View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1240-INSERTION-8 (Length: 602)

Name: NF1240-INSERTION-8
Description: NF1240
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1240-INSERTION-8
NF1240-INSERTION-8
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (80-497)||(16446642-16447069)
chr8 (80-495)||(34894965-34895385)
chr8 (80-492)||(37970286-37970708)
chr8 (80-495)||(36694733-36695158)
chr8 (80-495)||(43643362-43643787)
chr8 (80-495)||(38643976-38644401)
chr8 (80-494)||(5299713-5300137)
chr8 (111-497)||(27082636-27083032)
chr8 (80-390)||(1149399-1149721)
chr8 (80-495)||(1204925-1205350)
chr8 (80-494)||(10554971-10555393)
chr8 (80-494)||(12876108-12876533)
chr8 (81-487)||(23854200-23854615)
chr8 (111-494)||(6098311-6098709)
chr8 (82-485)||(465850-466253)
chr8 (80-452)||(11727064-11727448)
chr8 (176-494)||(13307622-13307936)
chr8 (80-488)||(7890724-7891133)
chr8 (88-496)||(8803591-8803999)
chr8 (176-495)||(9864146-9864462)
chr8 (80-495)||(16222861-16223289)
chr8 (80-387)||(33906316-33906633)
chr8 (80-366)||(4132453-4132750)
chr8 (85-415)||(1953760-1954104)
chr8 (80-496)||(30654350-30654776)
chr8 (103-495)||(40862417-40862820)
chr8 (80-452)||(31933653-31934036)
chr8 (93-388)||(35459491-35459798)
chr8 (85-390)||(44869598-44869915)
chr8 (85-416)||(39098891-39099234)
chr8 (206-452)||(41910895-41911139)
chr8 (80-264)||(35859160-35859357)
chr8 (298-496)||(34952028-34952224)
chr8 (286-497)||(1150090-1150299)
chr8 (84-341)||(18259233-18259498)
chr8 (220-369)||(43025824-43025972)
chr8 (299-499)||(41362512-41362707)
chr8 (85-260)||(12587812-12588000)
chr8 (82-263)||(34951826-34952020)
chr8 (174-269)||(1149794-1149889)
chr8 (113-242)||(24823194-24823336)
chr8 (80-235)||(33198057-33198225)
chr8 (80-177)||(41362748-41362845)
chr8 (298-378)||(7998407-7998488)
chr8 (103-174)||(43026003-43026075)
chr8 (174-260)||(34463704-34463787)
chr8 (213-274)||(7998494-7998555)
chr8 (80-151)||(13307931-13308002)
chr8 (80-126)||(30650900-30650946)
chr8 (337-390)||(33197950-33198003)
chr8 (429-494)||(15009241-15009305)
chr8 (80-130)||(9864544-9864594)
chr8 (80-150)||(41910825-41910895)
chr8 (83-126)||(4108583-4108626)
chr8 (84-122)||(7291060-7291098)
chr8 (88-126)||(23176460-23176498)
chr8 (88-121)||(23176423-23176456)
chr8 (427-494)||(33197891-33197957)
chr8 (83-124)||(34463913-34463954)
chr8 (445-496)||(38110351-38110401)
chr8 (425-495)||(24823395-24823464)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (84-496)||(2959742-2960164)
chr1 (82-472)||(9902812-9903212)
chr1 (80-495)||(34012138-34012558)
chr1 (80-452)||(32216092-32216475)
chr1 (80-495)||(8222126-8222548)
chr1 (80-495)||(32267029-32267454)
chr1 (85-494)||(38823210-38823629)
chr1 (80-495)||(15382928-15383354)
chr1 (80-488)||(15752031-15752449)
chr1 (80-495)||(16415640-16416066)
chr1 (80-484)||(37451292-37451705)
chr1 (80-461)||(27532738-27533128)
chr1 (80-485)||(10922732-10923147)
chr1 (80-495)||(19899524-19899950)
chr1 (80-497)||(30254417-30254843)
chr1 (80-495)||(10181763-10182189)
chr1 (80-483)||(47279196-47279610)
chr1 (80-482)||(14758049-14758452)
chr1 (81-495)||(15168084-15168515)
chr1 (103-484)||(28564562-28564951)
chr1 (82-461)||(4330307-4330699)
chr1 (80-494)||(23999343-23999768)
chr1 (80-452)||(46931448-46931830)
chr1 (82-452)||(51128896-51129275)
chr1 (138-496)||(18422645-18423006)
chr1 (80-494)||(47682250-47682673)
chr1 (112-400)||(27227273-27227573)
chr1 (82-481)||(27266959-27267364)
chr1 (80-495)||(39393378-39393804)
chr1 (96-494)||(42721035-42721439)
chr1 (124-494)||(30326751-30327132)
chr1 (103-488)||(28769655-28770050)
chr1 (111-488)||(238300-238686)
chr1 (85-452)||(27763071-27763449)
chr1 (85-488)||(27563666-27564080)
chr1 (80-488)||(33725367-33725774)
chr1 (138-494)||(3309144-3309515)
chr1 (80-452)||(3534969-3535343)
chr1 (174-488)||(41926165-41926469)
chr1 (88-494)||(7078827-7079254)
chr1 (118-400)||(25160720-25161015)
chr1 (80-390)||(22170809-22171131)
chr1 (107-495)||(1547282-1547664)
chr1 (174-461)||(40884841-40885126)
chr1 (107-494)||(31621331-31621733)
chr1 (209-495)||(48620632-48620906)
chr1 (80-495)||(11742124-11742531)
chr1 (174-495)||(37618764-37619077)
chr1 (80-292)||(48353739-48353962)
chr1 (84-292)||(1359696-1359915)
chr1 (173-369)||(38759652-38759847)
chr1 (91-273)||(21289817-21290009)
chr1 (80-173)||(48620916-48621009)
chr1 (80-250)||(31962853-31963037)
chr1 (344-487)||(21289668-21289816)
chr1 (8-71)||(30793232-30793294)
chr1 (499-599)||(30793296-30793392)
chr1 (424-497)||(30254851-30254923)
chr1 (427-495)||(22170749-22170816)
chr1 (80-144)||(38759846-38759910)
chr1 (83-126)||(16135660-16135703)
chr1 (83-126)||(47555092-47555135)
chr1 (84-126)||(42663232-42663274)
chr1 (84-125)||(10598223-10598264)
chr1 (100-168)||(41926488-41926556)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (80-494)||(23115981-23116397)
chr5 (80-495)||(38527988-38528412)
chr5 (80-494)||(31786397-31786821)
chr5 (80-494)||(40133385-40133809)
chr5 (80-486)||(35511233-35511644)
chr5 (91-485)||(699159-699563)
chr5 (80-494)||(36866762-36867186)
chr5 (80-461)||(22980825-22981217)
chr5 (80-493)||(31705363-31705785)
chr5 (80-460)||(33908266-33908656)
chr5 (80-495)||(12910349-12910779)
chr5 (80-487)||(22255188-22255606)
chr5 (80-495)||(19119858-19120283)
chr5 (111-480)||(30969106-30969485)
chr5 (83-495)||(36860422-36860845)
chr5 (80-495)||(27330305-27330728)
chr5 (81-488)||(5837561-5837978)
chr5 (91-495)||(8741647-8742063)
chr5 (81-493)||(32563150-32563563)
chr5 (85-488)||(7208620-7209033)
chr5 (80-497)||(25500677-25501104)
chr5 (85-495)||(22973838-22974258)
chr5 (107-494)||(7693230-7693618)
chr5 (80-425)||(23954553-23954897)
chr5 (80-496)||(9200231-9200648)
chr5 (80-496)||(35933900-35934320)
chr5 (82-494)||(5829897-5830314)
chr5 (83-344)||(2888199-2888472)
chr5 (80-496)||(17157782-17158210)
chr5 (103-390)||(35504467-35504766)
chr5 (78-496)||(39572817-39573237)
chr5 (80-495)||(24886101-24886511)
chr5 (80-494)||(14409092-14409501)
chr5 (80-482)||(27318239-27318650)
chr5 (90-413)||(15992301-15992636)
chr5 (111-495)||(35826268-35826659)
chr5 (80-481)||(8436979-8437389)
chr5 (80-451)||(42342775-42343145)
chr5 (84-494)||(22019632-22020043)
chr5 (107-495)||(14919317-14919705)
chr5 (174-496)||(1429020-1429322)
chr5 (81-370)||(13956116-13956415)
chr5 (80-485)||(43308411-43308818)
chr5 (111-494)||(15724490-15724881)
chr5 (174-494)||(21088624-21088941)
chr5 (222-481)||(26268087-26268343)
chr5 (83-341)||(25669737-25669997)
chr5 (249-495)||(5112247-5112489)
chr5 (178-436)||(6824343-6824599)
chr5 (80-279)||(25889582-25889794)
chr5 (80-495)||(8466744-8467150)
chr5 (280-452)||(28416490-28416661)
chr5 (80-177)||(43254182-43254279)
chr5 (80-235)||(28416302-28416470)
chr5 (337-452)||(25668691-25668804)
chr5 (80-177)||(26269136-26269233)
chr5 (416-495)||(13956443-13956521)
chr5 (429-494)||(26317795-26317859)
chr5 (355-482)||(11898014-11898139)
chr5 (80-122)||(11898197-11898239)
chr5 (416-494)||(16004474-16004552)
chr5 (81-126)||(21321087-21321132)
chr5 (85-126)||(33848017-33848058)
chr5 (416-456)||(22255612-22255652)
chr5 (80-129)||(34853846-34853895)
chr5 (86-126)||(12080405-12080445)
chr5 (459-495)||(22616493-22616529)
chr5 (78-126)||(31878721-31878769)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (80-488)||(46297523-46297941)
chr3 (80-495)||(39282643-39283067)
chr3 (80-494)||(37203058-37203483)
chr3 (80-494)||(37157699-37158123)
chr3 (80-496)||(26941021-26941447)
chr3 (80-496)||(52040683-52041110)
chr3 (80-494)||(4015451-4015874)
chr3 (81-447)||(42505837-42506214)
chr3 (80-496)||(11466813-11467225)
chr3 (80-495)||(48354931-48355356)
chr3 (80-496)||(40552020-40552446)
chr3 (80-494)||(3362243-3362670)
chr3 (80-482)||(53228913-53229326)
chr3 (80-495)||(21193596-21194022)
chr3 (80-369)||(22622479-22622780)
chr3 (94-400)||(24707890-24708210)
chr3 (80-452)||(33378546-33378929)
chr3 (85-497)||(7327246-7327671)
chr3 (174-495)||(34132925-34133243)
chr3 (83-479)||(11357145-11357535)
chr3 (113-495)||(22450958-22451350)
chr3 (80-452)||(2007965-2008354)
chr3 (80-497)||(22445826-22446253)
chr3 (80-445)||(21009562-21009939)
chr3 (80-482)||(44891510-44891912)
chr3 (81-452)||(47481554-47481937)
chr3 (85-494)||(54505799-54506218)
chr3 (82-377)||(33698259-33698566)
chr3 (80-484)||(29099356-29099762)
chr3 (100-497)||(3654980-3655390)
chr3 (80-488)||(32373469-32373884)
chr3 (80-390)||(24488722-24489045)
chr3 (174-494)||(45174494-45174814)
chr3 (80-462)||(25579761-25580154)
chr3 (80-485)||(43975653-43976061)
chr3 (103-496)||(44186301-44186688)
chr3 (109-495)||(4761438-4761837)
chr3 (107-389)||(29163912-29164190)
chr3 (86-365)||(1089811-1090102)
chr3 (80-481)||(40935995-40936388)
chr3 (80-434)||(14586441-14586796)
chr3 (174-495)||(46994529-46994836)
chr3 (80-374)||(36012246-36012555)
chr3 (170-372)||(43348368-43348569)
chr3 (81-326)||(20373025-20373263)
chr3 (174-451)||(54828569-54828843)
chr3 (227-495)||(35844316-35844581)
chr3 (80-400)||(38591781-38592100)
chr3 (202-494)||(27480258-27480564)
chr3 (281-494)||(51212955-51213166)
chr3 (80-292)||(11356919-11357135)
chr3 (80-273)||(51212538-51212738)
chr3 (174-378)||(11835501-11835699)
chr3 (228-461)||(53176078-53176308)
chr3 (114-272)||(50475021-50475199)
chr3 (311-452)||(20373300-20373440)
chr3 (80-165)||(35844577-35844662)
chr3 (174-277)||(53811602-53811701)
chr3 (429-495)||(55343405-55343470)
chr3 (81-136)||(13498676-13498731)
chr3 (340-377)||(53811695-53811732)
chr3 (83-122)||(49359296-49359335)
chr3 (416-480)||(2613895-2613958)
chr3 (84-126)||(23165291-23165333)
chr3 (80-130)||(34133323-34133373)
chr3 (80-153)||(43348556-43348630)
chr3 (80-150)||(45174819-45174889)
chr3 (85-126)||(53811435-53811476)
chr3 (103-166)||(27480142-27480205)
chr3 (83-126)||(31706488-31706531)
chr3 (83-122)||(47930333-47930372)
chr3 (416-452)||(33698220-33698256)
chr3 (142-174)||(34133256-34133288)
chr3 (83-126)||(40640298-40640342)
chr3 (444-494)||(42204342-42204391)
chr3 (458-494)||(49359640-49359676)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (80-495)||(30055500-30055926)
chr7 (80-495)||(18797303-18797726)
chr7 (81-493)||(24211717-24212140)
chr7 (84-495)||(32820820-32821240)
chr7 (80-494)||(4582894-4583318)
chr7 (80-496)||(21991609-21992026)
chr7 (80-494)||(15612521-15612944)
chr7 (82-495)||(9355590-9356013)
chr7 (82-488)||(23111171-23111589)
chr7 (85-497)||(31578831-31579258)
chr7 (80-494)||(37109847-37110273)
chr7 (80-494)||(27283719-27284145)
chr7 (80-495)||(41764840-41765265)
chr7 (80-494)||(6546494-6546918)
chr7 (80-495)||(17842346-17842773)
chr7 (80-494)||(7334769-7335192)
chr7 (80-478)||(48928059-48928466)
chr7 (80-497)||(32432429-32432851)
chr7 (80-494)||(10358976-10359400)
chr7 (80-494)||(5657242-5657667)
chr7 (80-494)||(8861260-8861684)
chr7 (78-495)||(10481577-10482006)
chr7 (107-494)||(37346997-37347393)
chr7 (176-496)||(43686014-43686330)
chr7 (175-451)||(33688132-33688406)
chr7 (111-480)||(22687228-22687599)
chr7 (80-461)||(29173547-29173921)
chr7 (80-359)||(37703260-37703551)
chr7 (174-494)||(12165727-12166035)
chr7 (80-494)||(31520503-31520909)
chr7 (80-376)||(15672519-15672832)
chr7 (195-493)||(38258521-38258816)
chr7 (132-488)||(11071186-11071550)
chr7 (214-485)||(48928473-48928740)
chr7 (80-452)||(26980339-26980705)
chr7 (94-359)||(46480905-46481182)
chr7 (111-485)||(25691337-25691722)
chr7 (80-495)||(12390411-12390817)
chr7 (80-452)||(35353124-35353507)
chr7 (80-398)||(44598735-44599065)
chr7 (115-390)||(43925179-43925459)
chr7 (80-348)||(26587854-26588126)
chr7 (212-488)||(27421291-27421559)
chr7 (278-488)||(44413351-44413560)
chr7 (236-383)||(37704241-37704387)
chr7 (82-274)||(44411304-44411509)
chr7 (80-261)||(37704387-37704581)
chr7 (107-446)||(32592996-32593327)
chr7 (80-177)||(38258881-38258978)
chr7 (176-484)||(38053470-38053751)
chr7 (109-252)||(34361967-34362125)
chr7 (343-495)||(26524364-26524514)
chr7 (362-451)||(34362205-34362292)
chr7 (83-126)||(4902657-4902700)
chr7 (80-153)||(12166215-12166288)
chr7 (80-144)||(33688054-33688118)
chr7 (458-496)||(241033-241071)
chr7 (429-488)||(8299196-8299254)
chr7 (148-177)||(12166045-12166074)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (80-488)||(7893-8311)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (84-496)||(3879703-3880125)
chr6 (79-495)||(1945832-1946261)
chr6 (80-488)||(6090942-6091360)
chr6 (87-495)||(8513232-8513638)
chr6 (80-493)||(20768087-20768506)
chr6 (80-495)||(4318576-4319008)
chr6 (80-495)||(5627390-5627816)
chr6 (80-494)||(7234792-7235218)
chr6 (109-485)||(29182172-29182556)
chr6 (114-488)||(6088914-6089286)
chr6 (118-482)||(21016916-21017284)
chr6 (84-452)||(33892776-33893145)
chr6 (205-488)||(30353256-30353536)
chr6 (222-452)||(15491656-15491884)
chr6 (103-461)||(33618866-33619234)
chr6 (232-496)||(7055140-7055401)
chr6 (81-238)||(7054533-7054704)
chr6 (361-487)||(18498440-18498565)
chr6 (80-126)||(21016727-21016773)
chr6 (123-177)||(33724062-33724116)
chr6 (78-126)||(11083821-11083869)
chr6 (80-126)||(6613658-6613704)
chr6 (85-126)||(4104353-4104394)
chr6 (83-126)||(19632086-19632129)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (81-461)||(46887946-46888336)
chr4 (80-495)||(35020818-35021247)
chr4 (80-496)||(37663528-37663952)
chr4 (80-496)||(25184111-25184537)
chr4 (80-494)||(19089240-19089664)
chr4 (80-488)||(36493476-36493893)
chr4 (80-488)||(17173296-17173714)
chr4 (80-494)||(28002773-28003197)
chr4 (80-495)||(34361278-34361703)
chr4 (80-488)||(17167719-17168137)
chr4 (84-494)||(55240896-55241315)
chr4 (80-485)||(6864044-6864459)
chr4 (80-495)||(32912366-32912792)
chr4 (82-494)||(7703517-7703931)
chr4 (80-451)||(23761114-23761495)
chr4 (80-495)||(25700843-25701269)
chr4 (80-494)||(49375966-49376391)
chr4 (80-488)||(47253755-47254164)
chr4 (80-494)||(19440435-19440860)
chr4 (80-495)||(29583987-29584410)
chr4 (80-497)||(879335-879762)
chr4 (121-485)||(34947923-34948299)
chr4 (79-493)||(37775670-37776083)
chr4 (107-488)||(33341401-33341795)
chr4 (118-495)||(55477716-55478107)
chr4 (89-384)||(1815409-1815715)
chr4 (79-370)||(3042741-3043044)
chr4 (80-497)||(42199726-42200154)
chr4 (80-462)||(33816303-33816713)
chr4 (80-496)||(37287731-37288153)
chr4 (176-495)||(38011853-38012169)
chr4 (107-495)||(50697241-50697639)
chr4 (81-488)||(27396622-27397037)
chr4 (80-462)||(5047753-5048145)
chr4 (80-495)||(32579443-32579870)
chr4 (85-481)||(32592106-32592503)
chr4 (80-487)||(30002428-30002828)
chr4 (80-485)||(4598002-4598406)
chr4 (80-372)||(17272084-17272388)
chr4 (81-480)||(50764746-50765143)
chr4 (92-495)||(9139246-9139639)
chr4 (212-400)||(4934134-4934321)
chr4 (214-496)||(35025530-35025801)
chr4 (80-259)||(4205216-4205408)
chr4 (85-350)||(46883905-46884177)
chr4 (99-306)||(7152010-7152230)
chr4 (84-292)||(26896287-26896508)
chr4 (85-263)||(39400236-39400427)
chr4 (208-461)||(54499166-54499418)
chr4 (80-220)||(23431826-23431979)
chr4 (107-229)||(35025381-35025515)
chr4 (286-494)||(39397918-39398115)
chr4 (80-177)||(38012589-38012686)
chr4 (187-250)||(56050171-56050234)
chr4 (427-495)||(17272010-17272077)
chr4 (429-495)||(4205115-4205180)
chr4 (107-177)||(4934026-4934097)
chr4 (80-126)||(2708227-2708273)
chr4 (416-495)||(7152240-7152318)
chr4 (416-495)||(4396325-4396403)
chr4 (380-452)||(23518402-23518473)
chr4 (83-125)||(1012645-1012687)
chr4 (78-124)||(5914933-5914979)
chr4 (88-126)||(9743924-9743962)
chr4 (84-126)||(17612671-17612713)
chr4 (85-126)||(51960026-51960067)
chr4 (416-494)||(53124287-53124364)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (80-495)||(4166921-4167346)
chr2 (80-390)||(41960942-41961264)
chr2 (80-494)||(26357577-26358001)
chr2 (80-494)||(4763628-4764056)
chr2 (78-452)||(43648022-43648407)
chr2 (81-488)||(3176945-3177362)
chr2 (80-495)||(2325157-2325574)
chr2 (80-496)||(11366159-11366586)
chr2 (80-488)||(33660156-33660565)
chr2 (80-495)||(29241924-29242342)
chr2 (81-495)||(31570514-31570938)
chr2 (81-494)||(44913662-44914090)
chr2 (80-495)||(19289102-19289522)
chr2 (80-496)||(19424421-19424833)
chr2 (80-494)||(33550761-33551189)
chr2 (84-452)||(33709015-33709394)
chr2 (91-494)||(41465509-41465914)
chr2 (107-488)||(43770654-43771035)
chr2 (80-495)||(18494060-18494472)
chr2 (80-404)||(45327808-45328113)
chr2 (100-494)||(37905709-37906115)
chr2 (172-496)||(4263960-4264282)
chr2 (85-493)||(13711465-13711878)
chr2 (82-495)||(39167150-39167567)
chr2 (200-496)||(17071649-17071942)
chr2 (175-494)||(4478368-4478681)
chr2 (80-373)||(31861971-31862276)
chr2 (80-366)||(35959023-35959316)
chr2 (80-497)||(27349732-27350145)
chr2 (186-488)||(36641992-36642293)
chr2 (217-497)||(41463779-41464056)
chr2 (174-494)||(19313852-19314164)
chr2 (174-462)||(44285980-44286266)
chr2 (200-496)||(17054008-17054301)
chr2 (86-400)||(7006723-7007032)
chr2 (111-496)||(5881532-5881922)
chr2 (200-351)||(18258199-18258349)
chr2 (238-494)||(33902068-33902319)
chr2 (84-288)||(19500700-19500914)
chr2 (81-249)||(41051083-41051260)
chr2 (80-177)||(33902341-33902439)
chr2 (309-389)||(19501760-19501839)
chr2 (347-461)||(41051263-41051377)
chr2 (427-495)||(41960882-41960949)
chr2 (80-175)||(17071549-17071646)
chr2 (80-175)||(17053909-17054005)
chr2 (83-130)||(19093787-19093834)
chr2 (88-177)||(18257325-18257414)
chr2 (80-144)||(36642296-36642360)
chr2 (111-177)||(41463400-41463466)
chr2 (80-124)||(7565630-7565674)
chr2 (84-126)||(38249826-38249867)
chr2 (85-118)||(18058723-18058756)
chr2 (458-495)||(34441933-34441970)
chr2 (86-126)||(19073689-19073729)
chr2 (84-124)||(39788280-39788320)
chr2 (457-497)||(43446473-43446513)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (80-497)||(267279-267700)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (115-497)||(131-517)
scaffold0002 (80-390)||(408192-408511)
scaffold0002 (254-472)||(94331-94546)
scaffold0002 (88-262)||(93870-94056)
scaffold0002 (80-130)||(691-741)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (80-488)||(11912-12332)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (80-451)||(145776-146159)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (80-488)||(43963-44380)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (80-488)||(154407-154824)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (402-497)||(42345-42438)
scaffold0009 (224-270)||(100948-100994)
scaffold0009 (80-137)||(101057-101115)
scaffold0009 (420-495)||(100820-100894)
scaffold0009 (307-348)||(100894-100935)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (85-122)||(11378-11415)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Original strand, 16446642 - 16447069
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16446642 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatga 16446741  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446742 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 16446841  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446842 gtgatagtc-ttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 16446940  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||||||| | ||||||||| |||| | || ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16446941 atagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtg-ttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcag-aaaagtca 16447038  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16447039 ttttcatgacttcaccatagaattttcctaa 16447069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34895385 - 34894965
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34895385 ggagcttctacggtgcagttaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 34895286  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895285 tcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 34895186  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||      |||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895185 gtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 34895092  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| |||||| || ||| ||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34895091 atagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtg-ttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcag-aaaagtca 34894994  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34894993 ttttcatgacttcaccatagaattttcct 34894965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 492
Target Start/End: Original strand, 37970286 - 37970708
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  37970286 ggagcttctatggtgcagtcaggaaagtgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatga 37970385  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37970386 tcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 37970485  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37970486 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatg 37970584  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  37970585 atactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 37970682  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaacttt 492  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  37970683 ttctcatgacttcaccatagaacttt 37970708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 36694733 - 36695158
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||         
T  36694733 ggagcttctacgatgcagtgaagaaactgatttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatga 36694832  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36694833 taaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 36694932  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  36694933 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatg 36695031  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36695032 atactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcag-aaaagtca 36695129  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36695130 ttttcctgacttcaccatagaattttcct 36695158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 43643362 - 43643787
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  43643362 ggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatga 43643461  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43643462 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattat 43643561  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43643562 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 43643660  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || |||||||| || | || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  43643661 atactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaatagtca 43643758  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43643759 ttctcatgacttcaccatagaattttcct 43643787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38644401 - 38643976
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||      
T  38644401 ggagcttttacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatga 38644302  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  38644301 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcat 38644202  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38644201 atgatagtcttga-gtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 38644103  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||  | ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  38644102 atactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgacca-aaaaagtca 38644005  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| || |||||||||||| ||||||    
T  38644004 ttctcatgatttcaccatagaattttcct 38643976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 5299713 - 5300137
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5299713 ggagcttctatggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 5299812  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  5299813 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcat 5299912  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5299913 ttgataatctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 5300011  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  5300012 atactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtg-ctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatta-aaaaagtca 5300109  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  5300110 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 111 - 497
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27083032
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |    
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgcggg 27082834  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  27082835 gtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccact 27082934  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    | | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  27082935 gcacaaacagtggggtg-ttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcctaa 27083032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Original strand, 1149399 - 1149721
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  1149399 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatga 1149498  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  1149499 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattat 1149598  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1149599 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 1149697  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttga 390  Q
    |||||||| |||  ||||||||||    
T  1149698 atactatgaggacagaacttttga 1149721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1205350 - 1204925
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||      
T  1205350 ggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatga 1205251  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1205250 tcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 1205151  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  1205150 gcgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatg 1205052  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| |||   ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  1205051 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtg-ttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 1204954  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||| || || ||||||    
T  1204953 ttctcatgacttcaccgtaaaattttcct 1204925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 10554971 - 10555393
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaag-ttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact----gat- 173  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||     
T  10554971 ggagcttctatggtgcggtcagaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattacttaatgatc 10555070  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
           ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10555071 aatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 10555170  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||   |||||||||  ||| ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555171 gtgatagtc---aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 10555267  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  10555268 atactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 10555365  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10555366 ttctcatgacttcaccgtagaattttcc 10555393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 12876533 - 12876108
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    ||||||| ||||||  | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||         
T  12876533 ggagcttatacggtataatcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatga 12876434  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12876433 taaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 12876334  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  12876333 gtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatg 12876234  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12876233 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtg-ttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcag-aaaagtca 12876136  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  12876135 ttttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 487
Target Start/End: Original strand, 23854200 - 23854615
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  23854200 gagcttttatggtgtagtcaggaaattga-ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgat 23854298  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23854299 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatg 23854398  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  23854399 tgattgtc-ttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatga 23854497  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || || | ||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  23854498 tactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcat 23854595  T
Q  468 tttcacgacttcaccataga 487  Q
    | ||| ||||||||| ||||    
T  23854596 tctcatgacttcaccgtaga 23854615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 494
Target Start/End: Original strand, 6098311 - 6098709
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             ||||||||||||||||||||    
T  6098311 ttttttgggaaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 6098410  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttat-----cgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 292  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6098411 catcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacacttt 6098509  T
Q  293 atgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacg 392  Q
     || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6098510 gtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatg 6098609  T
Q  393 ccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaacttt 492  Q
     ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6098610 tcactgtacaaacagtggggtg-ttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcacca-aaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 6098707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 466253 - 465850
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  466253 agcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 466154  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  466153 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgt 466055  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  466054 ga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 465965  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||    
T  465964 actaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcacca-caaaagtcatt 465867  T
Q  469 ttcacgacttcaccata 485  Q
    || | ||||||||||||    
T  465866 ttaatgacttcaccata 465850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11727448 - 11727064
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgac-ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11727448 ggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacattttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 11727349  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |    
T  11727348 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatca 11727249  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11727248 tgtgatagtctt-aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgat 11727150  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727149 gatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtg-ttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 11727064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 176 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307622
Alignment:
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13307837 tt-aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatgg 13307739  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacga 475  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  13307738 ggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcattctcatga 13307641  T
Q  476 cttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13307640 cttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 7890724 - 7891133
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7890724 ggagcttctacggtgcggtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 7890823  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7890824 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattat 7890923  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| || ||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890924 gtgataatc-ttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 7891022  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||| |||  |||||||||| |||| |||| |||  || | |||||          | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  7891023 atattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtt----------atttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaaagtca 7891111  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || ||| |||||||||||||||    
T  7891112 ttctcatgacttcaccatagaa 7891133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 88 - 496
Target Start/End: Original strand, 8803591 - 8803999
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---------- 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||              
T  8803591 tacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagt 8803690  T
Q  178 ----tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
        |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8803691 atattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag 8803790  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |  |||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        
T  8803791 t-attaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata---- 8803885  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
       |  ||||||||||| | || | || ||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    |     
T  8803886 ---ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcat----at 8803976  T
Q  474 gacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8803977 gacttcaccatagaattttccta 8803999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 176 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9864462 - 9864146
Alignment:
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9864462 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtc 9864363  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9864362 -ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatgg 9864264  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacga 475  Q
    ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||  || ||||||||||||||  ||    
T  9864263 ggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcacca-aaaaagtcattttcgtga 9864166  T
Q  476 cttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||  |||||| ||||||    
T  9864165 cttcattatagaattttcct 9864146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16223289 - 16222861
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaag---ttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 176  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223289 ggagcttctatggtccagtcagaaaactgactttttgaaaaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa 16223190  T
Q  177 t-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 263  Q
    |             ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16223189 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatat 16223090  T
Q  264 tatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16223089 tatgtgatactctt-aagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattg 16222991  T
Q  364 atgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||| |||  | ||||    ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16222990 atgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactg-tggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccag-aaaag 16222893  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||    
T  16222892 tcattctcatgatttcaccgtagaattttcct 16222861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33906633 - 33906316
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaatt-----gttgattactgat- 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||     | |||||| ||||     
T  33906633 ggagcttctacagtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatttgattgctgattaatgatc 33906534  T
Q  174 -----taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  33906533 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgc 33906434  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906433 gatagtc-ttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgat 33906335  T
Q  369 actatggggagtgaacttt 387  Q
    ||||||  || ||||||||    
T  33906334 actatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 366
Target Start/End: Original strand, 4132453 - 4132750
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac-------tga 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||       |||    
T  4132453 ggagcttctatggtgcagtcagcaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatga 4132552  T
Q  173 t------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
    |      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4132553 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 4132652  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132653 gtgatagtc-ttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 415
Target Start/End: Original strand, 1953760 - 1954104
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||           
T  1953760 ttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaat 1953859  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1953860 agtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgat 1953959  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgagg-tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat-gata 369  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  1953960 agtc-ttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagata 1954058  T
Q  370 ctatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgt 415  Q
    ||||| ||  ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  1954059 ctatgagggctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 30654350 - 30654776
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||      
T  30654350 ggagtttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatga 30654448  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  30654449 tcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatatta 30654548  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30654549 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgat 30654647  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||||  |  ||||||||||| | || |  | ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  30654648 gatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatc 30654745  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    | | | | |||||||||||| || |||||||    
T  30654746 actcttatgacttcaccataaaattttccta 30654776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 103 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 40862820 - 40862417
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||             ||||||||||||||    
T  40862820 aaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaa 40862721  T
Q  189 tgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttaca 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40862720 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttaca 40862622  T
Q  289 ctttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaactttt 388  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||||||| || | || |||||||||    
T  40862621 ctttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccat-gagactgaactttt 40862523  T
Q  389 gacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactaca-cttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccataga 487  Q
    || |||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  40862522 gatgccattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccag-aaaagttattttcgtgacttcactataga 40862425  T
Q  488 actttcct 495  Q
    | ||||||    
T  40862424 attttcct 40862417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Original strand, 31933653 - 31934036
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  31933653 ggagcttctatggtgcagttgggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatga 31933752  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31933753 tcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattat 31933852  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31933853 gtgataat-tttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatg 31933951  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||   || ||||||||||| | || |||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  31933952 atactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtg-ttactcattatatttttgatatcatagtgttaacttc 31934036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 388
Target Start/End: Original strand, 35459491 - 35459798
Alignment:
Q  93 tgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tc 179  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||    
T  35459491 tgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattc 35459590  T
Q  180 atctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttta 279  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  35459591 atctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtctt-a 35459689  T
Q  280 agtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggag 379  Q
    ||||||| | | | || | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||     
T  35459690 agtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggac 35459789  T
Q  380 tgaactttt 388  Q
    |||||||||    
T  35459790 tgaactttt 35459798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44869915 - 44869598
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           
T  44869915 ttctacgatgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaat 44869816  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || ||||    
T  44869815 agtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgat 44869716  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44869715 agtc-ttaagtgttacactttgtg-gggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatac 44869618  T
Q  371 tatggggagtgaacttttga 390  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  44869617 tatgacgattgaacttttga 44869598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 416
Target Start/End: Original strand, 39098891 - 39099234
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||           
T  39098891 ttctacggtgcaatcatgaaactgatttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaat 39098990  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||    
T  39098991 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgat 39099090  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39099091 agtc-ttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatact 39099189  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtt 416  Q
    ||| ||| ||||||||||| || | |||| ||| ||| |||||||    
T  39099190 atgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgtt 39099234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 206 - 452
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911139
Alignment:
Q  206 acttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttaca 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtatt-aagtgttacactttgtggggtgttaca 41910992  T
Q  306 cttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaat 405  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| || |||||   |||    
T  41910993 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataat 41911092  T
Q  406 agttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||| |||   |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41911093 agtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttc 41911139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35859357 - 35859160
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  35859357 ggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 35859258  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
           ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859257 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 298 - 496
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952224
Alignment:
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||| ||| ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctg-ttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccag-aaaagtcattttaatgactttactatagaattttccta 34952224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 286 - 497
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150299
Alignment:
Q  286 acactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaact 385  Q
    ||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  386 tttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||||| | |  |||| ||| ||| || || ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatg-ttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcacca-aaaaagtcattcttatgacttcaccata 1150287  T
Q  486 gaactttcctaa 497  Q
    ||| ||||||||    
T  1150288 gaattttcctaa 1150299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 84 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18259498 - 18259233
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---------- 173  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||              
T  18259498 cttctatggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaa 18259399  T
Q  174 ---taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   | ||| ||||||  |||||    
T  18259398 caataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga 18259299  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgta 341  Q
          ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  18259298 -----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025824
Alignment:
Q  220 ttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagta 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| || |||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggta 43025874  T
Q  320 kgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
     |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43025873 ggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgata 43025824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362512
Alignment:
Q  299 tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  399 tataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaac 498  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  41362607 tacaaatagtggggtg-ttactcactaca-tttttatg--ctagtgttaacttcacca-aaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcccaac 41362513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12588000 - 12587812
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           
T  12588000 ttctatggttcagttagagaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaat 12587901  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatga 260  Q
          ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12587900 agtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 263
Target Start/End: Original strand, 34951826 - 34952020
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat-------- 173  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  34951826 agcttctacggtgcaatcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 34951925  T
Q  174 -----taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 263  Q
         |||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34951926 aatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Original strand, 1149794 - 1149889
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1149794 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 1149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 242
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  113 ttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacg 199  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||     
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaaca 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33198225 - 33198057
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  33198225 ggagcttctacggtgcaatcatgaaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 33198126  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatc 235  Q
           ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33198125 tcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41362845 - 41362748
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41362845 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaat 41362748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998407
Alignment:
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 378  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatgggga 7998407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43026075 - 43026003
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaa-gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt 174  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43026075 aaattgatttttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgatt 43026003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34463787 - 34463704
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatga 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34463787 taattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998494
Alignment:
Q  213 ggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagt 7998494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13308002 - 13307931
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcat 151  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13308002 ggagcttctatggtgcaatcatgaaattgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 30650900 - 30650946
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30650900 ggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtta 30650946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33198003 - 33197950
Alignment:
Q  337 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttga 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  33198003 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttga 33197950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15009305 - 15009241
Alignment:
Q  429 ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  15009305 ttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 15009241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9864594 - 9864544
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattt 130  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9864594 ggagcttctaaggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattt 9864544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 41910825 - 41910895
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattca 150  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  41910825 ggagcttctatggtgcagtcattaatttgacttttttaaaaaagttaattttaatctgaatgtttgattca 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 4108583 - 4108626
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4108583 gcttttacggtgaagtcaaaaaattgacttttttgaaaaagtta 4108626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7291098 - 7291060
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7291098 cttctacggtgcagttagaaaattaacttttttgaaaaa 7291060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 126
Target Start/End: Original strand, 23176460 - 23176498
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23176460 tacggtgaagttagaaaattgacttttttgaaaaagtta 23176498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 121
Target Start/End: Original strand, 23176423 - 23176456
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaa 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23176423 tacggtgaagtcagaaaattgacttttttgaaaa 23176456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 33197957 - 33197891
Alignment:
Q  427 acttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  33197957 acttttgatgctatagtattaacttaatcagaaaaatt-attctcatgacttcaccatagaattttcc 33197891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34463954 - 34463913
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  34463954 gcttctacggtgcagtcataaaattaacttttttaaaaaagt 34463913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 38110401 - 38110351
Alignment:
Q  445 ttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  38110401 ttaacttcatcagaaaaa-tcattttcatgacttcaccataaaattttccta 38110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 495
Target Start/End: Original strand, 24823395 - 24823464
Alignment:
Q  425 acacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||    
T  24823395 acacttttgatattatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcct 24823464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 84 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 2960164 - 2959742
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  2960164 cttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 2960065  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2960064 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtga 2959965  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2959964 tagtc-ttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacac 2959866  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2959865 tatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatg-ttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcag-aaaagtcatttt 2959768  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  2959767 catgacttcaccatagaattttccta 2959742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 82 - 472
Target Start/End: Original strand, 9902812 - 9903212
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9902812 agcttctacggtgcagtcaagaatttgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 9902911  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9902912 aatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgt 9903011  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9903012 gatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgat 9903110  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    | |||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9903111 agtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtg-ttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtcatt 9903208  T
Q  469 ttca 472  Q
    ||||    
T  9903209 ttca 9903212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 34012138 - 34012558
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34012138 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 34012237  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012238 tcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 34012337  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||      |||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34012338 gtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatg 34012431  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| |||||| || ||| ||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  34012432 atagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtg-ttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatca-taaacgtca 34012529  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34012530 ttttcatgacttcaccatagaattttcct 34012558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32216475 - 32216092
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32216475 ggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 32216376  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32216375 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattat 32216276  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  32216275 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatg 32216177  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32216176 atactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtg-ttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttc 32216092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8222548 - 8222126
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8222548 ggagcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatg 8222449  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8222448 atcaatataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 8222349  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8222348 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatg 8222250  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||| |||   ||  ||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||    
T  8222249 atactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttca-ctaaaaaggtca 8222155  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  8222154 tttttatgacttcaccgtagaattttcct 8222126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 32267454 - 32267029
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32267454 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgt 32267355  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32267354 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 32267255  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  32267254 gtgatagtc-ttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatg 32267156  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  32267155 ataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatattgttaacttca-caaaaaaagtca 32267058  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || | | |||||||||||| || ||||||    
T  32267057 ttcttatgacttcaccataaaattttcct 32267029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 85 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38823629 - 38823210
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  38823629 ttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 38823530  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  38823529 agtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 38823430  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823429 agtctt-aagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 38823331  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  38823330 atggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtg-ttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccag-aaaagtcattctc 38823233  T
Q  472 acgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  38823232 atgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15383354 - 15382928
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15383354 ggagcttctacggttcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaata 15383255  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  15383254 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatatta 15383155  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383154 tgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 15383056  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||| |  || ||||||||||| | || |||| |||  || || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  15383055 gatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcacca-aaaaagtc 15382958  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  15382957 atttttataacttcaccatagaattttcct 15382928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15752449 - 15752031
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15752449 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 15752350  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15752349 tcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattat 15752250  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752249 gtgatactctt-aagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 15752151  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||  |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  15752150 atactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtg-ttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 15752053  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || ||| |||||||||||||||    
T  15752052 ttctcatgacttcaccatagaa 15752031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16416066 - 16415640
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16416066 ggagcttctacggcgcagtcaaataactaacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 16415967  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16415966 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 16415867  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | | || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16415866 gtgatagtc-ttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatg 16415768  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagtt-gggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16415767 atactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtg-ttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtc 16415670  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  16415669 attctcatgacttcaccttagaattttcct 16415640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 37451705 - 37451292
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37451705 ggagattctacggtgcagtgaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 37451606  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37451605 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 37451506  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37451505 gtgatagtc-ttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatg 37451407  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  37451406 atacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtg-ttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttacca-aaaaagtca 37451310  T
Q  467 ttttcacgacttcaccat 484  Q
    |||| | |||||||||||    
T  37451309 tttttatgacttcaccat 37451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 461
Target Start/End: Original strand, 27532738 - 27533128
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  27532738 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatga 27532836  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  27532837 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcat 27532936  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27532937 gtgatagtc-ttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 27533034  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27533035 atactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagag-tgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaa 27533128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10923147 - 10922732
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10923147 ggagcttctatggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 10923048  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10923047 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 10922948  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10922947 gtgacagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 10922849  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  10922848 atactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt-cttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatca 10922751  T
Q  467 ttttcacgacttcaccata 485  Q
    || ||| || |||||||||    
T  10922750 ttctcatgatttcaccata 10922732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 19899524 - 19899950
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19899524 ggagcttctacagtgcagttaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 19899623  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  19899624 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatatta 19899723  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19899724 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 19899822  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||| | || ||| |||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  19899823 gatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtg-ttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatc 19899920  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  19899921 attattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30254843 - 30254417
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  30254843 ggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataa 30254744  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30254743 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattat 30254644  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30254643 gtgacagtc-ttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatg 30254545  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgt-ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| | || |||| ||| |||   |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  30254544 atactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt---gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaaca-aaaaagtc 30254449  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    ||| | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  30254448 attcttataacttcaccatagaattttcctaa 30254417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 10181763 - 10182189
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  10181763 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgt 10181862  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttaca-ggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
               ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  10181863 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatatta 10181962  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10181963 tgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgac 10182061  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||| |||| ||||| | |||| |||||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  10182062 gatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtg-ttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcacca-aaaaagtc 10182159  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10182160 attttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 80 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 47279610 - 47279196
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgactttttt-gaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47279610 ggagcttctacggtgcagtcataaaactgattttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatg 47279511  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  47279510 atcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatca 47279411  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47279410 tgtgatagtctt-aagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 47279312  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||  || ||||| ||    
T  47279311 gatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcacca-aaaaaatc 47279214  T
Q  466 attttcacgacttcacca 483  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  47279213 attctcatgacttcacca 47279196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 80 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14758452 - 14758049
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  14758452 ggagcttctacggtgcagtcacgaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatga 14758353  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14758352 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 14758253  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |          ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14758252 gcgatagtcttaa----------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatg 14758163  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  14758162 aaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtg-ctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccag-aaaagtca 14758065  T
Q  467 ttttcacgacttcacc 482  Q
    || ||| |||||||||    
T  14758064 ttctcatgacttcacc 14758049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15168515 - 15168084
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  15168515 gagcttctacggtgcagttaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgat 15168416  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15168415 caatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 15168316  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15168315 cgatagcctt-aagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatga 15168217  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccac-------tgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaa 460  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||        ||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  15168216 tactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtg-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaa 15168118  T
Q  461 aagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| |||| |||  ||||||| |||||| ||||||    
T  15168117 aag-cattctcatcacttcacgatagaattttcct 15168084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 103 - 484
Target Start/End: Original strand, 28564562 - 28564951
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||    
T  28564562 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28564661  T
Q  190 gcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 289  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  28564662 gtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag---ttaagtgttacac 28564758  T
Q  290 tttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttg 389  Q
    |||| | |||||||  |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28564759 tttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttg 28564858  T
Q  390 acgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccat 484  Q
    | | || |||| ||| |||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28564859 atgtcattgtacaaacagtaaggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaaatcattttcataacttcaccat 28564951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 82 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 4330699 - 4330307
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  4330699 agcttctacggtgcagtcagacaactgatttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatc 4330600  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4330599 aattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgt 4330500  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4330499 gatagtctt-aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgat 4330401  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgt-ttactcactacacttttgatgttatagtg-ttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    ||||||  || |||||||||||  |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  4330400 actatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaaca-ttgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaa 4330307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23999768 - 23999343
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23999768 ggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 23999669  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23999668 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 23999569  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23999568 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 23999470  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
     |||||||| ||  ||||||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||  || | |||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||    
T  23999469 aatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtg-ttactcgttatattttttatgttgtagtgttaacttcacca-aaaaaatc 23999372  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||| | | |||||||||||| || |||||    
T  23999371 attcttatgacttcaccataaaattttcc 23999343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 46931830 - 46931448
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  46931830 ggagcttctacggtgcagtaaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 46931731  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46931730 tcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 46931631  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||   ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46931630 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 46931534  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||| |||| ||  |||| |||||| |||  | || ||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46931533 gatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggt-attactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 46931448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 51129275 - 51128896
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51129275 agcttctacgatgtagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 51129178  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51129177 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 51129078  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51129077 gatagt-tttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgat 51128979  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||   || ||||||||||| | || |||| |||  || | ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  51128978 actataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttc 51128896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 138 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422645
Alignment:
Q  138 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttgg 18422907  T
Q  232 catctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattag 331  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || ||||| ||| |||||||||||    
T  18422906 aatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattag 18422808  T
Q  332 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttt 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||  || | |||    
T  18422807 attaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtg-ttactcgttatatttt 18422709  T
Q  432 tgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18422708 tgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttccta 18422645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 47682250 - 47682673
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||      
T  47682250 ggagcttctatggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatga 47682349  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47682350 tcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 47682449  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682450 atgatagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 47682548  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgg-gtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||  ||| || ||| |||||||| ||| |||| |||   |||||||||||||  || ||||||||    
T  47682549 atactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtg-ttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcacca-aaaaagtc 47682644  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    | | ||| |||||||||||| || |||||    
T  47682645 actctcatgacttcaccataaaattttcc 47682673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Original strand, 27227273 - 27227573
Alignment:
Q  112 tttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaac 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||    
T  27227273 tttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27227372  T
Q  199 gtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgagg 298  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  27227373 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtctt-aagtgttgcactttgtgggg 27227471  T
Q  299 tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  27227472 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactg 27227571  T
Q  399 ta 400  Q
    ||    
T  27227572 ta 27227573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 481
Target Start/End: Original strand, 27266959 - 27267364
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||        
T  27266959 agcttctatggtgcattcaggaaactgactttttggaaaa-gttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatc 27267057  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27267058 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 27267157  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27267158 gatagtc-ttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 27267255  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||| |||| |||   |||||||||||||  || ||||| |||||    
T  27267256 actatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtg-tcactcactacattttttatg--ctagtgttaacttcacca-aaaaaatcatt 27267351  T
Q  469 ttcacgacttcac 481  Q
     ||| ||||||||    
T  27267352 ctcatgacttcac 27267364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 39393804 - 39393378
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39393804 ggagcttctacgcggcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39393705  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||    
T  39393704 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcat 39393605  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39393604 atgatagtc-ttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttat 39393506  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| | |   ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  39393505 gatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagt-attactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattag-aaaagtc 39393408  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| |||  |||||||| ||||| ||||||    
T  39393407 attctcataacttcaccgtagaattttcct 39393378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 96 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 42721439 - 42721035
Alignment:
Q  96 agtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatc 182  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||             | |||    
T  42721439 agtcagaaaattga-ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatc 42721341  T
Q  183 tagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagt 282  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42721340 tagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatctt-aagt 42721245  T
Q  283 gttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtga 382  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42721244 gttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattga 42721145  T
Q  383 acttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcacc 482  Q
    |||||||| |  |||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||| ||| ||||| | |||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||    
T  42721144 acttttgatgttactgtacaaacagtggggtg-ttactcactatattttttatgatatagggctaacttcacca-aaaaaatcattttcatgacttcacc 42721047  T
Q  483 atagaactttcc 494  Q
    |||||| |||||    
T  42721046 atagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 124 - 494
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30327132
Alignment:
Q  124 ttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggactt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  210 acaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacactta 309  Q
    | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgctta 30326949  T
Q  310 aaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagtt 409  Q
     ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | |||| |||  |||    
T  30326950 taacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggtt 30327049  T
Q  410 gggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  30327050 gggt-attactcattacatttttgatgttatagtgttaaattca-caaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28770050 - 28769655
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaat 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||             |||||||| |||    
T  28770050 aaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 28769951  T
Q  190 gcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 289  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28769950 gtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtc-ttaagcgttacac 28769852  T
Q  290 tttat-gaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaactttt 388  Q
    ||| | | ||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  28769851 tttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaaccttt 28769752  T
Q  389 gacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || |||| |||| |||  | |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  28769751 gatgccattgtacaaa-cggtgggtg-ttactcattacatttttgatgtcatagtgttaacttca-caaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaa 28769655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 111 - 488
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238686
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggg 238498  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  238499 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 238598  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||| ||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||  || ||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  238599 gtacaaacag-tggatg-ttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcacca-aaaaagttattttcgtgacttcactatagaa 238686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 85 - 452
Target Start/End: Original strand, 27763071 - 27763449
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  27763071 ttctacggtacagtcaggaaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 27763170  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  27763171 agtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtga 27763270  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27763271 tagtc-ttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatac 27763369  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaa-tagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||| ||  || |||||||| | || | || ||| ||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27763370 tatgagggctggacttttgatgtcattctacaaacta--tgggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 27763449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 488
Target Start/End: Original strand, 27563666 - 27564080
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta--------- 175  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||             
T  27563666 ttctatggtgcagtcaggaaactgatttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 27563765  T
Q  176 ----attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
        |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27563766 attaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgat 27563865  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||| ||||||||| | |||| || ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27563866 agtc-ttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatatt 27563964  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    || || | ||||||||||| | |||| || ||| ||| | ||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  27563965 atcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtg-ttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttc 27564063  T
Q  472 acgacttcaccatagaa 488  Q
    |  |||||||| |||||    
T  27564064 ataacttcaccgtagaa 27564080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 33725367 - 33725774
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattttta-aattgttgattactgattaatt 178  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  33725367 ggagcttatacgttgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatg 33725466  T
Q  179 catc--tagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtct 276  Q
     |||  |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  33725467 -atcaatagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtct 33725565  T
Q  277 ttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 376  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33725566 taaa-tgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgag 33725664  T
Q  377 gagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgac 476  Q
    || ||||||||||| |||||   | ||||||| || ||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||   || |||||||||| ||  |||    
T  33725665 gactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctg-ctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactag-aaaagtcattctcttgac 33725762  T
Q  477 ttcaccatagaa 488  Q
    || |||||||||    
T  33725763 tttaccatagaa 33725774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3309515 - 3309144
Alignment:
Q  138 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactatttta 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  3309515 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactatttta 3309416  T
Q  225 tcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt----ta-tgaggtgttacacttaaaacaaagta 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||    
T  3309415 tcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtctt-aagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagta 3309317  T
Q  320 kgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgttta 418  Q
     | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| ||| || |||||| |||    
T  3309316 ggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacag-tgggtg-tta 3309219  T
Q  419 ctcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  3309218 ctcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccag-aaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 3535343 - 3534969
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  3535343 ggagcttctacggtgtagtcatgaaactgattttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatga 3535244  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  3535243 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 3535144  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||          |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  3535143 gt----------aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgata 3535054  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| | ||||| | ||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535053 atattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 3534969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 174 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 41926469 - 41926165
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||     
T  41926469 taattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata- 41926372  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
          ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926371 ------agtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactat 41926278  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||   |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  41926277 agggactgaacttgtgatgccactgtacaaacag-tgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatca-aaaaaatcattttcat 41926180  T
Q  474 gacttcaccatagaa 488  Q
     ||||||||||||||    
T  41926179 aacttcaccatagaa 41926165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 88 - 494
Target Start/End: Original strand, 7078827 - 7079254
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---------- 177  Q
    |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||              
T  7078827 tacggtacagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagt 7078926  T
Q  178 ---tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 274  Q
       ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  7078927 aattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 7079026  T
Q  275 ctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 374  Q
    ||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7079027 ctt-aagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatg 7079125  T
Q  375 gggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgt----------ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
      || ||||||||||| | || |||| ||| |||  |||||          |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  7079126 atgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcacca-aaaaagt 7079224  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||| ||| ||||| |||||| || |||||    
T  7079225 cattatcatgactttaccataaaattttcc 7079254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160720
Alignment:
Q  118 aaaaagttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtctt 203  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  204 ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgtta 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttatactttgtggggtgtta 25160817  T
Q  304 cacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgta 400  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25160816 cacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgta 25160720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22171131 - 22170809
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||      
T  22171131 ggagcttctacggtgcaattagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatga 22171032  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               | ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171031 tcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 22170932  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  22170931 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatg 22170833  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttga 390  Q
    ||| ||||  || |||||||||||    
T  22170832 atattatgtagactgaacttttga 22170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1547664 - 1547282
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  1547664 tgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgctt 1547565  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  1547564 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca--------gagttgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttg 1547474  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  1547473 tggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctg--------atgatactatgagaactgaacttttgatgc 1547382  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    ||||| | ||| ||| | ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1547381 cactgcacaaacagtggagtg-ttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 1547284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 174 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 40885126 - 40884841
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  40885126 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 40885027  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    || ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40885026 tc-ttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactat 40884928  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  40884927 agggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg-ctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 494
Target Start/End: Original strand, 31621331 - 31621733
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||             ||||||| |||||||    
T  31621331 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgct 31621430  T
Q  193 tgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaac-----atgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttac 287  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  31621431 tgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtctt-aagtgtcac 31621529  T
Q  288 actttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttt 387  Q
    ||||  || ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31621530 acttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttt 31621628  T
Q  388 tgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccataga 487  Q
    ||| ||||| ||| ||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  31621629 tgatgccaccgtacaaatagcggggtg-ctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactag-aaaagtcattctcatgacttcaccgtaga 31621726  T
Q  488 actttcc 494  Q
    | |||||    
T  31621727 attttcc 31621733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 209 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620632
Alignment:
Q  209 tacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacactt 308  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||          |||||||||||| || ||||||||||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga----------gtgttacactttgtggggtgttacactt 48620817  T
Q  309 aaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagt 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||    
T  48620816 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagt 48620717  T
Q  409 tgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||    
T  48620716 ggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttca-caagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttcct 48620632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 11742124 - 11742531
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11742124 ggagtttctatggcgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 11742223  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||    
T  11742224 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcat 11742323  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |                   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11742324 gtgatagtcttaat------------------tgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatg 11742405  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  11742406 atattat-gggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 11742502  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || |||  ||||||| ||| || ||||||    
T  11742503 ttctcataacttcacgataaaattttcct 11742531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 495
Target Start/End: Original strand, 37618764 - 37619077
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||       
T  37618764 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatga--- 37618860  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg--atact 371  Q
           ||||||||||||||| | |||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37618861 -------gtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatact 37618953  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtg-tttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    ||| | | ||||||||||| | || | || ||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  37618954 atgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattct 37619052  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     |  |||||||||||||| ||||||    
T  37619053 tataacttcaccatagaattttcct 37619077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48353962 - 48353739
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48353962 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 48353863  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  48353862 tcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 48353763  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacacttt 292  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  48353762 gtgatagtctt--agtgttacacttt 48353739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 292
Target Start/End: Original strand, 1359696 - 1359915
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  1359696 cttctacggtgcagtcagaaaactgacttgttaaaaaaaaaaaattt-gatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcga 1359794  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  1359795 tagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatga 1359894  T
Q  271 tagtctttaagtgttacacttt 292  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  1359895 taatc-ttaagtgttacacttt 1359915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38759847 - 38759652
Alignment:
Q  173 ttaattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgata 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| |||| || |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  38759847 ttaattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgata 38759748  T
Q  273 gtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
    ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  38759747 gtc-tcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21290009 - 21289817
Alignment:
Q  91 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat-------------taat 177  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  21290009 ggtgcagttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataat 21289910  T
Q  178 tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21289909 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacaga---gttgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 48621009 - 48620916
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48621009 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31963037 - 31962853
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaa-- 176  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||      
T  31963037 ggagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatg 31962938  T
Q  177 -----------ttcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 250  Q
               |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  31962937 atcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289668
Alignment:
Q  344 cttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacactt-------ttgatg 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||       || |||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcactacattttttattatttatg 21289718  T
Q  437 ttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccataga 487  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21289717 atatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgacttcacaataga 21289668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 30793232 - 30793294
Alignment:
Q  8 acttgttcgaccttcatttgaatttgttacaaccctatgttctacactttttagtttaccgtta 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30793232 acttgttcgaccttcatttgaatttgtcacaacc-tatgttctacactttttagtttaccgtta 30793294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 599
Target Start/End: Original strand, 30793296 - 30793392
Alignment:
Q  499 tgattatctgtanc-aatataaatgaatctttttcaagaaaatgaatgattgaatattnattaaatgaaaataaaatattccaattatattacaagtacg 597  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30793296 tgattatctgtaaccaatataaatgaatctttt-caagaaaatgaatgattgaatatt-att-aatg-aaataaaatattccaattata-tacaagtacg 30793390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30254923 - 30254851
Alignment:
Q  424 tacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  30254923 tacatttttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcctaa 30254851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22170816 - 22170749
Alignment:
Q  427 acttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  22170816 acttttgatgttatagtgttaacttcattag-aaaagtcattttcatgatttcaccatagaattttcct 22170749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38759910 - 38759846
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgttt 144  Q
    |||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38759910 ggagcttctatggtgcagtcaattaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttt 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16135703 - 16135660
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16135703 gcttctagggtgcagtcagaaaatttgcttttttgaaaaagtta 16135660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47555135 - 47555092
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  47555135 gcttctacggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagtta 47555092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 42663232 - 42663274
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42663232 cttctatggtgcagtcacgaaattgacttttttgaaaaagtta 42663274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10598264 - 10598223
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtt 125  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10598264 cttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagtt 10598223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41926556 - 41926488
Alignment:
Q  100 agaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta 168  Q
    |||||| ||| ||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  41926556 agaaaactgatttttttttaaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgatta 41926488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 23115981 - 23116397
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23115981 ggagtttctacggtgaagtcaggaaaatgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 23116080  T
Q  178 tca----tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116081 tcaatagtc-agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 23116179  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116180 tc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactat 23116278  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    |   | |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||     
T  23116279 gtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtg-ctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcat-aaaaaaagtcattttcat 23116376  T
Q  474 gacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  23116377 gacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 38527988 - 38528412
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38527988 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 38528087  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38528088 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattat 38528187  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38528188 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 38528286  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| | || ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38528287 atactat-gagactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtg-ttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaa-cca 38528383  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38528384 ttttcatgacttcaccatagaattttcct 38528412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 31786397 - 31786821
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31786397 ggagattctatggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 31786496  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31786497 acaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattat 31786596  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31786597 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 31786695  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||    | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  31786696 atactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacag-tggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 31786793  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || |||| ||||||| |||||| |||||    
T  31786794 ttctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40133809 - 40133385
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  40133809 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatga 40133710  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  40133709 ttaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattat 40133610  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  40133609 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 40133511  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||  ||  ||||||||    
T  40133510 atattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtg-ttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcacca-caaaagtca 40133413  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  40133412 ttttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 486
Target Start/End: Original strand, 35511233 - 35511644
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35511233 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 35511332  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35511333 tcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 35511432  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||      |||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35511433 gtgatagt------gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtg 35511526  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| | |||| || ||| ||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  35511527 atagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtg-ttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcag-aaacgtca 35511624  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatag 486  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  35511625 ttttcatgacttcaccatag 35511644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 699563 - 699159
Alignment:
Q  91 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------------- 177  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 
T  699563 ggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaat 699464  T
Q  178 tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  699463 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-t 699365  T
Q  278 taagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 377  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  699364 taagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatg 699265  T
Q  378 agtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgact 477  Q
    | ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  699264 actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcag-aaaagtcattctcataact 699167  T
Q  478 tcaccata 485  Q
    ||||||||    
T  699166 tcaccata 699159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36867186 - 36866762
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  36867186 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatga 36867087  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  36867086 ttaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattat 36866987  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  36866986 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 36866888  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  36866887 atactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaa-tca 36866790  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  36866789 ttttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22981217 - 22980825
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22981217 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 22981118  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22981117 tcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattat 22981018  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981017 gtgatagtctt-aagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 22980919  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||   ||| ||| ||||  |||||||||  | |||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22980918 atactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggt-attactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaa 22980825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 493
Target Start/End: Original strand, 31705363 - 31705785
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31705363 ggagattctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 31705462  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31705463 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 31705562  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705563 gtgatggtc-ttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 31705661  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| | ||| || |||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  31705662 atacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtg-ttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatca 31705758  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31705759 tttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 33908656 - 33908266
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  33908656 ggagcatctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatga 33908557  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  33908556 tcaatagtaattatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatg 33908457  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  33908456 cgatagtctt-aagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatga 33908358  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaa 460  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  33908357 tactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtg-ctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaa 33908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12910779 - 12910349
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  12910779 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgt 12910680  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  12910679 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattat 12910580  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12910579 gtgatagtctt-aggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacg 12910481  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgcc-----actgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |     |||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  12910480 atactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtg-ttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcacca-aaaa 12910383  T
Q  462 agtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12910382 agtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 12910349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22255606 - 22255188
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22255606 ggagcttctacggtacagtcaggaaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 22255507  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22255506 tcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattat 22255407  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255406 gtaatagt-tttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 22255308  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactaca-cttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||| |||| | | ||||||||||| |||| |||| |||  || ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||     
T  22255307 ataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtg-ttactcattacattttttgatgttataatgttaacttcacca-aaaaagtt 22255210  T
Q  466 attttcacgacttcaccataga 487  Q
    ||||| | ||||||||| ||||    
T  22255209 atttttatgacttcaccgtaga 22255188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 19120283 - 19119858
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  19120283 ggagcttctaaggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatga 19120184  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||    
T  19120183 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcat 19120084  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19120083 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatg 19119985  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  19119984 acactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca-caaaagtca 19119887  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19119886 ttctcatgacttcaccatagaattttcct 19119858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 111 - 480
Target Start/End: Original strand, 30969106 - 30969485
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||| ||||||     
T  30969106 ttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcag 30969205  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30969206 catcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtgag 30969304  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |    
T  30969305 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 30969404  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttca 480  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  30969405 gtataaatagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaa-tcattctcatgacttca 30969485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 83 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 36860845 - 36860422
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt-------- 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||            
T  36860845 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgatta 36860746  T
Q  175 -----aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
         ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  36860745 atagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtg 36860646  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaa-gtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  36860645 atagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgat 36860547  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  36860546 actatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcatt 36860449  T
Q  469 ttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36860448 ttcgtgacttcaccatagaattttcct 36860422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 27330728 - 27330305
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  27330728 ggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatga 27330629  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  27330628 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcat 27330529  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27330528 gcgatagtctt-aagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatg 27330430  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||| |||| ||| |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  27330429 atactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtg-ttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 27330334  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  27330333 ttcccacgacttcaccatagaattttcct 27330305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 81 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5837978 - 5837561
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  5837978 gagcttctctggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgat 5837879  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  5837878 caacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatg 5837779  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5837778 tgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatga 5837680  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    |||||||| || |||| |||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  5837679 tactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccag-aaaagtcat 5837582  T
Q  468 tttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    | ||| || |||||| |||||    
T  5837581 tctcatgaattcaccgtagaa 5837561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 495
Target Start/End: Original strand, 8741647 - 8742063
Alignment:
Q  91 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------------- 177  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  8741647 ggtgcagtcatgaaacagacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatt 8741746  T
Q  178 tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt-atgtgatagtct 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||    
T  8741747 tcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtct 8741846  T
Q  277 ttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 376  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8741847 t-aagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgga 8741945  T
Q  377 gagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgac 476  Q
    || ||||||||||| |||| |||| ||| | | |||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||    
T  8741946 gactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgac 8742044  T
Q  477 ttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  8742045 ttcaccatagaattttcct 8742063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 81 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 32563563 - 32563150
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       
T  32563563 gagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgat 32563464  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  32563463 caataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatg 32563364  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||          |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32563363 tga----------gtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatga 32563274  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    || || ||||| ||||||||||| | ||||||| | | ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32563273 tattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaa-tcat 32563176  T
Q  468 tttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  32563175 tttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 488
Target Start/End: Original strand, 7208620 - 7209033
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||| |||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  7208620 ttctacgttgcagttaagaaactgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 7208719  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  7208720 aataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgat 7208819  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208820 agtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 7208918  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    | | ||| ||||||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||  | || |||| |||||| | ||||||||||  || |||||||||||||     
T  7208919 a-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtg-ttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttt 7209016  T
Q  472 acgacttcaccatagaa 488  Q
    | ||||||||| |||||    
T  7209017 atgacttcaccgtagaa 7209033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Original strand, 25500677 - 25501104
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  25500677 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatga 25500776  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||| |||||| ||    
T  25500777 tcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcat 25500876  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25500877 gtgatgatctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatg 25500975  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| |||| | ||||||||| | || |||| ||| |||  |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  25500976 atactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtg-ttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccag-aaaagtca 25501073  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  25501074 ttctcatgacttcaccatagaatttttctaa 25501104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 495
Target Start/End: Original strand, 22973838 - 22974258
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  22973838 ttctatggtgcagtcagaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 22973937  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  22973938 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaat 22974037  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  22974038 agtc-ttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataat 22974136  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    ||| | | ||||||||||| |  | |||| ||| ||| || || ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  22974137 atgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatg-ttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattctc 22974234  T
Q  472 acgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |  |||||||||||||| ||||||    
T  22974235 ataacttcaccatagaattttcct 22974258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 107 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7693618 - 7693230
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  7693618 tgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgctt 7693519  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||          ||||||||||||     
T  7693518 gcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga----------gtgttacactttg 7693429  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  7693428 tggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgc 7693329  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    ||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  7693328 cactgtacaaacagtgggatg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttc 7693231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 425
Target Start/End: Original strand, 23954553 - 23954897
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||          
T  23954553 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattaatgatcaatag 23954652  T
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||| ||||||| |     | ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23954653 taattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 23954746  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23954747 tctt-aagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactat 23954845  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccact-gtataaatagttgggtgtttactcacta 425  Q
    ||  | ||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  23954846 ggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtg-ttactcacta 23954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9200648 - 9200231
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9200648 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 9200549  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  9200548 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 9200449  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||          |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9200448 gtga----------gtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatg 9200359  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| | ||| | ||||||||| | ||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  9200358 atactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtta 9200261  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |||| | |||||||||||| || |||||||    
T  9200260 ttttaatgacttcaccataaaattttccta 9200231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 35934320 - 35933900
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35934320 ggagtttctacggtgcagttatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatga 35934221  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||    
T  35934220 tcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcat 35934121  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35934120 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 35934022  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||        |||  |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  35934021 gatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtg-ttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatca-aaaaaatc 35933931  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  35933930 attctcatgacttcaccatacaattttccta 35933900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5830314 - 5829897
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       
T  5830314 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacattttggaaaa-gttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgat 5830216  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5830215 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatg 5830116  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  5830115 tgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgtt---------aattgatga 5830026  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatg----ttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||| |||| |||| |||    ||||| ||||||||||  || |||||     
T  5830025 tactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtg-ttactcattacattttttatgttaattataatgttaacttcacca-aaaaaa 5829928  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  5829927 tcatttttacgacttcaccctagaattttcc 5829897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Original strand, 2888199 - 2888472
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat----- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  2888199 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 2888298  T
Q  178 --------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
            ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2888299 atagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctg 2888398  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtc 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  2888399 atagtc-ttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 17157782 - 17158210
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17157782 ggagcttctacggtacagtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 17157881  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  17157882 tcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattat 17157981  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17157982 gtgatggtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatg 17158080  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt--cwtcagaaaaagt 464  Q
    |||||||   ||  |||||||||| | || |||| |||  || | ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |   | ||||| |    
T  17158081 atactataatga-cgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaaat 17158178  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  17158179 catttttatgacttcaccatagaattttccta 17158210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35504766 - 35504467
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaat 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||    
T  35504766 aaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 35504667  T
Q  190 gcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 289  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35504666 acttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtc-ttaagtgttacac 35504568  T
Q  290 tttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttg 389  Q
    ||| || |||||||| |||| || |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  35504567 tttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttg 35504468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 39573237 - 39572817
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573237 atggagcttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 39573138  T
Q  178 -------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
                 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||        || ||| ||||||     
T  39573137 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca--------gagttgttgatatc 39573046  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  39573045 atgtgatagtctcga-gtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattta 39572947  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| | ||||| | ||| ||| | ||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||    || ||||||    
T  39572946 tgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtg-ttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactag-aaaagt 39572849  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39572848 cattctcatgacttcaccatagaattttccta 39572817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24886511 - 24886101
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  24886511 ggagcttttatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatga 24886412  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24886411 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 24886312  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||||                  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24886311 gtgatagtctt------------------aagtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatg 24886230  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtc-agaaaaagtc 465  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||    
T  24886229 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtc 24886131  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| ||| || ||||||||| || ||||||    
T  24886130 attctcatgatttcaccataaaattttcct 24886101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 14409092 - 14409501
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||      
T  14409092 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatga 14409191  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14409192 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 14409291  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |               |||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14409292 gcgatagtcttaa---------------gagtagttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 14409376  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||    
T  14409377 atactat-gagactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtg-ctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaa-tca 14409473  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14409474 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 482
Target Start/End: Original strand, 27318239 - 27318650
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaa--------ttgttgattactg 171  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||        || ||||||| ||    
T  27318239 ggagtttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatg 27318338  T
Q  172 at------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
    ||      |||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27318339 atcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 27318436  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27318437 tgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgat 27318535  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||| || | | | ||||||||| | || |||| ||| ||| | ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  27318536 gatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtg-ttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaa-tc 27318633  T
Q  466 attttcacgacttcacc 482  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  27318634 attctcatgacttcacc 27318650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 90 - 413
Target Start/End: Original strand, 15992301 - 15992636
Alignment:
Q  90 cggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------------ 177  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                
T  15992301 cggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaa 15992400  T
Q  178 -tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtct 276  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||     
T  15992401 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtc- 15992499  T
Q  277 ttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggg 376  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||| ||| ||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15992500 ttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaa 15992599  T
Q  377 gagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggt 413  Q
    || ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||    
T  15992600 gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 111 - 495
Target Start/End: Original strand, 35826268 - 35826659
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||||||||||    
T  35826268 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 35826367  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||      
T  35826368 catcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatc-ttaagggttacactttgtgga 35826464  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  35826465 gtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 35826563  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| ||| | |   ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35826564 gtacaaacaatgaagtg-ttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttca-caaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcct 35826659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8437389 - 8436979
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8437389 ggagcatctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 8437290  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8437289 tcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattat 8437190  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| || ||||||||||||| || || |||||   ||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||  ||||||    
T  8437189 gtgataatc-ttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatg 8437092  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||| | | || || |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  8437091 atataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatg-ttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcacca-aaaaaatca 8436994  T
Q  467 ttttcacgacttcac 481  Q
    || ||| ||||||||    
T  8436993 ttctcatgacttcac 8436979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 42343145 - 42342775
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  42343145 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 42343046  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
           ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  42343045 tcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcat 42342946  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||          ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42342945 gtg----------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaac-aagtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 42342857  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    |||||| |||||   |  |||||| | ||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42342856 atactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggt-attactcacaacatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 84 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 22020043 - 22019632
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  22020043 cttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 22019944  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  22019943 tagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga 22019844  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
              |||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22019843 ----------gtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatac 22019754  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    || ||||| | ||||||||| | |||| || ||| | | ||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  ||| |||||||||| |    
T  22019753 taaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtg-ttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccag-aaaagtcattct 22019656  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
     |  |||||||||||||| |||||    
T  22019655 aataacttcaccatagaaatttcc 22019632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 495
Target Start/End: Original strand, 14919317 - 14919705
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaattcatcta-gtaatgc------ttgcaacg 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||| | ||||| |      ||||||      
T  14919317 tgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatg-atcaatgtaattcatctgattgcaata 14919415  T
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt 299  Q
    |||||||||||    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  14919416 tcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtattacaatttgtgaggt 14919510  T
Q  300 gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgt 399  Q
    |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | || | |    
T  14919511 gttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattat 14919610  T
Q  400 ataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||| |||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  14919611 ataaacagtgaggtg-ttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcct 14919705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 174 - 496
Target Start/End: Original strand, 1429020 - 1429322
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  1429020 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatag 1429119  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |                  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1429120 tcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactat 1429201  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    || || |||| |||||| |||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||     
T  1429202 ggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtg-ttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcacca-aaagagtcattttcat 1429299  T
Q  474 gacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  1429300 gacttcaccatagatttttccta 1429322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 370
Target Start/End: Original strand, 13956116 - 13956415
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   | ||  ||||||||||||||||||||||       
T  13956116 gagcttctacggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgat 13956213  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13956214 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattata 13956313  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13956314 tgatagtc-ttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatga 13956412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 485
Target Start/End: Original strand, 43308411 - 43308818
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  43308411 ggagcttcaatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatga 43308510  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||       
T  43308511 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat--- 43308607  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
         |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  43308608 -----agtctt-aagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatg 43308701  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||  || || |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    | |||||||||    
T  43308702 atactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacag-tgggtg-ttattcattacatttttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtca 43308799  T
Q  467 ttttcacgacttcaccata 485  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  43308800 ttctcatgacttcaccata 43308818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724490
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
      | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || |||||||| |||| || ||||||||  |      
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtc-ttaattgatacactttggggc 15724683  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | || |    
T  15724682 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcatt 15724585  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  15724584 gtataaacagtggggtg-ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 494
Target Start/End: Original strand, 21088624 - 21088941
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||     
T  21088624 taattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataa 21088723  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  21088724 tctt-aagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactat 21088822  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| | |||||| ||| |||| ||  || ||| ||||||||  || ||||||||||||||      
T  21088823 ggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-tcactcacaacattttttatactacagt-ttaacttcaccaaaaaaagtcattttcgt 21088920  T
Q  474 gacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| | ||||| |||||    
T  21088921 gacttcatcgtagaattttcc 21088941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 222 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268087
Alignment:
Q  222 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakg 321  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatg 26268245  T
Q  322 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactc 421  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||| ||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  26268244 ataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtg-ttactc 26268146  T
Q  422 actacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcac 481  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  26268145 aaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcattctcatgacttcac 26268087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25669997 - 25669737
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat--------- 173  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25669997 gcttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 25669898  T
Q  174 ----taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
        ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25669897 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg 25669798  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgta 341  Q
              |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25669797 ----------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 495
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112489
Alignment:
Q  249 cagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgt 348  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtctt-aagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgt 5112344  T
Q  349 taatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaa 448  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  5112345 taatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcactatattttttatgttatagtattaa 5112443  T
Q  449 cttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  5112444 cttcacca-aaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcct 5112489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 436
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824599
Alignment:
Q  178 tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctt 6824440  T
Q  278 taagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 377  Q
     |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  6824441 -aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaag 6824539  T
Q  378 agtga--acttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatg 436  Q
    | |||  |||||||| | ||||||| ||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  6824540 actgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtg-ttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25889794 - 25889582
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25889794 ggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 25889695  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25889694 tcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 25889595  T
Q  267 gtgatagtcttta 279  Q
    || ||| ||||||    
T  25889594 gtcataatcttta 25889582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8467150 - 8466744
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||| |||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||      
T  8467150 ggagtttctatggtgcaatcattaaactgattttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatga 8467051  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  8467050 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtta-cacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcat 8466952  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     |||||||||| |                  |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8466951 atgatagtcttaa------------------gtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatg 8466870  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  8466869 atactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtg-ttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccag-aaaagtca 8466773  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  8466772 ttctcatgacctcatcatagaattttcct 8466744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 452
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416661
Alignment:
Q  280 agtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggag 379  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  380 tgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||| || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatg-ttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttc 28416661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43254279 - 43254182
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254279 ggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 43254182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 235
Target Start/End: Original strand, 28416302 - 28416470
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||          
T  28416302 ggagcttctacggtgcagtcatgaagctgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatga 28416401  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatc 235  Q
           ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28416402 tcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttggcatc 28416470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 337 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668691
Alignment:
Q  337 gtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatg 436  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatg 25668706  T
Q  437 ttatagtgttaacttc 452  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25668705 tta-agtgttaacttc 25668691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26269233 - 26269136
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269233 ggagtttctacggtgcagtcatgaaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaat 26269136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 13956443 - 13956521
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  13956443 ttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgag-aaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttcct 13956521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Original strand, 26317795 - 26317859
Alignment:
Q  429 ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  26317795 ttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 26317859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898014
Alignment:
Q  355 gatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwt 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||| || |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||       
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtg-ttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttac 11898041  T
Q  455 cagaaaaagtcattttcacgacttcacc 482  Q
    ||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  11898040 cag-aaaagttattatcatgacttcacc 11898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11898239 - 11898197
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11898239 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaa 11898197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 494
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004552
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc-attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21321132 - 21321087
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21321132 gagcttctatggtgcagccagaaaactgacttttttgaaaaagtta 21321087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 33848017 - 33848058
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33848017 ttctacggtgcggtcagaaaattgactattttgaaaaagtta 33848058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22255652 - 22255612
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtca 456  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22255652 ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatca 22255612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 129
Target Start/End: Original strand, 34853846 - 34853895
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatt 129  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34853846 ggagcttctatggtgcagtcgggaaactgacttttttggaaaagttaatt 34853895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Original strand, 12080405 - 12080445
Alignment:
Q  86 tctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12080405 tctatggtgtagtcaggaaattgacttttttgaaaaagtta 12080445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22616529 - 22616493
Alignment:
Q  459 aaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22616529 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 22616493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31878769 - 31878721
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  31878769 atggggcttctacggtgaagtaagaaaattgactttttaaaaaaagtta 31878721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 46297523 - 46297941
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  46297523 ggagcttctacggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatga 46297622  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46297623 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 46297722  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46297723 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatg 46297821  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  46297822 atactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtg-ttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 46297919  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  46297920 ttttcatgacttcaccatagaa 46297941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 39283067 - 39282643
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39283067 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 39282968  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39282967 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattat 39282868  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39282867 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatg 39282769  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  39282768 ataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggt-attactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaa-tca 39282672  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39282671 ttttcatgacttcaccatagaattttcct 39282643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37203483 - 37203058
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  37203483 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatga 37203384  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacag-atttgatgatatta 265  Q
               |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  37203383 tcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatatta 37203284  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37203283 tgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgat 37203185  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  37203184 gatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaaatc 37203087  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  37203086 atttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37158123 - 37157699
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  37158123 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatga 37158024  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacag-atttgatgatatta 265  Q
               |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  37158023 tcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatatta 37157924  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37157923 tgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgat 37157825  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  37157824 gatactatgatgactgaacttttgatgccactgta-caacagtggggtg-ttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagcc 37157728  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37157727 attttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 26941021 - 26941447
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26941021 ggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 26941120  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26941121 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 26941220  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26941221 atgatagt-tttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatg 26941319  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| | || | || ||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  26941320 ataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtg-ttactcattataattttgattttatagtgttaacttcacca-aaaaaatca 26941417  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  26941418 ttcttatgacttcaccatagaattttccta 26941447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 52040683 - 52041110
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  52040683 ggagcttctacgctgcagtcatacaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatga 52040782  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52040783 tcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 52040882  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52040883 gtgatagtctt-aagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatg 52040981  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||| || ||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  52040982 atactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccag-aaaagtca 52041080  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||| |||||||||  |||| |||||||    
T  52041081 ttctcatgacttcacctcagaattttccta 52041110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4015874 - 4015451
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4015874 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 4015775  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||    
T  4015774 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaat 4015676  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  4015675 gcgatagtctt-aagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatg 4015577  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||| || ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4015576 atactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcag-aaaagtca 4015479  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  4015478 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 81 - 447
Target Start/End: Original strand, 42505837 - 42506214
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  42505837 gagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 42505936  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  42505937 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatg 42506036  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506037 tgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 42506135  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgtta 447  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42506136 tactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt-attactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11467225 - 11466813
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  11467225 ggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaatgatcaatag 11467126  T
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||||||||||       ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11467125 taattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag 11467033  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11467032 tctt-aagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 11466934  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||     
T  11466933 ggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcag-aaaagtcattctcaa 11466836  T
Q  474 gacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  11466835 gacttcaccatagaattttccta 11466813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 48355356 - 48354931
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  48355356 ggagcttctatggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatga 48355257  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48355256 tcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 48355157  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48355156 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 48355058  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| | | ||||||||||| |||| |||| ||| | | ||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  48355057 atactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtg-ttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaa-tca 48354960  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48354959 ttctcatgacttcaccatagaattttcct 48354931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 40552020 - 40552446
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40552020 ggagcttctacggtgcagtctggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataa 40552119  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40552120 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 40552219  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||| | ||  |||||||||||| || || | |||||| |||| |||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40552220 gtgacaatc-ctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatg 40552318  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | || |||| |||  || | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  40552319 atattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttctcca-aaaaagtca 40552416  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40552417 ttctcatgacttcaccatagaattttccta 40552446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3362670 - 3362243
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3362670 ggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 3362571  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3362570 tcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttat 3362471  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagatta--agtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3362470 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattga 3362372  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||  || |||||||    
T  3362371 tgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatg-ttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaagt 3362273  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
     |||||||  | |||||| |||||||||||    
T  3362272 tattttcataatttcaccgtagaactttcc 3362243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 482
Target Start/End: Original strand, 53228913 - 53229326
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  53228913 ggagcttctacggtgcagtcaggcaactgatttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 53229012  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  53229013 tcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactat 53229112  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53229113 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 53229211  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagt-tgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| || |||||| ||| | |  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |     
T  53229212 atattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtg-ttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaa-ta 53229309  T
Q  466 attttcacgacttcacc 482  Q
    ||||||| |||||||||    
T  53229310 attttcatgacttcacc 53229326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 21194022 - 21193596
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21194022 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataa 21193923  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  21193922 tcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 21193823  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21193822 atgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatg 21193723  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||   | ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21193722 ataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccag-aaaagtca 21193625  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21193624 ttctcatgactttaccatagaattttcct 21193596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 369
Target Start/End: Original strand, 22622479 - 22622780
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  22622479 ggagcttttacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatga 22622578  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22622579 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattat 22622678  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22622679 gtgatagtc-ttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatg 22622777  T
Q  367 ata 369  Q
    |||    
T  22622778 ata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 24707890 - 24708210
Alignment:
Q  94 gcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tca 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             | |    
T  24707890 gcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattta 24707989  T
Q  181 tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaa 280  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24707990 tctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgt-tttaa 24708088  T
Q  281 gtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagat--taagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggga 378  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24708089 gtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga 24708188  T
Q  379 gtgaacttttgacgccactgta 400  Q
     ||||||||||| | |||||||    
T  24708189 ctgaacttttgatgtcactgta 24708210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Original strand, 33378546 - 33378929
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||      
T  33378546 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatga 33378645  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  33378646 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattat 33378745  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  33378746 gcgatagtctt-aagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgata 33378844  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  33378845 atactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaata-ttggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttc 33378929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Original strand, 7327246 - 7327671
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttg--aaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat----- 177  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  7327246 ttctacggtgcagttatgaaattgacttttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatta 7327345  T
Q  178 --------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
            ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  7327346 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtg 7327445  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| || ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7327446 atagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgata 7327544  T
Q  370 ctatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtg-ttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||    
T  7327545 ctatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttca-ctaaaaaagtcatt 7327642  T
Q  469 ttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  7327643 ctcataacttcaccatagaattttcctaa 7327671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 174 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34133243 - 34132925
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34133243 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatag 34133144  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  34133143 tc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattat 34133045  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||  || ||||||||||||||      
T  34133044 ggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcacca-aaaaagtcattttcgt 34132947  T
Q  474 gacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||  |||||| ||||||    
T  34132946 gacttcattatagaattttcct 34132925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 83 - 479
Target Start/End: Original strand, 11357145 - 11357535
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat----- 177  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  11357145 gcttctacgatgcagtcagacaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca 11357244  T
Q  178 --------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11357245 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtg 11357344  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
    ||||||||                  | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357345 atagtctt------------------aagtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 11357426  T
Q  370 ctatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattt 469  Q
    |||||  || ||||||||||| || |||||| ||| ||| |||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||     
T  11357427 ctatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattc 11357525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22450958
Alignment:
Q  113 ttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacg 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||             |||||||||||||||||||||     
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| || || ||||||||||  || |||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaa-tgttacacttactggggt 22451152  T
Q  300 gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgt 399  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  22451151 gttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccat 22451052  T
Q  400 ataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    | ||| |||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22451051 acaaacagtgaggtg-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaa-tcattctcatgacttcaccatagaattttcct 22450958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2008354 - 2007965
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------ctga 172  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  2008354 ggagcttttacggtgcaatcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactga 2008255  T
Q  173 ttaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatg 259  Q
    |||||             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2008254 ttaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctg 2008155  T
Q  260 atattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 359  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2008154 atatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatga 2008057  T
Q  360 attgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||    
T  2008056 attgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttc 2007965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Original strand, 22445826 - 22446253
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22445826 ggagcttctatagtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatga 22445925  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||    
T  22445926 tcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattat 22446025  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     |||||||| || ||||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  22446026 atgatagtc-ttgagtgttatacattgtga-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatg 22446123  T
Q  367 atactatg-gggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||    
T  22446124 atactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtg-ttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtc 22446221  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  22446222 attttcatgacttcaccgtagaatttccctaa 22446253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 80 - 445
Target Start/End: Original strand, 21009562 - 21009939
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21009562 ggagtttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 21009661  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  21009662 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatatta 21009761  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||  |||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21009762 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 21009860  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgt 445  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21009861 gataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgt 21009939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44891912 - 44891510
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||  ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44891912 ggagattctacaatgcagtcatcaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 44891813  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  44891812 tcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcat 44891713  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44891712 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatg 44891614  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||         ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  44891613 atactatgtggactaaacttttgatgccac---------agtgggatg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacc--aaaaagtca 44891526  T
Q  467 ttttcacgacttcacc 482  Q
    |||||| |||||||||    
T  44891525 ttttcatgacttcacc 44891510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 81 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 47481937 - 47481554
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  47481937 gagcttctacggtacagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 47481838  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  47481837 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattat 47481738  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  |||| || || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47481737 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatg 47481639  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||| ||  | ||||||||| | || | || ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481638 atactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 47481554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 54506218 - 54505799
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  54506218 ttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaat 54506119  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  54506118 agtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtga 54506019  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   ||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  54506018 tagtc-ttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatac 54505920  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||| ||  |||| |||||| | || | |||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  54505919 tatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaaca-aaaaagtcattct 54505823  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
      |||||||| |||| || |||||    
T  54505822 tgcgacttcatcataaaattttcc 54505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33698566 - 33698259
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    ||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  33698566 agcttctacggtgcatttatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatc 33698467  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  33698466 aatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgc 33698367  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33698366 gatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgat 33698268  T
Q  369 actatgggg 377  Q
    ||| |||||    
T  33698267 actctgggg 33698259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 29099762 - 29099356
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgactttttt-gaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29099762 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatg 29099663  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  29099662 atcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatca 29099563  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    ||||| |||          |||||||| || |||||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29099562 tgtgaaagt----------tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgat 29099473  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  29099472 gatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtc 29099375  T
Q  466 attttcacgacttcaccat 484  Q
    ||| | | |||||||||||    
T  29099374 attctaatgacttcaccat 29099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 497
Target Start/End: Original strand, 3654980 - 3655390
Alignment:
Q  100 agaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaat-------------tcat--ct 183  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||             ||||  ||    
T  3654980 agaaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatct 3655079  T
Q  184 agtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtg 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3655080 agtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagt-tttaagtg 3655178  T
Q  284 ttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaa 383  Q
    ||||| ||| ||  ||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3655179 ttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 3655278  T
Q  384 cttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcacca 483  Q
    ||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  3655279 cttttgatgtcattgtacaaacggtggggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaactttatca-aaaaagtcatttttatgacttcacca 3655376  T
Q  484 tagaactttcctaa 497  Q
    || || ||||||||    
T  3655377 taaaattttcctaa 3655390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 32373884 - 32373469
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||| |||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  32373884 ggagcttctacggtacagtcgtgaaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatga 32373786  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||    
T  32373785 tcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcat 32373686  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32373685 gtgatagtc-ttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatg 32373587  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||| || |||   |||||||||| ||||||||| ||| ||| | |   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |  | ||||||||    
T  32373586 ataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagtggag---ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttat-tggaaaagtca 32373491  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || ||| ||||||| |||||||    
T  32373490 ttctcatgacttcatcatagaa 32373469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Original strand, 24488722 - 24489045
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgactttt-ttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt---- 174  Q
    |||||||||||| || | | || |||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        
T  24488722 ggagcttctacgatgtaatgaggaaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatg 24488821  T
Q  175 ---------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
             ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  24488822 attaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattg 24488921  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24488922 tgtgatagtctt-aagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgat 24489020  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttga 390  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  24489021 gataatatggggactgaacttttga 24489045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 174 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 45174814 - 45174494
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || | ||||    
T  45174814 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattatag 45174715  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 372  Q
    || |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174714 tc-ttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 45174616  T
Q  373 tggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttact--cactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||   ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |    
T  45174615 tggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtg-ttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagttattct 45174518  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||| ||||||||||| || |||||    
T  45174517 cacaacttcaccataaaattttcc 45174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 25580154 - 25579761
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||      
T  25580154 ggagtttctacagtgcagtcttgaaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatga 25580055  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  25580054 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 25579955  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||    
T  25579954 gtaatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatg 25579856  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaa 462  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  25579855 ataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatg-ttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaa 25579761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 485
Target Start/End: Original strand, 43975653 - 43976061
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  43975653 ggagtttctacggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatga 43975752  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacag---atttgatgatat 263  Q
               ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | ||||||||||    
T  43975753 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatat 43975852  T
Q  264 tatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    |||| ||||||        |||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  43975853 tatgcgatagt--------gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattg 43975944  T
Q  364 atgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    |||||| |||| ||| | ||||||||| | ||  ||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     ||||||    
T  43975945 atgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtg-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca----aaaaag 43976039  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  43976040 tcattctcatgacttcaccata 43976061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 496
Target Start/End: Original strand, 44186301 - 44186688
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaat 189  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             | ||||||||||    
T  44186301 aaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 44186400  T
Q  190 gcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 289  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||                   
T  44186401 gcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt--------------- 44186485  T
Q  290 tttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttg 389  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44186486 --tgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttg 44186583  T
Q  390 acgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaac 489  Q
    | | ||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||| |||||||     
T  44186584 atgtcactgtataaacagcggggtg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattctctcgacttcatcatagaat 44186681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 109 - 495
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761837
Alignment:
Q  109 acttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgc 195  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||             |||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  196 aacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatg 295  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttatactttgtg 4761636  T
Q  296 agg-tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgcc 394  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |    
T  4761637 ggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 4761736  T
Q  395 actgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtc-agaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    | |||| ||| |||   ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||  | | ||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||    
T  4761737 attgtacaaacagtgaagtg-ttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttc 4761835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 107 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29164190 - 29163912
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------taattcatctagtaatgcttgcaacgt 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29164190 tgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacat 29164091  T
Q  201 cttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtg 300  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||          |||||||||||| || ||||    
T  29164090 cttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga----------gtgttacactttgtggggtg 29164001  T
Q  301 ttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttg 389  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  29164000 ttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1090102 - 1089811
Alignment:
Q  86 tctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------- 177  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||            
T  1090102 tctacggtgtagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaata 1090003  T
Q  178 -----tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgata 272  Q
         ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  1090002 gtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgata 1089904  T
Q  273 gtctttaagtgttacactttatgagg-tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  1089903 gtc-ttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 40936388 - 40935995
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  40936388 ggagcttctacggtgcggacatcaaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatga 40936289  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               | ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||    
T  40936288 tcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcat 40936189  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |                  ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40936188 gtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaa-aaagttggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatg 40936108  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| | |  |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||    
T  40936107 atactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtg-ttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaa-tca 40936010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 434
Target Start/End: Original strand, 14586441 - 14586796
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  14586441 ggagcttctatggtgcactcgtgaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatga 14586540  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  14586541 tcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcat 14586639  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
      ||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14586640 acga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 14586729  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttga 434  Q
    |||||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  14586730 atactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtg-ttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 495
Target Start/End: Original strand, 46994529 - 46994836
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46994529 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatag 46994628  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |||||||||| ||| || || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  46994629 tctt-aagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactat 46994727  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
    | ||| ||||||||||| | || |||||          ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| | ||    
T  46994728 gaggactgaacttttgatgtcattgtat----------gtgtt-actcattaca-ttttgatgttatagtattaacttcacca-aaaaaatcattcttac 46994814  T
Q  474 gacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  46994815 gacttcaccgtagaattttcct 46994836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36012555 - 36012246
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaa-tttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36012555 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatg 36012456  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaac-agatttgatgatatt 264  Q
                ||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||     
T  36012455 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatc 36012356  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36012355 atttgatagtc-ttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattg 36012257  T
Q  364 atgatactatg 374  Q
    |||||| ||||    
T  36012256 atgatattatg 36012246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43348569 - 43348368
Alignment:
Q  170 tgattaattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  43348569 tgattgattcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtg 43348470  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43348469 atagtctt-aagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 43348371  T
Q  370 cta 372  Q
    |||    
T  43348370 cta 43348368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 326
Target Start/End: Original strand, 20373025 - 20373263
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--t 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20373025 gagcttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 20373124  T
Q  179 catctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttt 278  Q
    ||  |||||||        | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20373125 ca-atagtaat-------tcatcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt-ttt 20373215  T
Q  279 aagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaa 326  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  20373216 aagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 451
Target Start/End: Original strand, 54828569 - 54828843
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  54828569 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttgatgatattatttgatag 54828668  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    | ||||||||||||||||| || | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  54828669 t-tttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctat 54828767  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    |  || |||| |||||| | |  ||| ||||  || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54828768 gaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtg-ttactcattaca-tttttatgttatagtgttaactt 54828843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844316
Alignment:
Q  227 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaa 326  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tctt-aagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaa 35844484  T
Q  327 a-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcacta 425  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| |    
T  35844483 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtg-ttactcacaa 35844385  T
Q  426 cacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35844384 catttttgttgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcct 35844316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38592100 - 38591781
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38592100 ggagcttcaacggtgcagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaattt-------------tgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 38592014  T
Q  178 tca-----------tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
    |||           | || ||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38592013 tcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattat 38591914  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||| || ||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  38591913 gtgatagtc-ttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgata 38591815  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgta 400  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||| |||| ||||    
T  38591814 ataatatgtggacttaacttttgatgccattgta 38591781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 494
Target Start/End: Original strand, 27480258 - 27480564
Alignment:
Q  202 ttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagat----ttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactt-----t 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     |    
T  27480258 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtctt-aagtgttacacttctgggt 27480356  T
Q  293 atga--------ggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaac 384  Q
     | |        ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27480357 gttacacttctgggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaac 27480456  T
Q  385 ttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccat 484  Q
    |||||| | ||| ||| ||| | |||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||   || ||||  ||||| ||| ||||||| |||    
T  27480457 ttttgatgtcaccgtacaaacaattggatg-ctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttacca-aaaatatcattctcatgacttcatcat 27480554  T
Q  485 agaactttcc 494  Q
    |||| |||||    
T  27480555 agaattttcc 27480564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 281 - 494
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213166
Alignment:
Q  281 gtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagt 380  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  381 gaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttca 480  Q
     ||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||| || |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtg-ttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcacca-aaaaagtcattctcatgacttca 51213152  T
Q  481 ccatagaactttcc 494  Q
    |||||||| |||||    
T  51213153 ccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 292
Target Start/End: Original strand, 11356919 - 11357135
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  11356919 ggagcatctacggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatga 11357018  T
Q  178 tcatctag----taatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    | |  |||    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11357019 tga-atagtaattaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatag 11357117  T
Q  274 tctttaagtgttacacttt 292  Q
    || || |||||||||||||    
T  11357118 tc-ttgagtgttacacttt 11357135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Original strand, 51212538 - 51212738
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------actga 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||      |||||||||||||||||||||       | |||    
T  51212538 ggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatga 51212631  T
Q  173 t------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
    |      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51212632 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 51212731  T
Q  267 gtgatag 273  Q
    |||||||    
T  51212732 gtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 378
Target Start/End: Original strand, 11835501 - 11835699
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||      ||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  11835501 taattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcatgtgatag 11835594  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaa-attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 372  Q
    |||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11835595 tctt-aattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatacta 11835693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 53176308 - 53176078
Alignment:
Q  228 ttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaa 327  Q
    ||||||||||  | ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| | ||||||  | ||  |||||||    
T  53176308 ttggcatcttgtatatgtaaatagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaa 53176210  T
Q  328 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactaca 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  | |||| ||| |||  ||   ||||| || |||    
T  53176209 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagt--ggacattacttacaaca 53176112  T
Q  428 cttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
     ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  53176111 tttttgatgttatgatgttaacttcatcagaaaa 53176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  114 tttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--------------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                    ||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgata 272  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 452
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373440
Alignment:
Q  311 aacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttg 410  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| | || |||| ||| ||| |    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  411 ggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20373400 ggtg-ttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttc 20373440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35844662 - 35844577
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttga 165  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844662 ggagcttttacggtgcagttatgaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 277
Target Start/End: Original strand, 53811602 - 53811701
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  53811602 taattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaaag----ttgatgatattatgtgatag 53811697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 495
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343470
Alignment:
Q  429 ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcag-aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 55343470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13498731 - 13498676
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattt 136  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13498731 gagcttctacagtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattt 13498676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 377
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811732
Alignment:
Q  340 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 53811732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 49359296 - 49359335
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49359296 gcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttgaaaaa 49359335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2613958 - 2613895
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttca 480  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||    
T  2613958 ttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaaca-aaaaagtcattttaatgacttca 2613895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 23165291 - 23165333
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23165291 cttctacggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaagtta 23165333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34133373 - 34133323
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattt 130  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34133373 ggagcttctaaggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattt 34133323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43348630 - 43348556
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgactttttt-gaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattt 153  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  43348630 ggagtttctacggttcagtcataaaattgattttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45174889 - 45174819
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattca 150  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  45174889 ggagcttcttcggtgtagtcatcaaactggcttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttaattca 45174819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Original strand, 53811435 - 53811476
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53811435 ttctacggtgcagtcagaaaactgactttcttgaaaaagtta 53811476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 27480142 - 27480205
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 166  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27480142 aaattgattttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgat 27480205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 31706488 - 31706531
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31706488 gcttcaacggtgcagtcaaaaaactgacttttttgaaaaagtta 31706531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 47930333 - 47930372
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 122  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47930333 gcttttacggtgaagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 47930372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33698256 - 33698220
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33698256 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttc 33698220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133256
Alignment:
Q  142 tttgattcatttttaaattgttgattactgatt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgatt 34133256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 40640298 - 40640342
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgac-ttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40640298 gcttctacggttcagtcaaaaaattgactttttttgaaaaagtta 40640342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 42204391 - 42204342
Alignment:
Q  444 gttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  42204391 gttaacttcatcagaaaa-gtcattctcacgacttcacgatagaattttcc 42204342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 494
Target Start/End: Original strand, 49359640 - 49359676
Alignment:
Q  458 aaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49359640 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 49359676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 30055926 - 30055500
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30055926 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 30055827  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  30055826 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattat 30055727  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30055726 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatg 30055628  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30055627 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtca 30055529  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || | | ||||||||||||||| ||||||    
T  30055528 ttcttatgacttcaccatagaattttcct 30055500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18797726 - 18797303
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18797726 ggagcttttatgatgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 18797627  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18797626 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 18797527  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18797526 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 18797428  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||  || |||||||||    
T  18797427 atactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcacca-aaaaagtca 18797332  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18797331 ttctcatgacttcaccatagaattttcct 18797303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 81 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24212140 - 24211717
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24212140 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 24212041  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  24212040 caatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattat 24211941  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24211940 gtgatagtc-ttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatg 24211842  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  24211841 atactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 24211744  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    || | | ||||||||||||||| ||||    
T  24211743 ttcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 84 - 495
Target Start/End: Original strand, 32820820 - 32821240
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---------- 173  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||              
T  32820820 cttctacgccgcagtcagaaaattaattttttt-aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaa 32820918  T
Q  174 ---taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32820919 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcga 32821018  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32821019 tagtc-ttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatac 32821117  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    || | ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||    
T  32821118 tacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtg-ttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcacca-aaaaaatcatttt 32821215  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  32821216 catgacttcaccatagaattttcct 32821240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4583318 - 4582894
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||         
T  4583318 ggagcttctacggtgcagccagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatga 4583219  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4583218 ttaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattat 4583119  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  4583118 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 4583020  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  4583019 atactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtg-ttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccag-aaaagtca 4582922  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4582921 ttttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21992026 - 21991609
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  21992026 ggagcttctacggtgtaatcatgaaactgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgatgatcaa 21991927  T
Q  174 ---taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
       ||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  21991926 tagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga 21991832  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991831 tagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 21991733  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  21991732 tatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtg-ttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaa-tcattct 21991635  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||    
T  21991634 catgacttcaccctagaattttccta 21991609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 15612521 - 15612944
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15612521 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 15612620  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  15612621 tcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 15612720  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15612721 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 15612819  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| | | ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| || |    
T  15612820 atattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtg-ttactcataacac-tttgatgttatagtgttaacttca-caagaaacgtta 15612916  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15612917 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 495
Target Start/End: Original strand, 9355590 - 9356013
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  9355590 agcttctatggtgcaggcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatc 9355689  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9355690 aatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 9355789  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9355790 gatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgat 9355888  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    | |||| | | | ||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||  || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  || |||  ||||||    
T  9355889 aatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt-attgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcacca-aaatggtcatt 9355986  T
Q  469 ttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     ||| |||||||||||| || ||||||    
T  9355987 ctcatgacttcaccataaaattttcct 9356013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23111589 - 23111171
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt------- 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  23111589 agcttctacggtacagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatc 23111490  T
Q  175 ------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
          ||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23111489 aatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 23111390  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakg--ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23111389 gatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatg 23111291  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| |  |  ||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  23111290 atactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtg-ttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa-tca 23111193  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  23111192 ttttcatgacttcaccacagaa 23111171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 85 - 497
Target Start/End: Original strand, 31578831 - 31579258
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||           
T  31578831 ttctatggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaat 31578930  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31578931 agtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgat 31579030  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579031 agtctt-aagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 31579129  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaat-----agttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||  || ||||||||||| | || |||||||||     ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |    
T  31579130 atgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatta 31579227  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    || | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  31579228 ttcttatgacttcaccatagaattttcctaa 31579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37110273 - 37109847
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37110273 ggagcttctacggtgcagtcaagaaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 37110174  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37110173 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 37110074  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaag--takgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110073 gtggtagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 37109975  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    ||||| |||   || ||||||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  37109974 tgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagt 37109877  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  37109876 catttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27284145 - 27283719
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaag-ttaatttcgattttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27284145 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaat 27284046  T
Q  178 -------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
                 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  27284045 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatatt 27283946  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27283945 atgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattga 27283847  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||   || |||| |||  || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    
T  27283846 taatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaat 27283749  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  27283748 catttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 41764840 - 41765265
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  41764840 ggagtttctacggtggagtcgggaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatga 41764939  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41764940 tcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 41765039  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41765040 gtgatagtctt-aagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatg 41765138  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||| ||||||||    
T  41765139 atactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtg-ctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcag-aaaagtca 41765236  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  41765237 ttctcatgacttcaccatggaattttcct 41765265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6546918 - 6546494
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6546918 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 6546819  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||    
T  6546818 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcat 6546719  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6546718 gtgataatatt-aagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 6546620  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  6546619 atactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtg-ttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaa-tca 6546522  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || | | ||||||||||||||| |||||    
T  6546521 ttcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 17842346 - 17842773
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17842346 ggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 17842445  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17842446 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 17842545  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaag--takgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842546 gtggtagtc-ttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 17842644  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    ||||| |||   || ||| ||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  17842645 tgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagt 17842742  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  17842743 catttttatgacttcaccatagaattttcct 17842773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7335192 - 7334769
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||      
T  7335192 ggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatga 7335093  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  7335092 ttaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaact-agttgatgatattat 7334994  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7334993 ctgataatctt-aagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatg 7334895  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| | | ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7334894 atactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtca 7334797  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  7334796 ttctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 478
Target Start/End: Original strand, 48928059 - 48928466
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||      
T  48928059 ggagcttctacggtgcagttagaaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatga 48928158  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48928159 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattat 48928258  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  48928259 gcgatagtc-ttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgata 48928357  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  48928358 atactat-gggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtg-ctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccag-aaaagtca 48928454  T
Q  467 ttttcacgactt 478  Q
    || ||| |||||    
T  48928455 ttctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32432851 - 32432429
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  32432851 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatga 32432752  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  32432751 ttaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattat 32432652  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32432651 gtgatagtc-ttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatg 32432553  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | || |||| ||| | | ||||| |||||||| ||| |||||     ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  32432552 atactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtg-ttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaa-tca 32432460  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  32432459 ttttcgtgacttcaccatagaattttcctaa 32432429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 10358976 - 10359400
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  10358976 ggagcttctacggtgcagttaagaaactaacttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 10359075  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  10359076 tcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttat 10359175  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattaga-ttaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10359176 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgat 10359274  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||   ||| |||||||    
T  10359275 gatactat-cagactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatg-ttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccag-aaaagtc 10359371  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  10359372 attatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 5657242 - 5657667
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgat-tttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||||||  |||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  5657242 ggagcttctacaatgcagttatgaaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatg 5657341  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  5657342 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatca 5657441  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  5657442 tgcgatagtctt-aagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgat 5657540  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||    
T  5657541 gatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactag-aaaagtc 5657638  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  5657639 attctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8861684 - 8861260
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8861684 ggagcttcaacggtgcagtgatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 8861585  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  8861584 tcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcat 8861485  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  8861484 gtgatggtcttga-gtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatg 8861386  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  8861385 atactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgag-aaaagtca 8861288  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  8861287 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 8861260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 78 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 10482006 - 10481577
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa- 176  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  10482006 atggatcttttatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaac 10481907  T
Q  177 ------------ttcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
                ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  10481906 gatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatatt 10481807  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10481806 atgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattga 10481708  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    |||||||||   || |||| |||||| | || |||| ||| ||| |||   ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10481707 tgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagt 10481608  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||| ||   |||| ||||||||| ||||||    
T  10481607 cattctcctaactttaccatagaattttcct 10481577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 107 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37347393 - 37346997
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||             ||||| ||||||||||    
T  37347393 tgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgctt 37347294  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  37347293 gcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtc-ttaagtgttacactttg 37347195  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
    ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  37347194 tggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgt 37347096  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    ||||||| ||| | | ||||| ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  37347095 cactgtacaaacaatggggtg-ttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcacca-aaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttc 37346998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686014
Alignment:
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagt- 43686232  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  43686231 tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatag 43686132  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacga 475  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  ||    
T  43686131 ggactgaacttttgatgccattgtacaaacag-tgggtg-ttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttca-cccaaaaagtcattttcgtga 43686035  T
Q  476 cttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  43686034 cttcaccatagaattttccta 43686014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 175 - 451
Target Start/End: Original strand, 33688132 - 33688406
Alignment:
Q  175 aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  33688132 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagt 33688231  T
Q  275 ctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 374  Q
    ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33688232 cttgaa-tgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactata 33688330  T
Q  375 gggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    | || ||||||||||| ||||||| | ||| ||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33688331 gagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatg-ttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt 33688406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687228
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        || ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| || |    
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca--------gagttgttgatatcatgagatagtcttga-gtgttacactttgtggg 22687409  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  22687408 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccact 22687309  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttca 480  Q
    | | ||| ||| | ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  22687308 gcacaaacagtggagtg-ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcag-aaaagtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 29173921 - 29173547
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  29173921 ggagcttctacgatgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatga 29173822  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29173821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattat 29173723  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||||                  | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  29173722 gtgatagtctt------------------aagtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatg 29173641  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||  |||||||    
T  29173640 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtg-ttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaa 29173547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Original strand, 37703260 - 37703551
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  37703260 ggagcttctatggtgcagtcagtaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatga 37703359  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37703360 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 37703459  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 359  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37703460 gtgatagtc-ttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 174 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 12166035 - 12165727
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||       
T  12166035 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga--- 12165939  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
           |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  12165938 -------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactta 12165846  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcac 473  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  12165845 agggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattttaac 12165748  T
Q  474 gacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  12165747 gacttcaccgtagaattttcc 12165727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 31520503 - 31520909
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  31520503 ggagcttctatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatga 31520602  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31520603 tcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattat 31520702  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||||                  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31520703 gtgatagtctt------------------aagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatg 31520784  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||| | | | ||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||    
T  31520785 atactat-gggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtg-ttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca-aaaaagtca 31520881  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  31520882 ttttcatgacttcatcataaaattttcc 31520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 376
Target Start/End: Original strand, 15672519 - 15672832
Alignment:
Q  80 ggagcttctac--ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---- 173  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        
T  15672519 ggagcttctacagggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcat 15672618  T
Q  174 ---------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactatt---ttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 261  Q
             ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15672619 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgat 15672718  T
Q  262 attatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15672719 attatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaat 15672817  T
Q  362 tgatgatactatggg 376  Q
    |||||||||||||||    
T  15672818 tgatgatactatggg 15672832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258521
Alignment:
Q  195 caacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttat 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgt 38258718  T
Q  295 gaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgcc 394  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |    
T  38258717 ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtc 38258618  T
Q  395 actgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    | |||| |||  ||  |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  38258617 attgtacaaacggtgtggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 11071550 - 11071186
Alignment:
Q  132 gattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtact 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11071550 gattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtatt 11071451  T
Q  219 attttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagt 318  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  11071450 attttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatctt-aagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggt 11071355  T
Q  319 akgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgttta 418  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||| |||    
T  11071354 aggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtg-tta 11071256  T
Q  419 ctcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||   || |||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11071255 ctcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaa 11071186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 214 - 485
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928740
Alignment:
Q  214 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt-aagcattacactttctgaggtgttacacttaaaat 48928571  T
Q  314 aaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggt 413  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  48928572 aatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactat-gggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggt 48928670  T
Q  414 gtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48928671 g-ctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccag-aaaagtcattctcatgacttcaccata 48928740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 26980705 - 26980339
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  26980705 ggagcttctaaggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatga 26980606  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  26980605 tcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcat 26980506  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |                  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26980505 gtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatg 26980424  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26980423 atattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtg-ttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttc 26980339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 359
Target Start/End: Original strand, 46480905 - 46481182
Alignment:
Q  94 gcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tca 180  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||             |||    
T  46480905 gcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca 46481004  T
Q  181 tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaa 280  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  46481005 tctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtc-ttaa 46481103  T
Q  281 gtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  46481104 gtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 111 - 485
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691722
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | | ||| ||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgtgacactttgtggg 25691535  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||  | | |||||| |||| ||||||    
T  25691536 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccact 25691635  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||| ||| |||  |||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25691636 gtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgag-aaaagtcattctcatgacttcaccata 25691722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 12390411 - 12390817
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  12390411 ggagcttctacggtgaagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatga 12390510  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  12390511 taaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattat 12390610  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||  ||||| |                  ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12390611 gtga--gtcttaa------------------gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgata 12390690  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||||||   ||||||||| | ||||| | ||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  12390691 atactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatg-ttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcg 12390788  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     | | | ||||||||||||||| ||||||    
T  12390789 atctgatgacttcaccatagaattttcct 12390817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 35353507 - 35353124
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  35353507 ggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatga 35353408  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  35353407 tcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattat 35353308  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagta--kgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||   | || |  |||  ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  35353307 gagatagtc-ttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttacatctag--taa-tgcagtcttgttaatctgatgaattgg 35353212  T
Q  365 tgatactatggggagtg-aacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  |||  ||| ||| | | |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35353211 tgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtg-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttc 35353124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44599065 - 44598735
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact---gattaa 176  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||  || |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||    
T  44599065 ggagtttctacggtgcagtcatgaaactgatttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaa 44598967  T
Q  177 t-----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
    |           ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  44598966 tgatcaatagtttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatca 44598867  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44598866 tgtgatagtctt-aggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttat 44598768  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactg 398  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  44598767 gatactatggggattgaatttttgatgccactg 44598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43925459 - 43925179
Alignment:
Q  115 ttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaatgcttgcaacgtc 201  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43925459 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 43925360  T
Q  202 ttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgt 301  Q
    ||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||| || || ||||||||    
T  43925359 ttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgt-attaagtattaaacgttgtgaggtgt 43925267  T
Q  302 tacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttga 390  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  43925266 tgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttga 43925179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 348
Target Start/End: Original strand, 26587854 - 26588126
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          
T  26587854 ggagcttctacggcgcaatcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatga 26587953  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
           |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| ||    
T  26587954 tcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcat 26588045  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgt 348  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26588046 gtgatagtc-ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 488
Target Start/End: Original strand, 27421291 - 27421559
Alignment:
Q  212 aggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaa 311  Q
    ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27421291 aggtaatattttatagttggcat----aacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtctt-aagtgttacactttgtgggatgttacacttaaa 27421385  T
Q  312 acaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgg 411  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| |     
T  27421386 ataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgga 27421484  T
Q  412 gtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27421485 gtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattatcacgacttcaccatagaa 27421559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 488
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413560
Alignment:
Q  278 taagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 377  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  378 agtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgact 477  Q
    |  ||||||||||   || |||| ||| | | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtg-ttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgact 44413549  T
Q  478 tcaccatagaa 488  Q
    | |||||||||    
T  44413550 ttaccatagaa 44413560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704241
Alignment:
Q  236 tttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagatta 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaatta 37704289  T
Q  336 agtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37704288 agtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 274
Target Start/End: Original strand, 44411304 - 44411509
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta------ 175  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          
T  44411304 agcttatatggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtc 44411403  T
Q  176 -------attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44411404 aatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 44411503  T
Q  269 gatagt 274  Q
    ||||||    
T  44411504 gatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37704581 - 37704387
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  37704581 ggagcttttatggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatga 37704482  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 261  Q
               |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37704481 tcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 446
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593327
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||             | ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||                    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt---------------- 32593178  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
      | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||  |    
T  32593179 --aagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgt-gagactgaacttttgatac 32593275  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgtt 446  Q
    |||  |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32593276 caccatataaacagtggggtg-ctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38258978 - 38258881
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258978 ggagcttctacggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 38258881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053470
Alignment:
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
    ||                  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||     
T  38053651 tt------------------aagtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatga 38053578  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacga 475  Q
    | | ||||||||||| | || |||| ||| ||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||  || |||||  |||| ||| ||    
T  38053577 gaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggt-tttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaaacattatcatga 38053479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362125
Alignment:
Q  109 acttttttgaaaaagttaatttcgatt--ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||             ||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaga 252  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaacaga 34362125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 495
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524514
Alignment:
Q  343 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatag 442  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| | ||| | | | ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtg-ttagtcacaacatttttgatgttatag 26524462  T
Q  443 tgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||| ||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26524463 tgttaacatcaccag-aaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 26524514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 451
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362292
Alignment:
Q  362 tgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgtt-actcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 34362292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4902700 - 4902657
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4902700 gcttctatggtgaagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 4902657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12166288 - 12166215
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattt 153  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  12166288 ggagcttctacactgcagtcatgaaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Original strand, 33688054 - 33688118
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgttt 144  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  33688054 ggagcttctacagtgcagtcgtgaaactgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttt 33688118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 496
Target Start/End: Original strand, 241033 - 241071
Alignment:
Q  458 aaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  241033 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccta 241071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8299254 - 8299196
Alignment:
Q  429 ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  8299254 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaa-gtcattttcgtgacttcaccatagaa 8299196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12166045
Alignment:
Q  148 tcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaat 12166045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7893
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8311 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 8212  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  8211 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattat 8112  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| | |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 8013  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8012 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtca 7915  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || | |  ||||||||||||||    
T  7914 ttcttataacttcaccatagaa 7893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 84 - 496
Target Start/End: Original strand, 3879703 - 3880125
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt--------- 174  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3879703 cttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaa 3879802  T
Q  175 ----aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3879803 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 3879902  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3879903 tagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatac 3880001  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||||||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  3880002 tatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtg-ttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccag-aaaagtcattct 3880099  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||    
T  3880100 cgtgacttcaccatagaattttccta 3880125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1946261 - 1945832
Alignment:
Q  79 tggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa-gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946261 tggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 1946162  T
Q  178 --------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 263  Q
                  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1946161 gatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatat 1946062  T
Q  264 tatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  1946061 tatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattc 1945963  T
Q  364 atgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | || | || ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  1945962 atgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaag 1945864  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||    
T  1945863 tcattcttatgacttcaccgtagaattttcct 1945832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 6090942 - 6091360
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6090942 ggagcttctacggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 6091041  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6091042 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattat 6091141  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6091142 gtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatg 6091241  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| | | | ||||||||||| | || |||| ||| | | | ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||   || ||||| | |    
T  6091242 atactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtg-ttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttacca-aaaaaatta 6091338  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  6091339 ttttcatgacttcacaatagaa 6091360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8513638 - 8513232
Alignment:
Q  87 ctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------taattca 180  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||    
T  8513638 ctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgatcaatagtaattca 8513539  T
Q  181 tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaa 280  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  8513538 tctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aa 8513440  T
Q  281 gtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggag 379  Q
    |||||||||||| |  |||||||      |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  8513439 gtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggac 8513346  T
Q  380 tgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttc 479  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  8513345 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgacttc 8513248  T
Q  480 accatagaactttcct 495  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8513247 accatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20768506 - 20768087
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20768506 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 20768407  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20768406 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattat 20768307  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | |||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20768306 gcgatgatc-ttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatg 20768210  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||  | ||| |  ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  20768209 atactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaaca-atggatg-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccag-aaaagtca 20768114  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20768113 ttctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 4318576 - 4319008
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaat------gtttgattcatttttaaattgttgattactgat 173  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4318576 ggagcttctacggtgcagttatgaaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgat 4318675  T
Q  174 taat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatga 260  Q
    ||||             ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  4318676 taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctga 4318775  T
Q  261 tattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 359  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4318776 tatcatgtgatagtc-ttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatga 4318874  T
Q  360 attgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaa 459  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  4318875 attgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aa 4318972  T
Q  460 aaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4318973 aaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 4319008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5627816 - 5627390
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5627816 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 5627717  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5627716 tcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 5627617  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5627616 tgtgatagtc-ttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 5627518  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
     |||||||| ||  ||||||||||| | || | || ||||||| ||||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  5627517 aatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtg-ttactcattatattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtc 5627420  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| | | ||||||||| ||||| ||||||    
T  5627419 attcttatgacttcaccttagaattttcct 5627390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 7234792 - 7235218
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt----------ac 169  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||          |     
T  7234792 ggagcttttacggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaa 7234891  T
Q  170 tgat------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 263  Q
    ||||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7234892 tgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatat 7234991  T
Q  264 tatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7234992 tatgcgatagtc-ttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattg 7235090  T
Q  364 atgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    || ||||||| | || ||||||||||| | ||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  7235091 ataatactat-gagactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtg-ctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttca-ccggaaaag 7235187  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  7235188 tcattctcataacttcaccatagaattttcc 7235218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 109 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29182556 - 29182172
Alignment:
Q  109 acttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat----------tcatctagtaatgcttgcaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||          |||||||||||| ||||||||    
T  29182556 acttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcagtaattcatctagtaatacttgcaac 29182457  T
Q  199 gtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgagg 298  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29182456 atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttatgggg 29182358  T
Q  299 -tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
     |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||    
T  29182357 gtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacact 29182258  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  29182257 gtataaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatca-ataaaatcattctcatgacttcaccata 29182172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6088914
Alignment:
Q  114 tttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggac 207  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggac 6089187  T
Q  208 ttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacact 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |   ||||||        
T  6089186 ttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttataccttgtagagtgtta---- 6089092  T
Q  308 taaaacaaagtakgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaata 406  Q
      |||||| ||| ||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||| |    
T  6089091 --aaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaaca 6088994  T
Q  407 gttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6088993 gtggggcg-ttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcattctcatgacttcaccatagaa 6088914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 118 - 482
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017284
Alignment:
Q  118 aaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttg 204  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  205 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttac 304  Q
    |||      ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttac 21017108  T
Q  305 acttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaa 404  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||    
T  21017109 acttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaa 21017208  T
Q  405 tagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcacc 482  Q
    || | ||||| |||||||| ||| |||| ||  || | ||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||    
T  21017209 taatggggtg-ttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcacca-aaaaagtcattttcgtgacttcacc 21017284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 452
Target Start/End: Original strand, 33892776 - 33893145
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    ||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  33892776 cttctacggtgcaattatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaa 33892875  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  33892876 tagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
              |||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33892976 ----------gtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 33893065  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||  |||| ||||||||| |   || |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33893066 ta-agggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttc 33893145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 205 - 488
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353536
Alignment:
Q  205 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtgggatgttac 30353354  T
Q  305 acttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaa 404  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||| |||    
T  30353355 acttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaa 30353454  T
Q  405 tagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
     || || |   |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30353455 cag-tgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgacttcaccatagaa 30353536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 222 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491656
Alignment:
Q  222 ttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakg 321  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatt-tttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtagg 15491786  T
Q  322 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactc 421  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15491785 ataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtg-ttactc 15491687  T
Q  422 actacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15491686 acaacacttttgatgttacaatgttaacttc 15491656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 33619234 - 33618866
Alignment:
Q  103 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat----------------taattcatctagt 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||                |||||||||||||    
T  33619234 aaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagt 33619135  T
Q  187 aatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaac-----atgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaag 281  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  33619134 aatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactctt-aag 33619036  T
Q  282 tgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtg 381  Q
    ||| ||||||   | |||||||||||         ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  33619035 tgtcacacttctag-ggtgttacactg--------gtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactg 33618945  T
Q  382 aacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  |||||   ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||    
T  33618944 aacttttgatgccaccgtacaaata-atgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaa 33618866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 496
Target Start/End: Original strand, 7055140 - 7055401
Alignment:
Q  232 catctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattag 331  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  7055140 catctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattat 7055238  T
Q  332 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttt 431  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | || | || |||||||  |||| ||||| | || | |||    
T  7055239 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtg-ttactaattatatttt 7055337  T
Q  432 tgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    | |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||    
T  7055338 ttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttccta 7055401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Original strand, 7054533 - 7054704
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta----- 175  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||         
T  7054533 gagcttttacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgat 7054632  T
Q  176 ---------attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatcttt 238  Q
             |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7054633 caatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498440
Alignment:
Q  361 ttgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaa 460  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||  || |||   || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||  |    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccag-ga 18498467  T
Q  461 aagtcattttcacgacttcaccataga 487  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18498466 aagtcattctcatgacttcactataga 18498440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 21016727 - 21016773
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21016727 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgtcttttttgaaaaagtta 21016773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724116
Alignment:
Q  123 gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaat 33724116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 126
Target Start/End: Original strand, 11083821 - 11083869
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11083821 atggagcttctacggtgaagtcaaaaaatttacttttttgaaaaagtta 11083869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 6613658 - 6613704
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6613658 ggagcttgtacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagtta 6613704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4104394 - 4104353
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4104394 ttctactgtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagtta 4104353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19632129 - 19632086
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  19632129 gcttctacggtgcagttagaaaattgatttttttcaaaaagtta 19632086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 81 - 461
Target Start/End: Original strand, 46887946 - 46888336
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  46887946 gagcttctacggtgcaatcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgat 46888045  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46888046 caatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatg 46888145  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  46888146 tgatagtc--taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacga 46888243  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46888244 tagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggt-attactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaa 46888336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 35020818 - 35021247
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  35020818 ggagcttctacggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatga 35020917  T
Q  178 ---------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgata 262  Q
                   ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35020918 tcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 35021017  T
Q  263 ttatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35021018 ttatgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 35021116  T
Q  363 gatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaa 462  Q
    |||||||||| | |||   |||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  35021117 gatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtg-ttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccag-aaaa 35021214  T
Q  463 gtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35021215 gtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 35021247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 37663528 - 37663952
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  37663528 ggagcttctacggtacagtcaggaaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 37663627  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  37663628 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattat 37663727  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663728 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 37663826  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37663827 atactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatca-aaaaagtca 37663922  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  37663923 ttcttatgacttcaccatagaattttccta 37663952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25184537 - 25184111
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  25184537 ggagcttctatggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatga 25184438  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25184437 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattat 25184338  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25184337 gtgatagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 25184239  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || |||||||| || | || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  25184238 atactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaatagtca 25184141  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25184140 ttctcatgacttcaccatagaattttccta 25184111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 19089240 - 19089664
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19089240 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 19089339  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  19089340 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattat 19089439  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| | || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089440 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 19089538  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | || | || ||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  19089539 atactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtg-ttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatca-aaaaagtta 19089636  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || | | ||||||||||||||| |||||    
T  19089637 ttcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 36493476 - 36493893
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||      
T  36493476 ggagcttctatggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatga 36493575  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36493576 tcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 36493675  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36493676 gtggtagtc-ttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatg 36493773  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | | ||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||  || ||||||| |    
T  36493774 atactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtg-ttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcacca-aaaaagtta 36493871  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  36493872 ttttcatgacttcaccatagaa 36493893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17173714 - 17173296
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||         
T  17173714 ggagtttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatga 17173615  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17173614 taaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 17173515  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  17173514 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatg 17173416  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  17173415 atactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcag-aaaagtca 17173318  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  17173317 ttttcgtaacttcaccatagaa 17173296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 28002773 - 28003197
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  28002773 ggagcttctacactgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatga 28002872  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28002873 tcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 28002972  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002973 gtgatagt-tttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatg 28003071  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||| | ||||||| ||| ||| | ||   |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  28003072 atactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagt-actactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccag-aaaagtca 28003169  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  28003170 ttctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 34361278 - 34361703
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34361278 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 34361377  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34361378 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 34361477  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  34361478 tgtgatag-ctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgat 34361576  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||| |||| ||  ||||||||| | | || | || ||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  34361577 gatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtg-ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtc 34361673  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  34361674 attcttatgacttcaccatagaattttcct 34361703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17168137 - 17167719
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  17168137 ggagtttctacggtgcagtaaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatga 17168038  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17168037 taaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattat 17167938  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  17167937 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatg 17167839  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  17167838 atactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcag-aaaagtca 17167741  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||||   ||||||||||||||    
T  17167740 ttttcgtaacttcaccatagaa 17167719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 494
Target Start/End: Original strand, 55240896 - 55241315
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  55240896 cttctacggtgcagttatgaaactgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaa 55240995  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  55240996 tagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtga 55241095  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  55241096 tagtc-ttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatac 55241193  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| | ||| |||||||  |||||| ||||||||   || |||||||||| |    
T  55241194 tatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactag-aaaagtcattct 55241291  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||||||||||||||| |||||    
T  55241292 catgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6864459 - 6864044
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  6864459 ggagcttctacggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 6864360  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6864359 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 6864260  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6864259 gtgatagtc-ttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatg 6864161  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| || |||||||| || | |||| ||| |||||| || ||| ||| || | |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  6864160 atactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatg-ttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcacca-aaaaagtca 6864063  T
Q  467 ttttcacgacttcaccata 485  Q
    || ||| ||| ||||||||    
T  6864062 ttctcatgacatcaccata 6864044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 32912366 - 32912792
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32912366 ggagcttttacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 32912465  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32912466 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatatta 32912565  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32912566 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgat 32912664  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    |||| |||| |   |||||||||||   || | || ||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32912665 gatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtc 32912762  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  32912763 attcttatgacttcaccatagaattttcct 32912792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 82 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7703931 - 7703517
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---- 177  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  7703931 agcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgata 7703832  T
Q  178 ---------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
             ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7703831 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgt 7703732  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||    
T  7703731 gatagtc-ttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatgat 7703641  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  7703640 actatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtg-ttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcatt 7703543  T
Q  469 ttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
     ||| ||||| | ||||||| |||||    
T  7703542 ctcatgactttaacatagaattttcc 7703517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23761495 - 23761114
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  23761495 ggagcttattcggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatga 23761396  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  23761395 tcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcat 23761296  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23761295 gcgatagtc-ttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 23761198  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23761197 atactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 25700843 - 25701269
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgt-------tgattactga 172  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||    
T  25700843 ggagtttctacggtgcagttaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatga 25700942  T
Q  173 t------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
    |      |||||||||||  |||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  25700943 tcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttat 25701042  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgagg-tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25701043 gtgataatctt-aagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgat 25701141  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||    
T  25701142 gatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtg-ttactcactacacttttgatgttataatgttaactttacca-aaaaagtc 25701239  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  25701240 attatcatgacttcaccataaaattttcct 25701269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 49376391 - 49375966
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  49376391 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatga 49376292  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  49376291 tcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattat 49376192  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| || ||||||||||||| || || |||||   ||||||| ||| | |  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49376191 gtgataatc-ttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatg 49376093  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  49376092 atactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtg-ttactcacgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtca 49375994  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  49375993 ttctcatgacttcaccgtagaattttcc 49375966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 47254164 - 47253755
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47254164 ggagcttctacggtggagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 47254065  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  47254064 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 47253965  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||        |||||    
T  47253964 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc--------tgatg 47253874  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||    
T  47253873 atactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaaca-atgggtg-ttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcacca-aaaaagtca 47253777  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || ||| |||||||||||||||    
T  47253776 ttctcatgacttcaccatagaa 47253755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 19440435 - 19440860
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||      
T  19440435 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatga 19440534  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19440535 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 19440634  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    || |||  | ||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440635 gttataaac-ttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 19440733  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||  || | ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  19440734 atattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtg-ttaatcattacatttttgatgttatagtgttaacatcacca-aaaaagtca 19440831  T
Q  467 ttttcacgac-ttcaccatagaactttcc 494  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  19440832 ttctcatgactttcaccatagaattttcc 19440860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 29583987 - 29584410
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  29583987 ggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatga 29584086  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  29584087 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcat 29584186  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  29584187 gcgatagtctt-aagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatg 29584285  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||| |||| ||| |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  29584286 atactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtg-ttactca--acacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 29584381  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  29584382 ttcccacgacttcaccatagaattttcct 29584410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Original strand, 879335 - 879762
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  879335 ggagcttctatggtgtagtcagaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatga 879434  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  879435 tcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 879534  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  879535 gtgatagtc-ttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatg 879633  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||||  || | ||||||||| | || |||| ||| | |  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||| | |    
T  879634 atactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcacca-aaaaaatta 879731  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    || ||| ||||||||| || || ||||||||    
T  879732 ttctcatgacttcaccttaaaattttcctaa 879762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 121 - 485
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948299
Alignment:
Q  121 aagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa-------------ttcatctagtaatgcttgcaacgtcttggac 207  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  208 ttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagt--gttacactttatgaggtgttaca 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| ||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc-ttaagtacgttacactttgtggggtgttgca 34948121  T
Q  306 cttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaat 405  Q
    ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| || |||     
T  34948122 ctttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaac 34948221  T
Q  406 agttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34948222 agtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccag-aaaagtcattctcatgacttcaccata 34948299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 37776083 - 37775670
Alignment:
Q  79 tggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37776083 tggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 37775984  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  37775983 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatca 37775884  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37775883 tgtga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgat 37775794  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||| |||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||  || ||||| ||    
T  37775793 gatactaaggg--gggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcacca-aaaaaatc 37775698  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttc 493  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  37775697 attttaatgacttcaccgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 107 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 33341795 - 33341401
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||    
T  33341795 tgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 33341696  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33341695 acaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttg 33341597  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  33341596 tgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgatgc 33341498  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcacta----cacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| || ||| | |    || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  33341497 cactgtacaaacagtggggtg-ttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaa-tcattctcatgacttcactatagaa 33341401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 495
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55478107
Alignment:
Q  118 aaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttg 204  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||             ||||||||||||||||||||| |||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  205 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttac 304  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc-ttcagtgttacacgttgtggggtgttac 55477914  T
Q  305 acttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgt----a 400  Q
    ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||    |    
T  55477915 acttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaa 55478014  T
Q  401 taaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     ||| ||| | ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55478015 caaacagtggagtg-ttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcct 55478107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1815715 - 1815409
Alignment:
Q  89 acggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat----------- 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  1815715 acggcgcagtcagaaaattgacttttta-aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgta 1815617  T
Q  178 --tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1815616 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 1815517  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
     |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  1815516 -ttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatga 1815418  T
Q  376 ggagtgaac 384  Q
    ||| |||||    
T  1815417 ggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 79 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3043044 - 3042741
Alignment:
Q  79 tggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3043044 tggagcttctacggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaata 3042945  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  3042944 atcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatatta 3042845  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| || || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3042844 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgat 3042746  T
Q  366 gatac 370  Q
    |||||    
T  3042745 gatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42200154 - 42199726
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||      
T  42200154 ggagcttctacggtgcaatcaggaaattgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatga 42200056  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttaca-ggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42200055 acagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatatt 42199956  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199955 atgtgatagtctt-aagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 42199857  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagt 464  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | | || | || ||||| | ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |    
T  42199856 tgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggt-attactcattacatttttgatgttatagtattaacttcacca-aaaaaat 42199759  T
Q  465 cattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||| | | || |||||||||||  ||||||||    
T  42199758 cattcttatgatttcaccatagatttttcctaa 42199726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 462
Target Start/End: Original strand, 33816303 - 33816713
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  33816303 ggagcttctacgatgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatga 33816402  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  33816403 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 33816502  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt-----------------gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgtt 349  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| || |||                 |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33816503 gcgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgtt 33816601  T
Q  350 aatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaac 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  33816602 aatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtg-ctactcactacacttttgatgctacaatgttgac 33816700  T
Q  450 ttcwtcagaaaaa 462  Q
    |||  ||||||||    
T  33816701 ttcaccagaaaaa 33816713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37288153 - 37287731
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgatt-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37288153 ggagcttccacggtgcagtcatgaaagtgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatg 37288054  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |    
T  37288053 ctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatca 37287954  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttat-gaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||        |     
T  37287953 tgtgctagtc-ttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tt 37287863  T
Q  364 atgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaag 37287764  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  37287763 tcattctcattacttcaccatagaattttccta 37287731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 176 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011853
Alignment:
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
    || ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38012069 tt-aagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatgg 38011971  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacga 475  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||| ||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||| ||    
T  38011970 ggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtg-ctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccag-aaaagtcattctcatga 38011873  T
Q  476 cttcaccatagaactttcct 495  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  38011872 tttcaccatagaattttcct 38011853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 107 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 50697639 - 50697241
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             ||||||||||||||||    
T  50697639 tgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 50697540  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacat-gcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttt 292  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50697539 acaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttgcacttt 50697441  T
Q  293 atgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacg 392  Q
     || |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |    
T  50697440 gtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatg 50697342  T
Q  393 ccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaacttt 492  Q
     || |||| |||  || ||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||| |||||  |  ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||    
T  50697341 tcattgtacaaacggtagggtg-ttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttca-ctaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaatttt 50697244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 81 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27397037 - 27396622
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac-----tgat-- 173  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||      
T  27397037 gagcttttacggtgcaatcatgaaactgattttttaaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacattaatgatca 27396938  T
Q  174 ----taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtg 269  Q
        ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |    
T  27396937 atagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcg 27396838  T
Q  270 atagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgata 369  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27396837 atggtctt-aagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 27396739  T
Q  370 ctatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattt 469  Q
    ||||| |||   ||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||     
T  27396738 ctatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtg-ttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccag-aaaagtcattc 27396641  T
Q  470 tcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  27396640 tcatgacttcaccatagaa 27396622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 462
Target Start/End: Original strand, 5047753 - 5048145
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgtt-------gattactga 172  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||    
T  5047753 ggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactga 5047852  T
Q  173 t------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
    |      ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||    
T  5047853 tcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcat 5047952  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5047953 gtgatagtc-ttaagtgttacattttgcg-ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatg 5048050  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaa 462  Q
    |||||||||| | |||||||||||   ||  ||| ||| |||  |||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  5048051 atactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggt-cctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaa 5048145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 32579870 - 32579443
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||      
T  32579870 ggagtttctacggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatga 32579771  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32579770 tcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattat 32579671  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
      ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||     
T  32579670 aagatagtc-ttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgata 32579572  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgt---ataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaag 463  Q
    ||||||| | || | ||||||||| | ||| ||   | ||| | | |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||    
T  32579571 atactat-gagactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtg-ctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccag-aaaag 32579475  T
Q  464 tcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||| |||  ||||||||||| || ||||||    
T  32579474 tcattctcagaacttcaccataaaattttcct 32579443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 32592503 - 32592106
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaa-------- 176  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  32592503 ttctacggtgcagtcataaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaat 32592404  T
Q  177 -----ttcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
         ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||| || || |||     
T  32592403 agtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatga- 32592305  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
             |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592304 ---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 32592214  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    | ||||| ||||||||||| | |||| || ||| ||| | ||| |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |     
T  32592213 aaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtg-ttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatca-aaaaagtcattata 32592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 487
Target Start/End: Original strand, 30002428 - 30002828
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  30002428 ggagcttctacggtgcagttatgaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatga 30002527  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
           ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  30002528 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 30002627  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||          ||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||    
T  30002628 gtg----------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc--------tgatg 30002709  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| |  || ||||||||||| | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||    
T  30002710 atactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtg-ttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaa-tca 30002807  T
Q  467 ttttcacgacttcaccataga 487  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30002808 ttttaatgacttcaccataga 30002828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4598406 - 4598002
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  4598406 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatga 4598307  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  4598306 tcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcat 4598207  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4598206 gtga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatg 4598118  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  4598117 agtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 4598021  T
Q  467 ttttcacgacttcaccata 485  Q
    || | | ||||||||||||    
T  4598020 ttctaatgacttcaccata 4598002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 80 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17272388 - 17272084
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||      
T  17272388 ggagcttctacggtgcagtcatgaaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatga 17272289  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  17272288 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcat 17272189  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17272188 gcgatagtctt-aagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatg 17272090  T
Q  367 atacta 372  Q
    ||||||    
T  17272089 atacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 81 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 50765143 - 50764746
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    |||||||||||||||| |||  |||   |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  50765143 gagcttctacggtgcaatcatgaaacaaacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat 50765044  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||    
T  50765043 caatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatg 50764944  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    ||||| | || | ||||| |||||| || ||||||||||          ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  50764943 tgataatattga-gtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatga 50764855  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  50764854 tactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgt--tagtgttaacttcatca-aaaaagttat 50764759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 92 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9139639 - 9139246
Alignment:
Q  92 gtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattg-----ttgattactgat------taattca 180  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||||      ||||||     
T  9139639 gtgcagtgaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattagattattgattaatgatcaatagtaattcg 9139540  T
Q  181 tctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaa 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||                  ||||    
T  9139539 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatc-----------------ttaa 9139457  T
Q  281 gtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagt 380  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9139456 gtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggatt 9139357  T
Q  381 gaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttca 480  Q
    |||||||| | | ||||||| |||  || ||||| |||||||||  | |||| ||| ||||  |||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||    
T  9139356 gaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtg-ttactcact--attttttatgctataacgttaacttcacca-aaaaagtcaatttcatgacttca 9139261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 400
Target Start/End: Original strand, 4934134 - 4934321
Alignment:
Q  212 aggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  4934134 aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtctt-aagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaa 4934232  T
Q  312 acaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgta 400  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  4934233 acaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgta 4934321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 214 - 496
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025801
Alignment:
Q  214 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtc-ttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaac 35025628  T
Q  314 aaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggt 413  Q
    ||  || |||||||||| ||||| || |||||||||||||        ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||    
T  35025629 aagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatc--------tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggt 35025720  T
Q  414 gtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  35025721 g-ctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaa-tcattttcatgacttcagcatagaattttccta 35025801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4205408 - 4205216
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||         
T  4205408 ggagcttctacggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatga 4205309  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatg 259  Q
            |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4205308 taaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Original strand, 46883905 - 46884177
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgactttttt-gaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          
T  46883905 ttctacggtgcagtcaaaaaattgattttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 46884004  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  46884005 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtga 46884100  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgtta 350  Q
    |||  ||||||||||||| ||| |||| |||||  |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46884101 tag--tttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 7152010 - 7152230
Alignment:
Q  99 cagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctag 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||     
T  7152010 cagaaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaa 7152109  T
Q  186 taatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 285  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7152110 taatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagt-attaagtgtt 7152208  T
Q  286 acactttatgagg-tgttacac 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||    
T  7152209 atactttgtgaggatgttacac 7152230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26896508 - 26896287
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta-------- 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            
T  26896508 cttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 26896409  T
Q  176 ------attcatctagtaatgcttgcaacgtctt-ggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
          ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  26896408 tagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgc 26896310  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacacttt 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  26896309 gatagtc-ttaagtgttacacttt 26896287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39400427 - 39400236
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           
T  39400427 ttctacggtccagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaat 39400328  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatat 263  Q
          ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39400327 agtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 208 - 461
Target Start/End: Original strand, 54499166 - 54499418
Alignment:
Q  208 ttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacact 307  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  54499166 ttaccggtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaa-gttacactttgtagggtgttacact 54499263  T
Q  308 taaaacaaagtakgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact-gtataaat 405  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| | || | ||| |||     
T  54499264 taaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaac 54499363  T
Q  406 agttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  54499364 ggtggggtg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaa 54499418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23431979 - 23431826
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat------ 173  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||          
T  23431979 ggagcttctacagtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatga 23431880  T
Q  174 -------taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactat 220  Q
           ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23431879 tcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025515
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat-------------taattcatctagtaatgctt 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgattt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgtt 229  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397918
Alignment:
Q  286 acactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaact 385  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||  |  || ||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  386 tttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccata 485  Q
    ||||| | ||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||| | | ||||||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgtt-actcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcacca-taaaagtcattctaatgacttcaccata 39397927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38012686 - 38012589
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38012686 ggagcttttacagtgcagtcaggaaactaatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaat 38012589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  187 aatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaca 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272010
Alignment:
Q  427 acttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcct 17272010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 429 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4205180 - 4205115
Alignment:
Q  429 ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4205180 ttttgatattatagtgttaacttcatcag-aaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcct 4205115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Original strand, 4934026 - 4934097
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4934026 tgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaat 4934097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2708273 - 2708227
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2708273 ggagcttctacggtgaagtcagaaaattgacttttttaaaaaagtta 2708227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 7152240 - 7152318
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  7152240 ttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccag-aaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcct 7152318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4396403 - 4396325
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  4396403 ttactcattacattttttatgttatagtgttaacttca-ctaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcct 4396325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 452
Target Start/End: Original strand, 23518402 - 23518473
Alignment:
Q  380 tgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23518402 tgaatttttgatgccactgtattaacagtggggtgtt-agtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1012687 - 1012645
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1012687 gcttctatggtgcagtcagaaaattgatttttttaaaaaagtt 1012645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Original strand, 5914933 - 5914979
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagt 124  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  5914933 atggagcttctatggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 5914979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9743962 - 9743924
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9743962 tacggtgaagtcaaaaaattgacttttttgaaaaagtta 9743924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17612713 - 17612671
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17612713 cttctacgatgcagtcagaaaattcatttttttgaaaaagtta 17612671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 51960067 - 51960026
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51960067 ttctacagtgcagtcagaaaattgatttttttggaaaagtta 51960026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 416 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 53124364 - 53124287
Alignment:
Q  416 ttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| | ||||||| |||| || |||||    
T  53124364 ttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaaatcattttaatgacttcatcatataattttcc 53124287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4167346 - 4166921
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----- 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  4167346 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatga 4167247  T
Q  175 --------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
            |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4167246 ttaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattat 4167147  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  4167146 gtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttg 4167048  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| | | |||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  4167047 atactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtg-ttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccag-aaaagtca 4166950  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4166949 ttttcgtgacttcaccatagaattttcct 4166921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41961264 - 41960942
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  41961264 ggagcttctacggtgcagtcaggaaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatga 41961165  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41961164 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattat 41961065  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961064 gtgataatctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 41960966  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttga 390  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  41960965 atactatgtggactgaacttttga 41960942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 26358001 - 26357577
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26358001 ggagcttctacattgcagttagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 26357902  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26357901 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattat 26357802  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||     
T  26357801 gtgatagt-tttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgata 26357703  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |  ||||  | | ||||||||||| | ||||||| ||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26357702 actctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatg-ttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcag-aaaagtca 26357605  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||    
T  26357604 ttttcatgacttcaccataaaattttcc 26357577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4764056 - 4763628
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa-gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4764056 ggagcttctacggtgcagtaaggaaactgactttttaaaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatg 4763957  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4763956 atcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatatta 4763857  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4763856 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgat 4763758  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatag---tgttaacttcwtcagaaaaa 462  Q
     |||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||   |||||||||| |||| ||||    
T  4763757 tatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtg-ttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcag-aaaa 4763660  T
Q  463 gtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  4763659 gtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 4763628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 78 - 452
Target Start/End: Original strand, 43648022 - 43648407
Alignment:
Q  78 atggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648022 atggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 43648121  T
Q  178 -------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
                 ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  43648122 gatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatatt 43648221  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattga 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43648222 atgtgatagtctt-aagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttga 43648320  T
Q  365 tgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| | || | || ||| |||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43648321 tgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttc 43648407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 81 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 3177362 - 3176945
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt------ 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||          
T  3177362 gagcttctacggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgat 3177263  T
Q  175 -------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
           |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3177262 aaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg 3177163  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  3177162 tgatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatga 3177064  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  3177063 tactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtg-ttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcag-aaaagtcat 3176966  T
Q  468 tttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||||   ||||||||||||||    
T  3176965 tttcgtaacttcaccatagaa 3176945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 2325157 - 2325574
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  2325157 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataa 2325256  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2325257 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattat 2325356  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  2325357 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatg 2325447  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| | | ||||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||   || ||||||||    
T  2325448 atactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtg-ttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgag-aaaagtca 2325545  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||  ||  |||||||||||||| ||||||    
T  2325546 ttcacataacttcaccatagaattttcct 2325574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 11366159 - 11366586
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11366159 ggagcatctacggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 11366258  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11366259 tcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 11366358  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||   ||| |||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11366359 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgat 11366457  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| | || | || |||||||  | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  11366458 gatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatg-ttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcacca-aaaaagtc 11366555  T
Q  466 attttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    ||| | | || |||||||||||| |||||||    
T  11366556 attcttatgatttcaccatagaattttccta 11366586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 33660156 - 33660565
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33660156 ggagcttctacggtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 33660255  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  33660256 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcat 33660355  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||           |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  33660356 gtgg----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatg 33660445  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||    
T  33660446 atactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactag-aaaagtca 33660543  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  33660544 ttttaatgacttcaccatagaa 33660565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 29241924 - 29242342
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  29241924 ggagcttctatggtgcagtcaggaaactgaactttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgt 29242023  T
Q  178 tcatctagtaatgctt---gcaa--cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgata 272  Q
    |||  ||||||| | |   | ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29242024 tcaa-tagtaattcatctagtaattcatcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgata 29242122  T
Q  273 gtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 372  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242123 gtctt-aggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatacta 29242221  T
Q  373 tggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttca 472  Q
    ||  || |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||  || |||||  ||||||||    
T  29242222 tgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtg-ttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcacca-aaaaaaccattttca 29242319  T
Q  473 cgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  29242320 tgacttcaccatagaattttcct 29242342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 81 - 495
Target Start/End: Original strand, 31570514 - 31570938
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat--- 177  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||       
T  31570514 gagcttctacactgcagtcatgaaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgat 31570613  T
Q  178 ----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatg 267  Q
              |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  31570614 caatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatg 31570713  T
Q  268 tgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatga 367  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31570714 tgacagtctt-aagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatga 31570812  T
Q  368 tactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcat 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||    
T  31570813 tactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtg-ttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccag-aaaagttat 31570910  T
Q  468 tttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    | |||  |||||||||||||| ||||||    
T  31570911 tctcataacttcaccatagaattttcct 31570938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 44914090 - 44913662
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt------ 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  44914090 gagcttctacggtgcagtcagcaaactggtttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgat 44913991  T
Q  175 -------aattcat---ctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 264  Q
           |||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44913990 taatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatatt 44913891  T
Q  265 atgtgatagtctttaagtgttacactttat-gaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44913890 atgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattg 44913792  T
Q  364 atgatactat-ggggagtgaacttttgacgccactgtataaa-tagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | || | || |||  |||  |||| |||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||  ||  |||    
T  44913791 atgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtg-ttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-ca-taaa 44913695  T
Q  462 agtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  44913694 agtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 19289102 - 19289522
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||      
T  19289102 ggagcttctatggtgcagttaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatga 19289201  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19289202 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattat 19289301  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19289302 gtgatagtc-ttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatg 19289400  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||| || | | | ||||||||| | || |||| ||| | | ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19289401 atactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtg-ttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtca 19289498  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||     ||||||||||||||| ||||||    
T  19289499 tt-----gacttcaccatagaattttcct 19289522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 496
Target Start/End: Original strand, 19424421 - 19424833
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19424421 ggagcttctacggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 19424520  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||              |||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  19424521 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------------ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 19424606  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19424607 gtgatagtcttaaa-tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatg 19424705  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||    
T  19424706 atactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccag-aaaagcca 19424803  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  19424804 ttctcatgacttcaccataaaattttccta 19424833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 494
Target Start/End: Original strand, 33550761 - 33551189
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa-gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat- 177  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33550761 ggagcttctacagtgctgtcagaaaactgaatttttaaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaata 33550860  T
Q  178 ----------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgat 261  Q
                    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33550861 aataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33550960  T
Q  262 attatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 361  Q
    |||||  | ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550961 attatacg-tagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 33551058  T
Q  362 tgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaa 461  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||| | || |||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  33551059 tgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtg-ttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttca-ctaaaaa 33551156  T
Q  462 agtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  33551157 agtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 33551189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 84 - 452
Target Start/End: Original strand, 33709015 - 33709394
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          
T  33709015 cttctacggtgcagtcatgatactgaattttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaa 33709114  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  33709115 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcga 33709214  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33709215 tagtctt-aagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatac 33709313  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttc 452  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||  || ||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709314 tatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtg-ttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttc 33709394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 41465914 - 41465509
Alignment:
Q  91 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------------- 177  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||                 
T  41465914 ggtgcagttagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat 41465815  T
Q  178 tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctt 277  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  41465814 tcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtc-t 41465716  T
Q  278 taagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgggg 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  41465715 taagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattataggg 41465616  T
Q  378 agtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgact 477  Q
    | |||||||||||  |||  ||        | |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||    
T  41465615 actgaacttttgataccagcgt--------tagggtg-ctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctcatgact 41465526  T
Q  478 tcaccatagaactttcc 494  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41465525 tcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 107 - 488
Target Start/End: Original strand, 43770654 - 43771035
Alignment:
Q  107 tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||             ||||||||||||||||    
T  43770654 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 43770753  T
Q  194 gcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacacttta 293  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||          ||||||||||||     
T  43770754 gcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga----------gtgttacactttg 43770843  T
Q  294 tgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgc 393  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  43770844 tgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgc 43770943  T
Q  394 cactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  43770944 cactgtataaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacc--aaaaaatcattctaatgacttcaccatagaa 43771035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Original strand, 18494060 - 18494472
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18494060 ggagcttatacggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 18494159  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||    
T  18494160 tcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcat 18494259  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  18494260 gtgatagtc-ttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatg 18494357  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |            | || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18494358 atactatgaggactgaacttttgatg------------tcgtggggtg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccag-aaaagtca 18494443  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  18494444 ttttcatgacttcaccacagaattttcct 18494472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 45328113 - 45327808
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaattc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  45328113 ggagcttctacggtgcagtcagaaact-gacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat------------- 45328028  T
Q  180 atctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttta 279  Q
      ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |    
T  45328027 --ct--taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtctt-a 45327933  T
Q  280 agtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggag 379  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  45327932 tgtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgac 45327833  T
Q  380 tgaacttttgacgccactgtataaa 404  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||    
T  45327832 tgaacttttgatgtcaccgtataaa 45327808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37906115 - 37905709
Alignment:
Q  100 agaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctag 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||             ||||| ||    
T  37906115 agaaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccag 37906016  T
Q  186 taatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 285  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37906015 taattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagt-tttaagtgtt 37905917  T
Q  286 acactttatgagg--tgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaa 383  Q
    ||||||| || ||  |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37905916 acactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaa 37905817  T
Q  384 cttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcacca 483  Q
    ||||||| | || |||| |||  || ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||| |  |||||||||    
T  37905816 cttttgatgtcattgtacaaacggtggggtg-ttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcacc--aaaaaatcatttttataacttcacca 37905720  T
Q  484 tagaactttcc 494  Q
    ||||| |||||    
T  37905719 tagaattttcc 37905709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 172 - 496
Target Start/End: Original strand, 4263960 - 4264282
Alignment:
Q  172 attaattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt-ga 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||    
T  4263960 attatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttga 4264059  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  4264060 tagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatac 4264158  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| |    
T  4264159 tatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatg-ttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccag-aaaagtcattat 4264256  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
     | ||||||||||||||| |||||||    
T  4264257 gatgacttcaccatagaattttccta 4264282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13711878 - 13711465
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------- 177  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  13711878 ttctacggtgcagttataaaattgtcttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaat 13711779  T
Q  178 ------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgat 271  Q
          |||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||    
T  13711778 agtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcat 13711679  T
Q  272 agtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 371  Q
    |||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13711678 agtctt-aactattatactttatggggtgttacacttaaaaca-----tgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacc 13711585  T
Q  372 atggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc 471  Q
    ||| ||| | ||||||||| | ||||||| |||  || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||| |     
T  13711584 atgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtg-ttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccag-aaaagtcattctg 13711487  T
Q  472 acgacttcaccatagaactttc 493  Q
    | ||||||||||||||| ||||    
T  13711486 atgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 495
Target Start/End: Original strand, 39167150 - 39167567
Alignment:
Q  82 agcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt------- 174  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           
T  39167150 agcttctactgtgcaatcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataatt 39167249  T
Q  175 ------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgt 268  Q
          |||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39167250 aatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgt 39167349  T
Q  269 gatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgat 368  Q
    ||||||       ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  39167350 gatagt-------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgat 39167442  T
Q  369 actatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatt 468  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | || |||| ||| |||  |||| |||||||| | |||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  39167443 actatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtg-ttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatca-aaaaaatcatt 39167540  T
Q  469 ttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
     ||  |||||||||||| || ||||||    
T  39167541 ctcgtgacttcaccataaaattttcct 39167567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 200 - 496
Target Start/End: Original strand, 17071649 - 17071942
Alignment:
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  17071649 tcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttgtggggt 17071747  T
Q  300 gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgt 399  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||| | || |||    
T  17071748 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgt 17071847  T
Q  400 ataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    | ||||| |  | || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  17071848 acaaataatgagatg-ttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcacca-aaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttccta 17071942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 175 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 4478681 - 4478368
Alignment:
Q  175 aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  4478681 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgataga 4478582  T
Q  275 ctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat-aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    | ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478581 c-ttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 4478488  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttc-a 472  Q
    | ||| | ||||||||| ||||||||| ||| | | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| |    
T  4478487 gaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtg-ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaatatcattttcta 4478390  T
Q  473 cgacttcaccatagaactttcc 494  Q
     |||||||| |||||| |||||    
T  4478389 tgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31862276 - 31861971
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  31862276 ggagcttctatggtgcagtcgggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatga 31862177  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               |||||||||||||  | |||  ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31862176 tcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattat 31862077  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862076 gtgataat-tttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 31861978  T
Q  367 atactat 373  Q
    |||||||    
T  31861977 atactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35959316 - 35959023
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35959316 ggagcttctacggtgcactcaaaaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 35959217  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35959216 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 35959121  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35959120 gtgatagtc-ttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Original strand, 27349732 - 27350145
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27349732 ggagcttctacagtgcagtcatgaaactgacttttctgaaaaagttaattt-----taaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 27349826  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||    
T  27349827 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcat 27349926  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||          |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27349927 gtga----------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 27350016  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||  | |    
T  27350017 atacta-agggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtg-ttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatatta 27350114  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  27350115 ttttaatgacttcaccataaaattttcctaa 27350145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 186 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641992
Alignment:
Q  186 taatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgtt 285  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtc-ttaagtgtt 36642195  T
Q  286 acactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgat--aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaa 383  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36642194 acactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaa 36642095  T
Q  384 cttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcacca 483  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||  |||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  36642094 cttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtg-ttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccag-aaaagtcattctcatgacttcacca 36641997  T
Q  484 tagaa 488  Q
    |||||    
T  36641996 tagaa 36641992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 497
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41464056
Alignment:
Q  217 ctattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaa 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaa-tgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaa 41463877  T
Q  317 gtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtt 416  Q
    ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||| |    
T  41463878 gtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg-t 41463976  T
Q  417 tactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41463977 tactcacaacacttttgattttatagtattaacttcacca-aaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttttctaa 41464056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 19314164 - 19313852
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggactta---caggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  19314164 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtga 19314065  T
Q  271 tagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatac 370  Q
    ||||        |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19314064 tagt--------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 19313973  T
Q  371 tatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcatttt 470  Q
    |||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||| |    
T  19313972 tat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtg-ttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccag-aaaagtcattct 19313876  T
Q  471 cacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
     | ||||||||||||||| |||||    
T  19313875 aatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 44286266 - 44285980
Alignment:
Q  174 taattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 273  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  44286266 taattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgatag 44286167  T
Q  274 tctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 373  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44286166 tctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactat 44286068  T
Q  374 ggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaa 462  Q
    | ||| | ||||||||| |||||| || ||| || || |   || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44286067 gtggactaaacttttgatgccactatacaaacag-tgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaa 44285980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 496
Target Start/End: Original strand, 17054008 - 17054301
Alignment:
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||    
T  17054008 tcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtntt-aagtgttacactttgtggggt 17054106  T
Q  300 gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgt 399  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  | |||||||| | || |||    
T  17054107 gttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgt 17054206  T
Q  400 ataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttccta 496  Q
    | ||| | |  | || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  17054207 acaaacaatgagatg-ttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcacca-aaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttccta 17054301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 400
Target Start/End: Original strand, 7006723 - 7007032
Alignment:
Q  86 tctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------- 177  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  7006723 tctacggtgcaatcatgaaaatgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata 7006822  T
Q  178 -----tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgata 272  Q
         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  7006823 gaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgata 7006922  T
Q  273 gtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 372  Q
     ||||                  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7006923 ttctt------------------aagtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatacta 7007004  T
Q  373 tggggagtgaacttttgacgccactgta 400  Q
    |||| | | ||||||||| || ||||||    
T  7007005 tgggaactaaacttttgatgctactgta 7007032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5881922 - 5881532
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-------------tcatctagtaatgcttgcaa 197  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||||||||||||||||||||    
T  5881922 ttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 5881823  T
Q  198 cgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgag 297  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||          |||||||||||| ||||    
T  5881822 catcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga----------gtgttacactttgtgag 5881733  T
Q  298 gtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact 397  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||    
T  5881732 gtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcact 5881634  T
Q  398 gtataaatagttgggtgtttactcactacac-----ttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaacttt 492  Q
    ||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||     ||||||||||||| | | ||||||  ||| |||||||||||| | |||||||| ||| || |||    
T  5881633 gtacaaacagtggggtg-ttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccag-aaaagtcattttaatgacttcacaataaaatttt 5881536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 18258199 - 18258349
Alignment:
Q  200 tcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggt 299  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18258199 tcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtctt-aagtgttacactttatggggt 18258297  T
Q  300 gttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 351  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18258298 gttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902068
Alignment:
Q  238 taacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaag 337  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactatt-aagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaa 33902221  T
Q  338 tgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgt 437  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| | || | || ||| ||| ||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  33902220 tatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggt-attactcactacattttttatgt 33902122  T
Q  438 tatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcc 494  Q
      |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  33902121 --tagtgttaacttcaccag-aaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttcc 33902068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 288
Target Start/End: Original strand, 19500700 - 19500914
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat------ 177  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  19500700 cttctatggtgcagtcaaaaaatt-acttttttgaaaaaat-aattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaa 19500797  T
Q  178 -------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
           ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19500798 tagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtga 19500897  T
Q  271 tagtctttaagtgttaca 288  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  19500898 tagtc-ttaagtgttaca 19500914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 249
Target Start/End: Original strand, 41051083 - 41051260
Alignment:
Q  81 gagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt------ 174  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          
T  41051083 gagcttctacggtgcagtcatgaaaatga---ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgat 41051179  T
Q  175 -------aattcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaac 249  Q
           ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41051180 caataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatccttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33902439 - 33902341
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa-gttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33902439 ggagcttctacggtgcaatcagaaaactaactttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaat 33902341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 389
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501839
Alignment:
Q  309 aaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttg 389  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 347 - 461
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051377
Alignment:
Q  347 gttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccact-gtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||   ||| |||  ||| |||||||||||| |||||| |    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtg-ttatacacaacacttttgatgctatagtat 41051361  T
Q  446 taacttcwtcagaaaa 461  Q
    || |||| ||||||||    
T  41051362 tagcttcatcagaaaa 41051377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41960949 - 41960882
Alignment:
Q  427 acttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  41960949 acttttgatgttatagtgttaacttcatca-aaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattttcct 41960882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 17071549 - 17071646
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaat-tgacttttttgaaa-aagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||   ||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17071549 ggagcttctacggtgcagtcagaaaaactgacttttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 17053909 - 17054005
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaat-tgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || ||   ||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17053909 ggagcttctacggtgcagtcagaaaaactgactttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19093834 - 19093787
Alignment:
Q  83 gcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattt 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19093834 gcttctacggtgcagtcaaaaaattgacttttttaaaaaagttaattt 19093787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Original strand, 18257325 - 18257414
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18257325 tacggtgcagttatcaaactgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaat 18257414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36642360 - 36642296
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgttt 144  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  36642360 ggagcttctatggtgcattcatgaaattgacttttttgaaaaagctaattttaattttaatgttt 36642296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 177
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463466
Alignment:
Q  111 ttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat 177  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaat 41463466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7565674 - 7565630
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  7565674 ggagcttctacggtgcagtcaaaaaaatgacttttttaaaaaagt 7565630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 126
Target Start/End: Original strand, 38249826 - 38249867
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38249826 cttctacgatgcagtcagaaaattgac-tttttgaaaaagtta 38249867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 118
Target Start/End: Original strand, 18058723 - 18058756
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18058723 ttctacggtgcagttagaaaattgacttttttga 18058756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 495
Target Start/End: Original strand, 34441933 - 34441970
Alignment:
Q  458 aaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34441933 aaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 34441970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19073729 - 19073689
Alignment:
Q  86 tctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagtta 126  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19073729 tctacgttgcaatcagaaaattgacttttttgtaaaagtta 19073689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Original strand, 39788280 - 39788320
Alignment:
Q  84 cttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  39788280 cttctacggtgcagtctgaaaactgatttttttgaaaaagt 39788320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 457 - 497
Target Start/End: Original strand, 43446473 - 43446513
Alignment:
Q  457 gaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43446473 gaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctaa 43446513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 80 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 267700 - 267279
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt----a 175  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  267700 ggagattctatggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggtta 267601  T
Q  176 attcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtc 275  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  267600 attcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 267501  T
Q  276 tttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgg 375  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  267500 tttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatag 267401  T
Q  376 ggagtgaacttttgacgccactgta-taaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacg 474  Q
     || ||||||||||| | |||||||  ||| |||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |   || ||||| | ||||||| |    
T  267400 agactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatg-ttactcactatatttttgatgctatagtgtaaatattaccaaaaaaaataattttcatg 267302  T
Q  475 acttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  267301 acttcaccatagaattttcctaa 267279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 131
Alignment:
Q  115 ttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatt-------------aattcatctagtaatgcttgcaacgtc 201  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||| ||    
T  517 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 418  T
Q  202 ttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgt 301  Q
    ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  417 ttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacactttatggggtgt 325  T
Q  302 tacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtat 401  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||     
T  324 tacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtac 225  T
Q  402 aaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    ||| ||| | ||| |||||||| ||| |||| ||  || ||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  224 aaacagtggagtg-ttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccag-aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctaa 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Original strand, 408192 - 408511
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  408192 ggagattctacggtgcagtcaaaaaattaactttt--gaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga 408289  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  408290 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgt 408389  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408390 gtgatagtc-ttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 408488  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttga 390  Q
    |||||| | ||| |||||||||||    
T  408489 atacta-gaggactgaacttttga 408511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 254 - 472
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94546
Alignment:
Q  254 ttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtctt-aagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 94429  T
Q  354 tgatgaattgatgatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcw 453  Q
    | |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  94430 tcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtg-ttactcactacaattttgatgttataatgttaacttca 94528  T
Q  454 tcagaaaaagtcattttca 472  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  94529 tcag-aaaagtcattttca 94546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 262
Target Start/End: Original strand, 93870 - 94056
Alignment:
Q  88 tacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat---------- 177  Q
    ||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||              
T  93870 tacggtgcagtaaggaaacggacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagc 93968  T
Q  178 ---tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgata 262  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  93969 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 691
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattt 130  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  741 ggagcttctacggtgcagtcaagaaattgatttttttgaaaaagttaattt 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12332 - 11912
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  12332 ggagcttctacggtgcagtcatgaaacttacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatga 12234  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  12233 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcat 12134  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12133 gcgatagtctt-aagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatg 12035  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactg-tataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtc 465  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||  |||||| || ||| | | |||   |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||||    
T  12034 atattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccag-aaaagtc 11936  T
Q  466 attt-tcacgacttcaccatagaa 488  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  11935 atttctcatgacttcaccatagaa 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 80 - 451
Target Start/End: Original strand, 145776 - 146159
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  145776 ggagcttctacggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatga 145875  T
Q  178 ------------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatta 265  Q
                |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  145876 tcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatatta 145975  T
Q  266 tgtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  145976 tgtgatagtc-ttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgat 146074  T
Q  366 gatactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaactt 451  Q
    |||||||||  |  ||||||||||| | || | || ||||| | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  146075 gatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtg-ttactcattacattttttatgttataatgttaactt 146159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 44380 - 43963
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44380 ggagcttctacgatgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 44281  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44280 tcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 44181  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||   |||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||  || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44180 gtgatag--cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatg 44083  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| ||| |   ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||     
T  44082 atactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtg-ttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcacca-aaaaagtct 43985  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  43984 ttcttacgacttcaccatagaa 43963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 154407 - 154824
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaatttcgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaat-- 177  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  154407 ggagcttctacgatgcagtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatga 154506  T
Q  178 -----------tcatctagtaatgcttgcaacgtcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattat 266  Q
               ||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  154507 tcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 154606  T
Q  267 gtgatagtctttaagtgttacactttatgaggtgttacacttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 366  Q
    |||||||   |||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||  || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  154607 gtgatag--cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatg 154704  T
Q  367 atactatggggagtgaacttttgacgccactgtataaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtca 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| ||| |   ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||     
T  154705 atactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtg-ttactcattacatttttgatattatagcgttaacttcacca-aaaaagtct 154802  T
Q  467 ttttcacgacttcaccatagaa 488  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  154803 ttcttacgacttcaccatagaa 154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 402 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42438 - 42345
Alignment:
Q  402 aaatagttgggtgtttactcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcctaa 497  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  42438 aaatagtggggtgtt-actcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa-ttattctcatgacttcaccataaaattttcctaa 42345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100948
Alignment:
Q  224 atcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtga 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 101115 - 101057
Alignment:
Q  80 ggagcttctacggtgcagtcagaaaa-ttgacttttttgaaaaagttaatttcgatttt 137  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  101115 ggagtttctacggtgcagtaagaaaacttgacttttttaaaaaagttaattttgatttt 101057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 100894 - 100820
Alignment:
Q  420 tcactacacttttgatgttatagtgttaacttcwtcagaaaaagtcattttcacgacttcaccatagaactttcct 495  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  100894 tcactacgtttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaa-tcattctcatgacttcaccatagaattttcct 100820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  307 ttaaaacaaagtakgataaaattagattaagtgtagtcttgt 348  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 122
Target Start/End: Original strand, 11378 - 11415
Alignment:
Q  85 ttctacggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11378 ttctacggtgcagtcagtaaattgacttttttggaaaa 11415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University