View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12501_low_10 (Length: 372)

Name: NF12501_low_10
Description: NF12501
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12501_low_10
NF12501_low_10
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (5-354)||(19038199-19038548)
chr5 (5-354)||(28238769-28239118)
chr5 (3-354)||(28879268-28879619)
chr5 (5-352)||(30707719-30708066)
chr5 (5-354)||(8577575-8577924)
chr5 (5-304)||(8739-9038)
chr5 (8-354)||(7760012-7760351)
chr5 (8-354)||(38407887-38408226)
chr5 (8-354)||(5199442-5199781)
chr5 (8-354)||(511646-511985)
chr5 (8-354)||(42538468-42538814)
chr5 (32-346)||(8699470-8699784)
chr5 (8-354)||(38970716-38971062)
chr5 (8-371)||(42937675-42938019)
chr5 (32-354)||(15939344-15939666)
chr5 (284-354)||(40623041-40623111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (5-354)||(17423138-17423487)
chr2 (5-354)||(30493997-30494346)
chr2 (5-354)||(43981193-43981542)
chr2 (5-354)||(15833928-15834277)
chr2 (5-354)||(5354643-5354992)
chr2 (5-354)||(43536740-43537089)
chr2 (5-354)||(45431177-45431526)
chr2 (5-354)||(28471200-28471549)
chr2 (5-354)||(39950166-39950515)
chr2 (8-354)||(29398641-29398987)
chr2 (5-342)||(7189485-7189822)
chr2 (8-354)||(10825954-10826293)
chr2 (5-166)||(22680191-22680351)
chr2 (8-350)||(36653536-36653878)
chr2 (25-354)||(7416474-7416803)
chr2 (8-258)||(40538214-40538464)
chr2 (251-354)||(20067493-20067596)
chr2 (8-82)||(45292545-45292619)
chr2 (296-331)||(22529914-22529949)
chr2 (284-354)||(40538476-40538546)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (5-354)||(46401377-46401726)
chr3 (5-354)||(42901192-42901541)
chr3 (5-354)||(46698347-46698696)
chr3 (5-354)||(49141550-49141899)
chr3 (5-354)||(50477809-50478158)
chr3 (5-354)||(54388797-54389146)
chr3 (5-354)||(34048097-34048446)
chr3 (5-354)||(2272088-2272437)
chr3 (5-371)||(36130157-36130523)
chr3 (5-354)||(4005443-4005791)
chr3 (8-354)||(47071219-47071558)
chr3 (8-354)||(599550-599888)
chr3 (43-354)||(17562375-17562686)
chr3 (88-354)||(9473034-9473300)
chr3 (8-354)||(20353216-20353562)
chr3 (8-354)||(41614944-41615282)
chr3 (8-354)||(49266401-49266747)
chr3 (8-354)||(16646183-16646516)
chr3 (8-354)||(44232393-44232732)
chr3 (8-354)||(48565551-48565890)
chr3 (8-354)||(42759337-42759676)
chr3 (29-354)||(48891213-48891538)
chr3 (29-261)||(50758795-50759027)
chr3 (5-131)||(52388827-52388953)
chr3 (164-354)||(52388630-52388820)
chr3 (242-354)||(2648608-2648720)
chr3 (29-354)||(42804993-42805318)
chr3 (8-133)||(51807851-51807976)
chr3 (118-354)||(50214199-50214428)
chr3 (8-354)||(30253126-30253472)
chr3 (5-77)||(3495550-3495622)
chr3 (191-354)||(6927989-6928146)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (9-354)||(27638424-27638769)
chr6 (5-354)||(6203821-6204170)
chr6 (5-354)||(11690788-11691137)
chr6 (5-354)||(30826654-30827003)
chr6 (5-354)||(22303902-22304251)
chr6 (5-354)||(31770746-31771088)
chr6 (5-276)||(26440113-26440384)
chr6 (17-352)||(26172594-26172936)
chr6 (8-354)||(2406918-2407257)
chr6 (29-354)||(24085850-24086177)
chr6 (8-354)||(32642567-32642912)
chr6 (191-354)||(2406059-2406222)
chr6 (29-354)||(18005475-18005800)
chr6 (8-354)||(3384104-3384449)
chr6 (231-327)||(21603282-21603378)
chr6 (296-354)||(32641897-32641955)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (5-354)||(1055198-1055547)
chr8 (5-354)||(23019323-23019672)
chr8 (5-354)||(26662119-26662468)
chr8 (5-354)||(15033801-15034150)
chr8 (5-354)||(22532-22881)
chr8 (5-354)||(42482542-42482891)
chr8 (5-354)||(486769-487118)
chr8 (8-354)||(34367646-34367992)
chr8 (8-354)||(39603963-39604308)
chr8 (5-354)||(43214075-43214405)
chr8 (17-354)||(34819646-34819983)
chr8 (8-354)||(41243120-41243447)
chr8 (8-354)||(20858688-20859034)
chr8 (8-354)||(39831787-39832125)
chr8 (8-354)||(5301343-5301689)
chr8 (8-354)||(21176349-21176695)
chr8 (32-354)||(45132438-45132760)
chr8 (8-354)||(35554270-35554609)
chr8 (32-354)||(40075736-40076051)
chr8 (32-354)||(5679558-5679882)
chr8 (29-354)||(51778-52103)
chr8 (191-352)||(30761310-30761485)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (5-354)||(41883212-41883561)
chr7 (5-354)||(48406030-48406379)
chr7 (5-354)||(9368438-9368787)
chr7 (5-354)||(17460298-17460647)
chr7 (5-354)||(17592567-17592916)
chr7 (5-354)||(35607427-35607776)
chr7 (6-354)||(42504970-42505318)
chr7 (5-354)||(15071319-15071655)
chr7 (5-354)||(17837632-17837974)
chr7 (5-371)||(10521503-10521868)
chr7 (8-354)||(5538587-5538933)
chr7 (5-354)||(13322706-13323055)
chr7 (8-354)||(16680134-16680480)
chr7 (8-354)||(17654370-17654716)
chr7 (8-354)||(27450723-27451069)
chr7 (49-354)||(34741444-34741742)
chr7 (8-224)||(11630427-11630643)
chr7 (32-354)||(47670239-47670561)
chr7 (8-212)||(11632680-11632884)
chr7 (75-354)||(37342992-37343271)
chr7 (195-354)||(47522013-47522172)
chr7 (29-261)||(9491989-9492221)
chr7 (284-354)||(11630317-11630387)
chr7 (29-146)||(36980256-36980373)
chr7 (8-131)||(17747944-17748067)
chr7 (242-354)||(16488281-16488394)
chr7 (191-261)||(41734630-41734700)
chr7 (318-354)||(41734713-41734749)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (5-354)||(6178840-6179189)
chr4 (5-354)||(49168183-49168532)
chr4 (5-354)||(41796075-41796424)
chr4 (5-354)||(31424412-31424761)
chr4 (5-354)||(1306170-1306521)
chr4 (5-354)||(49093093-49093443)
chr4 (5-354)||(21018628-21018977)
chr4 (5-354)||(40355453-40355802)
chr4 (5-276)||(30723877-30724148)
chr4 (8-354)||(44677020-44677366)
chr4 (8-354)||(50277829-50278175)
chr4 (8-354)||(37016633-37016967)
chr4 (17-354)||(8109835-8110172)
chr4 (32-354)||(10730030-10730352)
chr4 (32-354)||(10943799-10944121)
chr4 (8-302)||(51685810-51686104)
chr4 (17-354)||(50904047-50904377)
chr4 (20-354)||(71624-71958)
chr4 (11-354)||(50020734-50021065)
chr4 (29-354)||(13624569-13624894)
chr4 (8-150)||(50196076-50196218)
chr4 (8-342)||(14317284-14317618)
chr4 (32-258)||(41931108-41931334)
chr4 (8-219)||(46438743-46438954)
chr4 (86-371)||(30706657-30706942)
chr4 (284-354)||(30723777-30723847)
chr4 (231-354)||(50196224-50196351)
chr4 (247-354)||(55278820-55278927)
chr4 (269-351)||(46438956-46439038)
chr4 (9-157)||(21535449-21535597)
chr4 (254-345)||(12891833-12891924)
chr4 (8-126)||(12891586-12891703)
chr4 (231-327)||(40886693-40886789)
chr4 (8-146)||(40886874-40887012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (5-354)||(3729379-3729729)
chr1 (5-354)||(13637036-13637385)
chr1 (5-354)||(26878388-26878730)
chr1 (5-354)||(19158692-19159041)
chr1 (5-354)||(95132-95474)
chr1 (5-354)||(31780697-31781039)
chr1 (5-354)||(22526674-22527016)
chr1 (8-352)||(19522316-19522653)
chr1 (36-354)||(52804570-52804888)
chr1 (8-343)||(47505016-47505350)
chr1 (8-354)||(11196537-11196883)
chr1 (8-354)||(47660547-47660893)
chr1 (8-354)||(45828251-45828596)
chr1 (8-126)||(50341407-50341525)
chr1 (29-371)||(49855036-49855377)
chr1 (167-354)||(21143770-21143950)
chr1 (231-354)||(50617929-50618052)
chr1 (8-117)||(21143654-21143763)
chr1 (74-354)||(38120195-38120475)
chr1 (29-131)||(35256520-35256622)
chr1 (8-99)||(23273541-23273632)
chr1 (197-354)||(16269827-16269984)
chr1 (256-335)||(23273427-23273506)
chr1 (314-371)||(35256425-35256482)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (8-354)||(12025-12371)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (231-334)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (269-337)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19038548 - 19038199
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038548 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 19038449  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038448 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 19038349  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038348 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 19038249  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038248 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19038199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28239118 - 28238769
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239118 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgcccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28239019  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28239018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 28238919  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28238918 cactcacacgcttaaggcggacgctcgaggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtacactagggtgtctcac 28238819  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238818 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28238769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 354
Target Start/End: Original strand, 28879268 - 28879619
Alignment:
Q  3 aggaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879268 aggaggagcacagagagatccaggacttcgaggagattttctggtattcaggctggatcatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagag 28879367  T
Q  103 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28879368 ggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgattgatgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttc 28879467  T
Q  203 ggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 302  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28879468 cgcactcacacgattaaggcggacgatcgggatgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 28879567  T
Q  303 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879568 accctcagatctttccacctctttcaggagatcttccgaggcctgcaaatga 28879619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 352
Target Start/End: Original strand, 30707719 - 30708066
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707719 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattatgggtggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30707818  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  30707819 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattatgcaggtgttcgttgacttccg 30707918  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  30707919 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 30708018  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30708019 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 30708066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8577924 - 8577575
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577924 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8577825  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||  |||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  8577824 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagatcccattcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 8577725  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  8577724 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 8577625  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8577624 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 8577575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9038 - 8739
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattttggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 8939  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8938 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccgccgcctcccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 8839  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8838 cactcacacgcttaaggcagacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcac 8739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 7760012 - 7760351
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760012 gagcacagggagatccaagactttgaacaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 7760111  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7760112 tgaggcagtgcgaatacgtccagaccatccccagacatctaacggatgttgtagacctgccaccgctttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 7760211  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  7760212 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 7760304  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7760305 caaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 7760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38408226 - 38407887
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38408226 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 38408127  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38408126 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccatacatctaacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 38408027  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  38408026 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 38407934  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38407933 tagatcttgccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38407887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 5199442 - 5199781
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199442 gagcacagggagatccaggattttgaagaggttttctggtattcaggctgaattatgtgcgatgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 5199541  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  5199542 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcaaattgtgtaggcattcgtcgacttccgcac 5199641  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  5199642 tcacacgtttaaggcggccgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 5199734  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5199735 cagattttgccatctcttctaggagatcttccgaggccagcaaatga 5199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 511985 - 511646
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  511985 gagcacagggagatctaggattttgaggaggttttctggtattcatgctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 511886  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||| ||||||   || || |||||||||   ||||| |||   ||| |||||||| ||||    
T  511885 tgaggcagtacggatacgtccagagcgtccctagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtacaggcattcatcgacttccgcac 511786  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| | ||||       ||| |||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  511785 tcacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagaatacat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 511693  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  511692 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 42538468 - 42538814
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538468 gagcacatggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 42538567  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| ||| || |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || ||||| |||   |||||||||   || ||||||||| ||||    
T  42538568 tgaggcagtacgaatatgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccacctcagattgtgcaggcatttgtcgacttccgcac 42538667  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||  |||  ||   ||||||||||||||  |||| ||| |||   |  || ||||||||||||  | |||||| |||  |||| |||||||    
T  42538668 tcacacgcttacagcgaccgattggggtgagcaggcacaagagcagatatgatagatggtggatggctatgtgttatggtacactaaagtgtttcaccct 42538767  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42538768 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgagaccagcaaatga 42538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8699784 - 8699470
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8699784 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtctaga 8699685  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    ||  ||| ||||||||| | ||||||   || ||  | ||| ||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||   |    
T  8699684 ccgcccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcgccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggaggccgattg 8699585  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||   | | |||| |||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8699584 gggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtttgacagatgcctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccagga 8699485  T
Q  332 gatcttccgaggcct 346  Q
    ||| |||||||||||    
T  8699484 gatattccgaggcct 8699470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 38970716 - 38971062
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| | || |||||||| || |||||||| ||| | || | || |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38970716 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattatggtattcaggctggattatttgcagtgttcataaggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgt 38970815  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||| |||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  38970816 tgaggcagtacagatacgtacagaagatccctggacatctgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcaagcattcgtcgacttccgcac 38970915  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |  ||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38970916 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagcagacagcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttgtggtacactaaggtgtctcaccct 38971015  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38971016 cagatttttccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatga 38971062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42938019 - 42937675
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  42938019 gagcacagggagatccaagatttttaggaggttttctggttttcaggctggatcatgtgcggtgttcgtagggtgttc-gtcacttgcccgagggggttt 42937921  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||| ||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  42937920 tgaggcagtacagatacgtccagactgtccctaggcatctgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 42937821  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgt-ggtacgctagggtgtctcaccc 306  Q
    ||||||||||||||||  ||   |||||||||            ||||||       ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  42937820 tcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtgctatgggtacactagggtgtctcaccc 42937740  T
Q  307 tcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||| |||||||||    
T  42937739 tcagattttgccacctcttccaggagatcttcccaggctagcaaatgaggagcatatcattgcag 42937675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Original strand, 15939344 - 15939666
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  15939344 gaggagcttttctagtattcaggatgaattatgtgtggtgttcgtagagtgtactgtcatctgctcaagaggattttgaggcagtacggatatgtccaga 15939443  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||   || || |||||||||   |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||   |    
T  15939444 cggtccctagacatccgattgatgttgttgagctgccaccgcctcatattgtgcaggcttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattg 15939543  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| ||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  15939544 ggatgagcaggcagtagagcagacaaggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaagttgtctcacccttagattttgccacctcttccagga 15939643  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||||| ||||||| ||||||||    
T  15939644 tatctttcgaggccagcaaatga 15939666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40623111 - 40623041
Alignment:
Q  284 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40623111 tggtacactaaggtgcctcatcctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 40623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 17423138 - 17423487
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423138 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17423237  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423238 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 17423337  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423338 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 17423437  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423438 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30494346 - 30493997
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494346 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30494247  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30494246 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30494147  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494146 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30494047  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494046 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 43981193 - 43981542
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981193 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43981292  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43981293 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 43981392  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43981393 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43981492  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981493 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 43981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 15833928 - 15834277
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15833928 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 15834027  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15834028 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15834127  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15834128 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15834227  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15834228 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 15834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 5354643 - 5354992
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354643 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 5354742  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5354743 ttttgaggcagtacggatacgtgtagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 5354842  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5354843 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 5354942  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354943 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 5354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43537089 - 43536740
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537089 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 43536990  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43536989 ttttgaggcagtacggatacatgcagactatccccagacatctgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 43536890  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43536889 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 43536790  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43536789 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 43536740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 45431177 - 45431526
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431177 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 45431276  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  45431277 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatcctactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcaggtgttcgtcaacttccg 45431376  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  45431377 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 45431476  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45431477 cctcagatcttgccaccttttctaggagatcttccgaggcctgcaaatga 45431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 28471200 - 28471549
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471200 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttttggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 28471299  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28471300 ttttgaggtagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggatctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 28471399  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  28471400 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 28471499  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28471500 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatga 28471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 39950166 - 39950515
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950166 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 39950265  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  39950266 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttacattgtacaggcgttcgtcgacttccg 39950365  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39950366 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 39950465  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39950466 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 39950515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29398987 - 29398641
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29398987 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttt 29398888  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  29398887 tgaggcagtacggatacgtcctgaccatccccagacatccgacggatgttgtagacttgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 29398788  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  29398787 tcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 29398688  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29398687 cagattttgtcatctcttccaggaaatcttcctaggcctgcaaatga 29398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 342
Target Start/End: Original strand, 7189485 - 7189822
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189485 gaggagcacatggagatccaggactttgaagaggttttctggtattctgactggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 7189584  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  7189585 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 7189684  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
     ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  7189685 tactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 7189784  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 342  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7189785 cctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgag 7189822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10826293 - 10825954
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10826293 gagcacagggagatccaagactttgatgaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 10826194  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10826193 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccgcagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 10826094  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | || |||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10826093 tcacatgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcagaatagcagacatg-------gcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 10826001  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10826000 cagattttgccacctcttccaggagatattccgaggcctgcaaatga 10825954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 22680191 - 22680351
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680191 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22680290  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680291 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat-cccagacatccgactgatgttagggacctc 22680351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36653878 - 36653536
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36653878 gagcacagggagatccatgattttgaggaggttttttggtattcaggttggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttt 36653779  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||    ||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  36653778 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagtttgtgaaggcattcgtcgacttccgcac 36653679  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||  | |||||  || ||||||||| ||||    
T  36653678 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtatactcgggtgtctcgccct 36653579  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 350  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36653578 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaa 36653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 354
Target Start/End: Original strand, 7416474 - 7416803
Alignment:
Q  25 ggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatac 124  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   |  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  7416474 ggacttccaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcaatgatcgtaaggtgcaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatat 7416573  T
Q  125 gtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcgg 224  Q
    || |||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7416574 gtccagaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatactttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcag 7416673  T
Q  225 acgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctat 324  Q
     ||   | |||||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |  |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  7416674 ccgattgcggtgagcatgcaggagaggagacatggcatatggcagatggctatgtacgatggtacgccattgcgtctcactctcagattttgccacttct 7416773  T
Q  325 tccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7416774 tccaggagatattccgaggcctccaaatga 7416803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 40538214 - 40538464
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40538214 gagcacagggacttccaggctttcgaggaggtattttggtattcaggctggattatgtgcgatgatcgtagggtgcaccgtcactttcccgagagggttt 40538313  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   || |||   || ||  ||||| ||   |||||| ||   || |||||||||  |||    
T  40538314 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagacatctgttggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgtaggcttttgtcgacttccacac 40538413  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatg 258  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  40538414 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagaggagacatg 40538464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20067596 - 20067493
Alignment:
Q  251 gagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaa 350  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |    
T  20067596 gagaaatggcggatggaggatggctatgtaatatggtacattagggtgtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatcttccgaggccagcta 20067497  T
Q  351 atga 354  Q
    ||||    
T  20067496 atga 20067493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 45292545 - 45292619
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtg 82  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || |||||||||    
T  45292545 gagcacagggagatccgggattttgaggaggttttctagtattcaggctggattatgtgcagtgttcgtagggtg 45292619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22529949 - 22529914
Alignment:
Q  296 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22529949 gtgtctcaccctcagattttgccacctattccagga 22529914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 354
Target Start/End: Original strand, 40538476 - 40538546
Alignment:
Q  284 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  40538476 tggtacgccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaagagatattctgaggcctccaaatga 40538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 46401377 - 46401726
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401377 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46401476  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401477 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 46401576  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401577 cactcacacgcttaaggcggacgtccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 46401676  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401677 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46401726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42901541 - 42901192
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901541 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 42901442  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42901441 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42901342  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42901341 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 42901242  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901241 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42901192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46698696 - 46698347
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698696 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 46698597  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46698596 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 46698497  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46698496 cactcacacgcttaagacggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 46698397  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698396 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 46698347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49141899 - 49141550
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141899 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49141800  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  49141799 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgatttccg 49141700  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49141699 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49141600  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141599 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49141550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50478158 - 50477809
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478158 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 50478059  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50478058 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgttgacttccg 50477959  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50477958 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 50477859  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50477858 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatga 50477809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 54388797 - 54389146
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54388797 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggcgtaccgtcacttgcccgagaggg 54388896  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  54388897 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgattttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 54388996  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54388997 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 54389096  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389097 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 54389146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 34048097 - 34048446
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048097 gaggagcacatagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccatagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 34048196  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  34048197 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgattttcg 34048296  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34048297 cactcacacgcttaaggcggtagcttggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 34048396  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048397 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 34048446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2272437 - 2272088
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272437 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 2272338  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  2272337 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgctttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 2272238  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2272237 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 2272138  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2272137 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttttgaggcctgcaaatga 2272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 371
Target Start/End: Original strand, 36130157 - 36130523
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36130157 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 36130256  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  36130257 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 36130356  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  36130357 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 36130456  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  36130457 cctcagattttgccacctctccctggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcatatcattgcag 36130523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4005791 - 4005443
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005791 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggatgttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 4005692  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4005691 ttttgaggcagtacggatacatgcagaccatccctagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 4005592  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  4005591 cactcacacgcttaaagcgg-cgattggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcac 4005493  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| |  ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4005492 cctcatactttgccacctctccctagagatcttccgaggcctgcaaatga 4005443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47071558 - 47071219
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47071558 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctgactggattatatgcggcgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattt 47071459  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  47071458 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacggatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcac 47071359  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||| |||||||||||  |   | |||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  47071358 tcacatgcttaaggcggctgattgaggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcactct 47071266  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
      ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47071265 tggatcttgccacctttaccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 47071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 599550 - 599888
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599550 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggc--------tggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 599641  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||   || || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  599642 tgaggcagtacggatacgtccagaccatcctcagacatctcacggatgttgtagagctgccattgccttacattgtgcaggtgttcgtcgacttctgcac 599741  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||    
T  599742 tcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggagagcagtcatggcggatggctgatggctattagctatggtacactaggatgtctcaccct 599841  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  599842 cagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgcaaatga 599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17562686 - 17562375
Alignment:
Q  43 ctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaga 142  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17562686 ctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctaga 17562587  T
Q  143 catccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcagg 242  Q
    |||| | | ||||||   || ||  || || |||  |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  17562586 catctgtcggatgttgtagagctgtcatcgtcttagattgtgcagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagg 17562487  T
Q  243 caggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 342  Q
    |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17562486 caggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatctcgccatctcttccaggagatcttccgag 17562387  T
Q  343 gcctgcaaatga 354  Q
    ||| ||||||||    
T  17562386 gccagcaaatga 17562375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 354
Target Start/End: Original strand, 9473034 - 9473300
Alignment:
Q  88 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcag 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    | || |||||| ||  |||||| |||    
T  9473034 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgatcgatgttgtacagctgccaccgtctcacattgtccag 9473133  T
Q  188 atgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggt 287  Q
      ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9473134 gcgttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatggt 9473233  T
Q  288 acgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473234 acactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 20353216 - 20353562
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20353216 gagcatagggagatccaggattttgaggagattttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggggtt 20353315  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   | |||||||   ||||||||||||  |||    
T  20353316 tgaggcagtacggatacgtccagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgcctcagactgtgcaggcattcgtcgacttccacac 20353415  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20353416 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20353515  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| || |||||| || || ||||||||| ||||||  |||||||    
T  20353516 cagatttttccacctctttcacgagatcttctgaggccaacaaatga 20353562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 41614944 - 41615282
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41614944 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 41615043  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  41615044 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatctggcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 41615143  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  41615144 tcacacgcttagggcggccg-atggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 41615235  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41615236 cagattttgccacctcttacaggagatcttccgaggccagcaaatga 41615282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49266747 - 49266401
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49266747 gagcacaaggagatccagaattttgaggaggttttctggtatttaggctggattatgtgaggtggtcgtagggtctaccgtcatttgcccgagagggttt 49266648  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||    
T  49266647 tgaggcagtacggagacgtccagaccgtccccaaacatctgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcac 49266548  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| || ||    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| || |||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  49266547 tcacacgcttaaggtggccgattagggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 49266448  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49266447 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggtcagcaaatga 49266401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 16646183 - 16646516
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16646183 gagcacagggagatccaggactttgagaaggtattctggtattctggctg-attatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcactttcccgatagggttt 16646281  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||   |||||   ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16646282 tgaggcagtacggatacatccagaccatcccaagacatctgaagtatgttgtagacctgccaccgccttacattatgcaggcgttcgtcgacttccgcac 16646381  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||            | |||||||||  |||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  16646382 tcacacgcttaaggcagacgattggggtgagc------------acacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtaaactagggtgtctcaccct 16646469  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16646470 ttgattttgccacctcttccaggagatcttccgagacttgcaaatga 16646516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 44232393 - 44232732
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  44232393 gagcacatggagatccaggattttaaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcatagggtgtactgtcactttttcgagagggttt 44232492  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  44232493 tgaggcagtgcggatacgtccagaccgtccccagacatctgacagatgttgtagagctgccaccgcctcagattatgcagatattcgtcggcttccgcac 44232592  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| | ||||       ||| |||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  44232593 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaagagagcatacat-------ggctgatgacaatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 44232685  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44232686 cagattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 44232732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 48565551 - 48565890
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  48565551 gagcactgggagatccaggattttgaggaggttttctggtgttcaggctagattatgtgtggtgttcgtagggtgtactgtcacttacccgagcgggttt 48565650  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  48565651 tgaggcagtacagatacgtccagagcgtctttagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 48565750  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||  |||||||||||||    
T  48565751 tcacacgcttaaggcggtcgaatggggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactgaggtgtctcaccct 48565843  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48565844 cagattttgccacctcttccagaagatcttccgaggccagcaaatga 48565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 42759337 - 42759676
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42759337 gagcacagggagatccaagattttgaggagcctttctggtattcaggctgaattatgtgcggtgttcgtagggtgtagcgtcacttgcccgagagggttt 42759436  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||  |||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  42759437 tgaggcagtacggatacatccagagcgtccctagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcatgcattcgtcgacttccgcac 42759536  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||||| ||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  42759537 tcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagcagacacaagagcagacat-------ggcggatggctatgttttatggtacactaaggtgtctcaccct 42759629  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || || ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42759630 caaattttgccacctcttctaagagatcttccgaggccagcaaatga 42759676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Original strand, 48891213 - 48891538
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48891213 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatatgcagtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 48891312  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  || || ||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  48891313 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcatcggctgagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 48891412  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      || ||||||| ||| ||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  48891413 ttggagtgagcatgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 48891512  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| || |||||||| |||||||    
T  48891513 ggagatattacgaggcctccaaatga 48891538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 50758795 - 50759027
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50758795 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgattgtagggtgtaccgtcacttgaccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 50758894  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  50758895 agaccgtccctagacatccgccggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 50758994  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 261  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50758995 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcg 50759027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52388953 - 52388827
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52388953 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggataatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagaggg 52388854  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  52388853 ttttgaggtagtatagatacgtgcaga 52388827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 52388820 - 52388630
Alignment:
Q  164 ctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggg 263  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  52388820 ctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcgga 52388721  T
Q  264 aggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||| ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52388720 tggctgatggctatatgctatggtagactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatga 52388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2648720 - 2648608
Alignment:
Q  242 gcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648720 gcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 2648621  T
Q  342 ggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||    
T  2648620 ggcctgcaaatga 2648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42805318 - 42804993
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  42805318 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcatacggtgcaccgtcactagcccgagaggattttgaggcagtacagatacgttc 42805219  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
     |||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||   |||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  42805218 ggaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgttaccggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggcgggcga 42805119  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      |||||||||| ||| |||||||||||||| |   ||| ||||||||||| |  |||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  42805118 ttggggtgagcatgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 42805019  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42805018 ggagatattctgaggcctccaaatga 42804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 51807851 - 51807976
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807851 gagcacagggagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 51807950  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagacc 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51807951 tgaggcagtacggatacgtccagacc 51807976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50214428 - 50214199
Alignment:
Q  118 cggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgctt 217  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    | ||  ||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50214428 cggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatattgtaaagctgtcaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttcctcactcacacgctt 50214329  T
Q  218 aaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgc 317  Q
    ||| ||  ||   |||||||||||  | ||||| |||||||||||       |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50214328 aagacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcgg-------atggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgc 50214236  T
Q  318 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50214235 cacctcttccaggagatattccgaggccagcaaatga 50214199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30253472 - 30253126
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30253472 gagcacagggacttccaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgtggtgatcagagggtataccgtcacttgctcgagagggttt 30253373  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  30253372 tgaggcagtacagatacatccaaaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcactgcctgagattgtgcaggttttcatcgacttccgcac 30253273  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||| ||||  | ||||||||   ||| ||||||||||| |  ||||||      ||||||||  ||    
T  30253272 tcacacgcttaaggcggctgactggggtgagcatgcaagagaacaaacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacatcgttgtgtctcatgct 30253173  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||| | |||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  30253172 cagattttgccacttcttctgggagatattccgaggcctccaaatga 30253126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3495622 - 3495550
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgta 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3495622 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgta 3495550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 354
Target Start/End: Original strand, 6927989 - 6928146
Alignment:
Q  191 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctg-tggtac 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||   |||| |||||||||||       ||||||||||  |  ||||||    
T  6927989 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcgg-------atggctatgtgtttatggtac 6928081  T
Q  290 gctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6928082 actaaggtgtgtcaccctcaaattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 6928146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 354
Target Start/End: Original strand, 27638424 - 27638769
Alignment:
Q  9 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638424 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 27638523  T
Q  109 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638524 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 27638623  T
Q  209 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638624 cacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 27638723  T
Q  309 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27638724 agatcttgccacctattccaagagatcttccgaggcctgcaaatga 27638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 6203821 - 6204170
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203821 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6203920  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6203921 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6204020  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204021 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6204120  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204121 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6204170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 11690788 - 11691137
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690788 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 11690887  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11690888 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 11690987  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11690988 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 11691087  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691088 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 11691137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30827003 - 30826654
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30827003 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30826904  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30826903 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30826804  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30826803 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 30826704  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826703 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 30826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 22303902 - 22304251
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303902 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22304001  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22304002 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22304101  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304102 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22304201  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22304202 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 22304251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 31770746 - 31771088
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31770746 gaggagcacagagagatccatgattttgaggaggttttatggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggg 31770845  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  31770846 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttccg 31770945  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31770946 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31771038  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31771039 cctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 31771088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 26440113 - 26440384
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440113 gaggagcacaaggagatccatgactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26440212  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |    
T  26440213 ttttgaggcaatacggatacgtccagaccatccctagacatctgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaagcgttcgtcgacttccg 26440312  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggcta 276  Q
    |||||||||||||||||||   |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26440313 cactcacacgcttaaggcgactgattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcta 26440384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 352
Target Start/End: Original strand, 26172594 - 26172936
Alignment:
Q  17 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26172594 gagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagagttttgaggcagt 26172693  T
Q  117 acggatacgtgcagaccatccccagacatccg--------actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcact 208  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||        || ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26172694 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgaacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcact 26172793  T
Q  209 cacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctc 308  Q
    |||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  26172794 cacacgcttaaggcggccgattgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgtgttatggtacactagggtgtctca-cctc 26172892  T
Q  309 agatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 352  Q
    | || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26172893 aaattttgccacctcttcgaggagatcttccgacgccagcaaat 26172936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 2406918 - 2407257
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  2406918 gagcacagggagatccaggactttgagtaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgtacgtagggtctactgtcacttgctcgagagggttt 2407017  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2407018 taaggcaatacggatacgtctagaccgtccctaaacatccgacggatgttgtagagctgccactacctcaaattgtgcagacattcgtcgacttccgcac 2407117  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    | ||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||| ||| ||       ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  2407118 ttacacgcttaaggcggccgatcgaggtgaacaggcaggagagcagaaat-------ggcagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 2407210  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2407211 cggattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 2407257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24086177 - 24085850
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttg-cccgagagggttttgaggcagtacggatacgtg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24086177 ttcgaggaggtattctggtattcaggatggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgccccgagagggttttgaggcagtacagatacgtc 24086078  T
Q  128 cagaccatccc-cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggac 226  Q
    |||||| ||||  |||||| || | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24086077 cagaccgtcccttagacattcgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatgttttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggcc 24085978  T
Q  227 gcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 326  Q
    |   |||||||||| ||||||||| || |||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | ||     
T  24085977 gattggggtgagcatgcaggagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttg 24085878  T
Q  327 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24085877 taggagatattcggaggcctccaaatga 24085850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 32642567 - 32642912
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32642567 gagcacagagacttccaggctttcgaggaggtattctggtattcaggctgaattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 32642666  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| | ||    
T  32642667 tgaggcagtacggatacgtcctgaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagttgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgtac 32642766  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| |     ||||||||| | ||||| | ||||||||||   | | ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||    
T  32642767 tcacacgcttaaggcgg-ctgattgggtgagcatgtaggagggtagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccct 32642865  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32642866 caaattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2406222 - 2406059
Alignment:
Q  191 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacg 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||  | ||||||     
T  2406222 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtaca 2406123  T
Q  291 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2406122 caagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 2406059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18005800 - 18005475
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||| || |   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18005800 ttcgaggaggtattctagtattcaggctggattacgtgtggtgattgtagggtgcaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 18005701  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    ||||| |||| ||||||| |   | ||||   ||  |  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  18005700 agaccgtccctagacatctgttagctgttgtagagatgtcaccgactgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 18005601  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||| |   ||| ||||||||||| |   ||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  18005600 ttggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggctatgtacgaaggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 18005501  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18005500 ggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 3384104 - 3384449
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||| || | || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  3384104 gagcacagggagatccagggttttgagaagatattatggtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgcaccgtcacttgcctgagagggtgt 3384203  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||   ||  |  ||| ||||   ||||||||||  ||||| |||||   ||     
T  3384204 tgaggcagtacggatacgtccatacgatccctagacatcctacggatgttgtagagatgacactgcctcagattgtgcagacattcgtagactttcacat 3384303  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| |  ||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| ||||||||  | || ||| ||| | |||||||||||    
T  3384304 tcacacgcttaaggagaccgattgaagtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatgatacactaagatgtctcaccct 3384403  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3384404 cagattttgccatctcttcca-gagatcttccgaggccagcaaatga 3384449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 21603282 - 21603378
Alignment:
Q  231 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 327  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||  |  ||  ||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21603282 ggggtgagccagcaggagaggcgacatggaagatggatgatggctatatactatggtacactacggtgtctcaccctcagatttttccacctattcc 21603378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32641955 - 32641897
Alignment:
Q  296 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32641955 gtgtctcaccctcaaattttgtcacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32641897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 1055198 - 1055547
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055198 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1055297  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1055298 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1055397  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055398 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 1055497  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055498 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1055547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23019672 - 23019323
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019672 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 23019573  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23019572 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 23019473  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019472 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 23019373  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019372 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 23019323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 26662119 - 26662468
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662119 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26662218  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26662219 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26662318  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26662319 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 26662418  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662419 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 26662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15034150 - 15033801
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034150 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 15034051  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15034050 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaggaacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15033951  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15033950 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 15033851  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15033850 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15033801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22881 - 22532
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22881 gaggagcacagagagatctaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgtggcatccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22782  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22781 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 22682  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22681 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 22582  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22581 cctcagatcttgccacctattccaggagatattccgaggcctgcaaatga 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42482891 - 42482542
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42482891 gaggagcacagaaagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagga 42482792  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42482791 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 42482692  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  42482691 cactcacacgcttgaggcggacgctcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtacactagggtgtctcac 42482592  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482591 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 487118 - 486769
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487118 gaggagcacaaagagattcaggacttcgaggaggtttcctggtattctggatggattatgtgcggcgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 487019  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  487018 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgtttatcgacttccg 486919  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  486918 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 486819  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  486818 cctcagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggcctgcaaatga 486769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34367992 - 34367646
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34367992 gagcatagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtatggtgtaccttcacttgcccgagagggttt 34367893  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  34367892 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatcctcagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgactttcgcac 34367793  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  34367792 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccct 34367693  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34367692 cagatcttgccacctctttcaggagatcttctgaggcctgcaaatga 34367646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 39603963 - 39604308
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39603963 gagcacagggagatccaggactttgaggtggttttctcgtattctggatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 39604062  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  39604063 tgaggcagtacgaatacgtccagaccatccc-agacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 39604161  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39604162 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcaccct 39604261  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39604262 cagatcttgccacctcttccaggaaatcttctgaggcctgcaaatga 39604308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 43214075 - 43214405
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43214075 gaggagcacagggagatgcaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtaggatgtaccgtcacttgcccgagaggg 43214174  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  43214175 ttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 43214274  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||            ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43214275 cactcacacgcttaaggcgaacgattggggtgagc------------agacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 43214355  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43214356 cctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgaggcctgcaaatga 43214405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34819983 - 34819646
Alignment:
Q  17 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34819983 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 34819884  T
Q  117 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 216  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  34819883 acggatacgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgct 34819784  T
Q  217 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 316  Q
    |||||| | ||   ||||||||||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||     
T  34819783 taaggcagccgattggggtgagcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagattttt 34819684  T
Q  317 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34819683 ccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 34819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41243447 - 41243120
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41243447 gagcacagggagatccatgactttgaggagattttatggtattctggctggattatgtgcgctgttcgtagggtgtaccgtcacttgccagagagtgttt 41243348  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41243347 tgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgacagatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 41243248  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||                    ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  41243247 tgacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaggca-------------------tggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 41243167  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41243166 cagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcctgcaaatga 41243120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 20858688 - 20859034
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858688 gagcatagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 20858787  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||   ||  |  |||||||||  |||||||||   |||||| |||||  |||    
T  20858788 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccaaacatccgacggatgttgtagagttgtcaccgccttagattgtgcaggcattcgtcaacttccacac 20858887  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||||| | ||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  20858888 tcacacccttaaggcggcctattggagtgagcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 20858987  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  20858988 cagatttttccacctcttccaggagatctttcgaggcaagcaaatga 20859034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39832125 - 39831787
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39832125 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttgtggtattcaggctggattatgtgcggtgttcctaaggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 39832026  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  39832025 taaggcagtacggatacgtccagaccgtctccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 39831926  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||  |||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  39831925 tcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatgattatgtgttatggtacacta-ggtgtctcaccct 39831834  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39831833 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 39831787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5301689 - 5301343
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| || || || |||    
T  5301689 gagcacaggaagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaagctggattatgtgcggtgtttgttgggtctaccgtcacttgtccaagtggattt 5301590  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||   || |||||||  |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  5301589 tgaggtagtacggatacgtccataccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctcccactacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 5301490  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   | || ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  5301489 tcacacgcttaaggcggccgattgaggcgagcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 5301390  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5301389 cagattttgccacctcttccaggagatcttccaaggccagcaaatga 5301343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21176695 - 21176349
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  21176695 gagcacagggagatccagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtaggatgtaccgtcactttcttgagagggttt 21176596  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||   || || | | |||||   |||||| ||   ||| |||||||| ||||    
T  21176595 tgcggcagtaaggatacgtccagagcatccctagacatccgacggatgttgtagagctgcgatcgcctcagattgtggaggcattcatcgacttccgcac 21176496  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||||| |||||| || |||||| ||  |||||| ||||||    
T  21176495 tcacacgcttaaggagcacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtgtcacaccct 21176396  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21176395 cagattttgacacctcttccagaagatcttctgaggccagcaaatga 21176349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Original strand, 45132438 - 45132760
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45132438 gaggaggttttttggtattcaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgacatctgcccgagagggttttgaggtagtacggatacgtccaga 45132537  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
       |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||   |    
T  45132538 tggtccctagacatccgacggatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcaagctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggccgattg 45132637  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    ||||||||||| || |||  ||||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45132638 gggtgagcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 45132737  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  45132738 gatcttccgaggccagcaaatga 45132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 35554270 - 35554609
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||  ||||||||||  ||  ||||| | ||||||||| | || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35554270 gagcacatggagatccagggttttaaggagatattctggtatccaggctggattatttgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 35554369  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| |||  |   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  35554370 tgaggcagtacggatacgtccagagggtccctagacatccgacggataatgtagagctgacaccgcctcagattgtgcaggaattcgtcgacttccgcac 35554469  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  | || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  35554470 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaaaagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 35554562  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35554563 cagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 35554609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40076051 - 40075736
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  40076051 gaggagattttctagtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacatccaga 40075952  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
      ||||| ||||||| ||| ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||   |    
T  40075951 gaatccctagacatcagacggatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattg 40075852  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40075851 gggtgagcaggcacaagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 40075759  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  40075758 gatcttccgaggccagcaaatga 40075736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Original strand, 5679558 - 5679882
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgta--ccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgca 129  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5679558 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtacggtgtttgtagggtgtataccgtcacttgcctgagagggttttgcggcagtacggatacgtcca 5679657  T
Q  130 gaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcc 229  Q
    || | |||| ||||| |  || ||||||   || |  | |||||||   |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||      
T  5679658 gagcgtccctagacaactaacggatgttgtagagcggcgaccgcctcagattgtgcagccattcatcgacttccgcactcacacgcttaaggagcccgat 5679757  T
Q  230 cggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccag 329  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||   |  |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5679758 tggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggtatactacggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccag 5679857  T
Q  330 gagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||||||||||||||  ||||||||    
T  5679858 tagatcttccgaggctagcaaatga 5679882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Original strand, 51778 - 52103
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  | | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51778 ttcgagggggtattctgatattcatgctagattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 51877  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    || || |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  51878 agtccgtccctagacatccgtcagatgttgtagagctgtcaccgactcagattgtgcaggatttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcga 51977  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      |||||||||| ||| ||||| |||||||||    | | ||||||||||| |  |||||| |    |||||||||||||| || || |||| | || ||    
T  51978 ttggggtgagcatgcatgagagcagacatggcatatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcacatttttccacttctttca 52077  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||    
T  52078 tgagatattccgaggcctccaaatga 52103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30761485 - 30761310
Alignment:
Q  191 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagac--------------atggcgggaggcggatggcta 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||              |||||||  |||||||| |||    
T  30761485 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggcagatggcggatggcggatgacta 30761386  T
Q  277 tgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 352  Q
    |||  | |||||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30761385 tgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaatttttccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaat 30761310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 41883212 - 41883561
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883212 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 41883311  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41883312 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 41883411  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41883412 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 41883511  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883512 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41883561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 48406030 - 48406379
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406030 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 48406129  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48406130 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 48406229  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48406230 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 48406329  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406330 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 48406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9368787 - 9368438
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368787 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 9368688  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9368687 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 9368588  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9368587 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgtgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 9368488  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368487 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9368438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17460647 - 17460298
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460647 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17460548  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17460547 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17460448  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17460447 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17460348  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460347 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17460298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 17592567 - 17592916
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592567 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 17592666  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17592667 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 17592766  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17592767 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcac 17592866  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592867 cctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17592916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35607776 - 35607427
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607776 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctagatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 35607677  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35607676 ttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 35607577  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35607576 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 35607477  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607476 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 35607427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42505318 - 42504970
Alignment:
Q  6 aggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42505318 aggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggt 42505219  T
Q  106 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42505218 tttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattgtgcagatgttcgtcgacttccgc 42505119  T
Q  206 actcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42505118 actcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcacc 42505019  T
Q  306 ctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505018 ctcatatcttgctgcctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 42504970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15071655 - 15071319
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||          |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071655 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggttt---tg----------agggtgtaccatcacttgcccgagaggg 15071569  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15071568 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 15071469  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  15071468 cactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 15071369  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071368 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15071319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 17837632 - 17837974
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17837632 gaggagcatagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtatggtgtaccgtcacttgcccgagatgg 17837731  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  17837732 ttttgaggcagtatggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 17837831  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17837832 cacttacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaagcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 17837924  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837925 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 17837974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 371
Target Start/End: Original strand, 10521503 - 10521868
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10521503 gaggagcacatggagatgcatgactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagg- 10521601  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  10521602 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgcctgacattgtacaggcgttcgtcgactttcg 10521701  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  10521702 cactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 10521801  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10521802 cctcatatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcatatcattgcag 10521868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5538933 - 5538587
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5538933 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgttcgtacggtgtaccgtcacttgcccgagtgggttt 5538834  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||  |||| |  |||||| ||| ||||||||||  ||||||   || || ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5538833 tgaggcagtacaaatacatctagaccaaccctagacatccgatggatgttgtagagctgccatcgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 5538734  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  5538733 tcacacacttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 5538634  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5538633 cagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggccagcaaatga 5538587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 13322706 - 13323055
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13322706 gaggagaatagagagatccaggattttgaggaggttttatggtattctggctggataatgtgtggtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 13322805  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||   || || ||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||  |    
T  13322806 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgaaagatgttgtagagctgccaccacctcacattgtgcaggcgttcatcgactttag 13322905  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  13322906 cactcacacgcttaagggggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctcac 13323005  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13323006 cctcagatattgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 13323055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 16680134 - 16680480
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16680134 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 16680233  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  16680234 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 16680333  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  16680334 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 16680433  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16680434 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 16680480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 17654370 - 17654716
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17654370 gagcacagggagatccaggatttttaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttt 17654469  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  17654470 tgaggcagtacgaatacgtccagcctgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 17654569  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||    
T  17654570 tcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccct 17654669  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17654670 cagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatga 17654716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27451069 - 27450723
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27451069 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgtttatagggtgtaccgtcactttcccaagagggttt 27450970  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||  ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  27450969 tgaggtagtacggatacgtccaaaccgtctccagatatccgaacgatgttgtagagctgtcaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcac 27450870  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  27450869 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 27450770  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27450769 cagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 27450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 354
Target Start/End: Original strand, 34741444 - 34741742
Alignment:
Q  49 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 148  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  34741444 ttctggctggattatgtgcggtgttcgtagaatgtactgtcacttgcccgatagggttttgaagcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatctg 34741543  T
Q  149 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggag 248  Q
    || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  34741544 acggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggag 34741643  T
Q  249 aggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgc 348  Q
    || ||||||       |||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  34741644 agcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactaggctgtctcaacctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagaccagc 34741736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11630643 - 11630427
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11630643 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11630544  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11630543 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11630444  T
Q  208 tcacacgcttaaggcgg 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  11630443 tcacacgcttaaggcgg 11630427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47670561 - 47670239
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47670561 gaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgcaccgtcacttgcccgaaagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 47670462  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    || | || ||||||||| | || |||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   |    
T  47670461 ccgtacctagacatccgtcggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtcggccgattg 47670362  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    ||  ||||||||||    |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  47670361 gggtgagcatccaggagaggagacatggcgtatagcatatggctatgtatgatggtacgccattgtgtctcaccctcagaatttgccacttcttccagga 47670262  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||| || |||||||| |||||||    
T  47670261 gatatttcgaggcctccaaatga 47670239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11632884 - 11632680
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11632884 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttt 11632785  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||| ||||    
T  11632784 tgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcac 11632685  T
Q  208 tcaca 212  Q
    |||||    
T  11632684 tcaca 11632680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 354
Target Start/End: Original strand, 37342992 - 37343271
Alignment:
Q  75 gtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||   || ||  |||||||    
T  37342992 gtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttaaggcaatacggatacgtccagacaaaccctagacatccggcggatgttgtagagctgacaccgcc 37343091  T
Q  175 ttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggc 274  Q
    |   ||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| |||    
T  37343092 tcagattgtgcagacattcgtatacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggc 37343191  T
Q  275 tatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37343192 tatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 37343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47522172 - 47522013
Alignment:
Q  195 tcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctag 294  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||||    
T  47522172 tcgacttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactag 47522073  T
Q  295 ggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47522072 ggtgtctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaatga 47522013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9492221 - 9491989
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    |||||| |||| |||| | |||| || | ||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  9492221 ttcgagaaggtattctagcattcaggtttgattatgtgtggtgatcgtagagtgtaccgtcactttcccgagagggttttaaggcagtacggatacaccc 9492122  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |      
T  9492121 agaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccaa 9492022  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 261  Q
      |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9492021 ttggggtgagcatgtaggagaggagacatggcg 9491989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11630387 - 11630317
Alignment:
Q  284 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11630387 tggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 11630317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 36980256 - 36980373
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36980256 ttcgaggaggtattcctgtattcaggctgaattatgtgtggtgatcgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtcc 36980355  T
Q  129 agaccatccccagacatc 146  Q
    ||||  |||| |||||||    
T  36980356 agactgtccctagacatc 36980373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17748067 - 17747944
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| | ||    | ||||||  |||||||||| ||||| |||     
T  17748067 gagcacagggagatccaggattttgaggagattttctggtattcagtttggattatgtgcagtgttgacaaggtgtattgtcacttgcctgagagagtta 17747968  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  17747967 ggcggcagtacggatacgtgcaga 17747944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 16488281 - 16488394
Alignment:
Q  242 gcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccc-tcagatcttgccacctattccaggagatcttccg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||     |||||| |||||  | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16488281 gcaggagagcagacatggcggataagggatggatatgtgttatggtacactaaggtgtttcacccctcagattgtgccacctcttccaggagatcttccg 16488380  T
Q  341 aggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||    
T  16488381 aggccagcaaatga 16488394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 261
Target Start/End: Original strand, 41734630 - 41734700
Alignment:
Q  191 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcg 261  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41734630 ttcgtagacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 354
Target Start/End: Original strand, 41734713 - 41734749
Alignment:
Q  318 cacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41734713 cacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 41734749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6179189 - 6178840
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179189 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 6179090  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6179089 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 6178990  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178989 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 6178890  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178889 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 6178840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 49168183 - 49168532
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168183 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49168282  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49168283 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 49168382  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49168383 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcac 49168482  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168483 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41796424 - 41796075
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41796424 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtactgtcacttgcccgagaggg 41796325  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796324 ttttgaggcaatacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 41796225  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41796224 cactcacacgcttaaggcggacgcctggggtgagcaggtaggagaggagacatggcgggcgggggatggctatgtcttgtggtacgctagggtgtctcac 41796125  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796124 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 41796075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 31424412 - 31424761
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424412 gaggagcacagagagattcaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 31424511  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31424512 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttaaggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 31424611  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31424612 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcacactagggtgtctcac 31424711  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424712 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 31424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1306521 - 1306170
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306521 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 1306422  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1306421 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 1306322  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatg--gcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306321 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 1306222  T
Q  303 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306221 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 1306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 49093093 - 49093443
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093093 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 49093192  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  49093193 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccctagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccg 49093292  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacat-ggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49093293 cactcacatgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 49093392  T
Q  304 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093393 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 49093443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21018977 - 21018628
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21018977 gaggagcatagagagatccaggacttagaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagcgtgtaccgtcactttcccgagaagg 21018878  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |    
T  21018877 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattatgcaggtgttcgtcgacttccg 21018778  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21018777 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 21018678  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018677 cctaagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 21018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40355802 - 40355453
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355802 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttatggtattctgggtggattatgtgtagtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 40355703  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  40355702 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccg 40355603  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  40355602 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcgaatggcaatgtcatatggtacactagggtgtctaac 40355503  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40355502 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagacctgcaaatga 40355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30724148 - 30723877
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724148 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 30724049  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30724048 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttcaattgtgcagatgttcgtcgacttccg 30723949  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggcta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30723948 cactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44677366 - 44677020
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44677366 gagcacagggagatccaggactttgaggaggttttttggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttt 44677267  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  44677266 tgaggcagtacggatacatccagaccatccccaggcatctgactgatgttgtaaacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 44677167  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  44677166 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 44677067  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  44677066 cagatcttgccacctcttccaggagatttttcgaggcctgtaaatga 44677020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 50277829 - 50278175
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50277829 gagcacagagagatccaggattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50277928  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||  | |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  50277929 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagttgccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcac 50278028  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  50278029 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcacactagggtgtctcaccct 50278128  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50278129 catattttgtcacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37016967 - 37016633
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016967 gagcatagggagatccagaactttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 37016868  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  37016867 tgaggcaatacggatacgtcaagaccatccccagacatctgacggatgttgtagacctcccatcgccttacattgtgcagacgttcgttgacttccgcac 37016768  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||| |||||||||||||   |||||||||            |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37016767 tcacacacttaaggcggacgattggggtgagc------------agacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 37016680  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37016679 aagatcttgccacctctttcagtagatcttccgaggcctgcaaatga 37016633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 8109835 - 8110172
Alignment:
Q  17 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8109835 gagatccaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 8109934  T
Q  117 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 216  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||| |||||    
T  8109935 acggatacgtccagaccgtccccagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgtctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcatacgct 8110034  T
Q  217 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 316  Q
    |||||| | ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  8110035 taaggcagccgattggggtgagcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttt 8110134  T
Q  317 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8110135 ccacatcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 8110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10730352 - 10730030
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10730352 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10730253  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10730252 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10730153  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10730152 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10730053  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10730052 gatcttccgaggccagcaaatga 10730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10944121 - 10943799
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10944121 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10944022  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||   |    
T  10944021 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10943922  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 331  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10943921 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10943822  T
Q  332 gatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10943821 gatcttccgaggccagcaaatga 10943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 302
Target Start/End: Original strand, 51685810 - 51686104
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51685810 gagcacagagagatctaagattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccgagagggttt 51685909  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||| ||||| ||||    
T  51685910 tgaggcagtacagatacgtccagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcaacttctgcac 51686009  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctc 302  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  51686010 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcggatgacagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctc 51686104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 50904047 - 50904377
Alignment:
Q  17 gagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagt 116  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50904047 gagatccaggattttgaggagggtttttggttttcaggttggatcatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagt 50904146  T
Q  117 acggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgct 216  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  50904147 acagatacgtccagaccgtccccaggcatccgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgatttccgcactcacacgct 50904246  T
Q  217 taaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttg 316  Q
    ||||| || ||   | |||||||||| ||||||| ||||||       |||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  50904247 taaggtggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagacat-------ggcggacggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagattttg 50904339  T
Q  317 ccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
     ||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50904340 tcacctctttcagaagatcttcccaggccagcaaatga 50904377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 71624 - 71958
Alignment:
Q  20 atccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacg 119  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71624 atccaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttggccgagagggttttgaggcagtacg 71723  T
Q  120 gatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaa 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||   || ||  || || ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71724 gatacgtccagaccatccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcatcggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 71823  T
Q  220 ggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgcca 319  Q
    ||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||| ||    
T  71824 ggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgtca 71923  T
Q  320 cctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    | | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  71924 cttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 71958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50021065 - 50020734
Alignment:
Q  11 cacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttga 110  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50021065 cacagggagatacatgattttgaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttga 50020966  T
Q  111 ggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactca 210  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||| |||   |||||||    
T  50020965 ggcagtacgggtacgtccataccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgactcagattgtgcaggcattcgtcaactctcgcactca 50020866  T
Q  211 cacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcag 310  Q
    || ||| |||| || ||   |||||||||            ||||||||| |  ||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  50020865 catgctcaaggaggccgattggggtgagc------------agacatggctgatggcggatggctatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcaa 50020778  T
Q  311 atcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50020777 attttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 50020734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13624894 - 13624569
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13624894 ttcgaggaagtattctggtattcaggttggattatgtgcggtgatcgtagggcgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 13624795  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    ||||| |||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  13624794 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagatctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 13624695  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      |||||||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    ||||||      ||||||||||||||||| || |||| | |||||    
T  13624694 ttggggtgagcatgcaagagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtatgatggtacatcgttgtgtctcaccctcagatttttccacatcttcca 13624595  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||    
T  13624594 ggagatattctgatgcctccaaatga 13624569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 50196076 - 50196218
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196076 gagcacagggagatccagaattttgaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50196175  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgac 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  50196176 tgaggcagtacggatacgttcaggccgtccccagacattcgac 50196218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 342
Target Start/End: Original strand, 14317284 - 14317618
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14317284 gagcacagggagattcagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtataccatcacttgcccgagagggttt 14317383  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||    ||  | |||||| ||||    
T  14317384 tgaggcggtacagatacgtccaaactgtccctagtcatccgacggatgttgtagagctgccactacctcagattgtgcaagcatttcttgacttccgcac 14317483  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| |   |   ||||||||| ||| |||||| | ||||||||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  14317484 tcacacgcttaaggagcctgaatggggtgagccggcgggagagcaaacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 14317583  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgag 342  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14317584 catattttgccacctcttccaggagatcttccgag 14317618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41931334 - 41931108
Alignment:
Q  32 gaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  41931334 gaggaggttttctggtattaaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgttatctacccaagagggttttgaggcagcacggatacgtccaaa 41931235  T
Q  132 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccg 231  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||   |    
T  41931234 cagtccctagacatccgactgatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggccgattg 41931135  T
Q  232 gggtgagcaggcaggagaggagacatg 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  41931134 gggtgagcaggcagcagagcagacatg 41931108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 46438743 - 46438954
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||  ||||||||||  || |||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46438743 gagcacaaggagatccagggatttgaggagatattctagtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttt 46438842  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  46438843 tgaggcagtacagatacgtccagagggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtcgacttccgcac 46438942  T
Q  208 tcacacgcttaa 219  Q
    ||||||||||||    
T  46438943 tcacacgcttaa 46438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 371
Target Start/End: Original strand, 30706657 - 30706942
Alignment:
Q  86 cgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgc 185  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||    
T  30706657 cgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacgaatacgtctagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgc 30706756  T
Q  186 agatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtg 285  Q
    ||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||   ||||||||| ||||| |||| ||||||||||   |  |||  | | |||  | ||    
T  30706757 aggcattcgtagacttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatgagggaatgttgtgtgttatg 30706856  T
Q  286 gtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||| |||||||||    
T  30706857 atacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcggaggccaacaaatgaagagcatatcattgcag 30706942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30723847 - 30723777
Alignment:
Q  284 tggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723847 tggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgtaaatga 30723777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 354
Target Start/End: Original strand, 50196224 - 50196351
Alignment:
Q  231 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgct----agggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 326  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||  | |||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50196224 ggggtgtgcaggtaggagagcagacatggctgatggtggatggctatgtgttatggtacactcactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 50196323  T
Q  327 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50196324 caggagatcttccgaggccagcaaatga 50196351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 55278927 - 55278820
Alignment:
Q  247 agaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcct 346  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||     
T  55278927 agaggagacatggcggatggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgattttgccacttcttccaggatatcttccgaggcca 55278828  T
Q  347 gcaaatga 354  Q
    || |||||    
T  55278827 gctaatga 55278820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 351
Target Start/End: Original strand, 46438956 - 46439038
Alignment:
Q  269 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaa 351  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46438956 gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccatgagatcttccgaggccagcaaa 46439038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21535597 - 21535449
Alignment:
Q  9 agcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggtttt 108  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||| |||| || ||||| || | | |||||||| | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21535597 agcacagggagatccagggttttgaggagattttatgttattcaggctaggttatgtgcagtgttattagggtgtatcgtcacttgcctgagagagtttt 21535498  T
Q  109 gaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgtt 157  Q
    | ||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21535497 gcggctgtacggatatgtcgagaccgtccctagacatccgacggatgtt 21535449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Original strand, 12891833 - 12891924
Alignment:
Q  254 acatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcc 345  Q
    |||||||||  || |||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || | ||||||||| |||||||    
T  12891833 acatggcggatggaggatggctatatacggtggtacactagggtgtatcaccctcagattttgccacttctttcgggagatctttcgaggcc 12891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 12891586 - 12891703
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||  ||   ||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  12891586 gagcacagggagatccagggttttgaggagattttctggtattcaggctgggttatgtgcggtgt-tgttaagtgtatcgtcacttgcctgagagagtta 12891684  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgt 126  Q
     | ||||||||||||||||    
T  12891685 ggcggcagtacggatacgt 12891703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40886789 - 40886693
Alignment:
Q  231 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 327  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| |  ||  ||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40886789 ggggtgagccggcatgagaggtgacatggcagatggatgatggttatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacttattcc 40886693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40887012 - 40886874
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||    |  ||||| |||||||| |  ||||| |||     
T  40887012 gagcatagagagatccaagattttgaggagattttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttgacaacgtgtatcgtcactttcttgagagagtta 40886913  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatc 146  Q
     | ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40886912 ggcggcagtaaggatacgtgcagaacgtccctagacatc 40886874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3729729 - 3729379
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729729 gaggagcacagagagatccaagacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 3729630  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccg-ccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3729629 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgcccttccattgtgcagatgttcgttgacttcc 3729530  T
Q  204 gcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3729529 gcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctca 3729430  T
Q  304 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729429 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 3729379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13637385 - 13637036
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13637385 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 13637286  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13637285 ttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggagctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 13637186  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  13637185 cactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 13637086  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13637085 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 13637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 26878388 - 26878730
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878388 gaggagcacagagagatccatgacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 26878487  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26878488 ttttgagacagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccg 26878587  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26878588 cactcacacgcttaaggcggaagctcggggtgagcaagcaggagaggatacat-------ggcgaatggctatgtcctgtggtacactggggtgtctcac 26878680  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26878681 cctcagatcttgccacctattccagtagatcttctgaggcctgcaaatga 26878730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 19158692 - 19159041
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19158692 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggg 19158791  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  19158792 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaaacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 19158891  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19158892 cactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcac 19158991  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158992 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 19159041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 95474 - 95132
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  95474 gaggagcacagggagatccaggactttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgataggg 95375  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  95374 ttttgaggcagtacggatatttccagaccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 95275  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  95274 cactcacacgcttaaggcggatgattggggtgagcagacaggagagtagacatg-------gcggatggctatgtcctatagtacactagggtgtctcac 95182  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  95181 cctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 95132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31781039 - 31780697
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31781039 gaggagcacagggagatccaggactttgaggggattttctggtattctggttggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccatcacttgcccgagaggg 31780940  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31780939 ttatgaggcagtacggatacgtccagaccatccccaaacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcagacgttcgtcgacttccg 31780840  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||       |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  31780839 cactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagtaggcaggagagcagacatg-------gcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcac 31780747  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31780746 cctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgaggcctgcaaatga 31780697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 22526674 - 22527016
Alignment:
Q  5 gaggagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 104  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526674 gaggagcacatggagatctaggactttgaggaggttttctagtactctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggg 22526773  T
Q  105 ttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22526774 ttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccg 22526873  T
Q  205 cactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcac 304  Q
    | |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| | ||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22526874 ccctcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcaaacat-------ggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcac 22526966  T
Q  305 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22526967 cctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 22527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19522653 - 19522316
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19522653 gagcacagagagatacaggatattgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttt 19522554  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  19522553 tgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcaacttccgccc 19522454  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  19522453 tcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacat-------ggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 19522361  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaat 352  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19522360 cagattttgccacctcttccaggagatctttcgaggccagcaaat 19522316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 354
Target Start/End: Original strand, 52804570 - 52804888
Alignment:
Q  36 aggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat 135  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  52804570 aggttttctggtattatgcttggattatgtgaggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgt 52804669  T
Q  136 ccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||   || || |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |   |||||    
T  52804670 ccccagacatccgacggatgttgtagagctgccactgcctcacattgtgcagacgttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggt 52804769  T
Q  236 gagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  52804770 gagcaggcaggagagcagacatggaggatgacggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagata 52804869  T
Q  336 ttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  52804870 ttccgaggccagcaaatga 52804888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 47505016 - 47505350
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47505016 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtaatcaggctggattatgtgcggtgttcgt-gggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 47505114  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||   || |   ||||||||   |||||||||   |||||||||||| || |    
T  47505115 tgaggcagtacaaatacgtccagactgtccccagacatccgacggatgttgtagagcgatcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcgc 47505214  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  47505215 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccct 47505314  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgagg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47505315 cagatcttgccacctcttccaggagatctttcgagg 47505350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 11196537 - 11196883
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  11196537 gagcacaaagaaatccaggattttgaggaggttttttggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtagggtgtaccgtcacttgtctgagagggtgt 11196636  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  11196637 tgaggcagtacggatacgtccagatgatccctagacatccgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcagacattcgtcgatttccgcac 11196736  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  11196737 tcacatgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcagcagagcagacatgtcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 11196836  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11196837 cgtattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 11196883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 47660547 - 47660893
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47660547 gagcacagggagatccagggttttgaggagatattctggtattcaggctggattatctgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttacccgagagggttt 47660646  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  47660647 tgaggaagtacggatacgtccagagggtccctagacatcggacgaatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttctgcac 47660746  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| || ||   ||||||||| | || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  47660747 tcacacgcttaaggtggccgattggggtgagccgacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccct 47660846  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47660847 cagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatga 47660893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 45828251 - 45828596
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45828251 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtataccgtcacttgcccaagagggttt 45828350  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    ||||| |||||  |||||| || | | |||| |||||||| || ||||||   || || |||| ||||   |||||||||   |||||||||||| ||||    
T  45828351 tgaggtagtacaaatacgttcatagcgtccctagacatcctacagatgttgtagagctgccactgcctcagattgtgcag-cattcgtcgacttccgcac 45828449  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||   || ||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||    
T  45828450 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccct 45828549  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  45828550 cagattttgccacctctttcatgagatcttatgaggccagcaaatga 45828596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 50341525 - 50341407
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50341525 gagcacagggagatccaggatttagaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 50341426  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgt 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50341425 tgaggcagtacggatacgt 50341407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49855377 - 49855036
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  49855377 ttcgagggggtattctggtattcaagttggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtgacttgcccgagaggg-tttgaggcactacagatacgtcc 49855279  T
Q  129 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 228  Q
    ||||| |||| ||||||| | | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  49855278 agaccgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccggctcaaattgtgcagactttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggcggccga 49855179  T
Q  229 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 328  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| | || |     
T  49855178 ttggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttctttcg 49855079  T
Q  329 ggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  49855078 ggagatattccaaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 49855036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Original strand, 21143770 - 21143950
Alignment:
Q  167 ccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggagg 266  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||   |||||||||| |||| |||| |||||       |||    
T  21143770 ccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagaca-------agg 21143862  T
Q  267 cggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21143863 cggatggctatgtgctatggtacacttgggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagttcttccgaggccagcaaatga 21143950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50618052 - 50617929
Alignment:
Q  231 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50618052 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 50617953  T
Q  331 agatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  50617952 agatcttccgaggccagcaaatga 50617929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Original strand, 21143654 - 21143763
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| |||||| |||| || | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143654 gagcacagggagatctaggattttgtgaaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 21143753  T
Q  108 tgaggcagta 117  Q
    ||||||||||    
T  21143754 tgaggcagta 21143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38120475 - 38120195
Alignment:
Q  74 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||   || ||  ||| ||    
T  38120475 cgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagacgatccctaaacatctgacggatgttgtagagctgacactgc 38120376  T
Q  174 cttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatgg 273  Q
    ||   |||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||   |||||||||||| || |||| ||||||||||   |  ||| ||    
T  38120375 ctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcgtatgagggaggg 38120276  T
Q  274 ctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||  | |||||| ||| |||  | || |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38120275 ctatgtgttatggtacactaaggtaacccatcctcagatttttccacctcttctaggagatcttccgatgccagcaaatga 38120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35256622 - 35256520
Alignment:
Q  29 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  35256622 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagagttttgagacagtacggatacgttc 35256523  T
Q  129 aga 131  Q
    |||    
T  35256522 aga 35256520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23273632 - 23273541
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccga 99  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23273632 gagcacagggagatccaggattttgaggaggttttttggtattccggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccga 23273541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16269984 - 16269827
Alignment:
Q  197 gacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctaggg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |    ||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||  | |||||| ||| |     
T  16269984 gacttccgcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacga 16269885  T
Q  297 tgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16269884 tgtctcacccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatga 16269827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23273506 - 23273427
Alignment:
Q  256 atggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 335  Q
    |||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  23273506 atggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatc 23273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35256482 - 35256425
Alignment:
Q  314 ttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgatgtccatctcattgcag 371  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  35256482 ttgccacttattccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcatatcattgcag 35256425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 354
Target Start/End: Original strand, 12025 - 12371
Alignment:
Q  8 gagcacagagagatccaggacttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12025 gagcacagggagatccaggcttttgaggacgtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcatttgctcgagagggttt 12124  T
Q  108 tgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcac 207  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  12125 tgaggcagtacgaatacgtcctgaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgtagtctttcgtcgacttccgcac 12224  T
Q  208 tcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccct 307  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    |||||| | |  ||||||||||||    
T  12225 tcacacgcttaaggaggtcgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtaggatggtacaccattgtgtctcaccct 12324  T
Q  308 cagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 354  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  12325 cagattttgccacttcttccaggaaatattccgaggccaccaaatga 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 334
Target Start/End: Original strand, 56476 - 56579
Alignment:
Q  231 ggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  56476 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 56575  T
Q  331 agat 334  Q
    ||||    
T  56576 agat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22411 - 22343
Alignment:
Q  269 gatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 337  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  22411 gatggctatatactatggtacactagggtgtctcaacctctgattttgccacttcttctaggagatctt 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University