View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12449_high_11 (Length: 346)

Name: NF12449_high_11
Description: NF12449
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12449_high_11
NF12449_high_11
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (17-297)||(2174918-2175198)
chr5 (17-297)||(38882105-38882385)
chr5 (17-297)||(34477052-34477334)
chr5 (17-297)||(6745068-6745348)
chr5 (17-297)||(10529098-10529379)
chr5 (17-297)||(18466683-18466964)
chr5 (17-297)||(21948025-21948306)
chr5 (17-297)||(39854482-39854763)
chr5 (17-288)||(4236628-4236900)
chr5 (18-293)||(25804025-25804300)
chr5 (17-297)||(34479417-34479699)
chr5 (17-297)||(25921472-25921753)
chr5 (17-297)||(27912535-27912816)
chr5 (17-297)||(21684451-21684731)
chr5 (17-297)||(40221521-40221803)
chr5 (17-297)||(16776157-16776437)
chr5 (17-297)||(18511211-18511492)
chr5 (25-297)||(27910457-27910730)
chr5 (17-297)||(31545079-31545360)
chr5 (17-297)||(31179370-31179651)
chr5 (17-297)||(6747305-6747584)
chr5 (17-297)||(18469010-18469289)
chr5 (17-297)||(18509317-18509598)
chr5 (17-297)||(31542734-31543014)
chr5 (17-297)||(15552244-15552525)
chr5 (40-297)||(658355-658610)
chr5 (25-297)||(26097740-26098011)
chr5 (17-297)||(2818334-2818616)
chr5 (17-297)||(25904102-25904383)
chr5 (17-297)||(1189606-1189889)
chr5 (17-297)||(10474322-10474603)
chr5 (18-297)||(31472611-31472892)
chr5 (17-297)||(10586841-10587112)
chr5 (17-297)||(16092198-16092480)
chr5 (17-293)||(39397996-39398273)
chr5 (17-297)||(24126855-24127136)
chr5 (37-295)||(18596664-18596924)
chr5 (17-297)||(17072882-17073164)
chr5 (92-297)||(4410097-4410302)
chr5 (17-297)||(6756493-6756772)
chr5 (17-297)||(17818491-17818770)
chr5 (17-297)||(2954415-2954696)
chr5 (17-297)||(36402327-36402608)
chr5 (25-297)||(37705779-37706052)
chr5 (17-293)||(12555926-12556203)
chr5 (17-297)||(695888-696158)
chr5 (96-297)||(20505842-20506042)
chr5 (114-297)||(10749796-10749980)
chr5 (97-297)||(39798126-39798327)
chr5 (92-297)||(41585743-41585949)
chr5 (17-239)||(34530722-34530946)
chr5 (17-297)||(31465988-31466258)
chr5 (17-178)||(20045009-20045170)
chr5 (114-297)||(3373136-3373320)
chr5 (114-297)||(10757273-10757456)
chr5 (114-297)||(15354574-15354757)
chr5 (17-297)||(21288763-21289041)
chr5 (114-297)||(23665140-23665323)
chr5 (114-297)||(23793264-23793447)
chr5 (17-297)||(6661183-6661462)
chr5 (114-297)||(15356850-15357033)
chr5 (114-297)||(38960131-38960314)
chr5 (17-176)||(20043049-20043208)
chr5 (131-297)||(23741858-23742023)
chr5 (92-297)||(2723976-2724173)
chr5 (17-153)||(26098395-26098531)
chr5 (99-271)||(9020299-9020473)
chr5 (99-297)||(36208656-36208856)
chr5 (100-264)||(17413198-17413365)
chr5 (17-272)||(20053846-20054091)
chr5 (100-272)||(15143547-15143722)
chr5 (191-297)||(23667492-23667598)
chr5 (118-297)||(4897828-4898011)
chr5 (115-272)||(1170811-1170967)
chr5 (144-232)||(42770936-42771025)
chr5 (115-272)||(35385477-35385634)
chr5 (17-84)||(20507675-20507742)
chr5 (120-272)||(25445501-25445653)
chr5 (212-297)||(26098287-26098373)
chr5 (118-272)||(22672837-22672991)
chr5 (100-259)||(2144599-2144763)
chr5 (118-177)||(25452498-25452556)
chr5 (115-177)||(2298122-2298183)
chr5 (17-58)||(4410060-4410101)
chr5 (188-297)||(15445265-15445376)
chr5 (118-177)||(28786407-28786465)
chr5 (115-177)||(1240428-1240489)
chr5 (100-242)||(4754235-4754380)
chr5 (118-272)||(17841274-17841428)
chr5 (97-176)||(42770847-42770924)
chr5 (118-177)||(11962554-11962612)
chr5 (115-176)||(16093413-16093473)
chr5 (244-297)||(20043217-20043270)
chr5 (232-296)||(9353361-9353425)
chr5 (232-296)||(36932379-36932443)
chr5 (17-57)||(41585946-41585986)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (17-297)||(69291-69571)
scaffold0025 (17-113)||(73207-73303)
scaffold0025 (92-124)||(73160-73192)
[»] chr4 (122 HSPs)
chr4 (17-297)||(37089371-37089651)
chr4 (17-297)||(8631418-8631699)
chr4 (17-297)||(22046685-22046965)
chr4 (17-297)||(31849598-31849879)
chr4 (17-297)||(22044390-22044670)
chr4 (17-297)||(38409258-38409538)
chr4 (18-297)||(2484872-2485151)
chr4 (17-297)||(40637127-40637408)
chr4 (21-297)||(9148310-9148586)
chr4 (17-297)||(11435008-11435288)
chr4 (17-297)||(51015299-51015579)
chr4 (17-297)||(11006236-11006517)
chr4 (17-297)||(22802733-22803014)
chr4 (17-297)||(24348271-24348552)
chr4 (17-297)||(48486372-48486653)
chr4 (17-297)||(47868454-47868735)
chr4 (17-297)||(22132391-22132670)
chr4 (17-297)||(6764892-6765178)
chr4 (17-297)||(18847206-18847486)
chr4 (17-297)||(22800861-22801142)
chr4 (17-297)||(24888849-24889130)
chr4 (17-297)||(11008567-11008846)
chr4 (17-297)||(36921492-36921774)
chr4 (17-297)||(40091414-40091695)
chr4 (17-297)||(7941374-7941657)
chr4 (17-297)||(5198473-5198754)
chr4 (17-297)||(22134617-22134895)
chr4 (37-297)||(26085976-26086236)
chr4 (17-237)||(5637524-5637745)
chr4 (17-297)||(14633372-14633652)
chr4 (17-297)||(44599837-44600118)
chr4 (17-297)||(36919583-36919865)
chr4 (18-297)||(24880505-24880786)
chr4 (17-297)||(18709163-18709443)
chr4 (17-297)||(17662244-17662514)
chr4 (17-297)||(9176473-9176754)
chr4 (17-297)||(22780372-22780653)
chr4 (17-297)||(22782737-22783018)
chr4 (17-297)||(47274780-47275059)
chr4 (20-297)||(16934142-16934420)
chr4 (17-297)||(24879042-24879324)
chr4 (17-297)||(38928176-38928458)
chr4 (17-297)||(12395844-12396125)
chr4 (17-297)||(12400806-12401087)
chr4 (17-293)||(33415491-33415767)
chr4 (20-297)||(16931788-16932066)
chr4 (17-297)||(9174145-9174426)
chr4 (17-297)||(36378345-36378627)
chr4 (17-297)||(14787428-14787711)
chr4 (25-239)||(3824627-3824842)
chr4 (17-297)||(19095935-19096217)
chr4 (17-277)||(37313084-37313346)
chr4 (17-287)||(16453362-16453634)
chr4 (17-292)||(56030497-56030770)
chr4 (17-292)||(47210756-47211020)
chr4 (17-297)||(619447-619727)
chr4 (17-297)||(53405183-53405467)
chr4 (17-276)||(13544012-13544272)
chr4 (40-297)||(36380425-36380684)
chr4 (17-272)||(19322750-19323003)
chr4 (17-297)||(18409346-18409627)
chr4 (92-297)||(16455369-16455576)
chr4 (17-297)||(41997545-41997826)
chr4 (158-297)||(11437557-11437696)
chr4 (141-297)||(4215483-4215640)
chr4 (159-297)||(5635475-5635614)
chr4 (106-297)||(2891433-2891626)
chr4 (17-214)||(52942542-52942726)
chr4 (45-272)||(18537498-18537724)
chr4 (17-192)||(3937314-3937489)
chr4 (19-178)||(6132927-6133086)
chr4 (112-277)||(13547302-13547468)
chr4 (18-271)||(8756276-8756528)
chr4 (45-270)||(18534858-18535082)
chr4 (47-297)||(27499128-27499376)
chr4 (44-297)||(38890223-38890476)
chr4 (99-272)||(12102221-12102397)
chr4 (17-125)||(38270158-38270266)
chr4 (17-272)||(15032572-15032816)
chr4 (97-277)||(30136682-30136864)
chr4 (115-297)||(16185833-16186018)
chr4 (100-270)||(28453818-28453990)
chr4 (165-297)||(5101130-5101262)
chr4 (18-261)||(9863765-9864008)
chr4 (17-125)||(24446756-24446859)
chr4 (99-259)||(31983564-31983727)
chr4 (103-272)||(3982200-3982374)
chr4 (100-272)||(25357772-25357951)
chr4 (18-270)||(10112927-10113177)
chr4 (17-81)||(2891370-2891434)
chr4 (17-84)||(5101050-5101117)
chr4 (115-272)||(11853549-11853705)
chr4 (18-262)||(9022362-9022605)
chr4 (100-274)||(47150915-47151092)
chr4 (18-229)||(40999017-40999226)
chr4 (115-272)||(7050282-7050439)
chr4 (118-272)||(8529270-8529424)
chr4 (118-272)||(18586969-18587123)
chr4 (118-272)||(31300427-31300580)
chr4 (212-297)||(47563010-47563095)
chr4 (118-177)||(4556180-4556238)
chr4 (118-177)||(4558314-4558372)
chr4 (118-177)||(15316961-15317019)
chr4 (115-177)||(36771396-36771457)
chr4 (115-177)||(55822265-55822326)
chr4 (118-272)||(15831144-15831298)
chr4 (184-259)||(24446678-24446754)
chr4 (115-272)||(36769479-36769636)
chr4 (118-177)||(13072102-13072160)
chr4 (118-177)||(16689061-16689119)
chr4 (118-177)||(25699752-25699810)
chr4 (115-177)||(4570094-4570155)
chr4 (231-297)||(6133105-6133171)
chr4 (251-297)||(14789427-14789473)
chr4 (232-296)||(10047383-10047447)
chr4 (232-296)||(39245998-39246062)
chr4 (202-272)||(26557823-26557894)
chr4 (118-163)||(4884877-4884922)
chr4 (182-269)||(3578699-3578786)
chr4 (232-296)||(16623322-16623386)
chr4 (257-297)||(49088865-49088905)
chr4 (257-297)||(52942487-52942527)
[»] chr1 (103 HSPs)
chr1 (17-297)||(28840679-28840959)
chr1 (17-297)||(51750038-51750319)
chr1 (17-297)||(10399829-10400110)
chr1 (17-293)||(2617515-2617792)
chr1 (17-297)||(15294835-15295116)
chr1 (18-297)||(31735522-31735802)
chr1 (17-297)||(46431707-46431989)
chr1 (17-297)||(47906269-47906550)
chr1 (17-297)||(13761836-13762116)
chr1 (17-297)||(20291456-20291736)
chr1 (17-297)||(20302458-20302738)
chr1 (17-297)||(27336941-27337220)
chr1 (17-297)||(28842494-28842774)
chr1 (17-297)||(15823545-15823826)
chr1 (18-297)||(17324637-17324917)
chr1 (17-297)||(27339132-27339412)
chr1 (17-297)||(51752364-51752643)
chr1 (17-297)||(39932072-39932354)
chr1 (17-297)||(2510326-2510606)
chr1 (17-297)||(24325663-24325943)
chr1 (18-297)||(16226167-16226447)
chr1 (17-297)||(6823014-6823294)
chr1 (17-297)||(13215080-13215366)
chr1 (17-297)||(9463245-9463526)
chr1 (17-297)||(12302506-12302787)
chr1 (17-297)||(50307547-50307829)
chr1 (17-297)||(9459418-9459699)
chr1 (17-260)||(21948226-21948469)
chr1 (17-297)||(16428652-16428934)
chr1 (17-297)||(47179712-47179992)
chr1 (17-297)||(4131376-4131661)
chr1 (17-297)||(39462518-39462799)
chr1 (17-297)||(41646919-41647200)
chr1 (17-297)||(47177361-47177641)
chr1 (17-297)||(18839586-18839868)
chr1 (17-297)||(50076673-50076954)
chr1 (17-297)||(6995701-6995982)
chr1 (17-297)||(11457476-11457757)
chr1 (17-239)||(48665176-48665400)
chr1 (17-297)||(38925482-38925760)
chr1 (17-297)||(14097970-14098252)
chr1 (17-297)||(18307108-18307389)
chr1 (17-277)||(50078841-50079103)
chr1 (17-297)||(2949233-2949513)
chr1 (17-297)||(28998254-28998535)
chr1 (17-297)||(29003970-29004251)
chr1 (25-289)||(9241094-9241360)
chr1 (17-297)||(3579618-3579898)
chr1 (17-297)||(17186128-17186410)
chr1 (17-297)||(25127871-25128153)
chr1 (17-297)||(6756526-6756808)
chr1 (17-297)||(31425016-31425301)
chr1 (17-297)||(31489914-31490192)
chr1 (17-277)||(40133943-40134205)
chr1 (110-297)||(51757623-51757810)
chr1 (17-297)||(25251275-25251557)
chr1 (17-297)||(28207069-28207348)
chr1 (114-297)||(23785935-23786119)
chr1 (18-294)||(47451648-47451919)
chr1 (17-297)||(50248571-50248854)
chr1 (92-297)||(16231637-16231842)
chr1 (18-297)||(17324065-17324344)
chr1 (17-297)||(17318892-17319167)
chr1 (17-214)||(6823884-6824088)
chr1 (17-272)||(8347298-8347551)
chr1 (17-231)||(31422940-31423156)
chr1 (17-297)||(14183591-14183868)
chr1 (42-297)||(15669393-15669648)
chr1 (103-297)||(16429042-16429238)
chr1 (15-297)||(16432402-16432676)
chr1 (159-297)||(23816027-23816166)
chr1 (92-297)||(25248552-25248759)
chr1 (17-297)||(42922233-42922512)
chr1 (98-297)||(6115103-6115304)
chr1 (17-239)||(8349110-8349330)
chr1 (100-274)||(155788-155963)
chr1 (17-270)||(18800600-18800851)
chr1 (18-206)||(26520206-26520397)
chr1 (99-276)||(49495232-49495411)
chr1 (18-272)||(27916500-27916752)
chr1 (17-244)||(13125511-13125738)
chr1 (100-233)||(30738695-30738830)
chr1 (118-272)||(21353373-21353525)
chr1 (98-272)||(30790427-30790602)
chr1 (222-297)||(13358778-13358853)
chr1 (97-231)||(16561545-16561681)
chr1 (100-272)||(26613265-26613440)
chr1 (190-297)||(15916562-15916672)
chr1 (115-272)||(2232597-2232747)
chr1 (100-239)||(28279346-28279489)
chr1 (118-177)||(2401342-2401400)
chr1 (118-177)||(9526469-9526527)
chr1 (118-177)||(25134074-25134132)
chr1 (115-177)||(4144804-4144865)
chr1 (17-57)||(25248756-25248796)
chr1 (118-177)||(9521718-9521776)
chr1 (100-175)||(26332613-26332688)
chr1 (100-239)||(14353047-14353187)
chr1 (233-296)||(47102871-47102934)
chr1 (231-296)||(21536597-21536662)
chr1 (232-296)||(13598402-13598466)
chr1 (232-296)||(37069774-37069838)
chr1 (232-296)||(47703965-47704029)
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (17-297)||(20626047-20626328)
chr7 (17-297)||(20629938-20630219)
chr7 (17-297)||(20642357-20642638)
chr7 (17-297)||(38393995-38394276)
chr7 (17-297)||(40836742-40837022)
chr7 (24-297)||(20299475-20299750)
chr7 (17-297)||(44724588-44724869)
chr7 (17-297)||(48457662-48457943)
chr7 (17-297)||(1049295-1049575)
chr7 (17-297)||(7471979-7472260)
chr7 (17-297)||(1046924-1047204)
chr7 (17-297)||(1849990-1850271)
chr7 (17-297)||(7470021-7470302)
chr7 (17-297)||(35638-35919)
chr7 (17-297)||(44573-44854)
chr7 (17-297)||(3878586-3878867)
chr7 (17-297)||(18345550-18345831)
chr7 (17-297)||(31435045-31435327)
chr7 (17-293)||(20297371-20297648)
chr7 (17-297)||(40946337-40946618)
chr7 (17-297)||(13099473-13099756)
chr7 (17-297)||(3035730-3036014)
chr7 (17-297)||(27306229-27306509)
chr7 (17-297)||(31155910-31156191)
chr7 (17-297)||(7351651-7351932)
chr7 (17-293)||(43253520-43253796)
chr7 (24-242)||(11757245-11757465)
chr7 (17-297)||(25542539-25542818)
chr7 (17-297)||(20137108-20137389)
chr7 (18-297)||(443605-443886)
chr7 (17-293)||(37412128-37412408)
chr7 (17-272)||(7349297-7349553)
chr7 (17-297)||(4295933-4296215)
chr7 (17-297)||(24748603-24748885)
chr7 (17-297)||(11355267-11355548)
chr7 (17-297)||(42330996-42331279)
chr7 (17-297)||(21990159-21990440)
chr7 (17-297)||(28487562-28487843)
chr7 (17-297)||(39145985-39146267)
chr7 (17-287)||(21680036-21680307)
chr7 (17-297)||(42223166-42223448)
chr7 (17-297)||(21592142-21592423)
chr7 (17-297)||(28485575-28485855)
chr7 (17-282)||(27832646-27832913)
chr7 (17-277)||(9680828-9681090)
chr7 (91-297)||(38396718-38396924)
chr7 (17-297)||(21678075-21678356)
chr7 (17-297)||(9679068-9679349)
chr7 (92-293)||(7094463-7094665)
chr7 (92-297)||(7092212-7092417)
chr7 (27-239)||(25276160-25276374)
chr7 (17-277)||(24258472-24258737)
chr7 (17-201)||(26804578-26804765)
chr7 (114-297)||(2935374-2935558)
chr7 (37-297)||(24813496-24813755)
chr7 (114-297)||(1606486-1606669)
chr7 (114-297)||(22137184-22137367)
chr7 (114-297)||(40552211-40552394)
chr7 (114-297)||(9027193-9027376)
chr7 (114-297)||(22108173-22108356)
chr7 (114-297)||(40549933-40550116)
chr7 (17-272)||(24817377-24817629)
chr7 (17-214)||(22828716-22828913)
chr7 (42-263)||(20091580-20091797)
chr7 (17-239)||(22251602-22251822)
chr7 (17-297)||(7188552-7188831)
chr7 (17-125)||(18567622-18567730)
chr7 (45-297)||(24465578-24465827)
chr7 (159-297)||(26295598-26295738)
chr7 (162-297)||(22393876-22394013)
chr7 (18-297)||(11081522-11081801)
chr7 (100-297)||(6332311-6332512)
chr7 (115-272)||(25351353-25351508)
chr7 (99-272)||(2120881-2121056)
chr7 (115-272)||(3320076-3320232)
chr7 (115-272)||(3324824-3324980)
chr7 (156-272)||(6046641-6046759)
chr7 (115-272)||(25405393-25405549)
chr7 (115-272)||(25357047-25357202)
chr7 (18-268)||(6048885-6049134)
chr7 (100-176)||(16297146-16297222)
chr7 (115-272)||(25410130-25410287)
chr7 (138-231)||(6348912-6349006)
chr7 (115-272)||(7069780-7069936)
chr7 (115-272)||(7074787-7074943)
chr7 (45-153)||(22392502-22392606)
chr7 (115-272)||(8378529-8378686)
chr7 (17-69)||(38396325-38396377)
chr7 (115-177)||(42006663-42006724)
chr7 (118-177)||(30246973-30247031)
chr7 (118-177)||(44512646-44512704)
chr7 (115-177)||(15541116-15541177)
chr7 (103-208)||(40281466-40281572)
chr7 (100-177)||(11084467-11084544)
chr7 (249-297)||(11759369-11759417)
chr7 (118-166)||(44143997-44144045)
chr7 (118-177)||(34546984-34547042)
chr7 (17-57)||(7094662-7094702)
chr7 (233-296)||(9190038-9190101)
chr7 (233-296)||(20284093-20284156)
chr7 (100-177)||(26210631-26210710)
chr7 (115-177)||(21369642-21369703)
chr7 (17-57)||(7092414-7092455)
chr7 (256-296)||(8153470-8153510)
chr7 (232-296)||(21983288-21983352)
chr7 (232-296)||(44848713-44848777)
chr7 (232-296)||(46516339-46516403)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (17-297)||(11983028-11983309)
chr6 (17-297)||(1230248-1230529)
chr6 (18-297)||(14507175-14507454)
chr6 (17-297)||(14458766-14459045)
chr6 (17-297)||(4816230-4816511)
chr6 (17-297)||(28241320-28241601)
chr6 (17-297)||(2628885-2629165)
chr6 (17-297)||(26065020-26065296)
chr6 (17-297)||(26084989-26085265)
chr6 (17-297)||(19704566-19704849)
chr6 (17-297)||(20915355-20915636)
chr6 (17-297)||(30967235-30967516)
chr6 (18-297)||(30034602-30034882)
chr6 (18-297)||(9019961-9020241)
chr6 (17-297)||(13057228-13057510)
chr6 (17-296)||(12195515-12195795)
chr6 (17-297)||(3631938-3632218)
chr6 (17-297)||(3390413-3390695)
chr6 (17-297)||(13039788-13040070)
chr6 (17-297)||(26932561-26932842)
chr6 (17-293)||(32280030-32280308)
chr6 (21-253)||(15530166-15530398)
chr6 (17-297)||(15541139-15541420)
chr6 (17-297)||(30728823-30729108)
chr6 (17-297)||(25477308-25477597)
chr6 (25-297)||(3629864-3630136)
chr6 (17-297)||(15532681-15532961)
chr6 (92-297)||(5273215-5273421)
chr6 (17-297)||(3233724-3234011)
chr6 (114-297)||(26066123-26066307)
chr6 (18-191)||(19227514-19227687)
chr6 (114-297)||(33308988-33309171)
chr6 (17-297)||(24338447-24338728)
chr6 (114-297)||(26068394-26068578)
chr6 (114-297)||(29754708-29754892)
chr6 (114-297)||(33311257-33311440)
chr6 (18-272)||(3027876-3028128)
chr6 (17-297)||(12161557-12161835)
chr6 (103-297)||(1069717-1069913)
chr6 (60-297)||(14466399-14466639)
chr6 (45-297)||(15719708-15719959)
chr6 (17-231)||(22490673-22490889)
chr6 (99-297)||(12186070-12186271)
chr6 (18-272)||(16455449-16455701)
chr6 (97-297)||(15367145-15367347)
chr6 (100-272)||(22857977-22858152)
chr6 (17-110)||(32447502-32447596)
chr6 (158-297)||(15346522-15346662)
chr6 (98-231)||(26945258-26945393)
chr6 (45-229)||(17012105-17012287)
chr6 (100-297)||(19696556-19696757)
chr6 (18-82)||(8995514-8995578)
chr6 (17-84)||(1072090-1072157)
chr6 (17-111)||(13870608-13870702)
chr6 (17-84)||(17852576-17852643)
chr6 (115-272)||(13878727-13878883)
chr6 (115-272)||(16785919-16786075)
chr6 (100-254)||(20526922-20527078)
chr6 (115-272)||(13883475-13883631)
chr6 (100-227)||(7542452-7542581)
chr6 (188-271)||(12911471-12911555)
chr6 (180-297)||(25465589-25465708)
chr6 (115-272)||(26887252-26887406)
chr6 (101-272)||(28037750-28037927)
chr6 (115-177)||(31248835-31248896)
chr6 (115-177)||(35201447-35201508)
chr6 (214-297)||(10584227-10584311)
chr6 (115-177)||(3577636-3577696)
chr6 (118-177)||(17036058-17036116)
chr6 (118-177)||(17694972-17695030)
chr6 (17-75)||(10584155-10584213)
chr6 (115-271)||(12937219-12937376)
chr6 (159-288)||(30445699-30445832)
chr6 (100-175)||(11138423-11138499)
chr6 (122-177)||(12166267-12166321)
chr6 (118-177)||(22351973-22352031)
chr6 (118-175)||(19701985-19702041)
chr6 (121-177)||(25941650-25941704)
chr6 (118-272)||(33215830-33215984)
chr6 (118-177)||(13467585-13467642)
chr6 (118-177)||(22342922-22342980)
chr6 (232-296)||(5757507-5757571)
chr6 (232-296)||(10077194-10077258)
chr6 (182-276)||(28078215-28078310)
[»] chr3 (143 HSPs)
chr3 (17-297)||(25533421-25533702)
chr3 (17-297)||(4103893-4104173)
chr3 (17-297)||(4308278-4308559)
chr3 (17-297)||(18099167-18099448)
chr3 (17-297)||(42990283-42990564)
chr3 (17-297)||(43228270-43228551)
chr3 (17-297)||(10956024-10956305)
chr3 (17-297)||(3859507-3859787)
chr3 (17-297)||(10958320-10958601)
chr3 (17-297)||(11170383-11170664)
chr3 (17-297)||(5191632-5191911)
chr3 (18-294)||(18096900-18097177)
chr3 (17-297)||(38890019-38890300)
chr3 (17-297)||(43226065-43226345)
chr3 (17-297)||(51727004-51727284)
chr3 (19-297)||(10084386-10084665)
chr3 (17-297)||(45882918-45883200)
chr3 (17-297)||(25388885-25389165)
chr3 (17-297)||(27101178-27101459)
chr3 (17-297)||(30005820-30006101)
chr3 (42-297)||(1321483-1321739)
chr3 (17-297)||(746736-747017)
chr3 (25-297)||(1313396-1313669)
chr3 (17-297)||(458263-458544)
chr3 (17-297)||(6065793-6066074)
chr3 (25-297)||(9604604-9604877)
chr3 (17-297)||(53917661-53917942)
chr3 (17-297)||(455886-456167)
chr3 (60-297)||(7606585-7606822)
chr3 (17-297)||(10621527-10621808)
chr3 (17-297)||(22114302-22114583)
chr3 (17-297)||(6063443-6063724)
chr3 (17-297)||(28101999-28102280)
chr3 (17-297)||(43421412-43421693)
chr3 (17-297)||(43423460-43423741)
chr3 (17-297)||(50493978-50494259)
chr3 (17-297)||(53915493-53915774)
chr3 (19-297)||(10191307-10191585)
chr3 (17-297)||(5522624-5522893)
chr3 (17-297)||(26720527-26720807)
chr3 (17-297)||(18162642-18162923)
chr3 (36-297)||(28413029-28413291)
chr3 (18-296)||(32264035-32264316)
chr3 (17-297)||(1626680-1626961)
chr3 (17-297)||(38210349-38210630)
chr3 (17-297)||(51943350-51943630)
chr3 (17-297)||(24979686-24979968)
chr3 (17-254)||(29956665-29956903)
chr3 (17-297)||(5926761-5927042)
chr3 (17-297)||(3314663-3314945)
chr3 (17-297)||(47148892-47149173)
chr3 (17-297)||(880448-880730)
chr3 (17-297)||(36011806-36012087)
chr3 (17-253)||(6561789-6562028)
chr3 (17-294)||(35917944-35918227)
chr3 (17-297)||(53468450-53468733)
chr3 (25-297)||(48361668-48361941)
chr3 (92-293)||(25688161-25688364)
chr3 (99-297)||(5886261-5886458)
chr3 (99-297)||(5899734-5899931)
chr3 (18-297)||(54691571-54691851)
chr3 (17-288)||(889779-890049)
chr3 (102-297)||(11168165-11168361)
chr3 (17-297)||(15780839-15781139)
chr3 (17-297)||(42992265-42992530)
chr3 (17-297)||(12267972-12268244)
chr3 (17-232)||(39715448-39715664)
chr3 (92-297)||(6484414-6484620)
chr3 (17-276)||(28761446-28761706)
chr3 (17-203)||(35777400-35777587)
chr3 (17-193)||(28100143-28100319)
chr3 (60-297)||(32219106-32219345)
chr3 (64-297)||(51674763-51674997)
chr3 (59-297)||(4666535-4666774)
chr3 (18-297)||(31151329-31151605)
chr3 (92-297)||(6231855-6232060)
chr3 (25-198)||(28181009-28181182)
chr3 (64-296)||(53591210-53591442)
chr3 (18-297)||(23633440-23633713)
chr3 (17-297)||(27635655-27635905)
chr3 (97-297)||(17795317-17795519)
chr3 (97-297)||(19103757-19103959)
chr3 (17-272)||(36871323-36871576)
chr3 (45-272)||(13420208-13420432)
chr3 (18-214)||(23637007-23637199)
chr3 (17-130)||(41849131-41849244)
chr3 (19-249)||(54884138-54884367)
chr3 (45-272)||(561797-562024)
chr3 (17-272)||(53597219-53597472)
chr3 (165-297)||(47701668-47701801)
chr3 (45-231)||(25635391-25635575)
chr3 (17-178)||(28137423-28137573)
chr3 (100-272)||(1620483-1620657)
chr3 (38-206)||(1673975-1674140)
chr3 (156-272)||(24181498-24181616)
chr3 (116-297)||(3306839-3307020)
chr3 (17-84)||(11163129-11163196)
chr3 (17-84)||(6231428-6231495)
chr3 (17-84)||(47701806-47701873)
chr3 (118-272)||(29913980-29914132)
chr3 (18-142)||(24177260-24177380)
chr3 (100-249)||(14634486-14634638)
chr3 (115-272)||(10094100-10094256)
chr3 (181-297)||(25634030-25634148)
chr3 (92-180)||(4560399-4560487)
chr3 (221-297)||(41849243-41849319)
chr3 (230-297)||(35919112-35919179)
chr3 (115-272)||(10100117-10100273)
chr3 (115-272)||(10200980-10201136)
chr3 (115-272)||(10208026-10208182)
chr3 (118-272)||(10897008-10897162)
chr3 (118-272)||(54193229-54193383)
chr3 (230-297)||(53894054-53894121)
chr3 (115-272)||(6303310-6303466)
chr3 (115-177)||(16462203-16462264)
chr3 (115-177)||(22626105-22626166)
chr3 (115-177)||(47883003-47883064)
chr3 (115-272)||(5858546-5858701)
chr3 (118-272)||(10612803-10612957)
chr3 (118-272)||(47878196-47878350)
chr3 (17-81)||(3306778-3306842)
chr3 (118-272)||(54188512-54188665)
chr3 (115-272)||(11079517-11079674)
chr3 (118-177)||(20031439-20031497)
chr3 (118-177)||(27762107-27762165)
chr3 (91-125)||(7606830-7606864)
chr3 (115-272)||(27544273-27544429)
chr3 (232-296)||(1736324-1736388)
chr3 (119-272)||(10949285-10949438)
chr3 (232-296)||(18552902-18552966)
chr3 (232-296)||(30709809-30709873)
chr3 (115-175)||(38002869-38002928)
chr3 (118-177)||(10595155-10595213)
chr3 (100-177)||(11066652-11066731)
chr3 (127-177)||(4535626-4535675)
chr3 (37-153)||(13419883-13419994)
chr3 (100-133)||(1618824-1618857)
chr3 (100-140)||(7768632-7768672)
chr3 (232-296)||(8370505-8370569)
chr3 (232-296)||(26298992-26299056)
chr3 (232-296)||(27974971-27975035)
chr3 (232-296)||(27986465-27986529)
chr3 (256-296)||(39153361-39153401)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (17-297)||(27829352-27829632)
chr8 (17-297)||(28251566-28251847)
chr8 (17-297)||(27827041-27827321)
chr8 (17-297)||(608789-609070)
chr8 (17-297)||(3874065-3874346)
chr8 (17-297)||(18810763-18811043)
chr8 (17-297)||(14807806-14808097)
chr8 (17-297)||(22684652-22684936)
chr8 (17-297)||(32339364-32339645)
chr8 (17-297)||(44720898-44721179)
chr8 (17-297)||(28283220-28283499)
chr8 (17-297)||(15809274-15809554)
chr8 (17-297)||(43079657-43079938)
chr8 (17-297)||(15068036-15068317)
chr8 (17-297)||(27106896-27107177)
chr8 (17-297)||(30480502-30480783)
chr8 (17-297)||(15072765-15073047)
chr8 (17-297)||(43082028-43082309)
chr8 (17-297)||(14419189-14419471)
chr8 (17-297)||(4424073-4424354)
chr8 (17-297)||(24873180-24873461)
chr8 (17-293)||(27911070-27911345)
chr8 (17-293)||(27957489-27957764)
chr8 (17-297)||(1225221-1225503)
chr8 (60-297)||(43530213-43530451)
chr8 (17-297)||(13858483-13858764)
chr8 (17-297)||(18812948-18813217)
chr8 (17-297)||(41384799-41385080)
chr8 (17-297)||(36865593-36865873)
chr8 (17-297)||(25952576-25952857)
chr8 (18-297)||(41382729-41382998)
chr8 (17-293)||(5372179-5372458)
chr8 (17-206)||(14477331-14477520)
chr8 (17-179)||(33541506-33541668)
chr8 (52-297)||(15956051-15956294)
chr8 (45-290)||(21480589-21480832)
chr8 (45-297)||(21482397-21482647)
chr8 (17-297)||(15185713-15185990)
chr8 (53-297)||(31162303-31162549)
chr8 (100-297)||(3005629-3005829)
chr8 (17-153)||(5622882-5623018)
chr8 (97-267)||(31035252-31035424)
chr8 (92-232)||(181629-181772)
chr8 (100-272)||(31578301-31578476)
chr8 (17-139)||(26775256-26775378)
chr8 (17-125)||(35872555-35872658)
chr8 (50-178)||(37214319-37214438)
chr8 (17-73)||(12517248-12517304)
chr8 (115-272)||(16757293-16757449)
chr8 (100-228)||(31573794-31573924)
chr8 (200-293)||(33541413-33541507)
chr8 (168-297)||(2468128-2468259)
chr8 (115-272)||(28327908-28328064)
chr8 (115-272)||(9021132-9021289)
chr8 (115-272)||(6376141-6376300)
chr8 (115-177)||(16752643-16752704)
chr8 (115-177)||(28895502-28895563)
chr8 (18-135)||(31035126-31035239)
chr8 (17-62)||(3886153-3886198)
chr8 (118-272)||(29554810-29554964)
chr8 (241-297)||(37214263-37214319)
chr8 (118-177)||(590797-590855)
chr8 (118-177)||(33032657-33032715)
chr8 (115-177)||(4812608-4812669)
chr8 (115-177)||(28332631-28332692)
chr8 (118-272)||(23179586-23179740)
chr8 (184-259)||(35872477-35872553)
chr8 (118-177)||(3276347-3276405)
chr8 (118-272)||(25684646-25684799)
chr8 (115-200)||(13985176-13985262)
chr8 (97-142)||(2468261-2468306)
chr8 (100-272)||(17847661-17847830)
chr8 (17-57)||(181592-181632)
chr8 (230-297)||(14477519-14477587)
chr8 (115-163)||(17799558-17799606)
chr8 (231-272)||(28890881-28890922)
chr8 (232-296)||(4696625-4696689)
chr8 (232-296)||(9765848-9765912)
chr8 (232-296)||(26403259-26403323)
chr8 (17-49)||(37214458-37214490)
[»] chr2 (93 HSPs)
chr2 (17-297)||(27104774-27105053)
chr2 (17-297)||(45279983-45280265)
chr2 (17-297)||(42064490-42064771)
chr2 (17-297)||(13910044-13910324)
chr2 (17-297)||(19502010-19502291)
chr2 (17-297)||(23452236-23452517)
chr2 (17-297)||(19504345-19504625)
chr2 (17-297)||(42452758-42453036)
chr2 (17-297)||(21520692-21520973)
chr2 (17-297)||(24162222-24162492)
chr2 (17-297)||(35215585-35215866)
chr2 (17-297)||(42923508-42923789)
chr2 (17-297)||(19007615-19007896)
chr2 (17-297)||(35217962-35218243)
chr2 (17-297)||(43623579-43623848)
chr2 (17-297)||(40032052-40032338)
chr2 (19-297)||(11739558-11739838)
chr2 (17-297)||(28196612-28196891)
chr2 (17-297)||(22287335-22287616)
chr2 (91-297)||(5375345-5375551)
chr2 (18-297)||(17848419-17848696)
chr2 (17-297)||(6258816-6259095)
chr2 (17-297)||(6264147-6264425)
chr2 (18-297)||(44289066-44289347)
chr2 (17-297)||(3022138-3022428)
chr2 (17-206)||(15539566-15539755)
chr2 (17-297)||(34979576-34979859)
chr2 (17-297)||(31732775-31733045)
chr2 (17-273)||(45239000-45239256)
chr2 (114-297)||(36558863-36559047)
chr2 (114-297)||(36561140-36561324)
chr2 (17-297)||(17849092-17849373)
chr2 (17-297)||(14837248-14837524)
chr2 (17-268)||(11578136-11578384)
chr2 (114-297)||(45332180-45332364)
chr2 (18-272)||(20146632-20146884)
chr2 (156-297)||(22407453-22407595)
chr2 (19-272)||(17897270-17897519)
chr2 (52-277)||(28459209-28459435)
chr2 (48-260)||(18800349-18800559)
chr2 (45-297)||(22874137-22874387)
chr2 (17-142)||(38020177-38020302)
chr2 (98-272)||(40699429-40699606)
chr2 (168-293)||(7462950-7463077)
chr2 (17-115)||(22407591-22407689)
chr2 (17-125)||(22163119-22163227)
chr2 (180-297)||(22707750-22707870)
chr2 (37-272)||(35107294-35107526)
chr2 (17-97)||(5377629-5377709)
chr2 (118-272)||(17943540-17943692)
chr2 (212-297)||(22163021-22163106)
chr2 (100-231)||(43139432-43139564)
chr2 (97-226)||(27136195-27136326)
chr2 (115-272)||(2736205-2736361)
chr2 (115-231)||(20589763-20589881)
chr2 (115-272)||(17462436-17462592)
chr2 (98-184)||(38414194-38414279)
chr2 (115-272)||(39686983-39687139)
chr2 (118-272)||(27517664-27517818)
chr2 (115-272)||(20054790-20054947)
chr2 (182-277)||(23870956-23871052)
chr2 (115-272)||(2740941-2741097)
chr2 (115-177)||(22712637-22712698)
chr2 (115-177)||(22717346-22717407)
chr2 (115-177)||(45567409-45567470)
chr2 (118-242)||(17932637-17932759)
chr2 (99-297)||(37962940-37963137)
chr2 (118-177)||(12781342-12781400)
chr2 (100-177)||(17921754-17921833)
chr2 (115-262)||(33603994-33604143)
chr2 (99-231)||(15693958-15694094)
chr2 (101-153)||(27583483-27583535)
chr2 (115-163)||(38190997-38191045)
chr2 (118-177)||(37170873-37170931)
chr2 (115-177)||(28458949-28459011)
chr2 (115-177)||(39680045-39680106)
chr2 (100-175)||(7502975-7503052)
chr2 (99-175)||(26345661-26345738)
chr2 (19-56)||(38020120-38020157)
chr2 (232-296)||(8040064-8040128)
chr2 (232-296)||(14699036-14699100)
chr2 (100-175)||(35028632-35028707)
chr2 (161-199)||(38020311-38020349)
chr2 (115-272)||(20050046-20050204)
chr2 (231-272)||(33670992-33671033)
chr2 (18-59)||(41304627-41304667)
chr2 (231-272)||(45679838-45679879)
chr2 (232-296)||(8390179-8390243)
chr2 (232-296)||(13569332-13569396)
chr2 (256-296)||(17057369-17057409)
chr2 (256-296)||(17085352-17085392)
chr2 (232-296)||(17865207-17865271)
chr2 (232-296)||(20522224-20522288)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-297)||(41482-41763)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (18-297)||(79194-79474)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (17-297)||(14381-14662)
scaffold0131 (17-297)||(15027-15308)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (17-297)||(2888-3168)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (17-297)||(29179-29459)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (17-297)||(6207-6488)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (17-297)||(183640-183920)
scaffold0005 (17-297)||(52019-52302)
scaffold0005 (251-297)||(50257-50303)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (17-297)||(11472-11753)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (17-297)||(4005-4284)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (17-297)||(49-330)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (92-297)||(1452-1657)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (17-297)||(79867-80148)
scaffold0004 (115-177)||(188363-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (16-285)||(85237-85508)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (17-260)||(2050-2293)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-189)||(35647-35819)
scaffold0011 (231-297)||(35817-35883)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (114-297)||(22221-22404)
scaffold0140 (114-297)||(24496-24679)
scaffold0140 (232-296)||(8448-8512)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (98-272)||(1666-1842)
scaffold0468 (17-67)||(1862-1911)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (17-297)||(15819-16098)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (42-231)||(16716-16903)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (17-130)||(993-1111)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (100-272)||(4901-5076)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (115-177)||(224819-224880)
scaffold0006 (232-296)||(5687-5751)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (118-177)||(16328-16386)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (246-297)||(4678-4729)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (118-272)||(17011-17165)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (231-272)||(3095-3136)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 2174918 - 2175198
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  2174918 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 2175017  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175018 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 2175117  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2175118 aacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 2175198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 38882105 - 38882385
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38882105 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38882204  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882205 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 38882304  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38882305 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38882385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34477334 - 34477052
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  34477334 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 34477235  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477234 acactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 34477135  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34477134 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34477052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6745068 - 6745348
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6745068 gaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaa 6745166  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6745167 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 6745266  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6745267 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6745348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10529379 - 10529098
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  10529379 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 10529280  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10529279 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 10529180  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10529179 taacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10529098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18466683 - 18466964
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466683 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18466782  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466783 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18466882  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18466883 taacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18466964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 21948025 - 21948306
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21948025 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 21948124  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  21948125 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttg 21948224  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21948225 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 21948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 39854482 - 39854763
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39854482 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 39854581  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39854582 acactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 39854681  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  39854682 taacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 39854763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Original strand, 4236628 - 4236900
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  4236628 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 4236727  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4236728 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4236827  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  4236828 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgg 4236900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 25804025 - 25804300
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25804025 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25804124  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25804125 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25804224  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25804225 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 25804300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34479699 - 34479417
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  34479699 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 34479600  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479599 acactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 34479500  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34479499 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34479417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25921753 - 25921472
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  25921753 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaa 25921654  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25921653 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 25921554  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25921553 taacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 27912535 - 27912816
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27912535 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaa 27912634  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27912635 acactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 27912734  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27912735 taacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27912816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21684731 - 21684451
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||  |||||||||| ||||||||     
T  21684731 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggat 21684632  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21684631 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgt 21684532  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21684531 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 21684451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 40221521 - 40221803
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  40221521 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaa 40221620  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40221621 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 40221720  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40221721 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40221803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 16776157 - 16776437
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  16776157 gaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 16776256  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16776257 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttg 16776355  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  16776356 taacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaa 16776437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18511492 - 18511211
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18511492 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18511393  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  18511392 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttg 18511293  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18511292 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 18511211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 27910457 - 27910730
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910457 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27910556  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27910557 aggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 27910656  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27910657 ctcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27910730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 31545079 - 31545360
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  31545079 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31545178  T
Q  117 acactattatgatt-gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545179 acactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31545278  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  31545279 taacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31545360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31179651 - 31179370
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  31179651 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31179552  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31179551 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttg 31179452  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  31179451 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31179370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6747305 - 6747584
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6747305 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaa 6747403  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6747404 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgt 6747503  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6747504 aacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6747584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18469010 - 18469289
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18469010 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18469109  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18469110 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttg 18469209  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |  |||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  18469210 taacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctc--tctcccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaa 18469289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18509598 - 18509317
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18509598 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18509499  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||    
T  18509498 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttg 18509399  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18509398 taaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaa 18509317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 31542734 - 31543014
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  31542734 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31542833  T
Q  117 acactattatgatt-gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31542834 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttg 31542932  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  31542933 taacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31543014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15552244 - 15552525
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  15552244 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 15552343  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552344 acactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 15552443  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  15552444 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15552525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658355
Alignment:
Q  40 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatctt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  140 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  239 atcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 658355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 26097740 - 26098011
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097740 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactatt 26097838  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26097839 aggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 26097938  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26097939 ctcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaa 26098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2818616 - 2818334
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggtt-gattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||| |    
T  2818616 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaa 2818517  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||    
T  2818516 aacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 2818417  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2818416 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 2818334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25904102 - 25904383
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25904102 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 25904201  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  25904202 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattg 25904301  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25904302 taacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 25904383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1189889 - 1189606
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  1189889 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaa 1189790  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  1189789 acactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 1189690  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcc-cccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1189689 taaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1189606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10474603 - 10474322
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||    
T  10474603 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaa 10474504  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||     
T  10474503 acactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttc 10474404  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10474403 taaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 10474322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31472892 - 31472611
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472892 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaa 31472793  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  | | ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  31472792 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgt 31472693  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31472692 aaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 31472611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 10586841 - 10587112
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-gggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  10586841 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttggga 10586929  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10586930 aacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttg 10587029  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10587030 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 10587112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16092480 - 16092198
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16092480 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 16092381  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  16092380 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttg 16092281  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16092280 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaa 16092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39398273 - 39397996
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  39398273 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttggga 39398175  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39398174 aacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 39398075  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    || |||||||  || |||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  39398074 gtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 39397996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24126855 - 24127136
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||   ||||| | |||||| ||||||||||    
T  24126855 gaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaa 24126954  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24126955 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 24127054  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24127055 taaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24127136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 295
Target Start/End: Original strand, 18596664 - 18596924
Alignment:
Q  37 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  18596664 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 18596763  T
Q  137 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tata 234  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18596764 cttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18596863  T
Q  235 gtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18596864 gtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 17072882 - 17073164
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17072882 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 17072981  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||  |||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  17072982 acactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 17073081  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17073082 taaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17073164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 4410097 - 4410302
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4410097 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 4410196  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtc 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  4410197 ttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 4410296  T
Q  292 aacaaa 297  Q
    ||||||    
T  4410297 aacaaa 4410302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6756493 - 6756772
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756493 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaa 6756592  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||    
T  6756593 acactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttg 6756690  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| | | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  6756691 taaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 6756772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17818770 - 17818491
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17818770 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaa 17818671  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17818670 acactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 17818571  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| | || ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17818570 taaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17818491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 2954415 - 2954696
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||| |    
T  2954415 gaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaa 2954514  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2954515 aacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttg 2954614  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  2954615 taaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 2954696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36402608 - 36402327
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  36402608 gaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 36402509  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||| | |||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  36402508 atactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttg 36402409  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  36402408 taacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaa 36402327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37706052 - 37705779
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706052 ggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 37705953  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37705952 aggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 37705853  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||| | || ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  37705852 ctcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 37705779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12556203 - 12555926
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12556203 gaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaa 12556104  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg--atttctcttt 214  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| | | ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||    
T  12556103 acactattaggattgtgtctcttggctacgggaaga-gattggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctcttttt 12556005  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||||||||||||| || || | | |||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12556004 gtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaa 12555926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 695888 - 696158
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  695888 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aa 695975  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  695976 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 696075  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  696076 taaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 696158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505842
Alignment:
Q  96 agggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  196 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc--tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  295 aaa 297  Q
    |||    
T  20505844 aaa 20505842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749980
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 10749980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798327
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  39798326 aa 39798327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41585949 - 41585743
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41585949 tttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggagacttattt 41585850  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  41585849 ttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggt 41585750  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  41585749 caacaaa 41585743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34530946 - 34530722
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  34530946 gaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 34530847  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  34530846 acactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttg 34530747  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  34530746 taaagttgctcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31466258 - 31465988
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||| ||||||||||||||| |||    
T  31466258 gaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaa 31466159  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttg 215  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  31466158 acagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttg 31466060  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||||||||          |||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31466059 taaagttactcatcatatag----------ggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 31465988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 20045009 - 20045170
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20045009 gaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20045108  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20045109 acactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 20045170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373136
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattga-gtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 3373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757456
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaa 10757456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354574
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15354574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 21288763 - 21289041
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattt------tgagggttgattcacct 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||      |||||||||||||||||    
T  21288763 gaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacct 21288862  T
Q  111 tgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct 210  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||| ||      |||    
T  21288863 tga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct 21288955  T
Q  211 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21288956 -tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 21289041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665323
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23665323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793264
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23793264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6661462 - 6661183
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || |  |||||||||||| ||||||    
T  6661462 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaa 6661367  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6661366 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 6661267  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||    
T  6661266 taaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaa 6661183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356850
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 15356850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960131
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 38960131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 20043049 - 20043208
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20043049 gaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20043148  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 176  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043149 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 131 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741858
Alignment:
Q  131 gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 230  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 23741925  T
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  23741924 aatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23741858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 2723976 - 2724173
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||         ||||||||||| || || ||||||    
T  2723976 tttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcgggtgatttattc 2724066  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2724067 ttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 2724166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26098531 - 26098395
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||    
T  26098531 gaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaa 26098432  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagag 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26098431 acactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 271
Target Start/End: Original strand, 9020299 - 9020473
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9020299 gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaac 9020398  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtc 271  Q
    |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  9020399 ccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtc 9020473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208856
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctcttt-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  36208855 aa 36208856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17413365 - 17413198
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  17413365 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaac 17413266  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccaga 264  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || |||||| |||||||||    
T  17413265 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccaga 17413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 20053846 - 20054091
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |||   || |||| |||||||||||||||||    
T  20053846 gaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgggaa 20053941  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||      |||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||    
T  20053942 acactattaggattgagtctcttggtttggagat-----tgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttg 20054033  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  20054034 taaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtca 20054091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||| | ||||| |||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 297
Target Start/End: Original strand, 23667492 - 23667598
Alignment:
Q  191 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||| || ||||||||     
T  23667492 cttgcaacccattgatttctctttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggc 23667591  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  23667592 caacaaa 23667598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 297
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898011
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| | |  ||||||| | ||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaa 4898011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170967
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  144 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 232  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385477
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 35385477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20507742 - 20507675
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20507742 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 20507675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 272
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445653
Alignment:
Q  120 ctattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  219 cgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
     |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25445653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098287
Alignment:
Q  212 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 26098287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672991
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  217 aacgttactcat--cat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 22672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctg-ggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  197 acccattg-atttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    |||  ||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2144663 accttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Original strand, 4410060 - 4410101
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410060 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445265
Alignment:
Q  188 attcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaa 284  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  285 ctgggtcaacaaa 297  Q
    |||||| ||||||    
T  15445277 ctgggtaaacaaa 15445265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754380
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||   | || || |||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaac 4754334  T
Q  199 c-cattgatttctctttgtaacgttactcatc-atatagtggatcg 242  Q
    |   || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4754335 cttttttatatctctttgtaaagttactcatcaatatagtggatcg 4754380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841274
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17841333  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17841332 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 17841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770924
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 176  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 176  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Original strand, 20043217 - 20043270
Alignment:
Q  244 atggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  20043217 atggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 20043270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41585986 - 41585946
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 57  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  41585986 gaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 69571 - 69291
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  69571 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 69472  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69471 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 69372  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  69371 aacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 69291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 73303 - 73207
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  73303 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 73192 - 73160
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73192 tttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 122)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37089651 - 37089371
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37089651 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 37089552  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089551 acactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 37089452  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37089451 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 37089371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8631699 - 8631418
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  8631699 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 8631600  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8631599 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 8631500  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8631499 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 8631418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22046965 - 22046685
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  22046965 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22046866  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046865 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22046766  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22046765 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22046685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31849879 - 31849598
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaa-ttttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31849879 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttggga 31849780  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849779 aacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31849680  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31849679 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaa 31849598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22044670 - 22044390
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||| |||||||||    
T  22044670 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaa 22044571  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22044570 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgt 22044471  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22044470 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 38409258 - 38409538
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38409258 gaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38409357  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409358 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 38409457  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38409458 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38409538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2485151 - 2484872
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  2485151 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaa 2485052  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485051 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 2484952  T
Q  218 acgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2484951 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 2484872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 40637127 - 40637408
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40637127 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40637226  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40637227 acactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 40637326  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40637327 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40637408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 9148310 - 9148586
Alignment:
Q  21 caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacac 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148310 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 9148409  T
Q  121 tattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 220  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148410 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9148509  T
Q  221 ttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  9148510 ttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9148586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 11435008 - 11435288
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  11435008 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11435107  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435108 acactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 11435207  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11435208 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11435288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 51015299 - 51015579
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  51015299 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 51015398  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015399 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 51015498  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51015499 aacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 51015579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11006517 - 11006236
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  11006517 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11006418  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006417 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 11006318  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  11006317 taatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaa 11006236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22803014 - 22802733
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22803014 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 22802915  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22802914 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 22802815  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22802814 taatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaa 22802733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24348271 - 24348552
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  24348271 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 24348370  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24348371 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 24348470  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24348471 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24348552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 48486372 - 48486653
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  48486372 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 48486471  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  48486472 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttg 48486571  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48486572 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 48486653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 47868454 - 47868735
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868454 gaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaa 47868553  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47868554 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47868653  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  47868654 taacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 47868735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22132670 - 22132391
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  22132670 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22132572  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132571 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22132472  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22132471 aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22132391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6764892 - 6765178
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttg-----ggaacaaacgctaaattttgagggttgattcacctt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  6764892 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 6764991  T
Q  112 gggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc 211  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764992 gggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 6765091  T
Q  212 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6765092 ttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6765178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18847206 - 18847486
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  18847206 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 18847305  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847306 acactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 18847405  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18847406 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18847486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22801142 - 22800861
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  22801142 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 22801043  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22801042 acactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 22800943  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22800942 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22800861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24888849 - 24889130
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  24888849 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaa 24888948  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  24888949 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttg 24889048  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24889049 taacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24889130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11008846 - 11008567
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  11008846 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11008747  T
Q  117 acactattatgatt-gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11008746 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttg 11008649  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11008648 taatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 11008567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36921774 - 36921492
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  36921774 gaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 36921675  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  36921674 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 36921575  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  36921574 gtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 36921492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40091695 - 40091414
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40091695 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaa 40091596  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40091595 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 40091496  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40091495 taatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40091414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 7941374 - 7941657
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgc--taaattttgagggttgattcaccttggg 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||  ||   |||| ||||||||||||||||||    
T  7941374 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggg 7941473  T
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7941474 aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 7941573  T
Q  214 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7941574 tgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7941657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 5198473 - 5198754
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  5198473 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaa 5198572  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5198573 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 5198672  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5198673 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 5198754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22134895 - 22134617
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  22134895 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22134797  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134796 acactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22134697  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22134696 aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22134617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085976
Alignment:
Q  37 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  137 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagt 236  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagt 26086037  T
Q  237 ggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  26086036 ggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 26085976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5637745 - 5637524
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637745 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 5637646  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5637645 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 5637546  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5637545 taacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 14633372 - 14633652
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14633372 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14633471  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14633472 acactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14633570  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14633571 taatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14633652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44600118 - 44599837
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  44600118 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 44600019  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44600018 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 44599919  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  44599918 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 44599837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36919865 - 36919583
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  36919865 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 36919766  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  36919765 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 36919666  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36919665 gtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 36919583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 24880505 - 24880786
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24880505 aaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaa 24880604  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24880605 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24880704  T
Q  217 -aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24880705 aaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24880786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18709443 - 18709163
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| | ||||||||||||||||||    
T  18709443 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaa 18709344  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709343 acactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18709244  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  18709243 aacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 18709163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17662514 - 17662244
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17662514 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 17662426  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17662425 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 17662326  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17662325 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17662244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9176754 - 9176473
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  9176754 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9176655  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176654 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 9176555  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||    
T  9176554 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaa 9176473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22780653 - 22780372
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  22780653 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22780554  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780553 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22780454  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  22780453 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22780372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22783018 - 22782737
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  22783018 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22782919  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782918 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22782819  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||    
T  22782818 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaa 22782737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 47274780 - 47275059
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  47274780 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 47274878  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47274879 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 47274978  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  47274979 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaa 47275059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16934420 - 16934142
Alignment:
Q  20 acaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaaca 119  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16934420 acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaaca 16934321  T
Q  120 ctattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 218  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934320 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 16934221  T
Q  219 cgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16934220 cgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16934142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24879042 - 24879324
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||    
T  24879042 gaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaa 24879141  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24879142 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24879241  T
Q  216 t-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24879242 taaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 24879324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38928458 - 38928176
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  38928458 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 38928359  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
T  38928358 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 38928259  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38928258 gtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38928176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12396125 - 12395844
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  12396125 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12396026  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  12396025 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttg 12395926  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  12395925 taaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12395844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12401087 - 12400806
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  12401087 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12400988  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  12400987 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttg 12400888  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  12400887 taaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaa 12400806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33415767 - 33415491
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33415767 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaa 33415669  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33415668 acactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 33415569  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33415568 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 33415491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16932066 - 16931788
Alignment:
Q  20 acaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaaca 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16932066 acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaaca 16931967  T
Q  120 ctattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 218  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931966 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 16931867  T
Q  219 cgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16931866 cgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16931788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9174426 - 9174145
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   || | | ||||||||||||||||||    
T  9174426 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaa 9174327  T
Q  117 acactattatgattga-gtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9174326 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 9174227  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9174226 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 9174145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 36378345 - 36378627
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| ||    
T  36378345 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 36378444  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  36378445 acactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttg 36378544  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  36378545 tgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 36378627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14787711 - 14787428
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  14787711 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 14787612  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  14787611 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 14787512  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctg--ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14787511 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 14787428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3824842 - 3824627
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824842 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3824743  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3824742 aggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 3824643  T
Q  224 ctcatcatatagtgga 239  Q
    ||||||||||||||||    
T  3824642 ctcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 19095935 - 19096217
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  19095935 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtga 19096034  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19096035 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctctttt 19096134  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  19096135 gtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 19096217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37313346 - 37313084
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||| |||    
T  37313346 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaa 37313247  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  37313246 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 37313147  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37313146 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttg 37313084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 16453362 - 16453634
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16453362 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 16453461  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16453462 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 16453561  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactg 287  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16453562 taaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 16453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Original strand, 56030497 - 56030770
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  56030497 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 56030596  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg--atttctcttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||    
T  56030597 acactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-ttt 56030695  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtca 292  Q
    ||||||||| ||||||||   || | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  56030696 gtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47211020 - 47210756
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |            |||||||    
T  47211020 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaa 47210933  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47210932 acactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47210833  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtca 292  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  47210832 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 619727 - 619447
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  619727 gaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaa 619628  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  619627 acactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttg 619528  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  619527 taacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 619447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 53405183 - 53405467
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  53405183 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaaa-ctaggttttgagggttgattcaccttgagaa 53405281  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga------cttattcttgtaacccattgatttct 210  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  53405282 acactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttct 53405381  T
Q  211 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  53405382 cttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctgctc--tcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 53405467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 13544012 - 13544272
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  13544012 gaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcaccttggga 13544110  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13544111 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 13544210  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaattt 276  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||   ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13544211 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380684
Alignment:
Q  40 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatctt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  140 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtg 237  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  238 gatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaa 36380684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 19322750 - 19323003
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  19322750 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaa 19322845  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  19322846 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttg 19322945  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  19322946 taaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtca 19323003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18409627 - 18409346
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   |||||||||||||| ||||| || |    
T  18409627 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcggga 18409528  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-g 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18409527 acactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 18409428  T
Q  216 taacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| | | ||  | |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  18409427 taa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaa 18409346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 16455369 - 16455576
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455369 tttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 16455468  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16455469 ttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 16455568  T
Q  290 tcaacaaa 297  Q
    ||||||||    
T  16455569 tcaacaaa 16455576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 41997545 - 41997826
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  41997545 gaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 41997644  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||  || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||| ||||    
T  41997645 acactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttg 41997744  T
Q  216 taacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||    
T  41997745 taaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccagactaggttaatttggaccgaactggataaacaaa 41997826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437696
Alignment:
Q  158 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttc 257  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  258 ccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 297
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215640
Alignment:
Q  141 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 239  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  240 tcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4215640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635475
Alignment:
Q  159 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttc 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  258 ccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5635475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891626
Alignment:
Q  106 caccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  206 tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaa 2891626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52942726 - 52942542
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  52942726 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 52942627  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942626 acactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18537724 - 18537498
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||   || |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18537724 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtca 18537628  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  18537627 cgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 18537528  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18537527 gagggctgctctctcccccataataggtca 18537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3937489 - 3937314
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3937489 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3937390  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattct 192  Q
    ||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3937389 acactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 6132927 - 6133086
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6132927 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaac 6133026  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 178  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6133027 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 6133086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547468
Alignment:
Q  112 gggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  212 -tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 13547468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8756528 - 8756276
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  ||||||||||||||||||||    
T  8756528 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaa 8756433  T
Q  118 cactattatgattgagtatctt-ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  8756432 cactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 8756333  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtc 271  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  8756332 taaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534858
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtca 18534986  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    || ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||| | ||||||||| ||    
T  18534985 cgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacg 18534886  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggt 270  Q
    || || ||||||  ||||||||||||||    
T  18534885 gaggggtgctctcccccccagactaggt 18534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499376
Alignment:
Q  47 actagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  147 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggat 245  Q
      |||||  || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| || | || |     
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaag 27499325  T
Q  246 ggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  27499326 ggctgctcttt-ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 27499376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890223
Alignment:
Q  44 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||   || |  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  144 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 241  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  242 ggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     || ||||||||| ||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 38890223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102397
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtca 12102397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 38270266 - 38270158
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  38270266 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 38270167  T
Q  117 acactatta 125  Q
    |||||||||    
T  38270166 acactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15032816 - 15032572
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||          ||||| ||||||||  || ||||    
T  15032816 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaa 15032730  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15032729 acactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15032630  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| || |  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15032629 taaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtca 15032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 30136682 - 30136864
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  30136682 gggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtg 30136781  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    || ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  30136782 actcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatttg 30136864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185833
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 16185833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28453990
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  200 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggt 270  Q
      ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   || |||| |||||||||||||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggt 28453990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 297
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101262
Alignment:
Q  165 gggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccag 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||  | |||| ||||||| | | ||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccag 5101228  T
Q  264 actaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5101262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Original strand, 9863765 - 9864008
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||  || |  | |||||||||||||||||    
T  9863765 aaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaa 9863858  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  9863859 accctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttg 9863958  T
Q  216 taacgttactcatca----tatagtggatcggatggctgctctttccccc 261  Q
    ||| |||||||||||    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  9863959 taaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 9864008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24446859 - 24446756
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  24446859 gaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 24446765  T
Q  117 acactatta 125  Q
    |||||||||    
T  24446764 acactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  198 cccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    ||| ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982200
Alignment:
Q  103 attcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattcttgtaacc 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  200 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357951
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggta----gaattaggcagga-gacttattcttg 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  195 taacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtca 25357951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113177
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||   || |||  |||||||||||| |||||    
T  10112927 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaa 10113020  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttac-gggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcaggagacttattcttgtaacc-cattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| |||||||    
T  10113021 cactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctcttt 10113120  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggt 270  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  10113121 gtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggt 10113177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 2891370 - 2891434
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 81  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2891370 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 5101050 - 5101117
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5101050 gaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaac 5101117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgg-gaa 116  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| |||   || |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaaccc--attgatttctctt 213  Q
    ||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||||   |||||| ||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccccca 262  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||||    
T  9022556 tgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150915
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat 274  Q
    || ||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||| | || | | ||||| |||||||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaat 47150915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40999226 - 40999017
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||   || |||  ||||||||||| || |||    
T  40999226 aaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaa 40999131  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  40999130 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttg 40999031  T
Q  216 taacgttactcatc 229  Q
    ||| ||||||||||    
T  40999030 taaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7050343 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529424
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 8529365  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  8529366 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 8529424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587123
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||  ||||||| || ||   || |||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttgt 18587064  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18587065 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 18587123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 31300522  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31300523 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563095
Alignment:
Q  212 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 47563095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771457
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831298
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttgt 15831239  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15831240 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  184 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 36769479 - 36769636
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  36769479 aaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 36769574  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  36769575 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072102
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133171
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaa 6133171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14789473 - 14789427
Alignment:
Q  251 ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14789473 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14789427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557894
Alignment:
Q  202 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtca 26557894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 163
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884922
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactt 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578699
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactagg 269  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactagg 3578699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 297
Target Start/End: Original strand, 49088865 - 49088905
Alignment:
Q  257 cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  49088865 cccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaa 49088905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942487
Alignment:
Q  257 cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 52942487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 103)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 28840679 - 28840959
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  28840679 gaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 28840778  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840779 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 28840878  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28840879 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28840959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 51750038 - 51750319
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  51750038 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 51750137  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51750138 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 51750237  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51750238 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 51750319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10400110 - 10399829
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  10400110 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10400011  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10400010 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 10399911  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10399910 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10399829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 2617515 - 2617792
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2617515 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 2617614  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2617615 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 2617714  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  2617715 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 2617792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15295116 - 15294835
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15295116 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 15295017  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295016 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttg 15294917  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15294916 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15294835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31735802 - 31735522
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  31735802 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31735703  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31735702 cactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgt 31735603  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31735602 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 31735522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46431989 - 46431707
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  46431989 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 46431890  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431889 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 46431790  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctcttt--cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46431789 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 46431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 47906269 - 47906550
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  47906269 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaa 47906368  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47906369 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47906468  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47906469 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 47906550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 13761836 - 13762116
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  13761836 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaa 13761935  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761936 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 13762035  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13762036 aacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 13762116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 20291456 - 20291736
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20291456 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaa 20291555  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291556 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 20291655  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20291656 aacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20291736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 20302458 - 20302738
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20302458 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20302557  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302558 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 20302657  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20302658 aacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 20302738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27337220 - 27336941
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27337220 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27337122  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337121 acactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27337022  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27337021 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27336941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 28842494 - 28842774
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  28842494 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaa 28842593  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842594 acactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 28842693  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28842694 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaa 28842774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15823545 - 15823826
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  15823545 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 15823644  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15823645 acactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattg 15823744  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15823745 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 15823826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17324917 - 17324637
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324917 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 17324818  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  17324817 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 17324718  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17324717 aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17324637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27339412 - 27339132
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27339412 gaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27339313  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339312 atactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27339213  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27339212 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 27339132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 51752364 - 51752643
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  51752364 gaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaa 51752463  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752464 acactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 51752562  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51752563 aacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 51752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 39932072 - 39932354
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932072 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaa 39932171  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39932172 acactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttg 39932271  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  39932272 taacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 39932354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2510606 - 2510326
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2510606 gaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaa 2510507  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2510506 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca-gagacttattcttgtaacccattgatttctctcttg 2510408  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2510407 taaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 2510326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24325663 - 24325943
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||| ||||    
T  24325663 gaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaa 24325761  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24325762 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 24325861  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24325862 taatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 24325943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 16226167 - 16226447
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16226167 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 16226266  T
Q  118 cactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226267 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 16226366  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16226367 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 16226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6823014 - 6823294
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  6823014 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaaa-ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6823112  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6823113 atactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 6823212  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6823213 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6823294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 13215080 - 13215366
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13215080 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13215179  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga----tttctc- 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||     
T  13215180 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctct 13215279  T
Q  212 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13215280 tttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaa 13215366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9463526 - 9463245
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  9463526 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9463427  T
Q  117 acactattatgattga-gtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9463426 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttg 9463327  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  9463326 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9463245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12302787 - 12302506
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  12302787 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12302688  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||    
T  12302687 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttg 12302588  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12302587 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 12302506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50307829 - 50307547
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  50307829 gaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 50307730  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
T  50307729 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 50307630  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50307629 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 50307547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9459699 - 9459418
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  9459699 gaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9459600  T
Q  117 acactattatgattga-gtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9459599 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttg 9459500  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  9459499 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9459418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21948469 - 21948226
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  21948469 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aa 21948371  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21948370 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 21948271  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21948270 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 16428652 - 16428934
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  16428652 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaa 16428751  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16428752 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 16428851  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16428852 taaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 16428934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 47179712 - 47179992
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  47179712 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 47179811  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179812 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 47179911  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  47179912 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 47179992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4131661 - 4131376
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  4131661 gaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaa 4131562  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga----tttctc- 211  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    ||||||     
T  4131561 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctct 4131463  T
Q  212 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  4131462 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaa 4131376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 39462518 - 39462799
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39462518 gaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaa 39462617  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  39462618 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttg 39462717  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     || |||| ||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39462718 aaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 39462799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 41646919 - 41647200
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||| | |||||||||||||||||||    
T  41646919 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaa 41647018  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41647019 acactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 41647118  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41647119 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41647200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 47177361 - 47177641
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  47177361 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 47177460  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177461 acactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 47177560  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  47177561 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaa 47177641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18839586 - 18839868
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  18839586 gaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaa 18839685  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18839686 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 18839785  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18839786 taaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 18839868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50076954 - 50076673
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  50076954 gaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 50076855  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  50076854 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 50076755  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50076754 taaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-ccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 50076673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6995982 - 6995701
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  6995982 gaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaa 6995883  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||  |||| |||     
T  6995882 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctctttta 6995783  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6995782 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 6995701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11457757 - 11457476
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||   |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11457757 gaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 11457658  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11457657 acactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 11457558  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11457557 taaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 11457476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 48665176 - 48665400
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  48665176 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 48665275  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggtta-cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48665276 acactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 48665375  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtgga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48665376 gtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38925760 - 38925482
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  38925760 gaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 38925661  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38925660 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 38925561  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  38925560 taacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 38925482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14098252 - 14097970
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  14098252 gaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaa 14098153  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14098152 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 14098053  T
Q  216 t-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14098052 taaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14097970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18307108 - 18307389
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  18307108 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 18307207  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  18307208 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttg 18307307  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||    
T  18307308 taaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaa 18307389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50079103 - 50078841
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  50079103 gaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 50079004  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  50079003 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 50078904  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50078903 taaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 50078841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2949513 - 2949233
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||||||||||||||||    
T  2949513 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaa 2949414  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  2949413 acactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 2949314  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2949313 taacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 2949233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28998535 - 28998254
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28998535 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 28998436  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  28998435 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 28998336  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||||||||||| ||| | | || || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28998335 caacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28998254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29004251 - 29003970
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29004251 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 29004152  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  29004151 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 29004052  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||||||||||| ||| | | || || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29004051 caacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 29003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9241360 - 9241094
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9241360 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattatt 9241261  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  9241260 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagtta 9241161  T
Q  224 ctcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  9241160 ctcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggg 9241094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3579898 - 3579618
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  3579898 gaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 3579799  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3579798 acacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3579699  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3579698 taaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3579618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17186410 - 17186128
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17186410 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 17186311  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  17186310 acactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 17186211  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  17186210 taaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaa 17186128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25127871 - 25128153
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  25127871 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaa 25127970  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  25127971 acactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttg 25128070  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  25128071 taaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaa 25128153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6756526 - 6756808
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6756526 gaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 6756625  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  6756626 aacactattaggattgagt--cttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctttt 6756723  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  6756724 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaa 6756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31425301 - 31425016
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |    
T  31425301 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 31425202  T
Q  116 aacactattatgattgagta---tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 211  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||     
T  31425201 aacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctct 31425102  T
Q  212 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31425101 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 31425016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 31489914 - 31490192
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  31489914 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaa 31490011  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31490012 acactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 31490111  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  31490112 taaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctc-tccccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaa 31490192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Original strand, 40133943 - 40134205
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40133943 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40134042  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40134043 atactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 40134142  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40134143 taaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttg 40134205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757810
Alignment:
Q  110 ttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  210 tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 51757810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25251557 - 25251275
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  25251557 gaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 25251458  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  25251457 acactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttg 25251358  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| | | || || |||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25251357 taaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25251275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28207348 - 28207069
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||||||||    
T  28207348 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaa 28207249  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||  |||| |||||  || ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  28207248 acactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 28207149  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28207148 taacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28207069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786119
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 23786119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Original strand, 47451648 - 47451919
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || |        
T  47451648 aaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt- 47451746  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gt 216  Q
         ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  47451747 -----ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 47451841  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47451842 aacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50248854 - 50248571
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  50248854 gaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 50248755  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  50248754 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttg 50248655  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctg--ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  50248654 taaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaa 50248571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 16231637 - 16231842
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16231637 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggagacttatt 16231736  T
Q  191 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||    
T  16231737 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact-ggt 16231835  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  16231836 caacaaa 16231842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 17324065 - 17324344
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324065 aaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 17324162  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17324163 cactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 17324262  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || |||| |||||| ||||||| | |||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17324263 aaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 17324344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 17318892 - 17319167
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   || || |||||||||||||||||||    
T  17318892 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaa 17318991  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||       |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  17318992 acag------gattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttg 17319085  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | | ||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17319086 ttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 17319167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 6823884 - 6824088
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  6823884 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6823983  T
Q  117 acactattatgattgagtatctt-------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc 209  Q
    ||||||||| |||||| | ||||       ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823984 acactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttc 6824083  T
Q  210 tcttt 214  Q
    |||||    
T  6824084 tcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8347551 - 8347298
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||  ||  |||||||||||||||| ||||    
T  8347551 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaa 8347456  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8347455 acactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 8347356  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  8347355 taaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31423156 - 31422940
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaac-aaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||| |||   |||||  |||||||||||||||||    
T  31423156 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttggga 31423057  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  31423056 aacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctctttt 31422957  T
Q  215 gtaacgttactcatcat 231  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31422956 gtaaggttactcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14183868 - 14183591
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||   || |  |||||||||||||||| ||    
T  14183868 gaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaa 14183775  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14183774 acactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttg 14183675  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  14183674 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 14183591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669393
Alignment:
Q  42 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttgg 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||   || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  142 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  240 tcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttga-actgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaa 15669393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 297
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429238
Alignment:
Q  103 attcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  203 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 16429238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Original strand, 16432402 - 16432676
Alignment:
Q  15 cagaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggg 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||  |||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  16432402 cagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 16432490  T
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 213  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16432491 aaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttt 16432590  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccccc-agactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16432591 tgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 16432676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816166
Alignment:
Q  159 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttc 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  258 ccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 23816166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25248759 - 25248552
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25248759 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattc 25248660  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  25248659 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggg 25248560  T
Q  290 tcaacaaa 297  Q
    ||||||||    
T  25248559 tcaacaaa 25248552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42922233 - 42922512
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||   || |||| ||||||||||||| |||    
T  42922233 gaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaa 42922328  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42922329 aaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 42922428  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| | |||| |||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||    
T  42922429 taaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaa 42922512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115103
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    || |||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  6115104 aa 6115103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8349330 - 8349110
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  |||| ||||||||||||||    
T  8349330 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaa 8349235  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  8349234 acactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttg 8349135  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    | | ||||||||||| |||||||||    
T  8349134 ttaagttactcatcattatagtgga 8349110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat 274  Q
    |  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18800851 - 18800600
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||   || |  |||||||||||| || |||    
T  18800851 gaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaa 18800756  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18800755 acactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttg 18800656  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggt 270  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||| ||||||| |||||||    
T  18800655 taaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26520397 - 26520206
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  26520397 aaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaa 26520302  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttg------gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||      || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520301 cactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495232
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaattt 276  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | || | ||||  ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaattt 49495232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916752
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||   || ||   |||||||||||||| |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacc--cattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| |||||  | ||||| |||||||    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt 27916693  T
Q  215 gtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27916694 gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 27916752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13125738 - 13125511
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  13125738 gaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattggga 13125643  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 213  Q
    ||| || ||| |||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  13125642 aacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttt 13125543  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcgga 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13125542 tgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 13125511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatat 233  Q
    || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353373
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 21353430  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 21353373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790427
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtca 30790427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358853
Alignment:
Q  222 tactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13358853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561681
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||| || ||  || |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  196 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 231  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613265
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || ||||| |||| |||| || |||||| |||| ||||||||| | ||  ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtca 26613265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 297
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916672
Alignment:
Q  190 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaa-tttgaactgaact 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  287 gggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||    
T  15916662 gggtaaacaaa 15916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232747
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2232692  T
Q  214 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||||    | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2232693 tgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2232747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 28279346 - 28279489
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  28279346 ttgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 28279445  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    | |||||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28279446 ctcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 28279489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25248796 - 25248756
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 57  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25248796 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 239
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353187
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  198 cccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    ||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14353146 ccctttgaaatct-tttgtaaagttattcatcattatagtgga 14353187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  233 tagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 296
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 20626047 - 20626328
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20626047 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20626146  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20626147 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20626246  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20626247 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20626328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 20629938 - 20630219
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20629938 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20630037  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20630038 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20630137  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20630138 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20630219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 20642357 - 20642638
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20642357 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20642456  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20642457 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20642556  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20642557 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20642638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 38393995 - 38394276
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38393995 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38394094  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38394095 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 38394194  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38394195 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38394276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40837022 - 40836742
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  40837022 gaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 40836923  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836922 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 40836823  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40836822 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Original strand, 20299475 - 20299750
Alignment:
Q  24 gggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaa-ttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299475 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 20299574  T
Q  123 ttatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgt 221  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20299575 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 20299674  T
Q  222 tactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20299675 tactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20299750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 44724588 - 44724869
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  44724588 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 44724687  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44724688 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 44724787  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44724788 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44724869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 48457662 - 48457943
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||| |||||    
T  48457662 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaa 48457761  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48457762 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 48457861  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48457862 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 48457943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1049575 - 1049295
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  1049575 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 1049476  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049475 acactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 1049376  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1049375 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1049295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7472260 - 7471979
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  7472260 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7472161  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7472160 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 7472061  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7472060 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7471979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1047204 - 1046924
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  1047204 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 1047105  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047104 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 1047005  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1047004 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1046924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 1849990 - 1850271
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  1849990 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 1850089  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1850090 acactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 1850189  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1850190 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1850271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7470302 - 7470021
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  7470302 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaa 7470203  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7470202 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 7470103  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7470102 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7470021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 35638 - 35919
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35638 gaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 35737  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35738 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 35837  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  35838 taacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 35919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 44573 - 44854
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44573 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaa 44672  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44673 acactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 44772  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44773 taacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3878586 - 3878867
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||||||| ||    
T  3878586 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaa 3878685  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3878686 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 3878785  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||    
T  3878786 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3878867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18345550 - 18345831
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18345550 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18345649  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18345650 acactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18345749  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  18345750 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaa 18345831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31435327 - 31435045
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31435327 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaa 31435228  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31435227 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 31435128  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31435127 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaa 31435045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 20297371 - 20297648
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20297371 gaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20297470  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20297471 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20297570  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20297571 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20297648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 40946337 - 40946618
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||||| || |||| ||    
T  40946337 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaa 40946436  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40946437 acactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttg 40946536  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40946537 taacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40946618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13099756 - 13099473
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13099756 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 13099657  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--ttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  13099656 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttt 13099557  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13099556 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13099473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3035730 - 3036014
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  3035730 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3035829  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgg---gaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3035830 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3035929  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3035930 ttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27306509 - 27306229
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27306509 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27306411  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  27306410 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttg 27306311  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  27306310 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 27306229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31156191 - 31155910
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  31156191 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaa 31156092  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156091 acactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31155992  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  31155991 taacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 31155910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7351932 - 7351651
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  7351932 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7351833  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351832 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 7351733  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  7351732 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 7351651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43253796 - 43253520
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43253796 gaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttt-gagggttgattcaccttgggaa 43253698  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43253697 acactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 43253598  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  43253597 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 43253520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 11757245 - 11757465
Alignment:
Q  24 gggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaa-ttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757245 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 11757344  T
Q  123 ttatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgt 221  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11757345 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 11757444  T
Q  222 tactcatcatatagtggatcg 242  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11757445 tactcatcatatagtggatcg 11757465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25542539 - 25542818
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  25542539 gaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aa 25542637  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542638 agactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 25542737  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  25542738 aacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25542818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20137389 - 20137108
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20137389 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20137290  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20137289 acactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 20137190  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20137189 taaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20137108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 443605 - 443886
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  443605 aaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 443704  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  443705 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttat 443804  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  443805 aacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 443886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 37412408 - 37412128
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37412408 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 37412309  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tt 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  37412308 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 37412209  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  37412208 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaa 37412128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7349553 - 7349297
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  7349553 gaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7349454  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349453 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 7349354  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7349353 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 7349297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4296215 - 4295933
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  4296215 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttggga 4296116  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
T  4296115 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 4296016  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  4296015 gtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaa 4295933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24748603 - 24748885
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  24748603 gaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 24748702  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24748703 acactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24748802  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24748803 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 24748885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 11355267 - 11355548
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11355267 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 11355366  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  11355367 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttg 11355466  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11355467 taacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11355548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42331279 - 42330996
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  42331279 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 42331180  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggtt--acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  42331179 acactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 42331080  T
Q  214 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42331079 tgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42330996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 21990159 - 21990440
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  21990159 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 21990258  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  21990259 acactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttg 21990358  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21990359 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 21990440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 28487562 - 28487843
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||   || | ||||||||||||||| ||||    
T  28487562 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaa 28487661  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28487662 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 28487761  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28487762 taacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 28487843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39146267 - 39145985
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| ||    
T  39146267 gaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 39146168  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39146167 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 39146068  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39146067 taaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaa 39145985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 21680036 - 21680307
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  21680036 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 21680135  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21680136 acactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttg 21680235  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21680236 taaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42223166 - 42223448
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |    
T  42223166 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 42223265  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| |||| |||    
T  42223266 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctctttt 42223365  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  42223366 gtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaa 42223448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21592423 - 21592142
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  21592423 gaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaa 21592324  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  21592323 gcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttg 21592224  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21592223 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 21592142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 28485575 - 28485855
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||| ||||    
T  28485575 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaa 28485674  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28485675 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttg 28485774  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| || || |||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28485775 taacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28485855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27832913 - 27832646
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27832913 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27832814  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctt-tg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27832813 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctg 27832714  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactg 282  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27832713 taaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttgaactg 27832646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Original strand, 9680828 - 9681090
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  9680828 gaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggga 9680927  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  9680928 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatctttt 9681027  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9681028 gtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 9681090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Original strand, 38396718 - 38396924
Alignment:
Q  91 ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38396718 ttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 38396817  T
Q  191 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38396818 tttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggt 38396917  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  38396918 caacaaa 38396924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 21678075 - 21678356
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21678075 gaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 21678174  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  21678175 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttg 21678274  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||| ||||||||||| | | |  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  21678275 taaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaa 21678356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 9679068 - 9679349
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  9679068 gaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggttt-gaggattgattcaccttggga 9679166  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  9679167 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 9679266  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||   ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  9679267 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaa 9679349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7094665 - 7094463
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7094665 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 7094566  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7094565 ttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggt 7094466  T
Q  291 caa 293  Q
    |||    
T  7094465 caa 7094463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7092417 - 7092212
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092417 tttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 7092318  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7092317 ttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 7092219  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  7092218 caacaaa 7092212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 25276160 - 25276374
Alignment:
Q  27 tttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattat 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25276160 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattag 25276259  T
Q  127 gattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttact 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  25276260 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttact 25276359  T
Q  226 catca-tatagtgga 239  Q
    ||||| |||||||||    
T  25276360 catcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Original strand, 24258472 - 24258737
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  24258472 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaa 24258571  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24258572 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24258671  T
Q  216 taacgttactcatca----tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    ||| |||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  24258672 taaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttg 24258737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 26804578 - 26804765
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaat---tttgagggttgattcaccttgg 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||    
T  26804578 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgg 26804677  T
Q  114 gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 201  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804678 gaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935558
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 2935558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813496
Alignment:
Q  37 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||   ||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  137 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tata 234  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  235 gtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaa 24813496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606669
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaa 1606669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137367
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22137367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552394
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 40552394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027193
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9027193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108356
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22108356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550116
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 40550116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24817629 - 24817377
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||   ||   ||||||||||||||||| ||    
T  24817629 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaa 24817535  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
     || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24817534 gcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttg 24817435  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24817434 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtca 24817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22828913 - 22828716
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||| ||||||||||  || | ||    
T  22828913 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaa 22828814  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828813 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091580
Alignment:
Q  42 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttgg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | | |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaa-gattagggttg-gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttgg 20091701  T
Q  142 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 240  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  20091700 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaa 20091603  T
Q  241 cggatggctgctctttcccccag 263  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  20091602 cggagggctgctctctcccccag 20091580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22251822 - 22251602
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||     
T  22251822 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga- 22251724  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga----tttctc- 211  Q
           || |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||     
T  22251723 -------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctct 22251631  T
Q  212 tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 239  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251630 tttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 7188552 - 7188831
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||   || |  |||||||||||||||| ||    
T  7188552 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaa 7188647  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | || ||||    
T  7188648 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttg 7188747  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||| ||||  |||| |||||||| ||| ||||||    
T  7188748 taaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaa 7188831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 18567622 - 18567730
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18567622 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18567721  T
Q  117 acactatta 125  Q
    |||||||||    
T  18567722 acactatta 18567730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465827
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||   ||  |   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtca 24465673  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| | || ||||||| | ||||||||| |||| || | ||    
T  24465674 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacg 24465772  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  24465773 ggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaa 24465827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295738
Alignment:
Q  159 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctcttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||| |    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  257 cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaa 26295738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394013
Alignment:
Q  162 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || || ||| ||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  260 ccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaa 22394013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081801
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| |||   || |||  ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt- 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  214 tgtaacgttactcatc-atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||  || | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaa 11081801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332512
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattcttgtaac 198  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    || || || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  6332511 aa 6332512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351508
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121056
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttggg--aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 195  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  196 aacccattgatttctctttgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||   || ||||||||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2120980 aactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 272
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046759
Alignment:
Q  156 tgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |  |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  254 tttcccccagactaggtca 272  Q
    | |||||||||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405549
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357202
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtca 25357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049134
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgg-gaa 116  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| |||  ||| |  | |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactaggtttgg--gattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||   || |||||||| ||||||||||   || ||| ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  216 taacgttactcatc---atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactag 268  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||| ||||  | ||||||| |||||| |||||    
T  6049079 taaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactag 6049134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 176  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410287
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  138 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 231  Q
    ||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069936
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7074882  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392606
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||   ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 22392597  T
Q  145 cgggaagag 153  Q
    |||||||||    
T  22392598 cgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378529
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 8378591  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  8378590 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtca 8378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 38396325 - 38396377
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 69  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396325 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  103 attcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaaccca 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  202 ttgattt 208  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 297
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759417
Alignment:
Q  249 tgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11759417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgg 166  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7094702 - 7094662
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7094702 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  233 tagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  233 tagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7092455 - 7092414
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaa-actagggtttg 57  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7092455 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Original strand, 8153470 - 8153510
Alignment:
Q  256 tcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8153470 tcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11983309 - 11983028
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11983309 gaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 11983210  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11983209 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11983110  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11983109 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11983028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1230529 - 1230248
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1230529 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 1230430  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1230429 acactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 1230330  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1230329 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1230248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14507454 - 14507175
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  14507454 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 14507355  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507354 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 14507255  T
Q  218 acgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14507254 acgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14507175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14459045 - 14458766
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||  ||||||||    
T  14459045 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaa 14458948  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14458947 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14458848  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14458847 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14458766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4816511 - 4816230
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  4816511 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 4816412  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4816411 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4816312  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4816311 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4816230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28241601 - 28241320
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  28241601 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 28241502  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28241501 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 28241402  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  28241401 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28241320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2629165 - 2628885
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  2629165 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaa 2629066  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag-acttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629065 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttg 2628967  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  2628966 taacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 2628885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 26065020 - 26065296
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   || |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26065020 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 26065116  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26065117 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgt 26065216  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26065217 aacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26065296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 26084989 - 26085265
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   || |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  26084989 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 26085085  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26085086 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgt 26085185  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26085186 aacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26085265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19704849 - 19704566
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19704849 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 19704750  T
Q  117 acactattatgatt-gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatt--tctctt 213  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19704749 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctt 19704650  T
Q  214 tgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19704649 tgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19704566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20915636 - 20915355
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  20915636 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 20915537  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915536 acactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 20915437  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20915436 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 20915355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 30967235 - 30967516
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  30967235 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 30967334  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30967335 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 30967434  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30967435 taacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30034882 - 30034602
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  30034882 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30034783  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30034782 cactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30034683  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30034682 aacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30034602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 9019961 - 9020241
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9019961 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 9020060  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9020061 cactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 9020160  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9020161 aaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 9020241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 13057228 - 13057510
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13057228 gaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13057327  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13057328 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 13057427  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13057428 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaa 13057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12195795 - 12195515
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  12195795 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 12195696  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195695 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 12195596  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  12195595 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3632218 - 3631938
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||||||| ||||||||    
T  3632218 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaa 3632119  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3632118 acactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3632019  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3632018 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3631938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3390413 - 3390695
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3390413 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3390512  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3390513 acactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3390612  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  3390613 taaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaa 3390695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 13039788 - 13040070
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  13039788 gaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 13039887  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13039888 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 13039987  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13039988 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 13040070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26932842 - 26932561
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  26932842 gaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 26932743  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932742 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 26932643  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  26932642 taacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 26932561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 32280030 - 32280308
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  32280030 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaa 32280129  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32280130 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32280229  T
Q  216 taacgttactcatc-atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||| ||||||||||  ||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  32280230 taaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaa 32280308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15530398 - 15530166
Alignment:
Q  21 caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacac 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530398 caagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 15530299  T
Q  121 tattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 219  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15530298 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaac 15530200  T
Q  220 gttactcatcatatagtggatcggatggctgctc 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15530199 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15541420 - 15541139
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15541420 gaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 15541321  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15541320 acactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttg 15541221  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||| ||||||||||||| | | ||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15541220 taaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaa 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30729108 - 30728823
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  30729108 gaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaa 30729009  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga----tttctc- 211  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||     
T  30729008 acactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctct 30728909  T
Q  212 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  30728908 tttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 30728823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25477308 - 25477597
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25477308 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 25477407  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25477408 acactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 25477507  T
Q  216 taa-------cgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||       |||||||||||| ||||||| | | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25477508 taacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaa 25477597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3630136 - 3629864
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630136 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3630037  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3630036 aggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3629937  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || || |||||||| | | || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3629936 ctaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3629864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15532961 - 15532681
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  15532961 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaa 15532862  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15532861 acactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15532762  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15532761 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaa 15532681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5273421 - 5273215
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5273421 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 5273322  T
Q  191 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5273321 cttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5273222  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  5273221 caacaaa 5273215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3234011 - 3233724
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  3234011 gaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 3233912  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||    
T  3233911 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 3233812  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaattt-----gaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  3233811 gtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaa 3233724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066123
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26066123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19227687 - 19227514
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  19227687 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19227588  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19227587 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309171
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 33309171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24338728 - 24338447
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaat-tttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||| |||    |||||||||||||| ||||||| |    
T  24338728 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaa 24338629  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24338628 aacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 24338529  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  24338528 gtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc--tcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaa 24338447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068394
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 26068394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754708
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 29754708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311440
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 33311440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3028128 - 3027876
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  ||||||||||||||||||||    
T  3028128 aaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaa 3028034  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3028033 cactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgt 3027934  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctcttt-cccccagactaggtca 272  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3027933 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12161835 - 12161557
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||||||||||| ||||| |||||||    
T  12161835 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaa 12161738  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12161737 acactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 12161638  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| | ||| | ||||||| |||||| || ||||||  ||||||||    
T  12161637 taaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaa 12161557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069717
Alignment:
Q  103 attcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  203 tgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaa 1069717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 297
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466639
Alignment:
Q  60 tagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaa-ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgg 158  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  159 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctcttt 256  Q
    || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| |||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  257 cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaa 14466639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719959
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||   ||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 15719903  T
Q  243 gatggctgctcttt-cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  | |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  15719904 gagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaa 15719959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 22490673 - 22490889
Alignment:
Q  17 gaaacaagggttta-gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||   |||||||    || ||||||| ||    
T  22490673 gaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcga 22490772  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22490773 aacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 22490872  T
Q  215 gtaacgttactcatcat 231  Q
    ||||  |||||||||||    
T  22490873 gtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186070
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  12186071 aa 12186070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455449
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||   ||    ||||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtca 16455449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Original strand, 15367145 - 15367347
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  |||||||||  ||  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  15367145 gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgta 15367244  T
Q  197 acccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttc-ccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    ||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  15367245 acccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 15367344  T
Q  295 aaa 297  Q
    |||    
T  15367345 aaa 15367347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857977
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  199 cc-attgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22858052 ccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtca 22857977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32447596 - 32447502
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgcta-aattttgagggttgattcacct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  32447596 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346662
Alignment:
Q  158 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctcttt 256  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  |||||||| |    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  257 cccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 15346662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945393
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 231  Q
    || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012287
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||   || |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtca 17012201  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 229  Q
    || ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17012202 cgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696757
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || || | |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaaca 295  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  296 aa 297  Q
    ||    
T  19696756 aa 19696757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 8995514 - 8995578
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 82  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995514 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1072157 - 1072090
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072157 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 1072090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 13870702 - 13870608
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcacctt 111  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||||    
T  13870702 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 17852576 - 17852643
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17852576 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaac 17852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878883
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786075
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527078
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct 254  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctct 20527078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctctt 13883570  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13883571 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  198 cccattgatttctctttgtaacgttactca 227  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12911555 - 12911471
Alignment:
Q  188 attcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtc 271  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12911555 attcttgtaaccatttaatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465589
Alignment:
Q  180 ggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttg 277  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || |||| |||| |||| | |||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtattg 25465609  T
Q  278 aactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     || ||||||||| ||||||    
T  25465608 gaccgaactgggtaaacaaa 25465589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887252
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 26887311  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  26887310 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctc--tcccccagactaggtca 26887252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037750
Alignment:
Q  101 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga-cttattcttgtaacc 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| | |||| || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  200 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    || | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtca 28037750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584311
Alignment:
Q  214 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaa 10584311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Original strand, 10584155 - 10584213
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttg 75  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10584155 gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||| ||  ||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtc 271  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 288
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445832
Alignment:
Q  159 gactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctt 255  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||     
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  256 tcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgg 288  Q
    ||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  122 attatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 175  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  121 tattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215984
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 33215925  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  33215926 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtca 33215984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || ||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaattt 276  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||   | | ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 143)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25533421 - 25533702
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533421 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 25533520  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25533521 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 25533620  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25533621 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 25533702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4104173 - 4103893
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  4104173 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 4104074  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104073 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 4103974  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4103973 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4103893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4308559 - 4308278
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4308559 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 4308460  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4308459 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4308360  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4308359 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4308278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18099448 - 18099167
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18099448 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18099349  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18099348 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18099249  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  18099248 taacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaa 18099167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42990283 - 42990564
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990283 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaa 42990382  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42990383 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 42990482  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42990483 taacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42990564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 43228270 - 43228551
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  43228270 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43228369  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43228370 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 43228469  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43228470 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 43228551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10956305 - 10956024
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  10956305 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10956206  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10956205 acattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 10956106  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10956105 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10956024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3859507 - 3859787
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  3859507 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3859606  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3859607 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgt 3859706  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3859707 aacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3859787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10958601 - 10958320
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  10958601 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10958502  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10958501 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 10958402  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10958401 taacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10958320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 11170383 - 11170664
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| || |||||||||||||||||    
T  11170383 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaa 11170482  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11170483 acactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11170582  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  11170583 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaa 11170664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 5191632 - 5191911
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  5191632 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 5191731  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191732 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgt 5191831  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5191832 aacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5191911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18097177 - 18096900
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18097177 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18097078  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  18097077 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgt 18096978  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  18096977 aacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaac 18096900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 38890019 - 38890300
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38890019 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38890118  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38890119 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 38890218  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38890219 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 38890300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 43226065 - 43226345
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  43226065 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43226163  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43226164 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 43226263  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43226264 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43226345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51727284 - 51727004
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  51727284 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaa 51727186  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51727185 acactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 51727086  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51727085 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 51727004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10084665 - 10084386
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10084665 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10084566  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 217  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10084565 actattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgta 10084466  T
Q  218 acgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10084465 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 45882918 - 45883200
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45882918 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaa 45883017  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  45883018 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 45883117  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccccc-agactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45883118 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 45883200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25388885 - 25389165
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  25388885 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aa 25388983  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388984 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttg 25389083  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25389084 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 25389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27101459 - 27101178
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27101459 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 27101360  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27101359 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 27101260  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27101259 caacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 27101178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 30005820 - 30006101
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  30005820 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 30005919  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30005920 acactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 30006019  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30006020 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30006101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321739
Alignment:
Q  42 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttgg 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  142 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  241 cggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1321739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 746736 - 747017
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  746736 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 746835  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746836 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 746935  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  746936 taacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 747017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 1313396 - 1313669
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313396 ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 1313495  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1313496 aggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgtta 1313595  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1313596 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 1313669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 458263 - 458544
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  458263 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 458362  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458363 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 458462  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  458463 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaa 458544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6066074 - 6065793
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  6066074 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6065975  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065974 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 6065875  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  6065874 taacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaa 6065793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9604877 - 9604604
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604877 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9604778  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9604777 aggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 9604678  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  9604677 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaa 9604604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53917942 - 53917661
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  53917942 gaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 53917843  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53917842 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 53917743  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  53917742 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 53917661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 455886 - 456167
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  455886 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 455985  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455986 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 456085  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||    
T  456086 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaa 456167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 60 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606585
Alignment:
Q  60 tagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctggg 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  160 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctccc 7606623  T
Q  260 ccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7606622 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 7606585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10621808 - 10621527
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  10621808 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 10621709  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621708 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 10621609  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||    
T  10621608 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaa 10621527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22114583 - 22114302
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22114583 gaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 22114484  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114483 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 22114384  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || || ||| ||||||| || | || |||||| || ||||||||||||||||    
T  22114383 taacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22114302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6063724 - 6063443
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  6063724 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6063625  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063624 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 6063525  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  6063524 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaa 6063443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28102280 - 28101999
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28102280 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 28102181  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28102180 acgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28102081  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  28102080 taaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaa 28101999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43421693 - 43421412
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  43421693 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 43421594  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43421593 acactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 43421494  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43421493 taacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43421412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43423741 - 43423460
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  43423741 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 43423642  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43423641 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 43423542  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43423541 taacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43423460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 50493978 - 50494259
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  50493978 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 50494077  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494078 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 50494177  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  50494178 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 50494259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53915774 - 53915493
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |||||| |||    
T  53915774 gaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaa 53915675  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53915674 acattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 53915575  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  53915574 taatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaa 53915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10191585 - 10191307
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10191585 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10191486  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 217  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  10191485 actattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgta 10191387  T
Q  218 acgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10191386 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 10191307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5522893 - 5522624
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||| ||    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5522893 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaa 5522805  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522804 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 5522705  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5522704 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5522624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 26720527 - 26720807
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||      
T  26720527 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtt 26720626  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  26720627 a-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttg 26720725  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  26720726 taacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaa 26720807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18162642 - 18162923
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  18162642 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 18162741  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  18162742 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttg 18162841  T
Q  216 t-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  18162842 taaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac-gaactgtgtcaacaaa 18162923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28413291 - 28413029
Alignment:
Q  36 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattga-gt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28413291 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagt 28413192  T
Q  135 atcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 234  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28413191 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 28413092  T
Q  235 gtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||| | ||||||||||    
T  28413091 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaa 28413029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32264316 - 32264035
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  32264316 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 32264217  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttg 215  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  32264216 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttg 32264117  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||    
T  32264116 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1626961 - 1626680
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| ||    
T  1626961 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 1626862  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1626861 acactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 1626762  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  1626761 taaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaa 1626680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 38210349 - 38210630
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38210349 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38210448  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38210449 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 38210548  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  38210549 taacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 38210630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 51943350 - 51943630
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  51943350 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 51943449  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  51943450 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttg 51943548  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51943549 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 51943630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 24979686 - 24979968
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  24979686 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 24979785  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || | ||||    
T  24979786 atactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttg 24979885  T
Q  216 t-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24979886 taaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 24979968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 29956665 - 29956903
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29956665 gaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaa 29956764  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29956765 acactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 29956864  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29956865 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 29956903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5927042 - 5926761
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  5927042 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaa 5926943  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||    
T  5926942 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttg 5926843  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5926842 taaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5926761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3314663 - 3314945
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3314663 gaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3314762  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3314763 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3314862  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3314863 taaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3314945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47149173 - 47148892
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaa-caaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    ||||| |||||||||||||||| |    
T  47149173 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-a 47149075  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47149074 aacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 47148975  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | | || | ||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  47148974 gtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaa 47148892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 880730 - 880448
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  880730 gaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 880631  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  880630 aacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 880531  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  880530 gtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaa 880448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 36011806 - 36012087
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  36011806 gaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaa 36011905  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36011906 acactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 36012005  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36012006 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 36012087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 6561789 - 6562028
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  6561789 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaa 6561888  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--ttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  6561889 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttt 6561988  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctc 253  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  6561989 gtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35918227 - 35917944
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaa------attttgagggttgattcacct 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||      | |||||||||||||||||||    
T  35918227 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcacct 35918128  T
Q  111 tgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct 210  Q
    || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918127 tgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttct 35918028  T
Q  211 c-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||  || ||||||| |||||    
T  35918027 cttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53468733 - 53468450
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   ||||||  |||||||||||||||||    
T  53468733 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaa 53468635  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53468634 acactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 53468535  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccag--actaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53468534 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 53468450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48361941 - 48361668
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48361941 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactatt 48361842  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 223  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||    
T  48361841 aggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgtta 48361742  T
Q  224 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| |||||||  | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  48361741 ctcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 48361668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25688364 - 25688161
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25688364 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 25688265  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25688264 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 25688165  T
Q  290 tcaa 293  Q
    ||||    
T  25688164 tcaa 25688161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886458
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899931
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 54691851 - 54691571
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  54691851 aaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 54691752  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||    
T  54691751 cactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgt 54691652  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54691651 aacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaa 54691571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 890049 - 889779
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||    
T  890049 gaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttggga 889952  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  889951 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctctttt 889853  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgg 288  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  889852 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 297
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168361
Alignment:
Q  102 gattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  202 ttgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaa 11168361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15780839 - 15781139
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  15780839 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 15780938  T
Q  106 caccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg- 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  15780939 caccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattga 15781038  T
Q  205 ---atttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatgg---ctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
       ||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| || | ||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15781039 tatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 15781138  T
Q  297 a 297  Q
    |    
T  15781139 a 15781139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42992265 - 42992530
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  42992265 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaa 42992364  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42992365 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttg 42992448  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42992449 taacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42992530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12268244 - 12267972
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggg 114  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||    
T  12268244 gaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcgg 12268145  T
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         ||| |||    
T  12268144 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-ttt 12268055  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12268054 gtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 12267972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 39715448 - 39715664
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  39715448 gaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 39715547  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  39715548 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttg 39715647  T
Q  216 taacgttactcatcata 232  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39715648 taaagttactcatcata 39715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 6484414 - 6484620
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6484414 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattc 6484513  T
Q  192 ttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6484514 ttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 6484613  T
Q  291 caacaaa 297  Q
    |||||||    
T  6484614 caacaaa 6484620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28761706 - 28761446
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |   |||||| ||||||||||||||| ||    
T  28761706 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaa 28761608  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28761607 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28761508  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaattt 276  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28761507 taaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattt 28761446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Original strand, 35777400 - 35777587
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  35777400 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35777499  T
Q  117 acactattatgatt-gagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccatt 203  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35777500 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28100319 - 28100143
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  28100319 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 28100220  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattctt 193  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28100219 acgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 297
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219345
Alignment:
Q  60 tagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctggg 159  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  160 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttc 257  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 32219305  T
Q  258 ccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  32219306 tcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaa 32219345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51674997 - 51674763
Alignment:
Q  64 gtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactt 163  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  51674997 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattt 51674898  T
Q  164 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccccca 262  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| |||||||    
T  51674897 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccca 51674798  T
Q  263 gactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51674797 taccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 51674763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666774
Alignment:
Q  59 atagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgg 158  Q
    |||| ||||||||||||  |||| || |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  159 gactttgggtagaattaggcaggaga--cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  255 ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
       |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 4666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 31151329 - 31151605
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |   || |  ||||||||||||||||||||    
T  31151329 aaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaa 31151424  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  31151425 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgt 31151522  T
Q  217 aacgttactca-tcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  31151523 aaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaa 31151605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Original strand, 6231855 - 6232060
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6231855 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagacttattc 6231953  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| || ||| || |||| ||||||| | |||||| || |||||||||||| || ||||||||    
T  6231954 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccgaactggg 6232052  T
Q  290 tcaacaaa 297  Q
    ||||||||    
T  6232053 tcaacaaa 6232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Original strand, 28181009 - 28181182
Alignment:
Q  25 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28181009 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccatt 28181108  T
Q  125 atgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  28181109 aggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 296
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591442
Alignment:
Q  64 gtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactt 163  Q
    |||||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  164 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccccca 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||| | |||||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cccca 53591408  T
Q  263 gactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  53591409 gactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 23633440 - 23633713
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||   || |  |||||||| |||  ||||||    
T  23633440 aaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaa 23633533  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23633534 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgta 23633633  T
Q  218 acgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||    
T  23633634 aagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaa 23633713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27635905 - 27635655
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||           |||||    
T  27635905 gaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacacta--------gggt-----------gggaa 27635825  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-g 215  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||            ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  27635824 acaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 27635737  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27635736 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27635655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Original strand, 17795317 - 17795519
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17795317 gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgta 17795416  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  17795417 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaac 17795516  T
Q  295 aaa 297  Q
    |||    
T  17795517 aaa 17795519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 297
Target Start/End: Original strand, 19103757 - 19103959
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19103757 gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgta 19103856  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaac 294  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  19103857 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaac 19103956  T
Q  295 aaa 297  Q
    |||    
T  19103957 aaa 19103959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36871576 - 36871323
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |   ||  ||| |||||||||||||| ||    
T  36871576 gaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaa 36871481  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  36871480 acactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttg 36871381  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36871380 taaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 36871323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420208
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||   ||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| ||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||  |||||||| | | |||||||||||||    
T  13420236 gagagctgctctct-caccagactaggtca 13420208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 23637007 - 23637199
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||   ||||  |||||||| |||||| ||||    
T  23637007 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaa 23637102  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 214  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | | |||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637103 cactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 41849131 - 41849244
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  41849131 gaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 41849230  T
Q  117 acactattatgatt 130  Q
    || |||||| ||||    
T  41849231 actctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 54884138 - 54884367
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  54884138 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaac 54884235  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 217  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||  ||  ||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||    
T  54884236 actattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgta 54884334  T
Q  218 acgttactcatca-tatagtggatcggatggct 249  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54884335 aagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561797
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    || ||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  243 gatggctgctctttccc-ccagactaggtca 272  Q
     | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtca 561797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 53597219 - 53597472
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||  ||  |||||||||||||||||    
T  53597219 gaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaa 53597314  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | | ||| ||  || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  53597315 acactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttg 53597414  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||  ||| || |||||| |||| || |||||||||    
T  53597415 taaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtca 53597472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701668
Alignment:
Q  165 gggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccag 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  264 actaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaa 47701668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635575
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||   || |  | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcat 231  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28137573 - 28137423
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  28137573 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 28137485  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 178  Q
    ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28137484 acactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggc 28137423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674140
Alignment:
Q  38 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatc 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||   ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  138 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 206  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 272
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181616
Alignment:
Q  156 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctc 253  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctc 24181597  T
Q  254 tttcccccagactaggtca 272  Q
    | ||| ||| |||||||||    
T  24181598 tctcctccaaactaggtca 24181616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307020
Alignment:
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||  || || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctc--tctcctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaa 3307020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 11163129 - 11163196
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11163129 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 11163196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 6231428 - 6231495
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6231428 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaac 6231495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 47701873 - 47701806
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 84  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47701873 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaac 47701806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913980
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 29914037  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  |||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Original strand, 24177260 - 24177380
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||   ||||||||||||||||| |||    
T  24177260 aaacaagagtttaga-tgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaa 24177355  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggt 142  Q
    |||||||| |||||||| |||||||    
T  24177356 cactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634486
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggct 249  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggct 14634486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 297
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634148
Alignment:
Q  181 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttga 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  279 actgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || ||||| ||| ||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaa 25634148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4560487 - 4560399
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcag 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  4560487 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag 4560399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849319
Alignment:
Q  221 ttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41849319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919112
Alignment:
Q  230 atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 35919112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10100178  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200980
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10201041  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || || |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10201040 tggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208026
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10208087  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  10208086 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897162
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10897103  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10897162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193383
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54193324  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  || |  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 54193383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894054
Alignment:
Q  230 atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 53894054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 6303405  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858701
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagt--cttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 5858639  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  5858640 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612803
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10612862  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10612861 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10612803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878196
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 47878255  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 47878196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 3306778 - 3306842
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaaca 81  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3306778 gaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188665
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54188607  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  54188608 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtca 54188665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 11079612  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11079613 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7606864 - 7606830
Alignment:
Q  91 ttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606864 ttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 7606830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544429
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 27544368  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  27544369 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtca 27544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949285
Alignment:
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 217  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 10949343  T
Q  218 acgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | |  ||||  |||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10949342 aagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10949285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 175  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 177
Target Start/End: Original strand, 4535626 - 4535675
Alignment:
Q  127 gattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4535626 gattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419994
Alignment:
Q  37 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  | |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  137 cttggttacgggaagag 153  Q
    |||||| |||| |||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagag 13419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1618857 - 1618824
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1618857 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 1618824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39153401 - 39153361
Alignment:
Q  256 tcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  39153401 tcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 27829352 - 27829632
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27829352 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27829451  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829452 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27829551  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27829552 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27829632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28251847 - 28251566
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28251847 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 28251748  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28251747 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttg 28251648  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28251647 taatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28251566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 27827041 - 27827321
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27827041 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27827140  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827141 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27827240  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27827241 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27827321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 608789 - 609070
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  608789 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 608888  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  608889 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 608988  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  608989 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 609070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3874065 - 3874346
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  3874065 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3874164  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3874165 acactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 3874264  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3874265 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18810763 - 18811043
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  18810763 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 18810862  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810863 acactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18810962  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18810963 aacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaa 18811043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 14807806 - 14808097
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14807806 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14807905  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14807906 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14808005  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctg----------ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||          |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14808006 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14808097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22684936 - 22684652
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  22684936 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 22684837  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct- 212  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  22684836 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctcta 22684737  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22684736 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22684652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 32339364 - 32339645
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  32339364 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaa 32339463  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32339464 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32339563  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  32339564 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaa 32339645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 44720898 - 44721179
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  44720898 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 44720997  T
Q  117 a-cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720998 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 44721097  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44721098 taacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44721179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28283499 - 28283220
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  28283499 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 28283400  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28283399 acactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgt 28283300  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28283299 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 28283220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15809274 - 15809554
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15809274 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 15809372  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15809373 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 15809472  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15809473 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15809554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 43079657 - 43079938
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  43079657 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43079756  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079757 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 43079856  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43079938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15068036 - 15068317
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  15068036 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaa 15068135  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15068136 atactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15068235  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15068236 taacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaa 15068317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27107177 - 27106896
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27107177 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 27107078  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27107077 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttg 27106978  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  27106977 tagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 27106896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30480783 - 30480502
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  30480783 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 30480684  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30480683 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 30480584  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30480583 taacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 30480502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15072765 - 15073047
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||| ||    
T  15072765 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaa 15072864  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaaga-ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15072865 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttt 15072964  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15072965 gtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 15073047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 43082028 - 43082309
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  43082028 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43082127  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082128 acactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 43082227  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  43082228 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 43082309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14419471 - 14419189
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    |||||||||||||||||||||||||    
T  14419471 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaa 14419372  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||    
T  14419371 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttg 14419272  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14419271 taaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14419189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 4424073 - 4424354
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||   |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4424073 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaa 4424172  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4424173 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttg 4424272  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4424273 taacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 4424354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24873461 - 24873180
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||| ||||    
T  24873461 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaa 24873362  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24873361 acactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttg 24873262  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| || ||| || |||||||||    
T  24873261 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaa 24873180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 27911070 - 27911345
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27911070 gaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27911168  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  27911169 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattg 27911268  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  27911269 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27911345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Original strand, 27957489 - 27957764
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27957489 gaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27957587  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  27957588 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattg 27957687  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  27957688 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaa 27957764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 1225221 - 1225503
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1225221 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaa 1225320  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg--atttctcttt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||    
T  1225321 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 1225420  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1225421 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 1225503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 297
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530451
Alignment:
Q  60 tagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctggg 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  160 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcc 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctct 43530412  T
Q  259 cccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43530413 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 43530451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13858764 - 13858483
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13858764 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13858665  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||    
T  13858664 acactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttg 13858566  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  13858565 taaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaa 13858483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 18812948 - 18813217
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  18812948 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 18813036  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813037 acactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18813136  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18813137 aacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 18813217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 41384799 - 41385080
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  41384799 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 41384898  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  41384899 acaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttg 41384998  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41384999 taacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41385080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 36865593 - 36865873
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  36865593 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36865692  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||   | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  36865693 acactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 36865789  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccccc-agactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  36865790 taaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 36865873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 25952576 - 25952857
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  25952576 gaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 25952674  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25952675 acaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 25952774  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  25952775 taaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaa 25952857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 41382729 - 41382998
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||           
T  41382729 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct------- 41382821  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  41382822 ----attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 41382917  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41382918 aacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 41382998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5372458 - 5372179
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  5372458 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaa 5372359  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  5372358 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttg 5372259  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| || | |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  5372258 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaa 5372179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Original strand, 14477331 - 14477520
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14477331 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14477430  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 206  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477431 acgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33541668 - 33541506
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  33541668 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 33541569  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggca 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33541568 acactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggca 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956294
Alignment:
Q  52 ggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaag 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   ||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  152 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggct 249  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  250 gctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 15956294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 290
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480832
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    ||||||||   ||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 21480784  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggt 290  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21480785 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482647
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 21482492  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  | | ||    
T  21482493 tgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacg 21482592  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  21482593 gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaa 21482647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15185990 - 15185713
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||    
T  15185990 gaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaa 15185891  T
Q  117 acactattatgattgagtatct--tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 213  Q
    |||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15185890 acactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttt 15185798  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| | |||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15185797 tttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 15185713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 297
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162549
Alignment:
Q  53 gtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaaga 152  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaaga 31162399  T
Q  153 ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctg 250  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  31162400 gattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctg 31162499  T
Q  251 ctcttt--cccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |  |||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||    
T  31162500 ctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaa 31162549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005629
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacc 199  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  200 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca-atttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||||||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T
Q  297 a 297  Q
    |    
T  3005629 a 3005629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5623018 - 5622882
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5623018 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaa 5622919  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagag 153  Q
    ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5622918 acattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 267
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035424
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  196 aacccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagacta 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagacta 31035424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 232
Target Start/End: Original strand, 181629 - 181772
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-atgattgagtatcttggttacg--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  181629 tttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcggaagactta 181728  T
Q  189 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  181729 ttcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578301
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    |  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||| ||||| |||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtca 31578301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 26775256 - 26775378
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||| ||    
T  26775256 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaa 26775355  T
Q  117 acactattatgattgagtatctt 139  Q
    |||||||||  ||||||| ||||    
T  26775356 acactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35872658 - 35872555
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  35872658 gaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 35872564  T
Q  117 acactatta 125  Q
    |||||||||    
T  35872563 acactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214319
Alignment:
Q  50 agggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacggga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  150 agaggctgggactttgggtagaattaggc 178  Q
    || |  ||| |||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggc 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12517304 - 12517248
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517304 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757293
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  199 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 228  Q
     | ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541413
Alignment:
Q  200 cattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaa 33541413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468128
Alignment:
Q  168 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagac 265  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |   || ||||||||| || ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  266 taggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaa 2468128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328064
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021132
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 9021194  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  9021193 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 9021132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376300
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   || |||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtca 6376300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 31035126 - 31035239
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   ||   || ||||||||||||||||||    
T  31035126 aaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaa 31035221  T
Q  118 cactattatgattgagta 135  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagta 31035239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3886198 - 3886153
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886198 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta-ggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgt 29554869  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29554868 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214263
Alignment:
Q  241 cggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 37214263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179586
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 23179645  T
Q  217 aacgttactcat--cat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23179644 aaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtca 23179586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  184 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttccc 259  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684799
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttgt 25684741  T
Q  217 aacgttactcat-cat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  |||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  25684742 aaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25684799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2468306 - 2468261
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  2468306 gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg--gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | || ||||| |||| |||||||    | ||||  |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 181592 - 181632
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  181592 gaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477587
Alignment:
Q  230 atatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactg-ggtcaacaaa 297  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaa 14477587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799558
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactt 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890922
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 28890922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 37214490 - 37214458
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaact 49  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37214490 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 93)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 27104774 - 27105053
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  27104774 gaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaaa-ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27104872  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104873 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27104972  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27104973 aacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 27105053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45280265 - 45279983
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatg-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  45280265 gaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttggga 45280166  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 214  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45280165 tacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 45280066  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  45280065 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 45279983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42064490 - 42064771
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  42064490 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 42064589  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064590 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 42064689  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtc-aatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  42064690 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42064771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13910324 - 13910044
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||  ||||||||||||||||||||    
T  13910324 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaa 13910225  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910224 acaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 13910125  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13910124 aacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 13910044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19502291 - 19502010
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  19502291 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 19502192  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502191 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 19502092  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19502091 taacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19502010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23452517 - 23452236
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||||| |||    
T  23452517 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 23452418  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23452417 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 23452318  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23452317 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 23452236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19504625 - 19504345
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||||  |||||||||||||||||||    
T  19504625 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaa 19504526  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19504525 acactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 19504427  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19504426 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19504345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 42452758 - 42453036
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  42452758 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 42452855  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42452856 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 42452955  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42452956 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42453036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21520973 - 21520692
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  21520973 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 21520874  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21520873 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttg 21520774  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  21520773 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaa 21520692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24162492 - 24162222
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  24162492 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 24162393  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162392 acactattaagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 24162303  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  24162302 aatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 24162222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35215866 - 35215585
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  35215866 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35215767  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35215766 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 35215667  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  35215666 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35215585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42923789 - 42923508
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  42923789 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 42923690  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  42923689 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 42923590  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42923589 taaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 42923508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 19007615 - 19007896
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  19007615 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaa 19007714  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19007715 acactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 19007814  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19007815 taacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 19007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35218243 - 35217962
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  35218243 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35218144  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35218143 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttg 35218044  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  35218043 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 35217962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43623848 - 43623579
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43623848 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctca------------ctaggttttgagggttgattcaccttgggaa 43623761  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43623760 acaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 43623661  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  43623660 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 43623579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40032338 - 40032052
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  40032338 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40032239  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattga----tttctc- 211  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||     
T  40032238 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctct 40032139  T
Q  212 tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40032138 tttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 40032052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11739838 - 11739558
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11739838 aacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 11739739  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 217  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| |    
T  11739738 actattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaa 11739639  T
Q  218 acgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11739638 aggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 11739558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 28196612 - 28196891
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  28196612 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaa 28196711  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28196712 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28196811  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  28196812 taacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaa 28196891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22287616 - 22287335
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22287616 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 22287517  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22287516 acggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttg 22287417  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22287416 taacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 22287335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5375551 - 5375345
Alignment:
Q  91 ttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5375551 ttttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttatt 5375453  T
Q  191 cttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactggg 289  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  290 tcaacaaa 297  Q
    ||||||||    
T  5375352 tcaacaaa 5375345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 17848419 - 17848696
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||    
T  17848419 aaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaa 17848518  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-g 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  17848519 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttg 17848614  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17848615 taacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 17848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6259095 - 6258816
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  6259095 gaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 6258996  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6258995 acactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 6258898  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6258897 taaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6264425 - 6264147
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  6264425 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 6264330  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6264329 acactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 6264230  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6264229 taaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 6264147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44289347 - 44289066
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  44289347 aaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 44289248  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |  | | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  44289247 cactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 44289148  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  |||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44289147 aagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 44289066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 3022138 - 3022428
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  3022138 gaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaa 3022237  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  3022238 acactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttat 3022337  T
Q  217 aacgttactcatca----------tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    || |||||||||||          |||| || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3022338 aaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3022428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15539755 - 15539566
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15539755 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 15539656  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 206  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15539655 acactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34979859 - 34979576
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34979859 gaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 34979760  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  34979759 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttg 34979660  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||| ||||   |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34979659 taaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 34979576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31733045 - 31732775
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  31733045 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaa 31732946  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||            ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31732945 acactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 31732858  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  31732857 taaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaa 31732775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45239256 - 45239000
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45239256 gaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 45239158  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45239157 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 45239058  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaa 273  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45239057 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558863
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 36558863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561140
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 36561140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 17849092 - 17849373
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  17849092 gaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 17849191  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  17849192 acactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttg 17849291  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  17849292 taaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaa 17849373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 14837248 - 14837524
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14837248 gaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14837347  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||      ||||||||  || ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14837348 acactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 14837441  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14837442 taaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 14837524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11578384 - 11578136
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    |   ||| |||||||||||||| |||||    
T  11578384 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaact---agggttg-gggttgattcacctcgggaa 11578290  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  11578289 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 11578190  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactag 268  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11578189 taaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332180
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 45332180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146632
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||   || |  | ||||||||||||||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    || || || |||||||| ||||||| ||||||| ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtca 20146632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407453
Alignment:
Q  156 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 22407496  T
Q  255 ttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22407495 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 22407453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897270
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaac 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  ||  ||   |||||||||||||||||||    
T  17897519 aacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactaggttgaga---ttgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  119 actattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgta 217  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | | ||| ||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||    
T  17897424 actattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgta 17897325  T
Q  218 acgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17897324 aagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct-ccccagactaggtca 17897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459209
Alignment:
Q  52 ggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  152 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggct 249  Q
    ||  |||| |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  250 gctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
     |||| |  || ||||||||||||||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttg 28459209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800349
Alignment:
Q  48 ctagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgg 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||   ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacag 18800464  T
Q  148 gaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggat 245  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||     
T  18800463 gaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggag 18800364  T
Q  246 ggctgctctttcccc 260  Q
    |||| |||| |||||    
T  18800363 ggctactctctcccc 18800349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874387
Alignment:
Q  45 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggtta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  145 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    |||||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |     
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaact 22874332  T
Q  243 gatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||  |||||||| |||| || |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  22874333 gagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaa 22874387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 142
Target Start/End: Original strand, 38020177 - 38020302
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||| ||    
T  38020177 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaa 38020276  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggt 142  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||    
T  38020277 acactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699606
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgta 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  197 acccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    | || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtca 40699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  168 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagact 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  267 aggtcaa-tttgaactgaactgggtcaa 293  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22407689 - 22407591
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22407689 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22163227 - 22163119
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  22163227 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 22163128  T
Q  117 acactatta 125  Q
    |||||||||    
T  22163127 acactatta 22163119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707750
Alignment:
Q  180 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccc--cagactaggtcaattt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaattt 22707771  T
Q  277 gaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  22707770 ggactgaactaggtcaacaaa 22707750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107526
Alignment:
Q  37 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    |   ||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac----agggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  137 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag--gcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-ta 232  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T
Q  233 tagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||||||    
T  35107487 tagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtca 35107526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5377709 - 5377629
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgag 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||    
T  5377709 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943692
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 17943635  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  |||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163021
Alignment:
Q  212 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaa 22163021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 231  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43139532 cttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27136326 - 27136195
Alignment:
Q  97 gggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 195  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||| ||||   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27136326 gggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgt 27136227  T
Q  196 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactc 226  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27136226 aactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736361
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 212  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcat 231  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462592
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38414279 - 38414194
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38414279 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687139
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27517723  T
Q  217 aacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054790
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20054852  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20054851 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 20054790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871052
Alignment:
Q  182 agacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatttg 23871052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2741036  T
Q  214 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 242
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932759
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17932732  T
Q  217 aacgttactcatca-tatagtggatcg 242  Q
    || |  |||||||| ||||||||||||    
T  17932733 aaagaaactcatcattatagtggatcg 17932759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962940
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 198  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  199 ccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||| | | |  | ||| ||| || |||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||    
T  37963037 ccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaa 37962940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 262
Target Start/End: Original strand, 33603994 - 33604143
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| |  || |||||| || |||||||||   || |||| |||||| |||||  ||||| | ||||    
T  33603994 aaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatctt 33604093  T
Q  214 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttccccca 262  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  33604094 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgt 195  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  196 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 231  Q
    ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  101 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagag 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactt 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgg-gaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatta 175  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  99 gttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 175  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 38020120 - 38020157
Alignment:
Q  19 aacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 56  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38020120 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 175  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 38020311 - 38020349
Alignment:
Q  161 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacc 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38020311 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050046
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||| || |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggac-ttggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20050109  T
Q  214 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcggatggctgctct-ttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  20050108 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtca 20050046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670992
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 59  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679879
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 45679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17057409 - 17057369
Alignment:
Q  256 tcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  17057409 tcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17085392 - 17085352
Alignment:
Q  256 tcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  17085392 tcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41763 - 41482
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  41763 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 41664  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41663 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 41564  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  41563 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaa 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 297
Target Start/End: Original strand, 79194 - 79474
Alignment:
Q  18 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  79194 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaa 79293  T
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79294 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 79393  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  79394 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 79474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14662 - 14381
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14662 gaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14563  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14562 acactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 14463  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14462 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 14381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15308
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15027 gaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 15126  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15127 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15226  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  15227 taaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaa 15308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 2888 - 3168
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  2888 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 2987  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2988 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 3087  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  3088 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 29179 - 29459
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||  |||||||||| ||||||||     
T  29179 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggat 29278  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29279 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgt 29378  T
Q  217 aacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29379 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 29459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 6207 - 6488
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  6207 gaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6306  T
Q  117 acactattatgattga-gtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6307 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttg 6406  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||    
T  6407 taacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaa 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 183920 - 183640
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  183920 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 183821  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  183820 acactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 183722  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  183721 taatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 183640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 52019 - 52302
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  52019 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 52118  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  52119 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 52218  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctg--ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  52219 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaa 52302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 297
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50303
Alignment:
Q  251 ctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaa 50303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11753 - 11472
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||||||  |||||||||    
T  11753 gaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaa 11654  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11653 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11554  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  11553 taacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaa 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 4005 - 4284
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  4005 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 4103  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4104 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 4203  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  4204 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaa 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 49 - 330
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  49 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 148  T
Q  117 acactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149 acactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttg 248  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  249 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1452
Alignment:
Q  92 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattc 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1657 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 1558  T
Q  192 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1557 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 1458  T
Q  292 aacaaa 297  Q
    ||||||    
T  1457 aacaaa 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Original strand, 79867 - 80148
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg-aacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  79867 gaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttggga 79966  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 214  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||     
T  79967 aacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctctttt 80065  T
Q  215 gtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  80066 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaa 80148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 85237 - 85508
Alignment:
Q  16 agaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttggga 115  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  85237 agaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaa 85336  T
Q  116 aacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 214  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  85337 aacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttc 85436  T
Q  215 gtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaac 285  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85437 gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaac 85508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 2050 - 2293
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  2050 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaaa-ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 2148  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2149 acactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttg 2248  T
Q  216 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccc 260  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||    
T  2249 taacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 35647 - 35819
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||| |||||    
T  35647 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaa 35746  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 189  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35747 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35883
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaa 35883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22404
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 22404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24679
Alignment:
Q  114 gaaacactattatgattg-agtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  213 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 24679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1842 - 1666
Alignment:
Q  98 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1842 ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaa 1743  T
Q  198 cccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1742 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtca 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 1911 - 1862
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 67  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1911 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 1862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16098 - 15819
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaa 116  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||   || |||| ||||||||||||| |||    
T  16098 gaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaa 16003  T
Q  117 acactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 215  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16002 aaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15903  T
Q  216 taacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaat-ttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| | |||| |||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||    
T  15902 taaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaa 15819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16716
Alignment:
Q  42 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttgg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  16903 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttgg 16807  T
Q  142 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 231  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16806 tgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1111 - 993
Alignment:
Q  17 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-----ttgggaacaaacgctaaattttgagggttgattcacctt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  1111 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccacctt 1012  T
Q  112 gggaaacactattatgatt 130  Q
    | |||| ||| ||| ||||    
T  1011 gcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5076
Alignment:
Q  100 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacc 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  200 cattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| |  |   ||||||| | |||||||||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 177
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  115 aaacactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  232 atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaa 296  Q
    ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4729 - 4678
Alignment:
Q  246 ggctgctctttcccccagactaggtcaatttgaactgaactgggtcaacaaa 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4729 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaa 4678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17011
Alignment:
Q  118 cactattatgattgagtatcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| |||  |||    |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaacttatta---tctctttgt 17070  T
Q  217 aacgttactcat--cat-atagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17069 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3095
Alignment:
Q  231 tatagtggatcggatggctgctctttcccccagactaggtca 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University