View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1244_low_25 (Length: 371)

Name: NF1244_low_25
Description: NF1244
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1244_low_25
NF1244_low_25
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (60-301)||(22805019-22805260)
chr7 (60-361)||(22814668-22814978)
chr7 (60-301)||(22875623-22875867)
chr7 (55-301)||(22888993-22889248)
chr7 (71-301)||(22913375-22913605)
chr7 (55-360)||(22893595-22893900)
chr7 (55-317)||(22858144-22858418)
chr7 (127-317)||(22885310-22885500)
chr7 (60-361)||(22880233-22880542)
chr7 (55-302)||(22830731-22830987)
chr7 (55-322)||(22897952-22898219)
chr7 (62-317)||(22809326-22809593)
chr7 (62-302)||(22839752-22840001)
chr7 (55-357)||(22825903-22826205)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (62-316)||(21150765-21151028)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 60 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22805260 - 22805019
Alignment:
Q  60 aggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgttaaaccaacacgacctttgttatcattgaccaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  22805260 aggtatggattgattatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccagtttatgttgttaaaccaacaggaccttcgttatcaatgaccaa 22805161  T
Q  160 tgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagttttaag 259  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22805160 agatctttctccaattcttaacaatagtatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatattcttggttggagttttaag 22805061  T
Q  260 gttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22805060 gttaatggtcaagctcaaaaccttgtaatctctcaatttcct 22805019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22814978 - 22814668
Alignment:
Q  60 aggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttgttatc 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |         |||||||||| ||||||||||||    
T  22814978 aggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaatgagtgttggtgctagtaataaaccaacacaacctttgttatc 22814879  T
Q  151 attgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttgg 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  22814878 attgaccaaagatctttcttcaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgtagcttctcattatattcttgggtgg 22814779  T
Q  251 agttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttgatgagnnnnnnnngtcaaaatttttaactgttg 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||        ||| ||||||||||||||||    
T  22814778 agttttaaggttaatggccaagctcaaaaccttgaaatatctgaacttcctaagctaacagtatttgctgaggtaaaaaagtctaaatttttaactgttg 22814679  T
Q  351 ggttgcctttg 361  Q
    |||||||||||    
T  22814678 ggttgcctttg 22814668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22875867 - 22875623
Alignment:
Q  60 aggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgtt-gt--taaaccaacacgacctttgttatcattgac 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22875867 aggtatggattgactatgatggagtgaaaaaaaagattgatgttactttagctccaatagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgac 22875768  T
Q  157 caatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagtttt 256  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22875767 caaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagtttt 22875668  T
Q  257 aaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22875667 aaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctctgaacttcct 22875623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22889248 - 22888993
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||| |         |||||||||| |||||||    
T  22889248 tatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagcaccaatgagtgttggtgctagtaataaaccaacacaacctttg 22889149  T
Q  146 ttatcattgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttg 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||    
T  22889148 ttatcattgaccaaagatctttcttcaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttaatggtagcttctcagtatattcttg 22889049  T
Q  246 gttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889048 gttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct 22888993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22913605 - 22913375
Alignment:
Q  71 gaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgttaaaccaacacgacctttgttatcattgaccaatgatctttctc 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  22913605 gaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttactttagctccaattaatgttgttaaaccaaaacaacctttgttatcattgaacaaagatctttctt 22913506  T
Q  171 caattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagttttaaggttaatggtca 270  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22913505 caattcttaacactagtatgtatgttggattctcatcttcaacaggttcaattctaacttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtca 22913406  T
Q  271 agctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22913405 agctcaaaatcttgtaatctctgaacttcct 22913375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22893900 - 22893595
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgttaaaccaacacgacctttgttatcattg 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22893900 tatgcaggtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgttactttagctccaattaatgttgttaaaccaaaacaacctttgttatcattg 22893801  T
Q  155 accaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagtt 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || || | | ||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22893800 accaaagatctttctccaattcttaacaatagtatgtatgttggattttcatcagctactggttcatttctaacttctcattatattcttggttggagtt 22893701  T
Q  255 ttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttgatgagnnnnnnnngtcaaaatttttaactgttgggtt 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| | ||||         ||||| |||||||||||||||||    
T  22893700 ttaagattaatggtcaagctcaaaaccttgtaatctctgaacttcctgagttaccagtattagctgagaaaacgaaatcaaattttttaactgttgggtt 22893601  T
Q  355 gccttt 360  Q
    ||||||    
T  22893600 gccttt 22893595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22858418 - 22858144
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgat------------gttgttaaaccaacacgacct 142  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||            |||||||||||| ||||||||    
T  22858418 tatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacattagctccaattaattttggttgtaatgttgttaaaccagcacgacct 22858319  T
Q  143 ttgttatcattgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatattt 242  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||||     
T  22858318 ttgttatcattcacgaaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaaccggggtaattgtagcttcccattatattc 22858219  T
Q  243 ttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22858218 ttggttggagttttaaggttaatggccaagctcaaaaccttgaaatctctaaacttcctgagctaagaatatttg 22858144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22885500 - 22885310
Alignment:
Q  127 taaaccaacacgacctttgttatcattgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgca 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22885500 taaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaatactcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttaattgta 22885401  T
Q  227 gcttctcattatatttttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22885400 gcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatagccaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagccaagaatatttg 22885310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 60 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22880542 - 22880233
Alignment:
Q  60 aggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttgttatc 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||  ||||| |         ||||||||||||| |||||| ||    
T  22880542 aggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaagattgaggttacattagctccgattagtgttggttttaataataaaccaacacgacatttgttgtc 22880443  T
Q  151 attgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttgg 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  22880442 attgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagtatgtatgttggattatcatcttcaacaaggttaattttagcttctcattatgttcttggttgg 22880343  T
Q  251 agttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttgatgagnnnnnnnngtcaaaatttttaactgttg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||| |||         ||||||||||||||||||||    
T  22880342 agttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgagcttcatgagccaatagtatttgctga-caaaaaaagtcaaaatttttaactgttg 22880244  T
Q  351 ggttgcctttg 361  Q
    |||| ||||||    
T  22880243 ggttacctttg 22880233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22830987 - 22830731
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |         |||||||||| |||   |    
T  22830987 tatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccagttagtgttggttttagtcataaaccaacacaaccgacg 22830888  T
Q  146 ttatcattgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttg 245  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  22830887 ttatcattgaccaaagatctttccccaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttcattgcagcttctcattatattcatg 22830788  T
Q  246 gttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctg 302  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22830787 gttggagttttatggttaatggccaatctcaaaaccttgaaatctctgaccttcctg 22830731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22898219 - 22897952
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgttaaaccaacacgacctttgttatcattg 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22898219 tatgcaggtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgttactttagctccaattaatgttgttaaaccaaaacaacctttgttgtcattg 22898120  T
Q  155 accaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagtt 254  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  | || || | | ||    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22898119 accagagatctttctccaattttaaacaatagtatgtatgttggattttcatcagctactggttcagttttcacttctcattatattcttggttggagtt 22898020  T
Q  255 ttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttgatgag 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  22898019 ttaaggttaatggtcaagctgaaaaccttgtaatctctgaacttcctaagctaccaagatttggtgag 22897952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22809593 - 22809326
Alignment:
Q  62 gtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttg------------ttaaaccaacacgacctttgttat 149  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  22809593 gtatggattgaatatgatggtgaaaagaaaaagattgatgctactttagctccaattaatgttggttttaatgttgttaaaccaacacgacctttgttat 22809494  T
Q  150 cattgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttg 249  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||  | ||||||||||| || |||||||    
T  22809493 cattcaccaaagatctttctccaattcttaacactagtatgtatgttggattctcatcttcaacaggttctattctatcttctcattatgttcttggttg 22809394  T
Q  250 gagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  22809393 gagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgatatctctaaacttcctgagctaagaacatttg 22809326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22840001 - 22839752
Alignment:
Q  62 gtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttgttatcat 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |         |||||||||| |||   ||||||||    
T  22840001 gtatggattgaatatgatagagtgaagaaaaagattgatgttaccttagctccatttagtgttggttttagtcataaaccaacacaaccgacgttatcat 22839902  T
Q  153 tgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggag 252  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22839901 tgaccaaagatctttccccaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttcattgcagcttctcattatattcatggttggag 22839802  T
Q  253 ttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctg 302  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22839801 ttttatggttaatggccaatctcaaaaccttgaaatctctgaccttcctg 22839752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22826205 - 22825903
Alignment:
Q  55 tatgaaggtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgttaaaccaacacgacctttgttatcattg 154  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22826205 tatgcaggtatggatagaatatgatggtgaaaataaaaagattgatgttactttagctccaattaatgttgttaaaccaaaacaacctttgttttcattg 22826106  T
Q  155 accaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggagtt 254  Q
    ||||  |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  | || || | | ||    |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22826105 accagagatcttcctccaattttgaacaatagtatgtatgttggattctcatcagctactggttcagttttcacttctcattatattcttggttgaagtt 22826006  T
Q  255 ttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatatttgatgagnnnnnnnngtcaaaatttttaactgttgggtt 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||  || ||||| ||||        ||| ||||||||||||||||||||    
T  22826005 ttaagcttaatggtcaagctcaaaatcttgtaatttctgaacttcctaaactacgaagatttggtgagaaaaaagagtccaaatttttaactgttgggtt 22825906  T
Q  355 gcc 357  Q
    |||    
T  22825905 gcc 22825903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 316
Target Start/End: Original strand, 21150765 - 21151028
Alignment:
Q  62 gtatggattgaatatgatggagtgaacaaaaagattaatgttactttagctccaattgatgttgtt---------aaaccaacacgacctttgttatcat 152  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |         |||||| || |||||||||||||||    
T  21150765 gtatggattgaatatgatggtgaaaagaagaagattaatgttactttagctccaattagtgttggttttaataaaaaaccagcaagacctttgttatcat 21150864  T
Q  153 tgaccaatgatctttctccaattcttaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatatttttggttggag 252  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21150865 tgaccaaagatctttctccagttctcaacaatagtatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgcagcttctcattatattcttggttggag 21150964  T
Q  253 ttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgagctaacaatattt 316  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21150965 ttttaaggttaatggcctggctcaaaaccttgaaatctctgaacttcctgaagtaacagtattt 21151028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University