View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1242_low_132 (Length: 253)

Name: NF1242_low_132
Description: NF1242
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1242_low_132
NF1242_low_132
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (4-241)||(18955764-18956001)
chr6 (7-241)||(22862814-22863048)
chr6 (1-241)||(11566730-11566970)
chr6 (1-241)||(19870458-19870698)
chr6 (1-241)||(23394936-23395176)
chr6 (1-241)||(8243729-8243969)
chr6 (1-241)||(18917264-18917504)
chr6 (1-241)||(23989788-23990028)
chr6 (1-241)||(14472139-14472378)
chr6 (17-241)||(31477826-31478048)
chr6 (1-241)||(1644576-1644813)
chr6 (17-241)||(16760163-16760385)
chr6 (17-241)||(22948976-22949198)
chr6 (17-240)||(22952933-22953154)
chr6 (17-240)||(23871421-23871642)
chr6 (17-240)||(23875377-23875598)
chr6 (17-237)||(12618858-12619076)
chr6 (86-241)||(23414848-23415003)
chr6 (86-241)||(28103900-28104055)
chr6 (86-241)||(15705445-15705600)
chr6 (86-241)||(19773544-19773699)
chr6 (86-241)||(22805896-22806051)
chr6 (86-241)||(27556606-27556761)
chr6 (86-241)||(15817523-15817678)
chr6 (86-240)||(14979389-14979543)
chr6 (105-241)||(17377818-17377954)
chr6 (119-241)||(17743341-17743463)
chr6 (92-241)||(15875347-15875496)
chr6 (141-241)||(27415996-27416096)
chr6 (150-240)||(15174163-15174253)
chr6 (150-240)||(18913910-18914000)
chr6 (150-240)||(18937168-18937258)
chr6 (104-212)||(18696480-18696589)
chr6 (104-209)||(18706301-18706407)
chr6 (1-88)||(17804218-17804305)
chr6 (86-153)||(20136722-20136789)
chr6 (86-153)||(22196080-22196147)
chr6 (1-88)||(22430028-22430115)
chr6 (1-88)||(25767166-25767253)
chr6 (86-155)||(23838224-23838293)
chr6 (86-155)||(18453232-18453301)
chr6 (94-157)||(4476872-4476935)
chr6 (150-208)||(23956148-23956206)
chr6 (86-150)||(20182848-20182912)
chr6 (86-150)||(22153079-22153143)
chr6 (87-154)||(23539020-23539087)
chr6 (90-131)||(33443122-33443163)
chr6 (1-88)||(12706711-12706796)
chr6 (92-129)||(29416912-29416949)
chr6 (44-88)||(16523432-16523476)
chr6 (17-88)||(23414667-23414736)
chr6 (17-88)||(27556425-27556494)
chr6 (92-131)||(18177680-18177719)
chr6 (92-131)||(18199424-18199463)
chr6 (92-131)||(18204152-18204191)
chr6 (168-215)||(20078134-20078181)
chr6 (87-216)||(23538800-23538928)
chr6 (34-88)||(18907135-18907189)
chr6 (86-132)||(25619724-25619770)
chr6 (1-85)||(16741231-16741313)
chr6 (86-131)||(23076806-23076851)
chr6 (35-88)||(27325650-27325703)
chr6 (50-86)||(1587777-1587813)
chr6 (1-88)||(5616814-5616899)
chr6 (44-88)||(19790828-19790872)
chr6 (86-130)||(20224018-20224062)
chr6 (86-130)||(22118002-22118046)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (4-241)||(27533894-27534131)
chr4 (1-241)||(9556398-9556638)
chr4 (1-241)||(17810140-17810380)
chr4 (6-241)||(4561337-4561572)
chr4 (6-241)||(14757425-14757660)
chr4 (1-241)||(5756936-5757176)
chr4 (17-241)||(14954183-14954405)
chr4 (17-241)||(25689738-25689960)
chr4 (17-237)||(33742252-33742470)
chr4 (17-241)||(10712724-10712943)
chr4 (17-241)||(10926494-10926713)
chr4 (62-241)||(12487579-12487758)
chr4 (86-241)||(17048136-17048291)
chr4 (86-241)||(14746585-14746740)
chr4 (86-241)||(13591928-13592082)
chr4 (92-240)||(15497043-15497191)
chr4 (92-241)||(19857485-19857634)
chr4 (86-190)||(10056653-10056757)
chr4 (141-241)||(43256215-43256315)
chr4 (150-240)||(15884123-15884213)
chr4 (150-241)||(15008218-15008309)
chr4 (152-241)||(40619783-40619872)
chr4 (150-241)||(10694955-10695046)
chr4 (150-241)||(10908721-10908812)
chr4 (92-182)||(52873150-52873240)
chr4 (1-85)||(22634420-22634504)
chr4 (162-237)||(14650791-14650866)
chr4 (86-153)||(18212784-18212851)
chr4 (1-88)||(36133960-36134047)
chr4 (86-155)||(24047301-24047370)
chr4 (87-154)||(40907122-40907189)
chr4 (150-208)||(28385529-28385587)
chr4 (92-154)||(40906965-40907027)
chr4 (86-155)||(14185029-14185098)
chr4 (192-241)||(26013447-26013496)
chr4 (89-155)||(26045298-26045364)
chr4 (89-155)||(26050479-26050545)
chr4 (1-88)||(1951760-1951845)
chr4 (87-156)||(17333326-17333396)
chr4 (92-138)||(30146453-30146499)
chr4 (92-129)||(4831543-4831580)
chr4 (92-129)||(4834838-4834875)
chr4 (92-129)||(14047715-14047752)
chr4 (86-130)||(16043087-16043131)
chr4 (13-88)||(18222389-18222462)
chr4 (50-88)||(3412820-3412858)
chr4 (86-132)||(32306997-32307043)
chr4 (44-88)||(16488126-16488170)
chr4 (37-88)||(20157501-20157552)
chr4 (92-127)||(49547746-49547781)
chr4 (50-88)||(13813073-13813111)
chr4 (150-237)||(53631320-53631409)
chr4 (103-132)||(14852895-14852924)
chr4 (17-88)||(17152501-17152570)
chr4 (17-88)||(43256427-43256496)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-241)||(65526-65766)
scaffold0029 (1-241)||(61610-61850)
scaffold0029 (17-241)||(80583-80805)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (1-241)||(11854604-11854844)
chr3 (6-241)||(11165532-11165767)
chr3 (6-241)||(11069939-11070174)
chr3 (6-241)||(30065817-30066052)
chr3 (6-241)||(55022738-55022973)
chr3 (1-241)||(7109569-7109809)
chr3 (1-241)||(7113504-7113744)
chr3 (1-241)||(22336590-22336830)
chr3 (1-241)||(27409642-27409882)
chr3 (1-241)||(28949595-28949835)
chr3 (13-241)||(15617245-15617473)
chr3 (1-241)||(22321535-22321775)
chr3 (17-241)||(4111265-4111487)
chr3 (17-241)||(4107413-4107635)
chr3 (17-241)||(15964840-15965062)
chr3 (17-241)||(15968764-15968986)
chr3 (17-241)||(15972688-15972910)
chr3 (6-241)||(14499196-14499431)
chr3 (17-241)||(19775636-19775858)
chr3 (17-241)||(37439652-37439874)
chr3 (86-241)||(12339669-12339824)
chr3 (86-241)||(52989724-52989879)
chr3 (86-241)||(324198-324353)
chr3 (86-241)||(5223267-5223422)
chr3 (86-241)||(16796449-16796604)
chr3 (86-241)||(12469864-12470019)
chr3 (92-241)||(14966132-14966281)
chr3 (86-241)||(43889628-43889783)
chr3 (86-241)||(11914018-11914173)
chr3 (88-241)||(4588858-4589011)
chr3 (86-241)||(18700309-18700464)
chr3 (86-241)||(21837388-21837543)
chr3 (105-241)||(11300532-11300668)
chr3 (86-241)||(54876389-54876547)
chr3 (86-241)||(16643135-16643290)
chr3 (86-211)||(15465068-15465193)
chr3 (86-213)||(14670914-14671041)
chr3 (86-238)||(17691711-17691862)
chr3 (86-213)||(14682413-14682540)
chr3 (150-240)||(35961596-35961686)
chr3 (150-241)||(22652084-22652174)
chr3 (1-88)||(2897821-2897908)
chr3 (2-88)||(15482684-15482770)
chr3 (1-88)||(20461498-20461585)
chr3 (86-148)||(14179427-14179489)
chr3 (1-88)||(7793347-7793435)
chr3 (86-154)||(36527794-36527862)
chr3 (89-155)||(9577674-9577738)
chr3 (94-157)||(14763736-14763799)
chr3 (94-157)||(23371482-23371545)
chr3 (150-208)||(41813-41871)
chr3 (94-155)||(51300611-51300672)
chr3 (1-88)||(327162-327250)
chr3 (86-154)||(3265017-3265085)
chr3 (86-148)||(10542434-10542497)
chr3 (94-153)||(28194743-28194802)
chr3 (1-88)||(31097553-31097640)
chr3 (86-132)||(10834105-10834151)
chr3 (150-208)||(16325249-16325307)
chr3 (86-155)||(37427764-37427833)
chr3 (14-87)||(15850095-15850166)
chr3 (34-88)||(19725949-19726003)
chr3 (92-129)||(8928437-8928474)
chr3 (35-88)||(14665425-14665478)
chr3 (35-88)||(14668581-14668634)
chr3 (94-155)||(32402970-32403030)
chr3 (92-129)||(34852664-34852701)
chr3 (87-154)||(14568804-14568871)
chr3 (147-203)||(14569023-14569080)
chr3 (44-88)||(3403005-3403049)
chr3 (17-88)||(8489486-8489555)
chr3 (44-88)||(11862817-11862861)
chr3 (44-88)||(12172820-12172864)
chr3 (17-88)||(15464887-15464956)
chr3 (44-88)||(18383964-18384008)
chr3 (53-88)||(30029868-30029903)
chr3 (1-31)||(11300509-11300539)
chr3 (34-88)||(12496281-12496335)
chr3 (86-155)||(15246068-15246137)
chr3 (86-155)||(15265189-15265258)
chr3 (44-88)||(322616-322660)
chr3 (44-88)||(1982859-1982903)
chr3 (44-88)||(3389985-3390029)
chr3 (17-88)||(11854439-11854508)
chr3 (1-88)||(16798053-16798138)
chr3 (150-186)||(16979218-16979254)
chr3 (86-122)||(38311784-38311820)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (6-241)||(12901515-12901750)
chr2 (1-240)||(27379431-27379670)
chr2 (1-240)||(27383477-27383716)
chr2 (1-241)||(27601664-27601904)
chr2 (1-241)||(10101643-10101883)
chr2 (1-241)||(24628477-24628717)
chr2 (6-241)||(24649225-24649460)
chr2 (17-241)||(30345007-30345229)
chr2 (17-241)||(41531020-41531242)
chr2 (17-241)||(1283257-1283479)
chr2 (86-241)||(27472383-27472538)
chr2 (86-241)||(23069285-23069440)
chr2 (86-241)||(23707290-23707445)
chr2 (86-241)||(24918074-24918229)
chr2 (86-241)||(24670959-24671114)
chr2 (86-241)||(31345080-31345235)
chr2 (86-241)||(24681378-24681533)
chr2 (86-241)||(34874214-34874369)
chr2 (86-241)||(21081738-21081893)
chr2 (84-241)||(22459562-22459719)
chr2 (86-241)||(18358735-18358890)
chr2 (90-213)||(9784673-9784796)
chr2 (150-240)||(34492200-34492290)
chr2 (150-240)||(21914876-21914966)
chr2 (1-88)||(24735424-24735511)
chr2 (86-155)||(9241976-9242045)
chr2 (86-155)||(34136990-34137059)
chr2 (86-155)||(21073494-21073563)
chr2 (94-157)||(19662430-19662493)
chr2 (94-155)||(19201985-19202046)
chr2 (94-157)||(6261154-6261217)
chr2 (94-157)||(30644056-30644119)
chr2 (89-156)||(23287412-23287480)
chr2 (97-155)||(21237803-21237860)
chr2 (92-129)||(22703174-22703211)
chr2 (192-241)||(24316193-24316241)
chr2 (91-156)||(26392431-26392496)
chr2 (162-237)||(39827952-39828027)
chr2 (50-88)||(22811966-22812004)
chr2 (50-86)||(60840-60876)
chr2 (44-88)||(24869904-24869948)
chr2 (44-88)||(25961583-25961627)
chr2 (50-86)||(27263296-27263332)
chr2 (17-88)||(31344899-31344968)
chr2 (36-88)||(37524699-37524751)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (6-241)||(1010591-1010826)
chr1 (1-241)||(20228807-20229047)
chr1 (1-241)||(21407223-21407463)
chr1 (1-241)||(16375456-16375697)
chr1 (1-241)||(52639409-52639649)
chr1 (17-241)||(1925145-1925367)
chr1 (17-241)||(20924159-20924381)
chr1 (86-237)||(48603420-48603571)
chr1 (92-241)||(51326756-51326905)
chr1 (86-241)||(27653224-27653379)
chr1 (86-241)||(13881383-13881538)
chr1 (1-162)||(23819298-23819457)
chr1 (102-237)||(12271522-12271657)
chr1 (86-241)||(48520475-48520629)
chr1 (90-213)||(41781594-41781718)
chr1 (142-241)||(33797485-33797584)
chr1 (150-241)||(46198433-46198524)
chr1 (150-241)||(50000726-50000817)
chr1 (150-241)||(29764346-29764437)
chr1 (141-218)||(22130963-22131041)
chr1 (92-189)||(43543144-43543241)
chr1 (1-88)||(24783098-24783185)
chr1 (86-152)||(22124338-22124404)
chr1 (86-155)||(28312564-28312633)
chr1 (1-88)||(36819306-36819394)
chr1 (86-155)||(20437995-20438064)
chr1 (86-155)||(20958158-20958227)
chr1 (1-88)||(16080442-16080529)
chr1 (94-157)||(16372045-16372108)
chr1 (97-155)||(21043294-21043352)
chr1 (92-129)||(2332982-2333019)
chr1 (86-151)||(14800583-14800648)
chr1 (86-151)||(14809457-14809522)
chr1 (92-129)||(32649787-32649824)
chr1 (87-153)||(16381233-16381300)
chr1 (34-88)||(18182159-18182213)
chr1 (92-129)||(29534624-29534661)
chr1 (86-155)||(52940879-52940947)
chr1 (44-88)||(3472971-3473015)
chr1 (1-88)||(19211889-19211974)
chr1 (17-88)||(33797304-33797373)
chr1 (86-156)||(20454554-20454625)
chr1 (94-155)||(635992-636053)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-239)||(3873-4111)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-241)||(58717-58957)
[»] chr7 (91 HSPs)
chr7 (1-241)||(18283234-18283474)
chr7 (6-241)||(32975-33210)
chr7 (6-241)||(70768-71003)
chr7 (6-241)||(74877-75112)
chr7 (6-241)||(26292263-26292498)
chr7 (1-241)||(12714732-12714972)
chr7 (1-241)||(12718536-12718776)
chr7 (1-241)||(16907199-16907439)
chr7 (1-239)||(18279273-18279511)
chr7 (1-241)||(12704657-12704897)
chr7 (1-241)||(39722134-39722374)
chr7 (1-241)||(12723447-12723687)
chr7 (1-241)||(16114109-16114349)
chr7 (1-241)||(16117262-16117502)
chr7 (17-241)||(45170022-45170244)
chr7 (86-241)||(8940213-8940368)
chr7 (86-241)||(14258414-14258569)
chr7 (86-237)||(46580677-46580828)
chr7 (90-241)||(25927254-25927405)
chr7 (86-241)||(1858833-1858988)
chr7 (86-241)||(13918527-13918682)
chr7 (86-241)||(15719959-15720114)
chr7 (86-241)||(16460767-16460922)
chr7 (86-241)||(16998556-16998711)
chr7 (86-241)||(32301251-32301406)
chr7 (86-240)||(14273479-14273633)
chr7 (86-241)||(16579722-16579877)
chr7 (86-241)||(16585786-16585941)
chr7 (102-241)||(15112907-15113046)
chr7 (92-241)||(8468681-8468830)
chr7 (102-241)||(16324015-16324153)
chr7 (93-228)||(17060433-17060568)
chr7 (86-213)||(20487533-20487660)
chr7 (105-241)||(15116444-15116580)
chr7 (135-241)||(2530187-2530292)
chr7 (150-239)||(16550712-16550801)
chr7 (150-239)||(16614861-16614950)
chr7 (150-241)||(32160910-32161000)
chr7 (92-189)||(14270034-14270131)
chr7 (4-88)||(12318148-12318232)
chr7 (1-88)||(11312669-11312756)
chr7 (1-88)||(13635467-13635554)
chr7 (7-88)||(15580712-15580793)
chr7 (150-239)||(17232884-17232973)
chr7 (86-155)||(42461999-42462068)
chr7 (86-154)||(14157106-14157174)
chr7 (86-155)||(11661322-11661391)
chr7 (165-241)||(15084064-15084140)
chr7 (94-157)||(16008592-16008655)
chr7 (13-88)||(16583277-16583352)
chr7 (86-155)||(38519422-38519491)
chr7 (86-154)||(10501425-10501493)
chr7 (1-88)||(15605270-15605358)
chr7 (94-157)||(14566216-14566279)
chr7 (94-157)||(18872374-18872437)
chr7 (89-155)||(16996272-16996338)
chr7 (86-155)||(14422000-14422069)
chr7 (192-241)||(14981543-14981592)
chr7 (192-241)||(15411019-15411068)
chr7 (86-155)||(18607503-18607572)
chr7 (35-88)||(9751794-9751847)
chr7 (94-155)||(20619430-20619491)
chr7 (1-88)||(9593367-9593452)
chr7 (89-156)||(18203861-18203929)
chr7 (94-155)||(130827-130888)
chr7 (92-129)||(837364-837401)
chr7 (92-129)||(1202544-1202581)
chr7 (94-155)||(11525574-11525635)
chr7 (1-88)||(16457356-16457441)
chr7 (97-155)||(9033359-9033417)
chr7 (92-129)||(833368-833405)
chr7 (92-129)||(1198548-1198585)
chr7 (1-88)||(2530389-2530475)
chr7 (92-129)||(16109521-16109558)
chr7 (92-129)||(38828304-38828341)
chr7 (86-131)||(38898196-38898241)
chr7 (13-88)||(19069-19142)
chr7 (36-88)||(2832482-2832534)
chr7 (13-88)||(11987233-11987306)
chr7 (17-88)||(13918794-13918863)
chr7 (50-88)||(8917448-8917486)
chr7 (34-88)||(12321780-12321834)
chr7 (50-88)||(39267954-39267992)
chr7 (86-119)||(9177667-9177700)
chr7 (35-88)||(14429907-14429960)
chr7 (51-88)||(16724677-16724714)
chr7 (51-88)||(17701691-17701728)
chr7 (1-88)||(1859085-1859169)
chr7 (86-122)||(10896712-10896748)
chr7 (86-122)||(15167285-15167321)
chr7 (50-86)||(15728348-15728384)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (6-241)||(12290-12525)
[»] chr8 (51 HSPs)
chr8 (6-241)||(43251681-43251916)
chr8 (1-241)||(21976668-21976908)
chr8 (1-239)||(19278281-19278519)
chr8 (17-241)||(21828030-21828252)
chr8 (17-241)||(18862661-18862883)
chr8 (1-206)||(21972583-21972788)
chr8 (17-241)||(21410818-21411040)
chr8 (17-241)||(21805310-21805532)
chr8 (87-241)||(19808365-19808519)
chr8 (86-241)||(22238021-22238175)
chr8 (86-241)||(23409759-23409914)
chr8 (86-241)||(23659371-23659526)
chr8 (86-241)||(37515669-37515824)
chr8 (86-241)||(17461054-17461209)
chr8 (103-232)||(16402021-16402150)
chr8 (86-241)||(18833526-18833680)
chr8 (86-213)||(23914029-23914156)
chr8 (86-241)||(14397864-14398011)
chr8 (141-241)||(22111799-22111899)
chr8 (150-240)||(19880082-19880172)
chr8 (152-241)||(23478333-23478422)
chr8 (150-241)||(26453963-26454054)
chr8 (92-189)||(1327015-1327112)
chr8 (150-237)||(19929556-19929644)
chr8 (86-137)||(25363204-25363255)
chr8 (87-155)||(20502104-20502172)
chr8 (150-208)||(8414418-8414476)
chr8 (150-208)||(11775008-11775066)
chr8 (94-155)||(17438227-17438288)
chr8 (1-88)||(16231474-16231559)
chr8 (97-155)||(22963426-22963484)
chr8 (86-155)||(17086155-17086224)
chr8 (1-88)||(22044906-22044991)
chr8 (1-56)||(22111904-22111959)
chr8 (86-129)||(22253167-22253210)
chr8 (94-148)||(5083164-5083218)
chr8 (86-155)||(22995893-22995962)
chr8 (86-130)||(16799561-16799605)
chr8 (17-88)||(21383675-21383744)
chr8 (17-88)||(21387095-21387164)
chr8 (44-88)||(30643340-30643384)
chr8 (92-127)||(35026868-35026903)
chr8 (34-88)||(15603055-15603109)
chr8 (173-215)||(22381703-22381745)
chr8 (3-88)||(23834194-23834277)
chr8 (102-131)||(22525633-22525662)
chr8 (86-151)||(23943995-23944060)
chr8 (86-122)||(14103226-14103262)
chr8 (103-155)||(23667859-23667910)
chr8 (86-122)||(44476753-44476789)
chr8 (86-122)||(44480015-44480051)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-241)||(5099-5339)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-241)||(20295715-20295955)
chr5 (1-241)||(19472718-19472958)
chr5 (23-215)||(40723607-40723799)
chr5 (17-241)||(10753232-10753454)
chr5 (86-241)||(18356160-18356315)
chr5 (86-241)||(20910918-20911073)
chr5 (86-241)||(22107436-22107591)
chr5 (89-241)||(15236921-15237073)
chr5 (104-241)||(33895665-33895802)
chr5 (86-241)||(6765792-6765947)
chr5 (6-148)||(15236783-15236925)
chr5 (84-241)||(29447967-29448125)
chr5 (150-241)||(17010978-17011069)
chr5 (150-241)||(263110-263201)
chr5 (17-88)||(23535601-23535672)
chr5 (138-213)||(20910851-20910925)
chr5 (141-213)||(18356308-18356379)
chr5 (1-88)||(17410461-17410548)
chr5 (94-157)||(42960590-42960653)
chr5 (94-157)||(28371031-28371094)
chr5 (94-157)||(37598892-37598955)
chr5 (150-208)||(33473272-33473330)
chr5 (86-135)||(30138930-30138979)
chr5 (94-157)||(22336615-22336678)
chr5 (94-157)||(22340153-22340216)
chr5 (86-155)||(23469853-23469921)
chr5 (89-156)||(26740650-26740717)
chr5 (92-154)||(10816453-10816515)
chr5 (1-88)||(18774225-18774310)
chr5 (93-156)||(26732841-26732904)
chr5 (4-88)||(18784068-18784150)
chr5 (92-129)||(23538504-23538541)
chr5 (17-88)||(20911185-20911254)
chr5 (44-88)||(21366713-21366757)
chr5 (87-131)||(27988934-27988978)
chr5 (53-88)||(17517259-17517294)
chr5 (92-153)||(15796471-15796533)
chr5 (38-84)||(24767588-24767634)
chr5 (86-132)||(25576857-25576902)
chr5 (86-151)||(21328217-21328282)
chr5 (50-86)||(4036243-4036279)
chr5 (17-88)||(18355979-18356048)
chr5 (13-84)||(20232577-20232646)
chr5 (86-122)||(22750264-22750300)
chr5 (50-86)||(25229452-25229488)
chr5 (50-86)||(25293608-25293644)
chr5 (44-88)||(26680606-26680650)
chr5 (44-88)||(26952213-26952257)
chr5 (86-153)||(41861455-41861523)
chr5 (13-88)||(42805442-42805515)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-241)||(35956-36180)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (17-241)||(36102-36324)
scaffold0031 (1-88)||(53586-53673)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (17-241)||(189393-189615)
scaffold0012 (86-153)||(221208-221275)
scaffold0012 (10-88)||(24977-25053)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (17-241)||(11517-11739)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (17-241)||(14103-14325)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (17-241)||(318-541)
scaffold0676 (29-88)||(4454-4513)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (86-241)||(816-971)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (17-241)||(263-487)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (62-241)||(32719-32898)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (86-241)||(39216-39371)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (86-241)||(169751-169906)
scaffold0020 (94-155)||(142631-142692)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (86-241)||(125919-126074)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (92-241)||(53846-53995)
scaffold0022 (44-88)||(73815-73859)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (86-241)||(21130-21285)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (86-241)||(119972-120127)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (86-239)||(31089-31242)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (86-218)||(17560-17692)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (86-241)||(523-678)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (86-241)||(6943-7098)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (86-241)||(123-278)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (86-241)||(1294-1449)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (86-241)||(20212-20367)
scaffold0293 (86-155)||(17552-17621)
scaffold0293 (17-86)||(20479-20546)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (88-241)||(207587-207740)
scaffold0016 (35-86)||(207880-207931)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (88-232)||(80420-80564)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (86-241)||(15705-15861)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (86-241)||(1876-2031)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (86-239)||(24599-24751)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (92-235)||(387-530)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (86-235)||(6904-7053)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (92-241)||(10092-10241)
scaffold0107 (141-218)||(15471-15548)
scaffold0107 (86-155)||(36230-36299)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (86-241)||(67225-67379)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (86-241)||(85509-85664)
scaffold0009 (13-88)||(228384-228457)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (122-241)||(2751-2870)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (98-241)||(67397-67539)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (86-216)||(6161-6291)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (92-241)||(3335-3484)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (86-186)||(20769-20869)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (104-241)||(501-639)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (86-237)||(14965-15116)
scaffold0306 (150-241)||(4283-4374)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (86-241)||(7799-7952)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (141-241)||(71265-71365)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (92-207)||(105078-105193)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (86-198)||(4271-4383)
scaffold0741 (183-237)||(6851-6905)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (146-241)||(1227-1322)
scaffold0017 (146-241)||(7978-8073)
scaffold0017 (44-88)||(15259-15303)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (150-241)||(5711-5802)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (150-241)||(70536-70627)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (150-241)||(22477-22568)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (150-240)||(33171-33261)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (150-241)||(10474-10564)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-88)||(18630-18717)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (150-241)||(4283-4374)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-88)||(66413-66500)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (86-153)||(75830-75897)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (92-189)||(10859-10956)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (86-155)||(1944-2013)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (92-189)||(36038-36135)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (162-237)||(15550-15625)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-88)||(12925-13012)
scaffold0044 (1-88)||(19209-19296)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (162-237)||(166426-166501)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (86-156)||(15240-15310)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (164-237)||(7638-7711)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (86-155)||(3307-3376)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (86-154)||(8082-8150)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (162-237)||(56936-57011)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (94-157)||(110701-110764)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (86-136)||(15067-15117)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (86-132)||(6684-6730)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-86)||(20016-20099)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (150-208)||(176078-176136)
scaffold0001 (150-208)||(168724-168782)
scaffold0001 (4-88)||(173313-173395)
scaffold0001 (162-212)||(497538-497588)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (86-155)||(762-831)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (86-155)||(3917-3986)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (92-155)||(9728-9791)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (92-155)||(11196-11259)
scaffold0040 (92-155)||(22296-22359)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (17-88)||(2686-2757)
scaffold0013 (86-155)||(30381-30451)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (92-154)||(29261-29323)
scaffold0019 (86-132)||(132989-133035)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (94-155)||(988-1049)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (86-155)||(18169-18238)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (86-154)||(10524-10592)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (86-154)||(29723-29791)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (89-156)||(206528-206596)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (162-241)||(8972-9051)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (94-155)||(7499-7560)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (86-155)||(10213-10282)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (192-241)||(6883-6932)
scaffold0299 (17-88)||(6702-6771)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (92-129)||(48403-48440)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (92-129)||(146261-146298)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (86-155)||(697-766)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (36-88)||(183-235)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (13-88)||(18371-18444)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-88)||(3529-3614)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (198-241)||(13490-13533)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (34-88)||(17150-17204)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (34-88)||(9537-9591)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (94-155)||(3006-3067)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (44-88)||(417-461)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (36-84)||(2933-2981)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (44-88)||(6357-6401)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (44-88)||(2133-2177)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-88)||(5610-5704)
scaffold0476 (1-88)||(6805-6899)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (44-88)||(1518-1562)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (44-88)||(42651-42695)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (86-121)||(1785-1820)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-84)||(13485-13568)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (150-237)||(1314-1403)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (38-84)||(10085-10131)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (50-88)||(6046-6084)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (94-155)||(7481-7540)
scaffold0111 (94-155)||(14600-14659)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (98-127)||(101-130)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (86-131)||(2737-2782)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (103-132)||(55704-55733)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (86-122)||(663-699)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (44-88)||(15111-15155)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (44-88)||(313-357)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (103-155)||(29443-29494)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (44-88)||(30791-30835)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 18955764 - 18956001
Alignment:
Q  4 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18955764 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgtggttgattatca 18955863  T
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18955864 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 18955963  T
Q  204 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  18955964 taagttgttgatacttcataataatattgttatgttgt 18956001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22863048 - 22862814
Alignment:
Q  7 aagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863048 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 22862949  T
Q  107 gatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaa 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22862948 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 22862849  T
Q  207 gttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22862848 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 22862814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11566970 - 11566730
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11566970 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 11566871  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11566870 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 11566771  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  11566770 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 11566730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19870698 - 19870458
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19870698 atcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 19870599  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19870598 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 19870499  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19870498 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 19870458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23395176 - 23394936
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23395176 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 23395077  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23395076 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 23394977  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23394976 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 23394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8243969 - 8243729
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8243969 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 8243870  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8243869 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 8243770  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  8243769 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 8243729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18917264 - 18917504
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917264 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 18917363  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18917364 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 18917463  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18917464 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 18917504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23990028 - 23989788
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23990028 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 23989929  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23989928 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 23989829  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23989828 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 23989788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14472378 - 14472139
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14472378 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttattaa-ctaagttgcatgagttgttgttgatta 14472280  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14472279 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataat 14472180  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||| ||||| ||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  14472179 gttgaagttattgatacttcataataatattgttatgttgt 14472139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 31477826 - 31478048
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31477826 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 31477923  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31477924 tatcttgagatgtttacgtgtcgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 31478023  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  31478024 cttcatattaatattgttatgttgt 31478048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1644813 - 1644576
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  1644813 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagttgttg---atta 1644717  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1644716 tcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgat 1644617  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  1644616 gtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgt 1644576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16760385 - 16760163
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760385 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcacgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 16760288  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  16760287 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgata 16760188  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  16760187 ctttatattaatattgttatgttgt 16760163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22949198 - 22948976
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22949198 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 22949101  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22949100 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 22949001  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  22949000 ctttatattaatattgttatgttgt 22948976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22953154 - 22952933
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22953154 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 22953057  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22953056 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 22952957  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    || |  ||||||||||||||||||    
T  22952956 ctttatattaatattgttatgttg 22952933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23871642 - 23871421
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871642 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 23871545  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23871544 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 23871445  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    || |  ||||||||||||||||||    
T  23871444 ctttatattaatattgttatgttg 23871421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23875598 - 23875377
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23875598 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 23875501  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23875500 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 23875401  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    || |  ||||||||||||||||||    
T  23875400 ctttatattaatattgttatgttg 23875377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 12618858 - 12619076
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618858 aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 12618957  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12618958 tatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 12619055  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  12619056 cttcacattaatattgttatg 12619076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23415003 - 23414848
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415003 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23414904  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23414903 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 23414848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 28103900 - 28104055
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28103900 agttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 28103999  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28104000 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 28104055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 15705445 - 15705600
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15705445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacttgttttctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 15705544  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15705545 tggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgt 15705600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 19773544 - 19773699
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773544 agttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19773643  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19773644 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 19773699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22806051 - 22805896
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22806051 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgtgatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatg 22805952  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22805951 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 22805896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27556761 - 27556606
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556761 agttgttgttgatcatcatttgatgttgttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27556662  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27556661 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 27556606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 15817523 - 15817678
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15817523 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatg 15817622  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15817623 tggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15817678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 14979389 - 14979543
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttaagtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14979488  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  14979489 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 17377818 - 17377954
Alignment:
Q  105 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 204  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17377818 ttgatgttgtcatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttt 17377917  T
Q  205 aagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17377918 aagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgt 17377954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17743463 - 17743341
Alignment:
Q  119 tcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgct 218  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17743463 tcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatact 17743364  T
Q  219 cttcattaatattgttatgttgt 241  Q
      |||||||||||||||||||||    
T  17743363 tctcattaatattgttatgttgt 17743341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15875496 - 15875347
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15875496 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15875397  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15875396 atgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgt 15875347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 27415996 - 27416096
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27415996 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 27416095  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  27416096 t 27416096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174253
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 15174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913910
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttg 18913910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937168
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttg 18937168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18696589 - 18696480
Alignment:
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 202  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18696589 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 18696490  T
Q  203 ttaagttgtt 212  Q
    ||||||||||    
T  18696489 ttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18706407 - 18706301
Alignment:
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 202  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| |  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18706407 tttgatattgttatatcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 18706308  T
Q  203 ttaagtt 209  Q
    |||||||    
T  18706307 ttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 17804305 - 17804218
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17804305 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17804218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20136789 - 20136722
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20136789 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 20136722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 22196080 - 22196147
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22196080 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 22196147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 22430028 - 22430115
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22430028 atcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagt 22430115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 25767166 - 25767253
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25767166 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagt 25767253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23838293 - 23838224
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23838293 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23838224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18453301 - 18453232
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18453301 agttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18453232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4476935 - 4476872
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  4476935 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 4476872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20182912 - 20182848
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgct 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  20182912 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 20182848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 22153079 - 22153143
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgct 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  22153079 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 22153143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23539087 - 23539020
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||    
T  23539087 gttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 23539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33443163 - 33443122
Alignment:
Q  90 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33443163 gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12706796 - 12706711
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12706796 atcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 12706711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 29416912 - 29416949
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29416912 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 16523432 - 16523476
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16523432 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16523476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23414736 - 23414667
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23414736 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 23414667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27556494 - 27556425
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27556494 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 27556425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 131
Target Start/End: Original strand, 18177680 - 18177719
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18177680 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 131
Target Start/End: Original strand, 18199424 - 18199463
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18199424 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18204191 - 18204152
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18204191 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Original strand, 20078134 - 20078181
Alignment:
Q  168 atatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 215  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20078134 atatatatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 20078181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23538928 - 23538800
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt--acgtgttgtctatgttgctgttgttggttat-gtgaaatatttatatgcctta 183  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||     ||||||||    ||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  23538928 gttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatattgttgtct---ctgctggtgtgggttatggtaaaatatttatatacctta 23538832  T
Q  184 tgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23538831 tgtgaaaaatgtatgatg-ttaaggtgttgatg 23538800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18907189 - 18907135
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18907189 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagt 18907135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 25619724 - 25619770
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  25619724 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16741313 - 16741231
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatg 85  Q
    |||||||| || |||| | ||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  16741313 atcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaagttgcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23076851 - 23076806
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  23076851 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Original strand, 27325650 - 27325703
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27325650 ctgttgatgtgatatgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 27325703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 1587777 - 1587813
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1587777 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 5616814 - 5616899
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||| |||||| ||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5616814 atcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 5616899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 19790828 - 19790872
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19790828 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 19790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20224062 - 20224018
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  20224062 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22118046 - 22118002
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  22118046 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27534131 - 27533894
Alignment:
Q  4 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534131 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatca 27534032  T
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534031 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 27533932  T
Q  204 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  27533931 taagttgttgatacttcataataatattgttatgttgt 27533894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9556638 - 9556398
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556638 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 9556539  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9556538 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 9556439  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9556438 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 9556398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17810380 - 17810140
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810380 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 17810281  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17810280 tcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 17810181  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17810180 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 17810140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 4561337 - 4561572
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561337 gaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 4561436  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4561437 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 4561536  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  4561537 agttgttgatgcttcacattaataatgttatgttgt 4561572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 14757425 - 14757660
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757425 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 14757524  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14757525 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 14757624  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14757625 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 14757660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5756936 - 5757176
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5756936 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 5757035  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5757036 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 5757135  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  5757136 gtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgttgt 5757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 14954183 - 14954405
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954183 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 14954280  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14954281 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 14954380  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  14954381 ctttatattaatattgttatgttgt 14954405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25689960 - 25689738
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689960 aaataaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 25689863  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25689862 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 25689763  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  25689762 ctttatattaatattgttatgttgt 25689738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33742470 - 33742252
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742470 aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 33742371  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33742370 tatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 33742273  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  33742272 cttcacattaatattgttatg 33742252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10712943 - 10712724
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10712943 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgtta 10712849  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10712848 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 10712749  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||| ||||||    
T  10712748 cttcatattaatattgttgtgttgt 10712724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10926713 - 10926494
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10926713 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgtta 10926619  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10926618 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 10926519  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||| ||||||    
T  10926518 cttcatattaatattgttgtgttgt 10926494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12487758 - 12487579
Alignment:
Q  62 attgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggtta 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12487758 attgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 12487659  T
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  12487658 tgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 12487579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 17048136 - 17048291
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048136 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17048235  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17048236 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 17048291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 14746585 - 14746740
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746585 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 14746684  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746685 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 14746740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 13591928 - 13592082
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13591928 agttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13592027  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13592028 tggaa-atgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgt 13592082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 15497043 - 15497191
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15497043 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15497142  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15497143 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 15497191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19857634 - 19857485
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||      
T  19857634 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggaga 19857535  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  19857534 atatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgt 19857485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10056757 - 10056653
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056757 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 10056658  T
Q  186 tggaa 190  Q
    |||||    
T  10056657 tggaa 10056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 43256215 - 43256315
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  43256215 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttg 43256314  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  43256315 t 43256315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884213
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttg 15884213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008218
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgt 15008218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619783
Alignment:
Q  152 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgt 40619783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695046
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgt 10695046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908812
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgt 10908812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 182
Target Start/End: Original strand, 52873150 - 52873240
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 182  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  52873150 tgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttggctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcctt 52873240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 22634420 - 22634504
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatg 85  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22634420 atcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650791
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatg 14650791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18212851 - 18212784
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18212851 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgtt 18212784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 36133960 - 36134047
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36133960 atcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36134047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 24047301 - 24047370
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  24047301 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 24047370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40907189 - 40907122
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  40907189 gttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcctgtgttgctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40907027 - 40906965
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  40907027 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgatgtttgtgttgctgttg 40906965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14185098 - 14185029
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14185098 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 14185029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26013496 - 26013447
Alignment:
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26013496 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 26013447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 26045298 - 26045364
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  26045298 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 26050479 - 26050545
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  26050479 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26050545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 1951760 - 1951845
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1951760 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1951845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17333396 - 17333326
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  17333396 gttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgctgttgtt 17333326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30146499 - 30146453
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30146499 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 4831543 - 4831580
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831543 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 4834838 - 4834875
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4834838 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14047752 - 14047715
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047752 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16043131 - 16043087
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16043131 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 18222389 - 18222462
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18222389 ttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3412858 - 3412820
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3412858 gattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 3412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 32306997 - 32307043
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32306997 agttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 16488126 - 16488170
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16488126 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16488170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 20157501 - 20157552
Alignment:
Q  37 gttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20157501 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagt 20157552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 127
Target Start/End: Original strand, 49547746 - 49547781
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49547746 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Original strand, 13813073 - 13813111
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13813073 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 13813111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631409
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || |  || ||||||||||||||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatg 53631409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 132
Target Start/End: Original strand, 14852895 - 14852924
Alignment:
Q  103 atttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852895 atttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 17152501 - 17152570
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  17152501 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 17152570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 43256427 - 43256496
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43256427 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagt 43256496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 65526 - 65766
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  65526 atcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 65625  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65626 tcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 65725  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  65726 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 65766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 61610 - 61850
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61610 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 61709  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  61710 tcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 61809  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  61810 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 61850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 80805 - 80583
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  80805 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaatattgtta 80708  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  80707 tatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgata 80608  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    | |||||||||||||||||    
T  80607 cttcataataatattgttatgttgt 80583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11854844 - 11854604
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11854844 atcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 11854745  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11854744 ttatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgat 11854645  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11854644 gtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgttgt 11854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 11165532 - 11165767
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11165532 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatt 11165631  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11165632 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 11165731  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  11165732 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 11165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11070174 - 11069939
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070174 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 11070075  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11070074 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 11069975  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  11069974 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 11069939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30066052 - 30065817
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066052 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 30065953  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30065952 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 30065853  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  30065852 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 30065817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55022973 - 55022738
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55022973 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatt 55022874  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55022873 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 55022774  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  55022773 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 55022738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7109809 - 7109569
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7109809 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 7109710  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7109709 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 7109610  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  7109609 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 7109569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7113744 - 7113504
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7113744 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 7113645  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7113644 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 7113545  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  7113544 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 7113504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22336830 - 22336590
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22336830 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 22336731  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22336730 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 22336631  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22336630 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 22336590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27409642 - 27409882
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27409642 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 27409741  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27409742 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 27409841  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27409842 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 27409882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28949835 - 28949595
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28949835 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 28949736  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28949735 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 28949636  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28949635 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 28949595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15617473 - 15617245
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatatt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617473 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatatt 15617374  T
Q  113 gttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15617373 gttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtt 15617274  T
Q  213 gatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15617273 gatgcttcacattaatattgttatgttgt 15617245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22321775 - 22321535
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22321775 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 22321676  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22321675 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 22321576  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22321575 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 22321535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 4111265 - 4111487
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111265 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 4111362  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4111363 tatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 4111462  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||   ||||||||||||||||||||    
T  4111463 cttcacattaatattgttatgttgt 4111487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 4107413 - 4107635
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107413 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 4107510  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4107511 tatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 4107610  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
     |   ||||||||||||||||||||    
T  4107611 tttcacattaatattgttatgttgt 4107635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15965062 - 15964840
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965062 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 15964965  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15964964 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 15964865  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||| ||||||    
T  15964864 ctttatattaatattgttttgttgt 15964840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15968986 - 15968764
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968986 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 15968889  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15968888 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 15968789  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||| ||||||    
T  15968788 ctttatattaatattgttttgttgt 15968764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15972910 - 15972688
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972910 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 15972813  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15972812 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 15972713  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||| ||||||    
T  15972712 ctttatattaatattgttttgttgt 15972688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14499431 - 14499196
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14499431 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttaattatcatt 14499332  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14499331 ggatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 14499232  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14499231 agtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 14499196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19775858 - 19775636
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775858 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 19775761  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19775760 tatcttgagatgtttacatgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 19775661  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||| ||||||||    
T  19775660 cttcatattaatattgctatgttgt 19775636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 37439652 - 37439874
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37439652 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctacaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattattatttgatatggtta 37439749  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37439750 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 37439849  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  37439850 cttcatattaatattgttatgttgt 37439874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12339824 - 12339669
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339824 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12339725  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12339724 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12339669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 52989724 - 52989879
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989724 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 52989823  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989824 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 52989879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 324353 - 324198
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 324254  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  324253 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 324198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5223422 - 5223267
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223422 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 5223323  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5223322 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 5223267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16796604 - 16796449
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796604 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16796505  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16796504 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 16796449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12470019 - 12469864
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12470019 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12469920  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12469919 tggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 12469864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14966281 - 14966132
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14966281 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa 14966182  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966181 atatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 14966132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 43889628 - 43889783
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889628 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 43889727  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg-ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43889728 tagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctc-tcattaatattgttatgttgt 43889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 11914018 - 11914173
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11914018 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 11914117  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914118 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 11914173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Original strand, 4588858 - 4589011
Alignment:
Q  88 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588858 ttgttgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 4588957  T
Q  188 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  4588958 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 4589011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 18700309 - 18700464
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18700309 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatg 18700408  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  18700409 tgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgt 18700464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21837543 - 21837388
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837543 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21837444  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21837443 tggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgt 21837388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300668
Alignment:
Q  105 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 11300631  T
Q  205 aagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  11300632 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 11300668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 54876389 - 54876547
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt---gttggttatgtgaaatatttatatgcctt 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 54876488  T
Q  183 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  54876489 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgt 54876547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16643290 - 16643135
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtctaagttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16643191  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  16643190 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15465193 - 15465068
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465193 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15465094  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgt 211  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15465093 tggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14671041 - 14670914
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671041 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14670942  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14670941 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Original strand, 17691711 - 17691862
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691711 agttgatgttgataatcatttgatgttattatatct-gagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17691809  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  17691810 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgt 17691862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14682540 - 14682413
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682540 agttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14682441  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  14682440 tggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961686
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttg 35961686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652084
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgt 22652084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 2897821 - 2897908
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2897821 atcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2897908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15482770 - 15482684
Alignment:
Q  2 tcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15482770 tcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 15482684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 20461498 - 20461585
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20461498 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 20461585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14179489 - 14179427
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14179489 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttg 14179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 7793347 - 7793435
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccg-attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7793347 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 7793435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36527862 - 36527794
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  36527862 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttg 36527794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9577738 - 9577674
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  9577738 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaga--tttatgtgttgcctatgttgctgttgt 9577674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 14763736 - 14763799
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  14763736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14763799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 23371482 - 23371545
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  23371482 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 23371545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51300672 - 51300611
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  51300672 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgt 51300611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 327162 - 327250
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccga-ttatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  327162 atcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 3265017 - 3265085
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  3265017 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 3265085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Original strand, 10542434 - 10542497
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacg-tgttgtctatgttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10542434 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgatgttgtctaagttg 10542497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28194802 - 28194743
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28194802 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 31097553 - 31097640
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  31097553 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagt 31097640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 10834105 - 10834151
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834105 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37427833 - 37427764
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||    
T  37427833 agttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctgtgctgctgttgt 37427764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 15850095 - 15850166
Alignment:
Q  14 tgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgag 87  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15850095 tgaaaatgaattgttattaaact--tgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgag 15850166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 19725949 - 19726003
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19725949 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19726003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 8928437 - 8928474
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928437 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14665478 - 14665425
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14665478 ctgttgatgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14665425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14668634 - 14668581
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14668634 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14668581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 32402970 - 32403030
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32402970 ttgattattatttgatattgttatatcttgagacg-ttatgtgctgtctatgttgctgttgt 32403030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 34852664 - 34852701
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34852664 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 154
Target Start/End: Original strand, 14568804 - 14568871
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||    
T  14568804 gttggtgttaattatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 14568871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569080
Alignment:
Q  147 tgctgttgttggttatg-tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 203  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgtt 14569080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 3403005 - 3403049
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3403005 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3403049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 8489486 - 8489555
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8489486 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11862861 - 11862817
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11862861 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 11862817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12172864 - 12172820
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12172864 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 12172820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15464956 - 15464887
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15464956 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 15464887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 18383964 - 18384008
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18383964 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18384008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 30029903 - 30029868
Alignment:
Q  53 tatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029903 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 11300509 - 11300539
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300509 atcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12496335 - 12496281
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12496335 gctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 12496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15246137 - 15246068
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   ||| || |||||||||||||||    
T  15246137 agttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 15246068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15265258 - 15265189
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||   ||| || |||||||||||||||    
T  15265258 agttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 15265189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 322660 - 322616
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  322660 tgatctgattatgccgctattgttatttaactaagttgcatgagt 322616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 1982859 - 1982903
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1982859 tgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 1982903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 3389985 - 3390029
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3389985 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 3390029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11854508 - 11854439
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11854508 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 11854439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16798053 - 16798138
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |  |||| ||||  ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  16798053 atcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagtt--tgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttgcatgagt 16798138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16979254 - 16979218
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16979254 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 38311784 - 38311820
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38311784 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 12901515 - 12901750
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901515 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 12901614  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12901615 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 12901714  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12901715 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12901750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27379431 - 27379670
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379431 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 27379530  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27379531 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 27379630  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27379631 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 27379670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27383477 - 27383716
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383477 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 27383576  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27383577 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 27383676  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27383677 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 27383716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27601904 - 27601664
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27601904 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 27601805  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27601804 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 27601705  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27601704 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 27601664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10101643 - 10101883
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101643 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 10101742  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10101743 tcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 10101842  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  10101843 gtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgt 10101883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24628477 - 24628717
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24628477 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 24628576  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24628577 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 24628676  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24628677 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 24628717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24649460 - 24649225
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649460 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 24649361  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24649360 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgctta 24649261  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24649260 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 24649225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 30345007 - 30345229
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345007 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 30345104  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30345105 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 30345204  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  30345205 cttcatattaatattgttatgttgt 30345229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 41531020 - 41531242
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531020 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 41531117  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41531118 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 41531217  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  41531218 ctttatattaatattgttatgttgt 41531242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1283479 - 1283257
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283479 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 1283382  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1283381 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 1283282  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  1283281 cttcatattaatattgttatgttgt 1283257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27472538 - 27472383
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472538 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27472439  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27472438 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgt 27472383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 23069285 - 23069440
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23069384  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23069385 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 23069440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 23707290 - 23707445
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23707290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatg 23707389  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707390 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 23707445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24918229 - 24918074
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918229 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24918130  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918129 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 24918074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24671114 - 24670959
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24671114 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatg 24671015  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671014 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 24670959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31345235 - 31345080
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345235 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 31345136  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||    
T  31345135 tggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgt 31345080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24681533 - 24681378
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681533 agttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24681434  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24681433 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgt 24681378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 34874214 - 34874369
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874214 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 34874313  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874314 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 34874369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 21081738 - 21081893
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21081738 agttgatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 21081837  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081838 tgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgt 21081893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Original strand, 22459562 - 22459719
Alignment:
Q  84 tgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctta 183  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22459562 tgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgcctta 22459661  T
Q  184 tgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22459662 tgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 22459719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 18358735 - 18358890
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18358735 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtaccgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatg 18358834  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18358835 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgt 18358890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9784796 - 9784673
Alignment:
Q  90 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784796 gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 9784697  T
Q  190 agatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||    
T  9784696 aaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492290
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttg 34492290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914876
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttg 21914876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24735511 - 24735424
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24735511 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 24735424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9242045 - 9241976
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  9242045 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 9241976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34137059 - 34136990
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34137059 agttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 34136990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 21073494 - 21073563
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  21073494 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcatatgttgctgttgt 21073563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 19662430 - 19662493
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  19662430 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 19662493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 19201985 - 19202046
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19201985 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 19202046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 6261154 - 6261217
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  6261154 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 6261217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 30644056 - 30644119
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  30644056 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 30644119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23287480 - 23287412
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  23287480 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtt 23287412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21237860 - 21237803
Alignment:
Q  97 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21237860 attattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtc-atgttgctgttgt 21237803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22703211 - 22703174
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22703211 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 24316193 - 24316241
Alignment:
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24316193 atgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgt 24316241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26392496 - 26392431
Alignment:
Q  91 ttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||||||    
T  26392496 ttgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtt 26392431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828027
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||  ||||| |||| ||||||    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatg 39828027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Original strand, 22811966 - 22812004
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22811966 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22812004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 60876 - 60840
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  60876 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24869948 - 24869904
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24869948 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 24869904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 25961583 - 25961627
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25961583 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 25961627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27263332 - 27263296
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27263332 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 31344968 - 31344899
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31344968 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatgagt 31344899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37524751 - 37524699
Alignment:
Q  36 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  37524751 tgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 37524699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1010826 - 1010591
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010826 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 1010727  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1010726 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 1010627  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1010626 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 1010591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20228807 - 20229047
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228807 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 20228906  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20228907 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 20229006  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  20229007 gtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgt 20229047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21407463 - 21407223
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21407463 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 21407364  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21407363 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 21407264  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21407263 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 21407223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16375456 - 16375697
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16375456 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 16375555  T
Q  101 tcatttga-tattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatga 199  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16375556 tcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttga 16375655  T
Q  200 tgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16375656 tgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 16375697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52639649 - 52639409
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52639649 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 52639550  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  52639549 tcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgat 52639450  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  52639449 gtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 52639409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 1925145 - 1925367
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925145 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 1925242  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1925243 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 1925342  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  1925343 cttcatattaatattgttatgttgt 1925367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 20924159 - 20924381
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924159 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 20924256  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20924257 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 20924356  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  20924357 cttcatattaatattgttatgttgt 20924381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48603571 - 48603420
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48603571 agttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatg 48603472  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  48603471 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 48603420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51326905 - 51326756
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51326905 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 51326806  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51326805 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 51326756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 27653224 - 27653379
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653224 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27653323  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27653324 tagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 27653379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 13881383 - 13881538
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881383 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13881482  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13881483 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgt 13881538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 23819298 - 23819457
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23819298 atcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatgagttgttgttgatta 23819395  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23819396 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 23819457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271522
Alignment:
Q  102 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatg 12271558  T
Q  202 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  12271557 tttaagttgttgatacttttcattaattttgttatg 12271522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48520629 - 48520475
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520629 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatct-gagatgttcatgttctacctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 48520531  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  48520530 tggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgt 48520475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Original strand, 41781594 - 41781718
Alignment:
Q  90 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg- 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41781594 gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 41781693  T
Q  189 aagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    || ||||| ||||||||||||||||    
T  41781694 aaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797485
Alignment:
Q  142 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198524
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgt 46198524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000726
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgt 50000726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764437
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgt 29764437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 22130963 - 22131041
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg-tttaagttgttgatgct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22130963 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgct 22131041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43543241 - 43543144
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43543241 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 43543144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 24783098 - 24783185
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24783098 atcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 24783185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22124404 - 22124338
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  22124404 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgt 22124338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28312633 - 28312564
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28312633 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgatgttgt 28312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 36819306 - 36819394
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaatt-gatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36819306 atcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 20437995 - 20438064
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20437995 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20438064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20958227 - 20958158
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20958227 agttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20958158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16080442 - 16080529
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16080442 atcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagt 16080529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16372108 - 16372045
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  16372108 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 16372045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 21043294 - 21043352
Alignment:
Q  97 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  21043294 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 21043352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 2332982 - 2333019
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332982 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14800648 - 14800583
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctg 151  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  14800648 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14800583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14809522 - 14809457
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctg 151  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  14809522 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14809457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32649824 - 32649787
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649824 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16381300 - 16381233
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||||    
T  16381300 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgatgtctatgctgctgtt 16381233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 18182159 - 18182213
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18182159 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18182213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29534661 - 29534624
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29534661 tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 52940879 - 52940947
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||    
T  52940879 agttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatg-ttatgtgctgcctatgttgttgttgt 52940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 3472971 - 3473015
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3472971 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3473015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19211974 - 19211889
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||  |||  ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19211974 atcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct--tgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 19211889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 33797373 - 33797304
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33797373 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 33797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 20454554 - 20454625
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  20454554 agttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgttgtt 20454625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 635992 - 636053
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||    
T  635992 ttgaatattatttgacattgttatatcttgaaatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 636053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 3873 - 4111
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 3972  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3973 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaat 4072  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4073 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 58717 - 58957
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  58717 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 58816  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  58817 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 58916  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  58917 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 58957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18283474 - 18283234
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18283474 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 18283375  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18283374 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 18283275  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18283274 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 18283234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33210 - 32975
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33210 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttgcatgagttgttgttgattatcatt 33111  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33110 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 33011  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33010 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 70768 - 71003
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70768 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 70867  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  70868 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 70967  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  70968 agttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 74877 - 75112
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74877 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 74976  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74977 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 75076  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  75077 agttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgt 75112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26292498 - 26292263
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292498 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 26292399  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26292398 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgtcaatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 26292299  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26292298 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 26292263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12714972 - 12714732
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12714972 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 12714873  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12714872 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 12714773  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12714772 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12718776 - 12718536
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12718776 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 12718677  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12718676 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 12718577  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12718576 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12718536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16907199 - 16907439
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16907199 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 16907298  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16907299 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 16907398  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16907399 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 16907439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18279511 - 18279273
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18279511 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 18279412  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18279411 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 18279312  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18279311 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 18279273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12704657 - 12704897
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12704657 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 12704756  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12704757 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 12704856  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12704857 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12704897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39722374 - 39722134
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722374 atcaggaagttgttgaaaatgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 39722275  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722274 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgat 39722175  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  39722174 gtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgt 39722134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12723687 - 12723447
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12723687 atcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 12723588  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12723587 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 12723488  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12723487 gtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12723447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16114349 - 16114109
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16114349 atcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 16114250  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16114249 tcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 16114150  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16114149 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 16114109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16117502 - 16117262
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16117502 atcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 16117403  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16117402 tcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 16117303  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16117302 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 16117262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 45170022 - 45170244
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170022 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 45170119  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45170120 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 45170219  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  45170220 ctttatattaatattgttatgttgt 45170244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8940368 - 8940213
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940368 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 8940269  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940268 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 8940213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14258569 - 14258414
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258569 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14258470  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14258469 tggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 14258414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Original strand, 46580677 - 46580828
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580677 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 46580776  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580777 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 46580828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Original strand, 25927254 - 25927405
Alignment:
Q  90 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25927254 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtgga 25927353  T
Q  190 agatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  25927354 agatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 25927405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 1858833 - 1858988
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858833 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 1858932  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  1858933 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgt 1858988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 13918527 - 13918682
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13918527 agttgttgttaattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttata 13918626  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13918627 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 13918682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15720114 - 15719959
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720114 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15720015  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720014 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15719959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 16460767 - 16460922
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460767 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 16460866  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16460867 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgt 16460922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16998711 - 16998556
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998711 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16998612  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16998611 ttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 16998556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32301406 - 32301251
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301406 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 32301307  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32301306 tggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgt 32301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14273633 - 14273479
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14273633 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 14273534  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  14273533 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttg 14273479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16579877 - 16579722
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16579877 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16579778  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16579777 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 16579722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 16585786 - 16585941
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16585786 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16585885  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16585886 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 16585941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15112907
Alignment:
Q  102 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatg 15112947  T
Q  202 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15112946 tttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15112907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8468830 - 8468681
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  8468830 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaga 8468731  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8468730 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 8468681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16324153 - 16324015
Alignment:
Q  102 catttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatg 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  16324153 cattcgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatg 16324055  T
Q  202 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324054 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 16324015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 17060433 - 17060568
Alignment:
Q  93 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaga 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17060433 gttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaa 17060532  T
Q  193 tgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17060533 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat 17060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20487660 - 20487533
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20487660 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 20487561  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20487560 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116444
Alignment:
Q  105 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt 15116481  T
Q  205 aagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  15116480 acgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgt 15116444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Original strand, 2530187 - 2530292
Alignment:
Q  135 tgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  2530187 tgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 2530285  T
Q  235 atgttgt 241  Q
    |||||||    
T  2530286 atgttgt 2530292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550801
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 16550801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614861
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgtt 16614861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161000
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 32161000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 14270034 - 14270131
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14270034 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtgga 14270131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12318232 - 12318148
Alignment:
Q  4 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12318232 aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 12318148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11312756 - 11312669
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11312756 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 11312669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 13635467 - 13635554
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13635467 atcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 13635554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15580793 - 15580712
Alignment:
Q  7 aagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15580793 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagt 15580712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232884
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgtt 17232884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42462068 - 42461999
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42462068 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 42461999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 14157106 - 14157174
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14157106 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgtctatgttgctgttg 14157174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11661391 - 11661322
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  11661391 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 11661322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084064
Alignment:
Q  165 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 15084064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16008655 - 16008592
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  16008655 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 16008592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 16583352 - 16583277
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16583352 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagt 16583277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38519491 - 38519422
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38519491 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 38519422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 10501425 - 10501493
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  10501425 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10501493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 15605270 - 15605358
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaatt-gatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  15605270 atcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagt 15605358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14566279 - 14566216
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  14566279 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 14566216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18872437 - 18872374
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  18872437 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 18872374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16996338 - 16996272
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  16996338 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctacgttgctgttgt 16996272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14422069 - 14422000
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  14422069 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttactgttgt 14422000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 14981543 - 14981592
Alignment:
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14981543 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 14981592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Original strand, 15411019 - 15411068
Alignment:
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15411019 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 15411068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18607572 - 18607503
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18607572 agttgatgttgattatcatttgatatttttatatattgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18607503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Original strand, 9751794 - 9751847
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9751794 ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9751847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20619491 - 20619430
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  20619491 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgt 20619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9593452 - 9593367
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9593452 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 9593367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18203929 - 18203861
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  18203929 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgtctatgttgttgttgtt 18203861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 130827 - 130888
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  130827 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttctgtgctgcctatgttgatgttgt 130888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 837364 - 837401
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837364 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 1202544 - 1202581
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1202544 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 11525574 - 11525635
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11525574 ttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 11525635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16457356 - 16457441
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16457356 atcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 16457441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 9033359 - 9033417
Alignment:
Q  97 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  9033359 attattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttgcctatgttgttgttgt 9033417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 833368 - 833405
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  833368 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 1198548 - 1198585
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1198548 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 2530389 - 2530475
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgat-atgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2530389 atcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 2530475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 16109521 - 16109558
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16109521 tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38828341 - 38828304
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38828341 tgttgattatcatttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 38898196 - 38898241
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38898196 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 19069 - 19142
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  19069 ttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 19142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 88
Target Start/End: Original strand, 2832482 - 2832534
Alignment:
Q  36 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2832482 tgttgatgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2832534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 11987306 - 11987233
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11987306 ttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 11987233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 13918794 - 13918863
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13918794 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 13918863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 8917486 - 8917448
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8917486 gattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 8917448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 12321780 - 12321834
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12321780 gctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagt 12321834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Original strand, 39267954 - 39267992
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39267954 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39267992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 119
Target Start/End: Original strand, 9177667 - 9177700
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9177667 agttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14429960 - 14429907
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||| | ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14429960 ctgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaactaagttgcatgagt 14429907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 88
Target Start/End: Original strand, 16724677 - 16724714
Alignment:
Q  51 attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16724677 attatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 16724714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 88
Target Start/End: Original strand, 17701691 - 17701728
Alignment:
Q  51 attatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17701691 attatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 17701728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 1859085 - 1859169
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||  || | ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1859085 atcaagatgttgttgaaaa-gaattgttattaagct--tgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1859169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 10896712 - 10896748
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10896712 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15167321 - 15167285
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15167321 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15728384 - 15728348
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15728384 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12525 - 12290
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12525 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatt 12426  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12425 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 12326  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  12325 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 12290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43251916 - 43251681
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251916 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 43251817  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttta 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43251816 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 43251717  T
Q  206 agttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43251716 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 43251681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21976668 - 21976908
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21976668 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 21976767  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21976768 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 21976867  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21976868 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 21976908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19278281 - 19278519
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19278281 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 19278380  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19278381 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 19278480  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19278481 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 19278519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 21828030 - 21828252
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828030 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 21828127  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21828128 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 21828227  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  21828228 ctttatattaatattgttatgttgt 21828252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 18862661 - 18862883
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862661 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 18862758  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18862759 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 18862858  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  18862859 ctttatattaatattgttatgttgt 18862883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21972583 - 21972788
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21972583 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 21972682  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21972683 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 21972782  T
Q  201 gtttaa 206  Q
    ||||||    
T  21972783 gtttaa 21972788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21411040 - 21410818
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21411040 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 21410943  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21410942 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 21410843  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  21410842 cttcatattaatattgttatgttgt 21410818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21805532 - 21805310
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805532 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 21805435  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21805434 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 21805335  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  21805334 cttcatattaatattgttatgttgt 21805310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 19808365 - 19808519
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19808365 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgt 19808464  T
Q  187 ggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19808465 ggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgt 19808519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 22238021 - 22238175
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22238021 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtttcttatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22238120  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22238121 tggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgt 22238175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23409914 - 23409759
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23409914 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 23409815  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23409814 tggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgttgt 23409759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23659526 - 23659371
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659526 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23659427  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  23659426 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37515824 - 37515669
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37515824 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatg 37515725  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37515724 tggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgt 37515669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 17461054 - 17461209
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17461054 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtttcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17461153  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17461154 tggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgt 17461209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 232
Target Start/End: Original strand, 16402021 - 16402150
Alignment:
Q  103 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16402021 atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgt 16402120  T
Q  203 ttaagttgttgatgctcttcattaatattg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16402121 ttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18833680 - 18833526
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833680 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatct-gagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18833582  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  18833581 tggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgt 18833526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23914156 - 23914029
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914156 agttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23914057  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23914056 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 14397864 - 14398011
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  14397864 agttgctgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc------ 14397957  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  14397958 --gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgt 14398011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22111899 - 22111799
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22111899 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 22111800  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  22111799 t 22111799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880082
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttg 19880082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478333
Alignment:
Q  152 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgt 23478333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453963
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 26453963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 1327015 - 1327112
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1327015 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 1327112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929644
Alignment:
Q  150 tgttgttggttat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatg 19929644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 25363204 - 25363255
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363204 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 20502104 - 20502172
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  20502104 gttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 17438227 - 17438288
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17438227 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgtttctgttgt 17438288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16231474 - 16231559
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16231474 atcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 16231559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 22963426 - 22963484
Alignment:
Q  97 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  22963426 attattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctatgttgctgttgt 22963484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 17086155 - 17086224
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||    
T  17086155 agttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctattttgcttttgt 17086224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22044991 - 22044906
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22044991 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagttgcatgagt 22044906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22111959 - 22111904
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatg 56  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22111959 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 129
Target Start/End: Original strand, 22253167 - 22253210
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22253167 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Original strand, 5083164 - 5083218
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttg 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  5083164 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 5083218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22995962 - 22995893
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||   ||| || |||||||||||||||    
T  22995962 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctgaatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 22995893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16799605 - 16799561
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16799605 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21383744 - 21383675
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21383744 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21387164 - 21387095
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21387164 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21387095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 30643340 - 30643384
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30643340 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 30643384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 127
Target Start/End: Original strand, 35026868 - 35026903
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35026868 tgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 15603055 - 15603109
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  15603055 gctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 15603109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 215
Target Start/End: Original strand, 22381703 - 22381745
Alignment:
Q  173 tatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 215  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22381703 tatatgcgttatgtgtaagatgtatgatgttgaagttgttgat 22381745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23834277 - 23834194
Alignment:
Q  3 caagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||| || |||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23834277 caagaaattgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 23834194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22525662 - 22525633
Alignment:
Q  102 catttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525662 catttgatattgttatatcttgagatgttt 22525633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Original strand, 23943995 - 23944060
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctg 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  23943995 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttaatgtgctgcatatgttgctg 23944060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 14103226 - 14103262
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14103226 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23667910 - 23667859
Alignment:
Q  103 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||    
T  23667910 atttgatattgttatatcttgagatggttatgtgctg-ccatgttgctgttgt 23667859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44476789 - 44476753
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44476789 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44480051 - 44480015
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44480051 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 5099 - 5339
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5099 atcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgatta 5198  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5199 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 5298  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  5299 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20295955 - 20295715
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20295955 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 20295856  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20295855 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 20295756  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20295755 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 20295715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19472718 - 19472958
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgatta 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19472718 atcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgatta 19472817  T
Q  101 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19472818 tcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgat 19472917  T
Q  201 gtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19472918 gtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 19472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723799
Alignment:
Q  23 attgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaatattgatatatctt 40723706  T
Q  123 gagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 215  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40723707 gagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 40723799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10753454 - 10753232
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10753454 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 10753357  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10753356 tatcttgagatgtttacatgttgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 10753257  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||| ||||||||    
T  10753256 cttcatattaatattgctatgttgt 10753232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18356315 - 18356160
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356315 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18356216  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18356215 tggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 18356160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 20910918 - 20911073
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20910918 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 20911017  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20911018 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 20911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 22107436 - 22107591
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107436 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatg 22107535  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22107536 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 22107591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 15236921 - 15237073
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236921 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 15237020  T
Q  189 aagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15237021 aagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 15237073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 33895665 - 33895802
Alignment:
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33895665 tttgatattgttgtatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtt 33895764  T
Q  204 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33895765 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 33895802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6765947 - 6765792
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6765947 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatg 6765848  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6765847 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgt 6765792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Original strand, 15236783 - 15236925
Alignment:
Q  6 gaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236783 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatt 15236882  T
Q  106 tgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttg 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15236883 tgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 15236925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29448125 - 29447967
Alignment:
Q  84 tgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 182  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29448125 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgcctt 29448026  T
Q  183 atgtggaagatgtatgatgtttaagttg-ttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29448025 atgtggaa-atgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgt 29447967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010978
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 17010978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263110
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 263110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 23535601 - 23535672
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23535601 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 23535672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 213
Target Start/End: Original strand, 20910851 - 20910925
Alignment:
Q  138 tgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20910851 tgtctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18356379 - 18356308
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18356379 ctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 17410548 - 17410461
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17410548 atcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17410461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42960653 - 42960590
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  42960653 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttg 42960590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 28371031 - 28371094
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  28371031 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 28371094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 37598892 - 37598955
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  37598892 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 37598955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Original strand, 30138930 - 30138979
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30138930 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22336678 - 22336615
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||    
T  22336678 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22336615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22340216 - 22340153
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||    
T  22340216 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttg 22340153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23469921 - 23469853
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23469921 agttgatgttgattatcatttgatatggt-atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23469853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Original strand, 26740650 - 26740717
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  26740650 tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgtttatgcactgtctatgttgctgttgtt 26740717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10816515 - 10816453
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||| ||||||||    
T  10816515 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctacctatgatgctgttg 10816453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18774310 - 18774225
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18774310 atcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 18774225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Original strand, 26732841 - 26732904
Alignment:
Q  93 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||||||    
T  26732841 gttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtt 26732904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18784150 - 18784068
Alignment:
Q  4 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18784150 aagaaattgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 18784068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23538541 - 23538504
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23538541 tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 20911185 - 20911254
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20911185 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 20911254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 21366713 - 21366757
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21366713 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 21366757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Original strand, 27988934 - 27988978
Alignment:
Q  87 gttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27988934 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 88
Target Start/End: Original strand, 17517259 - 17517294
Alignment:
Q  53 tatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517259 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 17517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15796533 - 15796471
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||| || |||||||||||||    
T  15796533 tgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 15796471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 24767588 - 24767634
Alignment:
Q  38 ttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 84  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24767588 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 25576857 - 25576902
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25576857 agttgatgttgattattatt-gatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Original strand, 21328217 - 21328282
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctg 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||  ||| || |||||||||||    
T  21328217 agttgatgttgattatcatttgatattgctatatctgaatatgtttttgtgctgcctatgttgctg 21328282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4036279 - 4036243
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4036279 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18356048 - 18355979
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18356048 aaatgaattgttattaaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18355979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20232646 - 20232577
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 84  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20232646 ttgagaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22750300 - 22750264
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22750300 agttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 25229452 - 25229488
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25229452 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293644
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25293608 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26680650 - 26680606
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26680650 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26680606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26952257 - 26952213
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26952257 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26952213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 41861455 - 41861523
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||||||||||||    
T  41861455 agttgatggtgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 41861523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 42805515 - 42805442
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42805515 ttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagt 42805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 35956 - 36180
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35956 aaattaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 36055  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36056 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 36155  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    | |||||||||||||||||    
T  36156 cttcataataatattgttatgttgt 36180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 36102 - 36324
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36102 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 36199  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36200 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 36299  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  36300 ctttatattaatattgttatgttgt 36324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53673 - 53586
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  53673 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 53586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 189393 - 189615
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189393 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 189490  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  189491 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgata 189590  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  189591 ctttatattaatattgttatgttgt 189615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 221208 - 221275
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  221208 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgtagctgtt 221275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Original strand, 24977 - 25053
Alignment:
Q  10 ttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24977 ttattgaaaatgtgttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactgagttgcatgagt 25053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 11517 - 11739
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 11614  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11615 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgata 11714  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  11715 cttcatattaatattgttatgttgt 11739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 14103 - 14325
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 116  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtta 14200  T
Q  117 tatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  14201 tatcttgatatgtttacgtgtcgcctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgata 14300  T
Q  217 ctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||    
T  14301 ctttatattaatattgttatgttgt 14325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 541 - 318
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtt 115  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  541 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgctattgttatttaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgtt 444  T
Q  116 atatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgat 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  443 atatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgat 344  T
Q  216 gctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||   ||||||||||||||||||||    
T  343 gcttcacattaatattgttatgttgt 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4513 - 4454
Alignment:
Q  29 attaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4513 attatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagt 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 816
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  971 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 872  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  871 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 263
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaa-ctaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgt 114  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487 aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgt 390  T
Q  115 tatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  389 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttga 290  T
Q  215 tgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    | ||    |||||||||||||||||||    
T  289 tacttcatattaatattgttatgttgt 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 241
Target Start/End: Original strand, 32719 - 32898
Alignment:
Q  62 attgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggtta 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  32719 attgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggtta 32818  T
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  32819 tgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgt 32898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39371 - 39216
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 39272  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39271 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 39216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 169751 - 169906
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169751 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 169850  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169851 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 169906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 142692 - 142631
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  142692 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 142631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 126074 - 125919
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 125975  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  125974 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 125919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 53846 - 53995
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53846 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaa 53945  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53946 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 53995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 73815 - 73859
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73815 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 73859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21285 - 21130
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21186  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  21185 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgt 21130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 120127 - 119972
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120127 agttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 120028  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  120027 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgt 119972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31242 - 31089
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31242 agttgttgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 31143  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  31142 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 31089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17692 - 17560
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17692 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17593  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgct 17560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 523
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  678 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctttctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 579  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  578 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgt 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7098
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6943 agttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatg 7042  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7043 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 123
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  278 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttagg 179  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  178 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgt 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1449
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1294 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 1393  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 20212 - 20367
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20212 agttgttgttgattagcatttgatattgttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 20311  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  20312 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 20367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17621 - 17552
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||    
T  17621 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctaagttgctgttgt 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 20479 - 20546
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20479 aaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Original strand, 207587 - 207740
Alignment:
Q  88 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207587 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 207686  T
Q  188 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  207687 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgt 207740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 207880 - 207931
Alignment:
Q  35 ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  207880 ctgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 232
Target Start/End: Original strand, 80420 - 80564
Alignment:
Q  88 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  80420 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtg 80519  T
Q  188 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  80520 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15861 - 15705
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatat-ttatatgccttat 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  15861 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttat 15762  T
Q  185 gtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15761 gtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgt 15705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2031
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1876 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 1975  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1976 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgt 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Original strand, 24599 - 24751
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24599 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatc 24698  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24699 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgct-ttcattaatattgttatgtt 24751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 387
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  530 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa 431  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtta 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  430 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgtta 387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Original strand, 6904 - 7053
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6904 agttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatg 7003  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgtta 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7004 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgtta 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 10092 - 10241
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10092 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 10191  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  10192 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgt 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 15471 - 15548
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgct 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471 ctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgct 15548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36299 - 36230
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  36299 agttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 36230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 67379 - 67225
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  67379 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttggg-tgtttacgtgctgcttatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatg 67281  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67280 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 67225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 85664 - 85509
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  85664 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatg 85565  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85564 tggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 85509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 228384 - 228457
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  228384 ttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 228457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 2751 - 2870
Alignment:
Q  122 tgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctctt 221  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2751 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctttt 2850  T
Q  222 cattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2851 cattaatattgttatgttgt 2870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 241
Target Start/End: Original strand, 67397 - 67539
Alignment:
Q  98 ttatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67397 ttatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgttt 67495  T
Q  198 gatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  67496 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 67539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6291
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6161 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 6260  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 216  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6261 tggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 3335 - 3484
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  | |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  3335 tgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaa 3434  T
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3435 atgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20869 - 20769
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 20770  T
Q  186 t 186  Q
    |    
T  20769 t 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 639 - 501
Alignment:
Q  104 tttgatattgttatatcttgagatgttt-acgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgt 202  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  639 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgt 540  T
Q  203 ttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  539 ttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15116 - 14965
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15116 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacatgtggcctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 15017  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
     | || |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||    
T  15016 ggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatg 14965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4283
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 4283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7952 - 7799
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7952 agttgatgttgcttattatttgatattgttatatct-gagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 7854  T
Q  186 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||| |||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  7853 tggaaaatgtatgaag-ttaagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgt 7799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 71365 - 71265
Alignment:
Q  141 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  71365 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 71266  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  71265 t 71265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 105193 - 105078
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  105193 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaa 105094  T
Q  192 atgtatgatgtttaag 207  Q
    ||||||||||||||||    
T  105093 atgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Original strand, 4271 - 4383
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4271 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatg 4370  T
Q  186 tggaagatgtatg 198  Q
    ||||| |||||||    
T  4371 tggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6905
Alignment:
Q  183 atgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 6905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1322
Alignment:
Q  146 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgt 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8073
Alignment:
Q  146 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgt 8073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 15259 - 15303
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15259 tgatctgaatatgatgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 15303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5711
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgt 5711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70627
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 70627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22568
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 22568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33171
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttg 33171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10474
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt-agtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 10474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 18630 - 18717
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18630 atcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagt 18717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4283
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgt 4283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 66413 - 66500
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  66413 atcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 66500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 75830 - 75897
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgtt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  75830 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctacgttgctgtt 75897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 10859 - 10956
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10859 tgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcttatattgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcattatgtgga 10956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2013 - 1944
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  2013 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 36038 - 36135
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 189  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36038 tgttgattattttttgatgttcttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15550
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatg 15550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13012 - 12925
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13012 atcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 12925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19296 - 19209
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19296 atcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 19209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166501
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatg 166501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 15240 - 15310
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  15240 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctattgtt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7638
Alignment:
Q  164 tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatg 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3376 - 3307
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  3376 agttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttgt 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8150 - 8082
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  8150 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcatatgttgctgttg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56936
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatg 56936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 110764 - 110701
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  110764 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttg 110701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 15067 - 15117
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15067 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6730 - 6684
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6730 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 20016 - 20099
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatga 86  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20016 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 173395 - 173313
Alignment:
Q  4 aagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  173395 aagaaattgttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 173313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgtt 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 762 - 831
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||    
T  762 agttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgcctatgttgttgttgt 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3917
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  3986 agttgatgttgattatcatttggtaatgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Original strand, 9728 - 9791
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  9728 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctgcctatgttgttgttgt 9791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11259 - 11196
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  11259 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22359 - 22296
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  22359 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 22296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 2686 - 2757
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2686 aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagt 2757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30451 - 30381
Alignment:
Q  86 agttgttg-ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  30451 agttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgt 30381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29323 - 29261
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||    
T  29323 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgttattgtgttgtctatgttgttgttg 29261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 133035 - 132989
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  133035 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 988
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1049 ttgattattatttgacattcttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 18169 - 18238
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||    
T  18169 agttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgttgttgt 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10592 - 10524
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  10592 agttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29791 - 29723
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||| |||||    
T  29791 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgttattgtgttgtctatgttgttgttg 29723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Original strand, 206528 - 206596
Alignment:
Q  89 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttacgtgttgtctatgttgctgttgtt 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  206528 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtt 206596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8972
Alignment:
Q  162 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  || ||  ||||| |||||||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgt 8972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7560
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7499 ttgattattatttgacattgatatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10282 - 10213
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  10282 agttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgtttatgtgctgcttatgttgctgttgt 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6883
Alignment:
Q  192 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 6883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6771 - 6702
Alignment:
Q  17 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||  |||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6771 aaatgaattgttattaagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 6702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 48440 - 48403
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48440 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 146298 - 146261
Alignment:
Q  92 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146298 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 697
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  766 agttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 235 - 183
Alignment:
Q  36 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  235 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 18371 - 18444
Alignment:
Q  13 ttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18371 ttgaaaatgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3614
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3529 atcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 3614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 241
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13533
Alignment:
Q  198 gatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgt 13533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 17150 - 17204
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17150 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagt 17204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9591 - 9537
Alignment:
Q  34 gctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9591 gctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagt 9537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 3006
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||    
T  3067 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctacctatgttgttgttgt 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 417
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  461 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2981 - 2933
Alignment:
Q  36 tgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 84  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2981 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 6357 - 6401
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6357 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 2133 - 2177
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2133 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5704 - 5610
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |       |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5704 atcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 5610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6805
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |       |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6899 atcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1562 - 1518
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1562 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 1518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 42695 - 42651
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42695 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 42651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1820 - 1785
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatct 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1820 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 13485 - 13568
Alignment:
Q  1 atcaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 84  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||||||| | |||| ||||||||    
T  13485 atcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1403
Alignment:
Q  150 tgttgttggttatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 237  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || |  || ||||||||||||||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatg 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 10085 - 10131
Alignment:
Q  38 ttgatatgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcat 84  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10085 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 88
Target Start/End: Original strand, 6046 - 6084
Alignment:
Q  50 gattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6046 gattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 6084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7540 - 7481
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7540 ttgattattatttgacattgttatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14659 - 14600
Alignment:
Q  94 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  14659 ttgattattatttgacattgttatatctt--gatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 14600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 130 - 101
Alignment:
Q  98 ttatcatttgatattgttatatcttgagat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130 ttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2782 - 2737
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  2782 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 132
Target Start/End: Original strand, 55704 - 55733
Alignment:
Q  103 atttgatattgttatatcttgagatgttta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55704 atttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Original strand, 663 - 699
Alignment:
Q  86 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatctt 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  663 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15155 - 15111
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15155 tgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 357 - 313
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  357 tgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 29443 - 29494
Alignment:
Q  103 atttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctatgttgctgttgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||    
T  29443 atttgatattgttatatcttgagaagtttatgtgctg-ccatgttgctgttgt 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 30791 - 30835
Alignment:
Q  44 tgatccgattatgatgctattgttattaaactaagttgcatgagt 88  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  30791 tgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 30835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University