View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12531_low_1 (Length: 753)

Name: NF12531_low_1
Description: NF12531
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12531_low_1
NF12531_low_1
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (15-686)||(22462356-22463026)
chr5 (15-683)||(20774166-20774834)
chr5 (15-683)||(28894235-28894903)
chr5 (15-683)||(28915706-28916374)
chr5 (15-683)||(28923061-28923729)
chr5 (15-683)||(20821860-20822528)
chr5 (15-680)||(21890052-21890717)
chr5 (65-683)||(22235263-22235881)
chr5 (80-683)||(17268692-17269294)
chr5 (28-683)||(24715832-24716487)
chr5 (28-683)||(24619601-24620256)
chr5 (28-683)||(24748860-24749515)
chr5 (74-683)||(25848482-25849091)
chr5 (74-683)||(14886343-14886952)
chr5 (29-681)||(21831068-21831720)
chr5 (18-683)||(21563269-21563934)
chr5 (74-686)||(24797749-24798361)
chr5 (74-683)||(20342689-20343298)
chr5 (84-683)||(22503086-22503685)
chr5 (88-683)||(23079455-23080050)
chr5 (15-380)||(21680071-21680436)
chr5 (74-559)||(37542733-37543218)
chr5 (80-686)||(20467455-20468060)
chr5 (106-683)||(23471654-23472231)
chr5 (109-683)||(14999126-14999700)
chr5 (80-678)||(25423619-25424216)
chr5 (18-683)||(19770385-19771050)
chr5 (111-595)||(26738116-26738600)
chr5 (97-683)||(34566919-34567505)
chr5 (97-683)||(16356927-16357513)
chr5 (18-683)||(27667786-27668451)
chr5 (103-683)||(27684781-27685361)
chr5 (97-683)||(29475448-29476034)
chr5 (97-683)||(41771267-41771853)
chr5 (62-371)||(21496792-21497101)
chr5 (122-683)||(22348848-22349409)
chr5 (19-683)||(22135093-22135757)
chr5 (103-683)||(27610779-27611359)
chr5 (97-683)||(22332262-22332848)
chr5 (97-683)||(27518832-27519418)
chr5 (97-683)||(21338672-21339247)
chr5 (109-683)||(37290883-37291457)
chr5 (97-683)||(40709205-40709791)
chr5 (382-683)||(22381606-22381907)
chr5 (18-683)||(23574167-23574819)
chr5 (130-603)||(21407643-21408116)
chr5 (109-680)||(18776198-18776769)
chr5 (457-683)||(21497772-21497997)
chr5 (488-679)||(21496569-21496760)
chr5 (535-683)||(23516966-23517114)
chr5 (22-419)||(23440899-23441296)
chr5 (29-557)||(20799999-20800527)
chr5 (554-683)||(20799185-20799314)
chr5 (571-683)||(23440650-23440762)
chr5 (193-398)||(21936659-21936864)
chr5 (193-398)||(24581902-24582107)
chr5 (196-398)||(27011776-27011978)
chr5 (18-239)||(23517395-23517616)
chr5 (554-683)||(37545328-37545457)
chr5 (616-683)||(922-989)
chr5 (194-328)||(25243822-25243956)
chr5 (194-328)||(25307974-25308108)
chr5 (628-683)||(26738611-26738666)
chr5 (260-326)||(16065313-16065379)
chr5 (193-398)||(23504134-23504339)
chr5 (192-328)||(21881729-21881865)
chr5 (364-419)||(23517215-23517270)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (15-686)||(347-1019)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (15-686)||(20855943-20856615)
chr1 (17-683)||(20939248-20939914)
chr1 (80-683)||(19662385-19662992)
chr1 (17-683)||(19854821-19855479)
chr1 (17-683)||(20835085-20835739)
chr1 (17-683)||(24098788-24099454)
chr1 (80-683)||(31539245-31539848)
chr1 (74-683)||(37677588-37678197)
chr1 (82-683)||(20294920-20295521)
chr1 (316-683)||(22432600-22432967)
chr1 (97-683)||(21749449-21750034)
chr1 (97-687)||(50619509-50620099)
chr1 (82-422)||(21951678-21952018)
chr1 (97-683)||(22361509-22362095)
chr1 (103-683)||(21837458-21838038)
chr1 (29-620)||(20139401-20139992)
chr1 (103-683)||(16349869-16350450)
chr1 (97-683)||(21830811-21831397)
chr1 (97-683)||(51332758-51333344)
chr1 (103-683)||(33390300-33390880)
chr1 (97-683)||(19106875-19107462)
chr1 (97-614)||(20250379-20250895)
chr1 (130-683)||(17044313-17044866)
chr1 (29-263)||(16373457-16373691)
chr1 (80-687)||(19760121-19760721)
chr1 (62-326)||(22109887-22110151)
chr1 (62-326)||(22113736-22114000)
chr1 (18-419)||(41352848-41353249)
chr1 (457-683)||(16369805-16370031)
chr1 (192-683)||(16078016-16078503)
chr1 (193-398)||(20830753-20830958)
chr1 (19-180)||(23197433-23197594)
chr1 (571-683)||(41354208-41354320)
chr1 (610-683)||(41308333-41308406)
chr1 (301-419)||(20937686-20937804)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (16-683)||(27900879-27901546)
chr4 (17-683)||(1648390-1649056)
chr4 (15-683)||(15002475-15003143)
chr4 (17-683)||(15246417-15247083)
chr4 (29-683)||(8706411-8707065)
chr4 (19-681)||(15078130-15078792)
chr4 (74-683)||(3263964-3264573)
chr4 (88-683)||(33223416-33224011)
chr4 (32-683)||(15319644-15320294)
chr4 (80-683)||(11206407-11207010)
chr4 (74-683)||(29452707-29453316)
chr4 (80-681)||(44661042-44661643)
chr4 (73-683)||(20891475-20892085)
chr4 (18-683)||(15414140-15414805)
chr4 (91-687)||(14850293-14850889)
chr4 (351-683)||(15358537-15358869)
chr4 (19-683)||(14681060-14681724)
chr4 (283-687)||(14691391-14691795)
chr4 (97-683)||(8386905-8387491)
chr4 (97-683)||(8052556-8053142)
chr4 (97-683)||(12477093-12477679)
chr4 (97-683)||(14302911-14303497)
chr4 (97-683)||(29038337-29038923)
chr4 (19-683)||(40473533-40474197)
chr4 (97-683)||(19777726-19778312)
chr4 (18-683)||(27711829-27712494)
chr4 (97-683)||(7090925-7091511)
chr4 (104-683)||(12524169-12524748)
chr4 (97-683)||(23956240-23956826)
chr4 (103-687)||(1639364-1639948)
chr4 (80-676)||(14159970-14160566)
chr4 (17-314)||(15358233-15358530)
chr4 (19-683)||(15146740-15147403)
chr4 (97-683)||(18297698-18298284)
chr4 (100-680)||(18226382-18226962)
chr4 (367-680)||(16251648-16251961)
chr4 (74-307)||(16148580-16148813)
chr4 (74-307)||(16152726-16152959)
chr4 (192-683)||(16354473-16354964)
chr4 (62-230)||(14695059-14695227)
chr4 (193-398)||(15292447-15292652)
chr4 (193-329)||(14998163-14998299)
chr4 (538-614)||(18549694-18549770)
chr4 (220-398)||(9291613-9291791)
chr4 (643-681)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (15-680)||(67897-68562)
scaffold0034 (17-683)||(13017-13683)
scaffold0034 (17-683)||(4069-4735)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (17-683)||(15459693-15460359)
chr6 (15-683)||(21563388-21564056)
chr6 (15-683)||(21569247-21569915)
chr6 (32-683)||(25768548-25769199)
chr6 (28-683)||(8762202-8762857)
chr6 (16-683)||(34644843-34645510)
chr6 (15-683)||(19453777-19454445)
chr6 (15-683)||(18795047-18795715)
chr6 (32-679)||(21471962-21472609)
chr6 (17-683)||(5296464-5297130)
chr6 (15-680)||(19879658-19880323)
chr6 (15-683)||(14380723-14381391)
chr6 (17-683)||(28282071-28282737)
chr6 (17-683)||(10468107-10468773)
chr6 (80-683)||(24364769-24365372)
chr6 (248-683)||(27560106-27560541)
chr6 (279-683)||(22796152-22796556)
chr6 (17-389)||(19435653-19436025)
chr6 (344-681)||(17415845-17416182)
chr6 (19-683)||(5838479-5839143)
chr6 (18-687)||(15896447-15897116)
chr6 (97-683)||(18407280-18407866)
chr6 (29-686)||(25609131-25609788)
chr6 (19-683)||(1542344-1543008)
chr6 (97-683)||(22761793-22762379)
chr6 (19-683)||(19865044-19865708)
chr6 (103-683)||(24312512-24313092)
chr6 (29-683)||(23078826-23079480)
chr6 (29-380)||(19488542-19488893)
chr6 (97-683)||(16626055-16626641)
chr6 (97-683)||(28262535-28263121)
chr6 (97-683)||(28341284-28341870)
chr6 (103-683)||(29591264-29591844)
chr6 (97-620)||(20636639-20637162)
chr6 (97-683)||(25112909-25113495)
chr6 (97-683)||(2874141-2874727)
chr6 (18-683)||(22077949-22078614)
chr6 (18-683)||(27187793-27188458)
chr6 (18-683)||(27260782-27261447)
chr6 (29-620)||(18196995-18197589)
chr6 (18-676)||(27391432-27392090)
chr6 (30-683)||(22434226-22434879)
chr6 (18-676)||(27330692-27331350)
chr6 (210-679)||(28291823-28292292)
chr6 (30-596)||(22442711-22443277)
chr6 (80-587)||(18966613-18967114)
chr6 (192-683)||(16927073-16927564)
chr6 (415-680)||(11280161-11280426)
chr6 (80-350)||(18436295-18436569)
chr6 (547-686)||(17032737-17032876)
chr6 (29-419)||(16962715-16963105)
chr6 (15-218)||(14379173-14379376)
chr6 (600-683)||(1641129-1641212)
chr6 (540-683)||(16963148-16963291)
chr6 (109-263)||(27566330-27566484)
chr6 (193-398)||(16381807-16382012)
chr6 (193-398)||(1648248-1648453)
chr6 (193-398)||(18572293-18572498)
chr6 (536-683)||(27559765-27559912)
chr6 (193-395)||(23996893-23997095)
chr6 (193-398)||(14624791-14624996)
chr6 (535-620)||(21836973-21837058)
chr6 (193-398)||(18837342-18837547)
chr6 (193-269)||(16098821-16098897)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (15-622)||(468-1075)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (15-686)||(95116-95787)
scaffold0029 (15-679)||(113087-113751)
scaffold0029 (97-683)||(109007-109593)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (15-683)||(10419384-10420052)
chr3 (15-683)||(14086795-14087463)
chr3 (20-683)||(13971464-13972127)
chr3 (15-683)||(16827542-16828209)
chr3 (17-680)||(14574054-14574711)
chr3 (17-683)||(17492752-17493418)
chr3 (80-683)||(16835914-16836517)
chr3 (65-683)||(18133735-18134353)
chr3 (17-683)||(12359868-12360549)
chr3 (17-683)||(8758423-8759089)
chr3 (80-683)||(41177644-41178247)
chr3 (17-683)||(16380269-16380935)
chr3 (74-683)||(47124066-47124675)
chr3 (80-683)||(4678560-4679163)
chr3 (80-683)||(13942146-13942749)
chr3 (17-683)||(11303114-11303780)
chr3 (74-683)||(28754440-28755049)
chr3 (83-683)||(44777369-44777969)
chr3 (74-683)||(10384091-10384699)
chr3 (317-683)||(13322293-13322659)
chr3 (18-683)||(15227771-15228436)
chr3 (74-683)||(16337910-16338519)
chr3 (82-683)||(16329066-16329668)
chr3 (74-470)||(11960567-11960963)
chr3 (17-377)||(31694527-31694887)
chr3 (17-377)||(31939331-31939691)
chr3 (103-683)||(17489962-17490542)
chr3 (80-679)||(15248263-15248862)
chr3 (97-683)||(10005712-10006298)
chr3 (82-683)||(10906322-10906923)
chr3 (172-683)||(9522831-9523342)
chr3 (97-683)||(13252802-13253388)
chr3 (97-683)||(16635885-16636471)
chr3 (97-683)||(43163209-43163795)
chr3 (130-683)||(16491646-16492199)
chr3 (379-683)||(15952671-15952975)
chr3 (104-683)||(6600848-6601427)
chr3 (97-683)||(5424362-5424948)
chr3 (62-680)||(15209006-15209624)
chr3 (19-680)||(26791753-26792414)
chr3 (97-683)||(53384450-53385036)
chr3 (103-683)||(15347683-15348263)
chr3 (97-680)||(16411714-16412297)
chr3 (97-683)||(20061486-20062072)
chr3 (97-681)||(15339383-15339967)
chr3 (97-683)||(15588824-15589410)
chr3 (80-671)||(15015171-15015762)
chr3 (97-680)||(15724366-15724949)
chr3 (74-296)||(13319900-13320122)
chr3 (97-683)||(48425559-48426145)
chr3 (109-683)||(12498360-12498934)
chr3 (91-686)||(16371522-16372116)
chr3 (97-680)||(16756017-16756600)
chr3 (91-686)||(14875924-14876520)
chr3 (130-683)||(16806391-16806944)
chr3 (192-682)||(14126121-14126611)
chr3 (109-683)||(16692272-16692850)
chr3 (82-683)||(15401934-15402528)
chr3 (501-683)||(12850104-12850286)
chr3 (74-220)||(13299920-13300066)
chr3 (74-220)||(13310578-13310724)
chr3 (19-253)||(14580296-14580530)
chr3 (388-686)||(15061865-15062163)
chr3 (535-683)||(11564551-11564699)
chr3 (18-182)||(15234140-15234304)
chr3 (193-398)||(13966868-13967073)
chr3 (193-398)||(16742231-16742436)
chr3 (193-398)||(30138213-30138418)
chr3 (193-398)||(30147764-30147969)
chr3 (193-398)||(16257551-16257756)
chr3 (628-686)||(11960986-11961044)
chr3 (109-263)||(15062276-15062430)
chr3 (686-722)||(14685174-14685210)
chr3 (193-398)||(8273927-8274132)
chr3 (644-683)||(26008961-26009000)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (15-530)||(27209823-27210338)
chr2 (18-683)||(27364733-27365398)
chr2 (83-683)||(19651771-19652371)
chr2 (80-683)||(23276900-23277503)
chr2 (83-683)||(24948713-24949314)
chr2 (17-683)||(27787865-27788531)
chr2 (74-683)||(31830782-31831391)
chr2 (80-683)||(12574477-12575080)
chr2 (74-683)||(1063875-1064484)
chr2 (74-683)||(20828383-20828992)
chr2 (74-683)||(20833109-20833718)
chr2 (279-683)||(24641866-24642270)
chr2 (29-427)||(23294315-23294713)
chr2 (208-683)||(21125003-21125476)
chr2 (18-635)||(23110907-23111525)
chr2 (136-683)||(11357646-11358193)
chr2 (127-674)||(45529644-45530191)
chr2 (19-680)||(21144696-21145357)
chr2 (80-683)||(30210633-30211236)
chr2 (97-680)||(27371396-27371979)
chr2 (97-683)||(9610260-9610846)
chr2 (29-683)||(24675613-24676267)
chr2 (97-683)||(10868974-10869560)
chr2 (80-683)||(24876465-24877068)
chr2 (103-680)||(24262497-24263074)
chr2 (97-683)||(16925484-16926070)
chr2 (97-683)||(16999124-16999710)
chr2 (97-683)||(27218140-27218726)
chr2 (451-683)||(23294082-23294314)
chr2 (97-683)||(16923013-16923599)
chr2 (97-683)||(16982276-16982862)
chr2 (97-683)||(17063841-17064427)
chr2 (97-683)||(17067499-17068085)
chr2 (103-683)||(24710157-24710738)
chr2 (103-683)||(22324595-22325175)
chr2 (103-683)||(41608124-41608704)
chr2 (29-683)||(21324931-21325585)
chr2 (95-620)||(23107461-23107986)
chr2 (29-543)||(24819351-24819865)
chr2 (19-683)||(22756120-22756784)
chr2 (97-683)||(44385302-44385888)
chr2 (15-143)||(23099669-23099797)
chr2 (367-683)||(24707485-24707801)
chr2 (457-683)||(23064201-23064427)
chr2 (97-328)||(23066870-23067101)
chr2 (535-681)||(20442684-20442830)
chr2 (535-683)||(23189131-23189279)
chr2 (97-521)||(21890451-21890875)
chr2 (554-687)||(24825472-24825605)
chr2 (193-395)||(24831017-24831218)
chr2 (193-398)||(12640062-12640267)
chr2 (193-398)||(22276687-22276892)
chr2 (196-269)||(22761401-22761474)
chr2 (509-662)||(25128792-25128945)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (193-683)||(6708-7198)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (15-683)||(32791-33459)
scaffold0076 (74-521)||(56073-56520)
scaffold0076 (193-398)||(41067-41272)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (15-683)||(49628-50296)
scaffold0028 (97-683)||(43678-44264)
scaffold0028 (97-683)||(8998-9584)
scaffold0028 (97-683)||(15460-16046)
scaffold0028 (18-251)||(733-966)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (19-683)||(51298-51962)
scaffold0067 (19-683)||(60332-60996)
scaffold0067 (19-683)||(66720-67384)
scaffold0067 (113-218)||(26389-26494)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (16-683)||(20975206-20975873)
chr8 (17-683)||(1266797-1267463)
chr8 (15-683)||(21840976-21841644)
chr8 (17-683)||(31416030-31416696)
chr8 (17-680)||(23655489-23656152)
chr8 (15-683)||(19851970-19852638)
chr8 (15-683)||(19858006-19858674)
chr8 (62-683)||(20388658-20389279)
chr8 (17-683)||(22051422-22052088)
chr8 (17-683)||(31570398-31571064)
chr8 (74-683)||(6679670-6680279)
chr8 (45-683)||(22371499-22372137)
chr8 (74-683)||(6604217-6604826)
chr8 (74-683)||(803286-803895)
chr8 (83-683)||(16270846-16271446)
chr8 (74-686)||(14565698-14566310)
chr8 (73-683)||(27355107-27355716)
chr8 (32-683)||(20009491-20010122)
chr8 (74-683)||(29303039-29303648)
chr8 (279-681)||(22061251-22061653)
chr8 (82-683)||(12305317-12305918)
chr8 (106-687)||(22377099-22377680)
chr8 (106-687)||(22383274-22383855)
chr8 (94-687)||(20395765-20396351)
chr8 (106-685)||(23949476-23950055)
chr8 (103-683)||(19113249-19113829)
chr8 (97-681)||(21921372-21921955)
chr8 (30-683)||(18857136-18857789)
chr8 (97-683)||(21393501-21394087)
chr8 (97-683)||(21787995-21788581)
chr8 (103-683)||(17673665-17674245)
chr8 (62-686)||(22987757-22988376)
chr8 (97-683)||(21251500-21252089)
chr8 (15-261)||(20985101-20985347)
chr8 (18-683)||(23650600-23651265)
chr8 (29-679)||(30312712-30313362)
chr8 (62-401)||(22248018-22248357)
chr8 (18-683)||(19978526-19979191)
chr8 (18-683)||(16407602-16408267)
chr8 (18-683)||(21166095-21166759)
chr8 (22-683)||(32600703-32601364)
chr8 (109-679)||(22040422-22040992)
chr8 (97-679)||(22119810-22120392)
chr8 (192-683)||(22132772-22133263)
chr8 (18-419)||(19483621-19484022)
chr8 (535-683)||(22046932-22047080)
chr8 (97-419)||(21043268-21043590)
chr8 (538-679)||(15533943-15534084)
chr8 (367-680)||(22164098-22164411)
chr8 (97-393)||(22128594-22128890)
chr8 (576-683)||(20017865-20017972)
chr8 (571-683)||(19484980-19485092)
chr8 (193-398)||(21850069-21850274)
chr8 (165-398)||(23156716-23156949)
chr8 (220-328)||(22283918-22284026)
chr8 (220-328)||(25283044-25283152)
chr8 (193-398)||(16876827-16877032)
chr8 (538-614)||(19863684-19863760)
chr8 (538-614)||(19868321-19868397)
chr8 (193-328)||(20652065-20652200)
chr8 (193-320)||(22316113-22316240)
chr8 (193-230)||(22623596-22623633)
chr8 (220-328)||(25283270-25283378)
chr8 (538-653)||(22129017-22129132)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (17-683)||(19644-20310)
scaffold0058 (208-328)||(75437-75557)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (74-683)||(6411-7020)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-683)||(27749-28415)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (17-683)||(46515-47181)
scaffold0010 (74-683)||(41506-42115)
scaffold0010 (58-683)||(2445-3063)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (17-683)||(323228-323894)
scaffold0004 (29-683)||(202596-203250)
scaffold0004 (313-683)||(118092-118462)
scaffold0004 (482-683)||(386343-386544)
scaffold0004 (457-686)||(112542-112771)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (15-683)||(11387526-11388194)
chr7 (15-683)||(19147694-19148362)
chr7 (15-683)||(20747093-20747761)
chr7 (17-680)||(13666023-13666686)
chr7 (15-551)||(19613290-19613826)
chr7 (80-681)||(14285539-14286140)
chr7 (15-683)||(14263342-14264010)
chr7 (17-683)||(15101703-15102369)
chr7 (80-683)||(18053116-18053719)
chr7 (80-683)||(14434174-14434777)
chr7 (79-686)||(15340911-15341518)
chr7 (17-683)||(16949572-16950237)
chr7 (74-686)||(11305420-11306032)
chr7 (17-683)||(13021840-13022506)
chr7 (17-683)||(23504970-23505636)
chr7 (17-680)||(16071395-16072057)
chr7 (74-683)||(49152784-49153393)
chr7 (18-683)||(12205901-12206566)
chr7 (74-685)||(564-1175)
chr7 (137-683)||(14130356-14130902)
chr7 (75-683)||(12456185-12456793)
chr7 (97-687)||(15625030-15625620)
chr7 (62-685)||(11771408-11772031)
chr7 (74-683)||(13967825-13968434)
chr7 (135-683)||(8211346-8211894)
chr7 (74-683)||(26117762-26118371)
chr7 (17-506)||(12457300-12457789)
chr7 (322-683)||(6413994-6414355)
chr7 (97-683)||(12687983-12688568)
chr7 (62-687)||(15153824-15154449)
chr7 (63-683)||(14040178-14040797)
chr7 (63-683)||(14350208-14350827)
chr7 (97-683)||(11236415-11237001)
chr7 (97-683)||(44790553-44791139)
chr7 (103-683)||(18550966-18551546)
chr7 (97-683)||(9596539-9597125)
chr7 (97-683)||(8199110-8199696)
chr7 (97-683)||(8708087-8708673)
chr7 (97-683)||(10871477-10872063)
chr7 (103-683)||(13686546-13687126)
chr7 (193-674)||(21662452-21662933)
chr7 (103-683)||(15160265-15160845)
chr7 (97-683)||(11552304-11552890)
chr7 (109-683)||(14332879-14333452)
chr7 (97-683)||(18178224-18178810)
chr7 (18-496)||(321160-321638)
chr7 (80-328)||(15204456-15204704)
chr7 (109-679)||(16532-17100)
chr7 (97-650)||(23202815-23203368)
chr7 (97-650)||(23508942-23509495)
chr7 (97-419)||(14955304-14955622)
chr7 (510-683)||(14955102-14955275)
chr7 (193-398)||(27107072-27107277)
chr7 (193-398)||(7824667-7824872)
chr7 (109-263)||(14212576-14212730)
chr7 (510-674)||(4440419-4440583)
chr7 (193-328)||(13353987-13354122)
chr7 (194-269)||(23642342-23642417)
chr7 (625-683)||(23199451-23199509)
chr7 (193-398)||(13455514-13455719)
chr7 (193-269)||(4440824-4440900)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (15-683)||(27048-27716)
scaffold0192 (505-683)||(26666-26844)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (15-686)||(48148-48819)
scaffold0053 (80-540)||(57026-57486)
scaffold0053 (625-683)||(57541-57599)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (17-676)||(194820-195479)
scaffold0011 (17-686)||(149091-149760)
scaffold0011 (106-685)||(25738-26317)
scaffold0011 (193-392)||(180739-180938)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (80-683)||(41443-42044)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-683)||(4568-5234)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (15-683)||(1087-1754)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (18-681)||(3277-3940)
scaffold0035 (538-614)||(12833-12909)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (17-683)||(5274-5940)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (15-683)||(4954-5622)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (17-683)||(20507-21173)
scaffold0298 (17-409)||(11173-11565)
scaffold0298 (17-409)||(14943-15335)
scaffold0298 (405-683)||(12865-13143)
scaffold0298 (405-683)||(16635-16913)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (17-683)||(20787-21453)
scaffold0235 (17-607)||(10573-11163)
scaffold0235 (193-269)||(26744-26820)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (15-683)||(10317-10985)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (17-581)||(13415-13979)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (121-676)||(25085-25640)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (80-590)||(5830-6340)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (15-681)||(19375-20041)
scaffold0090 (15-681)||(23537-24203)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (103-680)||(100751-101331)
scaffold0020 (19-681)||(180725-181387)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (74-607)||(2188-2721)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (15-683)||(393-1061)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (80-686)||(11965-12570)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (17-683)||(45041-45707)
scaffold0114 (279-683)||(44029-44433)
scaffold0114 (17-363)||(20744-21090)
scaffold0114 (130-399)||(19570-19839)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (80-683)||(5515-6117)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (18-683)||(31934-32600)
scaffold0106 (279-683)||(14563-14967)
scaffold0106 (535-683)||(17965-18113)
scaffold0106 (367-603)||(18321-18557)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (80-683)||(51042-51645)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (17-683)||(2471-3137)
scaffold0222 (74-607)||(7660-8193)
[»] scaffold0139 (5 HSPs)
scaffold0139 (31-683)||(279-931)
scaffold0139 (17-251)||(28173-28407)
scaffold0139 (17-251)||(34426-34660)
scaffold0139 (556-683)||(28043-28170)
scaffold0139 (556-683)||(34296-34423)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (17-683)||(3315-3981)
scaffold0403 (130-683)||(6896-7449)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (82-662)||(81013-81593)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (18-530)||(5-513)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (169-683)||(40262-40776)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (88-686)||(260829-261427)
scaffold0005 (62-683)||(277991-278612)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (17-683)||(48322-48989)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (203-681)||(17839-18317)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (18-679)||(39876-40537)
scaffold0064 (223-679)||(28090-28546)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (15-680)||(47651-48296)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (49-571)||(14345-14867)
scaffold0261 (49-571)||(22524-23046)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (29-683)||(24200-24853)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (74-680)||(249140-249746)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (74-683)||(43307-43916)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (15-683)||(17883-18541)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (175-683)||(6510-7019)
scaffold0149 (175-683)||(10941-11450)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (15-546)||(28718-29249)
scaffold0026 (82-573)||(29578-30070)
scaffold0026 (541-683)||(37726-37868)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (196-683)||(6331-6818)
scaffold0585 (34-113)||(6224-6303)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (128-543)||(528-943)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (80-683)||(15892-16495)
scaffold0089 (29-143)||(10501-10615)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (74-683)||(32492-33101)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (280-683)||(903-1306)
scaffold0120 (109-683)||(6547-7118)
scaffold0120 (18-419)||(12846-13247)
scaffold0120 (19-237)||(670-887)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (74-687)||(1428-2041)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (15-473)||(176-633)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (74-683)||(26785-27394)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (80-683)||(4555-5158)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (88-505)||(20096-20513)
scaffold0104 (88-505)||(22916-23333)
scaffold0104 (502-683)||(1052-1233)
scaffold0104 (502-602)||(12582-12682)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (19-398)||(20559-20938)
scaffold0077 (193-398)||(27558-27763)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (285-683)||(11293-11691)
scaffold0518 (17-250)||(11690-11923)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (110-681)||(218626-219197)
scaffold0012 (62-687)||(229563-230188)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (29-683)||(31881-32534)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (286-683)||(2318-2715)
scaffold0751 (15-359)||(3024-3368)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (29-687)||(3660-4318)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (80-683)||(14258-14861)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (340-683)||(114704-115052)
scaffold0001 (192-687)||(390491-390986)
scaffold0001 (17-263)||(89561-89807)
scaffold0001 (17-263)||(90239-90485)
scaffold0001 (482-683)||(90513-90714)
scaffold0001 (482-622)||(89835-89975)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (17-409)||(12996-13390)
scaffold0124 (405-683)||(11412-11690)
scaffold0124 (502-683)||(5-186)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (17-410)||(7261-7654)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (91-687)||(9490-10086)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (17-365)||(802-1150)
scaffold0232 (360-683)||(2336-2657)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (97-682)||(19198-19783)
scaffold0324 (97-263)||(14407-14573)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (97-653)||(4425-4981)
scaffold0270 (97-653)||(11555-12111)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (16-527)||(9923-10434)
scaffold0130 (589-683)||(10428-10522)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (192-687)||(25010-25505)
scaffold0100 (74-141)||(24880-24947)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (80-687)||(116084-116691)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (15-402)||(4581-4968)
scaffold0600 (509-683)||(4399-4573)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (80-683)||(15401-16004)
scaffold0040 (109-680)||(112696-113266)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (130-683)||(6573-7126)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (62-683)||(220-841)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (111-679)||(3667-4232)
scaffold0023 (80-674)||(59287-59882)
scaffold0023 (506-683)||(130672-130849)
scaffold0023 (484-683)||(28963-29161)
scaffold0023 (130-328)||(130986-131184)
scaffold0023 (130-419)||(28601-28890)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (18-686)||(1197-1865)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (283-620)||(12081-12418)
scaffold0483 (600-683)||(9782-9865)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (62-683)||(19126-19747)
scaffold0081 (62-620)||(34613-35171)
scaffold0081 (482-683)||(50017-50218)
scaffold0081 (18-401)||(50238-50621)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (97-683)||(7463-8049)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (97-683)||(7890-8476)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (97-607)||(8283-8793)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (32-421)||(17467-17856)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (196-683)||(1991-2478)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (220-683)||(15742-16198)
scaffold0282 (32-149)||(15613-15730)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (370-542)||(49437-49609)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (80-683)||(16179-16781)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (121-380)||(34015-34274)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (130-667)||(2914-3451)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (22-683)||(6538-7199)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (18-519)||(17094-17595)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (109-685)||(3613-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (109-685)||(9118-9694)
scaffold0109 (109-685)||(32781-33357)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (103-683)||(63233-63813)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (80-674)||(4771-5364)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (80-312)||(2509-2741)
scaffold0476 (457-683)||(9867-10093)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (244-620)||(39354-39730)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (208-683)||(1-476)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (29-543)||(7019-7533)
scaffold0379 (571-687)||(12647-12763)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (29-543)||(11325-11839)
scaffold0018 (29-543)||(17517-18031)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (17-257)||(2601-2841)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (103-683)||(7921-8501)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (127-604)||(85745-86213)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (279-683)||(1144-1548)
scaffold0044 (355-683)||(14884-15212)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (113-683)||(7543-8110)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (74-328)||(102112-102366)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (130-683)||(3043-3596)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (18-401)||(1184-1567)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (62-683)||(38981-39601)
scaffold0042 (94-679)||(65933-66518)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (155-683)||(22391-22919)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (355-683)||(277-605)
scaffold0220 (109-263)||(31-185)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (157-683)||(938-1464)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (22-683)||(79615-80276)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (483-683)||(13011-13211)
scaffold0293 (109-419)||(13256-13566)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (192-683)||(25498-25989)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (18-681)||(1791-2458)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (15-188)||(6799-6972)
scaffold0117 (357-398)||(880-921)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (355-683)||(4553-4881)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (15-182)||(3-170)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (457-683)||(18761-18987)
scaffold0342 (32-400)||(18346-18711)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (18-263)||(26061-26306)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (507-683)||(622-798)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (192-683)||(8314-8805)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (509-683)||(68199-68373)
scaffold0066 (193-398)||(46963-47168)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (29-683)||(196606-197260)
scaffold0017 (130-263)||(19296-19429)
scaffold0017 (136-263)||(56961-57088)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (18-683)||(5745-6410)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (15-206)||(1968-2159)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (97-419)||(1681-2003)
scaffold0413 (544-683)||(1523-1662)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (536-683)||(844-991)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (80-246)||(10195-10361)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (556-680)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (355-607)||(24098-24350)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (17-207)||(1-191)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (19-401)||(3000-3382)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (193-398)||(3167-3372)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (193-398)||(24203-24408)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (18-263)||(4470-4715)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (97-215)||(39099-39217)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (193-398)||(271-476)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (193-398)||(3236-3441)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (104-263)||(137-296)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (193-398)||(18856-19061)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (73-214)||(27926-28067)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (203-398)||(5984-6179)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (193-398)||(9153-9358)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (193-398)||(13717-13922)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (220-398)||(3967-4145)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (196-398)||(15465-15667)
scaffold0132 (364-398)||(44347-44381)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (193-398)||(3351-3556)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (34-134)||(3405-3505)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (193-269)||(10232-10308)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (34-134)||(30418-30518)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (194-269)||(14030-14105)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (165-252)||(32677-32764)
scaffold0021 (509-596)||(71830-71917)
scaffold0021 (509-662)||(33021-33174)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (74-164)||(1-91)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (509-674)||(182-347)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22463026 - 22462356
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  22463026 cagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgctggtaatcaagcagagaatagtgatttcaaggttgataa-caaggtgtgttg 22462928  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22462927 agatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagcta 22462828  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462827 caaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagaaggctgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 22462728  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462727 ggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 22462628  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462627 actccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 22462528  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22462527 cggagatctacatttagaatattgttaagttgcatggagttccgtcaagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagttt 22462428  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22462427 acaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaag 22462356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20774834 - 20774166
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20774834 cagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttgtgagtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 20774735  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  20774734 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacctgggagcta 20774635  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20774634 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 20774535  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20774534 agttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgtcaagtttacctaat 20774435  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774434 acttcgagaggacatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 20774335  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20774334 cggagatctacattcagaatattgtgaaattgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagacagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagttt 20774235  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20774234 acaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 20774166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 28894235 - 28894903
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28894235 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28894334  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28894335 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28894434  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28894435 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 28894534  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28894535 agttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaat 28894634  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894635 actccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 28894734  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28894735 cggaaatctacattcagaatattgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagttt 28894834  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28894835 acaagatgtgttgggatcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 28894903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 28915706 - 28916374
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28915706 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28915805  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28915806 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28915905  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28915906 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 28916005  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28916006 agttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaat 28916105  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916106 actccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 28916205  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28916206 cggaaatctacattcagaatattgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagttt 28916305  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28916306 acaagatgcgttgggatcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 28916374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 28923061 - 28923729
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28923061 cagagaagcacaacaagttgatgttaagttcgtggatttgatggttgtgggtaatcaagccgaggagagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 28923160  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28923161 agatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagagcaacttgagtattcacccgggagcta 28923260  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28923261 caaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 28923360  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28923361 agttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttgcctaat 28923460  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923461 actccgagaggacatgattcgatatgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 28923560  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28923561 cggaaatctacattcagaatattgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagttt 28923660  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28923661 acaagatgcgttgggatcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 28923729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20822528 - 20821860
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  20822528 cagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtagatttgatagtcgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattg 20822429  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20822428 agatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagcta 20822329  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822328 cgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaagaaggatgtcgcacggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaa 20822229  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20822228 ggttgaacatcagaggcctgcgggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacctaat 20822129  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20822128 actccgagaggacatgattctatatgggttgtagttgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagttgg 20822029  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20822028 cggaaatctacattcagaatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccgaggtttacttcaagattttggaggagttt 20821929  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20821928 acaggacgcgttgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 20821860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 680
Target Start/End: Original strand, 21890052 - 21890717
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| || |  ||||||| |||||||||| ||| || || ||||||    
T  21890052 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtcgatttaatggttgctagtaatcaaactaaatatagtgacttcaaggttggtgatcagggtgtgttg 21890151  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || || || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  21890152 aggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaagtagctttagtattcatccgggagcta 21890251  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21890252 caaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgttcgacttgtcaaaagtctaa 21890351  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  21890352 ggttgagcatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttacaaaat 21890451  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  21890452 actccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtctataggttgacgaagtcgacacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 21890551  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21890552 cggagatttacattcataatattgtgaagttccatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagttt 21890651  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21890652 gcaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtc 21890717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 65 - 683
Target Start/End: Original strand, 22235263 - 22235881
Alignment:
Q  65 gtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagtt 164  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||| || ||||| |||||    
T  22235263 gtaatgaagctgaggatagtgactttaaggtcgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgaagagttgaaaaagtt 22235362  T
Q  165 gattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 264  Q
     |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22235363 aattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaag 22235462  T
Q  265 aaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccgg 364  Q
       || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22235463 cgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtgccgg 22235562  T
Q  365 agtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaa 464  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22235563 agtggaagtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatattggttgtggtcgacaggttgacgaa 22235662  T
Q  465 gtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagt 564  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||    
T  22235663 gtcggcgcactttattccgattaatattagttattcggtagcttagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagt 22235762  T
Q  565 atagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgc 664  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22235763 attgtgtcggatagggatccaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgc 22235862  T
Q  665 agacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22235863 agacagatggtcagtcgga 22235881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 17268692 - 17269294
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||    
T  17268692 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 17268791  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||| |||      
T  17268792 tcacaagagtagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgtcgctcat 17268891  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17268892 tttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaaggttgaccatcagaaacctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggata 17268991  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  17268992 gcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 17269091  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  17269092 tcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctgagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagg 17269191  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |   ||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17269192 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctctgggttcgaaattgagact-aattcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 17269290  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  17269291 cgga 17269294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 683
Target Start/End: Original strand, 24715832 - 24716487
Alignment:
Q  28 caagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggca 127  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||  || || ||  |||| || ||||| |    
T  24715832 caagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaa 24715931  T
Q  128 gaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatca 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24715932 gaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtacca 24716031  T
Q  228 tgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 327  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24716032 tgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcag 24716131  T
Q  328 aggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  24716132 aagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggc 24716231  T
Q  428 atgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacat 527  Q
    ||||| | || |||||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  24716232 atgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggcagagatttacat 24716331  T
Q  528 tcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttg 627  Q
    ||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |||    
T  24716332 tcataatatggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttg 24716431  T
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || || || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24716432 ggatcgaagttgaggttgagttcggcttagcatcctcagacagatggtcagtcgga 24716487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 683
Target Start/End: Original strand, 24619601 - 24620256
Alignment:
Q  28 caagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggca 127  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||  || || ||  |||| || ||||| |    
T  24619601 caagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaa 24619700  T
Q  128 gaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatca 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24619701 gaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtacca 24619800  T
Q  228 tgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 327  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24619801 tgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcag 24619900  T
Q  328 aggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  24619901 aagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggc 24620000  T
Q  428 atgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacat 527  Q
    ||||| | || |||||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  24620001 atgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggcagagatttacat 24620100  T
Q  528 tcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttg 627  Q
    ||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |||    
T  24620101 tcataatatggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttg 24620200  T
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || || || ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24620201 ggatcgaagttgaggttgagttcgacttagcatcctcagacagatggtcagtcgga 24620256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 683
Target Start/End: Original strand, 24748860 - 24749515
Alignment:
Q  28 caagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggca 127  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||  || || ||  |||| || ||||| |    
T  24748860 caagtcgatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagcgatttcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaa 24748959  T
Q  128 gaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatca 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24748960 gaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtacca 24749059  T
Q  228 tgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 327  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24749060 tgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcag 24749159  T
Q  328 aggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||    
T  24749160 aagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggacattatttctatggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggc 24749259  T
Q  428 atgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacat 527  Q
    ||||| | || |||||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  24749260 atgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggcacatttcattccaataaatattagttatccggtagcagagttggcagagatttacat 24749359  T
Q  528 tcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttg 627  Q
    ||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |||    
T  24749360 tcataatatggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttg 24749459  T
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || || || ||||  ||||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  24749460 ggatcgaagttgaggttgagttcgacttagcatccttagacagatggtcagtcgga 24749515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25849091 - 25848482
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  25849091 ctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttga 25848992  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  25848991 tgatagtcataagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 25848892  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25848891 gctcagtttgtttatgcctgtttgaattgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagt 25848792  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||  | || |||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||    
T  25848791 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagagcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgatgaagtcggcaca 25848692  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||     
T  25848691 ctttattcctatcaatatcagttatccagtagcacagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcg 25848592  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||  | |||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25848591 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 25848492  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  25848491 gtcagtcgga 25848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 14886343 - 14886952
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  14886343 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 14886442  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  14886443 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 14886542  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14886543 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 14886642  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || || ||||||||||| || |||||||| || ||| |||  || |||||| | || ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||    
T  14886643 gggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 14886742  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| || || ||||||    
T  14886743 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtca 14886842  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14886843 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 14886942  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  14886943 gtcagtcgga 14886952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 681
Target Start/End: Original strand, 21831068 - 21831720
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||| || |  || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  21831068 aagttgatgttaagtttgtagaattgttggttgctagtaatcaaactaaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcag 21831167  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21831168 aatttgtatccctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 21831267  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||   |||||  | | |||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  21831268 gacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcaaaaatctaaagttgaacatcaga 21831367  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
     |||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21831368 agcctactgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgaaaatgagatagcatatgcatggattttgtaacaagattaccgaatactccgagagggca 21831467  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||| | || ||||| || || || || ||| |||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  21831468 tgatgccatttgggtggttgttgatagattgtcgaagtcggcgcactttattccaatcaatattagttttccggtggctcagttggcggagatttatatt 21831567  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||| ||||  | |||| |||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  21831568 cgtgatattgtgaagctgcaccgtgttctgtcgagcattgtgtcagatagagatcgaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgg 21831667  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21831668 gttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacacatggtcagtcg 21831720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 21563269 - 21563934
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  21563269 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaacgtgtgttgaga 21563368  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||  || ||||||||||||| |  || | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  21563369 ttccgacacataatttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaa 21563468  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  21563469 agatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgccataaatctaaagt 21563568  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| |||||||  | ||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21563569 tgaacatcagaaacttgttgggttgttgacaccattggatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagtttaccgaatact 21563668  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||||| ||| | || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  21563669 ccaagagggcacgatgccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggcgg 21563768  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  21563769 agatttatattcgtgatattgtgaagctgcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 21563868  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| | ||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21563869 agaggcgttgggttctaagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacatatggtcagtcgga 21563934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 74 - 686
Target Start/End: Original strand, 24797749 - 24798361
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  24797749 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 24797848  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  24797849 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 24797948  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24797949 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 24798048  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || || ||||||||||| || |||||||| || ||| |||  || |||||| | || ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||    
T  24798049 gggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatgatgccatttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 24798148  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| || || |||||     
T  24798149 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttagcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 24798248  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  24798249 gatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttggggtcgaaactgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 24798348  T
Q  674 gtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||||||||    
T  24798349 gtcagtcggaaag 24798361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20343298 - 20342689
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  20343298 ctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 20343199  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||| |  |||||     
T  20343198 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaaagagatgtt 20343099  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20343098 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggacgtaccggagtggaagt 20342999  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || ||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||    
T  20342998 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtcgttgtcgaccggttgaggaagtcggcaca 20342899  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  20342898 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcg 20342799  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  20342798 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 20342699  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  20342698 gtcagtcgga 20342689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22503685 - 22503086
Alignment:
Q  84 tgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcat 183  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || ||||||    
T  22503685 tgattttaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcat 22503586  T
Q  184 aagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttg 283  Q
    ||||| |  ||||||||| | || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||| |  |||||  ||| |||||    
T  22503585 aagagtaggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttg 22503486  T
Q  284 tgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcat 383  Q
    | ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||    
T  22503485 tttatgcttgcttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtatcggagtggaagtgggacagtat 22503386  T
Q  384 ttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcg 483  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||| |     
T  22503385 ttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgaaagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattcct 22503286  T
Q  484 attaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacc 583  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |    
T  22503285 attaatatcagttatccggtagcacagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagggatc 22503186  T
Q  584 caaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22503185 cgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgcattgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgga 22503086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 88 - 683
Target Start/End: Original strand, 23079455 - 23080050
Alignment:
Q  88 ttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 187  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |    
T  23079455 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaaaa 23079554  T
Q  188 gcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgta 287  Q
    | |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||    
T  23079555 gtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgcgacgtagctcagtttgtgta 23079654  T
Q  288 tgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 387  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||    
T  23079655 tgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtcggacaatatttct 23079754  T
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||   ||||    
T  23079755 atggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattcatatta 23079854  T
Q  488 atatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaag 587  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |  ||||||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| ||  | ||    
T  23079855 atatcagttatccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagcattgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcggatagggattcgag 23079954  T
Q  588 gtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || || || || ||||  ||||| || ||||  |||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23079955 gttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggtttgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcgga 23080050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 21680071 - 21680436
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21680071 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 21680170  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||||| | || ||  | || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  21680171 aagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 21680270  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21680271 cgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 21680370  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatag 380  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680371 ggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatag 21680436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 559
Target Start/End: Original strand, 37542733 - 37543218
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| |||||||||||||| | || || |||||||| |||||| | ||    
T  37542733 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattcttga 37542832  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||     
T  37542833 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaaaagggatgtt 37542932  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  37542933 gctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccagagtggaagt 37543032  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||    
T  37543033 gggacattatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaagtcggcaca 37543132  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgt 559  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| |||||||    
T  37543133 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgt 37543218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 686
Target Start/End: Original strand, 20467455 - 20468060
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||    
T  20467455 atagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcaaaatttgtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 20467554  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    | | |  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    |||||  | | |    
T  20467555 taacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaacgtgatgtggcacag 20467654  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||| | ||||| || ||||||||| |||  ||||| || ||| ||||| | || || || || ||||||||||||||||    
T  20467655 tttgtatattcatgtttgatttgttaaaagtcaaaagttgagcattagaaacctgctgggttgatgacatctttagaagtgccagagtggaaatgggata 20467754  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || |||||    
T  20467755 gtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccaaaagggaatgacactatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctca-ttcat 20467853  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |   ||||||||||| | ||||| |||| ||| || || || |||||||||    
T  20467854 tccgattaatatcagttgtcctgtatctcagttgacggagatttacatccgcgatattgtgaagctacatggtgttctgtcaagcattgtatcagataga 20467953  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20467954 gatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtattatccgcagacagatggccagt 20468053  T
Q  680 cggaaag 686  Q
    | |||||    
T  20468054 ctgaaag 20468060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23472231 - 23471654
Alignment:
Q  106 ggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatc 205  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| | | |||  || | ||| |||||| |||    
T  23472231 ggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatc 23472132  T
Q  206 cgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtca 305  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||  |   ||| || ||| | |||||||  |||||    
T  23472131 cgggagctagaacgatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgttatgtggcatagttggtatattcctgtttgatatgtca 23472032  T
Q  306 gaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagt 405  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  23472031 gaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatataccatagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagt 23471932  T
Q  406 ttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtag 505  Q
    || || |||||||| |  ||| ||||  |||| || ||  | || || || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  23471931 ttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgtgtaattgttgatagattgacgaagtcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtat 23471832  T
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||  |||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23471831 ctcagttggcggagatttacattcgcaatattgtgaagctacatggttttccttcaagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttg 23471732  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||  |||||  |||| |  || ||||| || ||||  || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23471731 gaagagtttgaaagaggctttaggttctaagttgaggtttagttaggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcgga 23471654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Original strand, 14999126 - 14999700
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  14999126 gtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 14999225  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  14999226 gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 14999325  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  14999326 gtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 14999425  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| || ||| | ||| | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |    
T  14999426 ccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccgttgccc 14999525  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  14999526 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 14999625  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  14999626 aagtttgcaagaggttttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacatatggtcagtcgga 14999700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 25424216 - 25423619
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||| | |||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||    
T  25424216 atagtgattttaaaatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagag 25424117  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    |||||  || || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  25424116 tcatagaagtaa-ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacag 25424018  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || |||||  | ||||||||||||||||    
T  25424017 tttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgtcagagtggaaatgggata 25423918  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||| ||| || ||  |    
T  25423917 gtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagttggctcattttct 25423818  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||   |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  25423817 tccgattaatattagttttcctgtttctcaattggcagagatttatattcgagatatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagataga 25423718  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25423717 gatccaaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcag 25423619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19771050 - 19770385
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||  |||| |||||  | |||||||| ||  | ||  | ||||| |||||||||    
T  19771050 agaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgaga 19770951  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  19770950 ttccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga 19770851  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  19770850 agatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 19770751  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19770750 tgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatact 19770651  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || || || |||||||| |    
T  19770650 ccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttggcag 19770551  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  19770550 agatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 19770451  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19770450 agaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 19770385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 595
Target Start/End: Original strand, 26738116 - 26738600
Alignment:
Q  111 gttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccggga 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| ||||    
T  26738116 gttgagatttcgaggaagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcaggga 26738215  T
Q  211 gctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagt 310  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26738216 gctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagt 26738315  T
Q  311 ctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacc 410  Q
    | || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  26738316 caaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgtgatagcatatccatggattttgtgacgagtttgcc 26738415  T
Q  411 taatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcag 510  Q
     |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||| ||   |||||||||| || ||| ||  ||||     
T  26738416 gaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcatttccttctaattaatatcaattttcctgtttctcaa 26738515  T
Q  511 ttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26738516 ttggcggaaatttacattcgcgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttactt 26738600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 34567505 - 34566919
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  34567505 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 34567406  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  34567405 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 34567306  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  34567305 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 34567206  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  34567205 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 34567106  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34567105 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 34567006  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34567005 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 34566919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16357513 - 16356927
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16357513 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16357414  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16357413 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16357314  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16357313 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 16357214  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16357213 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 16357114  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  16357113 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagggatccaagatttacttc 16357014  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16357013 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16356927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 27667786 - 27668451
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||  |||| |||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  27667786 agaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgaga 27667885  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | |||||| |||| |    
T  27667886 tttcgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacga 27667985  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  27667986 agatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 27668085  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
     ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || ||  | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  27668086 cgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaaaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatact 27668185  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| |    
T  27668186 cctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccgttgcccagttggcag 27668285  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  27668286 agatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 27668385  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27668386 agaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27668451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 27684781 - 27685361
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  27684781 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 27684880  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  27684881 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 27684980  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  27684981 tcagaagtctaaaattgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 27685080  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || |    
T  27685081 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccg 27685180  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27685181 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 27685280  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  27685281 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 27685361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 29475448 - 29476034
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  29475448 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 29475547  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |  |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  29475548 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 29475647  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  29475648 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 29475747  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  29475748 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 29475847  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || || ||||| ||||| || ||| || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29475848 tccctgttgcccaattggcagagatttatattaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 29475947  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  | |||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29475948 tagattttggaaaagtttgcaagaggcttggggttcgaagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 29476034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41771853 - 41771267
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  41771853 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 41771754  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  41771753 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 41771654  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  41771653 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 41771554  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||| ||| ||||    
T  41771553 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattagtattagtt 41771454  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41771453 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 41771354  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || || | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41771353 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttcagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 41771267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21497101 - 21496792
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    |||||||| || ||||  || |||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | || || ||||| ||    
T  21497101 ctagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgatttgaaaaa 21497002  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21497001 gttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtctgggttg 21496902  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21496901 aaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgc 21496802  T
Q  362 cggagtggaa 371  Q
    | ||||||||    
T  21496801 cagagtggaa 21496792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22349409 - 22348848
Alignment:
Q  122 gaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaat 221  Q
    |||| |||||||||||||  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  22349409 gaggaagaatttgtattctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagat 22349310  T
Q  222 gtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgag 321  Q
    ||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||||||    
T  22349309 gtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgag 22349210  T
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    |||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  22349209 catcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactccta 22349110  T
Q  422 gggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
    | ||| | ||  | ||  ||||| | || || ||||||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||    
T  22349109 gagggaacgacgcaattagggttattgttgataggttgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccctgttgcccagttggcagagat 22349010  T
Q  522 ctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagat 621  Q
     || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||     
T  22349009 ttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagag 22348910  T
Q  622 gtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22348909 gctttgggttcgaagcagagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 22348848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22135757 - 22135093
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  22135757 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagat 22135658  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  |||  || ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22135657 tccgagaaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 22135558  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    | |||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || |||    
T  22135557 gatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgaggtgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtt 22135458  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    |||||||| |  ||| | ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22135457 gagcatcaaaaacctactggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 22135358  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| ||||| || ||  |  |||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||    
T  22135357 ctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcggctcattttctaccgatcaatattagtttccctgttgcccagttggcaga 22135258  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22135257 gatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 22135158  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22135157 gaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcgga 22135093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27611359 - 27610779
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  27611359 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 27611260  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  27611259 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 27611160  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  27611159 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacg 27611060  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||| ||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || |    
T  27611059 agtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacaaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctg 27610960  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27610959 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 27610860  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27610859 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggtgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27610779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 22332262 - 22332848
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  22332262 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 22332361  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  22332362 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22332461  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||| ||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||    
T  22332462 agtttgccagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccggaatggaagtgggatagtatatccatggatttt 22332561  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  22332562 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 22332661  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||||||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22332662 tccctgttgcccagttggcggagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 22332761  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22332762 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagaaagatggtcagtcgga 22332848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27519418 - 27518832
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  27519418 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27519319  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  27519318 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27519219  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  27519218 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 27519119  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || ||  ||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  27519118 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 27519019  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27519018 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 27518919  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27518918 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcgacgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27518832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 21338672 - 21339247
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  21338672 gatgatcagggagtattgagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21338771  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||  | | ||| |||||| | |||||    
T  21338772 gtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcttgttt 21338871  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
     | |||||| ||||| || |||||||||||||  ||| | ||  || ||  | | || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21338872 aatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctacggggatgatggtatctttagatgtgccagattggaaatgggatagcatatccatggatttt 21338971  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |  ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||           || |||||||||||||||    
T  21338972 gtgacgagtttgccgaatactcttaaagggaatgacgcaatttgggtgatcgttgatagattgacgaagtc-----------ttccgattaatatcagtt 21339060  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  21339061 ttcctgtgtctcagttggcggagatttatattcgcgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttc 21339160  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21339161 tagattttggaagagtttgcaagaggttttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 21339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Original strand, 37290883 - 37291457
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||  ||| ||  | | |||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  37290883 gtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacattgaagagattaggaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 37290982  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    ||||||||    
T  37290983 gagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtctgtcagaa 37291082  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  37291083 gtagaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 37291182  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || || ||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |    
T  37291183 ccaaacactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccctgttgccc 37291282  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  37291283 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 37291382  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37291383 aagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 37291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40709791 - 40709205
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  40709791 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 40709692  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  40709691 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 40709592  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  40709591 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 40709492  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || ||  ||||||||||||| || || ||  |  |||||||||| || |    
T  40709491 gtgacgagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaagtcagctcattttctaccgattaatattagct 40709392  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40709391 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgttaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 40709292  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40709291 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 40709205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 382 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22381907 - 22381606
Alignment:
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  22381907 atttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttctggttgataggttgacgaagtcggcacacttcattc 22381808  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22381807 ctattaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttatgttcaaaacattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggataggga 22381708  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  22381707 tccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttaggcagatggtcagtcg 22381608  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  22381607 ga 22381606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23574819 - 23574167
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||   |||| || ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  23574819 agaagcacaaaaaattgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagattgaggatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaga 23574720  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||| |||||        ||||  || || | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  23574719 ttccgaggccgaatttgtattcctgatgatga--------agaaaatgtttattgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 23574628  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |    
T  23574627 agatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagat 23574528  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  23574527 tgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatact 23574428  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| ||||  | |  |||||  | || ||     ||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |    
T  23574427 cctagagggaatgacacaaattgggtgattgttga-----tgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttccggttgcccagttggcag 23574333  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||  ||  || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  23574332 agatctatattaaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcatttattgatccaagatttacttctagattttggaagagtttgca 23574233  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23574232 agaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 23574167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 21408116 - 21407643
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatg-aggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| |  || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21408116 atttgtattcctgatgatacaggaat-gaaaaagatgattctagaacaaagtcacagaagtaatttgagtattcatgcaggagctacaaaaatgtatcat 21408018  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||||   |||||  | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||    
T  21408017 gatttgaagaatttattttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcaaaagttgaacaccaga 21407918  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||  || ||||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  || ||    
T  21407917 aacctgttggtttgttgacacctttagatattccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactccaaaaggaca 21407818  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    | || |||| |||||  | || || |   | ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||     
T  21407817 ttatgcgatttgggtaattgtggatacactaacgaagtcggcccattttattccgattaacatcagttttcctgtatctcagttggcggagatttatatc 21407718  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattt 603  Q
    |   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21407717 cgtgagattgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattt 21407643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18776769 - 18776198
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  18776769 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 18776670  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| | || ||||||| |||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  18776669 gagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaa 18776570  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| ||| | |||| ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  18776569 gtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccgaaatggatatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 18776470  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || |||| ||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  18776469 ccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgaagaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 18776370  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    | ||||||||||| || ||  || | ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  18776369 aattggcggagatttaaatcaaggagattatgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 18776270  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     ||||| ||||| |  || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18776269 gagtttgcaagaggccttaggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 18776198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Original strand, 21497772 - 21497997
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21497772 ttgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttatattcatgatattgtgaagttgcatggtgttc 21497871  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
      ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||    
T  21497872 t-tcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctggattttggaaaattttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgta 21497970  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  21497971 tcatccgcagatagatggtcagccgga 21497997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 488 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21496760 - 21496569
Alignment:
Q  488 atatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaag 587  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  21496760 atattagttttccggtagctcagttggcggatatttatattcataatattgtgaagttgcatggggttccatcaagtattgtgtcggatagagatccgag 21496661  T
Q  588 gtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| |||   ||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  21496660 gttcacttctagattttggaagagtttgcaaaatgccctgggttctaagttaaggttgagttcggcttatcattcgcaaatagatggtcagt 21496569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23517114 - 23516966
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  |||||||| |    
T  23517114 attgtgagattgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttgaaagagtttgcaagagggtttgggttcta 23517015  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23517014 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 23516966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23441296 - 23440899
Alignment:
Q  22 gcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagattta 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || || || ||||| || || |||||||||||      
T  23441296 gcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattcc 23441197  T
Q  122 gaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaat 221  Q
    ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  23441196 gaggtcggatttgcattcgtgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagat 23441097  T
Q  222 gtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgag 321  Q
    ||||||||| || |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||   |||||| ||||| ||| ||||     
T  23441096 gtatcatgatttaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtagcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcataagtcgaagattgaa 23440997  T
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23440996 catcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 23440899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 20800527 - 20799999
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || || || ||||| || || |||||||||||  ||||  |    
T  20800527 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcg 20800428  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||| |||||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  20800427 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 20800328  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||| ||| ||| || | ||| |||    
T  20800327 gatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaggtcgaagattaaacattaga 20800228  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| |    
T  20800227 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgcgtttaccgaatactcctagagggaa 20800128  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | || |||||| |  | || || ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||| || | ||| || || |||||||| ||||| || ||     
T  20800127 tgacgcaatttgggttattattgatagattgacaaagtcggctcattttctaccgattaatattaggtttcctgttgcccagttggcagagatttatatc 20800028  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttcc 557  Q
     || | ||||||||||||||||| |||||    
T  20800027 aaggagattgtgaagttgcatggtgttcc 20799999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 554 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20799314 - 20799185
Alignment:
Q  554 ttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggc 653  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||| |||||||| |||    
T  20799314 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaaaagtttgcaagaggttttgggttctaagttgagattgagtttggc 20799215  T
Q  654 ttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  20799214 ttattatccgcggacagatggtcagtcgga 20799185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 571 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23440762 - 23440650
Alignment:
Q  571 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgg 670  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  23440762 tcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggtgtatcatccgcagacag 23440663  T
Q  671 atggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||||    
T  23440662 atggtcagtcgga 23440650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 21936659 - 21936864
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| | || ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  21936659 ttgagtattcacccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 21936758  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21936759 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 21936858  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  21936859 ttttgt 21936864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24582107 - 24581902
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||   ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  24582107 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctgtaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 24582008  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24582007 gtttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 24581908  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  24581907 ttttgt 24581902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27011978 - 27011776
Alignment:
Q  196 agtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtt 295  Q
    |||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||  |||||| ||||| ||||    
T  27011978 agtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggtctggaatgaagaaggagattactgagtttgtttatgcttgtt 27011879  T
Q  296 tgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattt 395  Q
    ||  ||||||||| || ||| |||| ||||||||  |  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  27011878 tggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaacgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgagatagcatttctatggactt 27011779  T
Q  396 tgt 398  Q
    |||    
T  27011778 tgt 27011776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23517616 - 23517395
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||| | ||| ||||||||||  | ||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||    
T  23517616 agaagcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttattggttgctagtaatcagacagaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaga 23517517  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||  |||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||  |    
T  23517516 ttccgaggtcgaatttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatga 23517417  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaa 239  Q
    | |||||||||||  |||||||    
T  23517416 agatgtatcatgatctgaagaa 23517395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 683
Target Start/End: Original strand, 37545328 - 37545457
Alignment:
Q  554 ttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggc 653  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || |||| || |||||| || |  |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  37545328 ttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaattttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggc 37545427  T
Q  654 ttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  37545428 ttatcatcctcaaacagatggtcagtcgga 37545457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 683
Target Start/End: Original strand, 922 - 989
Alignment:
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  922 caagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 328
Target Start/End: Original strand, 25243822 - 25243956
Alignment:
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtg 293  Q
    |||||||| |||  ||||| || || |||||||| || || |||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| | | |  ||||||| |||| ||    
T  25243822 tgagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaagatttaaagatgttgttttggcggcctggagtgaagaaggatataaatgagtttgtgcatgcttg 25243921  T
Q  294 tttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25243922 tttgatttgtcagaagtctaagattgaacatcaga 25243956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 328
Target Start/End: Original strand, 25307974 - 25308108
Alignment:
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtg 293  Q
    |||||||| |||  ||||| || || |||||||| || || |||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| | | |  ||||||| |||| ||    
T  25307974 tgagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaagatttaaagatgttgttttggcggcctggagtgaagaaggatataaatgagtttgtgcatgcttg 25308073  T
Q  294 tttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25308074 tttgatttgtcagaagtctaagattgaacatcaga 25308108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 628 - 683
Target Start/End: Original strand, 26738611 - 26738666
Alignment:
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26738611 ggttctaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcgga 26738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 326
Target Start/End: Original strand, 16065313 - 16065379
Alignment:
Q  260 tgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  16065313 tgaagaaggatgtcacagagtttgtgtatgcttgattgatttatcagaagtctaagattgagcatca 16065379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23504339 - 23504134
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  23504339 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 23504240  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  |||||| || || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  || ||||  ||| || |||||||| |||||||| || | ||||||    
T  23504239 gtttggtttgtcaaaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaactgttgtttgtgccagagtggaattgggatagtatctttatgga 23504140  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  23504139 ttttgt 23504134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21881865 - 21881729
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||| |  |||||||| | || ||||||||||| |||||  | |||||| | | |||||||||| |     
T  21881865 cttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcataatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacacgatgtcgcacagtttgtgtattcc 21881766  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21881765 tgtttagtttgtcagaagtcaaagattgaacatcaga 21881729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23517270 - 23517215
Alignment:
Q  364 gagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  23517270 gagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 23517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 537; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 686
Target Start/End: Original strand, 347 - 1019
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  347 cagagaagcacaacaagttgatgttaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagcggagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttg 446  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgatttt-agaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  447 agatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagct 546  T
Q  214 acaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtcta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  547 acaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttatcggaagtcta 646  T
Q  314 aggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647 aggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaagtaccagagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 746  T
Q  414 tactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttg 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  747 tactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagtta 846  T
Q  514 gcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtt 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  847 gcggagatctacattcagaatattgtgaaattgcatggggttccgtcgagtatagtgtcaaatagagacccaaagtttacttgaagattttggaagagtt 946  T
Q  614 tacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  947 tacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcattcggaaag 1019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 686
Target Start/End: Original strand, 20855943 - 20856615
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20855943 cagagaagcgcaacaagttgatgttaagtttgtggatttgatggtcgctagtaatctagcggagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggtgtgttg 20856042  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20856043 agattaagaggcagaatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagcta 20856142  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa-gaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtcta 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20856143 caaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttttaaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttcacttgttagaagtcta 20856242  T
Q  314 aggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856243 aggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 20856342  T
Q  414 tactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttg 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856343 tactccgagagggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattctgattaatatcagttatccagtagctcagttg 20856442  T
Q  514 gcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtt 613  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20856443 gcggagatctacatttagaatattgttaagttgcatggtgttccgtcaagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagtt 20856542  T
Q  614 tacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20856543 tacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggaaag 20856615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 20939248 - 20939914
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20939248 gagaagcacaacaagtggatgtgaaggttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 20939347  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||     
T  20939348 attcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 20939447  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20939448 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 20939547  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  20939548 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacgc 20939647  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20939648 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcgacgcactttatttcgattaatatcaattattcggtagctcagttggcg 20939747  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  20939748 gagatttatattcataatataatgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 20939847  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || |||||||  || ||||    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20939848 aagacgttttgggttagaagttgaggccgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 20939914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 19662385 - 19662992
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19662385 atagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaag 19662484  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| |||      
T  19662485 tcacaagagtagcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaa 19662584  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgt----accggagtggaaatgg 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||    
T  19662585 tttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagagttgttgacaccgttggatgtgccggccggagtggaagtgg 19662684  T
Q  376 gatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcact 475  Q
     ||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19662685 tatagcatttttatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatgtgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcacact 19662784  T
Q  476 tcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcaga 575  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  19662785 ttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcgga 19662884  T
Q  576 tagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggt 675  Q
    ||| || || ||||| || || ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19662885 tagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttacaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggt 19662984  T
Q  676 cagtcgga 683  Q
    ||||||||    
T  19662985 cagtcgga 19662992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19855479 - 19854821
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  19855479 gagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgag 19855380  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| |||||| ||| |||||||||     
T  19855379 gttcagaggaaggatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagaatagcttaagtattcatctgggagctacg 19855280  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||| |  |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19855279 aaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaaacgggatattgctcaaattgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 19855180  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  19855179 ttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttggatgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 19855080  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||        ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19855079 tccgagagggcatgatgctatatgggttgt--------ggttgacaaagtcggcgcactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggcg 19854988  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  19854987 gagatttatattcataacatggtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 19854888  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19854887 aagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 19854821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 20835085 - 20835739
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  20835085 gagaagcacaactagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 20835184  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||           || ||  ||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||     
T  20835185 gttcagaggaagaatttgcattcccgatgatgatga-----------tggttc-agaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 20835272  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20835273 aaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagatgtctaagg 20835372  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20835373 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacac 20835472  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20835473 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacatgttgacaaagtcgacgcattttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcg 20835572  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  || | ||    
T  20835573 gagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagaattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagctgac 20835672  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  20835673 aagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagacggtcaatcgga 20835739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 24098788 - 24099454
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| ||||| ||  ||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| || || || || |||||    
T  24098788 gagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttgatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgacgatcagggtgttttgag 24098887  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  24098888 gttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctaca 24098987  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24098988 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgctcattttgtttatgcttgcttgacttgtcagaagtctaagg 24099087  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24099088 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacac 24099187  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    | |||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24099188 tacgagagggcatgatgctatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacatttcattccaatcaatatcagttatccggtagcacagttggcg 24099287  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| | || || || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||| |    
T  24099288 gagatttatgttcataacattgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgc 24099387  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||| || |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24099388 aagatgctttgggatcgaggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 24099454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 31539245 - 31539848
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||||||  ||||||| || || ||| |||| || | ||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  31539245 atagtgatttcaaaattgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagag 31539344  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |    
T  31539345 tcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcag 31539444  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31539445 tttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggaca 31539544  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  31539545 gtatctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcat 31539644  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||||    
T  31539645 tcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggataga 31539744  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31539745 gatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaaaatgaagttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 31539844  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  31539845 cgga 31539848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37678197 - 37677588
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  37678197 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 37678098  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  37678097 ggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgtt 37677998  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||  |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  37677997 gcttagtttgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 37677898  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  37677897 gggatagtatctctatggattttgtaactagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 37677798  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| || || |||||     
T  37677797 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 37677698  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  37677697 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 37677598  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  37677597 gtcagtcgga 37677588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 82 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20295521 - 20294920
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20295521 agtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtc 20295422  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    | ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |||    
T  20295421 acaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtt 20295322  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |      
T  20295321 tgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagtgggacatt 20295222  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||| | || ||| |||||||||||||||| || ||||||     
T  20295221 atctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttattgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattc 20295122  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    | ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  20295121 ctattaatatcagttactcggtagcacagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggga 20295022  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| ||||| || || ||||  ||| |||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20295021 tccgaggttcacttctaggttctggaagagtctacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcg 20294922  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  20294921 ga 20294920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 316 - 683
Target Start/End: Original strand, 22432600 - 22432967
Alignment:
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  22432600 gttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaaca 22432699  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22432700 ctccgagagggcataattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggc 22432799  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  || || ||||  |||||     
T  22432800 tgagatttatattcagaaaattgtgaagctgcatgaagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttataggttctggaagagtttg 22432899  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22432900 caggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 22432967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21750034 - 21749449
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| | ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  21750034 gatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtaggatttgtattccagatgat-atgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 21749936  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  21749935 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgttt 21749836  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  21749835 gatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctctagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 21749736  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  21749735 gtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagtt 21749636  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21749635 ttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 21749536  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21749535 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21749449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 687
Target Start/End: Original strand, 50619509 - 50620099
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||| || | |||||    
T  50619509 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttga 50619608  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  50619609 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 50619708  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||  |  ||  | | || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  50619709 gatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggattatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 50619808  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||  ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||    
T  50619809 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagttggctcatttcatcccgattaatatcagtt 50619908  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||  ||  |||||||||| ||||| || |||    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50619909 ttcttgtttctcagttggcagagatttatatttgtgatattgtgaaattgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 50620008  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
     ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50620009 tagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaga 50620099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21952018 - 21951678
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21952018 agtgattttaaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatccttgaagagagtc 21951919  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    | ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||    
T  21951918 acaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtt 21951819  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  21951818 tgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagt 21951719  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgag 422  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21951718 atctctatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgag 21951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 22361509 - 22362095
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  22361509 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagaaacttga 22361608  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    || ||  |   |||||||||| | |||||    
T  22361609 gtattcatccgggagctacgaagatctatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcatagtttgtgtattcttgttt 22361708  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22361709 gatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 22361808  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| | ||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  22361809 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaacgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 22361908  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||   | ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22361909 ttcctgtttattagttggcggagatttatattcgaaatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagacccaagatttacttc 22362008  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  ||  | || || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22362009 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttaagatctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacatatggtcagtcgga 22362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21838038 - 21837458
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | || ||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  21838038 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 21837939  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  21837938 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 21837839  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  21837838 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 21837739  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || |    
T  21837738 agtttgccaaatactcccagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctg 21837639  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21837638 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 21837539  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21837538 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 21837458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 20139992 - 20139401
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |||  ||| ||    
T  20139992 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaatatcgatgaccaaggtgtgttgaggtttcaaggtag 20139893  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
     ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  20139892 gatttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 20139793  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||| ||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||    
T  20139792 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtctattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcattaga 20139693  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||  || ||  | | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |    
T  20139692 aacctgctggtatgatggtatcattagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaa 20139593  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | || |||||  | || || || ||||||||||| || || ||  || |||||||||| ||||  || ||  ||| |||||| || || ||||||    
T  20139592 tgacacaatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcagctcattttcttccgattaatattagtttccctgtttctcggttggcagaaatttacatt 20139493  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
      | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20139492 tgggatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttacaaga 20139401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 16349869 - 16350450
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcag-aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 201  Q
    ||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||    
T  16349869 caaggtgtgttgagattccgaggaagtaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatt 16349968  T
Q  202 gatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgactt 301  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   ||    
T  16349969 catccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagttt 16350068  T
Q  302 gtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16350069 gtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgac 16350168  T
Q  402 aagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatcca 501  Q
     ||||| ||||||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| || |  ||     
T  16350169 gagtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagcttccct 16350268  T
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16350269 gttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagat 16350368  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16350369 tttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16350450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21831397 - 21830811
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  21831397 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21831298  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || || |||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  21831297 gtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 21831198  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  21831197 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 21831098  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |   ||||||||| ||||    
T  21831097 gtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctacagattaatattagtt 21830998  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || || ||||| ||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21830997 tccctgttgcccaattggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 21830898  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21830897 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21830811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 51332758 - 51333344
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  51332758 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 51332857  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  51332858 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 51332957  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  51332958 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 51333057  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  |||||||||| ||||    
T  51333058 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctaccgattaatattagtt 51333157  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51333158 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 51333257  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51333258 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 51333344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 33390300 - 33390880
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  33390300 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 33390399  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  33390400 atccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 33390499  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
     |||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| ||  | || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  33390500 ccagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttaaacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 33390599  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    |||||  | |||||||| || |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || |    
T  33390600 agtttgtcgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctg 33390699  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33390700 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 33390799  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33390800 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 33390880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19107462 - 19106875
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| || || | ||| | |||||    
T  19107462 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagccacaggagtagcttga 19107363  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||||| ||||||||||   |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  19107362 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagcgagatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 19107263  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || | |||||||||||| || || |||||||||    
T  19107262 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaattgaaatgggatagtatatcaatggatttt 19107163  T
Q  397 -gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagt 495  Q
     ||||  ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || ||||||||||| |  || ||  |  | |||||||| |||    
T  19107162 tgtgatgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcagttcattttctaccaattaatattagt 19107063  T
Q  496 tatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
    | ||| || || ||||| || ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||    
T  19107062 tttcctgttgcccagttagcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaatatttactt 19106963  T
Q  596 caagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19106962 ctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 19106875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20250895 - 20250379
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  20250895 gatgatcaaggtatgttgaggttttgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 20250796  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||||    |||||  | | |||||||||| | | |||    
T  20250795 gtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttattt 20250697  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||||||    
T  20250696 gatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatacatggatttt 20250597  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| || |  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  20250596 gtgacgagttttccgaatactcctaaagggaattacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagtt 20250497  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  20250496 ttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaattggcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagaaatccaagatttacttc 20250397  T
Q  597 aagattttggagaagttt 614  Q
     |||||||||| ||||||    
T  20250396 tagattttggaaaagttt 20250379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Original strand, 17044313 - 17044866
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |    
T  17044313 atttgtattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacg 17044412  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    | || |||||| | || |||||||||||||||||  | |||||  |   |||||||||| | || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  17044413 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacaagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 17044512  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| |     
T  17044513 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcagagagggaac 17044612  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||| | || |||||  | || || || |||||||||| ||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||| || ||      
T  17044613 gatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagttggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccaattggcagagatttatatca 17044712  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
    || | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  |||||    
T  17044713 aggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagacagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctttggg 17044812  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17044813 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatctgcagacagatggtcagtcgga 17044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16373691 - 16373457
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||    
T  16373691 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtag 16373592  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  16373591 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcat 16373492  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16373491 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaa 16373457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 687
Target Start/End: Original strand, 19760121 - 19760721
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||  |||  ||| ||||| | ||||| ||    
T  19760121 atagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgattccgaggtagaatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaagagag 19760220  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || | |||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  19760221 tcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacag 19760320  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||       || |||||||||||||   |||  || ||| ||  | | || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  19760321 tttgtatattcatgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcagaaatctgttgggttgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgagata 19760413  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||  ||||  | || |||||  | || || || ||||| |||||||| || || ||    
T  19760414 gtatatccatggattttgtgacaagtttgccgagtactccgaaaggaaatgacgctatttgggtgattgttgatagattgacaaagtcggctcatttaat 19760513  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| || |||| |||||||| |||||     ||||||||||| | ||||| ||||| ||||  || || || ||||||    
T  19760514 ttcgattaatatcagttttcatgtatcttagttagcggagatttacatctgcgatattgtgaagctacatggtgttccatcgaacattgtatcggataga 19760613  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     | || |||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19760614 aatccgaggtttacctctagattttagaagagtttgcaagaagctttaggttctaagttgaagttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagt 19760713  T
Q  680 cggaaaga 687  Q
    ||||||||    
T  19760714 cggaaaga 19760721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22110151 - 22109887
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  22110151 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaa 22110052  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22110051 aatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttg 22109952  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 326  Q
    ||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||| ||||||  || |||||||||||    
T  22109951 aaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatca 22109887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22114000 - 22113736
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  22114000 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaagatcgatgaccaaggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaa 22113901  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22113900 aatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccacgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttg 22113801  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 326  Q
    ||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||| ||||||  || |||||||||||    
T  22113800 aaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatca 22113736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Original strand, 41352848 - 41353249
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||  ||||  ||||  | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  41352848 agaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgaga 41352947  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  41352948 ttccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 41353047  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  41353048 agatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 41353147  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  41353148 tgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatact 41353247  T
Q  418 cc 419  Q
    ||    
T  41353248 cc 41353249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16370031 - 16369805
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||| | ||||| ||||    
T  16370031 ttgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatagctcagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaagctacatggtgttc 16369932  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    | ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||   |||| ||||| |  || || |  || ||||  ||||||||||| ||    
T  16369931 cttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattttggaagggtttgcaagaggctttaggctataagttgaggttgagttcggcgta 16369832  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16369831 tcatccgcagacagatggtcagtcgga 16369805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Original strand, 16078016 - 16078503
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || | |||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| |     
T  16078016 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcc 16078115  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    |||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||    
T  16078116 tgtttagtctgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgg 16078215  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||||  | || || || ||||  |||||||| || ||  |  ||||||||||    
T  16078216 attttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgagtaagtcggctcattttctaccgattaatat 16078315  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     |||| ||  || || || ||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| |||||  |||    ||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  16078316 tagttttcatgttgcccaattggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggtcttc----gagcattgtatcagatagagatccaagattt 16078411  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16078412 acttctagattttggaagagtttgcaagaggctttggcttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcgga 16078503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 20830753 - 20830958
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  20830753 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 20830852  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20830853 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 20830952  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  20830953 ttttgt 20830958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 23197433 - 23197594
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||| || ||| | || ||||  ||||||| || || |||||||| || || |||||||| |    
T  23197433 gaagcacagcaagtggatgttaagtttgtggatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgactttaaagttgatgatcagggtgtgttgaggt 23197532  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagt 180  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23197533 tcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagt 23197594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 683
Target Start/End: Original strand, 41354208 - 41354320
Alignment:
Q  571 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgg 670  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  41354208 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacag 41354307  T
Q  671 atggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| |||||    
T  41354308 atggtcaatcgga 41354320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41308406 - 41308333
Alignment:
Q  610 agtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41308406 agtttgcaagatgccttgggttctaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 41308333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20937804 - 20937686
Alignment:
Q  301 tgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtga 400  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  20937804 tgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtga 20937705  T
Q  401 caagtttacctaatactcc 419  Q
    | ||||| || ||||||||    
T  20937704 cgagtttgccaaatactcc 20937686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27901546 - 27900879
Alignment:
Q  16 agagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27901546 agagaagcacaacaagttgatgcaaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttga 27901447  T
Q  116 gatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  27901446 gatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccggaagctac 27901347  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901346 aaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 27901247  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901246 gttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 27901147  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901146 ctccgagagggcatgattctatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 27901047  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27901046 agagatttacattcataatattgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccggggtttacttcaagattttggaagagttta 27900947  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27900946 caagatgcattgggttcaaaattgaggttgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcgga 27900879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 1648390 - 1649056
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1648390 gagaagctcaacaggtggatgtaaaatttgttgatttaatgattgctggtaatgaaactgagaatggtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttgag 1648489  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1648490 attcagaagcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 1648589  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1648590 aagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgcacagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 1648689  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1648690 ttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatatactggagtggaaatgggacagcatttctatggattttgtaacgagtttacctaatac 1648789  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||     
T  1648790 tccgagagggcataattctatatgggttgtggtcgataggttgactaagtcggcacatttcattcctattaatattagttattcggtagctcagttggct 1648889  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || |||||  ||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |    
T  1648890 gagatttatattcatcatattgtgaagcttcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttccagattttagaagagtttgc 1648989  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1648990 aggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 1649056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 15002475 - 15003143
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||  ||| ||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  15002475 cagagaagcacaacaagatgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 15002574  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| || |||||| ||||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  15002575 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagcta 15002674  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15002675 caaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcattttgtctatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaa 15002774  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  15002775 ggttgagcatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttagatgtgccagagcggaagtgggagatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaac 15002874  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  15002875 actccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatgttagttatccggtagctcggttgg 15002974  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  15002975 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggaaagagacccgaggttcacttcaagattttggaagagttt 15003074  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15003075 gcaagatgcattgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 15003143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15247083 - 15246417
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15247083 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 15246984  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || || || |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  15246983 gttcaggggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 15246884  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15246883 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgagctgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 15246784  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  15246783 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacac 15246684  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  15246683 tccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatattagttatccaatagctcagttggca 15246584  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  15246583 gagatttatattcacaatattgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtatcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 15246484  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15246483 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccccagacagatggtcagtcgga 15246417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8707065 - 8706411
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  8707065 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcag 8706966  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  8706965 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtaacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcat 8706866  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  8706865 gacttaaagaaattgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcaga 8706766  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
     |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  8706765 agcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgagatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggca 8706666  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||| | || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  8706665 tgatgccatttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggcgcactttattccaatcaatattagttttccggtggctcagttggcggagatttatatt 8706566  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||     
T  8706565 cgtgatattgtgaagctgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttga 8706466  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8706465 gttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 8706411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 15078792 - 15078130
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||||  |    ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15078792 gaagcacagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggatgctagtaatcaaactgaagaggaagatttcaaggtcgatgagcagggtgtgttaaggt 15078693  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||   ||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||  || | ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  15078692 tcagaggaagaatttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaa 15078593  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15078592 gatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggttcggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggtt 15078493  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || ||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  15078492 gaacatcagaagcctgcagggttaatgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaatactc 15078393  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||    
T  15078392 cgagagggcatgataccatttgggttgttgttgaaaggttgatgaagtcggcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagcttagttggtgga 15078293  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  15078292 gatttacattcataatattgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggtttacttcaagattttggaagagtttgcaa 15078193  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15078192 gatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcg 15078130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 3263964 - 3264573
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  3263964 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 3264063  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  3264064 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 3264163  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3264164 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 3264263  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  3264264 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 3264363  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  3264364 cttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 3264463  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  3264464 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 3264563  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  3264564 gtcagtcgga 3264573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 88 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 33224011 - 33223416
Alignment:
Q  88 ttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 187  Q
    |||||||||||||| || || ||  || | || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33224011 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgtggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataaga 33223912  T
Q  188 gcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgta 287  Q
    | |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||    |||||  ||| |||||||||    
T  33223911 gtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgta 33223812  T
Q  288 tgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||    
T  33223811 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggaatggaagtgggacagtatctct 33223712  T
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |    
T  33223711 atggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttggattgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcctatca 33223612  T
Q  488 atatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaag 587  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |  ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  33223611 atatcagttatccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagcattgtgaagctacatggtgtcccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgag 33223512  T
Q  588 gtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| ||||| || || ||||  |||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33223511 gttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 33223416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15320294 - 15319644
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| || ||||  || ||||  ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||    
T  15320294 ttgatgtcaggtttgtggatttaatagttacccgtaattaaactgaagatggtgacctcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaat 15320195  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    ||  ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |  || | ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  15320194 ttacattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttaaaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgac 15320095  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  |   |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||    
T  15320094 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcatagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaa-atcagaagc 15319996  T
Q  332 ctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatga 431  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15319995 ctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcgagagtggaagtgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 15319896  T
Q  432 ttcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcag 531  Q
    | | || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||     
T  15319895 taccatttgggttgttgttgataggttgacgaactcggggcattttatcccgatcaatattagttttccggtagctcagttggcggaaatttatattcat 15319796  T
Q  532 aatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggtt 631  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |  |||||||    
T  15319795 aatattgtgaagttgcatggtgtcccatcgagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttgggtt 15319696  T
Q  632 caaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15319695 caaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 15319644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 11206407 - 11207010
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  11206407 atagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagag 11206506  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| || || |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |    
T  11206507 tcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcag 11206606  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11206607 tttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggaca 11206706  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  11206707 gtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccgattgacgaagtcggcacacttcat 11206806  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11206807 tcctattaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatatacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggataga 11206906  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || |  ||||| ||||| || || | ||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  11206907 gatctgaggttcacttctaggttcttgaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 11207006  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  11207007 cgga 11207010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 29452707 - 29453316
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  29452707 ctgaggataatgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 29452806  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  29452807 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgtt 29452906  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||  ||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29452907 gctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggtggagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 29453006  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  29453007 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 29453106  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  29453107 tttcattcctattaacatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 29453206  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  29453207 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 29453306  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  29453307 gtcagtcgga 29453316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 681
Target Start/End: Original strand, 44661042 - 44661643
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  44661042 atagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 44661141  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |    
T  44661142 tcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcag 44661241  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||  | ||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44661242 ttcttttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggctgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggata 44661341  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  44661342 gtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaagtcggcacacttcat 44661441  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44661442 tcctatcaatatcaattatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggataga 44661541  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  44661542 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 44661641  T
Q  680 cg 681  Q
    ||    
T  44661642 cg 44661643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20892085 - 20891475
Alignment:
Q  73 gctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttag 172  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||  |  |||| || ||||  ||| |||||||| ||||| | || || ||||||||||||||| | |    
T  20892085 gctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtttcctgaggttcagagaaagagtttgtatttctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttg 20891986  T
Q  173 aagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgt 272  Q
    |||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  20891985 aagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgt 20891886  T
Q  273 cactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaa 372  Q
      ||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20891885 tgctcagtttgtttatgcttgcttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtaccggagtggaag 20891786  T
Q  373 tgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgc 472  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |    
T  20891785 tgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcac 20891686  T
Q  473 acttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtc 572  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  20891685 acttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagtattgtgaagttgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtc 20891586  T
Q  573 agatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggat 672  Q
     |||| ||| || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| ||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  20891585 ggataaagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagat 20891486  T
Q  673 ggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||    
T  20891485 ggtcagtcgga 20891475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 15414140 - 15414805
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  | |||||| | |||| |||||||||  | |||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  15414140 agaagcacagaaggttgatattaagtttgtggatttgttggttgttagtaatcaaactgaagaaagtgatttcaaggttcatgatcagggtgtgttgaga 15414239  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| ||||||||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  15414240 ttctgaggaagaatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagtttaagtattcatccaggagctacaa 15414339  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15414340 agatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggttttaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagt 15414439  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||| ||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  15414440 tgaacatcagaagcctgctgggttgctgaaaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttactgaatact 15414539  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
     |||| ||||||||| | |||||| | || || || || || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||| | | || ||  ||||||| |    
T  15414540 tcgagagggcatgatgccatatggctggttgttgatagattaacgaagtcagcacactttattccgattaatattagtttttcggtggcatagttggcag 15414639  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  15414640 agatttacattcgtgatattgtgaagctgcatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgca 15414739  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| | |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  15414740 agaggcgttgggttcaaagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatagccagtcgga 15414805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 687
Target Start/End: Original strand, 14850293 - 14850889
Alignment:
Q  91 aaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagca 190  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| | |||||  || |    
T  14850293 aaggtcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagta 14850392  T
Q  191 acttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgc 290  Q
     |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| |    
T  14850393 gcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattc 14850492  T
Q  291 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatg 390  Q
     ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||    
T  14850493 ctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggataacatatccatg 14850592  T
Q  391 gattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaata 490  Q
     |||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||| ||||  |||| |||||  | ||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14850593 tattttgtgatgagttttccgaatactcagaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaata 14850692  T
Q  491 tcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtt 590  Q
    | |||| ||| ||  ||||||||||||  || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||    
T  14850693 tgagttttcctgtttctcagttggcgggaatttacattcgcgatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtt 14850792  T
Q  591 tacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14850793 tacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaga 14850889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 15358537 - 15358869
Alignment:
Q  351 gttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggta 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||     
T  15358537 gttggatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttctgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtc 15358636  T
Q  451 gacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatg 550  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||    
T  15358637 gacaggttgacgaagtcggcacacttcattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagctacatg 15358736  T
Q  551 gggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttc 650  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||  ||| | |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||    
T  15358737 gtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagatttgggaagagtctgcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttc 15358836  T
Q  651 ggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15358837 gacttatcatcctcagagagatggtcagtcgga 15358869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14681724 - 14681060
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||  ||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  14681724 gaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttagtttctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagat 14681625  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14681624 ttcgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 14681525  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||     
T  14681524 gatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtc 14681425  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14681424 gagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaaagggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 14681325  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||| ||||| ||||  || || || |||||||||||    
T  14681324 ctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgatcaatattagtttccctgttgcccagttggcgga 14681225  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||||||||  |||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  14681224 gatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 14681125  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14681124 gaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 14681060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 283 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 14691795 - 14691391
Alignment:
Q  283 gtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagca 382  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14691795 gtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatgggatagca 14691696  T
Q  383 tttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttc 482  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||| ||||  |||| |||||  | |||||  | |||||||||||||| || ||||||||    
T  14691695 tatccatggattttgtgacgagtttgccgaatacttcgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatggattgacgaagtcggctcatttcatttc 14691596  T
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
    || ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  14691595 gagtaatatcagttttcctgtacctcagttggtggagatttacattcccgatattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagat 14691496  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14691495 ccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgg 14691396  T
Q  683 aaaga 687  Q
    |||||    
T  14691395 aaaga 14691391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8387491 - 8386905
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  8387491 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8387392  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  8387391 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8387292  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  8387291 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8387192  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  8387191 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 8387092  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8387091 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 8386992  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8386991 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 8386905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 8052556 - 8053142
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| | |||||  || | |||||    
T  8052556 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattcatagaagtagcttga 8052655  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  8052656 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8052755  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  8052756 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8052855  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || ||||||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  8052856 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgacaggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 8052955  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || ||||| || ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8052956 tccctgttgcccagttagcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 8053055  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8053056 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 8053142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12477679 - 12477093
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  12477679 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 12477580  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  12477579 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 12477480  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  12477479 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 12477380  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  12477379 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 12477280  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12477279 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 12477180  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12477179 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 12477093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 14302911 - 14303497
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| || | || || |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  14302911 gatgaccaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 14303010  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  14303011 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 14303110  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  14303111 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 14303210  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  14303211 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 14303310  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14303311 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 14303410  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14303411 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagacagatggttagtcgga 14303497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 29038337 - 29038923
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  29038337 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 29038436  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  29038437 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 29038536  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  29038537 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 29038636  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  29038637 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 29038736  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29038737 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 29038836  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29038837 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 29038923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40474197 - 40473533
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||| |||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  40474197 gaagcacataaagctgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagat 40474098  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||  ||    
T  40474097 tccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaa 40473998  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || |||    
T  40473997 gatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtt 40473898  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  40473897 gagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactc 40473798  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| | ||| | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || ||||||||  |    
T  40473797 ctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccctgttgcccagttggcaaa 40473698  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  40473697 gatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 40473598  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||  || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  40473597 gaggctttgggtttgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 40473533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 19777726 - 19778312
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  19777726 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 19777825  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  19777826 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 19777925  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  19777926 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 19778025  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  19778026 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 19778125  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || |   || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19778126 tccctgttgcccagttggcagagatttataccaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 19778225  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19778226 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 19778312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27712494 - 27711829
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||  |||| |||||  | |||||||| ||  | ||  | ||||| |||||||||    
T  27712494 agaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcaggctgaagacagtgattttaaaatcgacaatcaaggtgtgttgaga 27712395  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  27712394 ttccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga 27712295  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  27712294 agatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 27712195  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgc-aggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| | ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27712194 tgagcatcagaaacctactaggat-gatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatac 27712096  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || || || ||||||||     
T  27712095 tccgagagggagcgacacaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttggca 27711996  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |    
T  27711995 gagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgc 27711896  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27711895 aagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcgga 27711829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7091511 - 7090925
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |  ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || ||||| |    
T  7091511 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtatgatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagccatagaagtaacttaa 7091412  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  7091411 gtatttatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaatttgtgtattcttgttt 7091312  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || || |||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  7091311 gatttatcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 7091212  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||| ||||  ||||  ||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  7091211 gtgacaagtttgtcgaatactcctaaagggaatgacgcgattagggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 7091112  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattc-agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
     ||| ||  |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  7091111 ttcctgtttctcagttggcagagatctatattcgagaa-attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaaatttactt 7091013  T
Q  596 caagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||||| || |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7091012 ctagattttagaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcagcatatcatccgcagacagatagtcagtcgga 7090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12524748 - 12524169
Alignment:
Q  104 aaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattga 203  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  ||  | ||| || ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||  |    
T  12524748 aaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacgatggagagattaaggagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatcca 12524649  T
Q  204 tccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgt 303  Q
    ||||| |||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | |||||||||||| | ||||||  ||||    
T  12524648 tccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacggtttgtgtattcctgtttggtttgt 12524549  T
Q  304 cagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaa 403  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||| |||  | ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  12524548 cagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaaagatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacga 12524449  T
Q  404 gtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagt 503  Q
    |||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| ||    
T  12524448 gtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgt 12524349  T
Q  504 agctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattt 603  Q
     || ||||| || ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  12524348 tgcccagttagcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattt 12524249  T
Q  604 tggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12524248 tggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 12524169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23956826 - 23956240
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  23956826 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23956727  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  23956726 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 23956627  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  23956626 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23956527  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || ||||||||||||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  23956526 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcaactcattttctacctattaatattagtt 23956427  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23956426 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 23956327  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23956326 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattaagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 23956240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 687
Target Start/End: Original strand, 1639364 - 1639948
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||| ||  | ||| || ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  1639364 caaggtgtgttgaggtttcgaggtagaatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 1639463  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  |    ||||||||| | ||||||  |||    
T  1639464 acccgagagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcatattttgtgtattcttgtttggtttg 1639563  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  1639564 tcaaaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatataccagagtggaagtgggatagcatatccatggattttgtgacg 1639663  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||||| |||| || ||  || ||||||||||||||| ||| |    
T  1639664 agtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtcgatagattgacgaagacggctcattttcttccgattaatatcagttttcccg 1639763  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattc-agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    ||||||||||| | ||||| || || | |||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1639764 tagctcagttgacagagatttatatccgagaa-attgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagat 1639862  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || ||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1639863 tttggaagagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggtggagtttggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggaaaga 1639948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 14160566 - 14159970
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||    
T  14160566 atagtgactttaaagttgatgaccaaggagtgttgagattccgcggtagaatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 14160467  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
     |||  ||| | |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  14160466 ccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacag 14160367  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | |||||   |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||    | || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14160366 tttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtgtctttagatataccagagtggaaatgggata 14160267  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||| || |||||||||||||| | ||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | ||  | ||  |||| |||||||| || ||| |    
T  14160266 gcatatccatggattttgtgacgattttgccgaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgtctatagactgactaagtcggctcatttcct 14160167  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | |||||||| |||| ||| ||  |||||||||| || || || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |  || || | ||| |||    
T  14160166 tccaattaatattagttttcctgtgtctcagttggcagaaatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtattagacaga 14160067  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtc 676  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14160066 gacccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtc 14159970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Original strand, 15358233 - 15358530
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  15358233 gagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 15358332  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  15358333 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 15358432  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358433 aaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 15358530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 15146740 - 15147403
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||| | ||  ||||||||||  ||||  |  |||| || ||||| ||| | || || ||||||||||    
T  15146740 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgataaacatggtgtgttgagat 15146839  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  ||||  |||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15146840 tccgaggtcgaatatgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 15146939  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||||||  |||||||| | || |||| |||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | | ||||  |||||||||||| ||| ||    
T  15146940 gatgtatcatgatctgaagaagatattctggtcgtctggattgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctatttggtttgtcagaagtcgaagatt 15147039  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || |||||||  |||||  |  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||  | |||||||    
T  15147040 gaacatcagaaacctgctagtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgaatactc 15147139  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| |||  | ||  ||||||  ||    
T  15147140 ctagagggaatgacgcgatttgggtgatagttgatagattgacgaagtcggctcattttcta-cgattaatatcagttttcctattgcctagttggtaga 15147238  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    |||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||  ||||| |||    
T  15147239 gatctatattaaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaa 15147338  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15147339 gaggctttgggttctaagttgagattgagttcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 15147403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18298284 - 18297698
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  18298284 gatgatcaaggtgtgtttagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 18298185  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  18298184 gtattcacccgggagctacaaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 18298085  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||| |||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||| |||||    
T  18298084 agtttgtcggaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgaatttt 18297985  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  18297984 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 18297885  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18297884 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 18297785  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18297784 tagatttcggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 18297698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 680
Target Start/End: Original strand, 18226382 - 18226962
Alignment:
Q  100 gagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagta 199  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||    
T  18226382 gagcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagta 18226481  T
Q  200 ttgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgac 299  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||  | || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||       
T  18226482 ttcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagt 18226581  T
Q  300 ttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtg 399  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18226582 ttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 18226681  T
Q  400 acaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatc 499  Q
    || ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||    
T  18226682 acgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttc 18226781  T
Q  500 cagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaag 599  Q
    | || ||  ||||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| ||||| || || ||||| || || |||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  18226782 ctgttgcctagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggtgtgccttcgagcattgtatcagatcgagatccaagatttacttctag 18226881  T
Q  600 attttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |  || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18226882 attttggaggagtttgcaagaggctttaggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtc 18226962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 367 - 680
Target Start/End: Original strand, 16251648 - 16251961
Alignment:
Q  367 tggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagt 466  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||| | || |||||  | || || || ||||||||||    
T  16251648 tggaaatgggatagtatattcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagggggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagt 16251747  T
Q  467 cggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtat 566  Q
    |||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||| || | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  16251748 cggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatattaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcat 16251847  T
Q  567 agtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcag 666  Q
     || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16251848 tgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcattcgcag 16251947  T
Q  667 acggatggtcagtc 680  Q
    || |||||||||||    
T  16251948 acagatggtcagtc 16251961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16148813 - 16148580
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || || || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| | | ||    
T  16148813 ctgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctgga 16148714  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||    
T  16148713 ggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtc 16148614  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 307  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16148613 gctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16148580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16152959 - 16152726
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || || || ||||| || || |||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| | | ||    
T  16152959 ctgaggatagtgactttaaagtcgatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctgga 16152860  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||    
T  16152859 ggaaagtcacaagagcagcttaagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtc 16152760  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 307  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16152759 gctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 16152726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Original strand, 16354473 - 16354964
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| |     
T  16354473 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcc 16354572  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    | |||   |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||  |  || ||  | |||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||    
T  16354573 tatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgcttgtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgg 16354672  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||   | ||| ||||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||    
T  16354673 attttgtgacgagtttgccgaatactcatggagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatat 16354772  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     |||| ||| || || ||||||||  |||| || ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| |||    
T  16354773 tagttttcctgttgcccagttggcaaagatttatattaaagagattgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagattt 16354872  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16354873 acttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcgga 16354964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14695227 - 14695059
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  14695227 ctagtaattaaactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaa 14695128  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatga 230  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14695127 aatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatcatga 14695059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 15292447 - 15292652
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||  || ||| ||||| |    
T  15292447 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggtctggaatgaagaaggagatcgctgagtatgtttatgctt 15292546  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15292547 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccatcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 15292646  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  15292647 ttttgt 15292652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14998299 - 14998163
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| || | ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || ||  |||||| ||||| |    
T  14998299 ttgagtattcattcaggagcgactaaaatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagatcgctgagtttgtttatgctt 14998200  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  14998199 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagag 14998163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 614
Target Start/End: Original strand, 18549694 - 18549770
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  18549694 gtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagttt 18549770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9291791 - 9291613
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| ||||||  |||| |||| || ||| |||    
T  9291791 atgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtttatgcttgtttggtttgtaagaaatcaaagattg 9291692  T
Q  320 agcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    | |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9291691 aacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggactttgt 9291613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 643 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16146447 - 16146409
Alignment:
Q  643 ttgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16146447 ttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcg 16146409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 68562 - 67897
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  68562 cagagaagcacaacaagttgatgctaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagagatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttg 68463  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  68462 agatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaacttgagtattcatccgggagcta 68363  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68362 caaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 68263  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  68262 ggttgagcatcagaggcctacagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggacaacatttctatggactttgtgacaagtttacctaat 68163  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68162 actccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 68063  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  68062 cagagatttacattcataatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttggaagagttt 67963  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  67962 acaagatgcattgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 67897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 13017 - 13683
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| |  |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13017 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgcgggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 13116  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  13117 attcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 13216  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||   |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13217 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcacaagtctaagg 13316  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  13317 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtaacaagtttaccgaacac 13416  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13417 tccgagagggcatgatgccatttgggttattgttgacaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggcg 13516  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || | ||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  13517 gagatttatagtcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggaatcagaggttcacttcaagattttggaagagtttgc 13616  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13617 aagatgcattgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 13683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 4069 - 4735
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  4069 gagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgag 4168  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||| || || || | ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| || |||||||||||    
T  4169 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattcgggagctaca 4268  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4269 aagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 4368  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  4369 ttgaacatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 4468  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4469 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgacaaagtcggcgcactttattccgattaatattagttatccggtggctcagttggcg 4568  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||  || || |    
T  4569 gagatttatattcataatattgtaaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttttagattctggaagagcttgc 4668  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  4669 aagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcgtcctcagacagatggtcagtcgga 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 483; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15460359 - 15459693
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15460359 gagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattgag 15460260  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||     
T  15460259 atttagaggcagaatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacg 15460160  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15460159 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaga 15460060  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15460059 ttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 15459960  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  15459959 tccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagctggca 15459860  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15459859 gagatttacattcataatatcgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagtttac 15459760  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15459759 aggacgcgttgggttcaaaattgaagttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 15459693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 21563388 - 21564056
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21563388 cagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatatattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttg 21563487  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||  |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||  ||||||||||||    
T  21563488 agatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagcta 21563587  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||  |||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21563588 cgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaa 21563687  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||| || ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563688 ggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaac 21563787  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  21563788 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatcaggtagctcagttgg 21563887  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| || | ||||||||| ||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21563888 cggagatatatattcataatattgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagttt 21563987  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21563988 gcaagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21564056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 21569247 - 21569915
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21569247 cagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatgtattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttg 21569346  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||  |||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||  ||||||||||||    
T  21569347 agatttagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagcta 21569446  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||  |||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21569447 cgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaa 21569546  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||| || ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21569547 ggtcgaacatcagaagcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaac 21569646  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  21569647 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacgaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatctggtagctcagttgg 21569746  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| || | ||||||||| ||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21569747 cggagatatatattcataatattgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagttt 21569846  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21569847 gcaagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21569915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 32 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25769199 - 25768548
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||  || |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  25769199 ttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaaatgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaat 25769100  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    ||||||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  25769099 ttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgat 25769000  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggc 331  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25768999 tttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagc 25768900  T
Q  332 ctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatga 431  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  25768899 ctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacagtatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatacttcgaggggacatga 25768800  T
Q  432 ttcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcag 531  Q
    | | || |||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  25768799 tgccatttgggttgtcgtcgatacgttgacgaagtcggcgcattttatttcgatcaatattagttttccagtagctcagttggcggagatttacatttat 25768700  T
Q  532 aatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggtt 631  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||    
T  25768699 aatattgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtccgatagagatccgaggtttaattcaagattttggaagagtttccaagatgccttgggtt 25768600  T
Q  632 caaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25768599 caaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 25768548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 28 - 683
Target Start/End: Original strand, 8762202 - 8762857
Alignment:
Q  28 caagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggca 127  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |    
T  8762202 caagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggta 8762301  T
Q  128 gaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatca 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  8762302 gaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaataaagtcacaaaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtacca 8762401  T
Q  228 tgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 327  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762402 tgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 8762501  T
Q  328 aggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  8762502 aagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacgacatttatatggattttgtgacgagtttaccgaacactcagagagggc 8762601  T
Q  428 atgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacat 527  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8762602 atgatgccatttgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattctgattgatatcaattatccggtagctcagttggcggagatctatat 8762701  T
Q  528 tcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttg 627  Q
    |||  ||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||||||  |||    
T  8762702 tcatgatattgtgaagctacatggcgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgcaagatgcattg 8762801  T
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8762802 ggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 8762857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 683
Target Start/End: Original strand, 34644843 - 34645510
Alignment:
Q  16 agagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttga 115  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  34644843 agagaagcgcaactagtggacgtcaagtttgtggatttaatgattgatagcaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttga 34644942  T
Q  116 gatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctac 215  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | || ||  |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  34644943 gattcagaggcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaagattgattttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagctac 34645042  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 315  Q
     || ||||| || |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34645043 gaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtcaaag 34645142  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  34645143 gttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaaca 34645242  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || || || |||||    
T  34645243 ctccgagaggacatgattctatatgggttgtagtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggcgcaattggc 34645342  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
     ||||| || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34645343 agagatttatatccgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagggatccaaggtttacttcaagattttggaagagttta 34645442  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34645443 caagatgcgttgggatcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 34645510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19454445 - 19453777
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  19454445 cagagaagcacaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttg 19454346  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19454345 aggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgattttcgaggaaagtcacaagagtaacttaagtattcatccgggagcta 19454246  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19454245 cgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgttagaagtctaa 19454146  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  19454145 ggttgaacatcagaagtctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaattgggatatcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaac 19454046  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19454045 actccgagagggcatgatgccatttgggttgtggttgacaggttgacaaagtcagcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttgg 19453946  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||  |||||    
T  19453945 cggagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagttt 19453846  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19453845 gcaagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 19453777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18795715 - 18795047
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18795715 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttatagtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 18795616  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  18795615 aggttcagaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatcttggaagaaagtcacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 18795516  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18795515 cgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcgtgtttgacttgccagaagtctaa 18795416  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  18795415 ggtcgagcatcagaagcctgcagggttgttgataccattagatgttccagagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacaattttaccaaac 18795316  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18795315 actccgaggggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacgaagtcagcgcactttattccgataaatatcagttttccggtagctcagttgg 18795216  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || || |   | ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||   ||||    
T  18795215 cggagatttatatccgtgacattgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtactgtgtcagatagagatccgaggttcacttctagattatggaagcgttt 18795116  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18795115 gcaagatgctttgggttcgaaattgaggctgagtttggcttatcatcctcatacggatggtcaatcgga 18795047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 32 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21472609 - 21471962
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| | |||    
T  21472609 ttgatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaataat 21472510  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    ||| ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||     
T  21472509 ttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagcagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgat 21472410  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21472409 ttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagc 21472310  T
Q  332 ctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatga 431  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||| |||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21472309 ctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctccatgaattttgcgacgagtttaccgaatactccaagagggcatga 21472210  T
Q  432 ttcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcag 531  Q
    | | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21472209 tgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcgcattttatcccgatcaatattagttttccggtagctcagttggcggagatttacattcat 21472110  T
Q  532 aatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggtt 631  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||    
T  21472109 attattgtgaagtttcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggtt 21472010  T
Q  632 caaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21472009 caaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagt 21471962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 5296464 - 5297130
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| ||| ||||||||  || |  ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5296464 gagaagcgcaacaactggatgtaaagtttgttgatttaatgtttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 5296563  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| | ||||| ||||||    
T  5296564 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagttacaagagtagcttgagtattcacccgggggctaca 5296663  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  5296664 aaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgcttgacttatcagaagtctaagg 5296763  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  5296764 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgactagtttaccaaacac 5296863  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||  ||||||||||||||     
T  5296864 tccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaacatcaattatcgggtagctcagttggct 5296963  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  5296964 gagatttatattcaaaacattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 5297063  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5297064 aggacgctttgggttcgaaattgaggttgggttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 5297130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19880323 - 19879658
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19880323 cagagaagcacaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcagactgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 19880224  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||||||||||||||||||| || | || ||  |||| | ||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  19880223 aggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagccacaagagtagcttgagtatccatccgggagcta 19880124  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19880123 cgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcctgtttgacttgccagaagtctaa 19880024  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  19880023 agttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaac 19879924  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||  | || |||||||    
T  19879923 actccgaggggatatgattcaatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccgatggcgcagttgg 19879824  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||   | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||  |||||    
T  19879823 cggagatttatatctgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagttt 19879724  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||  ||||| || || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19879723 gcaagatgctttgggctcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggacagtc 19879658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 14380723 - 14381391
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||||    ||||| | ||||| |||| ||| ||||| || || || |||    
T  14380723 cagagaagcgcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattg 14380822  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  14380823 aggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagcta 14380922  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||   |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14380923 caaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 14381022  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  14381023 ggttgaacatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaac 14381122  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  14381123 actccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatattagttacctggtagctcagttgg 14381222  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
     |||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  14381223 gggagatttatattcataacattgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagttt 14381322  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14381323 gcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcagcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 14381391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 28282071 - 28282737
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||     |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  28282071 gagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtattgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 28282170  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||     
T  28282171 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 28282270  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28282271 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaagg 28282370  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  28282371 ttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 28282470  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| | || || || |||||||| ||||||||||||||     
T  28282471 tccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggct 28282570  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  28282571 gagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 28282670  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28282671 aggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 28282737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 10468107 - 10468773
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| |  | ||| ||||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  10468107 gagaagcacagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaagttgatgatcagggtgttttgag 10468206  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  10468207 gttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctaca 10468306  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10468307 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaag 10468406  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  10468407 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatagatttcgtgacgagtttaccgaacac 10468506  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  10468507 tccgagagggcatgaagcaatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggca 10468606  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  | || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||  |||||||    
T  10468607 gagatttatgtccataatattgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttttggaagagtttac 10468706  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10468707 aggatgctttgggttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 10468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24365372 - 24364769
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  24365372 atagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 24365273  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| || || |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |    
T  24365272 tcacaatagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcag 24365173  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    || || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24365172 ttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggaca 24365073  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24365072 gtatatctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaagtcggcacacttcat 24364973  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || ||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||  |||||    
T  24364972 tcctatcaatatcaattatccggcagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcgaataga 24364873  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24364872 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 24364773  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  24364772 cgga 24364769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 248 - 683
Target Start/End: Original strand, 27560106 - 27560541
Alignment:
Q  248 ggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgac 347  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27560106 ggtggtctgggttgaagagagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggattgttgac 27560205  T
Q  348 accgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtg 447  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  27560206 gccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtg 27560305  T
Q  448 gtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgc 547  Q
    || || ||||||||||||||||| || || ||| | || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || | | |||||||| | |    
T  27560306 gttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttatatacatagtgttgtgaagctac 27560405  T
Q  548 atggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgag 647  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||   ||||    
T  27560406 atggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggctgag 27560505  T
Q  648 ttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27560506 ttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 27560541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 279 - 683
Target Start/End: Original strand, 22796152 - 22796556
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||| |     
T  22796152 gtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccaaagtggaagtggaac 22796251  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    | ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| |    
T  22796252 aacatatacatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacaaagtcgacacacttta 22796351  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22796352 ttccgatcattattagttatccggtagctcagttggcggagatttacattcataatattgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatag 22796451  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  22796452 agatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcattcgcaaacatatggtcag 22796551  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  22796552 tcgga 22796556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19436025 - 19435653
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||||    ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  19436025 gagaagctcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtgttgag 19435926  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  19435925 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 19435826  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||   |||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435825 aagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttatgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 19435726  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctat 389  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19435725 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctat 19435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 344 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 17416182 - 17415845
Alignment:
Q  344 tgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggt 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | || |||||    
T  17416182 tgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagaggacatgatgccatttgggt 17416083  T
Q  444 tgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaag 543  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  17416082 agtagtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaag 17415983  T
Q  544 ttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaat 643  Q
     | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  || || |||||||  |||||||| || ||||  |    
T  17415982 ctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcgaagttgaggt 17415883  T
Q  644 tgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17415882 taagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcg 17415845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 5838479 - 5839143
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||  ||||  || ||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  5838479 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggatttgttagtcgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaggtcgatgaccatggtgtgttaagat 5838578  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |   |||   ||||||||| |||||| |||| ||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  5838579 tccaaggtcaaatttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaa 5838678  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5838679 gatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggtc 5838778  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||  || ||  | |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5838779 gagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgactagtttgccgaatactc 5838878  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| ||||  | || |||||| | || |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| ||||| |||| ||| ||  |||||||||  ||    
T  5838879 ctagagggaatgacgcaatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggctcattttctaccgataaatattagttttcctgtttctcagttggtaga 5838978  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  5838979 gatttatatcaaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagttagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaa 5839078  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5839079 gaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 5839143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 15897116 - 15896447
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | |||  | | |||||  ||||  ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||    
T  15897116 agaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtagatttacttgttggtggaaatcagactgaagatagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgcga 15897017  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |  |||| ||||| |  || | |||||||||  |||| ||||||||||    
T  15897016 ttacgaggcagaattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaa 15896917  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||| ||| | ||| | | |||||||||||| || ||    
T  15896916 agatgtatcatgatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtctaatttgtcagaagtcaaaagt 15896817  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| ||  | |  | ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15896816 tgagcatcagaaacctgctgggttgatggtatctatagatgtaccaaagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatact 15896717  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||||  ||| |||     || |||||  | || || ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15896716 ccgaaagggaatggcgttatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtatctcagttggcgg 15896617  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| ||||| |   ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    |||| |||||| | ||||||||  ||||| ||    
T  15896616 agatttacatccgcgatattgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatgtgaggtatacttctatattttggaagagtttgca 15896517  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||| |   | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  15896516 agaggctgtaggttctaagttgaagttgagttcggcgtatcatccgcagacagataatcagtcggaaaga 15896447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 18407280 - 18407866
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  18407280 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 18407379  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| | |||||| |||||    |||||  | | |||| ||||| | |||||    
T  18407380 gtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttttgtattcttgttt 18407479  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18407480 gatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 18407579  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| | |||  | || || || |||||||||||| | || ||  || |||||||||||||||    
T  18407580 gtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgattttggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttcttccgattaatatcagtt 18407679  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  ||| |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18407680 ttcctgtttctctgttggcagagatttacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacgtc 18407779  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  18407780 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagagggtcagtcgga 18407866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 686
Target Start/End: Original strand, 25609131 - 25609788
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  |  ||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||    
T  25609131 aagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgattttaagatcgatgaccaaggtgtattgaggtttcgaggtag 25609230  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
     ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25609231 gatttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 25609330  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  25609331 gatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtgatgttgcaccgtttgtgtattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcaga 25609430  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || | |||||| |  ||| |    
T  25609431 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagattggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagtttgccgattactcctaaagggaa 25609530  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||  |  |||||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||| ||  ||    
T  25609531 tgacgcgatttgggtgattgttgacagattgacgaagtcagcacattttctggcgattagtatcagttttcctgtttctcaattggcagagatttatgtt 25609630  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
     |  | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  ||||    
T  25609631 aaagagatcgtgaagttgcatggtgttccttcgaccattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 25609730  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25609731 gttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaag 25609788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 1542344 - 1543008
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||  | ||| ||||| | ||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||    
T  1542344 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtgaccagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtctgttgagat 1542443  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  |||  |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  1542444 tccgagagagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaa 1542543  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  |   |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||     
T  1542544 gatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtc 1542643  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  1542644 gagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 1542743  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| |  || | || |||||| | || || ||||||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| ||    
T  1542744 ccagagggaaatatgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccgttgcccagttggcaga 1542843  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  1542844 gatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 1542943  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1542944 gaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 1543008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 22761793 - 22762379
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  22761793 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 22761892  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||| ||||| | |||||    
T  22761893 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttatgtattcttgttt 22761992  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22761993 gatttttcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 22762092  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||| |||||||| || ||  ||  ||||||||||||||    
T  22762093 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgactaagtcggctcattttcttatgattaatatcagtt 22762192  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22762193 ttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 22762292  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| | ||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  22762293 tagattttggaaaagtttgccagaggctttaggttataagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaactgatggttagtcgga 22762379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19865708 - 19865044
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | | || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  19865708 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttatagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagat 19865609  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    || |||   |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19865608 ttcgagttcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 19865509  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||| |  |||||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  19865508 gatgtatcattatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagatt 19865409  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19865408 gaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 19865309  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||  || || |||||||| ||    
T  19865308 ctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcgtgttgcccagttggcaga 19865209  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||| || | ||||||||||| ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  19865208 gatttatattaaggagattgtgaagtttcatggtgttcctacgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaa 19865109  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19865108 gaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 19865044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 24312512 - 24313092
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  24312512 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 24312611  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || | |||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  24312612 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 24312711  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  24312712 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 24312811  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| |    
T  24312812 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcccg 24312911  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24312912 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 24313011  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24313012 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 24313092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23079480 - 23078826
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| | || ||| |||||  | ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  23079480 aagttgatgttaggtttgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggagtgttgagattccgagggag 23079381  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23079380 aatttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcat 23079281  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  |    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  23079280 gatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtagcataatttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 23079181  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||  ||  || ||  | | || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||    |||||||| |  | | |    
T  23079180 aacctgttgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttttagaatactcctaaagtgaa 23079081  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| |||||  | ||||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||| || || |||    
T  23079080 tgacgcgatttgggtgattgtagatagattgacgaagttggctcatttcattccgattaatatcagttttcatgtgtctcagttggcggaaatttatatt 23078981  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||    || |    
T  23078980 cgagatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttttgaagagtttacaagagtctttag 23078881  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  23078880 gttataagttgaggttgagttcggcgtatcgtccgcagagagatggtcagtcgga 23078826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 380
Target Start/End: Original strand, 19488542 - 19488893
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  19488542 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttccaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcag 19488641  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||| ||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19488642 aattcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 19488741  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  19488742 gacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgatcattaga 19488841  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatag 380  Q
     |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19488842 agcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaaatgggatag 19488893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 16626055 - 16626641
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16626055 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16626154  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16626155 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16626254  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16626255 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16626354  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||| ||| | ||  | || |||||| | || || ||||||||||||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16626355 gtgacgagtttgccgaatactctgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcaactcattttctacctattaatattagtt 16626454  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16626455 ttcccgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 16626554  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16626555 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcaaagatgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16626641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 28262535 - 28263121
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  28262535 gatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 28262634  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  28262635 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 28262734  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  28262735 agtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 28262834  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||| | || |||||| | || || || ||||| ||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  28262835 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 28262934  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262935 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 28263034  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28263035 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcgga 28263121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 28341284 - 28341870
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  28341284 gatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 28341383  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  28341384 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 28341483  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  28341484 agtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 28341583  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||| | || |||||| | || || || ||||| ||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  28341584 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 28341683  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341684 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 28341783  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28341784 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcgga 28341870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 29591264 - 29591844
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  29591264 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 29591363  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  29591364 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 29591463  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  29591464 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 29591563  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || ||  ||||||||||||| || || ||| |  |||||||||| ||||  || |    
T  29591564 agtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaagtcagctcatttcctaccgattaatattagtttccctg 29591663  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29591664 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgtcccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 29591763  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29591764 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagagtgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 29591844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 620
Target Start/End: Original strand, 20636639 - 20637162
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  20636639 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 20636738  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||| | |||||    
T  20636739 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgttt 20636838  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  20636839 gatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 20636938  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  20636939 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 20637038  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20637039 atcctgtttctcagttggcagagatctatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 20637138  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaaga 620  Q
     |||||||||| |||||| |||||    
T  20637139 tagattttggaaaagtttgcaaga 20637162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25113495 - 25112909
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  25113495 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 25113396  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  25113395 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 25113296  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||     
T  25113295 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtaccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttc 25113196  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  25113195 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 25113096  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25113095 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 25112996  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25112995 tagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattaagttcggcctatcatccacagacagatggtcagtcgga 25112909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 2874141 - 2874727
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||  ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  2874141 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 2874240  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  2874241 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 2874340  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||   || || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  2874341 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtgcctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 2874440  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  2874441 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 2874540  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || ||  ||||||| ||||| || ||  || | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2874541 tccctgttgcctagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaacttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 2874640  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2874641 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 2874727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 22077949 - 22078614
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  || |  || ||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||     
T  22077949 agaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagatggtgattttaaaattgatgatcaaggtatgttgagg 22078048  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| |||||||||| ||  |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  22078049 tttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 22078148  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  22078149 agatgtatcatgatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggt 22078248  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  22078249 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaagtgggatagtatatccgtggattttgtgatgagtttgccgaatact 22078348  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || |  ||| | ||  |||| |||||  | || || || ||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||| ||| ||  |||||||| | |    
T  22078349 cctaaagggaacgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggcgcattttcttccggttaatatcagttttcctgtttctcagttgacag 22078448  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    ||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  22078449 agatctatattcgagatattatgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 22078548  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  || || || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22078549 agaggctttaggctctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcgga 22078614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27188458 - 27187793
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||  |||| |||||  | || ||||| |   | |||||  |||| |||||||||    
T  27188458 agaagcacaaagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgaga 27188359  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  27188358 ttccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 27188259  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  ||| |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  27188258 aaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 27188159  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  || |  ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27188158 tgagcatcagaaacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaataca 27188059  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| || || || ||  |  | |||||||| ||||  || || || |||||||| |    
T  27188058 cctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttggcag 27187959  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| |||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  27187958 agatttacatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 27187859  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27187858 agaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27187793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 27260782 - 27261447
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||  |||| |||||  | || ||||| |   | |||||  |||| |||||||||    
T  27260782 agaagcacaaagagttgatgtaaagtttgtggatttattggttgctagagatcaggctgaagacagcgattttagaatcgatgatgaaggcgtgttgaga 27260881  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  27260882 ttccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 27260981  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  ||| |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  27260982 aaatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 27261081  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  || |  ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27261082 tgagcatcagaaacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaataca 27261181  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| || || || ||  |  | |||||||| ||||  || || || |||||||| |    
T  27261182 cctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttggcag 27261281  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| |||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  27261282 agatttacatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 27261381  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27261382 agaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 620
Target Start/End: Original strand, 18196995 - 18197589
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  || || ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||    
T  18196995 aagttgacgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcacactaaggatagtgactttaaggtcgatgatcaaggtgtgttgagatttcgaggtag 18197094  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  18197095 aatttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcat 18197194  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctgg---tttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatc 325  Q
    || ||||| || |||||||||||||| ||    |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  18197195 gatttgaaaaatttgttttggtggtcgggattattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattttctagaagtcaaaggttgagcatc 18197294  T
Q  326 agaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggg 425  Q
    |||  |||||||| ||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||    
T  18197295 agaaacctgcagggttgatgacacctttagatataccagagtggaaatgggatagcatatgcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagg 18197394  T
Q  426 gcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctac 525  Q
    | | ||  | || |||||  | || || |  ||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||||||| |   ||| ||||||| || ||||| |||    
T  18197395 gaacgacgctatttgggtgattgtggataaattgacgaagtcagatcatttcattccgattaacatcagtttttttgtatctcagttagcagagatttac 18197494  T
Q  526 attcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    || |   ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  18197495 atccgcgatattgtgaagctacatggtgttccatcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaaga 18197589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 676
Target Start/End: Original strand, 27391432 - 27392090
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||     
T  27391432 agaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagg 27391531  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    |||  |   ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||| | |    
T  27391532 tttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcga 27391631  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||     ||||  | |  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27391632 agatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggt 27391731  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27391732 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtagaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagcttgccaaatact 27391831  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||    ||| ||||   ||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| ||  |||||||| | |    
T  27391832 ccttaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatataagttttcctgtttctcagttgacag 27391931  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  27391932 agatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 27392031  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtc 676  Q
    ||| |  ||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27392032 agaggctttgagttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtc 27392090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22434879 - 22434226
Alignment:
Q  30 agttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcaga 129  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  | ||| |||||||| |  ||||  || |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||  |||   ||    
T  22434879 agttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcga 22434780  T
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  22434779 atttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatg 22434680  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  |||||||  | ||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22434679 atctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 22434580  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||| | ||  || ||  | |||| || ||  | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||    
T  22434579 acctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaat 22434480  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || |  |||||||||||||| || ||  |   |||||||||||||| ||| || || |||||| | ||||| || |||     
T  22434479 gacgcgatttgggtgattgtcgatatattgacgaagtcggctcattttctactgattaatatcagttttcctgttgcccagttgacagagatttatatta 22434380  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
     | | || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  22434379 tggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctggattttggaagagtttgcaagaggctttggg 22434280  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22434279 ttctaagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatgattagtcgga 22434226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 676
Target Start/End: Original strand, 27330692 - 27331350
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||     
T  27330692 agaagcacataaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagg 27330791  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    |||  |   ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||| | |    
T  27330792 tttcaaaatagaatatgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcga 27330891  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||| |||||     ||||  | |  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27330892 agatgtaacatgatctaaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggt 27330991  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  27330992 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtagaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagcttgccctatact 27331091  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||    ||| ||||   ||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| ||  |||||||| | |    
T  27331092 ccttaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatataagttttcctgtttctcagttgacag 27331191  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  27331192 agatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 27331291  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtc 676  Q
    ||| |  ||| |||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27331292 agaggctttgagttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtc 27331350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 679
Target Start/End: Original strand, 28291823 - 28292292
Alignment:
Q  210 agctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaag 309  Q
    |||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||  | | |||||||||| | |||||   ||||||||||    
T  28291823 agctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaag 28291922  T
Q  310 tctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 409  Q
    || ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  28291923 tcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgc 28292022  T
Q  410 ctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctca 509  Q
    | ||||||||||| |||   ||| | || |||||| | || || || ||||| ||||| || || ||| |  | |||||||| ||||  || || || ||    
T  28292023 cgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaagtcagctcatttcctacctattaatattagtttccctgttgccca 28292122  T
Q  510 gttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaga 609  Q
    |||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28292123 gttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaa 28292222  T
Q  610 agtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28292223 agtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagt 28292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 22443277 - 22442711
Alignment:
Q  30 agttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcaga 129  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  | ||| |||||||| |  ||||  || |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||  |||   ||    
T  22443277 agttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaattagactgaagatggtgacttcaaggtcgatgaccacggtgtgttgagattccgagatcga 22443178  T
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  22443177 atttgtattcctgttgatgaagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatg 22443078  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  |||||||  | ||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22443077 atctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 22442978  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||| | ||  || ||  | |||| || ||  | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||    
T  22442977 acctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaat 22442878  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || |  |||||||||||||| || ||  |   |||||||||||||| ||| || || |||||| | ||||| || |||     
T  22442877 gacgcgatttgggtgattgtcgatatattgacgaagtcggctcattttctactgattaatatcagttttcctgttgcccagttgacagagatttatatta 22442778  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     | | || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22442777 tggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 22442711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 587
Target Start/End: Original strand, 18966613 - 18967114
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||| | ||||| ||    
T  18966613 atagtgactttaaggttgatgatcagggagtgttgtgatttcgaggtagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatgattcttgaagagag 18966712  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| |  |||||  | |      
T  18966713 tcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaatagtgatgtgccacaa 18966812  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |  ||||  || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||          
T  18966813 tttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaaggtgagcatcataaacctggtgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaat------ 18966906  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||  ||||| |  |||||||| |  ||| ||||    || |||||  | || || || ||||||| |||||| || |||||    
T  18966907 gtatatccatggattttgtgatgagttttctgaatactccaaaagggaatgacgttatttgggtgattgtggatagattgacgacgtcggctcatttcat 18967006  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| | ||||| |||  |||||  ||  |||||||||||    
T  18967007 tccgattaacatcagttttcttgtatctcagttggcggagatttacatccgcgatattgtgaaggtacatggtgttttgtcgatcattatgtcagataga 18967106  T
Q  580 gacccaag 587  Q
    || |||||    
T  18967107 gatccaag 18967114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Original strand, 16927073 - 16927564
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||   |||||||||||||| ||||||   |||||  | | |||||||||  |     
T  16927073 cttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgtgtactct 16927172  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    | ||||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  16927173 tatttgatttgttagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatgg 16927272  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||  |  ||||||| ||    
T  16927273 attttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgacagattgacgaagtcagcacattttctaccgattaacat 16927372  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
    ||||| ||| || ||  ||||||| ||| | || ||| |  | |||||||||||||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||||| || |||    
T  16927373 cagttttcctgttgcatagttggcagaggtttatattaaagagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcaaatagagacccgagattt 16927472  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||| | || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16927473 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtaccaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 16927564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 415 - 680
Target Start/End: Original strand, 11280161 - 11280426
Alignment:
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||  | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || || |||||||    
T  11280161 actccgaggggacatgattcaatattggttgtagtcgatggattgacgaagttggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggcacagttgg 11280260  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | ||||| || || | | | |||||||||||||||||  || | |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||  |||||    
T  11280261 cagagatttatatccgggaaattgtgaagttgcatggtattacatcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagttt 11280360  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||  ||||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11280361 gcaagatgctttgggctcgaaattgaggctgagttcggcttaccatcctcagaccgatggccagtc 11280426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18436569 - 18436295
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |    ||||||||||||||||| |||   ||| | || ||||||||| | ||||||||    
T  18436569 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatcaaaaagttgattctggaagaaag 18436470  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtc----tggtttgaagaaggatgtcac 275  Q
    ||| |  || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||   |||||  |    
T  18436469 tcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctgggtgggttgaagtgagatgtggc 18436370  T
Q  276 tcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacacc 350  Q
     |  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||  | |||||||||||    
T  18436369 acaatttgtgtatgcgtgtttaatttgttagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcttggttgttgacacc 18436295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 547 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 17032876 - 17032737
Alignment:
Q  547 catggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattga 646  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||    
T  17032876 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 17032777  T
Q  647 gttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17032776 gttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggaaag 17032737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 419
Target Start/End: Original strand, 16962715 - 16963105
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || || || ||||| || || |||||||||||  ||||  |    
T  16962715 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggcgtgttgagattccgaggtcg 16962814  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
     ||||| |||||||||||||  ||  ||| |||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||     
T  16962815 gatttgcattcctgacgatgcagagatgaggaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcac 16962914  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  | |||||  | |||||||||||||| ||||||   |||||  | | |||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16962915 gatctaaagaatatattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgtgtactcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgagcatcaga 16963014  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
      ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || || | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16963015 aacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatcgaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 16963105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 14379173 - 14379376
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||||    ||||| | ||||| |||| ||| ||||| || || || |||    
T  14379173 cagagaagcgcagcaagtggatgtgaagtttgttgatttgatagttgctggtaatggcactgaggaaagtgacttcatggtggatgatcagggtgtattg 14379272  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  14379273 aggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtgttcatccgggagcta 14379372  T
Q  215 caaa 218  Q
    ||||    
T  14379373 caaa 14379376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 600 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1641212 - 1641129
Alignment:
Q  600 attttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1641212 attttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 1641129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 540 - 683
Target Start/End: Original strand, 16963148 - 16963291
Alignment:
Q  540 gaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattg 639  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||| | || |||    
T  16963148 gaagttgcatggtgttccttcgagcattatatcagatagagacccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtaccaagttg 16963247  T
Q  640 aaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963248 aggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 16963291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 27566330 - 27566484
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  27566330 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgg 27566429  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| |||||    
T  27566430 gagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaa 27566484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 16381807 - 16382012
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  16381807 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 16381906  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16381907 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 16382006  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  16382007 ttttgt 16382012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 1648248 - 1648453
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| ||||  |||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  1648248 ttgagtattcatccaagagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 1648347  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||    || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648348 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgttgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaaatgggatagcatttctatgga 1648447  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  1648448 ttttgt 1648453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18572498 - 18572293
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||  | ||||||||  | |||  |||||| ||||| |    
T  18572498 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttttgtggcctggaattaagaaggagattactgagtttgtttatgctt 18572399  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  |||| ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18572398 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcaggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgagatagcatttctatgga 18572299  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  18572298 ctttgt 18572293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 683
Target Start/End: Original strand, 27559765 - 27559912
Alignment:
Q  536 ttgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaa 635  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| ||    
T  27559765 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27559864  T
Q  636 attgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27559865 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 27559912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23997095 - 23996893
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || || || | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  23997095 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagattttaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 23996996  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  ||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996995 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccattgtttgtgccagagtggaaatgggatagcatttctatgga 23996896  T
Q  393 ttt 395  Q
    |||    
T  23996895 ttt 23996893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 14624791 - 14624996
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  14624791 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgttctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 14624890  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  |||||| || || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14624891 gtttggtttgtcaaaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctattga 14624990  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  14624991 ttttgt 14624996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 620
Target Start/End: Original strand, 21836973 - 21837058
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  21836973 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaaga 21837058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 18837342 - 18837547
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  18837342 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttaaagagattgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtttatgctt 18837441  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || | | |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18837442 gtttggtttgtcagaaatcaatgattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggacgtgggatagcatttctatgga 18837541  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  18837542 ctttgt 18837547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16098897 - 16098821
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  16098897 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtggcccggaatgaagaagga 16098821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 476; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 1075 - 468
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1075 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgaacaaggtgtgttg 976  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  975 agatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagcta 876  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  875 cgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtataa 776  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  775 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggacaacatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 676  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  675 actccaagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaaatcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 576  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||    
T  575 cagagatttacattcataatattgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttgaaagagttt 476  T
Q  615 acaagatg 622  Q
    ||||||||    
T  475 acaagatg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 686
Target Start/End: Original strand, 95116 - 95787
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  95116 cagagaagcacaacaagttgacatcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaagttgatgagcaaggtgtattg 95215  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  95216 agatttagaggtagaatttgtgttcccgacaatgaagaattaaagaagttaattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagcta 95315  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  95316 cgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 95415  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  95416 agttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacccaat 95515  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  95516 accccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttacccagtagctcagttgg 95615  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  95616 cggaaatctacatccagaatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagttt 95715  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  95716 acaagatgcgttgggttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggaaag 95787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 113751 - 113087
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  113751 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaatggttaatagtaatcaaactgaagatagtgattgcaaggttgatgaacacggtgtgttg 113652  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||| | || ||  |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||  ||||||||||||    
T  113651 agattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgattttggaagaaagtcacaagaatagcttgagtatccatccgggagcta 113552  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||   |||||  ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  113551 cgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtgatgttgcttagtttgtgtatgcatgtttaacttgccagaagtctaa 113452  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  113451 agttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccaaac 113352  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| | | || || |||||||    
T  113351 actccgagaggacatgattcaatatgggttgtagtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccaataaatatcagttttacggtggcgcagttgg 113252  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | ||||| || |||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||  |||||    
T  113251 cagagatttatattcgggacattgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagattcgaggttcacatctagattctggaagagttt 113152  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     |||||||  ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  113151 gcaagatgctttgggctcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagt 113087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 109007 - 109593
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  109007 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 109106  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  109107 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 109206  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||   || || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||    
T  109207 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtgcctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggaattt 109306  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| ||||    
T  109307 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctacctattaatattagtt 109406  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  109407 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagaaccaagatttacttc 109506  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  109507 tagattttggaaaagtttgcaagacgctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 109593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 10419384 - 10420052
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  10419384 cagagaagcacaacgagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgatagtaatcaagctgaggatggtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtattg 10419483  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  10419484 agatttagaggcagaatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagcta 10419583  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419584 cgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaa 10419683  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10419684 ggttgaacatcagaagcctgcgggattgttgacaccgttggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacccaat 10419783  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  10419784 accccgagaggacacgattctatatgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatataagttatccagtagctcagctgg 10419883  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10419884 cggagatttacattcataatatcgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagttt 10419983  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10419984 acaggacgcgttgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcgga 10420052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14087463 - 14086795
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14087463 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 14087364  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |  || |||||||||||||| ||||| ||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  14087363 aagttcagaggcagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 14087264  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14087263 cgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 14087164  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087163 ggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 14087064  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  14087063 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttgg 14086964  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  14086963 cggagatttatattcgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagttt 14086864  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14086863 gcaagatgctttgggctcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 14086795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 683
Target Start/End: Original strand, 13971464 - 13972127
Alignment:
Q  20 aagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatt 119  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||    
T  13971464 aagcgcaacaggttgatgtcgagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagtt 13971563  T
Q  120 tagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaa 219  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||     
T  13971564 cagaggcagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaag 13971663  T
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13971664 atgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttg 13971763  T
Q  320 agcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971764 aacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 13971863  T
Q  420 gagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggag 519  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  13971864 gagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggcggag 13971963  T
Q  520 atctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaag 619  Q
    || || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  13971964 atttatatccgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaag 13972063  T
Q  620 atgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13972064 atgctttgggctcgaaattgaggctgagttcggcttatcatccccagacagatggtcagtcgga 13972127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 16827542 - 16828209
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| || ||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16827542 cagagaagcacatcaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttg 16827641  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| | ||||||||||| |||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||  || || || | ||| |||||| ||| ||||||||    
T  16827642 aggttcagaggaaaaatttgtattcatgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaacccacaaaagtagcttaagtattcatcagggagcta 16827741  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16827742 caaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtccaa 16827841  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  16827842 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaac 16827941  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||| ||| ||||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16827942 actctgagagggcatgatgccatttgggttgtg-tggataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttgg 16828040  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  | |||    
T  16828041 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagaattt 16828140  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16828141 gcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcgga 16828209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14574711 - 14574054
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| | || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  14574711 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcatggtgtgttgag 14574612  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  14574611 gttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 14574512  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14574511 aagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgagatgttgctcggtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 14574412  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14574411 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacac 14574312  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14574311 tccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttta-ttcta-----atcagttatccggtagctcagttggcg 14574218  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  14574217 gagatttatattcataatattgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtgtcagatagagatttcaggttcacttctagattttggaagagtttgc 14574118  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14574117 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 14574054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17493418 - 17492752
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| | |  ||||  ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  17493418 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtagtgacactgaagatagtgacttaaaggttgatgatcagggtgtgttgag 17493319  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| || | ||||||||     
T  17493318 gtttagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcattctggagctacg 17493219  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17493218 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttttgtatgcatgtttgacttgtcagaaatctaagg 17493119  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17493118 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagttgaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 17493019  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||| || ||||||||| | ||||||||| | || || || ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17493018 tccaagagggcatgatgccatatgggttattgtcgatagattgacgaagtcggcgcattttattccaattaatatcaattatccggtagctcagttggcg 17492919  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | || | || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  17492918 gagatctacattcataacattgtgaagttgcatggtgttccgttgtgtgttgtttcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 17492819  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17492818 aagatgccttggggtcgaacttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 17492752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 16835914 - 16836517
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  16835914 atagtgacttcaaagttgatgatcagggagtattaagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaatcaaaaaagttaattttagaggaaag 16836013  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||      
T  16836014 tcacaagagtagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcat 16836113  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16836114 tttgtgtatgcgtgcttcacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggata 16836213  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16836214 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccaagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaagttgacaaagtcggcgcacttcat 16836313  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||    
T  16836314 tcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctgagatttacattcataatgttgtgaagcttcatggagttccgtcgagtattgcatcggataga 16836413  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| || || ||||| ||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16836414 gatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 16836513  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  16836514 cgga 16836517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 65 - 683
Target Start/End: Original strand, 18133735 - 18134353
Alignment:
Q  65 gtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagtt 164  Q
    ||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| || || ||||| |||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||    
T  18133735 gtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaattagtattcctgataatgacgagttgaaaaagtt 18133834  T
Q  165 gattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 264  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18133835 aattttggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaag 18133934  T
Q  265 aaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccgg 364  Q
       || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18133935 cgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacattagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccgg 18134034  T
Q  365 agtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaa 464  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18134035 agtggaagtgggatagcatttcaatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaa 18134134  T
Q  465 gtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagt 564  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||    
T  18134135 ttcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttacattcataatattgtaaggttacatggtgtaccgtcgagt 18134234  T
Q  565 atagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgc 664  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| || ||    |||||||| || ||||  ||||||||  |||||||||| |    
T  18134235 attgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaggacactttgggttcgaagttgaggttgagttcaacttatcatcctc 18134334  T
Q  665 agacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18134335 agacagatggtcagtcgga 18134353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 12359868 - 12360549
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||  | |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  12359868 gagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 12359967  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgagg---------------aattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtatt 201  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |               | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12359968 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgttcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtatt 12360067  T
Q  202 gatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgactt 301  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12360068 catccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgactt 12360167  T
Q  302 gtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12360168 gtcagaagtctcaggttgaatattagaagcctgcagggttgttgacacagttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgac 12360267  T
Q  402 aagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatcca 501  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||     
T  12360268 gagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagttggcgcactttattccgattaatatcaaatatccg 12360367  T
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| || |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  12360368 atagctcagttggcggagatttacattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtagagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagat 12360467  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||  || ||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12360468 tatggaagagattacaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 12360549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 8758423 - 8759089
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| | || ||| || |||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  8758423 gagaagcacagcaagtggatgtcaagttagttgatctgatggttgctggtaatggcgttgaaaatagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgag 8758522  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||     
T  8758523 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 8758622  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  8758623 aagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaag 8758722  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  8758723 ttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 8758822  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| | || || || |||||||| ||||||||||||||     
T  8758823 tccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggct 8758922  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  8758923 gagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 8759022  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8759023 aggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 8759089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41178247 - 41177644
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||    
T  41178247 atagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagaatcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttgatcctagaggaaag 41178148  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||      
T  41178147 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 41178048  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41178047 tttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggata 41177948  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  41177947 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 41177848  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  41177847 tcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctgagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagg 41177748  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41177747 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 41177648  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  41177647 cgga 41177644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 16380269 - 16380935
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || |||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  16380269 gagaagcacaacaggtggatgtcaagttggttgatttgattgttactggtaatggcactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 16380368  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||     
T  16380369 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 16380468  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  || |||||    |||||| |||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16380469 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtacgggttgaattgagatgtcgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaagg 16380568  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  16380569 ttgagcatcaaaagcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacaagcttaccaaacac 16380668  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||| || || ||| | |||||||| || || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  16380669 tccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgatagattgtcaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggct 16380768  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || | ||| || || || || ||||  ||||| |    
T  16380769 gagatttatattcataatgttgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgatgttcacctctaggttctggaagagtttgc 16380868  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  16380869 aggacgctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcattctcagacagatggtcagtcgga 16380935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 47124675 - 47124066
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  47124675 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattcttga 47124576  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  47124575 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagggatgtt 47124476  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  47124475 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 47124376  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  | || ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||    
T  47124375 gggacagtatctctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgaggaggcatgacgctatttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 47124276  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||  | ||||| |||||||| || || |||||     
T  47124275 tttcattcctattaatatcagttacccggtagcgcagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 47124176  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  47124175 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 47124076  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  47124075 gtcagtcgga 47124066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4679163 - 4678560
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||    
T  4679163 atagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 4679064  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||      
T  4679063 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 4678964  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678963 tttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggata 4678864  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  4678863 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 4678764  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | | | || ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  4678763 tcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctgagatttatatacatagtgtggtaaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagg 4678664  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  4678663 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 4678564  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  4678563 cgga 4678560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13942749 - 13942146
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||    
T  13942749 atagtgacttccaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 13942650  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||      
T  13942649 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 13942550  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13942549 ttcgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacatcattggatgtaccggagtggaaatgggata 13942450  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  13942449 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 13942350  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | | | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  13942349 tcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggctgagatttatatacatagtgtggtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagg 13942250  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13942249 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 13942150  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  13942149 cgga 13942146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 11303114 - 11303780
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || |||| | |||||    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||    
T  11303114 gagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttaatggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttaag 11303213  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || | ||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||| |||||||||     
T  11303214 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttcaaaaggttgagtttagaggaaaggcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacg 11303313  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303314 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 11303413  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  11303414 ttgagcatcagaagcttgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacac 11303513  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  11303514 tccgagagggcatgatgccatttgggtcgtcgtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatctggtagctcagttggcg 11303613  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  11303614 gagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 11303713  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11303714 aggacgccttgggatcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 11303780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28755049 - 28754440
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  28755049 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 28754950  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  28754949 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgtt 28754850  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28754849 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 28754750  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  28754749 gggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacaccccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 28754650  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  28754649 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttagcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagtattgtgtca 28754550  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  28754549 gatagagatccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 28754450  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  28754449 gtcagtcgga 28754440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 83 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44777969 - 44777369
Alignment:
Q  83 gtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 182  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| ||||||||    
T  44777969 gtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtca 44777870  T
Q  183 taagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggttt 282  Q
    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  |||    
T  44777869 taagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcatttt 44777770  T
Q  283 gtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagca 382  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44777769 gtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcccgcaggattgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggatagca 44777670  T
Q  383 tttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttc 482  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |    
T  44777669 tttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaagggacatgattcgatttgggtggtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcc 44777570  T
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
     || || |||| |||||| |||||||||||||| || || || || || | | |||||||| | ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||     
T  44777569 tatcaacatcaattatccggtagctcagttggctgaaatttatatacatagtgttgtgaagctacatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagat 44777470  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    || ||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||  ||||| || || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44777469 ccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggctcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgg 44777370  T
Q  683 a 683  Q
    |    
T  44777369 a 44777369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10384699 - 10384091
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  10384699 ctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 10384600  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  10384599 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 10384500  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10384499 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 10384400  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  10384399 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 10384300  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| |||||||  ||||| |||||     
T  10384299 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgt-tagtattgtgtcg 10384201  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| | |||| || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  10384200 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaatgtttgcaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 10384101  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  10384100 gtcagtcgga 10384091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 683
Target Start/End: Original strand, 13322293 - 13322659
Alignment:
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13322293 ttgagcatcggaggtctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatctctatggattttgtgacgagtttacctaatac 13322392  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13322393 tccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggca 13322492  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  13322493 gagatttatattcataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatagggatctgaggtttacttctagattctggaagagtttgc 13322592  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| |||||||| |  || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13322593 aagatgttttgggttcgaggttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 13322659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15228436 - 15227771
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||  | ||  ||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15228436 agaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaga 15228337  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||  ||||||| |||||||||  |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15228336 ttccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataa 15228237  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15228236 agatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagt 15228137  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| ||||||| || ||  || ||||||||||  || || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15228136 tgaacatcagaagcttgttgggttgttgacactattagaagtaccagaaaggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccgaatact 15228037  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||| ||  || || |||||||| |    
T  15228036 ccgagagggcatgatgccatatgggtagttgttgatagattgacgaagtcagcacactttattccgattaatattagttttctggtggcacagttggcag 15227937  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| ||||||    |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  15227936 agatttacatttgtgatattgcgaagctgcatggtgttccatcgagtattgtatcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgca 15227837  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| | |||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  15227836 agaggcgttgggttcaaagttgaggtggagttcagcttatcatccgcaaacaattggtcagtcgga 15227771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 16337910 - 16338519
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  16337910 ctgagaatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 16338009  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||| | | ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||    |||||     
T  16338010 ggagagtcataagagtaggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgtt 16338109  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16338110 gctcagtttgtttatgcttgtttgacttgttagaagtctaaagttgagcatcagaagcctgcagggttgttcacaccgttggatgtaccggagtggaagt 16338209  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  16338210 gggacaatatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 16338309  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  |||| | |||||||||| |||| || || ||||| ||||| |||||     
T  16338310 cttcattcctattaatatcagttacccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagtattgtgaagctgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtcg 16338409  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| | ||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  16338410 gatagggatccgaggttcagttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 16338509  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  16338510 gtcagtcgga 16338519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 683
Target Start/End: Original strand, 16329066 - 16329668
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || ||||    
T  16329066 agtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtc 16329165  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    | ||||| |  ||||||||| | |||||  ||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |||    
T  16329166 acaagagtaggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtt 16329265  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgtt-ggatgtaccggagtggaaatgggatag 380  Q
    ||| ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16329266 tgtttatgcttgcttgatttgtcaaaagtccaaggttgagcatcaaaagcttgcaaggttgttgacaccgttaggatgtaccggagtggaagtgggacag 16329365  T
Q  381 catttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatt 480  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| ||  || ||||||||||||| || |||||||||    
T  16329366 tatctctatggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcaaccggttgacgaagtcagcacacttcatt 16329465  T
Q  481 tcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagag 580  Q
     | || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  |||| | |||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16329466 cctatcaatatcagttacccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagtattgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggg 16329565  T
Q  581 acccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    | || ||||| | ||| || || ||||  ||||||||||| |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  16329566 atccgaggttcatttctaggttctggaagagtttacaagacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggttagtc 16329665  T
Q  681 gga 683  Q
    |||    
T  16329666 gga 16329668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 74 - 470
Target Start/End: Original strand, 11960567 - 11960963
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  11960567 ctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 11960666  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| |||||  | || |  ||||||||| | || || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    |||||     
T  11960667 agagagtcacgatagtagtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgtt 11960766  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960767 gctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 11960866  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggc 470  Q
    | || || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11960867 gagacagtatttctatggattttgtgacgagttttccaaacactccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggc 11960963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Original strand, 31694527 - 31694887
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  31694527 gagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 31694626  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  31694627 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 31694726  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31694727 aagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 31694826  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatggga 377  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  31694827 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttaaatgtgccggagtggaagtggga 31694887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31939691 - 31939331
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  31939691 gagaagcacagcaagtggatgtgaagtttgttgacttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 31939592  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  31939591 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagggtagcttgagtattcatccgggagctaca 31939492  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || |||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31939491 aagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 31939392  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatggga 377  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  31939391 ttgaacatcagaagccttcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtggga 31939331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17490542 - 17489962
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||     
T  17490542 caaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattc 17490443  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||    || ||  ||  |||||||||| | ||||||| |||    
T  17490442 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcttagtttgtgtattcttgtttgatttg 17490343  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |     
T  17490342 tcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgagatagcatatccatggattttgtgtcg 17490243  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||  |  ||| ||||  | || |||||  |  | || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| |    
T  17490242 agtttgccgaatactcttaaagggaatgacgcaatttgggtgattattgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctg 17490143  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  17490142 tttctcagttggcggagatctatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttacttctagatt 17490043  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17490042 ttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 17489962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 80 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 15248862 - 15248263
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  15248862 atagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaag 15248763  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    |||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  15248762 tcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacag 15248663  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||  || ||  | | || |||||||  |||||||||||||| |    
T  15248662 tttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtactagagtggaaatgggaca 15248563  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |  ||| || |  |||| |||||  | || || || ||||| |||||||| || |||||    
T  15248562 gcatatccatggattttgtgacgagtttgccgtatactcctaaagggaataacgcgatttgggtgattgttgatagattgacaaagtcggctcatttcat 15248463  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || || || |   ||||||||||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||||    
T  15248462 tccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttatatccgcgatattgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagataga 15248363  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||    || |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  15248362 gatatgagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagctcggcgtatcatcagcagacagatggtcagt 15248263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10006298 - 10005712
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  10006298 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 10006199  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  10006198 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 10006099  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || |  || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  10006098 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgcgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10005999  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  10005998 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 10005899  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10005898 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 10005799  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||||||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10005798 tagattttggaaaagtttacaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 10005712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10906923 - 10906322
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  10906923 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 10906824  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    |||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||    
T  10906823 atagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 10906724  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||||||| | |||||   |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || ||||||||||||||     
T  10906723 tgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagt 10906624  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |      
T  10906623 atatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctac 10906524  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    | |||||||| ||||  || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  10906523 ctattaatattagtttccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagaga 10906424  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10906423 tccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcg 10906324  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  10906323 ga 10906322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 172 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9523342 - 9522831
Alignment:
Q  172 gaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatg 271  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |  | ||    ||||    
T  9523342 gaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaaacgtgatg 9523243  T
Q  272 tcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaa 371  Q
    |  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||| ||| || ||||| || ||||||||    
T  9523242 ttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatgataccattagatgtgccagagtggaa 9523143  T
Q  372 atgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcg 471  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||||||||||     
T  9523142 atgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctaaagggaatgacccgatttgggtaattgttgatagattgacgaagtcggct 9523043  T
Q  472 cacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgt 571  Q
    || ||  || ||||||||||||||| |||  |  || ||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  9523042 cattttcttccgattaatatcagttttcctatttcttagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgt 9522943  T
Q  572 cagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgga 671  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9522942 cagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacaga 9522843  T
Q  672 tggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||    
T  9522842 tggtcagtcgga 9522831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13253388 - 13252802
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  13253388 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 13253289  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  13253288 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 13253189  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  13253188 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 13253089  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||  | || |||||| | || ||  ||||||||||||| || || ||  |  ||||||| || ||||    
T  13253088 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaagtcagctcattttctaccgattaacattagtt 13252989  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13252988 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 13252889  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13252888 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 13252802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16636471 - 16635885
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16636471 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16636372  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16636371 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16636272  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16636271 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 16636172  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16636171 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctgcctattaatattagtt 16636072  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16636071 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16635972  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16635971 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16635885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 43163795 - 43163209
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  43163795 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 43163696  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  43163695 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 43163596  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  43163595 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 43163496  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  43163495 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 43163396  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43163395 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 43163296  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43163295 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 43163209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Original strand, 16491646 - 16492199
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | |||||    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  16491646 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagtaccataaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 16491745  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||  | ||| |    || ||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16491746 atctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 16491845  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |  ||| ||    
T  16491846 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacgatttttccgcatactcctaaagggaat 16491945  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16491946 gacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcggagatctacattc 16492045  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |  || ||    
T  16492046 gtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattatggaaaagtttgcaagaggctttagg 16492145  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || ||||  ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16492146 ttctaagttgaggttgagttcggtgtatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 16492199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 379 - 683
Target Start/End: Original strand, 15952671 - 15952975
Alignment:
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  15952671 agcatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggctgacgaagtcggcacacttta 15952770  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15952771 ttccgatcaatattgcttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatag 15952870  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15952871 agatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacatatggtcag 15952970  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  15952971 tcgga 15952975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6601427 - 6600848
Alignment:
Q  104 aaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattga 203  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |    
T  6601427 aaggcgtgttgagattccgagggagaatttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 6601328  T
Q  204 tccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgt 303  Q
     ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | |||||||||||| |||||||  | |||||  | | |||||||||| | |||||   ||||    
T  6601327 cccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaacaagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgt 6601228  T
Q  304 cagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaa 403  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  6601227 cagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacaa 6601128  T
Q  404 gtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagt 503  Q
    |||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || || ||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||  || ||    
T  6601127 gttttccgaatactccgagagggagcgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtttccctgt 6601028  T
Q  504 agctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattt 603  Q
     || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6601027 tgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattt 6600928  T
Q  604 tggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6600927 tggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 6600848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 5424362 - 5424948
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  5424362 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 5424461  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  5424462 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 5424561  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  5424562 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 5424661  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  5424662 gtgacaagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 5424761  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5424762 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 5424861  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5424862 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 5424948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 15209624 - 15209006
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||  |||||||    
T  15209624 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcatggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgttttcttgacgacgatgagatgaagaa 15209525  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15209524 aatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttg 15209425  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || |||||||    
T  15209424 aaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtac 15209325  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| ||| |  | || || || |||||    
T  15209324 cagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttggatgattgttgatagattgac 15209225  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
     ||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| || || || || ||   |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15209224 aaagtcggcttatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtcttagttggcagaaatttatatccacgttattgtgaagttgcatggtgttccttcg 15209125  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || |||||||||||    || |||||||| ||||||||||  | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||    
T  15209124 agcattgtatcagatagagatatgagatttacttctagattttggaagattttgcaagaggttgtaggttctaagttgaggttgagctcggcgtatcatc 15209025  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15209024 cgcagacagatggtcagtc 15209006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 680
Target Start/End: Original strand, 26791753 - 26792414
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||  ||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  26791753 gaagcacaaaaagttgatgtaaagtttgtggacttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagat 26791852  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26791853 tccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 26791952  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || |||    
T  26791953 gatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtt 26792052  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  26792053 gagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccaaatactc 26792152  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||| ||| || || ||  | |||||||| ||||  || || || || ||||| ||    
T  26792153 ctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagttggctcattttataccaattaatattagtttccccgttgcccatttggcaga 26792252  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  26792253 gatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttccagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 26792352  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    || |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  26792353 gaggctttgggttcaaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtc 26792414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 53384450 - 53385036
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  53384450 gatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 53384549  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | || ||    
T  53384550 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgctt 53384649  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  53384650 agtttgtcagaagtcaaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgtcggaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 53384749  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||| | || |||||| | || || || ||||| ||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  53384750 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgatgcaatttgggttatagttgatagattgacaaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 53384849  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcaga-atattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
      || || || |||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  53384850 tccctgttgcccagttggcagagatttacat-cagagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttactt 53384948  T
Q  596 caagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53384949 ctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcgga 53385036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 15347683 - 15348263
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  15347683 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 15347782  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  15347783 atccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 15347882  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  15347883 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 15347982  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || |    
T  15347983 agtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctg 15348082  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15348083 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattatgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 15348182  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15348183 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 15348263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 680
Target Start/End: Original strand, 16411714 - 16412297
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16411714 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16411813  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16411814 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16411913  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| ||  | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16411914 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaaaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16412013  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  16412014 gtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 16412113  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16412114 tccccgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 16412213  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||  ||||| || || || |||||||||||    
T  16412214 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggagtatcaaccacaaacagatggtcagtc 16412297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 20061486 - 20062072
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | || || |||||||  || | |||||    
T  20061486 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttga 20061585  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  20061586 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 20061685  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  20061686 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 20061785  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  20061786 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 20061885  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20061886 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttc 20061985  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20061986 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 20062072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 15339967 - 15339383
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  15339967 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15339868  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  15339867 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15339768  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  || || ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  15339767 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 15339668  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  15339667 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 15339568  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
       | || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15339567 tcactgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 15339468  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15339467 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgtagctgagattgagttcggcgtatcatcgacagacagatggtcagtcg 15339383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 15588824 - 15589410
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  15588824 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15588923  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  15588924 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15589023  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  15589024 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 15589123  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || ||  ||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  15589124 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatcggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 15589223  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15589224 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 15589323  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15589324 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 15589410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 671
Target Start/End: Original strand, 15015171 - 15015762
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |    ||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| ||||| | |||||||     
T  15015171 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaat 15015270  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   | ||||||   |||||  | |      
T  15015271 tcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggttcaggttgaagcgagatgtggcacaa 15015370  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||  ||||  ||  |||||||| | || ||| | || |||||||| |||||||    
T  15015371 tttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacaccagaaacctgttgggatgttgacatctttagatattcccgagtggaagtgggata 15015470  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||  |||||  | |||||||| |  || |||||| |||| ||| |  | || || ||  | |||||||| || || ||  |    
T  15015471 gtatatccatggattttgtgaagagtttgtcgaatactccaaaaggacatgatgcgatttggataattgtggatagactaacgaagtcagctcatttggt 15015570  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || ||||   | ||| ||| | | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  15015571 tccgattaatatcagttttcctgtatctcagttggcggaaatttatattcgtgagattttgaggctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagataga 15015670  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgga 671  Q
    || ||||| |||||||| |||||| |||  ||||| || || | ||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15015671 gatccaagatttacttctagatttaggaagagtttgcaggaggcgttgggttctaagttgagtttgagttcggcatatcatccgcagtcgga 15015762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 680
Target Start/End: Original strand, 15724366 - 15724949
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  15724366 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15724465  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  15724466 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15724565  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  15724566 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 15724665  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||| ||| ||||    
T  15724666 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattattattagtt 15724765  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  15724766 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcaggcattgtgtcagatagagatccaagatttacttg 15724865  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15724866 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtc 15724949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 296
Target Start/End: Original strand, 13319900 - 13320122
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  13319900 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttaga 13319999  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||    
T  13320000 ggaaagtcacaagagtagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgacgtc 13320099  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  13320100 gctcagtttgtgtatgcgtgttt 13320122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 48426145 - 48425559
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  48426145 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 48426046  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||  | |||||    
T  48426045 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtaatcctgttt 48425946  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  48425945 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 48425846  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| | ||  | || |||||| | || || ||| |||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  48425845 gtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 48425746  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48425745 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 48425646  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48425645 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 48425559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12498934 - 12498360
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | |||||||||| | ||||    
T  12498934 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgg 12498835  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||   |||||||||    
T  12498834 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaatgcgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcagaa 12498735  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| || | |||||||  ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||     
T  12498734 gtcgaagattaaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatctatggattttgtgacgagtttt 12498635  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| || ||| ||||  | || |||||| | || || || |||| ||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  12498634 ccgaatactcctagagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgatgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 12498535  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  12498534 agttggcagagatttatatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaa 12498435  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12498434 aagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 12498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16372116 - 16371522
Alignment:
Q  91 aaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagca 190  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||| | ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |    
T  16372116 aaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgagcccgaatttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagta 16372017  T
Q  191 acttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgc 290  Q
     |||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||||| |||    |||||  | | |||||||||| |    
T  16372016 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggtt-gaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattc 16371918  T
Q  291 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatg 390  Q
     |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||    
T  16371917 ttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatg 16371818  T
Q  391 gattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaata 490  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||   ||| |||||  | || || || ||||||||||| || || ||  |  |||||||||    
T  16371817 gattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgtgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctaccgattaata 16371718  T
Q  491 tcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtt 590  Q
    | |||| ||  || || |||||| | || || || ||| || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  16371717 ttagttttcatgttgcccagttgccagatatttatattaaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatt 16371618  T
Q  591 tacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16371617 tacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggaaag 16371522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 680
Target Start/End: Original strand, 16756017 - 16756600
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16756017 gatgatcaaggcgtgttgagattccgagggagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16756116  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | || ||| | || ||| |||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16756117 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagattttctgggggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16756216  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||||| |||| ||||| ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16756217 agtttgtcaggagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgctggaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 16756316  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || || ||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16756317 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 16756416  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16756417 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16756516  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16756517 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtc 16756600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 686
Target Start/End: Original strand, 14875924 - 14876520
Alignment:
Q  91 aaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagca 190  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||| | ||| |||  || |    
T  14875924 aaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggttgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaaaagagttatagaagta 14876023  T
Q  191 acttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgc 290  Q
     |||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  |||||||  | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| |    
T  14876024 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattc 14876123  T
Q  291 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatg 390  Q
     |||||   || ||||||||  ||| |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||    
T  14876124 ctgtttagtttatcagaagttgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatg 14876223  T
Q  391 gattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaata 490  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | || || || ||||||||| |||| || ||  |  |||||||||    
T  14876224 gattttgtgacgagtttgcagaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagccggctcattttctaccgattaata 14876323  T
Q  491 tc-agttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggt 589  Q
    |  |||| ||| || || |||| ||| ||||| || ||  || | |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  14876324 tttagttttcctgttgcccagtaggcagagatttatatcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagat 14876423  T
Q  590 ttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14876424 ttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaag 14876520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Original strand, 16806391 - 16806944
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||| ||||||||||||   ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||  |||||||| || |||||||| |    
T  16806391 atttgcattcctgacgatccagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacg 16806490  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    | || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  16806491 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 16806590  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||| |     
T  16806591 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggactttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaac 16806690  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  | || | |||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||      
T  16806691 gacacaatttaggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatca 16806790  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
    || | || |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||  ||||| |  |||||    
T  16806791 aggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagttagcaagaggctttggg 16806890  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16806891 ttcaaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 16806944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 682
Target Start/End: Original strand, 14126121 - 14126611
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || ||||||||||| |||||    ||||| || | |||||||||| |     
T  14126121 cttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaagatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtgacacagtttgtgtattcc 14126220  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
     ||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||    
T  14126221 cgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaattgggatagtatatccatgg 14126320  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || |||| ||||||||| || ||  |  || |||||||    
T  14126321 attttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgatgaagtcggctcattttctaccgtttaatat 14126420  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     ||||  || || || |||||||| ||||| || |   |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  14126421 tagtttccctgttgcccagttggcagagatttataccaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagattt 14126520  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14126521 acttctagattttggaaaagttttcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgg 14126611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16692850 - 16692272
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||||     
T  16692850 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaaaaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccga 16692751  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||   |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  16692750 gagctacgaagatgtatcaggacttaaagaagattttctggtggtctggtttgaagcgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 16692651  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||| | || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |     
T  16692650 gtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatatgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagcctg 16692551  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| |  ||| ||||    || |||||  | || |  || |||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  16692550 ccgaatactcctaaagggaatgacgtaatttgggtaatcgttggtagattgacgaagtcggctcatttcctaccgattaatattagttttcctgttgccc 16692451  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    | ||||||||||| || ||  || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||     
T  16692450 aattggcggagatttatatcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaa 16692351  T
Q  609 aagtttaca----agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||    ||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16692350 aagtttgcaagctagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcagcttatcatccacagacggatggtcagtcgga 16692272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 683
Target Start/End: Original strand, 15401934 - 15402528
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15401934 agtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtc 15402033  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    |||  || | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||    
T  15402034 atagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtt 15402133  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||||||| | |||||   |||||  ||||       |||||||||||  || || ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||||||||||||     
T  15402134 tgtgtattcctgtttagtttgtcgaaagt-------tgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagt 15402226  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    || || |||||||||||||| ||| | || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |      
T  15402227 atatccatggattttgtgacgagtatgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctac 15402326  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    |||||||||| | ||  || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15402327 cgattaatattactttccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagaga 15402426  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||    
T  15402427 tccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagctgagattgagttcggcgtatcatccatagacagctggtcagtcg 15402526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 501 - 683
Target Start/End: Original strand, 12850104 - 12850286
Alignment:
Q  501 agtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaaga 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||     
T  12850104 agtagctcagttggcggagatttacattcataatattgtgaagttgcatggtgtcccatcaagcattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagg 12850203  T
Q  601 ttttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12850204 ttttggaagagtttacaagaggccttggattcaaagttgaggttgagttcggcttataatccgtagacagatggtcagtcgga 12850286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 13299920 - 13300066
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  13299920 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttaga 13300019  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaa 220  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13300020 ggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13300066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 13310578 - 13310724
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  13310578 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttaga 13310677  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaa 220  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13310678 ggaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaa 13310724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 253
Target Start/End: Original strand, 14580296 - 14580530
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||   |||  |||||||||||||| | ||||| ||||| || || || |    
T  14580296 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtggatttgttggttactagtaatcagattgaagatagtgatttcaagatcgatgatcaaggtgtattaaggt 14580395  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| ||||| | || || ||||| |  || | |||||||||| | || |||||||| ||    
T  14580396 ttcgaggtagaatttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaa 14580495  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggt 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14580496 aatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 388 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 15062163 - 15061865
Alignment:
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||||||| || || ||  |  ||||||    
T  15062163 atggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctaccgatta 15062064  T
Q  488 atatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaag 587  Q
    |||| |||| ||| || || || ||||| || || || ||| || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15062063 atattagttttcctgttgcccaattggcagatatttatattaaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaag 15061964  T
Q  588 gtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15061963 atttacttctagattttggaatagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacgcagacagatggtcagtcggaaag 15061865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Original strand, 11564551 - 11564699
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||  ||||| |  |||||||| |    
T  11564551 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagattttcttctagattttggaaaagttagcaagaggctttgggttcga 11564650  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  11564651 agttgaaattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcgga 11564699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15234304 - 15234140
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||  | ||  ||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15234304 agaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagtaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaga 15234205  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 182  Q
    ||  |||  ||||||| |||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15234204 ttccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtca 15234140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 13966868 - 13967073
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || ||  |||||| ||||| |    
T  13966868 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaatcgctgagtttgtttatgctt 13966967  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| ||||| || ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13966968 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcaaagaccatcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 13967067  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  13967068 ttttgt 13967073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 16742231 - 16742436
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||  |||  ||||||||||  || ||  |||||| ||||| |    
T  16742231 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcttggaatgaagaaggagatcgctgagtttgtttatgctt 16742330  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  |||| ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16742331 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcaggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtggaatagcatttctatgga 16742430  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  16742431 ttttgt 16742436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30138418 - 30138213
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  30138418 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 30138319  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30138318 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 30138219  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  30138218 ttttgt 30138213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30147969 - 30147764
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  30147969 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 30147870  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30147869 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 30147770  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  30147769 ttttgt 30147764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16257756 - 16257551
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||   | ||  |||||| ||||| |    
T  16257756 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagaccgctgagtttgtttatgctt 16257657  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16257656 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgatcatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatgga 16257557  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  16257556 ttttgt 16257551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 686
Target Start/End: Original strand, 11960986 - 11961044
Alignment:
Q  628 ggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11960986 ggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaag 11961044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15062430 - 15062276
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||| ||| ||||| |   |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||||    
T  15062430 gtgttgagattccgaggccaaatttgtattcatgatgatgaagggatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgg 15062331  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    ||||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    
T  15062330 gagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaa 15062276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 722
Target Start/End: Original strand, 14685174 - 14685210
Alignment:
Q  686 gaccgctggaagcccatatggtgtgtacggctatcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685174 gaccgctggaagcccatatggtgtgtacggctatcaa 14685210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 8273927 - 8274132
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||| | |    
T  8273927 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttattctt 8274026  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    | |||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  ||| ||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8274027 gcttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccattctttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 8274126  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  8274127 ttttgt 8274132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 644 - 683
Target Start/End: Original strand, 26008961 - 26009000
Alignment:
Q  644 tgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26008961 tgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 26009000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 530
Target Start/End: Original strand, 27209823 - 27210338
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27209823 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggattttatggttactagtaatcaggctgagaatagtgatttcaagattgatgagcaaggtgtgttg 27209922  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27209923 agatttagaggcaaaatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatattagaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagcta 27210022  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27210023 cgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcgttttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 27210122  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27210123 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttatatggattttgtgataagtttacctaat 27210222  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27210223 actccgagggggcatgattctatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttgg 27210322  T
Q  515 cggagatctacattca 530  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27210323 cggagatttacattca 27210338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 27364733 - 27365398
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||      
T  27364733 agaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaag 27364832  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  27364833 ttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacga 27364932  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27364933 agatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggt 27365032  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365033 tgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 27365132  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  27365133 ccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttggcgg 27365232  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  27365233 agatttatatccgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgca 27365332  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||  ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27365333 agatgctttgggctcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 27365398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 83 - 683
Target Start/End: Original strand, 19651771 - 19652371
Alignment:
Q  83 gtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 182  Q
    |||| |||||||| ||||| |  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19651771 gtgacttcaaggtggatgatcggggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 19651870  T
Q  183 taagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggttt 282  Q
     ||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||   |||||  |||  |||    
T  19651871 caagagtagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcatttt 19651970  T
Q  283 gtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagca 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  19651971 gtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaacgttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacagta 19652070  T
Q  383 tttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttc 482  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19652071 tttctatggatttagtgacaagtataccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttattgtagacaggttgacgaagtcggcacacttcattcc 19652170  T
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||     
T  19652171 gattaatatcagttatccggtagcacagttggcggagatttatattcataacattgtgaagttatatggagtaccgtcgagtattgtgtcggataaggat 19652270  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19652271 ccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgg 19652370  T
Q  683 a 683  Q
    |    
T  19652371 a 19652371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23277503 - 23276900
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23277503 atagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaag 23277404  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||      
T  23277403 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcatgacgtcgctcaa 23277304  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23277303 tttgtatatgcgtgcttgagttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccggaatggaagtgggata 23277204  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23277203 gcatttctatggattttgtgacgattttaccgaacactccaagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttat 23277104  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||     
T  23277103 tccgattaatatcagttatccggtagcgcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagt 23277004  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||  | ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23277003 gattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgcattgggttcgaagttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 23276904  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  23276903 cgga 23276900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24949314 - 24948713
Alignment:
Q  83 gtgatttcaaggttgatgagcaagga-gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24949314 gtgacttcaaggttgatgatcatggttgtgatgagattcagaggaagaatttgcattcctcatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtc 24949215  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    | ||||| | ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||   || ||  |||  ||    
T  24949214 acaagagtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgttgctcattt 24949115  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  24949114 tgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgatatcgttggatgtgccggagttgaaatgggatagg 24949015  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  24949014 atttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgatgaagttggcgcactttattc 24948915  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  24948914 cgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtatcagataggga 24948815  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||||||  |||| ||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24948814 tccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaagatgcattggtttcgatgttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcg 24948715  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  24948714 ga 24948713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27788531 - 27787865
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||     |||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  27788531 gagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 27788432  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||     
T  27788431 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 27788332  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27788331 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaagg 27788232  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27788231 ttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 27788132  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| | || || || |||||||| ||||||||||||||     
T  27788131 tccgaggggacatgattcgatttgggtcgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacattagttatccggtagctcagttggct 27788032  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  27788031 gagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 27787932  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27787931 aggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 27787865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 31831391 - 31830782
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||    
T  31831391 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattcttga 31831292  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |  |||||     
T  31831291 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaaaagagatgtt 31831192  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31831191 gctcagtttgtttatgcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 31831092  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  31831091 gggacagtatctccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 31830992  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||  | ||||| |||||||| || || |||||     
T  31830991 tttcattcctattaatatcagttacccggtagcgcagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 31830892  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  31830891 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 31830792  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  31830791 gtcagtcgga 31830782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12575080 - 12574477
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||| |||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||    
T  12575080 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgcttagattcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaag 12574981  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||      
T  12574980 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 12574881  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12574880 tttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggata 12574781  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  12574780 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggtagtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 12574681  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12574680 tcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctgagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggataga 12574581  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12574580 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 12574481  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  12574480 cgga 12574477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1064484 - 1063875
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  1064484 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 1064385  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  1064384 ggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgtt 1064285  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1064284 gctcagtttgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 1064185  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  1064184 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 1064085  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  1064084 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtctagtattgtgtcg 1063985  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  1063984 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaaattgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 1063885  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  1063884 gtcagtcgga 1063875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20828992 - 20828383
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  20828992 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 20828893  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||||     
T  20828892 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgtt 20828793  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20828792 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 20828693  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  20828692 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 20828593  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  20828592 cttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 20828493  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  20828492 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 20828393  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  20828392 gtcagtcgga 20828383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20833718 - 20833109
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  20833718 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 20833619  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||||     
T  20833618 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgtt 20833519  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20833518 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 20833419  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  20833418 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 20833319  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  20833318 cttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 20833219  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  20833218 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 20833119  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  20833118 gtcagtcgga 20833109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 279 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24642270 - 24641866
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24642270 gtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttggatgtgccggagtggaagtgggat 24642171  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24642170 agcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttta 24642071  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||    
T  24642070 ttccaattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagattcatattcacaatattgtgaagttacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatag 24641971  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    ||  || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24641970 aggtccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgacttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggttag 24641871  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  24641870 tcgga 24641866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23294713 - 23294315
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  23294713 aagtggatgtgaagtttgtggatttaatggttgctggtaatgaagctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaag 23294614  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  23294613 aatttgcattcctgatgatgataatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcat 23294514  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23294513 gatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagtgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 23294414  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  23294413 agcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgaaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggc 23294315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 208 - 683
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125476
Alignment:
Q  208 ggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 307  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    ||| |  |||  ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttggcttgtcaga 21125102  T
Q  308 agtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttt 407  Q
    ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  21125103 agtctaaggttgagcatcacaagtctacagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagttt 21125202  T
Q  408 acctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagct 507  Q
    ||| ||||||||||| || |||| | | || ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  21125203 accgaatactccgagaggacatggtgccatttgggttgttttcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagct 21125302  T
Q  508 cagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21125303 cagttggcggagatttatattcata--atcgtgaagttacatggggttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttgga 21125400  T
Q  608 gaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
      ||||| |||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21125401 agagtttgcaagatgcattgggttcaaagttgaggttgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 21125476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23111525 - 23110907
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgaga-atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||  || ||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||||||||| || ||  |||||||    
T  23111525 agaagcacagaaatttgatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatcaaact-agagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgag 23111427  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga-gtattgatccgggagctac 215  Q
    |||  ||||||||||||  |||| ||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |  || | ||| | ||||| |||||||||||||    
T  23111426 attctgaggcagaattttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataagtagctttaagtattcatccgggagctac 23111327  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||   |||||  | | |||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||     
T  23111326 aaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtgatgttgcacagtttgtatatgcatatttgacttgccagaaatctaaa 23111227  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23111226 gttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggataacatatccatggattttgtaacaagtttacccaata 23111127  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    |||| || ||||||||| | || ||||| || || || || ||||||||||  ||||| || ||  |||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  23111126 ctccaagagggcatgatgctatttgggtagttgtcgatagattgacgaagttagcgcattttatcccgattaatattagttttccggtggctcagttggc 23111027  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
    |||||| || ||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||     
T  23111026 ggagatttatattcgtgatattgtgaagttgcattgtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttg 23110927  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaa 635  Q
    ||||| |  |||||||||||    
T  23110926 caagaggcattgggttcaaa 23110907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 136 - 683
Target Start/End: Original strand, 11357646 - 11358193
Alignment:
Q  136 attcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttga 235  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11357646 attcctgacattgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttga 11357745  T
Q  236 agaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgc 335  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11357746 agaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgc 11357845  T
Q  336 aggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcg 435  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  |     
T  11357846 agggttgttggcaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgct 11357945  T
Q  436 atatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaata 535  Q
    || ||||| || || ||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  | |     
T  11357946 atttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcaattatccggtagcgcagttagcagagatttatattcgcagtg 11358045  T
Q  536 ttgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaa 635  Q
    | || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| ||    
T  11358046 tggtaaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaa 11358145  T
Q  636 attgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  11358146 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgga 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 45530191 - 45529644
Alignment:
Q  127 agaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45530191 agaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatc 45530092  T
Q  227 atgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||  | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  45530091 atgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatca 45529992  T
Q  327 gaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgaggggg 426  Q
    ||  ||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||     
T  45529991 gaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttctagagtggaagtgggatagtatgtccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagga 45529892  T
Q  427 catgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctaca 526  Q
    |||||| |||| |||||  | || || ||  ||||||||||||| || || |||   ||||| ||||||| ||| ||  ||||||||   ||||| || |    
T  45529891 catgatgcgatttgggtaattgtggatagactgacgaagtcggctcattttattctaattaacatcagttttcctgtgtctcagttgatagagatttata 45529792  T
Q  527 ttcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgtt 626  Q
    | |   | ||||||||| | ||||| ||| | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || | |||    
T  45529791 tccgagagattgtgaagctacatggtgttgcatcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgtt 45529692  T
Q  627 gggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    |||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45529691 gggttctaagttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatgg 45529644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 680
Target Start/End: Original strand, 21144696 - 21145357
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||| | ||| ||||  ||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  21144696 gaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggacttattggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagat 21144795  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21144796 tccgagggagaatttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 21144895  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||     
T  21144896 gatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtc 21144995  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21144996 gagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactc 21145095  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| ||||| || ||  |  |||| ||||| ||||  || || ||  ||||||| ||    
T  21145096 ctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcggctcattttctaccgatcaatattagtttccctgttgccaagttggcaga 21145195  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
     || |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21145196 aatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 21145295  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  21145296 gatgctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtc 21145357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 30210633 - 30211236
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||   |  ||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  30210633 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcaggatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattctagaagaaag 30210732  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||   |||||  | |      
T  30210733 tcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttg-tttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaa 30210831  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||  || ||| | || ||||||| ||||||||    
T  30210832 tttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacatttagatattccagagtggatatgggata 30210931  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcga-tatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    | || || || ||||||||| | ||||| || |||||||| |  || ||||||  || | |||||  | || || || |||||||||||| |  | || |    
T  30210932 gtatatccatagattttgtgtcgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgtgattttgggtaattgtggatagattgacgaagtcgactaatttta 30211031  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || | ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || || |   | ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  30211032 ttccaattaacatcagttttcctgtatctcagttggcggagatttatatccgtgagattgtgaagctacatggtgttccatcgagtattgtatcagatag 30211131  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || | ||||||||| || ||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  30211132 ggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgttgggttctaagttgagtttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggacag 30211231  T
Q  679 tcgga 683  Q
     ||||    
T  30211232 acgga 30211236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 27371979 - 27371396
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  27371979 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27371880  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  27371879 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27371780  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  27371779 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 27371680  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||  | || |||||| | || || ||||||||||||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  27371679 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcaactcattttctacctattaatattagtt 27371580  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27371579 ttcccgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 27371480  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27371479 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtc 27371396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9610846 - 9610260
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  9610846 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 9610747  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  9610746 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 9610647  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  9610646 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 9610547  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  9610546 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 9610447  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9610446 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 9610347  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9610346 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 9610260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24676267 - 24675613
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||| |    
T  24676267 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccg 24676168  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  24676167 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 24676068  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  |||||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||  ||||| ||| |||||||| |||    
T  24676067 gatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtctaaagtcgaagattgagcattaga 24675968  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      | ||| ||  || ||  | | || ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |    
T  24675967 aacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatggaatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 24675868  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||| ||||| || |||    
T  24675867 tgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggcccattttctaccgattaatatcagttttcctgttgcctagttggcagagatttatatt 24675768  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
     || | ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||    
T  24675767 aaggagattgtgaagttgcatggtgttctttcgagcattgtatcatatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 24675668  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24675667 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 24675613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10869560 - 10868974
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||    
T  10869560 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttga 10869461  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  10869460 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 10869361  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  10869360 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10869261  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||| |||   ||  |||| |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  10869260 gtgacgagtttgccgagtactccgagagggagcgacgcgatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 10869161  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10869160 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 10869061  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10869060 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 10868974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 24876465 - 24877068
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  24876465 atagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagag 24876564  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||||| |||||||||    |||||  | | |    
T  24876565 tcacaggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacag 24876664  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | |||||   |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24876665 tttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggata 24876764  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||||| || || || |||||||| ||||| || ||| |    
T  24876765 gtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttgttgttgatagattgacgaaatcggctcatttcct 24876864  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
      |||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  24876865 accgatcaatattagtttccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagataga 24876964  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  24876965 gatccaagatttacttctacattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagt 24877064  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  24877065 cgga 24877068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 24263074 - 24262497
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | |||||  ||||||  || | ||||||||||     
T  24263074 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattc 24262975  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  24262974 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 24262875  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  24262874 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 24262775  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || |    
T  24262774 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccg 24262675  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24262674 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 24262575  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  24262574 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtc 24262497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16926070 - 16925484
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16926070 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16925971  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16925970 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 16925871  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  16925870 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtataacgatggatttt 16925771  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16925770 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 16925671  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16925670 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16925571  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16925570 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcgga 16925484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16999710 - 16999124
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16999710 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16999611  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16999610 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 16999511  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  16999510 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtataacgatggatttt 16999411  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16999410 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 16999311  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16999310 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16999211  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  16999210 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcgga 16999124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27218726 - 27218140
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  27218726 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27218627  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||| ||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  27218626 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27218527  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| ||  | || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  27218526 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttacacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 27218427  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  27218426 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 27218327  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27218326 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 27218227  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27218226 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 27218140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 451 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23294314 - 23294082
Alignment:
Q  451 gacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatg 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||    
T  23294314 gacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaaaatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctacatg 23294215  T
Q  551 gggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttc 650  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||  |||||||| || ||||  ||||||||    
T  23294214 gtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttacaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttc 23294115  T
Q  651 ggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23294114 ggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 23294082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16923599 - 16923013
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16923599 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16923500  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16923499 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16923400  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16923399 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16923300  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || ||| |||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16923299 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 16923200  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16923199 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16923100  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16923099 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16923013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16982862 - 16982276
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  16982862 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16982763  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  16982762 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16982663  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  16982662 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16982563  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || ||| |||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16982562 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 16982463  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16982462 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 16982363  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16982362 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 16982276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17064427 - 17063841
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  17064427 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 17064328  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  17064327 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 17064228  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  17064227 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 17064128  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || ||| |||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  17064127 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 17064028  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17064027 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 17063928  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17063927 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 17063841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17068085 - 17067499
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  17068085 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 17067986  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  17067985 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 17067886  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  17067885 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 17067786  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || ||| |||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  17067785 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggctgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 17067686  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17067685 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 17067586  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17067585 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 17067499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24710738 - 24710157
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  24710738 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 24710639  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  24710638 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 24710539  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  24710538 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacg 24710439  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggt-tgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatcca 501  Q
    ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | ||  |  ||| |||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  ||     
T  24710438 agtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgtgtaggggtgtgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccct 24710339  T
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24710338 gttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagat 24710239  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24710238 tttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 24710157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 22324595 - 22325175
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||| | || ||  |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || |  |||||||||     
T  22324595 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtgtcccagataatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattc 22324694  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  22324695 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 22324794  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  22324795 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 22324894  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  ||      
T  22324895 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttcccta 22324994  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22324995 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 22325094  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22325095 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 22325175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 41608124 - 41608704
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  41608124 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 41608223  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||   |||    
T  41608224 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttg 41608323  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || || ||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  41608324 tcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 41608423  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || |    
T  41608424 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccg 41608523  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41608524 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagacagagatccaagatttacttctagatt 41608623  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41608624 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcgga 41608704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Original strand, 21324931 - 21325585
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  |  || ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |    
T  21324931 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttgattgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcg 21325030  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||     
T  21325031 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcac 21325130  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || || |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | |  || || ||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21325131 gatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaattcgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 21325230  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  |    
T  21325231 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagttttccgaatactcctagaggata 21325330  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||   ||| |||||  | || ||||| |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || |||    
T  21325331 tgacgagatttgggtgattgttgacagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatt 21325430  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
     || | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || |    
T  21325431 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttctgtcgagcattatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttag 21325530  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21325531 gttctaagttgagattgagtccggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21325585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 620
Target Start/End: Original strand, 23107461 - 23107986
Alignment:
Q  95 ttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaactt 194  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||||||| |||| ||  |||||||  |||||   ||||| || ||||  || |||||    
T  23107461 ttgatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccatagaagtaactt 23107560  T
Q  195 gagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgt 294  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||| ||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||    
T  23107561 gagtattaatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggcggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgt 23107660  T
Q  295 ttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatt 394  Q
    |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  23107661 ttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatt 23107760  T
Q  395 ttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcag 494  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |  ||  ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||    
T  23107761 ttgtgacgagttttccgaatactcctaaaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattag 23107860  T
Q  495 ttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttact 594  Q
    || ||| ||  |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23107861 ttttcctgttcctcagttggccgagatctacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttact 23107960  T
Q  595 tcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    || |||||||||| |||||| |||||    
T  23107961 tctagattttggaaaagtttgcaaga 23107986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 543
Target Start/End: Original strand, 24819351 - 24819865
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||   ||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  24819351 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 24819450  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  24819451 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 24819550  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |   ||||  | |  ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24819551 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 24819650  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      |||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| |    
T  24819651 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaa 24819750  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | ||  ||||  | ||  | |  |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||     
T  24819751 tgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagtgggcggagatttacatc 24819850  T
Q  529 cagaatattgtgaag 543  Q
    |   |||||||||||    
T  24819851 cgcgatattgtgaag 24819865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 22756120 - 22756784
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  22756120 gaagcacataaagtttatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagat 22756219  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  22756220 tccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaa 22756319  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||||||  | |||||| | || ||||||||| | |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||| ||||||| ||| ||    
T  22756320 gatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtaagaagtcgaagatt 22756419  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || |||||||  |||||  |  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  22756420 gaacatcagaaacctgctagtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgcgacgagtttgccgaatactc 22756519  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| ||||  |||  |||||  |  | || || ||||| |||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||    
T  22756520 ctagagggaatgacgcgacttgggtgatttttgatagattgacaaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctgttgcccagttggcaga 22756619  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||    
T  22756620 gatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacctctagattttggaagagttttcaa 22756719  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22756720 gaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacacagacagatggtcagtcgga 22756784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 44385302 - 44385888
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  44385302 gatgatcaaggtgtgttgaaattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 44385401  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  |   |||| ||||| | |||||    
T  44385402 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttatgtattcctgttt 44385501  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || | ||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  44385502 agtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 44385601  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  ||   ||  | || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  44385602 gtgacgagtttgccgaatactccgagatggagcgacacaatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 44385701  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44385702 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 44385801  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  44385802 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcgga 44385888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 23099669 - 23099797
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23099669 cagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttattggttactagtaatcaagctgaggctagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttg 23099768  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctga 143  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  23099769 aggttcagaggcagaatttgtattcctga 23099797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 367 - 683
Target Start/End: Original strand, 24707485 - 24707801
Alignment:
Q  367 tggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagt 466  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || ||||| ||||||||||    
T  24707485 tggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgacagattgacgaagt 24707584  T
Q  467 cggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtat 566  Q
    |||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24707585 cggctcattttctagcgattaatattagtttccctgttgcccagttggcagagatttatattaaggaaattatgaagttgcatggtgttccttcgagcat 24707684  T
Q  567 agtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcag 666  Q
     || ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24707685 tgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcag 24707784  T
Q  667 acggatggtcagtcgga 683  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707785 acagatggtcagtcgga 24707801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23064427 - 23064201
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  23064427 ttgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcaattggcagagatttatattcgagatatagtgaagttgcatggtgttc 23064328  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    | || || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  23064327 cttcaagcattgtgtcagatagagatccaagttttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggctta 23064228  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23064227 tcatccgcagacagatggtcagtcgga 23064201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23067101 - 23066870
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||    
T  23067101 gatgatcaaggtgtgttgcggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttga 23067002  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    ||| |  | | ||||||||||   |||||    
T  23067001 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatattgcacagtttgtgtattattgttt 23066902  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23066901 gatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaga 23066870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 535 - 681
Target Start/End: Original strand, 20442684 - 20442830
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| |    
T  20442684 attgtgatgttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcga 20442783  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20442784 agttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcg 20442830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23189279 - 23189131
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| || |    
T  23189279 attgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 23189180  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23189179 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcgga 23189131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 521
Target Start/End: Original strand, 21890451 - 21890875
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||  ||||| || ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  21890451 gatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21890550  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||  |||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  21890551 gtattcatctaggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagcgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgttt 21890650  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  21890651 gatttgtcagaagtcgaaggttgaacattagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaaagggatagtatatccatggatttt 21890750  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||| ||| |  ||| ||||| |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  21890751 gtgacgagtttgccgaataatcctaaagggaatgatgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 21890850  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagat 521  Q
     ||| ||  |||||||||| |||||    
T  21890851 ttcctgtttctcagttggcagagat 21890875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 554 - 687
Target Start/End: Original strand, 24825472 - 24825605
Alignment:
Q  554 ttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggc 653  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  || ||||||||    
T  24825472 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttaagttcggc 24825571  T
Q  654 ttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24825572 gtatcatccgcagacagatggtcaatcggaaaga 24825605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 395
Target Start/End: Original strand, 24831017 - 24831218
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  24831017 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatca-gatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 24831115  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24831116 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 24831215  T
Q  393 ttt 395  Q
    |||    
T  24831216 ttt 24831218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 12640062 - 12640267
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||| | |    
T  12640062 ttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttattctt 12640161  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    | |||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12640162 gcttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccaaagtggaagtgggatagcatttctatgga 12640261  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  12640262 ttttgt 12640267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22276892 - 22276687
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  22276892 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctaaaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 22276793  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22276792 gtttggtttgtcagaaatagaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtaccaaaatggaaatgggatagcatttctatgga 22276693  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  22276692 ttttgt 22276687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 22761401 - 22761474
Alignment:
Q  196 agtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    |||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22761401 agtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaagga 22761474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25128945 - 25128792
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| | |||||||||| |  | ||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |  ||||||      
T  25128945 agttggctgggatctacattgaacagattgttaggttgcatggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttggga 25128846  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatcc 662  Q
    |||||| |||||||  |||||  | || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  25128845 aagtttgcaagatgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttatcatcc 25128792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 193 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 6708
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7098 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggaaagttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 6999  T
Q  393 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatc 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6998 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattccatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatc 6899  T
Q  493 agttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttta 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6898 agttatccggtagctcagttggcggagatttacattcataacattgtgaagttgcatggtatcccctcgagtatagtgtccgatagagacccaaggttca 6799  T
Q  593 cttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6798 cttctagattttggaagagttcacaagatgcgttgggttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 6708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 32791 - 33459
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  32791 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 32890  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  32891 aagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 32990  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32991 cgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 33090  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091 ggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 33190  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  33191 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttgg 33290  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  33291 cggagatttatattcgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagttt 33390  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33391 gcaagatgctttgggctcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 33459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 74 - 521
Target Start/End: Original strand, 56073 - 56520
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  56073 ctgaggatagtgacttcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttaga 56172  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||     
T  56173 agaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgaagtt 56272  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  56273 gctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagt 56372  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    | |||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  56373 gagatagcatttctatggatttggagccaagtttaccaaacacttcgagagggtatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgca 56472  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  56473 cttcattcctattaatattagttatccggtagcacagttggcggagat 56520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41272 - 41067
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  41272 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 41173  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41172 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 41073  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  41072 ttttgt 41067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 49628 - 50296
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  49628 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatgaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 49727  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |  || ||| |||||||||| ||||||||  | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  49728 aagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 49827  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  49828 cgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 49927  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49928 ggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacataat 50027  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  50028 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagttttccggtggctcagttgg 50127  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  50128 cggagatttatattcgggacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagttt 50227  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50228 ccaagatgctttgggctcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacggatggtcagtcgga 50296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44264 - 43678
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||| | ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||    
T  44264 gatgatcaaggtgtgttgagattccgagagagaatttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttga 44165  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |  |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  44164 gtattcactcgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 44065  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  44064 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 43965  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||||| | || || ||||||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  43964 gtgacgagtttgccgaatactcccagagggaacgatgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 43865  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43864 tccctgttgcccagttggcagagatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 43765  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43764 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 43678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9584 - 8998
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  9584 gatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 9485  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||| |    
T  9484 gtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtct 9385  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  9384 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 9285  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| ||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  9284 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcggctcattttctaccgattaatattagtt 9185  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      ||  | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9184 tccctattgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttc 9085  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  9084 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16046 - 15460
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||| || | ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  16046 gatgatcaaggtgtggtgagattccgaggaagaatttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 15947  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||  |    
T  15946 gtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgact 15847  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  15846 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccaaaatggaaatgtgatagtatatcaatggatttt 15747  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| ||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  15746 gtgacgagtttgccgaatactcctatagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcggctcattttctaccgattaatattagtt 15647  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      ||  |  | |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15646 tccctatttcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttc 15547  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| || || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15546 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggatcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 15460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 733 - 966
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||     
T  733 agaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtggccttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcatggtgtattgagg 832  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  833 tttcgaggtagaatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaa 932  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  933 aaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 51298 - 51962
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    | ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |    
T  51298 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 51397  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  51398 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 51497  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51498 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 51597  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  51598 gaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactc 51697  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  51698 cgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 51797  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  51798 gatatatattcagaatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacag 51897  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  51898 gacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcgga 51962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 60332 - 60996
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    | ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |    
T  60332 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 60431  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  60432 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 60531  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60532 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 60631  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  60632 gaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactc 60731  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  60732 cgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 60831  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  60832 gatatatattcagaatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacag 60931  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  60932 gacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcgga 60996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 683
Target Start/End: Original strand, 66720 - 67384
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||    | ||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |    
T  66720 gaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcaccgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggt 66819  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  66820 tcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgcgagctacgaa 66919  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66920 aatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 67019  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  67020 gaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactc 67119  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  67120 cgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctga 67219  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||     
T  67220 gatatatattcagaatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacag 67319  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  67320 gacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcgga 67384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26494 - 26389
Alignment:
Q  113 tgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagc 212  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  26494 tgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagc 26395  T
Q  213 tacaaa 218  Q
    ||||||    
T  26394 tacaaa 26389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 683
Target Start/End: Original strand, 20975206 - 20975873
Alignment:
Q  16 agagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttga 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  20975206 agagaagcaaaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttga 20975305  T
Q  116 gatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctac 215  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  20975306 ggttcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatacgggagctac 20975405  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 315  Q
     |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  20975406 gaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtatatgcatgtttgacttgctagaagtctaag 20975505  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  20975506 gttgaacatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgaatttaccacata 20975605  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20975606 ctccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccgatagctcagttggc 20975705  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||     
T  20975706 ggagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatggagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttg 20975805  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || ||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20975806 catgatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 20975873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1267463 - 1266797
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| || ||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  1267463 gagaagcacatcaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatgacactgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 1267364  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  1267363 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctaca 1267264  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  | |  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  1267263 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcccattttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaagg 1267164  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  1267163 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacac 1267064  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||  || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1267063 tcttagaggacacgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatcctgtagcacagttggcg 1266964  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |    
T  1266963 gagatttacattcataacattgttaagctgcatggtgtaccgtcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagcttgc 1266864  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  1266863 aagatgctttgggttcaaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcggtcgga 1266797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21841644 - 21840976
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  21841644 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaattaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 21841545  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  21841544 aggttcagaggaaggatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 21841445  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21841444 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctatgtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaa 21841345  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  21841344 ggttgagcattagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaat 21841245  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  21841244 actccgagagggcatgatgccatttgggtggtggtcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccagtagctcagttag 21841145  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21841144 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagttt 21841045  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  21841044 aaaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggctcatcatctgcaaacaaatggtcagtcgga 21840976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 31416030 - 31416696
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| ||||||||  ||||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31416030 gagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttaatgattactggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggcgtattgag 31416129  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  31416130 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 31416229  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31416230 aagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtttatgcatgcttgacttgtcagaagtctaagg 31416329  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  31416330 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgagcac 31416429  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31416430 tccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggcg 31416529  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  || | || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  31416530 gagatttatgtttataacattgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgc 31416629  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31416630 aagatgctttgggatcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 31416696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23656152 - 23655489
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  23656152 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 23656053  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  23656052 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaggtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 23655953  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    || ||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23655952 aagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 23655853  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  23655852 ttgagcatcagaagcctgcagggttattaacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacac 23655753  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  23655752 tccgagagggcatgatgccatttgggtagttgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttcattttgattaatattagttatccggtagcttagttggcg 23655653  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  23655652 gagatttatattcacaatattgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 23655553  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    |||| |  ||||||||  | ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23655552 aagacgccttgggttcggagttgaggttgagttcgggttatcatccgcagacagatggtcagtc 23655489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19852638 - 19851970
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||| ||||  || |||||||||||| |||||| || || ||||||    
T  19852638 cagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttg 19852539  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  19852538 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 19852439  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19852438 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaa 19852339  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||    
T  19852338 ggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaat 19852239  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  19852238 actccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggtacattttatttcgatcaatattagttttccggtagcacagttgg 19852139  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||     
T  19852138 cagaaatttacattcataatattgggaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttc 19852039  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19852038 gcaagatgcattgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 19851970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19858674 - 19858006
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||| ||||  || |||||||||||| |||||| || || ||||||    
T  19858674 cagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatgattgctagtattcaaactgaagatggtgatttcaaggatgatgatcagggtgtgttg 19858575  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  19858574 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 19858475  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19858474 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttatgcatgtttaacttgtcagaagtctaa 19858375  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||    
T  19858374 ggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttccatggattttgagacgagtttgccgaat 19858275  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  19858274 actccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggtacattttatttcgatcaatattagttttccggtagcacagttgg 19858175  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    | || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||     
T  19858174 cagaaatttacattcataatattgggaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttc 19858075  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19858074 gcaagatgcattgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 19858006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 62 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20389279 - 20388658
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||    
T  20389279 ctagtattcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaa 20389180  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |   | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  20389179 gttgattttagaagaaagtcacatacgtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtggtccggattg 20389080  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    |||   |||||    | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  20389079 aagcgtgatgttgtacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgc 20388980  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| || || || || |||||    
T  20388979 cggagtggaaatgggatagcatatccatggattgtgtgacaagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggtagttgttgatagattgac 20388880  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20388879 gaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccagtggctcagttggcggagatttatattcgtgatattgtaaagttgcatggtgttccgtcg 20388780  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    |  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  20388779 ataattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgtaagaggcgttgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatc 20388680  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  20388679 cgcaaacagatggtcagtcgga 20388658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22052088 - 22051422
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   || ||||||||  || ||||||||    | ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22052088 gagaagcacagcaagtggatgtcaagctggttgatttaatgattgctagtaatggcacggaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgag 22051989  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||     
T  22051988 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtaggttgagtattcatccgggagctacg 22051889  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||      
T  22051888 aagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttatgtatgcatgtttgacttgctagaagtctaaca 22051789  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22051788 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttactaaacac 22051689  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||  | |||||||| || ||||||||||  || |||||||| |||||||| || || ||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  22051688 tccgagaagacatgattctatttgggttgtgggtgataggttgacaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggct 22051589  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||  ||||| |    
T  22051588 gagatttatattcataatgttgtgaagctaaatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgc 22051489  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22051488 aggacgctttgggttccaagttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 22051422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 31570398 - 31571064
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||     |||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  31570398 gagaagcacagcaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttactggtaatagtattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 31570497  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||     
T  31570498 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 31570597  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31570598 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaagg 31570697  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  31570698 ttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 31570797  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| | || || || |||||| | ||||||||||||||     
T  31570798 tccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacattagttattcggtagctcagttggct 31570897  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  31570898 gagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 31570997  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31570998 aggacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 31571064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6680279 - 6679670
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| || || || ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  6680279 ctgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 6680180  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  6680179 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 6680080  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6680079 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 6679980  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  6679979 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 6679880  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  6679879 cttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 6679780  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  6679779 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 6679680  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  6679679 gtcagtcgga 6679670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 45 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22372137 - 22371499
Alignment:
Q  45 tgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgac 144  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||| |   | |||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||     
T  22372137 tgtggatttaatggttgctagtaatcaaaccgaaaagggtgatttcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaagaatattcattcctgat 22372038  T
Q  145 gatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgt 244  Q
      ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || | ||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  22372037 agtgatgagttgaaaaagttgattatagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattat 22371938  T
Q  245 tttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgtt 344  Q
    ||||||||||  | |||||  | |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  22371937 tttggtggtccagattgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgtt 22371838  T
Q  345 gacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggtt 444  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||     
T  22371837 gacaccgttagatgtgcctgagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatgatgccatttgggta 22371738  T
Q  445 gtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagt 544  Q
    || || || |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22371737 gttgttgataggttgacgaagtcggcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagctcatttgacggagatttacattcataatattgtgaagt 22371638  T
Q  545 tgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaatt 644  Q
    | |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22371637 ttcatgggcttccatcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggtttacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgcgttgggttcaaagttgaggtt 22371538  T
Q  645 gagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  22371537 gggttcggcttataatccgcaaacagatggtgagtcgga 22371499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6604826 - 6604217
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| || || || ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  6604826 ctgaggatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttga 6604727  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  6604726 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 6604627  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6604626 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 6604527  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  6604526 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 6604427  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  6604426 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 6604327  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  6604326 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 6604227  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  6604226 gtcagtcgga 6604217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 803286 - 803895
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  803286 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctaga 803385  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  803386 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgtt 803485  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||  ||| || ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  803486 gctaagttcgtttatgcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 803585  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  803586 gggacagtatctctacggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 803685  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  803686 cttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcatagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 803785  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||| || || ||||    
T  803786 gatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagtttggcttatcatcctcaaacagatg 803885  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  803886 gtcagtcgga 803895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 83 - 683
Target Start/End: Original strand, 16270846 - 16271446
Alignment:
Q  83 gtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 182  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || |||||    
T  16270846 gtgattttaaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtca 16270945  T
Q  183 taagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggttt 282  Q
     ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| ||||    
T  16270946 caagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagttt 16271045  T
Q  283 gtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagca 382  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16271046 gtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagta 16271145  T
Q  383 tttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttc 482  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16271146 tctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcc 16271245  T
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  16271246 gattaatatcagttacccggtagcacagttggcagagatttacattcacaatgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagggat 16271345  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16271346 ccgaggttcacttctaggttatggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgg 16271445  T
Q  683 a 683  Q
    |    
T  16271446 a 16271446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 74 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 14566310 - 14565698
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  14566310 ctgaggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 14566211  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| || || |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  14566210 ggagagtcacaaaagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgtt 14566111  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14566110 gctcagtttgtttatgcctgtttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 14566011  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || ||||| || || ||  |||||||||||||||| ||    
T  14566010 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggtagttgtcgatcggttgacgaagtcggcaca 14565911  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| || || |||||     
T  14565910 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttagcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 14565811  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14565810 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 14565711  T
Q  674 gtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||||||||    
T  14565710 gtcagtcggaaag 14565698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 73 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27355716 - 27355107
Alignment:
Q  73 gctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttag 172  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   || || ||||||  ||||||| | |    
T  27355716 gctgaggacagtgactttaaggttgatgatcagggtgtactgagattcagagggagagtttgtattcctgacagcgatgagttgaagg-gttgattcttg 27355618  T
Q  173 aagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgt 272  Q
    |||| ||||| ||||| |  ||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||    
T  27355617 aagatagtcacaagagtagattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgt 27355518  T
Q  273 cactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaa 372  Q
      ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  27355517 tgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggtttttgacaccgttagatgtactggagtggaag 27355418  T
Q  373 tgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgc 472  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||| | |    
T  27355417 tgggacagtatctctatggattttgtgacgaatttaccgaacactccgagagggcatgacgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcgacac 27355318  T
Q  473 acttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtc 572  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27355317 acttcattcccatcaatatcagttatccggtagaacagttggcagagatttacattcatagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtc 27355218  T
Q  573 agatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggat 672  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27355217 ggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacggat 27355118  T
Q  673 ggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||    
T  27355117 ggtcagtcgga 27355107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 683
Target Start/End: Original strand, 20009491 - 20010122
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  20009491 ttgatgtcaagcttgtggatttaatggttactagtaatcgaactgaagagggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaat 20009590  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    |||||||| |||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  20009591 ttgtattcttgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgat 20009690  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggc 331  Q
    |||||||| || |||||||||||  |||||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20009691 ttgaagaaattattttggtggtc-cgtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagc 20009789  T
Q  332 ctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatga 431  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||    
T  20009790 ctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggaatga 20009889  T
Q  432 ttcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcag 531  Q
    | | || |||||||| || ||  |||||||||| ||| |||| |                   || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  20009890 tgccatttgggttgttgtcgatcggttgacgaattcgacgcatt-------------------ttttccggtagcccagttggcggagatttacattcat 20009970  T
Q  532 aatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggtt 631  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  20009971 aatattgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatttcaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagatgccttgggtt 20010070  T
Q  632 caaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || |   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  20010071 caaagttaagggtgagttcggcttatcatccgcaggcagatggtcattcgga 20010122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 29303039 - 29303648
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| || ||| | ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| | |     
T  29303039 ctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattcttgt 29303138  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| ||||| ||||| |  ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||    |||||     
T  29303139 agagagtcacaagagtaggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgtt 29303238  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29303239 gctcagtttgtgtatgcatgtttgactttccagaagtctaaagtggaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagt 29303338  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||| ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  29303339 gggatagtatctctatggatttcgtgacgaatttaccaaacacttcgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 29303438  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||  || | || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||     
T  29303439 tttcattcctattaatatcagttattcggtagcacaattggcagagatttatgtttataacattgtgaagctacatggggttccttcgagtattgtgtcg 29303538  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29303539 gatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatg 29303638  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  29303639 gtcagtcgga 29303648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 279 - 681
Target Start/End: Original strand, 22061251 - 22061653
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061251 gtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgaacatcagaagcctgcagggttattgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 22061350  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22061351 agcatttctatggattttgtgatgagtttaccaaacactacgagaggacacgattctatatgggttgtggtcgacaggttgagaaagtcggcgcacttca 22061450  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22061451 ttcctattaacatcaagtatccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaaactacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatag 22061550  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
     || |||||||| ||||| || || ||||  ||| | || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22061551 ggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtctgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcag 22061650  T
Q  679 tcg 681  Q
    |||    
T  22061651 tcg 22061653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 82 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12305918 - 12305317
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| | ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12305918 agtgattttaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattcttgaagagagtc 12305819  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    ||||||| |  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    |||||  ||| |||    
T  12305818 ataagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaattgtgatgttgctcagtt 12305719  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    | | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  12305718 tttttatgcttgttttatttgtcagaagtctaaggttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagt 12305619  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    || ||||||||||| ||||| |  ||||| || |||||||| ||| ||||  | || || ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||     
T  12305618 atctctatggatttcgtgacgaccttaccgaacactccgagagggtatgacactatttgagttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacatttcattc 12305519  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  12305518 ctattaatatcagttatccggtagcacagttggcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagataggga 12305419  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| ||||| |  || ||||  |||||||| ||    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  12305418 tccgaggttcacttctatgttctggaagagtttacaggacacattgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcg 12305319  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  12305318 ga 12305317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 106 - 687
Target Start/End: Original strand, 22377099 - 22377680
Alignment:
Q  106 ggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatc 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |  | |||||||||| |||    
T  22377099 ggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatc 22377198  T
Q  206 cgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtca 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22377199 cgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca 22377298  T
Q  306 gaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagt 405  Q
     || || |  |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  22377299 taaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatccatgaattttgtgacgagt 22377398  T
Q  406 ttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtag 505  Q
    || |  |||||| | |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||| ||| |||     
T  22377399 ttgctgaatacttctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattctattctgattaatatcagttttcctgtat 22377498  T
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22377499 ctcagttggcggaaatttacattcgtgatattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttg 22377598  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22377599 gaagagtttgcaagaggcttttggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaga 22377680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 106 - 687
Target Start/End: Original strand, 22383274 - 22383855
Alignment:
Q  106 ggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatc 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |  | |||||||||| |||    
T  22383274 ggagtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatc 22383373  T
Q  206 cgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtca 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22383374 cgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca 22383473  T
Q  306 gaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagt 405  Q
     || || |  |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  22383474 taaatcaatagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgggaatgggatagcatatccatgaattttgtgacgagt 22383573  T
Q  406 ttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtag 505  Q
    || |  |||||| | |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || |  |||  |||||||||||||| ||| |||     
T  22383574 ttgctgaatacttctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattctattctgattaatatcagttttcctgtat 22383673  T
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22383674 ctcagttggcggaaatttacattcgtgatattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttg 22383773  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22383774 gaagagtttgcaagaggcttttggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaga 22383855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 687
Target Start/End: Original strand, 20395765 - 20396351
Alignment:
Q  94 gttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaact 193  Q
    |||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || | ||    
T  20395765 gttgatgatcagggattgttgcgatttcgaggcagaatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagct 20395864  T
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtg 293  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||| ||| | ||    
T  20395865 tgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtttattcatg 20395964  T
Q  294 tttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggat 393  Q
    ||||| |||||| ||||       |||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  20395965 tttgatttgtcaaaagt-------tgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaaatgggatagtatatccatggat 20396057  T
Q  394 tttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatca 493  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||   | || |||||  | || || || || |||||||| || || |||||| || |||||||||    
T  20396058 tttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggcatgccgctatttgggtgattgtggatagattaacgaagtcagctcatttcattccggttaatatca 20396157  T
Q  494 gttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttac 593  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| || | | |||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20396158 gttttcctctatctcagttggcggagatttacattcgccagattgtgaagttgcatggtgtcctgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttac 20396257  T
Q  594 ttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| ||  ||   ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20396258 ttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagctgtggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggaaaga 20396351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 23950055 - 23949476
Alignment:
Q  106 ggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatc 205  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||  |||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||| |||    
T  23950055 ggagtgttgcgattccgaggcagaaattgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatc 23949956  T
Q  206 cgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtca 305  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  | | |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  23949955 cgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaagtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtca 23949856  T
Q  306 gaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagt 405  Q
    |||||| || || ||||||||||  | ||| || ||| ||| | | || ||||| ||  |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  23949855 gaagtcaaaagtcgagcatcagaaacttgctgggttgatgatatctttagatgtgccaaagtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacaagt 23949756  T
Q  406 ttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtag 505  Q
    || || |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | ||||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||| ||| |||     
T  23949755 ttgccgaatactccaagagggaatgacgctatttgggtgattgtagatagattgacgaagttggctcatttcattccgattaacatcagttttcctgtat 23949656  T
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    |||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23949655 ctcagttggcggagatttacatccgcgatactgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttg 23949556  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
    ||  ||| | ||| | || || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23949555 gaagagtatgcaataggttttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggaaa 23949476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19113829 - 19113249
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  19113829 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 19113730  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  19113729 atccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 19113630  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  19113629 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacg 19113530  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| || |  || |    
T  19113529 agtttgcctaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagcttccctg 19113430  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19113429 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 19113330  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19113329 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 19113249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 681
Target Start/End: Original strand, 21921372 - 21921955
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||  |||||||| ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21921372 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttga 21921471  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  21921472 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttt 21921571  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  21921572 gatttgtcagaaatcaaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggataatatatccatggatttt 21921671  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |   || ||||  |||| |||||  | || || || ||| |||||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  21921672 gtgacgagtttgccgaa-actcctaaacggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgtcgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagtt 21921770  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21921771 ttcctgtttctcaattggaagagatttatattcataatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 21921870  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21921871 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcg 21921955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18857789 - 18857136
Alignment:
Q  30 agttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcaga 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  | ||| |||||||||   ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||     
T  18857789 agttgatgtcaagtttgtagatttgttggttgctagtaatcggactgaagaaagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagg 18857690  T
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  18857689 atttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 18857590  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    | || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||  | |||||   |||||| ||||| || ||||||||| |||     
T  18857589 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtactcctgtttagtttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaa 18857490  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |     
T  18857489 acctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcctagagggaac 18857390  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  | ||||| || ||||  || || || |||||||| ||||| || ||      
T  18857389 gacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaagtcggctcattttctacctattaacattagtttccctgttgcccagttggcagagatttatatca 18857290  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
    || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||    
T  18857289 aggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttggg 18857190  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18857189 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcacccgcagacagatggtcagtcgga 18857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 21393501 - 21394087
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||    
T  21393501 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 21393600  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||||| |||||    
T  21393601 gtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgttt 21393700  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  |  ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  21393701 gatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatggttagatgtgccatagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 21393800  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| | ||    
T  21393801 gtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattaatt 21393900  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  ||||  |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21393901 ttcctgtttctcaactggcagagatttatattcgaaatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 21394000  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21394001 cagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttttaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 21394087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 21787995 - 21788581
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||    
T  21787995 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 21788094  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||| ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||||| |||||    
T  21788095 gtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgttt 21788194  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  |  ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  21788195 gatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatggttagatgtgccatagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 21788294  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| | ||    
T  21788295 gtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattaatt 21788394  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  ||||  |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21788395 ttcctgtttctcaactggcagagatttatattcgaaatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 21788494  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21788495 cagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttttaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 21788581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 17673665 - 17674245
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  17673665 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 17673764  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  17673765 atccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 17673864  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  17673865 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 17673964  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || |    
T  17673965 agtttgccgaatactcctagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctg 17674064  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || |   || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  17674065 ttgcccagttggcagagatttataccaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 17674164  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17674165 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 17674245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22988376 - 22987757
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  22988376 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtgttgagattccgaggcagaatttctattccttacgatgatgagatgaagaa 22988277  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22988276 aatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttg 22988177  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    ||| |  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | |  || || |    
T  22988176 aaacgtgatatggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatcttaagacgtgc 22988077  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||    
T  22988076 cagagtagaaatgggataacatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgac 22987977  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
     |||||||  || || ||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22987976 aaagtcggatcattttataccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttatattcgcgatattgtgaagttgcatggtgttccttcg 22987877  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || | |||||||||  | || |||     |||||||||||  |||||  |||| |  || ||||| || ||||  ||| |||||||||||||||    
T  22987876 agcattgtatgagatagagattcgagattt-----aagattttggaagagtttgtaagaggctttaggttctaagttgaggttgcgttcggcttatcatc 22987782  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22987781 cgcagacagatggtcagtcggaaag 22987757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21252089 - 21251500
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || || |  || ||| |||    
T  21252089 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccacagaagtaacctga 21251990  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaa---aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtg 293  Q
    ||||| ||||||||||||| |   | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||    || || || | |||||| ||| | ||    
T  21251989 gtattcatccgggagctacgacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttacacagtttgtatattcttg 21251890  T
Q  294 tttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggat 393  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || || |||||||||||| | || || ||||||    
T  21251889 tttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtgtgatggtatcgttagatgtgccagattggaaatgggatcgtatatccatggat 21251790  T
Q  394 tttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatca 493  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |    
T  21251789 tttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatta 21251690  T
Q  494 gttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttac 593  Q
    ||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21251689 gttttcctgtttctcaattggcggagatttacatttgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttac 21251590  T
Q  594 ttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21251589 ttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatagtcagtcgga 21251500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Original strand, 20985101 - 20985347
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  || |||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  20985101 cagagaagcacagaaagttgatgtcaagtttgttgatttaatagttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 20985200  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| |||||| | ||| ||||||    
T  20985201 aggtttagaggaagaatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtatcttaagtattcacccgagagcta 20985300  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20985301 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggtttg 20985347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23651265 - 23650600
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  || |  | |||||||| ||| | ||||| ||| | ||||||||     
T  23651265 agaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactaaagacagtgattttaagatcgatgatcaatgtgtgttgagg 23651166  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| || |||||||||   |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  23651165 tttcgaggtaggatttgtattttagacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtatcttgagtattcatctgggagctacga 23651066  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||| || |||||||||||| || ||    
T  23651065 agatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgttggatttgtcagaagtcgaaagt 23650966  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  | ||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  23650965 tgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatcccaggattttgtgacgagtttgccaaatact 23650866  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||| ||||| || ||  ||  ||||||||| | || ||  ||  |||| ||||| |    
T  23650865 cctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaattcggctcattttcttctgattaatattatttttcttgtttctcatttggcag 23650766  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  23650765 agatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 23650666  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23650665 agaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcaatcgga 23650600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 679
Target Start/End: Original strand, 30312712 - 30313362
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||  ||||  |  |||| || || || || || || || |||||||||||  ||||  |    
T  30312712 aagttgatgtcaagtttgtagatttgttagttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgacgatcacggtgtgttgagattccgaggtcg 30312811  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
     ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||     
T  30312812 gatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcac 30312911  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || || |||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||  | | |||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30312912 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtctattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcaga 30313011  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||  || ||  | | || |||||  | || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |    
T  30313012 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgtcagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 30313111  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
     ||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || ||||||| |||||| || ||     
T  30313112 cgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggtggagatttatatc 30313211  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
     || | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  ||||    
T  30313212 aaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 30313311  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30313312 gttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagt 30313362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 401
Target Start/End: Original strand, 22248018 - 22248357
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||    
T  22248018 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccaaggcagaatttgtattcctgacattgacgagatgaagaa 22248117  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22248118 aatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttg 22248217  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| | ||||| || |||||||    
T  22248218 aaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgataacacctttagatgtac 22248317  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22248318 cagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgac 22248357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19979191 - 19978526
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| |||||||||| |||||  || |||| || ||||| ||||| || || || ||||||    
T  19979191 agaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcaggctgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtattgaga 19979092  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||  |||||||||||| |||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  19979091 ttccgaggtcgaatttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga 19978992  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| || ||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |    
T  19978991 agatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagat 19978892  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||||    
T  19978891 tgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagtttgccgaatact 19978792  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| ||||  | || |||||    || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || || |||||||| |    
T  19978791 cctagagggaatgacgcaatttgggtgactgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctgttgcccagttggcag 19978692  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  19978691 agatttatatcaatgaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtaacaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgca 19978592  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     || |  |||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19978591 ggaggctttgggttctaagttgagattgagctcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 19978526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 16407602 - 16408267
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || || || ||||| || || |||||||||    
T  16407602 agaagcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagtcgatgaccatggtgtgttgaga 16407701  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||  | ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | || |||||||| |    
T  16407702 ttccgaggtcggatttgcattcctgacgatgaagagatgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccaggagctacga 16407801  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg-tttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    | |||||||||||  | |||||| | || |||| |||||| ||||||    ||||   | | |||||||||| | | |||   |||||||||||| |||     
T  16407802 agatgtatcatgatctaaagaagattttctggtagtctggatttgaaacgagatgcggcacagtttgtgtattcctatttagtttgtcagaagtcgaaga 16407901  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | |||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16407902 ttgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagacgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatac 16408001  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||| || ||| || |  | || |||||| |  | || || |||||||||||||| || ||  |  |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||     
T  16408002 tcctagagggaattacgcaatttgggttataattgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgataaatattagttttcctgtggcccagttggca 16408101  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||| || | |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |    
T  16408102 gagatttatattaaggagattg-gaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagacccaagatttacttatagattttggaaaagtttgc 16408200  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16408201 aagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 16408267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 21166095 - 21166759
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || | || || ||||| ||||| || || |||||||||    
T  21166095 agaagcacataaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggagactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaga 21166194  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||  |||||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  21166195 ttccgaggtcgaatttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 21166294  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  | |||||| | || ||||||||| | |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  || ||||||||| ||| |    
T  21166295 agatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttatcagaagtcgaagat 21166394  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| |||||||   | || ||  || ||  | | || ||||| || |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21166395 tgaacatcagaaatccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatact 21166494  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || || ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || ||  |||| || |    
T  21166495 cctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctgttgcctagttagcag 21166594  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||| || | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  21166595 agatttatattaaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatt-tatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 21166693  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21166694 agaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 21166759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32601364 - 32600703
Alignment:
Q  22 gcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagattta 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||||||||  ||||  |  |||| || || || ||||| || || |||||||||||      
T  32601364 gcacaaaaagttgatgtcaagtatgtagatttgttggttgctagtaatcagactgaagacggtgactttaaagtcgatgatcacggtgtgttgagattcc 32601265  T
Q  122 gaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaat 221  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||  ||  ||||| |  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  32601264 gaggtcggatttgtattcccgacgatgcagagatgaaggaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagat 32601165  T
Q  222 gtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgag 321  Q
    |||||| ||  | || ||| | || |||||||||||||||||    |||||  |   |||||||||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||    
T  32601164 gtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgag 32601065  T
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  32601064 catcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccga 32600965  T
Q  422 gggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
    | ||| | ||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||    
T  32600964 gagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagat 32600865  T
Q  522 ctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagat 621  Q
     || ||  || | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||     
T  32600864 ttatatcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagag 32600765  T
Q  622 gtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32600764 gctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 32600703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22040992 - 22040422
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||   |  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||  |    
T  22040992 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcaaatatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctag 22040893  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  22040892 gagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 22040793  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||   |||| ||  || ||  | | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  22040792 gtcgaagattgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 22040693  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| || ||| | ||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  22040692 ccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 22040593  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    || |||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||     
T  22040592 agctggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaacatttacttctagattttggaa 22040493  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     ||||| ||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22040492 gagtttgcaagaggctttaggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagt 22040422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 679
Target Start/End: Original strand, 22119810 - 22120392
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||| | |||||||  ||   |||||    
T  22119810 gatgatcaaggtatgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaatagagtcatagaagttgcttga 22119909  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || | |||||||||||||||  | |||||  | | ||| |||||| | |||||    
T  22119910 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacaagatgtggcacagttcgtgtattcctgttt 22120009  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||||||| || || |||||||||||||  ||||  ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||||||||| || || || |||||||||    
T  22120010 agtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgttggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggacagtatatccatggatttt 22120109  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||||| | || || || ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||| || |    
T  22120110 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgatgcaatttgggttattgttgatagattgacaaagtcggctcattttctaccgattaatattagct 22120209  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | || |||| |||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  22120210 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattc 22120309  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22120310 tagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagt 22120392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Original strand, 22132772 - 22133263
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | ||||||| || |     
T  22132772 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgaattcc 22132871  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||    
T  22132872 tgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgg 22132971  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||    
T  22132972 attttgtgatgagttttccgaatactcctagagggaacgacacaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcatttcctaccgattaatat 22133071  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     |||| ||| || || ||||||   ||||| || ||  || | || || |  |||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| |||    
T  22133072 tagttttcctgttgcccagttgaaagagatttatatcaaggagatcgtaagattgcatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagattt 22133171  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22133172 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 22133263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Original strand, 19483621 - 19484022
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||  ||||  ||||  | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  19483621 agaagcacagaaagttgatgtaaagtttgtggatttgttggttgctagagatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgaga 19483720  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  19483721 ttccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 19483820  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||||| || ||    
T  19483821 agatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagt 19483920  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19483921 tgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatact 19484020  T
Q  418 cc 419  Q
    ||    
T  19484021 cc 19484022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22047080 - 22046932
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| |    
T  22047080 attgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcga 22046981  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22046980 aattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 22046932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21043590 - 21043268
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||    
T  21043590 gatgatcaaagagtgctgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 21043491  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    || ||  | |  ||||||||| | |||||    
T  21043490 gtattcatccgagagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacaatttgtgtattcttgttt 21043391  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    |  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  ||  |    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  21043390 ggtttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgacggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 21043291  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    ||||| ||||| || ||||||||    
T  21043290 gtgacgagtttgccgaatactcc 21043268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 538 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 15534084 - 15533943
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaat 637  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  15534084 gtgaggttacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagt 15533985  T
Q  638 tgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  15533984 tgagattgagttcggcttatcatccacagaaagatggtcagt 15533943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 680
Target Start/End: Original strand, 22164098 - 22164411
Alignment:
Q  367 tggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagt 466  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || ||||||||||    
T  22164098 tggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagt 22164197  T
Q  467 cggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtat 566  Q
    |||| || ||| |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | || || |  |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22164198 cggctcaattcctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtaagattgcatggtgttccttcgagcat 22164297  T
Q  567 agtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcag 666  Q
     || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  22164298 tgtattagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcagcgtgtcatccgcag 22164397  T
Q  667 acggatggtcagtc 680  Q
    ||  ||||||||||    
T  22164398 acatatggtcagtc 22164411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 393
Target Start/End: Original strand, 22128594 - 22128890
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || |  ||||    
T  22128594 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttga 22128693  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  22128694 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22128793  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggat 393  Q
       ||||||||| || || ||||||||||||| |||||| |||  | ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||    
T  22128794 agtttgtcagaaatcaaaagttgagcatcagaagcctgctggaaggatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggat 22128890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 576 - 683
Target Start/End: Original strand, 20017865 - 20017972
Alignment:
Q  576 tagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggt 675  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20017865 tagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggt 20017964  T
Q  676 cagtcgga 683  Q
    ||||||||    
T  20017965 cagtcgga 20017972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 571 - 683
Target Start/End: Original strand, 19484980 - 19485092
Alignment:
Q  571 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgg 670  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19484980 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacag 19485079  T
Q  671 atggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| |||||    
T  19485080 atggtcaatcgga 19485092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 21850069 - 21850274
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||| ||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  21850069 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgtttcggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 21850168  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850169 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccatagtggaaatgggatagcatttctatgga 21850268  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  21850269 ttttgt 21850274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 398
Target Start/End: Original strand, 23156716 - 23156949
Alignment:
Q  165 gattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaag 264  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||  |||||    
T  23156716 gattttggacgaaggtcataagagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgtttttgtggcctggaatgaag 23156815  T
Q  265 aaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccgg 364  Q
    |||||  |  |    ||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  |||||| |    
T  23156816 aaggagattgcgaaatttgtgtttgcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtaccag 23156915  T
Q  365 agtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  23156916 attggaagtgggatagtatctctatggattttgt 23156949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22284026 - 22283918
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |  ||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||    
T  22284026 atgtatcaggatctgaagaagttgttttggtggcatggaatgaagaaggatatagctgagtttgtgtatgcttgtttgatctgtcagaagtctaagattg 22283927  T
Q  320 agcatcaga 328  Q
    | |||||||    
T  22283926 aacatcaga 22283918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25283152 - 25283044
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |  |   |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||    
T  25283152 atgtatcaggatttgaagaagttgttttggtggccaggaatgaagaaggatatatcagagtttgtgtatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattg 25283053  T
Q  320 agcatcaga 328  Q
    | |||||||    
T  25283052 aacatcaga 25283044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 16876827 - 16877032
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||| | |    
T  16876827 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttattctt 16876926  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
      |||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16876927 acttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 16877026  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  16877027 ttttgt 16877032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 19863760 - 19863684
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  19863760 gtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagttt 19863684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 19868397 - 19868321
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  19868397 gtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagttt 19868321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 328
Target Start/End: Original strand, 20652065 - 20652200
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || ||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||||||||| |    
T  20652065 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgaatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtgtatgctt 20652164  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    | |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  20652165 gcttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 20652200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22316240 - 22316113
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||   |||||| ||||| |    
T  22316240 ttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggcctggaatgaagaaggagatcacagagtttgtttatgctt 22316141  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttga 320  Q
    |||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  22316140 gtttggtttgtcagaagtcgaagattga 22316113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Original strand, 22623596 - 22623633
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22623596 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatga 22623633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25283378 - 25283270
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| |      |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||    
T  25283378 atgtatcaggatttgaagaaattgttttggtggccaggaatgaagaaggatatataggagtttgtgtatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattg 25283279  T
Q  320 agcatcaga 328  Q
    | |||||||    
T  25283278 aacatcaga 25283270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 653
Target Start/End: Original strand, 22129017 - 22129132
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaat 637  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || |    
T  22129017 gtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcgaagt 22129116  T
Q  638 tgaaattgagttcggc 653  Q
    |||  |||||||||||    
T  22129117 tgaggttgagttcggc 22129132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20310 - 19644
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||| |||||||  ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  20310 gagaagcgcaacaagtggatgttaagtttgttgatttgatggttactggtaatgaagctgaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtattgag 20211  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||     
T  20210 attcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagagagtcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctact 20111  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20110 aatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcaaagg 20011  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20010 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacac 19911  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19910 tccgaaagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagtcggcgcacttcattcctattaatatcagttatctcgtagctcagttggcg 19811  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||| |    
T  19810 gagatttatattcagaacattgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtctgatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgc 19711  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  19710 aggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatgatcctcagacagatggtcagtcgga 19644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 75557 - 75437
Alignment:
Q  208 ggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 307  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||   |||||| ||||| ||||||  |||||| |    
T  75557 ggagcgacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggcctggaatgaagaaggatataacgaagtttgtatatgcttgtttgctttgtcaaa 75458  T
Q  308 agtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  75457 agtctaagattgaacatcaga 75437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 6411 - 7020
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  6411 ctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagatttagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttaga 6510  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || |||    
T  6511 ggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtc 6610  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6611 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgctggatgtaccggagtggaagt 6710  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6711 gggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgca 6810  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  6811 ctttattctgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggaaatctacattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcg 6910  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||| |  |||||||| || ||||   || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6911 gatagagatccgaggttcacttctagattctgaaagagtttgcaagacgctttgggttcgaagttgaggctgcgttcggcttatcatccgcagacagatg 7010  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  7011 gtcagtcgga 7020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28415 - 27749
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  | |||||| || ||||| || ||||| ||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||    
T  28415 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgacctgatagttgctggtaatgaaactgaggatagtgactataaggttgatgatcagggtgtgttaag 28316  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  28315 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 28216  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28215 aaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 28116  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  28115 ttgagcatcagaagcctgcacggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 28016  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| || |||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  28015 tccgagaggacatgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccgttagctcagttggca 27916  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  27915 gagatttacattcataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 27816  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27815 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcgga 27749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 46515 - 47181
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  46515 gagaagcacagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaagctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 46614  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  46615 gttcagaggaagaatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctaca 46714  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46715 aaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 46814  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  46815 ttgaacatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 46914  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  46915 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcaacaggttgacgaagtcggcgcattttattccgattaatatcaattatccgatagcttagttggcg 47014  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||  ||||| |    
T  47015 gagatttatattcataatattgtgaagctgcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtttgc 47114  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47115 aagacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 47181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 41506 - 42115
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  41506 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 41605  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  41606 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 41705  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  41706 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 41805  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  41806 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 41905  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  41906 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 42005  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42006 gatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatg 42105  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  42106 gtcagtcgga 42115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 3063 - 2445
Alignment:
Q  58 gttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattga 157  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||    
T  3063 gttactagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcagggggtgttgagattctgaggcagaatttgtattcctaatgatgatgagatga 2964  T
Q  158 agaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg 257  Q
    ||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2963 agaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgg 2864  T
Q  258 tttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggat 357  Q
     |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||       || |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||    
T  2863 gttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagat 2771  T
Q  358 gtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggt 457  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||  | |||||||| |  ||| |||   | || ||| |  | || || || |    
T  2770 gtaccagaatggaaatgggatagcatatccgtggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctaaagggaatggcgcaatttggctgattgttgatagat 2671  T
Q  458 tgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttcc 557  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| | || || ||||   ||||| ||||| | ||||| |||||    
T  2670 tgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcgaaaatttatattcgcgatattatgaagctacatggtgttcc 2571  T
Q  558 gtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttat 657  Q
     ||||| |  || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||| |||    
T  2570 ttcgagcaatgtatcagatagagatccgaggtttacctctagattttggaagagtgtgcaagaggctttaggttgtaagttgaggttgagttcggcgtat 2471  T
Q  658 catccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  2470 catccgcaaacagatggtcagtcgga 2445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 323894 - 323228
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||     |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  323894 gagaagcacaacaagtgggtgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcaatgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 323795  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||     
T  323794 attcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattttggaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacg 323695  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  323694 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcactcattttgtgtacgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 323595  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  323594 ttgaacatcaaaagcttgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 323495  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  323494 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgacgaagtcggcgcacttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcg 323395  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  323394 gagatttatattcataacattgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattttgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgc 323295  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |  |||||||| || ||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  323294 aagacgccttgggttcgaagttgaggctgagtttggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 323228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Original strand, 202596 - 203250
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| |||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||    
T  202596 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctaaaaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgcggtag 202695  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||||||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  202696 aatttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcat 202795  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||     ||||  | | |||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  202796 gacttgaagaaattgttttggtggtccgcattcaaacgtaatgttgcacagtttgtatatgaatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcaga 202895  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
     |||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  202896 agcctgctgggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaaataggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggca 202995  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||| | || ||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || |||    
T  202996 tgataccatttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccagtggctcagttggcagaaatttatatt 203095  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  203096 cgtgatattgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttgtagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgg 203195  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  203196 gttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 203250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 313 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 118462 - 118092
Alignment:
Q  313 aaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccta 412  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118462 aaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccta 118363  T
Q  413 atactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagtt 512  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  118362 acactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacatgttgatgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagcgcagtt 118263  T
Q  513 ggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagt 612  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||    
T  118262 ggcggagatttatattcataatattgtgaagctacatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagt 118163  T
Q  613 ttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  118162 ttgcaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 118092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 386544 - 386343
Alignment:
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  386544 cgatcaatattagttttccggtagctcagttagcggagaattacattcataatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtgtcggatagaga 386445  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  386444 tccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcg 386345  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  386344 ga 386343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 457 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 112771 - 112542
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||||    
T  112771 ttgacgaagtgggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagttggcggatatttacatccacgatattgtgaagctacatggtgttc 112672  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    || | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  112671 cgccaagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaagttgagttcggcgta 112572  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  112571 tcatccgtagacagatggtcagtcgaaaag 112542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 11387526 - 11388194
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11387526 cagagaagcgcaacaagttgatgtcaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaggttgatgaacaaggcgtgttg 11387625  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  11387626 aggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagtatccatccgggagcta 11387725  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11387726 cgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 11387825  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||    
T  11387826 agttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttctacggattttatgacgagtttaccgaat 11387925  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||  ||||||||| | || |||||| | || || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||    
T  11387926 actccgatagggcatgatgctatttgggtttttgtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgataaatatcagttttccggtacctcagctgg 11388025  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| ||||| |     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  11388026 cggagatttacatccgtgccattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagttt 11388125  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11388126 gcaagatgctttgggttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 11388194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19148362 - 19147694
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  19148362 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttg 19148263  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  | ||| |||||| |||| |||||||    
T  19148262 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagcta 19148163  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19148162 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 19148063  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  19148062 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 19147963  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||| ||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19147962 actcctagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 19147863  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  19147862 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagttt 19147763  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| ||  |||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19147762 gcaagatgccttgggttctaagatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 19147694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20747761 - 20747093
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  20747761 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgtgggtttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtatgttg 20747662  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  | ||| |||||| |||| |||||||    
T  20747661 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaatagcttaagtattcatccaggagcta 20747562  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20747561 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 20747462  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  20747461 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 20747362  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||| ||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  20747361 actccaagagggtatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 20747262  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  20747261 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagttt 20747162  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| ||  |||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20747161 gcaagatgccttgggttctaagatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 20747093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13666686 - 13666023
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||    || || ||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||    
T  13666686 gagaagcacaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactaaggatagtgactttaaggttgatgatcaggatgtgttgag 13666587  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  13666586 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 13666487  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13666486 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtcgaagg 13666387  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  13666386 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgatggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacac 13666287  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13666286 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagtcggcgcactttattccgatcaatatcagttatccggtagctcagttggtg 13666187  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||    
T  13666186 gagatttatattcataatattgtgaagctacatggtgtatcgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagcttac 13666087  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13666086 aagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 13666023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19613826 - 19613290
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19613826 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatagttaatagtaatcaagctgaggatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 19613727  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19613726 aagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagcta 19613627  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19613626 cgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 19613527  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613526 ggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 19613427  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | | || ||||||||||    
T  19613426 actccgagaggacatgattctatatgggttgtggttgatagattgacgaagtcggcgcactttattccgataaatatcagtttttcggtggctcagttgg 19613327  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatgg 551  Q
    ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||    
T  19613326 cggagatttatattcgggacattgtgaagttgcatgg 19613290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 80 - 681
Target Start/End: Original strand, 14285539 - 14286140
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  14285539 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaag 14285638  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  |||      
T  14285639 tcacaagagtagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcat 14285738  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  14285739 tttgtatacgcatacttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggaca 14285838  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14285839 gtatttctatggattttgtaacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcgacgcacttcat 14285938  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14285939 tccgattaacatcagttatccggtagcacagttagcggagatctacattcataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataga 14286038  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| || || |||||| |||  || || |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14286039 gatccgaggttcacatctagatttcggaagagcttgcaagatgctttgggttcaaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 14286138  T
Q  680 cg 681  Q
    ||    
T  14286139 cg 14286140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 14263342 - 14264010
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  14263342 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagttcgttgatttaatggttactagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 14263441  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |  | | | |||||| |||| ||| |||    
T  14263442 aggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacagaaatagcctaagtattcatccaggaacta 14263541  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263542 caaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 14263641  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| | |||    
T  14263642 ggttgagcatcagaagcctgcgtggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatgaattttgtgacgagtttatcgaat 14263741  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  14263742 actccgagagggcatgatgccatttgcgttgttgtcgataggttaacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 14263841  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  14263842 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatccgaggttcacttctagattttggaagagttt 14263941  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14263942 gcaagatgcattgggttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 14264010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 15101703 - 15102369
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| || |||  | ||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||    
T  15101703 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttattgatttgatggttgttggtaatgacactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctgag 15101802  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  15101803 gttcagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 15101902  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15101903 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtttcttagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 15102002  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15102003 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 15102102  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    | ||||  |||||||| | || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15102103 ttcgagacggcatgatgccatttgggtggttgtcgacagattgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggcg 15102202  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||  | || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  15102203 gagatttatattcataatattgtgaagctacatggtttaccatcgaatattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 15102302  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15102303 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 15102369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 18053116 - 18053719
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  18053116 atagtgacttcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcttagaggaaag 18053215  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||      
T  18053216 tcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcat 18053315  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053316 tttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggata 18053415  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||    
T  18053416 gcatttctatggattttgtgacgaatttaccaaacactccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttat 18053515  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || || | | |||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  18053516 tcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctgagatttatatacatagtgttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcagatagg 18053615  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18053616 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 18053715  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  18053716 cgga 18053719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14434777 - 14434174
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14434777 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaag 14434678  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||   |||||| |||      
T  14434677 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcat 14434578  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14434577 tttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggata 14434478  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||    
T  14434477 gcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggttgataggttgacaaagtcggcacattttat 14434378  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  14434377 tcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttatattcataatgttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagg 14434278  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||  ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14434277 gatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 14434178  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  14434177 cgga 14434174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 15341518 - 15340911
Alignment:
Q  79 aatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaa 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15341518 aatagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaa 15341419  T
Q  179 gtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcg 278  Q
     ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  |||     
T  15341418 ttcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctca 15341319  T
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341318 gtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 15341219  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| |    
T  15341218 agcatttctatggattttatgacgagtttaccaaacaccccgagaggacatgattctatatgggttgtagtcgataggttgacaaagttggcacacttta 15341119  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || | || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  15341118 ttcctatcaacattagttatccggtagctcagttggctgagatttatattcataatgttgtgaagctacatagagttccttctagtattgtgtcggatag 15341019  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
     || || ||||| || || || || ||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15341018 ggatccgaggttcacatctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggatgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcag 15340919  T
Q  679 tcggaaag 686  Q
    ||||||||    
T  15340918 tcggaaag 15340911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 16949572 - 16950237
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||| ||| ||||||||  ||| | ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16949572 gagaagctcagcaagtggatttgaagtttgttgatttaatgattattggtaatgacactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgag 16949671  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  16949672 atttagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcacccgggagctaca 16949771  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| || || |||| |||  ||||||||||||| ||||| |||   |||||  |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16949772 aagatgtaccacgatttga-gaaactgttttggtggtccggtttcaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaagg 16949870  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||    
T  16949871 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttaacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgacgagtctaccgagcac 16949970  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16949971 tccgagagggcatgatgccatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcacacttcattccgattaatatcagttatccggtagcacagttggcg 16950070  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  16950071 gagatttatgttcataacattgtgaagctacatggagtactgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgc 16950170  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||| || || ||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16950171 aagatgctttgggatcgaagttgaggttgagttcggattatcatcctcagacagatggtcagtcgga 16950237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 74 - 686
Target Start/End: Original strand, 11305420 - 11306032
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  11305420 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 11305519  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||| | ||||||     
T  11305520 ggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaaaagggatgtt 11305619  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11305620 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 11305719  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  11305720 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 11305819  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  11305820 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcgcagttggcagagatttatattcacagtgtggtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcg 11305919  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11305920 gatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 11306019  T
Q  674 gtcagtcggaaag 686  Q
    |||||||||||||    
T  11306020 gtcagtcggaaag 11306032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13022506 - 13021840
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| |  | ||| ||||||| ||||||||| |||| || || ||  ||||    
T  13022506 gagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgag 13022407  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  13022406 gttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctaca 13022307  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||   |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13022306 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgttttgaagtgtgatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaatg 13022207  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||    
T  13022206 ttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttcgtgacgagttaaccaaacac 13022107  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13022106 tccgagggggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttggcg 13022007  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  |||| |  ||||||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || |||| |||||| |    
T  13022006 gagatttatgttcatagcattgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacctctaggttctggaaaagtttgc 13021907  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13021906 aagatgctttgggatcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcgga 13021840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 23504970 - 23505636
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||| ||| || |||||     |||  ||| ||| |||||||||||||| || || ||| | ||    
T  23504970 gagaagcacaacaagtggatgtcaagttggttgatctaatggttgctggtaatggtattgaagataatgacttcaaggttgatgatcagggtgtgctaag 23505069  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||     
T  23505070 attcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtagcttaagcattcatccgggagctacg 23505169  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||||  |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23505170 aagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaagg 23505269  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23505270 ttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 23505369  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  23505370 tccgaggggacatgattcgatttgggttgtggttgataggttgacgaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccagtagctcagttggct 23505469  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || || || | | | |||||| | ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  23505470 gagatttatatacatagtgtggtgaagctacatggagttccttcgtgtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 23505569  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23505570 aggacgctttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 23505636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 680
Target Start/End: Original strand, 16071395 - 16072057
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16071395 gagaagcacgtcaaatggatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaagctgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 16071494  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||  || | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16071495 gttcagaggaagaatttgtattcatgataatgatgatttaaa-aagttgattttagaggaaagccatagaagtagcttaagtattcatccgggagctaca 16071593  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || || || ||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||    |||||   || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  16071594 aagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggttgaaacgtgatgttggtcagtttgtttatgcatgtttgactcgtcaaaagtctaagg 16071693  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| | || ||    
T  16071694 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgctagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttatcgaacac 16071793  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||  || ||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16071794 tcaaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacactttcttccgatcaatattagttatccggtagctcagttggcg 16071893  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| |    
T  16071894 gagatttatattcataatattgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcagttctagattttggaagagtttgc 16071993  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16071994 aagatgcattgggttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtc 16072057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 49153393 - 49152784
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||  |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  49153393 ctgaggatagtgatttcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttga 49153294  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  49153293 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaaaagatgtt 49153194  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  49153193 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaaatccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 49153094  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  49153093 gggacagtatctctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 49152994  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | | | |||||| | ||||| |||||||| || || |||||     
T  49152993 tttcattcctattaatatcagttatccggtagcacagttagcagagatttacattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcg 49152894  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  49152893 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacggatg 49152794  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  49152793 gtcagtcgga 49152784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Original strand, 12205901 - 12206566
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||  | ||  |||| || ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12205901 agaagcacaggaggttgatgttaagtttgtggatttgttggtggctagcaaccaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaga 12206000  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  12206001 ttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctataa 12206100  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||  | | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12206101 agatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaagt 12206200  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  12206201 tgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgttccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaatact 12206300  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    | ||| |||||||||   |||||| | || || || || |||| |||||| || ||||| ||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| |    
T  12206301 ctgagagggcatgatgtcatatggatggttgttgatagattgaagaagtcagcacactttattccaattaatattagttttccagtggcacagttggcag 12206400  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| |||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  12206401 agatttacattcgtgatattgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtgttggatagagatccaagatttacatcgagattttggaaaagtttgca 12206500  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| | |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12206501 agaggcgttgggttcaaagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 12206566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 74 - 685
Target Start/End: Original strand, 564 - 1175
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||  |||| || ||| | | |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  564 ctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttaga 663  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||   |||||     
T  664 agaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtt 763  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  764 gctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaagt 863  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||  | || ||||||||||||||||| || ||    
T  864 gggacaatatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtcattgtcgacaggttgacgaagtcagcaca 963  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||     
T  964 tttcattccgatcaatatcagttatctggtagcacagttggcggagatttatgttcataacattgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcg 1063  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||  ||||| || |  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1064 gatagggatacaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatg 1163  T
Q  674 gtcagtcggaaa 685  Q
    || |||||||||    
T  1164 gttagtcggaaa 1175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 137 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14130902 - 14130356
Alignment:
Q  137 ttcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaa 236  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  14130902 ttcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaa 14130803  T
Q  237 gaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgca 336  Q
     ||| ||||||||||||| | |||||||   |||||| |||  ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14130802 aaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgca 14130703  T
Q  337 ggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcga 436  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  14130702 gggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatgattcta 14130603  T
Q  437 tatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatat 536  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||| | || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |    
T  14130602 tttgggttgtggttgataggttgacaaagtcggcacattttattcctatcaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttatattcataatgt 14130503  T
Q  537 tgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaa 636  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||  ||| |||| ||     
T  14130502 tgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaag 14130403  T
Q  637 ttgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14130402 ttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 14130356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 75 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12456793 - 12456185
Alignment:
Q  75 tgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaa 174  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||  | || || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12456793 tgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctaaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaa 12456694  T
Q  175 gaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtca 274  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||    || ||      
T  12456693 gaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaaacgtgacgtag 12456594  T
Q  275 ctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatg 374  Q
    |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12456593 ctcattttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtg 12456494  T
Q  375 ggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcac 474  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||    
T  12456493 ggacaatatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcacac 12456394  T
Q  475 ttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcag 574  Q
    |||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||  || | |  ||||||||| | || || || ||||||||||| ||||| |    
T  12456393 ttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggtagagatttatgtttatagcattgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcgg 12456294  T
Q  575 atagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    |||| || || ||||| ||||| || || ||||  | |||||||||||  ||||| || || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12456293 atagggatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaagatgctttgggatcgaagttgaggttgagctcggcttatcatccccagacagatgg 12456194  T
Q  675 tcagtcgga 683  Q
    |||||||||    
T  12456193 tcagtcgga 12456185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 97 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 15625620 - 15625030
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||||| |  || | |||||    
T  15625620 gatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttga 15625521  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||  | | |||||||||| | |||||    
T  15625520 gtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtaatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 15625421  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| || ||| ||||||| || |  || || ||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  15625420 gatttgtcagaagtcaaaagtagagcatcagaaacctgctgggttgatgacacctttaggcgtgccagagtggaaatgggatactatatccatggatttt 15625321  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  ||| |||| || || |||||  | || || || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15625320 gtgacgagtttaccgaatactccaaaagggaatgactctatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagtt 15625221  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15625220 ttcctgtgtctcagttggcggagatctacattcgcgatattgtgaagctacatggtgttccgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttc 15625121  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
     ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15625120 tagattttggaagagtttgcaagaggttttgggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaaga 15625030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 62 - 685
Target Start/End: Original strand, 11771408 - 11772031
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  11771408 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggcgtggtgagatttcgaggcagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaa 11771507  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
    | ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11771508 gatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattg 11771607  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  11771608 aaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcattagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtac 11771707  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||    
T  11771708 cagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgac 11771807  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||  ||  ||||||||||||| || ||||| |   ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  11771808 gaagtcggctcatttcattccgataaatatcagttttcttgtgtctcagttggcggaaatttacatccgcgatattgtgaagctgcatggtgttccttcg 11771907  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||    
T  11771908 agcattgtatcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaggagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatc 11772007  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
     |||||| |||||| |||||||||    
T  11772008 tgcagacagatggttagtcggaaa 11772031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 13967825 - 13968434
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| ||||||||| ||||  ||| || |||||||| |||||| | ||    
T  13967825 ctgaggatagtgattttaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattctcga 13967924  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  13967925 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 13968024  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13968025 gctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagt 13968124  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  13968125 gggacagtatctctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 13968224  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  13968225 ctttattcctattaatataagttatccggtagcgcagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcg 13968324  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  13968325 gatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 13968424  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  13968425 gtcagtcgga 13968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 683
Target Start/End: Original strand, 8211346 - 8211894
Alignment:
Q  135 tattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttg 234  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  8211346 tattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgattta 8211445  T
Q  235 aagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctg 334  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8211446 aagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctg 8211545  T
Q  335 caggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattc 434  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||  |    
T  8211546 catggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgagacagtatctctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgacgc 8211645  T
Q  435 gatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaat 534  Q
     || ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| | |    
T  8211646 tatttgggtagttgtcgaccggttgacgaagtcggcacacttcattcctatcaatatcagttatccggtagcgcaattagcagagatttatattcacagt 8211745  T
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
     | |||||| | ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||||| |  |||||||| |    
T  8211746 gtggtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaagacgccttgggttcga 8211845  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8211846 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 8211894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 26117762 - 26118371
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| | | |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  26117762 ctgaggatagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttga 26117861  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||     
T  26117862 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgtt 26117961  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| ||| || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26117962 gctcagttcgtttatgcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagt 26118061  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||    
T  26118062 gggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatgacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaagtcggcaca 26118161  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||| | | | |||||  | ||||| |||||| ||||||| |||||     
T  26118162 cttcattcctatcaatatcaattatccggtagcgcagttagcagaaatttatattcacagtgtagtgaaacttcatggtgttccggcgagtattgtgtcg 26118261  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || ||||   ||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  26118262 gatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagcgtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 26118361  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  26118362 gtcagtcgga 26118371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12457789 - 12457300
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||| ||||||||| |||  |||  ||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12457789 gagaagctcagcaagtagatttgaagtttgtggatttgataaatacgggtaatgacactgaggatagtgattttaaggttgatgaccaaggtgtgctgag 12457690  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| | || || ||||||||||||||| | || || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  12457689 gtttagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctaca 12457590  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||   |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12457589 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagtgagatgttgctcagtttgtttatgcttgtttgacttgtcagaagtctaaag 12457490  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||  || ||    
T  12457489 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttacggaacac 12457390  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagc 506  Q
    |||||| ||||||||| | || | |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  12457389 tccgagagggcatgatgctatttaggttgttgtagaccggttgacgaagtcggcacatttcattcctattaatatcagttatccggtagc 12457300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 322 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6414355 - 6413994
Alignment:
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6414355 catcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccga 6414256  T
Q  422 gggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  6414255 gagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatatcagttatccgatagctcagttagcagagat 6414156  T
Q  522 ctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagat 621  Q
     || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6414155 ttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagat 6414056  T
Q  622 gtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  || ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  6414055 gctttaggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagaaggtcagtcgga 6413994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12688568 - 12687983
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  12688568 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattctagac-atgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 12688470  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||||||| || |||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  12688469 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 12688370  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  12688369 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 12688270  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||| ||||| ||||    
T  12688269 gtgacgagtttgccgaatactcctagggggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgatcaatattagtt 12688170  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||  |||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  12688169 tccctgttgcccagttggcggagatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttc 12688070  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12688069 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 12687983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 687
Target Start/End: Original strand, 15153824 - 15154449
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  15153824 ctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaa 15153923  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15153924 aatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatgatctgaagaatttgttttggtggtctggattg 15154023  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||   |||| ||  || ||  | | || ||||| |    
T  15154024 aaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgc 15154123  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| |  ||| |||| ||||| |||||  | || || || |||||    
T  15154124 cagagtggaaatgggatagtatatccatggattttttaacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgactcgatttgggtaattgttgatagattgac 15154223  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||  || |||||||||||| || ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15154224 gaagtcggctcattttcttccgattaatatcaattttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtgaaattgtgaagttacatggtgttccttcg 15154323  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||  | |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||    
T  15154324 agcattgtatcaaatagagatccaagattcacttctagattttggaaaagtttgcagcaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatc 15154423  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15154424 cgcagacagatggtcagtcggaaaga 15154449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 63 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14040797 - 14040178
Alignment:
Q  63 tagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaag 162  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||     
T  14040797 tagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaa 14040698  T
Q  163 ttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttga 262  Q
     ||| | | ||||| |||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14040697 atgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttga 14040598  T
Q  263 agaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtacc 362  Q
    |    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||  ||| | ||  || ||  | | ||  |||||||    
T  14040597 aacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaaaccttctgggatgatggtatctttaaatgtacc 14040498  T
Q  363 ggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacg 462  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||    
T  14040497 agagtggaaatgggatagtatatccatggatgttgtgacgagtttgccgaatattcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgt-gatagattgacg 14040399  T
Q  463 aagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcga 562  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14040398 aagtcggctcactttattccgattaatatcagttttcctgtgtttcagttggcagaaatctatattcgaaatattgtgaagttgcatggtgttccttcga 14040299  T
Q  563 gtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatcc 662  Q
    | || || ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| || ||| ||||| |   | ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14040298 gcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatcc 14040199  T
Q  663 gcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  14040198 acagacagatggtcagtcgga 14040178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 63 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14350827 - 14350208
Alignment:
Q  63 tagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaag 162  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||     
T  14350827 tagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaa 14350728  T
Q  163 ttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttga 262  Q
     ||| | | ||||| |||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14350727 atgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttga 14350628  T
Q  263 agaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtacc 362  Q
    |    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||  ||| | ||  || ||  | | ||  |||||||    
T  14350627 aacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattagaaaccttctgggatgatggtatctttaaatgtacc 14350528  T
Q  363 ggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacg 462  Q
     ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||    
T  14350527 agagtggaaatgggatagtatatccatggatgttgtgacgagtttgccgaatattcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgt-gatagattgacg 14350429  T
Q  463 aagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcga 562  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14350428 aagtcggctcactttattccgattaatatcagttttcctgtgtttcagttggcagaaatctatattcgaaatattgtgaagttgcatggtgttccttcga 14350329  T
Q  563 gtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatcc 662  Q
    | || || ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||| || ||| ||||| |   | ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14350328 gcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatcc 14350229  T
Q  663 gcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  14350228 acagacagatggtcagtcgga 14350208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 11236415 - 11237001
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  11236415 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 11236514  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  11236515 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcttgttt 11236614  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  11236615 agtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 11236714  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| |  |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  11236715 gtgacgagtttgcaaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgtggatagattgacgaagtcggctcattttctgccgattaatattagtt 11236814  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11236815 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 11236914  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11236915 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 11237001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 44790553 - 44791139
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  44790553 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 44790652  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  44790653 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 44790752  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  44790753 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 44790852  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  44790853 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 44790952  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44790953 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 44791052  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44791053 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 44791139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 18550966 - 18551546
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| | ||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  18550966 caaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 18551065  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  18551066 atccgggagctacgaagatgtatcataatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 18551165  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  18551166 tcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacg 18551265  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | ||  | || |||||| | || || ||||||||||||||  | || ||  |  | |||||||| |||| ||| |    
T  18551266 agtttgccgaatactccgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcaactcattttctacctattaatattagttttcccg 18551365  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18551366 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 18551465  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18551466 ttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 18551546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9597125 - 9596539
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  9597125 gatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 9597026  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  9597025 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 9596926  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||    
T  9596925 agtttgtcagaagtcgaagattgagcattagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggacttt 9596826  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  9596825 gtgacaagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtt 9596726  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9596725 ttcccgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggtgtcccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 9596626  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9596625 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 9596539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8199696 - 8199110
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  8199696 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8199597  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  8199596 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8199497  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  8199496 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 8199397  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  8199396 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 8199297  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8199296 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 8199197  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8199196 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 8199110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8708673 - 8708087
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  8708673 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8708574  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||| ||| | |||||    
T  8708573 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtttattcctgttt 8708474  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  8708473 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8708374  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || |||||||| |||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  8708373 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacaaagtcaactcattttctacctattaatattagtt 8708274  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8708273 ttcccgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttc 8708174  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8708173 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 8708087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10872063 - 10871477
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  10872063 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 10871964  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||    
T  10871963 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 10871864  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  10871863 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10871764  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||  | || |||||| | || || |||||||||||||| || || ||| |  | |||||||| ||||    
T  10871763 gtgacgagtttgccgaatactccgagagggagcgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcagctcatttcctacctattaatattagtt 10871664  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  |  | ||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10871663 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaagagattgtgaagctgcatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 10871564  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10871563 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 10871477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13687126 - 13686546
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  13687126 caaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 13687027  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | || ||   |||    
T  13687026 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttg 13686927  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  13686926 tcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacg 13686827  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || |    
T  13686826 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccg 13686727  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||  ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13686726 ttgcccagttggtagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 13686627  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  13686626 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 13686546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662452
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||  | |  |||||||||||||    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||||| || || |||||    
T  21662833 gtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgttgggttgttgacacctttagatgttccagagtggacgtgggatagtatatccatgga 21662734  T
Q  393 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatc 492  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||| |||| |||||  | || || ||  ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||    
T  21662733 ttttgtgacgagtttgccgaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactgacgaagtcggctcattttattccgattaacatc 21662634  T
Q  493 agttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttta 592  Q
    | || ||| ||| |||||||||   |||| || || |   | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| ||||    
T  21662633 aattttcctgtatctcagttggaaaagatttatatccgtgagattgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtattagatagggatccaagattta 21662534  T
Q  593 cttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    |||| ||||||||||  |||||  | || | ||||||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  21662533 cttctagattttggaagagtttgtaggaggcgttgggttctaagttgagtttgagttaggcgtatcatccgcagacagatgg 21662452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 15160265 - 15160845
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| |  || ||||||     
T  15160265 caaggtgtgctgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtatatttagtattc 15160364  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | || ||   |||    
T  15160365 atccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttg 15160464  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||||||| ||||     
T  15160465 tcagaagtctaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttttgacg 15160564  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || |    
T  15160565 agtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccccg 15160664  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15160665 ttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagatt 15160764  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15160765 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 15160845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Original strand, 11552304 - 11552890
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||  || |||| ||  | |||||| ||||| | || || ||||| | ||| | |||||    
T  11552304 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacaggagtagcttga 11552403  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||| | || |||||| ||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  11552404 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 11552503  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||| ||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  11552504 agtttgtcataagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 11552603  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||| ||||| ||||    
T  11552604 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgatcaatattagtt 11552703  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  11552704 tccctgttgcccagttggcagagatttacattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttccttc 11552803  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  11552804 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggacagtcgga 11552890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14333452 - 14332879
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || | | |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  14333452 gtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 14333353  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  14333352 gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcttg-tggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 14333254  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  14333253 gtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttg 14333154  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||  || ||| | ||  | || |||||| | || || ||||||||||||||  | || ||  |  | |||||||| |||| ||| || || |    
T  14333153 ccgaatactcttagagggaacgacgcaatttgggttattgttgataggttgacgaagtcaactcattttctacctattaatattagttttcccgttgccc 14333054  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  14333053 agttggcagagatttttatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 14332954  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14332953 aagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 14332879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18178810 - 18178224
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | |||||||||||||  || | |||||    
T  18178810 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttga 18178711  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | |  ||||||||| | || ||    
T  18178710 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgctt 18178611  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  || || ||  || ||  ||| |||||| | || || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18178610 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatctgccagaatggaaatgggatagtatatctatggatttt 18178511  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| ||||    
T  18178510 gtgacgagtttgccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctacctattaatattagtt 18178411  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| |||||  || | ||||||||| | ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||     
T  18178410 tccctgttgcccagttggcagagatttacatcaaggagattgtgaagctacatggtgttccttcgaacattgtatcagatagagatccaagatttacttt 18178311  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18178310 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 18178224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 496
Target Start/End: Original strand, 321160 - 321638
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  321160 agaagcacaaaaagttgatgttaagcttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtgttgaga 321259  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||||||| |||  || | |||||||||  |||| |||||||| |    
T  321260 ttccgagatagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacga 321359  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    |||||  | |||||||| |||   ||||| | |||||| ||||| |||||    
T  321360 agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatatttttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggt 321459  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  321460 tgagcatcagaaacctgctggtatgatgacatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatact 321559  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    || |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  321560 cctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 321638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15204704 - 15204456
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  15204704 atagtgacttcaaggtcgatgatcagggaatgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagagag 15204605  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| || || | |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    |||||  | | |    
T  15204604 tcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtggcacag 15204505  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15204504 tttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 15204456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 679
Target Start/End: Original strand, 16532 - 17100
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  16532 gtgttgagattccgaggtcggatttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 16631  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| ||  ||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  16632 gagctacgaa--tgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 16729  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  |  ||  | | || ||||  || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  16730 gtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtataatggtatctttagatgggccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttt 16829  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || || ||| |||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  16830 ccgaatactcctagagggaacgacacaatttgggtcatcgttgatagattgtcgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 16929  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | ||||||| | | ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  16930 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 17029  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     ||||| ||||| |  || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17030 gagtttgcaagaggctttaggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagt 17100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 650
Target Start/End: Original strand, 23202815 - 23203368
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  23202815 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23202914  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || | |||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  23202915 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23203014  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||||||| || || ||  | |||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  23203015 agtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23203114  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||  | || |||||| | || || || ||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  23203115 gtgacgagtttgccgaatactacgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 23203214  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || ||  | ||||| ||||| |||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23203215 tccctgttgccaaattggcagagatttacatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 23203314  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttc 650  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| || || |||| |||||||||    
T  23203315 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttggggtcgaagttgagattgagttc 23203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 650
Target Start/End: Original strand, 23508942 - 23509495
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  23508942 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23509041  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || | |||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  23509042 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23509141  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       ||||||||| || || ||  | |||||||  || || ||  || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  23509142 agtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23509241  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||  | || |||||| | || || || ||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||    
T  23509242 gtgacgagtttgccgaatactacgagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtt 23509341  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || ||  | ||||| ||||| |||||  || | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23509342 tccctgttgccaaattggcagagatttacatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttc 23509441  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttc 650  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| || || |||| |||||||||    
T  23509442 tagattttggaaaagtttgcaagaggccttggggtcgaagttgagattgagttc 23509495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14955622 - 14955304
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  14955622 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 14955523  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||    ||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||| ||||||||||  | |||||  | | ||||||| || | |||||    
T  14955522 gtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacaagatgtggcacagtttgtgaattcctgttt 14955427  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||    
T  14955426 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggacttt 14955327  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    ||||| ||||| || ||||||||    
T  14955326 gtgacgagtttgccgaatactcc 14955304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 510 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14955275 - 14955102
Alignment:
Q  510 gttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaga 609  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||  |||| ||||| || || |  |||||||| ||||| |||||||| ||  |||  | |    
T  14955275 gttggcggagatttacattaaggagattgtgacgttgcatggtattccttcgagcattgtattggatagagatccaagatttacttctaggattttcaaa 14955176  T
Q  610 agtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| ||| | |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14955175 agtttgcaacaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 14955102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 27107072 - 27107277
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  27107072 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 27107171  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27107172 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 27107271  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  27107272 ttttgt 27107277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7824872 - 7824667
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||| | || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  7824872 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 7824773  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7824772 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatgga 7824673  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  7824672 ttttgt 7824667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14212730 - 14212576
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||   || | |||||||||  ||||||    
T  14212730 gtgttgagattccgaggtcggatttgtattcccgacgatgcagaaatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatcgaagtagcttgagtatccatccgg 14212631  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    
T  14212630 gagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 14212576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4440583 - 4440419
Alignment:
Q  510 gttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaga 609  Q
    |||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |  ||||||  |    
T  4440583 gttggctgagatctacattgagcagattgtgaggttgcatggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaa 4440484  T
Q  610 agtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    ||||| |||| ||  |||||  | || ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  4440483 agtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttgagttctgcttatcatccccagaccgatgg 4440419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13354122 - 13353987
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||  || |   |||||| ||||| |    
T  13354122 ttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtggactggaatgaagaaggagatcgcagagtttgtttatgctt 13354023  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  13354022 gtttggtttgttagaagtctaagattgaacatcaga 13353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23642417 - 23642342
Alignment:
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  23642417 tgagtattcatccaggagcgacaaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaagga 23642342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 625 - 683
Target Start/End: Original strand, 23199451 - 23199509
Alignment:
Q  625 ttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23199451 ttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 23199509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13455719 - 13455514
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||| | || ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  13455719 ttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttatggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 13455620  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||  ||   ||| ||| ||  |||||||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13455619 gcttggtttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaaaccgttaggtttgatgcaaccgttgtttgttccagaatggaaatgagatagtatctctatgga 13455520  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  13455519 ttttgt 13455514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4440900 - 4440824
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4440900 ttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtatcaggatttaaagaggttgttttggtggtctggaatgaagaagga 4440824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27716 - 27048
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||||||| || || ||||||    
T  27716 cagagaagcgcagaaaattgatgtcaagtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaaaatgatgacttcaatgttgatgatcagggtgtgttg 27617  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  27616 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccgggagcta 27517  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27516 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 27417  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  27416 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 27317  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27316 actccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcagcgcattttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 27217  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
     | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||    
T  27216 agaagatttacattcataatattgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggttttggaagagctt 27117  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27116 acaagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 27048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 505 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26666
Alignment:
Q  505 gctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatttt 604  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26844 gctcagttggagaagatttacattcataatattgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggtttt 26745  T
Q  605 ggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  || ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26744 ggaagagcttacaagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 26666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 686
Target Start/End: Original strand, 48148 - 48819
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  48148 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 48247  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||| |||  |||||||    
T  48248 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccataggagtagcttaagtattcatctaggagcta 48347  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  48348 caaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacctgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtataa 48447  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  48448 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgggacaacatttccattgattttgtgacgagtttaccgaat 48547  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||| |||| || || |||||||||||||||||  ||||  || |||| ||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  48548 actccgagagggcatgatgccatttggattgttgtcgataggttgacgaagtcggcaaactttcttccgatcaatattagttttccgatagctcagttgg 48647  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  48648 cggagatttatattcataatattgtgaagttacatggggttccgtcgagtattgtgtcggataaagatccgaggttcacttcaagatgttggaagagttt 48747  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
     |||||||  |||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48748 gcaagatgccttgggttcgaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaag 48819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 80 - 540
Target Start/End: Original strand, 57026 - 57486
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| |||||    ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  57026 atagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgaggttcaggggaagaatttgcattcctgatgatgacagtttgaaaaagttaattttagaggaaag 57125  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||      
T  57126 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcat 57225  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57226 tttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 57325  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  57326 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 57425  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtg 540  Q
    | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  57426 tcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttacattcataatattgtg 57486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 625 - 683
Target Start/End: Original strand, 57541 - 57599
Alignment:
Q  625 ttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  57541 ttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 57599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 676
Target Start/End: Original strand, 194820 - 195479
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||  | |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  194820 gagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 194919  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  194920 attcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 195019  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195020 aagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 195119  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  195120 ttgaacatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagttggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 195219  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  195220 tctgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacaaagtcggcgcactttattccgattaatatcatttatccggtagctcagttagca 195319  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||| | || ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  195320 gaggtttatattcataacattgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgc 195419  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtc 676  Q
    || |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  195420 aacatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttaccatcctcagacagatggtc 195479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 149760 - 149091
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || || ||| || ||||| || ||||| | ||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  149760 gagaagcacaactagtggatgtcaagtttgtggacttgatggttgctggtaatgaaactgaggaaagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 149661  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  149660 gttcagaggaaaaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 149561  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  149560 aagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaatg 149461  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||    
T  149460 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgctggagtgtaattgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttactgaacac 149361  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  149360 tccgagagggcatgattccatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcacatttcattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggag 149261  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||| | || ||| ||||| | ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  ||| | |    
T  149260 gagatttatattgataacattttgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtctgc 149161  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||||||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  149160 aagatgcattgggttcgaagttggagttgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagtcggaaag 149091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 106 - 685
Target Start/End: Original strand, 25738 - 26317
Alignment:
Q  106 ggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatc 205  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | |    
T  25738 ggagtgttgcgttttcgagggagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacc 25837  T
Q  206 cgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtca 305  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25838 cgggagctacgaagatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca 25937  T
Q  306 gaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagt 405  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  25938 aaagtcaaaagttgagcatcagaaacttgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatggcatagcatatccatggattttgtgacgagt 26037  T
Q  406 ttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtag 505  Q
    || || ||||||||||  ||| ||||  |||| |||||  |  | || || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  26038 ttgccgaatactccgaaagggaatgacgcgatttgggtgattattgatagattgacgaagtcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtat 26137  T
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    | ||||||||||| || ||||| |   ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26138 cccagttggcggaaatttacatccgcgatattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttg 26237  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
    ||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26238 gaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaa 26317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 180938 - 180739
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| || || | ||||||||||||| || |  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  180938 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcatgattttaatatgttgttttggtggccttgaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 180839  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  180838 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatgga 180739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 42044 - 41443
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  42044 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtccagaggaagaatttgtattcctaataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaag 41945  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||      
T  41944 tcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcat 41845  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  41844 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatatgccggagtggaagtgggata 41745  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41744 gcatttctatggatttcgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaggttgatgaagtcggcgcactttat 41645  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||  |||||    
T  41644 tccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcgaataga 41545  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || ||  |||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41544 gatccggggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcgaagttgaggtt--gttcggcttatcatccgcagacagatggtcagt 41447  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  41446 cgga 41443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 4568 - 5234
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| || | ||| ||| ||| ||||||||||||||  | || || |||||    
T  4568 gagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggataatgacttcaaggttgatgattagggtgtattgag 4667  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||     
T  4668 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcataagagtagcttgagtattcatccggaagctacg 4767  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4768 aaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaag 4867  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  4868 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 4967  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  4968 tccgagagggcatgattctatatggattgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatccggtagctcagttggct 5067  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||    ||||| ||||| || || ||||  ||||| |    
T  5068 gagatttatattcataatattgtgaagctacatggagttctttcgagtattgtgtcggatagggatttgaggttcacttctaggttctggaagagtttgc 5167  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5168 aggatgttttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 5234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Original strand, 1087 - 1754
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1087 cagagaagcacagcaagccgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgga-ctgaagatagtgatttcaaggttgatgatcaaggagtgttg 1185  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| |||  |||||||    
T  1186 aggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatctaggagcta 1285  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1286 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 1385  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  1386 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttccatggattttatgacgagtttaccgaat 1485  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||  || || ||||||||||||| ||| || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  1486 actccgagagggcatgatgccatttgggttgctgtcgataggttgacgaagtaggcacattttattccgatcaatattagttttccggtagcttagttgg 1585  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || |||||  ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||    
T  1586 cggagatttatattcatcatatttttaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcgaggttttggaagagttt 1685  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1686 gcaagatgcattgagttcaaagttgaagttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcgga 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 3940 - 3277
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||     |||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||     
T  3940 agaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgatggttgctggtaatggcattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgagg 3841  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||| |    
T  3840 ttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccaggagctacga 3741  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3740 aaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 3641  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  3640 tgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtggcggaatggaagtgggacagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacact 3541  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    | ||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3540 ctgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcggcacattttattccaattaatatcagttatccggtagctcagttggcgg 3441  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||    
T  3440 agatctacattcataacattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagtgatctgaggttcacttctagattttggaagagtctgca 3341  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    | |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3340 aaatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcg 3277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 614
Target Start/End: Original strand, 12833 - 12909
Alignment:
Q  538 gtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  12833 gtgaagttgcatggtgttccttcgtgtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagttt 12909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5940 - 5274
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||    
T  5940 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtatgttgag 5841  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5840 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 5741  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5740 aaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 5641  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  5640 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagactggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaataa 5541  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    | |||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5540 tacgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagttggcacacttcattcctattaatatcagttatccggtagctcagttagcg 5441  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||  || || |    
T  5440 gagatttatattcataacattgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagcttgc 5341  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5340 aagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcaacttatcatctgcagacagatggtcagtcgga 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5622 - 4954
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  || |||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5622 cagagaagcacaaaaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 5523  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||  || |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  5522 aggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaagaaatacacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 5423  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5422 caaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 5323  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5322 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccatagtggaagtgggacaacatctccatggattttgtgacgagtttaccgaat 5223  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  5222 actccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttccgatagctcagttgg 5123  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  5122 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggggttccatcgagcatcgtgtcggatagagattcgaggtttacttcaaggttttggaagagttt 5023  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||||   | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5022 gcaagattcctcgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 21173 - 20507
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| ||  |||  ||||||| ||||||||| |||| || ||  | ||||     
T  21173 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaattgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtatattgaa 21074  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || | ||| || ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  21073 gttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 20974  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||    |||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20973 aaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttggtgtatgcgtgttagacttgtcagaagtctaagg 20874  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  20873 ttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttatgacgagtttaccgaacac 20774  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | |    
T  20773 tccgagagggcatgattccatttgggttgttgttgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttacccggtagctcagtttgtg 20674  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  20673 gagatttatattcacaatattgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagcgatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 20574  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20573 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggtttatcatccgcagacagatgtttagtcgga 20507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 409
Target Start/End: Original strand, 11173 - 11565
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11173 gagaagcgcagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 11272  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  11273 attcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 11372  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11373 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 11472  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 409  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11473 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 409
Target Start/End: Original strand, 14943 - 15335
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14943 gagaagcgcagcaagtagatgtgaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtgttgag 15042  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| | ||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  15043 attcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 15142  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15143 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 15242  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 409  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15243 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 683
Target Start/End: Original strand, 12865 - 13143
Alignment:
Q  405 tttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagta 504  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12865 tttaccttacactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggta 12964  T
Q  505 gctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatttt 604  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | ||| | |||||    
T  12965 gctcagttggcggagatttatattaataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaatttt 13064  T
Q  605 ggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  || ||||||||||  |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13065 ggaagagcttacaagatgcattggattcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 683
Target Start/End: Original strand, 16635 - 16913
Alignment:
Q  405 tttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagta 504  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16635 tttaccttacactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggta 16734  T
Q  505 gctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatttt 604  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | ||| | |||||    
T  16735 gctcagttggcggagatttatattaataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaatttt 16834  T
Q  605 ggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  || ||||||||||  |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16835 ggaagagcttacaagatgcattggattcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 16913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 20787 - 21453
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  |||| ||| ||||| || |||| | ||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||    
T  20787 gagaagcgcaataagtggatgagaagtttgttgatttgatggttattggtaatgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgag 20886  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| |||||| | ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  20887 gttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 20986  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||   || ||| |||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20987 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 21086  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  21087 ttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacac 21186  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21187 tccgagagggcatgatgcgatatgggttgtggtcgacaaattgacaaagttggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggcg 21286  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |    
T  21287 gagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgc 21386  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  21387 aagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagacggtcagtcgga 21453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 607
Target Start/End: Original strand, 10573 - 11163
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| ||| |||| ||||  |||| ||| ||||| || |||| | ||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||    
T  10573 gagaagcgcaataagtggatgagaagtttgttgatttgatggttattggtaatgacactgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgag 10672  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| |||||| | ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||     
T  10673 gttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacg 10772  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||   || ||| |||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10773 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcaaaagtctaagg 10872  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  10873 ttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtctacctaacac 10972  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10973 tccgagagggcatgatgcgatatgggttgtggtcgacaaattgacaaagttggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggtagctcagttggcg 11072  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  11073 gagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctgga 11163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26820 - 26744
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  26820 ttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaagga 26744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10985 - 10317
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  10985 cagagaagcacataaagtttatgtaaagtttgttgatttaatggttgctagcaatgaaactgaaaatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 10886  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| || ||||| |||| |||  |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || | | | |||||| ||||||||||||    
T  10885 aggttcagaggaaggatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacagaagtagcctaagtattcatccgggagcta 10786  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10785 caaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgttagaagtctaa 10686  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  10685 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgggatagcattttcatggattttgtgacgagtttaccgaat 10586  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    | |||||| |||||||||   || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10585 agtccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacactttattccaatcaatattagttttccggtagctcagttgg 10486  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  10485 aggagatttacattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagttt 10386  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10385 tcaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 581
Target Start/End: Original strand, 13415 - 13979
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||    ||||| ||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||    
T  13415 gagaagcacaacaagtggatgtgaagtttgttgatttaatggttgctagtaatggcactgaggatagtgacttcaaggttgatgaaaagggtgtgttgag 13514  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||  |||||||||    
T  13515 attcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctaggagctaca 13614  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13615 aaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaagg 13714  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13715 ttgaacatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacac 13814  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13815 tccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttattccgattaacatcagttatccggtagctcagttggcg 13914  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  13915 gagatttatattcataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagaga 13979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 121 - 676
Target Start/End: Original strand, 25085 - 25640
Alignment:
Q  121 agaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  25085 agaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacgaaaa 25184  T
Q  221 tgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttga 320  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25185 tgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttga 25284  T
Q  321 gcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccg 420  Q
     ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  25285 acatcagaagtctgcagggtttttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggaaaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccg 25384  T
Q  421 agggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggaga 520  Q
    || ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25385 agagggcatgatgccatttgggttgtggttgacaggttgacgaagtcagcgcactttattccaattattatcagttatccggtagctcagttggcggaga 25484  T
Q  521 tctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||||    
T  25485 tctacattcataattttatgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagattgcaaga 25584  T
Q  621 tgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtc 676  Q
    ||  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25585 tgctttgggatcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtc 25640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 80 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 6340 - 5830
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6340 atagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagagatagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaag 6241  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||  ||||||||   |||||| |||      
T  6240 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaagcgagatgtcgctcat 6141  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140 tttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 6041  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6040 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 5941  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  5940 tcctattaacattagttatcctgtagctcagttggctgagatttacattcataatattgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagg 5841  T
Q  580 gacccaaggtt 590  Q
    || ||||||||    
T  5840 gatccaaggtt 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19375
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20041 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatggttaatggtaatcaagctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 19942  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  19941 aggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagcta 19842  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19841 cgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 19742  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19741 ggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaat 19642  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19641 actccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgatcaatataagttttccggtagctcagttgg 19542  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || || | | | |||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| ||||| | ||  |||||    
T  19541 cggagatttatatccgggacattgtgagagtgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagttt 19442  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     |||||||   ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  19441 gcaagatgctctgggttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcg 19375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24203 - 23537
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  | |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24203 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagtttgtggatttaatgttttattgtaatcaatctgaagatagtgatttcaaagttgatgaacaaggtgtgttg 24104  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  24103 aggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcattcgggagcta 24004  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24003 cgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaa 23904  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23903 ggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttacccaat 23804  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  23803 actccgagagggcatgatgctatttgggttgtggtggataggttgacgaagtcagcgcactttattccgatcaatataagttttccggtagctcagttgg 23704  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || || | | | |||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||| ||||| | ||  |||||    
T  23703 cggagatttatatccgggacattgtgagagtgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagttt 23604  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     |||||||   ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23603 gcaagatgctctgggttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcg 23537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 103 - 680
Target Start/End: Original strand, 100751 - 101331
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||     
T  100751 caaggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtatta 100850  T
Q  203 ---atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgac 299  Q
       ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  100851 ttcatctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgat 100950  T
Q  300 ttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtg 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  100951 ttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtg 101050  T
Q  400 acaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatc 499  Q
    || ||||| || || ||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||| |||| ||    
T  101051 acgagtttgccaaacactccaagagggcatgatgccatttgggtcgtggtagataggttgacgaagtcggcacattttatcccgataaatattagttttc 101150  T
Q  500 cagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaag 599  Q
      |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  101151 tggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaag 101250  T
Q  600 attttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  101251 attttggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtc 101331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 181387 - 180725
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||| ||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || ||||||| ||    
T  181387 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctaataatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgaaat 181288  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  181287 tccgaggccgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaa 181188  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||||||  |||||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |     
T  181187 gatgtatcatgatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagatc 181088  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactc 418  Q
    || |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  181087 gaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 180988  T
Q  419 cgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgga 518  Q
    | || ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| |||  | || |||||||| ||    
T  180987 ctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctcttgcccagttggcaga 180888  T
Q  519 gatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaa 618  Q
    ||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  180887 gatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaacagtttgcaa 180788  T
Q  619 gatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    || |  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  180787 gaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcg 180725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 74 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 2721 - 2188
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||  | || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||    
T  2721 ctgaggatagtgactttaaggttgatgattagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattttaga 2622  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     |||||||| ||||| | ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||     
T  2621 ggaaagtcacaagagtagcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaagtgatgtt 2522  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  2521 gctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgttgggtttttgacaccgtttgatgtgccggagtggaagt 2422  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  2421 gggacagtatttctatggattttgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcaca 2322  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  2321 ctttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatctacattcataatattgtgaagttgcatggagtcccgtcgagtattgtttca 2222  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
     ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  2221 aatagagatccgaggttcacttctagattttgga 2188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1061 - 393
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1061 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatgaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 962  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||  |  | || ||||| ||||||||||| | |||||| || |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  961 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 862  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    |||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  861 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaaacgtgatgttgctcagttcgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 762  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  761 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatttgccaaagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 662  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||| | | || || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  661 actctgagagggcatgatgccatttgggattttgtcgataggttgacgaagtcgacacactttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 562  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  561 cggagatttatattcataatattgtgaagttgcatgatgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagttt 462  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  461 gcaagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccacaaacagatggtcagtcgga 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 80 - 686
Target Start/End: Original strand, 11965 - 12570
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11965 atagtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagatgaaag 12064  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    |||||| |||      
T  12065 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggttcggtttgaattgtgatgtcgctcat 12164  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12165 tttgtgtatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgac-ccgttggatgtaccagagtggaaatgggata 12263  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12264 gcatttctatggatttcgtgacgattttaccaaacactccgagaggacatgattctatttgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcgacgcacttcat 12363  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    |   || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||     
T  12364 tggtatcaacatcaattatccggtagctcagttggctgagatttatattcataatgttgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagg 12463  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| || || ||||||||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12464 gatccgaggttcacatctagattttggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 12563  T
Q  680 cggaaag 686  Q
    |||||||    
T  12564 cggaaag 12570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 45707 - 45041
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |   |||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45707 gagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcggataatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 45608  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||| | |||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  45607 attcagatgtagaatttgtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 45508  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    || ||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  45507 aaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggtccggtttgaaacgcgacgttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaat 45408  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  45407 ttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacac 45308  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  45307 tccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggaacacttcatccctattaacatgagttatccggtagctcagttggct 45208  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||    
T  45207 gagatttatattcataatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttac 45108  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  45107 aggacgctttggggtcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcgga 45041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 279 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 44433 - 44029
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44433 gtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 44334  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||    
T  44333 agcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggaacacttca 44234  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    |  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44233 tccctattaacatgagttatccggtagctcagttggctgagatttatattcataatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatag 44134  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
     || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  ||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  44133 ggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttggggtcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcag 44034  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  44033 tcgga 44029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21090 - 20744
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||| |  ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21090 gagaagcgcaacaagtggatgtaaagattgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 20991  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||||    
T  20990 attcagaggtagaatttgtattccttacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcatgagtattcatccgggacctaca 20891  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    |||||  |||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20890 aaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgtagctcaatttatttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaag 20791  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccg 363  Q
    |||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20790 ttgaacatcagaaacctgcaaggttgttgacaccgttggatgtaccg 20744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 399
Target Start/End: Original strand, 19570 - 19839
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||   | |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19570 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 19669  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  | |||||||||||||||||||| || |||||    || ||  | | ||| |||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  19670 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagttcgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 19769  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtg 399  Q
     ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19770 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 19839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 5515 - 6117
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5515 atagtgacttcaaagttgatgattagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaag 5614  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||  |||||||    || ||  ||| |    
T  5615 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagctcag 5713  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714 tttgtgtatgcatgtttgtcttgttagaagtctaaagttgaatatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 5813  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  5814 gcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcgacacacttcat 5913  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  5914 tcctattaacatcagttatccggtagctcagttggctaagatttatattcataatattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagg 6013  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || |  ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  6014 gatctgaggttcacttctaggttctggatgagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatagatggtcagt 6113  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  6114 cgga 6117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 32600 - 31934
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||     
T  32600 agaagcgcaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgagg 32501  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  32500 ttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaa 32401  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgtttt-ggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32400 aaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgttagaagtctaagg 32301  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  32300 ttgagcatcagaatcctgtagggctgttgacaccgttggatgtgcaggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacac 32201  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||||  | || ||||| || ||||||| || ||| ||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32200 tccgagagggcatgatgccatttgggttgtttttgataggttaacaaagtcggtgctctttattccaatcaatatcagttatccggtagctcaattggcg 32101  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  32100 gagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 32001  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  32000 aagatgccttgggttcgaagttggggttgagttcagcttatcatccgcaaacagattgtcagtcgga 31934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 279 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 14967 - 14563
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14967 gtttgtgtatgcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggat 14868  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    || || || |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || ||||||||||||||||| || ||      
T  14867 agtatatccatggattttgtgaagagtttgcctaatactcctaaagggaatgacacgatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcggctcattttc 14768  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||    
T  14767 ttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcggagatctacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttcattcgagcattgtgtcagatag 14668  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || | ||| || ||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||    
T  14667 agatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagattctaagttgaggttgagttcggcgtatcagccgcaaacagatgctcag 14568  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  14567 tcgga 14563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18113 - 17965
Alignment:
Q  535 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| |    
T  18113 attgtgaggttacacggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcga 18014  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18013 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 17965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 603
Target Start/End: Original strand, 18321 - 18557
Alignment:
Q  367 tggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagt 466  Q
    |||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| |||   |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  18321 tggaaatgggatagtatatccatgtattttgtgacgagtttaacgaatactcctaaagggaatgccgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagt 18420  T
Q  467 cggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtat 566  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  18421 cggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcggaaatttacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcat 18520  T
Q  567 agtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattt 603  Q
     || ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18521 tgtatcatatagagatccaagatttacttctagattt 18557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 51042 - 51645
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51042 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaag 51141  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || ||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |    
T  51142 tcacagaagtaacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcag 51241  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  51242 tttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggaca 51341  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||    
T  51342 gcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaaggcatgatgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcgtcacactttat 51441  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  51442 tccgatcaatattagttttccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtgtcggataga 51541  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || |  ||||| ||||  ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  51542 gatctgaggttcacttttagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggttagt 51641  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  51642 cgga 51645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 2471 - 3137
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||  | ||||| || | ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||    
T  2471 gagaagcgcaacaagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgttggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggtcgatgatcagggtgtgttaag 2570  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||     
T  2571 gttcagaggaaggatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccaggagctacg 2670  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2671 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcatttcgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaagg 2770  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || | || ||    
T  2771 ttgaacataagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatgaattttgtgacgagtatagcaaacac 2870  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||| || ||||| ||| | |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  2871 tccaagagggcacgatgctatataggttgttatcgacaggttgacgaagtcggcgcacttcattcctattaatatcagttatctggtagcatagttggcg 2970  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| ||  |||| || || |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |    
T  2971 gagatttatgttcataacatagtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgc 3070  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || |  |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3071 atgacgctttgggttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 3137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 74 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8193 - 7660
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||    
T  8193 ctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttaattttaga 8094  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||   || |||    
T  8093 ggagagtcacaagagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtc 7994  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7993 gctcattttgtgtatgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagt 7894  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  7893 gggatagcatttctctggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaagttgatgaagtcggcgca 7794  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| |||||     
T  7793 ctttattccgattaatatcagttatctggtagctcagttggtggagatttatattcataatattgtgaagctacgtggtgtaccgtcgagtattgtgtcg 7694  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
    ||||| || || | ||| ||||| ||||| ||||    
T  7693 gatagggatccgatgttcacttctagattctgga 7660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 5)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 683
Target Start/End: Original strand, 279 - 931
Alignment:
Q  31 gttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  || |||| ||||||||||| ||  | || |||||||| || ||||| ||||    
T  279 gttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatcgtgacttcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaa 378  T
Q  131 tttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatga 230  Q
    |||| ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || | ||| |||||| ||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  379 tttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatga 478  T
Q  231 cttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagagg 330  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  479 cctgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaag 578  T
Q  331 cctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  579 cctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaagtgggatagcatttccatggattttgtgacgagtttactgaatactccgagagggcatg 678  T
Q  431 attcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattca 530  Q
    || | || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||| ||  |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  679 atgccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttctggtagctcaattggctgagatttatattca 778  T
Q  531 gaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggt 630  Q
     |||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||    
T  779 taatattatgaagttacatggtgtttcatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggt 878  T
Q  631 tcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  879 tcaaagttgaggttgagttcggcttatcgtccgcaaacagatggtcagtcgga 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28407 - 28173
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || |||||||||   || || ||||||||    
T  28407 gagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgag 28308  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     ||  |||| |||||||||||| || |  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||| |||| ||||     
T  28307 gttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacg 28208  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 251  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  28207 aaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34660 - 34426
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || |||||||||   || || ||||||||    
T  34660 gagaagcacaacaagtggatgtcaagcttgttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgattttcagggtgtgttgag 34561  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     ||  |||| |||||||||||| || |  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||| |||| ||||     
T  34560 gttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatctgggatctacg 34461  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtg 251  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  34460 aaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 556 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28170 - 28043
Alignment:
Q  556 ccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctt 655  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||| || || ||||   ||||||||||||    
T  28170 ccgtcaagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggctt 28071  T
Q  656 atcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28070 atcatccgcagacagatggtcagtcgga 28043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 556 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 34423 - 34296
Alignment:
Q  556 ccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctt 655  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||| || || ||||   ||||||||||||    
T  34423 ccgtcaagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggctt 34324  T
Q  656 atcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34323 atcatccgcagacagatggtcagtcgga 34296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 3981 - 3315
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||  | ||||| |||||||||||||  || || ||||||||    
T  3981 gagaagcgcagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagagagtgacttcaaggttgatgttcagggtgtgttgag 3882  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3881 gttcagagggagaatttgcattccagataatgatgagttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 3782  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3781 aagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagactaagg 3682  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatac 416  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  3681 ttgagcatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaacac 3582  T
Q  417 tccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcg 516  Q
    ||| || |||| |||| | || ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  3581 tcccagagggcgtgatgccatttgggtggttgtcgataggttgacaaagtccgcgcactttattccgatcaatattagttatccgatagctcagttggcg 3482  T
Q  517 gagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttac 616  Q
    ||||| || ||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |    
T  3481 gagatttatattcataatattaagaagttacatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgc 3382  T
Q  617 aagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3381 aagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcgtcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7449 - 6896
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |  ||||  || |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  7449 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatg 7350  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  | |||| ||||||||||||||| |  |||||    || ||  | |  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |     
T  7349 atctaaagaggttgttttggtggtccgaattgaaacgtgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaaaa 7250  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||| ||    
T  7249 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtctaatactcctaaagggaat 7150  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7149 gacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcggagatctacattc 7050  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||    
T  7049 gtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagg 6950  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6949 ttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 6896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 82 - 662
Target Start/End: Original strand, 81013 - 81593
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  81013 agtgacttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattcttgaagagagtc 81112  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    | ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||    || ||  ||| |||    
T  81113 acaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaatgtgacgttgctcagtt 81212  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81213 tgtgtatgcatgtttgacttgtgagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 81312  T
Q  382 atttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcattt 481  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||     
T  81313 atttctatggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattc 81412  T
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  81413 ctattaacatcagttatccggtagctcagttgacttagatttatattcataatattttgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggga 81512  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatcc 662  Q
     || ||||| || || ||||||||||  || || || || |  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  81513 tccgaggttcacatctagattttggaagagcttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcc 81593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 513 - 5
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || ||||||    
T  513 agaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgaccagggtgtattgaga 414  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  413 ttcagaggtagaatttatattcctgaaaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacaa 314  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  313 aaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacatgacgttgctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagt 214  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  213 tgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaacact 114  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    ||||||||||| |    
T  113 ccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatcc----gctcagttggctg 18  T
Q  518 agatctacattca 530  Q
    |||| || |||||    
T  17 agatttatattca 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 169 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40776 - 40262
Alignment:
Q  169 ttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagg 268  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    |    
T  40776 ttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtg 40677  T
Q  269 atgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtg 368  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  40676 atgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtg 40577  T
Q  369 gaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcg 468  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40576 gaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaggttgacgaagtcg 40477  T
Q  469 gcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatag 568  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  40476 gcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttacatggagttccgtcgagtattg 40377  T
Q  569 tgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagac 668  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  40376 tgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaag 40277  T
Q  669 ggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||||||||||||    
T  40276 agatggtcagtcgga 40262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 88 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 261427 - 260829
Alignment:
Q  88 ttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 187  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  261427 ttcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtgttcttgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaggtcacaaga 261328  T
Q  188 gcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgta 287  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||||||    
T  261327 gtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgta 261228  T
Q  288 tgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 387  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  261227 tgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 261128  T
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||| | || |    
T  261127 atggattttgtgacgagtttaccaaacactctgagaggacatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacactttattcctatca 261028  T
Q  488 atatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaag 587  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||    
T  261027 acatcagttatccgatagctcaattggctgagatttatattcataatgttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgag 260928  T
Q  588 gtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
    ||| || || || || ||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  260927 gttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaag 260829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 683
Target Start/End: Original strand, 277991 - 278612
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  277991 ctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggccgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaa 278090  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || |  ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||    
T  278091 aatgattcttgaagagagtcatagaagtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattg 278190  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| |   || ||  | | || ||||| |    
T  278191 aaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcatgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctgatatgatggtatcattagatgtgc 278290  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||  |||| ||| |  | || || || |||||    
T  278291 cagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttggatgattgttgatagattgac 278390  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||     ||||||||||||||| ||| || || | || ||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  278391 gaagtcggctcattttccaccgattaatatcagttttcctgtcgccctgtaggcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcg 278490  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  278491 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaagagtttgcaagaggccttcggttctaaattgagattgagttcggcgtatcatc 278590  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  278591 cgcagacagatggtcagtcgga 278612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 683
Target Start/End: Original strand, 48322 - 48989
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   || ||||| ||  || || ||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  48322 gagaggcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatgattgctggtaatgaaacagaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtattgag 48421  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  48422 attcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcataagagtagcttgagtattcatccgggagctaca 48521  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgac-ttgtcagaagtctaag 315  Q
    |||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    || ||  ||| |||||   | |  ||    |  ||||||||| |||||     
T  48522 aaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgaaaaagtttgaaaaaagttgtcagaaatctaaa 48621  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  48622 gttgaacatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttagtgacaagtttaccaaaca 48721  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  48722 ctccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcacacttcattcctattaacatcagttatctggtagctcagttggc 48821  T
Q  516 ggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttta 615  Q
     ||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | || ||||| ||||| || || ||||  ||||||    
T  48822 tgagatttatattcataatattgtaaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggataggaatccgaggttcacttctaggttctggaagagttta 48921  T
Q  616 caagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48922 caggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 48989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 203 - 681
Target Start/End: Original strand, 17839 - 18317
Alignment:
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  17839 atccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttg 17938  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  17939 ttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttagatgtggcagagtgaaagtgggacagcatttccatggatttcgtaacg 18038  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18039 agtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgttgtcgacaagttgacaaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccag 18138  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18139 tagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagtttcatggagttccgtcgagtattgtgtcgtatagagatccaaggttcacttctagatt 18238  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    |||||  ||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18239 ttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcg 18317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 679
Target Start/End: Original strand, 39876 - 40537
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  39876 agaagcacaaaaagttgatattaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcaaggcgtgttgaga 39975  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  39976 tttcgaggaagaatttgtattccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagatattcacagaagtagcttaagtattcatccgggagctacaa 40075  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  40076 agatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagt 40175  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||| |||||||  | ||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40176 tgaacatcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatact 40275  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || ||||| |||||| | || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  40276 ccaaggggacatgataccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggcgg 40375  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || ||| ||    
T  40376 agatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgca 40475  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||| | ||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40476 agaggcgttgggttctaagttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagt 40537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 223 - 679
Target Start/End: Original strand, 28090 - 28546
Alignment:
Q  223 tatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagc 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  28090 tatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaac 28189  T
Q  323 atcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgag 422  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  28190 atcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactccaag 28289  T
Q  423 ggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatc 522  Q
    ||| |||||| | || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||     
T  28290 gggacatgataccatttgggtagttgttgatagattgacgaagtcggcgcattttattccgattaatattagttttccggtggctcagttggcggagatt 28389  T
Q  523 tacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatg 622  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || ||| ||||| |    
T  28390 tatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgcaagagg 28489  T
Q  623 tgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
     ||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28490 cgttgggttctaagttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagt 28546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 48296 - 47651
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  48296 cagagaagcacatcaggttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatgatgaaggtgtgttg 48197  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  48196 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagcta 48097  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    || ||||                    |||||||||||||||| |||||    |||||  |||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48096 cagaaat--------------------tgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtttatgcatgttagacttgtcagaagtctaa 48017  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  48016 ggttgagcatcagaagcctacagggttgttgaccccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 47917  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    |||||||| || | |||| | || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47916 actccgagaggccctgatgccatttgggttgttgtcgataggttgactaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccggtagctcagttgg 47817  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagttt 614  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  47816 gggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagacccgaggttcacttctagattttggaagagttt 47717  T
Q  615 acaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47716 gcaagatgcattgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacaaatggtcagtc 47651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 571
Target Start/End: Original strand, 14345 - 14867
Alignment:
Q  49 gatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatg 148  Q
    ||||| || ||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||  |||    
T  14345 gatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatg 14444  T
Q  149 aggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttg 248  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14445 atgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 14544  T
Q  249 gtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgaca 348  Q
    ||||||||| |||||    ||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  14545 gtggtctgggttgaaacgtgatgttactaagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgaca 14644  T
Q  349 ccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtgg 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| | || ||||| || |    
T  14645 ccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttg 14744  T
Q  449 tagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgca 548  Q
    | |||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  14745 tcgacaggttgacgaagtcggcacaatttattccgatcaatcttagttatccggtagctcagttgccggagatttatattcataatattgtgaagttaca 14844  T
Q  549 tggggttccgtcgagtatagtgt 571  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  14845 tggagttccgtcgagtattgtgt 14867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 49 - 571
Target Start/End: Original strand, 22524 - 23046
Alignment:
Q  49 gatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatg 148  Q
    ||||| || ||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||  |||    
T  22524 gatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatg 22623  T
Q  149 aggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttg 248  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22624 atgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaactagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttg 22723  T
Q  249 gtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgaca 348  Q
    ||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  22724 gtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgctgggttgttgaca 22823  T
Q  349 ccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtgg 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||| | || ||||| || |    
T  22824 ccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttg 22923  T
Q  449 tagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgca 548  Q
    | |||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  22924 tcgacaggttgacgaagtcggcacaatttattccgatcaatcttagttatccggtagctcagttgccggagatttatattcataatattgtgaagttaca 23023  T
Q  549 tggggttccgtcgagtatagtgt 571  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  23024 tggagttccgtcgagtattgtgt 23046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Original strand, 24200 - 24853
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||    
T  24200 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcag 24299  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24300 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataat 24399  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  24400 gacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcttgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcaga 24499  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
     |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24500 agcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccgaagtggaaatgggatagtattcc-atggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggca 24598  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||| | || ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||| | || ||||| |||| |   || ||||| ||||||||||| || |||    
T  24599 tgataccatttgggtggttgtagatagattgacgaagtcgacgcaatttattccaatcaatattagttttatggtggctcatttggcggagatttatatt 24698  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  24699 cgtgaaattgtgtagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagattgagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgg 24798  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | || || ||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  24799 gatctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtaaacagatggtcagtcgga 24853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 74 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 249746 - 249140
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  249746 ctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttaga 249647  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    | ||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    || ||     
T  249646 aaaaagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgta 249547  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     |||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  249546 gctcattttgtatatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtcgaagt 249447  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||    
T  249446 gggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgcaatttgggttattgtcgacaggttgacgaagtcggcaca 249347  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||  |||| |  ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  249346 tttcattccaattaatatcagttatccggtagcacagttggtagagatttatgttcatagcattgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtca 249247  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || |||||||| || || || ||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  249246 gatagggatccgaggtttacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatg 249147  T
Q  674 gtcagtc 680  Q
    |||||||    
T  249146 gtcagtc 249140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 43916 - 43307
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  43916 ctgaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattctaga 43817  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    || ||     
T  43816 agagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacttgacgta 43717  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43716 gctcagtttgtgtatgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagt 43617  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||   || |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  43616 gggacagtatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatgatgtcatttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 43517  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  |||| |  ||||||||| | || || || ||||||||||| || |||    
T  43516 cttcattcctattaatatcagttatctggtagcacagttggcagagatttatgttcatagcattgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtatca 43417  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||||  ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43416 gatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagctgaatttgagttcggcttatcatccacagacagatg 43317  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  43316 gtcagtcgga 43307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18541 - 17883
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  18541 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 18442  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| |||| |||   ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| | || || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  18441 aggttcagaggaagaatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtaacaaaagtagcttaagtattcatccgggagcta 18342  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttgg-tggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtcta 313  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||| ||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18341 caaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgatggtttgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagttta 18242  T
Q  314 aggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 413  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18241 aggttgagcatcagaagccttcagggttgttgactccgttagatgtgccagagtggaagtgggacatcatttccatggattttgtgacgagtttaccgaa 18142  T
Q  414 tactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttg 513  Q
    ||||||| | | ||||||| | || ||||||           ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18141 tactccgtgagagcatgatgccatttgggtt-----------gttgacgaagtcggcacactttattccgatcaatattagttatccagtagctcagtcg 18053  T
Q  514 gcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtt 613  Q
    |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||    
T  18052 gcggaggtttatattcataatattgtaaagttgcatggagttctatcgagtattgtgtgggatagagatccgagattcacttctagattttggaagagtt 17953  T
Q  614 tacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||  ||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17952 tgcaagatgcattgagttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgga 17883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 683
Target Start/End: Original strand, 6510 - 7019
Alignment:
Q  175 gaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtca 274  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||      
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 6609  T
Q  275 ctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatg 374  Q
    |||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  6610 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 6709  T
Q  375 ggatagcatttctatggatttt-gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  6710 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 6809  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| |||  ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6810 ctttattctgatcaatgttagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtca 6909  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6910 gatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatg 7009  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  7010 gtcagtcgga 7019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 683
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11450
Alignment:
Q  175 gaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtca 274  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    |||||      
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 11040  T
Q  275 ctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatg 374  Q
    |||  ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  11041 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 11140  T
Q  375 ggatagcatttctatggatttt-gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11141 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgtggtcgataggttgacaaagtcggcgca 11240  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||| |||  ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11241 ctttattctgatcaatgttagttatccggtagctcagttggcggagatttatattcataatattgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtca 11340  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11341 gatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatg 11440  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  11441 gtcagtcgga 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29249 - 28718
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  || |||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  29249 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatggttactagtaatgaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 29150  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||  ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || | ||| |||||| |||| |||||||    
T  29149 aggttcagaggaagaattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccaggagcta 29050  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29049 caaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgcttagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 28950  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  28949 ggttgagaattagaagcctgcagggttgttaacactgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaat 28850  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttgg 514  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||  | ||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28849 actccaagagggcatgatgccatttgggttgttgtctataggttgacgaagtcggcacattttattccgatcaatattagttttccggtagctcagttgg 28750  T
Q  515 cggagatctacattcagaatattgtgaagttg 546  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28749 tggagatttacattcataatattgtgaagttg 28718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 30070 - 29578
Alignment:
Q  82 agtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtc 181  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||| ||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||    
T  30070 agtgattttaagatcgatgatcaacgtgtgttgaggtttcgaggtaggatttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtc 29971  T
Q  182 ataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtt 281  Q
    |||  || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||  | |||| |||||||| || |||||| |||||    |||||  |   |||    
T  29970 atagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacgatctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaacgcgatgttgcagagtt 29871  T
Q  282 tgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagc 381  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||  || ||    | || ||||| || |||||||||||||||||     
T  29870 tgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgaccatcagaaacctactggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagt 29771  T
Q  382 atttctatgga-ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatt 480  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| |  ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  ||    
T  29770 atatccatggatttttgtgacgagtttgcatgatactcctaaagggaatgacgcaatttgggtgattgttgaaagattgacgaagtcggctcattttctt 29671  T
Q  481 tcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||||||| |||| ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  29670 ccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtca 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 541 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 37868 - 37726
Alignment:
Q  541 aagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattga 640  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||  || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37868 aagttgtatggggttccatcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaaagttga 37769  T
Q  641 aattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
      || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37768 ggttcagttcagcctatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 37726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 196 - 683
Target Start/End: Original strand, 6331 - 6818
Alignment:
Q  196 agtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  | |  ||| | || || ||||    
T  6331 agtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacaatttctataggcatgtt 6430  T
Q  296 tgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattt 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6431 tgacttgtcagaagtctaagattgaacatgagaagcctgcaggattgttgacaccgttagattttccagagtggaagtgggacagcatctccatggattt 6530  T
Q  396 tgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagt 495  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| |||    
T  6531 tgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatgataccatttgggttgttgtcgataggttgacgaagtcggcgcattttatcccgatcaatattagt 6630  T
Q  496 tatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  6631 tttccggtagctcagttggcggagatttacattcataatattgtgaagttacatggggttccatcgaacattgtgtcggatagagatctgaggttcactt 6730  T
Q  596 caagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  6731 caaggttttggaagagtttacaagaggccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcgga 6818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 6224 - 6303
Alignment:
Q  34 gatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgtt 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6224 gatgccaagtttgtggatttaatggttactagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaagttgatgatcaaggtgtgtt 6303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 128 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 528
Alignment:
Q  128 gaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatca 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |  ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  943 gaatttgcattcctgatgatgttggtttgaaaaagttagttttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatca 844  T
Q  228 tgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 327  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||   || ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  843 tgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcag 744  T
Q  328 aggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggc 427  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||    
T  743 aagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtgccgaagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagagggc 644  T
Q  428 atgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacat 527  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  643 atgatactatatgggttgtggtcgacaagttgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatctggtagctcagttggcggagatttatat 544  T
Q  528 tcagaatattgtgaag 543  Q
      | ||||||||||||    
T  543 cgataatattgtgaag 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 15892 - 16495
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | || || ||    
T  15892 atagtgattttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagag 15991  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |    
T  15992 tcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcag 16091  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16092 tttgtttatggctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggaca 16191  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |  | || |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  16192 gtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcataacgctatttgggttgttgtcgaccggttgacaaagtcggcacacttcat 16291  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | | || ||||||| |||||| |||||  |||| || ||||| || ||||| | | | |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16292 tcctatcaatatcaattatccggtagcgtagttagcagagatttatattcacagtgtggtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggataga 16391  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16392 gatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagt 16491  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  16492 cgga 16495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10615 - 10501
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||   |||||||    
T  10615 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcaaactgaagatggtgacttcaaggttgatgatgaaggtgtgttgagataccgaggcag 10516  T
Q  129 aatttgtattcctga 143  Q
    ||||||||| |||||    
T  10515 aatttgtatccctga 10501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Original strand, 32492 - 33101
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||  |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||    
T  32492 ctgaggatagtgacttcaaggtagatgatcagggtgtaatgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctaga 32591  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||    || ||     
T  32592 agagagtcacaagagtagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtt 32691  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32692 gctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagt 32791  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||   | ||| |||||||||||||||| ||    
T  32792 gggacagtatttctatggatttcgtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatgatgccatttgggttgctatcgaccggttgacgaagtcggcaca 32891  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     |||||| | |||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||  |||| |  ||||||||| |||| || || |||||||||||   |||     
T  32892 tttcattcctattaatgtcagttacccggtagcacagttggtagagatttatgttcatagcattgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtatttcgtcg 32991  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || || ||||| || || || || ||||  ||||| || ||||  |||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  32992 gatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgatttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatg 33091  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  33092 gtcagtcgga 33101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 280 - 683
Target Start/End: Original strand, 903 - 1306
Alignment:
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  903 tttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacc 1002  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  1003 taatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcacactatat 1102  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||     
T  1103 tccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttatatttataacattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtatcgtgtcggacagg 1202  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||  || || |||||||  |||||||| || |||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1203 gatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgctttgggttcgaagttgtggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagt 1302  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  1303 cgga 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 6547
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||| |    
T  7118 gtgttaaggtttagaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccag 7019  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || ||||| || ||  | |||   ||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  7018 gagctacgaagatgtaccacgatctaaag---ttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtatacttgtttgatttgtcagaa 6922  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
     || ||||||||| ||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||     
T  6921 atcgaaggttgagtatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtaacgagtttg 6822  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||  ||||||||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  6821 cctaatactcctaaagggaatgacgcgatatgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctc 6722  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  6721 agttggcagagatttacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaa 6622  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| || || |  || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6621 aagtttgcatgaggctttaggttctaagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 12846
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  13247 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgaga 13148  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| || ||||||||||| ||| |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||| | || |||||||| |    
T  13147 tttcgaggtaggatttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctggagctacga 13048  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||    |||||  | | ||| |||||| | ||||| | |||||||||||| |||||    
T  13047 agatgtatcatgatctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaacgagatgttgcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcagaagtcgaaggt 12948  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  12947 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatact 12848  T
Q  418 cc 419  Q
    ||    
T  12847 cc 12846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 670 - 887
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || ||||| || ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  670 gaagcacaacaagtggatgtcaagctggttgatttgatggttgctggtaatggcactgaggatagtgactttaaggttgatgatcaaggtgtattgaggt 769  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  770 tcagaggaagaatttgtattcctgataatgag-agttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaa 868  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaag 237  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  869 aatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 74 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 2041 - 1428
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||    
T  2041 ctgaggatagtgactttaaagttgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcttgacaatgatgagataaagaagatgattctcga 1942  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| ||||| |  || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||    |||||     
T  1941 agagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtg 1842  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
    || | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |  || |||||||    
T  1841 acacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgctagaatggaaat 1742  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| ||    
T  1741 gggatagtatatacatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagaggacatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctca 1642  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
     ||||||  |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| | || || ||||| ||||  || ||||||    
T  1641 tttcattctgattaacatcagttttcctgtatctcagttggcggagatttacattcacgagattgtgaagctacaaggtgttccatcgaacattgtgtca 1542  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  1541 gatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgaagttgagttcggtgtatcatccgcagacagatg 1442  T
Q  674 gtcagtcggaaaga 687  Q
    || ||||| |||||    
T  1441 gttagtcgaaaaga 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 473
Target Start/End: Original strand, 176 - 633
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  176 cagagaagcacataaaattgatgtcatgtttgtggatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcaaggtgtgttg 275  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||| ||| |||| |||   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  276 aggttcagaggaagaacttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagcta 375  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    || ||  | | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  376 caaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaagtctaa 475  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaat 414  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  476 ggttgaacatcagaagcatgcagg-ttgttgacaccgttagatgtacctgagtggaagtgggatagcatttccatggattttgtgacaagtttgccgaat 574  T
Q  415 actccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||||||| ||||||||  | ||  ||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  575 actccgagagggcatgacaccattagggttgttgtcgataggttgacgaagtcagcgca 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 74 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27394 - 26785
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| || | ||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | ||    
T  27394 ctgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttga 27295  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
     || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |   ||||     
T  27294 ggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagatatgtt 27195  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 373  Q
     |||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  27194 gctcattttgtttatgcttgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtttgatgtaccgtagtggaagt 27095  T
Q  374 gggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgca 473  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  |  | |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  27094 gggacagtatctctatggatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgacgctgtttgggttgttgtcgaccggttgacgaagtcggcaca 26995  T
Q  474 cttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtca 573  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| | |||||||||| |||| || ||  |||| ||||| |||||     
T  26994 cttcattcctatcaatatcagttatccggtagcacagttggcagagatttatgttcatagtattgtgaagctgcacggtgtatcgtcaagtattgtgtcg 26895  T
Q  574 gatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatg 673  Q
    ||||| || |  ||||| ||||| || || ||||  |||||||| || |  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  26894 gatagggatctgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatg 26795  T
Q  674 gtcagtcgga 683  Q
    ||||||||||    
T  26794 gtcagtcgga 26785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5158 - 4555
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||    
T  5158 atagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgttttcgaggcagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 5059  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    |||||| || | |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  5058 tcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgtggcacag 4959  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||  |||| |  ||||||||||||||||    
T  4958 tttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgcaggtttgatgacacctttatatgttctagagtggaaatgggata 4859  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || || ||    
T  4858 gcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcataaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttat 4759  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||   ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  4758 tccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttacattcgcgatattatgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagataga 4659  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||  || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  4658 gatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttataagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggt 4559  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  4558 cgga 4555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20096
Alignment:
Q  88 ttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 187  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||| || | ||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20513 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 20414  T
Q  188 gcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgta 287  Q
    | |  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||   |||||  ||| |||||||||    
T  20413 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgta 20314  T
Q  288 tgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 387  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  20313 tgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 20214  T
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  20213 atggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgacaggttgacgaaatcggcacacttcattcctatta 20114  T
Q  488 atatcagttatccagtag 505  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  20113 atatcagttatccggtag 20096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 23333 - 22916
Alignment:
Q  88 ttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataaga 187  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||| || | ||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  23333 ttcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaaga 23234  T
Q  188 gcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgta 287  Q
    | |  ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||   |||||  ||| |||||||||    
T  23233 gtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgta 23134  T
Q  288 tgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttct 387  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  23133 tgcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 23034  T
Q  388 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgatta 487  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||    
T  23033 atggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatgatgacatttgggttattgtcgacaggttgacgaaatcggcacacttcattcctatta 22934  T
Q  488 atatcagttatccagtag 505  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  22933 atatcagttatccggtag 22916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 502 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1233 - 1052
Alignment:
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||||    
T  1233 gtagcacagttggcggagatttatattgataacattgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttctagat 1134  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||  || || |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  1133 tcaggaagagcttgcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcgga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 502 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 12682 - 12582
Alignment:
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  12682 gtagcacagttggcggagatttatattcataacattgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagat 12583  T
Q  602 t 602  Q
    |    
T  12582 t 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Original strand, 20559 - 20938
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| |    || || ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||    
T  20559 gaagcacagcaagtggatgtcaagtttgtcgatttgatggttgctggtagtggcactcaggatagtgactttaaggttgatgatcatggtgtgttgagat 20658  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20659 tcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaa 20758  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     || |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20759 gatctatcttgatttgaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtgatgttgctcagtttgtctatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 20858  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20859 gagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggacagcatttctatggattttgt 20938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 27558 - 27763
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  27558 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctgggatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 27657  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27658 gtttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 27757  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  27758 ttttgt 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 285 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11691 - 11293
Alignment:
Q  285 gtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatt 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11691 gtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacatt 11592  T
Q  385 tctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcga 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||  |||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||| | |    
T  11591 tctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggtttgattctatatggtttgtggtcgataggttgacaaagtcggtacacttcattccta 11492  T
Q  485 ttaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagaccc 584  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  11491 ttaacatcagttatccggtagctcagttggctgagatttatattcaaaacattgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatggagatcc 11392  T
Q  585 aaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||| ||||| || || ||||  ||||| || || |  |||||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11391 gaggttcacttcgaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaagttgaggttcagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11923 - 11690
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11923 gagaagcgcaacaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgctggtaatgaaacagaggatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtattgag 11824  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||    
T  11823 attcataggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatcttagaagaaagtcataagagtagcttaagtattcatccaggagctaca 11724  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggt 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11723 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 681
Target Start/End: Original strand, 218626 - 219197
Alignment:
Q  110 tgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccggg 209  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||    
T  218626 tgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccggg 218725  T
Q  210 agctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaag 309  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | ||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  218726 agctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgaattcctgtttgatttgtcagaag 218825  T
Q  310 tctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 409  Q
    || || |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||      
T  218826 tcaaaagttgagcatcagaaacctgcagggttgatgacaccattagatataccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagcttgt 218925  T
Q  410 ctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctca 509  Q
    | |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  218926 cgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtgtctca 219025  T
Q  510 gttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaga 609  Q
    ||||||||| || |||||||   ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||      
T  219026 gttggcggaaatttacattcgcgatattgtgaagtgacatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaaggtttacttctagattttggaag 219125  T
Q  610 agtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  219126 agtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggggtatcatccgcagacagatggtcagtcg 219197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 230188 - 229563
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  230188 ctagtaatcagactgaagatggtgattttaagatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttatattccagacgatgatgagatgaagaa 230089  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
    | ||||| | |||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  230088 gatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttggtttggtggtctggattg 229989  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| |    
T  229988 aaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgc 229889  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||    
T  229888 cagagtggaattgtgatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgac 229789  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  229788 gaagtcggctcattttattccgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcg 229689  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| ||||| |  || ||||| || || |  ||||||||||| ||||||     
T  229688 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttatagagtttggaaaagtttgcaagaggatttaggttctaagttaaggttgagttcggcgtatcatt 229589  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  229588 cgcagacaaatggtcagtcggaaaga 229563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Original strand, 31881 - 32534
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||    
T  31881 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtag 31980  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  31981 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 32080  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | | ||| | |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  32081 gatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctatttaatttgtgagaagtcgaaagttgagcatcaga 32180  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||| ||| || ||  | | || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| |    
T  32181 aacctgctggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaa 32280  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| |||||  | || || || |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||    
T  32281 tgacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggaaatttacatt 32380  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || |    
T  32381 cgagatattgtgaagttgcatggtgttctttcgagaat-gtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaagctttag 32479  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32480 gttctaagttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 32534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 286 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2715 - 2318
Alignment:
Q  286 tatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcattt 385  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| | |||||    
T  2715 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtagaagtgggacaacattt 2616  T
Q  386 ctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgat 485  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||    
T  2615 ccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcacgatgccatttgggtggttgtcgacaggttgacgaagtcaacacactttattccgat 2516  T
Q  486 taatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagaccca 585  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||     
T  2515 caataatagttatccggtagctcagttggcagagatttacattcataatattgtgaagttacatggacttccatcgagtattgtgtcggatagacatccg 2416  T
Q  586 aggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2415 aggttcacttcacgattttggaagagtttgcaagatgccttgggttctaagttgaggttgagttcggcatatcatccgtagacagatggtcagtcgga 2318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3368 - 3024
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||   | || ||||||    
T  3368 cagagaagcacagcaagttgatgccaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagatggtgatttcaaggttgatggtgagggtgtgttg 3269  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||||| | |||||| |||| || || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  3268 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaagaatgtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagcta 3169  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3168 caaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaa 3069  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgt 359  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3068 ggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgt 3024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 4318 - 3660
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||| ||||||| || |  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  4318 aagttgatgtcaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaggatagtgactttagagttgatgaccaaggtgtgctgagatttcgaggccg 4219  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||  || | |||||||||| ||  |||| |||| || ||||||||     
T  4218 aatttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcac 4119  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||| | ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  4118 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttatttattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 4019  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||||||  || ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||  | || |||||||  ||| |    
T  4018 aacctgcagggctgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttttcgaacactccgaaagggaa 3919  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| | |||  | ||||| || |||   |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || ||     
T  3918 tgacgcgatttaggtgattgtagatagattgcacaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctgtgtctcagttggcggagatttatatc 3819  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || |    
T  3818 cgcgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttag 3719  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    |||| || ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3718 gttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacaaatggtcagtcggaaaga 3660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Original strand, 14258 - 14861
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||    
T  14258 atagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcggtttcgaggcagaatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 14357  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | |    
T  14358 tcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgacacag 14457  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||  ||||  || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  14458 tttgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcaaaagttgagtatcagaaacctgttgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgagata 14557  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  ||| ||||  | || |||||  | ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  14558 gtatatccatggaatttgtgacgagtttgccgaatactccgaatgggaatgacgctatttgggtgattgtagatagattaacgaagtcggctcatttcat 14657  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||| | ||||| |||||||| |  ||  | |||||||||    
T  14658 tccgattaacatcagttttcctgtatctcagttggcagagatttacatccgcgatattgtgaagctacatggtgttccgtcaaacattttatcagataga 14757  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14758 gatccgaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggatttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcacccgcggacagatggtcagt 14857  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  14858 cgga 14861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 340 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 115052 - 114704
Alignment:
Q  340 ttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatat 439  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||    
T  115052 ttgttgacaccgttggatgtgctggagtggaagtggaatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatgatgctatat 114953  T
Q  440 gggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgt 539  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  114952 gggttgtggttgacagattgacgaagtcggcgcactttattccgattaatatcagttatccggtagctcagttggcggagatttacagtcataatattgt 114853  T
Q  540 gaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag-----agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaa 634  Q
     ||| ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||      || || ||||| ||||| ||||||||||  || || |||||||  |||||||| |    
T  114852 aaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgttggatagggatccgatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 114753  T
Q  635 aattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  114752 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 114704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 687
Target Start/End: Original strand, 390491 - 390986
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| |     
T  390491 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtattct 390590  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||  || || ||  | | || ||| | || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  390591 tgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctagaatgatggtatctttagatatgccagagtggaaatgggatagtatatccatgg 390690  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||| |  ||| ||||  |||| ||||| || || || || |||||||||| | | || || ||| ||||||||||    
T  390691 attttgtgacgagtttgctgaatactcctaaaggggatgacgcgatttgggtggttgttgatagattgacgaagttgactcattttattccgattaatat 390790  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
    ||||| |||  |  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||| |||    
T  390791 cagttttcctatttctcagttggctgagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccatcgagcattgtatcagataaagatccaagattt 390890  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  390891 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaga 390986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 89561 - 89807
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  89561 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 89660  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||| ||||||||||||||    
T  89661 gttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctaca 89760  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  89761 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 89807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 90239 - 90485
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  90239 gagaagcacagcaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgag 90338  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||| ||||||||||||||    
T  90339 gttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctaaagtattcatccgggagctaca 90438  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  90439 aaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaa 90485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 683
Target Start/End: Original strand, 90513 - 90714
Alignment:
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  90513 cgatcaatattagttatctagtagctcagttggcagagatttatattcataatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagaga 90612  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||   || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  90613 tccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatggcttgggtgtgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcg 90712  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  90713 ga 90714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 482 - 622
Target Start/End: Original strand, 89835 - 89975
Alignment:
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  89835 cgatcaatattagttatctagtagctcagttggcagagatttatattcataatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagaga 89934  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatg 622  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  89935 tccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatg 89975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13390 - 12996
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||    ||||| ||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  13390 gagaagcacaactagtagatgtgaagtttgttgatttaatggttgctggtaatggcactgaggatagtgagtttaaggtggatgatcagggtgtgttgag 13291  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccggga-gctac 215  Q
     || ||||| |||||||||||||||||  |||| || || || | ||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| |||||    
T  13290 gttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggaagctac 13191  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggt-ggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
     |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||   |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13190 gaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgtgtatgcatgtttgacttgtctgaagtctaa 13091  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttac 409  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13090 ggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttac 12996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 405 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11690 - 11412
Alignment:
Q  405 tttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagta 504  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11690 tttaccttacactcctagagggcatgatgctatatgggttgtggtcgacaggttgacgaagtcggcgcactttatttcgattaatatcagttatccggta 11591  T
Q  505 gctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatttt 604  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | ||| | |||||    
T  11590 gctcagttggcggagatttatattaataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaatttt 11491  T
Q  605 ggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||  || ||||||||||  |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11490 ggaagagcttacaagatgcattggattcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 11412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 502 - 683
Target Start/End: Original strand, 5 - 186
Alignment:
Q  502 gtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagat 601  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  5 gtagctcagttggcggagatttatattaataatattgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctagat 104  T
Q  602 tttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  105 tttggaagagtttacaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 410
Target Start/End: Original strand, 7261 - 7654
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |  ||||| |  | ||| ||||||| ||||||||| |||| || || ||  ||||    
T  7261 gagaagcgcagcaagtggatgtaaagtttgttgatttaatggttgcgggtaatgagacagaggatagtgacttcaaggtttatgatcagggtgttctgag 7360  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||| | ||||||    
T  7361 gttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgagggctaca 7460  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||  ||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  7461 aagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcttgcttgagttgtcagaagtctaagg 7560  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacc 410  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7561 ttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacc 7654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 10086 - 9490
Alignment:
Q  91 aaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagca 190  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || |    
T  10086 aaggtcgatgaccaaggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagta 9987  T
Q  191 acttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgc 290  Q
     |||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    |||||  |   |||||||||| |    
T  9986 gcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattc 9887  T
Q  291 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatg 390  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || || |||    
T  9886 ttgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcaaaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtgccagagtggaaataggatagtatatccatg 9787  T
Q  391 gattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaata 490  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||| |||||  ||| |||||  | || || || || ||||| || || || |||||| |||||||||    
T  9786 gattttgtgacgagttttccgaatactacgaaagggaatgatgtgatttgggtaattgttgatagattaacgaaatcagctcatttcattccgattaata 9687  T
Q  491 tcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtt 590  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||| ||| || |||||||   ||||||||||| | ||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  9686 tcagttttcctgtgtctcagttggaggaaatttacattcgcgatattgtgaagctacatggtgttcattcgagcattgtatcagatagagatccaaggtt 9587  T
Q  591 tacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || || |  || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9586 tacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagtttaggttaagttcggcatatcatccgcagacagattgtcagtcggaaaga 9490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 365
Target Start/End: Original strand, 802 - 1150
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| ||| |||| || | ||  ||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  802 gagaagcacaacaagtggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctaataatgaaacggaagatattgacttcaaagttgatgatcagggtgtgttgag 901  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||||||    
T  902 gttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattctagaagaaagtcacaagagtagctagagtattcacccgggagctaca 1001  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1002 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagg 1101  T
Q  317 ttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccgga 365  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1102 ttgagcatcagaagcttgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 683
Target Start/End: Original strand, 2336 - 2657
Alignment:
Q  360 accggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttg 459  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| || || || |||||     
T  2336 accggagtggaagtgggacggcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatgatgccatttgggtggttgtcgataggtta 2435  T
Q  460 acgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgt 559  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  2436 acgaagtcggcacactttattccaattaatatcaattatccggtagctcag--ggcggagatttatagtcacaatattgtgaagttacatggtgtaccgt 2533  T
Q  560 cgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatca 659  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||   |||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  2534 cgagtattgtatcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagattccttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatca 2633  T
Q  660 tccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2634 tccacagacagatggtcagtcgga 2657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 682
Target Start/End: Original strand, 19198 - 19783
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||    
T  19198 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 19297  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||    || ||  | |||||||||||||| |||||    
T  19298 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacggtttgtgtatgcttgttt 19397  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || ||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |   |||||  | |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19398 gatttgccagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctgatatgttggtatcgttagatgttccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 19497  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||| |  | |||||||| |  ||| || |  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||    
T  19498 gtgacgagtatgacaaatactcctaaagggaataacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagtt 19597  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19598 ttcctgtttctcagttggcggagatctacattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 19697  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
     ||||| |||| ||||||  |||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19698 tagattatggaaaagtttgaaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgg 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 14407 - 14573
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||    
T  14407 gatgatcaaggtgtgctgaggtttcgaggtcggatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttga 14506  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14507 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaa 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 4981 - 4425
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  4981 gatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 4882  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    |||||  |   |||||||||| | |||||    
T  4881 gtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattcctgttt 4782  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| || || ||||||||||  |||  ||| ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  4781 gatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatccatggatttt 4682  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | ||  | || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  4681 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtttatagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagtt 4582  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||  ||| ||||||| ||||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  4581 ttcttgtatctcagttagcggaaatttacattcgagatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttc 4482  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggc 653  Q
     | ||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  |||||||||||    
T  4481 tatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggc 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 12111 - 11555
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  12111 gatgatcaaggagtgttgagattccgagccagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 12012  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    |||||  |   |||||||||| | |||||    
T  12011 gtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattcctgttt 11912  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| || || ||||||||||  |||  ||| ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  11911 gatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcagaaacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaaatagaatagcatatccatggatttt 11812  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | ||  | || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  11811 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtttatagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagtt 11712  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||  ||| ||||||| ||||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  11711 ttcttgtatctcagttagcggaaatttacattcgagatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttc 11612  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggc 653  Q
     | ||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  |||||||||||    
T  11611 tatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggc 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 527
Target Start/End: Original strand, 9923 - 10434
Alignment:
Q  16 agagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttga 115  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||  | |||  |||||||| | || |  ||||||| |||||||||||||| |  || |||||||    
T  9923 agagaagcacagaaggttgatgttaagtttgtggatttgttggttggtagtaatccaactaaagatagtgacttcaaggttgatgatctgggtgtgttga 10022  T
Q  116 gatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctac 215  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||| ||| ||||||||     
T  10023 gattccgaggaagaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatcagggagctaa 10122  T
Q  216 aaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaag 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||  | | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  10123 aaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgacttgtcagaaatctaaa 10222  T
Q  316 gttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaata 415  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10223 gttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagaatggaaatgggatagcatatccatggactttgtaacaagtttaccaaata 10322  T
Q  416 ctccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggc 515  Q
    |  |||| ||||||||| | | |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||   |||||||| |||| ||| || || || |||||    
T  10323 cctcgagagggcatgatgccacatgggtggtggttgatagattgacgaagtcagcacactttattctaattaatattagttttccggtggcacaattggc 10422  T
Q  516 ggagatctacat 527  Q
     ||||| |||||    
T  10423 agagatttacat 10434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 683
Target Start/End: Original strand, 10428 - 10522
Alignment:
Q  589 tttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| || ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10428 tttacatctagattttcgaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgagattgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 10522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 192 - 687
Target Start/End: Original strand, 25010 - 25505
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| |     
T  25010 cttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattca 25109  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | || ||||    
T  25110 tgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgttgggttgttgacaccgttagatgtgccgtagtggaaatgggatagtgtatccatgg 25209  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||  | || |||||  | || || || |||||||||||||| || |||||| | ||||| ||    
T  25210 attttgtcacgagtttgccgaatactccaagagggcatgacgctatttgggtgattgtggatagattgacgaagtcggctcatttcattccaattaacat 25309  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||| ||||| |||||||   | ||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||| |||||    
T  25310 cagttttcttgtatctcagttggcagagatttacattcgtgagattgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagttccatggttt 25409  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaaga 687  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  25410 acttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccggagacagatggtcagtctgaaaga 25505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 141
Target Start/End: Original strand, 24880 - 24947
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcct 141  Q
    ||||| ||||||| || || |||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24880 ctgaggatagtgacttaaaagttgataatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcct 24947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 687
Target Start/End: Original strand, 116084 - 116691
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||    
T  116084 atagtgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgatttcgaggcagaatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagag 116183  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  116184 tcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgcag 116283  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||  |||||  | ||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  116284 tttgtgtattcatgtttgatttctcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgctaggttgatgacacctttagaagtgccagagtggaaatgggata 116383  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||||||||| | || |||||    
T  116384 gtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaatgacgctatttgggtgattgtggagagattgacgaagtcgactcatttcat 116483  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    |   ||||| | || ||  ||  || | |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||| || || |||||||||    
T  116484 tcatattaacaacaatttacctctatcccagttggcggagatttacatccgcgatattgtgaagctacatggtgtttcgtcgagcattgtatcagataga 116583  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  116584 gatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagt 116683  T
Q  680 cggaaaga 687  Q
    || |||||    
T  116684 cgaaaaga 116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4581
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||  |  |||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  4968 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaaccgaagagggtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttg 4869  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  |||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |  || | ||| |||||| ||||||||||||    
T  4868 aggttcagaggaagaatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaagaaagccacagaagtagcttaagtattcatccgggagcta 4769  T
Q  215 caaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 314  Q
     ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    ||| |  ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4768 aaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggttgaaacgtgatattgctcagtttttttatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaa 4669  T
Q  315 ggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  4668 ggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtggtatagcatatccatggattttgtgaca 4581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 509 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4573 - 4399
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  4573 agttggcggagatttatattcataatattgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggaaagagatccgaggttcacttcaaggttttggaa 4474  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4473 gagtttgcaagatgcattgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagagagatggtcagtcgga 4399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16004 - 15401
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||| | ||||| ||    
T  16004 atagtgacttcaaagtcgatgatcagggtgtgttgagatttcgagatataatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagag 15905  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    || ||  | | |    
T  15904 tcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgagacgtggcacag 15805  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  15804 tttgtgtattactgtttgatttgtcagaagtcaaaagttcagcatcagaaacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccatagtggaaatgggata 15705  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||  |||| |||||  | || ||  | |||| ||||||||| || || ||    
T  15704 gcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactacgagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatggattgatgaagtcggctcattttat 15605  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    | ||||||| ||  ||| ||| ||  ||||||| |||||||| || || |   ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  15604 tccgattaacattggttctcctgtgtctcagttcgcggagatttatatccgtgatattgtaaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagataga 15505  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15504 gatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcgacatatcatcctcagacagatggtcagt 15405  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  15404 cgga 15401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 109 - 680
Target Start/End: Original strand, 112696 - 113266
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  112696 gtgttgagattccgaggtagaatttgtattccagacgatgaggagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 112795  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  112796 gagctacgaagatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttaatttgtcagaa 112895  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||     
T  112896 gtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtatctttagatgtgccaga-tggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttg 112994  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| |  ||| ||||  |||| ||||| || || || || |||||||||||||| || ||| || | |||||||| |||| ||| ||  |||    
T  112995 ccgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtggttgttgatagattgacgaagtcggctcatttccttccaattaatattagttttcctgtttctc 113094  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||  || || || ||||   | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||     
T  113095 agttggaagaaatttatattccagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttaattctagattttggaa 113194  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
     ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  113195 gagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtgtcatccgcagacagatggtcagtc 113266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7126 - 6573
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7126 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 7027  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  | || ||||||||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7026 atctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgcttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 6927  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||    
T  6926 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgcctgagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaat 6827  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || || ||||||||||||||  | ||  || |||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6826 gacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggcttattttcttccgattaatattagttttcctgtttctcagttggcggagatctacattc 6727  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
       ||||| ||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || |     
T  6726 gtgatattctgaagttgcatggtgttccttcgaccattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaga 6627  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  6626 ttctaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcaaatagatagtcagtcgga 6573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 841 - 220
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||  |||||||| ||| |||| || |||| |||||| ||||| || ||  |||||||    
T  841 ctagtaatcagactgaggatagtgattttaaaatcgatgatcaagctgtgttgaggtttcgaggtaggatttctattccagacgacgatgagatgaagaa 742  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  741 aatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattg 642  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||  | |||||  | |  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||  || ||    | || ||||| |    
T  641 aaacacgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacccgctggtatgatggtgtctttagatgtgc 542  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | ||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||    
T  541 cagagtggaaatgggatagtatacccatgaattttgtgacgagtttgcctaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgac 442  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||  ||  |||||||||||||  ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||    |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  441 gaagtcggctcattttcttctgattaatatcagtcttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtggtattgtgaagttgcatggtgttccttcg 342  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||    
T  341 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagagcctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatc 242  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  241 cgcagacagatggtcagtcgga 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 679
Target Start/End: Original strand, 3667 - 4232
Alignment:
Q  111 gttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccggga 210  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| ||||    
T  3667 gttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctggga 3766  T
Q  211 gctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagt 310  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | |  ||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  3767 gctacgaaaatgtatcatgatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagt 3866  T
Q  311 ctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacc 410  Q
    | || |||||||||||||  ||||  ||  || ||  | | || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  3867 cgaaagttgagcatcagaaacctgttgggatgatggtatctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgcc 3966  T
Q  411 taatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcag 510  Q
     |||||||| |  ||| ||||  |||| ||| |||| |   | || ||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||||| ||| ||  || ||    
T  3967 gaatactcctaaagggaatgacacgatttggattgttg---atagattgacgaagtcagcttagtttattccgattaatatcagttttcccgtgtcttag 4063  T
Q  511 ttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaa 610  Q
    ||||||||||| |||||||   | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||  |    
T  4064 ttggcggagatttacattcgcgaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttatagattttggaaga 4163  T
Q  611 gtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    |||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  4164 gtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcacacagatggtcagt 4232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 59882 - 59287
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |    ||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  59882 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaatagaatttgtattcctgatgatacagaaatgaagaagatgattatggaagaaag 59783  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||  | |      
T  59782 tcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtccgggttgaagcgacatgtggcacaa 59683  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||  || | ||| || ||||  ||| | || ||||||||||| || ||| | |  |||||||| |||||||    
T  59682 tttgggtatgcgtgtttaatttgtcagaagttaaaagatgaacaccagaaacctactgggttgttgacacctttagatattcgagagtggaagtgggata 59583  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||| | ||| || |||||||| |  || |||||| |||| |||||  | || || ||  | |||||||||||  | ||  |    
T  59582 gtatatccatggattttgtgacgattttgccaaatactccaaaaggacatgatgcgatttgggtaattgtggatagactaacgaagtcggctaatttttt 59483  T
Q  480 tt-cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    || |||||| |||||  | ||| ||| || ||||||| || || || ||||   | ||||| ||  |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  59482 ttccgattattatcatctttcctgtatcttagttggcagaaatttatattcgtgagattgtaaaactatatggtgttccgtcaagtattgtatcagatag 59383  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||| || || | ||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  59382 agatccaagatttacttctagattttgggagagtttgcaggaggcgttgggttctaagttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatgg 59287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 130849 - 130672
Alignment:
Q  506 ctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  130849 ctcagttggcggagatctacattcgtgatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttg 130750  T
Q  606 gagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  130749 gaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcgga 130672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 484 - 683
Target Start/End: Original strand, 28963 - 29161
Alignment:
Q  484 attaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacc 583  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| |    
T  28963 attaatatcagttttcctgttgcccagttagcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatc 29062  T
Q  584 caaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29063 caagattt-cttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 29161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 131184 - 130986
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  131184 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatg 131085  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||||    || ||  |   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||    
T  131084 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcaaagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgatggttaagcatcaga 130986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 419
Target Start/End: Original strand, 28601 - 28890
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  28601 atttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 28700  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |    |||||| | || | || |||||  |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||     
T  28701 atccaaagaagattttatagttgtctgtattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 28800  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
     || || ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  28801 acccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 28890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1197
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | || || ||||| |||||||||    
T  1865 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgacgatcaaggtgtgttgaga 1766  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||||   || |  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  1765 tttagaggaaggatttgtattctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacga 1666  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||  | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||    
T  1665 agatgcaccatgatttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagcgtgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagt 1566  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||  |   || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  1565 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatatttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgactttgccgaatact 1466  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || |  ||| ||||| |||| |||||  | || || || ||||| |||||||| || ||  || |||||| |||||||| | | ||  |||||||||| |    
T  1465 cctaaagggaatgatgcgatttgggtgattgttgatagattgacaaagtcggctcattttcttccgattagtatcagtttttctgtgtctcagttggcag 1366  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||   | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  1365 agatatatattcgtcaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 1266  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaag 686  Q
     || |  || ||||| || |||| |||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  1265 ggaggctttaggttctaagttgagattgagtttggcgtatcatcctcagacatatggtcagtccgaaag 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 283 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12418 - 12081
Alignment:
Q  283 gtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagca 382  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12418 gtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtaccagagtggaaatgggatagca 12319  T
Q  383 tttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttc 482  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || |||||| |||  ||| ||||  |||| |||||  | |||||  | |||||||||||||| || ||||||||    
T  12318 tatccatggattttgtgacgagtttgccgaatacttcgaaagggaatgacgcgatttgggtgattgtagatggattgacgaagtcggctcatttcatttc 12219  T
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
    || ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  12218 gagtaatatcagttttcctgtacctcagttggtggagatttacattcccgatattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagat 12119  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  12118 ccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaaga 12081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 683
Target Start/End: Original strand, 9782 - 9865
Alignment:
Q  600 attttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9782 attttggaagagtttacaagatgcattgggttcaaaattaaggttgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcgga 9865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19747 - 19126
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  19747 ctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaa 19648  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | | | |||||| | |||| |||||| || |||||||||||  |||||||  | || ||||||||| | |||    
T  19647 aatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattg 19548  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||     |||| || | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| |    
T  19547 aaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatccttagatgtgc 19448  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||    
T  19447 cagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgac 19348  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19347 gaagtcggctcattttctgccgattaatatcagttttcctgttgcccagttggcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcg 19248  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  19247 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatc 19148  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  19147 cgcagacagatggtcagtcgga 19126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 35171 - 34613
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  35171 ctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaa 35072  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| |||||||  || | | | |||||| | |||| |||||| || |||||||||||  |||||||  | || ||||||||| | |||    
T  35071 aatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaatattctggtggtctagattg 34972  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||     |||| || | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| |    
T  34971 aaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatccttagatgtgc 34872  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||    
T  34871 cagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgac 34772  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34771 gaagtcggctcattttctgccgattaatatcagttttcctgttgcccagttggcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcg 34672  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  34671 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaaga 34613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50218 - 50017
Alignment:
Q  482 cgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagaga 581  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||||||    
T  50218 cgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttatattcttgatattgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagaga 50119  T
Q  582 cccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
     ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50118 tccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcg 50019  T
Q  682 ga 683  Q
    ||    
T  50018 ga 50017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 50621 - 50238
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| ||| || ||  | ||||||||||||||  ||||  | |||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||     
T  50621 agaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttactagtaatcagactgaagacagtgattttaaaattgatgatcaaggtgtattgagg 50522  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  50521 tttcgaggtagaatttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga 50422  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||    |||||  | | ||||| |||| | ||||||| ||| |||||||| || ||    
T  50421 agatgtaccatgatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgcgtattcttgtttgatttgccagaagtcgaaagt 50322  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  50321 tgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 50238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8049 - 7463
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |  ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||    
T  8049 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 7950  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| | ||||||||||| || || |||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||    
T  7949 gtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 7850  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  7849 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 7750  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |   ||||||||| ||||    
T  7749 gtgacgagttttccaaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctacagattaatattagtt 7650  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || || ||||| ||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7649 tccctgttgcccaattggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttc 7550  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7549 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 7463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 7890
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||| | ||||| ||||| | ||| | |||||    
T  8476 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 8377  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||| |    
T  8376 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtct 8277  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||    
T  8276 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 8177  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||| ||||| || ||  |  |||||||||| ||||    
T  8176 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttattgttgatagattgacgaaatcggctcattttctaccgattaatattagtt 8077  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
      || || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  8076 tccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagaggtccaagatttacttc 7977  T
Q  597 aagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  7976 tagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcaggcgga 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 607
Target Start/End: Original strand, 8283 - 8793
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| | |||||  ||   ||| |    
T  8283 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaa 8382  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | ||| |||||| | |||||    
T  8383 gtatccatccgggagctacgcagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcatgttt 8482  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  | | || |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  8483 gatttgttagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgcgggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttt 8582  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagtt 496  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| | |||  | || || || |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  8583 gtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaatgacgcgattttggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttattccgattaatatcagtt 8682  T
Q  497 atccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
     ||| ||  |||||||||  ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  8683 ttcctgtttctcagttggtagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtattagatagagatccaagatttacttc 8782  T
Q  597 aagattttgga 607  Q
     ||||||||||    
T  8783 tagattttgga 8793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17856 - 17467
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    ||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  ||| |||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17856 ttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattctgaggcagaat 17757  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  17756 ttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 17657  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggc 331  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||  |    
T  17656 ctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcagaaac 17557  T
Q  332 ctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  17556 ctgcagggttgatgacacctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaacactccga 17467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2478 - 1991
Alignment:
Q  196 agtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtt 295  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  | |||||||||||||| || ||   ||||||  | | |||||||||| | ||||    
T  2478 agtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagtttgtgtattcttgtt 2379  T
Q  296 tgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattt 395  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2378 tgatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagaagtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattt 2279  T
Q  396 tgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagt 495  Q
    ||| || |||||  | |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||| | || ||  || || |||||||||||    
T  2278 tgtaacgagtttgtcgaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttcttccgcttaatatcagt 2179  T
Q  496 tatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttactt 595  Q
    | ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  2178 tttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatcgtgttccgtcgagcattgtatcagatagagacccaagatttactt 2079  T
Q  596 caagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2078 ctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcgga 1991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 220 - 683
Target Start/End: Original strand, 15742 - 16198
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||       ||    
T  15742 atgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagt-------tg 15834  T
Q  320 agcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    |||||||||  |||||||   || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15835 agcatcagaaacctgcagcgatgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcc 15934  T
Q  420 gagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggag 519  Q
     |  ||  ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||| |||  |  || ||||||||||     
T  15935 taaaggaaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttattccgattaatatcagttttcctatgtctaagttggcggaa 16034  T
Q  520 atctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaag 619  Q
    || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||     
T  16035 atttacattcgcgatattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaat 16134  T
Q  620 atgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |  || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16135 aggctttaggttctaagttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacaaatggtcagtcgga 16198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 149
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15730
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    ||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  || ||||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15613 ttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgagattccgaggcagaat 15712  T
Q  132 ttgtattcctgacgatga 149  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  15713 ttgtatccctggcgatga 15730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 370 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 49609 - 49437
Alignment:
Q  370 aaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcgg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49609 aaatgggatagcatttctatggattttgtggcgagtttaccaaacactccgagagggcatgattctatatgggttgtggtcgacaagttgacgaagtcgg 49510  T
Q  470 cgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaa 542  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  49509 cgcacttcattccgattaatatcagttaaccggtagctcagttggcggagatttatattcataacattgtgaa 49437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 16781 - 16179
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |  || ||||||  ||||| | ||||| ||    
T  16781 atagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtcttgaggtttcgaggtagaatttgcattccagacgatgtgagat-gaagaaaatgattcttgaagagag 16683  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    |||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||    |||||  | | |    
T  16682 tcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacag 16583  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  16582 tttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgcgata 16483  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |    
T  16482 gtatatccatcgattttgtgacgagttttccaaatactcctaatgggaatgatgcaatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttct 16383  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    |  |||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||| |||||    
T  16382 tctgattaatatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagaattgcatcatataga 16283  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    || ||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16282 gatccaagatatacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatcctcagacagatggtcagt 16183  T
Q  680 cgga 683  Q
    ||||    
T  16182 cgga 16179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34274 - 34015
Alignment:
Q  121 agaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaa 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || ||  | || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |    
T  34274 agaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaaga 34175  T
Q  221 tgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttga 320  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||   |||||  |||  ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34174 tgtatcacgatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttttttatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttga 34075  T
Q  321 gcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatag 380  Q
     |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34074 acatcagaatcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatag 34015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3451 - 2914
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |    
T  3451 atttgtattccagacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 3352  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  | ||||||||||| ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||     
T  3351 atctaaagaagttgttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaattgaaggttgagcatcagaa 3252  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||    
T  3251 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctaaagggaat 3152  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||  |||| |||||  | || || || |||||||| ||||| || ||  || |||||||||| | || ||  ||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  3151 gacacgatttgggtgattgttgatagattgacgaattcggctcattttcttccgattaatattaattttcttgtttctcaattggcagagatttatattc 3052  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  || ||    
T  3051 gagatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagg 2952  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcaga 667  Q
    ||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  2951 ttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaga 2914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 7199 - 6538
Alignment:
Q  22 gcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagattta 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| |||| |||||| ||||  || ||||||| || || ||||| |  || |||||||||||      
T  7199 gcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagcaatcaaactgaagatggtgattttaaagtcgatgaccttggtgtgttgagattcc 7100  T
Q  122 gaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaat 221  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  7099 gaggtcgaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagat 7000  T
Q  222 gtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgag 321  Q
    |||||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||    || ||  | | |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  6999 gtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcataagtcgaaggttgaa 6900  T
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||  | | |||||| |    
T  6899 catcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgattactccta 6800  T
Q  422 gggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
      ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| || ||    
T  6799 tagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagtttccctgttgcccagttggcagatat 6700  T
Q  522 ctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagat 621  Q
     ||  || || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||     
T  6699 ttatttttaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagaatttggaagagtttgcaagag 6600  T
Q  622 gtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  6599 gctttgggttctaagttgagattgtgttcggcgtatcatccgtagacagatggttagtcgga 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 519
Target Start/End: Original strand, 17094 - 17595
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  ||| ||| |||||||||||||| || |  |||||| ||    
T  17094 agaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtaatcagactgaagataatgacttcaaggttgatgatcaggaggtgttgcga 17193  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||| ||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17194 ttctgaggcagaatttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacga 17293  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||    
T  17294 agatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagt 17393  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    ||||||||| |  ||||  || ||| ||  | | || ||||| || |||||||||||  |||| || || ||| |||||||||| |||||    ||||||    
T  17394 tgagcatcaaaaacctgttgggttgatgctatctttagatgtgccagagtggaaatgcaatagtatatccatgaattttgtgacgagtttgttgaatact 17493  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || |  ||| ||||    || |||||  | ||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  17494 ccaaaagggaatgacgatatttgggtgattgtagatagattgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatcttagttggcgg 17593  T
Q  518 ag 519  Q
    ||    
T  17594 ag 17595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 685
Target Start/End: Original strand, 3613 - 4189
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| ||    
T  3613 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgg 3712  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    | ||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  3713 gtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaa 3812  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  || || ||   | ||  | | || ||||| || ||  ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  3813 gtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtaagatggtatctttagatgtgccagaacggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 3912  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| |  ||| ||||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  3913 ccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 4012  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  4013 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 4112  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4113 aagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaa 4189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 9694 - 9118
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||| ||    
T  9694 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgg 9595  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    | ||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  9594 gtgctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaa 9495  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  || || ||   | ||  | | || ||||| || ||  ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  9494 gtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtaagatggtatctttagatgtgccagaacggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 9395  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| |  ||| ||||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |    
T  9394 ccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgccc 9295  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  9294 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 9195  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9194 aagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaa 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 685
Target Start/End: Original strand, 32781 - 33357
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | || || |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  32781 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 32880  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  ||||||||     
T  32881 gagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagag 32980  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  || || ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  32981 gtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 33080  T
Q  409 cctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctc 508  Q
    || |||||||| |  ||| ||||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||  || || |    
T  33081 ccgaatactcctacagggaatgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcttgttgccc 33180  T
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| || ||  || | |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  33181 agttggcagagatttatatcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 33280  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcggaaa 685  Q
    |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33281 aagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagccggaaa 33357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Original strand, 63233 - 63813
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||||||||||     
T  63233 caaggtgtgttgagattacgaggtcgaatttgaattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattc 63332  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | |||| |  |||    
T  63333 acccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcgcagtttgtgtattcctgttaggtttg 63432  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||     
T  63433 tcagaagtcgaagattgaacataagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatgcatggattttgtgacg 63532  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| ||||  |||| |||||  | || || || ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||| |    
T  63533 agtttgccgaatactcctagagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgacgtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcctg 63632  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  63633 ttgctcagttggcagagatttatataaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattatatcagaaaaagatccaagatttacttctagatt 63732  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||  ||||| ||||| |   ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  63733 ttggaagagtttgcaagaggctctgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 63813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 674
Target Start/End: Original strand, 4771 - 5364
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |     ||||||||||||||||  ||   ||| |||| ||| ||||| | ||||||||    
T  4771 atagtgattttaaagttgatgatcaaggagtgttgcggtttcggaattgaatttgtattcctgataatacagaaatgaaaaagatgattctggaagaaag 4870  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| |  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||   |||||  | |      
T  4871 tcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagcgagatgttgcacaa 4970  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggata 379  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |   || | || ||||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||    
T  4971 tttgtgtatgcatgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgaacatcacaaaacttctgggttgttgacacctttagatattccagagtggaagtgggata 5070  T
Q  380 gcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcat 479  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  || || |||||| |||| |||||  |  | || ||  ||||||| ||||| || || ||    
T  5071 gtatatc-atggattttgtgacgagtttgccgaatactcaaagaggacatgatgcgatttgggtaattatggatagactgacgaattcggctcattttat 5169  T
Q  480 ttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagataga 579  Q
    |  |||||| || |||| ||  ||| ||||| |||||||||| || |||    | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  5170 tctgattaacattagttttcttgtatctcaggtggcggagatttatatttgtgagattgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagataga 5269  T
Q  580 gacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||   |||| || || | ||||||||| ||  |||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  5270 gatccaagatttacttctagattttggaagggtttgcaggaggcgttgggttctaagctgagtttgagttcgacgtatcatccgcagaccgatgg 5364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 312
Target Start/End: Original strand, 2509 - 2741
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2509 atagtgacttcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttggaagaaag 2608  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcgg 279  Q
    ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||   |||||  |||      
T  2609 tcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaa 2708  T
Q  280 tttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtct 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2709 tttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtct 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10093 - 9867
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||||| | || ||  || ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||  ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  10093 ttgacgaagtcgactcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctgagttgggagagatttatattcgtgatattgtgaagttgcatggtgttc 9994  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  ||  |||| || ||||  |||||||| || ||    
T  9993 cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttacgttctaagttgaggttgagttcagcgta 9894  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||    
T  9893 tcatccgcaaacagatgatcagtcgga 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 620
Target Start/End: Original strand, 39354 - 39730
Alignment:
Q  244 ttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgt 343  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||  | |||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||  ||     
T  39354 ttttggtggtctggattgaaacacgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatga 39453  T
Q  344 tgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggt 443  Q
    ||    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||    
T  39454 tggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggt 39553  T
Q  444 tgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaag 543  Q
      | || || || |||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||    
T  39554 gattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctttcgattagtatcagttttcctgtttctcagttggcagagatttacattcgtgatattgtgaag 39653  T
Q  544 ttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaaga 620  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39654 ttgcatggtgttccatcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 39730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 208 - 683
Target Start/End: Original strand, 1 - 476
Alignment:
Q  208 ggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaga 307  Q
    |||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  1 ggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcaga 100  T
Q  308 agtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttt 407  Q
    | || ||||||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  101 aatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttt 200  T
Q  408 acctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagct 507  Q
     || |||||||| |  ||| ||||  |||| |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||| |||  |  ||    
T  201 gccaaatactcctaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcggctcattttcttccgattaatattagttttcctatttct 300  T
Q  508 cagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||| ||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  301 cagttggcggagatctacattcgtgatattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtgtgtgatagagatccaagatttacttctagattttgga 400  T
Q  608 gaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     |||||| ||||| |  || ||||| ||  |||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  401 aaagtttgcaagaggctttaggttctaagctgaggttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 543
Target Start/End: Original strand, 7019 - 7533
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||| ||||  ||||  ||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  7019 aagttgatgttaagtttgtggacttgttggttgctagtgatcagactgaagataatgactttaaggtcgatgatcagggagtgttgcgtttttgaggtag 7118  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  || | |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  7119 aatttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 7218  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  | |||||| |||||||||||||| | |||||    |||||  |   |||||| ||| | ||||||  |||||||||||| || || ||||||||||    
T  7219 gatctaaagaagatgttttggtggtctcggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtatattcatgtttggtttgtcagaagtcaaaagtggagcatcaga 7318  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||||  || ||| ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| |    
T  7319 aacctgttgggttgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcccaaagggaa 7418  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | || |||||  | || || ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  7419 tgacgctatttgggtgattgttgataggttgacgaagtcgactcatttcattccgattaatatcagttttcccgtgtctcagttggcggagatttacatt 7518  T
Q  529 cagaatattgtgaag 543  Q
    |   |||||||||||    
T  7519 cgcgatattgtgaag 7533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 687
Target Start/End: Original strand, 12647 - 12763
Alignment:
Q  571 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacgg 670  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  || ||||| || |||||||||||||  |    
T  12647 tcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgatgttcagttcagcgtatcatccgcagatag 12746  T
Q  671 atggtcagtcggaaaga 687  Q
    |||||||||||||||||    
T  12747 atggtcagtcggaaaga 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 543
Target Start/End: Original strand, 11325 - 11839
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||   ||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  11325 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 11424  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11425 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 11524  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |   ||||  | |  ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11525 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 11624  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      |||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| |    
T  11625 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaa 11724  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | ||  ||||  | ||  | |  |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||     
T  11725 tgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagtgggcggagatttacatc 11824  T
Q  529 cagaatattgtgaag 543  Q
    |   |||||||||||    
T  11825 cgcgatattgtgaag 11839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 543
Target Start/End: Original strand, 17517 - 18031
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||   ||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  17517 aagtagatgttaagtttgtggatttgttggttgctagtaatccgactgaagatagtgacttcaaagtcgatgatcaaggagtgttgagattctgaggtag 17616  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||| | |  |||| ||||| |  || | |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17617 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 17716  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |   ||||  | |  ||||||||| | ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17717 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 17816  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      |||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||| |    
T  17817 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaaaagggaa 17916  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  | ||  ||||  | ||  | |  |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||     
T  17917 tgacactattggggtgattgttcatatattgacgaactcggctcatttcattccgattaatatcagttttcctatatctcagtgggcggagatttacatc 18016  T
Q  529 cagaatattgtgaag 543  Q
    |   |||||||||||    
T  18017 cgcgatattgtgaag 18031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 2601 - 2841
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| || ||| || ||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||    
T  2601 gagaagcacagcaactggatgtcaagtttgttgatttgatggttgctggtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttgatgatgagggtgtgttgag 2700  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctaca 216  Q
     ||  |||  |||||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  2701 gttcggagaaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctaca 2800  T
Q  217 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2801 aaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgg 2841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8501 - 7921
Alignment:
Q  103 caaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattg 202  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||| |||  ||  | | |||| ||||| | ||||| |||||||  || ||||||||||||     
T  8501 caaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattc 8402  T
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||| || |   ||||  | | |||||||||| | |||||   |||    
T  8401 atccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttcaaaagaaatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttg 8302  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgaca 402  Q
    ||||||||| || || ||||||||||  | |||   | || ||  ||| || ||||| || |  |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8301 tcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacatgctaaaatgatggtacctttagatgtgccagtatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgaca 8202  T
Q  403 agtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccag 502  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||||| || || ||||||| ||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||  |    
T  8201 agttttccgaatactcctagagggaacgacgcaatttgggttgttgttgataggttgatgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcttg 8102  T
Q  503 tagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatt 602  Q
    | || | ||| || ||||| || ||  || | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  8101 ttgccctgttagcagagatttatatcaaggagattgtgaagttgtatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatt 8002  T
Q  603 ttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  8001 ttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcgga 7921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 604
Target Start/End: Original strand, 85745 - 86213
Alignment:
Q  127 agaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85745 agaatttgtattcctgatgatacagaaatgaaaaagatgattttggaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatc 85844  T
Q  227 atgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 326  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||   |||||  | |  |||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||    
T  85845 atgatttgaagaagtt-atttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgcatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatca 85943  T
Q  327 gaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgaggggg 426  Q
    ||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||  || || |||||||||||||| ||||  || |||||||| |  ||     
T  85944 gaaacctgctgggttgttgacacctttagatgttccaaagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttgtccgaatactccaaaagga 86043  T
Q  427 catgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctaca 526  Q
    ||| || |||| |||||  | || || ||  ||| ||||||||| || || ||| | ||||| |||| || |||  || |||||||||||||||| || |    
T  86044 cataatgcgatttgggtaattgtggatagactgatgaagtcggcccattttattccaattaacatcaattttcctctatctcagttggcggagatttata 86143  T
Q  527 ttcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagatttt 604  Q
    |||        ||||  || ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  86144 ttc--------gtgagattacatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagacccaagatttacttctagatttt 86213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1548 - 1144
Alignment:
Q  279 gtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggat 378  Q
    |||||||||| | |||||   |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  1548 gtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggat 1449  T
Q  379 agcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttca 478  Q
    || || || |||||||||||||||||||| || |||||| | || ||| | ||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||      
T  1448 agtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatacttctagagggaacgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttc 1349  T
Q  479 tttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatag 578  Q
    |  |||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||| || ||  || | || |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1348 taccgattaatattagtttccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatag 1249  T
Q  579 agacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcag 678  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || ||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1248 agatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgaggttgaattcggcgtatcatccgcagacagatggtcag 1149  T
Q  679 tcgga 683  Q
    |||||    
T  1148 tcgga 1144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 355 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 15212 - 14884
Alignment:
Q  355 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagaca 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || ||| |  | || || |    
T  15212 gatgtaccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaacgatgcaatttggctaatcgttgata 15113  T
Q  455 ggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggt 554  Q
    | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || ||  ||||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| ||||||||    
T  15112 gattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcctagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggggt 15013  T
Q  555 tccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggct 654  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  || |||| |||||||||||||    
T  15012 tccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggtttgaagttgagattgagttcggct 14913  T
Q  655 tatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14912 tatcatccgcagacagatggtcagtcgga 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 683
Target Start/End: Original strand, 7543 - 8110
Alignment:
Q  113 tgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagc 212  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| || ||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  7543 tgaggtttcgaggtaggatttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagc 7642  T
Q  213 tacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtct 312  Q
    ||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||    || ||  | | |||||||||| | ||||||| |||| |||||||     
T  7643 tacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgttagaagtcg 7742  T
Q  313 aaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccta 412  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |    
T  7743 aaggttgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgccaaaatggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccga 7842  T
Q  413 atactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagtt 512  Q
    ||||||| |  ||| | ||  |||| |||||  | || || || |||||||||||| | || ||  ||  ||||||||| |||| ||| ||   ||||||    
T  7843 atactcctaaagggaaagacgcgatttgggtgattgttgatagattgacgaagtcgactcattttcttctgattaatattagttttcctgtt--tcagtt 7940  T
Q  513 ggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagt 612  Q
    ||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||     
T  7941 ggcagagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaag- 8039  T
Q  613 ttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||  |||   |||||||||||||    
T  8040 ttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccaaagaaaaatggtcagtcgga 8110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 102366 - 102112
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttaga 173  Q
    |||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | ||    
T  102366 ctgaaaatagtgattttaaaatcgatgaccaaggtgtgttgagattccgaggtagaatttgtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttga 102267  T
Q  174 agaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtc 273  Q
    ||| |||||||  || | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||     
T  102266 agagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtg 102167  T
Q  274 actcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
     | | |||||||||| | | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  102166 tcacagtttgtgtattcctatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 102112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 683
Target Start/End: Original strand, 3043 - 3596
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  3043 atttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatg 3142  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagag 329  Q
    |  |||||||  | || ||||||||||| | |||    |||||  | | |||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||  ||| | |||||     
T  3143 atctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtgttcttgtttggtttgtcagaagtcgaagactgaacgtcagaa 3242  T
Q  330 gcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcat 429  Q
     || || ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| ||    
T  3243 acccgctggtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaat 3342  T
Q  430 gattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattc 529  Q
    ||   ||| |||||  | || || || ||||| |||||||| || ||  |  ||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| ||||| || |||     
T  3343 gacgggatttgggtgattgttgatagattgacaaagtcggctcattttctaccgattaatatcagttttcttgttacccagttggcagagatatatatta 3442  T
Q  530 agaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttggg 629  Q
    || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  3443 aggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacataaagattttggaaaagtttacaagaggctttggg 3542  T
Q  630 ttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3543 ttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcgga 3596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 401
Target Start/End: Original strand, 1184 - 1567
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  1184 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagactttttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaga 1283  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||| || ||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  1284 ttccgaggtagaatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacga 1383  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||    
T  1384 agatatatcatgatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagt 1483  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  1484 tgagcatcagaaacctgcgggaatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggataatatatccatggattttgtgac 1567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 683
Target Start/End: Original strand, 38981 - 39601
Alignment:
Q  62 ctagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaa 161  Q
    ||||||||||  ||||  || |||| || ||| ||||||| || || |||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  38981 ctagtaatcagactgaagatggtgactttaagcttgatgaccatggtgtgttgagattccgagatcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaa 39080  T
Q  162 gttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttg 261  Q
      ||||| | ||||| | |||||  || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  |||||||  | || ||||||||||| |||    
T  39081 aatgattcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcatgatctgaagaaaattttatggtggtctggattg 39180  T
Q  262 aagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtac 361  Q
    ||    |||||  | |  ||||||||| | |||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||  || || || ||| ||  | | || ||||| |    
T  39181 aaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacccgctggtttgatggtatccttagatgtgc 39280  T
Q  362 cggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgac 461  Q
    | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | || || || |||||    
T  39281 cagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgctgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgatagattgac 39380  T
Q  462 gaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcg 561  Q
    ||||||||| || ||  |  | ||||||||||||| |||  | || ||||| |  ||||| || ||| || | ||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  39381 gaagtcggctcattttctaccaattaatatcagttttcctattgcccagttagtagagatttatattaaggagattgcaaagttgcatggtgttccttcg 39480  T
Q  562 agtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatc 661  Q
    || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||| |  |||||||| || || | |||||||||||| |||||||    
T  39481 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttcgaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttaagattgagttcggcgtatcatc 39580  T
Q  662 cgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | ||||| ||| ||||||||||    
T  39581 cacagacagat-gtcagtcgga 39601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 66518 - 65933
Alignment:
Q  94 gttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaact 193  Q
    |||||||| || || |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | ||    
T  66518 gttgatgatcacggtgtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagct 66419  T
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtg 293  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||  | ||    
T  66418 tgagtatccatctgggagctacgaaaatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtactcctg 66319  T
Q  294 tttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggat 393  Q
    |||   |||||||||||| ||| |||||||||| |  | ||| ||  || ||  | | || ||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||    
T  66318 tttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcaaaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccataatggaaatgggatagtatatccatggat 66219  T
Q  394 tttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatca 493  Q
    |||||||| || || || |||||||| |  |||   ||| | || |||||  | || || || |||||||||||||| || ||  |  |||||||||  |    
T  66218 tttgtgacgagcttgccgaatactcctaaagggagcgatgcaatttgggtaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaataata 66119  T
Q  494 gttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttac 593  Q
    ||| ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | || |||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  66118 gttttcctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagggatccaagatttac 66019  T
Q  594 ttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagt 679  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  66018 ttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagt 65933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 22919 - 22391
Alignment:
Q  155 tgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtc 254  Q
    |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||  | |||||||||||    
T  22919 tgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtc 22820  T
Q  255 tggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttg 354  Q
    |||||||||    |||||  | | |||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | |  |     
T  22819 tggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctcta 22720  T
Q  355 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagaca 454  Q
    |||||  | || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||  | || |||||  | || || |    
T  22719 gatgtgtctgaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggggacgacgcaatttgggtaatcgttgata 22620  T
Q  455 ggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggt 554  Q
    | ||||||||||| ||  | ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||| ||| ||||| ||    
T  22619 gattgacgaagtctgcttattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaggttacatggtgt 22520  T
Q  555 tccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggct 654  Q
    | | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22519 ttcttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcgaagttgaaattgagttcggct 22420  T
Q  655 tatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22419 tatcatccgcagacagatggtcagtcgga 22391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 355 - 683
Target Start/End: Original strand, 277 - 605
Alignment:
Q  355 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagaca 454  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || | | ||||  |||| |||||  | || || |    
T  277 gatgtgccagagtggaaatgggacagtatatccatggagtttgtgacgagtttgccgaatactcctagagagaatgacgcgatttgggtgatagttgata 376  T
Q  455 ggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggt 554  Q
    | |||| ||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  377 gattgatgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgt 476  T
Q  555 tccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggct 654  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||     
T  477 tccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgaaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcg 576  T
Q  655 tatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  577 tatcatcagcagacagatggtcagtcgga 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 31 - 185
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||    
T  31 gtgttgagattccgaggtcgaatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgg 130  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    ||||||| || |||| ||||||  |||||||  | || | |||||||||||||||    
T  131 gagctacgaagatgtttcatgatctgaagaaaattttctagtggtctggtttgaa 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 157 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1464 - 938
Alignment:
Q  157 aagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctg 256  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | || ||||||||||    
T  1464 aagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctg 1365  T
Q  257 gtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttgga 356  Q
    |||||||    |||||  |   |||| ||||| | |||||   |||||||||||| || || | ||||||||  || || ||  || ||  ||| || ||    
T  1364 gtttgaaacgagatgtggcatagtttatgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttaga 1265  T
Q  357 tgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacagg 456  Q
    ||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||   ||  | || |||||  | || || |||    
T  1264 tgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagatggagcgacacaatttgggtgattgttgatagg 1165  T
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    ||||||||||| || || ||  |  | |||||||| ||||  || || || |||||||| ||||| || ||  ||   ||||||||||||||||| ||||    
T  1164 ttgacgaagtcagctcattttctacctattaatattagtttccctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggggattgtgaagttgcatggtgttc 1065  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| ||    
T  1064 cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcgta 965  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  964 tcatccacagacagatgatcagtcgga 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 683
Target Start/End: Original strand, 79615 - 80276
Alignment:
Q  22 gcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagattta 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| | ||  ||||||||||  ||||  |  |||| || ||||| ||||| || || |||||||||||      
T  79615 gcacaaaaagttgatgtcaagtttgtagacttattggtagctagtaatcagactgaagaaggtgaatttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagattac 79714  T
Q  122 gaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaat 221  Q
    |||    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  79715 gagatcaaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagat 79814  T
Q  222 gtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgag 321  Q
    |||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | ||||||||||  ||||||   |||||| ||||| ||| | ||     
T  79815 gtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgtatttgtgtttattttgtcataagtcgaagatcgaa 79914  T
Q  322 catcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccga 421  Q
    |||||||  ||||| ||  || ||  | |||| ||||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||  | |||||||| |    
T  79915 catcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccacggattttgtgacgagtttgtcgaatactccta 80014  T
Q  422 gggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagat 521  Q
    | ||| ||||  | || |||||| | |   | || |||| ||||||||| || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||    
T  80015 gagggaatgacgcaatttgggttattgataatagattgatgaagtcggctcattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagat 80114  T
Q  522 ctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagat 621  Q
     || ||| |  | ||||||||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||  ||||     
T  80115 ttatattaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttagagcattgtatcagatagagatccaagatttacttaaagattttggaagagtttgaaagag 80214  T
Q  622 gtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  80215 gctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcggacagatggtcattcgga 80276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 483 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13011
Alignment:
Q  483 gattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagac 582  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||  || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  13211 gattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatcaaggagattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagat 13112  T
Q  583 ccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgg 682  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13111 ccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgg 13012  T
Q  683 a 683  Q
    |    
T  13011 a 13011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13566 - 13256
Alignment:
Q  109 gtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgg 208  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| ||||||    
T  13566 gtgttgagattccgaggtcggatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgg 13467  T
Q  209 gagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaa 308  Q
    ||||||| || |||||||| || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||||| | |||||   |||||||||    
T  13466 gagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaa 13367  T
Q  309 gtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagttta 408  Q
    ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||     
T  13366 gtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttg 13267  T
Q  409 cctaatactcc 419  Q
    || ||||||||    
T  13266 ccgaatactcc 13256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 25989 - 25498
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| |     
T  25989 cttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagatgattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcc 25890  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    | |||   |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||  |  || ||  | |||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||    
T  25889 tatttagtttgtcacaagtcgaagattgaacatcagaaacctgcttgtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgg 25790  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||   | ||| ||||  | || |||||| | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||    
T  25789 attttgtgacgagtttgccgaatactcatggagggaatgacacaatttgggttattgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatat 25690  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     |||| ||| || || ||||||||  |||| || ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| |||    
T  25689 tagttttcctgttgcccagttggcaaagatttatattaaagagattgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagattt 25590  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25589 acttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcgga 25498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 2458 - 1791
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| |||| | ||  | ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||     
T  2458 agaagcgcaaaaagttgatgttaagtttgtgtacttgttggttgctagtaatcagactgaagatagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgagg 2359  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcata---aga-gcaacttgagtattgatccgggagct 213  Q
    ||| |||| || |||||| |||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||| | |||||||   ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  2358 tttcgaggtaggatttgtcttccagacgatgacgagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatatatagaagtaacttgagtattcatccgggagct 2259  T
Q  214 acaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtcta 313  Q
     | || ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    || ||  | | |||||||||| | ||||| | |||||||||||| |    
T  2258 ccgaagatgtagcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgttttatttgtcagaagtcga 2159  T
Q  314 aggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaa 413  Q
    ||| ||||| |||||  ||||| ||  || ||    | || ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||    
T  2158 aggatgagcgtcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaa 2059  T
Q  414 tactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttg 513  Q
    |||||  |  ||| ||||  |||| |||||  | || | ||  |||||| ||||||| || ||  ||  ||||||||| |||| |||  |  |||| |||    
T  2058 tactcttaaagggaatgacgcgatttgggtgattgttggcatattgacgtagtcggctcattttcttcagattaatattagttttcctatttctcaattg 1959  T
Q  514 gcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtt 613  Q
    || ||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |  || || ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  1958 gcagagatttatattcgagatattgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtatcagatatagatccaagatttacttctagattttgtaaaagtt 1859  T
Q  614 tacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcg 681  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1858 tgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtctgtcg 1791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 6799 - 6972
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  6799 cagagaagcgcaacaggttgatgtcaagcttgtggatttaagggttaatagtaatcaaactgaagatagtgatttcaaggttgatgaacacggtgtgttg 6898  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagag 188  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  6899 aggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaaaaggctgattttagaagaaagtcacaagag 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 398
Target Start/End: Original strand, 880 - 921
Alignment:
Q  357 tgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  880 tgtaccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgt 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 355 - 683
Target Start/End: Original strand, 4553 - 4881
Alignment:
Q  355 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagaca 454  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||| || ||| ||||  | || |||||  | || || |    
T  4553 gatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagcttgccgaatactcctagagggaatgacgcaatttgggtgattgttgata 4652  T
Q  455 ggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggt 554  Q
    | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| ||||  || ||  | |||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  4653 gattgacgaagtcagctcattttctaccgattaatattagtttccctgtttcccagttggcagagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgt 4752  T
Q  555 tccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggct 654  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| || |||  ||||||||||||     
T  4753 tccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttctaagttgggattgagttcggcg 4852  T
Q  655 tatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4853 tatcatccacagacagatggtcagtcgga 4881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 3
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  170 cagagaagcacagcaagttgatgtcaagtttgttgatttaatggttgctagtaatcaaactgaagagggtgatttcaaggttgatgatcagggggtgttg 71  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtca 182  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  70 aggttcagaggaagaatttgcattcctgataacgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtca 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 457 - 683
Target Start/End: Original strand, 18761 - 18987
Alignment:
Q  457 ttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttc 556  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| ||||| ||||    
T  18761 ttgacgaagtcggctcatttcattccgattaatatcagttttcttgtatctcagttggcggaaatttacattcgcgatattgtgaagttacatggtgttc 18860  T
Q  557 cgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctta 656  Q
    | ||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||  |||||  |||| |  ||  |||| || ||||  ||| ||||||| ||    
T  18861 cttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgaaagaggctttaagttctaagttgaggttgcgttcggcgta 18960  T
Q  657 tcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18961 tcatccgcagacagatggtcagtcgga 18987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 400
Target Start/End: Original strand, 18346 - 18711
Alignment:
Q  32 ttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaat 131  Q
    ||||||| |||| |||||| ||  | ||| ||||||||||  ||||  || ||||||| ||  | ||||| || ||||||||| | ||| ||  ||||||    
T  18346 ttgatgttaagtttgtggacttgttggtttctagtaatcagactgaagattgtgattttaaaatcgatgatcagggagtgttgcgttttcgattcagaat 18445  T
Q  132 ttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgac 231  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | | ||||||||| || |||||||||||     
T  18446 ttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcatgat 18545  T
Q  232 ttgaagaagttgttttggtggtc-tggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagagg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||  | | |||||||||| | ||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||      
T  18546 ttgaagaagttgttttggtggtcttggttt----tgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtccaaagtcaaaagttgagcatcagaaa 18641  T
Q  331 cctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtga 400  Q
    |||||||  ||| ||||||| || ||| |||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18642 cctgcagcgttgatgacacctttagatatactagagtgaaaatgggatagcatatccatggattttgtga 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 26061 - 26306
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  ||||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  26061 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttagttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgatcaaggtgtgttgaga 26160  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  |  | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  26161 tttcgaggtagaatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacga 26260  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26261 agatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaa 26306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 507 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 798 - 622
Alignment:
Q  507 tcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttgg 606  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||   |||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  798 tcagttggcggagatttatattcacaatattgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtggtggatagagatccgaggttcacttctagattttgg 699  T
Q  607 agaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |  || || |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  698 aagagcttgcaagatgccttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagacgga 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 8805 - 8314
Alignment:
Q  192 cttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcg 291  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || |||||| | || || |||||| | || |||||||||||||||||    |||||  |   |||||||||| |     
T  8805 cttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgtattcc 8706  T
Q  292 tgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 391  Q
    || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||    
T  8705 tgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgg 8606  T
Q  392 attttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatat 491  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| | ||| | || ||||   | || || || |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||    
T  8605 attttgtgacgagtttgccgaatactcagagagggaacgatgcaatttgggcaatcgttgatagattgacgaagtcggctcattttctaccgattaatat 8506  T
Q  492 cagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggttt 591  Q
     |||| |||  | || |||||||| ||||| || ||  ||   ||||||| ||| |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  8505 tagttttcctattgcccagttggcagagatttatatcaaggtgattgtgaggttacatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagattt 8406  T
Q  592 acttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||| |  |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8405 acttctagtttttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgatgttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcgga 8314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 509 - 683
Target Start/End: Original strand, 68199 - 68373
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||     
T  68199 agttggcagagatttacattcataatattgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaa 68298  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||| |||||    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || || |  ||||||||||||||    
T  68299 gagtttgcaagagaacttgggttcaaagttgagattgacttcggcttatcacccacaaatagatggtcagtcgga 68373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47168 - 46963
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| |||||  | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  47168 ttgagtattcatcctggagcggctaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaaggaggaaattgctgagtttgtttatgctt 47069  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  | || ||  ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47068 gtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttcatgcaaccgttgtttgtgcctgagtggaagtgggatagcatttctatgga 46969  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  46968 ctttgt 46963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 683
Target Start/End: Original strand, 196606 - 197260
Alignment:
Q  29 aagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcag 128  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || || |||||||| ||  | |||||||||||  ||||  |    
T  196606 aagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaagttgatgaccatcgtgtgttgagattccgaggtcg 196705  T
Q  129 aatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcat 228  Q
     ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | || || || ||||  || | |||||||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  196706 tatttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaggagagccatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcat 196805  T
Q  229 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 328  Q
    ||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  196806 gatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaacgagatgtggcatagtttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgagcatcaga 196905  T
Q  329 ggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggca 428  Q
      ||  | |   || ||  | | || ||| | || |||| |||||||||||  || || |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||| |    
T  196906 aacccactgatatgatggtatctttagatatgccagagtcgaaatgggataatatatccatggattttgtgacgagttagccgaatactcctagagggaa 197005  T
Q  429 tgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacatt 528  Q
    |||  |||| ||| |  | || || || ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| || |||    
T  197006 tgacgcgatttggatgattgttgatagattgacgaagtcagcacattttctaccgattaatattagttttcctgttgcccagttggcagagatttatatt 197105  T
Q  529 cagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgg 628  Q
     || | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || |    
T  197106 aaggagattgtgaagttgtatggcgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttag 197205  T
Q  629 gttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  197206 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcgga 197260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 263
Target Start/End: Original strand, 19296 - 19429
Alignment:
Q  130 atttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatg 229  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||| | |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19296 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaatagagtcatataagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatg 19395  T
Q  230 acttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
      || |||||| | || ||||||||||| |||||    
T  19396 gtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaa 19429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 57088 - 56961
Alignment:
Q  136 attcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttga 235  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||  | ||||||||||| || |||||||| || || |    
T  57088 attcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaa 56989  T
Q  236 agaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  56988 agaagattttctggtggtctggtttgaa 56961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 6410 - 5745
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| || ||  | ||| ||||||||||  ||||  | |||||||| ||  | |||||  |||| |||||||      
T  6410 agaagcacagaaagttgatgttaagtttgtagacttgttggttgctagtaatcagactgaagacagtgattttaaaatcgatgataaaggtgtgttgaag 6311  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||| |||| || ||||| ||||  ||| |||| ||  |||||||  ||||| | |||||||||||||  || | |||||||||  ||| ||||||||  |    
T  6310 tttcgaggtaggatttgcattctagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatga 6211  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggt 317  Q
    | ||||| || ||  | ||||||||||||| ||||||| | |||||    |||||  | |  ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  6210 agatgtaccacgatctaaagaagttgttttagtggtctagattgaaacgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgacttgttagaagtcgaaggt 6111  T
Q  318 tgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatact 417  Q
    |||||||||||  ||||| ||   | ||  | | ||  |||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  6110 tgagcatcagaaacctgctggtaggatggtatctttatatgtgctagagtggaaatgggatagtatacccatggattttgtgacgagtttgccgaatact 6011  T
Q  418 ccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagacaggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcgg 517  Q
    || |  ||| ||||  | || |||||  |  | |  || |||||||||||||  || ||  || ||||||||||||||| ||| ||  || |||||||      
T  6010 cctaaagggaatgacgcaatttgggtgattatgggtagattgacgaagtcggttcattttcttccgattaatatcagttttcctgtttctaagttggcat 5911  T
Q  518 agatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttaca 617  Q
    |||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  5910 agatttatattcgtaatattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 5811  T
Q  618 agatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    ||| |  || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||||    
T  5810 agaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatctgtagacagattgttagtcgga 5745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 1968 - 2159
Alignment:
Q  15 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |||| || || ||||||    
T  1968 cagagaagcacaacaagttgatgtcaagtttgttgatttgatgattgctagtaatgaaactgaagatagtgacttcaaggttaatgatcagggtgtgttg 2067  T
Q  115 agatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatcc 206  Q
    || ||  |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||| ||||    
T  2068 aggttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagaaaagtcacaagagtagcttaagtattcatcc 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2003 - 1681
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| |  |||| |||||||  || | |||||    
T  2003 gatgatcaaggtgtgttcagattccgaggtagaatttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcatagaagtagcttga 1904  T
Q  197 gtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |||||    |||||  | |  ||||||||| |  ||||    
T  1903 gtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattctggttt 1804  T
Q  297 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggatttt 396  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||| |  ||| | ||| || ||    | || ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  1803 gatttgtcagaagtcgaaagttgaggatcaaaaacctactggaatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaagtgggatagtatatccatggatttt 1704  T
Q  397 gtgacaagtttacctaatactcc 419  Q
    ||||| ||||| || ||||||||    
T  1703 gtgacgagtttgccaaatactcc 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1662 - 1523
Alignment:
Q  544 ttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaat 643  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| || ||||  |    
T  1662 ttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatcttagttttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggt 1563  T
Q  644 tgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1562 ttagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgga 1523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 536 - 683
Target Start/End: Original strand, 844 - 991
Alignment:
Q  536 ttgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaa 635  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| || ||    
T  844 ttgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggctcgaa 943  T
Q  636 attgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatggtcagtcgga 683  Q
     ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  944 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgga 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 10195 - 10361
Alignment:
Q  80 atagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaag 179  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||| | ||||| ||    
T  10195 atagtgactttaaggtcgacgatcagggagtgttgcgattccgaagcagaatttgtattcctgacgacgatgacatgaagaaaatgattcttgaagagag 10294  T
Q  180 tcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttt 246  Q
    ||| |  || | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10295 tcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttt 10361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 680
Target Start/End: Original strand, 4953 - 5077
Alignment:
Q  556 ccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggagaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggctt 655  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| || ||||  || ||||||||||    
T  4953 ccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttaagttcggctt 5052  T
Q  656 atcatccgcagacggatggtcagtc 680  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  5053 atcatccgcagacagatggtcagtc 5077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24350 - 24098
Alignment:
Q  355 gatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatgattcgatatgggttgtggtagaca 454  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||  | |||||| | |  ||| ||||  |||| |||||  | || || |    
T  24350 gatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagtttgtcgaatacttctatagggaatgacgcgatttgggtgattgttgata 24251  T
Q  455 ggttgacgaagtcggcgcacttcatttcgattaatatcagttatccagtagctcagttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggt 554  Q
    | |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| || ||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  24250 gattgacgaagtcggctcatttcctaccgattaatatcagttttcctgttgcccagttggcgaagatttatattaaggagattgtgaagttgcatggtgt 24151  T
Q  555 tccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttgga 607  Q
    ||| ||||| || |  || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24150 tccttcgagcattggatcggatagagatccaagattaacttctagattttgga 24098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 1
Alignment:
Q  17 gagaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgag 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||| || |||||     |||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  191 gagaagcacagcaagtagatgttaagtttgttgatttgattgttgctggtaatgttattgaggatagtgactttaaggttgatgatcagggtgtgttgag 92  T
Q  117 atttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccg 207  Q
     || ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||    
T  91 gttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3382 - 3000
Alignment:
Q  19 gaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagat 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||  | ||| | ||||||||  ||||  || |||| || ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  3382 gaagcacagaaagttgatgtcaagtttgtagacttgttggttgccagtaatcagactgaagatggtgactttaaggtcgatgaccatggtgtgttgagat 3283  T
Q  119 ttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaa 218  Q
    |  ||||   ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| | | ||||||||| ||    
T  3282 tccgaggtttaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaa 3183  T
Q  219 aatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggtt 318  Q
     |||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||||    |||||  | | |||||||||| | ||||||  |||||||||||| | | ||    
T  3182 gatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgacgatt 3083  T
Q  319 gagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgac 401  Q
    || |||||||  ||||| ||  || ||  | | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  3082 gaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgac 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 3167 - 3372
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  3167 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 3266  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3267 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 3366  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  3367 ttttgt 3372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24408 - 24203
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  24408 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 24309  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24308 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatgga 24209  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  24208 ttttgt 24203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 4470 - 4715
Alignment:
Q  18 agaagcacaacaagttgatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgaga 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | | || ||  | ||| ||||||||||  ||||  || |||| || ||||||||||| || || |||||||||    
T  4470 agaagcacagaaagttgatgtcaagtttttagacttgttggttgctagtaatcagactgaagatggtgactttaaggttgatgaccatggtgtgttgaga 4569  T
Q  118 tttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaa 217  Q
    ||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||   ||||| | |||||  ||||||  || | |||||||||| | ||||||||||| |    
T  4570 ttccgaggtcgaatttgcattcctgacgatgaagagatgaagataatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacga 4669  T
Q  218 aaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
    | |||||||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  4670 agatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaa 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 215
Target Start/End: Original strand, 39099 - 39217
Alignment:
Q  97 gatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttga 196  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  39099 gatgatcaaggagtgatgaggtttcgaggtaggatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttga 39198  T
Q  197 gtattgatccgggagctac 215  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  39199 gtattcatccgggagctac 39217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 271
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||  ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |  ||  |||||| ||||| |    
T  476 ttgagtattcatctaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaatgatattgctgagtttgtttatgctt 377  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  376 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagaccatcgggtttgatgcaaccgttgtttgttccagagtggatttgggatagcatttctatgga 277  T
Q  393 ttttgt 398  Q
    ||||||    
T  276 ttttgt 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 3236 - 3441
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  3236 ttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 3335  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| ||||  ||||||| ||  |  | ||| ||  |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3336 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaaaatcagagaccgacgagtttgatgcaaccgttgtttgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatgga 3435  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  3436 ctttgt 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 137 - 296
Alignment:
Q  104 aaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattga 203  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| | || ||  | |||||| ||||| | ||||| |||||||  || | |||||||||| |    
T  137 aaggcgtgttgagattccgagggagaatttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattca 236  T
Q  204 tccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaa 263  Q
     ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||||||||    
T  237 cccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaa 296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19061 - 18856
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  19061 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtttatgctt 18962  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||| |||    | ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18961 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcagagacctttgtgtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatgga 18862  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  18861 ctttgt 18856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28067 - 27926
Alignment:
Q  73 gctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagttgattttag 172  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  | || ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |    
T  28067 gctgagaacagtgatttcaagattgatgattagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattcttg 27968  T
Q  173 aagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagcta 214  Q
    |||| ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||    
T  27967 aagagagtcacaagagtagattgagtattcacccgggggcta 27926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6179 - 5984
Alignment:
Q  203 atccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttg 302  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| ||||||  |||    
T  6179 atccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtttatgcttgtttggtttg 6080  T
Q  303 tcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    |||||| || ||| |||| ||| |||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6079 tcagaaatcgaagattgaacattagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgttccagagtggaagtgggatagcatttctatggactttgt 5984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 9153 - 9358
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  9153 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgtttatgctt 9252  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  |||| |||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9253 gtttggtttgttagaaatcgaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagaatggaagtgggatagcatttctatgga 9352  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  9353 ctttgt 9358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13922 - 13717
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| |    
T  13922 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtttatgctt 13823  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  ||||||||| || ||| ||||  | ||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13822 gtttggtttgtcagaaatcgaagattgaataacagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatgga 13723  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  13722 ctttgt 13717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4145 - 3967
Alignment:
Q  220 atgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttg 319  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||  |  ||  |||||| ||||| ||| ||  ||||| |||||| ||| |||    
T  4145 atgtatcatgatttgaagagattgttttgatggcctggaatgaagaaggaaattgctgagtttgtatatgcttgtctggtttgtccgaagtcgaagattg 4046  T
Q  320 agcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    | |||||||  ||  |||| ||| ||  |||||||   || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4045 aacatcagaaaccgtcaggtttgatgcaaccgttgttcgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggattttgt 3967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15667 - 15465
Alignment:
Q  196 agtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgtgtt 295  Q
    |||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |   |  |||||| ||||| ||||    
T  15667 agtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgtttagtttgtttatgcttgtt 15568  T
Q  296 tgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattt 395  Q
    ||  ||||||||| || ||| || | |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  15567 tggtttgtcagaaatcgaagatttatcatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggataacatttctatggaatt 15468  T
Q  396 tgt 398  Q
    |||    
T  15467 tgt 15465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44381 - 44347
Alignment:
Q  364 gagtggaaatgggatagcatttctatggattttgt 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44381 gagtggaagtgggatagcatttctatggattttgt 44347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3556 - 3351
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcactcggtttgtgtatgcgt 292  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |   |  |||||| ||||| |    
T  3556 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattggtgagtttgtttatgctt 3457  T
Q  293 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 392  Q
    |||||  |||||| || || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| ||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  3456 gtttgctttgtcaaaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccgttgtttgtgccagagtggaagtgggataatatttctatgga 3357  T
Q  393 ttttgt 398  Q
     |||||    
T  3356 ctttgt 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Original strand, 3405 - 3505
Alignment:
Q  34 gatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaattt 133  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||  ||  |||  ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||    
T  3405 gatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 3504  T
Q  134 g 134  Q
    |    
T  3505 g 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10308 - 10232
Alignment:
Q  193 ttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10308 ttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaagga 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 134
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30518
Alignment:
Q  34 gatgtcaagtgtgtggatttaatagttactagtaatcaagctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaattt 133  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||  ||  |||  ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||    
T  30418 gatgtcaagtttgtggatttgatggttgctagtaatcaaactgaagatgttgacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattt 30517  T
Q  134 g 134  Q
    |    
T  30518 g 30518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Original strand, 14030 - 14105
Alignment:
Q  194 tgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaagga 269  Q
    |||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  14030 tgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaagga 14105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 252
Target Start/End: Original strand, 32677 - 32764
Alignment:
Q  165 gattttagaagaaagtcataagagcaacttgagtattgatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtgg 252  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |  ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32677 gattttagacgaaggtcataaaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 71917 - 71830
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc 596  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| | || | ||||||||||||    
T  71917 agttggctgagatctacattgagcagattgtgaggttgcatggtattccgtctagtattgtgtcggatcgggatctaaggtttacttc 71830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 662
Target Start/End: Original strand, 33021 - 33174
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggag 608  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||  ||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |  ||||||      
T  33021 agttggctgagatctacattgagcagattgtgagattgcatggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttggga 33120  T
Q  609 aagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatcc 662  Q
    |||||| |||| ||  |||||  | || ||||  |||||||| |||||||||||    
T  33121 aagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttgagttctgcttatcatcc 33174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 1
Alignment:
Q  74 ctgagaatagtgatttcaaggttgatgagcaaggagtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacgatgaggaattgaagaagtt 164  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  91 ctgaggatagtgactttatggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 509 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 347 - 182
Alignment:
Q  509 agttggcggagatctacattcagaatattgtgaagttgcatggggttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttc-aagattttgga 607  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||| || ||| | ||||||||| | || || ||||||| ||| ||| |||||||    
T  347 agttggctgagatctacattgagcatattgtgaggttgcatggtattccttctagtcttgtgtcagatcgggatccgaggtttagttctaagtttttgga 248  T
Q  608 gaagtttacaagatgtgttgggttcaaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacggatgg 674  Q
     |||||| |||| |   |||||  | || |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  247 -aagtttgcaagctactttgggaactaagttgagattgagttctgcttatcatcgccagaccgatgg 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University