View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12447_high_2 (Length: 366)

Name: NF12447_high_2
Description: NF12447
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12447_high_2
NF12447_high_2
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (1-350)||(1901661-1902010)
chr4 (1-350)||(15229273-15229622)
chr4 (1-350)||(15283446-15283795)
chr4 (1-350)||(15389896-15390245)
chr4 (1-359)||(6571257-6571615)
chr4 (1-359)||(34187469-34187827)
chr4 (1-359)||(31125027-31125385)
chr4 (1-359)||(24590864-24591222)
chr4 (1-359)||(30755158-30755516)
chr4 (1-359)||(33672307-33672665)
chr4 (1-359)||(36343024-36343382)
chr4 (12-359)||(14666433-14666780)
chr4 (1-359)||(14099945-14100303)
chr4 (1-359)||(5007277-5007635)
chr4 (1-359)||(39852042-39852400)
chr4 (1-359)||(21971105-21971463)
chr4 (1-359)||(27161825-27162183)
chr4 (1-311)||(40104195-40104505)
chr4 (1-359)||(54834791-54835149)
chr4 (1-359)||(14761813-14762171)
chr4 (105-359)||(17014551-17014805)
chr4 (6-359)||(24114071-24114424)
chr4 (1-311)||(18799170-18799480)
chr4 (282-350)||(24460281-24460349)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (1-350)||(16625160-16625509)
chr3 (1-350)||(18531738-18532087)
chr3 (1-359)||(20575397-20575755)
chr3 (1-359)||(8297322-8297680)
chr3 (12-359)||(18052623-18052970)
chr3 (1-350)||(5607881-5608230)
chr3 (1-359)||(7074562-7074920)
chr3 (1-359)||(18226541-18226899)
chr3 (30-359)||(29663520-29663849)
chr3 (1-349)||(20067393-20067741)
chr3 (6-349)||(15891266-15891609)
chr3 (1-359)||(4345237-4345595)
chr3 (1-359)||(5015062-5015420)
chr3 (6-359)||(15739644-15739997)
chr3 (6-359)||(22386128-22386481)
chr3 (1-359)||(22869406-22869764)
chr3 (1-359)||(22884465-22884823)
chr3 (1-359)||(31963023-31963381)
chr3 (1-311)||(18244089-18244399)
chr3 (1-359)||(28114504-28114862)
chr3 (1-350)||(5468335-5468684)
chr3 (6-319)||(6193670-6193983)
chr3 (1-350)||(11108908-11109257)
chr3 (1-350)||(5594916-5595265)
chr3 (1-359)||(10397483-10397841)
chr3 (1-359)||(18290903-18291261)
chr3 (1-359)||(18306204-18306562)
chr3 (6-359)||(35882121-35882474)
chr3 (6-349)||(4722986-4723329)
chr3 (1-359)||(10644420-10644778)
chr3 (1-359)||(17983506-17983864)
chr3 (1-359)||(24329509-24329867)
chr3 (1-359)||(51783373-51783731)
chr3 (1-359)||(18275602-18275960)
chr3 (1-359)||(29147305-29147663)
chr3 (6-359)||(8288021-8288374)
chr3 (1-359)||(6541012-6541370)
chr3 (33-359)||(18332010-18332336)
chr3 (1-259)||(48467277-48467535)
chr3 (15-359)||(7997926-7998270)
chr3 (12-259)||(4795303-4795550)
chr3 (1-359)||(47024803-47025161)
chr3 (1-359)||(4418269-4418627)
chr3 (1-359)||(21676043-21676401)
chr3 (105-349)||(32440608-32440852)
chr3 (1-350)||(8213088-8213437)
chr3 (282-350)||(5652860-5652928)
chr3 (282-350)||(4626417-4626485)
chr3 (282-350)||(5713700-5713768)
chr3 (282-350)||(5724610-5724678)
chr3 (282-350)||(5767690-5767758)
chr3 (282-350)||(17993501-17993569)
chr3 (238-359)||(28340766-28340887)
chr3 (238-359)||(36995750-36995871)
chr3 (15-109)||(20441481-20441575)
chr3 (15-109)||(41438607-41438701)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-350)||(22889867-22890216)
chr5 (1-350)||(25200427-25200776)
chr5 (105-350)||(25264686-25264931)
chr5 (1-349)||(23893604-23893952)
chr5 (1-349)||(15657176-15657524)
chr5 (1-359)||(24682838-24683196)
chr5 (1-359)||(24725365-24725723)
chr5 (30-359)||(40471955-40472284)
chr5 (6-349)||(11550757-11551100)
chr5 (1-359)||(15757263-15757621)
chr5 (6-349)||(30936036-30936379)
chr5 (30-349)||(33293952-33294271)
chr5 (1-348)||(33517754-33518101)
chr5 (1-359)||(9318849-9319207)
chr5 (6-359)||(33778890-33779243)
chr5 (1-349)||(41676107-41676455)
chr5 (1-359)||(8663881-8664239)
chr5 (1-359)||(13323235-13323593)
chr5 (6-349)||(24686573-24686916)
chr5 (6-349)||(24971421-24971764)
chr5 (1-359)||(12133553-12133911)
chr5 (1-359)||(26481789-26482147)
chr5 (1-359)||(30169867-30170225)
chr5 (1-359)||(37357049-37357407)
chr5 (1-311)||(37669937-37670247)
chr5 (6-359)||(23750856-23751209)
chr5 (1-359)||(30030813-30031171)
chr5 (1-359)||(30153416-30153774)
chr5 (1-359)||(3790939-3791297)
chr5 (1-359)||(18499136-18499494)
chr5 (1-359)||(28650633-28650991)
chr5 (1-359)||(37756378-37756736)
chr5 (1-359)||(43079650-43080008)
chr5 (6-359)||(22997520-22997873)
chr5 (6-359)||(23716394-23716747)
chr5 (1-359)||(6875703-6876061)
chr5 (1-359)||(31824813-31825171)
chr5 (1-359)||(34617916-34618274)
chr5 (1-359)||(28958192-28958550)
chr5 (1-359)||(31432838-31433196)
chr5 (6-311)||(37769441-37769746)
chr5 (1-359)||(2512449-2512807)
chr5 (1-349)||(18125811-18126159)
chr5 (282-350)||(13440067-13440135)
chr5 (238-359)||(18373941-18374062)
chr5 (282-350)||(9548116-9548184)
chr5 (282-350)||(11326315-11326383)
chr5 (282-350)||(13184222-13184290)
chr5 (238-359)||(5639422-5639543)
chr5 (238-350)||(32594689-32594801)
chr5 (280-349)||(20390438-20390507)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-350)||(19454929-19455277)
chr2 (1-350)||(21701671-21702020)
chr2 (30-359)||(27805121-27805450)
chr2 (1-359)||(37376546-37376904)
chr2 (1-359)||(27778607-27778965)
chr2 (30-359)||(12588224-12588553)
chr2 (15-359)||(19414997-19415341)
chr2 (30-350)||(9348489-9348809)
chr2 (1-359)||(12715100-12715458)
chr2 (1-359)||(16827836-16828194)
chr2 (1-359)||(16893287-16893645)
chr2 (1-359)||(32051183-32051541)
chr2 (1-359)||(39050320-39050678)
chr2 (1-359)||(40234896-40235254)
chr2 (30-350)||(13935051-13935371)
chr2 (1-359)||(259251-259609)
chr2 (1-311)||(27818365-27818675)
chr2 (1-359)||(34287739-34288097)
chr2 (1-359)||(34292799-34293157)
chr2 (1-359)||(21675680-21676038)
chr2 (12-359)||(28883610-28883957)
chr2 (105-359)||(20839390-20839644)
chr2 (1-359)||(31877666-31878024)
chr2 (6-349)||(23127074-23127417)
chr2 (1-359)||(11633683-11634041)
chr2 (6-349)||(27432952-27433295)
chr2 (1-359)||(39891459-39891817)
chr2 (1-359)||(34863065-34863423)
chr2 (282-350)||(34302968-34303036)
chr2 (6-349)||(12656932-12657275)
chr2 (1-359)||(37684407-37684765)
chr2 (1-359)||(37699672-37700030)
chr2 (1-359)||(37949820-37950178)
chr2 (282-350)||(3785162-3785230)
chr2 (282-350)||(27119196-27119264)
chr2 (282-350)||(31890993-31891061)
chr2 (282-350)||(34157518-34157586)
chr2 (238-359)||(37926992-37927113)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-350)||(16042713-16043062)
chr7 (1-350)||(16448402-16448751)
chr7 (1-359)||(5145735-5146093)
chr7 (6-359)||(5129387-5129740)
chr7 (1-359)||(26514171-26514529)
chr7 (1-359)||(31126310-31126668)
chr7 (6-349)||(5160914-5161257)
chr7 (1-311)||(26436647-26436957)
chr7 (1-359)||(31562785-31563143)
chr7 (6-359)||(10915263-10915616)
chr7 (1-359)||(3446696-3447054)
chr7 (1-359)||(9620041-9620399)
chr7 (12-359)||(16501796-16502143)
chr7 (1-359)||(26318264-26318622)
chr7 (6-359)||(11423172-11423525)
chr7 (1-350)||(26536274-26536623)
chr7 (1-359)||(11442269-11442627)
chr7 (1-359)||(26273489-26273847)
chr7 (6-349)||(2155968-2156311)
chr7 (12-359)||(16516832-16517179)
chr7 (1-359)||(16734855-16735213)
chr7 (1-359)||(16749909-16750267)
chr7 (1-359)||(17524922-17525280)
chr7 (1-359)||(17527935-17528293)
chr7 (1-359)||(26668309-26668667)
chr7 (282-350)||(2108567-2108635)
chr7 (180-359)||(45388789-45388968)
chr7 (282-350)||(45733973-45734041)
chr7 (282-359)||(4201060-4201137)
chr7 (282-343)||(31088033-31088094)
chr7 (238-359)||(4143641-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-350)||(16206549-16206898)
chr1 (3-183)||(20462475-20462655)
chr1 (1-359)||(10964058-10964416)
chr1 (1-359)||(51639606-51639964)
chr1 (1-359)||(28586369-28586727)
chr1 (1-359)||(41791817-41792175)
chr1 (1-359)||(10946467-10946825)
chr1 (288-359)||(20462656-20462727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-350)||(22079379-22079728)
chr8 (30-349)||(16284867-16285186)
chr8 (1-359)||(19675830-19676188)
chr8 (6-359)||(27607373-27607726)
chr8 (6-359)||(18792101-18792454)
chr8 (1-359)||(9356012-9356370)
chr8 (1-359)||(3327975-3328333)
chr8 (1-359)||(19206828-19207186)
chr8 (12-359)||(19689498-19689845)
chr8 (1-359)||(29830711-29831069)
chr8 (6-359)||(14559018-14559371)
chr8 (33-359)||(2135727-2136053)
chr8 (1-311)||(12091240-12091550)
chr8 (6-349)||(16278948-16279290)
chr8 (1-359)||(31355914-31356272)
chr8 (1-359)||(33260112-33260470)
chr8 (1-311)||(28360471-28360781)
chr8 (282-350)||(33245177-33245245)
chr8 (180-359)||(31488341-31488520)
chr8 (282-350)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (3-350)||(17090907-17091254)
chr6 (6-311)||(27628206-27628511)
chr6 (1-359)||(29550861-29551219)
chr6 (1-359)||(16675525-16675883)
chr6 (1-350)||(3697467-3697816)
chr6 (1-359)||(26776062-26776420)
chr6 (6-359)||(24303070-24303423)
chr6 (6-349)||(22933342-22933685)
chr6 (6-349)||(23855787-23856130)
chr6 (6-349)||(26919771-26920114)
chr6 (175-359)||(20162176-20162360)
chr6 (175-359)||(22170471-22170655)
chr6 (6-349)||(15422779-15423122)
chr6 (1-311)||(26114910-26115220)
chr6 (1-359)||(27009116-27009474)
chr6 (6-313)||(27271078-27271385)
chr6 (1-359)||(29502801-29503159)
chr6 (1-359)||(30556468-30556826)
chr6 (1-359)||(4759150-4759508)
chr6 (6-359)||(27020529-27020883)
chr6 (1-359)||(27045774-27046132)
chr6 (1-311)||(27486515-27486825)
chr6 (1-311)||(28208840-28209150)
chr6 (6-359)||(24865108-24865461)
chr6 (1-359)||(4526672-4527030)
chr6 (1-350)||(4544236-4544585)
chr6 (1-359)||(16942479-16942837)
chr6 (84-349)||(13297413-13297678)
chr6 (6-359)||(16751245-16751598)
chr6 (6-359)||(27288822-27289175)
chr6 (1-311)||(4722634-4722944)
chr6 (105-337)||(34913563-34913795)
chr6 (3-103)||(20162079-20162179)
chr6 (3-103)||(22170652-22170752)
chr6 (6-190)||(26990280-26990464)
chr6 (1-359)||(29574399-29574757)
chr6 (238-359)||(4774506-4774627)
chr6 (282-350)||(8891930-8891998)
chr6 (282-350)||(8903165-8903233)
chr6 (282-350)||(28163166-28163234)
chr6 (282-350)||(33373875-33373943)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (252-350)||(46134-46232)
scaffold0124 (1-349)||(31842-32190)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (30-359)||(5746-6075)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (1-359)||(949-1307)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (6-349)||(31151-31494)
scaffold0089 (12-349)||(45504-45841)
scaffold0089 (6-337)||(38600-38931)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-359)||(7404-7762)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-311)||(9338-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-359)||(13439-13797)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-311)||(10955-11265)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-359)||(24710-25068)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (84-349)||(28765-29030)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (282-350)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (282-350)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (238-350)||(7707-7819)
scaffold0159 (238-350)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (118-311)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1901661 - 1902010
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1901661 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaaagaa 1901760  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  1901761 tggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgccttt 1901860  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1901861 caaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccg 1901960  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1901961 gctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 15229273 - 15229622
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15229273 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 15229372  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15229373 tggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 15229472  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15229473 caaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccg 15229572  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229573 gctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15283795 - 15283446
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15283795 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 15283696  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15283695 tgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 15283596  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  15283595 caaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggctgtcg 15283496  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15283495 gctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15390245 - 15389896
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15390245 acatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaaagaa 15390146  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || |||    
T  15390145 tggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgctttt 15390046  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    |  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||  || |||    
T  15390045 cagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagctaccg 15389946  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389945 gctggggcaagttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 6571257 - 6571615
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  6571257 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 6571356  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  6571357 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 6571456  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  6571457 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 6571556  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6571557 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34187827 - 34187469
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  34187827 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 34187728  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| |||    
T  34187727 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactgctttt 34187628  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  34187627 caaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 34187528  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  34187527 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 34187469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31125385 - 31125027
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  31125385 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 31125286  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31125285 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31125186  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  31125185 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 31125086  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31125085 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31125027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24591222 - 24590864
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| |     
T  24591222 acattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaag 24591123  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  24591122 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 24591023  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  24591022 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 24590923  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  24590922 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 24590864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 30755158 - 30755516
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30755158 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 30755257  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| |||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  30755258 tggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 30755357  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  30755358 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 30755457  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30755458 gatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33672665 - 33672307
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  33672665 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 33672566  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  33672565 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 33672466  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  33672465 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 33672366  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33672365 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33672307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36343382 - 36343024
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  36343382 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 36343283  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  36343282 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 36343183  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  36343182 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 36343083  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  36343082 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 36343024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666780
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 310  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| |||||||     
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcag 14666731  T
Q  311 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14666732 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14666780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 14099945 - 14100303
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14099945 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 14100044  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  14100045 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 14100144  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  14100145 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 14100243  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  14100244 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 14100303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 5007277 - 5007635
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  5007277 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 5007376  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| ||     
T  5007377 tggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactgctttc 5007476  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  5007477 caaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagactgccg 5007576  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5007577 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5007635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 39852042 - 39852400
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  39852042 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 39852141  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  39852142 tggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 39852241  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  39852242 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 39852341  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39852342 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39852400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 21971105 - 21971463
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  21971105 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 21971204  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  21971205 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttc 21971304  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  21971305 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 21971403  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21971404 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21971463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27162183 - 27161825
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27162183 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 27162084  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  27162083 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 27161984  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  27161983 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 27161885  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27161884 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27161825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40104505 - 40104195
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  40104505 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 40104406  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  40104405 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 40104306  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  40104305 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 40104206  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    | |||||||||    
T  40104205 gttggggcaag 40104195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 54834791 - 54835149
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  54834791 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 54834890  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  54834891 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 54834990  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||  ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  54834991 caaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccg 54835090  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  54835091 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 54835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14762171 - 14761813
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  14762171 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 14762072  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  14762071 tggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 14761972  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  14761971 caaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 14761872  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14761871 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014805
Alignment:
Q  105 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 204  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| ||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  205 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 17014805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 24114071 - 24114424
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  24114071 aatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 24114170  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || || |||| |||    
T  24114171 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgcttttcaagg 24114270  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  24114271 attaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 24114370  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24114371 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24114424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18799480 - 18799170
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  18799480 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 18799381  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  18799380 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactgctttc 18799281  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||    
T  18799280 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccg 18799181  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  18799180 gctggggcaag 18799170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24460349 - 24460281
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460349 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16625509 - 16625160
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16625509 acatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 16625410  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16625409 tgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 16625310  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16625309 caaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggctgccg 16625210  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625209 gctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 18531738 - 18532087
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18531738 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 18531837  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  18531838 tggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgccttt 18531937  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18531938 caaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccg 18532037  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532038 gctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20575755 - 20575397
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  20575755 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 20575656  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  20575655 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 20575556  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  20575555 caaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccg 20575456  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20575455 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 20575397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 8297322 - 8297680
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||| |     
T  8297322 acattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaag 8297421  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  8297422 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 8297521  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||    
T  8297522 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgcc 8297620  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8297621 ggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8297680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052970
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5608230 - 5607881
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5608230 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 5608131  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  5608130 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 5608031  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | ||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  5608030 caaggtctgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 5607932  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5607931 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7074562 - 7074920
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  7074562 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 7074661  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  7074662 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 7074761  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  7074762 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 7074861  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  7074862 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 7074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 18226541 - 18226899
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  18226541 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 18226640  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  18226641 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 18226740  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  18226741 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 18226840  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18226841 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29663849 - 29663520
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||||||| || ||||| || |    
T  29663849 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaag 29663750  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  29663749 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 29663650  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  29663649 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 29663550  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29663549 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29663520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 20067393 - 20067741
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  20067393 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 20067492  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  20067493 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 20067592  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  20067593 caaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 20067692  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    || ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20067693 gccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15891609 - 15891266
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  15891609 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 15891510  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  15891509 agcttgttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 15891410  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  || |||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  15891409 attaactgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 15891310  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15891309 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4345595 - 4345237
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  4345595 acatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagca 4345496  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4345495 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4345396  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | || ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  4345395 caaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 4345296  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4345295 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 5015062 - 5015420
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5015062 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 5015161  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||     
T  5015162 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttc 5015261  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||    
T  5015262 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccg 5015361  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5015362 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15739997 - 15739644
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||| | ||| |    
T  15739997 aatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 15739898  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  15739897 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 15739798  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  15739797 attaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 15739698  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  15739697 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 15739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22386481 - 22386128
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  22386481 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 22386382  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||    
T  22386381 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaagg 22386282  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  22386281 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 22386182  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22386181 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22386128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22869764 - 22869406
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  22869764 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 22869665  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  22869664 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 22869565  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  22869564 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 22869466  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22869465 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22869406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22884823 - 22884465
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  22884823 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 22884724  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  22884723 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 22884624  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  22884623 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 22884525  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22884524 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31963381 - 31963023
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31963381 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31963282  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||| ||     
T  31963281 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactgctttc 31963182  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  31963181 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 31963083  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31963082 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31963023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 18244089 - 18244399
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  18244089 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 18244188  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||| ||     
T  18244189 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactgctttc 18244288  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  18244289 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 18244388  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  18244389 gctggggcaag 18244399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28114862 - 28114504
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||  | |||    
T  28114862 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgagaggaa 28114763  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| ||     
T  28114762 tggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactgctttc 28114663  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  28114662 caaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 28114563  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28114562 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 5468335 - 5468684
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  5468335 acattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaa 5468434  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  5468435 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 5468534  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||  |||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  5468535 caaggtttgaccgttgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 5468634  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5468635 gctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 6193670 - 6193983
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  6193670 aatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 6193769  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  6193770 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 6193869  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  6193870 attaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 6193969  T
Q  306 ggcaagttagtaca 319  Q
    |||| |||| ||||    
T  6193970 ggcaggttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11109257 - 11108908
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11109257 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 11109158  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  11109157 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 11109058  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||    
T  11109057 caagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccg 11108958  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108957 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5595265 - 5594916
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5595265 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 5595166  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  5595165 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 5595066  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  5595065 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 5594967  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594966 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10397483 - 10397841
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  10397483 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 10397582  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  10397583 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 10397682  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  10397683 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 10397782  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10397783 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10397841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18291261 - 18290903
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  18291261 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 18291162  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  18291161 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 18291062  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  18291061 caaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 18290962  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18290961 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18306562 - 18306204
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  18306562 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 18306463  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  18306462 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 18306363  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  18306362 caaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 18306263  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18306262 gctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18306204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 35882121 - 35882474
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  35882121 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 35882220  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  35882221 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 35882320  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || || |  || || | ||| || ||  |||||||||||    
T  35882321 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagctgccggctgg 35882420  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  35882421 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 35882474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 4722986 - 4723329
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  4722986 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 4723085  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || || |||| |||    
T  4723086 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgcttttcaagg 4723185  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  4723186 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 4723285  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4723286 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10644420 - 10644778
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  10644420 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 10644519  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  10644520 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 10644619  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  10644620 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 10644718  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10644719 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10644778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17983864 - 17983506
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17983864 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 17983765  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  17983764 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 17983665  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  17983664 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 17983566  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17983565 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17983506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 24329509 - 24329867
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24329509 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 24329608  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  24329609 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 24329708  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  24329709 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 24329807  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24329808 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 51783373 - 51783731
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  51783373 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 51783472  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  51783473 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 51783572  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  51783573 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 51783671  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51783672 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18275960 - 18275602
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  18275960 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 18275861  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  18275860 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 18275761  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  18275760 caaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 18275661  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||| ||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18275660 gctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttagcttctcc 18275602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29147663 - 29147305
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| |     
T  29147663 acattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaag 29147564  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||    
T  29147563 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgctttt 29147464  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||   |||||    
T  29147463 caaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagttgccg 29147364  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29147363 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29147305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8288374 - 8288021
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  8288374 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 8288275  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||    
T  8288274 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgcttttcaagg 8288175  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||| ||||||    
T  8288174 attaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgctggctgg 8288075  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8288074 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8288021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6541370 - 6541012
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6541370 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 6541271  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  6541270 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 6541171  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  6541170 caaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 6541072  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6541071 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6541012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 18332010 - 18332336
Alignment:
Q  33 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaag 132  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | | |||||||||||    
T  18332010 agaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcgtggagaggaag 18332109  T
Q  133 catatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaa 232  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||||||||||| |||    
T  18332110 catacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaa 18332209  T
Q  233 gaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaat 332  Q
    || |  ||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||     
T  18332210 gagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcttgagaac 18332309  T
Q  333 aagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18332310 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 18332336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 48467277 - 48467535
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  48467277 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 48467376  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  48467377 tggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 48467476  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 259  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48467477 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttcttt 48467535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 7997926 - 7998270
Alignment:
Q  15 tacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgtta 114  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  7997926 tacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgtta 7998025  T
Q  115 cagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactat 214  Q
    || ||||||| || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||    
T  7998026 caatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccaaggtttgaccat 7998125  T
Q  215 tgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagtt 313  Q
    ||||||| | ||| || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7998126 tgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggt 7998224  T
Q  314 agtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
      |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7998225 gatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7998270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795303
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 259  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttcttt 4795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 47024803 - 47025161
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | || || ||||| ||||| |||||    
T  47024803 acattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtgaagaa 47024902  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| |||||||| ||     
T  47024903 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactgctttc 47025002  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  47025003 caaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 47025101  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  47025102 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 47025161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4418269 - 4418627
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  4418269 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 4418368  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
     || |||||||||||  | ||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4418369 gggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4418468  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  4418469 cagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 4418568  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4418569 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 21676043 - 21676401
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  21676043 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 21676142  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||  | || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  21676143 tggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 21676242  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||||||    
T  21676243 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccg 21676342  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21676343 gttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21676401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 349
Target Start/End: Original strand, 32440608 - 32440852
Alignment:
Q  105 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 204  Q
    |||||||||||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||| ||    
T  32440608 aagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccgcttttcaag 32440707  T
Q  205 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  32440708 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 32440807  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  32440808 gggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 8213088 - 8213437
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| ||||| | |||    
T  8213088 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgacgaa 8213187  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  8213188 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 8213287  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| |||||| || | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||||||    
T  8213288 caaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccg 8213387  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213388 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 5652860 - 5652928
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5652860 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 4626417 - 4626485
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626417 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 5713700 - 5713768
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713700 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 5724610 - 5724678
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724610 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5767758 - 5767690
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767758 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17993569 - 17993501
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993569 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 28340766 - 28340887
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  28340766 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 28340865  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  28340866 taaagaaggtctcgggttctcc 28340887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36995871 - 36995750
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  36995871 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 36995772  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  36995771 taaagaaggtctcgggttctcc 36995750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Original strand, 20441481 - 20441575
Alignment:
Q  15 tacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 109  Q
    |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20441481 tacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Original strand, 41438607 - 41438701
Alignment:
Q  15 tacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 109  Q
    |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || | ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  41438607 tacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 22889867 - 22890216
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22889867 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 22889966  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  22889967 tggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactaccttt 22890066  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  22890067 caaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagctgtcg 22890166  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890167 gctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 350
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  105 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  205 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 23893604 - 23893952
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||     
T  23893604 acatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaaagag 23893703  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| || |||    
T  23893704 tggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgctttt 23893803  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  | |  |||||||||||||||| || || || || | ||| || |||||||| ||  | ||||    
T  23893804 caaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagccgccg 23893903  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23893904 gctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15657524 - 15657176
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||  |     
T  15657524 acattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaag 15657425  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  15657424 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 15657325  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  15657324 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 15657225  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15657224 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 24682838 - 24683196
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24682838 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 24682937  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  24682938 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 24683037  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24683038 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 24683137  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24683138 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24683196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 24725365 - 24725723
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24725365 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 24725464  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  24725465 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 24725564  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24725565 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 24725664  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24725665 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24725723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40472284 - 40471955
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |    
T  40472284 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaag 40472185  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  40472184 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 40472085  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  40472084 taagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 40471985  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40471984 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40471955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 11550757 - 11551100
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || |||||||||| ||| | ||| |    
T  11550757 aatgcctcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaaaaagtggaa 11550856  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  11550857 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 11550956  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  11550957 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 11551056  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11551057 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15757621 - 15757263
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  15757621 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 15757522  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||| ||     
T  15757521 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactgctttc 15757422  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  15757421 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 15757323  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  15757322 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 15757263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 30936036 - 30936379
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  30936036 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 30936135  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  30936136 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 30936235  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  30936236 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 30936335  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  30936336 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 349
Target Start/End: Original strand, 33293952 - 33294271
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  33293952 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggagagg 33294051  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||||||||||     
T  33294052 aggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcc 33294151  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
    ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  33294152 caagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgag 33294251  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtct 349  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  33294252 aacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 33517754 - 33518101
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  33517754 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 33517853  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  33517854 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 33517953  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  33517954 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 33518053  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtc 348  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  33518054 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9318849 - 9319207
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||| |||    
T  9318849 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaa 9318948  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
     || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  9318949 gggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 9319048  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  9319049 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 9319148  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9319149 gttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9319207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 33778890 - 33779243
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  33778890 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 33778989  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  33778990 agcttgttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 33779089  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  33779090 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 33779189  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  33779190 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 33779243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 41676107 - 41676455
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  41676107 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 41676206  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  41676207 tggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 41676306  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  41676307 caaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 41676406  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  41676407 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8664239 - 8663881
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8664239 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 8664140  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  8664139 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 8664040  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  8664039 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagt-tggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 8663941  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8663940 ggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 8663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13323593 - 13323235
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| | |||||    
T  13323593 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaa 13323494  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  13323493 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 13323394  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  13323393 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 13323295  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13323294 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24686916 - 24686573
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  24686916 aatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 24686817  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  24686816 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 24686717  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||| |||||||    
T  24686716 attaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgtcggctgg 24686617  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24686616 ggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 24971421 - 24971764
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  24971421 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 24971520  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  24971521 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 24971620  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  24971621 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 24971720  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24971721 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 12133553 - 12133911
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||| |||    
T  12133553 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaa 12133652  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
     || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  12133653 gggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 12133752  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  12133753 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 12133852  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12133853 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 26481789 - 26482147
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  26481789 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 26481888  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26481889 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26481988  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  26481989 caaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 26482088  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26482089 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26482147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 30169867 - 30170225
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30169867 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 30169966  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  30169967 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 30170066  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||    
T  30170067 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccg 30170166  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30170167 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctcgggttctcc 30170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37357407 - 37357049
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37357407 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 37357308  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37357307 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37357208  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37357207 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 37357108  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37357107 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37670247 - 37669937
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37670247 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 37670148  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37670147 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37670048  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37670047 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 37669948  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  37669947 gctggggcaag 37669937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23751209 - 23750856
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  23751209 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 23751110  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  23751109 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 23751010  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  23751009 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 23750910  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23750909 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23750856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 30030813 - 30031171
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30030813 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 30030912  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  30030913 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 30031012  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  30031013 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 30031111  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30031112 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30031171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 30153416 - 30153774
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30153416 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 30153515  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  30153516 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 30153615  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  30153616 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 30153714  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30153715 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3790939 - 3791297
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  3790939 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 3791038  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  3791039 tggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 3791138  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  |||||  ||||||| |||| || ||||| |||| ||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  3791139 caaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagactgccg 3791238  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3791239 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3791297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18499494 - 18499136
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  18499494 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 18499395  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  18499394 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 18499295  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||  ||||||    
T  18499294 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccg 18499195  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18499194 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 28650633 - 28650991
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28650633 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 28650732  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  28650733 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 28650832  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  28650833 caaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 28650932  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28650933 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 37756378 - 37756736
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37756378 acattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 37756477  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37756478 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37756577  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  37756578 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 37756677  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37756678 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37756736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43080008
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  43079650 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 43079749  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  43079750 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 43079849  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  43079850 caaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 43079949  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43079950 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 43080008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22997873 - 22997520
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  22997873 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 22997774  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  22997773 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 22997674  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  22997673 attaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 22997574  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22997573 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22997520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23716747 - 23716394
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||| | ||| |    
T  23716747 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 23716648  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  23716647 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 23716548  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      |  || | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  23716547 attagctgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 23716448  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23716447 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 6875703 - 6876061
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6875703 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 6875802  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| ||     
T  6875803 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttc 6875902  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  6875903 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 6876001  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6876002 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6876061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31825171 - 31824813
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31825171 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31825072  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31825071 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31824972  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  31824971 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 31824873  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31824872 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34617916 - 34618274
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34617916 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 34618015  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  34618016 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 34618115  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  34618116 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 34618214  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34618215 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34618274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28958550 - 28958192
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28958550 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 28958451  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||| ||     
T  28958450 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgctttc 28958351  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  28958350 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 28958251  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28958250 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28958192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31432838 - 31433196
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31432838 acattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31432937  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31432938 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31433037  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  31433038 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 31433136  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31433137 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31433196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37769746 - 37769441
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  37769746 aatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaa 37769647  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    | || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||    
T  37769646 aactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagg 37769547  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
      |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  37769546 tttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctg 37769448  T
Q  305 gggcaag 311  Q
    |||||||    
T  37769447 gggcaag 37769441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 2512449 - 2512807
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  2512449 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 2512548  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||| | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| ||     
T  2512549 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttc 2512648  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  | || ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  2512649 caaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 2512747  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  2512748 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 2512807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18126159 - 18125811
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  18126159 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 18126060  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||| | || |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||    
T  18126059 tggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccgctttt 18125960  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    |  ||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  18125959 cagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 18125860  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18125859 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13440135 - 13440067
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440135 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18374062 - 18373941
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  18374062 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 18373963  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  18373962 taaagaaggtctcgggttctcc 18373941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9548184 - 9548116
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548184 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 11326315 - 11326383
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326315 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13184290 - 13184222
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184290 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639543
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  5639422 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 5639521  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  5639522 taaagaaggtctcgggttctcc 5639543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32594801 - 32594689
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  32594801 ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 32594702  T
Q  338 caaagaaggtctc 350  Q
     ||||||||||||    
T  32594701 taaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20390507 - 20390438
Alignment:
Q  280 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  20390507 ttcaagaaggaaaagctgaaggctgggggaagttagtacagctgcccgagaacaagcacaaagaaggtct 20390438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19455277 - 19454929
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19455277 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 19455178  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19455177 tgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 19455079  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19455078 caaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggctgccg 19454979  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454978 gatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21702020 - 21701671
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  21702020 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaaagaa 21701921  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21701920 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 21701821  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21701820 caaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccg 21701721  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21701720 gccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Original strand, 27805121 - 27805450
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||  | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  27805121 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaag 27805220  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  27805221 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 27805320  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  27805321 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 27805420  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27805421 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27805450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 37376546 - 37376904
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  |||| |     
T  37376546 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaaaag 37376645  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  37376646 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 37376745  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  37376746 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 37376845  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  37376846 gctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 37376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27778607 - 27778965
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  27778607 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 27778706  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  27778707 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 27778806  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  27778807 caaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 27778906  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27778907 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27778965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Original strand, 12588224 - 12588553
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  12588224 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaag 12588323  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  12588324 aagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 12588423  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  12588424 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 12588523  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12588524 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19415341 - 19414997
Alignment:
Q  15 tacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgtta 114  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  19415341 tacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgtta 19415242  T
Q  115 cagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactat 214  Q
    || ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||    
T  19415241 caatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccat 19415142  T
Q  215 tgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagtt 313  Q
    ||||||| | ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19415141 tgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggt 19415043  T
Q  314 agtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19415042 aatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19414997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9348809 - 9348489
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |    
T  9348809 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaag 9348710  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  9348709 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 9348610  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  9348609 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgag 9348510  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    || ||||  ||||||||||||    
T  9348509 aacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12715458 - 12715100
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  12715458 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 12715359  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  12715358 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 12715259  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  12715258 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 12715159  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12715158 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16828194 - 16827836
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  16828194 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 16828095  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16828094 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16827995  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  16827994 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 16827895  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16827894 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16827836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16893287 - 16893645
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  16893287 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 16893386  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16893387 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16893486  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  16893487 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 16893586  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16893587 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 32051183 - 32051541
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| ||  ||| |||    
T  32051183 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaa 32051282  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  32051283 tggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 32051382  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  32051383 caaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 32051482  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  32051483 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 32051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39050678 - 39050320
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  39050678 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 39050579  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  39050578 tgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 39050479  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||| | || |  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  39050478 caaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 39050379  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39050378 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 40234896 - 40235254
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  40234896 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 40234995  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| || | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  40234996 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 40235095  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  40235096 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 40235195  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40235196 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40235254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13935371 - 13935051
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||| || |    
T  13935371 ggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaag 13935272  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  13935271 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 13935172  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  13935171 taaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgag 13935072  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    || ||||  ||||||||||||    
T  13935071 aacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 259609 - 259251
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  259609 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 259510  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  259509 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 259410  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  259409 caagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 259310  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  259309 gctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 259251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 27818365 - 27818675
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  27818365 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 27818464  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  27818465 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 27818564  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  27818565 caaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 27818664  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    | |||||||||    
T  27818665 gttggggcaag 27818675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34287739 - 34288097
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  34287739 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 34287838  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||| | ||     
T  34287839 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactactttc 34287938  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  34287939 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccg 34288038  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34288039 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34292799 - 34293157
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  34292799 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 34292898  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||| | ||     
T  34292899 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactactttc 34292998  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  34292999 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccg 34293098  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34293099 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21676038 - 21675680
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  21676038 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 21675939  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  21675938 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 21675839  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||| |||    
T  21675838 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagaccgcc 21675740  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21675739 ggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21675680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883957
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 28883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839644
Alignment:
Q  105 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 204  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  205 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 20839644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31877666 - 31878024
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31877666 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31877765  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||     
T  31877766 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttc 31877865  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||| ||    
T  31877866 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgtcg 31877965  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31877966 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23127417 - 23127074
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  23127417 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 23127318  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| || || |||| |||    
T  23127317 agcttgttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgcttttcaagg 23127218  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  23127217 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 23127118  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||    
T  23127117 ggcaggttaatacagctttgtgagaacaagcataaggaaggtct 23127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11634041 - 11633683
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||  |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  11634041 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcataaggaa 11633942  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  11633941 tggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 11633842  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||    
T  11633841 caaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccg 11633742  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11633741 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11633683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27433295 - 27432952
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||  | || || || | |||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  27433295 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 27433196  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  27433195 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 27433096  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  27433095 attaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 27432996  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27432995 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 39891459 - 39891817
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  39891459 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 39891558  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  39891559 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 39891658  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||  |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  39891659 caaggtttgatcattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 39891757  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39891758 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39891817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 34863065 - 34863423
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34863065 acattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 34863164  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  34863165 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 34863264  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||    
T  34863265 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccg 34863364  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34863365 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34303036 - 34302968
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303036 caagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 12656932 - 12657275
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||| | || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  12656932 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 12657031  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||| | ||||| || ||||||| |||    
T  12657032 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgcctttcaagg 12657131  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  12657132 attaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 12657231  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12657232 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37684765 - 37684407
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37684765 acattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 37684666  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37684665 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37684566  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  37684565 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgcc 37684467  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37684466 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37700030 - 37699672
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37700030 acattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 37699931  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37699930 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37699831  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  37699830 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgcc 37699732  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37699731 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37699672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37950178 - 37949820
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  37950178 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 37950079  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  37950078 tggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 37949979  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||  | || || || ||||||||||    
T  37949978 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagactgccg 37949879  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37949878 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37949820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 3785162 - 3785230
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785162 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 27119196 - 27119264
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119196 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31891061 - 31890993
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891061 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 34157518 - 34157586
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157518 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 37926992 - 37927113
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  37926992 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 37927091  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  37927092 taaagaaggtctcgggttctcc 37927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 16042713 - 16043062
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16042713 acatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtgaagaa 16042812  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16042813 tggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 16042912  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16042913 caaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggctgccg 16043012  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043013 gctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16448751 - 16448402
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16448751 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 16448652  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| ||||     
T  16448651 tggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactaccttc 16448552  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16448551 caaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccg 16448452  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448451 gctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5146093 - 5145735
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  5146093 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 5145994  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  5145993 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 5145894  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  5145893 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 5145794  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5145793 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 5129387 - 5129740
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||| | ||| |    
T  5129387 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 5129486  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  5129487 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 5129586  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  5129587 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 5129686  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  5129687 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 5129740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 26514171 - 26514529
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  26514171 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 26514270  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26514271 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26514370  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  26514371 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 26514470  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26514471 gctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31126310 - 31126668
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| | |||||    
T  31126310 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaa 31126409  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31126410 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31126509  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  31126510 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 31126609  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31126610 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31126668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 5160914 - 5161257
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  5160914 aatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 5161013  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  5161014 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 5161113  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| || ||  |||||||||||    
T  5161114 attgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagctgccggctgg 5161213  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5161214 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 26436647 - 26436957
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  26436647 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaa 26436746  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26436747 tggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26436846  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  26436847 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 26436946  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    | |||||||||    
T  26436947 gttggggcaag 26436957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31563143 - 31562785
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31563143 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31563044  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31563043 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31562944  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  31562943 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 31562844  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31562843 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31562785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10915616 - 10915263
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| |||| ||| |  || |    
T  10915616 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagcggaa 10915517  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  10915516 agcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgcttttcaagg 10915417  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  10915416 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 10915317  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||  ||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  10915316 ggcagattaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttggcttctcc 10915263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 3446696 - 3447054
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3446696 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 3446795  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  3446796 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 3446895  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  3446896 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 3446994  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3446995 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3447054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9620041 - 9620399
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  9620041 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 9620140  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  9620141 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 9620240  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  9620241 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 9620339  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9620340 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9620399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501796
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |  || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16501796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26318622 - 26318264
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||| |||    
T  26318622 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaa 26318523  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
     || |||||||||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26318522 gggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26318423  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  26318422 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 26318323  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26318322 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcggtttctcc 26318264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11423525 - 11423172
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  11423525 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 11423426  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  11423425 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 11423326  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||| ||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  | || ||||||    
T  11423325 attaactgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagccgctggctgg 11423226  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  11423225 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 11423172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26536623 - 26536274
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  26536623 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 26536524  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26536523 tggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26536424  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||    
T  26536423 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccg 26536324  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536323 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 11442269 - 11442627
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11442269 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 11442368  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  11442369 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 11442468  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  11442469 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaagccgggg-ctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 11442567  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11442568 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11442627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26273847 - 26273489
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  26273847 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 26273748  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26273747 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26273648  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  26273647 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 26273549  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26273548 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26273489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 2155968 - 2156311
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  2155968 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 2156067  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  2156068 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 2156167  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||  ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  |||||||||||    
T  2156168 attaactgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagctgccggctgg 2156267  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  2156268 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516832
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |  || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16735213 - 16734855
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16735213 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 16735114  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16735113 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16735014  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  16735013 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 16734914  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16734913 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16734855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16750267 - 16749909
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16750267 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 16750168  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16750167 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16750068  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  16750067 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 16749968  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16749967 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 17524922 - 17525280
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17524922 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 17525021  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  17525022 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 17525121  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  17525122 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 17525221  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17525222 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17525280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17528293 - 17527935
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17528293 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 17528194  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || || |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  17528193 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 17528094  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  17528093 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 17527994  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17527993 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17527935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26668667 - 26668309
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| || ||    
T  26668667 acattaatgcatcctacagttgcctgttgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaaaaa 26668568  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26668567 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26668468  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  26668467 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgcc 26668369  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26668368 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26668309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2108635 - 2108567
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2108635 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Original strand, 45388789 - 45388968
Alignment:
Q  180 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 279  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  45388789 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 45388888  T
Q  280 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  45388889 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 45388968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 45733973 - 45734041
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733973 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 359
Target Start/End: Original strand, 4201060 - 4201137
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4201060 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31088094 - 31088033
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaaga 343  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31088094 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4143762 - 4143641
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  4143762 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 4143663  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4143662 taaagaaggtctcgggttctcc 4143641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16206898 - 16206549
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16206898 acatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtgaagaa 16206799  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  16206798 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgccttt 16206699  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16206698 caaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggctgccg 16206599  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16206598 gctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 20462475 - 20462655
Alignment:
Q  3 atcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatg 102  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  20462475 atcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaaagaatg 20462574  T
Q  103 ggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462575 ggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10964058 - 10964416
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  10964058 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 10964157  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  10964158 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 10964257  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  10964258 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 10964356  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10964357 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10964416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 51639606 - 51639964
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||  |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  51639606 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 51639705  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  51639706 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 51639805  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  51639806 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 51639904  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51639905 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 28586369 - 28586727
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28586369 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 28586468  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||     
T  28586469 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttc 28586568  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||    
T  28586569 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccg 28586668  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28586669 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28586727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41792175 - 41791817
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  41792175 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 41792076  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| ||     
T  41792075 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttc 41791976  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  41791975 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 41791877  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  41791876 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 41791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 10946467 - 10946825
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  10946467 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 10946566  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  10946567 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 10946666  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  10946667 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgcc 10946765  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10946766 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10946825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Original strand, 20462656 - 20462727
Alignment:
Q  288 ggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20462656 ggacaggctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctcgggttctcc 20462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22079728 - 22079379
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  22079728 acatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaaagaa 22079629  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || |||    
T  22079628 tggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgctttt 22079529  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    |  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| | |||||| ||  || |||    
T  22079528 cagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagctaccg 22079429  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079428 gctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 349
Target Start/End: Original strand, 16284867 - 16285186
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||| || ||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||||| | ||||||||||    
T  16284867 ggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaaaaagcggaaagcttgttacaattcatggagagg 16284966  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||| |||  | ||| | |||||||||||||     
T  16284967 aagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcc 16285066  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
    ||| | |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||  || ||  ||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  16285067 caaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagctgccggctggggcaggttaatacaacttcgtgag 16285166  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtct 349  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  16285167 aacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 19675830 - 19676188
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19675830 acattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 19675929  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  19675930 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactgctttc 19676029  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  19676030 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 19676129  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19676130 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19676188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27607726 - 27607373
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27607726 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaa 27607627  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  27607626 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 27607527  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
     || ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  27607526 actaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 27607427  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27607426 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27607373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 18792101 - 18792454
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  18792101 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 18792200  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  18792201 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 18792300  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  18792301 attaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 18792400  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18792401 ggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18792454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 9356012 - 9356370
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  9356012 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaa 9356111  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  9356112 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 9356211  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  9356212 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 9356310  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9356311 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9356370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3328333 - 3327975
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3328333 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 3328234  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  3328233 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 3328134  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  3328133 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 3328034  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||||||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3328033 gctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3327975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19207186 - 19206828
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19207186 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 19207087  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || || ||||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  19207086 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 19206987  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  19206986 caaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 19206887  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19206886 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19206828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689845
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 19689845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29830711 - 29831069
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  29830711 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 29830810  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| || ||||| ||     
T  29830811 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgctttc 29830910  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  29830911 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 29831009  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29831010 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 14559018 - 14559371
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||| || | ||||| ||||| ||||  || |  || |    
T  14559018 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgccaaaagcggaa 14559117  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  14559118 agcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 14559217  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  14559218 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 14559317  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  14559318 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttagcttctcc 14559371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2136053 - 2135727
Alignment:
Q  33 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaag 132  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  2136053 agaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaag 2135954  T
Q  133 catatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaa 232  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||||||||||  ||    
T  2135953 catacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaa 2135854  T
Q  233 gaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaat 332  Q
    || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| ||||||| |||| |||| || || |||||     
T  2135853 gagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaac 2135754  T
Q  333 aagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  2135753 aagcataaggaaggtcttggcttctcc 2135727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12091550 - 12091240
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  12091550 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 12091451  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  12091450 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 12091351  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||| |||    
T  12091350 caagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactaccg 12091251  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  12091250 gctggggcaag 12091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 16278948 - 16279290
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  16278948 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 16279047  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || | ||||| |||    
T  16279048 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg-ctttcaagg 16279146  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  16279147 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 16279245  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16279246 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 31355914 - 31356272
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31355914 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 31356013  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  31356014 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 31356113  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  31356114 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 31356212  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31356213 ggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31356272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 33260112 - 33260470
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  33260112 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 33260211  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||     
T  33260212 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttc 33260311  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | || ||||||||| | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  33260312 caaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 33260411  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33260412 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33260470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28360781 - 28360471
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28360781 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 28360682  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  28360681 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 28360582  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  28360581 caaggtttgaccattgaaggtgcagaggctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 28360483  T
Q  300 ggctggggcaag 311  Q
    ||||||||||||    
T  28360482 ggctggggcaag 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 33245177 - 33245245
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33245177 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31488520 - 31488341
Alignment:
Q  180 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 279  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  31488520 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 31488421  T
Q  280 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31488420 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31488341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19658743 - 19658675
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19658743 caagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17091254 - 17090907
Alignment:
Q  3 atcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatg 102  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| | |||||    
T  17091254 atcaacgcttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtgaggaatg 17091155  T
Q  103 ggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcg 202  Q
    | ||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||     
T  17091154 gaaagctcgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgcttttca 17091055  T
Q  203 aggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggc 302  Q
    |||  |||| |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  17091054 aggattgaccattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggctgccggt 17090955  T
Q  303 tggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    ||||| |||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17090954 tggggtaagttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27628511 - 27628206
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| || | ||||| || |||||||| |||||||| |    
T  27628511 aatgcttcatacagctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatggaa 27628412  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||    
T  27628411 aactcgttacagtccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagg 27628312  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      |||| ||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  27628311 tttgaccattgaaggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagactgccggctgg 27628212  T
Q  306 ggcaag 311  Q
    ||||||    
T  27628211 ggcaag 27628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29550861 - 29551219
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  29550861 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 29550960  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  29550961 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgctttt 29551060  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||    
T  29551061 caaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccg 29551160  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29551161 gctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29551219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 16675525 - 16675883
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||    
T  16675525 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaa 16675624  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16675625 tggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16675724  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  16675725 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 16675824  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16675825 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16675883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3697467 - 3697816
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3697467 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtgaagaa 3697566  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  3697567 tggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 3697666  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  3697667 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 3697766  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697767 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26776420 - 26776062
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||| |  | ||||| ||||| || |||| |||    
T  26776420 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaa 26776321  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||  ||||| |||||  | ||||| || || ||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  26776320 tgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 26776221  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  26776220 caaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccg 26776121  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26776120 gatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26776062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24303423 - 24303070
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  24303423 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 24303324  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  24303323 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 24303224  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  24303223 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 24303124  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24303123 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22933685 - 22933342
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  22933685 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 22933586  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || || |||| |||    
T  22933585 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaagg 22933486  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  22933485 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 22933386  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22933385 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23856130 - 23855787
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  23856130 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 23856031  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || || |||| |||    
T  23856030 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaagg 23855931  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  23855930 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 23855831  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23855830 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 26919771 - 26920114
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| |||||||| |||||  | || | |||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| ||||| |    
T  26919771 aatgcctcttacagttgcctcttggggaaaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaa 26919870  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  26919871 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 26919970  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  26919971 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 26920070  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26920071 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Original strand, 20162176 - 20162360
Alignment:
Q  175 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  20162176 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 20162275  T
Q  275 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  20162276 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 20162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22170655 - 22170471
Alignment:
Q  175 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22170655 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 22170556  T
Q  275 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  22170555 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 22170471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15423122 - 15422779
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  15423122 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 15423023  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  15423022 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 15422923  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  15422922 attaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 15422823  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15422822 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26115220 - 26114910
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  26115220 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 26115121  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| ||     
T  26115120 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactgctttc 26115021  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  26115020 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 26114922  T
Q  300 ggctggggcaag 311  Q
    ||||||||||||    
T  26114921 ggctggggcaag 26114910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27009116 - 27009474
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||| | |||||    
T  27009116 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaa 27009215  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  27009216 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 27009315  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  27009316 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 27009414  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27009415 ggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27009474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27271385 - 27271078
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| || | |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  27271385 aatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtgaagaatggaa 27271286  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    | || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||    
T  27271285 aactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaggg 27271186  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      |||| |||||||||   ||||  |||| |  |||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27271185 tttgaccattgaaggtgtagagcctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttgg 27271086  T
Q  306 ggcaagtt 313  Q
    ||||||||    
T  27271085 ggcaagtt 27271078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29502801 - 29503159
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  29502801 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 29502900  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  29502901 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 29503000  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  29503001 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 29503099  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29503100 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29503159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30556826 - 30556468
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30556826 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 30556727  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  30556726 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 30556627  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  30556626 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 30556528  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30556527 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4759150 - 4759508
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4759150 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 4759249  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4759250 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4759349  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  4759350 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 4759449  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4759450 gctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 27020529 - 27020883
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  27020529 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 27020628  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  27020629 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 27020728  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
      | ||| | |||||||||||| || | || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  27020729 attaactgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 27020828  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27020829 gggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27020883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27045774 - 27046132
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27045774 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 27045873  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  27045874 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 27045973  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||    
T  27045974 caaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccg 27046073  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27046074 gttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 27486515 - 27486825
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27486515 acattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 27486614  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| || || ||||| ||     
T  27486615 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactgctttc 27486714  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  27486715 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 27486814  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  27486815 gctggggcaag 27486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 28208840 - 28209150
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  28208840 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 28208939  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  28208940 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 28209039  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  28209040 caagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 28209139  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  28209140 gctggggcaag 28209150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 24865108 - 24865461
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  24865108 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 24865207  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  24865208 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 24865307  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||| |||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||| |||||||    
T  24865308 attaactgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgtcggctgg 24865407  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24865408 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24865461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4526672 - 4527030
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4526672 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 4526771  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4526772 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4526871  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||  | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  4526872 caaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 4526971  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4526972 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4544585 - 4544236
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4544585 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 4544486  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4544485 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4544386  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  4544385 caaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 4544287  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4544286 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16942837 - 16942479
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16942837 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 16942738  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  16942737 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 16942638  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||  |||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  16942637 caaggtttgaccgttgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 16942538  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16942537 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13297678 - 13297413
Alignment:
Q  84 ttgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 183  Q
    ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || |    
T  13297678 ttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccg 13297579  T
Q  184 ctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttca 283  Q
    | ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || |||||    
T  13297578 cagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttca 13297479  T
Q  284 agaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||| || ||  ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13297478 agagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Original strand, 16751245 - 16751598
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  16751245 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 16751344  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  16751345 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 16751444  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | ||||||| ||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| || ||  |||||||||||    
T  16751445 attaactgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagctgccggctgg 16751544  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16751545 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16751598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27289175 - 27288822
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  27289175 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 27289076  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  27289075 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaagg 27288976  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||| ||||  || | |  |||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || |||||||| || |||    
T  27288975 attaactgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagactgctgggtgg 27288876  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||| |  |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27288875 ggcaaggtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27288822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4722944 - 4722634
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4722944 acattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 4722845  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  4722844 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 4722745  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  4722744 caaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 4722646  T
Q  300 ggctggggcaag 311  Q
    ||||||||||||    
T  4722645 ggctggggcaag 4722634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913563
Alignment:
Q  105 aagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 204  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  205 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 304  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||  | ||  ||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  305 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 34913563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 20162079 - 20162179
Alignment:
Q  3 atcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatg 102  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20162079 atcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtgaagaatg 20162178  T
Q  103 g 103  Q
    |    
T  20162179 g 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22170752 - 22170652
Alignment:
Q  3 atcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatg 102  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22170752 atcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtgaagaatg 22170653  T
Q  103 g 103  Q
    |    
T  22170652 g 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 26990280 - 26990464
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  26990280 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 26990379  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgaggg 190  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  26990380 agcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggg 26990464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 29574399 - 29574757
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  29574399 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 29574498  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| | || || || || ||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  29574499 tggaaaactcgttacaattcacggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 29574598  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||    
T  29574599 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgcc 29574697  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29574698 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29574757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Original strand, 4774506 - 4774627
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||||    
T  4774506 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagca 4774605  T
Q  338 caaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4774606 taaagaaggtctcgggttctcc 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8891998 - 8891930
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8891998 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8903233 - 8903165
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903233 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 28163166 - 28163234
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163166 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33373943 - 33373875
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373943 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  252 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 31842 - 32190
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| |     
T  31842 acattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaag 31941  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||    
T  31942 tggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgctttt 32041  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||||| ||  ||||||    
T  32042 caaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagctgccg 32141  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||||||||||||| |||| || || ||||  ||||| || ||||||||    
T  32142 gctggggcaagttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6075 - 5746
Alignment:
Q  30 ggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagagg 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| |  | ||||| ||||||||  ||| |||||| || ||||||||  | ||||| || |    
T  6075 ggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaag 5976  T
Q  130 aagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagct 229  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||||     
T  5975 aagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcc 5876  T
Q  230 caagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgag 329  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||    
T  5875 taagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgag 5776  T
Q  330 aataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5775 aacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 949
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||| || | ||||| || |||||||| |||||    
T  1307 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaa 1208  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  1207 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 1108  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  ||||  |||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | | |||| ||||| ||||||||||    
T  1107 caaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagactgccg 1008  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    | ||||||||| |  |||| || || ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1007 gttggggcaaggtgatacagcttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 31151 - 31494
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || ||||||| ||||| |||| ||| | ||| |    
T  31151 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 31250  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  31251 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 31350  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  31351 attaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 31450  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31451 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  12 tcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 111  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  112 ttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 211  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  212 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  312 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38931 - 38600
Alignment:
Q  6 aatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaatggga 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  || |||| || ||||| |||| ||| | ||| |    
T  38931 aatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaa 38832  T
Q  106 agcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgagg 205  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||    
T  38831 agcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaagg 38732  T
Q  206 cctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctgg 305  Q
      | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||    
T  38731 attaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctgg 38632  T
Q  306 ggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    |||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  38631 ggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 7404 - 7762
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7404 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 7503  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  7504 tggaaagctcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 7603  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  7604 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcagactgcc 7702  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7703 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9648
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  9338 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 9437  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  9438 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 9537  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  9538 caagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 9637  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  9638 gctggggcaag 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13797 - 13439
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13797 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 13698  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  13697 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 13598  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgcc 299  Q
    |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||||||    
T  13597 cagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgcc 13499  T
Q  300 ggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13498 ggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 10955 - 11265
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  10955 acattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 11054  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| ||     
T  11055 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttc 11154  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  11155 caaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 11254  T
Q  301 gctggggcaag 311  Q
    |||||||||||    
T  11255 gctggggcaag 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25068 - 24710
Alignment:
Q  1 acatcaatgcttcttacagctgccttctaggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacttctaccctgtaccagaaattgaagtttgtaaagaa 100  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  25068 acattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaa 24969  T
Q  101 tgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 200  Q
    ||| || || |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || ||     
T  24968 tggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttc 24869  T
Q  201 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 300  Q
    | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||    
T  24868 caaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccg 24769  T
Q  301 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 359  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24768 gctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 349
Target Start/End: Original strand, 28765 - 29030
Alignment:
Q  84 ttgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 183  Q
    ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||    
T  28765 ttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctg 28864  T
Q  184 ctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttca 283  Q
    | ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||    
T  28865 cagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtcca 28964  T
Q  284 agaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 349  Q
    ||| || ||  ||||||||||||||| |||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28965 agagggtcaagctgccggctggggcaggttaatatagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Original strand, 22073 - 22141
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22073 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 119642 - 119574
Alignment:
Q  282 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 350  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  119642 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7819 - 7707
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  7819 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 7720  T
Q  338 caaagaaggtctc 350  Q
     ||||||||||||    
T  7719 taaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21372 - 21260
Alignment:
Q  238 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 337  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  21372 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 21273  T
Q  338 caaagaaggtctc 350  Q
     ||||||||||||    
T  21272 taaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 311
Target Start/End: Original strand, 27711 - 27904
Alignment:
Q  118 tccatggagaggaagcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 217  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| || | |||  ||||  ||||    
T  27711 tccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttga 27810  T
Q  218 aggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 311  Q
    |||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27811 aggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University