View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12423_high_8 (Length: 316)

Name: NF12423_high_8
Description: NF12423
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12423_high_8
NF12423_high_8
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (14-316)||(29433641-29433943)
chr8 (14-316)||(41977061-41977363)
chr8 (14-298)||(41907460-41907743)
chr8 (18-316)||(45293660-45293958)
chr8 (14-316)||(23966603-23966905)
chr8 (14-316)||(39204233-39204535)
chr8 (14-316)||(6300700-6301002)
chr8 (14-316)||(37029440-37029742)
chr8 (14-316)||(44940044-44940346)
chr8 (14-316)||(19247714-19248012)
chr8 (14-316)||(19320898-19321196)
chr8 (14-316)||(12760077-12760379)
chr8 (14-316)||(41156241-41156543)
chr8 (14-316)||(14078913-14079215)
chr8 (14-316)||(23626427-23626729)
chr8 (14-316)||(12250282-12250579)
chr8 (14-316)||(39444628-39444925)
chr8 (14-316)||(41628493-41628795)
chr8 (15-316)||(22333204-22333505)
chr8 (14-316)||(19395646-19395948)
chr8 (18-316)||(33424342-33424639)
chr8 (33-297)||(22946904-22947168)
chr8 (14-316)||(30826053-30826359)
chr8 (14-316)||(42060878-42061179)
chr8 (15-316)||(6477576-6477876)
chr8 (14-316)||(42811020-42811321)
chr8 (14-315)||(38961777-38962072)
chr8 (14-315)||(38992121-38992416)
chr8 (14-291)||(23522750-23523027)
chr8 (219-316)||(38993490-38993587)
chr8 (219-316)||(44599509-44599606)
chr8 (269-310)||(3750968-3751009)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (14-316)||(9702076-9702378)
chr5 (14-316)||(33929618-33929920)
chr5 (15-316)||(41780653-41780954)
chr5 (18-316)||(3210293-3210591)
chr5 (14-316)||(20996037-20996339)
chr5 (14-316)||(19395180-19395482)
chr5 (14-316)||(31295767-31296069)
chr5 (14-316)||(7285501-7285803)
chr5 (14-316)||(3397231-3397533)
chr5 (14-316)||(33611233-33611535)
chr5 (14-316)||(1852022-1852325)
chr5 (14-316)||(2194989-2195291)
chr5 (14-316)||(3150697-3150999)
chr5 (14-316)||(19447827-19448129)
chr5 (14-316)||(20349747-20350049)
chr5 (14-306)||(21029932-21030225)
chr5 (14-290)||(12588400-12588675)
chr5 (14-316)||(4882097-4882398)
chr5 (14-316)||(30689133-30689435)
chr5 (14-316)||(26321168-26321470)
chr5 (14-316)||(3028575-3028880)
chr5 (101-316)||(33706872-33707087)
chr5 (14-291)||(17996404-17996681)
chr5 (14-291)||(20757785-20758062)
chr5 (14-291)||(38934301-38934578)
chr5 (86-316)||(290447-290673)
chr5 (14-257)||(10513253-10513496)
chr5 (153-316)||(27065835-27065999)
chr5 (219-316)||(35540012-35540109)
chr5 (14-130)||(27065724-27065838)
chr5 (219-316)||(34374473-34374570)
chr5 (249-316)||(10512457-10512524)
chr5 (116-228)||(19222824-19222935)
chr5 (278-316)||(38041692-38041730)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (14-316)||(42827474-42827776)
chr7 (14-316)||(42244955-42245257)
chr7 (14-316)||(38434649-38434951)
chr7 (14-316)||(9149223-9149526)
chr7 (14-316)||(6911574-6911876)
chr7 (14-316)||(27735148-27735450)
chr7 (14-316)||(47573552-47573854)
chr7 (14-299)||(47174337-47174622)
chr7 (14-316)||(47163650-47163954)
chr7 (14-309)||(9226326-9226622)
chr7 (14-316)||(23766538-23766840)
chr7 (14-304)||(33638786-33639076)
chr7 (14-316)||(42687414-42687716)
chr7 (18-315)||(4481487-4481784)
chr7 (14-316)||(5962559-5962860)
chr7 (14-316)||(33030658-33030960)
chr7 (14-316)||(42996315-42996612)
chr7 (14-316)||(17477751-17478053)
chr7 (14-316)||(17575161-17575463)
chr7 (14-290)||(3795372-3795648)
chr7 (14-316)||(23299822-23300121)
chr7 (14-299)||(8926007-8926292)
chr7 (14-316)||(17482198-17482496)
chr7 (14-316)||(17570718-17571016)
chr7 (14-316)||(11499720-11500023)
chr7 (14-291)||(17469609-17469886)
chr7 (14-291)||(17583328-17583605)
chr7 (108-316)||(19521082-19521290)
chr7 (66-237)||(42917708-42917879)
chr7 (14-165)||(14308792-14308943)
chr7 (240-316)||(14308941-14309017)
chr7 (250-316)||(42917920-42917986)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (14-316)||(55294874-55295176)
chr3 (17-316)||(8242560-8242859)
chr3 (14-316)||(54793060-54793362)
chr3 (14-316)||(39796568-39796870)
chr3 (14-316)||(52463028-52463329)
chr3 (14-316)||(48521117-48521419)
chr3 (14-316)||(5252469-5252771)
chr3 (14-316)||(54512636-54512937)
chr3 (14-316)||(16495747-16496049)
chr3 (14-316)||(48976541-48976843)
chr3 (18-316)||(40827130-40827428)
chr3 (14-316)||(50741210-50741512)
chr3 (14-316)||(50771342-50771644)
chr3 (14-316)||(23193319-23193627)
chr3 (14-316)||(35087933-35088235)
chr3 (24-316)||(21699668-21699960)
chr3 (14-316)||(11598058-11598361)
chr3 (14-316)||(52853539-52853839)
chr3 (14-316)||(6104222-6104523)
chr3 (14-316)||(31369112-31369414)
chr3 (14-315)||(36165106-36165408)
chr3 (14-290)||(22477565-22477841)
chr3 (14-316)||(49112932-49113225)
chr3 (14-290)||(11951096-11951372)
chr3 (18-316)||(51248222-51248508)
chr3 (86-316)||(35436768-35436998)
chr3 (14-216)||(52840728-52840930)
chr3 (42-316)||(11383004-11383271)
chr3 (14-184)||(32755343-32755513)
chr3 (173-316)||(32755532-32755675)
chr3 (14-169)||(11325886-11326041)
chr3 (14-151)||(2845117-2845254)
chr3 (219-316)||(16341717-16341814)
chr3 (14-83)||(19893699-19893768)
chr3 (17-90)||(23937005-23937078)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (14-316)||(4811441-4811743)
chr2 (14-316)||(17091670-17091972)
chr2 (14-316)||(17037162-17037464)
chr2 (14-316)||(17025485-17025787)
chr2 (14-316)||(18092819-18093121)
chr2 (14-316)||(28380100-28380402)
chr2 (14-309)||(14753075-14753369)
chr2 (14-316)||(1515087-1515389)
chr2 (14-316)||(35286437-35286739)
chr2 (14-316)||(45398635-45398937)
chr2 (14-316)||(6342940-6343242)
chr2 (14-316)||(10821301-10821603)
chr2 (14-316)||(14323424-14323726)
chr2 (14-316)||(28502044-28502346)
chr2 (14-316)||(45205115-45205417)
chr2 (14-316)||(16724446-16724748)
chr2 (14-316)||(36633183-36633485)
chr2 (14-290)||(9916812-9917088)
chr2 (14-316)||(26821513-26821815)
chr2 (14-298)||(1993171-1993454)
chr2 (14-316)||(33663891-33664194)
chr2 (14-316)||(21097592-21097894)
chr2 (14-316)||(30566962-30567264)
chr2 (14-316)||(30570647-30570949)
chr2 (14-316)||(19167738-19168042)
chr2 (14-228)||(16883817-16884031)
chr2 (14-228)||(17041507-17041721)
chr2 (17-184)||(42885287-42885454)
chr2 (219-316)||(26827598-26827695)
chr2 (219-316)||(33907326-33907423)
chr2 (219-316)||(42885474-42885571)
chr2 (246-316)||(30572527-30572597)
chr2 (239-316)||(11706731-11706808)
chr2 (268-316)||(7984188-7984236)
chr2 (278-316)||(1691628-1691666)
chr2 (267-316)||(25806050-25806099)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (14-316)||(12245923-12246225)
chr1 (14-316)||(16031686-16031989)
chr1 (14-316)||(43254767-43255069)
chr1 (14-316)||(50395181-50395483)
chr1 (14-316)||(18111452-18111754)
chr1 (14-316)||(52309700-52310002)
chr1 (15-316)||(51965815-51966116)
chr1 (14-316)||(28565798-28566103)
chr1 (14-316)||(12714343-12714645)
chr1 (14-316)||(13662488-13662790)
chr1 (14-316)||(24294395-24294697)
chr1 (14-316)||(34687453-34687755)
chr1 (14-316)||(18814085-18814387)
chr1 (14-316)||(34691981-34692283)
chr1 (14-316)||(36681110-36681411)
chr1 (14-316)||(48340195-48340497)
chr1 (14-316)||(45004599-45004900)
chr1 (14-316)||(52521650-52521952)
chr1 (14-290)||(10763248-10763524)
chr1 (14-314)||(50560908-50561206)
chr1 (14-316)||(31619555-31619857)
chr1 (14-316)||(41830132-41830433)
chr1 (22-316)||(41963012-41963306)
chr1 (14-290)||(29840795-29841071)
chr1 (41-290)||(42682279-42682527)
chr1 (89-316)||(39760232-39760459)
chr1 (18-291)||(44406245-44406518)
chr1 (14-203)||(15315116-15315305)
chr1 (109-316)||(47135361-47135568)
chr1 (14-281)||(38845350-38845608)
chr1 (14-190)||(17671172-17671348)
chr1 (175-316)||(17671483-17671624)
chr1 (199-316)||(15317298-15317415)
chr1 (218-316)||(28631382-28631480)
chr1 (278-316)||(23909917-23909955)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (14-312)||(3839479-3839783)
chr4 (14-306)||(41984353-41984645)
chr4 (14-316)||(740520-740822)
chr4 (14-316)||(1944369-1944671)
chr4 (14-316)||(15520593-15520895)
chr4 (14-316)||(40622025-40622326)
chr4 (14-316)||(37701709-37702011)
chr4 (14-316)||(34056673-34056975)
chr4 (14-306)||(47720189-47720481)
chr4 (14-316)||(33503107-33503410)
chr4 (14-316)||(5272385-5272687)
chr4 (14-316)||(7643902-7644204)
chr4 (14-316)||(26870399-26870696)
chr4 (14-316)||(54331753-54332055)
chr4 (14-316)||(53342285-53342588)
chr4 (14-316)||(14829621-14829923)
chr4 (14-316)||(23478787-23479089)
chr4 (14-316)||(17739916-17740219)
chr4 (14-316)||(13627929-13628231)
chr4 (14-316)||(38007721-38008023)
chr4 (14-316)||(55998807-55999109)
chr4 (14-290)||(35707764-35708040)
chr4 (14-316)||(19831507-19831809)
chr4 (18-316)||(36856969-36857266)
chr4 (14-316)||(39742856-39743158)
chr4 (14-293)||(21352976-21353255)
chr4 (101-316)||(47557535-47557750)
chr4 (14-290)||(574283-574559)
chr4 (14-316)||(17699053-17699356)
chr4 (14-316)||(35495653-35495955)
chr4 (14-287)||(2776169-2776442)
chr4 (14-316)||(28135175-28135478)
chr4 (18-316)||(8530711-8530995)
chr4 (14-291)||(22116171-22116452)
chr4 (132-290)||(53991383-53991541)
chr4 (239-316)||(28973164-28973241)
chr4 (278-316)||(56541556-56541594)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (14-316)||(14831327-14831629)
chr6 (14-316)||(33321556-33321858)
chr6 (14-316)||(1073366-1073668)
chr6 (14-316)||(13456948-13457249)
chr6 (14-316)||(18599089-18599391)
chr6 (42-316)||(25539943-25540217)
chr6 (14-316)||(22373944-22374246)
chr6 (14-316)||(34320934-34321237)
chr6 (14-316)||(4424328-4424630)
chr6 (14-314)||(17939364-17939664)
chr6 (14-292)||(11934807-11935085)
chr6 (14-316)||(34855797-34856099)
chr6 (69-316)||(4425404-4425651)
chr6 (14-316)||(14888041-14888342)
chr6 (18-316)||(15275504-15275801)
chr6 (14-316)||(2521005-2521309)
chr6 (14-291)||(35040950-35041227)
chr6 (14-290)||(18311649-18311924)
chr6 (219-316)||(30044255-30044352)
chr6 (14-106)||(28228824-28228916)
chr6 (221-316)||(1931987-1932082)
chr6 (36-121)||(1931890-1931975)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (14-316)||(30092-30394)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (27-316)||(10705-10994)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (14-316)||(13026-13328)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (14-316)||(152250-152552)
scaffold0006 (14-316)||(64729-65031)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (65-316)||(100509-100760)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (14-316)||(1197-1494)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (14-316)||(26455-26757)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-316)||(9786-10088)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (29-316)||(53063-53345)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (14-316)||(276-578)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (14-287)||(4301-4576)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (127-316)||(61267-61456)
scaffold0051 (14-131)||(49907-50024)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (14-195)||(119898-120079)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (148-316)||(26477-26645)
[»] scaffold1891 (1 HSPs)
scaffold1891 (148-254)||(9-115)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (219-316)||(3549-3646)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (219-316)||(49330-49427)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (14-106)||(29322-29414)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 29433641 - 29433943
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  29433641 gaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaagtcaccgaagaatttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttaaacttc 29433740  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  29433741 tactattttggcgtatcgctttcgactgtaatcataaattatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtttgatgtaaatatcgacaaaa 29433840  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29433841 atccctttttggttagtctatgactcttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 29433940  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  29433941 tta 29433943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 41977061 - 41977363
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41977061 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 41977160  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977161 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgtgacgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 41977260  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41977261 atctctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttagttccttcattgattccaa 41977360  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  41977361 tta 41977363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Original strand, 41907460 - 41907743
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41907460 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 41907559  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41907560 tactattttggcgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatct-gactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgtcaaaa 41907658  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttc 298  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41907659 atctcttttcggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatatgcacattgttggttc 41907743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45293958 - 45293660
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45293958 gtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcactaaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctact 45293859  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45293858 attttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatcc 45293759  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45293758 ttttttggttagtctatgacacttgcagttttttttataaacctaactattatgcaacgttaatttgcacattgttgattccttcattggttctaatta 45293660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23966905 - 23966603
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23966905 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 23966806  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23966805 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 23966706  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  23966705 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattgattcaaa 23966606  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  23966605 tta 23966603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 39204233 - 39204535
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39204233 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttgcaaaatagatctttgttgctaaactatttgaacttc 39204332  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39204333 tattattttggcgcatcgccttggactgtaatcgtaatctatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 39204432  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39204433 atccctttttggttagtttatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 39204532  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  39204533 tta 39204535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6301002 - 6300700
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  6301002 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 6300903  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6300902 tactattttgacgtatcgctttggtctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgaagtaaatattggcaaaa 6300803  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6300802 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcattggttcaaa 6300703  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  6300702 tta 6300700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 37029440 - 37029742
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  37029440 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttc 37029539  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37029540 tactattttgacgtatcgttttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 37029639  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37029640 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcaaa 37029739  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  37029740 tta 37029742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 44940044 - 44940346
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  44940044 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 44940143  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44940144 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 44940243  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44940244 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgtcaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 44940343  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  44940344 tta 44940346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 19247714 - 19248012
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19247714 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaattatttgaacttc 19247813  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247814 tactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttctttttattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 19247913  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19247914 atccttttttggttagtctatgatacttgcagt-ttttttataaac---actattatgtaacgttaatttgcacattgttgattccttcattggttccaa 19248009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 19320898 - 19321196
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19320898 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccaaagaacttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaattatttgaacttc 19320997  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320998 tactattttgacgtatcgctttggactgtaattgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttctttttattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 19321097  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19321098 atccttttttggttagtctatgatacttgcagt-ttttttataaac---actattatgtaacgttaatttgcacattgttgattccttcattggttccaa 19321193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 12760077 - 12760379
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||     
T  12760077 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaactta 12760176  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12760177 tactattttgacgcattgttttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccgtttgttcttttcattttgtctgatataaatattggcaaaa 12760276  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12760277 atccctttttggttagtctatgacactagcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattacaa 12760376  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  12760377 tta 12760379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 41156241 - 41156543
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  41156241 gaaggtggtaagctcatttttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctatgttgctgaaatatttgaacttc 41156340  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41156341 tactattttgacgcatcgttttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgtcaaaa 41156440  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  41156441 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctagctattatataacgttaatctgcacattgttggtttcttcattgatttcaa 41156540  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  41156541 tta 41156543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14079215 - 14078913
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  14079215 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 14079116  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14079115 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 14079016  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079015 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 14078916  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  14078915 tta 14078913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23626729 - 23626427
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23626729 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 23626630  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23626629 tactattttggcgtatggctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattgacaaaa 23626530  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||  |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23626529 atcacttttatgttagtctatgacacttgtaatctattttataaacctaactattatataacattaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 23626430  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  23626429 tta 23626427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12250579 - 12250282
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12250579 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 12250485  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12250484 tactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 12250385  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12250384 atcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaa 12250285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 39444628 - 39444925
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39444628 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 39444722  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39444723 tactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 39444822  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39444823 atcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaa 39444922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 41628493 - 41628795
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||     
T  41628493 gaaggtggtaagctcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttattgaactatttgaacttt 41628592  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628593 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 41628692  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
      | |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41628693 gaccctttttcgttagtctatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttccaa 41628792  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  41628793 tta 41628795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22333505 - 22333204
Alignment:
Q  15 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 114  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||| | |||| || | || |||||||||||||    
T  22333505 aaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagttatttgttgttgaactatttgaacttct 22333406  T
Q  115 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaa 214  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22333405 actattttgacgtatcactttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaaa 22333306  T
Q  215 tctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaat 314  Q
    || ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22333305 tccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactaatatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattggttccaat 22333206  T
Q  315 ta 316  Q
    ||    
T  22333205 ta 22333204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19395948 - 19395646
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  19395948 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttaaacttc 19395849  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19395848 taccattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatatcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaa 19395749  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19395748 atccctttttgattagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattagttccaa 19395649  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  19395648 tta 19395646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33424639 - 33424342
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||    
T  33424639 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctact 33424540  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||      
T  33424539 attttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaagtattggcaaaaattc 33424440  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424439 ctttttggttagtctatgaaacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaac-ctaatctgtacattgttggttccttcattggttccaatta 33424342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22947168 - 22946904
Alignment:
Q  33 ttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgc 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22947168 ttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatctactattttgacgtatcgc 22947069  T
Q  133 tttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatct 232  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  22947068 tttgcactgtaatcgtaaactatattgactttgggaagccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatccctttttggttagtct 22946969  T
Q  233 atgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggtt 297  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22946968 atgacacttgcattttcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtt 22946904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 30826053 - 30826359
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  30826053 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 30826152  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30826153 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttattttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 30826252  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaac----tgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggtt 309  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30826253 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactatatattatgtaatgttaatttgtacattgttggttccttcattggtt 30826352  T
Q  310 ccaatta 316  Q
    |||||||    
T  30826353 ccaatta 30826359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42061179 - 42060878
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  42061179 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttc 42061080  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42061079 taataaattgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgac-aaa 42060981  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  42060980 atctatttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattgattccttcattgattcaaa 42060881  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  42060880 tta 42060878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6477876 - 6477576
Alignment:
Q  15 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||| |||| | | | |||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  6477876 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcaagttat-ctatagtagatctttgttgttgaactatttgaacttct 6477778  T
Q  115 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaa 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6477777 actattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaaa 6477678  T
Q  215 tctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaat 314  Q
    || ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6477677 tccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacatcattggttccttcattgattccaat 6477578  T
Q  315 ta 316  Q
    ||    
T  6477577 ta 6477576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42811321 - 42811020
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  42811321 gaaggtggtaaactcatctttgatatcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttgaacttc 42811222  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42811221 tactattttgacgtatcactttggattgtagtcgtaaactatcttcactttgggatgtcatttgttcttttca-tttgtctggtgtaaatattggcaaaa 42811123  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |   |||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811122 actcctttttggttagcctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtgactttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 42811023  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  42811022 tta 42811020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 38961777 - 38962072
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||  ||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  38961777 gaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 38961876  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| ||||      | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38961877 tactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcatcttgtctggtgtaaatattggcaaaa 38961970  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961971 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 38962070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 38992121 - 38992416
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||  ||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  38992121 gaaggtggtgatctcatctttgatctcgaaaagtcacataagtacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 38992220  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| ||||      | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38992221 tactattttgacgtatcgttttg------agtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcatcttgtctggtgtaaatattggcaaaa 38992314  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38992315 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacataactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 38992414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23523027 - 23522750
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  23523027 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 23522928  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23522927 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcaagactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 23522828  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  23522827 atcactttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaaccttactattatataacgttaatctgcacattg 23522750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 38993490 - 38993587
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38993490 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaatta 38993587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 44599509 - 44599606
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599509 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaatta 44599606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 310
Target Start/End: Original strand, 3750968 - 3751009
Alignment:
Q  269 atgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttc 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3750968 atgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttc 3751009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 9702076 - 9702378
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9702076 gaagatggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 9702175  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9702176 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 9702275  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9702276 atctcttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 9702375  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  9702376 tta 9702378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 33929618 - 33929920
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  33929618 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatc 33929717  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33929718 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 33929817  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33929818 attcctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 33929917  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  33929918 tta 33929920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Original strand, 41780653 - 41780954
Alignment:
Q  15 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 114  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  41780653 aaggtggtaagctcatcttttatctcgaaaagtcatcgaagaactagcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgatactgaactatttgaacttct 41780752  T
Q  115 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaa 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780753 actattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaa 41780852  T
Q  215 tctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaat 314  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41780853 tccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaat 41780952  T
Q  315 ta 316  Q
    ||    
T  41780953 ta 41780954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3210591 - 3210293
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3210591 gtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgtcccaaaatagatctttgctgctaaactatttgaacttctatt 3210492  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3210491 attttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattagcaaaaatcc 3210392  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3210391 tttttttgttagtttatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaatta 3210293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20996339 - 20996037
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  20996339 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 20996240  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20996239 tactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaaccatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattgtcaaaa 20996140  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20996139 atccctttttggttaatctttgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaa 20996040  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  20996039 tta 20996037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 19395180 - 19395482
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19395180 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 19395279  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395280 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 19395379  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    || ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19395380 atatctttttagttagtctttgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttagtctgcacattgttggttctttcattggttcaaa 19395479  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  19395480 tta 19395482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31296069 - 31295767
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  31296069 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 31295970  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31295969 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 31295870  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31295869 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattggttcaaa 31295770  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  31295769 tta 31295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 7285501 - 7285803
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  7285501 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 7285600  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7285601 tactattttgacgtatcactttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 7285700  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285701 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 7285800  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  7285801 tta 7285803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3397533 - 3397231
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  3397533 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 3397434  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3397433 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaa 3397334  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3397333 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacgattatgtaacattaatctgcacattgttggttcattcattggttccaa 3397234  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  3397233 tta 3397231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33611535 - 33611233
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  33611535 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 33611436  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33611435 taatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 33611336  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611335 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 33611236  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  33611235 tta 33611233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1852325 - 1852022
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  1852325 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttc 1852226  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggc-aaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1852225 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 1852126  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1852125 aatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgtaaatttgcacattgttggttccttcattggtttca 1852026  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  1852025 atta 1852022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 2194989 - 2195291
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||  || | || ||||| ||||||    
T  2194989 gaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccgaagtagatctttattgttgaactattttaacttc 2195088  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2195089 tactattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattgacaaaa 2195188  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195189 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 2195288  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  2195289 tta 2195291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3150999 - 3150697
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  3150999 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 3150900  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3150899 taccattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatatcatttgttcttttcattttgtcttgtgtaaatattggcaaaa 3150800  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3150799 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgcactttgttggttccttcattggttctaa 3150700  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  3150699 tta 3150697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 19447827 - 19448129
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  19447827 gaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 19447926  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19447927 tattattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaattttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 19448026  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19448027 atcctttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtatcgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 19448126  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  19448127 tta 19448129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 20349747 - 20350049
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || ||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||    
T  20349747 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttc 20349846  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20349847 tactattttaacatatcgctttgcactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 20349946  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20349947 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttctaa 20350046  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  20350047 tta 20350049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 21029932 - 21030225
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  21029932 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 21030031  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  21030032 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctagagtaaatattgacaaaa 21030131  T
Q  214 at-ctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattg 306  Q
    || | | ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21030132 atcccccttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattg 21030225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12588675 - 12588400
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  12588675 gaaggtggtaagctcatctttgattttgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttt 12588576  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||    
T  12588575 tactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttctttttattttatctgatgtaaatattagc-aaa 12588477  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12588476 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 12588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 4882097 - 4882398
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  4882097 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaattagatctttgttgttaaactatttgaacttc 4882196  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4882197 tactattttgacgtatcgctttgg-ctgtagtcgtaaactatcttgaatttggaatatcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattcgtaaaa 4882295  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4882296 atccctttttggttagtctattaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 4882395  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  4882396 tta 4882398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 30689133 - 30689435
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| ||||||    
T  30689133 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaaagtgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaacttc 30689232  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30689233 tactattttgatgtatcgctttggactgaagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 30689332  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689333 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 30689432  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  30689433 tta 30689435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26321470 - 26321168
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  26321470 gaaggtggtaagctcatctttgatcccgaaaagtcatagaagaacttggaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 26321371  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26321370 tactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 26321271  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  || |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321270 attcctgtttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 26321171  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  26321170 tta 26321168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 3028575 - 3028880
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctt----tgctgctaaattatttgaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||||| ||    || || | || ||||||||    
T  3028575 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaag-cacagaagaacttgcaaattcgagttgttacaaagtagatattaatttgttgttgaactatttgaa 3028673  T
Q  110 cttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggc 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028674 cttctactattttgtcgtatcgttttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggc 3028773  T
Q  210 aaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggtt 309  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3028774 aaaaatccctttttcgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatttgcacattgttagttccttcgttggtt 3028873  T
Q  310 ccaatta 316  Q
    |||||||    
T  3028874 ccaatta 3028880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 101 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33707087 - 33706872
Alignment:
Q  101 ttatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33707087 ttattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgta 33706988  T
Q  201 aatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttcct 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33706987 aatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttcct 33706888  T
Q  301 tcattggttccaatta 316  Q
    |||||  |||||||||    
T  33706887 tcattaattccaatta 33706872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 17996404 - 17996681
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17996404 gaaggtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17996503  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17996504 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 17996603  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||  ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17996604 attcctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 17996681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 20757785 - 20758062
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  20757785 gaaggtggtaagatcatatttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 20757884  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20757885 tactattttggcgtactgctttggactgtagtcgcaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 20757984  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20757985 atcgctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 20758062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 38934301 - 38934578
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  38934301 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcatagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 38934400  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38934401 tactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattgacaaaa 38934500  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    |||  |||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  38934501 atccatttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctacctattatgtaacgttaatctgcacattg 38934578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 316
Target Start/End: Original strand, 290447 - 290673
Alignment:
Q  86 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 185  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  290447 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcctttc 290546  T
Q  186 attttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    | |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||    
T  290547 attttgtctgatgtaaatattggaaaaaattcctttttggttagtctatgac----ggagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgc 290642  T
Q  286 acattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  290643 acattgttggttccttcattggttctaatta 290673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10513496 - 10513253
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  10513496 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 10513397  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10513396 tactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 10513297  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataa 257  Q
    ||  || |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  10513296 attcctctttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataa 10513253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Original strand, 27065835 - 27065999
Alignment:
Q  153 tatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttt 252  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  27065835 tatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttt 27065934  T
Q  253 tataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttc-cttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  27065935 tataaacctaattattatgtaacgttaatctacacattgttggttctctttattggttccgatta 27065999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35540109 - 35540012
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35540109 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 35540012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 27065724 - 27065838
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  27065724 gaaggtggtaagc--atctttgatctcgaaaagtcacagaagaatttacaaattcgagttgttgcaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 27065821  T
Q  114 tactattttggcgtatc 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  27065822 tactattttgacgtatc 27065838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34374570 - 34374473
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34374570 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaatta 34374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10512524 - 10512457
Alignment:
Q  249 cttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10512524 cttttataaacctaactattatgtaaccttaatctgcacattgttggtttcttcattggtttcaatta 10512457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 228
Target Start/End: Original strand, 19222824 - 19222935
Alignment:
Q  116 ctattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaat 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||  |||||| | ||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  19222824 ctattttggtgtatcactt-ggactgtaatcttaaaatatctcatctttgggatgcggtttgttttgttcattttgcctaatgtacatatcggcaaaaat 19222922  T
Q  216 ctctttttggtta 228  Q
     || |||||||||    
T  19222923 ttcgttttggtta 19222935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38041730 - 38041692
Alignment:
Q  278 taatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38041730 taatttgcacattattggttccttcatcggttccaatta 38041692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42827776 - 42827474
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  42827776 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaacttc 42827677  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42827676 tactattttgacgtatcgctttgaactgtaatcgtaaactatattgactttgagatgccatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 42827577  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42827576 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 42827477  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  42827476 tta 42827474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42245257 - 42244955
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  42245257 gaaggtggtaagctcatctttaatctggaaaagtcaccgaagaacttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 42245158  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245157 taatattttagcgtatctttttggattgtaattgtaaattatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 42245058  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42245057 atccctttttggttagtctattactcttgcagtctcttttataaacataactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttcattcattggttccaa 42244958  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  42244957 tta 42244955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38434951 - 38434649
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38434951 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 38434852  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38434851 tactattttggcgtatagctttggactgtaatagtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattgacaaaa 38434752  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38434751 atcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 38434652  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  38434651 tta 38434649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 9149223 - 9149526
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9149223 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 9149322  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9149323 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 9149422  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcag-tctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| |||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9149423 attactttttggttagtctatgacacttgcagcatttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattcca 9149522  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  9149523 atta 9149526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6911876 - 6911574
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  6911876 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 6911777  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6911776 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 6911677  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6911676 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 6911577  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  6911576 tta 6911574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27735450 - 27735148
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27735450 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 27735351  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27735350 tactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgccatttgttcttttcattttgtttgatgtaaatattggcaaaa 27735251  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27735250 atccctttttggttagtttatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcactttgttggttacttcattgattccaa 27735151  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  27735150 tta 27735148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47573854 - 47573552
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  47573854 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 47573755  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47573754 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 47573655  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47573654 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 47573555  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  47573554 tta 47573552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Original strand, 47174337 - 47174622
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||    
T  47174337 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaaaaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctattgaactatttaaacttc 47174436  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47174437 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 47174536  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttcc 299  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47174537 atccctttttggttagtctatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttcc 47174622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47163954 - 47163650
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47163954 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcctcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctaaactatttgaacttc 47163855  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47163854 aactattttggcgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgataaaa 47163755  T
Q  214 atctctttttggttaatctatg--actcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcc 311  Q
    |||  |||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  47163754 atccatttttggttagtttatgacacttttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgttttc 47163655  T
Q  312 aatta 316  Q
    |||||    
T  47163654 aatta 47163650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9226622 - 9226326
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  9226622 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaaagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgcagaactatttgaacttc 9226523  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9226522 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattgggaaaa 9226423  T
Q  214 atctctttttggttaatctatg-actcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggtt 309  Q
    ||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9226422 attcctttttggttagtctatgaacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgcacattgttggttccttcattggtt 9226326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23766840 - 23766538
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  23766840 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 23766741  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23766740 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 23766641  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766640 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgtacattgttggttccttcattggttccaa 23766541  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  23766540 tta 23766538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33639076 - 33638786
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33639076 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgccgaagaatttacatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 33638977  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || ||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638976 tattattttgacgcatcgctttgaactataatcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 33638877  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcat 304  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33638876 attcctttttggttagtctatgacacttgcaatcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcat 33638786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 42687414 - 42687716
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  42687414 gaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 42687513  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42687514 taccattttgacgtatcgctttggacagtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaa 42687613  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687614 atctctttttggttattctatgaaacctgcaatctcttttataaacctgactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 42687713  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  42687714 tta 42687716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4481784 - 4481487
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  4481784 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttgttgctgaactatttgaacttctatt 4481685  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4481684 attttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatcc 4481585  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatt 315  Q
     ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4481584 atttttggctagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattaggtaacgttaatctacacattgttgattccttcattggttctaatt 4481487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 5962559 - 5962860
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  5962559 gaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcatagaagaagttgtaaattcgagttgttccaa-gtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 5962657  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5962658 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcatattgtctggtgtaaatattggcaaaa 5962757  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962758 atatctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacattaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 5962857  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  5962858 tta 5962860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 33030658 - 33030960
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||    
T  33030658 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactaattgaacttc 33030757  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33030758 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaatcatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatactgacaaaa 33030857  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33030858 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctacacattgttggttccttcgttggttccaa 33030957  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  33030958 tta 33030960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 42996315 - 42996612
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42996315 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 42996409  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42996410 tactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 42996509  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  42996510 atcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaa 42996609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17477751 - 17478053
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17477751 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17477850  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17477851 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 17477950  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477951 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 17478050  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  17478051 tta 17478053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17575463 - 17575161
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17575463 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17575364  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17575363 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 17575264  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575263 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 17575164  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  17575163 tta 17575161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 3795372 - 3795648
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||     
T  3795372 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcattttcgagttgttccaaaatagatctttgctggtgaactatttgaacttt 3795471  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3795472 tactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaa 3795571  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3795572 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaatctaactattatgtaactttaatctgcacatt 3795648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23300121 - 23299822
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  23300121 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcatcgaagaacttgcatgttcgagttgttcgaaagtagatctttgatgctgaactatttgaacttc 23300022  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
     ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| | |||||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23300021 aactattttgacgcatcgctttggattgtaaccatatactatcttaagtttgggatgccatttgtt---ttcattttgtctgatttaaatattgacaaaa 23299925  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23299924 atccctttttggttagtctatgacacttaaagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattggttcaaa 23299825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8926292 - 8926007
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  8926292 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttcaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 8926193  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8926192 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 8926093  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttcc 299  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  8926092 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgtcggttcc 8926007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17482198 - 17482496
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17482198 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17482297  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17482298 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 17482397  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| |    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482398 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactat----taatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 17482493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17571016 - 17570718
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17571016 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17570917  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17570916 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 17570817  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| |    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17570816 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctctttcataaacctaactat----taatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 17570721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 11499720 - 11500023
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  11499720 gaaggtggtaagctcgtctttgatctcgaaaggtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 11499819  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||| |  |||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499820 tactattttgacgtatcgatttgcattgtagtggtaaactattttgactttgggatctcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 11499919  T
Q  214 at-ctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    || |  |||||||||  |||||||  |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499920 atccattttttggtttgtctatgaaacttgcaatatcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcca 11500019  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  11500020 atta 11500023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 17469609 - 17469886
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17469609 gaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17469708  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17469709 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 17469808  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17469809 atccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 17469886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17583605 - 17583328
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17583605 gaaggtggtaagctcatattttatctcgaaaagtcacagaagaaatagcaaattcgagctgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17583506  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17583505 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcatgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 17583406  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17583405 atccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 17583328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Original strand, 19521082 - 19521290
Alignment:
Q  108 aacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattg 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521082 aacttctactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattg 19521181  T
Q  208 gcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattgg 307  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19521182 gcaaaaatctctttttcgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttctttgg 19521281  T
Q  308 ttccaatta 316  Q
    | |||||||    
T  19521282 tgccaatta 19521290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Original strand, 42917708 - 42917879
Alignment:
Q  66 ttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttg 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42917708 ttcgagttcttccaaagtagatctttgctgctgaagtatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcacaaactatcttgactttg 42917807  T
Q  166 ggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgac 237  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  42917808 ggatgacatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccttttttggttagtctatgac 42917879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 14308792 - 14308943
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  14308792 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 14308891  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttg 165  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  14308892 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttg 14308943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 14308941 - 14309017
Alignment:
Q  240 ttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14308941 ttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttagttccttcattggttccaatta 14309017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 316
Target Start/End: Original strand, 42917920 - 42917986
Alignment:
Q  250 ttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42917920 ttttataaacctcactattatgtaacgttaatatgcacattgttgattccttcattggttccaatta 42917986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55295176 - 55294874
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  55295176 gaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 55295077  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295076 tactattttgacgcatcgctttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 55294977  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55294976 atccctttttggttagtctatgacacttgcagttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttacttcattgattccaa 55294877  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  55294876 tta 55294874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Original strand, 8242560 - 8242859
Alignment:
Q  17 ggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctac 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8242560 ggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtggatcttttctgctgaactatttgaacttctac 8242659  T
Q  117 tattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatc 216  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8242660 tattttgacgtatcggtttggactgtaatcgtaaacaatcttgcctttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatc 8242759  T
Q  217 tctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8242760 cctttttggttagtctatgacacttacagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattggttccaatta 8242859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54793362 - 54793060
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || || |||| |||| || ||||||||||||    
T  54793362 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatatttgttgctgaactatttgaacttc 54793263  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793262 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaatctatattgactttgggatgccatttgtgcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 54793163  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793162 atctctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 54793063  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  54793062 tta 54793060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39796870 - 39796568
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  39796870 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 39796771  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39796770 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 39796671  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39796670 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcaaa 39796571  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  39796570 tta 39796568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52463329 - 52463028
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52463329 gaaggtggtaagctcattattgatctcgaaaagtcgctgatgaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 52463230  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52463229 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgacttagggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgcaaatattggcaaaa 52463130  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52463129 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcatt-gttccaa 52463031  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  52463030 tta 52463028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48521419 - 48521117
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  48521419 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttactactgaactatttgaacttc 48521320  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48521319 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 48521220  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
     ||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48521219 ttctttttttggttagtatatgacacttgcagtcttttttagaaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttcattcattgattccaa 48521120  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  48521119 tta 48521117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5252771 - 5252469
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  5252771 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttc 5252672  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5252671 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 5252572  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
     ||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5252571 ttctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcaaa 5252472  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  5252471 tta 5252469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 54512636 - 54512937
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  54512636 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaggtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 54512735  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54512736 tactattttg-cgtatcgctttggactgtagtcaaaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 54512834  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54512835 atctctttttggttaatctatgaaactcgcagtctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgcataatgttggttccttcattggttccaa 54512934  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  54512935 tta 54512937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 16495747 - 16496049
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495747 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaacttc 16495846  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495847 tactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 16495946  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16495947 atccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctgcacattgttggttgcttcattggttccaa 16496046  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  16496047 tta 16496049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 48976541 - 48976843
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  48976541 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaagttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 48976640  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48976641 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaa 48976740  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48976741 atctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttatataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattggttctaa 48976840  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  48976841 tta 48976843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40827428 - 40827130
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  40827428 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaactttttct 40827329  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40827328 attttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgatttttggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatcc 40827229  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40827228 ttttttggttagtctatcacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcgttgattccaatta 40827130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 50741210 - 50741512
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  50741210 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaattcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttaaacttc 50741309  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50741310 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 50741409  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741410 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 50741509  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  50741510 tta 50741512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50771644 - 50771342
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  50771644 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaaatcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaattatttaaacttc 50771545  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771544 tactattttaacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 50771445  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| | ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771444 atcccattttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 50771345  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  50771344 tta 50771342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 23193319 - 23193627
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||| ||||    
T  23193319 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgatgttgaacaatttgaccttc 23193418  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgtt------cttttcattttgtctgatgtaaatattg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193419 tactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttttttttcttttcattttgtctgatgtaaatattg 23193518  T
Q  208 gcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattgg 307  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23193519 gcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattgg 23193618  T
Q  308 ttccaatta 316  Q
    || ||||||    
T  23193619 tttcaatta 23193627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35088235 - 35087933
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| ||||||    
T  35088235 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaacttc 35088136  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35088135 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 35088036  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||   |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088035 attcatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacaattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 35087936  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  35087935 tta 35087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21699960 - 21699668
Alignment:
Q  24 agcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttg 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  21699960 agctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttctactattttg 21699861  T
Q  124 gcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctcttttt 223  Q
     ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21699860 acgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatcccttttt 21699761  T
Q  224 ggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699760 ggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 21699668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11598361 - 11598058
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11598361 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagtacttgcatgttcgagttgttcaaaagtagatcttttctactaaactatttgaacttc 11598262  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11598261 tactattttgacgcattgctttggactgttatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaacattggcaaaa 11598162  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaac-gtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    | |  ||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11598161 aaccattttttgttagtttatgacacttgcagtcttttttataaactttaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattcca 11598062  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  11598061 atta 11598058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52853839 - 52853539
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  52853839 gaaggtggtaagctcatctttgatcttgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttc 52853740  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52853739 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcgaaa 52853640  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||||  | ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52853639 atccctttttggttagtctatgaaacttgcag--ttttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 52853542  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  52853541 tta 52853539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6104523 - 6104222
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  6104523 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 6104424  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6104423 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 6104324  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6104323 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctctttgataaacctaactattatgtaacgttaatctgtaca-tgttggttccttcattggttcaaa 6104225  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  6104224 tta 6104222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31369414 - 31369112
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  31369414 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 31369315  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31369314 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattgacaaaa 31369215  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  | |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31369214 attcccttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttcattcattggttccaa 31369115  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  31369114 tta 31369112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36165408 - 36165106
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  36165408 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaacgatttgaacttc 36165309  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36165308 tactattttggtgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgttcttttcattttgtctgatataaatattgggaaaa 36165209  T
Q  214 atctc-tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |  || |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  36165208 aattcttttttgattagtctatgacagttgcagtctcttttataaatctaactattatataatgttaatatgcacattgtagattccttcattggttcta 36165109  T
Q  313 att 315  Q
    |||    
T  36165108 att 36165106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 22477565 - 22477841
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  22477565 gaaggtggtatgctcctctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttt 22477664  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || ||||||| || ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22477665 tattattttgacgcatcactttggactgtaaccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaa 22477764  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22477765 atccctttttggttggtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 22477841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 49112932 - 49113225
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||         | |||||||    
T  49112932 gaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttg---------tcgaacttc 49113022  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  49113023 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctggtgtaattattgacaaaa 49113122  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113123 atccctttttgtttagtctatgaaacttgcgatctcttatataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 49113222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11951372 - 11951096
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  11951372 gaagttggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagttgatctttgctggtgtactatttgaacttc 11951273  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  11951272 tactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttcattttatccgatgtaaatgttagcaaaa 11951173  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11951172 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 11951096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 51248222 - 51248508
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||    
T  51248222 gtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaactttcacattcgagttgttccaaagtagatctttgtcgttgaactatttgaacttctact 51248321  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  51248322 attttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtgtggtgtaaatattggcaaaaatcc 51248421  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||            ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51248422 ctttttggttagtctatgaaactttcaatctcttttata------------atgtaacgttaatcttcacattgttggttccttcattggttcaaatta 51248508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 316
Target Start/End: Original strand, 35436768 - 35436998
Alignment:
Q  86 atctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttc 185  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  35436768 atctttgttgctgaactatttgaacttctacaattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcctgactttgggatgtcatttgttcttttc 35436867  T
Q  186 attttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgc 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||| |||    
T  35436868 attttgcctgatgtaaatattgggaaaaattcctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatct-actattatgtaatgttaatatgc 35436966  T
Q  286 aca-ttgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35436967 acatttgttggttccttcattggttctaatta 35436998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52840930 - 52840728
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  52840930 gaaggtggtaatctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttc 52840831  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52840830 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 52840731  T
Q  214 atc 216  Q
    |||    
T  52840730 atc 52840728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Original strand, 11383004 - 11383271
Alignment:
Q  42 aaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactg 141  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11383004 aaaaatcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagacctttactgctgaactatttgaccttctactattttggcgtatcgctt-ggattg 11383102  T
Q  142 taatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactctt 241  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  11383103 taatcctaaactatcttgaccttgagatgtcatttgttttgttcattttgtcttatgtaaatattggtaaaaatcactttttggttagtctatgacactg 11383202  T
Q  242 gcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||      ||||| ||||||||||||||||||    
T  11383203 acagactcttttataaacctaattattatgtaacattaatctgca------tggttgcttcattggttccaatta 11383271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 32755343 - 32755513
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  32755343 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtacatctttgctgctgaactatttgaacttc 32755442  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32755443 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttttttt 32755513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Original strand, 32755532 - 32755675
Alignment:
Q  173 atttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||  |||||    
T  32755532 atttgttgttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactactatgt 32755631  T
Q  273 aacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755632 aacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 32755675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11326041 - 11325886
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||  |||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  11326041 gaaggtgataagcttatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgtttgaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 11325942  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggat 169  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  11325941 tattattttgacatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgacgttgggat 11325886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2845254 - 2845117
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  2845254 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcaccgaagaacttgcacgatcgagttgttcaaaagtatatcttttgtgctgaactatttgaacttc 2845155  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaa 151  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  2845154 tactattttgatgtataactttggactgtaatcgtaaa 2845117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 16341717 - 16341814
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16341717 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 16341814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19893768 - 19893699
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagt 83  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19893768 gaaggtggtaagctcatcttggatctcgaaaagtcacagaagaactttcatgttcgagttgttccaaagt 19893699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Original strand, 23937005 - 23937078
Alignment:
Q  17 ggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctt 90  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23937005 ggtggtaaactaatctttgatctggaaaagccacctaaaaacatgcacgttcaagttgttcccaaatagatctt 23937078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 4811441 - 4811743
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4811441 gaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 4811540  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4811541 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctaatgtagatattggcaaaa 4811640  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4811641 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctatttattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 4811740  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  4811741 tta 4811743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17091670 - 17091972
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17091670 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 17091769  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17091770 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 17091869  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17091870 atcccttttttgttagtctatgacacttgaaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 17091969  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  17091970 tta 17091972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17037162 - 17037464
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17037162 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 17037261  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17037262 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 17037361  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17037362 atcccttttttgttagtctatgacacttgtaatctattttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 17037461  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  17037462 tta 17037464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17025485 - 17025787
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17025485 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaacnatttgaacttc 17025584  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17025585 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 17025684  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17025685 atcccttttttgttagtctatgacacttgtaatctnttttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaa 17025784  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  17025785 tta 17025787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18093121 - 18092819
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  18093121 gaaggtgttaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttc 18093022  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093021 tactattttgacgcatcgttttggactgtaatcataaactatcttgacttcgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 18092922  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18092921 atccctttttggttagtctatgacacttgcaatattttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaa 18092822  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  18092821 tta 18092819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28380402 - 28380100
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28380402 gaaggtggtacgctcaactttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 28380303  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28380302 tactattttgacgtatcgcattggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttttcactttgtctaatgtaaatattggcaaaa 28380203  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28380202 atccttttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttcattcattggtttcaa 28380103  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  28380102 tta 28380100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 14753075 - 14753369
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  14753075 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtaaatctttgttgctgaactatttgaacttc 14753174  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14753175 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgggaaaa 14753274  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggtt 309  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14753275 at-tctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgcacattgttggttccttcattggtt 14753369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1515389 - 1515087
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  1515389 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaactta 1515290  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515289 tactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgttatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 1515190  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1515189 atccctttttgattagtctatgactcttacagtcttttttataaacctaactgttatttaatgttaatatgcacattgttggttccttcattgattccaa 1515090  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  1515089 tta 1515087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35286739 - 35286437
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  35286739 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacggaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatc 35286640  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35286639 ttttattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 35286540  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35286539 atccctttttggttagtctatgacacttgcattctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 35286440  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  35286439 tta 35286437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 45398635 - 45398937
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  45398635 gaaggtggtacgctcaactttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttc 45398734  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45398735 tagtattttgatgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatattgactttgggatgccatttgttcttttcactttgtctaatgtaaatattggcaaaa 45398834  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||   |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45398835 attcttttttgattagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 45398934  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  45398935 tta 45398937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6343242 - 6342940
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  6343242 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgttgaactatttgaacttc 6343143  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343142 tactattttgacgtatcgctttgggctgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 6343043  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6343042 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctacacattgttggttccttcattggttcaaa 6342943  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  6342942 tta 6342940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10821603 - 10821301
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10821603 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 10821504  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10821503 tactatgttggcgtatcgctttggactataatcgtaaattatcttgactctgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 10821404  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10821403 atccctttttggttagtttatgacacttgaagtctcttttataaacctaactattatgtagcgttaatctgcacattgttggttccttcattagtttcaa 10821304  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  10821303 tta 10821301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14323726 - 14323424
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  14323726 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtatatatttgctgctgaactatttgaacttc 14323627  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14323626 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgtgatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 14323527  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14323526 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattattggttccttcattggttcaaa 14323427  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  14323426 tta 14323424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 28502044 - 28502346
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  28502044 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 28502143  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28502144 tattattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 28502243  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28502244 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttcctttattggttcaaa 28502343  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  28502344 tta 28502346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45205417 - 45205115
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  45205417 gaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcgcgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttaaactatttgaacttc 45205318  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45205317 tactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 45205218  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45205217 atacctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaattattatgtaacgttgatctgcacattattggttccttcattggttccaa 45205118  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  45205117 tta 45205115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16724748 - 16724446
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  16724748 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 16724649  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16724648 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 16724549  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724548 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 16724449  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  16724448 tta 16724446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36633485 - 36633183
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  36633485 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcacgttcgagttgttccaacgtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 36633386  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36633385 tactattttgatgtatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttattttcattctgtctgatgtaagtattggcaaaa 36633286  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36633285 atccatttttggttaatctttgacacttacaatctcttttataaacctaactactatataacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaa 36633186  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  36633185 tta 36633183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9917088 - 9916812
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  9917088 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaagtatttgaacttt 9916989  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9916988 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaa 9916889  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9916888 atctctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacatt 9916812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 26821513 - 26821815
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  26821513 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaagtcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 26821612  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26821613 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcataaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 26821712  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||   |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821713 attcatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccaaacaattatgtaacgttaatctacacattgttggttccttcattggttccaa 26821812  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  26821813 tta 26821815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1993454 - 1993171
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  1993454 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 1993355  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1993354 tactattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtct-atgtaaatattggcaaaa 1993256  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttc 298  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1993255 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttc 1993171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33664194 - 33663891
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  33664194 gaaggtggtaaactcatccttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgctgttgaactatttgaacttc 33664095  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttca-ttttgtctgatgtaaatattggcaaa 212  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33664094 tactattttgacgaatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcatttttttctgatgtaaatattggcaaa 33663995  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33663994 aatccctttttggttagtctatgaaacttgtaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttcattcattggttcca 33663895  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  33663894 atta 33663891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 21097592 - 21097894
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  21097592 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaagtattttaacttc 21097691  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21097692 tactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatctttactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattgacaaaa 21097791  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097792 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaactaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 21097891  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  21097892 tta 21097894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30567264 - 30566962
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  30567264 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaacttc 30567165  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30567164 tactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgttcttttcattgcgtctggtgtaaatattggcaaaa 30567065  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567064 atctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 30566965  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  30566964 tta 30566962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30570949 - 30570647
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  30570949 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaacttc 30570850  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30570849 tactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttaggatgtcatttgttcttttcattgcgtctggtgtaaatattggcaaaa 30570750  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570749 atctctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 30570650  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  30570649 tta 30570647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19168042 - 19167738
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  19168042 gaaggtggtaagctcatatttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttattgttgaactatttgaacttc 19167943  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgg--caa 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  19167942 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgctcttttcattttgtctggtgtaaatattggaaaaa 19167843  T
Q  212 aaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcc 311  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19167842 aaatcccttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtatcgttaatctgcacattgttggttccttcattgcttcc 19167743  T
Q  312 aatta 316  Q
    |||||    
T  19167742 aatta 19167738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 16883817 - 16884031
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16883817 gaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 16883916  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16883917 tactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaac 16884016  T
Q  214 atctctttttggtta 228  Q
    ||| |||||||||||    
T  16884017 atccctttttggtta 16884031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 17041507 - 17041721
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17041507 gaaggtggtaagctcatctttgatctcggaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccacaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 17041606  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17041607 tactattttggcctatcactttggactgtaatcttaaaatatctcgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaac 17041706  T
Q  214 atctctttttggtta 228  Q
    ||| |||||||||||    
T  17041707 atccctttttggtta 17041721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 42885287 - 42885454
Alignment:
Q  17 ggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctac 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||    
T  42885287 ggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttctaaagtagatctttgttgtcgaactatctgaacttctac 42885386  T
Q  117 tattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttctttt 184  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  42885387 tattttgacgtatcactttgcaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttttttt 42885454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 26827598 - 26827695
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26827598 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacattaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 26827695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 33907326 - 33907423
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907326 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggttccaatta 33907423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 42885474 - 42885571
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42885474 tttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcatattgttggttccttcattggtttcaatta 42885571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30572597 - 30572527
Alignment:
Q  246 tctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572597 tctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 30572527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Original strand, 11706731 - 11706808
Alignment:
Q  239 cttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706731 cttgcaatcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgggtattgttggttccttcattggttcaaatta 11706808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7984236 - 7984188
Alignment:
Q  268 tatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7984236 tatgtaatcttaatttgcacatcattggttccttcattggttccaatta 7984188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1691666 - 1691628
Alignment:
Q  278 taatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1691666 taatttgcacattattggttccttcatcggttccaatta 1691628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 316
Target Start/End: Original strand, 25806050 - 25806099
Alignment:
Q  267 ttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25806050 ttatgtaatggtaatctgcatattgttgattccttcattggttccaatta 25806099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12246225 - 12245923
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  12246225 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttggtgcttaactatttgaacatc 12246126  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12246125 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 12246026  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12246025 atccctttttggttagtctatgacgcttgcattctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattggtttcaa 12245926  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  12245925 tta 12245923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16031989 - 16031686
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  16031989 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatcttttctactgaactatttgaacttc 16031890  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatatt-ggcaaa 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16031889 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtataatgtaaatattgggcaaa 16031790  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16031789 aattccattttggttactctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttaattggttcca 16031690  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  16031689 atta 16031686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43255069 - 43254767
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  43255069 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 43254970  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254969 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 43254870  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43254869 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 43254770  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  43254769 tta 43254767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50395483 - 50395181
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  50395483 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 50395384  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50395383 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 50395284  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  50395283 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 50395184  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  50395183 tta 50395181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 18111452 - 18111754
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  18111452 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 18111551  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111552 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 18111651  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18111652 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattacgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 18111751  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  18111752 tta 18111754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 52309700 - 52310002
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  52309700 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagttgatatttgctgatgaactatttgaacttc 52309799  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52309800 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttaagaagtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 52309899  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52309900 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaa 52309999  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  52310000 tta 52310002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51966116 - 51965815
Alignment:
Q  15 aaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttct 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  51966116 aaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaaattgcatgttcgagtttttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttct 51966017  T
Q  115 actattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaa 214  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51966016 actattttgacgcatcactttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattagcaaaaa 51965917  T
Q  215 tctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaat 314  Q
    || ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51965916 tccctttttggttagtgtataacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaat 51965817  T
Q  315 ta 316  Q
    ||    
T  51965816 ta 51965815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28566103 - 28565798
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||    
T  28566103 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagttattgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgctgaactatttgaacttc 28566004  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgg---ca 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |    
T  28566003 tactattttggcgtatctctttggactataatcgtaacctatcttgactttgggatgccatttgttctattcattttgtctgatgtaaatattggaaaaa 28565904  T
Q  211 aaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttc 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28565903 aaaatctctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacattaatctgcacattgttggttccttcattggttc 28565804  T
Q  311 caatta 316  Q
    ||||||    
T  28565803 caatta 28565798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 12714343 - 12714645
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  12714343 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaatttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgatgctgaactatttgaacttc 12714442  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714443 tactattttttcgtattgctttgggatgtaatcgtaacttatcttgactttgggatgccattttttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 12714542  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12714543 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattggtttcaa 12714642  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  12714643 tta 12714645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13662790 - 13662488
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13662790 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaacttc 13662691  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662690 tactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 13662591  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13662590 atccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctgcacattgttggttgcttcattggttccaa 13662491  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  13662490 tta 13662488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 24294395 - 24294697
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  24294395 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 24294494  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24294495 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 24294594  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
     ||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24294595 ctctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactagtatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcattggttcaaa 24294694  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  24294695 tta 24294697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 34687453 - 34687755
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  34687453 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 34687552  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34687553 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 34687652  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687653 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 34687752  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  34687753 tta 34687755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 18814085 - 18814387
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  18814085 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 18814184  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18814185 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 18814284  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814285 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 18814384  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  18814385 tta 18814387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 34691981 - 34692283
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  34691981 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 34692080  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34692081 taatattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 34692180  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692181 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatataacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 34692280  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  34692281 tta 34692283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 36681110 - 36681411
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  36681110 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttc 36681209  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  36681210 tactattttgatgtatctctttggactgtaatcgtaaactatattgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattgac-aaa 36681308  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36681309 atccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 36681408  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  36681409 tta 36681411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 48340195 - 48340497
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  48340195 gaaggtggtaagttcatctttgatctcaaaaagtcatagaagaacttgcacgttcgagttgtttcaaagtagatcttagttgttgaactatttgaacttc 48340294  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48340295 tactattttgacgtatcgctttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 48340394  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48340395 ataactttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaaatattatgtaacgttgatctgcacattattggttccttcattggttccaa 48340494  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  48340495 tta 48340497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 45004599 - 45004900
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  45004599 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgaaaagtcaccaaagaacttgcacgttcaagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactattttaacttc 45004698  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  45004699 tactcttttgatgtatctctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattgac-aaa 45004797  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45004798 atccatttttgattagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaa 45004897  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  45004898 tta 45004900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52521952 - 52521650
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  ||||||    
T  52521952 gaaggtggcaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattataacttc 52521853  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52521852 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttattttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 52521753  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52521752 atccatttttggttagtttatgaaacttgcactctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttctaa 52521653  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  52521652 tta 52521650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 10763248 - 10763524
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  10763248 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttt 10763347  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  10763348 tactattttgacgcatcattttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttatctgatgtaagtattagcaaaa 10763447  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10763448 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 10763524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 50560908 - 50561206
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || || |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50560908 gaagatggtaaactcatctttgatctcgaaaattcagcgaagaacttgcatgtccgagttgttctaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 50561007  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50561008 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaataatggcaaaa 50561107  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  50561108 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtattttttataaacctaa-tattatgt-acgttaatctgcatattgttggttccttcatttattccaa 50561205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 31619555 - 31619857
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||     
T  31619555 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttt 31619654  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  31619655 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgattttgggatgtcatttgttcttttcattttgtccgatgtaagtattgacaaaa 31619754  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31619755 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaatctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggtttcttcattggttccaa 31619854  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  31619855 tta 31619857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41830433 - 41830132
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  41830433 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 41830334  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41830333 tactattttgatgtatcactttggtctgtagtcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 41830234  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830233 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacg-taatatgtacattgttggttccttcattggttccaa 41830135  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  41830134 tta 41830132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41963306 - 41963012
Alignment:
Q  22 taagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattt 121  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||    
T  41963306 taagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgatttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttctactattt 41963207  T
Q  122 tggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctcttt 221  Q
    ||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  41963206 tgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattccttt 41963107  T
Q  222 ttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41963106 ttggttagtgtatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctatacattgttggttccttcattggttccaatta 41963012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29841071 - 29840795
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||     
T  29841071 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctagtgaactatttgaacttt 29840972  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29840971 tactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactattttgactttggtatgtcatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaa 29840872  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  29840871 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaatctaactattatgtaactttaatctgcacatt 29840795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 290
Target Start/End: Original strand, 42682279 - 42682527
Alignment:
Q  41 gaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggact 140  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  42682279 gaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttttactattttgacgcatcactttggact 42682378  T
Q  141 gtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactct 240  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  42682379 gtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttttttttattttatctgatgtaaatattagc-aaaatccctttttggttagtctatgacact 42682477  T
Q  241 tgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42682478 tgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 42682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39760459 - 39760232
Alignment:
Q  89 tttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcatt 188  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39760459 tttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttcatt 39760360  T
Q  189 ttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcaca 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  39760359 ttgtctaatgtaaatattggcaaaagtctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactagtatgtaacgttaatctgcaca 39760260  T
Q  289 ttgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39760259 ttgttggtttcttcattggttcaaatta 39760232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 291
Target Start/End: Original strand, 44406245 - 44406518
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  44406245 gtggtaaactcatatttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctact 44406344  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  44406345 attttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatcc 44406444  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  44406445 ctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctacacattg 44406518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 15315116 - 15315305
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15315116 gaaggtggaaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaatttgcacgttcgagttgttccaaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 15315215  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaat 203  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315216 tactattttgacatatcggtttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaat 15315305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 316
Target Start/End: Original strand, 47135361 - 47135568
Alignment:
Q  109 acttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgg 208  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47135361 acttgtactattttgacgcatcgctttggaccgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttattcttttcattttgtctgatgtaaatattgg 47135460  T
Q  209 caaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggt 308  Q
    ||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  47135461 caaaaatcatgtttaggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctacacattgttggttccttcattgat 47135560  T
Q  309 tccaatta 316  Q
    ||||||||    
T  47135561 tccaatta 47135568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38845608 - 38845350
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  38845608 gaaggtggtaagctcatctctgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttattccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 38845509  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||         |||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38845508 tactattttgacgtatcgctttggac---------aaaccatcttgattttgggatgtcatttgttcttttcattttgtcaggtgtaaatattggcaaaa 38845418  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaat 281  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38845417 atccctttttggttagtctatgaagcttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaat 38845350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 17671172 - 17671348
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17671172 gaaggtggtaagctcacattttatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 17671271  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcatttt 190  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17671272 tactattttgacatatcgctttggactgtaatcgtaaactatattgactttgggatgccatttgttcttttcatttt 17671348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Original strand, 17671483 - 17671624
Alignment:
Q  175 ttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaa 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17671483 ttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaaatccatttttggttagtctatgacacttgtagtatcttttatagacataactattatgtaa 17671582  T
Q  275 cgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17671583 cgttaatctgcacattgttggttccttcattggttctaatta 17671624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 316
Target Start/End: Original strand, 15317298 - 15317415
Alignment:
Q  199 taaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttc 298  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15317298 taaatattggcaaaaatacctttttggttagtcaatgacacttgcagtctcttttataaacccaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttc 15317397  T
Q  299 cttcattggttccaatta 316  Q
    |||  |||||||||||||    
T  15317398 ctttgttggttccaatta 15317415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 316
Target Start/End: Original strand, 28631382 - 28631480
Alignment:
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28631382 cttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcgttggttccaatta 28631480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23909955 - 23909917
Alignment:
Q  278 taatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23909955 taatttgcacattattggttccttcatcggttccaatta 23909917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3839783 - 3839479
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3839783 gaaggtggtaagctcatctttgatctggaaaattcaccgaaaaacttccacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttaaacttc 3839684  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctga------tgtaaatattg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||    
T  3839683 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaattatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtagatgtaaatattg 3839584  T
Q  208 gcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattgg 307  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3839583 gcaaaaattcctttttggttagtctatgattcttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgg 3839484  T
Q  308 ttcca 312  Q
    |||||    
T  3839483 ttcca 3839479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41984645 - 41984353
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41984645 gaaggtagtaagctcatcattgatcttgaaaagtcaccgatgaacttgcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttc 41984546  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41984545 tactattttgacatatcgctttggactgtaatcataaactatcttgacttttggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 41984446  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattg 306  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41984445 atccttttttggttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacttaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcattg 41984353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 740822 - 740520
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  740822 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtaaatatttgctgctgaactatttgaacttc 740723  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  740722 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcataaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 740623  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  740622 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttccttcattggttcaaa 740523  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  740522 tta 740520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 1944369 - 1944671
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||||||| || | || ||||||||||||    
T  1944369 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttc 1944468  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1944469 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 1944568  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1944569 atccctttttggttagtttatgacacttacagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattggtttcaa 1944668  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  1944669 tta 1944671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 15520593 - 15520895
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  15520593 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttaaacttc 15520692  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520693 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 15520792  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520793 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcaaa 15520892  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  15520893 tta 15520895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 40622025 - 40622326
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  40622025 gaaggtggtaa-ctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttt 40622123  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622124 ttctattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgagtttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 40622223  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  40622224 atccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttcattcattagttctaa 40622323  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  40622324 tta 40622326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37702011 - 37701709
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  37702011 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttaaactatttgaacttc 37701912  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37701911 tactattttgacgtattgctttggactgtagccgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgaaaaaa 37701812  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37701811 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcaaa 37701712  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  37701711 tta 37701709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34056975 - 34056673
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  34056975 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 34056876  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34056875 tactattttgatgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 34056776  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34056775 attcctttttggttaatctatgaaacttgcaatctcttttataaaactaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 34056676  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  34056675 tta 34056673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47720481 - 47720189
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  47720481 gaaggtggtaagcttatctttgatctcgaaaagtcatcaaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 47720382  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47720381 tactattttagcgtatcgctttggattgttatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggaaaaa 47720282  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattg 306  Q
    ||   |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47720281 attcatttttggttagtctacgacacttgcagtctcttttataaatctaactattatgtgatgttaatatgcacattgttggttccttcattg 47720189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33503410 - 33503107
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  33503410 gaaggtgataagctcatctttgatttcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 33503311  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgg-caaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33503310 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttaactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggaaaaa 33503211  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503210 aatccctttttcgttagtctatgacacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcca 33503111  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  33503110 atta 33503107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5272687 - 5272385
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  5272687 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcgcagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 5272588  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5272587 tactattttgatgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 5272488  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5272487 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttctaa 5272388  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  5272387 tta 5272385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7644204 - 7643902
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  7644204 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 7644105  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644104 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgcgatgtcatctgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 7644005  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
     |  | ||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644004 cttccgttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttatagacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 7643905  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  7643904 tta 7643902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26870696 - 26870399
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26870696 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacattcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 26870602  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26870601 tactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 26870502  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26870501 atcccttttttgttagtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaa 26870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54332055 - 54331753
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  54332055 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 54331956  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54331955 tactattttgacgtatcgctttgaactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 54331856  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331855 atccatttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaacaattacgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 54331756  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  54331755 tta 54331753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 53342285 - 53342588
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgcta-aattatttgaactt 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |  || |||||||||||    
T  53342285 gaaggaggtaagctcatctttgatctcgagaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttttttgaactatttgaactt 53342384  T
Q  113 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaa 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53342385 ctactattttgacgcatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattagcaaa 53342484  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53342485 aatccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgtacattgttgattccttcattagttcca 53342584  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  53342585 atta 53342588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14829923 - 14829621
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| |||||     
T  14829923 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaacttt 14829824  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14829823 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 14829724  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14829723 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggtttcttcattggttccaa 14829624  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  14829623 tta 14829621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 23478787 - 23479089
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  23478787 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 23478886  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23478887 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatctgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 23478986  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  | ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478987 attcccttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 23479086  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  23479087 tta 23479089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17739916 - 17740219
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  17739916 gaaggtggtaagctcatatttgatctggaaaagtcaccgaagaacatgcatgttcgagttgttccaaagtatatctttgctgctgaactatttgaacttc 17740015  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttg-ggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaa 212  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  17740016 tactattttgacgcatctctttggaatgtaatcgtaaactatcttgaatttttggatgccatttgttcttttcattttatttgatgcaaatattgacaaa 17740115  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17740116 aatccctttttggttagtctatgacacttgtagtcttttttataaacctaactattttgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattcca 17740215  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  17740216 atta 17740219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 13627929 - 13628231
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||||||    
T  13627929 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagacacagaagaacttgaaaattcgagttgttccaaggtagatctttgttcttgaactatttgaacttc 13628028  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13628029 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttaagatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 13628128  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13628129 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatcacttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattgattccaa 13628228  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  13628229 tta 13628231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 38007721 - 38008023
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  38007721 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 38007820  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||| || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38007821 tactattttgacgtatctctctgtactgtagtcgtaaactatcttaacttagggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 38007920  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  |||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38007921 attcctttttggttagcctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgttcattgttggttccttcattggttccaa 38008020  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  38008021 tta 38008023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55999109 - 55998807
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  55999109 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttcaacttc 55999010  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  55999009 tactagtttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaattatcttgactttgggatgtcatttgctcttttcattttgtctagtgtaaatattgacaaaa 55998910  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998909 atccctttttggttagtatatgaaacttgcaatctcttttataaacttaactattatgttaaattaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 55998810  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  55998809 tta 55998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35708040 - 35707764
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  35708040 gaaggtggtatgctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaaatatttgaacttt 35707941  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35707940 tactattttgacgcatcactttgaactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaa 35707841  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35707840 atccctttttggttggtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 35707764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19831809 - 19831507
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||    
T  19831809 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaaatctttgttgttgaactatttgaacttc 19831710  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtc-tgatgtaaatattggcaaa 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19831709 ttctattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttctttttattttgtcttgatgtaaatattgacaaa 19831610  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831609 aatttctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttat-aacctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttcca 19831511  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  19831510 atta 19831507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 36856969 - 36857266
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  36856969 gtggtaagctcatctttgatatcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttctact 36857068  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36857069 attttgacgtatcactttggactgtagttgtaaactatcttgactttgggatgtactttgttcttttcattttgtctaatgtaagtattggcaaaaatct 36857168  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36857169 ctttttggttagtctatgaaacttacaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaattt-cacattgttggttccttcgttggttccaatta 36857266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39743158 - 39742856
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||  ||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||||    
T  39743158 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacaaaagaacttgcaaatttaagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactgtttgaacttc 39743059  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39743058 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcagtttgtctggtataaatattggcaaaa 39742959  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39742958 atccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctgactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgtttccaa 39742859  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  39742858 tta 39742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 21352976 - 21353255
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||    
T  21352976 gaaggtggtaagcccatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaaattc 21353075  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21353076 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 21353175  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgtt 293  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21353176 atccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgtt 21353255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47557750 - 47557535
Alignment:
Q  101 ttatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47557750 ttattttaacttctactattttgatgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgta 47557651  T
Q  201 aatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttcct 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47557650 aatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctgactgttatgtaacgttaatctgcacattgttggttcct 47557551  T
Q  301 tcattggttccaatta 316  Q
    |||||| |||||||||    
T  47557550 tcattgattccaatta 47557535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 574559 - 574283
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  574559 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaaatcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttc 574460  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  574459 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatatcatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattatcaaaa 574360  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||  |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  574359 attcctttttagttagtctatgacacttgcagtcttttaaataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 574283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17699053 - 17699356
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17699053 gaaggtagtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaaaaactagcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17699152  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattg-gcaaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  17699153 tactattttgacgtatcgctttagactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctggtttaaatattgataaaa 17699252  T
Q  213 aatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    || | ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17699253 aaaccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacataactattatgtaacgttaatctgcacatttttggttccttcattgcttcca 17699352  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  17699353 atta 17699356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35495955 - 35495653
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| ||| ||    
T  35495955 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttcaaaagtagatctttgttgttgaactatttaaacatc 35495856  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35495855 tactattttgacgtatcgctttggaatgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaa 35495756  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  35495755 atacctttttggttagtatatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaaagttaatctgcacataattggttccttcattgattcaaa 35495656  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  35495655 tta 35495653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 2776169 - 2776442
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  2776169 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaaattgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 2776268  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2776269 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 2776368  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcac 287  Q
    ||| ||||||| ||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  2776369 atccctttttgattagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattttgtaacgttaatctgcac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28135478 - 28135175
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  28135478 gaagttggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttacaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 28135379  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttg--ttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaa 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28135378 tactattttgacgtattgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgtttttttttcattgtgtctggtgtaaatattggcaa 28135279  T
Q  212 aaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcc 311  Q
    ||||| | ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28135278 aaatc-ccttttggttagtttatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattggtttc 28135180  T
Q  312 aatta 316  Q
    |||||    
T  28135179 aatta 28135175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 8530711 - 8530995
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||    
T  8530711 gtggtaagttcatctttgatctcgaaaattcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgc--------------aacttctact 8530796  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  8530797 attttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaacaatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtacatattgacaaaaatcc 8530896  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8530897 ctttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgcacattgttgattccttcattgattccaatta 8530995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22116452 - 22116171
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||    
T  22116452 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactatttgaacttc 22116353  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22116352 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcacaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 22116253  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtc----tcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    | | ||||||||||| || ||||  |||||| ||    | |||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22116252 acccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatcccttttttttttgaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattg 22116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53991541 - 53991383
Alignment:
Q  132 ctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatc 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  53991541 ctttggactgtaatcgtaaactatcttgattttggaatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattagcaaaaatccctttttggttagtc 53991442  T
Q  232 tatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  53991441 tatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 53991383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 239 - 316
Target Start/End: Original strand, 28973164 - 28973241
Alignment:
Q  239 cttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28973164 cttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 28973241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 316
Target Start/End: Original strand, 56541556 - 56541594
Alignment:
Q  278 taatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56541556 taatttgcacattcttggttccttcattggttccaatta 56541594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 14831327 - 14831629
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  14831327 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 14831426  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14831427 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtttgatgtaaatattggcaaaa 14831526  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14831527 atccctttttggttagtctatgacacttgctgttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattgattccaa 14831626  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  14831627 tta 14831629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33321858 - 33321556
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  33321858 gaaggtggtaagttcatctttgatctcgagaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgaacttc 33321759  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33321758 tactattttgacgcatcgctttggactgtaatcataaactatcttgagtttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 33321659  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33321658 atccctttttggttagtcaatgacacttgcagccttttttattaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcattgattccaa 33321559  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  33321558 tta 33321556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1073668 - 1073366
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  1073668 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 1073569  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1073568 tactattttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 1073469  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073468 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 1073369  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  1073368 tta 1073366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13457249 - 13456948
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  13457249 gaaggtggtaagctcatatttggtctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacgttcgagttgttctaaagtagatatttgctgctgaactatttgaacttc 13457150  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13457149 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactattttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtct-atgtaaatattggcaaaa 13457051  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  13457050 atctctttttagttagtctttgacacttggagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattattggttcctttattggttcaaa 13456951  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  13456950 tta 13456948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18599391 - 18599089
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  18599391 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 18599292  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18599291 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 18599192  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599191 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaa 18599092  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  18599091 tta 18599089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 316
Target Start/End: Original strand, 25539943 - 25540217
Alignment:
Q  42 aaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactg 141  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25539943 aaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaactttttaaacttctactattttgacacatcgctttggactg 25540042  T
Q  142 taatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactctt 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  25540043 taatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgacaaaaatcccttttaggttagtctatgacactt 25540142  T
Q  242 gcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25540143 gcagtcttttttataagcctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 25540217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22374246 - 22373944
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||    
T  22374246 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaatttgagttgttccaaagtagatcttttttgttgaactatttgaacttc 22374147  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22374146 tactattttgacgtatcgctttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattcacaaaa 22374047  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22374046 atccctttttggttattctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccctcattggttccaa 22373947  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  22373946 tta 22373944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 34320934 - 34321237
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  34320934 gaaggtgataatctcatctttgatctcgaaaaatcaccaaagaacttgcatgttcgagttgttccatagtagatctttgttgctgaactatttgaacttc 34321033  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321034 tactattttgacgtatcgctttggattgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgatatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 34321133  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctctttt-ataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcca 312  Q
    | |  |||||||||| | |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34321134 agccttttttggttagtatatgacacttgcagttttttttcataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttgattccttcattggttcca 34321233  T
Q  313 atta 316  Q
    ||||    
T  34321234 atta 34321237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 4424328 - 4424630
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  4424328 gaaggtggtaagctcatctttgatctccaaaagttacaaaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 4424427  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4424428 tactattttgacgtatcgatttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcatttcgtctggtgtaaatattggcaaaa 4424527  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4424528 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatctaacattaatctgcacattattggttccttcattggttccaa 4424627  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  4424628 tta 4424630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 17939364 - 17939664
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  17939364 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacagaataacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 17939463  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17939464 tactattttgacgtatcgttttggactttagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 17939563  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||   ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17939564 attctttttttgttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttaattccttcattggttccaa 17939663  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  17939664 t 17939664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11935085 - 11934807
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||||| ||||||    
T  11935085 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtaaatctttgttgttgaactattttaacttc 11934986  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11934985 tactattttgacgtatcgctttggactatagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggtaaaa 11934886  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgt 292  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11934885 atccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgt 11934807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 34855797 - 34856099
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  34855797 gaaggtggtaagctcattttttatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 34855896  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34855897 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtgttggcaaaa 34855996  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34855997 attcctttttggttagtctatgaaacttgtaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggtttcttcattggttccaa 34856096  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  34856097 tta 34856099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 4425404 - 4425651
Alignment:
Q  69 gagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttggga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4425404 gagttgttccaaagtagatctttgctactgaactatttgaactattactattttggcgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttggga 4425503  T
Q  169 tgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgtt 268  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4425504 tgtcatttgttctttttattttgtctgatgtaaatattgggaaaaatccctttttggttagtctatgacacttacagtctcttttataaacctaactatt 4425603  T
Q  269 atgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4425604 atgtaatgttaatatgcacattgttggttccttccttggttctaatta 4425651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14888342 - 14888041
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||    
T  14888342 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactattttaacttc 14888243  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14888242 tactattttgatgtatcgctttggattttattcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 14888143  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888142 attcctttttggttagtcta-gaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaatgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 14888044  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  14888043 tta 14888041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 15275504 - 15275801
Alignment:
Q  18 gtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  || ||||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| || |    
T  15275504 gtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatatttgagttgttcgaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttatatt 15275603  T
Q  118 attttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatct 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  15275604 attttgacgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggtaaaaatcc 15275703  T
Q  218 ctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15275704 ctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaaccttaatccgcacattgttggttcc-tcattggttctaatta 15275801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 2521005 - 2521309
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatcttt-gctgctaaattatttgaactt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| | || | || ||||| |||||    
T  2521005 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgcaaattcgagttgttccaaaatagatcttttgttgttgaactattttaactt 2521104  T
Q  113 ctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaa 212  Q
    ||| |||||||  |||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2521105 ctattattttgatgtatcgttttggattgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattgacaaa 2521204  T
Q  213 aat-ctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttcc 311  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2521205 aattccctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgtacattgttggttccttcattggttcc 2521304  T
Q  312 aatta 316  Q
    |||||    
T  2521305 aatta 2521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 291
Target Start/End: Original strand, 35040950 - 35041227
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  35040950 gaaggtggtaagctcatatttgatctcgaaaagtcagagaagaacttgcaaatccgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 35041049  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35041050 tactattttgacataccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 35041149  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattg 291  Q
    ||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35041150 atccctttttggttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatttgcacattg 35041227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 18311649 - 18311924
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    
T  18311649 gaaggtggta-gctcatatttgatctcgaaaagtcacagaagaacttgcaaattcgagttgttccaaagtagatctttgttgttgaactatttgaacttc 18311747  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18311748 tactattttgacgtaccgctttggactgtagtcgcaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctaatgtaaatattggcaaaa 18311847  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacatt 290  Q
    ||| ||||||| ||| || ||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18311848 atccctttttgtttagtcaatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacatt 18311924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Original strand, 30044255 - 30044352
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30044255 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccgaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 30044352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28228916 - 28228824
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattattt 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  28228916 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 28228824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Original strand, 1931987 - 1932082
Alignment:
Q  221 tttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1931987 tttggttagtctatgacacttgcggtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgcacattgttgtttccttcattggttctaatta 1932082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 1931890 - 1931975
Alignment:
Q  36 atctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattt 121  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||  || | || ||||||||||||||||||||    
T  1931890 atctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttattgttgaactatttgaacttctactattt 1931975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30394 - 30092
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30394 gaaggtgataagctcatctttgatcttgaaaagtcaccaaagaacttgcatgtttgagttgttccaaagtagatctttactgctaaactatttgaacttc 30295  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30294 tactattttgacgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgacatttgttcttttcaatttgtctgatgtaaatattggcaaaa 30195  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30194 atctttttttggttagtctatgacacttgcagtttttcttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttgattccttcattagttccaa 30095  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  30094 tta 30092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10994 - 10705
Alignment:
Q  27 ttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||    
T  10994 ttatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttacatattcgagttgttccaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttaacg 10895  T
Q  127 tatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggt 226  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10894 catcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcgaaaatccctttttcgt 10795  T
Q  227 taatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    || |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10794 tagtctatgacacttgaagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgtttgttccttcattgattccaatta 10705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13328 - 13026
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  13328 gaaggtggtaagctcatctttaatctcgaaaagtcactgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactatttgagcttc 13229  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13228 tactattttgacgcatcactttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttttctgatgtaaatattggcaaaa 13129  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  13128 atccttttttggttagtctatgacacttgcagtcttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcaaatagttggttccttcattggttacaa 13029  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  13028 tta 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 152552 - 152250
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  152552 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagttatcgaagaacttgcacgttcgagctgttccaaaatatatctttgctgttaaactatttgaacttc 152453  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152452 tactattttggcgtatccctttggactgtaatcgtaacctatcttgactttggaatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 152353  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  152352 atccatttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctgactattatataacgttaatctgcacattgttggttgcttcattggttccaa 152253  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  152252 tta 152250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 65031 - 64729
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||||||| || | || ||||||||||||    
T  65031 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcatcgaagaacttgcacgtttgagttgatccaaaatagatctttgttgttgaactatttgaacttc 64932  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  64931 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgaaaaaa 64832  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| ||||||||||| | |||||  ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  64831 atccctttttggttagtatatgaaacttacaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttctttcattggtttcaa 64732  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  64731 tta 64729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 65 - 316
Target Start/End: Original strand, 100509 - 100760
Alignment:
Q  65 gttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgacttt 164  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  100509 gttcgagttgtttgaaagtagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttgacgtaccgctttggactgtaatcgtaaactatattgacttt 100608  T
Q  165 gggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaac 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  100609 gggatgcgatttgttcttttcattttttctaatgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctatgacacttgcagtctcttttataaacctaac 100708  T
Q  265 tgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100709 tattatgtaatgttaatctgcacattgttggttccttcattggttccaatta 100760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1494
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1197 gaaggtggtaaactcatctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttc 1291  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1292 tactattttggcataccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaa 1391  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1392 atcccttttttgttagtctataacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaa 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26757 - 26455
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| |||||     
T  26757 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaacttt 26658  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26657 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 26558  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26557 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggtttcttcattggttccaa 26458  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  26457 tta 26455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 9786 - 10088
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||| |||||     
T  9786 gaaggtggtaagctcatctttgatctcaaaaagtcacagaagaacttgcaagttcgagttgttccaaagtagatatttgttgttgaactattttaacttt 9885  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9886 tactattttgatgtatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgggatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 9985  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9986 attcctttttggttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggtttcttcattggttccaa 10085  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  10086 tta 10088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 53345 - 53063
Alignment:
Q  29 atctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttctactattttggcgta 128  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  53345 atctttgatctcgaaaagtcactgaagaacttgcacgttcgagtt-----aaaatagatctttgctgctgaactatttgaacttctactattttggcata 53251  T
Q  129 tcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggtta 228  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  53250 ccgttttggactgtaatcgtaaactatcttgtctttgggatgccatttgttcttttcattttatctgatgtaaatattggcaaaaattctttttttgtta 53151  T
Q  229 atctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53150 gtctatgacacttgtagtctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatatgcacattgttggttccttcgttggtttcaatta 53063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 276 - 578
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |  ||||||||||| ||||||||||||||| || | || | ||| ||||||    
T  276 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcacataagaacttgaaaattcgagttgtttcaaagtagatctttgttgttgaactgttttaacttc 375  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  376 tactattttgatatatcgctttggactgtagtcgtaaactatcttgactttgagatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaa 475  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaa 313  Q
    ||  ||||||||||| |||||||  | |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  476 attcctttttggttagtctatgaaacctgcgatctcttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgtacattgttggttccttcattggttccaa 575  T
Q  314 tta 316  Q
    |||    
T  576 tta 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4576 - 4301
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  4576 gaaggtggtaagctcatctttgatttcgaaaagtcaccgaagaacttgcatgttcgagttgttccaaagtagatctttgctggtgaactatttgaacttt 4477  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaa 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4476 tactattttgacgcatctctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggataccatttgttcttttcattttatctgatgtaagtattagcaaaa 4377  T
Q  214 atctctttttggttaatctatgactcttgcag--tctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcac 287  Q
        ||||||||||| |||||||| |||||||  | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4376 tcacctttttggttagtctatgacacttgcagttttttttttataaacctaactattatgtaacgttaatctgcac 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 316
Target Start/End: Original strand, 61267 - 61456
Alignment:
Q  127 tatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggt 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  61267 tatcgctttggactgtaatcgtaaactatcttgactttgggatgccatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattgggaaaattttctttttggt 61366  T
Q  227 taatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  61367 tagtctatgacacttgtagtctcttttataaatctaactattatgtaatgttaatatgcacattgttgcttccttcattggttctaatta 61456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 49907 - 50024
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  49907 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtaatcgaagaacttgcacgttcgagttgttcaaaagtagatctttattgctgaactatttgaacttc 50006  T
Q  114 tactattttggcgtatcg 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50007 tactattttggcgtatcg 50024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 119898 - 120079
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattatttgaacttc 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||    
T  119898 gaaggtggtaagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttgcacattcgagttgttccaaagtaaatttttgctactgaactatttgaacttc 119997  T
Q  114 tactattttggcgtatcgctttggactgtaatcataaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctg 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  119998 tactattttaacgtatcgctttggaatctaatcgtaaactatcttgactttgggatgccgtttgttctttttattttgtctg 120079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 26477 - 26645
Alignment:
Q  148 taaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtc 247  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||| | |     
T  26477 taaactatcttaactttgggatgtcatttgatcttttcattttgtctggtgtaaatattggcaaaaatccctttttggttagtctttgaaacttgtaata 26576  T
Q  248 tcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  26577 tcttttataaacctaagtattatgtagcgttaatctgcacattgttgattctttcattgattccaatta 26645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1891 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 254
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  148 taaattatcttgactttgggatgctatttgttcttttcattttgtctgatgtaaatattggcaaaaatctctttttggttaatctatgactcttgcagtc 247  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| ||    
T  9 taaactatcttgactttgtgatgtcatttgttcttttcattttgtctgatgtaagtattggcaaaaattcctttttggttagtctatgaaacttgcaatc 108  T
Q  248 tctttta 254  Q
    |||||||    
T  109 tctttta 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3646 - 3549
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3646 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccaaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggtttcttcattggttccaatta 3549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49427 - 49330
Alignment:
Q  219 tttttggttaatctatgactcttgcagtctcttttataaacgtaactgttatgtaacgttaatttgcacattgttggttccttcattggttccaatta 316  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49427 tttttagttagtctatgaaacttgcaatctcttttataaaccgaactattatgtaacgttaatctgcacattgttggttccttcattggtttcaatta 49330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29414 - 29322
Alignment:
Q  14 gaaggtggtaagcttatctttgatctggaaaagtcaccgaagaattttcacgttcgagttgttccaaagtagatctttgctgctaaattattt 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  29414 gaaggtgataagctcatctttgatctcgaaaagtcaccgaagaacttatacgttcgagttgttccaaagtagatctttgttgctgaactattt 29322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University