View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12534_low_1 (Length: 752)

Name: NF12534_low_1
Description: NF12534
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12534_low_1
NF12534_low_1
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (5-733)||(28979768-28980484)
chr3 (40-215)||(55293591-55293766)
chr3 (7-215)||(39094235-39094429)
chr3 (2-221)||(29528910-29529115)
chr3 (41-221)||(40821913-40822093)
chr3 (40-221)||(8526996-8527177)
chr3 (1-221)||(19893336-19893542)
chr3 (40-221)||(35855828-35856009)
chr3 (1-221)||(48519813-48520019)
chr3 (2-221)||(26776594-26776799)
chr3 (2-221)||(52842864-52843068)
chr3 (40-221)||(29529681-29529862)
chr3 (1-221)||(4137560-4137766)
chr3 (40-221)||(19368262-19368443)
chr3 (2-221)||(55290555-55290758)
chr3 (1-221)||(8396443-8396649)
chr3 (3-221)||(22521931-22522150)
chr3 (1-218)||(35860685-35860887)
chr3 (2-213)||(19360893-19361090)
chr3 (46-215)||(9373137-9373300)
chr3 (2-190)||(26100937-26101111)
chr3 (81-221)||(53801520-53801660)
chr3 (40-221)||(26101600-26101767)
chr3 (1-221)||(53802041-53802247)
chr3 (38-221)||(36006487-36006663)
chr3 (97-221)||(39093603-39093727)
chr3 (40-221)||(19361556-19361723)
chr3 (38-221)||(9373961-9374123)
chr3 (113-221)||(4138621-4138729)
chr3 (38-221)||(51656384-51656547)
chr3 (43-147)||(14555611-14555715)
chr3 (38-127)||(9373839-9373929)
chr3 (38-121)||(9373537-9373620)
chr3 (131-221)||(46489291-46489382)
chr3 (49-129)||(16040631-16040711)
chr3 (38-146)||(40822145-40822253)
chr3 (78-221)||(53521737-53521860)
chr3 (38-146)||(40822305-40822413)
chr3 (162-221)||(19367744-19367803)
chr3 (46-154)||(53521986-53522096)
chr3 (46-154)||(53522285-53522395)
chr3 (247-364)||(2740933-2741052)
chr3 (247-298)||(28787276-28787327)
chr3 (35-146)||(53927522-53927633)
chr3 (38-117)||(55369548-55369627)
chr3 (38-124)||(38362057-38362143)
chr3 (40-129)||(16046978-16047066)
chr3 (33-146)||(49067908-49068021)
chr3 (167-215)||(9373771-9373819)
chr3 (38-146)||(53927265-53927373)
chr3 (33-103)||(9374197-9374268)
chr3 (175-221)||(9373457-9373503)
chr3 (38-88)||(16062531-16062581)
chr3 (38-124)||(38362157-38362243)
chr3 (38-124)||(38362357-38362443)
chr3 (1-43)||(40817335-40817377)
chr3 (38-124)||(49453788-49453874)
chr3 (465-561)||(2740734-2740831)
chr3 (38-111)||(38362457-38362530)
chr3 (1-33)||(18688526-18688558)
chr3 (72-148)||(36946736-36946812)
chr3 (38-118)||(38362257-38362337)
chr3 (38-118)||(49453894-49453974)
chr3 (38-117)||(36946455-36946534)
chr3 (38-117)||(55369703-55369782)
chr3 (82-148)||(36946579-36946645)
chr3 (76-129)||(16036429-16036482)
chr3 (465-534)||(28787036-28787105)
chr3 (72-154)||(36006750-36006834)
chr3 (72-145)||(40822642-40822715)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (243-733)||(16683630-16684118)
chr5 (10-221)||(2182517-2182728)
chr5 (1-221)||(33704913-33705119)
chr5 (2-221)||(41692820-41693025)
chr5 (2-221)||(25695696-25695901)
chr5 (2-221)||(34719136-34719341)
chr5 (40-215)||(752999-753174)
chr5 (3-221)||(42975549-42975753)
chr5 (40-215)||(43137204-43137379)
chr5 (40-221)||(12419376-12419556)
chr5 (2-221)||(36884939-36885144)
chr5 (40-221)||(753742-753923)
chr5 (40-221)||(2181778-2181959)
chr5 (40-221)||(6304736-6304917)
chr5 (40-221)||(43137836-43138017)
chr5 (40-221)||(26601481-26601661)
chr5 (2-204)||(30181106-30181294)
chr5 (40-214)||(30180365-30180539)
chr5 (40-214)||(34717866-34718040)
chr5 (40-221)||(42976839-42977020)
chr5 (40-221)||(3087352-3087533)
chr5 (40-221)||(17637624-17637804)
chr5 (40-221)||(33705571-33705752)
chr5 (1-221)||(43136432-43136637)
chr5 (2-221)||(17636844-17637049)
chr5 (11-221)||(34725427-34725623)
chr5 (47-221)||(34726200-34726374)
chr5 (40-214)||(41691550-41691724)
chr5 (40-209)||(25696351-25696520)
chr5 (40-221)||(36885716-36885893)
chr5 (40-221)||(42976217-42976384)
chr5 (2-221)||(752214-752432)
chr5 (93-215)||(6304045-6304167)
chr5 (2-221)||(3086592-3086779)
chr5 (38-144)||(3890316-3890422)
chr5 (38-221)||(38937351-38937514)
chr5 (33-128)||(16683432-16683527)
chr5 (131-221)||(27440854-27440944)
chr5 (33-129)||(16679864-16679960)
chr5 (38-141)||(3890201-3890304)
chr5 (33-217)||(16679637-16679801)
chr5 (131-221)||(39915370-39915460)
chr5 (38-144)||(41289838-41289942)
chr5 (148-221)||(30755418-30755491)
chr5 (38-154)||(38096799-38096915)
chr5 (38-129)||(41289948-41290039)
chr5 (60-111)||(16685461-16685512)
chr5 (33-129)||(16679547-16679642)
chr5 (47-148)||(38096953-38097054)
chr5 (38-154)||(35393466-35393582)
chr5 (38-146)||(35393629-35393737)
chr5 (38-154)||(38096653-38096769)
chr5 (38-148)||(17547713-17547823)
chr5 (33-146)||(35394267-35394380)
chr5 (38-146)||(17547410-17547518)
chr5 (38-146)||(35394108-35394215)
chr5 (46-149)||(38939117-38939222)
chr5 (175-215)||(16679798-16679838)
chr5 (38-146)||(41041942-41042050)
chr5 (38-117)||(41041800-41041879)
chr5 (47-117)||(5079807-5079877)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (214-733)||(38641258-38641781)
chr4 (1-221)||(24944291-24944511)
chr4 (3-221)||(8531891-8532109)
chr4 (40-221)||(20589997-20590178)
chr4 (40-215)||(24944850-24945025)
chr4 (1-221)||(39404749-39404968)
chr4 (40-221)||(24947566-24947747)
chr4 (40-221)||(46105200-46105381)
chr4 (2-221)||(17741341-17741546)
chr4 (2-221)||(39713654-39713859)
chr4 (40-215)||(8988138-8988313)
chr4 (40-215)||(37351038-37351213)
chr4 (40-221)||(8987500-8987681)
chr4 (5-221)||(13172627-13172829)
chr4 (40-221)||(24548348-24548529)
chr4 (40-221)||(37350400-37350581)
chr4 (2-221)||(3758958-3759163)
chr4 (2-221)||(36741958-36742163)
chr4 (2-221)||(52802612-52802817)
chr4 (40-215)||(2117131-2117306)
chr4 (1-221)||(12680792-12680998)
chr4 (40-221)||(9888209-9888390)
chr4 (10-221)||(43023697-43023900)
chr4 (40-214)||(52801300-52801474)
chr4 (1-221)||(46106100-46106306)
chr4 (40-221)||(47556239-47556420)
chr4 (1-221)||(8964513-8964718)
chr4 (1-221)||(8988880-8989085)
chr4 (1-221)||(37351780-37351985)
chr4 (1-221)||(37356679-37356884)
chr4 (2-221)||(50118226-50118431)
chr4 (38-221)||(46419557-46419739)
chr4 (40-221)||(3758313-3758494)
chr4 (2-221)||(20590681-20590887)
chr4 (40-209)||(39714357-39714525)
chr4 (1-221)||(50043016-50043221)
chr4 (40-221)||(50118888-50119069)
chr4 (40-204)||(16904665-16904829)
chr4 (2-221)||(24549101-24549306)
chr4 (1-221)||(47555583-47555788)
chr4 (38-221)||(26603405-26603582)
chr4 (40-215)||(43022967-43023135)
chr4 (2-215)||(29713510-29713708)
chr4 (40-221)||(39405531-39405698)
chr4 (1-221)||(2117868-2118074)
chr4 (46-221)||(49355261-49355435)
chr4 (29-221)||(5755276-5755454)
chr4 (40-221)||(29712998-29713165)
chr4 (63-221)||(42348484-42348644)
chr4 (38-221)||(37061526-37061695)
chr4 (1-215)||(9887428-9887641)
chr4 (2-109)||(30527746-30527853)
chr4 (40-204)||(43022468-43022619)
chr4 (35-215)||(37061735-37061901)
chr4 (80-221)||(42348221-42348362)
chr4 (33-213)||(42349529-42349695)
chr4 (38-158)||(48808351-48808471)
chr4 (38-144)||(48808234-48808340)
chr4 (38-221)||(26602650-26602813)
chr4 (38-129)||(42348387-42348478)
chr4 (1-94)||(16652986-16653079)
chr4 (38-129)||(54866762-54866853)
chr4 (47-129)||(42348112-42348194)
chr4 (38-111)||(8120421-8120494)
chr4 (46-154)||(8120224-8120334)
chr4 (247-298)||(16639676-16639727)
chr4 (38-124)||(1325554-1325640)
chr4 (38-146)||(11659265-11659373)
chr4 (38-146)||(54242940-54243048)
chr4 (161-221)||(54866865-54866925)
chr4 (46-117)||(8120128-8120199)
chr4 (38-148)||(54242785-54242895)
chr4 (38-124)||(24527973-24528059)
chr4 (1-33)||(5759194-5759226)
chr4 (38-118)||(23980173-23980253)
chr4 (64-124)||(24527911-24527971)
chr4 (36-118)||(24527565-24527648)
chr4 (38-144)||(11654403-11654509)
chr4 (40-117)||(8119797-8119874)
chr4 (38-91)||(49752392-49752445)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (251-733)||(21679886-21680374)
chr1 (2-221)||(16301806-16302025)
chr1 (2-221)||(19320579-19320784)
chr1 (40-221)||(19321236-19321417)
chr1 (2-221)||(4893646-4893851)
chr1 (2-221)||(29184636-29184841)
chr1 (40-215)||(28572083-28572258)
chr1 (40-221)||(16301217-16301398)
chr1 (3-215)||(33363256-33363454)
chr1 (1-221)||(47137536-47137742)
chr1 (40-221)||(28571334-28571515)
chr1 (40-221)||(50562333-50562514)
chr1 (40-221)||(22198182-22198363)
chr1 (2-221)||(46623535-46623740)
chr1 (3-221)||(38896493-38896697)
chr1 (40-214)||(4892376-4892550)
chr1 (40-214)||(29185937-29186111)
chr1 (40-221)||(33074933-33075114)
chr1 (40-221)||(1827379-1827560)
chr1 (1-218)||(22194625-22194827)
chr1 (40-214)||(33361979-33362153)
chr1 (2-215)||(51964622-51964820)
chr1 (2-221)||(5427993-5428198)
chr1 (2-221)||(50563150-50563355)
chr1 (1-215)||(1375667-1375866)
chr1 (1-215)||(33074389-33074588)
chr1 (1-221)||(1828117-1828322)
chr1 (9-221)||(52311901-52312099)
chr1 (40-221)||(52311119-52311294)
chr1 (66-221)||(28950641-28950797)
chr1 (40-215)||(47136813-47136974)
chr1 (40-221)||(5427261-5427428)
chr1 (38-221)||(8256444-8256620)
chr1 (2-221)||(28572825-28573043)
chr1 (40-221)||(46624303-46624470)
chr1 (40-221)||(38895753-38895920)
chr1 (131-221)||(49586841-49586931)
chr1 (1-94)||(24289359-24289452)
chr1 (38-221)||(21056084-21056246)
chr1 (131-221)||(33373567-33373657)
chr1 (46-129)||(20130697-20130780)
chr1 (35-111)||(35593623-35593699)
chr1 (60-129)||(35598756-35598825)
chr1 (38-158)||(9754165-9754284)
chr1 (247-298)||(18851541-18851592)
chr1 (101-154)||(20089396-20089449)
chr1 (60-129)||(35599347-35599416)
chr1 (39-91)||(50278377-50278429)
chr1 (131-164)||(24289489-24289522)
chr1 (40-154)||(8256241-8256357)
chr1 (465-534)||(18851302-18851371)
chr1 (96-129)||(24289468-24289501)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (1-221)||(41978523-41978743)
chr8 (2-215)||(18375716-18375915)
chr8 (40-221)||(4465281-4465462)
chr8 (40-221)||(12761168-12761349)
chr8 (2-221)||(36778158-36778363)
chr8 (40-215)||(1944126-1944301)
chr8 (40-215)||(8161328-8161503)
chr8 (40-215)||(8761950-8762125)
chr8 (40-215)||(25834927-25835102)
chr8 (40-221)||(8162071-8162252)
chr8 (40-221)||(8761312-8761493)
chr8 (40-221)||(25835559-25835740)
chr8 (2-221)||(9473801-9474006)
chr8 (2-221)||(25361193-25361398)
chr8 (40-221)||(1943377-1943558)
chr8 (40-221)||(7390248-7390429)
chr8 (2-221)||(24055518-24055723)
chr8 (41-221)||(44381597-44381777)
chr8 (40-215)||(32845513-32845688)
chr8 (40-221)||(32844762-32844944)
chr8 (1-221)||(7390996-7391202)
chr8 (40-221)||(32846140-32846321)
chr8 (40-221)||(36777519-36777700)
chr8 (2-221)||(42244494-42244699)
chr8 (2-221)||(44380871-44381076)
chr8 (3-221)||(40586601-40586805)
chr8 (1-221)||(8762692-8762897)
chr8 (1-221)||(41531927-41532132)
chr8 (40-221)||(41532643-41532824)
chr8 (1-221)||(41158325-41158528)
chr8 (1-221)||(1944867-1945072)
chr8 (40-221)||(9473163-9473344)
chr8 (1-221)||(25345672-25345878)
chr8 (1-221)||(25834155-25834360)
chr8 (40-221)||(41157589-41157761)
chr8 (2-221)||(25618658-25618863)
chr8 (1-221)||(4464512-4464718)
chr8 (53-221)||(25619604-25619771)
chr8 (1-221)||(8160577-8160780)
chr8 (1-129)||(32846952-32847080)
chr8 (33-221)||(34894088-34894262)
chr8 (47-204)||(34894775-34894926)
chr8 (33-129)||(34894571-34894667)
chr8 (33-129)||(37588310-37588406)
chr8 (38-217)||(37588144-37588315)
chr8 (136-221)||(34894275-34894359)
chr8 (47-154)||(44428432-44428537)
chr8 (131-215)||(38295309-38295387)
chr8 (38-154)||(18493154-18493270)
chr8 (38-146)||(41843821-41843929)
chr8 (40-148)||(41843974-41844082)
chr8 (38-129)||(38295375-38295465)
chr8 (38-146)||(16913968-16914075)
chr8 (251-296)||(29129209-29129254)
chr8 (72-148)||(41844173-41844249)
chr8 (38-129)||(37588040-37588131)
chr8 (38-129)||(44428771-44428862)
chr8 (175-221)||(32846888-32846933)
chr8 (63-120)||(34894508-34894565)
chr8 (38-111)||(37587961-37588034)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-221)||(14832716-14832936)
chr6 (40-221)||(4108988-4109169)
chr6 (2-215)||(1222068-1222267)
chr6 (2-221)||(9978867-9979072)
chr6 (40-221)||(4896772-4896953)
chr6 (40-221)||(33320362-33320543)
chr6 (2-221)||(24447473-24447678)
chr6 (40-221)||(35159121-35159302)
chr6 (2-220)||(15043986-15044190)
chr6 (2-221)||(9735855-9736060)
chr6 (40-214)||(24446203-24446377)
chr6 (2-221)||(6966396-6966601)
chr6 (2-196)||(18320430-18320610)
chr6 (40-214)||(1220796-1220970)
chr6 (2-221)||(4109734-4109939)
chr6 (6-221)||(35159799-35160002)
chr6 (1-215)||(4896119-4896318)
chr6 (38-221)||(4621320-4621496)
chr6 (6-108)||(33319729-33319831)
chr6 (47-147)||(31426210-31426311)
chr6 (146-221)||(21059293-21059368)
chr6 (151-221)||(33319846-33319916)
chr6 (146-214)||(21078541-21078609)
chr6 (101-158)||(31497194-31497251)
chr6 (105-158)||(31502584-31502637)
chr6 (175-221)||(21055521-21055567)
chr6 (101-154)||(31491805-31491858)
chr6 (35-154)||(26899782-26899901)
chr6 (38-148)||(21855243-21855352)
chr6 (38-124)||(28078962-28079048)
chr6 (38-91)||(19989962-19990015)
chr6 (38-146)||(26899644-26899752)
chr6 (39-146)||(21855399-21855506)
chr6 (38-148)||(26899997-26900107)
chr6 (40-117)||(21855112-21855189)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-215)||(32675901-32676114)
chr2 (2-221)||(4289186-4289391)
chr2 (40-214)||(28608886-28609060)
chr2 (40-221)||(42781605-42781786)
chr2 (40-221)||(1513689-1513870)
chr2 (40-221)||(32676463-32676644)
chr2 (40-221)||(18091530-18091711)
chr2 (1-221)||(28609610-28609837)
chr2 (40-221)||(6931063-6931244)
chr2 (40-221)||(19487199-19487380)
chr2 (40-214)||(4290485-4290659)
chr2 (5-221)||(19487955-19488157)
chr2 (40-204)||(9543452-9543616)
chr2 (3-221)||(18090771-18090976)
chr2 (2-221)||(42782352-42782557)
chr2 (40-221)||(19485117-19485298)
chr2 (38-221)||(25235107-25235290)
chr2 (2-202)||(9542788-9542974)
chr2 (2-221)||(10874557-10874762)
chr2 (38-215)||(44940665-44940838)
chr2 (1-215)||(17838159-17838358)
chr2 (3-221)||(6931585-6931788)
chr2 (40-221)||(10875338-10875505)
chr2 (33-138)||(1501622-1501727)
chr2 (18-130)||(1501514-1501626)
chr2 (33-158)||(8909774-8909899)
chr2 (138-221)||(1513139-1513223)
chr2 (38-144)||(25234787-25234893)
chr2 (38-144)||(25234570-25234676)
chr2 (38-144)||(25234997-25235101)
chr2 (38-154)||(38328106-38328222)
chr2 (134-221)||(15783438-15783525)
chr2 (38-129)||(25234472-25234563)
chr2 (33-154)||(38328963-38329084)
chr2 (40-129)||(25234684-25234773)
chr2 (38-148)||(39087616-39087726)
chr2 (40-129)||(25234901-25234990)
chr2 (36-146)||(39087780-39087890)
chr2 (47-144)||(38328560-38328657)
chr2 (38-146)||(38328252-38328360)
chr2 (38-129)||(692922-693013)
chr2 (38-146)||(38328706-38328814)
chr2 (465-534)||(21797308-21797377)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (2-221)||(17172572-17172777)
chr7 (1-221)||(9151097-9151303)
chr7 (2-221)||(48527570-48527775)
chr7 (2-221)||(27733112-27733317)
chr7 (2-221)||(31896972-31897177)
chr7 (2-221)||(35155647-35155852)
chr7 (2-221)||(44806256-44806461)
chr7 (40-221)||(7855901-7856082)
chr7 (40-209)||(24683950-24684119)
chr7 (40-214)||(44805515-44805689)
chr7 (40-221)||(49145089-49145273)
chr7 (40-221)||(4849382-4849563)
chr7 (40-221)||(29468377-29468558)
chr7 (2-221)||(7855122-7855327)
chr7 (2-220)||(21669390-21669594)
chr7 (2-204)||(39648140-39648328)
chr7 (40-214)||(17171302-17171476)
chr7 (40-214)||(39648784-39648958)
chr7 (1-221)||(690966-691172)
chr7 (2-221)||(34873498-34873703)
chr7 (40-221)||(9150575-9150755)
chr7 (40-209)||(31897625-31897794)
chr7 (3-221)||(4850126-4850330)
chr7 (1-215)||(29468903-29469102)
chr7 (64-221)||(35156333-35156490)
chr7 (1-213)||(49144192-49144390)
chr7 (40-215)||(33637584-33637759)
chr7 (3-221)||(11835119-11835338)
chr7 (18-220)||(39277929-39278117)
chr7 (78-215)||(24683245-24683382)
chr7 (40-221)||(34872756-34872923)
chr7 (2-196)||(21598111-21598306)
chr7 (40-167)||(49144961-49145088)
chr7 (1-221)||(24682435-24682654)
chr7 (40-215)||(27733880-27734041)
chr7 (247-329)||(7619558-7619640)
chr7 (46-129)||(19327247-19327329)
chr7 (88-204)||(35074761-35074876)
chr7 (1-45)||(33637032-33637076)
chr7 (38-146)||(34406727-34406835)
chr7 (38-148)||(15236310-15236420)
chr7 (38-146)||(15236614-15236722)
chr7 (72-146)||(15236493-15236567)
chr7 (38-91)||(32200184-32200237)
chr7 (38-91)||(32200408-32200461)
chr7 (38-91)||(32200788-32200841)
chr7 (38-91)||(32200990-32201043)
chr7 (38-146)||(2733600-2733708)
chr7 (38-146)||(2734056-2734164)
chr7 (38-146)||(2734357-2734465)
chr7 (40-128)||(29953957-29954045)
chr7 (38-117)||(16717853-16717932)
chr7 (38-117)||(17692063-17692142)
chr7 (72-146)||(16718072-16718146)
chr7 (72-146)||(17692282-17692356)
chr7 (73-146)||(2733755-2733828)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (2-215)||(26185-26384)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (2-215)||(14332-14531)
[»] scaffold2127 (1 HSPs)
scaffold2127 (40-215)||(641-816)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (40-214)||(232249-232423)
scaffold0009 (40-215)||(232881-233057)
scaffold0009 (2-111)||(139349-139458)
scaffold0009 (139-221)||(139267-139349)
scaffold0009 (1-31)||(233078-233108)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (2-221)||(8334-8539)
scaffold0484 (40-221)||(8986-9171)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (40-221)||(10154-10335)
scaffold0381 (1-215)||(10903-11116)
[»] scaffold0115 (3 HSPs)
scaffold0115 (1-221)||(14690-14896)
scaffold0115 (40-221)||(3689-3856)
scaffold0115 (40-221)||(11429-11596)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (40-214)||(18217-18391)
scaffold0057 (2-221)||(17559-17765)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-221)||(55237-55443)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (40-204)||(3765-3929)
scaffold0032 (2-204)||(3003-3191)
scaffold0032 (161-221)||(10335-10395)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (40-221)||(9524-9705)
scaffold0079 (131-221)||(8864-8954)
[»] scaffold0129 (2 HSPs)
scaffold0129 (214-378)||(29193-29361)
scaffold0129 (214-378)||(28986-29153)
[»] scaffold0432 (2 HSPs)
scaffold0432 (38-158)||(5490-5610)
scaffold0432 (38-91)||(5616-5669)
[»] scaffold0180 (8 HSPs)
scaffold0180 (35-124)||(213-302)
scaffold0180 (35-124)||(4533-4622)
scaffold0180 (38-124)||(4217-4303)
scaffold0180 (35-124)||(4317-4407)
scaffold0180 (38-119)||(4014-4095)
scaffold0180 (35-118)||(3-87)
scaffold0180 (45-124)||(105-184)
scaffold0180 (45-124)||(4425-4504)
[»] scaffold0089 (14 HSPs)
scaffold0089 (35-124)||(249-338)
scaffold0089 (35-118)||(22141-22225)
scaffold0089 (45-124)||(21936-22015)
scaffold0089 (45-120)||(22448-22523)
scaffold0089 (35-124)||(33-123)
scaffold0089 (45-118)||(20673-20746)
scaffold0089 (45-124)||(141-220)
scaffold0089 (69-120)||(20805-20856)
scaffold0089 (45-120)||(21202-21277)
scaffold0089 (45-124)||(21520-21599)
scaffold0089 (38-124)||(20558-20644)
scaffold0089 (38-124)||(21821-21907)
scaffold0089 (36-124)||(20884-20973)
scaffold0089 (45-118)||(21628-21701)
[»] scaffold0090 (3 HSPs)
scaffold0090 (38-146)||(13407-13515)
scaffold0090 (38-146)||(13569-13677)
scaffold0090 (38-146)||(13717-13825)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (131-215)||(673-751)
[»] scaffold0759 (1 HSPs)
scaffold0759 (1-36)||(3582-3617)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (38-148)||(9624-9734)
scaffold0246 (72-146)||(9781-9855)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (50-129)||(200930-201011)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 629; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 733
Target Start/End: Original strand, 28979768 - 28980484
Alignment:
Q  5 tacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28979768 tacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaa 28979867  T
Q  105 ttttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979868 ttttactgtattaatcctatttaat--------------ttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 28979953  T
Q  205 atctccttaatcttacttacttaaaataagaaaatcttattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttcca 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979954 ttctccttaatcttacttacttaaaataagaaagtctgattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttcca 28980053  T
Q  305 ctaaaccctgttttggtgccttgcacaattcctaatcaccaaagtgtctgtattaaatgagaatgtggtagggacacacaatttattagcaagcaaacaa 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980054 ctaaaccctgttttggcgccttgcacaattcctaatcacccaactgtctgtattaaatgagaatgtggtagggacacacaatttattagcaagcaaacaa 28980153  T
Q  405 gtctttaatgattcagggtt--atgtagtgcttgggaaaaaatgcagccattattttgaatataaccaatgcagactatctgcataccctacacatcatt 502  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980154 gtctttaatgactcagggttccatgtagtgcttgggaaaaaatgcagccattattttgaatataaccaatggagactatctgcataccctacacatcatt 28980253  T
Q  503 caatgtcatccaattgaagatgtcttgaaacaagccaaacaccttagattaacgagccacattggtattatggtctccattgtgcttactatataaacaa 602  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980254 caatgccatccaattgaagatgtcttgaaacaagccaaacaccttagattaacgagccacattggtattatggtctccattgtgcttactatataaacaa 28980353  T
Q  603 ccatcctttgttatggttagccatgccttcaaaaacacttaaccatttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgag 702  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980354 caatcctttgttatggttagccatgccttcaaaaacacttaaccatttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgag 28980453  T
Q  703 aatgtcgagttcggacaatttcatcatgttt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980454 aatgtcgagttcggacaatttcatcatgttt 28980484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 55293591 - 55293766
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  55293591 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaagcctatttaattaaccctgtt 55293690  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55293691 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 55293766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39094429 - 39094235
Alignment:
Q  7 cataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39094429 cataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatt 39094330  T
Q  107 ttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttat 206  Q
    ||||| ||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  39094329 ttactatatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataattttt 39094244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 29528910 - 29529115
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29528910 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttcttttct 29529009  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29529010 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 29529095  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
     || |||||||||| |||||    
T  29529096 attttctccttaattttact 29529115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 40821913 - 40822093
Alignment:
Q  41 tatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctattt 140  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40821913 tattccttaaagctaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctattt 40822012  T
Q  141 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  40822013 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcaccttaattttact 40822093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 8526996 - 8527177
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8526996 ttatttcttaaagttaacgcggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtt 8527095  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8527096 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaatttttctctttaattttact 8527177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19893336 - 19893542
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19893336 gcactacataaaaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgacctagatttaacctaacttctttgc 19893435  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19893436 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctccta 19893521  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  19893522 atttttctccttaattttact 19893542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35856009 - 35855828
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  35856009 ttatttttgaaagttaacccgaacgcaaaattttgcactagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 35855910  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  35855909 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 35855828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 48519813 - 48520019
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48519813 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacataaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 48519912  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48519913 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaagtcaaaataaacaaatcgctccta 48519998  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  48519999 atttttctctttaattttact 48520019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 26776594 - 26776799
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26776594 cactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaatttttccctagatttaacctaacttctttgct 26776693  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26776694 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 26776779  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  26776780 tttttctccttaattttact 26776799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52843068 - 52842864
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52843068 cactacataaaaa-taatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacttaacttctttgct 52842970  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||||||||||||              | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52842969 taattttactgtattaat--------------cttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 52842884  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  52842883 tttttctccttaattttact 52842864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 29529681 - 29529862
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  29529681 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 29529780  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  29529781 taatttgatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 29529862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 4137560 - 4137766
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4137560 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgcccttgatttaacctaacttctttgc 4137659  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4137660 ttaattttactgtatt--------------aaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgcacata 4137745  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  4137746 atttttctccttaattttact 4137766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 19368262 - 19368443
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  19368262 ttatttcttaaagttaacccagacgcaaaattttaccctagaattaacctaacttctttacttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatatt 19368361  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  19368362 taattttatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 19368443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 55290555 - 55290758
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55290555 cactacataaaaaataacataacagctattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 55290654  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||||                || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55290655 taattttact----------------attaaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgcttctaa 55290738  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  55290739 tttttctccttaattttact 55290758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8396649 - 8396443
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  8396649 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttaaacgcaaaattttgctctagatttaacctaacttctttac 8396550  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  8396549 ttaattttactgtatt--------------aacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttcta 8396464  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8396463 atttttctccttaattttact 8396443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22522150 - 22521931
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattt---cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||      |||||||||    
T  22522150 actacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaaagataacccgaacgcaaaattttgtcctaa------cctaacttc 22522057  T
Q  96 tttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22522056 tttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgc 22521957  T
Q  196 tcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  22521956 tcctaatttttctccataattttact 22521931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35860887 - 35860685
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  35860887 gcactacataaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttcaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacttaacttttttgc 35860788  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35860787 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 35860703  T
Q  201 atttatctccttaatctt 218  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35860702 atttttctccttaatctt 35860685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 19360893 - 19361090
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19360893 cactacataaaaaataacataacaactcttataatatcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccaaagatttaacctaacttctttgct 19360992  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| |||||||||              | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  19360993 taattttattgtattaat--------------cttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaa 19361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9373300 - 9373137
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9373300 cttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacttaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctatttaattt 9373201  T
Q  146 aatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||||||||      |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9373200 aatcaaaatg------ttaattgtttaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaat 9373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 26100937 - 26101111
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  26100937 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgtaaaattttgcccaagatttaacttaacttctttgct 26101036  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaa 190  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26101037 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaa 26101111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53801660 - 53801520
Alignment:
Q  81 atttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatca 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53801660 atttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatca 53801561  T
Q  181 aaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  53801560 aaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttact 53801520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 26101600 - 26101767
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||    
T  26101600 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgctctaaaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa--------------ccctatt 26101685  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  26101686 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttttaatttttctccttaattttact 26101767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53802247 - 53802041
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||    
T  53802247 gcactgcataaaaaataacataacaactattttaatatcttattccttaaagttaattcgaacgcaaaattttgtcatagatttaacataacttctctgc 53802148  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||| ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  53802147 ttaatattactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacata 53802062  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| ||| |||||| |||||    
T  53802061 atttttcttcttaattttact 53802041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36006663 - 36006487
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  36006663 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaatttgtcatagatttaacctagcatctttgcttaattttactatatt-accctatttaattaacccta 36006565  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    | |||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36006564 tctaatttaatcaaaat------gttaattgttatgaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 36006487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39093727 - 39093603
Alignment:
Q  97 ttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgct 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39093727 ttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgct 39093628  T
Q  197 cctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||    
T  39093627 cctaatttttctctttaattttact 39093603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 19361556 - 19361723
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||              |||||||    
T  19361556 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccatagaattaaccaaacttctttgcttaattttaccatattaa--------------ccctatt 19361641  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  19361642 taatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 19361723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9374123 - 9373961
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||              |||||||    
T  9374123 tcttattccttaaagttaatc-gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttattatatt--------------aacccta 9374039  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9374038 tttaatttaatcaaaat------gttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 9373961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 4138621 - 4138729
Alignment:
Q  113 tattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctcctt 212  Q
    |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4138621 tattaaccctatttaattaatcctgtttaatttaatcaaaatgttaatgttaatcgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctcttt 4138720  T
Q  213 aatcttact 221  Q
    ||| |||||    
T  4138721 aattttact 4138729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 51656384 - 51656547
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||              |||||||    
T  51656384 tcttattcgttaaagttaatccgaacacaaaattttgccctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatatt--------------aacccta 51656469  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  51656470 tttaatttaatcaaaat------gttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctccttaattttact 51656547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 147
Target Start/End: Original strand, 14555611 - 14555715
Alignment:
Q  43 tttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaa 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14555611 tttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttattctagatttaacctaacttttttgtttaattttactatattaaccctatttaattaaccttatttaa 14555710  T
Q  143 tttaa 147  Q
    |||||    
T  14555711 tttaa 14555715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9373929 - 9373839
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaacca-gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctattta 127  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  9373929 tcttattccttaaagttaaccccgaatgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattatactatattaatccgattta 9373839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9373620 - 9373537
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9373620 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaaatttcactagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatcc 9373537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46489382 - 46489291
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaac-aaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46489382 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaattaaaatgaactaagtagctcctaatttttctccttaattttact 46489291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Original strand, 16040631 - 16040711
Alignment:
Q  49 aaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16040631 aaagttaacccgtaagcaaaattttgctctaaatttaacctaatttctctacttaattttactatattaatcctatttaat 16040711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 40822145 - 40822253
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || | |||||| || ||||    
T  40822145 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattactcttgtttaattaaaccta 40822244  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  40822245 tttaattta 40822253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53521860 - 53521737
Alignment:
Q  78 taaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||              ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| | |||    
T  53521860 taaatttaacctaacttctttgcttaattttactatatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaat------gttaattgttatggaaa 53521781  T
Q  178 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  53521780 tcgaaataaacaaatcgctcctaatttttttccttaattttact 53521737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 40822305 - 40822413
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||    
T  40822305 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattctatgtttacttttactgtattactcctgtttaattaaaccta 40822404  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  40822405 tttaattta 40822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Original strand, 19367744 - 19367803
Alignment:
Q  162 ttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  19367744 ttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 19367803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 53522096 - 53521986
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat--ttaatcaaccctatttaat 143  Q
    ||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||| || ||||||||||    
T  53522096 cttaaagttaacccgaacgctaattgttaccctaaatttaaccgaaccctattgcttaattttactgtattacccctatatttaattaatcctatttaat 53521997  T
Q  144 ttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||    
T  53521996 ttaatcaaaat 53521986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 53522395 - 53522285
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat--ttaatcaaccctatttaat 143  Q
    ||||||||||||| |||||| || | || ||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||    
T  53522395 cttaaagttaacccgaacgctaattgttaccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtattacccctatatttaattaaccctatttaat 53522296  T
Q  144 ttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||    
T  53522295 ttaatcaaaat 53522285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2741052 - 2740933
Alignment:
Q  247 gagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaaccctgttttggtgccttgcacaatt--cctaatcacc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||   ||||  | |||||||| ||||||||   ||   |||||||||    
T  2741052 gagttaatccctaaccctaattgcatcaagggcccacattatgcttaatctcttttgcctaatacatgttttggcgccttgcaattttgctctaatcacc 2740953  T
Q  345 aaagtgtctgtattaaatga 364  Q
     || ||||||||||||||||    
T  2740952 caactgtctgtattaaatga 2740933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28787327 - 28787276
Alignment:
Q  247 gagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28787327 gagttaatccctaaccctaattgcatcaagggcccacattatgcttaatctc 28787276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 53927633 - 53927522
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacc 134  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || |    
T  53927633 atatcttatttattacagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattttatgcttacttttattgtattacccctgtttaattaaac 53927534  T
Q  135 ctatttaattta 146  Q
    ||||||||||||    
T  53927533 ctatttaattta 53927522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 55369548 - 55369627
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  55369548 tcttatttattaaagttaacctggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtatta 55369627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 38362057 - 38362143
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  38362057 tcttattacttaaagttaatccgtaagcaatattttgccctatatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 38362143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 129
Target Start/End: Original strand, 16046978 - 16047066
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||| || || ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16046978 ttattacttaaagttaacctgtaagcaaaatttttcc-tatatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaat 16047066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 49068021 - 49067908
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  49068021 taatctcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaa 49067922  T
Q  133 ccctatttaattta 146  Q
     |||||| ||||||    
T  49067921 acctattgaattta 49067908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9373819 - 9373771
Alignment:
Q  167 tgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9373819 tgttatgaaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaat 9373771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 53927373 - 53927265
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||| | | |||||| || ||||    
T  53927373 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactattgccctaattttaacataaattatatgcttacttttactgtattaaccatgtttaattaaaccta 53927274  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  53927273 tttaattta 53927265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9374268 - 9374197
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaa-gttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctta 103  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9374268 taatctcttatttcttaaaagttaaccggaatttaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgctta 9374197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9373503 - 9373457
Alignment:
Q  175 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  9373503 aaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaattttact 9373457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 88
Target Start/End: Original strand, 16062531 - 16062581
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacc 88  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  16062531 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaaaattttgccctaaatttaacc 16062581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 38362157 - 38362243
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||  | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  38362157 tcttattacttaaagttaacacgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttattatattaaccctat 38362243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 38362357 - 38362443
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||| |||| ||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  38362357 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttgtcctatatttaccctaatttttctgcttaattttactatattaaccctat 38362443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 40817335 - 40817377
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttat 43  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40817335 gcactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttat 40817377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49453874 - 49453788
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||  |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  49453874 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttttcctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 49453788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 2740831 - 2740734
Alignment:
Q  465 taaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaacaagccaaa-caccttagattaacgagcca 561  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||    
T  2740831 taaccaatgcaaactatctgcatgccctaggtatcattcaatgccatctaagtgaagatgccttcaaacactccaaacctccttagataaacgagcca 2740734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 38362457 - 38362530
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttact 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  38362457 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattctact 38362530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18688558 - 18688526
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18688558 gcactacataaaaaataacataacaactattgt 18688526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36946812 - 36946736
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaat 148  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||| |||||  ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36946812 ttgccctaattttaacctaaattatatgcttatttttactatattacccctgtttaattaaacctatttaatttaat 36946736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 38362257 - 38362337
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||| | |||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  38362257 tcttattacttaaagttaacccgtaagcaatatttagtcctatatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaa 38362337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 49453974 - 49453894
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  49453974 tcttattacttaaagttaacccgtaaacaatattttgtcctaaatttatcctaatttctctgtttaattttactatattaa 49453894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 36946534 - 36946455
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||| |||||    
T  36946534 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatacttacttttactctatta 36946455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 55369703 - 55369782
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  55369703 tcttatttattaaagttaatccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtatta 55369782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36946645 - 36946579
Alignment:
Q  82 tttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaat 148  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36946645 tttaacctaaattctatgcttacttttactctattacccctgtttaattaaacctatttaatttaat 36946579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 16036429 - 16036482
Alignment:
Q  76 cctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16036429 cctagatttaacttaatttctctgcttaattttactatattaaccctatttaat 16036482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28787105 - 28787036
Alignment:
Q  465 taaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaaca 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||    
T  28787105 taaccaatgcaaactatctgcatgccctaggtatcattcaatgccatctaagtgaagatgccttcaaaca 28787036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36006834 - 36006750
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat--ttaatcaaccctatttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||| ||||||||||||     |||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36006834 ttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactatattacccctatatttaattaaccctatttaatttaattaaaat 36006750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 40822642 - 40822715
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattt 145  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||||||||||    
T  40822642 ttgccctaattttaacataaattctatgcttacttttattgtattacccctgtttaattaaacctatttaattt 40822715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 243 - 733
Target Start/End: Original strand, 16683630 - 16684118
Alignment:
Q  243 attagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaaccctgttttggtgccttgcacaattc---ctaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||    
T  16683630 attagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttatgcttaacctccttccactaatccctgttttggcgccttgcacaatttggtctaa 16683729  T
Q  340 tcaccaaagtgtctgtattaaatgagaatgtggtagggacacacaatttattagcaagcaaacaagtctttaatgattcagggtt--atgtagtgcttgg 437  Q
    ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||     |  ||||| ||||| |    
T  16683730 tcacctaactgcctgtattaaatgataatgtgttagggacccacgatgtattagcaagcaaacaggtctttaattattctaccatccatgtaatgcttag 16683829  T
Q  438 gaaaaaatgcagccattattttgaatataaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaacaagc 537  Q
    |||||||||||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||       |||||||||||||||||||||||||  |    
T  16683830 gaaaaaatgcagccgtttttttatgtgtaaccaatgcaaactatttgcatgccctaggcatcatt-------atccaattgaagatgtcttgaaacactc 16683922  T
Q  538 caaacaccttagattaacgagccacattggtattatggtctccattgtgcttactatataaacaaccatcctttgttatggttagccatgccttcaaaaa 637  Q
    ||||||||| |||||||||||||    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16683923 caaacacctcagattaacgagcctttgtgctattatggtctccaatgtgcttactatataaacaaccatcctttgttatggttagccatgccttcaaaaa 16684022  T
Q  638 cacttaaccatttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgagaatgtcgagttcggacaatttcatcatgttt 733  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  16684023 catttaaccattccagttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgagtatctcaagtttggacaatttcatcatgttt 16684118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2182728 - 2182517
Alignment:
Q  10 aaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaatttta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  2182728 aaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttc 2182629  T
Q  110 ctgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2182628 ctgtattaaccctatttaattaactctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 2182529  T
Q  210 cttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||    
T  2182528 cttaattttact 2182517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 33704913 - 33705119
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33704913 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 33705012  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33705013 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctccta 33705098  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  33705099 atttttctccttaattttact 33705119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41693025 - 41692820
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41693025 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 41692926  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41692925 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 41692840  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  41692839 tttatctccttaattttact 41692820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 25695696 - 25695901
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25695696 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 25695795  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25695796 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 25695881  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25695882 tttatctccttaattttact 25695901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34719341 - 34719136
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34719341 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 34719242  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34719241 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 34719156  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34719155 tttatctccttaattttact 34719136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 752999 - 753174
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  752999 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 753098  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  753099 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 753174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 42975549 - 42975753
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42975549 actacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttctttgctt 42975648  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||||| ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42975649 aattttattgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaat 42975734  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  42975735 ttttctccttaattttact 42975753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137379
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  43137204 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 43137303  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43137304 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 43137379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 12419376 - 12419556
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  12419376 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccc-att 12419474  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  12419475 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 12419556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 36884939 - 36885144
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36884939 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 36885038  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36885039 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaaggttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 36885124  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  36885125 tttttctccttaattttact 36885144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 753742 - 753923
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  753742 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 753841  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  753842 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 753923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2181959 - 2181778
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  2181959 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgcttaattttaatgtattaatcctatttaattaatcctgtt 2181860  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  2181859 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttact 2181778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 6304736 - 6304917
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | ||    
T  6304736 ttatttcttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccatatttaattaacattgtt 6304835  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  6304836 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 6304917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 43137836 - 43138017
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  43137836 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaactttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 43137935  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  43137936 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 43138017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 26601481 - 26601661
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  26601481 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaa-ttttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 26601579  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  26601580 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 26601661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30181294 - 30181106
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30181294 cactgcataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 30181195  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30181194 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaattaaacaaatcgctcctaa 30181109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30180539 - 30180365
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||    
T  30180539 ttatttcttaaagttaaccccaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 30180440  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30180439 taacttaaacaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 30180365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34718040 - 34717866
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  34718040 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 34717941  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34717940 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 34717866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 42976839 - 42977020
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  42976839 ttatttcttaaagttataccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 42976938  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  42976939 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 42977020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 3087352 - 3087533
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  3087352 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctggaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccatgtt 3087451  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  3087452 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttggggaaatcaaaataaacaaatcactcttaatttttctctttaattttact 3087533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 17637624 - 17637804
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  17637624 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccattgaattaacctaacttctttgcttaattttact-tattaaccctatttaattaaccctgtt 17637722  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  17637723 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 17637804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 33705571 - 33705752
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||    
T  33705571 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaaatttttccatagattaaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtt 33705670  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  33705671 taatttaatcaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 33705752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43136432 - 43136637
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  43136432 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 43136531  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43136532 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 43136616  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  43136617 atttttctccttaattttact 43136637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 17636844 - 17637049
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  17636844 cactacataaaaaataacatgacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgcccaagatttaacataacttctttgct 17636943  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17636944 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttcgggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 17637029  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  17637030 tttttctccttaattttact 17637049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 34725427 - 34725623
Alignment:
Q  11 aaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725427 aaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacacaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttgcttaattttac 34725526  T
Q  111 tgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctcc 210  Q
    ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  34725527 tgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataatttttctcc 34725612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 34726200 - 34726374
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  34726200 ttaaagttaaaccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgctaaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattta 34726299  T
Q  147 atcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||||    
T  34726300 atcaaaattttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaatttttctctttaattttact 34726374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41691724 - 41691550
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||    
T  41691724 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttgacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 41691625  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41691624 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 41691550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 25696351 - 25696520
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||    
T  25696351 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaaatttgtcctagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 25696450  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25696451 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 25696520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 36885716 - 36885893
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  36885716 ttatttcttaaagttaacc----cggaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 36885811  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  36885812 taatttgatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctctttaattttact 36885893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 42976217 - 42976384
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||    
T  42976217 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa--------------ccctatt 42976302  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  42976303 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 42976384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 752214 - 752432
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttg-c 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |    
T  752214 cactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttaac 752313  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
     ||| ||   ||  |||||  || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  752314 ctaacttatttgc-ttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 752411  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  752412 atttttctccttaattttact 752432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Original strand, 6304045 - 6304167
Alignment:
Q  93 ttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaat 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6304045 ttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaataaat 6304144  T
Q  193 cgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  6304145 cgctcctaatttttctctttaat 6304167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 3086592 - 3086779
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  3086592 cactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgca------------aaatttaacctaacttctttgct 3086679  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3086680 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaat------gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 3086759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 3890316 - 3890422
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||| |||||||    
T  3890316 tcttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttgcttaattttattattttaaccttatttaattaacccta 3890415  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    |||||||    
T  3890416 tttaatt 3890422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38937514 - 38937351
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||              |||||||    
T  38937514 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttacttaattttactatatt--------------aacccta 38937429  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  38937428 tttaatttaatcaaaat------gttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgcccctaatttttctccttaattttact 38937351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16683527 - 16683432
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaa 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16683527 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgcataattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaa 16683432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 27440854 - 27440944
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27440854 aaccctatttaatttaatcaaaatattaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcttaatttttctccttaattttact 27440944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16679960 - 16679864
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16679960 taatctcttattccttaaagttaatatgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaat 16679864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 141
Target Start/End: Original strand, 3890201 - 3890304
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  3890201 tcttattccttaatgttaacccgaacgcaaaattttgctctagatttaacccaaattctttgcttaattttactattttaaccctatttaattaacccta 3890300  T
Q  138 ttta 141  Q
    ||||    
T  3890301 ttta 3890304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16679801 - 16679637
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||              ||    
T  16679801 taatttcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagattttacctaaatcgtttgcttaattttactatatt--------------aa 16679716  T
Q  133 ccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16679715 ccctatttaatttaatcaaaat------gttaattgatgtggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaatct 16679637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39915460 - 39915370
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  39915460 aaccctatttaatttaatcaaaatgctaatgttaattggtagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcctaattttttttcttaattttact 39915370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 41289838 - 41289942
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||| ||||| |    
T  41289838 tcttatttcttaaagttaacc-gaacgtaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactattttaactatatttaattaaccc-a 41289935  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    |||||||    
T  41289936 tttaatt 41289942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30755491 - 30755418
Alignment:
Q  148 tcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  30755491 tcaaaatgttaacgttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 30755418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38096915 - 38096799
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  | | |||||| || ||||    
T  38096915 tcttatctcttaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccatgtttaattaaaccta 38096816  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  38096815 tttaatttaatcaaaat 38096799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 41289948 - 41290039
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41289948 tcttattctttaaagttaacccgaatgcaaatttttgccctatatttaacctaatttctttgcttaattttactattttaaccctatttaat 41290039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16685512 - 16685461
Alignment:
Q  60 gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttact 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16685512 gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaactcctttgcttaattttact 16685461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16679642 - 16679547
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || | |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16679642 taatctcttattccttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaaactta-tcatttgcttaattttactatattaaccctatttaat 16679547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38097054 - 38096953
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||    
T  38097054 ttaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattttatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaacctatttaattta 38096955  T
Q  147 at 148  Q
    ||    
T  38096954 at 38096953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35393582 - 35393466
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||  | | |||||| || | ||    
T  35393582 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttattgtattacccttgtttaattaaacata 35393483  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  35393482 tttaatttaatcaaaat 35393466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35393737 - 35393629
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  35393737 tcttatttattaaatttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 35393638  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  35393637 ttgaattta 35393629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38096769 - 38096653
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||    
T  38096769 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccataattttaacctaaattttatgcttacttttaatgtattacccctgtttaattaaaccta 38096670  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  38096669 tttaatttaatcaaaat 38096653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17547823 - 17547713
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | || | || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  17547823 tcttatttattaaagttaacccggacactaattgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 17547724  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    ||  |||||||    
T  17547723 ttatatttaat 17547713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35394380 - 35394267
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  35394380 taatctcttatctcttatatttaacctggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattattcctgtttaattaa 35394281  T
Q  133 ccctatttaattta 146  Q
     |||||| ||||||    
T  35394280 acctattaaattta 35394267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17547518 - 17547410
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||| |||||  | |||||||| || ||||    
T  17547518 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactatattacccatatttaattaaaccta 17547419  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  17547418 tttaattta 17547410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35394215 - 35394108
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || |  ||||  || |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  35394215 tcttatttattaaagttaacccgaacgctaactggtgccg-aattttaacataaattctatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 35394117  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  35394116 tttaattta 35394108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38939222 - 38939117
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcc--tatttaatcaaccctatttaat 143  Q
    ||||||||||||| |||||  || | |||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||  ||||| || |||||||||||||    
T  38939222 cttaaagttaacccgaacggtaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtattacccctatatttgattaaccctatttaat 38939123  T
Q  144 ttaatc 149  Q
    ||||||    
T  38939122 ttaatc 38939117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16679838 - 16679798
Alignment:
Q  175 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16679838 aaatcaaaataaacaaattgctcctaatttttctccttaat 16679798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41042050 - 41041942
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | | |||||| || ||||    
T  41042050 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttatttttactgtattacccttttttaattaaaccta 41041951  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  41041950 ttgaattta 41041942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 41041879 - 41041800
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  41041879 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtatta 41041800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 5079807 - 5079877
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||    
T  5079807 ttaaagttaatcagaatgcaaaatgttgccctatatttaacctaattttaatggttaattttaatgtatta 5079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 214 - 733
Target Start/End: Original strand, 38641258 - 38641781
Alignment:
Q  214 atcttacttacttaaaat--aagaaaatcttattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaacc 311  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  38641258 atcttacttacttaaaatcaaaggtagtctgattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttatgcttaacctccttccactaatcc 38641357  T
Q  312 ctgttttggtgccttgcacaattc---ctaatcaccaaagtgtctgtattaaatgagaatgtggtagggacacacaatttattagcaagcaaacaagtct 408  Q
    || |||||  |||||||||||||    ||||||||| || || || || ||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  38641358 cttttttgacgccttgcacaatttgctctaatcacctaactgcctatactaaatgataatgtgttagggacccacgatgtattagcaagcaaacaggtct 38641457  T
Q  409 ttaatgattcagggtt--atgtagtgcttgggaaaaaatgcagccattattttgaatataaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaat 506  Q
    ||||| | ||     |  ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  38641458 ttaattactctaccatccatgaaatgcttaggaaaaaatgcagccgtttttttatgtgtaaccaatgcaaactatttgcatgccctaggcatcattcaat 38641557  T
Q  507 gtcatccaattgaagatgtcttgaaacaagccaaacaccttagattaacgagccacattggtattatggtctccattgtgcttactatataaacaaccat 606  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38641558 gccatccaattgaagatgtcttgaaacactccaaacacctcaaattaacgagcctttgtgctattatggtctccaatgtgcttactatataaacaaccat 38641657  T
Q  607 cctttgttatggttagccatgccttcaaaaacacttaaccatttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgagaatg 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  38641658 cctttgttatggttagccatgccttcaa---catttaaccattccagttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttttgagactc 38641754  T
Q  707 tcgagttcggacaatttcatcatgttt 733  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38641755 tcgagtttggacaatttcatcatgttt 38641781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24944291 - 24944511
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24944291 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctttaattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgc 24944390  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24944391 ttaattttacagtactaaccctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataagcaaatcgctccta 24944490  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| | |||||||| |||||    
T  24944491 atttttatccttaattttact 24944511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8532109 - 8531891
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  8532109 actacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccctaaagttaactcgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgttt 8532010  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8532009 aattttattgtattaaccctatttaattaacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataat 8531910  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  8531909 ttttctccttaattttact 8531891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20590178 - 20589997
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  20590178 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 20590079  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20590078 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 20589997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 24944850 - 24945025
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  24944850 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 24944949  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24944950 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 24945025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 39404749 - 39404968
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39404749 gcactacataaaaaataacataacaactattgcaatcttttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaatttctttgc 39404848  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | |||||    
T  39404849 ttaattttactgtattacctctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aataaattgttccta 39404947  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  39404948 atttttctccttaattttact 39404968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 24947566 - 24947747
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  24947566 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctctt 24947665  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  24947666 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttact 24947747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46105381 - 46105200
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  46105381 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 46105282  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  46105281 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 46105200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17741546 - 17741341
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17741546 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaaccggaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgat 17741447  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17741446 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 17741361  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| ||| |||||| |||||    
T  17741360 tttttcttcttaattttact 17741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 39713654 - 39713859
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39713654 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatttggccctagatttaacctaacttctttgct 39713753  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39713754 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 39713839  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  39713840 tttatctccttaattttact 39713859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8988313 - 8988138
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  8988313 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 8988214  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8988213 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 8988138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37351213 - 37351038
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  37351213 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 37351114  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37351113 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 37351038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8987681 - 8987500
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  8987681 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8987582  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8987581 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 8987500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13172829 - 13172627
Alignment:
Q  5 tacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13172829 tacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgcttaa 13172730  T
Q  105 ttttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13172729 ttttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 13172644  T
Q  205 atctccttaatcttact 221  Q
     |||| ||||| |||||    
T  13172643 ttctctttaattttact 13172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24548529 - 24548348
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24548529 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaatctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtt 24548430  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  24548429 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 24548348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37350581 - 37350400
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  37350581 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 37350482  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  37350481 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 37350400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3759163 - 3758958
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3759163 cactaaataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 3759064  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3759063 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 3758978  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  3758977 tttttctccttaattttact 3758958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 36741958 - 36742163
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36741958 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 36742057  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  36742058 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacttctaa 36742143  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  36742144 tttttctccttaattttact 36742163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52802817 - 52802612
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52802817 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccaaacgctaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 52802718  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52802717 taattttacggtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 52802632  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  52802631 tttatctccttaattttact 52802612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2117306 - 2117131
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  2117306 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 2117207  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  2117206 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaat 2117131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12680792 - 12680998
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12680792 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgc 12680891  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  12680892 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgcacgta 12680977  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  12680978 atttttctccttaattttact 12680998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 9888209 - 9888390
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  | ||    
T  9888209 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtt 9888308  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9888309 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 9888390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43023900 - 43023697
Alignment:
Q  10 aaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaatttta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43023900 aaaaaataacataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatatta 43023801  T
Q  110 ctgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||       ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43023800 ctgtattaaccctatttaattaaccctgtttaattt-------atgttaatgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaatttttctc 43023709  T
Q  210 cttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||    
T  43023708 cttaattttact 43023697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52801474 - 52801300
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  52801474 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaatcctgtt 52801375  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52801374 taatttaaataaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 52801300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46106306 - 46106100
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46106306 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacacaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 46106207  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  46106206 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcacacata 46106121  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  46106120 atttttctccttaattttact 46106100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 47556239 - 47556420
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||    
T  47556239 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaaataaccatgtt 47556338  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  47556339 taatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 47556420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8964718 - 8964513
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8964718 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 8964619  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8964618 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 8964534  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8964533 atttttctccttaattttact 8964513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8989085 - 8988880
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8989085 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 8988986  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8988985 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 8988901  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8988900 atttttctccttaattttact 8988880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37351985 - 37351780
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  37351985 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 37351886  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37351885 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 37351801  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  37351800 atttttctccttaattttact 37351780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37356884 - 37356679
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  37356884 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 37356785  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37356784 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 37356700  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  37356699 atttttctccttaattttact 37356679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 50118226 - 50118431
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  50118226 cactatataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaatttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttact 50118325  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50118326 taattttactgtatt--------------aaccctttttaatttaatgaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 50118411  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  50118412 tttttctccttaattttact 50118431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 46419557 - 46419739
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  46419557 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaagttttccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaatcctattcaattaacc-ta 46419655  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  46419656 tttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaatcaacaaatcgctcctaatctttctccttaattttact 46419739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3758494 - 3758313
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  3758494 ttatttcttaaagttaacccggacgtaaaattttgccctagaattaacctaaattttttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 3758395  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  3758394 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 3758313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20590887 - 20590681
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaa-taacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20590887 cactacataaaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaacccgaacgtaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgc 20590788  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20590787 ttaattttactgtatt--------------aactctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttcta 20590702  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  20590701 atttttctccttaattttact 20590681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 39714357 - 39714525
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  39714357 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 39714456  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39714457 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaac-aatcgctcctaatttttctc 39714525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50043221 - 50043016
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  50043221 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 50043122  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  50043121 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aataaatcgctccta 50043037  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  50043036 atttttctccttaattttact 50043016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 50118888 - 50119069
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||| | |     
T  50118888 ttatttcttaaagttaacccggacgccaaattttgccctagaattaacataacttctttgcttaattttaccgtatcaaccctatttaattaaccatgtg 50118987  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  50118988 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 50119069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16904829 - 16904665
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  16904829 ttatttcttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaaccttgtt 16904730  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16904729 taatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcattcctaattt 16904665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24549306 - 24549101
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24549306 cactacataacaaatgacataacaactattataatatcttattccttaaatttaacccgaatgcaaaatttttcccaagatttaacctaacttctttgct 24549207  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||| ||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24549206 taattttactatatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 24549121  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  24549120 tttttctccttaattttact 24549101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 47555583 - 47555788
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  47555583 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttatttgc 47555682  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  47555683 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgtaagggaaat-aaaataaacaaatcgcttcta 47555767  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  47555768 atttttctccttaattttact 47555788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26603582 - 26603405
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  26603582 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaacccta 26603483  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    | ||||||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26603482 tctaatttaatcaaaatg------ttaattgttatggaaatcgaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 26603405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43023135 - 43022967
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  43023135 ttatttcttaaagttaactcgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatattactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 43023036  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||||       ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43023035 taattt-------atgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 43022967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29713708 - 29713510
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29713708 cactacataaaaaataaaataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaacgtaacttctttgct 29713609  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29713608 taattttattgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcctaa 29713524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 39405531 - 39405698
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||              |||||||    
T  39405531 ttatttcttaaagttaacccgaatgcaaaatcttgccctagatttaacctaaattctttgcttaattttactgtattaa--------------ccctatt 39405616  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  39405617 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 39405698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2118074 - 2117868
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | || ||||||| |||||||| |||    
T  2118074 gcactgcataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaattcgaacgcaaaattttgtcatagatttaacataacttctctgc 2117975  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||| ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  2117974 ttaatattactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacata 2117889  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| ||| |||||| |||||    
T  2117888 atttttcttcttaattttact 2117868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 49355261 - 49355435
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattt 145  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| || || | |||||||    
T  49355261 cttaatgttaacccgaacacaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaatttgactatattaaccctaattaattaagccaacttaattt 49355360  T
Q  146 aatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49355361 aatcaaaatgttaatgttaattgttatg-aaatcaaaataaacagatcgctcctaatttttctccttaattttact 49355435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5755454 - 5755276
Alignment:
Q  29 attgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaa 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||              
T  5755454 attgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaattttttccctagatttaacctaacttctttgcttaactttactgtattaa---------- 5755365  T
Q  129 tcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  5755364 ----ccttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 5755276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29713165 - 29712998
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||| ||    
T  29713165 ttatttcttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccatagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaa--------------ccctgtt 29713080  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  29713079 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaatgttact 29712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 42348484 - 42348644
Alignment:
Q  63 cgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgt 162  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42348484 cgcaaaattttgccttagatttaaccgaacttatttgcttaaatttactctattaaccctatttaattaatcatatttaatttaatcaaaatgttaatgt 42348583  T
Q  163 taattgttaggaaaatcaaaataaacaa--atcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42348584 taattgttagggaaatcaaaatgaacaaatatcgctcctaatttttctccttaattttact 42348644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 37061526 - 37061695
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||                
T  37061526 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaatcatatt------------ 37061613  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  37061614 --taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 37061695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 9887428 - 9887641
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttcttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||      
T  9887428 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttaa 9887527  T
Q  100 cttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcct 199  Q
    | |||  ||| |   |||||  || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9887528 cctaa-cttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcct 9887625  T
Q  200 aatttatctccttaat 215  Q
    ||||| |||| |||||    
T  9887626 aatttttctctttaat 9887641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 30527746 - 30527853
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30527746 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 30527845  T
Q  102 taatttta 109  Q
    ||||||||    
T  30527846 taatttta 30527853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43022619 - 43022468
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||| ||    
T  43022619 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtatt--------------aaccctgtt 43022534  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaac-aaatcgctcctaattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43022533 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaaatcgctcctaattt 43022468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 37061735 - 37061901
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacc 134  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||               
T  37061735 atatcttattcctaaaagttaacctgaacgcaaaattttactctagatttaacctaaattctttgcttaattttactatattaatccta----------- 37061823  T
Q  135 ctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37061824 ---tttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttctccttaat 37061901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 42348221 - 42348362
Alignment:
Q  80 aatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  42348221 aatttaacccaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaattaatcatatttaatttaatcaaaatgttaatgttaagtgttagggaaatc 42348320  T
Q  180 aaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42348321 aaaatgaacaaatagctcctaatttttctccttaattttact 42348362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 213
Target Start/End: Original strand, 42349529 - 42349695
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||              ||    
T  42349529 taatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatatt--------------aa 42349614  T
Q  133 ccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctcctta 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  42349615 ccctatttaatttaatcaaaatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctcctta 42349695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 158
Target Start/End: Original strand, 48808351 - 48808471
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  48808351 tcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaatgttgccctaaatttaacctaactttaatgattaattatactgtattagccctatttaattaacccta 48808450  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48808451 tttaatttaatcaaaatgtta 48808471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 48808234 - 48808340
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  48808234 tcttattttttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttagttttattattttaaccctatttaatcaacccta 48808333  T
Q  138 tttaatt 144  Q
     ||||||    
T  48808334 attaatt 48808340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26602813 - 26602650
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||              |||||||    
T  26602813 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttattatatt--------------aacccta 26602728  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||      | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  26602727 tttaatttaatcaaaat------ggtaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctccaaatttttctccttaattttact 26602650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 42348387 - 42348478
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  42348387 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaat 42348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16653079 - 16652986
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaactt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16653079 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaactt 16652986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 54866762 - 54866853
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54866762 tcttattccttaaagctaatccgaacgcaaaattttggcttagatttaacctaatttctttgcttaattttactatattaatcctatttaat 54866853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 42348112 - 42348194
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  42348112 ttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttacttaaatttactatattaaccctatttaat 42348194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 8120421 - 8120494
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttact 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120421 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaagattttgacatagatttaacctaacttctttgcttaattttact 8120494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Original strand, 8120224 - 8120334
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcc--tatttaatcaaccctatttaat 143  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||| ||||||    
T  8120224 cttaaagttaacccgaacgctaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtattacccctatatttaattaaccctgtttaat 8120323  T
Q  144 ttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||    
T  8120324 ttaatcaaaat 8120334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Original strand, 16639676 - 16639727
Alignment:
Q  247 gagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16639676 gagttaatccctaaccctaattgcatcaagggcccacattatgcttaatctc 16639727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 1325554 - 1325640
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  1325554 tcttattacttaaagttaacccgcaaacaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 1325640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11659373 - 11659265
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||  |||    
T  11659373 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccctctttaattaaatcta 11659274  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  11659273 ttgaattta 11659265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 54242940 - 54243048
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||  |||||| || ||||    
T  54242940 tcttatttattaaagttaacccagacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttatttttactgtattacccccgtttaattaaaccta 54243039  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  54243040 ttgaattta 54243048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Original strand, 54866865 - 54866925
Alignment:
Q  161 gttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  54866865 gttaattgttatgaaaatcaaaatgaacaaatcactcataatttttctccttaattttact 54866925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Original strand, 8120128 - 8120199
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  8120128 cttaaagttaaccagaacgctaattgttgccctagatttaacctaaccctaatgcttaattttactgtatta 8120199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 54242785 - 54242895
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaac-cagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccct 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | | |||||| || |||    
T  54242785 tcttatttattaaagttaactcaga-cgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccatgtttaattaaacct 54242883  T
Q  137 atttaatttaat 148  Q
    ||||||||||||    
T  54242884 atttaatttaat 54242895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 24527973 - 24528059
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | | |||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  24527973 tcttattacttaatgttaacacgtaagcaatattttgccttagatttaacctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24528059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 5759226 - 5759194
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5759226 gcactacataaaaaataacataacaactattgt 5759194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 23980173 - 23980253
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    |||||||  |||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  23980173 tcttattagttaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctacttaattttactatattaa 23980253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Original strand, 24527911 - 24527971
Alignment:
Q  64 gcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  24527911 gcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 24527971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Original strand, 24527565 - 24527648
Alignment:
Q  36 tatcttatttcttaaa-gttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  24527565 tatcttattacttaaaagttaacccgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttttctgcttaattttactatattaa 24527648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11654509 - 11654403
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | || | || | || |||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||   ||||||||| || ||||    
T  11654509 tcttatttattaaagttaacccggaccctaactgtttccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacctctatttaattaaaccta 11654410  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    || ||||    
T  11654409 ttgaatt 11654403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Original strand, 8119797 - 8119874
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  || | ||||||||| |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||    
T  8119797 ttatttattaaagttaaccagaatgttaattgttgccctaactttaacctaaattcaatgcttgcttttactgtatta 8119874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 49752445 - 49752392
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49752445 tcttatttattaaagttaacccgaatgtaaaatgttgccctagatttaacctaa 49752392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 251 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21680374 - 21679886
Alignment:
Q  251 taatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaaccctgttttggtgcct-tgcacaattcctaatcaccaaagt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||| || |    
T  21680374 taatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgattaaactactgccactaaacccttatttggcgcctaaccacaattcctaatcacccaact 21680275  T
Q  350 gtctgtattaaatga-gaatgtggtagggacacacaatttattagcaagcaaacaagtctttaatgattcagggtt--atgtagtgcttggg-aaaaaat 445  Q
     | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| ||||||     
T  21680274 ctgtgtattaaatgagggttatggtagggacacacaatgtatcagcaagcaaacaactctttaatgactcagggttcaatttggttcttgggaaaaaaaa 21680175  T
Q  446 gcagccattattttgaatataaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaacaagccaaacacc 545  Q
    || ||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |  || ||||    
T  21680174 gccgccgtttttttg---ataaccaatgcagactatctgcataccctatgcatcattcaatgccatccaattgaagctttcttgagacacgtgaagcacc 21680078  T
Q  546 ttagattaacgagccacattggtattatggtctccattgt-gcttactatataaacaaccatcctttgttatggttagccatgccttcaaaaacacttaa 644  Q
    | | ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |    
T  21680077 tcatattaacgagccacaacggtgttatggtctgcattgtcgcgcggtatataaataatcatcctttgttatggttagccatgccttcaacctcacttta 21679978  T
Q  645 ---ccatttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgagaatgtcgagttcggacaatttcatcatgttt 733  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21679977 gttttttttcatttgtctgtattcatttgtctaagtaagttttggtccataactttctgagaatgtcgagtttggacagtttcatcatgttt 21679886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16302025 - 16301806
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16302025 cactacataaaaaacaacataacaactattgtaatatcttgttccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaatcaaacttctttgct 16301926  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16301925 taattttactgtattaaccctatttaattaaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgccccaaa 16301826  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||  ||||| |||||    
T  16301825 tttttctttttaattttact 16301806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 19320579 - 19320784
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19320579 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 19320678  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19320679 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 19320764  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19320765 tttatctccttaattttact 19320784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 19321236 - 19321417
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  19321236 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 19321335  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  19321336 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 19321417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4893851 - 4893646
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4893851 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 4893752  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4893751 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 4893666  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4893665 tttatctccttaattttact 4893646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 29184636 - 29184841
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29184636 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 29184735  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29184736 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 29184821  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  29184822 tttatctccttaattttact 29184841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28572258 - 28572083
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  28572258 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 28572159  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28572158 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 28572083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16301398 - 16301217
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  16301398 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 16301299  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  16301298 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctttttaattttact 16301217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33363454 - 33363256
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33363454 actacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgctt 33363355  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    |||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33363354 aattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctaat 33363269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47137742 - 47137536
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47137742 gcactacataaaaaataacataataactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 47137643  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
     |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47137642 ctaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctccta 47137557  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  47137556 atttttctccttaattttact 47137536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28571515 - 28571334
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  28571515 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 28571416  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  28571415 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 28571334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50562514 - 50562333
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  50562514 ttatttcttaaagttaacccgaacacaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccttgtt 50562415  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  50562414 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgtttggtaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 50562333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 22198182 - 22198363
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  22198182 ttatttcttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 22198281  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  22198282 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttact 22198363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 46623535 - 46623740
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  46623535 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaacctaacttctttgct 46623634  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| |||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  46623635 taattttattgtattaat--------------cctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggagatcaaaataaacaaatcgcttctaa 46623720  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  46623721 tttttctccttaattttact 46623740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38896697 - 38896493
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38896697 actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaaattaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgctt 38896598  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38896597 aattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaat 38896512  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  38896511 ttttctccttaattttact 38896493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4892550 - 4892376
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  4892550 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 4892451  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4892450 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 4892376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 29185937 - 29186111
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  29185937 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 29186036  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29186037 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 29186111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 33074933 - 33075114
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  33074933 ttatttcttaaagttaacatgaatgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 33075032  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  33075033 taatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttact 33075114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1827560 - 1827379
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  1827560 ttatttcttaaagttaacccgaatccaaaaaatttccctagatttaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 1827461  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1827460 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 1827379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22194625 - 22194827
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22194625 gcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacacaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgc 22194724  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22194725 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 22194809  T
Q  201 atttatctccttaatctt 218  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22194810 atttttctccttaatctt 22194827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33362153 - 33361979
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||    
T  33362153 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttagttaatcctgtt 33362054  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33362053 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 33361979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 51964622 - 51964820
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51964622 cactacataaaaaataacataacaattattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaaggcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgct 51964721  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51964722 taattttattgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttagg-aaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 51964806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5428198 - 5427993
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||    
T  5428198 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaattcgaacgtaaaattttgccatagatttaacataatttctctgct 5428099  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  5428098 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 5428013  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  5428012 tttttctccttaattttact 5427993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50563355 - 50563150
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  50563355 cactacataaaaactaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgtaaaattttgacctagatttaacctaacttctttgtt 50563256  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||    
T  50563255 taattttactgtatt--------------aaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatttctcttaa 50563170  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  50563169 tttttctccttaattttact 50563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1375866 - 1375667
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1375866 gcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccaaacacaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgc 1375767  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1375766 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 1375682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33074389 - 33074588
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33074389 gcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgc 33074488  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  33074489 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccaa 33074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1828322 - 1828117
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1828322 gcactgcataaaaaataacataataattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaattttccctagatttaacctaacttctttgc 1828223  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1828222 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 1828138  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| | |||||||| |||||    
T  1828137 atttttatccttaattttact 1828117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52312099 - 52311901
Alignment:
Q  9 taaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaatttt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312099 taaaaaataacataacaactattgtaatttcttattctttaaagttaacccaaatgcaaaattttgccctagatttaaactaacttctttgcttaatttt 52312000  T
Q  109 actgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatct 208  Q
     |||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  52311999 cctgtatt--------------aaccttatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgcacctaatttttct 52311914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52311294 - 52311119
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  52311294 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 52311195  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||| || |||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  52311194 taatttaatcaatatattaacgt------ttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatctttctctttaattttact 52311119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28950797 - 28950641
Alignment:
Q  66 aaaattttgccctaaatttaacctaactt-ctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28950797 aaaattttgccttaaatttaacataactttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctacttaatttaatcaaaatgttaaagtta 28950698  T
Q  165 attgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  28950697 attgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattgttttccttaattttact 28950641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47136974 - 47136813
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||    
T  47136974 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtatt--------------aaccctatt 47136889  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  47136888 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 47136813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5427428 - 5427261
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||| ||    
T  5427428 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttattgtattaa--------------ccctgtt 5427343  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  5427342 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 5427261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 8256444 - 8256620
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  8256444 tcttatttcttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatatatttaacctagcttctttgcttaattttactatatt-accctatttaattaacccta 8256542  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  8256543 tttaatttaatcaaaat------gttaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttccctttaattttact 8256620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28573043 - 28572825
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttg-c 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |    
T  28573043 cactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttaac 28572944  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
     ||| ||   ||  |||||  || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28572943 ctaacttatttgc-ttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 28572846  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  28572845 atttttctccttaattttact 28572825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 46624303 - 46624470
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||              |||||||    
T  46624303 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaatctaacttctttgcttaattttaccgtgttaa--------------ccctatt 46624388  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  46624389 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 46624470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38895920 - 38895753
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||              | |||||    
T  38895920 ttatttcttaaagttaacccagacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttacttaattttattgtattaa--------------cactatt 38895835  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  38895834 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 38895753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49586931 - 49586841
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  49586931 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgttcctagtttttctctttaattttact 49586841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24289359 - 24289452
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaactt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24289359 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaactt 24289452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 21056084 - 21056246
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||               |||||    
T  21056084 tcttattccttacaattaacccgaacgcaaaattttaccatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatatta---------------cccta 21056168  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21056169 tttaatttaatcaaaatgtta------attgttatggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 21056246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 33373567 - 33373657
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  33373567 aaccctacttaatttaatgaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcttaatttttctccttaattttact 33373657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20130780 - 20130697
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20130780 cttaaagttaacccaaacgcaaaattttgcgttggatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaatcctatttaat 20130697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 111
Target Start/End: Original strand, 35593623 - 35593699
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttact 111  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35593623 atatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaacttctttccttaattttact 35593699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 35598756 - 35598825
Alignment:
Q  60 gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35598756 gaacacaaaattttgtcttagatttaacctaacttatttgcttaattttactatattaaccctatttaat 35598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 158
Target Start/End: Original strand, 9754165 - 9754284
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  9754165 tcttattccttaaggttaatccgaatgcagaatgttgtcctagatttaacctaaatttaatgattaattttactatattacccctatttaattaacccta 9754264  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  9754265 ttt-atttaatcaaaatgtta 9754284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18851592 - 18851541
Alignment:
Q  247 gagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18851592 gagttaatccctaaccctaattgcatcaagggcccacattatgcttaatctc 18851541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20089449 - 20089396
Alignment:
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20089449 ttaattttactgtattatccctgtttaattaaccctatttaatttaatcaaaat 20089396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 35599347 - 35599416
Alignment:
Q  60 gaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  35599347 gaacgcaaaattttacattagatttaacctaatttctttgcttaattttattatattaaccctatttaat 35599416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 50278377 - 50278429
Alignment:
Q  39 cttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50278377 cttatttattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctagatttaacctaa 50278429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 164
Target Start/End: Original strand, 24289489 - 24289522
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24289489 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtta 24289522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Original strand, 8256241 - 8256357
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat--ttaatcaacccta 137  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || || | ||||| || |||||| |||||     |||||||||||||| |||||  |||||  ||||| ||| |||    
T  8256241 ttatttattaaagttaacccgaatgctaattgttgccttagatttaatctaaccctaatgcttaattttactatattacccctatatttaattaactcta 8256340  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  8256341 tttaatttaatcaaaat 8256357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18851371 - 18851302
Alignment:
Q  465 taaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaaca 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||    
T  18851371 taaccaatgcaaactatctgcatgccctaggtatcattcaatgccatctaagtgaagatgccttcaaaca 18851302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 129
Target Start/End: Original strand, 24289468 - 24289501
Alignment:
Q  96 tttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24289468 tttgcttaattttactgtattaaccctatttaat 24289501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41978743 - 41978523
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  41978743 gcactacataaaaaattacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacacagaattttgccctaattttaacctaacttcttcgc 41978644  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41978643 ttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcata 41978544  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  41978543 atttttctctttaattttact 41978523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 18375716 - 18375915
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18375716 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 18375815  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18375816 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 18375901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 4465281 - 4465462
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  4465281 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 4465380  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  4465381 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttact 4465462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12761349 - 12761168
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  12761349 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttgtttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 12761250  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  12761249 taatttaattaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 12761168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36778363 - 36778158
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36778363 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 36778264  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36778263 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 36778178  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  36778177 tttttctccttaattttact 36778158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1944301 - 1944126
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1944301 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctatt 1944202  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1944201 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaat 1944126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 8161328 - 8161503
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  8161328 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 8161427  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8161428 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 8161503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8762125 - 8761950
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  8762125 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 8762026  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8762025 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 8761950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 25834927 - 25835102
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  25834927 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 25835026  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25835027 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 25835102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 8162071 - 8162252
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  8162071 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8162170  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8162171 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 8162252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8761493 - 8761312
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  8761493 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 8761394  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8761393 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 8761312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 25835559 - 25835740
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  25835559 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 25835658  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  25835659 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 25835740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9474006 - 9473801
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9474006 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 9473907  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9473906 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 9473821  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  9473820 tttttctccttaattttact 9473801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25361398 - 25361193
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25361398 cactacataaaaaataacataacaactgttctaatatcttattccttaaagttaacccgaaggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttctttgct 25361299  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25361298 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 25361213  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  25361212 tttttctccttaattttact 25361193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1943558 - 1943377
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  1943558 ttatttcttaaagttaacccgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 1943459  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1943458 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 1943377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7390429 - 7390248
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  7390429 ttatttcttaaagttaacccgaatgaaaagttttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 7390330  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  7390329 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcataatttttctctttaattttact 7390248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24055723 - 24055518
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24055723 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 24055624  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24055623 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 24055538  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  24055537 tttttctccttaattttact 24055518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 44381597 - 44381777
Alignment:
Q  41 tatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctattt 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  44381597 tatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaacctgttt 44381696  T
Q  141 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  44381697 aatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggatatcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctccttaattttact 44381777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32845688 - 32845513
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  32845688 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaaccttatttctttgcttaattttactgtagtaaccctatttaattaaccctgtt 32845589  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32845588 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 32845513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32844944 - 32844762
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  32844944 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 32844845  T
Q  140 taatttaatc-aaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  32844844 taatttaatcaaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 32844762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7391202 - 7390996
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7391202 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccatagatttaacttaacttctttgc 7391103  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  7391102 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgcacata 7391017  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  7391016 atttttctccttaattttact 7390996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32846321 - 32846140
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  32846321 ttattttttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 32846222  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  32846221 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttttctttaattttact 32846140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36777700 - 36777519
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  36777700 ttatttcttaaagttaactcggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 36777601  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  36777600 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 36777519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 42244494 - 42244699
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  42244494 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccggaacgtaaaattttacccaagatttaacctaacttctttgct 42244593  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42244594 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgtcaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 42244679  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  42244680 tttttctccttaattttact 42244699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 44380871 - 44381076
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  44380871 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctctagatttaacctaacttttttgct 44380970  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44380971 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatcaaactaaacaaatcgctcctaa 44381056  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  44381057 tttttctccttaattttact 44381076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 40586601 - 40586805
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40586601 actacatgaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgctt 40586700  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40586701 aattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgcttctaat 40586786  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  40586787 ttttctccttaattttact 40586805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8762897 - 8762692
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8762897 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 8762798  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8762797 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 8762713  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8762712 atttttctccttaattttact 8762692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 41531927 - 41532132
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531927 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 41532026  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||| ||||||              |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41532027 ttaattttattgtatt--------------aaccttatttaatttaattaaaatgtaaacgttaattgttagggaaatcaacataaa-aaatcgctccta 41532111  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  41532112 atttttctccttaattttact 41532132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 41532643 - 41532824
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  41532643 ttatttcttaaaattaacccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttttttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 41532742  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  41532743 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgtttctaatttttctctttaattttact 41532824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41158528 - 41158325
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41158528 gcactacataaaaaacaacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 41158429  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||||| |||              |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41158428 ttaattttactgcatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatg--aacgttaatt-ttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcata 41158346  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  41158345 atttttctccttaattttact 41158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1945072 - 1944867
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  1945072 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 1944973  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  1944972 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaa-aaatcgttccta 1944888  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  1944887 atttttctccttaattttact 1944867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9473344 - 9473163
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  9473344 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacttaacttctttgcttaattttattgtattaaccctatttaattaaccatgtt 9473245  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9473244 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttcgggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaatttttctctttaattttact 9473163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25345878 - 25345672
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25345878 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttgaagttaatctgaacacaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 25345779  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||    
T  25345778 ttaattttactgtatt--------------aacactatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcaaata 25345693  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    | || |||||||||| |||||    
T  25345692 aattttctccttaattttact 25345672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25834155 - 25834360
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  25834155 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 25834254  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||||| |||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25834255 ttaattttactgcatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 25834339  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  25834340 atttttctccttaattttact 25834360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41157761 - 41157589
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41157761 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttaccctaaatttaacctaacttcttt---------tactgtattaactctatttaattaaccctatt 41157671  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  41157670 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 41157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 25618658 - 25618863
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25618658 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaattcaaatgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 25618757  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  25618758 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtaaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataa 25618843  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  25618844 tttttctccttaattttact 25618863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 4464512 - 4464718
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||    
T  4464512 gcactgcataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattccttaaagttaattcgaacgtaaaattttgccatagatttaacataacttctctgc 4464611  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4464612 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattggtagggaaatcaaaataaacaaatcgcacata 4464697  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  4464698 atttttctccttaattttact 4464718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 221
Target Start/End: Original strand, 25619604 - 25619771
Alignment:
Q  53 ttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaa 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  25619604 ttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttatttgcttaagtttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatc-ga 25619702  T
Q  153 atgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  25619703 atgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 25619771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8160577 - 8160780
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8160577 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttgc 8160676  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||  | |||              |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8160677 ttaatttta--gcatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 8160759  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8160760 atttttctccttaattttact 8160780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32847080 - 32846952
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  32847080 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaactcgaaagcaaaaattttccctagatttaacctaacttatttgc 32846981  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32846980 ttaattttactgtattaaccctatttaat 32846952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34894262 - 34894088
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||                  
T  34894262 taatctcttattccttaaagttaaaccgaacgcaaaattttgccttaaatttaacctaatttccttgcttaaatttactatattaa-------------- 34894177  T
Q  133 ccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  34894176 cactatttaatttaatcaaaatcttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaacaaatcgctcataatttttctccttaattttact 34894088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34894926 - 34894775
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  34894926 ttaaagttaacccgaaagtaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgtttaaatttactatattaaccctatttaattaatcatatttaattta 34894827  T
Q  147 atcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    |||||||||      |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34894826 atcaaaatg------ttaattgttatggaaatcaaaatgaacaaattgctcctaattt 34894775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34894667 - 34894571
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  34894667 taatctcttattccttaaagttaacctgaacgtaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaaatttactatattaaccctatttaat 34894571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 129
Target Start/End: Original strand, 37588310 - 37588406
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37588310 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgccaaattttgccctagatttaacctaactcctttgcttaattttactatattaaccctatttaat 37588406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Original strand, 37588144 - 37588315
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||    
T  37588144 tcttattcattaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaactcattttcttaattttactatattaaccatatttaattaa-ccta 37588242  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatct 217  Q
    |||||||| ||||||||      |||||||| |  | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37588243 tttaatttgatcaaaat------gttaattggtgtggaaatcaaaatgaacaaatcgc-cctaatttttctccttaatct 37588315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34894359 - 34894275
Alignment:
Q  136 tatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34894359 tatttaatttaatcaaaattttaatgttaattgttagggaaatcaaaatgaac-aatcgctcctaatttttctccttaattttact 34894275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Original strand, 44428432 - 44428537
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    ||||||| |||| ||| |||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  44428432 ttaaagtcaacccgaatgcaagattttgtcctagatt--acctaacttctttgcttaattttactatattaaccatatttaattaaccatatttaattta 44428529  T
Q  147 atcaaaat 154  Q
    ||||||||    
T  44428530 atcaaaat 44428537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38295387 - 38295309
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38295387 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaagtaaacaattcgctcctaatttttctccttaat 38295309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18493270 - 18493154
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||||    
T  18493270 tcttattccttaaagttattccgaacgctaaatgttgtcttagatttaacctaactttgatgattaattttactatattacccctgtttaattaacccta 18493171  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||| ||||||||||    
T  18493170 tttaatctaatcaaaat 18493154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41843929 - 41843821
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  41843929 tcttatttattaaaattaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 41843830  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  41843829 ttgaattta 41843821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41844082 - 41843974
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||   || |||||| || ||||||    
T  41844082 ttatttattaaagttaacccgaacggtaactgttgccctaattttaacctaaattctatgtttacttttactgtattacctctgtttaattaaacctatt 41843983  T
Q  140 taatttaat 148  Q
    |||||||||    
T  41843982 taatttaat 41843974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38295465 - 38295375
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | |||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38295465 tcttattccttaaa-ttaacccgaaagtaaaattgtgtcttagatttaacctaacttctttgctgaattttactatattaaccctatttaat 38295375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16914075 - 16913968
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || | ||    
T  16914075 tcttatttattaaagttaaccgga-cgctaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaacata 16913977  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  16913976 tttaattta 16913968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29129254 - 29129209
Alignment:
Q  251 taatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatc 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29129254 taatccctaaccttaattgcagcaagagcccactttatgcttaatc 29129209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41844249 - 41844173
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaat 148  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||  | | |||||| || |||||||||||||||    
T  41844249 ttgccctaattttaatctaaattctatgcttacttttactgtattacccatgtttaattaaacctatttaatttaat 41844173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 37588040 - 37588131
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| | || |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  37588040 tcttattcattaaagttaatccgaacgtaaaattttgtcatagatttaacctaactctttttcttaattttattatattaaccttatttaat 37588131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 44428771 - 44428862
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | | || |||||| | || ||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44428771 tcttattacttaaagttaacccgtaagtaatattttgtcttagatttaccttaatttctctgcttaattttactatattaattctatttaat 44428862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32846933 - 32846888
Alignment:
Q  175 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32846933 aaatcaaaataa-caaatcgctcctaatttttctccttaattttact 32846888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 34894565 - 34894508
Alignment:
Q  63 cgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatc 120  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  34894565 cgcaaaattttgccttacaattaacccaacttcttcgcttaaatttactatattaatc 34894508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 37587961 - 37588034
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttact 111  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  37587961 tcttattcattaaagttaacccgaacgtaaaattttaccttagatgtaacctaactctttttcttaattttact 37588034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14832936 - 14832716
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  14832936 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgacatagatttaacctaacttttttgc 14832837  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  14832836 ttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtttgggaaattaaaataaacaaatcgctccta 14832737  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  14832736 atttttctctttaattttact 14832716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4109169 - 4108988
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  4109169 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 4109070  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4109069 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 4108988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1222267 - 1222068
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1222267 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 1222168  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1222167 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 1222082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 9978867 - 9979072
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9978867 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgaaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 9978966  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9978967 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 9979052  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  9979053 tttttctccttaattttact 9979072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 4896772 - 4896953
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  4896772 ttatttcttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 4896871  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  4896872 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttact 4896953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 33320362 - 33320543
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||    
T  33320362 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattgaccctatttaattaactctgtt 33320461  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  33320462 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttact 33320543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24447678 - 24447473
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24447678 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttact 24447579  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24447578 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 24447493  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24447492 tttatctccttaattttact 24447473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35159302 - 35159121
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||    
T  35159302 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgacctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatttactctgtt 35159203  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  35159202 taatttaatcaaaatgttaacgttaatttttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 35159121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 15043986 - 15044190
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15043986 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttctttgct 15044085  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |    
T  15044086 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatagctcctga 15044171  T
Q  202 tttatctccttaatcttac 220  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  15044172 tttttctccttaattttac 15044190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 9735855 - 9736060
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9735855 cactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaaccctaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 9735954  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||| ||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9735955 taattttactatatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 9736040  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  9736041 tttttctccttaattttact 9736060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24446377 - 24446203
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  24446377 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 24446278  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24446277 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 24446203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 6966396 - 6966601
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6966396 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgct 6966495  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||| |||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6966496 taattgtactgtatt--------------aaccccatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 6966581  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  6966582 tttttctccttaattttact 6966601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18320610 - 18320430
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18320610 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatttcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 18320511  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgct 196  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18320510 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgct 18320430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1220970 - 1220796
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  1220970 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 1220871  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1220870 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 1220796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4109939 - 4109734
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4109939 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttcattgct 4109840  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||| |||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  4109839 taactttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacataa 4109754  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  4109753 tttttctccttaattttact 4109734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35160002 - 35159799
Alignment:
Q  6 acataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattt--cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctta 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35160002 acataaaaaataacatatcaactattgtaatctcttatattccttaaagttaactcaatcgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttactta 35159903  T
Q  104 attttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatt 203  Q
     |||||||||||              ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35159902 gttttactgtat--------------caaccctatttaatttaatgaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatt 35159817  T
Q  204 tatctccttaatcttact 221  Q
    | |||||||||| |||||    
T  35159816 tttctccttaattttact 35159799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4896119 - 4896318
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| |    
T  4896119 gcaccacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccttagatttaacctaacttctttac 4896218  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  4896219 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacagatcgctccta 4896303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 4621320 - 4621496
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  4621320 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaatttttgtcatagatttaacctagcttctttgcttaattttactatatt-accctatttaattaacccta 4621418  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||       |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  4621419 tttaatttaatcaaaat------attaattgttatggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 4621496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 33319729 - 33319831
Alignment:
Q  6 acataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaat 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33319729 acataaaaaataacatatcaattattgtaatctcttattccttaaagttaactcaatcgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgcttagt 33319828  T
Q  106 ttt 108  Q
    |||    
T  33319829 ttt 33319831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31426311 - 31426210
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgc-cctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattt 145  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31426311 ttaaaattaatctgaacgcaaaattttgatcctaaatttaacataacttctttgcttaattttactatattaatcatatttaattaaccctatttaattt 31426212  T
Q  146 aa 147  Q
    ||    
T  31426211 aa 31426210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21059368 - 21059293
Alignment:
Q  146 aatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21059368 aatcaaaatgttaatgtaaactgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 21059293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 33319846 - 33319916
Alignment:
Q  151 aaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  33319846 aaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcataatttttctccttaattttact 33319916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21078609 - 21078541
Alignment:
Q  146 aatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21078609 aatcaaaatgttaatgtaaattgttaaggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaa 21078541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 158
Target Start/End: Original strand, 31497194 - 31497251
Alignment:
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31497194 ttaatttaactgtattactcctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 31497251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Original strand, 31502584 - 31502637
Alignment:
Q  105 ttttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31502584 ttttactgtattactcgtatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgtta 31502637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21055567 - 21055521
Alignment:
Q  175 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21055567 aaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 21055521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Original strand, 31491805 - 31491858
Alignment:
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaat 154  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31491805 ttaatttaactgtattactcctatttaattaaccctatttaatttaaccaaaat 31491858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26899901 - 26899782
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||| ||||| || | |||||| ||||| |||| ||   || |||||| || |    
T  26899901 atatcttatttattaaagttaacccgaacgttaagtgttgccctaattttatcctaaattttatgcttacttttattgtactacctctgtttaattaaac 26899802  T
Q  135 ctatttaatttaatcaaaat 154  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26899801 atatttaatttaatcaaaat 26899782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21855352 - 21855243
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||||  || | |||||| |||||||||||| | ||| |||||| || ||||    
T  21855352 tcttatttattaaagttaacccggtcgctaactattgccctaattttaacctacattatatgcttacttttactgtatt-accctgtttaattaaaccta 21855254  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    |||||||||||    
T  21855253 tttaatttaat 21855243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28079048 - 28078962
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| ||||||||||| | | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  28079048 tcttattacttaaagttaatctgtaagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgtttaattttactatattaaccctat 28078962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19990015 - 19989962
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19990015 tcttattccttaaagttaatctgaacgcaaaattttgcccttgatttaacctaa 19989962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26899752 - 26899644
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | | || || | ||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||| | || ||||    
T  26899752 tcttatttattaaagttaacccggatgctaactgttgccctaattttagcctaaattctatgcttacttttactgtattacacctgtttatttaaaccta 26899653  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  26899652 ttgaattta 26899644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21855506 - 21855399
Alignment:
Q  39 cttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctat 138  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  || | ||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || |||||    
T  21855506 cttatttattaaagttaacccgaacgttaattgttgccataattttaacctaaattttatgcttacttttattgtattacccctgtttaattaaacctat 21855407  T
Q  139 ttaattta 146  Q
    | ||||||    
T  21855406 tgaattta 21855399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26900107 - 26899997
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||  || | ||||||||| ||||| |||| || | |||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||  |||    
T  26900107 tcttatttattaaaattaatctgaacgttaactgttgccctaattttaatctaaattatatgcttatttttactatattacccctatttaattaaatcta 26900008  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    |||||||||||    
T  26900007 tttaatttaat 26899997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21855189 - 21855112
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||| |||||||||||| | |||  || | ||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  21855189 ttatttattaaagttaacccggacgttaactattgccttaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtatta 21855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 32675901 - 32676114
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  32675901 gcactacataaaaaataacataacaattattgcaatatcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccttacatttaacctaacttctttgc 32676000  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32676001 ttaattttactgtattacccctatttaataaaccctatttaatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaattaaaat-aacaaatcgctccta 32676099  T
Q  201 atttatctccttaat 215  Q
    |||| ||||||||||    
T  32676100 atttttctccttaat 32676114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 4289186 - 4289391
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4289186 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 4289285  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4289286 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 4289371  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4289372 tttatctccttaattttact 4289391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28609060 - 28608886
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  28609060 ttatttcttaaagtaaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 28608961  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28608960 taatttaatcaaaatgttaacgttaattattaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 28608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42781786 - 42781605
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  42781786 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctataattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaaccctgtt 42781687  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  42781686 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 42781605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 1513689 - 1513870
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  1513689 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttatttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 1513788  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1513789 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcggtcctaatttttctctttaattttact 1513870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 32676463 - 32676644
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  32676463 ttatttcttaaagttaacctgaacgcaaaattttgccctagatgtaacctaacttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 32676562  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  32676563 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttcactttaattttact 32676644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 18091530 - 18091711
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  18091530 ttatttcttaaagttaacccgaatgcaaaattttgccctagatttaacataacttcttttcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 18091629  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18091630 taatttaatcaaaatattaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 18091711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28609837 - 28609610
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattt---cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaact 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||     |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28609837 gcactacataaaaaataacataaccactattatatatcttatcttattattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaact 28609738  T
Q  94 tctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatc 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  28609737 tctttgcttaattttactatattaaccctatttaattatccctgtttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatt 28609638  T
Q  194 gctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| |||||    
T  28609637 gcttctaatttttctctttaattttact 28609610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6931244 - 6931063
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||  | ||    
T  6931244 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgcttaattttaatgtattaactctatttaattaactttgtt 6931145  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  6931144 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 6931063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19487380 - 19487199
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19487380 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaatcaaccctgtt 19487281  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  19487280 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaataaatcgctcctaatttttatctttaattttact 19487199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 4290485 - 4290659
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  4290485 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 4290584  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4290585 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 4290659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19488157 - 19487955
Alignment:
Q  5 tacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19488157 tacataaaaaataacataacaactattataatagcttattccttaaagttaacccaaacgtaaaattttgcccaaaatttaacctaacttcttttcttaa 19488058  T
Q  105 ttttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19488057 ttttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaattt 19487972  T
Q  205 atctccttaatcttact 221  Q
     |||||||||| |||||    
T  19487971 ttctccttaattttact 19487955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Original strand, 9543452 - 9543616
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  9543452 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttaatgtattaaccctatttaattaatcctgtt 9543551  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543552 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagtgaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 9543616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 18090771 - 18090976
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttg-ccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18090771 actacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccctagatttaacctaacttctttgct 18090870  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  18090871 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatctcttttaa 18090956  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||| ||||| |||||    
T  18090957 tttttctctttaattttact 18090976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42782557 - 42782352
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  42782557 cactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccataaagttaacccgaacgcaaaattttacccaagatttaacctaacttctttgct 42782458  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42782457 taattttattgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 42782372  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  42782371 tttttctccttaattttact 42782352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 19485117 - 19485298
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  19485117 ttatttcttaaagttataccggacgcaaaatttttccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 19485216  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||    
T  19485217 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctgctaatttttctctttaattttact 19485298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 25235107 - 25235290
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  25235107 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacttaacttctttgtttaattttactatattaaccctatttaattaacccta 25235206  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  25235207 cttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaataaaaataaaaaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 25235290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 9542788 - 9542974
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9542788 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 9542887  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9542888 taattttacggtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttcacattaatttttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 9542973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 10874557 - 10874762
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  10874557 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccaaacacaaatttttgctcaagatttaacctaacttctttgct 10874656  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||    
T  10874657 taattttattgtatt--------------aagcctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggagatcaaaataaacaaatcgtttctaa 10874742  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  10874743 tttttctccttaattttact 10874762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 44940665 - 44940838
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||    
T  44940665 tcttattccttaaagttaacc----cgcaaaattttgccatagatttaacctaacttctttgcttaattttacgatattaaccctatttaattaacctta 44940760  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  44940761 tttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgttcctaacttttctctttaat 44940838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17838358 - 17838159
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  17838358 gcactacataaaaaataacataacaattattgcagtctcttattcgttaaagttaacccgaacacaaaattttacgctagatttaacctaacttctttgc 17838259  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17838258 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 17838174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6931788 - 6931585
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||    
T  6931788 actacataaaaaataacataacaattatt-taatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaatttagtcattgatttaacctaacttctttgctt 6931690  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||| ||||||||||              || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6931689 aatttgactgtattaa--------------ccatatttaatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 6931604  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  6931603 ttttctccttaattttact 6931585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 10875338 - 10875505
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||    
T  10875338 ttatttcttaaagttaatccggacgcaaaattttgccctagaattcacctaacttctttgcttaattttactgtattaa--------------ccctatt 10875423  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  10875424 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 10875505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Original strand, 1501622 - 1501727
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  1501622 taatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaa 1501721  T
Q  133 ccctat 138  Q
    ||||||    
T  1501722 ccctat 1501727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 1501514 - 1501626
Alignment:
Q  18 acataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1501514 acataacaactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaatgcaaaattttgccctagatttaacttaacttttttgcttaattttactgtatta 1501613  T
Q  118 atcctatttaatc 130  Q
    | |||||||||||    
T  1501614 accctatttaatc 1501626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8909899 - 8909774
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||   || ||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  8909899 taatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatgttgctctagatttaacctaactttaatgattaattttattgtattacccctatttaattaa 8909800  T
Q  133 ccctatttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8909799 ccctatttaatttaatcaaaatgtta 8909774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 221
Target Start/End: Original strand, 1513139 - 1513223
Alignment:
Q  138 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgtta-ggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1513139 tttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccttaattttact 1513223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 25234787 - 25234893
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  25234787 tcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttcttttcttcattttactattttaaccatatttaattaacccta 25234886  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    |||||||    
T  25234887 tttaatt 25234893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 25234570 - 25234676
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  25234570 tcttattctttaaagttaacctgaatgcaaaattttgtcctaaatttaacctaacttcttttcttcattttactattttaaccatatttaattaacccta 25234669  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    |||||||    
T  25234670 tttaatt 25234676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Original strand, 25234997 - 25235101
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  25234997 tcttattccttaaagttaacc-gaacgcaaaattttgctatagatttaacctaacttctttgcttaa-tttactattttaaccttatttaattaacccta 25235094  T
Q  138 tttaatt 144  Q
    |||||||    
T  25235095 tttaatt 25235101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 38328106 - 38328222
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||  ||| |||||| || ||||    
T  38328106 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttactttcactgtattacccctgtttaattaaaccta 38328205  T
Q  138 tttaatttaatcaaaat 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  38328206 tttaatttaatcaaaat 38328222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15783525 - 15783438
Alignment:
Q  134 cctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  15783525 cctatttaatttaatcaaaatattaatgttaattattagggaaatcaaaatgaacaaattgcttctaatttttctccttaattttact 15783438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 25234472 - 25234563
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25234472 tcttattccttaaagttaacctgaacgcaaaattttgtcctagatttaacgtaatttatttgcttaattttactattttaaccctatttaat 25234563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 38328963 - 38329084
Alignment:
Q  33 taatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa 132  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  38328963 taatctcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaa 38329062  T
Q  133 ccctatttaatttaatcaaaat 154  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  38329063 acctatttaatttaatcaaaat 38329084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 129
Target Start/End: Original strand, 25234684 - 25234773
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25234684 ttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcatagatttaacctaacttctttcctgaattttactattttaaccctatttaat 25234773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39087726 - 39087616
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  | | |||||| || ||||    
T  39087726 tcttatttattaaagttaacccgaacgttaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccatgtttaattaaaccta 39087627  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    || ||||||||    
T  39087626 ttgaatttaat 39087616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 129
Target Start/End: Original strand, 25234901 - 25234990
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  25234901 ttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttatcatagatttaacctaacttctttgttgaattttactattttaaccctatttaat 25234990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39087890 - 39087780
Alignment:
Q  36 tatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccc 135  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||   || | ||||| ||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  39087890 tatcttatttattaaagttaacccggacattaactgttgccttaattttaacataaattctatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaacc 39087791  T
Q  136 tatttaattta 146  Q
    |||||||||||    
T  39087790 tatttaattta 39087780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 38328560 - 38328657
Alignment:
Q  47 ttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatt 144  Q
    |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||    
T  38328560 ttaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaacctatttaatt 38328657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 38328252 - 38328360
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | | |||||| || ||||    
T  38328252 tcttatttgttaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatgtgcttacttttactgtattacccatgtttaattaaaccta 38328351  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  38328352 tttaattta 38328360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 693013 - 692922
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||   || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  693013 tcttattccttaaagttaatctgaacgttaaatgttgccctagatttaacctaattttaatgattaattttactgtattacccctatttaat 692922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 38328706 - 38328814
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||  ||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||  || ||||||| || ||||    
T  38328706 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgctttaattttaacctaaattctatgcttacttttattgtattaccccaatttaattaaaccta 38328805  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  38328806 tttaattta 38328814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21797377 - 21797308
Alignment:
Q  465 taaccaatgcagactatctgcataccctacacatcattcaatgtcatccaattgaagatgtcttgaaaca 534  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||    
T  21797377 taaccaatgcaaactatctgcatgccctaggtatcattcaatgccatctaagtgaagatgccttcaaaca 21797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17172777 - 17172572
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17172777 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 17172678  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17172677 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 17172592  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17172591 tttatctccttaattttact 17172572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9151303 - 9151097
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9151303 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttaatacttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgc 9151204  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9151203 ttaattttactgtatt--------------aactctatttaatttaatcaaaatgttaacgtttattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctccta 9151118  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  9151117 atttttctccttaattttact 9151097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 48527570 - 48527775
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48527570 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 48527669  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48527670 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 48527755  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  48527756 tttatctccttaattttact 48527775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 27733112 - 27733317
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27733112 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatcttttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 27733211  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27733212 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaattaaaataaacaaatcgcttctaa 27733297  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  27733298 tttttctccttaattttact 27733317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 31896972 - 31897177
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31896972 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttttttgct 31897071  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| ||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31897072 taattttacagtagt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 31897157  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  31897158 tttatctccttaattttact 31897177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 35155647 - 35155852
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  35155647 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttggt 35155746  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35155747 taattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 35155832  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  35155833 tttttctccttaattttact 35155852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44806461 - 44806256
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44806461 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 44806362  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44806361 taattttaatgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacattaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 44806276  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  44806275 tttttctccttaattttact 44806256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 7855901 - 7856082
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||    
T  7855901 ttatttcttaaagttaacctggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaacattgtt 7856000  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  7856001 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 7856082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 24683950 - 24684119
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || ||    
T  24683950 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacactgtt 24684049  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24684050 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 24684119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44805689 - 44805515
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  44805689 ttattttttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 44805590  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44805589 taatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 44805515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 49145089 - 49145273
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatca---accct 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||    
T  49145089 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaattaccct 49145188  T
Q  137 atttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  49145189 gtttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttacggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 49145273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4849563 - 4849382
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  4849563 ttatttcttaaagttaacccaaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttttagtattaaccctatttaattaaccctgtt 4849464  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  4849463 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 4849382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29468558 - 29468377
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  29468558 ttatttcttaaagttaacctgaacgcaaaattttaccctagatgtaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 29468459  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  29468458 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaaaaaatcgctcctaatttttcactttaattttact 29468377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 7855122 - 7855327
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  7855122 cactacataacaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaacctaacttctttgct 7855221  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||||| ||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7855222 taattttactatatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 7855307  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  7855308 tttttctccttaattttact 7855327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 220
Target Start/End: Original strand, 21669390 - 21669594
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  21669390 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttcttttct 21669489  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  21669490 taattttattgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatagctcctga 21669575  T
Q  202 tttatctccttaatcttac 220  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  21669576 tttttctccttaattttac 21669594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 39648140 - 39648328
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39648140 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 39648239  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39648240 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaaagttaattgttagggaaatcaaattaaacaaatcgctcctaa 39648325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17171476 - 17171302
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  17171476 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 17171377  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17171376 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 17171302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 39648784 - 39648958
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||    
T  39648784 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 39648883  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39648884 taacttaaacaaaatgttaacgttaattattagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 39648958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 691172 - 690966
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  691172 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacttgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttac 691073  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  691072 ttaattttactgtatt--------------aacccaatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaattgcttcta 690987  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  690986 atttttctccttaattttact 690966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34873703 - 34873498
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  34873703 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgctcaagatttaacctaacttctttgct 34873604  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34873603 taattttattgtatt--------------aaccatatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaacaaacaaatcgcttctaa 34873518  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  34873517 tttttctccttaattttact 34873498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9150755 - 9150575
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  9150755 ttatttcttaaagttaacccaaacgcaaaattttaccctagatttaaa-taacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 9150657  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9150656 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctctttaattttact 9150575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 31897625 - 31897794
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||    
T  31897625 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcatgtt 31897724  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctc 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31897725 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctc 31897794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4850330 - 4850126
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4850330 actacataaaaaataacataataactattgtaatatcatattccctaaagttaatccgaacgcaaaattttgccctatatttaacctaacttctttgctt 4850231  T
Q  103 aattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaat 202  Q
    ||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||     
T  4850230 aattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcacataaa 4850145  T
Q  203 ttatctccttaatcttact 221  Q
    || |||||||||| |||||    
T  4850144 ttttctccttaattttact 4850126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29469102 - 29468903
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29469102 gcactacataaaaaataacataacaattattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaacacaaaattttaccctagatttaacctaacttctttgc 29469003  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29469002 ttaattttactgtatt--------------acccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctccta 29468918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 35156333 - 35156490
Alignment:
Q  64 gcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgtt 163  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35156333 gcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctgtttaatttgatcaaaatgttaacgtt 35156432  T
Q  164 aattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  35156433 aattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgatcctaatttttctctttaattttact 35156490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 49144192 - 49144390
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  49144192 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttaccctagatttaacctaatttatttgc 49144291  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  49144292 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacata 49144377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 33637584 - 33637759
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||    
T  33637584 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaatttctttgtttaattttactgtattaaccctatttaattaactctgtt 33637683  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatc-aaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  33637684 taatttaatcaaaatattaacgttaatttttagggaaatcaaaaataaacaaat-gctcctaatttttctctttaat 33637759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 11835119 - 11835338
Alignment:
Q  3 actacataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattt---cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttc 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||    ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||      |||||||||    
T  11835119 actacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaacgataacccgaacgcaaaattttgtcctaa------cctaacttc 11835212  T
Q  96 tttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11835213 tttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgc 11835312  T
Q  196 tcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  11835313 tcctaatttttctccataattttact 11835338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39278117 - 39277929
Alignment:
Q  18 acataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  39278117 acataaaaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctggatttaacctaacttcttttcttaattttactgtatt- 39278019  T
Q  118 atcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatct 217  Q
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |    
T  39278018 -------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatagctcctgatttttctccttaattt 39277932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 215
Target Start/End: Original strand, 24683245 - 24683382
Alignment:
Q  78 taaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaa 177  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24683245 taaaattaaccttatttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaa 24683344  T
Q  178 tcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  24683345 tcaaaataaacaaatcgctcttaatttttctctttaat 24683382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34872923 - 34872756
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||    
T  34872923 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccctagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa--------------ccctatt 34872838  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  34872837 taagttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 34872756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Original strand, 21598111 - 21598306
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaa----tatcttattt---cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaactt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||    ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||      ||||||||    
T  21598111 cactacataaaaaataacataacaactattatatatcttatcttattattccttaacgataacccgaacgcaaaattttgtcctaa------cctaactt 21598204  T
Q  95 ctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21598205 ctttgcttaattttactgtattaaccctattaaatcatccatatttaatttaattaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcg 21598304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 167
Target Start/End: Original strand, 49144961 - 49145088
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  49144961 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccttagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 49145060  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaatt 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  49145061 taatttaatcaaaatgttaatgttaatt 49145088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24682435 - 24682654
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttg- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||      
T  24682435 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttaa 24682534  T
Q  100 cttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcct 199  Q
    | ||| ||   ||  |||||  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24682535 cctaacttatttgc-ttaattttactgtattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaa-aaatcgttcct 24682632  T
Q  200 aatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  24682633 aatttttctccttaattttact 24682654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Original strand, 27733880 - 27734041
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||| ||    
T  27733880 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatatatttaacctaacttttttgcttaattttactgtatt--------------aaccctgtt 27733965  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27733966 taatttattcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatctctcctaatttttctctttaat 27734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7619640 - 7619558
Alignment:
Q  247 gagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaaccctgttttggtgccttgca 329  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  7619640 gagttaatccttaaccctaactgcagcaagggcccacattatgcttaatctcttttgcctaaaccctgttttggcgccttgca 7619558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Original strand, 19327247 - 19327329
Alignment:
Q  46 cttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  19327247 cttaaagttaacc-gaacgcaaaattttgccataaatttaagctaatttttttgcttaattttagtattttaaccctatttaat 19327329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 204
Target Start/End: Original strand, 35074761 - 35074876
Alignment:
Q  88 ctaacttctttgcttaattttactgtattaa--tcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaata 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||   ||   || ||||||||||| |||||||||||||    
T  35074761 ctaatttctttgcttaattttactatattaatctcttatttaattaaccctattgaatttactc---atcaaaatgttaattgttatgaaaatcaaaata 35074857  T
Q  186 aacaaatcgctcctaattt 204  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  35074858 aatcaatcgctcctaattt 35074876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 33637032 - 33637076
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttattt 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33637032 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattt 33637076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34406835 - 34406727
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||  || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  34406835 tcttatttattaaagttaactcggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattaactctgtttaattaaaccta 34406736  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  34406735 tttaattta 34406727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Original strand, 15236310 - 15236420
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | || | || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  15236310 tcttatttattaaagttaacccggacactaattgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 15236409  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    ||  |||||||    
T  15236410 ttatatttaat 15236420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Original strand, 15236614 - 15236722
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||| |||||  | |||||||| || ||||    
T  15236614 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattatatgcttacttttactatattacccatatttaattaaaccta 15236713  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  15236714 tttaattta 15236722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 15236493 - 15236567
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||    
T  15236493 ttgccctaattttaacctaaaatctatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaacctatttaattta 15236567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Original strand, 32200184 - 32200237
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  32200184 tcttatttattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgcgctagatttaacctaa 32200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Original strand, 32200408 - 32200461
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32200408 tcttatttattaaagttaacccgaatgcaaaatgttgccctagatttaacctaa 32200461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Original strand, 32200788 - 32200841
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32200788 tcttatgtattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctatatttaacctaa 32200841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Original strand, 32200990 - 32201043
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  32200990 tcttatttattaaagttaacccgaacgcaaaatgttgccctagatttaatctaa 32201043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2733708 - 2733600
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||| ||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||  ||| |||||| || ||||    
T  2733708 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgttgccttaattttaacctaaattctatgcttgtttttactgtattacccctgtttaattaaaccta 2733609  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  2733608 ttgaattta 2733600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2734164 - 2734056
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||   || |||||| || ||||    
T  2734164 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactattgccctaattttaacctaaattttatgcttacttttactgtattacctctgtttaattaaaccta 2734065  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  2734064 ttgaattta 2734056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2734465 - 2734357
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||  || | ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || ||||    
T  2734465 tcttacttattaaagttaacccggacgttaactgttgccctaattttaacctaaattttatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaaccta 2734366  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    || ||||||    
T  2734365 ttgaattta 2734357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Original strand, 29953957 - 29954045
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaa 128  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || || | ||||||||| |||||||||| |||  |||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  29953957 ttatttattaaagttaatcagaaggctaattgttgccctaattttaacctaaattcagtgcttgcttttactgtattatccctatttaa 29954045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 16717853 - 16717932
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  16717853 tcttatttattaaagttaacccggacgttaattgttgccctaattttaatctaaattctatgcttacttttactgtatta 16717932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 17692063 - 17692142
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | ||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  17692063 tcttatttattaaagttaacccggacgttaattgttgccctaattttaatctaaattctatgcttacttttactgtatta 17692142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 16718072 - 16718146
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||   || |||||| || |||||| ||||||    
T  16718072 ttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacgtctgtttaattaaacctattgaattta 16718146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Original strand, 17692282 - 17692356
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||   || |||||| || |||||| ||||||    
T  17692282 ttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacgtctgtttaattaaacctattgaattta 17692356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2733828 - 2733755
Alignment:
Q  73 tgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  | | ||| || || |||||||||||||    
T  2733828 tgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccatgttttattaaacctatttaattta 2733755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 26185 - 26384
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26185 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 26284  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26285 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 26370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14531 - 14332
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14531 cactacataaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgct 14432  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    ||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14431 taattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 14346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2127 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold2127
Description:

Target: scaffold2127; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 816 - 641
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  816 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacataacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaaccatgtt 717  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  716 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaatataaacaaatcgctcctaatttttctctttaat 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 232423 - 232249
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  232423 ttatttcttaaagtaaacctgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttccttgcttaatttgactgtattaaccctatttaattaaccctgtt 232324  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  232323 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 232249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 233057 - 232881
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  233057 ttattccttaaagttaacccgaacgcaaaaattttctctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctattaaattatccctatt 232958  T
Q  140 taatttaatc-aaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  232957 taatttaatcaaaaatgttaatgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctccataat 232881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 139458 - 139349
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  139458 cactacataaaaaataacataacaactattataatatcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgcccaagatttaacctaacttctttgct 139359  T
Q  102 taattttact 111  Q
    ||||||||||    
T  139358 taattttact 139349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 139349 - 139267
Alignment:
Q  139 ttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  139349 ttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaatttttctccttaattttact 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 233108 - 233078
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactatt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233108 gcactacataaaaaataacataacaactatt 233078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 8334 - 8539
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8334 cactacataaaaaataacataacaactgttataatatcttatttcttaaagttaacccgaaggcaaaattttgcccaaaatttaacctaacttctttgct 8433  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8434 taattttattgtatt--------------aaccctattaaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgcttctaa 8519  T
Q  202 tttatctccttaatcttact 221  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  8520 tttttctccttaattttact 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 8986 - 9171
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaa----ccc 135  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||     
T  8986 ttatttcttaaagttaacccggacgcaaaattttgccttagaattaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaattaattaacca 9085  T
Q  136 tatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9086 tgtttaatttgatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatatctcctaatttttctctttaattttact 9171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10154
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  | ||    
T  10335 ttatttcttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctagatttaacctaacttctttgcttaatcttactgtattaaccatatttaattaacattgtt 10236  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  10235 taatttaatcaaaatgttaactttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 10154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11116 - 10903
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttcttt-g 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||      
T  11116 gcactacataaaaaataacataataactattgcaatctcttattccttaaagttaacccgaaagcaaaatttttccctagatttaacctaacttatttaa 11017  T
Q  100 cttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcct 199  Q
    | |||  ||| |   |||||  || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11016 cctaa-cttatttgcttaattttactgcattaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttagttgttagggaaatcaaaat-aacaaatcgctcct 10919  T
Q  200 aatttatctccttaat 215  Q
    ||||| |||| |||||    
T  10918 aatttttctctttaat 10903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14896 - 14690
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14896 gcactacataaaaaataacataacaactattgttatctcttattccttaaagttaacccaaacgtaaaaattttccctagatttaagctaacttctttgc 14797  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14796 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 14711  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  14710 atttttctccttaattttact 14690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3856 - 3689
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| ||    
T  3856 ttatttcttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatt--------------aaccctgtt 3771  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  3770 taatttaaacaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttact 3689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11596 - 11429
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| ||    
T  11596 ttatttcttaaggttaacccgaacgcaaaatttttccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtatt--------------aaccctgtt 11511  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  11510 taatttaaacaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctgtttaattttact 11429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 214
Target Start/End: Original strand, 18217 - 18391
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  18217 ttatttcttaaagttaacccgaactcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattaatcctgtt 18316  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaa 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18317 taatttaaataaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaa 18391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 17559 - 17765
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaa-taacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  17559 cactacataaaaaaataatataacaactattgtaatctcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccatagatttaatctaacttctttgc 17658  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    |||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17659 ttaattttacagtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaatagacaaatcgctccta 17744  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  17745 atttatctccttaattttact 17765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 55443 - 55237
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  55443 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaatataatattccttaaagttaatccgaacgcaaaattttgtcctagatttaacctaacttctttgc 55344  T
Q  101 ttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctccta 200  Q
    ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  55343 ttaattttactgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcacacata 55258  T
Q  201 atttatctccttaatcttact 221  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  55257 atttttctccttaattttact 55237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Original strand, 3765 - 3929
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||    
T  3765 ttatttcataaagttaacccgaacgcaaaattttgtgctagatttaacctaacttctttgcttaattttactatattaaccctatttaattaaccctgtt 3864  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3865 taatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaattt 3929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 3003 - 3191
Alignment:
Q  2 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3003 cactacataaaaaataacataacaactattgtaatctcttattctttaaagttaacccgaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaatttctatgct 3102  T
Q  102 taattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 201  Q
    |||||||| ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3103 taattttattgtatt--------------aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgctacggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaa 3188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10395
Alignment:
Q  161 gttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  10335 gttaattgttagggaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Original strand, 9524 - 9705
Alignment:
Q  40 ttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatt 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||    
T  9524 ttatttcttaaagttaacctgaatgcaaaaattttcccaggatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaaccctatttaattatccatgtt 9623  T
Q  140 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  9624 taatttaatcaaaatgttaacgttaattgttagggaaaaataaataaacaaatcgctcctaatttttctctttaattttact 9705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Original strand, 8864 - 8954
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaatcttact 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  8864 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaatgttaattgttagagaaatcaaaataaacaaatcactcctaatttttctccttaattttact 8954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 29193 - 29361
Alignment:
Q  214 atcttacttacttaaaat--aagaaaatcttattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaacc 311  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29193 atcttacttacttaaaatctaagacagtctgattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttatgcttaatctccttccactaatcc 29292  T
Q  312 ctgttttggtgccttgcacaatt--cctaatcaccaaagtgtctgtattaaatgagaatgtggtaggga 378  Q
    || |||||| |||||||||||||   ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29293 cttttttggcgccttgcacaattgctctaatcacccaactgtatgtattaaatgagaatgtgttaggga 29361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 378
Target Start/End: Original strand, 28986 - 29153
Alignment:
Q  214 atcttacttacttaaaat--aagaaaatcttattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttttgcttaatctccttccactaaacc 311  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  28986 atcttacttacttaaaatttaaggcagtctgattagagttaatccctaaccctaattgcagcaagggcccactttatgcttaatctccttccac-aatcc 29084  T
Q  312 ctgttttggtgccttgcacaatt--cctaatcaccaaagtgtctgtattaaatgagaatgtggtaggga 378  Q
    || |||||| |||||||||||||   ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29085 cttttttggcgccttgcacaattgctctaatcacccaactgtatgtattaaatgagaatgtgttaggga 29153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5610 - 5490
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  5610 tcttattccttaaagttaacccgaacgcaaaatattgccctagatttaacctaactttaatgattaattttactgtattacccatatttaattaacccta 5511  T
Q  138 tttaatttaatcaaaatgtta 158  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5510 attaatttaatcaaaatgtta 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5669 - 5616
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaa 91  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  5669 tcttattccttaaagttaactcgaacgcaaaatgttgccctagatttaatctaa 5616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 8)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 302 - 213
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  302 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4622 - 4533
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4622 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4303 - 4217
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  4303 tcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgtttaattttactatattaaccctat 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4407 - 4317
Alignment:
Q  35 atatcttatt-tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4407 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4095 - 4014
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaat 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  4095 tcttattacttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccttaatttctctgcttaatttaactatattaat 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 3
Alignment:
Q  35 atatcttatt-tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  87 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 184 - 105
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  184 tcttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4425
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4504 tcttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 14)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 249
Alignment:
Q  35 atatcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  338 atatcttattacttaaaattaacccgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 118
Target Start/End: Original strand, 22141 - 22225
Alignment:
Q  35 atatcttatt-tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||    
T  22141 atatcttattatcttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaacctaatttatctgcttaattatactatattaa 22225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 21936 - 22015
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21936 tcttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 22015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 22448 - 22523
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatc 120  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22448 tcttaaagttaacctgttagcaatattttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaatc 22523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 123 - 33
Alignment:
Q  35 atatcttatt-tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  123 atatcttattatcttaaagttaacccgtaaccaatatttttccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 33  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 118
Target Start/End: Original strand, 20673 - 20746
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20673 tcttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaa 20746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 220 - 141
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  220 tcttaaagttaacccgtcagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 120
Target Start/End: Original strand, 20805 - 20856
Alignment:
Q  69 attttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20805 attttgccctagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaatc 20856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 21202 - 21277
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatc 120  Q
    |||||||||||||  | | |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21202 tcttaaagttaacatgtaagcaacattttgccctagatttaccctaatttctctgtttaattttactatattaatc 21277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 21520 - 21599
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    |||||||||||||  | | |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21520 tcttaaagttaacatgtaagcaatattttgccctagatttaccataatttctctgcttaattttactatattaaccctat 21599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 20558 - 20644
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| |||||| |||||  | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  20558 tcttattacttaaaattaactcgtacgcaatattttgccatagatttaccctaatttcgctgcttaattttactatattaaccctat 20644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 21821 - 21907
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||| |||||| |||||| | || ||| |||||| | || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21821 tcttattacttaaaattaacccgtacacaatattttggcatagatttaccctaatttctctgcttaattttactatattaaccctat 21907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Original strand, 20884 - 20973
Alignment:
Q  36 tatcttatt-tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctat 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  20884 tatcttattatcttaaagttaactcgtaagcaatatttttccctagatttaacctaatttatctgcttaattatactatattaaccctat 20973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 118
Target Start/End: Original strand, 21628 - 21701
Alignment:
Q  45 tcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaa 118  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||| ||| |||| ||||||    
T  21628 tcttaaagttaacctgtaagcaatattttgccctagatttaacctaatttatctgctttattatactatattaa 21701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13515 - 13407
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||| || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| || |||     
T  13515 tcttatttattaaagttaacccagacgctaactattgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattacccctgtttaattaaacctt 13416  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  13415 tttaattta 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13677 - 13569
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || | ||| | ||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||    
T  13677 tcttatttattaaagttaacccggacgctaactgttgtcttaattttaacctaaattttatgcttacttttactgtattacccctatttaattaaaccta 13578  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  13577 tttaattta 13569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13825 - 13717
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | || | || | ||| ||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||   || |||||| || ||||    
T  13825 tcttatttattaaagttaacccggacactaactgttgtcctaattttaacctaaattttatgcttacttttactgtattacctctgtttaattaaaccta 13726  T
Q  138 tttaattta 146  Q
    |||||||||    
T  13725 tttaattta 13717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 751 - 673
Alignment:
Q  131 aaccctatttaatttaatcaaaatgttaacgttaattgttaggaaaatcaaaataaacaaatcgctcctaatttatctccttaat 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  751 aaccntatttaatttaatcaaaatgttaa------ttgttatggaaatcaaagtaaacaattcgctcctaatttttctccttaat 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0759 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 3582 - 3617
Alignment:
Q  1 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaat 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3582 gcactacataaaaaataacataacaactattgtaat 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9734 - 9624
Alignment:
Q  38 tcttatttcttaaagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaacccta 137  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  || | | | ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||    
T  9734 tcttatttattaaagttaacccggacgttaactgtagtcctaattttaacctaaattctatgcttacttttaatgtattacccctgtttaattaaaccta 9635  T
Q  138 tttaatttaat 148  Q
    |||||||||||    
T  9634 tttaatttaat 9624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9855 - 9781
Alignment:
Q  72 ttgccctaaatttaacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaatcaaccctatttaattta 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  | | |||||| || |||||||||||||    
T  9855 ttgccctaattttaacctaaattctatgcttacttttactgtattagccgtgtttaattaaacctatttaattta 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 201011 - 200930
Alignment:
Q  50 aagttaaccagaacgcaaaattttgccctaaattt--aacctaacttctttgcttaattttactgtattaatcctatttaat 129  Q
    ||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  201011 aagttaacccgtaagcaatattttaccctaaatttttaacttaatttctttgcttaattttactatattaaccctatttaat 200930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University