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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12513_low_39 (Length: 203)

Name: NF12513_low_39
Description: NF12513
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12513_low_39
NF12513_low_39
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (42-203)||(12756161-12756321)
chr8 (42-203)||(24052033-24052193)
chr8 (50-203)||(41043479-41043631)
chr8 (42-203)||(41048859-41049012)
chr8 (74-104)||(24042894-24042924)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (42-203)||(6156551-6156711)
chr4 (42-203)||(6162248-6162408)
chr4 (42-203)||(20192591-20192751)
chr4 (42-203)||(20197955-20198115)
chr4 (42-203)||(53982095-53982254)
chr4 (47-107)||(12733922-12733982)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (42-203)||(630731-630891)
chr2 (42-203)||(636282-636442)
chr2 (42-203)||(7909962-7910122)
chr2 (42-203)||(7917417-7917577)
chr2 (42-203)||(22430348-22430508)
chr2 (42-203)||(22435942-22436102)
chr2 (42-203)||(43776991-43777151)
chr2 (42-203)||(22424978-22425138)
chr2 (42-203)||(14893226-14893390)
chr2 (42-203)||(43771465-43771623)
chr2 (42-203)||(14898783-14898943)
chr2 (42-203)||(26694153-26694313)
chr2 (42-203)||(1519142-1519306)
chr2 (70-203)||(1525642-1525780)
chr2 (42-127)||(26702324-26702409)
chr2 (105-203)||(19052428-19052525)
chr2 (80-110)||(19052381-19052411)
chr2 (50-110)||(14188410-14188470)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (42-203)||(27178969-27179129)
chr1 (42-203)||(15716624-15716784)
chr1 (42-203)||(26711476-26711636)
chr1 (42-203)||(27194970-27195130)
chr1 (42-203)||(15711043-15711203)
chr1 (42-203)||(33498418-33498578)
chr1 (74-203)||(33492968-33493096)
chr1 (42-118)||(17721823-17721899)
chr1 (42-168)||(3343872-3344002)
chr1 (47-115)||(16498728-16498796)
chr1 (105-188)||(16498808-16498889)
chr1 (70-118)||(9088672-9088720)
chr1 (115-203)||(17721718-17721805)
chr1 (42-78)||(33491523-33491559)
chr1 (42-110)||(22575864-22575932)
chr1 (42-110)||(29644986-29645054)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (42-203)||(16648423-16648583)
chr7 (42-203)||(17622784-17622944)
chr7 (42-203)||(32148477-32148637)
chr7 (42-203)||(42208893-42209059)
chr7 (42-203)||(42167620-42167780)
chr7 (42-203)||(44655599-44655759)
chr7 (42-203)||(557871-558031)
chr7 (42-203)||(576054-576214)
chr7 (45-126)||(25499152-25499233)
chr7 (45-126)||(25493915-25493996)
chr7 (74-203)||(26456877-26457006)
chr7 (70-203)||(38011712-38011844)
chr7 (43-114)||(11726483-11726553)
chr7 (129-203)||(25499054-25499127)
chr7 (129-203)||(25493817-25493890)
chr7 (83-139)||(30027341-30027397)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (42-203)||(28375720-28375880)
chr5 (42-203)||(28366980-28367140)
chr5 (42-203)||(30963173-30963331)
chr5 (42-203)||(1536554-1536714)
chr5 (42-152)||(30927382-30927490)
chr5 (42-140)||(34647933-34648031)
chr5 (148-203)||(30957702-30957756)
chr5 (82-114)||(14664032-14664064)
chr5 (43-108)||(54437-54502)
chr5 (50-110)||(23775275-23775335)
chr5 (50-110)||(23862229-23862289)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (42-203)||(3110508-3110668)
chr3 (42-203)||(13990832-13990992)
chr3 (42-203)||(23344376-23344536)
chr3 (42-203)||(40800637-40800797)
chr3 (42-203)||(2168650-2168810)
chr3 (42-203)||(2174217-2174377)
chr3 (42-203)||(13985260-13985420)
chr3 (42-203)||(23338829-23338989)
chr3 (42-203)||(3112125-3112285)
chr3 (42-203)||(9730312-9730472)
chr3 (42-203)||(40802561-40802721)
chr3 (42-203)||(48216335-48216495)
chr3 (42-203)||(13980655-13980815)
chr3 (43-203)||(13991988-13992147)
chr3 (89-203)||(9724670-9724782)
chr3 (70-147)||(34578844-34578921)
chr3 (42-92)||(9721562-9721612)
chr3 (45-110)||(19307722-19307787)
chr3 (105-197)||(20454624-20454715)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (42-203)||(350991-351151)
scaffold0004 (42-203)||(345670-345830)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (42-203)||(14855937-14856097)
chr6 (42-203)||(14847079-14847239)
chr6 (42-203)||(26680571-26680730)
chr6 (116-203)||(6933040-6933126)
chr6 (42-114)||(10345722-10345793)
chr6 (173-203)||(10345872-10345902)
chr6 (150-203)||(6924850-6924902)
chr6 (42-110)||(31023400-31023468)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (42-203)||(26904-27064)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (42-169)||(10991-11118)
scaffold0169 (70-203)||(8696-8828)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (42-126)||(11425-11509)
scaffold0121 (105-203)||(11510-11607)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (42-126)||(39540-39624)
scaffold0124 (105-203)||(39442-39539)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 12756161 - 12756321
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12756161 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 12756260  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12756261 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 12756321  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 24052033 - 24052193
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24052033 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 24052132  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24052133 actaacaatatgatccaataactcaattgt-tatatggacatccatttgtaatattcataac 24052193  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41043631 - 41043479
Alignment:
Q  50 tattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaa 149  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  41043631 tattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagtaagcacaataaagcccaataagctaacaa 41043532  T
Q  150 tatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41043531 tatgatccaataacccaa-ttgctatatagacatccacttgtaatattcataac 41043479  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41049012 - 41048859
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | || | ||||||||    
T  41049012 gattatgttattatcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttataaataaatacaatgacttggggagcaaacataataagacccaataa 41048913  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||       ||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41048912 gctaa-------atcaaataactcaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 41048859  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 104
Target Start/End: Original strand, 24042894 - 24042924
Alignment:
Q  74 gttacatatgagctctatttatagagaaata 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24042894 gttacatatgagctctatttatagagaaata 24042924  T

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Target: chr4 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6156711 - 6156551
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6156711 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 6156612  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6156611 actaacaatatgatccaataacccaa-tttctatatgaacattcacttgtaatattcataac 6156551  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6162408 - 6162248
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6162408 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgacccaataa 6162309  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6162308 actaacaatatgatccaataacccaa-tttctatatggatatccacttgtaatattcataac 6162248  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 20192591 - 20192751
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20192591 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatataagctctatttatagagaaatacaatgactttgggagcaagcacaatatggcccaataa 20192690  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20192691 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 20192751  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 20197955 - 20198115
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20197955 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatataagctctatttatagagaaatacaatgactttgggagcaagcacaatatggcccaataa 20198054  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20198055 actaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccatttgtaatattcataac 20198115  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53982254 - 53982095
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  53982254 gattatgttattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgactt-gggagcaagcacaataaggcccaataa 53982156  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53982155 gctaacagtatgatcaaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 53982095  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Original strand, 12733922 - 12733982
Alignment:
Q  47 tattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaa 107  Q
    |||||||||||||||||    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12733922 tattattctcttgtgataaccaattaggttacatgtgagctctatttatagagaaatacaa 12733982  T

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Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 630891 - 630731
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  630891 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 630792  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  630791 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 630731  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 636442 - 636282
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  636442 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 636343  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  636342 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 636282  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 7909962 - 7910122
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7909962 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 7910061  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7910062 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 7910122  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 7917417 - 7917577
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7917417 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 7917516  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7917517 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 7917577  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22430508 - 22430348
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22430508 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 22430409  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22430408 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 22430348  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22436102 - 22435942
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22436102 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 22436003  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22436002 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 22435942  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43777151 - 43776991
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43777151 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 43777052  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43777051 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 43776991  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22425138 - 22424978
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22425138 gattatattattctcttgtgatgtataattgggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 22425039  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22425038 gctaacaatatgatccaataaccc-atttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 22424978  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14893390 - 14893226
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac----agtatggccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||    
T  14893390 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaataaatatggccca 14893291  T
Q  138 ataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14893290 ataagctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 14893226  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43771623 - 43771465
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43771623 gattatattattctcttgtgatgtataattaggtta--tatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 43771526  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43771525 gctaacaatatgatctaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 43771465  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14898943 - 14898783
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14898943 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgatttagggagcaagcacaatatggtccaataa 14898844  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14898843 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacctgtaatattcataac 14898783  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26694313 - 26694153
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  26694313 gattatgttattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaataaggttcaataa 26694214  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26694213 actaacagtatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 26694153  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1519306 - 1519142
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaataca----atgacttggggagcaagcacagtatggccca 137  Q
    ||||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1519306 gattatattattctcttggtatctctaattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgaatgacttggggagcaagcacaatatgaccca 1519207  T
Q  138 ataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  1519206 ataagctaacaatataatccaataatccaa-ttgctatatggatatccacttataatattcataac 1519142  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1525780 - 1525642
Alignment:
Q  70 ttaggttacatatgagctctatttata------gagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1525780 ttaggttacatatgagctctatttatatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgacctaataagctaacagtatgatccaataac 1525681  T
Q  164 ccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1525680 ccaa-tttctatatggacatccacttataatattcataac 1525642  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26702409 - 26702324
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcaca 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26702409 gattatgttattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcaca 26702324  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 19052428 - 19052525
Alignment:
Q  105 caatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||  ||||||| ||| || ||||||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  19052428 caatgacttggggagcaagcacaatatcgtccaataagctaatagtatgactcaataactcaa-ttgctatatggatattcacttataatatccataac 19052525  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 110
Target Start/End: Original strand, 19052381 - 19052411
Alignment:
Q  80 tatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19052381 tatgagctctatttatagagaaatacaatga 19052411  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14188470 - 14188410
Alignment:
Q  50 tattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||| |||| | ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14188470 tattctcttgtggtgtacaattatgttacatgtggtctctatttatagagaagtacaatga 14188410  T

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Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 27178969 - 27179129
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27178969 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 27179068  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27179069 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 27179129  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15716784 - 15716624
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15716784 gattatattattctcttgtgatgtataattacgttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 15716685  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15716684 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 15716624  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 26711476 - 26711636
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26711476 gattatattattctcttgtgatgtctaattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 26711575  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26711576 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 26711636  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 27194970 - 27195130
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27194970 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 27195069  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27195070 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatagacatccacttgtaatattcataac 27195130  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15711203 - 15711043
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15711203 gattatattattctcttgtgatgtataattacgttacatatgagctctatttataaagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggtccaataa 15711104  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15711103 actaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 15711043  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 33498418 - 33498578
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33498418 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatataagctccatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatagcccaataa 33498517  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33498518 gctaaaaatatgatccaacaacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 33498578  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 33492968 - 33493096
Alignment:
Q  74 gttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttct 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  33492968 gttacatataagctctatttatagagaaatacaatgacttagggagcaagcacaatatagcccaataagctaacaatatgatccaacaactcaa-ttgct 33493066  T
Q  174 atatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33493067 atatggacatccacttgtaatattcataac 33493096  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17721899 - 17721823
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttgggga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17721899 gattatattattctcttgtgatgtacaattaggttacatacgagctctatttatagagaaatataatgacttgggga 17721823  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Original strand, 3343872 - 3344002
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttg----gggagcaagcacagtatggccca 137  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    || |||||||||| |||| ||||    
T  3343872 gattctattattttcttgttatatataattaggttacatataagttctatttatatagaaatacaatgacttgggaaggaagcaagcacaatatgaccca 3343971  T
Q  138 ataagctaacaatatgatccaataacccaat 168  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||    
T  3343972 ataagctaatagtataacccaataacccaat 3344002  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 115
Target Start/End: Original strand, 16498728 - 16498796
Alignment:
Q  47 tattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttgg 115  Q
    ||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16498728 tattattctcttgtggtatgcaattaggttacatatgagctctatttatagagagatacaatgacttgg 16498796  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 16498808 - 16498889
Alignment:
Q  105 caatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccact 188  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16498808 caatgacttggg-agcaagcacaatatggcccaataagctaatagtataacctaataacccaa-ttgctatatggacatccact 16498889  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9088720 - 9088672
Alignment:
Q  70 ttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttgggga 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9088720 ttagattacatataagctctatttatagagaaatataatgatttgggga 9088672  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17721805 - 17721718
Alignment:
Q  115 gggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17721805 gggagcaaacacaatatagcccaataagctagtagtatgacccaataaccaaattct-tacatggacatccacttataatattcataac 17721718  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 78
Target Start/End: Original strand, 33491523 - 33491559
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33491523 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttac 33491559  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Original strand, 22575864 - 22575932
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22575864 gattatattattctcttgtagtgttcaattatgttacatgtggtctctatttatagagaagtacaatga 22575932  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 29645054 - 29644986
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  29645054 gattatattatcgttttgtgatgtataattatgttacatgtgatttttatttatagagaagtacaatga 29644986  T

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Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16648583 - 16648423
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16648583 gattatatttttctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 16648484  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16648483 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 16648423  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17622944 - 17622784
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17622944 gattatatttttctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 17622845  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17622844 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 17622784  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32148637 - 32148477
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32148637 gattatattattttcttgtgatgtataattaggttacatataagctctatttatagagaaatacaatgactttgggagcaagcacaatatggcccaataa 32148538  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32148537 actaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttgtaatattcataac 32148477  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42209059 - 42208893
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatattta------ggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42209059 gattatattattctcttgtgatgtataattataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggtc 42208960  T
Q  136 caataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42208959 caataagctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 42208893  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 42167620 - 42167780
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42167620 gattatgttattttcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaataaggcccaataa 42167719  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42167720 actaacagtatgatcaaataactcaa-ttgctatatggacatccactggtaatattcataac 42167780  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44655759 - 44655599
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | | ||||||||    
T  44655759 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagcttaatttatagagaaatacaaagacttgggtagcaagcacaacaagacccaataa 44655660  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44655659 gctaacagtatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 44655599  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 557871 - 558031
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  557871 gattatattattctcttgtgatgtacaattaggttacatatgaactctatttatagagaaatacaatgacttgggaagcaagcacaatatggcccaataa 557970  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| |||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  557971 gctaatagtatgacccaataaccgaattgt-tatatagacatccacttataatattcataac 558031  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 576054 - 576214
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  576054 gattatattattctcttgtgatgtacaattaggttacatatgaactctatttatagagaaatacaatgacttgggaagcaatcacaatatggcccaataa 576153  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| | ||||| ||||||||| |||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  576154 gctaatagtatgacccaataaccgaattgt-tatatagacatccacttataatattcataac 576214  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25499233 - 25499152
Alignment:
Q  45 tatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25499233 tatattattctcttgtgatgtatcattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 25499152  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25493996 - 25493915
Alignment:
Q  45 tatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25493996 tatattattctcttgtgatgtatcattatgttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 25493915  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 203
Target Start/End: Original strand, 26456877 - 26457006
Alignment:
Q  74 gttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| || ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||  ||    
T  26456877 gttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgatttggagagcaagcgcaatatagcacaataagctaatagtataacccaataatccaattgcct 26456976  T
Q  174 atatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26456977 atatggacatccacttataatattcataac 26457006  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Original strand, 38011712 - 38011844
Alignment:
Q  70 ttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaatt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| | || | | ||  ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  38011712 ttaggttacatatgagctctatagatagagtaatacaatgacttggggatccagtataataaagcccaataaactaagagtatgacctaataacccaatt 38011811  T
Q  170 ttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38011812 gt-tatatggacatccacttctaatattcataac 38011844  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 114
Target Start/End: Original strand, 11726483 - 11726553
Alignment:
Q  43 attatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttg 114  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11726483 attatattattctcttatgttgtcaata-aggttacatgtgagctctatttatagagaaatacaataacttg 11726553  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25499127 - 25499054
Alignment:
Q  129 tatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25499127 tatggtccaataagctaatagtatgacccaataacctaa-ttgctatatggacatccacttataatattcataac 25499054  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25493890 - 25493817
Alignment:
Q  129 tatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25493890 tatggtccaataagctaatagtatgacccattaacctaa-ttgctatatggacatccacttataatattcataac 25493817  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 30027341 - 30027397
Alignment:
Q  83 gagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaat 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| |||||    
T  30027341 gagctctatttatagaaaaatacagtgactttaggagcaaacacaatatggtccaat 30027397  T

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Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 28375720 - 28375880
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28375720 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 28375819  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28375820 gctaacaatatgatccaataactcaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 28375880  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 28366980 - 28367140
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28366980 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 28367079  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28367080 gctaacaatatgatccaataactcaa-ttgctatattgacatccacttgtaatattcataac 28367140  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 30963173 - 30963331
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30963173 gattatattattctcttgtgatgtataattaagtta--tatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggtccaataa 30963270  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30963271 gctaacaatatgatccaataacccaattgt-tatatggacatccacttataatattcataac 30963331  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 1536554 - 1536714
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1536554 gattatattattctcttggtatctctaattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 1536653  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  1536654 gctaacagtatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttataatatttataac 1536714  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Original strand, 30927382 - 30927490
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30927382 gattatattattcttttgtgatgtataattaagtta--tatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggtccaataa 30927479  T
Q  142 gctaacaatat 152  Q
    |||||||||||    
T  30927480 gctaacaatat 30927490  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Original strand, 34647933 - 34648031
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaata 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  34647933 gattctattattctcttgtgatgtacaattaggttacatatgagctcaatttatacagaaatacaatgatttggggagcaagcacaatatagcctaata 34648031  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 30957702 - 30957756
Alignment:
Q  148 aatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30957702 aatatgatccaataacccaattg-ctatatggacatccacttgtaatattcataac 30957756  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 114
Target Start/End: Original strand, 14664032 - 14664064
Alignment:
Q  82 tgagctctatttatagagaaatacaatgacttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664032 tgagctctatttatagagaaatacaatgacttg 14664064  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 108
Target Start/End: Original strand, 54437 - 54502
Alignment:
Q  43 attatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaat 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  54437 attatattattcacttgtgttgtacaattgtgttacatgtgaactctatttatatagaaatacaat 54502  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23775335 - 23775275
Alignment:
Q  50 tattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23775335 tattctcttctgatgtacaattatcttacatgtgatctctatttatagagaagtacaatga 23775275  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23862289 - 23862229
Alignment:
Q  50 tattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23862289 tattctcttctgatgtacaattatcttacatgtgatctctatttatagagaagtacaatga 23862229  T

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Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 3110508 - 3110668
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3110508 gattatattattctcttgtgatgtataattaagttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 3110607  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3110608 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 3110668  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13990992 - 13990832
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13990992 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaaacacaatatggcccaataa 13990893  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13990892 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 13990832  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23344536 - 23344376
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23344536 gattatattattctcttgtgatctataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 23344437  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23344436 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 23344376  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 40800637 - 40800797
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40800637 gattatattattctcttgttatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 40800736  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40800737 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 40800797  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 2168650 - 2168810
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2168650 gattatattattctcttgtgatgtataattaggctacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaaacacaatatggcccaataa 2168749  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2168750 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 2168810  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 2174217 - 2174377
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2174217 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaaacacaatatggcccaataa 2174316  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2174317 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatacacttgtaatattcataac 2174377  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13985420 - 13985260
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13985420 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgatctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaaacacaatatggcccaataa 13985321  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13985320 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 13985260  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23338989 - 23338829
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23338989 gattatattattctcttgtgatctataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 23338890  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23338889 gctaacaatatgatccaataatccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 23338829  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 3112125 - 3112285
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3112125 gattatattattctcttgtgatgtataattaagttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 3112224  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3112225 gctaacaatatgatcttataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 3112285  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 9730312 - 9730472
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9730312 gattatattattctcttgtcatgtataattagattacatatgagctctatttatagagaaatacaatgatttggggagcaagcacaatatggcccaataa 9730411  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9730412 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 9730472  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 40802561 - 40802721
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40802561 gattatattattctcttgtgatgtataattaagttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttgggaagcaagcacaatatcgcccaataa 40802660  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40802661 gctaacaatatgatccaataactcaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 40802721  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 48216335 - 48216495
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  48216335 gattatattattctcttgtgatatataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaaccaaaatatggcccaataa 48216434  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48216435 gctgacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 48216495  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 13980655 - 13980815
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13980655 gattatattattctcttggtatgtacaattagattacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggcccaataa 13980754  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  13980755 gctaatagtatgacccaataacccaa-ttcctatatagacatccacttataatattcataac 13980815  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 203
Target Start/End: Original strand, 13991988 - 13992147
Alignment:
Q  43 attatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataag 142  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  13991988 attatattattctcttgatatgtataattaggttgcatatgagctctatttatacataaacacaatgacttgaagagcaagcacaatatgacccaataag 13992087  T
Q  143 ctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  13992088 ctaatagtatgacccaataacccaa-ttgctatatagacatccacttataatattcataac 13992147  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 203
Target Start/End: Original strand, 9724670 - 9724782
Alignment:
Q  89 tatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccact 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  9724670 tatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgg-ccaaaaagctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccact 9724767  T
Q  189 tgtaatattcataac 203  Q
     ||||||||||||||    
T  9724768 agtaatattcataac 9724782  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 147
Target Start/End: Original strand, 34578844 - 34578921
Alignment:
Q  70 ttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaac 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  34578844 ttaggttacatataagctctatttatagagaaatacaatgacttggggaataagtacaatatgatccaataagctaac 34578921  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 92
Target Start/End: Original strand, 9721562 - 9721612
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatt 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  9721562 gattatattattctcttgtgatgtataattagagtacatatgagctttatt 9721612  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 110
Target Start/End: Original strand, 19307722 - 19307787
Alignment:
Q  45 tatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||| |  |||||  | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19307722 tatattattctccttggatgtcaagttatgttacatgtgatctctatttatagagaaatacaatga 19307787  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20454715 - 20454624
Alignment:
Q  105 caatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatatt 197  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||  | ||||||  ||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20454715 caataacttggagatcaagcacaatataacacaataaattaatagtatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttataatatt 20454624  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 350991 - 351151
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  350991 gattatattattctcttatgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatggaccaataa 351090  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  351091 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 351151  T

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Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 345670 - 345830
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  345670 gattatattattttcttatgatgtataattaggttacatgtgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagtaagcacaatatggcccaataa 345769  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  345770 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 345830  T

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Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 1e-67; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14856097 - 14855937
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14856097 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacgtggggagcaagcacaatatggcccaatat 14855998  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14855997 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 14855937  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14847239 - 14847079
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14847239 gattatattattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagttctatttatagagaaatacaatgacgtggggagcaatcacaatatggcccaataa 14847140  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14847139 gctaacaatatgatcaaataacccaa-ttgctatatggatatccacttgtaatattcataac 14847079  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26680730 - 26680571
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  26680730 gattatgttattctcttgtgatgtataattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgactt-gggagcaagcacaataaggcccaataa 26680632  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
     |||||| ||||||| || ||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26680631 actaacagtatgatcaaaaaactcaa-ttgctacatggacatccacttgtaatattcataac 26680571  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6933126 - 6933040
Alignment:
Q  116 ggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6933126 ggagcaaacacaatatagtccaataagctaacagtatgacccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttataatattcataac 6933040  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 114
Target Start/End: Original strand, 10345722 - 10345793
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttg 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10345722 gattatattattctcttgtgttgtcaattaag-ttacatgtgaactctatttatatagaaatagaatgacttg 10345793  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 203
Target Start/End: Original strand, 10345872 - 10345902
Alignment:
Q  173 tatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10345872 tatatgaacatccacttgtaatattcataac 10345902  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6924902 - 6924850
Alignment:
Q  150 tatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  6924902 tatgatccaataacccaattg-ctatatcgacatccacttataatattcataac 6924850  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31023468 - 31023400
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatga 110  Q
    |||||||||||| || |||||| || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  31023468 gattatattattttcatgtgatatacaattatgttacatgtgatctctatttatatagaactacaatga 31023400  T

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Target: scaffold0211 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27064 - 26904
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27064 gattatattattctctttttatgttttattatgttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgacccaataa 26965  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26964 gctaacaatatgatccaataacccaa-ttgctatatggacatccacttgtaatattcataac 26904  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11118 - 10991
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataa 141  Q
    ||||||||||||||||||  || |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11118 gattatattattctcttggtatatccaattaggttatatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgacccaataa 11019  T
Q  142 gctaacaatatgatccaataacccaatt 169  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11018 gctaatagtatgacccaataacccaatt 10991  T

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Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8828 - 8696
Alignment:
Q  70 ttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaatt 169  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  8828 ttagattacatataatctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcacaatatgacccaataagctaatagtatgacccaataacccaa-t 8730  T
Q  170 ttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    | ||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8729 tgctatatagacatccacttataatattcataac 8696  T

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Target: scaffold0121 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Original strand, 11425 - 11509
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 126  Q
    |||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425 gattatattattctcttagtatgtaccattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 11509  T

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Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Original strand, 11510 - 11607
Alignment:
Q  105 caatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| || || |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  11510 caatgacttagggagcaaccacaatatggtccaataagctaatagtatgacccaataacctaa-ttgctatgtggacatccacttataatattcataac 11607  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 39624 - 39540
Alignment:
Q  42 gattatattattctcttgtgatgtatatttaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttggggagcaagcac 126  Q
    |||||||||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39624 gattatattattctcttagtatgtaccattaggttacatatgagctctatttatagagaaatacaatgacttgaggagcaagcac 39540  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39539 - 39442
Alignment:
Q  105 caatgacttggggagcaagcacagtatggcccaataagctaacaatatgatccaataacccaattttctatatgaacatccacttgtaatattcataac 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || || ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39539 caatgacttagggagcaagcacaatatggtccaataagctaatagtacgacccaataacctaattgt-tatatggacatccacttataatattcataac 39442  T

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