  3293193 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 3293098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 507
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Original strand, 46720026 - 46720195
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  46720026 ttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccac 46720125  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
     |||||| ||   |||       |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46720126 ctaaaaaggt-gatat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 607
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573976
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactta 526  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  527 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||| ||            ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  573907 aaaaagt-----------gaatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcaccat 573976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 1662429 - 1662323
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  1662429 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 1662330  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  1662329 ctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 424 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| || |||||||||  ||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  524 ttaaaa 529  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 478 - 606
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509479
Alignment:
Q  478 aaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacca 577  Q
    |||||| | |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  578 ttattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacca 42509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 33558114 - 33557976
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||  ||||||||||||||||||||       
T  33558114 gattttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaat--- 33558018  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
            ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33558017 --------atgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattac 33557976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 535 - 604
Target Start/End: Original strand, 33048993 - 33049062
Alignment:
Q  535 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33048993 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 6371419 - 6371249
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| || | |  ||||||    
T  6371419 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccac 6371320  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  6371319 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 6371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 419 - 522
Target Start/End: Original strand, 43231499 - 43231601
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  43231499 tttggttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggat 43231597  T
Q  519 acca 522  Q
    ||||    
T  43231598 acca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 471 - 561
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  471 ccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaa-gatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgg 561  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 604
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  503 aagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  603 ac 604  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 424 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 17555667 - 17555617
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555667 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 528 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  528 aaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  537 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 606
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872751
Alignment:
Q  451 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgt 550  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| || ||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||            |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  551 gtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacca 27872751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981505
Alignment:
Q  530 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcatt 51981505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206608
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagata 508  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 18206608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662261
Alignment:
Q  553 attggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 605
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  500 gtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||        ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||| || | |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17433508 - 17433465
Alignment:
Q  284 gattgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaat 327  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17433508 gattgtatatgatttatgcattcaatataatctttggtttaaat 17433465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 114)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 45538154 - 45538337
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  45538154 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 45538253  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45538254 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45538337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 31308002 - 31308183
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31308002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31308101  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31308102 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 3611137 - 3611320
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3611137 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3611236  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3611237 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 3611320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 425 - 603
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251891
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 44661971 - 44662152
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  44661971 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 44662070  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44662071 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21139593 - 21139410
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21139593 ttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 21139494  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  21139493 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 21139410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 26277178 - 26277361
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26277178 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26277277  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26277278 ttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26277361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 17995132 - 17994951
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17995132 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccac 17995033  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17995032 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 31040710 - 31040891
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31040710 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31040809  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31040810 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37620373 - 37620192
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37620373 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 37620274  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  37620273 ttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25678440 - 25678257
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25678440 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25678341  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  25678340 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccat 25678257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26085578 - 26085396
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26085578 tttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 26085480  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085479 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 425 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068689
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Original strand, 5981166 - 5981352
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5981166 tttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 5981265  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5981266 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 25058689 - 25058871
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  25058689 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccac 25058788  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25058789 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25058871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 33884089 - 33884270
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  33884089 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33884188  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33884189 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33960163 - 33959982
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||     
T  33960163 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccat 33960064  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33960063 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38332040 - 38331859
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38332040 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 38331941  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  38331940 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24245206 - 24245024
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24245206 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24245107  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24245106 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 24245024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 47671587 - 47671769
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  47671587 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccac 47671686  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47671687 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 47671769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 6327728 - 6327548
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6327728 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6327629  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6327628 ttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 23984756 - 23984937
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23984756 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23984855  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23984856 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 26525070 - 26524889
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  26525070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccac 26524971  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26524970 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33112998 - 33112818
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  33112998 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 33112899  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  33112898 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg-taccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790197
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 46616550 - 46616731
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  46616550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcac 46616649  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  46616650 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 418 - 617
Target Start/End: Original strand, 36566325 - 36566524
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  36566325 ttttggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 36566424  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctctttttga 617  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  36566425 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatatgtttttga 36566524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317499
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 47317499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 23932690 - 23932509
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  23932690 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccac 23932591  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23932590 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 24885502 - 24885683
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24885502 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 24885601  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  24885602 ttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 601
Target Start/End: Original strand, 26794305 - 26794482
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  26794305 ttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 26794404  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgt 601  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26794405 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 39646569 - 39646750
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  39646569 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccac 39646668  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39646669 ttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 5980069 - 5980250
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  5980069 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccac 5980168  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  5980169 ttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 577
Target Start/End: Original strand, 31844377 - 31844530
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31844377 ttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccac 31844476  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacca 577  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31844477 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 41999816 - 41999997
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  41999816 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccac 41999915  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  41999916 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 49254156 - 49253975
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  49254156 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 49254057  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  49254056 ttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacc 49253975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 35273597 - 35273780
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35273597 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 35273696  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35273697 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 35273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 35692845 - 35692663
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  35692845 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccg 35692746  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  35692745 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 46784424 - 46784606
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  46784424 ttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccac 46784523  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  46784524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacca 46784606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 46967222 - 46967040
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46967222 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46967123  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  46967122 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 46967040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 47383913 - 47383731
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47383913 ttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 47383814  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  47383813 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacca 47383731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774399
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 23221110 - 23220933
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23221110 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23221011  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  23221010 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgtgaccat 23220933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 425 - 587
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864029
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatg 587  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 51057072 - 51057254
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  51057072 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccac 51057171  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  51057172 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 51057254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 3285403 - 3285582
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3285403 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 3285502  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  3285503 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 602
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 49399169 - 49398987
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||    
T  49399169 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccac 49399070  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  49399069 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacca 49398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 561
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgg 561  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 47187106 - 47187287
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  47187106 ttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 47187205  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  47187206 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 42313546 - 42313361
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg----gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  42313546 ttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaata 42313447  T
Q  520 ccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  42313446 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003315
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattc---catggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||   ||| | ||||||||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 48373505 - 48373677
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48373505 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 48373604  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  48373605 ttaaaaatgt---------gcttatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 10928068 - 10928238
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||         
T  10928068 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat----- 10928162  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  10928163 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 27983768 - 27983602
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||                ||||||     
T  27983768 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccat 27983685  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27983684 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27983602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41467802 - 41467630
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  41467802 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 41467708  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  41467707 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 41467630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 51403188 - 51403034
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51403188 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 51403089  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatgg 588  Q
    || |||||||         ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51403088 tt-aaaatgt---------gcttatatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 33073212 - 33073382
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||||||||||||         
T  33073212 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat----- 33073306  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33073307 ------atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 2657304 - 2657474
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  2657304 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 2657398  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  2657399 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045594
Alignment:
Q  464 ccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggg 563  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  564 taaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||| ||||||| ||| | || || |||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcaccat 51045594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 424 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26472349 - 26472185
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  26472349 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 26472255  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
          |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||    
T  26472254 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 425 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtg 542  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 458 - 606
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450677
Alignment:
Q  458 atttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattgg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  558 ttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2450677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 605
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  477 aaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 576  Q
    ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  577 attattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 6626194 - 6626025
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  6626194 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 6626100  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  6626099 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 29770671 - 29770841
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  29770671 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 29770765  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  29770766 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 2557027 - 2556909
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2557027 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccac 2556928  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtg 542  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  2556927 ttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 425 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475869
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccatt 45475869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13281732 - 13281597
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||         
T  13281732 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat----- 13281638  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 570  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13281637 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatta 13281597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 2954856 - 2955026
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  2954856 ttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccac 2954955  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||           ||  | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2954956 ttaaaaa-----------ggtgattgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953223
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| | ||||||||||||||||||         
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 4953147  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  4953148 ------atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 26685857 - 26686027
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  26685857 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccac 26685956  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||||| ||            ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26685957 ctaaaaaagt-----------gaatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 426 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289908
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||           
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaat------- 30289986  T
Q  526 aaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
        |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  30289985 ----atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcaccat 30289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895163
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||          
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaat------ 41895240  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  41895239 -----atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 42234841 - 42235010
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  42234841 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 42234935  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  42234936 ------atgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 10920201 - 10920373
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  10920201 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 10920300  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
     ||||||           ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  10920301 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcaccat 10920373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 434 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293455
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||           ||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 44293527  T
Q  534 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  44293526 acttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 501 - 605
Target Start/End: Original strand, 4156472 - 4156576
Alignment:
Q  501 tcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttg 600  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||    
T  4156472 tcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatttttccatgggtactctagttg 4156571  T
Q  601 tcacc 605  Q
    |||||    
T  4156572 tcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 4243660 - 4243490
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||| ||||||||||||| ||||||         
T  4243660 ttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaat----- 4243566  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  4243565 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 51155759 - 51155590
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||         
T  51155759 ttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatgaat----- 51155665  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          ||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  51155664 ------atgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg-taccttagctgtcacc 51155590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13313346 - 13313253
Alignment:
Q  424 ttttttctagatta--cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatg 515  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13313346 ttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatg 13313253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 519
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448744
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 32448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Original strand, 52323939 - 52324045
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  52323939 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccac 52324038  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  52324039 ctaaaaa 52324045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 426 - 609
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388648
Alignment:
Q  426 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactt 525  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  526 aaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatct 609  Q
    |||||           ||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1388576 aaaaa-----------ggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccatct 1388648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 34752484 - 34752320
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| || ||| | | ||||||||||||||||         
T  34752484 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaat----- 34752390  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||| || |||||||    
T  34752389 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 38716417 - 38716247
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  38716417 ttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 38716318  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  38716317 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544121
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 44544121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 512 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312530
Alignment:
Q  512 catgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 13312530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 24649892 - 24649802
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcat 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24649892 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 33187341 - 33187507
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||    
T  33187341 ttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccac 33187440  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||                 ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33187441 ttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 33187507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 46428423 - 46428328
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  46428423 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatgaata 46428328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683330
Alignment:
Q  435 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgta 534  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||        
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaa---- 48683394  T
Q  535 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
       |||     ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48683393 --gatg-----aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4156246 - 4156188
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156246 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 27924828 - 27924722
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  27924828 ttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 27924729  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  27924728 ctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 39475952 - 39475844
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  39475952 ttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtg-ggtcaagatagtttatggataccac 39475854  T
Q  524 ttaaaaatgt 533  Q
     |||||||||    
T  39475853 ctaaaaatgt 39475844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5961437 - 5961267
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  5961437 ttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 5961338  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5961337 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 7561714 - 7561527
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaa-gatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||  |    | ||  |||     
T  7561714 gattttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatag 7561615  T
Q  521 cacttaaaaatgtactta--tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
      | | || |||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7561614 ttcatgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 424 - 513
Target Start/End: Original strand, 39637901 - 39637986
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttca 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39637901 ttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 530
Target Start/End: Original strand, 52367878 - 52367990
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  ||||||||||||| ||| |    
T  52367878 ttttggttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatgga 52367977  T
Q  518 taccacttaaaaa 530  Q
    |||||| ||||||    
T  52367978 taccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 324
Target Start/End: Original strand, 32044590 - 32044669
Alignment:
Q  245 aagtagctaggaatataatgtattacttttaatctagtcgattgtatatgatttatatattcaatataacctttggttta 324  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32044590 aagtagctaggattttaatgtattactcttaatctagctgattgtatatgatttatgcattcaatataacctttggttta 32044669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 425 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991634
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||          
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat------ 35991675  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 570  Q
         || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35991674 -----atatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatta 35991634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10919364 - 10919313
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 475  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919364 ttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31286563 - 31286504
Alignment:
Q  546 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31286563 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 38718309 - 38718165
Alignment:
Q  458 atttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattgg 557  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||     | || |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  38718309 atttatccaccgaccaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaata-----tgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcgg 38718215  T
Q  558 ttggg-gtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  38718214 ttgggagtaaattacccatcattctttcatgg-tagcctagttgtcaccat 38718165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 586
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359544
Alignment:
Q  544 ctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccat 39359544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 750 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 4365585 - 4365534
Alignment:
Q  750 taaactaatttgt-actaatattaacgaacttgcaactacatttaacaaact 800  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4365585 taaactaatttgtcactaatataaaccaacttgtaactacatttaacaaact 4365534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 413
Target Start/End: Original strand, 8934062 - 8934105
Alignment:
Q  370 ttttgaattagcaagtgtgatacatcgacttgttactcaaggga 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8934062 ttttgatttagcaagtgtgatacaacgacttgttacttaaggga 8934105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 464
Target Start/End: Original strand, 12891401 - 12891440
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacc 464  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891401 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacc 12891440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 511
Target Start/End: Original strand, 15611671 - 15611758
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagtt 511  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| || ||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15611671 tttttactaaattatctttaaagaacggtggataacttacctactaaccaataaaaataaacaatttattgatgaggtcaagatagtt 15611758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 571
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215900
Alignment:
Q  536 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 24215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 454
Target Start/End: Original strand, 23994849 - 23994879
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgg 23994879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 414
Target Start/End: Original strand, 34049171 - 34049269
Alignment:
Q  316 tttggtttaaatctttacttaatgttttcgttgacgtgaactctgtacacaatgttttgaattagcaagtgtgatacatcgacttgttactcaagggat 414  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||| || |||||| | |||| | ||||| |||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||    
T  34049171 tttggtttaaatatttgcataatgcttttgtcgacgtgcaatctgcaaacaatattttgatttagcaagtgtgagacgttgacttcttacttaagggat 34049269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 549 - 602
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448807
Alignment:
Q  549 gtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 606
Target Start/End: Original strand, 52324058 - 52324111
Alignment:
Q  553 attggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  52324058 attgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacca 52324111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 150; Significance: 9e-79; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 4034592 - 4034773
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4034592 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccac 4034691  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4034692 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 746466 - 746648
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  746466 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 746565  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  746566 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 746648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 6594639 - 6594458
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6594639 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6594540  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6594539 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901961
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23901961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 38997101 - 38997282
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38997101 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38997200  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38997201 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Original strand, 45370990 - 45371174
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  45370990 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccac 45371089  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45371090 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatc 45371174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 27400403 - 27400586
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27400403 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 27400502  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  27400503 ttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 27400586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 602
Target Start/End: Original strand, 10424595 - 10424773
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10424595 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10424694  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10424695 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 2325070 - 2324889
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2325070 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2324971  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  2324970 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 17600836 - 17601017
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17600836 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 17600935  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17600936 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13815399 - 13815216
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13815399 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13815300  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13815299 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccat 13815216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 27651221 - 27651034
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27651221 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgga 27651122  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27651121 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 26710345 - 26710527
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26710345 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 26710444  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  26710445 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 26710527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 419 - 605
Target Start/End: Original strand, 40635213 - 40635399
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40635213 tttggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 40635312  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40635313 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 11184972 - 11185153
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11184972 ttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 11185071  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11185072 ttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 14660446 - 14660627
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14660446 ttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 14660545  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  14660546 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 34518367 - 34518548
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  34518367 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 34518466  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34518467 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 599
Target Start/End: Original strand, 6430473 - 6430648
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  6430473 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 6430572  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6430573 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 10244763 - 10244582
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10244763 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10244664  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  10244663 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 5726129 - 5726311
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  5726129 ttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccac 5726228  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5726229 ttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 1092132 - 1091951
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1092132 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 1092033  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1092032 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 609
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327546
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatct 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcaccatct 32327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 424 - 581
Target Start/End: Original strand, 32608380 - 32608537
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  32608380 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccac 32608479  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattat 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608480 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattat 32608537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 421 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2914322 - 2914136
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  2914322 tgattttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 2914223  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2914222 cacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcaccat 2914136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 7892869 - 7892688
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  7892869 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccac 7892770  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  7892769 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427647
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 14697718 - 14697535
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  14697718 ttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccac 14697619  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14697618 ttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 14697535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Original strand, 27024409 - 27024596
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  27024409 ttttggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgga 27024508  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27024509 taccacttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 40735464 - 40735647
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  40735464 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 40735563  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40735564 ttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcaccat 40735647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609808
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4609808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 40037143 - 40037323
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  40037143 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 40037242  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40037243 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 607
Target Start/End: Original strand, 32948446 - 32948628
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  32948446 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccac 32948544  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32948545 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcaccat 32948628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444874
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatga 516  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  517 ataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatta---ttccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 37621051 - 37620866
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggt---caagatagttcatgaatac 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||    
T  37621051 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggatac 37620952  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  37620951 cacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacca 37620866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 424 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 8433097 - 8432942
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8433097 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccac 8432998  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 579  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8432997 tttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37255513 - 37255337
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  37255513 ttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 37255419  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  37255418 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 12842101 - 12842257
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  12842101 gattttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggatacc 12842200  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 578  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842201 aattaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 438 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856436
Alignment:
Q  438 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtactt 537  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  538 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 427 - 605
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  427 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccactta 526  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  527 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 424 - 599
Target Start/End: Original strand, 15925080 - 15925255
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15925080 ttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 15925179  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagtt 599  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||| || ||| | ||||||||||    
T  15925180 ttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 425 - 571
Target Start/End: Original strand, 41172459 - 41172605
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  41172459 tttttttaaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccact 41172558  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172559 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 424 - 548
Target Start/End: Original strand, 42899915 - 42900039
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42899915 ttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 42900014  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaat 548  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  42900015 ttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 422 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35158222 - 35158049
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||       
T  35158222 gattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat--- 35158126  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  35158125 --------atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 35158049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 424 - 604
Target Start/End: Original strand, 39103047 - 39103216
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||         
T  39103047 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaat----- 39103141  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcac 604  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39103142 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 21735070 - 21734900
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||         
T  21735070 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaat----- 21734976  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21734975 ------atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 602
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  475 tgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 574  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  575 ccattattccatggctaccctagttgtc 602  Q
     |||| |||||||  |||||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 28641462 - 28641291
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  28641462 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 28641368  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
        | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  28641367 ----atatgt--ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28641291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 424 - 603
Target Start/End: Original strand, 145282 - 145450
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||       
T  145282 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac--- 145378  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtca 603  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||    
T  145379 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 499 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 447739 - 447631
Alignment:
Q  499 ggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagt 598  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  447739 ggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagt 447640  T
Q  599 tgtcaccat 607  Q
    |||||||||    
T  447639 tgtcaccat 447631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 12333665 - 12333496
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||         
T  12333665 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat----- 12333571  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  12333570 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgg-tagcctagttgtcacca 12333496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 29687041 - 29687212
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  29687041 ttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 29687135  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  29687136 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 29687212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 4258485 - 4258661
Alignment:
Q  419 tttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaat 518  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  4258485 tttggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtg-ggtcaagatagttcatgaat 4258583  T
Q  519 accacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccat 607  Q
               |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||||| || |||||||||||||||    
T  4258584 -----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcaccat 4258661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 1229635 - 1229809
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |        ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  1229635 ttttttctagattacctttaaagaatggtaggtaatttgtc--------aatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccac 1229726  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccat-ggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  1229727 ttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacc 1229809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543624
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 533  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||           ||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgt 13543696  T
Q  534 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 39301273  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  39301272 ------atgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 421 - 605
Target Start/End: Original strand, 27331295 - 27331472
Alignment:
Q  421 tgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatac 520  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||||||       
T  27331295 tgattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa--- 27331391  T
Q  521 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
        || | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  27331392 ----tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 19428597 - 19428425
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacc-tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||        
T  19428597 ttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaat---- 19428502  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  19428501 -------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 19428425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 27765032 - 27764897
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||||         
T  27765032 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat----- 27764938  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 570  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27764937 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 27764897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 2688899 - 2688729
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| | | |||| || ||  |||||||||||||||||||||        
T  2688899 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata---- 2688804  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  2688803 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 44481828 - 44481998
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  44481828 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 44481927  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     ||||||           ||  || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  44481928 ctaaaaa-----------ggtgaaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 43899140 - 43898968
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||||||||||         
T  43899140 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaat----- 43899046  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatc 608  Q
          |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  43899045 ------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatc 43898968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 591
Target Start/End: Original strand, 8056626 - 8056782
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||||||||||||         
T  8056626 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatgaat----- 8056720  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggcta 591  Q
          |||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  8056721 ------atgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatggcta 8056782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 424 - 503
Target Start/End: Original strand, 12814614 - 12814693
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtca 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  12814614 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 28566868 - 28566703
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||||||||||         
T  28566868 ttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaat----- 28566774  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttg 600  Q
          |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  28566773 ------atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 422 - 519
Target Start/End: Original strand, 3266294 - 3266391
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  3266294 gattttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata 3266391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 12730061 - 12730231
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||              
T  12730061 ttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 12730150  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  12730151 -taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 40544246 - 40544151
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  40544246 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 40544151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 503 - 585
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827223
Alignment:
Q  503 aagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattcca 585  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12827142 aagatagttcatga-taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 600
Target Start/End: Original strand, 35126780 - 35126945
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  35126780 ttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 35126879  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttg 600  Q
     |||||| ||            ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35126880 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 43356099 - 43356267
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||         
T  43356099 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat----- 43356190  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
          |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||  ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  43356191 ------atgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 499 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 28014924 - 28014856
Alignment:
Q  499 ggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 567  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014924 ggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249435
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||||||| ||||||         
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaat----- 34249359  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
          |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||||||    
T  34249360 ------atgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 2000507 - 2000412
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata 519  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||| | |||| ||||||||| ||||    
T  2000507 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcataaata 2000412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 455 - 605
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711803
Alignment:
Q  455 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 554  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  555 tggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28020002 - 28019959
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020002 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 512
Target Start/End: Original strand, 30545821 - 30545909
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttc 512  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| | | || |||||| ||||||||||||||    
T  30545821 ttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttc 30545909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985342
Alignment:
Q  431 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaa 530  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Original strand, 10176559 - 10176618
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||    
T  10176559 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatga 10176618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 424 - 462
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897168
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattta 462  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattta 1897168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  506 atagttcatgaataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 339
Target Start/End: Original strand, 22116572 - 22116625
Alignment:
Q  286 ttgtatatgatttatatattcaatataacctttggtttaaatctttacttaatg 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  22116572 ttgtatatgatttatgcattcaatataatccttggtttaaatcatttcttaatg 22116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 39737 - 39556
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39737 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 39638  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39637 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 13943 - 13762
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13943 ttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 13844  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13843 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2052
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 425 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11132
Alignment:
Q  425 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccact 524  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  525 taaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 11132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 75425 - 75244
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  75425 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccac 75326  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  75325 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2431
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  2613 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2514  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2513 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacca 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 127; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 435 - 605
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176836
Alignment:
Q  435 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgta 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  535 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 278007 - 278190
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaata--cc 521  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  278007 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacccc 278106  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  278107 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19041 - 18854
Alignment:
Q  418 ttttgattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaa 517  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  19041 ttttggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatgga 18942  T
Q  518 taccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18941 taccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 577
Target Start/End: Original strand, 32562 - 32715
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  32562 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccat 32661  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacca 577  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32662 ttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 4773 - 4595
Alignment:
Q  422 gattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacc 521  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||    
T  4773 gattttttctagattaactttgaataatggtgggtaa------caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggatacc 4680  T
Q  522 acttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4679 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 98; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 424 - 605
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3261
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||         ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacc 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 14745 - 14916
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14745 ttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccac 14844  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
     ||||||           ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14845 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 606
Target Start/End: Original strand, 7091 - 7263
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||        
T  7091 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---- 7186  T
Q  523 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
           |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7187 -------atgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 20647 - 20471
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  20647 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccac 20548  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcaccatctct 611  Q
     ||||||           ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20547 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccctctct 20471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Original strand, 103 - 209
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  103 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccac 202  T
Q  524 ttaaaaa 530  Q
     ||||||    
T  203 ctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 606
Target Start/End: Original strand, 221 - 273
Alignment:
Q  553 attggttggggtaaattactcaccattattccatggctaccctagttgtcacca 606  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  221 attggttgaggtaaattcc-caccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4618
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4725 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 4626  T
Q  523 cttaaaaa 530  Q
     |||||||    
T  4625 tttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 530
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3500
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaatacca 522  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3393 ttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacca 3492  T
Q  523 cttaaaaa 530  Q
     |||||||    
T  3493 tttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 424 - 571
Target Start/End: Original strand, 17907 - 18043
Alignment:
Q  424 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagatagttcatgaataccac 523  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||  ||||| ||| || ||||||||       
T  17907 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac--- 18003  T
Q  524 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 571  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004 --------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19302
Alignment:
Q  434 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacgatttgttggtgaggtcaagata 508  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University