View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12431_high_1 (Length: 836)

Name: NF12431_high_1
Description: NF12431
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12431_high_1
NF12431_high_1
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (19-826)||(8585415-8586222)
chr7 (443-826)||(8628608-8628991)
chr7 (19-450)||(8616333-8616764)
chr7 (115-818)||(8659111-8659814)
chr7 (19-818)||(27830592-27831391)
chr7 (21-818)||(10494091-10494888)
chr7 (19-719)||(17267591-17268291)
chr7 (112-753)||(8654195-8654836)
chr7 (21-740)||(8667073-8667792)
chr7 (168-818)||(13333173-13333823)
chr7 (19-722)||(17259893-17260596)
chr7 (115-741)||(1301208-1301838)
chr7 (19-743)||(6789164-6789888)
chr7 (408-775)||(8636103-8636470)
chr7 (328-749)||(8646838-8647259)
chr7 (217-749)||(3147114-3147654)
chr7 (431-752)||(8602038-8602359)
chr7 (331-812)||(29581564-29582045)
chr7 (331-775)||(8545597-8546040)
chr7 (438-818)||(7877450-7877830)
chr7 (411-740)||(8382671-8383000)
chr7 (444-816)||(8609994-8610366)
chr7 (331-775)||(8576290-8576734)
chr7 (451-752)||(8538120-8538421)
chr7 (331-775)||(8570275-8570719)
chr7 (444-752)||(8590715-8591023)
chr7 (601-740)||(8671425-8671564)
chr7 (395-812)||(29577392-29577812)
chr7 (439-728)||(8559405-8559694)
chr7 (439-775)||(8581772-8582108)
chr7 (19-296)||(8601626-8601903)
chr7 (19-173)||(29582203-29582357)
chr7 (657-740)||(8640342-8640425)
chr7 (596-745)||(39985875-39986024)
chr7 (601-740)||(8017208-8017347)
chr7 (408-551)||(8017397-8017540)
chr7 (19-89)||(8545285-8545355)
chr7 (145-255)||(8576104-8576214)
chr7 (19-89)||(8581352-8581422)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (21-818)||(16661709-16662506)
chr2 (178-818)||(16657234-16657874)
chr2 (19-748)||(14703060-14703789)
chr2 (19-773)||(12258343-12259097)
chr2 (108-746)||(12234430-12235068)
chr2 (22-740)||(7541881-7542599)
chr2 (19-773)||(12245168-12245922)
chr2 (395-740)||(43625440-43625785)
chr2 (451-773)||(11999478-11999800)
chr2 (610-745)||(17716483-17716618)
chr2 (19-254)||(11999060-11999294)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (21-818)||(30774906-30775703)
chr4 (21-740)||(9335686-9336405)
chr4 (431-754)||(35132512-35132835)
chr4 (19-287)||(35132108-35132377)
chr4 (604-745)||(23596375-23596516)
chr4 (439-508)||(54396495-54396564)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (49-823)||(34466505-34467274)
chr1 (19-740)||(15594686-15595414)
chr1 (178-734)||(4678359-4678914)
chr1 (194-255)||(52549292-52549353)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (19-752)||(12528156-12528889)
chr8 (517-775)||(43744999-43745255)
chr8 (19-487)||(43744468-43744936)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (435-717)||(28910650-28910932)
chr6 (438-498)||(11133065-11133125)
chr6 (603-683)||(11170806-11170886)
chr6 (602-671)||(11156505-11156574)
chr6 (602-671)||(11196958-11197027)
chr6 (602-683)||(11200123-11200204)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (526-775)||(28220110-28220359)
chr5 (193-494)||(28219744-28220045)
chr5 (625-695)||(42555760-42555830)
[»] scaffold1207 (1 HSPs)
scaffold1207 (602-683)||(1120-1201)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 640; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 640; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 8586222 - 8585415
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  8586222 aaagaagcctgaactgcagccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaagtcactcaatagttcctgta 8586123  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8586122 ctttgggaattctggacgagccaccgacaaggacaatatcgtctacaccattcttctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttataca 8586023  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8586022 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtg 8585923  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8585922 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctct 8585823  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8585822 taaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcaccttt 8585723  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8585722 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacagttacctttgttgtcaaggccatatgca 8585623  T
Q  619 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataag 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8585622 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataag 8585523  T
Q  719 caggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8585522 caggcacagtcacaactgcattttgaacaggtgatttcaaatatgtctctgcaatcttcttcatgtttgtgaggatgatagatgatatttcctcagcaca 8585423  T
Q  819 caggttct 826  Q
     |||||||    
T  8585422 taggttct 8585415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 443 - 826
Target Start/End: Original strand, 8628608 - 8628991
Alignment:
Q  443 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8628608 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 8628707  T
Q  543 agtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattg 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8628708 agtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtggggtcattg 8628807  T
Q  643 attatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttt 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8628808 attatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcattcatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttt 8628907  T
Q  743 taacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcacacaggttct 826  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8628908 ttacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctcagcacataggttct 8628991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 450
Target Start/End: Original strand, 8616333 - 8616764
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||| |||||||||||    
T  8616333 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcacaaatccttcccatcgaaaaagtcactcaatagttcctgca 8616432  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  8616433 ctttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatcttagaatcattaaaacaactctcaacagtctttataca 8616532  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8616533 ctcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 8616632  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8616633 accaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaacgatcttgggttcctagtaatatccacattgttcttcctct 8616732  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctg 450  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8616733 taaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 115 - 818
Target Start/End: Original strand, 8659111 - 8659814
Alignment:
Q  115 tgcactttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtattta 214  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  8659111 tgcactttgggaatcctagacgaaccacccacaagaacaatatcgtcaatatcactcatctgtatttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttca 8659210  T
Q  215 tgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagt 314  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||||| | ||| |||| || || |||| | ||||| |||| | ||||| |||    
T  8659211 tacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagt 8659310  T
Q  315 agtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttc 414  Q
     ||||| ||    ||||| |||||||| |||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| ||   | |||| ||||| |  ||||||    
T  8659311 ggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttc 8659410  T
Q  415 ctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcac 514  Q
     | || || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8659411 tttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcac 8659510  T
Q  515 ctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccata 614  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||   |||| | |||||||  |||||    
T  8659511 ccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattttgtttaccatcacagtcacctctcttgtcaaaaccata 8659610  T
Q  615 tgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaa 714  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8659611 tgcaatagctgcagcagtaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaatggcaccggaatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaac 8659710  T
Q  715 taagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttct-tcatatttgcaaggataatagatgatatttcctcc 813  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | | ||| | |||||||| |||||  ||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  8659711 tatgcaggcactgtaacaacagcattcttcacaggtgacattagatatgtctctgcaa-cttctcgcatttttgtaagtaccatagatgatatttcctcc 8659809  T
Q  814 gcaca 818  Q
    |||||    
T  8659810 gcaca 8659814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 27831391 - 27830592
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || ||   || ||| | |||||    
T  27831391 aaagcagcctgcacagctgcaccaaaagcaacagcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatcctttcccttgaaaaagtccgccaatagctgctgca 27831292  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| |  || ||    
T  27831291 ctttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatcttagagtcagtgagacaactctcaacagtctccataca 27831192  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    ||| |||| || ||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||    
T  27831191 ttcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctcaaataaggcatctatctcaatagtagtg 27831092  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
     | |     ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||  | |||| |||||    |||||| |||    
T  27831091 tcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttct 27830992  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    | ||  ||||  |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| | | | ||    
T  27830991 tgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagttgccttaacttggaagaccttatcctt 27830892  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  | |  |   |    |||||||||||||||||    
T  27830891 aattgtaacaagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaacacaaaaatattccgttctccagtatattttgttcccgtgtcaaggccatatgca 27830792  T
Q  619 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataag 718  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  27830791 atagctgcagcagtaggctcgcttattatccgcataacattaaggccagcaatggcaccggaatctacagtggcttttcgttgagagtcattgaaataag 27830692  T
Q  719 caggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    | |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    ||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  27830691 ctggcacggttattactgcattcttaaccggtgattgcaaatatgcctccgcgatctctcgcatctttgtaaggaccattgatgaaatttcctccgcaca 27830592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 10494888 - 10494091
Alignment:
Q  21 agcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcact 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| || |||||   | || |||| || ||||| ||||| |||||   || ||| |||||||||    
T  10494888 agcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatacgcatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagatcctgcact 10494789  T
Q  121 ttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcact 220  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |    | |||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| || ||||    
T  10494788 ttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacact 10494689  T
Q  221 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgac 320  Q
    |  | |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||  | |||||  ||| | |||||  || |||||    
T  10494688 cgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgac 10494589  T
Q  321 caatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctctta 420  Q
     ||    ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| | ||||||||  | | || ||||| |  |||||| | ||     
T  10494588 aaaagaaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttg 10494489  T
Q  421 aattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 520  Q
    || |||||| |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10494488 aactcctcaacaaaataattcaccattctgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaa 10494389  T
Q  521 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaat 620  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||   || | | ||||||||||||||||||||    
T  10494388 ttgtgaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccctcacaatcacttctcttgtcaaggccatatgcaat 10494289  T
Q  621 agctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagca 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||||| |||||     
T  10494288 agctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagcaccagcatcaatagtagcctttcgttgagaatcgttgaagtaagcc 10494189  T
Q  721 ggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || |||||   |||||| |||||||||| ||    ||| |||  |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  10494188 ggcacagtaacaacagcattcttgactggtgaccccaaatatgcctctgcaacctctcgcatctttataaggaccatagatgatatttcctcggcaca 10494091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 719
Target Start/End: Original strand, 17267591 - 17268291
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||||||||| || || |||  |||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||| |||||||| |    || ||||| |||||    
T  17267591 aaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataattccttccccttgaagaagttctgcaatagttgctgca 17267690  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||| ||||| || || || || || |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| | |||  |||||||  |||||||| | |  |||||    
T  17267691 ctttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctgctcttgtcaatcttagcatcactaagacacttctcaacaatctccatgca 17267790  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  |||| | |||||   || | ||||| | | ||     
T  17267791 ctcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtc 17267890  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    ||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||  |  ||| | ||  |  || ||||| |    
T  17267891 acagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttt 17267990  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    | | ||||||| |||| ||||  | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | ||||| |||||||| ||||| | | | ||    
T  17267991 tgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatcctt 17268090  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||  ||  | | ||| ||||||||||||||    
T  17268091 aattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgttcttcaacacagttagttctcttgccaaggccatatgca 17268190  T
Q  619 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataag 718  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  17268191 atagctgcagcagttggttcattgattaccttcaatacattaaggccagcaatgacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcgttgaagtaag 17268290  T
Q  719 c 719  Q
    |    
T  17268291 c 17268291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 112 - 753
Target Start/End: Original strand, 8654195 - 8654836
Alignment:
Q  112 tcctgcactttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtat 211  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||| |||||| |    | |||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||    
T  8654195 tcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacgagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatat 8654294  T
Q  212 ttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaat 311  Q
    | || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| || ||||| |||  | |||||  ||| | |||||     
T  8654295 tgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaac 8654394  T
Q  312 agtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttc 411  Q
    ||| ||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| ||     |||| ||||| |  |||    
T  8654395 agtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattc 8654494  T
Q  412 ttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacat 511  Q
    ||| | || || |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8654495 ttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacat 8654594  T
Q  512 cacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggcc 611  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |  ||| |   |||||||||||    
T  8654595 cacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaataccaaaatattccgtttaccatcatagttacttcgcttgtcaaggcc 8654694  T
Q  612 atatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattg 711  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  8654695 atatgcaatagctgcggcagtaggttcattgagtatccgaatgacgttaagtccagcaatggcaccagcatctatggttgcttttcgctgagagtcattg 8654794  T
Q  712 aaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgat 753  Q
    || || || ||||| || |||||  ||||||| || ||||||    
T  8654795 aagtatgccggcacagtaacaacgacatttttgacgggtgat 8654836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 740
Target Start/End: Original strand, 8667073 - 8667792
Alignment:
Q  21 agcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcact 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| || || |||||   | || |||| || ||||| |||||  ||||   || | |||||||||||    
T  8667073 agcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaatattctagcaattgttcctgcact 8667172  T
Q  121 ttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcact 220  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| |    | |||| | ||||||||||||  | |||||  | |||||  |||| || ||||    
T  8667173 ttgggaatcctagacgagccaccgacaagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaactatattcatacact 8667272  T
Q  221 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgac 320  Q
    |||| |||| |||||| || | ||||||||| ||  |||| || ||||| ||| | || ||||| |||  | |||||  ||| | ||||| ||| || ||    
T  8667273 cattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaacaaaagtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaacagtggtaac 8667372  T
Q  321 caatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctctta 420  Q
     ||    ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| |||| | | || ||||| |  |||||| | ||     
T  8667373 aaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgactgatgtccactttattcttctttttt 8667472  T
Q  421 aattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 520  Q
    || |||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8667473 aactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaa 8667572  T
Q  521 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaat 620  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||   |  | | ||||||||||||||||||||    
T  8667573 ttgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggctaccatcacagtcatttctcttgtcaaggccatatgcaat 8667672  T
Q  621 agctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagca 720  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  8667673 agctgccgcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagct 8667772  T
Q  721 ggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  8667773 ggcacagtaacaacggcatt 8667792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 168 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 13333823 - 13333173
Alignment:
Q  168 actcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgatt 267  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||| |||| || |||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  13333823 actcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgatt 13333724  T
Q  268 gacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctca 367  Q
    || ||||| || ||||| |||  | |||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||    || || ||| |||||||| || | ||||| || |||||||    
T  13333723 gatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctca 13333624  T
Q  368 accgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcc 467  Q
    ||| ||| |||| | |||| |||  | | ||||| || |  |||||| | || || |||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  13333623 acctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcc 13333524  T
Q  468 accaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacaca 567  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  13333523 cccaaggtgagtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagaca 13333424  T
Q  568 aaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccag 667  Q
    ||||||||||| | |||||||||   || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || | |||||||||||    
T  13333423 aaaatatttcgcttaccatcacaatcacgtctcttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattattcgaatgatattaaggccag 13333324  T
Q  668 caatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctc 767  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||   || ||| |||||    
T  13333323 caatagcaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagccggcacagtaacaacggcattcttgactggtgaccccatatatgcctc 13333224  T
Q  768 tgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    ||||| ||    ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13333223 tgcaacctctcgcatctttgtaaggaccatagatgatatttcctcggcaca 13333173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 722
Target Start/End: Original strand, 17259893 - 17260596
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||||||||| || || |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || || |||||||| ||   || ||||| |||||    
T  17259893 aaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttacccttgaagaaatcctgcaatagttgctgca 17259992  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||| ||||| || || || || || |||||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||   |||  |||||||  |||||||| | |  |||||    
T  17259993 ctttcggaatcctagaagatccaccaacaaggacaacatcatcaattctgctcttgtcaatcttaccatcactaagacacttctcaacaatctccatgca 17260092  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |  |||| | |||||   || | ||||| | | ||     
T  17260093 ctcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtc 17260192  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    ||  |    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||  | |||| ||||  |  ||| | || |    
T  17260193 acagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttt 17260292  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    | |  |||||  |||| |||| || |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | ||||| |||||||| ||||| | | | ||    
T  17260293 tgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatcctt 17260392  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |   | ||||  ||  | | ||| ||||||||||||||    
T  17260393 aattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatattccgtacttaaacacaattagttctcttgacaaggccatatgca 17260492  T
Q  619 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataag 718  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17260493 atagctgcagcaataggttcattaattaacttcaaaacataaaggccagcaataacaccagcatctatggtggcttttcgctgagaatcattgaaataag 17260592  T
Q  719 cagg 722  Q
    ||||    
T  17260593 cagg 17260596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 115 - 741
Target Start/End: Original strand, 1301208 - 1301838
Alignment:
Q  115 tgcactttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtattta 214  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |    |||| |   ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  1301208 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttg 1301307  T
Q  215 tgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagt 314  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||| ||||| |||| | ||||| |||| | |||||  ||    
T  1301308 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggt 1301407  T
Q  315 agtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttc 414  Q
     ||||| ||    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||| ||| |||| | |  | ||   | |||| ||||| |  ||||||    
T  1301408 ggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttc 1301507  T
Q  415 ctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcac 514  Q
     |  | || |||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  1301508 tttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgc 1301607  T
Q  515 ctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccata 614  Q
    | || || || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||   || | | |||||||  |||||    
T  1301608 ccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatattccgtttaccatcacagtcacttctcttgtcaaaaccata 1301707  T
Q  615 tgcaatagctgcagcag----tgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcatt 710  Q
     ||||||||||||||||    | |||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1301708 cgcaatagctgcagcagtagctaggttcattaattatctgaatgacattaaggccagcaattgcaccggcatctatggtggcttttcgctgagaatcatt 1301807  T
Q  711 gaaataagcaggcacggtgacaactgcattt 741  Q
    |||||  |||||||| || ||||| ||||||    
T  1301808 gaaatgtgcaggcacagtaacaacagcattt 1301838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 743
Target Start/End: Original strand, 6789164 - 6789888
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatc-tttcccattgaagaattcgctcattagttcctgc 117  Q
    ||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||| ||| | |||   || |||||  |||    
T  6789164 aaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatcctttcccat-gaaaacttcttgcaatagttgttgc 6789262  T
Q  118 actttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgc 217  Q
    |||||||||||||| || || || || |||||||||| ||||| |||  ||||||| || ||||| |  ||   ||||||||||||||| || || || |    
T  6789263 actttgggaattctagaagacccaccaacaaggacaacatcatttacaatactcttgtccatcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcatac 6789362  T
Q  218 actcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagt 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | || || | ||| |||  ||| |||||||||| | ||||| | || | ||||||||||||    
T  6789363 actcattaaaaatatccatattgatttcctcaaacttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagtagt 6789462  T
Q  318 gaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctc 417  Q
    ||| |     ||||| |||  |||||| ||| ||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  ||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  6789463 gacgacaacaaaagagagtacccttttggccctttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctc 6789562  T
Q  418 ttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctt 517  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| |||||||  ||||| | | |||    
T  6789563 ttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcggttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatctt 6789662  T
Q  518 taattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgc 617  Q
    | ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||||  ||| ||| |  |  ||  | | || ||||||||||||||    
T  6789663 tgattgttaagatagacacatcgaaagtgccaccaccaaggtcgaagacgaaaatatttttttctccaccgtaattagttctcttatcaaggccatatgc 6789762  T
Q  618 aatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataa 717  Q
    || ||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6789763 aagagcagcagctgttggttcattgattattcgtataacattaagaccagcaatggcaccagcatctaaagtggctttccgttgagaatcattgaaataa 6789862  T
Q  718 gcaggcacggtgacaactgcattttt 743  Q
    |||||||| || | ||||||||||||    
T  6789863 gcaggcacagtaataactgcattttt 6789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 408 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 8636470 - 8636103
Alignment:
Q  408 gttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaag 507  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  8636470 gttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaag 8636371  T
Q  508 acatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaa 607  Q
    || |||||||||||| |||| | |||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||   | ||||  ||||| | || | ||    
T  8636370 acttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaatgtaccaccaccaagatcaaatacgaaaatgtttctctctttaacacagttacctctcttttgaa 8636271  T
Q  608 ggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatc 707  Q
    | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||    
T  8636270 gtccatacgcaaaagctgcagcagttggttcattgattatccgaattacattaaggccggcaatggcaccagcatctttggtggatttacgctgagaatc 8636171  T
Q  708 attgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
    |||||||||||| ||||| || |  |||||||| || |||| ||||| || ||| ||||| |||||||    
T  8636170 attgaaataagcgggcacagtaatgactgcattcttgacagatgattccagatatgcctcagcaatct 8636103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 328 - 749
Target Start/End: Original strand, 8646838 - 8647259
Alignment:
Q  328 aaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcct 427  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||   |||||| ||||| | ||||||| | |||||||| |    
T  8646838 aaagatagtgtcctttttgctctctcgcatgccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattctt 8646937  T
Q  428 cagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgag 527  Q
      ||||||| || || ||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| | | | |||||||| ||    
T  8646938 gtgcaaagtggtccaccattctactatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaag 8647037  T
Q  528 gagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgca 627  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  || |||||||||||  || ||||  |   | | ||||||||||||||||| | ||| |||    
T  8647038 gagagacacatcaaaagttccaccaccaaggtcgaagatgaatatatttcgttcttcagcacaatttgttctcttgtcaaggccatatgcgagagcagca 8647137  T
Q  628 gcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacgg 727  Q
    || || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |    
T  8647138 gctgttggttcattgattatccggatgatattaaggccagcaatggccccggcatctatagtggcttttcgctgataatcattgaagtatgcaggcacag 8647237  T
Q  728 tgacaactgcatttttaacagg 749  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  8647238 taacaactgcattctttacagg 8647259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 749
Target Start/End: Original strand, 3147114 - 3147654
Alignment:
Q  217 cactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtag 316  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | || || |  |||| | ||||| |||| |||||||| || |    
T  3147114 cactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaatggtgg 3147213  T
Q  317 tgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcct 416  Q
    |||  |     ||||| ||| | | ||||||  ||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||  |||| | |||| || || | ||||||| |    
T  3147214 tgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttctt 3147313  T
Q  417 cttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacct 516  Q
    |||||| |||   ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||||| |||||| | | |     
T  3147314 cttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatcc 3147413  T
Q  517 ttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttc------accatcacacc--tacctttgttgtcaag 608  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| || ||      || || ||||   ||  | | ||||| ||    
T  3147414 ttaattgtaagaagagacacatcaaaagtcccaccacccaagtcaaagataaaaatattacgctcctctacacaattacacaattagttctcttgtccag 3147513  T
Q  609 gccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatca 708  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| || || ||||| | ||||| ||||    
T  3147514 tccatacgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgcataatattaaggccagcaataacaccagcatctattgtcgctttccgctgagcatca 3147613  T
Q  709 ttgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacagg 749  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3147614 ttgaaataagcaggtacggtaacaactgcattcttgacagg 3147654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 431 - 752
Target Start/End: Original strand, 8602038 - 8602359
Alignment:
Q  431 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 530  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | ||| | |||||| || |||||||||| || |   ||||||||||| ||    
T  8602038 caaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaag 8602137  T
Q  531 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 630  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||  || ||||  || || | || | |||||||||||||| ||| || |||    
T  8602138 agaaacatcaaaagttccaccaccaagatcaaatatgaaaatatttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagcagctgca 8602237  T
Q  631 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtga 730  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  8602238 gttggctcattgattatccgcattacattgagaccagcaatggcaccagcatcttttgtggcttttcgctgagaatcattaaaataagccggcacagtaa 8602337  T
Q  731 caactgcatttttaacaggtga 752  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  8602338 caactgcattcttgacaggtga 8602359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 331 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 29582045 - 29581564
Alignment:
Q  331 gaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcag 430  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||| |  ||| || ||| |||| |||  | |||| |||| || |||||||||||| || || |  |    
T  29582045 gaaagtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcg 29581946  T
Q  431 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 530  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||   |||| | || | |||||| ||    
T  29581945 caaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaaacttatcatccttgagtgtgagaag 29581846  T
Q  531 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 630  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||  ||| || |  |||||   || | ||  ||||||||||  || ||||||    
T  29581845 agacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagatgaatatatttcgttttccaacaaaattacctcccttttgaataccatatgcaagtgcagcagca 29581746  T
Q  631 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtga 730  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29581745 gttggttcgttgattatcctcattacattgaggccagctataatgccagcatctttggtggcttttcgctgagaatcattgaaataagcaggcacggtaa 29581646  T
Q  731 caactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctc 812  Q
      |||||||| || |||||  ||| |||| |   ||||||||| |  | ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  29581645 tcactgcattctttacaggcaattccaaaaatttctctgcaatatcatgcatctttgagaggatcatagatgatatttcctc 29581564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 331 - 775
Target Start/End: Original strand, 8545597 - 8546040
Alignment:
Q  331 gaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcag 430  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||  | |||||||| ||| |||||||||||| || ||||       
T  8545597 gaaagtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttca 8545696  T
Q  431 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 530  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| || || || |||| ||| | |||||||||||| || || |||||||| | |  ||||||||| || |     
T  8545697 caaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagtggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaat 8545796  T
Q  531 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 630  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  | | || | ||  || || | || | |||||||||||||| ||| || |||    
T  8545797 agacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaac-caattagctctcttttgaaggccatatgcaagagccgccgca 8545895  T
Q  631 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtga 730  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||  |||| |||||  | |||| | ||   || |||||||| ||||||||||| || || |    
T  8545896 gtcggttcattgattatccgcatgacatttagaccggcaatttcacctgcatcttttgtggatctttgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaa 8545995  T
Q  731 caactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
      |||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  8545996 tcactgcattcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatct 8546040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 438 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 7877830 - 7877450
Alignment:
Q  438 gttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacaca 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| | || ||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||    
T  7877830 gttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaagctatcatcttttagtgtgagaagagacaca 7877731  T
Q  538 tcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcacc-atcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggt 636  Q
    || ||||| ||||||||||||||||  |  || | ||||||||  || ||   |  ||  | | || | ||||||||||||||  || |||||||| |||    
T  7877730 tcgaaagtgccaccaccaagatcaatgatgaacacatttcgttttccgatgttatttat-tctcttttgaaggccatatgcaagggcagcagcagttggt 7877632  T
Q  637 tcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactg 736  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  7877631 tcattaattatccgcataacattgaggccggcaactgcaccagcatcttttgtggcttttcgttgagaatcattgaaataagccggcacagtaacaactg 7877532  T
Q  737 catttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    |||| || |||||||| | |||| |   |||||||||||    ||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7877531 cattcttgacaggtgactccaaaaacttctctgcaatctcgcgcatctttgtaaggatcatggatgatatttcctcggcaca 7877450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 411 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8383000 - 8382671
Alignment:
Q  411 cttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagaca 510  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||||| | ||| |||||||| || ||  ||||||||    
T  8383000 cttcctcttgaactcgtcaacaaagtacttcacgattctgttatctaagtcttcacctcctagatgagtgtctccggcagtggccttcacaacaaagaca 8382901  T
Q  511 tcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggc 610  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||  ||  |||  || || | || | |||||    
T  8382900 ttattcttaattgtgaggagagacacatcaaaagttccaccaccaagatcaaagatgaaaatatttctctcttcaagacaattagctctcttctgaaggc 8382801  T
Q  611 catatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcatt 710  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |  |||||||||||    
T  8382800 catatgcaagagcagcggcagttggctcattgattatccgcattacattgaggccagcaatcgcaccagcatcttttgtggctttccgttgagaatcatt 8382701  T
Q  711 gaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  8382700 gaaatatgcaggcacggtaacaactacatt 8382671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 444 - 816
Target Start/End: Original strand, 8609994 - 8610366
Alignment:
Q  444 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || || ||  |||    |||||||||||| | ||||||||| |||    
T  8609994 cattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccagcagtagccttgacatcgaaagcattgtttttaattgtgagaacagacacatcgaaa 8610093  T
Q  544 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcg-ttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattg 642  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||  ||| ||||  || || | || | ||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  8610094 gtcccaccaccaagatcaaagataaaaatatttctattttcca-cacaattagctctcttctgaagaccatatgcaagagccgcagccgttggttcattg 8610192  T
Q  643 attatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttt 742  Q
    || ||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||    
T  8610193 ataatccggattacattaaggccagaaatgacaccagcatcttttgtggctttccgctgagaatcattaaaataagcaggcacagtgatcactgcatctt 8610292  T
Q  743 taacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgca 816  Q
    ||||   ||| | |||| |   ||| || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8610293 taacctttgactccaaaaatttctcggctatctctttcatttttgcaaggatcatagatgaaatttcctccgca 8610366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 331 - 775
Target Start/End: Original strand, 8576290 - 8576734
Alignment:
Q  331 gaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcag 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||| ||||| | |||||||| | | || |||  || | || |||| |     
T  8576290 gaaagtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaa 8576389  T
Q  431 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 530  Q
    ||||||  | || |||| ||||||||||||| |  || || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||     |||| |||||| |     
T  8576390 caaagtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaat 8576489  T
Q  531 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 630  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| || | || ||||  || || | || | ||||||||| |||| |||||| |||    
T  8576490 agacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttcttttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatacgcaagagctgccgca 8576589  T
Q  631 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtga 730  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||  | |||||| |||  || |||||||| |||||||||||||| |  |    
T  8576590 gtcggttcattgattatctgcatgacattgagaccagcaattgcacctgcatctttagtggctcttcgttgggaatcattaaaataagcaggcacagaaa 8576689  T
Q  731 caactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
      |||||||| ||||||||||  | || | |||||||||||||||    
T  8576690 tcactgcattcttaacaggtgtctgcagaaaagcctctgcaatct 8576734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 451 - 752
Target Start/End: Original strand, 8538120 - 8538421
Alignment:
Q  451 ttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccac 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||| ||| |   || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  8538120 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatctccggcagtggccttgactgtaaaggcattattcttcaatgtaaggagagatacatcaaaagttccac 8538219  T
Q  551 caccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcct 650  Q
    ||||||||||||| |  ||||  ||||  ||  || ||||  || || | || | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  8538220 caccaagatcaaagatgaaaacttttctctcttcaacacaattagctctcttttgaaggccgtatgcaagagcagcagctgtaggttcattgattatccg 8538319  T
Q  651 cataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggt 750  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||||||    
T  8538320 cattacattgaggccagcaatgacaccagcatctttggtggctcttcgctgtgaatcattgaaataagcaggtactgtaatcactgcatttttgacaggt 8538419  T
Q  751 ga 752  Q
    ||    
T  8538420 ga 8538421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 331 - 775
Target Start/End: Original strand, 8570275 - 8570719
Alignment:
Q  331 gaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaa-ttcctca 429  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||| ||| || |||||||| | | ||||||| |||| || ||| |||    
T  8570275 gaaagtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttca 8570374  T
Q  430 gcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgagga 529  Q
     ||||||   ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| | |||||||||||| || |||||| ||   | | | |||| |||||| |    
T  8570375 -caaagtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaa 8570473  T
Q  530 gagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagc 629  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  | | || || |  || || | || | |||||||||||||| |||||| ||    
T  8570474 tagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacaaaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgc 8570573  T
Q  630 agtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtg 729  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||  | |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  8570574 agtcggttcattgattatccgcattacattgagaccagcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagta 8570673  T
Q  730 acaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
    |  |||||||| |||||||| || | |||| | || ||||||||||    
T  8570674 atcactgcattcttaacaggagactccaaaaatgcttctgcaatct 8570719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 752
Target Start/End: Original strand, 8590715 - 8591023
Alignment:
Q  444 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  8590715 cattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagagacacatcaaaa 8590814  T
Q  544 gtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcacc-atcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattg 642  Q
    || ||||||||||||||||| |  || | ||||||||  || ||   | ||  || | || | ||||||||||||||   | || ||||| ||||||||     
T  8590815 gtgccaccaccaagatcaaagatgaacacatttcgttttccgatgtta-ctttctctcttttgaaggccatatgcaaggccagcggcagttggttcatta 8590913  T
Q  643 attatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttt 742  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  8590914 attatccgcattacattcaagccagcaatgacaccagcatctttggtagctttcctctgagaatcattaaaataagctggcacagtaacaactgcattct 8591013  T
Q  743 taacaggtga 752  Q
    | ||||||||    
T  8591014 tgacaggtga 8591023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 601 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8671564 - 8671425
Alignment:
Q  601 ttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctct 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  8671564 ttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaagtccagcaatagtaccagcatcaatggtggccgttcgct 8671465  T
Q  701 gagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8671464 gagaatcattgaagtaagctggcacggtaacaacggcatt 8671425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 29577812 - 29577392
Alignment:
Q  395 taatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggc 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || || |   |||||| | ||| |||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  29577812 taatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggc 29577713  T
Q  495 tttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgtt---caccatcacac 591  Q
     || ||||||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || | |||||| |   || || || |     
T  29577712 ctttacttcaaaactatcatccttaagtgtgagaagagacacatcaaaggtgccaccaccaagatcaaagatgaatacatttcgctttccaacaacaaaa 29577613  T
Q  592 ctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtgg 691  Q
     ||||| | || | ||  ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    || |||||  ||||||    
T  29577612 ttacctctcttttgaattccatatgcaagtgcagcagcagttggttcattgattatccgcattacattgaggccagcaataatgccggcatctttggtgg 29577513  T
Q  692 cttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaag 791  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || || ||| | | |||| |   ||||||||||| || ||| ||||  ||    
T  29577512 cttttcgctgagaatcattgaaataagctggcactgtgatcactgcattctttacgggtaactccaaaaatttctctgcaatctcctgcatctttgagag 29577413  T
Q  792 gataatagatgatatttcctc 812  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  29577412 gatcatagacgatatttcctc 29577392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 439 - 728
Target Start/End: Original strand, 8559405 - 8559694
Alignment:
Q  439 ttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacat 538  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| | |||||| || |||||||||| || |   ||||||||||| ||||| ||||    
T  8559405 ttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaagagattattcttaattgtgagaagagaaacat 8559504  T
Q  539 caaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttc 638  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||   | ||||  ||  | | || | ||| |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  8559505 caaaagttccaccaccgagatcaaagatgaaaatatttctctctttaacacaattagatctcttttgaagtccatatgcaagagcagctgcagttggttc 8559604  T
Q  639 attgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggt 728  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8559605 attgattatctgcattacattaagaccagcaatttcacctgcatctttggtggctcttctttgagaatcattaaaataagcaggtacggt 8559694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 439 - 775
Target Start/End: Original strand, 8581772 - 8582108
Alignment:
Q  439 ttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacat 538  Q
    |||| ||||||||||||||| || || || || |||||||| | |||||||||||| || |||||| || | | |   |||| |||||| | ||||||||    
T  8581772 ttcaccattctgttatcaaaatcttcccctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttcatagtcgttattcttaactgtgagaatagacacat 8581871  T
Q  539 caaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttc 638  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  | | || ||||  || || | || | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8581872 caaaagttccacctccaaggtcaaagataaaaatatttctcttatcaacacaattagctctcttttgaaggccatatgcaagagctgccgcagtcggttc 8581971  T
Q  639 attgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgca 738  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || || |||||  |||| |||||  | |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||    
T  8581972 attgattatccgcattacattgagacctgcaatttcacctgcatctttagtggctcttcgttgtgaatcattaaaataagcaggtacagtaatcactgca 8582071  T
Q  739 tttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
    || ||||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  8582072 ttcttaacaggtgactccaaaaatgcctctgcaatct 8582108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 8601626 - 8601903
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |  || |||| |||||| |||||  ||| || ||  ||||    
T  8601626 aaagcagcttgaactgctgcgccataggcaactgcctcatcaggattgatgctcacgcaaatgtccttccaattgaaaaattctttcagtaattgttgca 8601725  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| || |||||||| || ||||  | |||  |||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  8601726 ctttgggaatcctagaagaaccgccaacaaggacagcatcatccacactactcttttcgatctgagcatcactaagacaactttcaacagtctctataca 8601825  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataa 296  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| | || |||||||| |||  |||||| || |||||| ||||    
T  8601826 cttcttaaagaggtccacattgagttgctcaaacttggcccgagtgattgatgaatggaaatcaataccctcaaataa 8601903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29582357 - 29582203
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||| ||||| |||||   || ||| |  ||||    
T  29582357 aaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttccccttgaaaaattcttgcaatagctgatgca 29582258  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactctt 173  Q
    ||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29582257 ctttgggaattctagaagagccaccaataaggacgatatcatctacactactctt 29582203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 657 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8640425 - 8640342
Alignment:
Q  657 attaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  8640425 attaaggccagcaatggccccggcatctatggtggctttttgctgataatcattgaagtaagcaggcatagtaacaactgcatt 8640342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 745
Target Start/End: Original strand, 39985875 - 39986024
Alignment:
Q  596 ctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttt 695  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || |||||  | ||||||||| |||| ||||     
T  39985875 ctttcttgtcaagaccataagcaatggcagcagcagtgggctcattgataattcgcatgacattaagaccggcaataactccagcatccttggtagcttg 39985974  T
Q  696 tctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaa 745  Q
     | ||| || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  39985975 acgctgggagtcattaaagtaagcagggacagtaacaacagcattcttaa 39986024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 8017347 - 8017208
Alignment:
Q  601 ttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctct 700  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| || |||| |||||| || || |||||| |||| |||||| | |||||||  | ||    
T  8017347 ttgtcaagtccgtacgcaatagctgcagctgttggctcgttgataattctcaaaacattgagtcctgcaatgacaccggcatcctttgtggcttgacgct 8017248  T
Q  701 gagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||    
T  8017247 gcgaatcattgaagtaagctggaactgtaacaacggcatt 8017208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8017540 - 8017397
Alignment:
Q  408 gttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaag 507  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| |  || | ||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||     
T  8017540 gttcttcctcttaaactcctgaacaaaatgattaaccattctgttgtcaaaatcttcaccaccaagatgggtatcaccagcagtagccttaacttcaaaa 8017441  T
Q  508 acatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccacc 551  Q
    | | |  ||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  8017440 ataccctcttcaatagtaagaagagacacatcaaaagtaccacc 8017397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 8545285 - 8545355
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttccc 89  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||    
T  8545285 aaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctcttgcataattccttccc 8545355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Original strand, 8576104 - 8576214
Alignment:
Q  145 acaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgattt 244  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| | ||| | ||||||| | | ||||||||| || ||||  | ||| |||| |||||| ||||    
T  8576104 acaaggacaacatcatctacactattcttgtccatcttagcatcagcaagacaaatattaacagtattcatacacttttcaaagaggttcatattcattt 8576203  T
Q  245 cctcaaacttg 255  Q
    |||||||||||    
T  8576204 cctcaaacttg 8576214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 8581352 - 8581422
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttccc 89  Q
    |||||||||||||  || || |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  8581352 aaagcagcctgaatagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttccc 8581422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 16662506 - 16661709
Alignment:
Q  21 agcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcact 120  Q
    |||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |  | || || ||||||||||    
T  16662506 agcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcact 16662407  T
Q  121 ttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcact 220  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  | ||| || |||||||||||   || ||||||||||||| | || || ||||    
T  16662406 tttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacact 16662307  T
Q  221 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgac 320  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  16662306 cgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgac 16662207  T
Q  321 caatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctctta 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  16662206 caatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctatta 16662107  T
Q  421 aattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 520  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662106 aattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 16662007  T
Q  521 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  16662006 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttcaccatcacaattacttcttttgtcaaggccatatgcaat 16661907  T
Q  621 agctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagca 720  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  16661906 agctgctgcagtgggttcattgattatcctcacaacgttaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttcgctgagaatcgttaaaataagca 16661807  T
Q  721 ggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16661806 ggaacagtgacaactgcatttttaaccggtgattccaaataagcctctgcaacctccttcatgtttgtgaggacaatagatgagatttcctcggcaca 16661709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 178 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 16657874 - 16657234
Alignment:
Q  178 atctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagaga 277  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  16657874 atctttgaatcacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaa 16657775  T
Q  278 aatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaa 377  Q
    | || || |||| | ||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||    ||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16657774 agtcaattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaa 16657675  T
Q  378 ggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtga 477  Q
    ||||||||  |||  | | || ||||| |  |||||| | | ||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16657674 ggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtga 16657575  T
Q  478 gtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttc 577  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16657574 gtgtttccggcagtggcttttacctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaatattcc 16657475  T
Q  578 gttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcacc 677  Q
    ||| |||||||||   || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||    
T  16657474 gtttaccatcacaatcacttctcttgtcaagaccatatgcaatagctgcagcagtaggttcattgataattcgaatgacattaaggccagcgatggcacc 16657375  T
Q  678 agcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttc 777  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || | || | | ||||| |||| ||||    
T  16657374 agcatctatggtggcttttcgctgcgaatcattgaagtaagctggcacagtaacaacagcattcttgacaggcgactccataaatgcctcagcaa-cttc 16657276  T
Q  778 t-tcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    |  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16657275 tcgcatctttgtaaggatcatagatgatatttcctcagcaca 16657234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 748
Target Start/End: Original strand, 14703060 - 14703789
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| || || ||||| | ||| || ||    | || || ||| |    
T  14703060 aaagcagcctgaacagctgccccataagctacagcttcatcagggttaatgctgttgcacaactccttcccctggaaaaagtcctgtaataattgctgta 14703159  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| |  || || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||  ||||||||||||||||| | || |  ||    
T  14703160 ctttgggaatccgagaagacccaccgacaagaacaacatcatctactctactcttgtccatcttagcatcaataagacaactctcaacaatcttcacaca 14703259  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |   |||| || ||||| || || ||||  | | |||||  ||| | ||||||||| | |    
T  14703260 ctcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgcattgaaataaagcatctacctcaatagtggcg 14703359  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatc-gttcttcctc 417  Q
    || | || |||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||| | ||| |||||| |||||||   | |||| |||| ||| ||| || |||    
T  14703360 acaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggatttccactaatgtcca-atctgttttttctc 14703458  T
Q  418 ttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctt 517  Q
    || || || | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||| ||  |||||    || |    
T  14703459 ttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcagtagccttaatttggaagacggtgccct 14703558  T
Q  518 taattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgc 617  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| || |   |  | | |||||||||||||||||    
T  14703559 taattgttaggagagacacgtcaaaagtaccaccaccaagatcaaagacaaatatattacgttctccaccataatcagttctcttgtcaaggccatatgc 14703658  T
Q  618 aatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataa 717  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  14703659 aatagctgcagctgtaggttcattcattaccctcataacattgaggccggcaataacaccagcatccatagtggcttttctttgagaatcactaaaataa 14703758  T
Q  718 gcaggcacggtgacaactgcatttttaacag 748  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  14703759 gcaggcaccgtaacaactgcattcttaacag 14703789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 12259097 - 12258343
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||||||||  || ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||    | ||| | |||||    
T  12259097 aaagcagcctgaatagccgccccaaaagctacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgca 12258998  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    ||||| |||| || || || || || |||||||||| |||||||||  ||||||| ||  | || | ||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  12258997 ctttgagaatcctagaagacccacctacaaggacaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatccgtaagacaactctcaacagtcttcatgca 12258898  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
     ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |      
T  12258897 ttcattgaaaagttccaaatttatttcctcaaacttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgca 12258798  T
Q  319 accaatttga-aagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctc 417  Q
    || ||   || |||||||||  ||||||||  | ||||| || ||| |||| | |||||| |||||||||||   | | ||||| || | |||||| |||    
T  12258797 ac-aacaagataagaaagtgatctttttgcactctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctc 12258699  T
Q  418 ttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctt 517  Q
    || || || ||  |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||||| | | |    
T  12258698 ttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatcct 12258599  T
Q  518 taattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgc 617  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |  ||||  ||  | | |||||||||||||||||    
T  12258598 taatggttagtagagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatattccgtttttcgacacaattaattcttttgtcaaggccatatgc 12258499  T
Q  618 aatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataa 717  Q
    || |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||   |||  |||| || |||||||| || || |||||| | |||||     
T  12258498 aaaagctgcagcagtaggttcatttaatatcttcataacattcaggccaacaatattacccacatctatagtggctttcctttgtgaatcactaaaatat 12258399  T
Q  718 gcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaat 773  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  12258398 gcaggcacagtaacaactgcattcttaacgggtgattctaaatatgcctcagcaat 12258343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 746
Target Start/End: Original strand, 12234430 - 12235068
Alignment:
Q  108 tagttcctgcactttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaaca 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||| || || ||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  12234430 tagttgctgcactttgggaatcctagaggacccgccaataaggacaacttcatccaccctacttttgtccatcttagcatcactaagacaactctcaaca 12234529  T
Q  208 gtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatct 307  Q
     | || || |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |   |||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| | ||    
T  12234530 atcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaaataaagaatctacct 12234629  T
Q  308 caatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatc 407  Q
    |||| || |  || |    |||||| | ||  ||||||||| | ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||   | | || ||||| |     
T  12234630 caatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttt 12234729  T
Q  408 gttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaag 507  Q
     ||||| || || || || | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  |||    
T  12234730 tttctttctattgaactcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaag 12234829  T
Q  508 acatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaa 607  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||   |  | | |||||||    
T  12234830 acattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttcgttctccaacacaatcagttctcttgtcaa 12234929  T
Q  608 ggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatc 707  Q
    | |||||||||| ||| || ||  ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||  ||||||||    
T  12234930 gaccatatgcaacagcggctgccatgggttcgttcattaccctcataacattgaggccagcaatgacaccagcatctatagttgcttttcgttgagaatc 12235029  T
Q  708 attgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaac 746  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12235030 attgaaataagcaggcacggtaacaactgcattcttaac 12235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 740
Target Start/End: Original strand, 7541881 - 7542599
Alignment:
Q  22 gcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcactt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||||| || ||  | | ||| |  || |||     
T  7541881 gcagcctgaacagctgccccataagcaacagcctcatcaggattaatgctcttgcacaagtcctttccattgaaaaagtcctttaatagctgatgtacta 7541980  T
Q  122 tgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactc 221  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||   | ||||| || || || | |||  ||||||| ||  ||||| |  | || |||||    
T  7541981 tgggaatcctcgaagacccgccgacaaggacaacatcatctatcatgctcttgtccatattagcatcaataagacagcttccaacaatcgtcatacactc 7542080  T
Q  222 attaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgacc 321  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||||||| | |   |||| || ||||| || || ||||| | | ||||| |||| | ||||||||| |  ||     
T  7542081 gttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagtggcaaca 7542180  T
Q  322 aatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaa 421  Q
    |    |||||||||||  ||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||| | |||||| ||||| |    
T  7542181 acaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttga 7542280  T
Q  422 attcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaat 521  Q
    | || |   |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||   |  || |||||    
T  7542281 actcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggccttaacttggaagttgttgcccttaat 7542380  T
Q  522 tgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaata 621  Q
     || || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |   |  | | ||||||||||||||||||| |    
T  7542381 cgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttcgctctccatcataatcagttctcttgtcaaggccatatgcaaca 7542480  T
Q  622 gctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcag 721  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7542481 gctgcggcagtaggttcattcattgccctcataacattgaggccagcaatggcacccgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattaaaataagcag 7542580  T
Q  722 gcacggtgacaactgcatt 740  Q
    | || || |||||||||||    
T  7542581 gtacagtaacaactgcatt 7542599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 12245922 - 12245168
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| || ||| ||||||| || || ||||| ||||| || ||    | ||| |  || |    
T  12245922 aaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgtcagggttaatgctcttgcacaattccttcccgttgaaaaagtcctgtaatagctgttgga 12245823  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| || || || || || ||||| |||| ||||||||   ||||||| || ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  12245822 ctttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttataca 12245723  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
     ||||||| ||| || | ||| | ||||||||||||  | ||  |||| || ||||| ||||| ||||| | | ||||| |||| | ||||||||| |      
T  12245722 atcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgca 12245623  T
Q  319 accaatttgaaa-gaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctc 417  Q
    || ||   |||| |||||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| | |||||||||| ||| | |   | |||||||||  | |||||| |||    
T  12245622 ac-aacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctc 12245524  T
Q  418 ttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctt 517  Q
    || || ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  | | | |    
T  12245523 ttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggccttaacttggaagatgttatcct 12245424  T
Q  518 taattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgc 617  Q
    |||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||   | || | || ||||||||||||||    
T  12245423 taatagttaggatagaaacgtcaaaagtgccaccaccaagatcaaacacaaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttttcaaggccatatgc 12245324  T
Q  618 aatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataa 717  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |  |||||||| || || ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  12245323 aacagctgcagcagtgggttcattcattaccctcataacattgagaccagcaattgagccagcatctatcgttgcttttcgctgagaatcactaaaataa 12245224  T
Q  718 gcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaat 773  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  12245223 gcaggtacagtaacaacagcattctttaccggtgattctaaatatgcctcagcaat 12245168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 395 - 740
Target Start/End: Original strand, 43625440 - 43625785
Alignment:
Q  395 taatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggc 494  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43625440 taatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggc 43625539  T
Q  495 tttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacaccta 594  Q
    ||||||    ||||| |   | |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  43625540 tttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagatgaaaatatttcgttctccaacacaatta 43625639  T
Q  595 cctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggctt 694  Q
      | | |||| |||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||  |  | ||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43625640 attctcttgttaaggccgtatgctagagcagcagctgttggttcattgattactcgtaaaacattaaggccgacaatgacaccaacatctatggtggctt 43625739  T
Q  695 ttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43625740 ttcgctgagaatcattgaagtaagcaggcacggtaacaactgcatt 43625785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 451 - 773
Target Start/End: Original strand, 11999478 - 11999800
Alignment:
Q  451 ttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccac 550  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||   | |||||||| || | ||||| ||||||||| ||||    
T  11999478 ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgtggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgccac 11999577  T
Q  551 caccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcct 650  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||| ||| ||| ||||   | || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||    
T  11999578 cgccaagatcaaagactaaaatgtttctttctccaacacaatcagctctcttgtcaaggccatatgcaacagttgcagcagtgggttcattcattaccct 11999677  T
Q  651 cataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggt 750  Q
     |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||| | |||||||| || || || |||||  |||| || || |||    
T  11999678 tataacattgatgccagcaattgcaccggcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagctggtacagtaacaacaacattctttaccggt 11999777  T
Q  751 gatttcaaataagcctctgcaat 773  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||    
T  11999778 gattctaaatatgcctcagcaat 11999800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 17716618 - 17716483
Alignment:
Q  610 ccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcat 709  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||| | | || |||| ||||||||||  ||    
T  17716618 ccataagcaatggctgcagcagtgggctcattaataattctcatgaaattaagaccagcaatagcaccagcatgcttagtagcttgtctctgagaaaaat 17716519  T
Q  710 tgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaa 745  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  17716518 taaagtaagcagggacagtaacaacggcattcttaa 17716483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 11999060 - 11999294
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || || ||||| ||||| || ||    | ||| |  || |    
T  11999060 aaagcagcttgaacagctgccccataagctacagcctcatcagggttaatgctcttgcacaactccttcccgttgaaaaagtcatgtaatagctgttgga 11999159  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||| | || || || || || ||||| |||| ||||||||   ||||||| || ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  11999160 ctttggga-tcctagaagatccaccaacaagtacaacatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttataca 11999258  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaactt 254  Q
     ||||||| ||| || | ||| | ||||||||||||    
T  11999259 atcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactt 11999294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 818
Target Start/End: Original strand, 30774906 - 30775703
Alignment:
Q  21 agcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcact 120  Q
    ||||||||| || ||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |  | || |||||||||||||    
T  30774906 agcagcctggacagctgccccgtgagcaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcact 30775005  T
Q  121 ttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcact 220  Q
    |||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  30775006 ttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacact 30775105  T
Q  221 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgac 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | | | |||||| ||| ||||||| |   ||||     
T  30775106 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgag 30775205  T
Q  321 caatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctctta 420  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  30775206 aaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtctta 30775305  T
Q  421 aattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 520  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||    
T  30775306 aattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaacacatcatctctaa 30775405  T
Q  521 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaat 620  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  30775406 tggtgagaagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaagacaaaaatattcctctcagcatcacacctacctctcttctcaagtccatatgcaat 30775505  T
Q  621 agctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagca 720  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  30775506 agctgctgcagtgggctcattaattattctcataacattaagaccagcaatggcaccagcatccatagtggcttttcgctgtgcatcattgaaataagca 30775605  T
Q  721 ggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcaca 818  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||   |||||||||||   |||||||||  ||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  30775606 ggcacagtgataactgcatttttaactggggattccaaatacatctctgcaatctctctcatatttgtgaggactattgatgaaatttcctcggcaca 30775703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 9336405 - 9335686
Alignment:
Q  21 agcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcact 120  Q
    |||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| || |||||   | || |||| || ||||| ||||| |||||   || |||||| ||||||    
T  9336405 agcagcttgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagttcttgcact 9336306  T
Q  121 ttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcact 220  Q
    || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |   ||||||| | ||||||||||||  | |||||  | |||||| |||| || ||||    
T  9336305 ttcggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacact 9336206  T
Q  221 cattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgac 320  Q
    |||| |||| |||||| || | ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||  | |||||  ||| | ||||| ||| || ||    
T  9336205 cattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtaac 9336106  T
Q  321 caatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctctta 420  Q
     ||    ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| ||||   | || ||||| |  |||||| | ||     
T  9336105 aaaagcaaaagacagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttctttttt 9336006  T
Q  421 aattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaa 520  Q
    || || ||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  9336005 aactcttccacaaaatagttaaccattctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcacccttaa 9335906  T
Q  521 ttgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaat 620  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||   |  | | || |||||||||||||||||    
T  9335905 ttgtgaggatagacacatcaaaagtaccgccacccagatcaaagacaaaaatatttcggttaccatcacagtcatttctcttatcaaggccatatgcaat 9335806  T
Q  621 agctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagca 720  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||     
T  9335805 agctgcagcagtaggttcattgattatccgaatgacattaaggccagcaatagtaccagcatctatggtggcctttcgctgagaatcattgaagtaagct 9335706  T
Q  721 ggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  9335705 ggcacggtaacaacggcatt 9335686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 431 - 754
Target Start/End: Original strand, 35132512 - 35132835
Alignment:
Q  431 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggag 530  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||| | | ||||| || || |     
T  35132512 caaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtat 35132611  T
Q  531 agacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagca 630  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||   |  | | |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  35132612 tgaaacatcaaaagtgccaccaccaagatcgaagacaaaaatattttgttctccagcacaatcagatctcttgtcaaggccatatgcaaccgctgcggca 35132711  T
Q  631 gtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtga 730  Q
    || |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  35132712 gtaggttcattcattactctcataacattgggaccagcaatagcaccagcatctatagtggcttttcgttgagaatcactaaaataagcaggcacagtaa 35132811  T
Q  731 caactgcatttttaacaggtgatt 754  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  35132812 caactgcattcttaacagttgatt 35132835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Original strand, 35132108 - 35132377
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||| ||||||| || || ||||| ||||| || |    || ||| | |||||    
T  35132108 aaagcagcctgaactgctgccccataagctacagcctcatcggggttaatgctcttgcacaactccttccctttgaaaaagttttgcaatagctgctgca 35132207  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactcta-ctcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgc 217  Q
    |||||||||| || || || || || ||||| |||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| | |||  | ||||||||||| || ||||| || |    
T  35132208 ctttgggaatcctagaagaccctccaacaagaacaacatcatctacccttgctcttgtccatcttagcatcaatgagacaactctctacggtattcatac 35132307  T
Q  218 actcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgcc 287  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  35132308 actcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgcc 35132377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 23596516 - 23596375
Alignment:
Q  604 tcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgag 703  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||| | || ||||  |  || |    
T  23596516 tcaagaccataagcaatagcggcagcagtgggctcgttaataattctcatcacattgagtccagaaatgacaccagcatccttagtagcttgacgttgtg 23596417  T
Q  704 aatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaa 745  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  23596416 aatcgttgaagtatgcaggcacggttacaacggcattcttaa 23596375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 508
Target Start/End: Original strand, 54396495 - 54396564
Alignment:
Q  439 ttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaaga 508  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  54396495 ttcaccattctgttatcaaaatcttcaccaccaagatgagtatcaccagcagtagctttcacttcgaaga 54396564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 34467274 - 34466505
Alignment:
Q  49 acagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgcactttgggaattctggacgagccgccgacaa 148  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| || |||||||| || || | || ||| | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  34467274 acagcctcatcagggttgatgctattgcatagatccttaccattgaaaaagtcccgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagagcccccgacaa 34467175  T
Q  149 ggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactcat---taaaaaggtccatattgatttc 245  Q
    |||||  |||||  || |||||| | || ||||| | |||   |||||||||| ||||| |  | ||||| | ||   |||| | |||||||||||||||    
T  34467174 ggacagcatcatgcacactactcgtgtccatcttagcatcaacaagacaactcacaacaatcctcatgcattaatctttaaagaagtccatattgatttc 34467075  T
Q  246 ctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtccttttt 345  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||  ||||| ||||| |||| || |||| ||||| ||| ||        | |||||||| |||    
T  34467074 ctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgacaaa--------agagtgtcctcttt 34466983  T
Q  346 gccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaaca 445  Q
    || || || || || |||||||||| |||||| ||||| || ||   | ||||||||  ||  | ||||||||| || ||||  ||||||| ||||  ||    
T  34466982 gcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgcaaagtggttcgcca 34466883  T
Q  446 ttctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagt 545  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34466882 ttctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagt 34466783  T
Q  546 cccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgatt 645  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||  |  || |   | || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34466782 cccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttccttcttccacaaagtcagctctcttgtcaagtccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgatt 34466683  T
Q  646 atcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaactgcatttttaa 745  Q
    ||   || |||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34466682 atttgcaaaacattaaggccagcaatagtaccagcatccacagtagcttttcgctgagaatcattaaaataagcaggcacggtgataactgcattcttaa 34466583  T
Q  746 caggtgatttcaaataagcctctgcaatcttcttcatatttgcaaggataatagatgatatttcctccgcacacaggt 823  Q
      ||||||| ||||||  |||||||| | | |  ||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34466582 ttggtgattccaaatattcctctgcagtatcccgcatctttgaaaggatcatagatgagatttcctcagcacataggt 34466505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 740
Target Start/End: Original strand, 15594686 - 15595414
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || |||| || || || || | ||| || ||  ||| |||||  ||||    
T  15594686 aaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaattcctttccctcgaaaaaatccttcaatagttgttgca 15594785  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| || || || || || |||| ||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| | |||   |||||||||||||||  | || || ||    
T  15594786 ctttgggaatcctagaagacccaccaacaatgacaatatcatttacactactcttattcatcttagcatcatcaagacaactctcaactatcttcataca 15594885  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
     || ||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||| || |  || ||| |||| || || || | | ||||| |||| | |||||| ||||||    
T  15594886 atccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaaataaacaatctacctcaatggtagtg 15594985  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    ||     | ||||| |||  |||||||||| |||| || || |||||||| | ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | ||||||| |||    
T  15594986 acagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtct 15595085  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    | |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||  ||||| |   | ||    
T  15595086 tgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtcctt 15595185  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||  ||    | ||||||||||||||||||    
T  15595186 aattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccaccaagatcaaagacaaaaatatttctttctccaacacagttaatcctcttgtcaaggccatatgca 15595285  T
Q  619 atagctg-------cagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattg 711  Q
    |||||||       |||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  15595286 atagctgcagctgtcagctgtcggttcattgattacccgtataacattaaggccagcaatggcacctgcatctatagtggcttttcgttgagaatcattg 15595385  T
Q  712 aaataagcaggcacggtgacaactgcatt 740  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15595386 agataagcaggcacggtaacaactgcatt 15595414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 178 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4678914 - 4678359
Alignment:
Q  178 atctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagaga 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || || ||||| |    
T  4678914 atctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctcaaacttggcacgagtaatagatgaagaaa 4678815  T
Q  278 aatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaa 377  Q
    | || || |||| | ||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||   |||||| |||||||| |||||| | || || || |||||||||| ||| ||    
T  4678814 agtctattccctgaaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccctctcgcaggcagttctcaacctccttaa 4678716  T
Q  378 ggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtga 477  Q
    || | |||  |||||| |||| |||||||  |||||| | || || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4678715 gggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccacctaggtga 4678616  T
Q  478 gtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttc 577  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4678615 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaccaccaaggtcaaagacaaatatatttc 4678516  T
Q  578 gttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcacc 677  Q
    ||| || |||||    || | | |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    || |||||||| ||||||||||||||    
T  4678515 gtttacaatcactttcacttctcttgtcaaaaccatatgcaatagctgcaacagtaggttcgttgattatttgaatgacattaagtccagcaatggcacc 4678416  T
Q  678 agcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcacggtgacaac 734  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  4678415 agcatctatggtagcttttcgttgagaatcattgaagtatgcaggcacagtaacaac 4678359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 52549353 - 52549292
Alignment:
Q  194 gacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttg 255  Q
    ||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52549353 gacaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttg 52549292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 752
Target Start/End: Original strand, 12528156 - 12528889
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    |||||||||||||| || || |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || || || ||||| || ||   || ||| | || ||    
T  12528156 aaagcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaactcctgcaatagctgcttca 12528255  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||| | |||||| ||||| || |  || ||    
T  12528256 ctttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaactttcaacggtctccataca 12528355  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||  | ||| ||||||||||| | || ||| |||||| | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||      
T  12528356 cttttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgccctcacatatagcatctatgtcaattgtagcc 12528455  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
     |    | | | |||||||||||||| ||||| || ||    |||||||| | ||| | |||| |||  |||  | |||| || || | |||||||||||    
T  12528456 tctgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctct 12528555  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcaccttt 518  Q
    |||| || |   ||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||| |   ||    
T  12528556 taaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagacattattctt 12528655  T
Q  519 aattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgca 618  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||  |||  ||  ||  |||  || || | || | || ||||||||||    
T  12528656 tactgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaaaataaaaatccttctctcttcaagacaattagctctcttttgaatgccatatgca 12528755  T
Q  619 atagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataag 718  Q
    | ||| || ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| |    
T  12528756 agagcagctgcagttggttcgttgattatccgtattacattgaggccagcaatgacaccagcatccttggtggctcgtcgctgcgaatcattgaaatacg 12528855  T
Q  719 caggcacggtgacaactgcatttttaacaggtga 752  Q
    | ||||| || |  |||||||| |||||||||||    
T  12528856 ctggcaccgtaatcactgcattcttaacaggtga 12528889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 517 - 775
Target Start/End: Original strand, 43744999 - 43745255
Alignment:
Q  517 ttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatg 616  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||| | | |   || |  ||  | | || || || |||||||    
T  43744999 ttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcttcctcgcacagagttagttctcttttccagaccatatg 43745098  T
Q  617 caatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaata 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||    
T  43745099 caatagctgcagcagtgggttcattgattatcttcataacatcaagcccagcaatggcaccagcatc--tagtggctttccgctgataatcattgaaata 43745196  T
Q  717 agcaggcacggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| || |||||  ||| |||| | | |||||||||||    
T  43745197 agccggcacagtaacaactgcattcttgacaggcaattgcaaaaatgtctctgcaatct 43745255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 43744468 - 43744936
Alignment:
Q  19 aaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaattcgctcattagttcctgca 118  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||    || |||||   || |||||  || |    
T  43744468 aaagcagcctgcacagctgcaccaatagcaactgcctcatcagggttaatgttcttacacaaatccttccctgcaaaaaattcctgcaatagttgttgta 43744567  T
Q  119 ctttgggaattctggacgagccgccgacaaggacaatatcatctactctactcttctctatctttgaatcggtaagacaactctcaacagtatttatgca 218  Q
    |||| ||||| || || ||||| || ||||| |||| ||||| ||     ||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||| | || |  ||    
T  43744568 cttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagcgctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaaca 43744667  T
Q  219 ctcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtg 318  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||  | | ||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||    
T  43744668 ctcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggtg 43744767  T
Q  319 accaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattcttagtaatatccacatcgttcttcctct 418  Q
    || |     ||||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||   |||||| ||||| | ||||||| |||    
T  43744768 acaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttct 43744867  T
Q  419 taaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccag 487  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  43744868 taaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 435 - 717
Target Start/End: Original strand, 28910650 - 28910932
Alignment:
Q  435 gtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagac 534  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| | | | | |||||| ||||||||     
T  28910650 gtagttcaccatcctattatcaatgtcctcgaccccgaggtgagtgtttccagcggtggccttaacttggaagaccttatcctgaattgtaaggagagaa 28910749  T
Q  535 acatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgg 634  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || |  ||| |||||||||| ||| |||||  | || | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  28910750 acatcaaaagtcccactacccaggtcgaagatgaaagtatttcgttctccagcacactcagctctcttgtcgaggccatatgaaatagctacagcagtga 28910849  T
Q  635 gttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataa 717  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28910850 gctcattgattatccgcataacattaagcctgacaatggcaccagcatctatggtggctttcctctaagaatcattgaaataa 28910932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 498
Target Start/End: Original strand, 11133065 - 11133125
Alignment:
Q  438 gttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggcttta 498  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11133065 gttcaccattgtgttatcaaagtcttgtcccccgaggtgagtatctccagcagtggcttta 11133125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 603 - 683
Target Start/End: Original strand, 11170806 - 11170886
Alignment:
Q  603 gtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatc 683  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  11170806 gtcaaggccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatc 11170886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 671
Target Start/End: Original strand, 11156505 - 11156574
Alignment:
Q  602 tgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaat 671  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||  || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  11156505 tgtcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcataacattgaggccagcaat 11156574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 671
Target Start/End: Original strand, 11196958 - 11197027
Alignment:
Q  602 tgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaat 671  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||  || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  11196958 tgtcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcataacattgaggccagcaat 11197027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Original strand, 11200123 - 11200204
Alignment:
Q  602 tgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatc 683  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||  || ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  11200123 tgtcaagaccatatgcaattgcagctgcagaaggctcattgattattcgcaaaacattgaggccagcaatagcacccgcatc 11200204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 526 - 775
Target Start/End: Original strand, 28220110 - 28220359
Alignment:
Q  526 aggagagacacatcaaaagtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttcgttcaccatcacacctacctttgttgtcaaggccatatgcaatagctg 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||    ||  ||  | | ||||| |  |||||||||||||| |    
T  28220110 aggagagacacatcaaaagtcccaccacccaggtcaaagatgaaaatatttcgttctcccatgcagttagttcttttgtccaatccatatgcaatagcag 28220209  T
Q  626 cagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttttctctgagaatcattgaaataagcaggcac 725  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220210 cagcagtgggttcattgactatccttagaacatttagaccagcaatggtacctgcatctatggtggctttccgctgataatcattgaaataagcaggcac 28220309  T
Q  726 ggtgacaactgcatttttaacaggtgatttcaaataagcctctgcaatct 775  Q
     || | ||||||||| || |||||  ||| |||| | |||||||||||||    
T  28220310 agtaataactgcattcttgacaggaaattccaaaaaggcctctgcaatct 28220359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 494
Target Start/End: Original strand, 28219744 - 28220045
Alignment:
Q  193 agacaactctcaacagtatttatgcactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgtgtgattgacgaagagaaatcgatgccctcac 292  Q
    ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||     
T  28219744 agacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaa 28219843  T
Q  293 ataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgcggttctcaaccgcctcaaggctcttggattctt 392  Q
    ||||| |||| | |||||| || | ||| |     ||||| ||||||||||||||  | |  || || |||||||||| ||| ||||||||||  ||       
T  28219844 ataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttcc 28219943  T
Q  393 agtaatatccacatcgttcttcctcttaaattcctcagcaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtg 492  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28219944 agtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtg 28220043  T
Q  493 gc 494  Q
    ||    
T  28220044 gc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 625 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 42555830 - 42555760
Alignment:
Q  625 gcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatccatggtggcttt 695  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  42555830 gcagcagtgggttcattgattatcttcataacattcagaccagcaatagtacctgcatctattgtggcttt 42555760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1207
Description:

Target: scaffold1207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1201
Alignment:
Q  602 tgtcaaggccatatgcaatagctgcagcagtgggttcattgattatcctcataacattaaggccagcaatggcaccagcatc 683  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1120 tgtcaaagccatatgcaattgcagctgcagtaggctcattgagtattcccaaaacattgaggccagcaatagcacctgcatc 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University