View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12504_high_9 (Length: 319)

Name: NF12504_high_9
Description: NF12504
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12504_high_9
NF12504_high_9
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-258)||(1815409-1815663)
chr4 (1-268)||(46888007-46888270)
chr4 (1-266)||(55477740-55478002)
chr4 (2-266)||(37663591-37663852)
chr4 (1-270)||(33341495-33341760)
chr4 (1-270)||(55240954-55241219)
chr4 (2-266)||(19089303-19089564)
chr4 (1-270)||(34947944-34948212)
chr4 (1-267)||(6864134-6864397)
chr4 (1-269)||(35020880-35021149)
chr4 (2-266)||(47253848-47254101)
chr4 (1-269)||(19440497-19440762)
chr4 (1-231)||(7703644-7703871)
chr4 (4-266)||(28002838-28003097)
chr4 (1-266)||(50697342-50697604)
chr4 (1-266)||(17167813-17168075)
chr4 (1-266)||(17173390-17173652)
chr4 (1-266)||(23761172-23761433)
chr4 (1-265)||(32912428-32912690)
chr4 (1-266)||(36493538-36493799)
chr4 (1-266)||(25184213-25184475)
chr4 (1-266)||(25700905-25701168)
chr4 (1-269)||(29584049-29584314)
chr4 (1-266)||(879397-879659)
chr4 (1-236)||(3042749-3042981)
chr4 (1-226)||(37287866-37288090)
chr4 (1-270)||(37775765-37776020)
chr4 (31-265)||(5047843-5048075)
chr4 (1-262)||(34361340-34361598)
chr4 (4-270)||(33816368-33816648)
chr4 (1-266)||(27396716-27396976)
chr4 (1-231)||(30002490-30002708)
chr4 (1-266)||(50764830-50765082)
chr4 (1-266)||(32579547-32579808)
chr4 (1-266)||(17272068-17272326)
chr4 (1-262)||(42199833-42200093)
chr4 (1-270)||(4598088-4598344)
chr4 (1-266)||(32592193-32592446)
chr4 (5-270)||(49376063-49376325)
chr4 (54-266)||(38011954-38012165)
chr4 (1-180)||(7152053-7152230)
chr4 (86-269)||(4934134-4934316)
chr4 (1-137)||(39400236-39400370)
chr4 (1-130)||(4205219-4205346)
chr4 (31-262)||(9139349-9139563)
chr4 (88-231)||(35025530-35025672)
chr4 (1-217)||(46883963-46884170)
chr4 (1-103)||(35025415-35025515)
chr4 (4-167)||(26896285-26896447)
chr4 (81-266)||(54499165-54499349)
chr4 (1-94)||(23431826-23431917)
chr4 (61-124)||(56050171-56050234)
chr4 (169-226)||(39398049-39398106)
chr4 (4-59)||(38012568-38012621)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (2-270)||(11727119-11727384)
chr8 (1-266)||(1149461-1149723)
chr8 (1-266)||(1205026-1205288)
chr8 (4-269)||(16446707-16446969)
chr8 (1-266)||(6098342-6098609)
chr8 (5-270)||(5299779-5300041)
chr8 (1-266)||(37970348-37970610)
chr8 (1-270)||(1953817-1954085)
chr8 (1-266)||(16222962-16223224)
chr8 (1-270)||(34895062-34895323)
chr8 (1-266)||(36694795-36695057)
chr8 (1-270)||(38644073-38644339)
chr8 (1-266)||(23854260-23854522)
chr8 (5-270)||(27082671-27082933)
chr8 (1-269)||(7890786-7891051)
chr8 (5-236)||(4132519-4132746)
chr8 (1-266)||(9864247-9864509)
chr8 (1-266)||(43643424-43643686)
chr8 (1-266)||(12876208-12876471)
chr8 (1-266)||(44869596-44869858)
chr8 (4-261)||(33906316-33906568)
chr8 (1-267)||(39098948-39099211)
chr8 (1-270)||(465937-466193)
chr8 (1-269)||(40862516-40862781)
chr8 (1-266)||(10555034-10555293)
chr8 (1-236)||(8803645-8803878)
chr8 (54-266)||(13307722-13307932)
chr8 (1-266)||(31933715-31933977)
chr8 (1-262)||(35459540-35459798)
chr8 (1-266)||(30654412-30654674)
chr8 (82-267)||(41910897-41911080)
chr8 (8-143)||(1149756-1149889)
chr8 (1-138)||(35859160-35859295)
chr8 (1-137)||(34951886-34952020)
chr8 (1-130)||(12587816-12587943)
chr8 (94-215)||(43025852-43025972)
chr8 (2-215)||(18259233-18259439)
chr8 (1-116)||(24823223-24823336)
chr8 (2-105)||(33198061-33198162)
chr8 (169-266)||(1150099-1150196)
chr8 (173-266)||(41362614-41362707)
chr8 (87-161)||(7998481-7998555)
chr8 (172-266)||(34952028-34952122)
chr8 (43-130)||(34463708-34463792)
chr8 (1-64)||(43025974-43026035)
chr8 (5-63)||(41362723-41362779)
chr8 (172-231)||(7998428-7998488)
chr8 (242-270)||(4133077-4133105)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-270)||(31786459-31786725)
chr5 (1-266)||(22980893-22981155)
chr5 (1-266)||(699250-699512)
chr5 (1-266)||(38528050-38528311)
chr5 (1-266)||(12910455-12910717)
chr5 (1-266)||(31705425-31705686)
chr5 (1-270)||(33908329-33908594)
chr5 (1-266)||(35504465-35504727)
chr5 (2-266)||(19119959-19120220)
chr5 (1-266)||(7208677-7208938)
chr5 (1-266)||(15992353-15992615)
chr5 (1-266)||(35511295-35511552)
chr5 (2-266)||(5837655-5837916)
chr5 (1-269)||(22255279-22255544)
chr5 (1-269)||(8741698-8741964)
chr5 (1-266)||(9200333-9200586)
chr5 (6-226)||(5830032-5830249)
chr5 (1-269)||(27330401-27330666)
chr5 (1-266)||(27318301-27318562)
chr5 (1-266)||(24886204-24886449)
chr5 (1-266)||(35826299-35826558)
chr5 (1-266)||(17157844-17158105)
chr5 (1-266)||(22973895-22974157)
chr5 (1-266)||(30969137-30969399)
chr5 (1-270)||(23116043-23116301)
chr5 (1-266)||(39572919-39573173)
chr5 (5-269)||(40133482-40133743)
chr5 (1-270)||(35933991-35934258)
chr5 (2-266)||(36860523-36860785)
chr5 (5-269)||(36866859-36867120)
chr5 (1-266)||(22019732-22019985)
chr5 (1-266)||(25500739-25501001)
chr5 (37-266)||(21088613-21088841)
chr5 (31-270)||(23954636-23954868)
chr5 (5-266)||(8437066-8437323)
chr5 (1-266)||(32563249-32563502)
chr5 (13-236)||(13956187-13956407)
chr5 (31-269)||(1429003-1429223)
chr5 (1-270)||(7693326-7693583)
chr5 (1-217)||(2888258-2888471)
chr5 (93-266)||(14919431-14919603)
chr5 (1-269)||(43308473-43308730)
chr5 (5-151)||(25889584-25889728)
chr5 (4-270)||(14409157-14409405)
chr5 (1-261)||(15724594-15724850)
chr5 (38-258)||(6824329-6824546)
chr5 (1-144)||(25669797-25669938)
chr5 (1-246)||(42342851-42343083)
chr5 (107-266)||(26268174-26268332)
chr5 (1-164)||(8466928-8467088)
chr5 (1-105)||(28416364-28416466)
chr5 (123-270)||(5112247-5112392)
chr5 (6-105)||(26269069-26269166)
chr5 (1-66)||(43254154-43254217)
chr5 (156-270)||(28416493-28416606)
chr5 (181-270)||(8466840-8466929)
chr5 (172-215)||(25669737-25669780)
chr5 (120-178)||(11898141-11898199)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-270)||(8861356-8861622)
chr7 (1-266)||(18797402-18797664)
chr7 (9-265)||(27283820-27284073)
chr7 (2-266)||(30055602-30055863)
chr7 (1-270)||(25691368-25691634)
chr7 (2-270)||(15612584-15612849)
chr7 (1-266)||(9355650-9355912)
chr7 (5-270)||(5657309-5657571)
chr7 (1-266)||(31578888-31579150)
chr7 (1-266)||(32432527-32432789)
chr7 (1-269)||(32820877-32821142)
chr7 (1-266)||(37109947-37110211)
chr7 (1-266)||(11071281-11071540)
chr7 (2-248)||(6546612-6546855)
chr7 (1-269)||(24211813-24212079)
chr7 (6-270)||(41764907-41765168)
chr7 (1-266)||(37347097-37347358)
chr7 (1-266)||(21991711-21991964)
chr7 (1-269)||(23111262-23111529)
chr7 (1-266)||(17842408-17842672)
chr7 (3-270)||(22687310-22687566)
chr7 (1-266)||(7334869-7335130)
chr7 (1-266)||(10359038-10359300)
chr7 (5-231)||(37703326-37703549)
chr7 (31-266)||(48928149-48928382)
chr7 (9-266)||(10481680-10481934)
chr7 (2-270)||(44598737-44599002)
chr7 (7-270)||(12165823-12166074)
chr7 (5-248)||(15672587-15672830)
chr7 (69-266)||(38258620-38258816)
chr7 (1-266)||(29173615-29173859)
chr7 (5-266)||(4582994-4583252)
chr7 (34-270)||(33688117-33688352)
chr7 (1-266)||(31520565-31520809)
chr7 (58-269)||(43686112-43686322)
chr7 (1-215)||(26587916-26588119)
chr7 (4-193)||(35353256-35353442)
chr7 (9-231)||(46480961-46481180)
chr7 (2-270)||(26980394-26980642)
chr7 (1-266)||(43925177-43925432)
chr7 (5-148)||(44411368-44411509)
chr7 (88-266)||(48928473-48928649)
chr7 (110-257)||(37704241-37704387)
chr7 (6-266)||(12390478-12390716)
chr7 (1-135)||(37704387-37704519)
chr7 (112-266)||(27421313-27421465)
chr7 (11-270)||(32593040-32593278)
chr7 (1-137)||(34362002-34362138)
chr7 (60-161)||(38053640-38053741)
chr7 (156-265)||(44413356-44413464)
chr7 (219-270)||(26524366-26524417)
chr7 (1-52)||(38258867-38258916)
chr7 (172-231)||(38053588-38053647)
chr7 (33-97)||(27421219-27421283)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (5-270)||(27227307-27227569)
chr1 (1-266)||(2959844-2960106)
chr1 (1-270)||(4330373-4330639)
chr1 (1-270)||(16415738-16416004)
chr1 (1-266)||(37451382-37451643)
chr1 (1-269)||(28769745-28770011)
chr1 (6-269)||(8222221-8222480)
chr1 (1-269)||(32216148-32216413)
chr1 (2-266)||(51128955-51129216)
chr1 (1-266)||(38823310-38823572)
chr1 (6-266)||(15383029-15383286)
chr1 (6-269)||(25160725-25160985)
chr1 (1-270)||(27532800-27533064)
chr1 (6-267)||(30326775-30327033)
chr1 (5-270)||(47682316-47682578)
chr1 (1-266)||(23999443-23999706)
chr1 (1-266)||(9902872-9903134)
chr1 (1-270)||(47279281-47279547)
chr1 (2-266)||(7078882-7079143)
chr1 (1-270)||(10181825-10182092)
chr1 (4-270)||(15168188-15168451)
chr1 (1-266)||(238331-238593)
chr1 (1-269)||(19899586-19899852)
chr1 (1-270)||(34012200-34012461)
chr1 (5-269)||(15752122-15752383)
chr1 (1-266)||(27763128-27763391)
chr1 (1-266)||(10922823-10923085)
chr1 (1-266)||(30254519-30254781)
chr1 (1-266)||(32267130-32267392)
chr1 (1-266)||(28564601-28564861)
chr1 (5-270)||(39393475-39393738)
chr1 (1-266)||(3535028-3535281)
chr1 (5-270)||(27267022-27267283)
chr1 (31-266)||(18422747-18422981)
chr1 (1-270)||(3309239-3309511)
chr1 (1-266)||(27563723-27563985)
chr1 (1-266)||(42721135-42721394)
chr1 (4-270)||(14758133-14758387)
chr1 (1-268)||(46931505-46931768)
chr1 (1-270)||(1547379-1547629)
chr1 (1-266)||(22170807-22171069)
chr1 (57-270)||(33725472-33725684)
chr1 (33-270)||(40884905-40885141)
chr1 (1-270)||(41926255-41926514)
chr1 (1-169)||(48353735-48353900)
chr1 (1-151)||(11742186-11742334)
chr1 (1-169)||(1359753-1359919)
chr1 (31-270)||(31621395-31621637)
chr1 (48-236)||(38759659-38759846)
chr1 (11-266)||(37618729-37618974)
chr1 (1-147)||(21289817-21289958)
chr1 (83-266)||(48620733-48620906)
chr1 (1-124)||(31962853-31962975)
chr1 (173-266)||(11742338-11742430)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (2-266)||(42505899-42506160)
chr3 (1-269)||(46297585-46297850)
chr3 (2-266)||(26941084-26941345)
chr3 (1-267)||(53228975-53229238)
chr3 (1-270)||(52040745-52041011)
chr3 (2-270)||(44891584-44891849)
chr3 (1-267)||(11357204-11357450)
chr3 (1-270)||(39282739-39283005)
chr3 (1-270)||(37157794-37158061)
chr3 (1-266)||(4015551-4015812)
chr3 (1-266)||(33378608-33378870)
chr3 (1-241)||(1089809-1090046)
chr3 (1-270)||(3362340-3362608)
chr3 (1-266)||(24707938-24708202)
chr3 (1-236)||(22622541-22622773)
chr3 (3-245)||(33698265-33698504)
chr3 (1-266)||(34133026-34133288)
chr3 (2-266)||(7327306-7327567)
chr3 (6-266)||(25579830-25580087)
chr3 (1-269)||(48355029-48355294)
chr3 (7-266)||(46994490-46994746)
chr3 (1-270)||(37203154-37203421)
chr3 (1-270)||(2008020-2008292)
chr3 (1-266)||(4761471-4761734)
chr3 (1-266)||(40552082-40552344)
chr3 (1-269)||(38591786-38592051)
chr3 (11-270)||(32373557-32373813)
chr3 (31-266)||(54828552-54828786)
chr3 (1-266)||(44186340-44186586)
chr3 (1-266)||(21193697-21193960)
chr3 (4-270)||(22451055-22451318)
chr3 (1-266)||(47481613-47481876)
chr3 (1-266)||(29099446-29099699)
chr3 (9-266)||(3655031-3655287)
chr3 (1-270)||(22445888-22446154)
chr3 (1-266)||(21009624-21009887)
chr3 (41-267)||(45174595-45174821)
chr3 (31-270)||(11466911-11467142)
chr3 (31-263)||(29163912-29164134)
chr3 (1-250)||(36012244-36012492)
chr3 (1-266)||(24488785-24489047)
chr3 (1-265)||(14586503-14586754)
chr3 (1-266)||(54505899-54506161)
chr3 (4-266)||(43975718-43975973)
chr3 (57-270)||(43348345-43348556)
chr3 (2-161)||(40936168-40936325)
chr3 (6-147)||(51212599-51212738)
chr3 (41-255)||(11835494-11835702)
chr3 (4-266)||(27480184-27480464)
chr3 (1-146)||(50475021-50475171)
chr3 (124-266)||(53176145-53176286)
chr3 (4-170)||(11356984-11357140)
chr3 (72-200)||(20373136-20373263)
chr3 (107-266)||(35844417-35844575)
chr3 (43-151)||(53811597-53811701)
chr3 (156-269)||(51212957-51213069)
chr3 (188-266)||(20373303-20373381)
chr3 (172-266)||(40936082-40936175)
chr3 (1-52)||(20373086-20373135)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-266)||(41960940-41961202)
chr2 (1-269)||(2325219-2325476)
chr2 (1-266)||(4763731-4763993)
chr2 (1-266)||(33709073-33709335)
chr2 (2-266)||(31570576-31570837)
chr2 (1-266)||(11366221-11366484)
chr2 (1-266)||(26357677-26357939)
chr2 (1-266)||(43648086-43648348)
chr2 (5-269)||(4167019-4167280)
chr2 (1-248)||(44913781-44914029)
chr2 (10-266)||(4263926-4264180)
chr2 (6-266)||(37905808-37906067)
chr2 (1-270)||(29241986-29242245)
chr2 (1-266)||(18494122-18494383)
chr2 (31-270)||(44286045-44286283)
chr2 (1-266)||(3177039-3177301)
chr2 (11-270)||(4478465-4478717)
chr2 (1-266)||(27349789-27350041)
chr2 (1-270)||(33660218-33660475)
chr2 (1-266)||(33550824-33551089)
chr2 (71-266)||(17071646-17071840)
chr2 (5-266)||(19289168-19289426)
chr2 (2-270)||(19424484-19424735)
chr2 (1-236)||(35959027-35959254)
chr2 (2-266)||(13711564-13711820)
chr2 (1-265)||(31861953-31862214)
chr2 (60-266)||(36642086-36642293)
chr2 (1-267)||(7006779-7007025)
chr2 (4-265)||(41465602-41465860)
chr2 (60-266)||(45327820-45328025)
chr2 (31-266)||(19313952-19314181)
chr2 (1-170)||(19500756-19500923)
chr2 (1-270)||(43770689-43770946)
chr2 (71-266)||(17054005-17054199)
chr2 (5-266)||(39167214-39167466)
chr2 (1-266)||(5881639-5881891)
chr2 (91-270)||(41463779-41463957)
chr2 (89-210)||(18258214-18258334)
chr2 (112-266)||(33902166-33902319)
chr2 (1-123)||(41051141-41051260)
chr2 (2-92)||(41463432-41463520)
chr2 (5-77)||(18257383-18257453)
chr2 (221-270)||(41051263-41051312)
chr2 (191-263)||(19501768-19501839)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (2-266)||(7987-8248)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-265)||(408252-408512)
scaffold0002 (1-269)||(231-490)
scaffold0002 (1-124)||(93924-94044)
scaffold0002 (132-270)||(94335-94472)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-266)||(6091004-6091267)
chr6 (4-266)||(7234857-7235118)
chr6 (1-266)||(3879761-3880023)
chr6 (1-266)||(1945934-1946197)
chr6 (1-266)||(5627491-5627754)
chr6 (5-270)||(20768180-20768440)
chr6 (2-266)||(29182263-29182522)
chr6 (1-269)||(21016940-21017199)
chr6 (1-266)||(4318644-4318907)
chr6 (1-262)||(33892834-33893082)
chr6 (31-266)||(8513333-8513562)
chr6 (4-270)||(33618930-33619192)
chr6 (96-270)||(15491711-15491884)
chr6 (31-270)||(6089004-6089237)
chr6 (82-270)||(30353259-30353446)
chr6 (107-266)||(7055141-7055299)
chr6 (1-112)||(7054594-7054704)
chr6 (241-270)||(18498530-18498559)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (9-270)||(12005-12263)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (5-269)||(44054-44314)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-269)||(154473-154733)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (5-266)||(145842-146101)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (48-266)||(267384-267602)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (98-144)||(100948-100994)
scaffold0009 (31-86)||(100994-101047)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1815663 - 1815409
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815663 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 1815566  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1815565 gttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaa 1815467  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaac 258  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  1815466 attagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 46888007 - 46888270
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46888007 tttgattcatttttaaattgttgatta--gtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatc 46888104  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46888105 gttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtc-taagtgttacgttttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 46888202  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcc 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  46888203 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgcc 46888270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 55477740 - 55478002
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  55477740 tttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatc 55477837  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  55477838 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgt-ggggtgttacacttataacaagttaggataaa 55477936  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55477937 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 55478002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 37663591 - 37663852
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37663591 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 37663688  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  37663689 ttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa 37663787  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37663788 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 37663852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33341760 - 33341495
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33341760 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 33341663  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33341662 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33341564  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| ||||| | || | |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33341563 attatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccac 33341495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 55240954 - 55241219
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  55240954 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 55241051  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  55241052 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 55241150  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | || || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55241151 attagattaagtgtattcttctt-atctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccac 55241219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 19089303 - 19089564
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19089303 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 19089400  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| | || |  ||||||||||||||    
T  19089401 ttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaa 19089499  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19089500 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 19089564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 34947944 - 34948212
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34947944 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 34948041  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcag--cgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggata 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  34948042 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgt-ggggtgttgcactttaaacaagataggata 34948140  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34948141 aaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccac 34948212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6864397 - 6864134
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||    
T  6864397 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatc 6864300  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  6864299 gttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtatgataaa 6864201  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6864200 attaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgc 6864134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 35020880 - 35021149
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaata----gtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  35020880 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattt 35020977  T
Q  97 tatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtagga 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35020978 tatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaacaaggtagga 35021076  T
Q  197 taaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  35021077 taaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgcca 35021149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47254101 - 47253848
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| |    
T  47254101 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattg 47254004  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47254003 ttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 47253905  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||| ||||| |||| | |||||||| ||        || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47253904 ttaaattaagtgtattcttgttaatctg--------atgatactatgaggactgaacttttgatg 47253848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19440497 - 19440762
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19440497 tttgattaatttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 19440594  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| |||||||||| |||| || ||| || ||||||    
T  19440595 attggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgt-ggggtgttacgcttataacaagctaagataaa 19440693  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19440694 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgcca 19440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7703871 - 7703644
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7703871 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatc 7703774  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7703773 gttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 7703675  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  7703674 attagattaagtgtattcttgttaatctgat 7703644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 28002838 - 28003097
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28002838 gattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 28002935  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28002936 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttct-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 28003034  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| || ||| ||||||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28003035 agattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatg 28003097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50697604 - 50697342
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50697604 tttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatc 50697507  T
Q  101 gttggtatctttaaca-tgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  50697506 gttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgt-gtggtgttacgcttataacaaggtaggataa 50697408  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||| ||| | |||||||||||||    
T  50697407 aattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatg 50697342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17168075 - 17167813
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17168075 tttgattcatttttaaattattgattacta--attaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17167978  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17167977 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 17167879  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | || ||| | |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  17167878 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatg 17167813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17173652 - 17173390
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17173652 tttgattcatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17173555  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17173554 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 17173456  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | || ||| | |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  17173455 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatg 17173390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23761433 - 23761172
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  23761433 tttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatc 23761336  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  || ||| ||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23761335 gttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttat-gaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaa 23761238  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23761237 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 23761172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 32912428 - 32912690
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32912428 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 32912525  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  32912526 cgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 32912624  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  32912625 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgat 32912690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 36493538 - 36493799
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  36493538 tttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatc 36493635  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |   |||||||||||| || ||| ||||||    
T  36493636 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggag--tttacacttaaaacaatgtatgataaa 36493733  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36493734 attagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 36493799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25184475 - 25184213
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  25184475 tttgattcatttttaaattgtcgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 25184378  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  25184377 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 25184279  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||| || |||||||| ||||    
T  25184278 attagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatg 25184213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 25700905 - 25701168
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  25700905 tttgattcatttttaaattgtacattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatc 25701002  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25701003 gttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 25701102  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25701103 attagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 25701168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 29584049 - 29584314
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||     
T  29584049 tttgattcatttttaaatcgttcattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 29584146  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||  | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  29584147 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat-ggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaa 29584245  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||| | |  ||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29584246 attagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcca 29584314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 879397 - 879659
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  879397 tttgattcatttttaaattgttgattactt--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 879494  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  879495 gtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 879593  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||| || | |||||||||||    
T  879594 attagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatg 879659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3042981 - 3042749
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3042981 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatc 3042884  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  3042883 gttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataataaggtatgataaa 3042785  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  3042784 attatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaatt 3042749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37288090 - 37287866
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37288090 tttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37287993  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aa 199  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||    
T  37287992 gttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaa 37287893  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaat 226  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  37287892 aattagattaagtgtattcttgttaat 37287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37776020 - 37775765
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37776020 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 37775923  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37775922 gttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 37775833  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  37775832 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccac 37775765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 265
Target Start/End: Original strand, 5047843 - 5048075
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  5047843 tgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttt 5047942  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||| ||||||||||||| || |||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |    
T  5047943 atgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattt--tgcgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctca 5048040  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    | |||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  5048041 tgaattgatgatactatgggaactgaacttttgat 5048075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 34361340 - 34361598
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34361340 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 34361437  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || || |||||| |||||  ||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  34361438 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 34361536  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaactttt 262  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||   ||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  34361537 aattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaactttt 34361598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Original strand, 33816368 - 33816648
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  33816368 gattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgtt 33816465  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtg----------------ggggtgttacacttaaaat 187  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||                ||||||||||||||||||     
T  33816466 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaac 33816565  T
Q  188 aaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33816566 aaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccac 33816648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27396976 - 27396716
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||    
T  27396976 tttgattcatttttaaattgttgattac----attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatc 27396881  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || || ||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27396880 gttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttat-gggatgttacacttaaaacaaggtagaataaa 27396782  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  27396781 attaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatg 27396716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30002490 - 30002708
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  30002490 tttgattcatttttaaattgtttattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatc 30002587  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002588 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 30002677  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  30002678 attagattaagtgtattcttgttaatctgat 30002708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50765082 - 50764830
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  50765082 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 50764985  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | || || ||| || ||||| ||||||||||||          ||||||||||    
T  50764984 gttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgt-ggggtgttacac----------gtaggataaa 50764896  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | || |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  50764895 attagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatg 50764830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32579808 - 32579547
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32579808 tttgatttatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 32579711  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || |||||| ||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32579710 gttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttct-gaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaa 32579612  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |  |||  ||||||| |||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32579611 attagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatg 32579547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17272326 - 17272068
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  17272326 tttgattcatttttaaatcgttcattaccg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 17272229  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17272228 gttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 17272130  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |  ||||| |||| |||| || ||||||    ||||||||||||||||    
T  17272129 attagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta----gactgaacttttgatg 17272068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42200093 - 42199833
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttaca-ggtactatttta 98  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42200093 tttgattaatttttaaattattgattactg--attaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattatttta 42199996  T
Q  99 tcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggata 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||  |||| || |||||| ||||    
T  42199995 tcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttatgcttagaacaaggtatgata 42199897  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaactttt 262  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  42199896 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttt 42199833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4598344 - 4598088
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  4598344 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatc 4598247  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  4598246 gttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaa-gcaggataaa 4598158  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||| || |  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  4598157 attaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccac 4598088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32592446 - 32592193
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32592446 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatc 32592349  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || |  |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32592348 gtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32592259  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  32592258 attaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 32592193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49376325 - 49376063
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49376325 attcatttttaaattcttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttg 49376228  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||   |||||||  |||| || |||||||||    
T  49376227 acatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgt-ggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaatta 49376129  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| ||  ||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49376128 gatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccac 49376063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38012165 - 38011954
Alignment:
Q  54 atctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttca 153  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38012165 atctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 38012066  T
Q  154 gcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggac 253  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||    
T  38012065 gcgttacactttct-gggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggac 38011967  T
Q  254 tgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||    
T  38011966 tgaacttttgatg 38011954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7152053 - 7152230
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7152053 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatc 7152150  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacac 180  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||| | |||||| || ||||||||    
T  7152151 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtgaggatgttacac 7152230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 269
Target Start/End: Original strand, 4934134 - 4934316
Alignment:
Q  86 aggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||  |||||||    
T  4934134 aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttggacttaaa 4934232  T
Q  186 ataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4934233 acaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgcca 4934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39400370 - 39400236
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  39400370 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatc 39400273  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39400272 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4205346 - 4205219
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4205346 tttgattcatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 4205249  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205248 gttggcatctttaacatgcaaacagagttg 4205219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9139563 - 9139349
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9139563 tgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt- 9139465  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
        ||           |||| || |||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  9139464 ----ta-----------tcttaagtgttacactttgt-agggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 9139381  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaactttt 262  Q
    | | || || |||||||| ||| |||||||||    
T  9139380 tgagttgatgatactatggggattgaactttt 9139349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025672
Alignment:
Q  88 gtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaat 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | ||||||| ||||||||||     
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttct-ggggtgtgacacttaaaac 35025628  T
Q  188 aaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  35025629 aagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgat 35025672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 46883963 - 46884170
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  46883963 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatc 46884056  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||| | | |||||  |||| || ||| || ||||||    
T  46884057 tttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgt-gagatgtta-gcttataacaagatatgataaa 46884153  T
Q  201 attagattaaatgtagt 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  46884154 attagattaagtgtagt 46884170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 35025415 - 35025515
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35025415 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35025512  T
Q  101 gtt 103  Q
    |||    
T  35025513 gtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26896447 - 26896285
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatctt-ggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26896447 gattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcg 26896350  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgt 167  Q
    |||  || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  26896349 ttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Original strand, 54499165 - 54499349
Alignment:
Q  81 tttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacac 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  54499165 tttaccggtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtaggg-tgttacac 54499262  T
Q  181 ttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || | ||||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||||    
T  54499263 ttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatg 54499349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23431917 - 23431826
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactat 94  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23431917 tttgatgcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  61 aatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39398106 - 39398049
Alignment:
Q  169 ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  39398106 ggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 38012621 - 38012568
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctag 59  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38012621 gatttatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11727384 - 11727119
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  11727384 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcg 11727287  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727286 ttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 11727188  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11727187 ttagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccac 11727119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 1149461 - 1149723
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1149461 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1149558  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  1149559 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaagataaa 1149657  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1149658 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatg 1149723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1205288 - 1205026
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1205288 tttgattcatttttaaattgctgatta--gtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1205191  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  1205190 gttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaa 1205092  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1205091 attagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatg 1205026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 16446707 - 16446969
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16446707 gattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcatt 16446804  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16446805 ggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaatt 16446903  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    | ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16446904 aaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgcca 16446969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6098342 - 6098609
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat- 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  6098342 tttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtatt 6098439  T
Q  100 ----cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtagg 195  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  6098440 gtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaagatagg 6098538  T
Q  196 ataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  6098539 ataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatg 6098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 5299779 - 5300041
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5299779 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 5299876  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5299877 ttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaatta 5299975  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5299976 gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccac 5300041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 37970348 - 37970610
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  37970348 tttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 37970445  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37970446 gtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaa 37970544  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||   || |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37970545 attagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatg 37970610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 1953817 - 1954085
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953817 tttgattcattttaaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatc 1953914  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1953915 gttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaa 1954014  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaata-atactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||| | ||||||  | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1954015 attagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgccac 1954085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16223224 - 16222962
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16223224 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 16223127  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||| | ||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  16223126 attggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacacttt-ttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaa 16223028  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223027 attagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 16222962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34895323 - 34895062
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  34895323 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttc 34895226  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34895225 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 34895132  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34895131 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccac 34895062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 36694795 - 36695057
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36694795 tttgatttatttttaaattattgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatc 36694892  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36694893 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 36694991  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | || ||| | |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36694992 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 36695057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38644339 - 38644073
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38644339 tttgatttatttttaaatttttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 38644242  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38644241 attgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttat-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 38644143  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38644142 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccac 38644073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 23854260 - 23854522
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23854260 tttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 23854357  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||| | | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  23854358 gtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttat-gcggtgttacacttataactaggtaagataaa 23854456  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | || | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23854457 attagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 23854522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 27082671 - 27082933
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27082671 attcatttttaaattgttgattattg--attaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 27082768  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  27082769 acatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg-cggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaatta 27082867  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27082868 gattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccac 27082933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 7890786 - 7891051
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  7890786 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatc 7890883  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  7890884 gttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgt-ggggtgttacgcttataacaaagtaagataaa 7890982  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    | |||||| | |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7890983 actagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgcca 7891051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 4132519 - 4132746
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4132519 attcatttttaaattgttgattacaa--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 4132616  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4132617 gcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgt-ggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaatta 4132714  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  4132715 gattaagtgtagtcttgttaatttgatgaatt 4132746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864247
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatc 9864412  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9864411 gttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 9864313  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||| | || ||| | |||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  9864312 attatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatg 9864247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 43643424 - 43643686
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  43643424 tttgattcatttttaaattgtcgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 43643521  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  43643522 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 43643620  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||| || |||||||| ||||    
T  43643621 attagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatg 43643686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12876471 - 12876208
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||   ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12876471 tttgatttattttcaaactgttgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatc 12876374  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtc-ttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12876373 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaataaggtaggataa 12876275  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12876274 aattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 12876208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44869858 - 44869596
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  44869858 tttgattcatttttaaattgttggttactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatc 44869761  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aa 199  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||| ||    
T  44869760 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg--acaacacttaaaacaaggtaggataaa 44869663  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  44869662 aattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatg 44869596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33906568 - 33906316
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33906568 gattcatttttaaat--ttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 33906473  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | ||  |||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  33906472 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttt-ttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaatt 33906374  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttt 261  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  33906373 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 39098948 - 39099211
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  39098948 tttgatgcatttttaaattattgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatc 39099045  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || | | ||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  39099046 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgt-gggatgttacacttaaaacagggtaagataaa 39099144  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39099145 attagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgc 39099211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 466193 - 465937
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  466193 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatc 466096  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  466095 attggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaa 466007  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  466006 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccac 465937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40862781 - 40862516
Alignment:
Q  1 tttgattcattttt-aaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||  ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40862781 tttgattcattttttaaattgtcgattactg--atttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 40862684  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||| || || |||||||||    
T  40862683 cgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttagaacaaagtaggataa 40862585  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40862584 aattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgcca 40862516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 10555034 - 10555293
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagt--aatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatttta 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||     ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10555034 tttgattcatttttaaattgtttattact-----taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactatttta 10555128  T
Q  99 tcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggata 198  Q
    | || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||||| | |||||| | |||| || |||||||||||    
T  10555129 ttgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgt-gaggtgttgcgcttataacaaggtaggata 10555225  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  10555226 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatg 10555293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 8803645 - 8803878
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8803645 tttgattcatttttaaattgttcattactg--attaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 8803742  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||| |  ||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  8803743 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacacttt-ttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 8803841  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  8803842 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaatt 8803878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13307932 - 13307722
Alignment:
Q  54 atctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttca 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  13307932 atcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaa 13307834  T
Q  154 gcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggac 253  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  13307833 gtgttacactttgtgggg-tgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggac 13307735  T
Q  254 tgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||    
T  13307734 tgaacttttgatg 13307722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31933715 - 31933977
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||     
T  31933715 tttgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttatt 31933812  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || || |||||| ||||| | ||| |||  |||| || |||||| ||||||    
T  31933813 gttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt-gcggtattatgcttataacaaggtatgataaa 31933911  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31933912 attagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatg 31933977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 35459540 - 35459798
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||     
T  35459540 tttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttatt 35459637  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || |  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||| | | ||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||||    
T  35459638 gtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgt-gggatgttacatttataacaaagtaggataaa 35459736  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaactttt 262  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| | || || ||| ||||||||||||||||||    
T  35459737 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaactttt 35459798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 30654412 - 30654674
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30654412 tttgattcatttt-aaattgttaattactg--attaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 30654508  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| ||||||| || ||| | |||    
T  30654509 cgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaa 30654607  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| || | || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30654608 aattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatg 30654674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Original strand, 41910897 - 41911080
Alignment:
Q  82 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacact 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  41910897 ttacaggtaatattttatcgttgc-atctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtgggg-tgttacact 41910994  T
Q  182 taaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  41910995 taaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgc 41911080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149889
Alignment:
Q  8 catttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggta 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |    
T  1149756 catttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaa 1149853  T
Q  108 tctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1149854 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtg 1149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35859295 - 35859160
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  35859295 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatc 35859198  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatatt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35859197 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 34951886 - 34952020
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  34951886 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 34951983  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 137  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951984 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12587943 - 12587816
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  12587943 tttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatc 12587846  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  12587845 gttgacatctttaacatgcaaatagagttg 12587816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025852
Alignment:
Q  94 ttttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggta 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgt-ggggtgttacagttaaaataaggta 43025874  T
Q  194 ggataaaattagattaaatgta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43025873 ggataaaattagattaaatgta 43025852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18259439 - 18259233
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  18259439 ttgattcatttttaaattgttgattactc--attactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcg 18259342  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  || |||||||||||||   | ||||||||||  |||||    |||  | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18259341 ttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgt-gggatgttacacttaaaataaggtatgataaaa 18259247  T
Q  202 ttagattaaatgta 215  Q
    ||| ||||||||||    
T  18259246 ttaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 24823223 - 24823336
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24823223 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 24823320  T
Q  101 gttggtatctttaaca 116  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24823321 gttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33198162 - 33198061
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  33198162 ttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcg 33198065  T
Q  102 ttgg 105  Q
    ||||    
T  33198064 ttgg 33198061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 266
Target Start/End: Original strand, 1150099 - 1150196
Alignment:
Q  169 ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1150099 ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatg 1150196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362614
Alignment:
Q  173 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || || | |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatg 41362614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7998555 - 7998481
Alignment:
Q  87 ggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttaca 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  7998555 ggtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttaca 7998481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952122
Alignment:
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||| |||| || ||||||   |||||||||||||||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatg 34952122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463708
Alignment:
Q  43 aatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttg 34463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43026035 - 43025974
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatg 64  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43026035 tttgattcatttttaaattgttgatcactg--attcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41362779 - 41362723
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41362779 attcatttttaaattgttgattactgg--ttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998428
Alignment:
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 7998428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 270
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133105
Alignment:
Q  242 tactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccac 4133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 31786459 - 31786725
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786459 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 31786556  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31786557 gttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-agggtgttacacttaaaacaagataggataaa 31786655  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31786656 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccac 31786725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22981155 - 22980893
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22981155 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatc 22981058  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22981057 gttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 22980959  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22980958 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 22980893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 699512 - 699250
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  699512 tttgattcatttttaaattgttaattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 699415  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  699414 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt-ggagtgttacacttaaaataaggtatgataaa 699316  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  699315 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatg 699250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 38528050 - 38528311
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38528050 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 38528147  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  38528148 gttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaa 38528246  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38528247 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatg 38528311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12910717 - 12910455
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||     
T  12910717 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtatt 12910620  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12910619 gttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 12910521  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12910520 attagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatg 12910455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31705425 - 31705686
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31705425 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatc 31705522  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||| |||| || |||||| ||||||    
T  31705523 tttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgt-gagatgttacgcttataacaaggtatgataaa 31705621  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||    
T  31705622 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatg 31705686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33908594 - 33908329
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33908594 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 33908498  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  33908497 gttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttct-ggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaa 33908399  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908398 attagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 33908329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35504727 - 35504465
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35504727 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35504630  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  35504629 gttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataatatggtaggataaa 35504531  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| | || |||||||||||||    
T  35504530 attatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatg 35504465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19120220 - 19119959
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  19120220 ttgattcatttttaaattgttgatcactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcg 19120123  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19120122 ttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaa 19120024  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||| | || | |||||||| |||| |||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  19120023 ttagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatg 19119959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 7208677 - 7208938
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  7208677 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 7208774  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  7208775 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacgtttataacaaggtaggataaa 7208873  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  7208874 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatg 7208938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 15992353 - 15992615
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15992353 tttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatc 15992450  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||||    
T  15992451 gttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt-ggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaa 15992549  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| || |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15992550 attagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 15992615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 35511295 - 35511552
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  35511295 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 35511392  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  35511393 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 35511486  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35511487 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatg 35511552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5837916 - 5837655
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  5837916 ttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcg 5837819  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||    
T  5837818 ttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaa 5837720  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5837719 ttagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatg 5837655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22255544 - 22255279
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22255544 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 22255447  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | |||||||| |||| || ||  |||| ||||    
T  22255446 gttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgt-gtggtgttacgcttataacaaaataggctaaa 22255348  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22255347 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgcca 22255279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 8741698 - 8741964
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  8741698 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatc 8741795  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgat-attatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  8741796 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacacttaaaacaaggtatgacaa 8741894  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8741895 aattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcca 8741964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9200586 - 9200333
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||    
T  9200586 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatc 9200489  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9200488 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 9200399  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  9200398 attagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatg 9200333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5830249 - 5830032
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5830249 ttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgg 5830152  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||    
T  5830151 aatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgag 5830053  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaat 226  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  5830052 attaagtgtagtcttgttaat 5830032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27330666 - 27330401
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||     
T  27330666 tttgattcatttttaaatcgttcattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 27330569  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27330568 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcat-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 27330470  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||| | |  ||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27330469 attagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcca 27330401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27318301 - 27318562
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaa-tcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  | |||   ||||||||||||    
T  27318301 tttgattcatttttaaaattgttgatt--tttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttat 27318396  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27318397 cgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacgcttaaaataaggtaggataa 27318495  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  27318496 aattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatg 27318562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24886449 - 24886204
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  24886449 tttgattcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 24886352  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |                  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24886351 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------------gtgttacacttataataaggtaggataaa 24886270  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24886269 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 24886204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 35826299 - 35826558
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35826299 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35826396  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  35826397 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgt-ggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaa 35826493  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | || || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35826494 attagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatg 35826558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 17157844 - 17158105
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  17157844 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 17157941  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  17157942 gttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataataaggtaagataca 17158040  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| | ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||    
T  17158041 attatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatg 17158105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 22973895 - 22974157
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  22973895 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 22973992  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  22973993 gtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgt-gaggtgttacgcttataacaagataggataaa 22974091  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| | || || ||| |||||| | |||||||||||||    
T  22974092 attagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatg 22974157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 30969137 - 30969399
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| | ||| || |||||||||||     
T  30969137 tttgattcatttttaaattgtggattactg--attaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttatt 30969234  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30969235 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 30969333  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30969334 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 30969399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 23116043 - 23116301
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23116043 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 23116132  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23116133 gttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 23116231  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  23116232 attagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccac 23116301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39573173 - 39572919
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39573173 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 39573076  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| ||||||        |||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39573075 attggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgt-gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 39572985  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  39572984 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatg 39572919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40133743 - 40133482
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||    
T  40133743 attcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 40133646  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40133645 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 40133547  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40133546 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgcca 40133482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35934258 - 35933991
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  35934258 tttgaatcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatt 35934161  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aa 199  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35934160 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 35934062  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    || |||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35934061 aactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccac 35933991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36860785 - 36860523
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  36860785 ttgattcatttttaaattgttgattacta--attcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 36860688  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacactt-aaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36860687 ttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaa 36860589  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  36860588 attagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatg 36860523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36867120 - 36866859
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||    
T  36867120 attcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 36867023  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36867022 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 36866924  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36866923 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgcca 36866859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22019985 - 22019732
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  22019985 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatc 22019888  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||         || |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22019887 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtg---------agtgttatactttgt-ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 22019798  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| || | || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  22019797 attagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatg 22019732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 25500739 - 25501001
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25500739 tttgattcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatc 25500836  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||  |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25500837 gttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 25500935  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| | || | |||||||| |||| |||| || |||||||  ||||| |||||||||||    
T  25500936 attaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatg 25501001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 21088613 - 21088841
Alignment:
Q  37 atgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgata 136  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  21088613 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgata 21088712  T
Q  137 ttatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  21088713 ttatgtgataatcttaagtgttacactttgt-gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaatt 21088811  T
Q  237 aataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
      | |||||||| |||||||||||||||||    
T  21088812 gttgatactatggggactgaacttttgatg 21088841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954868
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     ||||||| | |||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttg 23954729  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23954730 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatga 23954828  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | |||| || ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23954829 tgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccac 23954868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8437323 - 8437066
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8437323 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttg 8437226  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||   |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8437225 gcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgt-ggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaatta 8437127  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||   ||||||||| ||| ||||   || || |||  |||||||||||||||||||||    
T  8437126 gattaagcatagttttgtaaatctgat-ggttgatgatataatgaggactgaacttttgatg 8437066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32563502 - 32563249
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32563502 tttgattcatttttaaattgttaattgctg--attaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32563405  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563404 gttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-gggctgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32563315  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  32563314 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatg 32563249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956407
Alignment:
Q  13 ttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatcttt 112  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13956187 ttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatcttt 13956284  T
Q  113 aacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaat 212  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| || |||||  |||||  ||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||| |    
T  13956285 aacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgt-agggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagt 13956383  T
Q  213 gtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    | |||||||||||| |||| ||||    
T  13956384 gaagttttgttaatctgatgaatt 13956407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 269
Target Start/End: Original strand, 1429003 - 1429223
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  1429003 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagttt 1429102  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||||||||||||||||| |                  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1429103 atgatattatgtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttga 1429184  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    | |||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1429185 tgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgcca 1429223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7693583 - 7693326
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  7693583 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatc 7693486  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7693485 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaa 7693396  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||  ||| |  ||||||| | || |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7693395 attagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccac 7693326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 2888258 - 2888471
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2888258 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatc 2888355  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | ||  ||||| |||| ||| ||||||  |||||    
T  2888356 gttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttat-ggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaa 2888454  T
Q  201 attagattaaatgtagt 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  2888455 attagattaagtgtagt 2888471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 266
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919603
Alignment:
Q  93 attttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggt 192  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgagg-tgttacacttataataaggt 14919529  T
Q  193 aggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14919530 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 14919603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 43308473 - 43308730
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  43308473 tttgattcgtttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatt 43308570  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || |||||||||||||||  ||||||| ||||        |||||||| || |||||| ||| |  |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  43308571 gtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--------atagtcttaagtgttacacttt-tcagggtgttacacttataacaaggtaagataaa 43308661  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308662 attagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 43308730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25889728 - 25889584
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25889728 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttg 25889631  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  25889630 gtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Original strand, 14409157 - 14409405
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14409157 gattcatttttaaattgttgattgctg--aataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgtt 14409254  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||                ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14409255 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagt---------------agttacacttaaaacaaggtagaataaaatt 14409339  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14409340 agattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccac 14409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15724850 - 15724594
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||     
T  15724850 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttata 15724753  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||| |  | |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15724752 gttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaa 15724654  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttt 261  Q
    |||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  15724653 attaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt 15724594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824546
Alignment:
Q  38 tgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 137  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  138 tatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaatta 237  Q
      |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||     
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattg 6824525  T
Q  238 ataatactatgaggactgaac 258  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  6824526 atgatactatgaagactgaac 6824546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25669938 - 25669797
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  25669938 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatc 25669841  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 144  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25669840 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42343083 - 42342851
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  42343083 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatc 42342986  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||         || |||||| ||||| || || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  42342985 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaa 42342897  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatacta 246  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||    
T  42342896 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268174
Alignment:
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattaga 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcgg-tgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttga 26268234  T
Q  207 ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26268233 ttaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatg 26268174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8467088 - 8466928
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||    
T  8467088 tttgattcatttttaaactgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatc 8466991  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattt 164  Q
    |||   | |||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  8466990 gtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacattt 8466928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 28416364 - 28416466
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  28416364 tttgattcttttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 28416461  T
Q  101 gttgg 105  Q
    |||||    
T  28416462 gttgg 28416466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112392
Alignment:
Q  123 cagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgt 222  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||  | ||||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggtt--tacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgt 5112344  T
Q  223 taatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5112345 taatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccac 5112392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26269166 - 26269069
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  26269166 ttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatccttgg 26269069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43254217 - 43254154
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgct 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43254217 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 270
Target Start/End: Original strand, 28416493 - 28416606
Alignment:
Q  156 gttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactg 255  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| || |  || ||    
T  28416493 gttacactttgtgggg-tgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattg 28416591  T
Q  256 aacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| ||||    
T  28416592 aacttttgattccac 28416606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466840
Alignment:
Q  181 ttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccac 8466840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25669780 - 25669737
Alignment:
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgta 215  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  25669780 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898141
Alignment:
Q  120 aaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttac 178  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtggggatgttac 11898141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8861622 - 8861356
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8861622 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 8861525  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8861524 gttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttg-cggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 8861426  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8861425 attagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccac 8861356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18797664 - 18797402
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18797664 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 18797567  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18797566 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacacttataacaaggtaggataaa 18797468  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| | || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  18797467 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatg 18797402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27284073 - 27283820
Alignment:
Q  9 atttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtat 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27284073 atttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaat 27283976  T
Q  109 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27283975 ctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagatt 27283877  T
Q  209 aaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    || | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283876 aagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgat 27283820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30055863 - 30055602
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30055863 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 30055766  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  30055765 ttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa 30055667  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30055666 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatg 30055602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 25691368 - 25691634
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||  |||||||||    
T  25691368 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatc 25691465  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25691466 gttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtgggg-tgttacacttaaaataaggtaggataaa 25691564  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25691565 attagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccac 25691634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 15612584 - 15612849
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  15612584 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatca 15612681  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15612682 ttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 15612780  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15612781 ttaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccac 15612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 9355650 - 9355912
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9355650 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 9355747  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9355748 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaa 9355846  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  9355847 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatg 9355912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 5657309 - 5657571
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  5657309 attcatttttaaatttttgattactc--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttg 5657406  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5657407 gcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgt-gggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaatta 5657505  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5657506 aattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccac 5657571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31578888 - 31579150
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  31578888 tttgattcatttttaaattattgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 31578985  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31578986 gttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttat-agggtgttatacttataacaaggtaggataaa 31579084  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31579085 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 31579150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32432789 - 32432527
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  32432789 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatc 32432692  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432691 gttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 32432593  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||| | |||||| | |||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  32432592 attatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatg 32432527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 32820877 - 32821142
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32820877 tttgattcatttttaaattgttgattattg--atgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32820974  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32820975 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttat-ggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaa 32821073  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    | || ||||| |||||| |||||||| | || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32821074 actaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgcca 32821142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37110211 - 37109947
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37110211 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37110114  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataagg--taggata 198  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||  |||||||    
T  37110113 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtataggata 37110015  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  37110014 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatg 37109947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11071540 - 11071281
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11071540 tttgattcatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 11071443  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||   |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11071442 gttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaa 11071347  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  11071346 attagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatg 11071281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6546855 - 6546612
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6546855 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcg 6546758  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || || |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6546757 ttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 6546659  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatg 248  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  6546658 ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 6546612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24212079 - 24211813
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24212079 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 24211982  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||  || ||||||||||| || |||||| |||||    
T  24211981 cgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgt-aggatgttacacttagaacaaggtatgataa 24211883  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24211882 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgcca 24211813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 41764907 - 41765168
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  41764907 ttcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttgg 41765004  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  41765005 catctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttct-ggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattag 41765103  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41765104 attaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccac 41765168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37347358 - 37347097
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37347358 tttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 37347261  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |   |||||||||||| || ||| ||||||    
T  37347260 attggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggag--tttacacttaaaacaatgtatgataaa 37347163  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37347162 attagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 37347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21991964 - 21991711
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||      |||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21991964 tttgattcatttttaaattgttgattaatg------atgatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 21991876  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21991875 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 21991777  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  21991776 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 21991711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23111529 - 23111262
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23111529 tttgattcatttttaaattgttgattactg--atttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatc 23111432  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtagg--ata 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| || ||| |  |||    
T  23111431 gttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatata 23111333  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| || |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  23111332 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgcca 23111262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 17842408 - 17842672
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17842408 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 17842505  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataagg--taggata 198  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |||||| |||| || ||||  |||||||    
T  17842506 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgt-gggatgttacgcttataacaaggtataggata 17842604  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||| | |||||| |||||||||    
T  17842605 aaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatg 17842672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22687566 - 22687310
Alignment:
Q  3 tgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22687566 tgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 22687469  T
Q  103 tggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaat 202  Q
    ||| ||| ||||||        |||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687468 tggcatccttaaca--------gagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 22687378  T
Q  203 tagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22687377 tagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccac 22687310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7335130 - 7334869
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7335130 tttgattcatttttaaattattgatttctg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatt 7335033  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7335032 gtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaa 7334935  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  |||| | || || |||||||||| |||||||||||||||    
T  7334934 attagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatg 7334869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 10359038 - 10359300
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  10359038 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatc 10359135  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10359136 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 10359234  T
Q  201 attaga-ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| || |||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  10359235 attagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatg 10359300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 37703326 - 37703549
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37703326 attcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 37703423  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37703424 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgt-gggatgttacacttaaaataagatatgataaaatta 37703522  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||    
T  37703523 gattaagtgtagtcttattaatctgat 37703549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 48928149 - 48928382
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  48928149 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttg 48928248  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||    
T  48928249 atgatattatgcgatagtcttaagcattacactttct-gaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctga 48928347  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48928348 tgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatg 48928382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481680
Alignment:
Q  9 atttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtat 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactg--attaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaat 10481837  T
Q  109 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 208  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  10481836 ctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagatt 10481738  T
Q  209 aaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||  ||||| |||||||| |||| |||| || ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10481737 aagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatg 10481680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44599002 - 44598737
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgt-gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  44599002 ttgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatc 44598906  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44598905 gttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 44598807  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  44598806 attagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgccac 44598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165823
Alignment:
Q  7 tcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||      
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtc 12165977  T
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattaga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12165976 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaga 12165887  T
Q  207 ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||    ||||| |||||||||||||||    
T  12165886 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccac 12165823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 15672587 - 15672830
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatt---ttatcg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  15672587 attcatttttaaattgttgattattg--atgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcg 15672684  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15672685 ttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 15672783  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatg 248  Q
    ||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| || ||||||||    
T  15672784 ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258620
Alignment:
Q  69 caacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtg 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||     
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt- 38258718  T
Q  169 ggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  38258717 ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatg 38258620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29173859 - 29173615
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29173859 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 29173762  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |                  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29173761 gttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------------gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaa 29173681  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29173680 attagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 29173615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4583252 - 4582994
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||| |||||||    
T  4583252 attcatttttaaattgttgatgactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttg 4583155  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4583154 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaatta 4583056  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  4583055 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatg 4582994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688352
Alignment:
Q  34 ttaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctg 133  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  134 atattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataa 233  Q
    |||| || |||||||||| |  |||||| ||| | || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttat-ggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T
Q  234 attaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| || |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33688316 attgatgatactatagagactgaacttttgatgccac 33688352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 31520565 - 31520809
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31520565 tttgattcatttttaaattgttaattacgg--attaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 31520662  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |                  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31520663 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 31520744  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | || |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  31520745 attagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatg 31520809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43686322 - 43686112
Alignment:
Q  58 agtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  43686322 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 43686223  T
Q  158 tacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaa 257  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||  | |||||||  ||||||||    
T  43686222 tacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaa 43686124  T
Q  258 cttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||||    
T  43686123 cttttgatgcca 43686112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 26587916 - 26588119
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26587916 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 26588013  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||        |||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26588014 gttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 26588104  T
Q  201 attagattaaatgta 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  26588105 attagattaagtgta 26588119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35353442 - 35353256
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  35353442 gattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgtt 35353345  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggta 193  Q
    |  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  35353344 gacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttct-ggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 46480961 - 46481180
Alignment:
Q  9 atttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  46480961 atttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacat 46481058  T
Q  109 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | | | |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||     
T  46481059 ctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttat-gagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatc 46481157  T
Q  209 aaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    || | |||| |||||||| ||||    
T  46481158 aagtatagtcttgttaatctgat 46481180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26980642 - 26980394
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  26980642 ttgattcatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcg 26980545  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |                  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26980544 ttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 26980463  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26980462 ttagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccac 26980394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43925432 - 43925177
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| |||||||||    
T  43925432 tttgattcatttttaaattgttgatta--gtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg------acgtattattttatc 43925341  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||  ||| |  |||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  43925340 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgt-gaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaa 43925242  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | |||| | || || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  43925241 attagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatg 43925177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Original strand, 44411368 - 44411509
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  44411368 attcatttttaaattgttgattactg--attaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttg 44411465  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagt 148  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44411466 gcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928649
Alignment:
Q  88 gtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaat 187  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttct-gaggtgttacacttaaaat 48928571  T
Q  188 aaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    || |||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48928572 aatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatg 48928649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704241
Alignment:
Q  110 tttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaatta 37704289  T
Q  210 aatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaa 257  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  37704288 agtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa 37704241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 12390478 - 12390716
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  12390478 ttcatttttaaattgtcaattactg--attaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgg 12390575  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||| |                  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12390576 catctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaa------------------gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattag 12390655  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12390656 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatg 12390716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37704519 - 37704387
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37704519 tttgattcatttgtaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37704422  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgat 135  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37704421 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 266
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421465
Alignment:
Q  112 taacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtggga-tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaag 27421411  T
Q  212 tgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| | |||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27421412 tgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatg 27421465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593278
Alignment:
Q  11 ttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatct 110  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctg--attaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatct 32593137  T
Q  111 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |                  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32593138 ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaa 32593219  T
Q  211 atgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  32593220 atgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccac 32593278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 34362002 - 34362138
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34362002 tttgattcatttttaaattgttaatgactg--attaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 34362099  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaac--agagttgctgatat 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34362100 gttgatatttttaacatgcaaacagagagttgctgatat 34362138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38053741 - 38053640
Alignment:
Q  60 taatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgtta 159  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  38053741 taatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtta 38053642  T
Q  160 ca 161  Q
    ||    
T  38053641 ca 38053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 265
Target Start/End: Original strand, 44413356 - 44413464
Alignment:
Q  156 gttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactg 255  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||| |  ||||||||  ||| |    
T  44413356 gttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccg 44413454  T
Q  256 aacttttgat 265  Q
    ||||||||||    
T  44413455 aacttttgat 44413464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Original strand, 26524366 - 26524417
Alignment:
Q  219 ttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26524366 ttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccac 26524417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 38258916 - 38258867
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatt 52  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38258916 tttgattcatttttaaattgttgattac--tgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053588
Alignment:
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgat 38053588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  33 attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatttt 97  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 27227307 - 27227569
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27227307 attcatttttaaatggttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttg 27227404  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27227405 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 27227503  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227504 gattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 27227569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2960106 - 2959844
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2960106 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 2960009  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2960008 gttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgt-gggatgttacacttgaaacaaggtaggataaa 2959910  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  2959909 attagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatg 2959844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4330639 - 4330373
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  4330639 tttgattcatttttatattgttgattactg--attaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatc 4330542  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4330541 tttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 4330443  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4330442 attagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccac 4330373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16416004 - 16415738
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16416004 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 16415907  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16415906 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgt-ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 16415808  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | || |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16415807 attagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccac 16415738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37451643 - 37451382
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37451643 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37451546  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | | ||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  37451545 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt-ttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaa 37451447  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  37451446 attagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatg 37451382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28770011 - 28769745
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28770011 tttgattcatttttaaattgttgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 28769914  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||    
T  28769913 gttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaa 28769814  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28769813 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgcca 28769745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8222480 - 8222221
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8222480 ttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgg 8222384  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||    
T  8222383 aatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgag 8222285  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8222284 attaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgcca 8222221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32216413 - 32216148
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  32216413 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 32216316  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32216315 gttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 32216217  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32216216 atttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgcca 32216148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51129216 - 51128955
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51129216 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 51129119  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  51129118 ttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtatgataaaa 51129020  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  51129019 ttatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatg 51128955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38823572 - 38823310
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  38823572 tttgtttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatc 38823475  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38823474 gttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-tgggtgttacacttaaaataaagtaggataaa 38823376  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38823375 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatg 38823310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15383286 - 15383029
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383286 ttcatttttaaattgttgattgctg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 15383189  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  15383188 aatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattag 15383090  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||| || ||||||||||||||||    
T  15383089 attaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatg 15383029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25160985 - 25160725
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25160985 ttcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgg 25160888  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  25160887 aatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgag 25160789  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||| |||||| || ||||| | || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25160788 attaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 25160725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 27532800 - 27533064
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27532800 tttgattcatttttaatt-gttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 27532896  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27532897 gttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 27532995  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| |||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27532996 att-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccac 27533064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 267
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327033
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactg--attgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttgg 30326872  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||    
T  30326873 aatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgag 30326971  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30326972 attaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgc 30327033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 47682316 - 47682578
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47682316 attcttttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 47682413  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  47682414 acatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaatta 47682512  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47682513 gtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccac 47682578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23999706 - 23999443
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23999706 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 23999609  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||  |||| || |||||| |||||    
T  23999608 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttatgcttagaacaaggtatgataa 23999510  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23999509 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatg 23999443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 9902872 - 9903134
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9902872 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatc 9902969  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  9902970 gttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaa 9903068  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  9903069 attagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatg 9903134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 47279547 - 47279281
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  47279547 tttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 47279450  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47279449 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttat-gggatgttacaattaaaacaaggtaggataaa 47279351  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47279350 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccac 47279281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 7078882 - 7079143
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  7078882 ttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcg 7078979  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7078980 ttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 7079078  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7079079 ttagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatg 7079143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 10181825 - 10182092
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttaca-ggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  10181825 tttgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtat 10181922  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
     ||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10181923 tgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataa 10182021  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10182022 aattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccac 10182092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15168451 - 15168188
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15168451 gattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgtt 15168354  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15168353 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttct-gaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 15168255  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15168254 agattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccac 15168188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 238331 - 238593
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  238331 tttgattcatttttaaattgtggattactg--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatc 238428  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  238429 gttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaa 238527  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | |||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  238528 attagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatg 238593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19899586 - 19899852
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19899586 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 19899683  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| |||| || || ||| |||||    
T  19899684 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttagaacaatgtatgataa 19899782  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19899783 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgcca 19899852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 34012200 - 34012461
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||    
T  34012200 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatc 34012297  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34012298 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggttggataaa 34012391  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34012392 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccac 34012461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15752383 - 15752122
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  15752383 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttg 15752286  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
    | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15752285 gaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatgggg-tgttacgcttaaaacaaggtaggataaaatta 15752187  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752186 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 15752122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27763128 - 27763391
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  27763128 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttat 27763225  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  27763226 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt-agggtgttacgcttagaactaggtatgataa 27763324  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27763325 aattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatg 27763391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10923085 - 10922823
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||     
T  10923085 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttatt 10922988  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| | |||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  10922987 gtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgt-gaggtgttacccttataacaaggtatgataaa 10922889  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| |||| | || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  10922888 ataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatg 10922823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30254781 - 30254519
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  30254781 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 30254684  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||| ||| |  ||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  30254683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttat-agggtgttatgcttataacaaggtaggataaa 30254585  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30254584 attagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatg 30254519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32267392 - 32267130
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  32267392 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttata 32267295  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  32267294 gttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgt-ggagtgttacgcttataacaaggtaggataaa 32267196  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| ||||   || || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  32267195 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatg 32267130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 28564601 - 28564861
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  28564601 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 28564698  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||| |||   |||||||||  |||| || |||| | ||||||    
T  28564699 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacacttt-acggggtgttatgcttataacaaggcatgataaa 28564795  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28564796 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 28564861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39393738 - 39393475
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39393738 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattg 39393641  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaatt 203  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| || |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39393640 gcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgt-aggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaatt 39393542  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| || |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39393541 agatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccac 39393475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3535281 - 3535028
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3535281 tttgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 3535184  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3535183 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------taagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaa 3535094  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  3535093 attagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatg 3535028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Original strand, 27267022 - 27267283
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  27267022 attcatttttaaattattgattattg--attaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 27267119  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  27267120 acatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgt-ggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaatta 27267217  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27267218 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccac 27267283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422747
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 18422783  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18422782 tgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatg 18422747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3309511 - 3309239
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3309511 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatc 3309414  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtg----ggggtgttacacttaaaataaggtagga 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| || |||    | ||||||||| |||||| || |||||     
T  3309413 gttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggt 3309314  T
Q  197 t-aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  3309313 taaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccac 3309239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27563723 - 27563985
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  27563723 tttgattcttttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatc 27563820  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||| |  ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  27563821 gtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgt-ggggtattatacttaaaacaaggtaggataaa 27563919  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||  | |||||||||||||||    
T  27563920 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatg 27563985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42721394 - 42721135
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  42721394 tttgattcatttttaaattattgattactc--attaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatc 42721297  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  42721296 gttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtgggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaa 42721201  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  42721200 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatg 42721135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14758387 - 14758133
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14758387 gattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 14758290  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||         | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14758289 ggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt---------aatttct-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 14758200  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||| || ||| |||||||| | || |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14758199 agattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccac 14758133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46931768 - 46931505
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46931768 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 46931671  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| ||   || |||||| |||||    
T  46931670 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgct--gaacaaggtatgataa 46931574  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcc 268  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  46931573 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgcc 46931505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1547629 - 1547379
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1547629 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 1547532  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||||||||||        |||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1547531 gttggtatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 1547441  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||        || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1547440 attagattaagtgtatttttgttaatctg--------atgatactatgagaactgaacttttgatgccac 1547379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22171069 - 22170807
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||||||    
T  22171069 tttgatttatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatc 22170972  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  22170971 gttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaa 22170873  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| | || |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22170872 attagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725684
Alignment:
Q  57 tagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcg 156  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  157 ttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactga 256  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  33725572 ttacactttctgggg-tgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactga 33725670  T
Q  257 acttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||    
T  33725671 acttttgatgccac 33725684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40885141 - 40884905
Alignment:
Q  33 attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgct 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  40885141 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgat 40885042  T
Q  133 gatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgata 232  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | ||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || | | |||||||| ||||     
T  40885041 gatattatgcgatagtcttaagtgttacacttt-tcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatg 40884943  T
Q  233 aattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40884942 aattgaagatactatagggactgaacttttgatgccac 40884905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41926514 - 41926255
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  41926514 tttgattcaattttaaatcattgattatta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttatt 41926418  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||      || |||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41926417 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------agtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaa 41926325  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  41926324 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccac 41926255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48353900 - 48353735
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  48353900 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 48353803  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgg 169  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  48353802 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 11742186 - 11742334
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11742186 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 11742283  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtctt 151  Q
    ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11742284 gttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtctt 11742334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 1359753 - 1359919
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  1359753 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatc 1359850  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgg 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||    
T  1359851 gttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 31621395 - 31621637
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatct-----ttaacatgcaaacag 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||     
T  31621395 tgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacat 31621494  T
Q  126 agttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaa 225  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || || ||| ||    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31621495 agttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacactt--ctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaa 31621592  T
Q  226 tatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31621593 tctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccac 31621637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759659
Alignment:
Q  48 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  148 tcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaatt 38759659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618974
Alignment:
Q  11 ttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatct 110  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattg--attaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatct 37618826  T
Q  111 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||         || |||||| ||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37618827 ttaacatgcaaacagagttgatgatattatatg---------agtgttacactttat-gggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaa 37618916  T
Q  211 atgtagttttgttaatatgataaattaat--aatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
     |||||| |||||||| |||| |||| ||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  37618917 gtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatg 37618974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21289958 - 21289817
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||    
T  21289958 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatc 21289861  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21289860 gttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620733
Alignment:
Q  83 tacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacactt 182  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggg-tgttacactt 48620817  T
Q  183 aaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  48620816 aaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatg 48620733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31962975 - 31962853
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaa-tcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||||    
T  31962975 tttgatttatttttaaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttat 31962878  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaaca 124  Q
    ||||| | |||||||||||||||||    
T  31962877 cgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 11742338 - 11742430
Alignment:
Q  173 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  11742338 tgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatg 11742430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 42505899 - 42506160
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42505899 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 42505996  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  42505997 ttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa 42506095  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42506096 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 42506160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 46297585 - 46297850
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  46297585 tttgattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatc 46297682  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46297683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 46297781  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
     || |||||| ||||||||||||||| | || |||| || |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  46297782 gtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgcca 46297850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 26941084 - 26941345
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26941084 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 26941181  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||| | | ||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  26941182 ttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttat-gaggtattacgcttataacaaggtaggataaaa 26941280  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26941281 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatg 26941345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 53228975 - 53229238
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  53228975 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatc 53229072  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53229073 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggagttacacttaaaataaggtaggataaa 53229171  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53229172 attagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgc 53229238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 52040745 - 52041011
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52040745 tttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 52040842  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  52040843 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgt-ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaa 52040941  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52040942 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccac 52041011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44891849 - 44891584
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  44891849 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcg 44891752  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44891751 ttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 44891653  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44891652 ttagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgccac 44891584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 11357204 - 11357450
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11357204 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 11357301  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |                  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357302 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa------------------gtgttacacttaaaataaggtaggataaa 11357383  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11357384 attagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgc 11357450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39283005 - 39282739
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  39283005 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttatt 39282908  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39282907 gttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 39282809  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39282808 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccac 39282739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37158061 - 37157794
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37158061 tttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatc 37157964  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacag-agttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
     |||| ||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37157963 attggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttgaaataaggtaggataa 37157865  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37157864 aattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccac 37157794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4015812 - 4015551
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  4015812 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttacc 4015715  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4015714 gttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 4015617  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| ||| | || | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4015616 attagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 4015551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 33378608 - 33378870
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  33378608 tttgattcatttttaaatcgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 33378705  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33378706 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattaca-cttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33378804  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33378805 attagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatg 33378870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1090046 - 1089809
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1090046 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatc 1089950  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1089949 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 1089850  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataa 241  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  1089849 attagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgataa 1089809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3362608 - 3362340
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||    
T  3362608 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatc 3362511  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3362510 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaa 3362412  T
Q  201 attagatta--aatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3362411 attagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccac 3362340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 24707938 - 24708202
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24707938 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatc 24708035  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24708036 gttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 24708134  T
Q  201 attagattaaa--tgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24708135 attagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatg 24708202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22622541 - 22622773
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22622541 tttgattcatttttaaatagttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 22622638  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  22622639 gttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaa 22622737  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  22622738 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 22622773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33698504 - 33698265
Alignment:
Q  3 tgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33698504 tgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgt 33698407  T
Q  103 tggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33698406 tggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 33698308  T
Q  203 tagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatact 245  Q
    |||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||    
T  33698307 tagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133026
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccg--attcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 34133191  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34133190 gttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 34133092  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||| | || ||| | |||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  34133091 attatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatg 34133026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 7327306 - 7327567
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  7327306 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcg 7327403  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  7327404 ttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaa 7327502  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
     || ||||| |||| | ||||||||  ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7327503 ataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 7327567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25580087 - 25579830
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  25580087 ttcatttttaaattgttgattgcgg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttgg 25579990  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattag 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25579989 catctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattag 25579891  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  25579890 attaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatg 25579830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48355294 - 48355029
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  48355294 tttgattcatttttaaattgttgcttactg--attaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 48355197  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  48355196 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggtatgttacatttataacaaggtaggataaa 48355098  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| |||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48355097 attagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgcca 48355029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994746
Alignment:
Q  7 tcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggt 106  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||     
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcgga 46994587  T
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattaga 206  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46994588 atctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-ggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattaga 46994686  T
Q  207 ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||||| ||||||||   || | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46994687 ttaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37203421 - 37203154
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  37203421 tttgattcatttttaaattgttgattactc--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatc 37203324  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacag-agttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
     |||  ||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37203323 attgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgatacactaaaaataaggtaggataa 37203225  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203224 aattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 37203154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2008292 - 2008020
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactg-----tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatt 95  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2008292 tttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactatt 2008193  T
Q  96 ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtagg 195  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||    
T  2008192 ttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggagtg-tacacttaaaacgaggtagg 2008095  T
Q  196 ataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||| |||| |||| || || ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2008094 ataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccac 2008020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 4761471 - 4761734
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  4761471 tttgattcattttcaaattgttgatttctg--attaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttatt 4761568  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4761569 gtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaa 4761668  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4761669 attagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 4761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 40552082 - 40552344
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  40552082 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatc 40552179  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||  |||| ||| |||||| |||| || ||| || ||||||    
T  40552180 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgt-gggatgttacgcttataacaagctaagataaa 40552278  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40552279 attaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatg 40552344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591786
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatc 38591954  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  38591953 gttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgt-ggggtattacacttgaaacaagataggataaa 38591855  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  38591854 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgcca 38591786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373557
Alignment:
Q  11 ttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatct 110  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatct 32373716  T
Q  111 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32373715 ttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgt-gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 32373617  T
Q  211 atgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
     |||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||  ||   ||||||||||||||||    
T  32373616 gtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccac 32373557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 54828552 - 54828786
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  54828552 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttg 54828651  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  54828652 atgatattatttgatagttttaagtgttacactttgt-gggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatga 54828750  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    | |||| || || |||||| || |||| ||||||||    
T  54828751 tgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatg 54828786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 44186340 - 44186586
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  44186340 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatc 44186437  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||                |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44186438 attggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag----------------ttgt-ggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaa 44186520  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  44186521 attagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 44186586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21193960 - 21193697
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  21193960 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatc 21193863  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtc-ttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||   ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21193862 gtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttat-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataa 21193764  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  21193763 aattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatg 21193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22451318 - 22451055
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  22451318 gattcatttttaaatttttgattgctg--attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtt 22451221  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| || |  |||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  22451220 gacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttact-ggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaatt 22451122  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22451121 agattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccac 22451055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47481876 - 47481613
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  47481876 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttat 47481779  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||  |||| |||||||||  ||||    
T  47481778 cgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttatgcttagaataaggtataataa 47481680  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  47481679 aattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatg 47481613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29099699 - 29099446
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29099699 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 29099602  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |         |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29099601 gttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa---------gttacactttgt-ggggtgttacacttaaaataaggcacgataaa 29099512  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||| ||||    
T  29099511 attaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatg 29099446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655287
Alignment:
Q  9 atttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatt--tatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| |||     
T  3655031 atttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatgga 3655128  T
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattaga 206  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  3655129 atctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgt-ggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattaga 3655227  T
Q  207 ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3655228 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 3655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 22445888 - 22446154
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22445888 tttgattcatatttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatc 22445985  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |  ||||  | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22445986 gttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt--gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaa 22446083  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatga-ggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||| |||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22446084 attagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccac 22446154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 21009624 - 21009887
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21009624 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttat 21009721  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  | ||||||  |||| || ||| || |||||    
T  21009722 cgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaagttatgataa 21009820  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21009821 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatg 21009887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174595
Alignment:
Q  41 tcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  141 gtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaat 239  Q
     | |||||||| || |||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||| ||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat 45174623  T
Q  240 aatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45174622 gatactatggggactgaacttttgatgc 45174595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11467142 - 11466911
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11467142 tgattaatgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttg 11467050  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  11467049 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 11466951  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11466950 tgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccac 11466911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29164134 - 29163912
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29164134 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttg 29164035  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
    ||||||| |||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||    
T  29164034 ctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctga 29163945  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttg 263  Q
    | |||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  29163944 tgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36012492 - 36012244
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  36012492 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatc 36012395  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaac-agagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-a 198  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  36012394 gttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgt-gggatgttacactgaaaacaaggtaggataa 36012296  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgag 250  Q
    |||||||||||  |||| | ||||| || |||| |||| || ||| ||||||    
T  36012295 aaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 24488785 - 24489047
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||     
T  24488785 tttgattcatttttaaattattgattattg--attcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttatt 24488882  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  24488883 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgt-gaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaa 24488981  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  24488982 attagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatg 24489047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 14586503 - 14586754
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  14586503 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac-cgtactattttatc 14586599  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14586600 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 14586689  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
     ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | ||||  ||||||||||    
T  14586690 gttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgat 14586754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54506161 - 54505899
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||    
T  54506161 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttat 54506064  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  | ||||||  |||| || |||||| |||||    
T  54506063 cgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaaggtatgataa 54505965  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||   |||  ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  54505964 aattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatg 54505899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 43975718 - 43975973
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43975718 gattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgtt 43975815  T
Q  104 ggtatctttaacatgca---aacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || |||||||||||| |   |||| ||||| |||||||||| ||||||       |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  43975816 ggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt-------gttacactttct-ggggtgttacacttaaaacaagataagataaa 43975907  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| | |||||||||||    
T  43975908 attagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatg 43975973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43348556 - 43348345
Alignment:
Q  57 tagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcg 156  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  43348556 tagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtg 43348457  T
Q  157 ttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactga 256  Q
    | ||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||  | ||||||    
T  43348456 tcacactttat-gggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactga 43348359  T
Q  257 acttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||    
T  43348358 acttttgatgccac 43348345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40936325 - 40936168
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  40936325 ttgatttatttttaaattgttgattaccg--attaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcg 40936228  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttaca 161  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  40936227 ttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttaca 40936168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Original strand, 51212599 - 51212738
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  51212599 ttcatttttaaattgttgatt--tttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcgg 51212696  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 147  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51212697 aatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835702
Alignment:
Q  41 tcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattat 140  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||   |||      ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  141 gtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa-attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaat 239  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgtaggt-tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgat 11835686  T
Q  240 aatactatgaggactg 255  Q
     |||||||| ||||||    
T  11835687 gatactatggggactg 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 27480184 - 27480464
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaa----catcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27480184 gattcatttttaaattgttgatcgctg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttat 27480281  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacaga----gttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgg------------gggtgttacactta 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||   ||            ||||||||||||||    
T  27480282 cgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacactta 27480381  T
Q  184 aaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27480382 aaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatg 27480464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 50475171 - 50475021
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactg-----tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatt 95  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  50475171 tttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattatt 50475072  T
Q  96 ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgata 146  Q
    ||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50475071 ttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53176286 - 53176145
Alignment:
Q  124 agagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgtt 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  53176286 agagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggag-tgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgtt 53176188  T
Q  224 aatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  53176187 aatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 53176145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 11356984 - 11357140
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  11356984 gattcatttttaaattgttgattacta--attaatgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcatt 11357073  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtggg 170  Q
    || || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  11357074 ggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 200
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373263
Alignment:
Q  72 catcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggg 171  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||| | |||    
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttat-ggg 20373234  T
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     | |||| |||| || |||||||||||||    
T  20373235 atattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844417
Alignment:
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttag 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtaggg-tgttacacttaaaactaggtaggataaaaattag 35844478  T
Q  206 attaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  35844477 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatg 35844417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 151
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  43 aatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgt 142  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  143 gatagtctt 151  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Original strand, 51212957 - 51213069
Alignment:
Q  156 gttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactg 255  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||||||||     
T  51212957 gttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactc 51213055  T
Q  256 aacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||||||    
T  51213056 aacttttgatgcca 51213069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 266
Target Start/End: Original strand, 20373303 - 20373381
Alignment:
Q  188 aaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  20373303 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatg 20373381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40936175 - 40936082
Alignment:
Q  172 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40936175 gtgttacacttaaaaaaagtt-ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatg 40936082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 20373086 - 20373135
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatt 52  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20373086 tttgattcatttttaaattgttgattac--tgattaatgatcaatagtaatt 20373135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41961202 - 41960940
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41961202 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 41961105  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41961104 gttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaa 41961006  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41961005 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 2325219 - 2325476
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325219 tttgatttatttttaaattgttgattactg--attaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 2325316  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2325317 gttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaa 2325415  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||        || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325416 attagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 2325476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4763993 - 4763731
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4763993 tttgattcatttttaaattattgattactg--attaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatc 4763896  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4763895 gttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaa 4763797  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  4763796 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatg 4763731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 33709073 - 33709335
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33709073 tttgattcatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatc 33709170  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33709171 attgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt-agggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33709269  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||| |||  | || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  33709270 attagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatg 33709335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Original strand, 31570576 - 31570837
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  31570576 ttgattcatttttaaatatttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcg 31570673  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31570674 ttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgt-ggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa 31570772  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  31570773 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatg 31570837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 11366221 - 11366484
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11366221 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 11366318  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||   ||| || ||| || |||||    
T  11366319 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttatgtttagaacaagatatgataa 11366417  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11366418 aattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatg 11366484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26357939 - 26357677
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  26357939 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatc 26357842  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26357841 gttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgt-gggatgttacacttgaaacaaggtaggataaa 26357743  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||||||||    
T  26357742 attagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatg 26357677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 43648086 - 43648348
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  43648086 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatc 43648183  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| | ||||| | ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  43648184 gttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgt-gtggtgttacacttataacaaggtatgataaa 43648282  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43648283 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatg 43648348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4167280 - 4167019
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||    
T  4167280 attcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttg 4167183  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4167182 acatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 4167084  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4167083 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgcca 4167019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44914029 - 44913781
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttat---ctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatttt 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44914029 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 44913932  T
Q  98 atcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  44913931 atcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgat 44913832  T
Q  198 aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatg 248  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| || ||||||||    
T  44913831 aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 44913781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264180
Alignment:
Q  10 tttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatc 109  Q
    ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactg--atcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatc 4264023  T
Q  110 tttaacatgcaaacagagttgctgatattatg-tgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4264024 tttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 4264122  T
Q  209 aaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    || |||| | || |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4264123 aagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatg 4264180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37906067 - 37905808
Alignment:
Q  6 ttcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgg 105  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||    
T  37906067 ttcatttttaaattgttaattactg--attaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattgg 37905970  T
Q  106 tatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgt-gggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  37905969 aatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatta 37905870  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37905869 gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 37905808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 29241986 - 29242245
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |       |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29241986 tttgattcatttttaaattgttgattgctg--attaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttggacttacaggtactattgtatc 29242076  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29242077 gttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 29242175  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29242176 attagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccac 29242245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 18494122 - 18494383
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18494122 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 18494219  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || || ||  |||||| ||   |||||||||| | |||||||||||||    
T  18494220 gttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgagg--tttacacttaatacaaggtaggataaa 18494317  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||| || |||| | | || ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18494318 attagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 18494383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44286045
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatga 230  Q
     |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  231 taaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44286084 tgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccac 44286045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3177301 - 3177039
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  3177301 tttgatttattttcaaattgttgattactt--attcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttata 3177204  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3177203 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaa 3177105  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | || ||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3177104 attagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 3177039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478465
Alignment:
Q  11 ttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatct 110  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatct 4478620  T
Q  111 ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagatta 209  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| |||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4478619 ttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatta 4478526  T
Q  210 aatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    | |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4478525 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccac 4478465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350041
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatc 27349886  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||         || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27349887 gttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggttggataaa 27349976  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  27349977 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatg 27350041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 33660218 - 33660475
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  33660218 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatc 33660315  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||          | |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33660316 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg---------ggtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 33660405  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||| | || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33660406 attagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccac 33660475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 33550824 - 33551089
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactg--tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactatttta 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  33550824 tttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactatttta 33550923  T
Q  99 tcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggata 198  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  33550924 tcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttaaaacaacgtaggata 33551021  T
Q  199 aaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33551022 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatg 33551089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071840
Alignment:
Q  71 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtggg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gg 17071744  T
Q  171 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||  || ||||||||||||    
T  17071745 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatg 17071840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 19289168 - 19289426
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |    
T  19289168 attcatttttaaattgttaatttctg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcg 19289265  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  19289266 gaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gggatgttacatttataacaatgtaggataaaatta 19289364  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||| | || || ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  19289365 gattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatg 19289426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 19424484 - 19424735
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||           
T  19424484 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat------- 19424574  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19424575 -------ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaagataaaa 19424666  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||||||  ||| | |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19424667 ttagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccac 19424735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35959254 - 35959027
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  35959254 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga----catgtactattttatc 35959161  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||    
T  35959160 gttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aa 35959063  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaatt 236  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  35959062 attatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaatt 35959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13711820 - 13711564
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13711820 ttgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcg 13711723  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |   ||| | ||| | ||||||||||||||||||      | |||||||    
T  13711722 ctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttat-ggggtgttacacttaaaa-----catgataaaa 13711629  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  13711628 ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatg 13711564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31862214 - 31861953
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  31862214 tttgattcatttttaaatcgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttatt 31862117  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    || || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || || |||||| ||||| |||||||||| |||| || || ||| | ||||    
T  31862116 gtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaa 31862018  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||| | ||||||| |||||||    
T  31862017 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642086
Alignment:
Q  60 taatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgtta 159  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  160 cattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat--aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaa 257  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||    
T  36642193 cactttgt-agggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaa 36642095  T
Q  258 cttttgatg 266  Q
    |||||||||    
T  36642094 cttttgatg 36642086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 7006779 - 7007025
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7006779 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 7006876  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |                  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7006877 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaa------------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaa 7006958  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgc 267  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  7006959 attagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgc 7007025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41465860 - 41465602
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41465860 gattcaattttaaattgttgattgctg--attaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 41465763  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41465762 ggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttct-gaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaatt 41465664  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    ||||||| |  ||| |||| ||| | || |||| || ||| |||  ||||||||||||||||    
T  41465663 agattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgat 41465602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327820
Alignment:
Q  60 taatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgtta 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||  | ||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  160 cattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaact 259  Q
    || ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||    
T  45327925 cactttctgagg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaact 45327827  T
Q  260 tttgatg 266  Q
    |||||||    
T  45327826 tttgatg 45327820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19314181 - 19313952
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggattt---acaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagag 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||    
T  19314181 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatag 19314082  T
Q  128 ttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaata 227  Q
    |||||||||| ||||||||||       |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||     
T  19314081 ttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatc 19313990  T
Q  228 tgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19313989 tgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatg 19313952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 19500756 - 19500923
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19500756 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatc 19500853  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtggg 170  Q
    |||   |||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19500854 gttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 43770689 - 43770946
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||     
T  43770689 tttgattcatttttaaattgttgatttcta--attaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttatt 43770786  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43770787 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-gaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaa 43770876  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||| ||||| | || | |||||||| |||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  43770877 attaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccac 43770946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054199
Alignment:
Q  71 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtggg 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgt-gg 17054103  T
Q  171 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||| || ||| |||||  || | ||||||||||    
T  17054104 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatg 17054199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 39167214 - 39167466
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39167214 attcatttttaaattgttgattactg--attcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttg 39167311  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||       |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  39167312 acatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgt-gggatgttacacttaaaacaaggtataataaaatta 39167404  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    || ||| |||| | |||||| | | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39167405 gaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 39167466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5881891 - 5881639
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||     
T  5881891 tttgattcatttttaaattgttgattactg--aataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatt 5881794  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||         || |||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  5881793 gttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-gaggtattacacttaaaacaaggtatgat-aa 5881705  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  5881704 attagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatg 5881639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 270
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463957
Alignment:
Q  91 ctattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataag 190  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||     
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgagg-tgttacaattaaaacaaa 41463877  T
Q  191 gtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41463878 gtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccac 41463957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258334
Alignment:
Q  89 tactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaata 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||| |    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttat-ggggtgttacacttaaaaaa 18258312  T
Q  189 aggtaggataaaattagattaa 210  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18258313 atgtaggataaaattagattaa 18258334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902166
Alignment:
Q  112 taacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaa 211  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtgggg-tgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaa 33902221  T
Q  212 tgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    | |||| |||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33902220 tatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatg 33902166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 41051141 - 41051260
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41051141 tttgattcatttttgaattgttgattattg--attaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatc 41051238  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaac 123  Q
     |||| || ||||||||||||||    
T  41051239 cttggcat-tttaacatgcaaac 41051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 41463432 - 41463520
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtact 92  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| |||||||    
T  41463432 ttgattcatttttaaattattaattattg--attaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagacttagaggtact 41463520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 18257383 - 18257453
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctt 77  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257383 attcattttaaaattgtcgattactg--attaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051312
Alignment:
Q  221 gttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 41051312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 19501768 - 19501839
Alignment:
Q  191 gtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttg 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||||   |||||||||||||    
T  19501768 gtagaataaaattagattaaatgtag-tttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8248 - 7987
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8248 ttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcg 8151  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||| ||||||||||    
T  8150 ttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaa 8052  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8051 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatg 7987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 408252 - 408512
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  408252 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 408349  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||| || ||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  408350 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgt-gaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 408448  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgat 265  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  408449 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgat 408512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 490 - 231
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||    
T  490 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtactattttatc 399  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  398 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggg-tgttacacttaaaataagataggataaa 300  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  299 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 93924 - 94044
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  93924 tttgattcatttt-aaattgttgatta--gtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 94020  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaaca 124  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  94021 gttgacatctttaacatgcaaaca 94044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 270
Target Start/End: Original strand, 94335 - 94472
Alignment:
Q  132 tgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgat 231  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||    
T  94335 tgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcat 94433  T
Q  232 aaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
     |||| || ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  94434 gaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccac 94472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 6091004 - 6091267
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6091004 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 6091101  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtc-ttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6091102 gtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgt-tgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataa 6091200  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  6091201 aattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatg 6091267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 266
Target Start/End: Original strand, 7234857 - 7235118
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactgt-gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 102  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7234857 gatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 7234956  T
Q  103 tggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaat 202  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7234957 tggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttct-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 7235055  T
Q  203 tagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7235056 tagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga-gactgaacttttgatg 7235118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3879761 - 3880023
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3879761 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 3879858  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3879859 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-ggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaa 3879957  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||||| ||| | || | |||||| | |||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  3879958 attagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatg 3880023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1946197 - 1945934
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1946197 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttat 1946100  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  1946099 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttacgcttagaacaaggtatgataa 1946001  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1946000 aattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatg 1945934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5627754 - 5627491
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5627754 tttgattcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 5627657  T
Q  100 cgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||  |||| || |||||| |||||    
T  5627656 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgt-agggtgttatgcttagaacaaggtatgataa 5627558  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5627557 aattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatg 5627491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20768440 - 20768180
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20768440 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttg 20768343  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||  |||| || |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20768342 acatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttat-gggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaatta 20768244  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||  ||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768243 gattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccac 20768180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29182522 - 29182263
Alignment:
Q  2 ttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29182522 ttgattcatttttaaattgttgattgttg--attaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcg 29182428  T
Q  102 ttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 201  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29182427 ttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaa 29182328  T
Q  202 ttagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||| |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  29182327 ttagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatg 29182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21016940 - 21017199
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||    
T  21016940 tttgattcatttataaattgttgattactg--attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac------gtactattttatc 21017031  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21017032 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaataacgtaggataaa 21017130  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
    |||||||||| | || | |||||| | |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21017131 attagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 21017199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 4318644 - 4318907
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||    
T  4318644 tttgatttatttttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatc 4318741  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aa 199  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4318742 gttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttat-agggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 4318840  T
Q  200 aattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| | || |||| || |||||||| ||  |||||||||||||    
T  4318841 aattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatg 4318907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 33892834 - 33893082
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  33892834 tttgattcatttttaaattgttgattattg--attaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 33892931  T
Q  101 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||         || |||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  33892932 gttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgt-ggggtgttatacataaaacaaggtaggataaa 33893021  T
Q  201 attagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaactttt 262  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||||||    
T  33893022 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaactttt 33893082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8513562 - 8513333
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8513562 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 8513463  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtagttttgttaatatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||  |||||      |||||| |||||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  8513462 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatg 8513370  T
Q  230 ataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    || |||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  8513369 atgaattgatgatattatggggactgaacttttgatg 8513333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33619192 - 33618930
Alignment:
Q  4 gattcatttttaaatcgttgattactg-tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33619192 gattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgt 33619093  T
Q  103 tggtatct-----ttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat 197  Q
    ||| ||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| || || ||| ||     ||||||||||||        ||||||||    
T  33619092 tggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacactt--ctagggtgttacact--------ggtaggat 33619003  T
Q  198 aaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33619002 aaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccac 33618930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491711
Alignment:
Q  96 ttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtagg 195  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtgggg-tgttacacttaaaataaggtagg 15491786  T
Q  196 ataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15491785 ataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccac 15491711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6089237 - 6089004
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6089237 tgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 6089138  T
Q  131 ctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggat-aaaattagattaaatgtagttttgttaatatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| |  ||||  | |||      |||||| |||||||||| |||||||||| ||   || | |||||||| ||    
T  6089137 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgt-agagtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctg 6089045  T
Q  230 ataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    || |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6089044 atgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccac 6089004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Original strand, 30353259 - 30353446
Alignment:
Q  82 ttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacact 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  30353259 ttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-gggatgttacact 30353357  T
Q  182 taaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||| || ||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  30353358 taaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccac 30353446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055299
Alignment:
Q  107 atctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattaga 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| | | ||||||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcg-tgttacacttagaacaaggtatgataaaattata 7055239  T
Q  207 ttaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7055240 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatg 7055299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 7054594 - 7054704
Alignment:
Q  1 tttgattcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttat 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7054594 tttgattcatctttaaattgttgattaatg--attaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttat 7054691  T
Q  100 cgttggtatcttt 112  Q
    |||||| ||||||    
T  7054692 cgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18498559 - 18498530
Alignment:
Q  241 atactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498559 atactatgaggactgaacttttgatgccac 18498530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12263 - 12005
Alignment:
Q  9 atttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12263 atttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcat 12166  T
Q  109 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12165 ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagatt 12067  T
Q  209 aaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgccac 270  Q
    || |||| | |||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12066 aagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccac 12005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44314 - 44054
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44314 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttg 44217  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||  |||| || ||| || ||||||||||    
T  44216 aaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgt-ggggtgttaagcttataacaagatatgataaaatta 44119  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
     |||||||||||| || ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44118 tattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgcca 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 154473 - 154733
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  154473 attcatttttaaattgttgattactg--attaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttg 154570  T
Q  105 gtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 204  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||  |||| || ||| || ||||||||||    
T  154571 aaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgt-ggggtgttaagcttataacaagatatgataaaatta 154668  T
Q  205 gattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatgcca 269  Q
     |||||||||||| || ||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  154669 tattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgcca 154733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 266
Target Start/End: Original strand, 145842 - 146101
Alignment:
Q  5 attcatttttaaatcgttgattactgtgattaatgatcaatagta-atttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgtt 103  Q
    ||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  145842 attcatttttaaattttttattactg--attaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgtt 145939  T
Q  104 ggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatagtcttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 203  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  145940 ggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaatt 146038  T
Q  204 agattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatactatgaggactgaacttttgatg 266  Q
    | ||||| |||||| |||||||  |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  146039 atattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatg 146101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267384
Alignment:
Q  48 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtgatag 147  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  148 tc-ttcagcgttacattttgtgggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagttttgttaatatgataaattaataatacta 246  Q
    || || || |||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | || |||| || ||| ||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgt-gggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatatta 267404  T
Q  247 tgaggactgaacttttgatg 266  Q
    |   ||||||||||||||||    
T  267403 tagagactgaacttttgatg 267384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100948
Alignment:
Q  98 atcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 101047 - 100994
Alignment:
Q  31 tgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggatttaca 86  Q
    ||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  101047 tgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttaca 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University