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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1242_low_4 (Length: 713)

Name: NF1242_low_4
Description: NF1242
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1242_low_4
NF1242_low_4
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (15-706)||(22364256-22364963)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 22364963 - 22364256
Alignment:
Q  15 caacgatatttttggacatagttcaaatatcacattttttatgaccaaaccatgatattttcagttttagaagtttagaatagggatagggattgtgttt 114  Q
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T  22364963 caacgacatttttggacatagttcaaatatcacattttttatgaccaaaccatgatattttcagttttggaagtttagaatagggatagggattgtgttt 22364864  T
Q  115 gtagttacactaatcaatttgaggaatgactcttctttgtgcaatattttattctgaattctttctaaatatatttatagtgaaaaatatatatgacaaa 214  Q
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T  22364863 gtagttacactaatcaatttgaggaatgactcttctttgtgcaatattttattttgaattctttttaaatatatttatagtgacaaatatatatgacaaa 22364764  T
Q  215 ttgttaatcttttgctcacaattgtttgaaattaaattattatttggagtctatgcattaaatttgttgccaacattgtgtattgggtctatacatttca 314  Q
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T  22364763 ttgttaatcttttgctcacaattgtttgaaattaaattattatttggagtctattcattaaatttgttgccaacattgtgtattgggtctatacatttca 22364664  T
Q  315 ttgtgtaagagtttatgtttatgatgatgataattg-----------------aaacctcttattcatagttaagagtttgtttgaattgtgaaaatctt 397  Q
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T  22364663 ttgtgtaagagtttatgtttatgatgatgataattgaaatgaaaccatctatcaaacctctaattcatagttaagagtttgtttgaattgtgaaaatctt 22364564  T
Q  398 gaaacttatgtgtatttaaacaaacttatgaaggnnnnnnngttccaccccacgataatattcgatcatttacaatgtacaacactccattacataaacc 497  Q
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T  22364563 gaaacttatgtgtatctaaacaaacttatgaaggaaaaaaa-ttccaccccacgataatattagatcatttacaatgtacaacactccattacataaacc 22364465  T
Q  498 ggtcatgcaatattttgcatggggtccgtatttttattaagtgatcatgcaattgtatctcagctctaagacatactccttttcttttctttcttcaaac 597  Q
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T  22364464 gatcatgcaatagtttgcatggggtccgtatttttattaagtgatcatgcaattgtatctcagctctaagacatactccttttcttttctttcttcaaac 22364365  T
Q  598 cgtaggtttcaattgtttggatggcttggaatgaataccatcattacaaacacatttctcatgtatttctatattattcaaagaccatcatcatttatcc 697  Q
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T  22364364 tgtaggtttcaattgtttggatggcttggaatgaataccatcattacaaacacatttctcatgtatttctatattattcaaagaccatcatcatttatcc 22364265  T
Q  698 cctatgata 706  Q
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T  22364264 cctatgata 22364256  T

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