View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1242_low_43 (Length: 363)

Name: NF1242_low_43
Description: NF1242
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1242_low_43
NF1242_low_43
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (6-268)||(1205123-1205389)
chr8 (68-268)||(1149426-1149626)
chr8 (51-269)||(43643372-43643590)
chr8 (51-268)||(37970296-37970513)
chr8 (64-268)||(16446665-16446869)
chr8 (51-268)||(4132463-4132680)
chr8 (64-268)||(7890747-7890951)
chr8 (51-265)||(23854209-23854422)
chr8 (72-266)||(27082636-27082830)
chr8 (57-265)||(33906411-33906617)
chr8 (64-268)||(1953778-1953982)
chr8 (51-268)||(5299723-5299940)
chr8 (57-265)||(16223062-16223273)
chr8 (64-268)||(44869693-44869897)
chr8 (68-265)||(8803610-8803808)
chr8 (63-259)||(35459500-35459696)
chr8 (64-265)||(38644177-38644378)
chr8 (72-268)||(11727220-11727416)
chr8 (68-268)||(40862615-40862816)
chr8 (64-267)||(30654373-30654576)
chr8 (68-248)||(34895178-34895358)
chr8 (64-268)||(12876305-12876510)
chr8 (81-268)||(6098320-6098512)
chr8 (64-268)||(36694756-36694960)
chr8 (65-234)||(12587812-12587981)
chr8 (64-268)||(31933676-31933880)
chr8 (64-238)||(35859160-35859334)
chr8 (110-268)||(1149756-1149910)
chr8 (103-268)||(9864344-9864509)
chr8 (64-268)||(39098909-39099113)
chr8 (58-269)||(10554988-10555197)
chr8 (64-237)||(466059-466232)
chr8 (64-237)||(34951847-34952020)
chr8 (74-216)||(24823194-24823336)
chr8 (68-203)||(33198063-33198198)
chr8 (51-268)||(18259279-18259492)
chr8 (150-268)||(13307819-13307936)
chr8 (51-163)||(41362723-41362835)
chr8 (143-234)||(34463704-34463792)
chr8 (72-164)||(43025974-43026066)
chr8 (180-268)||(41910895-41910982)
chr8 (194-268)||(43025898-43025972)
chr8 (187-264)||(7998478-7998555)
chr8 (68-111)||(41910852-41910895)
chr8 (68-112)||(13307931-13307975)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (57-269)||(18797498-18797710)
chr7 (51-265)||(31578836-31579050)
chr7 (51-268)||(37703270-37703487)
chr7 (64-268)||(9355611-9355815)
chr7 (52-268)||(17842357-17842573)
chr7 (64-267)||(24211914-24212118)
chr7 (52-268)||(37110046-37110262)
chr7 (57-268)||(23111364-23111575)
chr7 (68-267)||(30055700-30055899)
chr7 (64-265)||(46480914-46481115)
chr7 (57-264)||(29173699-29173905)
chr7 (72-265)||(32820846-32821039)
chr7 (35-261)||(35353287-35353517)
chr7 (64-264)||(31520526-31520726)
chr7 (64-268)||(10358999-10359203)
chr7 (64-268)||(15612544-15612748)
chr7 (64-268)||(37347193-37347397)
chr7 (51-268)||(10481777-10481994)
chr7 (64-268)||(32432624-32432828)
chr7 (68-268)||(27283916-27284118)
chr7 (64-266)||(8861459-8861661)
chr7 (85-268)||(11071378-11071558)
chr7 (68-265)||(41764867-41765064)
chr7 (64-268)||(6546691-6546895)
chr7 (72-268)||(25691337-25691533)
chr7 (64-264)||(26980482-26980682)
chr7 (64-268)||(21991808-21992003)
chr7 (64-268)||(15672544-15672751)
chr7 (63-265)||(48928081-48928283)
chr7 (63-268)||(4583091-4583296)
chr7 (51-268)||(7334966-7335182)
chr7 (51-248)||(44411312-44411509)
chr7 (64-268)||(5657265-5657470)
chr7 (68-264)||(32592996-32593191)
chr7 (64-268)||(26587877-26588073)
chr7 (68-264)||(12390438-12390632)
chr7 (79-269)||(43925272-43925456)
chr7 (109-244)||(12165939-12166074)
chr7 (72-203)||(22687468-22687599)
chr7 (51-235)||(37704387-37704571)
chr7 (64-268)||(44598838-44599042)
chr7 (169-268)||(38258717-38258816)
chr7 (70-224)||(34361967-34362123)
chr7 (134-265)||(33688117-33688248)
chr7 (150-268)||(43686212-43686330)
chr7 (150-264)||(38053637-38053751)
chr7 (52-152)||(38258867-38258967)
chr7 (210-268)||(37704329-37704387)
chr7 (188-265)||(48928473-48928550)
chr7 (64-114)||(12166215-12166265)
chr7 (133-197)||(27421219-27421283)
chr7 (212-268)||(27421313-27421369)
chr7 (51-87)||(23402047-23402083)
chr7 (64-105)||(33688077-33688118)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (52-268)||(46297534-46297750)
chr3 (65-264)||(11357166-11357365)
chr3 (52-265)||(26941032-26941245)
chr3 (64-267)||(21009585-21009789)
chr3 (68-268)||(42505863-42506063)
chr3 (52-268)||(1089882-1090097)
chr3 (64-268)||(22622502-22622706)
chr3 (64-268)||(40552043-40552247)
chr3 (68-268)||(48355129-48355329)
chr3 (65-268)||(52040707-52040910)
chr3 (65-268)||(53228937-53229140)
chr3 (64-268)||(39282840-39283044)
chr3 (64-268)||(44891685-44891889)
chr3 (72-267)||(47481711-47481907)
chr3 (51-268)||(3362443-3362660)
chr3 (64-268)||(37203255-37203460)
chr3 (64-268)||(4015648-4015851)
chr3 (64-264)||(33378569-33378769)
chr3 (72-267)||(54505996-54506192)
chr3 (64-268)||(37157895-37158100)
chr3 (72-268)||(7327274-7327470)
chr3 (64-268)||(33698341-33698545)
chr3 (57-268)||(24707892-24708103)
chr3 (64-268)||(2008120-2008331)
chr3 (103-268)||(34133123-34133288)
chr3 (64-268)||(32373658-32373861)
chr3 (70-268)||(4761438-4761636)
chr3 (74-264)||(22451160-22451350)
chr3 (64-269)||(22445849-22446054)
chr3 (64-259)||(21193803-21193999)
chr3 (51-252)||(51212548-51212743)
chr3 (64-244)||(29099558-29099739)
chr3 (64-268)||(36012326-36012532)
chr3 (68-268)||(25579927-25580127)
chr3 (68-264)||(40936165-40936361)
chr3 (109-268)||(46994490-46994649)
chr3 (52-248)||(43975664-43975863)
chr3 (79-248)||(44186316-44186485)
chr3 (79-269)||(24488761-24488951)
chr3 (63-268)||(3654982-3655190)
chr3 (64-237)||(14586464-14586636)
chr3 (64-244)||(29164021-29164194)
chr3 (52-268)||(11356930-11357138)
chr3 (51-265)||(20373034-20373229)
chr3 (125-268)||(54828546-54828689)
chr3 (64-268)||(11467012-11467202)
chr3 (72-264)||(27480150-27480350)
chr3 (103-257)||(38591897-38592051)
chr3 (79-246)||(50475021-50475195)
chr3 (141-267)||(45174695-45174821)
chr3 (150-265)||(43348448-43348563)
chr3 (141-267)||(11835494-11835614)
chr3 (143-251)||(53811597-53811701)
chr3 (68-126)||(35844577-35844635)
chr3 (207-267)||(35844516-35844575)
chr3 (53-95)||(13498678-13498720)
chr3 (226-268)||(53176242-53176284)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (51-269)||(879345-879563)
chr4 (52-268)||(3042816-3043032)
chr4 (52-268)||(6864232-6864448)
chr4 (51-269)||(25184309-25184527)
chr4 (68-268)||(37663555-37663755)
chr4 (73-268)||(1815498-1815693)
chr4 (68-267)||(19089267-19089466)
chr4 (66-269)||(33341594-33341797)
chr4 (52-268)||(35020829-35021049)
chr4 (64-267)||(32912389-32912593)
chr4 (64-268)||(33816326-33816530)
chr4 (64-265)||(28002796-28002997)
chr4 (63-275)||(7152013-7152225)
chr4 (64-267)||(34361301-34361505)
chr4 (64-268)||(7703706-7703910)
chr4 (64-268)||(19440458-19440662)
chr4 (64-268)||(49376164-49376368)
chr4 (64-268)||(50697438-50697643)
chr4 (64-268)||(47253937-47254141)
chr4 (63-265)||(32579646-32579848)
chr4 (78-268)||(55477715-55477905)
chr4 (51-268)||(36493486-36493703)
chr4 (64-269)||(55240915-55241120)
chr4 (64-260)||(46887968-46888163)
chr4 (70-268)||(50764917-50765115)
chr4 (52-268)||(17173487-17173703)
chr4 (52-265)||(23761271-23761484)
chr4 (64-268)||(17167910-17168114)
chr4 (68-268)||(25700870-25701070)
chr4 (68-244)||(37775879-37776055)
chr4 (68-268)||(37287925-37288126)
chr4 (68-264)||(29584014-29584210)
chr4 (68-267)||(26896285-26896485)
chr4 (82-268)||(34947923-34948111)
chr4 (68-264)||(17272165-17272361)
chr4 (52-230)||(32592319-32592497)
chr4 (68-244)||(30002455-30002631)
chr4 (64-265)||(27396816-27397015)
chr4 (64-237)||(39400236-39400409)
chr4 (68-267)||(42199927-42200127)
chr4 (52-269)||(46883911-46884124)
chr4 (38-266)||(5047746-5047978)
chr4 (52-233)||(4205216-4205397)
chr4 (66-203)||(35025379-35025515)
chr4 (54-269)||(4934012-4934217)
chr4 (64-244)||(4598203-4598383)
chr4 (64-229)||(9139465-9139628)
chr4 (64-194)||(23431826-23431956)
chr4 (150-265)||(38012054-38012169)
chr4 (72-159)||(38012568-38012655)
chr4 (188-265)||(35025530-35025607)
chr4 (161-226)||(56050169-56050234)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (52-267)||(6090953-6091169)
chr6 (64-268)||(3879722-3879926)
chr6 (64-267)||(5627589-5627793)
chr6 (64-267)||(1946032-1946237)
chr6 (72-265)||(20768282-20768475)
chr6 (52-265)||(7234803-7235019)
chr6 (76-268)||(21016913-21017099)
chr6 (85-265)||(4318626-4318806)
chr6 (64-267)||(8513426-8513622)
chr6 (64-244)||(33892795-33892975)
chr6 (64-265)||(29182364-29182562)
chr6 (68-264)||(33619026-33619230)
chr6 (52-212)||(7054543-7054704)
chr6 (79-259)||(6089109-6089282)
chr6 (179-268)||(30353256-30353345)
chr6 (207-267)||(7055141-7055201)
chr6 (84-139)||(33724062-33724117)
chr6 (196-268)||(15491812-15491884)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (51-264)||(24886288-24886501)
chr5 (64-268)||(22255379-22255583)
chr5 (51-269)||(22973843-22974061)
chr5 (52-265)||(2888207-2888420)
chr5 (64-268)||(699347-699551)
chr5 (64-268)||(38528011-38528215)
chr5 (64-267)||(31786420-31786623)
chr5 (57-268)||(35504562-35504773)
chr5 (51-269)||(22980989-22981207)
chr5 (63-268)||(35826259-35826462)
chr5 (52-269)||(31705374-31705591)
chr5 (80-268)||(5830089-5830278)
chr5 (64-269)||(7208638-7208843)
chr5 (57-268)||(17157798-17158009)
chr5 (51-268)||(27318249-27318465)
chr5 (63-265)||(33908433-33908634)
chr5 (64-268)||(15992314-15992518)
chr5 (64-268)||(8437162-8437366)
chr5 (64-268)||(19120056-19120260)
chr5 (64-248)||(35511256-35511440)
chr5 (52-268)||(36860621-36860837)
chr5 (52-268)||(36866959-36867175)
chr5 (52-268)||(40133582-40133798)
chr5 (64-267)||(35934094-35934297)
chr5 (50-267)||(8741645-8741863)
chr5 (51-268)||(5837752-5837969)
chr5 (68-268)||(23116008-23116200)
chr5 (51-268)||(12910552-12910769)
chr5 (64-269)||(30969097-30969303)
chr5 (64-244)||(25669797-25669977)
chr5 (68-264)||(27330505-27330701)
chr5 (64-244)||(42342942-42343122)
chr5 (64-251)||(25889584-25889771)
chr5 (52-267)||(13956126-13956339)
chr5 (64-268)||(25500700-25500904)
chr5 (64-254)||(14409115-14409305)
chr5 (64-244)||(7693442-7693622)
chr5 (64-268)||(39573016-39573212)
chr5 (64-244)||(22019844-22020024)
chr5 (114-264)||(1428983-1429136)
chr5 (72-266)||(15724687-15724881)
chr5 (64-237)||(43308434-43308607)
chr5 (64-244)||(9200445-9200625)
chr5 (64-261)||(8466931-8467127)
chr5 (63-268)||(21088541-21088744)
chr5 (64-244)||(32563361-32563541)
chr5 (67-203)||(28416328-28416464)
chr5 (64-269)||(14919313-14919507)
chr5 (51-269)||(23954563-23954768)
chr5 (64-200)||(26269074-26269210)
chr5 (51-166)||(43254154-43254269)
chr5 (138-268)||(6824329-6824457)
chr5 (207-268)||(26268271-26268332)
chr5 (220-268)||(11898151-11898199)
chr5 (226-268)||(5112250-5112292)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (52-268)||(32216248-32216464)
chr1 (51-269)||(10922919-10923137)
chr1 (51-267)||(23999541-23999758)
chr1 (64-267)||(46931603-46931807)
chr1 (64-265)||(30254619-30254820)
chr1 (68-265)||(37451481-37451678)
chr1 (64-268)||(2959941-2960145)
chr1 (57-268)||(8222321-8222532)
chr1 (57-261)||(16415846-16416050)
chr1 (64-267)||(19899547-19899751)
chr1 (68-268)||(32267227-32267427)
chr1 (68-265)||(28564566-28564761)
chr1 (51-269)||(47682260-47682478)
chr1 (68-268)||(9902837-9903037)
chr1 (72-268)||(28769846-28770042)
chr1 (54-268)||(51129052-51129264)
chr1 (64-253)||(14758240-14758429)
chr1 (64-265)||(15168292-15168493)
chr1 (64-264)||(11742147-11742347)
chr1 (80-268)||(27227280-27227468)
chr1 (80-268)||(27266995-27267183)
chr1 (64-268)||(48353736-48353939)
chr1 (78-268)||(25160825-25161016)
chr1 (64-267)||(38823408-38823611)
chr1 (72-268)||(15383126-15383323)
chr1 (52-268)||(4330474-4330690)
chr1 (64-269)||(27532761-27532965)
chr1 (72-268)||(238300-238496)
chr1 (52-268)||(1359703-1359918)
chr1 (68-267)||(27763093-27763293)
chr1 (64-248)||(34012161-34012345)
chr1 (52-265)||(47279385-47279599)
chr1 (63-268)||(22170904-22171109)
chr1 (51-268)||(10181773-10181991)
chr1 (51-268)||(27563671-27563888)
chr1 (64-268)||(7078842-7079046)
chr1 (85-268)||(30326751-30326935)
chr1 (68-267)||(39393578-39393777)
chr1 (52-242)||(3535142-3535332)
chr1 (52-265)||(15752225-15752438)
chr1 (79-264)||(3309350-3309536)
chr1 (72-268)||(42721232-42721425)
chr1 (64-268)||(1547472-1547668)
chr1 (51-247)||(21289817-21290010)
chr1 (63-265)||(40885009-40885212)
chr1 (64-264)||(31621327-31621533)
chr1 (101-268)||(18422844-18423004)
chr1 (113-240)||(37618729-37618856)
chr1 (63-240)||(41926378-41926554)
chr1 (64-224)||(31962853-31963014)
chr1 (64-265)||(33725390-33725580)
chr1 (148-268)||(38759726-38759846)
chr1 (64-134)||(48620916-48620986)
chr1 (51-105)||(38759846-38759900)
chr1 (183-244)||(48620845-48620906)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (52-268)||(2325168-2325384)
chr2 (52-267)||(11366170-11366386)
chr2 (59-268)||(35959093-35959298)
chr2 (68-268)||(43648051-43648251)
chr2 (64-268)||(41961037-41961241)
chr2 (64-268)||(4763828-4764033)
chr2 (64-268)||(19289125-19289329)
chr2 (52-269)||(18494071-18494288)
chr2 (63-268)||(26357774-26357979)
chr2 (63-265)||(41465701-41465903)
chr2 (52-268)||(4167119-4167335)
chr2 (68-264)||(7006744-7006940)
chr2 (51-268)||(19500706-19500921)
chr2 (66-267)||(33709036-33709237)
chr2 (72-268)||(44913861-44914060)
chr2 (64-268)||(3177136-3177340)
chr2 (64-268)||(31862049-31862253)
chr2 (64-243)||(33660179-33660358)
chr2 (58-268)||(33550778-33550992)
chr2 (63-268)||(37905907-37906113)
chr2 (63-248)||(39167170-39167355)
chr2 (64-244)||(5881750-5881930)
chr2 (64-268)||(31570536-31570740)
chr2 (64-268)||(19424444-19424634)
chr2 (64-244)||(43770650-43770830)
chr2 (51-268)||(29241934-29242144)
chr2 (113-268)||(4478562-4478717)
chr2 (103-244)||(27349789-27349930)
chr2 (131-268)||(44286146-44286283)
chr2 (71-253)||(13711671-13711853)
chr2 (112-268)||(4263926-4264083)
chr2 (171-268)||(17071646-17071743)
chr2 (74-200)||(41051112-41051238)
chr2 (160-265)||(45327920-45328025)
chr2 (126-248)||(19314061-19314186)
chr2 (171-268)||(17054005-17054102)
chr2 (72-192)||(41463400-41463520)
chr2 (160-267)||(36642186-36642293)
chr2 (72-162)||(33902317-33902407)
chr2 (64-177)||(18257340-18257453)
chr2 (64-127)||(45328028-45328091)
chr2 (173-265)||(18258198-18258290)
chr2 (191-269)||(41463779-41463857)
chr2 (212-268)||(33902263-33902319)
chr2 (62-136)||(17071571-17071646)
chr2 (62-136)||(17053931-17054005)
chr2 (52-91)||(19093787-19093826)
chr2 (64-109)||(4263711-4263756)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (57-268)||(44154-44364)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (57-268)||(154423-154633)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (68-268)||(8084-8284)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (74-269)||(408223-408418)
scaffold0002 (64-236)||(93885-94056)
scaffold0002 (79-265)||(334-514)
scaffold0002 (228-268)||(94331-94371)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (64-268)||(12106-12309)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (68-267)||(145803-146003)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (51-268)||(267481-267690)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (120-244)||(100948-101058)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1205389 - 1205123
Alignment:
Q  6 gtcgaagaatattggagggaattttgtgtttttattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttatt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1205389 gtcgaaaaatattggagggaattttgtgtttttattttgggagcttctacggtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgtt 1205290  T
Q  102 gtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205289 gtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 1205190  T
Q  202 ttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1205189 ttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtg 1205123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 1149426 - 1149626
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149426 tgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 1149525  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149526 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 1149625  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  1149626 g 1149626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Original strand, 43643372 - 43643590
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43643372 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaa 43643471  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43643472 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtct 43643571  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43643572 taagtgttacactttgtga 43643590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 37970296 - 37970513
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  37970296 tggtgcagtcaggaaagtgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaa 37970395  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37970396 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 37970495  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37970496 taagtgttacactttgtg 37970513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 16446665 - 16446869
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446665 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 16446764  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16446765 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgct 16446864  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  16446865 ttgtg 16446869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 4132463 - 4132680
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4132463 tggtgcagtcagcaaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaa 4132562  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4132563 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct 4132662  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    || |||||||||||||||    
T  4132663 tatgtgttacactttgtg 4132680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 7890747 - 7890951
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890747 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 7890846  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7890847 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacg 7890946  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  7890947 ttgtg 7890951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Original strand, 23854209 - 23854422
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23854209 tggtgtagtcaggaaattga-ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaa 23854307  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23854308 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtct 23854407  T
Q  251 taagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||    
T  23854408 taagtgttacacttt 23854422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 27082636 - 27082830
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27082636 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27082735  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082736 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 27082830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33906617 - 33906411
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33906617 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatc 33906520  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33906519 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtg 33906420  T
Q  257 ttacacttt 265  Q
    |||||||||    
T  33906419 ttacacttt 33906411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 1953778 - 1953982
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1953778 aaactgatttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 1953877  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1953878 gcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacact 1953977  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  1953978 ttgtg 1953982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 5299723 - 5299940
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5299723 tggtgcagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaa 5299822  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||    
T  5299823 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatct 5299922  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5299923 taagtgttacactttgtg 5299940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16223273 - 16223062
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaag---ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16223273 agtcagaaaactgactttttgaaaaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 16223174  T
Q  154 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16223173 atctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaa 16223074  T
Q  254 gtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||    
T  16223073 gtgttacacttt 16223062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44869897 - 44869693
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44869897 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 44869798  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44869797 gcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacact 44869698  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  44869697 ttgtg 44869693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 8803610 - 8803808
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8803610 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgct 8803709  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8803710 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacacttt 8803808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 35459500 - 35459696
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35459500 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35459599  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35459600 tgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgtta 35459696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38644378 - 38644177
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644378 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38644279  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  38644278 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacact 38644179  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  38644178 tt 38644177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11727416 - 11727220
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727416 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 11727317  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11727316 catcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 11727220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40862816 - 40862615
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 166  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40862816 tgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgct 40862717  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862716 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 40862617  T
Q  267 tg 268  Q
    ||    
T  40862616 tg 40862615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 30654373 - 30654576
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  30654373 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaa 30654471  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654472 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 30654571  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  30654572 tttgt 30654576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34895358 - 34895178
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34895358 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgctt 34895259  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34895258 gcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34895178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12876510 - 12876305
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12876510 aaactgacttttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaat 12876411  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgttacac 262  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12876410 gcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacac 12876311  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  12876310 tttgtg 12876305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098512
Alignment:
Q  81 aaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 180  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  181 cttacaggtac-----tattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| ||||     |||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 6098512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 36694756 - 36694960
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36694756 aaactgatttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgat 36694855  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694856 gcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 36694955  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  36694956 ttgtg 36694960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12587981 - 12587812
Alignment:
Q  65 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587981 aactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 12587882  T
Q  165 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587881 cttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 31933676 - 31933880
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31933676 aaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 31933775  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31933776 gtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacact 31933875  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  31933876 ttgtg 31933880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35859334 - 35859160
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35859334 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 35859235  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatatt 238  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859234 gcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149910
Alignment:
Q  110 catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  210 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtg 1149910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864344
Alignment:
Q  103 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  203 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 9864344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 39098909 - 39099113
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39098909 aaactgatttttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39099008  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||    
T  39099009 gcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatact 39099108  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  39099109 ttgtg 39099113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 10554988 - 10555197
Alignment:
Q  58 gtcaaaaaactgactttttt-aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagt--aattca 154  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||||||    
T  10554988 gtcagaaaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattca 10555084  T
Q  155 tctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10555085 tctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aag 10555182  T
Q  255 tgttacactttgtga 269  Q
    ||||||  |||||||    
T  10555183 tgttacgttttgtga 10555197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 466232 - 466059
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466232 aaactgatttttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 466133  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  466132 gcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 466059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 34951847 - 34952020
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34951847 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaag 34951946  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951947 acttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 216
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  74 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  174 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaaca 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33198198 - 33198063
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33198198 tgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgctt 33198099  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  33198098 gcaacattttagacttacatgtactattttatcgtt 33198063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18259492 - 18259279
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||    
T  18259492 tggtgcagtcatgaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataa 18259393  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||  || ||| ||||||  |||||    ||    
T  18259392 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----ct 18259297  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    || |||||||||||||||    
T  18259296 taggtgttacactttgtg 18259279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307819
Alignment:
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  250 ttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtg 13307819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41362835 - 41362723
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41362835 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaa 41362736  T
Q  151 ttcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||    
T  41362735 ttcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  143 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatga 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43026066 - 43025974
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026066 tttttgaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41910982
Alignment:
Q  180 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttgca-tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtg 41910982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025898
Alignment:
Q  194 ttttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtg 43025898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998478
Alignment:
Q  187 ggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 111
Target Start/End: Original strand, 41910852 - 41910895
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  41910852 tgacttttttaaaaaagttaattttaatctgaatgtttgattca 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13307975 - 13307931
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcat 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13307975 tgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18797710 - 18797498
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18797710 agtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 18797611  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797610 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 18797511  T
Q  257 ttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||    
T  18797510 ttacactttgtga 18797498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Original strand, 31578836 - 31579050
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31578836 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaa 31578935  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31578936 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtct 31579035  T
Q  251 taagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||    
T  31579036 taagtgttacacttt 31579050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 37703270 - 37703487
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37703270 tggtgcagtcagtaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaa 37703369  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37703370 ttcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct 37703469  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| |||||||||||    
T  37703470 taagtggtacactttgtg 37703487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 9355611 - 9355815
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9355611 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaat 9355710  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9355711 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 9355810  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  9355811 ttgtg 9355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 17842357 - 17842573
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17842357 ggtgcagtcaagaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 17842456  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17842457 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 17842556  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  17842557 aagtgttacactttgtg 17842573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24212118 - 24211914
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24212118 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 24212019  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24212018 tgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacac 24211919  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  24211918 tttgt 24211914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37110262 - 37110046
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37110262 ggtgcagtcaagaaattgatttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 37110163  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37110162 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtctt 37110063  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  37110062 aagtgttacactttgtg 37110046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23111575 - 23111364
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23111575 agtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttc 23111476  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111475 tagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 23111376  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  23111375 ttacactttgtg 23111364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30055899 - 30055700
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055899 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30055800  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055799 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 30055700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 46480914 - 46481115
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46480914 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 46481013  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481014 gtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 46481113  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  46481114 tt 46481115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29173905 - 29173699
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29173905 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatc 29173806  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173805 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 29173707  T
Q  257 ttacactt 264  Q
    | ||||||    
T  29173706 taacactt 29173699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 265
Target Start/End: Original strand, 32820846 - 32821039
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820846 tttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 32820945  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32820946 catcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttt 32821039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35353517 - 35353287
Alignment:
Q  35 ttttattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattag 130  Q
    |||||||||||||||||    |||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  35353517 ttttattttgggagcttctaaggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgc 35353418  T
Q  131 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  35353417 tgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttg 35353318  T
Q  231 atgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353317 atgatattatgagatagtcttaagtgttaca 35353287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 31520526 - 31520726
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31520526 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 31520625  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520626 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 31520725  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  31520726 t 31520726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 10358999 - 10359203
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10358999 aaactaacttttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaat 10359098  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10359099 gcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacact 10359198  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  10359199 ttgtg 10359203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 15612544 - 15612748
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15612544 aaactgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaat 15612643  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15612644 gcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 15612743  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  15612744 ttgtg 15612748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37347397 - 37347193
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37347397 aaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaat 37347298  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37347297 gcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacact 37347198  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  37347197 ttgtg 37347193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10481994 - 10481777
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  10481994 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaa 10481895  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10481894 ttcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtct 10481795  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10481794 taagtgttacactttgtg 10481777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32432828 - 32432624
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32432828 aaactgacttttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaat 32432729  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32432728 gcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacatt 32432629  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  32432628 ttgtg 32432624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27284118 - 27283916
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaag-ttaattttgatcttattgtttgattc-atttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 165  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284118 tgactttttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 27284019  T
Q  166 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27284018 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacacttt 27283919  T
Q  266 gtg 268  Q
    |||    
T  27283918 gtg 27283916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8861661 - 8861459
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8861661 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaat 8861562  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8861561 gcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacact 8861462  T
Q  264 ttg 266  Q
    |||    
T  8861461 ttg 8861459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071378
Alignment:
Q  85 ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 184  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  185 caggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgtt---gtctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtg 11071378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 41764867 - 41765064
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41764867 tgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgctt 41764966  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41764967 gcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 41765064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6546895 - 6546691
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546895 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 6546796  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||    
T  6546795 gcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatact 6546696  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  6546695 ttgtg 6546691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 25691337 - 25691533
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25691337 ttttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaa 25691436  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25691437 cattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtg 25691533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26980682 - 26980482
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26980682 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaat 26980583  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26980582 acttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 26980483  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  26980482 t 26980482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21992003 - 21991808
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     |    
T  21992003 aaactgacttttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----t 21991913  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21991912 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 21991813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 15672544 - 15672751
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15672544 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaat 15672643  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtac---tattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||   ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15672644 gcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 15672743  T
Q  261 actttgtg 268  Q
    ||||||||    
T  15672744 actttgtg 15672751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Original strand, 48928081 - 48928283
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928081 aaaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 48928180  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  48928181 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacac 48928280  T
Q  263 ttt 265  Q
    |||    
T  48928281 ttt 48928283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4583296 - 4583091
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4583296 aaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaa 4583197  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4583196 tgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacac 4583097  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  4583096 tttgtg 4583091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7335182 - 7334966
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  7335182 tggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaa 7335083  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  7335082 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatct 7334984  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7334983 taagtgttacactctgtg 7334966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 44411312 - 44411509
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  44411312 tggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaa 44411411  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411412 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 5657265 - 5657470
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatctt-attgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657265 aaactgacatttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 5657364  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5657365 tgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacac 5657464  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  5657465 tttgtg 5657470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Original strand, 32592996 - 32593191
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  32592996 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatattt 32593094  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32593095 gtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 26587877 - 26588073
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26587877 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 26587976  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26587977 gcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacact 26588068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Original strand, 12390438 - 12390632
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12390438 tgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggtt 12390537  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12390538 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaagtgttacactt 12390632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43925456 - 43925272
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925456 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43925357  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtga 269  Q
    |||      ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||    
T  43925356 gac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtga 43925272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165939
Alignment:
Q  109 tcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  209 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 12165939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22687599 - 22687468
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22687599 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaa 22687500  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgtt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22687499 catcttggacttacatgtactattttatcgtt 22687468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37704571 - 37704387
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37704571 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaa 37704472  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704471 ttcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44599042 - 44598838
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagt---gattaatgatcaatagtaattcatctagt 160  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44599042 aaactgatttttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagt 44598946  T
Q  161 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 260  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44598945 aatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttac 44598846  T
Q  261 actttgtg 268  Q
    ||||||||    
T  44598845 actttgtg 44598838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258717
Alignment:
Q  169 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 34361967 - 34362123
Alignment:
Q  70 acttttttaaaaaagttaattttga-tctt-attgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  34361967 acttttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgttt 34362066  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 224  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  34362067 gcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688248
Alignment:
Q  134 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  234 atattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacacttt 33688248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686212
Alignment:
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  250 ttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtg 43686212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  250 ttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38258967 - 38258867
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38258967 ggtgcagtcagaaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 38258868  T
Q  152 t 152  Q
    |    
T  38258867 t 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704329
Alignment:
Q  210 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtg 37704329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928550
Alignment:
Q  188 gtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacacttt 48928550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12166265 - 12166215
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattt 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12166265 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 197
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  133 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactatttt 197  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421369
Alignment:
Q  212 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtg 27421369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 87
Target Start/End: Original strand, 23402047 - 23402083
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagtta 87  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402047 tggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagtta 23402083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 105
Target Start/End: Original strand, 33688077 - 33688118
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  33688077 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttt 33688118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 46297534 - 46297750
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46297534 ggtgcagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaat 46297633  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297634 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 46297733  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  46297734 aagtgttacactttgtg 46297750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 264
Target Start/End: Original strand, 11357166 - 11357365
Alignment:
Q  65 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357166 aactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 11357265  T
Q  165 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357266 cttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 11357365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Original strand, 26941032 - 26941245
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26941032 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 26941131  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26941132 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtttt 26941231  T
Q  252 aagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||    
T  26941232 aagtgttacacttt 26941245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 21009585 - 21009789
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21009585 aaactgacttttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 21009684  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009685 tgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 21009784  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  21009785 tttgt 21009789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 42505863 - 42506063
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505863 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 42505962  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505963 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 42506062  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  42506063 g 42506063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1090097 - 1089882
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1090097 ggtgtagtcaggaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 1089998  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  1089997 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtctt 1089899  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  1089898 aagtgttacactttgtg 1089882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 22622502 - 22622706
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622502 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 22622601  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22622602 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgct 22622701  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  22622702 ttgtg 22622706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 40552043 - 40552247
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40552043 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 40552142  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||     
T  40552143 gcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacg 40552242  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  40552243 ttgtg 40552247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48355329 - 48355129
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  48355329 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatactt 48355230  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355229 gcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 48355130  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  48355129 g 48355129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Original strand, 52040707 - 52040910
Alignment:
Q  65 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52040707 aactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatg 52040806  T
Q  165 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52040807 tttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacta 52040906  T
Q  265 tgtg 268  Q
    ||||    
T  52040907 tgtg 52040910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Original strand, 53228937 - 53229140
Alignment:
Q  65 aactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53228937 aactgatttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatg 53229036  T
Q  165 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53229037 cttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactt 53229136  T
Q  265 tgtg 268  Q
    ||||    
T  53229137 tgtg 53229140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39283044 - 39282840
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39283044 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaat 39282945  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39282944 gcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 39282845  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  39282844 ttgtg 39282840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44891889 - 44891685
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44891889 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaat 44891790  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44891789 gcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 44891690  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  44891689 ttgtg 44891685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47481907 - 47481711
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgca 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47481907 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgca 47481808  T
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481807 acatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 47481711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3362660 - 3362443
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3362660 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 3362561  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3362560 ttcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtct 3362461  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3362460 taagtgttacactttgtg 3362443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37203460 - 37203255
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37203460 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 37203361  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203360 gcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 37203261  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  37203260 tttgtg 37203255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4015851 - 4015648
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015851 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 4015752  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  4015751 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaac-aagttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacact 4015653  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  4015652 ttgtg 4015648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 33378569 - 33378769
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378569 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33378668  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33378669 gtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacact 33378768  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  33378769 t 33378769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54506192 - 54505996
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgca 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54506192 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgca 54506093  T
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54506092 acattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 54505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37158100 - 37157895
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37158100 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 37158001  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37158000 gcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 37157901  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  37157900 tttgtg 37157895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 7327274 - 7327470
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327274 ttttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 7327373  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327374 catcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 7327470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33698545 - 33698341
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33698545 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaat 33698446  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33698445 gcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacact 33698346  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  33698345 ttgtg 33698341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 24707892 - 24708103
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24707892 agtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatc 24707991  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  24707992 taataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtg 24708091  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  24708092 ttacactttgtg 24708103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2008331 - 2008120
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta-------atgatcaatagtaattcatc 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| || ||||||    
T  2008331 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatc 2008232  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2008231 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtg 2008132  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  2008131 ttacactttgtg 2008120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133123
Alignment:
Q  103 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  203 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 34133123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32373861 - 32373658
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32373861 aaactgaattttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaat 32373763  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32373762 gcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacact 32373663  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  32373662 ttgtg 32373658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 4761438 - 4761636
Alignment:
Q  70 acttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4761438 actttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgc 4761537  T
Q  170 aacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4761538 aacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtg 4761636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22451160
Alignment:
Q  74 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  174 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacactt 22451160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 22445849 - 22446054
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22445849 aaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaat 22445948  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||     
T  22445949 acttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttataca 22446048  T
Q  264 ttgtga 269  Q
    ||||||    
T  22446049 ttgtga 22446054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21193999 - 21193803
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21193999 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaat 21193900  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtgtta 259  Q
    | ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  21193899 ggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgtta 21193803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Original strand, 51212548 - 51212743
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  51212548 tggtgcagtcagaaaactgacatttttgaaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaa 51212641  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  51212642 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcct 51212741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29099739 - 29099558
Alignment:
Q  64 aaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29099739 aaactgactttttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaa 29099640  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29099639 tgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36012532 - 36012326
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaa-ttttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36012532 aaactgacttttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 36012433  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa-agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36012432 tgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttaca 36012333  T
Q  262 ctttgtg 268  Q
     ||||||    
T  36012332 ttttgtg 36012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25580127 - 25579927
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580127 tgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 25580028  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25580027 gcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgt 25579928  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  25579927 g 25579927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40936361 - 40936165
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40936361 tgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgctt 40936262  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40936261 gcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 40936165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994649
Alignment:
Q  109 tcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  209 ctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 46994649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 43975664 - 43975863
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  43975664 ggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaat 43975763  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaa---agttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  43975764 tcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt 43975863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 44186316 - 44186485
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44186316 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 44186415  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  44186416 gacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 269
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24488951
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtga 269  Q
     |||||| |  |||||||||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtga 24488951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 3654982 - 3655190
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattc-atttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat--ctag 159  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  3654982 aaaactgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctag 3655081  T
Q  160 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3655082 taatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgtta 3655181  T
Q  260 cactttgtg 268  Q
    || ||||||    
T  3655182 cattttgtg 3655190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 14586464 - 14586636
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14586464 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaat 14586563  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14586564 gcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatat 14586636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29164194 - 29164021
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  29164194 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaat 29164102  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29164101 gcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29164021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 11356930 - 11357138
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11356930 ggtgcagtcagacaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaat 11357029  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
            |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   || |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11357030 --------taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtctt 11357121  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
     ||||||||||||||||    
T  11357122 gagtgttacactttgtg 11357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Original strand, 20373034 - 20373229
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20373034 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 20373133  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||                   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20373134 tt-------------------catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttt 20373214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828689
Alignment:
Q  125 gattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  225 aagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtg 54828689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11467202 - 11467012
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||         
T  11467202 aaactgacttttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcta----- 11467115  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11467114 --ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 11467017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 27480150 - 27480350
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg--- 168  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27480150 tttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaa 27480249  T
Q  169 -caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaac----aaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27480250 ttaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacact 27480349  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  27480350 t 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591897
Alignment:
Q  103 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  203 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 257  Q
    |   |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 38591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50475195 - 50475021
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50475195 aaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 50475096  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgata 246  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475095 catcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174695
Alignment:
Q  141 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  241 gtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgt 45174695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348448
Alignment:
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  250 ttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||||| |||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacacttt 43348448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 267
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835614
Alignment:
Q  141 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||      |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  241 gtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgt 11835614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 251
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  143 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg----caaagttgatgatattatgt 53811692  T
Q  243 gatagtctt 251  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35844635 - 35844577
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttga 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844635 tgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844516
Alignment:
Q  207 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgt 35844516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13498720 - 13498678
Alignment:
Q  53 gtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgat 95  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13498720 gtgtagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttgat 13498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176242
Alignment:
Q  226 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 53176242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Original strand, 879345 - 879563
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  879345 tggtgtagtcagaaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataa 879444  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879445 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 879544  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  879545 taaatgttacactttgtga 879563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3043032 - 3042816
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3043032 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaat 3042933  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042932 tcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 3042833  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  3042832 aagtgttacactttgtg 3042816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6864448 - 6864232
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864448 ggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaat 6864349  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864348 tcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 6864249  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6864248 aagtattacactttgtg 6864232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25184527 - 25184309
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25184527 tggtgcagtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaa 25184428  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25184427 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtct 25184328  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25184327 taagtgttacactttgtga 25184309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 37663555 - 37663755
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663555 tgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 37663654  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663655 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 37663754  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  37663755 g 37663755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1815693 - 1815498
Alignment:
Q  73 tttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1815693 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaac 1815594  T
Q  173 atcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815593 atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 1815498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Original strand, 19089267 - 19089466
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089267 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19089366  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089367 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 19089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33341797 - 33341594
Alignment:
Q  66 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341797 actgacttttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 33341698  T
Q  166 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33341697 ttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 33341598  T
Q  266 gtga 269  Q
    ||||    
T  33341597 gtga 33341594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 35020829 - 35021049
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaata----g 147  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    |    
T  35020829 ggtgtagtcagaaaactgactcttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatag 35020928  T
Q  148 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35020929 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 35021028  T
Q  248 tcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35021029 tcttaagtgttacactttgtg 35021049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 32912389 - 32912593
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32912389 aaactgacttttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 32912488  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912489 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 32912588  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  32912589 tttgt 32912593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 33816326 - 33816530
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33816326 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33816425  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33816426 gtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacact 33816525  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  33816526 ttgtg 33816530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 28002796 - 28002997
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002796 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 28002895  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28002896 gttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 28002995  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  28002996 tt 28002997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 7152013 - 7152225
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7152013 aaaactgacttttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataa 7152112  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  7152113 tgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatac 7152212  T
Q  263 tttgtgatgatgt 275  Q
    ||||||| |||||    
T  7152213 tttgtgaggatgt 7152225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 34361301 - 34361505
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34361301 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 34361400  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34361401 tgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacac 34361500  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  34361501 tttgt 34361505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7703910 - 7703706
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7703910 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaat 7703811  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7703810 gcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacact 7703711  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  7703710 ttgtg 7703706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 19440458 - 19440662
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440458 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19440557  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||     
T  19440558 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacg 19440657  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  19440658 ttgtg 19440662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49376368 - 49376164
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49376368 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaat 49376269  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  49376268 gctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacaca 49376169  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  49376168 ttgtg 49376164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50697643 - 50697438
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697643 aaactgacttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 50697544  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaaca-tgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50697543 gcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcac 50697444  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  50697443 tttgtg 50697438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47254141 - 47253937
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47254141 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 47254042  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47254041 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 47253942  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  47253941 ttgtg 47253937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32579848 - 32579646
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32579848 aaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 32579749  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  32579748 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacac 32579649  T
Q  263 ttt 265  Q
    |||    
T  32579648 ttt 32579646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Original strand, 55477715 - 55477905
Alignment:
Q  78 aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477715 aaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 55477814  T
Q  178 ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  55477815 ggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtg 55477905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 36493486 - 36493703
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  36493486 tggtgcagtcaggaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaa 36493585  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36493586 ttcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtct 36493685  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36493686 taagtgttacactttgtg 36493703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 55240915 - 55241120
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55240915 aaactgacttttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaat 55241014  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55241015 gtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacact 55241114  T
Q  264 ttgtga 269  Q
    ||||||    
T  55241115 ttgtga 55241120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 260
Target Start/End: Original strand, 46887968 - 46888163
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46887968 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 46888067  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 260  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46888068 gcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-taagtgttac 46888163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50765115 - 50764917
Alignment:
Q  70 acttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50765115 acttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 50765016  T
Q  170 aacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | || |||||| |||||||||    
T  50765015 aacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtg 50764917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17173703 - 17173487
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  17173703 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 17173604  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173603 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 17173504  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  17173503 aagtgttacactttgtg 17173487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23761484 - 23761271
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23761484 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataat 23761385  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23761384 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtctt 23761285  T
Q  252 aagtgttacacttt 265  Q
    || ||| |||||||    
T  23761284 aaatgtgacacttt 23761271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17168114 - 17167910
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17168114 aaactgacttttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgat 17168015  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17168014 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 17167915  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  17167914 ttgtg 17167910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 25700870 - 25701070
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25700870 tgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgctt 25700969  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||| ||||| || |||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25700970 gcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgt 25701069  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  25701070 g 25701070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37776055 - 37775879
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776055 tgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 37775956  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37775955 gcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37288126 - 37287925
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttga-tcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 166  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37288126 tgacttttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgct 37288027  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37288026 tgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttg 37287927  T
Q  267 tg 268  Q
    ||    
T  37287926 tg 37287925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Original strand, 29584014 - 29584210
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584014 tgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 29584113  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29584114 gcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 29584210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26896485 - 26896285
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26896485 tgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtt 26896386  T
Q  167 tgcaacatctt-ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26896385 tgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacacttt 26896287  T
Q  266 gt 267  Q
    ||    
T  26896286 gt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 268
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948111
Alignment:
Q  82 aagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 181  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  182 ttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt--gttacactttgtg 268  Q
    ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtg 34948111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17272361 - 17272165
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272361 tgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 17272262  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17272261 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 17272165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32592497 - 32592319
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32592497 ggtgcagtcataaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaat 32592398  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttg 230  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  32592397 tcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 244
Target Start/End: Original strand, 30002455 - 30002631
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002455 tgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 30002554  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  30002555 gcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 30002631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27397015 - 27396816
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397015 aaactgattttttaaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27396918  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27396917 gcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacact 27396818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39400409 - 39400236
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39400409 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaat 39400310  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400309 gcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42200127 - 42199927
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 166  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  42200127 tgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgct 42200029  T
Q  167 tgcaacatcttggacttaca-ggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200028 tgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 42199929  T
Q  266 gt 267  Q
    ||    
T  42199928 gt 42199927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 269
Target Start/End: Original strand, 46883911 - 46884124
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46883911 ggtgcagtcaaaaaattgattttttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 46884010  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  46884011 ttcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-t 46884105  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  46884106 taagtgttacattttgtga 46884124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Original strand, 5047746 - 5047978
Alignment:
Q  38 tattttgggagctt----ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtga 133  Q
    ||||||||||||||    |||| |||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||    
T  5047746 tattttgggagcttttacggtgcagtcaggaaacagacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttga 5047845  T
Q  134 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 233  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||| |||    
T  5047846 ttactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatg 5047945  T
Q  234 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5047946 atatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg 5047978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4205397 - 4205216
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  4205397 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaat 4205298  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205297 tcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Original strand, 35025379 - 35025515
Alignment:
Q  66 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 165  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025379 actgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 35025477  T
Q  166 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35025478 ttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 269
Target Start/End: Original strand, 4934012 - 4934217
Alignment:
Q  54 tgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaatt 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  4934012 tgtagtcaataaactgacttttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaatt 4934111  T
Q  153 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta 252  Q
    |||||| |||||| ||||||||           ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4934112 catctattaatgcgtgcaacat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtctta 4934200  T
Q  253 agtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||||||    
T  4934201 agtgttacactttgtga 4934217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4598383 - 4598203
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4598383 aaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataat 4598284  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4598283 gcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9139628 - 9139465
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9139628 aaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaat 9139531  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagtt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  9139530 gcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23431956 - 23431826
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23431956 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaat 23431857  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23431856 gcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012054
Alignment:
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  250 ttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||| ||||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacacttt 38012054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38012655 - 38012568
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctag 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012655 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025607
Alignment:
Q  188 gtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttt 35025607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050169
Alignment:
Q  161 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaacaaa 56050169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Original strand, 6090953 - 6091169
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6090953 ggtgcagtcagaaaacttacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 6091052  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc-t 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6091053 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctt 6091152  T
Q  251 taagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||    
T  6091153 taagtgttacactttgt 6091169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 3879722 - 3879926
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3879722 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaat 3879821  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879822 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3879921  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  3879922 ttgtg 3879926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5627793 - 5627589
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5627793 aaactgatttttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaa 5627694  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5627693 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacac 5627594  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  5627593 tttgt 5627589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1946237 - 1946032
Alignment:
Q  64 aaactgactttttt-aaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagta 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1946237 aaactgacttttttgaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaata 1946138  T
Q  162 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946137 atgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1946038  T
Q  262 ctttgt 267  Q
    ||||||    
T  1946037 ctttgt 1946032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20768475 - 20768282
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768475 ttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 20768376  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  20768375 caccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacacttt 20768282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Original strand, 7234803 - 7235019
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtg---attaatgatcaatagt 148  Q
    ||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  7234803 ggtgtagtcaggaaaatgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagt 7234902  T
Q  149 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7234903 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagt 7235002  T
Q  249 cttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||| ||||||||||    
T  7235003 cttaagcgttacacttt 7235019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 268
Target Start/End: Original strand, 21016913 - 21017099
Alignment:
Q  76 ttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21016913 ttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 21017012  T
Q  176 ttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    || |||      |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017013 ttagac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 21017099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318806
Alignment:
Q  85 ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 184  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  185 caggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |  ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 4318806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8513622 - 8513426
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  8513622 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaat 8513530  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8513529 gcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 8513430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 33892795 - 33892975
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33892795 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaat 33892894  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  33892895 gtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29182562 - 29182364
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29182562 aaactaacttttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaat 29182466  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29182465 acttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 29182366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33619230 - 33619026
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgat---taatgatcaatagtaattcatctagtaatg 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33619230 tgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 33619131  T
Q  165 cttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatct-----ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  33619130 cttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtca 33619031  T
Q  260 cactt 264  Q
    |||||    
T  33619030 cactt 33619026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 7054543 - 7054704
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-a 150  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7054543 ggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtata 7054642  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 212  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7054643 ttcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6089282 - 6089109
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6089282 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttg 6089190  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6089189 gacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtta 6089109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353345
Alignment:
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 30353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055201
Alignment:
Q  207 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 7055201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 139
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  84 gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatg 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491812
Alignment:
Q  196 ttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtg 15491812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24886501 - 24886288
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24886501 tggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaa 24886402  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24886401 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 24886302  T
Q  251 taagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||    
T  24886301 taagtgttacactt 24886288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22255583 - 22255379
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22255583 aaactgactttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaag 22255484  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22255483 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacact 22255384  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  22255383 ttgtg 22255379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Original strand, 22973843 - 22974061
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22973843 tggtgcagtcagaaaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 22973942  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  22973943 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtct 22974042  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  22974043 taagtgttacattttgtga 22974061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Original strand, 2888207 - 2888420
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2888207 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 2888306  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  2888307 tcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtctt 2888406  T
Q  252 aagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||    
T  2888407 aagtgttacacttt 2888420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 699551 - 699347
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699551 aaactgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 699452  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  699451 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacact 699352  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  699351 ttgtg 699347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 38528011 - 38528215
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528011 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38528110  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528111 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 38528210  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  38528211 ttgtg 38528215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 31786420 - 31786623
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31786420 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaat 31786519  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31786520 gcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 31786619  T
Q  264 ttgt 267  Q
    ||||    
T  31786620 ttgt 31786623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35504773 - 35504562
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35504773 agtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatc 35504674  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35504673 tagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtg 35504574  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  35504573 ttacactttgtg 35504562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22981207 - 22980989
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22981207 tggtgcagtcaggaaactgactttttaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataa 22981108  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22981107 ttcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtct 22981008  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  22981007 taagtgttacattttgtga 22980989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 35826259 - 35826462
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826259 aaaactggttttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 35826358  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  35826359 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacac 35826456  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  35826457 tttgtg 35826462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 269
Target Start/End: Original strand, 31705374 - 31705591
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31705374 ggtgcagtcaagaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 31705473  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31705474 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtctt 31705573  T
Q  252 aagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||| |||||||    
T  31705574 aagtgttacattttgtga 31705591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830089
Alignment:
Q  80 aaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtg 5830089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 7208638 - 7208843
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7208638 aaactgactttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 7208737  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208738 acttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacact 7208837  T
Q  264 ttgtga 269  Q
    ||||||    
T  7208838 ttgtga 7208843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 17157798 - 17158009
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17157798 agtcaagaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatc 17157897  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17157898 tagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtg 17157997  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  17157998 ttacactttgtg 17158009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 27318249 - 27318465
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaa-ttgttgattagtgattaatgatcaatagta 149  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27318249 tggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagta 27318348  T
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27318349 attcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 27318446  T
Q  250 ttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27318447 ttaagtgttacactttgtg 27318465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33908634 - 33908433
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33908634 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaa 33908536  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33908535 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacac 33908436  T
Q  263 ttt 265  Q
    |||    
T  33908435 ttt 33908433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 15992314 - 15992518
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992314 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 15992413  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  15992414 gcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 15992513  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  15992514 ttgtg 15992518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8437366 - 8437162
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8437366 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8437267  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8437266 gttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacaca 8437167  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  8437166 ttgtg 8437162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19120260 - 19120056
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120260 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19120161  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19120160 gcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 19120061  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  19120060 ttgtg 19120056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Original strand, 35511256 - 35511440
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35511256 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaat 35511355  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35511356 gcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 35511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36860837 - 36860621
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  36860837 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaat 36860738  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36860737 tcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36860638  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  36860637 aagtgttacactttgtg 36860621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36867175 - 36866959
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  36867175 ggtgcagtcagaaaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 36867076  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36867075 tcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 36866976  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  36866975 aagtgttacactttgtg 36866959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40133798 - 40133582
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  40133798 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 40133699  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40133698 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 40133599  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  40133598 aagtgttacactttgtg 40133582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35934297 - 35934094
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35934297 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaat 35934198  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35934197 gcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 35934098  T
Q  264 ttgt 267  Q
    ||||    
T  35934097 ttgt 35934094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 8741645 - 8741863
Alignment:
Q  50 ttggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta 149  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8741645 ttggtgcagtcatgaaacagacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta 8741744  T
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgat-attatgtgatagt 248  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||    
T  8741745 tttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagt 8741844  T
Q  249 cttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8741845 cttaagtgttacactttgt 8741863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5837969 - 5837752
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5837969 tggtgcagtcatcaaactgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaa 5837870  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5837869 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtct 5837770  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5837769 taagtgttacactttgtg 5837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 23116008 - 23116200
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |        |||||||||    
T  23116008 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgctt 23116099  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116100 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 23116199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12910769 - 12910552
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12910769 tggtgcagtcaggaaactgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaa 12910670  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||   ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12910669 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtct 12910570  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    || |||||||||||||||    
T  12910569 taggtgttacactttgtg 12910552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 30969097 - 30969303
Alignment:
Q  64 aaactgactttt-ttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30969097 aaactgactttttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaa 30969196  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    | |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30969197 tacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacac 30969296  T
Q  263 tttgtga 269  Q
    |||||||    
T  30969297 tttgtga 30969303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25669977 - 25669797
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669977 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25669878  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25669877 gcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27330701 - 27330505
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330701 tgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 27330602  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27330601 gcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactt 27330505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42343122 - 42342942
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42343122 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 42343023  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42343022 gcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25889771 - 25889584
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25889771 aaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 25889672  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889671 gctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Original strand, 13956126 - 13956339
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||   | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13956126 ggtgcagtcagaaagctgatttttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 13956223  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13956224 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtctt 13956323  T
Q  252 aagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||| ||||||    
T  13956324 aagtgttacgctttgt 13956339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 25500700 - 25500904
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25500700 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaat 25500799  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  25500800 gcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacact 25500899  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  25500900 ttgtg 25500904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 254
Target Start/End: Original strand, 14409115 - 14409305
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14409115 aaactgatttttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaat 14409214  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaag 254  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14409215 gtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 14409305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7693622 - 7693442
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7693622 aaactgacttttctaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaat 7693523  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  7693522 gcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39573212 - 39573016
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573212 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 39573113  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  39573112 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacact 39573021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22020024 - 22019844
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22020024 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 22019925  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22019924 gcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429136
Alignment:
Q  114 tttaaattgttga---ttagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatct 210  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  211 ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429083 ttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1429136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15724881 - 15724687
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15724881 ttttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaa 15724782  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||||    
T  15724781 tattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 15724687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 43308434 - 43308607
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308434 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 43308533  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43308534 gcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9200625 - 9200445
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200625 aaactgatttttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 9200526  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  9200525 gcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8467127 - 8466931
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8467127 aaactgattttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 8467028  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| | | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8467027 gcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttaca 8466931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 21088541 - 21088744
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaag-ttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 161  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21088541 aaaactgactttttaaaaaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagta 21088637  T
Q  162 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21088638 atgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttaca 21088737  T
Q  262 ctttgtg 268  Q
    |||||||    
T  21088738 ctttgtg 21088744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32563541 - 32563361
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32563541 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaat 32563442  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  32563441 tcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Original strand, 28416328 - 28416464
Alignment:
Q  67 ctgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28416328 ctgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgct 28416427  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28416428 tgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgtt 28416464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 14919313 - 14919507
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||      |    
T  14919313 aaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatc------t 14919405  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | |||||| ||||||||||||    ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14919406 gattgcaatatcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaat 14919501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Original strand, 23954563 - 23954768
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  23954563 tggtgcagtcaggaaactgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaa 23954655  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||| ||||||| |     ||||||| |||||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23954656 ttcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtct 23954749  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  23954750 taagtgttacattttgtga 23954768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26269210 - 26269074
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  26269210 aaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtatt 26269111  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 200  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26269110 gcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43254269 - 43254154
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43254269 tggtgcagtcaggaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 43254170  T
Q  151 ttcatctagtaatgct 166  Q
    ||||||||||||||||    
T  43254169 ttcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824457
Alignment:
Q  138 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatat 237  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  238 tatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 6824457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268271
Alignment:
Q  207 atctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 26268271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898151
Alignment:
Q  220 aaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtg 11898151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 268
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112292
Alignment:
Q  226 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtg 5112292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32216464 - 32216248
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32216464 ggtgcagtcagaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 32216365  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32216364 tcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtctt 32216265  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  32216264 aagtgttacactttgtg 32216248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10923137 - 10922919
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10923137 tggtgcagtcagaaaactgactcttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 10923038  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10923037 ttcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtct 10922938  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10922937 taagtgttacactttgtga 10922919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23999758 - 23999541
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta- 149  Q
    ||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23999758 tggtgcagtcaggaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtat 23999659  T
Q  150 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23999658 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 23999559  T
Q  250 ttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23999558 ttaagtgttacactttgt 23999541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 46931807 - 46931603
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46931807 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaa 46931708  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931707 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 46931608  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  46931607 tttgt 46931603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30254820 - 30254619
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30254820 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaat 30254721  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30254720 gcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacact 30254621  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  30254620 tt 30254619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37451678 - 37451481
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37451678 tgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 37451579  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451578 gcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 37451481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2960145 - 2959941
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960145 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2960046  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2960045 gcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaat 2959946  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  2959945 ttgtg 2959941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8222532 - 8222321
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat 155  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8222532 agtcagaaaactgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcat 8222434  T
Q  156 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8222433 ctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagt 8222334  T
Q  256 gttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||    
T  8222333 gttacactttgtg 8222321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16416050 - 16415846
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16416050 agtcaaataactaacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatc 16415951  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16415950 taataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagta 16415851  T
Q  257 ttaca 261  Q
    |||||    
T  16415850 ttaca 16415846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Original strand, 19899547 - 19899751
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19899547 aaactgacttttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaa 19899646  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899647 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 19899746  T
Q  263 tttgt 267  Q
    |||||    
T  19899747 tttgt 19899751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32267427 - 32267227
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32267427 tgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgctt 32267328  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32267327 gcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgt 32267228  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  32267227 g 32267227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 265
Target Start/End: Original strand, 28564566 - 28564761
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28564566 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 28564665  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28564666 gcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacacttt 28564761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Original strand, 47682260 - 47682478
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47682260 tggtgcagtcagtaaactgacttttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaa 47682359  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47682360 ttcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtct 47682459  T
Q  251 taagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47682460 taagtgttacactttgtga 47682478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 9902837 - 9903037
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9902837 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgctt 9902936  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9902937 gcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt 9903036  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  9903037 g 9903037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28770042 - 28769846
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28770042 ttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaa 28769943  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28769942 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtg 28769846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51129264 - 51129052
Alignment:
Q  54 tgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattc 153  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||  || ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51129264 tgtagttaagaaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc 51129167  T
Q  154 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51129166 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaa 51129067  T
Q  254 gtgttacactttgtg 268  Q
     ||||||||||||||    
T  51129066 ttgttacactttgtg 51129052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14758429 - 14758240
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758429 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 14758330  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14758329 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa 14758240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15168493 - 15168292
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168493 aaactgatttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataat 15168394  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15168393 gcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacact 15168294  T
Q  264 tt 265  Q
    ||    
T  15168293 tt 15168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 11742147 - 11742347
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742147 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 11742246  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11742247 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacact 11742346  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  11742347 t 11742347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227468
Alignment:
Q  80 aaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 179  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  180 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtg 27227468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267183
Alignment:
Q  80 aaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  180 acttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtg 27267183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48353939 - 48353736
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48353939 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaat 48353840  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48353839 gcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacact 48353741  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  48353740 ttgtg 48353736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25161016 - 25160825
Alignment:
Q  78 aaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 176  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25161016 aaaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatct 25160917  T
Q  177 tggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25160916 tggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtg 25160825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38823611 - 38823408
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823611 aaactgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38823512  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38823511 gcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacact 38823412  T
Q  264 ttgt 267  Q
    ||||    
T  38823411 ttgt 38823408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15383323 - 15383126
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383323 ttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 15383224  T
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15383223 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtg 15383126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4330690 - 4330474
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4330690 ggtgcagtcagacaactgatttttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaat 4330591  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4330590 tcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtctt 4330491  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4330490 aagtgttacattttgtg 4330474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 269
Target Start/End: Original strand, 27532761 - 27532965
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532761 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 27532859  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27532860 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacact 27532959  T
Q  264 ttgtga 269  Q
    ||||||    
T  27532960 ttgtga 27532965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 238300 - 238496
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  238300 ttttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 238399  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238400 catcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 238496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 1359703 - 1359918
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1359703 ggtgcagtcagaaaactgacttgttaaaaaaaaaaaattt-gatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaat 1359801  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1359802 tcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatctt 1359901  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  1359902 aagtgttacactttgtg 1359918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Original strand, 27763093 - 27763293
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 166  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27763093 tgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgct 27763192  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27763193 tgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttg 27763292  T
Q  267 t 267  Q
    |    
T  27763293 t 27763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Original strand, 34012161 - 34012345
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34012161 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaat 34012260  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34012261 gcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34012345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47279599 - 47279385
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgactttttta-aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47279599 ggtgcagtcataaaactgattttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaa 47279500  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  47279499 ttcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtct 47279400  T
Q  251 taagtgttacacttt 265  Q
    |||||||||||||||    
T  47279399 taagtgttacacttt 47279385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22171109 - 22170904
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22171109 aaaactgatttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataa 22171010  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    || |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171009 tgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 22170910  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  22170909 tttgtg 22170904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 10181773 - 10181991
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10181773 tggtgcagtcaggaaactaacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaa 10181872  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-aggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10181873 ttcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtc 10181972  T
Q  250 ttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10181973 ttaagtgttacactttgtg 10181991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 27563671 - 27563888
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27563671 tggtgcagtcaggaaactgatttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaa 27563770  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27563771 ttcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtct 27563870  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||| | |||||||    
T  27563871 taagtgttcctctttgtg 27563888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 7078842 - 7079046
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078842 aaactgatttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 7078941  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  7078942 gtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatact 7079041  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  7079042 ttgtg 7079046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 268
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326935
Alignment:
Q  85 ttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 183  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  184 acaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    | | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtg 30326935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39393777 - 39393578
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39393777 tgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 39393678  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39393677 gcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgt 39393578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3535332 - 3535142
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3535332 ggtgtagtcatgaaactgattttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaat 3535233  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  3535232 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15752438 - 15752225
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15752438 ggtgcagtcagaaaattgattttttaaaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaat 15752339  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15752338 tcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactctt 15752239  T
Q  252 aagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||    
T  15752238 aagtgttacacttt 15752225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3309536 - 3309350
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttga-tcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 177  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3309536 aaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 3309437  T
Q  178 ggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3309436 ggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactt 3309350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42721425 - 42721232
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  42721425 ttttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaa 42721326  T
Q  172 catcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42721325 catcttggacttacatgtaatattttatcgtt---gtctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtg 42721232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1547668 - 1547472
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547668 aaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaat 1547569  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  1547568 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacact 1547477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21290010 - 21289817
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  21290010 tggtgcagttaaaaaactgacttttttagaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataa 21289911  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289910 ttcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40885212 - 40885009
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaa-ttttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 161  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||| | || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885212 aaaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagta 40885113  T
Q  162 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40885112 atgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 40885013  T
Q  262 cttt 265  Q
    ||||    
T  40885012 cttt 40885009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 31621327 - 31621533
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttt-taaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31621327 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaa 31621426  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatct-----ttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 257  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31621427 tgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T
Q  258 tacactt 264  Q
     ||||||    
T  31621527 cacactt 31621533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18423004 - 18422844
Alignment:
Q  101 tgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18423004 tgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatc 18422912  T
Q  201 gttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422911 gttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 18422844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 240
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618856
Alignment:
Q  113 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  213 aacatgcaaacaaagttgatgatattat 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattat 37618856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41926554 - 41926378
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41926554 aaaactgatttttttttaaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 41926455  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattat 240  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41926454 tgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 41926378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31963014 - 31962853
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaa-ttgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31963014 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataa 31962915  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaaca 224  Q
    |||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31962914 tgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 33725390 - 33725580
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcattttta-aattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||               
T  33725390 aaactgatttttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat----------- 33725478  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
     | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33725479 -gtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacac 33725577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759726
Alignment:
Q  148 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  248 tcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtg 38759726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48620986 - 48620916
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgat 134  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48620986 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38759900 - 38759846
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgttt 105  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759900 tggtgcagtcaattaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttt 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620845
Alignment:
Q  183 tacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 48620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Original strand, 2325168 - 2325384
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2325168 ggtgcagtcagaaaattgattttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaat 2325267  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2325268 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtctt 2325367  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  2325368 aagtgttacactttgtg 2325384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Original strand, 11366170 - 11366386
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-a 150  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11366170 ggtgcagtcagaaaattgatttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtata 11366269  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11366270 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtct 11366369  T
Q  251 taagtgttacactttgt 267  Q
    |||||||||||||||||    
T  11366370 taagtgttacactttgt 11366386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35959298 - 35959093
Alignment:
Q  59 tcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatcta 158  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959298 tcaaaaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatcta 35959199  T
Q  159 gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtt 258  Q
    |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35959198 gtaatgcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgtt 35959103  T
Q  259 acactttgtg 268  Q
    ||||||||||    
T  35959102 acactttgtg 35959093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 43648051 - 43648251
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43648051 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt 43648150  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43648151 gcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgt 43648250  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  43648251 g 43648251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41961241 - 41961037
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961241 aaactgaattttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41961142  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41961141 gcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacact 41961042  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  41961041 ttgtg 41961037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4764033 - 4763828
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaa-gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4764033 aaactgactttttaaaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaa 4763934  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763933 tgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 4763834  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  4763833 tttgtg 4763828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 19289125 - 19289329
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289125 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19289224  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289225 gcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 19289324  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  19289325 ttgtg 19289329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 269
Target Start/End: Original strand, 18494071 - 18494288
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18494071 ggtgtagtcatgaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaat 18494170  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  18494171 tcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtctt 18494270  T
Q  252 aagtgttacactttgtga 269  Q
    |||||| || ||||||||    
T  18494271 aagtgtgactctttgtga 18494288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26357979 - 26357774
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357979 aaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 26357880  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26357879 tgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaa 26357780  T
Q  263 tttgtg 268  Q
    ||||||    
T  26357779 tttgtg 26357774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41465903 - 41465701
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41465903 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaa 41465804  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41465803 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacac 41465704  T
Q  263 ttt 265  Q
    |||    
T  41465703 ttt 41465701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4167335 - 4167119
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaat 151  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  4167335 ggtgcagtcagaaaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaat 4167236  T
Q  152 tcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctt 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4167235 tcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtttt 4167136  T
Q  252 aagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  4167135 aagtgttacactttgtg 4167119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Original strand, 7006744 - 7006940
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7006744 tgacttttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgctt 7006843  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7006844 gcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 19500706 - 19500921
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19500706 tggtgcagtcaaaaaatt-acttttttgaaaaaat-aattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaa 19500803  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  19500804 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtct 19500903  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  19500904 taagtgttacattttgtg 19500921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Original strand, 33709036 - 33709237
Alignment:
Q  66 actgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 165  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709036 actgaattttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 33709135  T
Q  166 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33709136 ttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttt 33709235  T
Q  266 gt 267  Q
    ||    
T  33709236 gt 33709237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44914060 - 44913861
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcat---ctagtaatgcttg 168  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||    
T  44914060 ttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttg 44913961  T
Q  169 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913960 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 44913861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3177340 - 3177136
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3177340 aaactgacttttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaat 3177241  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177240 gcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 3177141  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  3177140 ttgtg 3177136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31862253 - 31862049
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31862253 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 31862154  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |  | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||   |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31862153 gtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacact 31862054  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  31862053 ttgtg 31862049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 243
Target Start/End: Original strand, 33660179 - 33660358
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660179 aaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 33660278  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 243  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33660279 gcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg 33660358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 268
Target Start/End: Original strand, 33550778 - 33550992
Alignment:
Q  58 gtcaaaaaactgacttttttaaaaaa-gttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatga----tcaatagtaatt 152  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||||||| |||    
T  33550778 gtcagaaaactgaatttttaaaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttatt 33550877  T
Q  153 catctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctta 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||    
T  33550878 catctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtctta 33550976  T
Q  253 agtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||||    
T  33550977 agtgttacactttgtg 33550992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37906113 - 37905907
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt-catttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagta 161  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37906113 aaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagta 37906014  T
Q  162 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 261  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37906013 attcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttaca 37905914  T
Q  262 ctttgtg 268  Q
    |||||||    
T  37905913 ctttgtg 37905907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Original strand, 39167170 - 39167355
Alignment:
Q  63 aaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  39167170 aaaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaa 39167269  T
Q  163 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39167270 tgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt 39167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5881930 - 5881750
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881930 aaactgatttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaat 5881831  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  5881830 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 31570536 - 31570740
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31570536 aaactgactttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaat 31570635  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  31570636 gcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacatt 31570735  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  31570736 ttgtg 31570740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Original strand, 19424444 - 19424634
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424444 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 19424543  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||              |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19424544 gcttgcaacatcttagacttgcaggtact--------------atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacact 19424629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 244
Target Start/End: Original strand, 43770650 - 43770830
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43770650 aaactgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaat 43770749  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  43770750 gcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 29241934 - 29242144
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||  |||||||  |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29241934 tggtgcagtcaggaaactgaactttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaa 29242033  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 250  Q
    ||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29242034 ttcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtct 29242126  T
Q  251 taagtgttacactttgtg 268  Q
    || |||||||||||||||    
T  29242127 taggtgttacactttgtg 29242144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478562
Alignment:
Q  113 ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatcttt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||   ||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  213 aacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg 4478562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 244
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27349930
Alignment:
Q  103 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  203 taaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286146
Alignment:
Q  131 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  231 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 44286146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13711853 - 13711671
Alignment:
Q  71 cttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 170  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || | | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13711853 cttttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgca 13711754  T
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13711753 acatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaa 13711671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264083
Alignment:
Q  112 tttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctt 211  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||   |||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  212 taacatgcaaacaaagttgatgatattatg-tgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtg 4264083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071743
Alignment:
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 17071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 200
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051238
Alignment:
Q  74 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 173  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  174 tcttggacttacaggtactattttatc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttatc 41051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327920
Alignment:
Q  160 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  260 cacttt 265  Q
    ||||||    
T  45327925 cacttt 45327920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19314061
Alignment:
Q  126 attagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt---acaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaa 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  223 caaagttgatgatattatgtgatagt 248  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagt 19314061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054102
Alignment:
Q  171 acatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtg 17054102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 41463400 - 41463520
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 171  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  41463400 tttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaa 41463499  T
Q  172 catcttggacttacaggtact 192  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  41463500 catcttagacttagaggtact 41463520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642186
Alignment:
Q  160 taatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  260 cactttgt 267  Q
    ||||||||    
T  36642193 cactttgt 36642186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33902407 - 33902317
Alignment:
Q  72 ttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902407 ttttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 18257340 - 18257453
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18257340 aaactgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaat 18257439  T
Q  164 gcttgcaacatctt 177  Q
    ||||||||||||||    
T  18257440 gcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 45328091 - 45328028
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45328091 aaactgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 265
Target Start/End: Original strand, 18258198 - 18258290
Alignment:
Q  173 atcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18258198 atcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 18258290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463857
Alignment:
Q  191 ctattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtga 41463857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902263
Alignment:
Q  212 taacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtg 33902263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 17071571 - 17071646
Alignment:
Q  62 aaaaactgacttttttaaaa-aagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17071571 aaaaactgacttttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 17053931 - 17054005
Alignment:
Q  62 aaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgatta 136  Q
    ||||||||||||||| ||| ||   ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17053931 aaaaactgactttttaaaataaaaaaaaattgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19093826 - 19093787
Alignment:
Q  52 ggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattt 91  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19093826 ggtgcagtcaaaaaattgacttttttaaaaaagttaattt 19093787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 4263711 - 4263756
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgatt 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4263711 aaactgattttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 4263756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44364 - 44154
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  44364 agtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatt 44265  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44264 cagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtg 44166  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  44165 ttacactttgtg 44154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 154423 - 154633
Alignment:
Q  57 agtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  154423 agtcaacaaactgacttttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatt 154522  T
Q  157 tagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg 256  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  154523 cagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtg 154621  T
Q  257 ttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||    
T  154622 ttacactttgtg 154633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8284 - 8084
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 167  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284 tgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 8185  T
Q  168 gcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8184 gcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8085  T
Q  268 g 268  Q
    |    
T  8084 g 8084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 269
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408418
Alignment:
Q  74 ttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 173  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  174 tcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtga 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtga 408418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 93885 - 94056
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  93885 aaacggacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaat 93983  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  93984 gcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 334
Alignment:
Q  79 aaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 178  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 415  T
Q  179 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 265  Q
    |||      ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  414 gac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94371
Alignment:
Q  228 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtg 94371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12309 - 12106
Alignment:
Q  64 aaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12309 aaacttacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 12211  T
Q  164 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacact 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  12210 gcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacact 12111  T
Q  264 ttgtg 268  Q
    |||||    
T  12110 ttgtg 12106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Original strand, 145803 - 146003
Alignment:
Q  68 tgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgct 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  145803 tgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgct 145902  T
Q  167 tgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 266  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145903 tgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 146002  T
Q  267 t 267  Q
    |    
T  146003 t 146003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 267690 - 267481
Alignment:
Q  51 tggtgtagtcaaaaaactgacttttttaaaaaagttaattttgatcttattgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaa 150  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |         |||    
T  267690 tggtgcagtcaagaaactgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taa 267600  T
Q  151 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc- 249  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  267599 ttcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtct 267500  T
Q  250 ttaagtgttacactttgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  267499 ttaagtgttacactttgtg 267481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100948
Alignment:
Q  120 ttgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||            ||||||  ||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttac------------atcgttggaatctttaacatgc 100973  T
Q  220 aaacaaagttgatgatattatgtga 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  100972 aaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University