View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12453_high_7 (Length: 379)

Name: NF12453_high_7
Description: NF12453
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12453_high_7
NF12453_high_7
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (11-360)||(19038199-19038548)
chr5 (11-360)||(28238769-28239118)
chr5 (9-360)||(28879268-28879619)
chr5 (11-358)||(30707719-30708066)
chr5 (11-360)||(8577575-8577924)
chr5 (11-310)||(8739-9038)
chr5 (14-360)||(7760012-7760351)
chr5 (14-360)||(38407887-38408226)
chr5 (14-360)||(5199442-5199781)
chr5 (14-360)||(511646-511985)
chr5 (14-360)||(42538468-42538814)
chr5 (38-352)||(8699470-8699784)
chr5 (14-360)||(38970716-38971062)
chr5 (14-377)||(42937675-42938019)
chr5 (38-360)||(15939344-15939666)
chr5 (290-360)||(40623041-40623111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (11-360)||(17423138-17423487)
chr2 (11-360)||(30493997-30494346)
chr2 (11-360)||(15833928-15834277)
chr2 (11-360)||(43981193-43981542)
chr2 (11-360)||(5354643-5354992)
chr2 (11-360)||(43536740-43537089)
chr2 (11-360)||(28471200-28471549)
chr2 (11-360)||(45431177-45431526)
chr2 (11-360)||(39950166-39950515)
chr2 (14-360)||(29398641-29398987)
chr2 (11-348)||(7189485-7189822)
chr2 (14-360)||(10825954-10826293)
chr2 (11-172)||(22680191-22680351)
chr2 (14-356)||(36653536-36653878)
chr2 (31-360)||(7416474-7416803)
chr2 (14-264)||(40538214-40538464)
chr2 (257-360)||(20067493-20067596)
chr2 (14-88)||(45292545-45292619)
chr2 (302-337)||(22529914-22529949)
chr2 (290-360)||(40538476-40538546)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (11-360)||(46401377-46401726)
chr3 (11-360)||(42901192-42901541)
chr3 (11-360)||(46698347-46698696)
chr3 (11-360)||(49141550-49141899)
chr3 (11-360)||(50477809-50478158)
chr3 (11-360)||(54388797-54389146)
chr3 (11-360)||(34048097-34048446)
chr3 (11-360)||(2272088-2272437)
chr3 (11-377)||(36130157-36130523)
chr3 (11-360)||(4005443-4005791)
chr3 (14-360)||(47071219-47071558)
chr3 (14-360)||(599550-599888)
chr3 (49-360)||(17562375-17562686)
chr3 (94-360)||(9473034-9473300)
chr3 (14-360)||(20353216-20353562)
chr3 (14-360)||(41614944-41615282)
chr3 (14-360)||(49266401-49266747)
chr3 (14-360)||(16646183-16646516)
chr3 (14-360)||(44232393-44232732)
chr3 (14-360)||(48565551-48565890)
chr3 (14-360)||(42759337-42759676)
chr3 (35-360)||(48891213-48891538)
chr3 (35-267)||(50758795-50759027)
chr3 (11-137)||(52388827-52388953)
chr3 (170-360)||(52388630-52388820)
chr3 (248-360)||(2648608-2648720)
chr3 (35-360)||(42804993-42805318)
chr3 (14-139)||(51807851-51807976)
chr3 (124-360)||(50214199-50214428)
chr3 (14-360)||(30253126-30253472)
chr3 (11-83)||(3495550-3495622)
chr3 (197-360)||(6927989-6928146)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (15-360)||(27638424-27638769)
chr6 (11-360)||(6203821-6204170)
chr6 (11-360)||(11690788-11691137)
chr6 (11-360)||(30826654-30827003)
chr6 (11-360)||(22303902-22304251)
chr6 (11-360)||(31770746-31771088)
chr6 (11-282)||(26440113-26440384)
chr6 (23-358)||(26172594-26172936)
chr6 (14-360)||(2406918-2407257)
chr6 (35-360)||(24085850-24086177)
chr6 (14-360)||(32642567-32642912)
chr6 (197-360)||(2406059-2406222)
chr6 (35-360)||(18005475-18005800)
chr6 (14-360)||(3384104-3384449)
chr6 (237-333)||(21603282-21603378)
chr6 (302-360)||(32641897-32641955)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (11-360)||(1055198-1055547)
chr8 (11-360)||(23019323-23019672)
chr8 (11-360)||(26662119-26662468)
chr8 (11-360)||(15033801-15034150)
chr8 (11-360)||(22532-22881)
chr8 (11-360)||(42482542-42482891)
chr8 (11-360)||(486769-487118)
chr8 (14-360)||(34367646-34367992)
chr8 (14-360)||(39603963-39604308)
chr8 (11-360)||(43214075-43214405)
chr8 (23-360)||(34819646-34819983)
chr8 (14-360)||(41243120-41243447)
chr8 (14-360)||(20858688-20859034)
chr8 (14-360)||(39831787-39832125)
chr8 (14-360)||(5301343-5301689)
chr8 (14-360)||(21176349-21176695)
chr8 (38-360)||(45132438-45132760)
chr8 (14-360)||(35554270-35554609)
chr8 (38-360)||(40075736-40076051)
chr8 (38-360)||(5679558-5679882)
chr8 (35-360)||(51778-52103)
chr8 (197-358)||(30761310-30761485)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (11-360)||(41883212-41883561)
chr7 (11-360)||(48406030-48406379)
chr7 (11-360)||(9368438-9368787)
chr7 (11-360)||(17460298-17460647)
chr7 (11-360)||(17592567-17592916)
chr7 (11-360)||(35607427-35607776)
chr7 (12-360)||(42504970-42505318)
chr7 (11-360)||(15071319-15071655)
chr7 (11-360)||(17837632-17837974)
chr7 (11-377)||(10521503-10521868)
chr7 (14-360)||(5538587-5538933)
chr7 (11-360)||(13322706-13323055)
chr7 (14-360)||(16680134-16680480)
chr7 (14-360)||(17654370-17654716)
chr7 (14-360)||(27450723-27451069)
chr7 (55-360)||(34741444-34741742)
chr7 (14-230)||(11630427-11630643)
chr7 (38-360)||(47670239-47670561)
chr7 (14-218)||(11632680-11632884)
chr7 (81-360)||(37342992-37343271)
chr7 (201-360)||(47522013-47522172)
chr7 (35-267)||(9491989-9492221)
chr7 (290-360)||(11630317-11630387)
chr7 (35-152)||(36980256-36980373)
chr7 (14-137)||(17747944-17748067)
chr7 (248-360)||(16488281-16488394)
chr7 (197-267)||(41734630-41734700)
chr7 (324-360)||(41734713-41734749)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (11-360)||(6178840-6179189)
chr4 (11-360)||(41796075-41796424)
chr4 (11-360)||(49168183-49168532)
chr4 (11-360)||(31424412-31424761)
chr4 (11-360)||(1306170-1306521)
chr4 (11-360)||(49093093-49093443)
chr4 (11-360)||(21018628-21018977)
chr4 (11-360)||(40355453-40355802)
chr4 (11-282)||(30723877-30724148)
chr4 (14-360)||(44677020-44677366)
chr4 (14-360)||(50277829-50278175)
chr4 (14-360)||(37016633-37016967)
chr4 (23-360)||(8109835-8110172)
chr4 (38-360)||(10730030-10730352)
chr4 (38-360)||(10943799-10944121)
chr4 (14-308)||(51685810-51686104)
chr4 (23-360)||(50904047-50904377)
chr4 (26-360)||(71624-71958)
chr4 (17-360)||(50020734-50021065)
chr4 (35-360)||(13624569-13624894)
chr4 (14-156)||(50196076-50196218)
chr4 (14-348)||(14317284-14317618)
chr4 (38-264)||(41931108-41931334)
chr4 (14-225)||(46438743-46438954)
chr4 (92-377)||(30706657-30706942)
chr4 (290-360)||(30723777-30723847)
chr4 (237-360)||(50196224-50196351)
chr4 (253-360)||(55278820-55278927)
chr4 (275-357)||(46438956-46439038)
chr4 (15-163)||(21535449-21535597)
chr4 (260-351)||(12891833-12891924)
chr4 (14-132)||(12891586-12891703)
chr4 (237-333)||(40886693-40886789)
chr4 (14-152)||(40886874-40887012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (11-360)||(3729379-3729729)
chr1 (11-360)||(13637036-13637385)
chr1 (11-360)||(26878388-26878730)
chr1 (11-360)||(19158692-19159041)
chr1 (11-360)||(95132-95474)
chr1 (11-360)||(31780697-31781039)
chr1 (11-360)||(22526674-22527016)
chr1 (14-358)||(19522316-19522653)
chr1 (42-360)||(52804570-52804888)
chr1 (14-349)||(47505016-47505350)
chr1 (14-360)||(11196537-11196883)
chr1 (14-360)||(47660547-47660893)
chr1 (14-360)||(45828251-45828596)
chr1 (14-132)||(50341407-50341525)
chr1 (35-377)||(49855036-49855377)
chr1 (237-360)||(50617929-50618052)
chr1 (14-123)||(21143654-21143763)
chr1 (173-360)||(21143770-21143950)
chr1 (80-360)||(38120195-38120475)
chr1 (35-137)||(35256520-35256622)
chr1 (14-105)||(23273541-23273632)
chr1 (203-360)||(16269827-16269984)
chr1 (262-341)||(23273427-23273506)
chr1 (320-377)||(35256425-35256482)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (14-360)||(12025-12371)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (237-340)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (275-343)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19038548 - 19038199
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038548 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 19038449  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038448 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 19038349  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038348 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 19038249  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038248 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19038199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28239118 - 28238769
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239118 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgcccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28239019  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28239018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 28238919  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28238918 cactcacacgcttaaggcggacgctcgaggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtacactagggtgtctcac 28238819  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238818 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28238769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 28879268 - 28879619
Alignment:
Q  9 aggaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879268 aggaggagcacagagagatccaggacttcgaggagattttctggtattcaggctggatcatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 28879367  T
Q  109 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28879368 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgattgatgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttc 28879467  T
Q  209 ggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 308  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28879468 cgcactcacacgattaaggcggacgatcgggatgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 28879567  T
Q  309 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879568 accctcagatctttccacctctttcaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28879619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 358
Target Start/End: Original strand, 30707719 - 30708066
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707719 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattatgggtggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30707818  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  30707819 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattatgcaggtgttcgttgacttccg 30707918  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  30707919 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 30708018  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30708019 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 30708066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8577924 - 8577575
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577924 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8577825  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||  |||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  8577824 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagatcccattcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 8577725  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  8577724 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 8577625  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8577624 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 8577575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9038 - 8739
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattttggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8939  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8938 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccgccgcctcccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 8839  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8838 cactcacacgcttaaggcagacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcac 8739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 7760012 - 7760351
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760012 gagcacagggagatccaagactttgaacaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 7760111  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7760112 tgaggcagtgcgaatacgtccagaccatccccagacatctaacggatgttgtagacctgccaccgctttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 7760211  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  7760212 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 7760304  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7760305 caaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 7760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38408226 - 38407887
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38408226 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 38408127  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38408126 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccatacatctaacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 38408027  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  38408026 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 38407934  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38407933 tagatcttgccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38407887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 5199442 - 5199781
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199442 gagcacagggagatccaggattttgaagaggttttctggtattcaggctgaattatgtgcgatgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 5199541  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  5199542 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcaaattgtgtaggcattcgtcgacttccgcac 5199641  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  5199642 tcacacgtttaaggcggccgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 5199734  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5199735 cagattttgccatctcttctaggagatcttccgaggccagcaaatga 5199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 511985 - 511646
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  511985 gagcacagggagatctaggattttgaggaggttttctggtattcatgctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 511886  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||||   || || |||||||||   ||||| |||   ||| |||||||| ||||    
T  511885 tgaggcagtacggatacgtccagagcgtccctagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtacaggcattcatcgacttccgcac 511786  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| | ||||       ||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  511785 tcacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagaatacat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 511693  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  511692 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 42538468 - 42538814
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538468 gagcacatggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 42538567  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || ||||| |||   |||||||||   || ||||||||| ||||    
T  42538568 tgaggcagtacgaatatgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccacctcagattgtgcaggcatttgtcgacttccgcac 42538667  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||  |||  ||   ||||||||||||||  |||| ||| |||   |  || ||||||||||||  | |||||| |||  |||| |||||||    
T  42538668 tcacacgcttacagcgaccgattggggtgagcaggcacaagagcagatatgatagatggtggatggctatgtgttatggtacactaaagtgtttcaccct 42538767  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42538768 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgagaccagcaaatga 42538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8699784 - 8699470
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8699784 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtctaga 8699685  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    ||  ||| ||||||||| | ||||||   || ||  | ||| ||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |    
T  8699684 ccgcccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcgccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggaggccgattg 8699585  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||   | | |||| |||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8699584 gggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtttgacagatgcctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccagga 8699485  T
Q  338 gatcttccgaggcct 352  Q
    ||| |||||||||||    
T  8699484 gatattccgaggcct 8699470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 38970716 - 38971062
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| | || |||||||| || |||||||| ||| | || | || |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38970716 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattatggtattcaggctggattatttgcagtgttcataaggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgt 38970815  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||| |||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  38970816 tgaggcagtacagatacgtacagaagatccctggacatctgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcaagcattcgtcgacttccgcac 38970915  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |  ||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38970916 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagcagacagcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttgtggtacactaaggtgtctcaccct 38971015  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38971016 cagatttttccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38971062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42938019 - 42937675
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  42938019 gagcacagggagatccaagatttttaggaggttttctggttttcaggctggatcatgtgcggtgttcgtagggtgttc-gtcacttgcccgagggggttt 42937921  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||| ||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  42937920 tgaggcagtacagatacgtccagactgtccctaggcatctgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 42937821  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgt-ggtacgctagggtgtctcaccc 312  Q
    ||||||||||||||||  ||   |||||||||            ||||||       ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  42937820 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtgctatgggtacactagggtgtctcaccc 42937740  T
Q  313 tcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||| |||||||||    
T  42937739 tcagattttgccacctcttccaggagatcttcccaggctagcaaatgaggagcatatcattgcag 42937675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 15939344 - 15939666
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15939344 gaggagcttttctagtattcaggatgaattatgtgtggtgttcgtagagtgtactgtcatctgctcaagaggattttgaggcagtacggatatgtccaga 15939443  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||   || || |||||||||   |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   |    
T  15939444 cggtccctagacatccgattgatgttgttgagctgccaccgcctcatattgtgcaggcttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattg 15939543  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| ||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15939544 ggatgagcaggcagtagagcagacaaggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaagttgtctcacccttagattttgccacctcttccagga 15939643  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||||| ||||||| ||||||||    
T  15939644 tatctttcgaggccagcaaatga 15939666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40623111 - 40623041
Alignment:
Q  290 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40623111 tggtacactaaggtgcctcatcctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 40623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 17423138 - 17423487
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423138 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17423237  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423238 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 17423337  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423338 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 17423437  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423438 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30494346 - 30493997
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494346 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30494247  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30494246 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30494147  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494146 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30494047  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494046 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 15833928 - 15834277
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15833928 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 15834027  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15834028 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15834127  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15834128 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15834227  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15834228 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 15834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 43981193 - 43981542
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981193 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43981292  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43981293 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 43981392  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43981393 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43981492  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981493 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 43981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 5354643 - 5354992
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354643 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 5354742  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5354743 ttttgaggcagtacggatacgtgtagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 5354842  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5354843 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 5354942  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354943 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 5354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43537089 - 43536740
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537089 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43536990  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43536989 ttttgaggcagtacggatacatgcagactatccccagacatctgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 43536890  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43536889 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43536790  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43536789 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 43536740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 28471200 - 28471549
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471200 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttttggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28471299  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28471300 ttttgaggtagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggatctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 28471399  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  28471400 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 28471499  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28471500 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatga 28471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 45431177 - 45431526
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431177 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 45431276  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  45431277 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatcctactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcaggtgttcgtcaacttccg 45431376  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  45431377 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 45431476  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45431477 cctcagatcttgccaccttttctaggagatcttccgaggcctgcaaatga 45431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 39950166 - 39950515
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950166 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 39950265  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  39950266 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttacattgtacaggcgttcgtcgacttccg 39950365  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39950366 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 39950465  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950466 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 39950515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29398987 - 29398641
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29398987 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttt 29398888  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  29398887 tgaggcagtacggatacgtcctgaccatccccagacatccgacggatgttgtagacttgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 29398788  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  29398787 tcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 29398688  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29398687 cagattttgtcatctcttccaggaaatcttcctaggcctgcaaatga 29398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 7189485 - 7189822
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189485 gaggagcacatggagatccaggactttgaagaggttttctggtattctgactggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 7189584  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  7189585 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 7189684  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
     ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  7189685 tactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 7189784  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 348  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7189785 cctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgag 7189822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10826293 - 10825954
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10826293 gagcacagggagatccaagactttgatgaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 10826194  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10826193 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 10826094  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | || |||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10826093 tcacatgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcagaatagcagacatg-------gcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 10826001  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10826000 cagattttgccacctcttccaggagatattccgaggcctgcaaatga 10825954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 22680191 - 22680351
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680191 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22680290  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680291 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat-cccagacatccgactgatgttagggacctc 22680351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36653878 - 36653536
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36653878 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttttggtattcaggttggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttt 36653779  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||    ||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  36653778 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagtttgtgaaggcattcgtcgacttccgcac 36653679  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||  | |||||  || ||||||||| ||||    
T  36653678 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtatactcgggtgtctcgccct 36653579  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 356  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36653578 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaa 36653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 360
Target Start/End: Original strand, 7416474 - 7416803
Alignment:
Q  31 ggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatac 130  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7416474 ggacttccaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcaatgatcgtaaggtgcaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatat 7416573  T
Q  131 gtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcgg 230  Q
    || |||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7416574 gtccagaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatactttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcag 7416673  T
Q  231 acgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctat 330  Q
     ||   | |||||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |  |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  7416674 ccgattgcggtgagcatgcaggagaggagacatggcatatggcagatggctatgtacgatggtacgccattgcgtctcactctcagattttgccacttct 7416773  T
Q  331 tccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7416774 tccaggagatattccgaggcctccaaatga 7416803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 40538214 - 40538464
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40538214 gagcacagggacttccaggctttcgaggaggtattttggtattcaggctggattatgtgcgatgatcgtagggtgcaccgtcactttcccgagagggttt 40538313  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   || |||   || ||  ||||| ||   |||||| ||   || |||||||||  |||    
T  40538314 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagacatctgttggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgtaggcttttgtcgacttccacac 40538413  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatg 264  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40538414 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagaggagacatg 40538464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20067596 - 20067493
Alignment:
Q  257 gagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 356  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |    
T  20067596 gagaaatggcggatggaggatggctatgtaatatggtacattagggtgtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatcttccgaggccagcta 20067497  T
Q  357 atga 360  Q
    ||||    
T  20067496 atga 20067493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 45292545 - 45292619
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtg 88  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || |||||||||    
T  45292545 gagcacagggagatccgggattttgaggaggttttctagtattcaggctggattatgtgcagtgttcgtagggtg 45292619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22529949 - 22529914
Alignment:
Q  302 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22529949 gtgtctcaccctcagattttgccacctattccagga 22529914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 360
Target Start/End: Original strand, 40538476 - 40538546
Alignment:
Q  290 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  40538476 tggtacgccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaagagatattctgaggcctccaaatga 40538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 46401377 - 46401726
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401377 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46401476  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401477 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 46401576  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401577 cactcacacgcttaaggcggacgtccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 46401676  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401677 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46401726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42901541 - 42901192
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901541 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 42901442  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42901441 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42901342  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42901341 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 42901242  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901241 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42901192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 46698696 - 46698347
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698696 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46698597  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46698596 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 46698497  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46698496 cactcacacgcttaagacggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 46698397  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698396 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46698347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49141899 - 49141550
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141899 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49141800  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  49141799 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgatttccg 49141700  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49141699 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49141600  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141599 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49141550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50478158 - 50477809
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478158 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 50478059  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50478058 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgttgacttccg 50477959  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50477958 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 50477859  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50477858 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 50477809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 54388797 - 54389146
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54388797 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggcgtaccgtcacttgcccgagaggg 54388896  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  54388897 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgattttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 54388996  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54388997 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 54389096  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389097 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 54389146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 34048097 - 34048446
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048097 gaggagcacatagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccatagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 34048196  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  34048197 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgattttcg 34048296  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34048297 cactcacacgcttaaggcggtagcttggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 34048396  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048397 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 34048446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2272437 - 2272088
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272437 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 2272338  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  2272337 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgctttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 2272238  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2272237 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 2272138  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2272137 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttttgaggcctgcaaatga 2272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 377
Target Start/End: Original strand, 36130157 - 36130523
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36130157 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 36130256  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  36130257 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 36130356  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  36130357 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 36130456  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  36130457 cctcagattttgccacctctccctggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcatatcattgcag 36130523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4005791 - 4005443
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005791 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggatgttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 4005692  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4005691 ttttgaggcagtacggatacatgcagaccatccctagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 4005592  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  4005591 cactcacacgcttaaagcgg-cgattggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 4005493  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| |  ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4005492 cctcatactttgccacctctccctagagatcttccgaggcctgcaaatga 4005443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47071558 - 47071219
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47071558 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctgactggattatatgcggcgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattt 47071459  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  47071458 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacggatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcac 47071359  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||| |||||||||||  |   | |||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  47071358 tcacatgcttaaggcggctgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcactct 47071266  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
      ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071265 tggatcttgccacctttaccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 47071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 599550 - 599888
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599550 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggc--------tggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 599641  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||   || || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  599642 tgaggcagtacggatacgtccagaccatcctcagacatctcacggatgttgtagagctgccattgccttacattgtgcaggtgttcgtcgacttctgcac 599741  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||    
T  599742 tcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggagagcagtcatggcggatggctgatggctattagctatggtacactaggatgtctcaccct 599841  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  599842 cagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgcaaatga 599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17562686 - 17562375
Alignment:
Q  49 ctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaga 148  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17562686 ctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctaga 17562587  T
Q  149 catccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcagg 248  Q
    |||| | | ||||||   || ||  || || |||  |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  17562586 catctgtcggatgttgtagagctgtcatcgtcttagattgtgcagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagg 17562487  T
Q  249 caggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 348  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17562486 caggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatctcgccatctcttccaggagatcttccgag 17562387  T
Q  349 gcctgcaaatga 360  Q
    ||| ||||||||    
T  17562386 gccagcaaatga 17562375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 360
Target Start/End: Original strand, 9473034 - 9473300
Alignment:
Q  94 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcag 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    | || |||||| ||  |||||| |||    
T  9473034 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgatcgatgttgtacagctgccaccgtctcacattgtccag 9473133  T
Q  194 atgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggt 293  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9473134 gcgttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatggt 9473233  T
Q  294 acgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473234 acactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 20353216 - 20353562
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20353216 gagcatagggagatccaggattttgaggagattttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggggtt 20353315  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   | |||||||   ||||||||||||  |||    
T  20353316 tgaggcagtacggatacgtccagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgcctcagactgtgcaggcattcgtcgacttccacac 20353415  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20353416 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20353515  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| || |||||| || || ||||||||| ||||||  |||||||    
T  20353516 cagatttttccacctctttcacgagatcttctgaggccaacaaatga 20353562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 41614944 - 41615282
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41614944 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 41615043  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  41615044 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatctggcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 41615143  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  41615144 tcacacgcttagggcggccg-atggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 41615235  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41615236 cagattttgccacctcttacaggagatcttccgaggccagcaaatga 41615282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49266747 - 49266401
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49266747 gagcacaaggagatccagaattttgaggaggttttctggtatttaggctggattatgtgaggtggtcgtagggtctaccgtcatttgcccgagagggttt 49266648  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||    
T  49266647 tgaggcagtacggagacgtccagaccgtccccaaacatctgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcac 49266548  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| || ||    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  49266547 tcacacgcttaaggtggccgattagggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 49266448  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49266447 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggtcagcaaatga 49266401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 16646183 - 16646516
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16646183 gagcacagggagatccaggactttgagaaggtattctggtattctggctg-attatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcactttcccgatagggttt 16646281  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||   |||||   ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16646282 tgaggcagtacggatacatccagaccatcccaagacatctgaagtatgttgtagacctgccaccgccttacattatgcaggcgttcgtcgacttccgcac 16646381  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||            | |||||||||  |||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  16646382 tcacacgcttaaggcagacgattggggtgagc------------acacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtaaactagggtgtctcaccct 16646469  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16646470 ttgattttgccacctcttccaggagatcttccgagacttgcaaatga 16646516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 44232393 - 44232732
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  44232393 gagcacatggagatccaggattttaaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcatagggtgtactgtcactttttcgagagggttt 44232492  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  44232493 tgaggcagtgcggatacgtccagaccgtccccagacatctgacagatgttgtagagctgccaccgcctcagattatgcagatattcgtcggcttccgcac 44232592  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| | ||||       ||| |||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  44232593 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaagagagcatacat-------ggctgatgacaatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 44232685  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44232686 cagattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 44232732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 48565551 - 48565890
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  48565551 gagcactgggagatccaggattttgaggaggttttctggtgttcaggctagattatgtgtggtgttcgtagggtgtactgtcacttacccgagcgggttt 48565650  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  48565651 tgaggcagtacagatacgtccagagcgtctttagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 48565750  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||  |||||||||||||    
T  48565751 tcacacgcttaaggcggtcgaatggggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactgaggtgtctcaccct 48565843  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48565844 cagattttgccacctcttccagaagatcttccgaggccagcaaatga 48565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 42759337 - 42759676
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42759337 gagcacagggagatccaagattttgaggagcctttctggtattcaggctgaattatgtgcggtgttcgtagggtgtagcgtcacttgcccgagagggttt 42759436  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||  |||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  42759437 tgaggcagtacggatacatccagagcgtccctagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcatgcattcgtcgacttccgcac 42759536  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||| ||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  42759537 tcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagcagacacaagagcagacat-------ggcggatggctatgttttatggtacactaaggtgtctcaccct 42759629  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42759630 caaattttgccacctcttctaagagatcttccgaggccagcaaatga 42759676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Original strand, 48891213 - 48891538
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48891213 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatatgcagtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 48891312  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  || || ||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  48891313 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcatcggctgagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 48891412  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      || ||||||| ||| ||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  48891413 ttggagtgagcatgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 48891512  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| || |||||||| |||||||    
T  48891513 ggagatattacgaggcctccaaatga 48891538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Original strand, 50758795 - 50759027
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50758795 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgattgtagggtgtaccgtcacttgaccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 50758894  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  50758895 agaccgtccctagacatccgccggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 50758994  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 267  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50758995 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcg 50759027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52388953 - 52388827
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52388953 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggataatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 52388854  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  52388853 ttttgaggtagtatagatacgtgcaga 52388827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 52388820 - 52388630
Alignment:
Q  170 ctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggg 269  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  52388820 ctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcgga 52388721  T
Q  270 cggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||| ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52388720 tggctgatggctatatgctatggtagactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatga 52388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2648720 - 2648608
Alignment:
Q  248 gcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648720 gcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 2648621  T
Q  348 ggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||    
T  2648620 ggcctgcaaatga 2648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42805318 - 42804993
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  42805318 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcatacggtgcaccgtcactagcccgagaggattttgaggcagtacagatacgttc 42805219  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
     |||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||   |||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  42805218 ggaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgttaccggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggcgggcga 42805119  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      |||||||||| ||| |||||||||||||| |   ||| ||||||||||| |  |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  42805118 ttggggtgagcatgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 42805019  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42805018 ggagatattctgaggcctccaaatga 42804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 51807851 - 51807976
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807851 gagcacagggagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 51807950  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagacc 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51807951 tgaggcagtacggatacgtccagacc 51807976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50214428 - 50214199
Alignment:
Q  124 cggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgctt 223  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    | ||  ||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50214428 cggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatattgtaaagctgtcaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttcctcactcacacgctt 50214329  T
Q  224 aaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgc 323  Q
    ||| ||  ||   |||||||||||  | ||||| |||||||||||       |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50214328 aagacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcgg-------atggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgc 50214236  T
Q  324 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50214235 cacctcttccaggagatattccgaggccagcaaatga 50214199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30253472 - 30253126
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30253472 gagcacagggacttccaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgtggtgatcagagggtataccgtcacttgctcgagagggttt 30253373  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  30253372 tgaggcagtacagatacatccaaaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcactgcctgagattgtgcaggttttcatcgacttccgcac 30253273  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||| ||||  | ||||||||   ||| ||||||||||| |  ||||||      ||||||||  ||    
T  30253272 tcacacgcttaaggcggctgactggggtgagcatgcaagagaacaaacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacatcgttgtgtctcatgct 30253173  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||| | |||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  30253172 cagattttgccacttcttctgggagatattccgaggcctccaaatga 30253126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3495622 - 3495550
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgta 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3495622 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgta 3495550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Original strand, 6927989 - 6928146
Alignment:
Q  197 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctg-tggtac 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||   |||| |||||||||||       ||||||||||  |  ||||||    
T  6927989 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcgg-------atggctatgtgtttatggtac 6928081  T
Q  296 gctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6928082 actaaggtgtgtcaccctcaaattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 6928146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 27638424 - 27638769
Alignment:
Q  15 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638424 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 27638523  T
Q  115 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638524 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 27638623  T
Q  215 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638624 cacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 27638723  T
Q  315 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27638724 agatcttgccacctattccaagagatcttccgaggcctgcaaatga 27638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 6203821 - 6204170
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203821 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6203920  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6203921 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6204020  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204021 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6204120  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204121 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6204170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 11690788 - 11691137
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690788 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 11690887  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11690888 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 11690987  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11690988 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 11691087  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691088 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 11691137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30827003 - 30826654
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30827003 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30826904  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30826903 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30826804  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30826803 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30826704  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826703 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 22303902 - 22304251
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303902 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22304001  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22304002 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22304101  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304102 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22304201  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22304202 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 22304251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 31770746 - 31771088
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31770746 gaggagcacagagagatccatgattttgaggaggttttatggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggg 31770845  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  31770846 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttccg 31770945  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31770946 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31771038  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31771039 cctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 31771088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 26440113 - 26440384
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440113 gaggagcacaaggagatccatgactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26440212  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |    
T  26440213 ttttgaggcaatacggatacgtccagaccatccctagacatctgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaagcgttcgtcgacttccg 26440312  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggcta 282  Q
    |||||||||||||||||||   |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26440313 cactcacacgcttaaggcgactgattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcta 26440384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 358
Target Start/End: Original strand, 26172594 - 26172936
Alignment:
Q  23 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26172594 gagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagagttttgaggcagt 26172693  T
Q  123 acggatacgtgcagaccatccccagacatccg--------actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 214  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||        || ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26172694 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgaacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcact 26172793  T
Q  215 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 314  Q
    |||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26172794 cacacgcttaaggcggccgattgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgtgttatggtacactagggtgtctca-cctc 26172892  T
Q  315 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 358  Q
    | || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26172893 aaattttgccacctcttcgaggagatcttccgacgccagcaaat 26172936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 2406918 - 2407257
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  2406918 gagcacagggagatccaggactttgagtaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgtacgtagggtctactgtcacttgctcgagagggttt 2407017  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2407018 taaggcaatacggatacgtctagaccgtccctaaacatccgacggatgttgtagagctgccactacctcaaattgtgcagacattcgtcgacttccgcac 2407117  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    | ||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||| ||| ||       ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  2407118 ttacacgcttaaggcggccgatcgaggtgaacaggcaggagagcagaaat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 2407210  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2407211 cggattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 2407257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24086177 - 24085850
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttg-cccgagagggttttgaggcagtacggatacgtg 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24086177 ttcgaggaggtattctggtattcaggatggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgccccgagagggttttgaggcagtacagatacgtc 24086078  T
Q  134 cagaccatccc-cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggac 232  Q
    |||||| ||||  |||||| || | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24086077 cagaccgtcccttagacattcgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatgttttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggcc 24085978  T
Q  233 gcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 332  Q
    |   |||||||||| ||||||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  24085977 gattggggtgagcatgcaggagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttg 24085878  T
Q  333 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24085877 taggagatattcggaggcctccaaatga 24085850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 32642567 - 32642912
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32642567 gagcacagagacttccaggctttcgaggaggtattctggtattcaggctgaattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 32642666  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| | ||    
T  32642667 tgaggcagtacggatacgtcctgaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagttgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgtac 32642766  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| |     ||||||||| | ||||| | ||||||||||   | | ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||    
T  32642767 tcacacgcttaaggcgg-ctgattgggtgagcatgtaggagggtagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccct 32642865  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32642866 caaattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 197 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2406222 - 2406059
Alignment:
Q  197 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacg 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||  | ||||||     
T  2406222 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtaca 2406123  T
Q  297 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2406122 caagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 2406059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18005800 - 18005475
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||| || |   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18005800 ttcgaggaggtattctagtattcaggctggattacgtgtggtgattgtagggtgcaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 18005701  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    ||||| |||| ||||||| |   | ||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18005700 agaccgtccctagacatctgttagctgttgtagagatgtcaccgactgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 18005601  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||| |   ||| ||||||||||| |   ||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  18005600 ttggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggctatgtacgaaggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 18005501  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18005500 ggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 3384104 - 3384449
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||| || | || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  3384104 gagcacagggagatccagggttttgagaagatattatggtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgcaccgtcacttgcctgagagggtgt 3384203  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||   ||  |  ||| ||||   ||||||||||  ||||| |||||   ||     
T  3384204 tgaggcagtacggatacgtccatacgatccctagacatcctacggatgttgtagagatgacactgcctcagattgtgcagacattcgtagactttcacat 3384303  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| |  ||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| ||||||||  | || ||| ||| | |||||||||||    
T  3384304 tcacacgcttaaggagaccgattgaagtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatgatacactaagatgtctcaccct 3384403  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3384404 cagattttgccatctcttcca-gagatcttccgaggccagcaaatga 3384449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Original strand, 21603282 - 21603378
Alignment:
Q  237 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 333  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||  |  ||  ||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21603282 ggggtgagccagcaggagaggcgacatggaagatggatgatggctatatactatggtacactacggtgtctcaccctcagatttttccacctattcc 21603378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32641955 - 32641897
Alignment:
Q  302 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32641955 gtgtctcaccctcaaattttgtcacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32641897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 1055198 - 1055547
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055198 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1055297  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1055298 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1055397  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055398 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 1055497  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055498 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1055547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23019672 - 23019323
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019672 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 23019573  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23019572 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 23019473  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019472 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 23019373  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019372 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 23019323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 26662119 - 26662468
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662119 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26662218  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26662219 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26662318  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26662319 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 26662418  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662419 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 26662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15034150 - 15033801
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034150 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 15034051  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15034050 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaggaacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15033951  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15033950 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15033851  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15033850 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15033801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22881 - 22532
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22881 gaggagcacagagagatctaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgtggcatccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22782  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22781 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22682  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22681 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22582  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22581 cctcagatcttgccacctattccaggagatattccgaggcctgcaaatga 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42482891 - 42482542
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42482891 gaggagcacagaaagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagga 42482792  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42482791 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42482692  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42482691 cactcacacgcttgaggcggacgctcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtacactagggtgtctcac 42482592  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482591 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 487118 - 486769
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487118 gaggagcacaaagagattcaggacttcgaggaggtttcctggtattctggatggattatgtgcggcgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 487019  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  487018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgtttatcgacttccg 486919  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  486918 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 486819  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  486818 cctcagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggcctgcaaatga 486769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34367992 - 34367646
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34367992 gagcatagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtatggtgtaccttcacttgcccgagagggttt 34367893  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  34367892 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatcctcagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgactttcgcac 34367793  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  34367792 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccct 34367693  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34367692 cagatcttgccacctctttcaggagatcttctgaggcctgcaaatga 34367646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 39603963 - 39604308
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39603963 gagcacagggagatccaggactttgaggtggttttctcgtattctggatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 39604062  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  39604063 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatccc-agacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 39604161  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39604162 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 39604261  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39604262 cagatcttgccacctcttccaggaaatcttctgaggcctgcaaatga 39604308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 43214075 - 43214405
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43214075 gaggagcacagggagatgcaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtaggatgtaccgtcacttgcccgagaggg 43214174  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  43214175 ttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 43214274  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||            ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43214275 cactcacacgcttaaggcgaacgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 43214355  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43214356 cctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgaggcctgcaaatga 43214405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34819983 - 34819646
Alignment:
Q  23 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 122  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34819983 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 34819884  T
Q  123 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 222  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  34819883 acggatacgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgct 34819784  T
Q  223 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 322  Q
    |||||| | ||   ||||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||     
T  34819783 taaggcagccgattggggtgagcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagattttt 34819684  T
Q  323 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34819683 ccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 34819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41243447 - 41243120
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41243447 gagcacagggagatccatgactttgaggagattttatggtattctggctggattatgtgcgctgttcgtagggtgtaccgtcacttgccagagagtgttt 41243348  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41243347 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacagatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 41243248  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||                    ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  41243247 tgacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaggca-------------------tggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 41243167  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41243166 cagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcctgcaaatga 41243120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 20858688 - 20859034
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858688 gagcatagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 20858787  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||  |  |||||||||  |||||||||   |||||| |||||  |||    
T  20858788 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccaaacatccgacggatgttgtagagttgtcaccgccttagattgtgcaggcattcgtcaacttccacac 20858887  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||||| | ||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20858888 tcacacccttaaggcggcctattggagtgagcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20858987  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  20858988 cagatttttccacctcttccaggagatctttcgaggcaagcaaatga 20859034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39832125 - 39831787
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39832125 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttgtggtattcaggctggattatgtgcggtgttcctaaggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 39832026  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  39832025 taaggcagtacggatacgtccagaccgtctccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 39831926  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||  |||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  39831925 tcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatgattatgtgttatggtacacta-ggtgtctcaccct 39831834  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39831833 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 39831787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5301689 - 5301343
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| || || || |||    
T  5301689 gagcacaggaagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaagctggattatgtgcggtgtttgttgggtctaccgtcacttgtccaagtggattt 5301590  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||   || |||||||  |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  5301589 tgaggtagtacggatacgtccataccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctcccactacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 5301490  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   | || ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  5301489 tcacacgcttaaggcggccgattgaggcgagcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 5301390  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5301389 cagattttgccacctcttccaggagatcttccaaggccagcaaatga 5301343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21176695 - 21176349
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  21176695 gagcacagggagatccagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtaggatgtaccgtcactttcttgagagggttt 21176596  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||   || || | | |||||   |||||| ||   ||| |||||||| ||||    
T  21176595 tgcggcagtaaggatacgtccagagcatccctagacatccgacggatgttgtagagctgcgatcgcctcagattgtggaggcattcatcgacttccgcac 21176496  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| |||||| || |||||| ||  |||||| ||||||    
T  21176495 tcacacgcttaaggagcacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtgtcacaccct 21176396  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21176395 cagattttgacacctcttccagaagatcttctgaggccagcaaatga 21176349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 45132438 - 45132760
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45132438 gaggaggttttttggtattcaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgacatctgcccgagagggttttgaggtagtacggatacgtccaga 45132537  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
       |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||   |    
T  45132538 tggtccctagacatccgacggatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcaagctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggccgattg 45132637  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45132638 gggtgagcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 45132737  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  45132738 gatcttccgaggccagcaaatga 45132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 35554270 - 35554609
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||  ||||||||||  ||  ||||| | ||||||||| | || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35554270 gagcacatggagatccagggttttaaggagatattctggtatccaggctggattatttgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 35554369  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| |||  |   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  35554370 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatccgacggataatgtagagctgacaccgcctcagattgtgcaggaattcgtcgacttccgcac 35554469  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  | || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  35554470 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaaaagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 35554562  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35554563 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 35554609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40076051 - 40075736
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  40076051 gaggagattttctagtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacatccaga 40075952  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
      ||||| ||||||| ||| ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||   |    
T  40075951 gaatccctagacatcagacggatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattg 40075852  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40075851 gggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 40075759  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  40075758 gatcttccgaggccagcaaatga 40075736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Original strand, 5679558 - 5679882
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgta--ccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgca 135  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5679558 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtacggtgtttgtagggtgtataccgtcacttgcctgagagggttttgcggcagtacggatacgtcca 5679657  T
Q  136 gaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcc 235  Q
    || | |||| ||||| |  || ||||||   || |  | |||||||   |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||      
T  5679658 gagcgtccctagacaactaacggatgttgtagagcggcgaccgcctcagattgtgcagccattcatcgacttccgcactcacacgcttaaggagcccgat 5679757  T
Q  236 cggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccag 335  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5679758 tggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggtatactacggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccag 5679857  T
Q  336 gagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||||||||||||||  ||||||||    
T  5679858 tagatcttccgaggctagcaaatga 5679882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Original strand, 51778 - 52103
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  | | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51778 ttcgagggggtattctgatattcatgctagattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 51877  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    || || |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  51878 agtccgtccctagacatccgtcagatgttgtagagctgtcaccgactcagattgtgcaggatttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcga 51977  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      |||||||||| ||| ||||| |||||||||    | | ||||||||||| |  |||||| |    |||||||||||||| || || |||| | || ||    
T  51978 ttggggtgagcatgcatgagagcagacatggcatatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcacatttttccacttctttca 52077  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||    
T  52078 tgagatattccgaggcctccaaatga 52103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30761485 - 30761310
Alignment:
Q  197 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagac--------------atggcgggcggcggatggcta 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||              |||||||  |||||||| |||    
T  30761485 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggcagatggcggatggcggatgacta 30761386  T
Q  283 tgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 358  Q
    |||  | |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30761385 tgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaatttttccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaat 30761310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 41883212 - 41883561
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883212 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 41883311  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41883312 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 41883411  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41883412 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 41883511  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883512 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41883561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 48406030 - 48406379
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406030 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 48406129  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48406130 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 48406229  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48406230 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 48406329  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406330 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 48406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9368787 - 9368438
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368787 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 9368688  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9368687 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 9368588  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9368587 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgtgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 9368488  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368487 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9368438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17460647 - 17460298
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460647 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17460548  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17460547 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17460448  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17460447 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17460348  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460347 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17460298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 17592567 - 17592916
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592567 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17592666  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17592667 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17592766  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17592767 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17592866  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592867 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17592916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35607776 - 35607427
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607776 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctagatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 35607677  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35607676 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 35607577  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35607576 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 35607477  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607476 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 35607427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42505318 - 42504970
Alignment:
Q  12 aggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42505318 aggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggt 42505219  T
Q  112 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42505218 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattgtgcagatgttcgtcgacttccgc 42505119  T
Q  212 actcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcacc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42505118 actcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcacc 42505019  T
Q  312 ctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505018 ctcatatcttgctgcctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42504970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15071655 - 15071319
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||          |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071655 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggttt---tg----------agggtgtaccatcacttgcccgagaggg 15071569  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15071568 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15071469  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15071468 cactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 15071369  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071368 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15071319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 17837632 - 17837974
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17837632 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtatggtgtaccgtcacttgcccgagatgg 17837731  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  17837732 ttttgaggcagtatggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 17837831  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17837832 cacttacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaagcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 17837924  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837925 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17837974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 377
Target Start/End: Original strand, 10521503 - 10521868
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10521503 gaggagcacatggagatgcatgactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagg- 10521601  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  10521602 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgcctgacattgtacaggcgttcgtcgactttcg 10521701  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  10521702 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 10521801  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10521802 cctcatatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcatatcattgcag 10521868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5538933 - 5538587
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5538933 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgttcgtacggtgtaccgtcacttgcccgagtgggttt 5538834  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||| ||| ||||||||||  ||||||   || || ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5538833 tgaggcagtacaaatacatctagaccaaccctagacatccgatggatgttgtagagctgccatcgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 5538734  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  5538733 tcacacacttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 5538634  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5538633 cagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggccagcaaatga 5538587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 13322706 - 13323055
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13322706 gaggagaatagagagatccaggattttgaggaggttttatggtattctggctggataatgtgtggtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 13322805  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||   || || ||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||  |    
T  13322806 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgaaagatgttgtagagctgccaccacctcacattgtgcaggcgttcatcgactttag 13322905  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  13322906 cactcacacgcttaagggggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctcac 13323005  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13323006 cctcagatattgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 13323055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 16680134 - 16680480
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16680134 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 16680233  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  16680234 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 16680333  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  16680334 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 16680433  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16680434 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 16680480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 17654370 - 17654716
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17654370 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 17654469  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  17654470 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 17654569  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  17654570 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 17654669  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17654670 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 17654716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27451069 - 27450723
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27451069 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgtttatagggtgtaccgtcactttcccaagagggttt 27450970  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||  ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  27450969 tgaggtagtacggatacgtccaaaccgtctccagatatccgaacgatgttgtagagctgtcaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 27450870  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  27450869 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 27450770  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27450769 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 27450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 360
Target Start/End: Original strand, 34741444 - 34741742
Alignment:
Q  55 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 154  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  34741444 ttctggctggattatgtgcggtgttcgtagaatgtactgtcacttgcccgatagggttttgaagcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatctg 34741543  T
Q  155 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggag 254  Q
    || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  34741544 acggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggag 34741643  T
Q  255 aggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgc 354  Q
    || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  34741644 agcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaggctgtctcaacctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagaccagc 34741736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11630643 - 11630427
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11630643 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11630544  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11630543 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11630444  T
Q  214 tcacacgcttaaggcgg 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  11630443 tcacacgcttaaggcgg 11630427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47670561 - 47670239
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47670561 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgcaccgtcacttgcccgaaagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 47670462  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    || | || ||||||||| | || |||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   |    
T  47670461 ccgtacctagacatccgtcggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtcggccgattg 47670362  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    ||  ||||||||||    |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  47670361 gggtgagcatccaggagaggagacatggcgtatagcatatggctatgtatgatggtacgccattgtgtctcaccctcagaatttgccacttcttccagga 47670262  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||| || |||||||| |||||||    
T  47670261 gatatttcgaggcctccaaatga 47670239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11632884 - 11632680
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11632884 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11632785  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11632784 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11632685  T
Q  214 tcaca 218  Q
    |||||    
T  11632684 tcaca 11632680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 360
Target Start/End: Original strand, 37342992 - 37343271
Alignment:
Q  81 gtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcc 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||   || ||  |||||||    
T  37342992 gtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttaaggcaatacggatacgtccagacaaaccctagacatccggcggatgttgtagagctgacaccgcc 37343091  T
Q  181 ttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggc 280  Q
    |   ||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| |||    
T  37343092 tcagattgtgcagacattcgtatacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggc 37343191  T
Q  281 tatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37343192 tatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 37343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 201 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47522172 - 47522013
Alignment:
Q  201 tcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctag 300  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||    
T  47522172 tcgacttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactag 47522073  T
Q  301 ggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47522072 ggtgtctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaatga 47522013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9492221 - 9491989
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    |||||| |||| |||| | |||| || | ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  9492221 ttcgagaaggtattctagcattcaggtttgattatgtgtggtgatcgtagagtgtaccgtcactttcccgagagggttttaaggcagtacggatacaccc 9492122  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |      
T  9492121 agaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccaa 9492022  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 267  Q
      |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9492021 ttggggtgagcatgtaggagaggagacatggcg 9491989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11630387 - 11630317
Alignment:
Q  290 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11630387 tggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 11630317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 152
Target Start/End: Original strand, 36980256 - 36980373
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36980256 ttcgaggaggtattcctgtattcaggctgaattatgtgtggtgatcgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtcc 36980355  T
Q  135 agaccatccccagacatc 152  Q
    ||||  |||| |||||||    
T  36980356 agactgtccctagacatc 36980373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17748067 - 17747944
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | ||    | ||||||  |||||||||| ||||| |||     
T  17748067 gagcacagggagatccaggattttgaggagattttctggtattcagtttggattatgtgcagtgttgacaaggtgtattgtcacttgcctgagagagtta 17747968  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  17747967 ggcggcagtacggatacgtgcaga 17747944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 360
Target Start/End: Original strand, 16488281 - 16488394
Alignment:
Q  248 gcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccc-tcagatcttgccacctattccaggagatcttccg 346  Q
    ||||||||| |||||||||||     |||||| |||||  | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16488281 gcaggagagcagacatggcggataagggatggatatgtgttatggtacactaaggtgtttcacccctcagattgtgccacctcttccaggagatcttccg 16488380  T
Q  347 aggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||    
T  16488381 aggccagcaaatga 16488394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Original strand, 41734630 - 41734700
Alignment:
Q  197 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 267  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41734630 ttcgtagacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 360
Target Start/End: Original strand, 41734713 - 41734749
Alignment:
Q  324 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41734713 cacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 41734749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6179189 - 6178840
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179189 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6179090  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6179089 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6178990  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178989 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6178890  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178889 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6178840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41796424 - 41796075
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41796424 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtactgtcacttgcccgagaggg 41796325  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796324 ttttgaggcaatacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 41796225  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41796224 cactcacacgcttaaggcggacgcctggggtgagcaggtaggagaggagacatggcgggcgggggatggctatgtcttgtggtacgctagggtgtctcac 41796125  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796124 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41796075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 49168183 - 49168532
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168183 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49168282  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49168283 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 49168382  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49168383 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49168482  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168483 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 31424412 - 31424761
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424412 gaggagcacagagagattcaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 31424511  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31424512 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaaggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 31424611  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31424612 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcacactagggtgtctcac 31424711  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424712 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 31424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1306521 - 1306170
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306521 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1306422  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1306421 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1306322  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatg--gcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306321 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 1306222  T
Q  309 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306221 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 49093093 - 49093443
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093093 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49093192  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  49093193 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccctagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 49093292  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacat-ggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49093293 cactcacatgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 49093392  T
Q  310 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093393 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49093443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21018977 - 21018628
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21018977 gaggagcatagagagatccaggacttagaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagcgtgtaccgtcactttcccgagaagg 21018878  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |    
T  21018877 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattatgcaggtgttcgtcgacttccg 21018778  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21018777 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 21018678  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018677 cctaagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 21018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40355802 - 40355453
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355802 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttatggtattctgggtggattatgtgtagtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 40355703  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40355702 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 40355603  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  40355602 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcgaatggcaatgtcatatggtacactagggtgtctaac 40355503  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40355502 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagacctgcaaatga 40355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30724148 - 30723877
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724148 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30724049  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30724048 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttcaattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30723949  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggcta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30723948 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44677366 - 44677020
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44677366 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttttggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 44677267  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  44677266 tgaggcagtacggatacatccagaccatccccaggcatctgactgatgttgtaaacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 44677167  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  44677166 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 44677067  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  44677066 cagatcttgccacctcttccaggagatttttcgaggcctgtaaatga 44677020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 50277829 - 50278175
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50277829 gagcacagagagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50277928  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||  | |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  50277929 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagttgccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 50278028  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  50278029 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcacactagggtgtctcaccct 50278128  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50278129 catattttgtcacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37016967 - 37016633
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016967 gagcatagggagatccagaactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 37016868  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  37016867 tgaggcaatacggatacgtcaagaccatccccagacatctgacggatgttgtagacctcccatcgccttacattgtgcagacgttcgttgacttccgcac 37016768  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||            |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37016767 tcacacacttaaggcggacgattggggtgagc------------agacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 37016680  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37016679 aagatcttgccacctctttcagtagatcttccgaggcctgcaaatga 37016633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 8109835 - 8110172
Alignment:
Q  23 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 122  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109835 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 8109934  T
Q  123 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 222  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||| |||||    
T  8109935 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgtctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcatacgct 8110034  T
Q  223 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 322  Q
    |||||| | ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  8110035 taaggcagccgattggggtgagcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttt 8110134  T
Q  323 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8110135 ccacatcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 8110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10730352 - 10730030
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10730352 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10730253  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10730252 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10730153  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10730152 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10730053  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10730052 gatcttccgaggccagcaaatga 10730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10944121 - 10943799
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10944121 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10944022  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10944021 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10943922  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 337  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10943921 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10943822  T
Q  338 gatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10943821 gatcttccgaggccagcaaatga 10943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Original strand, 51685810 - 51686104
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51685810 gagcacagagagatctaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccgagagggttt 51685909  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||| ||||| ||||    
T  51685910 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcaacttctgcac 51686009  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 308  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  51686010 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcggatgacagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctc 51686104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 50904047 - 50904377
Alignment:
Q  23 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 122  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50904047 gagatccaggattttgaggagggtttttggttttcaggttggatcatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagt 50904146  T
Q  123 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 222  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50904147 acagatacgtccagaccgtccccaggcatccgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgatttccgcactcacacgct 50904246  T
Q  223 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 322  Q
    ||||| || ||   | |||||||||| ||||||| ||||||       |||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  50904247 taaggtggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagacat-------ggcggacggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagattttg 50904339  T
Q  323 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
     ||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50904340 tcacctctttcagaagatcttcccaggccagcaaatga 50904377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Original strand, 71624 - 71958
Alignment:
Q  26 atccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacg 125  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71624 atccaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttggccgagagggttttgaggcagtacg 71723  T
Q  126 gatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaa 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||   || ||  || || ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71724 gatacgtccagaccatccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcatcggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 71823  T
Q  226 ggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgcca 325  Q
    ||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||| ||    
T  71824 ggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgtca 71923  T
Q  326 cctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    | | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  71924 cttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 71958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50021065 - 50020734
Alignment:
Q  17 cacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttga 116  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50021065 cacagggagatacatgattttgaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttga 50020966  T
Q  117 ggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactca 216  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||| |||   |||||||    
T  50020965 ggcagtacgggtacgtccataccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgactcagattgtgcaggcattcgtcaactctcgcactca 50020866  T
Q  217 cacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcag 316  Q
    || ||| |||| || ||   |||||||||            ||||||||| |  ||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  50020865 catgctcaaggaggccgattggggtgagc------------agacatggctgatggcggatggctatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcaa 50020778  T
Q  317 atcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50020777 attttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 50020734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13624894 - 13624569
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13624894 ttcgaggaagtattctggtattcaggttggattatgtgcggtgatcgtagggcgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 13624795  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  13624794 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagatctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 13624695  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      |||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    ||||||      ||||||||||||||||| || |||| | |||||    
T  13624694 ttggggtgagcatgcaagagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtatgatggtacatcgttgtgtctcaccctcagatttttccacatcttcca 13624595  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||    
T  13624594 ggagatattctgatgcctccaaatga 13624569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 50196076 - 50196218
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196076 gagcacagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50196175  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgac 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  50196176 tgaggcagtacggatacgttcaggccgtccccagacattcgac 50196218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 348
Target Start/End: Original strand, 14317284 - 14317618
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14317284 gagcacagggagattcagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtataccatcacttgcccgagagggttt 14317383  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||    ||  | |||||| ||||    
T  14317384 tgaggcggtacagatacgtccaaactgtccctagtcatccgacggatgttgtagagctgccactacctcagattgtgcaagcatttcttgacttccgcac 14317483  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| |   |   ||||||||| ||| |||||| | ||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  14317484 tcacacgcttaaggagcctgaatggggtgagccggcgggagagcaaacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 14317583  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 348  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14317584 catattttgccacctcttccaggagatcttccgag 14317618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41931334 - 41931108
Alignment:
Q  38 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 137  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  41931334 gaggaggttttctggtattaaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgttatctacccaagagggttttgaggcagcacggatacgtccaaa 41931235  T
Q  138 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 237  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||   |    
T  41931234 cagtccctagacatccgactgatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggccgattg 41931135  T
Q  238 gggtgagcaggcaggagaggagacatg 264  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  41931134 gggtgagcaggcagcagagcagacatg 41931108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 46438743 - 46438954
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||  ||||||||||  || |||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46438743 gagcacaaggagatccagggatttgaggagatattctagtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttt 46438842  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  46438843 tgaggcagtacagatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtcgacttccgcac 46438942  T
Q  214 tcacacgcttaa 225  Q
    ||||||||||||    
T  46438943 tcacacgcttaa 46438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 377
Target Start/End: Original strand, 30706657 - 30706942
Alignment:
Q  92 cgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgc 191  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||    
T  30706657 cgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacgaatacgtctagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgc 30706756  T
Q  192 agatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtg 291  Q
    ||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||   |  |||  | | |||  | ||    
T  30706757 aggcattcgtagacttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatgagggaatgttgtgtgttatg 30706856  T
Q  292 gtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||| |||||||||    
T  30706857 atacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcggaggccaacaaatgaagagcatatcattgcag 30706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30723847 - 30723777
Alignment:
Q  290 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723847 tggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgtaaatga 30723777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 360
Target Start/End: Original strand, 50196224 - 50196351
Alignment:
Q  237 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgct----agggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 332  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||  | |||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50196224 ggggtgtgcaggtaggagagcagacatggctgatggtggatggctatgtgttatggtacactcactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 50196323  T
Q  333 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50196324 caggagatcttccgaggccagcaaatga 50196351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 55278927 - 55278820
Alignment:
Q  253 agaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcct 352  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  55278927 agaggagacatggcggatggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgattttgccacttcttccaggatatcttccgaggcca 55278828  T
Q  353 gcaaatga 360  Q
    || |||||    
T  55278827 gctaatga 55278820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 46438956 - 46439038
Alignment:
Q  275 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaa 357  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46438956 gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccatgagatcttccgaggccagcaaa 46439038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21535597 - 21535449
Alignment:
Q  15 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 114  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||| |||| || ||||| || | | |||||||| | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21535597 agcacagggagatccagggttttgaggagattttatgttattcaggctaggttatgtgcagtgttattagggtgtatcgtcacttgcctgagagagtttt 21535498  T
Q  115 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgtt 163  Q
    | ||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21535497 gcggctgtacggatatgtcgagaccgtccctagacatccgacggatgtt 21535449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 351
Target Start/End: Original strand, 12891833 - 12891924
Alignment:
Q  260 acatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcc 351  Q
    |||||||||  || |||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || | ||||||||| |||||||    
T  12891833 acatggcggatggaggatggctatatacggtggtacactagggtgtatcaccctcagattttgccacttctttcgggagatctttcgaggcc 12891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 12891586 - 12891703
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||  ||   ||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  12891586 gagcacagggagatccagggttttgaggagattttctggtattcaggctgggttatgtgcggtgt-tgttaagtgtatcgtcacttgcctgagagagtta 12891684  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgt 132  Q
     | ||||||||||||||||    
T  12891685 ggcggcagtacggatacgt 12891703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40886789 - 40886693
Alignment:
Q  237 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 333  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |  ||  ||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40886789 ggggtgagccggcatgagaggtgacatggcagatggatgatggttatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacttattcc 40886693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40887012 - 40886874
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    |  ||||| |||||||| |  ||||| |||     
T  40887012 gagcatagagagatccaagattttgaggagattttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttgacaacgtgtatcgtcactttcttgagagagtta 40886913  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatc 152  Q
     | ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40886912 ggcggcagtaaggatacgtgcagaacgtccctagacatc 40886874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3729729 - 3729379
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729729 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 3729630  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccg-ccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3729629 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgcccttccattgtgcagatgttcgttgacttcc 3729530  T
Q  210 gcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3729529 gcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 3729430  T
Q  310 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729429 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 3729379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13637385 - 13637036
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13637385 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 13637286  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13637285 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggagctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 13637186  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13637185 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 13637086  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13637085 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 13637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 26878388 - 26878730
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878388 gaggagcacagagagatccatgacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26878487  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26878488 ttttgagacagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26878587  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26878588 cactcacacgcttaaggcggaagctcggggtgagcaagcaggagaggatacat-------ggcgaatggctatgtcctgtggtacactggggtgtctcac 26878680  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26878681 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttctgaggcctgcaaatga 26878730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 19158692 - 19159041
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19158692 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 19158791  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  19158792 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaaacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 19158891  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19158892 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 19158991  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158992 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19159041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 95474 - 95132
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  95474 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgataggg 95375  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  95374 ttttgaggcagtacggatatttccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 95275  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  95274 cactcacacgcttaaggcggatgattggggtgagcagacaggagagtagacatg-------gcggatggctatgtcctatagtacactagggtgtctcac 95182  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  95181 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 95132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31781039 - 31780697
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31781039 gaggagcacagggagatccaggactttgaggggattttctggtattctggttggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 31780940  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31780939 ttatgaggcagtacggatacgtccagaccatccccaaacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcagacgttcgtcgacttccg 31780840  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31780839 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagtaggcaggagagcagacatg-------gcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31780747  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31780746 cctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgaggcctgcaaatga 31780697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 360
Target Start/End: Original strand, 22526674 - 22527016
Alignment:
Q  11 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 110  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526674 gaggagcacatggagatctaggactttgaggaggttttctagtactctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22526773  T
Q  111 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22526774 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 22526873  T
Q  211 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 310  Q
    | |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22526874 ccctcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcaaacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 22526966  T
Q  311 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526967 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 22527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19522653 - 19522316
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19522653 gagcacagagagatacaggatattgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 19522554  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  19522553 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcaacttccgccc 19522454  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19522453 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 19522361  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 358  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19522360 cagattttgccacctcttccaggagatctttcgaggccagcaaat 19522316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 360
Target Start/End: Original strand, 52804570 - 52804888
Alignment:
Q  42 aggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  52804570 aggttttctggtattatgcttggattatgtgaggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgt 52804669  T
Q  142 ccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||   || || |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |   |||||    
T  52804670 ccccagacatccgacggatgttgtagagctgccactgcctcacattgtgcagacgttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggt 52804769  T
Q  242 gagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  52804770 gagcaggcaggagagcagacatggaggatgacggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagata 52804869  T
Q  342 ttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  52804870 ttccgaggccagcaaatga 52804888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 47505016 - 47505350
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47505016 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtaatcaggctggattatgtgcggtgttcgt-gggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 47505114  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||   || |   ||||||||   |||||||||   |||||||||||| || |    
T  47505115 tgaggcagtacaaatacgtccagactgtccccagacatccgacggatgttgtagagcgatcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcgc 47505214  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  47505215 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 47505314  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgagg 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47505315 cagatcttgccacctcttccaggagatctttcgagg 47505350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 11196537 - 11196883
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  11196537 gagcacaaagaaatccaggattttgaggaggttttttggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtagggtgtaccgtcacttgtctgagagggtgt 11196636  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  11196637 tgaggcagtacggatacgtccagatgatccctagacatccgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcagacattcgtcgatttccgcac 11196736  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  11196737 tcacatgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcagcagagcagacatgtcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 11196836  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11196837 cgtattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 11196883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 47660547 - 47660893
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47660547 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattctggtattcaggctggattatctgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 47660646  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  47660647 tgaggaagtacggatacgtccagagggtccctagacatcggacgaatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttctgcac 47660746  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||| | || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  47660747 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagccgacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 47660846  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47660847 cagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatga 47660893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 45828251 - 45828596
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45828251 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtataccgtcacttgcccaagagggttt 45828350  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    ||||| |||||  |||||| || | | |||| |||||||| || ||||||   || || |||| ||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  45828351 tgaggtagtacaaatacgttcatagcgtccctagacatcctacagatgttgtagagctgccactgcctcagattgtgcag-cattcgtcgacttccgcac 45828449  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||   || ||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||    
T  45828450 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccct 45828549  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  45828550 cagattttgccacctctttcatgagatcttatgaggccagcaaatga 45828596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50341525 - 50341407
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50341525 gagcacagggagatccaggatttagaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50341426  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgt 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50341425 tgaggcagtacggatacgt 50341407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49855377 - 49855036
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  49855377 ttcgagggggtattctggtattcaagttggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtgacttgcccgagaggg-tttgaggcactacagatacgtcc 49855279  T
Q  135 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 234  Q
    ||||| |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  49855278 agaccgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccggctcaaattgtgcagactttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggcggccga 49855179  T
Q  235 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 334  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | || |     
T  49855178 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttctttcg 49855079  T
Q  335 ggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  49855078 ggagatattccaaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 49855036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50618052 - 50617929
Alignment:
Q  237 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50618052 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 50617953  T
Q  337 agatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  50617952 agatcttccgaggccagcaaatga 50617929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 21143654 - 21143763
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| |||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143654 gagcacagggagatctaggattttgtgaaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 21143753  T
Q  114 tgaggcagta 123  Q
    ||||||||||    
T  21143754 tgaggcagta 21143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 360
Target Start/End: Original strand, 21143770 - 21143950
Alignment:
Q  173 ccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcgg 272  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||   |||||||||| |||| |||| ||||| ||||         
T  21143770 ccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagacaaggcg----- 21143864  T
Q  273 cggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
      ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21143865 --gatggctatgtgctatggtacacttgggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagttcttccgaggccagcaaatga 21143950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38120475 - 38120195
Alignment:
Q  80 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||   || ||  ||| ||    
T  38120475 cgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagacgatccctaaacatctgacggatgttgtagagctgacactgc 38120376  T
Q  180 cttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatgg 279  Q
    ||   |||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||| || |||| ||||||||||   |  ||| ||    
T  38120375 ctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcgtatgagggaggg 38120276  T
Q  280 ctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||  | |||||| ||| |||  | || |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38120275 ctatgtgttatggtacactaaggtaacccatcctcagatttttccacctcttctaggagatcttccgatgccagcaaatga 38120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35256622 - 35256520
Alignment:
Q  35 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  35256622 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagagttttgagacagtacggatacgttc 35256523  T
Q  135 aga 137  Q
    |||    
T  35256522 aga 35256520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23273632 - 23273541
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccga 105  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23273632 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttttggtattccggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccga 23273541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16269984 - 16269827
Alignment:
Q  203 gacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctaggg 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||  | |||||| ||| |     
T  16269984 gacttccgcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacga 16269885  T
Q  303 tgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16269884 tgtctcacccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatga 16269827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23273506 - 23273427
Alignment:
Q  262 atggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 341  Q
    |||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  23273506 atggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatc 23273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35256482 - 35256425
Alignment:
Q  320 ttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  35256482 ttgccacttattccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 35256425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 360
Target Start/End: Original strand, 12025 - 12371
Alignment:
Q  14 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 113  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12025 gagcacagggagatccaggcttttgaggacgtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcatttgctcgagagggttt 12124  T
Q  114 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 213  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  12125 tgaggcagtacgaatacgtcctgaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgtagtctttcgtcgacttccgcac 12224  T
Q  214 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 313  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    |||||| | |  ||||||||||||    
T  12225 tcacacgcttaaggaggtcgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtaggatggtacaccattgtgtctcaccct 12324  T
Q  314 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 360  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  12325 cagattttgccacttcttccaggaaatattccgaggccaccaaatga 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Original strand, 56476 - 56579
Alignment:
Q  237 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  56476 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 56575  T
Q  337 agat 340  Q
    ||||    
T  56576 agat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22411 - 22343
Alignment:
Q  275 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 343  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  22411 gatggctatatactatggtacactagggtgtctcaacctctgattttgccacttcttctaggagatctt 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University