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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12500_low_4 (Length: 517)

Name: NF12500_low_4
Description: NF12500
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12500_low_4
NF12500_low_4
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (16-517)||(36392717-36393213)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 517
Target Start/End: Original strand, 36392717 - 36393213
Alignment:
Q  16 agtatccgtcttaacgatagtttgatataataaatattagcatgatgatacattcaccgctcttttttaaaaaagttcatcaatatcatcacaatacata 115  Q
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T  36392717 agtatccgtcttaacgatagtttgatataataaatattagcatgatgatacattcaccgcttttttttttaa--gttcatcaatatcatcacaatacata 36392814  T
Q  116 gtgggatgcatatttatacttgattaccacttaattatgaaatatccatactattagcaagataattttctttgcttttgatggaaaatcaaacatataa 215  Q
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T  36392815 gtgtgatgcatatttatacttgattaccacttaattatgaaatatccatactattagcaagataattttctttccttttgatggaaaatcaaacatataa 36392914  T
Q  216 aaaacggaatatctactcaagatccacaaagcaatacaaaaggaaattgacaacaacactgattgttgtctttttatataaccactcttgataaacacac 315  Q
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T  36392915 aaaacggaatatctactcaagatccacaaagcaatacaaaaggaaattgacaacaacactgattgttgtctttctatataaccactcttgataaacacac 36393014  T
Q  316 aacgttatttatgcatgaaatttattacttagaagttcaccatgcatgatgatgatatcattatgatcagttacgagtgttgttctcagtttgcatggca 415  Q
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T  36393015 aacgttatttatgcatgaaatttattacttagaagttcaccatgc---atgatgatatcattatgatcagttacgagtgttgttctctgtttgcatggca 36393111  T
Q  416 acagcttcaccagcatatgagcaacactttctgcaactcccataatacctgtcaccgcaacagccatagcgacaataattaccaccacggtttccaggat 515  Q
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T  36393112 acagcttcaccagcatatgagcaacactttctgcaactcccataatacctgtcaccgcaacagccatagcgacaataattaccaccacggtttccaggat 36393211  T

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