View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12450_low_5 (Length: 423)

Name: NF12450_low_5
Description: NF12450
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12450_low_5
NF12450_low_5
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (47-395)||(3409470-3409818)
chr6 (47-395)||(2377937-2378284)
chr6 (47-268)||(29518857-29519078)
chr6 (45-393)||(10073989-10074336)
chr6 (47-213)||(29518495-29518661)
chr6 (47-213)||(32741171-32741337)
chr6 (21-213)||(35210196-35210386)
chr6 (47-237)||(2578443-2578634)
chr6 (57-213)||(3409251-3409407)
chr6 (36-238)||(10074352-10074553)
chr6 (23-213)||(3058218-3058409)
chr6 (34-238)||(16454872-16455078)
chr6 (36-214)||(3415449-3415629)
chr6 (47-213)||(14748342-14748504)
chr6 (47-203)||(2377756-2377912)
chr6 (21-205)||(2579848-2580030)
chr6 (47-212)||(1846741-1846906)
chr6 (33-234)||(2579478-2579678)
chr6 (34-230)||(2578822-2579016)
chr6 (57-213)||(26544041-26544197)
chr6 (35-213)||(1127352-1127530)
chr6 (21-203)||(16454577-16454758)
chr6 (56-203)||(16107680-16107827)
chr6 (21-237)||(2579085-2579297)
chr6 (47-199)||(2843560-2843713)
chr6 (35-238)||(10073604-10073804)
chr6 (25-203)||(5832007-5832182)
chr6 (48-268)||(16107998-16108208)
chr6 (50-202)||(6999799-6999951)
chr6 (34-205)||(593694-593867)
chr6 (62-202)||(1950200-1950340)
chr6 (97-200)||(32460630-32460733)
chr6 (51-205)||(10911565-10911720)
chr6 (80-199)||(9062383-9062501)
chr6 (21-205)||(12071666-12071849)
chr6 (86-238)||(8481893-8482045)
chr6 (34-205)||(12085021-12085191)
chr6 (35-205)||(12092470-12092640)
chr6 (53-210)||(5958613-5958766)
chr6 (73-238)||(6071098-6071264)
chr6 (24-205)||(31714671-31714849)
chr6 (132-238)||(35210456-35210551)
chr6 (36-201)||(17135058-17135223)
chr6 (89-237)||(2975521-2975668)
chr6 (298-395)||(29518686-29518784)
chr6 (146-268)||(33605913-33606034)
chr6 (21-198)||(30618593-30618766)
chr6 (93-137)||(22605301-22605345)
chr6 (54-101)||(3409405-3409452)
chr6 (86-137)||(11637760-11637811)
chr6 (122-168)||(14789279-14789325)
chr6 (93-137)||(21130103-21130147)
chr6 (306-397)||(26544230-26544321)
chr6 (55-113)||(10902438-10902496)
chr6 (317-395)||(2579387-2579467)
chr6 (21-80)||(2975296-2975354)
chr6 (87-129)||(11638053-11638095)
chr6 (317-395)||(2578730-2578810)
chr6 (317-395)||(16107863-16107943)
chr6 (22-71)||(35210554-35210602)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (28-395)||(22304378-22304747)
chr3 (64-345)||(4823515-4823796)
chr3 (23-292)||(37990615-37990884)
chr3 (47-395)||(41359765-41360111)
chr3 (53-297)||(15773099-15773346)
chr3 (21-237)||(54017791-54018008)
chr3 (48-308)||(11661846-11662108)
chr3 (21-203)||(37990951-37991133)
chr3 (49-203)||(43346793-43346947)
chr3 (21-205)||(15772854-15773037)
chr3 (47-203)||(35946524-35946680)
chr3 (21-205)||(42342362-42342546)
chr3 (35-205)||(29644890-29645060)
chr3 (47-254)||(29644581-29644791)
chr3 (49-238)||(42342092-42342283)
chr3 (35-205)||(12114550-12114720)
chr3 (47-205)||(32589704-32589861)
chr3 (47-205)||(33803252-33803410)
chr3 (55-214)||(39934963-39935124)
chr3 (47-237)||(21832345-21832532)
chr3 (47-205)||(54018198-54018356)
chr3 (56-213)||(39389062-39389219)
chr3 (55-238)||(22303963-22304141)
chr3 (47-205)||(25739425-25739583)
chr3 (50-203)||(32462903-32463057)
chr3 (21-203)||(52634678-52634858)
chr3 (47-238)||(32462558-32462752)
chr3 (47-213)||(50612447-50612618)
chr3 (46-205)||(31190017-31190168)
chr3 (47-205)||(53577364-53577522)
chr3 (47-203)||(25755396-25755552)
chr3 (23-205)||(1634291-1634473)
chr3 (73-267)||(3135099-3135293)
chr3 (50-205)||(45395656-45395811)
chr3 (47-203)||(3135454-3135617)
chr3 (54-237)||(9240118-9240300)
chr3 (46-203)||(45901715-45901873)
chr3 (47-204)||(53117975-53118131)
chr3 (45-205)||(39914252-39914412)
chr3 (46-205)||(8327904-8328067)
chr3 (150-238)||(22304213-22304301)
chr3 (47-213)||(37726496-37726654)
chr3 (55-203)||(49336694-49336843)
chr3 (46-213)||(51886553-51886714)
chr3 (23-147)||(22303634-22303759)
chr3 (23-203)||(33175635-33175820)
chr3 (47-205)||(44160547-44160702)
chr3 (226-395)||(22303759-22303929)
chr3 (73-224)||(47964544-47964694)
chr3 (23-195)||(42584800-42584970)
chr3 (23-131)||(41359467-41359575)
chr3 (98-216)||(3384317-3384435)
chr3 (81-179)||(33362327-33362425)
chr3 (35-205)||(39336219-39336387)
chr3 (21-135)||(54017522-54017636)
chr3 (47-205)||(47964915-47965073)
chr3 (113-202)||(7767380-7767469)
chr3 (21-96)||(22304302-22304378)
chr3 (87-203)||(11661537-11661638)
chr3 (97-202)||(46546375-46546480)
chr3 (149-205)||(43346650-43346706)
chr3 (77-163)||(39336000-39336086)
chr3 (58-163)||(12749211-12749316)
chr3 (95-155)||(52634990-52635050)
chr3 (48-101)||(8328374-8328427)
chr3 (73-202)||(25317161-25317290)
chr3 (87-203)||(25991405-25991521)
chr3 (87-138)||(53596027-53596078)
chr3 (87-138)||(53596342-53596393)
chr3 (93-150)||(17731950-17732007)
chr3 (93-150)||(19033181-19033238)
chr3 (47-125)||(43978865-43978947)
chr3 (87-138)||(53596542-53596593)
chr3 (47-123)||(7766783-7766857)
chr3 (91-138)||(48127859-48127906)
chr3 (21-78)||(9239940-9239996)
chr3 (173-205)||(12747878-12747910)
chr3 (93-137)||(16871005-16871049)
chr3 (93-137)||(17735037-17735081)
chr3 (93-137)||(19036306-19036350)
chr3 (181-243)||(2299937-2300000)
chr3 (93-138)||(16143505-16143550)
chr3 (93-134)||(16869843-16869884)
chr3 (139-200)||(36986040-36986101)
chr3 (139-200)||(37011479-37011540)
chr3 (21-74)||(41360111-41360164)
chr3 (106-142)||(50329391-50329427)
chr3 (328-395)||(53577548-53577616)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (35-360)||(3669905-3670229)
chr8 (55-395)||(1013879-1014219)
chr8 (20-379)||(9309180-9309538)
chr8 (47-214)||(3669678-3669845)
chr8 (35-215)||(30441071-30441255)
chr8 (21-203)||(3038263-3038446)
chr8 (37-227)||(34835185-34835377)
chr8 (37-238)||(34835439-34835643)
chr8 (37-238)||(34835705-34835909)
chr8 (49-238)||(40518550-40518738)
chr8 (55-203)||(34834878-34835026)
chr8 (23-213)||(20870550-20870741)
chr8 (54-271)||(45121663-45121881)
chr8 (47-237)||(8918764-8918956)
chr8 (57-205)||(45122067-45122215)
chr8 (21-203)||(30359273-30359456)
chr8 (55-213)||(1014253-1014411)
chr8 (51-254)||(30359558-30359763)
chr8 (35-205)||(45121898-45122068)
chr8 (47-232)||(45122604-45122782)
chr8 (45-237)||(6731872-6732055)
chr8 (51-227)||(9482608-9482784)
chr8 (44-203)||(25561812-25561972)
chr8 (47-205)||(6876862-6877021)
chr8 (46-205)||(9608745-9608904)
chr8 (48-203)||(33113368-33113523)
chr8 (47-203)||(40518071-40518229)
chr8 (47-237)||(45122972-45123164)
chr8 (47-203)||(37544490-37544646)
chr8 (47-202)||(147454-147609)
chr8 (34-180)||(9483174-9483320)
chr8 (47-203)||(1513915-1514071)
chr8 (50-198)||(70277-70425)
chr8 (51-254)||(18371665-18371863)
chr8 (53-211)||(40579512-40579670)
chr8 (47-205)||(5915872-5916025)
chr8 (49-205)||(5420651-5420807)
chr8 (50-205)||(41972158-41972316)
chr8 (21-195)||(18371968-18372142)
chr8 (133-254)||(18372342-18372463)
chr8 (57-238)||(147794-147968)
chr8 (47-234)||(6651476-6651652)
chr8 (47-205)||(9308977-9309139)
chr8 (133-254)||(18372785-18372905)
chr8 (57-202)||(32640542-32640682)
chr8 (101-254)||(18372988-18373139)
chr8 (48-201)||(18380020-18380171)
chr8 (47-211)||(32305478-32305635)
chr8 (57-205)||(4154678-4154824)
chr8 (54-205)||(9507777-9507933)
chr8 (68-182)||(9609108-9609222)
chr8 (161-250)||(18372485-18372574)
chr8 (127-213)||(41416251-41416335)
chr8 (92-202)||(43274824-43274934)
chr8 (36-238)||(4154270-4154472)
chr8 (34-127)||(41129066-41129159)
chr8 (87-203)||(8794113-8794229)
chr8 (35-205)||(9620666-9620834)
chr8 (47-130)||(40579269-40579352)
chr8 (56-205)||(12283873-12284021)
chr8 (47-123)||(8919144-8919220)
chr8 (97-203)||(18372656-18372758)
chr8 (115-202)||(3037776-3037865)
chr8 (56-201)||(43398077-43398225)
chr8 (132-195)||(25561729-25561792)
chr8 (100-200)||(20130454-20130553)
chr8 (73-205)||(5274775-5274907)
chr8 (35-128)||(20995404-20995497)
chr8 (38-202)||(40991756-40991920)
chr8 (47-111)||(43274635-43274699)
chr8 (21-94)||(3037942-3038016)
chr8 (67-124)||(16524446-16524503)
chr8 (113-169)||(18373236-18373292)
chr8 (179-254)||(43274699-43274776)
chr8 (64-151)||(40417733-40417820)
chr8 (51-105)||(18372288-18372342)
chr8 (97-134)||(12156708-12156745)
chr8 (148-205)||(20995502-20995559)
chr8 (128-205)||(33831978-33832055)
chr8 (106-147)||(11442911-11442952)
chr8 (173-205)||(18645713-18645745)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (47-395)||(44290458-44290798)
chr1 (25-392)||(48588465-48588833)
chr1 (47-378)||(26661522-26661856)
chr1 (21-215)||(44290798-44290993)
chr1 (36-268)||(41157311-41157545)
chr1 (56-243)||(37556071-37556260)
chr1 (126-395)||(3537226-3537494)
chr1 (47-213)||(41759475-41759641)
chr1 (36-213)||(3537589-3537765)
chr1 (47-205)||(41142372-41142531)
chr1 (46-237)||(34364891-34365084)
chr1 (36-236)||(22077484-22077683)
chr1 (23-205)||(41156991-41157175)
chr1 (51-213)||(3550712-3550871)
chr1 (47-232)||(11977251-11977438)
chr1 (21-205)||(31767136-31767319)
chr1 (50-203)||(17294579-17294733)
chr1 (21-214)||(45493949-45494146)
chr1 (21-205)||(34364507-34364690)
chr1 (47-205)||(29798199-29798357)
chr1 (47-203)||(34649440-34649596)
chr1 (21-213)||(50051999-50052189)
chr1 (173-395)||(50051777-50051999)
chr1 (47-205)||(5319965-5320123)
chr1 (21-201)||(9955911-9956092)
chr1 (47-197)||(14318875-14319025)
chr1 (55-204)||(40082408-40082556)
chr1 (23-213)||(32168674-32168853)
chr1 (79-211)||(32594748-32594880)
chr1 (23-205)||(45084382-45084557)
chr1 (49-205)||(3875333-3875489)
chr1 (34-205)||(37850588-37850758)
chr1 (62-208)||(38804370-38804516)
chr1 (70-203)||(26661921-26662054)
chr1 (56-202)||(37555733-37555878)
chr1 (21-205)||(66447-66630)
chr1 (54-205)||(24600321-24600472)
chr1 (47-205)||(39066201-39066358)
chr1 (38-237)||(22077101-22077311)
chr1 (58-237)||(66100-66278)
chr1 (23-199)||(5575110-5575284)
chr1 (57-238)||(30630648-30630828)
chr1 (21-205)||(41184381-41184583)
chr1 (23-205)||(24131965-24132143)
chr1 (85-214)||(44043810-44043944)
chr1 (53-204)||(22793279-22793431)
chr1 (20-195)||(5528727-5528902)
chr1 (20-205)||(19283429-19283613)
chr1 (36-205)||(22077818-22077986)
chr1 (57-203)||(45839629-45839779)
chr1 (22-205)||(21378035-21378199)
chr1 (47-134)||(11977015-11977102)
chr1 (57-205)||(44685456-44685605)
chr1 (274-395)||(48588340-48588461)
chr1 (34-205)||(1188574-1188746)
chr1 (47-135)||(50051689-50051776)
chr1 (34-205)||(1187349-1187522)
chr1 (23-134)||(47380143-47380254)
chr1 (48-190)||(44091909-44092051)
chr1 (146-223)||(50469180-50469256)
chr1 (87-163)||(10351202-10351278)
chr1 (58-178)||(4956218-4956340)
chr1 (153-254)||(47379891-47379990)
chr1 (158-205)||(35154150-35154197)
chr1 (139-205)||(4878803-4878869)
chr1 (56-238)||(24448245-24448426)
chr1 (111-156)||(41184152-41184197)
chr1 (47-106)||(4266798-4266855)
chr1 (45-205)||(5996870-5997029)
chr1 (90-150)||(35154046-35154106)
chr1 (140-213)||(4266875-4266948)
chr1 (48-164)||(9499020-9499136)
chr1 (301-380)||(11977144-11977224)
chr1 (87-123)||(12466365-12466401)
chr1 (137-196)||(30630912-30630972)
chr1 (86-132)||(9956212-9956258)
chr1 (35-112)||(30697310-30697387)
chr1 (23-65)||(45084576-45084617)
chr1 (220-311)||(3537495-3537587)
chr1 (87-123)||(31973375-31973411)
chr1 (220-268)||(41184198-41184246)
chr1 (69-205)||(50556451-50556587)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (25-395)||(6500634-6501002)
chr5 (21-213)||(6500443-6500634)
chr5 (34-297)||(3295002-3295266)
chr5 (23-205)||(40296292-40296473)
chr5 (22-268)||(624134-624379)
chr5 (23-213)||(27502013-27502202)
chr5 (51-213)||(18603124-18603286)
chr5 (47-213)||(32487386-32487551)
chr5 (47-212)||(41170627-41170792)
chr5 (48-208)||(36492218-36492378)
chr5 (21-202)||(25327938-25328119)
chr5 (23-232)||(26074122-26074330)
chr5 (36-237)||(13415750-13415951)
chr5 (25-238)||(26074577-26074792)
chr5 (47-205)||(15370099-15370257)
chr5 (47-202)||(3295345-3295498)
chr5 (23-203)||(42405574-42405752)
chr5 (25-205)||(41632782-41632961)
chr5 (47-214)||(9498655-9498821)
chr5 (22-203)||(1028492-1028673)
chr5 (35-203)||(6224198-6224366)
chr5 (47-198)||(11416977-11417128)
chr5 (23-205)||(36568545-36568725)
chr5 (47-204)||(299490-299647)
chr5 (51-195)||(34753029-34753173)
chr5 (47-205)||(12662652-12662810)
chr5 (54-203)||(26075168-26075318)
chr5 (35-238)||(24489194-24489394)
chr5 (46-205)||(35150007-35150165)
chr5 (73-238)||(26074807-26074975)
chr5 (47-213)||(623810-623976)
chr5 (34-179)||(15370428-15370573)
chr5 (51-193)||(33747783-33747925)
chr5 (70-208)||(29549278-29549416)
chr5 (67-213)||(5723811-5723957)
chr5 (55-237)||(38427525-38427697)
chr5 (55-205)||(26590918-26591068)
chr5 (49-203)||(300961-301107)
chr5 (73-238)||(36521922-36522086)
chr5 (47-203)||(35167838-35167994)
chr5 (36-202)||(2411010-2411176)
chr5 (47-202)||(35914852-35915007)
chr5 (87-238)||(36522277-36522427)
chr5 (259-379)||(9498496-9498615)
chr5 (130-213)||(7768842-7768925)
chr5 (87-238)||(31509589-31509742)
chr5 (37-119)||(26900007-26900089)
chr5 (110-203)||(42508614-42508707)
chr5 (125-203)||(26074320-26074398)
chr5 (68-202)||(41635212-41635346)
chr5 (48-203)||(13786002-13786157)
chr5 (80-191)||(31509745-31509857)
chr5 (87-138)||(13042606-13042657)
chr5 (47-118)||(38427306-38427377)
chr5 (124-203)||(39309686-39309764)
chr5 (46-147)||(13785631-13785732)
chr5 (69-121)||(795254-795306)
chr5 (67-134)||(9498343-9498410)
chr5 (69-148)||(36527117-36527196)
chr5 (310-396)||(32487575-32487661)
chr5 (110-203)||(42524719-42524811)
chr5 (87-147)||(32445943-32446003)
chr5 (91-138)||(13112604-13112651)
chr5 (170-233)||(13785732-13785794)
chr5 (145-202)||(6225047-6225104)
chr5 (165-213)||(5660290-5660338)
chr5 (80-168)||(19275566-19275653)
chr5 (87-125)||(13042784-13042822)
chr5 (87-125)||(13112782-13112820)
chr5 (163-205)||(35150747-35150789)
chr5 (163-205)||(35151038-35151080)
chr5 (49-147)||(42435486-42435583)
chr5 (266-319)||(795196-795249)
chr5 (51-103)||(24489583-24489635)
chr5 (193-237)||(15370380-15370426)
chr5 (87-138)||(36389016-36389067)
chr5 (93-123)||(5963765-5963795)
chr5 (73-151)||(9510546-9510624)
chr5 (156-213)||(22298956-22299014)
chr5 (71-107)||(795152-795189)
chr5 (51-115)||(5660340-5660405)
chr5 (93-134)||(34103625-34103666)
chr5 (47-100)||(35150810-35150863)
chr5 (93-137)||(41341523-41341567)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (47-395)||(5542625-5542973)
chr2 (49-237)||(37106156-37106344)
chr2 (54-395)||(14745300-14745641)
chr2 (20-213)||(41283448-41283641)
chr2 (47-214)||(36178605-36178772)
chr2 (47-213)||(14745667-14745833)
chr2 (48-395)||(29676711-29677065)
chr2 (47-209)||(37105920-37106082)
chr2 (51-215)||(5543002-5543166)
chr2 (53-233)||(15880233-15880415)
chr2 (98-277)||(36178320-36178498)
chr2 (21-203)||(6421387-6421568)
chr2 (50-205)||(962598-962753)
chr2 (50-237)||(40679632-40679818)
chr2 (21-205)||(42514649-42514832)
chr2 (47-238)||(6422084-6422268)
chr2 (37-237)||(7598577-7598769)
chr2 (47-198)||(15511495-15511646)
chr2 (47-205)||(35580724-35580881)
chr2 (49-238)||(28531316-28531504)
chr2 (47-187)||(36178171-36178311)
chr2 (22-203)||(6712978-6713160)
chr2 (21-205)||(38796591-38796778)
chr2 (54-203)||(36005887-36006035)
chr2 (23-200)||(33731653-33731831)
chr2 (47-238)||(40733482-40733675)
chr2 (23-205)||(37632575-37632755)
chr2 (47-238)||(40733848-40734040)
chr2 (20-213)||(1769884-1770076)
chr2 (66-201)||(28254258-28254391)
chr2 (37-194)||(40163362-40163520)
chr2 (23-192)||(23346250-23346417)
chr2 (46-205)||(7598228-7598387)
chr2 (23-285)||(3673003-3673249)
chr2 (61-203)||(5367457-5367599)
chr2 (97-225)||(31468800-31468926)
chr2 (127-237)||(38796298-38796410)
chr2 (24-143)||(6421793-6421911)
chr2 (98-205)||(16542449-16542556)
chr2 (47-197)||(29676543-29676687)
chr2 (21-235)||(30313147-30313360)
chr2 (57-205)||(12529038-12529186)
chr2 (23-205)||(16590888-16591065)
chr2 (148-268)||(36785664-36785786)
chr2 (88-238)||(30323430-30323581)
chr2 (117-202)||(31899496-31899581)
chr2 (87-238)||(33561491-33561641)
chr2 (35-238)||(29873525-29873729)
chr2 (24-133)||(3672773-3672882)
chr2 (47-203)||(29874023-29874179)
chr2 (93-197)||(37895107-37895211)
chr2 (89-202)||(31259658-31259774)
chr2 (87-237)||(37894732-37894881)
chr2 (51-143)||(6421688-6421780)
chr2 (60-152)||(36784273-36784365)
chr2 (97-224)||(33953821-33953947)
chr2 (98-238)||(41678419-41678559)
chr2 (47-202)||(9231252-9231407)
chr2 (74-204)||(31385738-31385868)
chr2 (100-189)||(28254165-28254254)
chr2 (143-237)||(42514981-42515078)
chr2 (49-202)||(3594180-3594333)
chr2 (34-115)||(31899090-31899170)
chr2 (51-141)||(35580443-35580534)
chr2 (98-202)||(12910231-12910335)
chr2 (157-203)||(6421306-6421352)
chr2 (64-205)||(33954279-33954419)
chr2 (87-163)||(30312831-30312907)
chr2 (92-151)||(25390313-25390372)
chr2 (87-138)||(28226404-28226455)
chr2 (106-163)||(2336666-2336723)
chr2 (87-135)||(8904498-8904546)
chr2 (87-134)||(28226726-28226772)
chr2 (23-101)||(2109988-2110066)
chr2 (316-397)||(7598409-7598491)
chr2 (183-238)||(40734243-40734300)
chr2 (89-138)||(13792536-13792585)
chr2 (169-205)||(3672719-3672755)
chr2 (328-395)||(36178513-36178581)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (47-297)||(37533011-37533259)
chr7 (50-392)||(14681323-14681663)
chr7 (21-205)||(1085591-1085774)
chr7 (86-324)||(22566702-22566940)
chr7 (76-292)||(7553937-7554154)
chr7 (23-205)||(7517580-7517762)
chr7 (21-211)||(29157559-29157749)
chr7 (47-237)||(30244236-30244428)
chr7 (21-213)||(37533339-37533530)
chr7 (47-205)||(23377-23535)
chr7 (22-237)||(30245043-30245255)
chr7 (22-198)||(11845198-11845373)
chr7 (47-203)||(6054562-6054718)
chr7 (35-203)||(45433243-45433411)
chr7 (47-205)||(40094774-40094932)
chr7 (25-205)||(22567017-22567196)
chr7 (55-205)||(36939741-36939891)
chr7 (47-292)||(45434548-45434794)
chr7 (58-203)||(45754718-45754862)
chr7 (57-197)||(19122740-19122879)
chr7 (47-205)||(24177435-24177593)
chr7 (49-199)||(34218036-34218186)
chr7 (21-203)||(47129097-47129277)
chr7 (23-205)||(118277-118459)
chr7 (21-205)||(8128415-8128599)
chr7 (24-205)||(36622960-36623140)
chr7 (47-200)||(30032572-30032725)
chr7 (49-202)||(9901648-9901799)
chr7 (85-205)||(16569196-16569316)
chr7 (85-205)||(16596346-16596466)
chr7 (51-205)||(40230295-40230449)
chr7 (79-232)||(1085280-1085436)
chr7 (70-202)||(24838724-24838857)
chr7 (50-202)||(20599317-20599471)
chr7 (56-205)||(36534795-36534942)
chr7 (47-205)||(41854635-41854792)
chr7 (49-184)||(37167808-37167937)
chr7 (47-163)||(30253534-30253646)
chr7 (23-159)||(28300229-28300366)
chr7 (135-237)||(30244667-30244771)
chr7 (132-234)||(30255308-30255412)
chr7 (53-202)||(41910592-41910749)
chr7 (22-124)||(47129450-47129550)
chr7 (84-205)||(43241495-43241616)
chr7 (132-234)||(30245463-30245567)
chr7 (117-205)||(28301613-28301701)
chr7 (48-122)||(28300569-28300644)
chr7 (137-205)||(36109007-36109075)
chr7 (49-117)||(37532753-37532821)
chr7 (23-104)||(30244453-30244533)
chr7 (23-104)||(30253671-30253751)
chr7 (100-200)||(44361517-44361616)
chr7 (208-283)||(37532822-37532896)
chr7 (87-254)||(37345868-37346036)
chr7 (155-237)||(40094502-40094583)
chr7 (87-138)||(21416181-21416232)
chr7 (21-104)||(30245256-30245338)
chr7 (23-95)||(7517767-7517839)
chr7 (23-95)||(7518033-7518105)
chr7 (88-136)||(23569043-23569091)
chr7 (87-205)||(4124128-4124246)
chr7 (307-395)||(37532897-37532986)
chr7 (168-211)||(14681281-14681324)
chr7 (58-137)||(40094424-40094503)
chr7 (60-122)||(45755010-45755072)
chr7 (93-138)||(21619091-21619136)
chr7 (316-395)||(37533259-37533339)
chr7 (297-345)||(45697753-45697801)
chr7 (47-150)||(37393114-37393216)
chr7 (153-203)||(36967335-36967385)
chr7 (47-163)||(15902342-15902457)
chr7 (93-137)||(27391815-27391859)
chr7 (56-110)||(4719305-4719359)
chr7 (23-69)||(7517982-7518028)
chr7 (316-397)||(28300473-28300554)
chr7 (98-138)||(27598052-27598092)
chr7 (317-378)||(48243356-48243419)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (85-379)||(5181-5477)
scaffold0078 (21-205)||(4982-5166)
[»] chr4 (111 HSPs)
chr4 (47-392)||(18932747-18933102)
chr4 (24-238)||(36629205-36629418)
chr4 (25-215)||(50630731-50630921)
chr4 (21-205)||(25483336-25483519)
chr4 (47-213)||(41370349-41370515)
chr4 (38-213)||(55933113-55933288)
chr4 (34-268)||(44620595-44620830)
chr4 (21-205)||(10245920-10246103)
chr4 (48-268)||(39404334-39404555)
chr4 (50-205)||(54017596-54017751)
chr4 (22-236)||(22027935-22028150)
chr4 (57-233)||(54108888-54109060)
chr4 (21-205)||(3340807-3340990)
chr4 (48-205)||(1731646-1731803)
chr4 (34-203)||(39792845-39793014)
chr4 (47-208)||(50002423-50002584)
chr4 (35-205)||(36608647-36608817)
chr4 (21-203)||(39404020-39404202)
chr4 (57-205)||(52884695-52884844)
chr4 (57-235)||(52884856-52885038)
chr4 (21-205)||(22028340-22028527)
chr4 (48-203)||(34646648-34646803)
chr4 (67-213)||(49880152-49880297)
chr4 (48-202)||(50459724-50459878)
chr4 (47-195)||(54343006-54343147)
chr4 (47-196)||(44620362-44620511)
chr4 (47-203)||(36572021-36572177)
chr4 (38-205)||(22183253-22183420)
chr4 (64-205)||(4955332-4955473)
chr4 (52-237)||(20826186-20826370)
chr4 (47-196)||(44621011-44621160)
chr4 (21-186)||(54936215-54936378)
chr4 (21-205)||(49076805-49076986)
chr4 (21-199)||(20825842-20826020)
chr4 (96-292)||(2740984-2741180)
chr4 (46-237)||(3244448-3244638)
chr4 (37-204)||(16888804-16888971)
chr4 (54-205)||(32941128-32941279)
chr4 (47-242)||(49076449-49076643)
chr4 (46-202)||(49302907-49303065)
chr4 (47-206)||(54108537-54108694)
chr4 (34-205)||(2740700-2740869)
chr4 (47-248)||(3341083-3341286)
chr4 (48-204)||(16889535-16889691)
chr4 (76-190)||(45496820-45496934)
chr4 (50-205)||(4390102-4390257)
chr4 (34-229)||(43174480-43174677)
chr4 (48-237)||(45489331-45489522)
chr4 (47-151)||(23817679-23817783)
chr4 (21-205)||(54741152-54741334)
chr4 (87-203)||(41707503-41707618)
chr4 (82-213)||(6975489-6975620)
chr4 (50-205)||(34004586-34004739)
chr4 (59-203)||(19504707-19504842)
chr4 (50-205)||(51768061-51768216)
chr4 (50-205)||(3700365-3700512)
chr4 (49-159)||(18879852-18879962)
chr4 (47-165)||(43827480-43827597)
chr4 (273-378)||(41370557-41370662)
chr4 (53-154)||(31691203-31691306)
chr4 (139-268)||(44621361-44621492)
chr4 (97-192)||(54017750-54017845)
chr4 (68-203)||(40067045-40067181)
chr4 (47-205)||(28034229-28034387)
chr4 (116-325)||(10246240-10246436)
chr4 (47-184)||(48111696-48111833)
chr4 (47-183)||(3271806-3271947)
chr4 (36-200)||(760194-760356)
chr4 (64-163)||(15841383-15841482)
chr4 (153-213)||(50788087-50788147)
chr4 (139-197)||(44620304-44620362)
chr4 (73-205)||(23556890-23557022)
chr4 (47-199)||(45489712-45489864)
chr4 (47-113)||(43174233-43174299)
chr4 (87-138)||(11197293-11197344)
chr4 (87-202)||(34544107-34544225)
chr4 (49-180)||(39698944-39699077)
chr4 (139-221)||(44620926-44621011)
chr4 (21-142)||(11783526-11783646)
chr4 (21-92)||(23817429-23817498)
chr4 (168-234)||(41370673-41370738)
chr4 (51-125)||(41370738-41370812)
chr4 (117-205)||(11348396-11348484)
chr4 (87-199)||(15841023-15841134)
chr4 (209-268)||(16889315-16889375)
chr4 (87-138)||(10396198-10396249)
chr4 (87-138)||(10396483-10396534)
chr4 (86-138)||(922485-922537)
chr4 (98-137)||(1868119-1868158)
chr4 (56-95)||(19895406-19895445)
chr4 (89-147)||(11706584-11706641)
chr4 (93-139)||(51681604-51681650)
chr4 (303-395)||(3340990-3341083)
chr4 (34-91)||(11702284-11702341)
chr4 (327-395)||(45496734-45496803)
chr4 (91-151)||(2891864-2891924)
chr4 (157-205)||(45050601-45050649)
chr4 (21-77)||(45496678-45496734)
chr4 (51-127)||(50787996-50788072)
chr4 (87-138)||(11197003-11197054)
chr4 (182-213)||(18933103-18933134)
chr4 (107-150)||(45484774-45484817)
chr4 (87-161)||(31249896-31249970)
chr4 (87-129)||(41707279-41707321)
chr4 (317-379)||(2740889-2740953)
chr4 (164-205)||(11706636-11706677)
chr4 (57-94)||(19895533-19895570)
chr4 (316-378)||(20826037-20826101)
chr4 (109-142)||(29802604-29802637)
chr4 (37-77)||(1731581-1731621)
chr4 (87-123)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (47-395)||(147-489)
scaffold0702 (47-203)||(514-670)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (22-237)||(1082-1298)
scaffold0391 (21-158)||(1658-1802)
scaffold0391 (154-238)||(3092-3178)
scaffold0391 (313-395)||(1380-1464)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (56-292)||(5689-5931)
scaffold0734 (56-205)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (89-237)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (47-205)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (128-203)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (73-203)||(39459-39588)
scaffold0113 (80-238)||(39805-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (127-211)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (127-167)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409470
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 3409619  T
Q  247 tgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||     
T  3409618 tgctccccttagagccgaagcttttgactttgcctgtattgccatccctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgccgttgctgctttttacgcaac 3409519  T
Q  347 gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||| ||||||||||||     |||||||||||| | ||||||||||||    
T  3409518 gaccggctgcctcggtcatatacttcgtcgaaccggggctctgatacca 3409470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2377937
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   || | |     
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccc-caaatgtgagtccatttattcatca 2378086  T
Q  247 tgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa 345  Q
    |||| ||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  2378085 tgctcccccttcaagcggaagctctt-agtttacctgtatcattgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtactgctgttgcgactttcttcgcaa 2377987  T
Q  346 tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
     ||||  || ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2377986 cgaccgactacctcggttgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 2377937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518857
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcg 29518879  T
Q  247 tgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||||||| |  ||||||||||    
T  29518878 tgctccccctcaagcggaagct 29518857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 393
Target Start/End: Original strand, 10073989 - 10074336
Alignment:
Q  45 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073989 taggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 10074088  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |     
T  10074089 cttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcaca-caacactccccctcaagtgcgagtctatcaattcat 10074187  T
Q  245 cgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgc 343  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| || || |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||    
T  10074188 catgctcccccttcaagcggaagctctt-ac-ttgcttgtatcgccgttgttgcacaatgagccacttgctgcttgtaccgtcgttgctactttctgcgc 10074285  T
Q  344 aa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatac 393  Q
    || ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10074286 aactgaccggcggcctcggtcgtacccttcttcgaaccggggctctgatac 10074336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518495
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741171
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32741171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35210386 - 35210196
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210386 actgttgggtcactg-ggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaag 35210289  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210288 gcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 2578443 - 2578634
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2578443 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact 2578542  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578543 tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 2578634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 10074352 - 10074553
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10074352 aggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 10074451  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074452 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcaca-caacactcccccttaagtgtgagtcca 10074550  T
Q  236 tca 238  Q
    |||    
T  10074551 tca 10074553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3058409 - 3058218
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058409 tgttggttcggtgaggggagctttgggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 3058310  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058309 caatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16455078 - 16454872
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16455078 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttat 16454979  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgag 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||     
T  16454978 gggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaacactccccctcaactgtgac 16454879  T
Q  232 tccatca 238  Q
    |||||||    
T  16454878 tccatca 16454872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415449
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaacac 3415449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748504
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377756
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 2579848 - 2580030
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2579848 actgttgggtaa-tgaggggagctt-ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaag 2579945  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579946 gctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846741
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 2579478 - 2579678
Alignment:
Q  33 gtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 132  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2579478 gtgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagttta 2579577  T
Q  133 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  2579578 tgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacacctgctaa-caacactctccctcaagtgtgagt 2579676  T
Q  233 cc 234  Q
    ||    
T  2579677 cc 2579678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 2578822 - 2579016
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2578822 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttat 2578921  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtga 230  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2578922 ggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgctca-caacactccccctcaagtgtga 2579016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1127530 - 1127352
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1127530 gaggggagctttggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatg 1127431  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1127430 agtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaaca 1127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16454758 - 16454577
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16454758 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaag 16454660  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454659 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 2579085 - 2579297
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  2579085 actgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaa 2579182  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccc 218  Q
    |  |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  2579183 gttatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaacactccc 2579278  T
Q  219 cctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2579279 cctcaagtgtgagtccatc 2579297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2843713 - 2843560
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttac 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2843713 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttac 2843614  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843613 ttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 10073604 - 10073804
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10073604 gaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatg 10073703  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||    
T  10073704 gatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcaca-caacaccccctcttaagtgtgagtcc 10073800  T
Q  235 atca 238  Q
    ||||    
T  10073801 atca 10073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832182
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||       
T  5832007 ttgggtca-tgaggggagcct-ggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg- 5832103  T
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832104 tggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16107998
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatc 16108021  T
Q  246 gtgctccccttagagcggaagct 268  Q
     ||||||||||  ||||||||||    
T  16108020 atgctccccttcaagcggaagct 16107998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593867
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 131  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  62 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  162 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  197 acac 200  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  151 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 199
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  80 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  180 tgtgggacatataactcaca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 12071666 - 12071849
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12071666 actgttaggtca-tgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 12071764  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |  || |||||||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071765 gtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481893
Alignment:
Q  86 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  186 acatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagtccatca 8481893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 12085021 - 12085191
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12085021 tgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttat 12085120  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||| |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085121 gagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 12092470 - 12092640
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12092470 gaggggggccaaggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 12092569  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092570 gatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958766
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacca 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071098
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacaatcttcccctcaaatgtgagtccatca 6071098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31714849 - 31714671
Alignment:
Q  24 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31714849 gttgggtcattgaggggagtctgggagaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcga-aaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggca 31714751  T
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||| ||||||||||| | |||||    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714750 atgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210456
Alignment:
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgag 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg-----------gcacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgag 35210463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 17135058 - 17135223
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||     
T  17135058 aggggagtctgggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatga 17135157  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 201  Q
     ||||||| |||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135158 atcctcttgcttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975521
Alignment:
Q  89 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 188  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  189 t-ataactcacacttgcaaac-caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    | || ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2975568 taattacttacactt--aaacacaacactccccc-caagtgtgagtgcatc 2975521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29518784 - 29518686
Alignment:
Q  298 acaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||| || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29518784 acaaggagccacttgctgcttgtaccgtcgttgctgctttctgcgcaactaaccggcggtctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 29518686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33606034 - 33605913
Alignment:
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 245  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  33606034 ttataaagtgttcaacctccacttttctattcgatgtgggacatataacttacatttgcacac-atcactccccctcaagtgtgagtccatcaattcacc 33605936  T
Q  246 gtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||| |  ||| |||||||||||    
T  33605935 gtgcccttcttcgagcggaagct 33605913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 30618593 - 30618766
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  30618593 actgttgggtcac-gaggggagccttggggaccacccacatt-aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaag 30618690  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 198  Q
     |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618691 acaa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcctccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  86 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 168
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26544321 - 26544230
Alignment:
Q  306 ccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgataccagt 397  Q
    |||||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  26544321 ccacttgctgtttgtaccagcgttgcggctttctacgcaaataccggctgcctcggtcgcacccttcatcgaaccggggctctaataccagt 26544230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 113  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 395
Target Start/End: Original strand, 2579387 - 2579467
Alignment:
Q  317 ttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat--gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2579387 ttgtaccgccgttgctgctttctgcgcaagtggaccggctgcctcggtcgtaccgttcgtcgaaccggggctctgatacca 2579467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2975354 - 2975296
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 80  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2975354 actgttaggtcactgaggggagtc-agaggactgtccacatcgaggctagaacaaccaca 2975296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 395
Target Start/End: Original strand, 2578730 - 2578810
Alignment:
Q  317 ttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat--gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||   |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2578730 ttgtaacgccgttgctgctttctgcccaagcggaccggctgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 2578810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16107943 - 16107863
Alignment:
Q  317 ttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat--gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16107943 ttgtaccgccgttgctgctttctgcacaaatggaccggctgcctcggtcatacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 16107863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 35210602 - 35210554
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctaga 71  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35210602 ctgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctaga 35210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22304747 - 22304378
Alignment:
Q  28 ggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304747 ggtcagtgaggggaagctagggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg 22304648  T
Q  127 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagt 226  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304647 tgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaacactccccctcaagt 22304548  T
Q  227 gtgagtccatcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgc 325  Q
    |||||||||||  || | | |||| ||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22304547 gtgagtccatctattcatcatgctcccccttcaagcggaagctctt-actttgcttgtatcgtcgttcctgaacaaggagccacttactacttgtacagc 22304449  T
Q  326 tgttgc-ggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22304448 tgttgcttgctttctgcgcaacgaccggctgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 22304378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823515
Alignment:
Q  64 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  164 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcgg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaacactccccttcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc-tagagcgg 4823598  T
Q  264 aagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgc-ggctttctgcgcaa 345  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  4823597 aagctttttactttgcatgtatcgccattcctgcacaaggagccacttgttgcttgtaccaccgttgcttgctttctgcgcaa 4823515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 37990615 - 37990884
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990615 tgttgggtcattgaggagagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37990714  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccc 220  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  37990715 aatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactccccc 37990814  T
Q  221 tcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgtt 292  Q
    |||| ||||||||||||| || | | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37990815 tcaactgtgagtccatcaattcatcatgcccccctca-agcggaagctttt-actttgcatgtatcgccgtt 37990884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41360111
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||  || |     
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgcacacaacaacactcccccttaagtgtgagt-catctattcat 41359959  T
Q  245 cgtgctc-cccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttg--ctacttgtaccgctgttgcggctttctgc 341  Q
    | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||| |||||||||    
T  41359960 catgctctcccttcaagtggaagctctttactttgcctgtatcgccgttcttgcacaaggagccacttgctctgcttgtaccgtcgttgctgctttctgc 41360059  T
Q  342 gcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
     ||| |||| |||||  ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  41360060 acaacgaccggctgc--cggtcgtactcttcgtcgaaccggcgctctgatacca 41360111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773099
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg 248  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtg 15773147  T
Q  249 ctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgc 297  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||    
T  15773146 ctcccccaagagcggaagctttttac-ttgcttgtatcgctgttgctgc 15773099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 54017791 - 54018008
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017791 actgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54017889  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccc 218  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  54017890 gcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaatactccc 54017989  T
Q  219 cctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54017990 cctcaagtgtgagtccatc 54018008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661846
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 244  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacacttacatacaacaacactcccccaaaagtgtgagtccatcactttat 11661910  T
Q  245 cgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagcca 308  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11661909 cgtgctcctcctagagcggaagctttttactttgcatgtatcgccgttgctgcacaaggagcca 11661846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 37990951 - 37991133
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgagggg-agcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990951 actgttgggtca-tgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 37991049  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991050 ggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346947
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15773037 - 15772854
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15773037 actgttgggtca-tgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaa 15772939  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772938 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946524
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 42342362 - 42342546
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42342362 actgttgggtcactaaggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 42342461  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342462 acaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 29644890 - 29645060
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29644890 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 29644989  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644990 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644791
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac---tccccctcaagtgtgagtccatcacttta 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaaaacattcccccctcaagtgtgacttcatcacttta 29644780  T
Q  244 acgtgctcccc 254  Q
     ||||||||||    
T  29644781 tcgtgctcccc 29644791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342283
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 42342283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 12114550 - 12114720
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12114550 gaggggagtctgggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12114649  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114650 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32589861 - 32589704
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589861 ggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32589762  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589761 tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803410
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935124
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaacac 39935124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832532
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgcaca-taacactccgcctcaagtgtgagtccatc 21832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018356
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389062
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 39389062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304141
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacattctccctcaagtgtgagtccatca 22304141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739583
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  150 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52634858 - 52634678
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52634858 actgttgggtcactg-ggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 52634760  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634759 gcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 32462558 - 32462752
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  32462558 gggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttact 32462657  T
Q  147 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32462658 tataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 32462752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612618
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcctc 141  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| ||||||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  142 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50612618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190017
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||    
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577364
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| |    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755396
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 1634291 - 1634473
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1634291 tgttgtgtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagcc 1634389  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634390 aatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 267
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135293
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca-aaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||| |  |||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcacttgtacacaacaaacactcaccatcaagtgtgagt-catcaattcatcgtgctccccctctagcggaagc 3135293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 3135454 - 3135617
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggtcctctta 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3135454 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctta 3135553  T
Q  145 c-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135554 ctaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240118
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcaca-caacactcctcctcaagtgtgagtccatc 9240118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45901873 - 45901715
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  45901873 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttac 45901774  T
Q  146 ttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901773 ttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 53117975 - 53118131
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  53117975 ggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact 53118073  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39914412 - 39914252
Alignment:
Q  45 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39914412 tagggggctgtctacatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctctta 39914313  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914312 tttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8328067 - 8327904
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaac----cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  8328067 aggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctc 8327968  T
Q  142 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327967 ttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304213
Alignment:
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 22304213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726496
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||||    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttact 37726563  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51886714 - 51886553
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||    
T  51886714 agggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttac 51886621  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886620 ttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 22303634 - 22303759
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303634 tgttgagtcagtgaggagaagctagggagaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg 22303733  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22303734 caatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Original strand, 33175635 - 33175820
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||| || ||||||||||   |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  33175635 tgttgggccactgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaag 33175734  T
Q  121 gcaatgggtttat---gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || ||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175735 gctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160702
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 395
Target Start/End: Original strand, 22303759 - 22303929
Alignment:
Q  226 tgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgacttt-gcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccg 324  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22303759 tgtgagtccatcaattcaacgtgttcccctaa-agcggaagctttttacttttgcctgaatcgccgttgctgcacaagaagccacttgctgcttgtaccg 22303857  T
Q  325 ctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22303858 tcgttgctgctttctgcgcaactgaccggcggcctctgtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 22303929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964694
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaa 224  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgcaca-caacactcgccctcaa 47964694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 42584800 - 42584970
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||| |  |||  |||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  42584800 tgttgggtcattgaggagagtcgggggagccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaagac 42584897  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584898 aattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Original strand, 41359467 - 41359575
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41359467 tgttgggtcagcgaggggagtctgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggt 41359566  T
Q  123 aatgggttt 131  Q
     ||||||||    
T  41359567 tatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384435
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  198 cacttgcaaaccaacactc 216  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaacactc 3384435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  81 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 179  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 39336219 - 39336387
Alignment:
Q  35 gaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  39336219 gaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttat 39336315  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336316 ggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 54017522 - 54017636
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  ||||||||    |||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017522 actgttgggtcatagaggggagttagggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54017621  T
Q  121 gcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||||||||    
T  54017622 gcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965073
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| || | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  113 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22304378 - 22304302
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac 96  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304378 actgttgggtcagtgaggggaagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  187 catataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  197 acactt 202  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 163
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  77 cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  58 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 157  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  158 caacct 163  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  95 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  187 catataactcacacttg 203  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 125
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 125  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 7766783 - 7766857
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766783 ggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 138
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  91 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9239996 - 9239940
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacca 78  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9239996 actgttggatca-tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacca 9239940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2300000 - 2299937
Alignment:
Q  181 gtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatcacttta 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2300000 gtgggacatataacccacacttgcaca-caacaatatccccctcaagtgtgagtccatcaattta 2299937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 41360111 - 41360164
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaaca 74  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41360111 actgttaggacagcgaggggagcccggggaaccgtccacatcgaggctagaaca 41360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 142
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  106 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 53577616 - 53577548
Alignment:
Q  328 ttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  53577616 ttgctgctttctgcgcaactgaccggcggcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgggactctgatacca 53577548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3670229 - 3669905
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670229 gaggggagc-tagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatg 3670131  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3670130 ggtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacagtccccctcaagtgtgagtcc 3670031  T
Q  235 atcactttaacgtgctc-cccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcgg 333  Q
    |||| || | | ||||| |||||  ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3670030 atcaattcatcatgctcacccttcaagcagaagctctt-actttgcatgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgttgcttgtaccgttgttgcgg 3669932  T
Q  334 ctttctgcgcaatgaccagctgcctcg 360  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  3669931 ctttctgcgcaacgaccggctgcctcg 3669905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 395
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014219
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct-ccc 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | || |||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcatactcccc 1014078  T
Q  254 cttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagc 353  Q
    |||  |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1014079 cttcaagcggaagctctt-actttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtaccgccgttgcggctttctgcgcaacgaccggc 1014177  T
Q  354 tgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1014178 tgcctcagtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 1014219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9309538 - 9309180
Alignment:
Q  20 aactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9309538 aactgttgggtcactg-ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaa 9309441  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactcc 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  9309440 ggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactcc 9309341  T
Q  218 ccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctact 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    | | |||| |||| ||||    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9309340 ccctcaattgtgagtccatcactttatcgtgctcccc--ccaacagaagttttttacttgctttgtatcactgttgctgcacaaggagccacttgctgct 9309243  T
Q  318 tgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaac 379  Q
    ||| |||  ||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||| ||||||||    
T  9309242 tgtgccgtcgttgttgctttctacgcaactgaccggcggcctcggtcgtaccctccgtcgaac 9309180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3669845 - 3669678
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3669845 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 3669746  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669745 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 3669678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30441255 - 30441071
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441255 gaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 30441156  T
Q  135 ggtcctcttactta----taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 215  Q
    || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441155 ggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 30441071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 3038263 - 3038446
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgag-gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    |||||||||||| |||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3038263 actgttgggtcactgagagggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaa 3038362  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038363 ggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835185
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtg 34835185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835439
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagtc 34835444  T
Q  234 catca 238  Q
    |||||    
T  34835443 catca 34835439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835705
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagtc 34835710  T
Q  234 catca 238  Q
    |||||    
T  34835709 catca 34835705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518550
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaatactccccctcaagtgtgagtccatca 40518550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834878
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 20870550 - 20870741
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20870550 tgttgggtca-tgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaaca 20870741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 271
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121881
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctc 251  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaacactcccccttaagtgtgagtccatcactttatcgtgctc 45121861  T
Q  252 cccttagagcggaagctttt 271  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  45121862 cccccagagcggaagctttt 45121881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918956
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 8918956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30359456 - 30359273
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359456 actgttgggtcattgaggggagctcgagggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 30359357  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359356 ggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014411
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359558
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg 248  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacattccccctcaagtgtgagtccatcaatttatcatg 30359564  T
Q  249 ctcccc 254  Q
    ||||||    
T  30359563 ctcccc 30359558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 45121898 - 45122068
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45121898 gaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatg 45121997  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121998 agtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122604
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat------cacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagt 45122604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6732055 - 6731872
Alignment:
Q  45 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  6732055 taggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta 6731956  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6731955 ctt---------tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaacactccccctcaaatgtgagtccatc 6731872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482784
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtg 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||   | || | |||||||||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcacttgtacacaacaacactccccctcaagtg 9482784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 203
Target Start/End: Original strand, 25561812 - 25561972
Alignment:
Q  44 ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25561812 ctaggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctct 25561911  T
Q  143 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561912 tacttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877021
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9608904 - 9608745
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9608904 agggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttac 9608805  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608804 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45122972
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaacactccccctcaagtgtaagtccatc 45122972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544646
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147454
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514071
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 198  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371863
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa- 18371762  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct 250  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18371763 ---tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacttctacacaacagcactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgcc 18371859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579670
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972158
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 18371968 - 18372142
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctagggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18371968 actgttgggtca-tgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaa 18372066  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372067 agcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 254
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372463
Alignment:
Q  133 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactttcacaacaacactccccctcaagtgtgagt 18372441  T
Q  233 ccatcactttaacgtgctcccc 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18372442 ccatcactttatcgtgctcccc 18372463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147794
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 147794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651476
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta-- 6651555  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 234  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  6651554 -------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataact--cacttgcaaaacaacacctcccctcaagtgtgagtcc 6651476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308977
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  144 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 254
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372905
Alignment:
Q  133 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactttcacaacaacact-ctcctcaagtgtgagt 18372883  T
Q  233 ccatcactttaacgtgctcccc 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  18372884 ccatcactttatcgtgctcccc 18372905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 254
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373139
Alignment:
Q  101 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T
Q  201 t-tgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 254  Q
    | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373085 tgtacacaacaacactccatctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgctcccc 18373139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 201
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305478
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 4154678 - 4154824
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  4154678 cacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgt 4154775  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154776 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  154 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 205  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  68 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  168 tattttatccgatgt 182  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372574
Alignment:
Q  161 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactttcacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgct 18372574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 213
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416335
Alignment:
Q  127 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaaca 41416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  92 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  192 aactcacactt 202  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 4154270 - 4154472
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||| |||| ||| |||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4154270 aggggagtctcggggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgg 4154369  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||   |||||||||||||||||||    
T  4154370 gt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcacatttgcaca-caacaatttccccctcaagtgtgagtc 4154467  T
Q  234 catca 238  Q
    |||||    
T  4154468 catca 4154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41129159 - 41129066
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129159 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  187 catataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 9620666 - 9620834
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||  ||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| |||||||    
T  9620666 gaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatg 9620763  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620764 ggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 130
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579352
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  197 acacttg 203  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 202
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  115 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 202  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 152  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  100 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274775
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 20995404 - 20995497
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 128  Q
    ||||||||||   ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995404 gaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40991920 - 40991756
Alignment:
Q  38 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | | ||||| |||||||||| |  ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991920 gggagcctaggggatcatccacattgggcctagagcaaccacacaggtgagttggacaccaca-tcttaacccaaaaccttgaggcattgggtttatggg 40991822  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991821 tcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 3037942 - 3038016
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgagggg-agcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 94  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037942 actgttgggtcactgagggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  67 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  113 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 169  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 254
Target Start/End: Original strand, 43274699 - 43274776
Alignment:
Q  179 atgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 254  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43274699 atgtgagatatataactcacacttgtacacaacaacactgtccctcaagtgtgagtccatcactttatcgtgctcccc 43274776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 151
Target Start/End: Original strand, 40417733 - 40417820
Alignment:
Q  64 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417733 aggcaagagcaatcacacaagtgagagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Original strand, 18372288 - 18372342
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt 105  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372288 accgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  128 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  106 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290798
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |     
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatctattcatca 44290657  T
Q  247 tgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa 345  Q
    |||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44290658 tgctcccccttcaaggggaagctctt-actttgcctgtatcgtcgttcctgcacaaggagcca--------ttgtaccaccgttgcggctttctgcgcaa 44290748  T
Q  346 tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44290749 caaccggctgcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 44290798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 392
Target Start/End: Original strand, 48588465 - 48588833
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggg-gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588465 ttggttcagtgaggggaactttgggcgaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggca 48588564  T
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 223  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588565 atgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaacactccccctca 48588664  T
Q  224 agtgtgagtccatcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtac 322  Q
    ||||||||||||||  || | | |||| ||||||  |||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48588665 agtgtgagtccatctattcatcatgctaccccttcaagcggaagctctt-attttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtac 48588763  T
Q  323 cgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgata 392  Q
    ||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  48588764 cgtcgttgcagctttctgcacaatgaccggctgcctcagtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgata 48588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 378
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661856
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||  || |     
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactcccccttaagtgtgagtccatctattcat 26661721  T
Q  245 cgtgctc-cccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgc 343  Q
    | | ||| |||||  |||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26661722 catactctcccttcaagcggaagctctt-actttgcatgtatcgtcgttgctgcacaaggagccacttgttgcttgtaccgtcgttgctgctttctgcgc 26661820  T
Q  344 aa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaa 378  Q
    || ||||  || ||||||||||  ||||||||||||    
T  26661821 aattgactggcggcctcggtcgtacccttcgtcgaa 26661856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 44290798 - 44290993
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44290798 actgttgggtcagtggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaa 44290897  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290898 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 44290993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41157545 - 41157311
Alignment:
Q  36 aggggagcctag-gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41157545 aggggagccttgagggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatg 41157446  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41157445 ggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaatactcccccttaagtgtgagt 41157346  T
Q  233 ccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41157345 ccatcaatttatcgtgctcccc-cagagcggaagct 41157311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556071
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  156 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcacttta 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcacttta 37556071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 126 - 395
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537494
Alignment:
Q  126 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 3537325  T
Q  226 tgtgagtccatcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagc--cacttgctacttgtac 322  Q
    ||||||||||||| || | | |||| ||||||  |||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  3537326 tgtgagtccatcaattcatcttgctcccccttcaagcggaagctctttaccttgcatgtatcgtcgttcctgcacaaggagccacacttgctgcttgtac 3537425  T
Q  323 cgctgttgc-ggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||| |||||  |||||||||     ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3537426 cgccgttgcttgctttctgc-----gactaactgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgtggctctgatacca 3537494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759475
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaaca 41759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Original strand, 3537589 - 3537765
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3537589 aggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatag 3537687  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3537688 gtcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaaca 3537765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142372
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34365084 - 34364891
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34365084 agggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 34364985  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364984 ttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 34364891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 22077484 - 22077683
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22077484 aggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgg 22077583  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22077584 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtcca 22077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41157175 - 41156991
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtga-ggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41157175 tgttgggtcactgaaggggagccttgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaa 41157076  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157075 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550712
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaaca 3550712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977251
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacagcaacactccccctcaagtgtgagt 11977251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 31767136 - 31767319
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31767136 actgttgggtca-tgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaag 31767234  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767235 gcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294579
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaacca-cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 45493949 - 45494146
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45493949 actgttgggtcattggggggagc-tgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaag 45494047  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494048 gcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaacac 45494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34364690 - 34364507
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34364690 actgttgggtcactg-ggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 34364592  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364591 gctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798199
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649440
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 50051999 - 50052189
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50051999 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaag 50052096  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052097 aaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051999
Alignment:
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc-ttagagcggaagctttt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | | |||||||| ||  ||| |||||| ||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacattccccctcaagtgtgagtccattaattcatcatgctcccccttcaagcagaagctctt 50051876  T
Q  272 gactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctccctt 371  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  50051877 -actttgccagtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtactgtcgttgcggctttctgcccaaccaccggctgcctcggtcgcgccctt 50051975  T
Q  372 cgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
     |||||||| | ||||||||||||    
T  50051976 tgtcgaaccggggctctgatacca 50051999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9956092 - 9955911
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9956092 actgttgggtcac-gaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaag 9955994  T
Q  121 gcaatgggttt-atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 201  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955993 gcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082408
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 32168674 - 32168853
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcct-aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32168674 tgttgggtcact-aggggagccttaggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaagg 32168772  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168773 caatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  79 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  179 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084382
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45084557 tgttgggtca-tgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagac 45084459  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084458 g------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875489
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 37850588 - 37850758
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  || | |||||||    
T  37850588 tgaggggagc-taggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttat 37850686  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850687 gggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 208
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  62 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  162 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 208  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  70 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  170 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 66447 - 66630
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  66447 actgttgggtca-tgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaag 66545  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66546 gccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600472
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066358
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 22077101 - 22077311
Alignment:
Q  38 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22077101 gggagcctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggt 22077200  T
Q  138 cctcttacttataaggtgttcaacctttact----------attt--tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaag 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22077201 cctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgattttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaag 22077299  T
Q  226 tgtgagtccatc 237  Q
    |||| |||||||    
T  22077300 tgtgtgtccatc 22077311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 237
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66278
Alignment:
Q  58 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 157  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  158 c-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    | |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgcaca-caacacttcccctcaagtgtgagtccatc 66278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5575284 - 5575110
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5575284 tgttgggtcactgaggagagtctgggggacattccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagc 5575187  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575186 tatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630828
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgcaca-taacactccctctcaagtgtgagtccatca 30630828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 41184381 - 41184583
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac---cacactcttacccaaaac-- 114  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||      
T  41184381 actgttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaacct 41184480  T
Q  115 ------------cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41184481 taaggctgaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 41184580  T
Q  203 gca 205  Q
    |||    
T  41184581 gca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132143
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  24131965 tgttgggtca-tgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggc 24132060  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132061 aatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043944
Alignment:
Q  85 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  179 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaacac 44043944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  152 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 5528727 - 5528902
Alignment:
Q  20 aactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |  ||||  | |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5528727 aactgttgggtcaggaaggggagtccggggggtcatccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaa 5528826  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528827 gaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 19283429 - 19283613
Alignment:
Q  20 aactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19283429 aactattgggtca-tgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaa 19283527  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283528 ggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077986
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  157 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 21378035 - 21378199
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||                   
T  21378035 ctgttgggtcactg-ggggagcgcaggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta--------------- 21378118  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378119 ---tgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977015
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  156 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 395
Target Start/End: Original strand, 48588340 - 48588461
Alignment:
Q  274 ctttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||    
T  48588340 ctttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgttgtttgtatcgtcgttgcggctttctgcgcaacaaccggctgcctcggttgcacccttcg 48588439  T
Q  374 tcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    | ||||| |  |||||||||||    
T  48588440 ttgaaccgggactctgatacca 48588461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 1188574 - 1188746
Alignment:
Q  34 tgaggggagcc-taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 132  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1188574 tgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagttta 1188673  T
Q  133 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188674 tgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 135
Target Start/End: Original strand, 50051689 - 50051776
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051689 ggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 1187349 - 1187522
Alignment:
Q  34 tgaggggagc-ctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | || |  ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  1187349 tgaggggagctctaggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagttt 1187448  T
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1187449 atgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 134
Target Start/End: Original strand, 47380143 - 47380254
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  47380143 tgttgggtcaattaggggagtctaggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggc 47380242  T
Q  123 aatgggtttatg 134  Q
    |||| |||||||    
T  47380243 aatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 190  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 223
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469256
Alignment:
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctca 50469256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  58 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||| || | ||| | ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccg 178  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379990
Alignment:
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcc 252  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgc--atcaacactccccctcaaatgtaagtccaacaattcatcgtgctcc 47379988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  158 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24448426 - 24448245
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || |||  ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||    
T  24448426 ccacatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatg 24448327  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||| |  ||| || | |  |||||   |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24448326 ttcaacttccacttttctttgagatgtctaacatataacttacacttgcacac-aacactccccctcaattgtgagcccatca 24448245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  111 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Original strand, 5996870 - 5997029
Alignment:
Q  45 taggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  5996870 taggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctca 5996968  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     ||||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996969 tttataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  90 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  140 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  148 ataaggtgttcaacctt 164  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11977224 - 11977144
Alignment:
Q  301 aggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacc 380  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11977224 aggagccacttgctgcttgtaccgtcgttgctgctttctgcgcaactgaccgacggcctcggtcgtacccttcgtcaaacc 11977144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 132
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  86 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30697387 - 30697310
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttacccaaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30697387 gaggggagcct-ggggaccgcccacatctaggccatagcaaccacgcaaagtgagagagacaccacactcttacccaaa 30697310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45084617 - 45084576
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgag 65  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45084617 tgttgggtca-tgagggaagcctaggggaccgtccacatcgag 45084576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 3537495 - 3537587
Alignment:
Q  220 ctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc-ttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccactt 311  Q
    |||||||||||||||||||  | | | |||||||| ||  |||||||||| || || |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3537495 ctcaagtgtgagtccatcaaatcatcatgctcccccttcaagcggaagctctttaccttgcatgtgtcgtcgttcttgcacaaggagccactt 3537587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Original strand, 41184198 - 41184246
Alignment:
Q  220 ctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  41184198 ctcaagtgtgagtccatcacttcatcgtgctccccctcaagcggaagct 41184246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 50556587 - 50556451
Alignment:
Q  69 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 168  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| |||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||   ||    
T  50556587 agaacaatcacacaagtgagagagataccaaacttttattcaaaaccttaagaaaataggtttacggattctctcacttataaattgttcaacctccgct 50556488  T
Q  169 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     || |||  |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  50556487 tttctatatgatgtgtgatatataacccacacttgca 50556451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6501002 - 6500634
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6501002 ttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaa 6500903  T
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaa 224  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6500902 tgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccatcaa 6500804  T
Q  225 gtgtgagtccatcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtacc 323  Q
    |||||||||||||  || | | |||| ||||||  || ||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  6500803 gtgtgagtccatctattcatcatgctcccccttcaaggggaagctctt-actttg-ctgtatcggcgttcctacataaggagccacttgctgcttatacc 6500706  T
Q  324 gctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  6500705 gccgttgcggctttctgcgcaacgactggctgcctcggttgcacccttcgtcgaaccggaactctgatacca 6500634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6500634 - 6500443
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500634 actgttgggtaagtgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 6500535  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500534 gcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Original strand, 3295002 - 3295266
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3295002 tgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttat 3295101  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac----caacactccccctcaagtgtg 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  3295102 gggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgcacacacaacaacactccccctcaagtgtg 3295200  T
Q  230 agtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgc 297  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||    
T  3295201 agtccatcactttttcgtgctcccccttaagcggaagctctt-ac-ttgcttgtatcgccgttgctgc 3295266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 40296292 - 40296473
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40296292 tgttgggtca-tgagggaggcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggc 40296390  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296391 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 624379 - 624134
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| |  |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  624379 ctgttgggtcactagggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaagg 624280  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccct 221  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  624279 ctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacacttcccct 624180  T
Q  222 caagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    ||||||||| ||||||  || | | ||||||||||  ||||||||||    
T  624179 caagtgtga-tccatctattcatcatgctcccctttaagcggaagct 624134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 27502013 - 27502202
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27502013 tgttgggtca-tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggc 27502111  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502112 aataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 27502202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603286
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaaca 18603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487386
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170627
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25328119 - 25327938
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328119 actgttgggtcactgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 25328020  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328019 gcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 26074122 - 26074330
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074122 tgttgggtcagagaggggagctttggggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 26074221  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctc 222  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26074222 aatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaca-caacactccccctc 26074320  T
Q  223 aagtgtgagt 232  Q
    ||||||||||    
T  26074321 aagtgtgagt 26074330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Original strand, 13415750 - 13415951
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13415750 aggggagccacggggaccg-ccatttcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgg 13415848  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||    
T  13415849 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacagcact-cccctcaagtgtgagtc 13415947  T
Q  234 catc 237  Q
    ||||    
T  13415948 catc 13415951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26074792 - 26074577
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074792 ttgggtcagagaggggagctttagggatcacccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 26074693  T
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  26074692 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgtacacaaaaacactccccctc 26074593  T
Q  223 aagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  26074592 aagtgtgagtccatca 26074577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370099
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 3295345 - 3295498
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295345 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact 3295443  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Original strand, 42405574 - 42405752
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405574 tgttgggtcactggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggc 42405671  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    | | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405672 attaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41632961 - 41632782
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  41632961 ttgggtcattaaggggagc-tgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcat 41632863  T
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632862 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 9498655 - 9498821
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498655 ggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 9498753  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9498754 tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaacac 9498821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 1028492 - 1028673
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1028492 ctgttgggtcactgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaagg 1028591  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
      || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028592 ttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6224366 - 6224198
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  6224366 gaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatg 6224267  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224266 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 36568545 - 36568725
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36568545 tgttgggtcattgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggc 36568642  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568643 aatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 299647 - 299490
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  299647 ggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttact 299548  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299547 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662810
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 203
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 24489194 - 24489394
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24489194 gaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatg 24489293  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 234  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489294 ggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaacactccccctcaagtgtgagtcc 24489390  T
Q  235 atca 238  Q
    ||||    
T  24489391 atca 24489394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35150165 - 35150007
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35150165 aggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttac 35150067  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150066 ttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074975
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 171  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  172 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 26074975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623810
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15370573 - 15370428
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15370573 tgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttat 15370474  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370473 gggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 193  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 208
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  70 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 169  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  170 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 208  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723957
Alignment:
Q  67 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  167 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5723957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427525
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcaca---------caacactccccctcaagtgtgagtccatc 38427525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591068
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300961
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        ||||||||||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttactta 301016  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522086
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactcacacttgcgca-caacactctccctcaagtgtgagtccatca 36522086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35167994
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2411176 - 2411010
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2411176 aggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgg 2411077  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411076 gttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35915007 - 35914852
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||| || | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  35915007 ggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttact 35914908  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914907 tataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522427
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  187 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  36522377 catataactcacactttcata-caacactccccctcaattgtaaatccatca 36522427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Original strand, 9498496 - 9498615
Alignment:
Q  259 agcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcct 358  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  9498496 agcggaagctctt-actttgcatgtatcaccgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtagcgccgttgcagctttctgcgcaacgaccggctgcct 9498594  T
Q  359 cggtcgctcccttcgtcgaac 379  Q
    ||||||  ||||| |||||||    
T  9498595 cggtcgtaccctttgtcgaac 9498615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768842
Alignment:
Q  130 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaaca 7768842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509589
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 185  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  186 acatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgcaca-caacaatctctccctcaagtgtgagtccatca 31509589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 119
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  110 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 202
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  68 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 167  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  168 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 13786002 - 13786157
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| || |  ||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  13786002 gggaccgtcgacaacgaggccagaacaatcataatagtgagagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttactt 13786101  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttg 203  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  13786102 ataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  80 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 178  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  179 atgtgggacatat 191  Q
    ||||| |||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 118  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 13785631 - 13785732
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||    
T  13785631 aggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattac 13785730  T
Q  146 tt 147  Q
    ||    
T  13785731 tt 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  69 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  67 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 148
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  69 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32487661 - 32487575
Alignment:
Q  310 ttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgataccag 396  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32487661 ttgctgcttgtaccgccgttgcggctttctgcacaacgatcggctgcctcagtcgcacccttcgtcgaatcggggctctgataccag 32487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  110 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  91 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785794
Alignment:
Q  170 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacacttccaca-caacactccccctcaaatgtgagtc 13785794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  165 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  80 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 168  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  163 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  163 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 319
Target Start/End: Original strand, 795196 - 795249
Alignment:
Q  266 gcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttg 319  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  795196 gctttttactttgtctgtatcaccgttgctgcacaaggagccacttgctgcttg 795249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactc 103  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15370426 - 15370380
Alignment:
Q  193 actcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370426 actcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 15370380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Original strand, 9510546 - 9510624
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9510546 caaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataa 9510624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299014
Alignment:
Q  156 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaaca 22299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Original strand, 795152 - 795189
Alignment:
Q  71 aacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttac 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  795152 aacaaccacacaaagcaagagagacaccacactcttac 795189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5660405 - 5660340
Alignment:
Q  51 accgtccacatc-gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660405 accgtccacatttgaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35150863 - 35150810
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  35150863 ggggaccatccacatcgaggctaaaacaatcacactagtgagagagacaccaca 35150810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 5542625 - 5542973
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5542625 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 5542724  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |     
T  5542725 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatctattcatca 5542824  T
Q  247 tgc-tccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa 345  Q
    ||| |||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5542825 tgcttccccttcaagcggaagc-tctaactttgcctgtatcgctgttcctgcacaaggagccacttgttgcttgtaccgccgttgcggctttctgcacaa 5542923  T
Q  346 tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
     ||||  |||||||||| ||   | ||||||||||   ||||||||||||    
T  5542924 cgaccgactgcctcggttgcattcgtcgtcgaaccgaagctctgatacca 5542973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106156
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 37106156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745641
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct-c 251  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  || | | |||| |    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaacact-cccctcaagtttgagtacatctattcatcatgctcc 14745498  T
Q  252 cccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgacca 351  Q
    |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| || || |     
T  14745499 cccttcaagcggaagctctt-actttgtctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgttgcttgtactgtcgttgcggctttctgcgtaacgatcg 14745597  T
Q  352 gctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  14745598 gctgccttggtcgcacccttcatcgaaccggggctctgatacca 14745641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 41283448 - 41283641
Alignment:
Q  20 aactgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41283448 aactgttgggtaagtgaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaa 41283547  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283548 ggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178772
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaacac 36178772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745833
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676711
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 142  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  143 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcact 240  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaacacaccccctcaagtgtgagtccatcact 29676866  T
Q  241 ttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctg 340  Q
    ||| ||||||||||  ||| ||||||||||| || |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||    
T  29676865 ttatcgtgctccccccagaccggaagctttttac-ttgcttgtatttccgttgctgcacaaggagccacttgctgcttgtactgtcgttgttgctttctg 29676767  T
Q  341 cgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||| ||| | || ||||| |||   |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  29676766 cgcaactgatcggcggcctcagtcatacccttcgttgaaccggggctctgatacca 29676711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105920
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacc 37105920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543166
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 5543166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880233
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacacttccccttaagtgtgagtc 15880233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178498
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  198 cacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgacttt 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaacagtccccctcaagtgtgagtccatcactttaatgtgttcccc-tagagcggaagctttttacttt 36178498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6421568 - 6421387
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6421568 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaag 6421470  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421469 gcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962598
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679818
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtccatc 40679818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42514832 - 42514649
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42514832 actgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaag 42514734  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514733 gcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6422268 - 6422084
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6422268 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat 6422169  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||      ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggaca------tcacatttgcaca-caagactccccctcaagtgtgagtccatca 6422084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7598769 - 7598577
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||    
T  7598769 ggggagcccagtgggccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatggg 7598678  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7598677 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaacactccctctcaagtgtgagtccat 7598578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 198  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580881
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 238
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531504
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca-caacactccccctcaagtgtgagtccatca 28531504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 187
Target Start/End: Original strand, 36178171 - 36178311
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36178171 ggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttact 36178270  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6713160 - 6712978
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaag 120  Q
    ||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  6713160 ctgttggatcagtgagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaa 6713061  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713060 gcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 38796591 - 38796778
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctagg--ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaacct 116  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  38796591 actgttgggtcattg-ggggagccttggagggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaacct 38796689  T
Q  117 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796690 taaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 203
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006035
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33731831 - 33731653
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33731831 tgttgggtcaccgaggggagctttggaggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 33731732  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731731 caataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733482
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataacacttcccctcaagtgtgagtctatca 40733482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 37632575 - 37632755
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  37632575 tgttgggacactgaggggagcc-agggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagt 37632672  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632673 tatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733848
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | |||||||||    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttact 40733942  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataacactccccctcaagtgtgagtccatca 40733848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1770076 - 1769884
Alignment:
Q  20 aactgttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    
T  1770076 aactgttgggtcattg-ggggagc-taggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttca 1769979  T
Q  119 aggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769978 aagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  66 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 165  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  166 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 201  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Original strand, 40163362 - 40163520
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| ||||    
T  40163362 ggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgg 40163461  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163462 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23346417 - 23346250
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23346417 tgttgggtca-tgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggc 23346319  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 192  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346318 tatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7598387 - 7598228
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  7598387 aggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttat 7598288  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598287 ttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3673249 - 3673003
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3673249 tgttgggtcactg-ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagc 3673151  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccc 220  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||                 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  3673150 aatgagtttatggatcctcttacttataa-----------------attttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactcctcc 3673068  T
Q  221 tcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccc-cttagagcggaagcttttgactttgcctgtat 285  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3673067 tcaagtgtgagtccatcaattcatcatgctccctcttcaagcggaagctttt-actttgcatgtat 3673003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  61 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 160  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  161 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468926
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  197 acacttgcaaac--caacactccccctcaag 225  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaacactccccctcaag 31468926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796410
Alignment:
Q  127 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaa 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaa 38796397  T
Q  225 gtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||    
T  38796398 gtgtgagtccatc 38796410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  24 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtca-tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 6421813  T
Q  124 atgggtttatgggtcctctt 143  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6421812 ataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  198 cacttgca 205  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30313360 - 30313147
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30313360 actgttgggtcac-gaggagagcccgggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaag 30313262  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccc 218  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||  || ||    
T  30313261 gcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgcaca-caacaatcttcc 30313164  T
Q  219 cctcaagtgtgagtcca 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  30313163 cctcaagtgtgagtcca 30313147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16591065 - 16590888
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  |||||||||||||    
T  16591065 tgttgggtcattgaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggc 16590966  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590965 aatgtgtttatgggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785786
Alignment:
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctaaagtgtgagtccatcaattcatc 36785763  T
Q  246 gtgctccccttagagcggaagct 268  Q
     |||||||| |  ||||||||||    
T  36785764 atgctccccctcaagcggaagct 36785786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323430
Alignment:
Q  88 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  188 atataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagtccatca 30323430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  117 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561641
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  187 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgcaca-caacattccccatcaagtgcgtgtccatca 33561641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873729
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||  | |||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca--ctccccctcaagtgtgagt 232  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgcaca-caacaatctccccctcaagtgtgagt 29873723  T
Q  233 ccatca 238  Q
    ||||||    
T  29873724 ccatca 29873729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3672882 - 3672773
Alignment:
Q  24 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| |  ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3672882 gttgggtcactagggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 3672783  T
Q  124 atgggtttat 133  Q
    ||||||||||    
T  3672782 atgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 29874023 - 29874179
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| ||||||| |||| | | ||||| ||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  29874023 ggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaat 29874122  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874123 tataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  193 actca 197  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  89 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  186 acatataactcacactt 202  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894881
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  187 catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  37894832 catataactcacatttgcaca-caatactcccccttaagtatgagtccatc 37894881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 143  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 152
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  60 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 152  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 224
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953947
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  197 acacttgcaaaccaacactccccctcaa 224  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  33953921 acatttgcaca-caacactccccctcaa 33953947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678559
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  196 cacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41678518 cacacttgcaca-caacactccccttcaagtgtgagtccatca 41678559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385738
Alignment:
Q  74 aaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 173  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  174 atccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    | |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  100 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 189  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42514981
Alignment:
Q  143 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga----catataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacatacatataactcacacctgcaca-caacactccccctcaaatgtgagtccatc 42514981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Original strand, 31899090 - 31899170
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 115  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899090 tgaggggagctt-ggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 141
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580534
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  198 cactt 202  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 33954279 - 33954419
Alignment:
Q  64 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||    
T  33954279 aggccagaacaaccatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacct 33954377  T
Q  164 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954378 caacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  92 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  106 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 2110066 - 2109988
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 101  Q
    |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| ||| ||||||    
T  2110066 tgttgggttactgaggggagtcagggggaccgtccacatcgagactagagcaatcatacaagcgagagggacgccacac 2109988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7598491 - 7598409
Alignment:
Q  316 cttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatg-accagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgataccagt 397  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7598491 cttgtaccgtcgttgctgctttctgcgcaacggaccggctacctcagtcgtacccttcgtcgaacctgggctttgataccagt 7598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40734300 - 40734243
Alignment:
Q  183 gggacatataactcacacttgcaaacca--acactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40734300 gggacatataactcacacttgtacacaataacactccccctcaagtgtgattccatca 40734243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 138
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  89 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  169 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 395
Target Start/End: Original strand, 36178513 - 36178581
Alignment:
Q  328 ttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36178513 ttgctgctttctgcgcaactgaccggtggccttggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 36178581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533259
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagcgtgagtccatcactttaacg 37533209  T
Q  247 tgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgc 297  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  37533210 tgttcccc-tagagcggaagctttttactttgtctgtatcgccgttgctgc 37533259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 50 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681323
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatctattcatcatgc 14681466  T
Q  250 t--ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatg 347  Q
    |  ||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||      
T  14681465 tccccccttcaagcggaagctctt-actttgcatgtatcgcc-ttcctgcataaggagccatttgctgtttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaaca 14681368  T
Q  348 accagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgata 392  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||    
T  14681367 accggctgcctcggtcgcacccttcatccaaccggggctctgata 14681323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 1085591 - 1085774
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1085591 actgttgggtca-tgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaag 1085689  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085690 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 324
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566940
Alignment:
Q  86 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  186 acatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgt 283  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||    
T  22566801 acatattactcacacttgcatacaacaacactccccctcaaatgttagtctatcactttatcgtgctccccccagagcggaagctttttac-ttgcttgt 22566899  T
Q  284 atcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccg 324  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566900 attgtcgttgctgcacaaggagccacttgcttcttgtaccg 22566940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7553937
Alignment:
Q  76 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  176 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||| || |    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcgtgctccccctcaagcggaagctctt-a 7553956  T
Q  274 ctttgcctgtatcgccgtt 292  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  7553955 ctttgcatgtgtcgccgtt 7553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7517762 - 7517580
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517762 tgttgggttactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 7517663  T
Q  123 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517662 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29157749 - 29157559
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157749 actgttgggtcagtgaggagagtctgggagaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 29157650  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157649 gcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244236
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtgagttcatc 30244236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 37533339 - 37533530
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533339 actgttgggtcac-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 37533437  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533438 gcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23535
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30245255 - 30245043
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    |||||||||||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245255 ctgttgggtcac-gaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 30245161  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactcccc 219  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  30245160 caatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacactcccc 30245061  T
Q  220 ctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||| |||||||||    
T  30245060 ctcaagtgcgagtccatc 30245043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11845373 - 11845198
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| || |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11845373 ctgttgggtcactg-ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagg 11845275  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845274 caatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054562
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433243
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094932
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Original strand, 22567017 - 22567196
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 124  Q
    |||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22567017 ttgggtcgttgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaa 22567116  T
Q  125 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567117 tgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  55 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434548
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |  || ||||| ||||||||||||| ||| || | |     
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaacacccccccaagtgtgagtccttcaattcatca 45434595  T
Q  247 tgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgtt 292  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||    |||| ||||||||||||    
T  45434594 tgctcccccttcaagcggaagcttttttacttgcttgtatcgccgtt 45434548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  58 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  158 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177435
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218186
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47129277 - 47129097
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  47129277 actgttggatca-tgaggggagc-tcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaa 47129180  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129179 gcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 118277 - 118459
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  118277 tgttgggtcactg-ggggagcct-ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacg 118374  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118375 gtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 8128415 - 8128599
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8128415 actgttgggttagtgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaag 8128514  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128515 gttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622960
Alignment:
Q  24 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtca-tgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggca 36623042  T
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623041 atggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032572
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  85 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  185 gacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 205
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  85 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  185 gacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230449
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    || |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 232
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085436
Alignment:
Q  79 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 178  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  179 atgtgggacat-ataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    || |||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgcacacaacaacactccccttcaagtgtgagt 1085436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  70 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  169 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854635
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167808
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||      
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact-- 37167840  T
Q  149 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 184  Q
         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167839 ----ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30253646 - 30253534
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30253646 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 30253551  T
Q  147 tataaggtgttcaacct 163  Q
    |||||||| ||||||||    
T  30253550 tataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Original strand, 28300229 - 28300366
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||||||||| | ||||||| |  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  28300229 tgttgggtcaataaggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggc 28300328  T
Q  123 aatgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttca 159  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28300329 aatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244667
Alignment:
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagt 30244672  T
Q  233 ccatc 237  Q
    |||||    
T  30244671 ccatc 30244667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255308
Alignment:
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtg 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtg 30255313  T
Q  230 agtcc 234  Q
    |||||    
T  30255312 agtcc 30255308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  145 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 47129550 - 47129450
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129550 ctgttgggtca-tgaggggagc-tcggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 47129453  T
Q  122 caa 124  Q
    |||    
T  47129452 caa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  84 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 183  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  184 ggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245463
Alignment:
Q  132 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtg 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacagtccccctcaagtgtg 30245468  T
Q  230 agtcc 234  Q
     ||||    
T  30245467 tgtcc 30245463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 205
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  117 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 117
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 30244533 - 30244453
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244533 tgttgggtca-tgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 30253751 - 30253671
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253751 tgttgggtca-tgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  100 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 37532822 - 37532896
Alignment:
Q  208 ccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  37532822 ccaacactccccctcaagtgtgagtccttcactttaacgtgttcccc-tatagcggaagctttttactttgcctgt 37532896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345868
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  187 c--atataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctcccc 254  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgcaca-caacactccccttcaagtgtgagttcatcaattcatcgtgctcccc 37345868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094583
Alignment:
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcaca-caacactcctcctaaagtgtgagtccatc 40094583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 30245338 - 30245256
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 104  Q
    |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245338 actgttgggtca-taaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7517839 - 7517767
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 95  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517839 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7518105 - 7518033
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 95  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518105 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  88 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  187 catataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 395
Target Start/End: Original strand, 37532897 - 37532986
Alignment:
Q  307 cacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37532897 cacttgctgcttgtacagtcgttgctgctttctgcgcaactgaccggcggcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 37532986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  168 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  58 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  60 atcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 395
Target Start/End: Original strand, 37533259 - 37533339
Alignment:
Q  316 cttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37533259 cttgtaccgtcgttgctgctttctacgcaactgaccggcggcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 37533339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45697801 - 45697753
Alignment:
Q  297 cacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45697801 cacaaggagccacttgcttcttgtaccgccgttgctgctttctgcgcaa 45697753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393114
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatcttact 37393118  T
Q  147 tata 150  Q
    ||||    
T  37393117 tata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15902457 - 15902342
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||  | | |||    
T  15902457 ggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcact 15902359  T
Q  147 tataaggtgttcaacct 163  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15902358 tataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 110
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccca 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7518028 - 7517982
Alignment:
Q  23 tgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggcta 69  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  7518028 tgttgggtcactgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggcta 7517982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 397
Target Start/End: Original strand, 28300473 - 28300554
Alignment:
Q  316 cttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat-gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgataccagt 397  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  28300473 cttgtaccgtcgttgctgctttctgcgcaatggaccgactgcctcggtcgtacccttcgtcgaatcag-gctctgataccagt 28300554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 378
Target Start/End: Original strand, 48243356 - 48243419
Alignment:
Q  317 ttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa--tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaa 378  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  48243356 ttgtaccgccgttgctgctttctgcgcaaacggaccggctgcctcggtcgtacccttcgtcgaa 48243419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 85 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5181
Alignment:
Q  85 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  185 gacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcct 281  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgcacacaacaaaactctccctcaagtgtgagtccatcagttcatcgtgctcccccttcaagcggaagctctt-actttgcct 5279  T
Q  282 gtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  5278 gtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtaccgccgttgctgctttctgcgcaacgaccagctgcctcgatcgtacctttcgtcgaac 5181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5166 - 4982
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||| |  |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5166 actgttgggtcacttaggggagaaaagggaatggtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataag 5067  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5066 gcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 111)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 392
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18933102
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttat-----------ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggaccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaacac-ccccctcaagtgtgagtcta 18932945  T
Q  236 tcactttaacgtgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggc 334  Q
    ||  || | | |||| ||||||  ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  18932946 tctattcatcatgctcccccttcaagcggaaactctt-attttacctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtaccgccgttgcgac 18933044  T
Q  335 tttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgata 392  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||    
T  18933045 tttctgcacaaccaccggctgcctcggtcgcacacttcgtcgaaccggggctctgata 18933102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36629418 - 36629205
Alignment:
Q  24 gttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629418 gttgggtcattgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 36629319  T
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctca 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  36629318 atgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg-aacacaacactccccctca 36629220  T
Q  224 agtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||| ||||||    
T  36629219 agtgtgagcccatca 36629205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 50630731 - 50630921
Alignment:
Q  25 ttgggtcagtgaggggagcctagg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630731 ttgggtcagtgaggggag-ctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 50630829  T
Q  124 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50630830 atgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaacact 50630921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25483519 - 25483336
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483519 actgttgggtcactg-ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 25483421  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483420 gcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370349
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41370349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933288
Alignment:
Q  38 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 55933212  T
Q  138 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933213 cctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaaca 55933288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44620830 - 44620595
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  44620830 tgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttat 44620732  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgag 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||||||    
T  44620731 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacgacactccacctcaagtgtgag 44620632  T
Q  232 tccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    ||||||| || | ||||||||||  | ||||||||||    
T  44620631 tccatcaattcatcgtgctcccccaaaagcggaagct 44620595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10246103 - 10245920
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246103 actgttgggtcagcgaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaag 10246004  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10246003 gctttgggtttat-ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404334
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaac 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacactcctcctcaagtgt-agtccatcaattcatc 39404357  T
Q  246 gtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||||| || |  ||||||||||    
T  39404356 gtgctctccctcaagcggaagct 39404334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017751
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 22027935 - 22028150
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22027935 ctgttgggtca-tgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaagg 22028033  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactcccc 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| || |    
T  22028034 caatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaacacccctc 22028133  T
Q  220 ctcaagtgtgagtccat 236  Q
    || ||||||||||||||    
T  22028134 cttaagtgtgagtccat 22028150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108888
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 156  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggac--ataactgacacttgcaca-caacactcccccttaagtgtgagtc 54108888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3340990 - 3340807
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340990 actgttgggtcactg-ggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaag 3340892  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340891 gcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 203
Target Start/End: Original strand, 39792845 - 39793014
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39792845 tgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttac 39792944  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792945 ggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002423
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 208  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 205
Target Start/End: Original strand, 36608647 - 36608817
Alignment:
Q  35 gaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 134  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36608647 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatg 36608746  T
Q  135 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608747 gatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39404202 - 39404020
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39404202 actgttggattagtgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaat 39404103  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404102 gctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 155  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  156 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884856
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtcca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact-cccctcaagtgtgagtcca 52884856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 22028340 - 22028527
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctagggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22028340 actgttgggtcagtgaggggagctttgggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaa 22028439  T
Q  120 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028440 gacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49880297 - 49880152
Alignment:
Q  67 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 166  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880297 ctagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 49880199  T
Q  167 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880198 ctattttattcaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 22183253 - 22183420
Alignment:
Q  38 gggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183253 gggagtctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22183352  T
Q  138 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183353 ccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  64 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  164 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826186
Alignment:
Q  52 ccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  152 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca-tttctacataacactccccctcaagtgtgagtccatc 20826186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54936378 - 54936215
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| || |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936378 actgttgggtcactg-ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 54936281  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936280 gcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 49076805 - 49076986
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49076805 actgttgggtca-tgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaag 49076902  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076903 gttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20826020 - 20825842
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826020 actgttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaag 20825921  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    || |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825920 gctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2740984
Alignment:
Q  96 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  196 cacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg--ctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgtt 292  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||  ||||||||  |||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  2741080 cacacttgcaca-taacactccccttcaagtgtgagtccatcaattcatcatgctctccccttcaagcggaagctctt-actttgctcgtatcgccgtt 2740984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244638
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcaca-caacactctcccttaagcgtgagtccatc 3244638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Original strand, 16888804 - 16888971
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 136  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||    
T  16888804 ggggagcttaggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttatagg 16888903  T
Q  137 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888904 ttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  54 gtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 242
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076643
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcacttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaacaacactcctcctcaagtgtgagtccatcacttt 49076643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  46 aggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  146 --ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 202  Q
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108537
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctcttac 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  146 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740700
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    ||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341083
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa 244  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacactctgcctcaagtgtgagtccatcactttat 3341087  T
Q  245 cgtg 248  Q
    ||||    
T  3341086 cgtg 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889691
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 204  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  76 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  176 ccgatgtgggacata 190  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43174677 - 43174480
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 133  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||    
T  43174677 tgaggggagc-tagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttat 43174579  T
Q  134 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccctcaagtgtg 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  43174578 gtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaacactccccctcaagtgtg 43174480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489522
Alignment:
Q  48 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  148 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacact-ccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaacactcccccctcaagtgtgagtccatc 45489522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Original strand, 23817679 - 23817783
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23817679 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttact 23817778  T
Q  147 tataa 151  Q
    |||||    
T  23817779 tataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 54741152 - 54741334
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||| || |||  |||||||||||||| ||||  |  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  54741152 actgttgggtcactgaggggagcccgagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaag 54741249  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
     ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741250 acaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  187 catataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  82 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  182 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004739
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  59 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  159 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768216
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700365
Alignment:
Q  50 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttat 3700421  T
Q  150 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  149 taaggtgttca 159  Q
    |||||||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827480
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  147 tataaggtgttcaaccttt 165  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  43827498 tataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41370662 - 41370557
Alignment:
Q  273 actttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaatgaccagctgcctcggtcgctcccttc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  41370662 actttacctgtatcgccgttcctgcacaaggagctacttgctgcttgtaccgccgttgcggctttctgtgcaacgaccggctgcctcggtcgcacccttc 41370563  T
Q  373 gtcgaa 378  Q
    ||||||    
T  41370562 gtcgaa 41370557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  53 cgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  151 aggt 154  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621361
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccat 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaacgacactccccctcaagtgtgagtccat 44621393  T
Q  237 cactttaacgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    || || | ||||||||||  | ||||||||||    
T  44621392 caattcatcgtgctcccccaaaagcggaagct 44621361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  97 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  68 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  167 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28034387 - 28034229
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||    
T  28034387 ggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcact 28034288  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034287 tataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246240
Alignment:
Q  116 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caaca 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||  || ||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaacagca 10246337  T
Q  214 ctccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtgctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgc 313  Q
    |||||||||||| |||||||              ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||     
T  10246336 ctccccctcaagcgtgagtc--------------gctcccc-tagagtggaagctttttactttgcatgtatagccattgctgcacaagaagccacttgt 10246252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 184
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111833
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271806
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctta 3271848  T
Q  145 ctt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 183  Q
    |||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271847 cttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 760356 - 760194
Alignment:
Q  36 aggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 135  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||   ||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  760356 aggggagcccaggggaccacccacatccagta-agagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgg 760259  T
Q  136 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 200  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760258 gtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 163
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  64 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 163  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788147
Alignment:
Q  153 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 50788147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  173 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489864
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || |||||||    
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttact 45489811  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 199  Q
    |||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489812 tatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  186 --acatataactcacactt 202  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699077
Alignment:
Q  49 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| ||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttact 39699043  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgat 180  Q
    || ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699044 tagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620926
Alignment:
Q  139 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg--caaaccaacactccccct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgtccacaacaacactccccct 44620926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Original strand, 11783526 - 11783646
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 120  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||  ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  11783526 actgttgggtca-tgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatg 11783624  T
Q  121 gcaatgggtttatgggtcctct 142  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  11783625 gcaataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 23817429 - 23817498
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagag 92  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23817429 actgttgggtcactg-ggggagcct-gggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370673
Alignment:
Q  168 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtcc 234  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaacact-cccctcaagtgtgagtcc 41370673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 205
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  117 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 199
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  187 catataactcaca 199  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Original strand, 16889315 - 16889375
Alignment:
Q  209 caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaa-cgtgctccccttagagcggaagct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  16889315 caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaatcgtgctccccctcaagcggaagct 16889375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  86 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  98 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  89 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  93 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3341083 - 3340990
Alignment:
Q  303 gagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    |||||||||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  3341083 gagccacttgttgtttgtaccgtcgttgctgctttctgcgcaactgaccagcgacctcggtcgtaccgttcgtcgaaccggggctctgatacca 3340990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 11702284 - 11702341
Alignment:
Q  34 tgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga 91  Q
    ||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11702284 tgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45496803 - 45496734
Alignment:
Q  327 gttgcggctttctgcgcaa-tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45496803 gttgctgctttctacgcaactgaccggcggcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 45496734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  91 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 151  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  157 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 45496734 - 45496678
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 77  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45496734 actgttgggtcagtaaggggagctcgagggaccgtctacatcgaggctagaacaacc 45496678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 127
Target Start/End: Original strand, 50787996 - 50788072
Alignment:
Q  51 accgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 127  Q
    |||||| |||| || | |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50787996 accgtctacattgaagttagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 213
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  182 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  107 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 161  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 129  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2740953 - 2740889
Alignment:
Q  317 ttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa--tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaac 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   || | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  2740953 ttgtaccgctgttgctgctttctgcgcaaacggatcggctgcctcggtcgtacccttcgtcgaac 2740889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 205
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  164 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19895570 - 19895533
Alignment:
Q  57 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagac 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19895570 cacatcgaagctagaacaaccacacaagcaagatagac 19895533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20826101 - 20826037
Alignment:
Q  316 cttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa--tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaa 378  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  20826101 cttgtaccgccgttgctgctttctgcgcaaatggaccggctgcctcggtcgtacccttcgtcgaa 20826037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  109 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 1731581 - 1731621
Alignment:
Q  37 ggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 77  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1731581 ggggagcctgggggaccatccacatcgaggctagaataacc 1731621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  87 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 147 - 489
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||||    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttact 241  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   || | |     
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccc-caaatgtgagtccatttattcatca 340  T
Q  247 tgct-ccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgttcctgcacaaggagccacttgctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaa 345  Q
    |||| ||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  341 tgctcccccttcaagcggaagctctt-agtttacctgtatcattgttcctgcacaaggagccacttgctgcttgtactgctgttgcgactttcttcgcaa 439  T
Q  346 tgaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
     ||||  || ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  440 cgaccgactacctcggttgcacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 514 - 670
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 1082 - 1298
Alignment:
Q  22 ctgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 121  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1082 ctgttgggtcactg-ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaagg 1180  T
Q  122 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg--caaaccaacactcccc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||    
T  1181 caatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacattcccc 1280  T
Q  220 ctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1281 ctcaagtgtgagtccatc 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 1658 - 1802
Alignment:
Q  21 actgttgggtcagtgaggggagcctaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacaca--------agcaagagagacaccacactcttacccaaa 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  1658 actgttgggtcac-gaggggagctagggggactgcccacatcgaggctagaacaaccacacttgtgtgagagagagagagacaccacactcttaccaaaa 1756  T
Q  113 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1757 accttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3178
Alignment:
Q  154 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatca 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Original strand, 1380 - 1464
Alignment:
Q  313 ctacttgtaccgctgttgcggctttctgcgcaat--gaccagctgcctcggtcgctcccttcgtcgaacctgtgctctgatacca 395  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1380 ctacttgtaccgccgttgctgctttctgcacaaacggaccggctgcctcggtcatacccttcgtcgaaccggggctctgatacca 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5689
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 150  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  151 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatcactttaacgtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatcaattcatcttg 5732  T
Q  249 ctccccttagagcggaagcttttgactttgcctgtatcgccgtt 292  Q
    |||||| |  |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  5731 ctccccctcaagcggaagctctt-actttgcatgtgtcgccgtt 5689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  56 ccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 154  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  155 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17648
Alignment:
Q  89 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  187 catataactcacacttgcaaac--caacactccccctcaagtgtgagtccatc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgcacacaacaacactccccctcaagtgtgagtccatc 17648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47360
Alignment:
Q  47 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  147 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  128 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  73 caaccacacaagcaagagagacacc-acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 171  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  172 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 203  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39805
Alignment:
Q  80 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 179  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  180 tgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacactccccctcaagtgtgagtccatca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |  | |||||||||||||||||| |||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttgaacacaacaattccccctcaagtgtgagttcatca 39805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  127 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 211  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 167
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  127 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 167  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University