View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12539_low_10 (Length: 250)

Name: NF12539_low_10
Description: NF12539
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12539_low_10
NF12539_low_10
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-250)||(559-808)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (1-250)||(3069-3318)
scaffold0079 (5-250)||(35849-36094)
scaffold0079 (17-250)||(28429-28662)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-250)||(24567-24816)
scaffold0104 (28-250)||(44148-44370)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (1-250)||(15100291-15100540)
chr7 (2-250)||(12458952-12459200)
chr7 (1-250)||(13023669-13023918)
chr7 (1-246)||(16948160-16948405)
chr7 (1-250)||(14261933-14262182)
chr7 (1-249)||(13966356-13966604)
chr7 (1-250)||(13675764-13676012)
chr7 (9-222)||(12799239-12799452)
chr7 (5-250)||(11386121-11386366)
chr7 (1-250)||(16069985-16070234)
chr7 (1-249)||(26092486-26092734)
chr7 (1-232)||(21754742-21754973)
chr7 (1-249)||(26116278-26116526)
chr7 (1-249)||(49154614-49154862)
chr7 (5-250)||(14139991-14140236)
chr7 (1-249)||(11300901-11301149)
chr7 (23-250)||(19614987-19615214)
chr7 (1-250)||(12204488-12204737)
chr7 (5-243)||(15342750-15342988)
chr7 (5-250)||(14284066-14284313)
chr7 (5-250)||(11234927-11235172)
chr7 (5-249)||(11550816-11551060)
chr7 (5-248)||(18180058-18180301)
chr7 (5-250)||(13688352-13688597)
chr7 (5-250)||(14956865-14957110)
chr7 (5-250)||(18051645-18051890)
chr7 (1-249)||(11770112-11770360)
chr7 (5-248)||(16727097-16727340)
chr7 (5-248)||(17704169-17704412)
chr7 (5-250)||(8709916-8710161)
chr7 (5-250)||(14334707-14334952)
chr7 (5-250)||(15158771-15159016)
chr7 (5-250)||(18587885-18588130)
chr7 (1-250)||(44789061-44789310)
chr7 (1-249)||(14042007-14042255)
chr7 (1-249)||(14352037-14352285)
chr7 (5-250)||(10873001-10873246)
chr7 (17-250)||(12689813-12690046)
chr7 (1-249)||(48812962-48813210)
chr7 (3-249)||(15626837-15627083)
chr7 (5-248)||(9590681-9590924)
chr7 (5-153)||(14150149-14150297)
chr7 (1-249)||(15146594-15146842)
chr7 (113-250)||(15172-15309)
chr7 (79-249)||(7826212-7826382)
chr7 (79-249)||(27105562-27105732)
chr7 (79-249)||(27172593-27172763)
chr7 (79-180)||(13379264-13379365)
chr7 (1-30)||(12799189-12799218)
chr7 (71-179)||(13458417-13458525)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (1-250)||(10466695-10466944)
chr6 (1-246)||(19455213-19455458)
chr6 (1-249)||(14377762-14378010)
chr6 (1-249)||(24366599-24366847)
chr6 (1-250)||(24516260-24516503)
chr6 (1-250)||(18796876-18797125)
chr6 (1-250)||(19437188-19437437)
chr6 (5-250)||(19866873-19867118)
chr6 (11-243)||(21567847-21568079)
chr6 (1-249)||(21473787-21474035)
chr6 (1-250)||(8761598-8761847)
chr6 (1-250)||(25770030-25770279)
chr6 (5-250)||(21755119-21755363)
chr6 (5-250)||(2872653-2872898)
chr6 (5-250)||(25114738-25114983)
chr6 (5-250)||(27563683-27563928)
chr6 (12-250)||(22436055-22436293)
chr6 (5-250)||(22828205-22828450)
chr6 (71-249)||(14379382-14379560)
chr6 (5-250)||(16574076-16574321)
chr6 (5-250)||(16621059-16621304)
chr6 (5-250)||(24293632-24293877)
chr6 (5-250)||(28261047-28261292)
chr6 (5-250)||(28284624-28284869)
chr6 (5-250)||(28339796-28340041)
chr6 (1-249)||(18962934-18963182)
chr6 (11-250)||(15461522-15461761)
chr6 (5-250)||(27189622-27189867)
chr6 (5-250)||(27259373-27259618)
chr6 (5-249)||(16961332-16961576)
chr6 (1-241)||(23085617-23085857)
chr6 (3-250)||(18405792-18406039)
chr6 (23-250)||(34643454-34643681)
chr6 (5-247)||(28311819-28312061)
chr6 (5-249)||(23080610-23080854)
chr6 (5-250)||(18183217-18183462)
chr6 (1-250)||(5837074-5837314)
chr6 (1-250)||(22760301-22760550)
chr6 (1-249)||(30678854-30679101)
chr6 (1-250)||(25607707-25607956)
chr6 (17-192)||(16925501-16925676)
chr6 (1-156)||(20135254-20135409)
chr6 (1-156)||(22197460-22197615)
chr6 (1-125)||(19487138-19487262)
chr6 (79-249)||(1646738-1646908)
chr6 (71-156)||(13751856-13751941)
chr6 (79-249)||(16647893-16648063)
chr6 (79-249)||(23998435-23998605)
chr6 (5-99)||(29590289-29590383)
chr6 (79-249)||(16380297-16380467)
chr6 (143-231)||(19881502-19881590)
chr6 (104-244)||(23496141-23496281)
chr6 (2-174)||(18450707-18450881)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (11-250)||(19650301-19650540)
chr2 (2-248)||(19717259-19717505)
chr2 (1-250)||(23278729-23278978)
chr2 (1-250)||(25255872-25256120)
chr2 (1-249)||(31832612-31832860)
chr2 (5-248)||(23098263-23098506)
chr2 (1-249)||(1065705-1065953)
chr2 (5-250)||(27373222-27373467)
chr2 (1-250)||(23112692-23112941)
chr2 (5-250)||(27789693-27789938)
chr2 (5-250)||(41606630-41606875)
chr2 (5-250)||(10870803-10871048)
chr2 (5-250)||(12576306-12576551)
chr2 (5-250)||(24264323-24264568)
chr2 (5-250)||(9337535-9337780)
chr2 (5-250)||(9486169-9486414)
chr2 (5-250)||(27219969-27220214)
chr2 (5-250)||(44383815-44384060)
chr2 (5-192)||(21323511-21323698)
chr2 (5-250)||(24677442-24677685)
chr2 (1-250)||(16927313-16927562)
chr2 (1-250)||(17000953-17001202)
chr2 (5-250)||(21143286-21143531)
chr2 (1-250)||(23073816-23074065)
chr2 (5-250)||(24705727-24705972)
chr2 (5-250)||(24711987-24712232)
chr2 (5-250)||(24874995-24875240)
chr2 (2-250)||(30010426-30010674)
chr2 (5-244)||(23204273-23204512)
chr2 (5-250)||(22734019-22734264)
chr2 (5-250)||(23105973-23106218)
chr2 (2-250)||(30209159-30209407)
chr2 (1-154)||(24818081-24818234)
chr2 (1-117)||(16983326-16983442)
chr2 (1-117)||(16924063-16924179)
chr2 (5-120)||(24657903-24658017)
chr2 (79-249)||(24829507-24829677)
chr2 (79-189)||(22280119-22280229)
chr2 (158-249)||(24818628-24818719)
chr2 (79-189)||(25130623-25130733)
chr2 (79-189)||(22759890-22759998)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (1-250)||(579-828)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-250)||(7095-7344)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-250)||(15356821-15357070)
chr4 (1-247)||(15258252-15258498)
chr4 (1-250)||(16150033-16150282)
chr4 (1-250)||(16154179-16154428)
chr4 (1-249)||(11204933-11205181)
chr4 (1-250)||(15001066-15001315)
chr4 (1-249)||(3262495-3262743)
chr4 (1-218)||(20892385-20892602)
chr4 (1-249)||(29451238-29451486)
chr4 (1-250)||(15072681-15072930)
chr4 (1-243)||(44659567-44659809)
chr4 (5-250)||(15145338-15145583)
chr4 (5-250)||(14301424-14301669)
chr4 (5-250)||(16251295-16251540)
chr4 (1-250)||(8708229-8708478)
chr4 (5-250)||(14682889-14683134)
chr4 (5-250)||(23958069-23958314)
chr4 (5-250)||(27713658-27713903)
chr4 (5-250)||(40475362-40475607)
chr4 (5-250)||(51604497-51604742)
chr4 (1-249)||(14696436-14696684)
chr4 (11-250)||(1646988-1647227)
chr4 (11-250)||(27902708-27902946)
chr4 (5-250)||(8051068-8051313)
chr4 (5-250)||(16234437-16234682)
chr4 (1-250)||(17092590-17092839)
chr4 (5-250)||(8388734-8388979)
chr4 (1-250)||(16218552-16218801)
chr4 (1-250)||(16221872-16222121)
chr4 (5-250)||(19776238-19776483)
chr4 (5-249)||(14161793-14162037)
chr4 (5-250)||(12478922-12479167)
chr4 (17-250)||(16352987-16353220)
chr4 (5-250)||(18224891-18225136)
chr4 (1-249)||(14848807-14849055)
chr4 (56-250)||(23443427-23443621)
chr4 (5-250)||(22632026-22632267)
chr4 (5-100)||(19634608-19634703)
chr4 (79-249)||(15290937-15291107)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (1-250)||(1189-1438)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-250)||(5055-5304)
scaffold0149 (1-250)||(9486-9735)
scaffold0149 (17-250)||(180-413)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-250)||(42049-42298)
scaffold0102 (11-250)||(51059-51298)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (1-250)||(11959098-11959347)
chr3 (1-250)||(12358456-12358705)
chr3 (1-250)||(11949837-11950086)
chr3 (1-250)||(12272289-12272538)
chr3 (1-189)||(17493658-17493846)
chr3 (1-250)||(12180295-12180544)
chr3 (1-250)||(16826210-16826459)
chr3 (1-250)||(31940854-31941103)
chr3 (1-250)||(12510412-12510661)
chr3 (1-250)||(18132275-18132524)
chr3 (1-250)||(31693114-31693363)
chr3 (1-250)||(24189255-24189504)
chr3 (5-249)||(10407920-10408164)
chr3 (1-166)||(14575021-14575186)
chr3 (1-250)||(15229554-15229803)
chr3 (1-250)||(15235422-15235671)
chr3 (1-249)||(47125896-47126144)
chr3 (23-250)||(14088624-14088851)
chr3 (1-248)||(14291461-14291708)
chr3 (1-250)||(17188325-17188574)
chr3 (1-249)||(28756270-28756519)
chr3 (8-246)||(13318438-13318676)
chr3 (23-250)||(13970071-13970298)
chr3 (5-250)||(15714000-15714245)
chr3 (5-250)||(13943975-13944220)
chr3 (5-250)||(15587336-15587581)
chr3 (5-250)||(41179473-41179718)
chr3 (5-250)||(44779198-44779443)
chr3 (5-250)||(3687884-3688129)
chr3 (1-250)||(5108551-5108800)
chr3 (5-250)||(5422874-5423119)
chr3 (5-250)||(8745323-8745568)
chr3 (5-250)||(10007541-10007786)
chr3 (5-250)||(10908151-10908396)
chr3 (5-250)||(12888650-12888895)
chr3 (5-250)||(15400461-15400706)
chr3 (5-250)||(16637714-16637959)
chr3 (5-250)||(16694105-16694350)
chr3 (5-250)||(20059998-20060243)
chr3 (5-250)||(24185131-24185376)
chr3 (5-250)||(26791357-26791602)
chr3 (5-250)||(43164616-43164861)
chr3 (1-250)||(48427388-48427637)
chr3 (26-250)||(16804912-16805136)
chr3 (1-247)||(12844043-12844289)
chr3 (5-250)||(13254631-13254876)
chr3 (5-250)||(15346189-15346434)
chr3 (5-250)||(16378862-16379106)
chr3 (5-250)||(53382962-53383207)
chr3 (1-249)||(14579348-14579596)
chr3 (2-250)||(15013697-15013945)
chr3 (3-250)||(15261571-15261818)
chr3 (5-182)||(6602745-6602922)
chr3 (11-250)||(10417984-10418223)
chr3 (11-250)||(15358024-15358263)
chr3 (5-156)||(12071009-12071160)
chr3 (5-250)||(16754645-16754890)
chr3 (1-249)||(11888294-11888542)
chr3 (5-250)||(17491791-17492036)
chr3 (1-246)||(18437085-18437330)
chr3 (5-114)||(16832461-16832570)
chr3 (111-250)||(16834554-16834693)
chr3 (5-90)||(14874512-14874597)
chr3 (146-247)||(16327734-16327835)
chr3 (79-249)||(15612055-15612225)
chr3 (114-197)||(13304298-13304381)
chr3 (1-100)||(16327638-16327737)
chr3 (79-249)||(13965370-13965540)
chr3 (79-249)||(30139758-30139928)
chr3 (79-249)||(30149309-30149479)
chr3 (118-192)||(14874599-14874673)
chr3 (79-249)||(15948488-15948658)
chr3 (53-174)||(8272391-8272512)
chr3 (79-219)||(17200616-17200756)
chr3 (131-222)||(25768297-25768388)
chr3 (79-189)||(6150871-6150981)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-250)||(33687-33937)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-250)||(9414-9663)
scaffold0222 (8-250)||(1200-1442)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-250)||(250973-251222)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-248)||(5849-6096)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-248)||(19338-19585)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-250)||(14559-14808)
scaffold0124 (79-249)||(5589-5758)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-250)||(28975-29224)
scaffold0067 (1-246)||(49884-50129)
scaffold0067 (1-246)||(58918-59163)
scaffold0067 (1-246)||(65306-65551)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-250)||(5102-5351)
scaffold0035 (2-248)||(41812-42058)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (1-250)||(21473-21722)
scaffold0058 (104-250)||(27055-27201)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-249)||(21953247-21953495)
chr1 (1-250)||(20296749-20296998)
chr1 (1-216)||(22016518-22016733)
chr1 (1-250)||(24097388-24097625)
chr1 (6-249)||(20937841-20938084)
chr1 (1-250)||(19856642-19856891)
chr1 (1-249)||(48425242-48425490)
chr1 (1-249)||(52988110-52988358)
chr1 (1-250)||(21739809-21740058)
chr1 (1-250)||(21743325-21743574)
chr1 (1-249)||(37679418-37679666)
chr1 (1-249)||(31537770-31538018)
chr1 (3-250)||(41310894-41311141)
chr1 (5-250)||(20833677-20833922)
chr1 (1-249)||(38910599-38910847)
chr1 (2-246)||(17042789-17043033)
chr1 (77-250)||(19660985-19661158)
chr1 (5-250)||(21839287-21839532)
chr1 (1-249)||(21862146-21862394)
chr1 (5-250)||(16348372-16348617)
chr1 (17-250)||(19108705-19108938)
chr1 (5-250)||(21233508-21233753)
chr1 (11-250)||(20854543-20854782)
chr1 (11-249)||(16378433-16378671)
chr1 (5-250)||(21832639-21832884)
chr1 (5-250)||(22503066-22503311)
chr1 (5-250)||(33388806-33389051)
chr1 (5-250)||(51331269-51331515)
chr1 (1-250)||(50618171-50618420)
chr1 (1-250)||(21751277-21751523)
chr1 (1-250)||(20140420-20140669)
chr1 (5-182)||(41351445-41351622)
chr1 (1-250)||(22360017-22360266)
chr1 (5-249)||(429893-430137)
chr1 (79-249)||(20829243-20829413)
chr1 (48-248)||(20927393-20927593)
chr1 (79-249)||(20527391-20527561)
chr1 (133-249)||(35930730-35930846)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-248)||(49459-49705)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-247)||(64223-64469)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-250)||(31023-31272)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-250)||(2657-2906)
scaffold0034 (11-250)||(69723-69962)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-250)||(21323423-21323672)
chr8 (1-249)||(27356925-27357173)
chr8 (1-250)||(16269368-16269617)
chr8 (1-248)||(19984570-19984817)
chr8 (3-250)||(21927816-21928063)
chr8 (2-250)||(29301571-29301819)
chr8 (51-250)||(31414663-31414862)
chr8 (56-250)||(23657315-23657509)
chr8 (1-250)||(22053251-22053499)
chr8 (1-249)||(28983300-28983548)
chr8 (1-249)||(28988519-28988767)
chr8 (17-250)||(19980355-19980588)
chr8 (1-249)||(22522935-22523183)
chr8 (5-250)||(21164686-21164931)
chr8 (1-249)||(22373257-22373506)
chr8 (1-250)||(20390474-20390723)
chr8 (5-250)||(22042215-22042460)
chr8 (5-250)||(22118323-22118568)
chr8 (5-250)||(30311292-30311537)
chr8 (5-250)||(31568991-31569236)
chr8 (2-246)||(32602537-32602781)
chr8 (5-250)||(15535771-15536016)
chr8 (5-250)||(22127107-22127352)
chr8 (5-250)||(18858965-18859210)
chr8 (1-250)||(22422036-22422285)
chr8 (5-250)||(20016411-20016656)
chr8 (5-250)||(22030491-22030736)
chr8 (1-248)||(20394277-20394524)
chr8 (5-250)||(17672170-17672416)
chr8 (1-182)||(19114856-19115037)
chr8 (17-250)||(22131201-22131434)
chr8 (83-249)||(4984431-4984597)
chr8 (5-250)||(19482220-19482465)
chr8 (1-249)||(22375597-22375845)
chr8 (107-249)||(22060929-22061071)
chr8 (1-249)||(22989434-22989682)
chr8 (5-192)||(21253390-21253577)
chr8 (5-250)||(19864241-19864486)
chr8 (8-112)||(22028431-22028535)
chr8 (50-248)||(23887418-23887616)
chr8 (1-249)||(22246577-22246825)
chr8 (11-250)||(21392015-21392254)
chr8 (11-250)||(21781341-21781580)
chr8 (11-250)||(21786509-21786748)
chr8 (79-249)||(16875317-16875487)
chr8 (79-249)||(21848559-21848729)
chr8 (41-250)||(20650539-20650748)
chr8 (79-180)||(21194762-21194863)
chr8 (86-248)||(23155271-23155433)
chr8 (155-249)||(24932122-24932216)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-248)||(36292-36539)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (1-250)||(60090-60339)
scaffold0046 (14-247)||(79548-79781)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (1-249)||(20344519-20344767)
chr5 (1-250)||(25850311-25850560)
chr5 (1-229)||(23564051-23564279)
chr5 (1-248)||(22504917-22505164)
chr5 (1-249)||(37541264-37541512)
chr5 (1-250)||(22233803-22234052)
chr5 (8-249)||(14884881-14885122)
chr5 (8-249)||(24796287-24796528)
chr5 (3-249)||(23473482-23473728)
chr5 (1-250)||(21561908-21562157)
chr5 (2-159)||(23078789-23078946)
chr5 (5-250)||(17267221-17267466)
chr5 (5-250)||(22136922-22137167)
chr5 (1-181)||(21984060-21984240)
chr5 (11-250)||(22464187-22464426)
chr5 (5-250)||(29473960-29474205)
chr5 (1-249)||(21337177-21337425)
chr5 (5-250)||(14997626-14997871)
chr5 (5-182)||(22330774-22330951)
chr5 (5-250)||(27520660-27520905)
chr5 (5-250)||(37289383-37289628)
chr5 (5-250)||(40711034-40711279)
chr5 (23-250)||(21676739-21676966)
chr5 (5-250)||(16358756-16359001)
chr5 (5-250)||(18781368-18781613)
chr5 (5-250)||(19772214-19772459)
chr5 (5-250)||(22350173-22350418)
chr5 (5-250)||(27683287-27683532)
chr5 (5-250)||(34568748-34568993)
chr5 (5-247)||(27666377-27666619)
chr5 (1-250)||(26736610-26736859)
chr5 (11-250)||(28892835-28893074)
chr5 (11-250)||(28921661-28921900)
chr5 (5-182)||(27612676-27612853)
chr5 (5-250)||(41773096-41773341)
chr5 (1-250)||(20823689-20823938)
chr5 (11-246)||(20778153-20778388)
chr5 (1-250)||(25428687-25428936)
chr5 (1-115)||(705-819)
chr5 (1-249)||(20465982-20466230)
chr5 (2-250)||(21409388-21409636)
chr5 (12-156)||(20802945-20803089)
chr5 (79-249)||(21935149-21935319)
chr5 (79-249)||(23507921-23508091)
chr5 (79-249)||(24583447-24583617)
chr5 (125-179)||(21625475-21625529)
chr5 (140-195)||(21220542-21220597)
chr5 (158-227)||(20801668-20801737)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (5-247)||(43272-43514)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-247)||(53401-53647)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-250)||(150922-151167)
scaffold0011 (1-249)||(24237-24485)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (3-250)||(19705-19952)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-250)||(54115-54364)
scaffold0076 (1-250)||(31381-31630)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (5-250)||(99270-99515)
scaffold0020 (1-222)||(175372-175588)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (14-250)||(996-1232)
scaffold0420 (14-250)||(7965-8201)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (14-250)||(22227-22463)
scaffold0114 (14-250)||(39409-39645)
scaffold0114 (5-248)||(18049-18292)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-249)||(515057-515305)
scaffold0001 (1-250)||(452917-453166)
scaffold0001 (1-249)||(495372-495620)
scaffold0001 (1-182)||(441109-441290)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (1-242)||(538-779)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-250)||(29285-29534)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (14-250)||(18200-18436)
scaffold0348 (14-250)||(5566-5802)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-249)||(40037-40285)
scaffold0010 (1-250)||(45131-45380)
scaffold0010 (1-249)||(4268-4515)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-250)||(2222-2471)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-250)||(4793-5042)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-250)||(28878-29127)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-250)||(11311-11560)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-237)||(1249-1485)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (15-250)||(853-1088)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-247)||(49581-49825)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (1-182)||(2-183)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (1-250)||(1976-2225)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-250)||(4532-4781)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-250)||(12147-12396)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-250)||(28989-29238)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (1-166)||(14558-14723)
scaffold0074 (1-249)||(5465-5713)
scaffold0074 (161-250)||(11474-11563)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-250)||(16465-16714)
scaffold0266 (79-180)||(7643-7744)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-250)||(21202-21451)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-248)||(9165-9412)
scaffold0235 (1-248)||(19379-19626)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (1-250)||(11181-11430)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (5-243)||(262584-262822)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (5-250)||(2775-3020)
scaffold0044 (5-250)||(16511-16756)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (5-250)||(325057-325303)
scaffold0004 (5-250)||(201176-201421)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (5-250)||(9291-9536)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (1-148)||(13069-13216)
scaffold0261 (1-148)||(21249-21395)
scaffold0261 (175-250)||(13214-13289)
scaffold0261 (175-250)||(21393-21468)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (1-250)||(24002-24251)
scaffold0018 (1-154)||(10055-10208)
scaffold0018 (158-249)||(10602-10693)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-250)||(103578-103827)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-248)||(4593-4840)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (5-250)||(9719-9964)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (5-242)||(10494-10731)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-249)||(12915-13163)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-250)||(24649-24898)
scaffold0243 (1-99)||(10476-10574)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (5-222)||(28203-28420)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (11-250)||(25466-25702)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (5-250)||(13832-14077)
scaffold0109 (5-250)||(40506-40751)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (5-250)||(31235-31480)
scaffold0080 (5-250)||(36701-36946)
scaffold0080 (5-250)||(13601-13847)
scaffold0080 (5-250)||(10946-11192)
scaffold0080 (1-250)||(53988-54237)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (5-250)||(21598-21843)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (5-250)||(37528-37773)
scaffold0042 (119-249)||(23059-23189)
scaffold0042 (1-113)||(25840-25952)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-250)||(2209-2458)
scaffold0023 (86-250)||(151463-151627)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (5-249)||(17290-17534)
scaffold0028 (23-250)||(48240-48467)
scaffold0028 (11-249)||(10828-11066)
scaffold0028 (78-182)||(45572-45676)
scaffold0028 (5-72)||(53256-53323)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (119-250)||(9880-10011)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-247)||(51166-51412)
scaffold0026 (48-219)||(31298-31469)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-249)||(3935-4183)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (102-250)||(9759-9907)
scaffold0146 (102-250)||(17426-17574)
scaffold0146 (1-106)||(5778-5883)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (70-250)||(109983-110163)
scaffold0031 (5-149)||(52633-52777)
scaffold0031 (148-249)||(54842-54943)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-164)||(11246-11409)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (2-249)||(5594-5841)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (23-250)||(3896-4123)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (1-247)||(3788-4034)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (12-250)||(15709-15947)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (26-243)||(2656-2873)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-250)||(94598-94847)
scaffold0029 (27-250)||(114912-115136)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (5-246)||(17774-18015)
scaffold0017 (51-250)||(58368-58567)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-250)||(176049-176297)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (23-250)||(313-540)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-250)||(41209-41458)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-250)||(8373-8622)
scaffold0120 (79-189)||(24590-24700)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (5-250)||(20955-21200)
scaffold0081 (5-250)||(36379-36624)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-250)||(56108-56357)
scaffold0022 (1-249)||(40986-41232)
scaffold0022 (1-249)||(74706-74952)
scaffold0022 (79-189)||(8608-8718)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (1-249)||(234-482)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-249)||(483-731)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (2-250)||(1350-1598)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-249)||(114742-114990)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (121-247)||(38004-38130)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-249)||(6801-7039)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (1-250)||(517-766)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-250)||(15682-15931)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (5-250)||(12064-12309)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-250)||(7574-7823)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (101-250)||(46838-46987)
scaffold0053 (126-250)||(55676-55800)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-249)||(14925-15173)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-249)||(18002-18250)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-249)||(14183-14431)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (71-249)||(3253-3431)
scaffold0647 (1-247)||(7363-7609)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (5-250)||(10866-11112)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (5-150)||(8449-8594)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-249)||(20592-20840)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (2-250)||(84225-84473)
scaffold0007 (86-246)||(268965-269125)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-250)||(803-1052)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (5-250)||(29624-29868)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-249)||(2953-3201)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (5-249)||(413-657)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-249)||(14822-15070)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-249)||(6225-6473)
scaffold0270 (1-249)||(13355-13603)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-249)||(217124-217372)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (5-162)||(111615-111772)
scaffold0040 (1-249)||(17230-17478)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (5-153)||(1105-1253)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (29-249)||(21918-22138)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (1-249)||(6690-6938)
scaffold0083 (1-249)||(8738-8986)
scaffold0083 (161-249)||(1386-1474)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (5-247)||(84938-85180)
scaffold0008 (113-182)||(85612-85681)
scaffold0008 (79-180)||(132271-132372)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (5-139)||(277-411)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (50-188)||(4534-4672)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (5-99)||(13-107)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (79-249)||(13407-13577)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (79-249)||(565-735)
scaffold0302 (79-249)||(7507-7677)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (5-174)||(1086-1255)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (79-249)||(1403-1573)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (79-249)||(25748-25918)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (5-93)||(12171-12259)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-61)||(1-61)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (17-108)||(126489-126580)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (79-249)||(15262-15432)
scaffold0162 (79-249)||(10956-11126)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (5-93)||(25420-25508)
scaffold0218 (79-249)||(1734-1904)
scaffold0218 (79-195)||(26735-26851)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (79-250)||(445-616)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (5-111)||(1441-1547)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (79-189)||(89914-90024)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (11-68)||(7791-7848)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (79-147)||(23417-23485)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (79-180)||(34508-34607)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (173-250)||(1305-1382)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (79-162)||(4435-4518)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (125-180)||(144462-144517)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (79-189)||(728-838)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (79-180)||(7022-7123)


Alignment Details
Target: scaffold1288 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 559 - 808
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  559 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 658  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  659 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgtattt 758  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  759 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3318 - 3069
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3318 tgaattttcaattgagcttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 3219  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  3218 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtaccatgaggctatgcattg 3119  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3118 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36094 - 35849
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  36094 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagaat 35995  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  35994 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtatcgatta 35895  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  35894 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 35849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28662 - 28429
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  28662 cttgttcctggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaactgagttgaataaacaattagaagatttgcttgagaaga 28563  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||||||   |||||||||    
T  28562 agtttgttagaccaagtttttcaccttgaggagcgcccgttttgttagtaaagaaaaaagatggtagtatgaggttatgtatcgattatcatcagttgaa 28463  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     ||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  28462 taaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 28429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24816 - 24567
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24816 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgaattagctgaattgaagaaacagttggag 24717  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24716 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagtcaagaagaaggatggtagcatgagattatgcattg 24617  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24616 attactgtcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 24567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 250
Target Start/End: Original strand, 44148 - 44370
Alignment:
Q  28 aacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaaga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  44148 aacgaagccggtgtcgatggcacattatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaccagttggaggatttacttgataagaagtttgtaaga 44247  T
Q  128 ccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatga 227  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||| ||||| |||| ||||| | ||    
T  44248 ccgagtgtttaaccgtggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtagcgtgaggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacga 44347  T
Q  228 taaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44348 taaagaacaggtatccacttccg 44370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 15100291 - 15100540
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15100291 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacaattggag 15100390  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  15100391 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggcagcatgaggttatgcattg 15100490  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15100491 attatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccg 15100540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12459200 - 12458952
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12459200 gaattttcaattgaccttgttccaggaatgaagccggtgtcgatggcaccttttcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 12459101  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||    
T  12459100 acttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcattga 12459001  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12459000 ttaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccg 12458952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13023918 - 13023669
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13023918 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacaattggag 13023819  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  13023818 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagctccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattg 13023719  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  13023718 attaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccg 13023669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16948160 - 16948405
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16948160 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctaaattgaagaaacagttggaa 16948259  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16948260 gacctgcttgataagaagtttgtaagaccaagtttttcaccttggggagcgctggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcattg 16948359  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16948360 attaccgtcagttgaataaagttatgataaagaataggtatccact 16948405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14261933 - 14262182
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14261933 tgaattttcaatcgatcttgtgcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 14262032  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  14262033 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 14262132  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  14262133 attactgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 14262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 13966356 - 13966604
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13966356 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 13966455  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  13966456 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttattggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 13966555  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  13966556 attaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcc 13966604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13676012 - 13675764
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13676012 tgaatttt-aattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaagaaacagttggag 13675914  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |    
T  13675913 gacttgcttgataagaagtttgtaagactaagtgtttcaccttggggagcaccgatgttgttggttaagaagaaagacgatagcatgagattatgcattg 13675814  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13675813 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 13675764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 12799239 - 12799452
Alignment:
Q  9 caattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12799239 caattgaccttgttccaggaacgaagccggtatcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggaggacttgct 12799338  T
Q  109 tgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||| ||    
T  12799339 tgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcattaggttatgtatagattaccgt 12799438  T
Q  209 cagttgaacaaagt 222  Q
    |||||||| |||||    
T  12799439 cagttgaataaagt 12799452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 11386121 - 11386366
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11386121 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatcggagttggctgaattgaagaaacagttggaagact 11386220  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  11386221 tgtttgataagaagtttgtaaaaccgagtgtctcgccgtggggagcgcctgtgttgctggtaaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatagacta 11386320  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11386321 ccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccg 11386366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16069985 - 16070234
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  16069985 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctaagtagaagaaacagttggag 16070084  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||| || || || |    
T  16070085 gatttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatagtagtacgaggttgtgtatag 16070184  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16070185 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaagtatccacttccg 16070234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26092486 - 26092734
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26092486 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 26092585  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  26092586 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 26092685  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  26092686 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 26092734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21754973 - 21754742
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21754973 tgaattttcaattgaccttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggaa 21754874  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  21754873 gacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagattgtgcatag 21754774  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaag 232  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||    
T  21754773 attaccgtcagttgaataaggttacgataaag 21754742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 26116278 - 26116526
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26116278 tgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 26116377  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||      
T  26116378 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtnttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagattgtgtatat 26116477  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  26116478 atcaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 26116526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49154862 - 49154614
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49154862 tgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 49154763  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  49154762 gacctgttagataaaaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagattgtgtatag 49154663  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  49154662 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 49154614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14140236 - 14139991
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14140236 ttttcgattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcatatgtcagcatctgaattagctgaattgaagaaacagttggaagact 14140137  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || ||||| || ||    
T  14140136 tgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaaaaaggaaggtagcatgaggttgtgcattgacta 14140037  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  14140036 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccg 14139991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11300901 - 11301149
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11300901 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 11301000  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  11301001 gacctgttatataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 11301100  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  11301101 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcc 11301149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19615214 - 19614987
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19615214 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttg 19615115  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  19615114 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagt 19615015  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  19615014 tacgataaagaacagatatccgcttccg 19614987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12204488 - 12204737
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12204488 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcagcgtctgagctagttgagttgaagaaacagttggag 12204587  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  12204588 gatttacttgataagaaatttgtaagacggagtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggataaaaagaaggatggtagcatgaggttgtgcatag 12204687  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12204688 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 12204737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15342988 - 15342750
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15342988 ttttccattgaccttgttccgggaacaaagccgatgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcctctgagttagctgaattgaagaaaaagttggaagact 15342889  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||  ||||    
T  15342888 tgcttgataagaagtttgtttgacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatatatta 15342789  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcc 243  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15342788 ccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatcc 15342750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 14284066 - 14284313
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||| || || |    
T  14284066 ttttcgattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcatctgagttggctgaactgaagaaacagttagaagatt 14284165  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagat--tatgcatcgat 202  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | || || |||    
T  14284166 tacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtctcaccgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgagattgtgtgtatagat 14284265  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  14284266 taccgtcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccg 14284313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 11234927 - 11235172
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11234927 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 11235026  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  11235027 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 11235126  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  11235127 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 11235172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 11550816 - 11551060
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  11550816 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatt 11550915  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  11550916 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 11551015  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  11551016 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcc 11551060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18180301 - 18180058
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18180301 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 18180202  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  18180201 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 18180102  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||    
T  18180101 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttc 18180058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13688597 - 13688352
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13688597 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 13688498  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  13688497 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 13688398  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  13688397 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 13688352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14957110 - 14956865
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||| || |    
T  14957110 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagctgaagaaacagttggaagatt 14957011  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  14957010 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 14956911  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14956910 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14956865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 18051645 - 18051890
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18051645 ttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatgacaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 18051744  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  18051745 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 18051844  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  18051845 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 18051890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11770112 - 11770360
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||   ||||||||| || ||     
T  11770112 tgaattttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcggcttctgagttggctgagcagaagaaacaattagaa 11770211  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  11770212 gatttgcttgataaaatgtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 11770311  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  11770312 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 11770360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 16727097 - 16727340
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| || || |    
T  16727097 ttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcatccgagttagctgagttgaagagacagttagaagatt 16727196  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  16727197 tgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 16727296  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||    
T  16727297 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttc 16727340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 17704169 - 17704412
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||| || || |    
T  17704169 ttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcatccgagttagctgagttgaagagacagttagaagatt 17704268  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  17704269 tgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 17704368  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||    
T  17704369 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttc 17704412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8710161 - 8709916
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8710161 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagtcggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 8710062  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  8710061 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 8709962  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  8709961 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 8709916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14334952 - 14334707
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14334952 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 14334853  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  |||||  |||| || |||||    
T  14334852 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagacggtagtatgaggctatgtattgatta 14334753  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14334752 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14334707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15158771 - 15159016
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15158771 ttttctattgatcttgtccctggaacaaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 15158870  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  15158871 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 15158970  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15158971 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15159016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 18587885 - 18588130
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18587885 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 18587984  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  18587985 tgcttgagaagaagtttgttaaaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 18588084  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  18588085 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 18588130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 44789061 - 44789310
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  44789061 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 44789160  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |    
T  44789161 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattg 44789260  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  44789261 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 44789310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14042255 - 14042007
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  | |||    
T  14042255 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacaaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaactagag 14042156  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  14042155 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattg 14042056  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  14042055 actatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttcc 14042007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14352285 - 14352037
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  | |||    
T  14352285 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacaaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaactagag 14352186  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  14352185 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattg 14352086  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  14352085 actatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttcc 14352037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10873246 - 10873001
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10873246 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatttgagttgaagaaacagttggaagact 10873147  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  10873146 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 10873047  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  10873046 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 10873001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12690046 - 12689813
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  12690046 cttgttcctggcacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttgagaaga 12689947  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||  | ||||||||    
T  12689946 aatttgttcgaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttactagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgattatcgacagttgaa 12689847  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  12689846 caaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 12689813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 48812962 - 48813210
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |  |||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  48812962 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacttcttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 48813061  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |    
T  48813062 gatttgcttgataagaagtttgtaagatcgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttacttgttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtattg 48813161  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |  |||||||||||||    
T  48813162 attatcgacagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttcc 48813210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15627083 - 15626837
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||   ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15627083 aattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgatgccttaccgtatgtcggcttatgagttggctgagttgaagaaacagttagaaga 15626984  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  15626983 tttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttgaggagcaccggtgttgttggttaaaaagaaagatggtagcatgaggttatgcattaat 15626884  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||    |||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  15626883 tatcagcagttgaataaaatgacgataaagaataggtatccacttcc 15626837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9590924 - 9590681
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  9590924 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgtgttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 9590825  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| |||||| || || || || ||    
T  9590824 tgctcgaaaagaaatttattagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtattgacta 9590725  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
      ||||||||||||| || |  || ||| | |||||||||||||    
T  9590724 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttc 9590681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 14150149 - 14150297
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  14150149 ttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 14150248  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14150249 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcc 14150297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 15146594 - 15146842
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  15146594 tgaattttcgattgatcttgttcctggaacgaagcttgtgtttatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttagctgagttaaagaaacagttagaa 15146693  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||  ||||| |||||||| |    
T  15146694 gatttgcttgagaaaaagtttgttataccaagtgtttcaccttggggagcacctgttttgttagtgaagaagaaagacggtagtatgaggttatgcattg 15146793  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  |||||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||    
T  15146794 attatcgtcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttcc 15146842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 250
Target Start/End: Original strand, 15172 - 15309
Alignment:
Q  113 aagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagt 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||  || || || ||  ||||||    
T  15172 aagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagatagtgtattgactatcgtcagt 15271  T
Q  213 tgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15272 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7826382 - 7826212
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  7826382 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 7826283  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  7826282 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 7826212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 27105562 - 27105732
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  27105562 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 27105661  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  27105662 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 27105732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27172763 - 27172593
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  27172763 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 27172664  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  27172663 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 27172593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13379365 - 13379264
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  13379365 tgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13379266  T
Q  179 gg 180  Q
    ||    
T  13379265 gg 13379264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 12799189 - 12799218
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaac 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12799189 tgaattttcaattgaccttgttccaggaac 12799218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13458525 - 13458417
Alignment:
Q  71 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaaga 170  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||  | ||||  ||||||||  | ||||| || || ||||||||||||||||    
T  13458525 gagttaggtgaattgaagaagcacttggaagagttacttgagaagcagttcattagactgagtgtttcttcgtggggtgctccagtgttgttggttaaga 13458426  T
Q  171 agaaggatg 179  Q
    |||||||||    
T  13458425 agaaggatg 13458417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 10466695 - 10466944
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466695 tgaattttcaattgaacttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 10466794  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  10466795 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattg 10466894  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  10466895 attaccgtcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccg 10466944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19455458 - 19455213
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19455458 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggcgtcgatgacaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacatttggag 19455359  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19455358 gacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattg 19455259  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    | ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  19455258 actatcgtcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact 19455213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14377762 - 14378010
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14377762 tgaattttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 14377861  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||      
T  14377862 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagtatgaggttgtgcattt 14377961  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14377962 attatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcc 14378010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24366847 - 24366599
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24366847 tgaattttcaattgaccttgttcaaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 24366748  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  24366747 gacctgttagataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagattgtgtatag 24366648  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24366647 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 24366599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24516260 - 24516503
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24516260 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcaccttatcgtatgtcggctttcgaacttgctgagttgaagaaacagttggag 24516359  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||      |||| |    
T  24516360 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctaaccttggggagcgccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatga------gcattg 24516453  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24516454 actatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 24516503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18797125 - 18796876
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18797125 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagtttgctgaattgaagaaacaattggaa 18797026  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||| |    
T  18797025 gacttgcttgataagaagttcgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatagtagtatgaggctatgcattg 18796926  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18796925 actatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccgcttccg 18796876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19437437 - 19437188
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19437437 tgaatttttaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 19437338  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||| |  ||||| |    
T  19437337 gacttgcttgataataagtttgtaaaaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaaaaaggacgatagcatgaggtcgtgcattg 19437238  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19437237 attatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 19437188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19867118 - 19866873
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  19867118 ttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 19867019  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19867018 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgatta 19866919  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19866918 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 19866873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 21567847 - 21568079
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21567847 attgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcgccatatcgtatgtcagcatctgagttggctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttg 21567946  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| || |    
T  21567947 ataagaagtttgtaagaccgagtgtctcaccgtggggagcgcctgtattgttggtagagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatagactaccgtta 21568046  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcc 243  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21568047 gttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatcc 21568079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21474035 - 21473787
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  21474035 tgaatttgcaattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaagaaatagttggag 21473936  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  21473935 gatttactttataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 21473836  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21473835 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcc 21473787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 8761598 - 8761847
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  8761598 tgaattttcaattgaccttgtcccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggag 8761697  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || || || |    
T  8761698 gacttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcgccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaagaatggtagtatgaggttgtgtattg 8761797  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8761798 actatcgtcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccg 8761847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25770279 - 25770030
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||     
T  25770279 tgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaagccggtgttaatggtaccttatcgtatgtcggcgtttgagttagcggagttgaagaagcagttggat 25770180  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  25770179 gatgtacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 25770080  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25770079 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccg 25770030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21755363 - 21755119
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  21755363 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgtatgtctacttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 21755264  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  21755263 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgatta 21755164  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||| |||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  21755163 tcgtcagttgaac-aagtaactatcaagaataggtatccacttccg 21755119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 2872653 - 2872898
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2872653 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 2872752  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  2872753 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 2872852  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  2872853 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 2872898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25114983 - 25114738
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25114983 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcaatggcaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgaattgaagaaacagttggaagact 25114884  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  25114883 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 25114784  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  25114783 ccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 25114738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 27563683 - 27563928
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| || || |    
T  27563683 ttttctattgatcttgttcctggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaatagttagaagaat 27563782  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| || |||||| || || || ||    
T  27563783 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcaggagattgtgtattgacta 27563882  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  27563883 tcgtcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccg 27563928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22436293 - 22436055
Alignment:
Q  12 ttgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttga 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22436293 ttgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatttgcttga 22436194  T
Q  112 taagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcag 211  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22436193 gaagaagtttgtcagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgattatcgtcag 22436094  T
Q  212 ttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||| |  || || || |||||||||||||||    
T  22436093 ttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccg 22436055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 22828205 - 22828450
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22828205 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagact 22828304  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  22828305 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggaacgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 22828404  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||||||| || || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22828405 tcgacagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22828450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Original strand, 14379382 - 14379560
Alignment:
Q  71 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14379382 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaaga 14379481  T
Q  171 agaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||||| ||||  ||||| || |||||  ||||  || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14379482 agaaggacggtagtatgaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcc 14379560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16574321 - 16574076
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16574321 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgtttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 16574222  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| ||  ||||    
T  16574221 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattaatta 16574122  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16574121 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16574076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16621059 - 16621304
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16621059 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgtttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 16621158  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| ||  ||||    
T  16621159 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattaatta 16621258  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16621259 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16621304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 24293632 - 24293877
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24293632 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 24293731  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  24293732 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 24293831  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |  |||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24293832 tcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 24293877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 28261047 - 28261292
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28261047 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaaggaacagttggaggact 28261146  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  28261147 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 28261246  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  28261247 tcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 28261292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28284869 - 28284624
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28284869 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaaggaacagttggaggact 28284770  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  28284769 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 28284670  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  28284669 tcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 28284624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 28339796 - 28340041
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28339796 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaaggaacagttggaggact 28339895  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  28339896 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 28339995  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  28339996 tcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 28340041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18962934 - 18963182
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| || | ||| |  ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18962934 tgaattttcgatttatcttgttccgggtaagaaacatgtgtctatgactccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 18963033  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |    
T  18963034 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcacgttggggagagccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtattg 18963133  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18963134 attatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttcc 18963182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15461761 - 15461522
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15461761 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgagttggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 15461662  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  | ||    
T  15461661 ataaaaagtttgtgagaccaagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcggca 15461562  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||    
T  15461561 gttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27189867 - 27189622
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27189867 ttttctattgatcttgtccctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggact 27189768  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  27189767 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 27189668  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27189667 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27189622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 27259373 - 27259618
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27259373 ttttctattgatcttgtccctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggact 27259472  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  27259473 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 27259572  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27259573 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27259618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 16961332 - 16961576
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||      
T  16961332 ttttctattgatcttgtgactggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgagttagccgagttgaagaaacaattagaagatc 16961431  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||| || || || ||    
T  16961432 tgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcctgttttgctagttaagaagaaagatggtagcctgagattgtgtattgacta 16961531  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      || |||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||    
T  16961532 tcgttagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcc 16961576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23085617 - 23085857
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  23085617 tgaattttcgattgatcttgttccaggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 23085716  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  23085717 tatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggaagtatgaggttatgcattg 23085816  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtat 241  Q
     |||  | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  23085817 gttatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtat 23085857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 18405792 - 18406039
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || || ||    
T  18405792 aattttcgactgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttcagagttagctgagttgaagaaataattagaaga 18405891  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
     || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |||    
T  18405892 tttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtatcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattgat 18405991  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||  | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||| ||||    
T  18405992 tatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccg 18406039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 34643454 - 34643681
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  ||  | ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  34643454 ccaggaacgaagccggtatcgatggcaccttatcgtatgtcggcatctgaacttgctgagttaaaaaaacagttggaggatttactcgacaagaagtttg 34643553  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || || || ||| |||||||||| |||||    
T  34643554 taagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgtattgactaccgtcagttgaataaagt 34643653  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34643654 tacgataaagaacagatatcctcttccg 34643681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28312061 - 28311819
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  28312061 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttagaagact 28311962  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  28311961 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 28311862  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||    
T  28311861 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23080854 - 23080610
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||   | || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  23080854 ttttcgattgatcttattccgggaacgaagcatgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctaatttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 23080755  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  23080754 tgcttgataaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcatgtattgctggttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgatta 23080655  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | |||||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||||||    
T  23080654 tcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttcc 23080610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 18183217 - 18183462
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  18183217 ttttcgattgatcttgttccgggttcgaagcctgtgtctatgacaccttaccatatgtcggcttctgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 18183316  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || |||||    
T  18183317 tacttgataagaagtttataagaccaagtgtttcaccgtggggagctctggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgacattgtgtattgatta 18183416  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |  ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18183417 tcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccg 18183462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5837074 - 5837314
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||  | ||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||         |||||||||||| ||     
T  5837074 tgaattttctattgatttagttcctgggactaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagtt---------gaagaaacagttagaa 5837164  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||   ||||||||||| ||||    
T  5837165 gatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggttttatgagattatgtatcg 5837264  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  5837265 attatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 5837314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 22760301 - 22760550
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||| | || ||     
T  22760301 tgaattttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaataattagaa 22760400  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| || || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| |||||| || || || |    
T  22760401 gatttacttgagaaaaagtttgttagactaagtgtttcgccttggggagcgcccgttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtattg 22760500  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  22760501 attatcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccg 22760550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 30678854 - 30679101
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||| ||||| | |||  ||||||| ||||  || |||| ||| ||||| || ||||||||     
T  30678854 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacaaagcatgtgtctatggcgctttactgtatgtcggcttctgaattagatgagttgaaaaagcagttggaa 30678953  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || || || |    
T  30678954 gatttgcttgataagaagtttataagaccgagtgtctcaccttggggagcgccgg-gttgttagttaagaagaaagatggtagcataaggttgtgtatag 30679052  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||    
T  30679053 attaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttcc 30679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 25607707 - 25607956
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  25607707 tgaattttcgattgatcttgttcttggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaggttctgagttggcagagttgaagaaacaattagaa 25607806  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || || ||||| || |||||||| ||||||| ||| || || || || |    
T  25607807 gatttacttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggagagcacctgttttgttagtgaagaagaaagatggtagcataaggttgtgtattg 25607906  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | || |||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25607907 attatcgacaattgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccg 25607956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 192
Target Start/End: Original strand, 16925501 - 16925676
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||| || || ||  || |||| | ||    
T  16925501 cttgttcctggaacgaaaccggtgtccatggcaccttatcgtatgtctgtttccgagttagccgagttgaagaaacaattagaagatctggttgagatga 16925600  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagatt 192  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16925601 aattttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagttaagaagaaagatggaagcatgagatt 16925676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20135409 - 20135254
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  20135409 tgaattttttattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggctcatgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 20135310  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 156  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20135309 gatttactagataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggt 20135254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22197460 - 22197615
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  22197460 tgaattttttattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggctcatgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 22197559  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 156  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22197560 gatttactagataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggt 22197615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19487138 - 19487262
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  19487138 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcaacgtctgagttagaagagttgaagaaacagttggag 19487237  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaa 125  Q
    || || ||||||||||| |||||||    
T  19487238 gatttacttgataagaagtttgtaa 19487262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 1646738 - 1646908
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1646738 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 1646837  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  1646838 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 1646908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 13751856 - 13751941
Alignment:
Q  71 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 156  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13751856 gagttagcagagttgaagaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggt 13751941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 16647893 - 16648063
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  16647893 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 16647992  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || || || |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  16647993 ggaagcatgaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 16648063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23998605 - 23998435
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  23998605 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 23998506  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || || || |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  23998505 ggaagcatgaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 23998435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Original strand, 29590289 - 29590383
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttgga 99  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29590289 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttgga 29590383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 16380297 - 16380467
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  16380297 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 16380396  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  16380397 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 16380467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19881590 - 19881502
Alignment:
Q  143 tggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaa 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  19881590 tggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaa 19881502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Original strand, 23496141 - 23496281
Alignment:
Q  104 ttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatt 203  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || |    
T  23496141 ttgctcgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttagggagcgccagttttgatagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgact 23496240  T
Q  204 actgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcca 244  Q
    |  ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||    
T  23496241 atcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18450881 - 18450707
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || | ||| || || || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  18450881 gaattttctattgatcttattccgggtatgaaacctgtttctatggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaagcacttagagg 18450782  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttg--taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaa 174  Q
    | |||||||||||||| ||||   ||| || ||||| || || |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  18450781 atttgcttgataagaagtttgaaaaaggccgagtgtgtcgccgtgggaagcgccggtgttattggttaaaaagaa 18450707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 19650301 - 19650540
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19650301 attgaccttgttccaggaacaaagtcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 19650400  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||    
T  19650401 ataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgtattgattaccgtca 19650500  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19650501 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 19650540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Original strand, 19717259 - 19717505
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19717259 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattaaagaaacagttggaag 19717358  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||    
T  19717359 acttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattga 19717458  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19717459 ttaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttc 19717505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23278978 - 23278729
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23278978 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgtag 23278879  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  23278878 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttaggaagcgccggtattattggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattg 23278779  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23278778 actatcgtcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccg 23278729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25256120 - 25255872
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25256120 tgaatttgcaattgatcttattctcggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcacccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 25256021  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  25256020 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgt-gggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 25255922  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25255921 attatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccg 25255872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31832860 - 31832612
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31832860 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 31832761  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| | || || |    
T  31832760 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaaaaaggatggtagtatgagactgtgtatag 31832661  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  31832660 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 31832612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 23098263 - 23098506
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  23098263 ttttcaattgaccttgttccaagaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatcggagttggctgaattgaagaaacagttggaagacg 23098362  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| || || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  23098363 tgcttgataagaagcttgtaagaccgagtgtctcgccgtggggagcgcctatgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatagacta 23098462  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  23098463 ccgtcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttc 23098506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1065953 - 1065705
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1065953 tgaattttcaattgatgttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaagcagttggag 1065854  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  1065853 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 1065754  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  1065753 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 1065705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27373467 - 27373222
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27373467 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 27373368  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  27373367 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 27373268  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27373267 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27373222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23112941 - 23112692
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23112941 tgaatttacaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaagaaacaattggag 23112842  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  23112841 gatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaacttgggatgcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 23112742  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  23112741 attatcgtcaactgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 23112692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27789938 - 27789693
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27789938 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 27789839  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  27789838 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 27789739  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  27789738 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 27789693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 41606630 - 41606875
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41606630 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 41606729  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  41606730 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 41606829  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  41606830 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 41606875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10871048 - 10870803
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10871048 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 10870949  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  10870948 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 10870849  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||    
T  10870848 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccg 10870803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12576551 - 12576306
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12576551 ttttcaattgaccttattcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 12576452  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  12576451 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 12576352  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  12576351 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 12576306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24264568 - 24264323
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24264568 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 24264469  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  24264468 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 24264369  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24264368 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 24264323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9337780 - 9337535
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9337780 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 9337681  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  9337680 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 9337581  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9337580 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 9337535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9486414 - 9486169
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9486414 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 9486315  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  9486314 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 9486215  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9486214 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 9486169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27220214 - 27219969
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27220214 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 27220115  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  27220114 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 27220015  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27220014 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27219969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 44383815 - 44384060
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44383815 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 44383914  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  44383915 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 44384014  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  44384015 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 44384060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 21323511 - 21323698
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||      
T  21323511 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcggatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatc 21323610  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagatt 192  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21323611 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagatt 21323698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24677685 - 24677442
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  24677685 ttttctattgatctttttcctggaacgaagcctgtgtc--tggcaccttatcgtatgtcaacttccgagttagctgagttgaagaagcagttagaagatt 24677588  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || || || |||||    
T  24677587 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattgatta 24677488  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24677487 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 24677442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16927562 - 16927313
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  16927562 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 16927463  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |    
T  16927462 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattg 16927363  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16927362 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16927313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17001202 - 17000953
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  17001202 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 17001103  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |    
T  17001102 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattg 17001003  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  17001002 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 17000953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 21143286 - 21143531
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||    
T  21143286 ttttctattgatctagttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcttatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagcct 21143385  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  21143386 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 21143485  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| ||||||| |||||||    
T  21143486 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccg 21143531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23074065 - 23073816
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||| || ||     
T  23074065 tgaattttctattgatcttgttcttggaacaaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagccaagttgaagaaacaattagaa 23073966  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  23073965 gatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagggaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 23073866  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  23073865 actatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccg 23073816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 24705727 - 24705972
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  24705727 ttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 24705826  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  24705827 tgcttgagaagagatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 24705926  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||    
T  24705927 tcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccg 24705972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24712232 - 24711987
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24712232 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtttcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 24712133  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  24712132 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 24712033  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |  |||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24712032 tcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 24711987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 24874995 - 24875240
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  24874995 ttttctattgatctagtccctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtttgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatt 24875094  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  24875095 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 24875194  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24875195 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 24875240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 30010426 - 30010674
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||  | || ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  30010426 gaattttctattgatcttattccgggtacgaagcctatttctatggcaccttaccatatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaaacagttagaag 30010525  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  30010526 atttgcttgataaaaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtataga 30010625  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || ||  ||||| || ||||| |  |||||||| | |||||||||||||    
T  30010626 ttgctaacagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccg 30010674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23204512 - 23204273
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  23204512 ttttctattgatcttgttcctgggacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 23204413  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  23204412 tgctcgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttagggagcgccagttttgatagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 23204313  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcca 244  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||    
T  23204312 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23204273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 22734019 - 22734264
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||| || || ||||||||||| || || || |    
T  22734019 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 22734118  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  22734119 tacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 22734218  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | || |||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  22734219 tcgacaattgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccg 22734264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 23105973 - 23106218
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||| || ||||| |    
T  23105973 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttcgccgagttaaagaaacaattagaggatt 23106072  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | || || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  23106073 tactcgagaaaaagttcgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgctggtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 23106172  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  23106173 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 23106218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 30209159 - 30209407
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||  | |  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||  | |    
T  30209159 gaattttctattgatcttattccgggtacgaagcctatttatatggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaagcagttaaaag 30209258  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| || ||    
T  30209259 atttgcttgataaaaagtttgtaagaccgagtgtatcgccctggggagcgccgatgttattggttaagaagaaagatggtcgcatgaggttatgtataga 30209358  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||| ||||| || ||||| |  |||||||| | |||||||||||||    
T  30209359 ttactgacagttaaataaagtgacaataaagaataagtatccacttccg 30209407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24818081 - 24818234
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  24818081 tgaattttctattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgaattgaagaaataattacaa 24818180  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccg 154  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818181 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccg 24818234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16983442 - 16983326
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  16983442 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 16983343  T
Q  101 gacttgcttgataagaa 117  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16983342 gacttgcttgagaagaa 16983326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16924179 - 16924063
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  16924179 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcgccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 16924080  T
Q  101 gacttgcttgataagaa 117  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16924079 gacttgcttgagaagaa 16924063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 24657903 - 24658017
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || |    
T  24657903 ttttctattgatcttgttcgtggaacgaagccggtgtcgatggcacctta-cgtatgtctgcttccgagttagttgagttgaagaaacagttagaagatt 24658001  T
Q  105 tgcttgataagaaatt 120  Q
    ||||||| ||||||||    
T  24658002 tgcttgagaagaaatt 24658017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 24829507 - 24829677
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  24829507 tgaattgaaaaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcgccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 24829606  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  24829607 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 24829677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22280229 - 22280119
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||| | ||| | ||| | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  22280229 tgaattgaagaaacaattagaagagttgcttcagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggggctccagtgttgttggttaagaagaaagat 22280130  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  22280129 ggaagcatgag 22280119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 24818628 - 24818719
Alignment:
Q  158 ttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| | |||||  | |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  24818628 ttgttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttcc 24818719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25130733 - 25130623
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | ||| | || ||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||    
T  25130733 tgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttattaggccaagtgtttctccgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagat 25130634  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  25130633 ggaagcatgag 25130623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 22759890 - 22759998
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || ||  ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  22759890 tgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggcc--gtgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 22759987  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  22759988 ggaagcatgag 22759998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 579
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 729  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  728 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttagggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattg 629  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  628 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccg 579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7344 - 7095
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7344 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggag 7245  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  7244 aacttgcttgataagaaatttgtaagatcaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 7145  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7144 acttccgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 7095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 15356821 - 15357070
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  15356821 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttggctgagttgaagaaacaattggaa 15356920  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356921 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgttttaccgtggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 15357020  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357021 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 15357070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15258498 - 15258252
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15258498 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaactgttggag 15258399  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  15258398 gacttgctcgataagaaatttgtaagaccaagtgattcaccttggggagcgtcggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattg 15258299  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15258298 attaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactt 15258252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16150282 - 16150033
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  16150282 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgaattgaagaaatagttggag 16150183  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  16150182 gacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaataaggatggtactatgaggttgtgcattg 16150083  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16150082 attatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 16150033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16154428 - 16154179
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  16154428 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgaattgaagaaatagttggag 16154329  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  16154328 gacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaataaggatggtactatgaggttgtgcattg 16154229  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16154228 attatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 16154179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11204933 - 11205181
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11204933 tgaattttcaattgagcttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaagaagcagttggag 11205032  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  11205033 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 11205132  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11205133 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcc 11205181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 15001066 - 15001315
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15001066 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgaaggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggag 15001165  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  15001166 aacttgcttgacaagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgaggagtgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 15001265  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  15001266 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 15001315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 3262495 - 3262743
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3262495 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 3262594  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  3262595 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 3262694  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  3262695 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 3262743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20892602 - 20892385
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20892602 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgaag 20892503  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  20892502 gacttgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcattg 20892403  T
Q  201 attactgtcagttgaaca 218  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  20892402 attaccgtcagttgaaca 20892385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 29451238 - 29451486
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29451238 tgaattttcaattgatcttgttccaggaacaaagccggtgtcgatgacaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 29451337  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || |    
T  29451338 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagactatgtatag 29451437  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  29451438 attaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcc 29451486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15072930 - 15072681
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072930 tgaattttcgattgatcttgtccccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 15072831  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |  ||||| || || || |    
T  15072830 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggtattattggttaagaagaatgatggcagtatgaggttgtgtatag 15072731  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     |||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  15072730 gttaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccg 15072681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 44659567 - 44659809
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44659567 tgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccatatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 44659666  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  44659667 gacctgttagataagaagtttgtaagactcagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 44659766  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcc 243  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  44659767 attaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatcc 44659809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15145338 - 15145583
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15145338 ttttctattgatcttgttcttggaatgaagccggtgtctatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagact 15145437  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15145438 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccttttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgatta 15145537  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15145538 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 15145583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 14301424 - 14301669
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14301424 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 14301523  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  14301524 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 14301623  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14301624 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16251295 - 16251540
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16251295 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcaggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgaattgaagaaacagttagaagatt 16251394  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  16251395 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 16251494  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16251495 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16251540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8708478 - 8708229
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||  |||||||| | |||||  |||||||||| |  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  8708478 tgaattttcaatcgatcttgttccagatacgaagcctatgtcgatgacgccttactgtatgtcagcatctgagctagcagagttgaagaaacagttggag 8708379  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || || || |    
T  8708378 gatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcgtgaggttgtgtatag 8708279  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  8708278 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 8708229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14683134 - 14682889
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||| || |    
T  14683134 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagtcgaagaaacagttggaagatt 14683035  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  14683034 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 14682935  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14682934 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14682889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23958314 - 23958069
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23958314 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 23958215  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  23958214 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 23958115  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  23958114 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 23958069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27713903 - 27713658
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27713903 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 27713804  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  27713803 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 27713704  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27713703 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27713658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40475607 - 40475362
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| || |    
T  40475607 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaactgttggaagatt 40475508  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  40475507 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaggatggtagtatgcggttatgtattgatta 40475408  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  40475407 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 40475362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 51604497 - 51604742
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  51604497 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 51604596  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  51604597 tacttgataagaagtttgtaagacccagcgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 51604696  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  51604697 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 51604742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14696684 - 14696436
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||| |||||||||||||| ||     
T  14696684 tgaattttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggttgagttgaagaaacagttagaa 14696585  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  14696584 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 14696485  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||    
T  14696484 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttcc 14696436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 1646988 - 1647227
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1646988 attgatcttgtcccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgaattggctgagttgaagaaacagttggaggatttgcttg 1647087  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  1647088 acaagaagtttgtaagacccagtgtctcaccgtggggagcacctgtgttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 1647187  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  1647188 attgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccg 1647227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27902946 - 27902708
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27902946 attgatcttattccgggaacgaaaccggtgtcgatggcaccatatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaagaaacagttg-aggacttgcttg 27902848  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||  ||||    
T  27902847 ataagaagtttgtaagacccagtgtttcgttgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagattgtgcattgactatcgtca 27902748  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  27902747 gttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccg 27902708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 8051068 - 8051313
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8051068 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 8051167  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  8051168 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagtgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 8051267  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  8051268 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 8051313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16234437 - 16234682
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  16234437 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttagaagact 16234536  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  16234537 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 16234636  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16234637 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16234682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 17092590 - 17092839
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  17092590 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 17092689  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |    
T  17092690 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattg 17092789  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  17092790 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 17092839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8388979 - 8388734
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  8388979 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaagact 8388880  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  8388879 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 8388780  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  8388779 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 8388734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16218801 - 16218552
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||     
T  16218801 tgaattttcgattgatctggttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggttgagttgaagaagcagttagaa 16218702  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16218701 gatttacttcataagaagtttataagaccaagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattg 16218602  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16218601 attatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccg 16218552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16222121 - 16221872
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||     
T  16222121 tgaattttcgattgatctggttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggttgagttgaagaagcagttagaa 16222022  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16222021 gatttacttcataagaagtttataagaccaagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattg 16221922  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16221921 attatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccg 16221872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 19776238 - 19776483
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19776238 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 19776337  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  19776338 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 19776437  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19776438 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 19776483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14162037 - 14161793
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||| || ||| || | |||||||||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14162037 ttttcaatcgatcttatttcgggaacgaagcctatatctatgacaccttatcgtatgtctgcttctaagttagctgaattgaagaaacagttggaggatt 14161938  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  |||||| | || || |||||    
T  14161937 tgcttgacaagaaatttgtgagaccaagtgtttctccttggggagcgccagtgttgttagtcaagaagaaagatggtagtatgagactgtgtattgatta 14161838  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | ||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||    
T  14161837 tcgacagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttcc 14161793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12479167 - 12478922
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  12479167 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggtaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaagact 12479068  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  12479067 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 12478968  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  12478967 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 12478922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 16352987 - 16353220
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  16352987 cttgttcctggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaactgagttgaataaacaattagaagatttgcttgagaaga 16353086  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||||||   |||||||||    
T  16353087 agtttgttagaccaagtttttcaccttgaggagcgcccgttttgttagtaaagaaaaaagatggtagtatgaggttatgtatcgattatcatcagttgaa 16353186  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     ||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16353187 taaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 16353220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 18224891 - 18225136
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |    
T  18224891 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagttggtatcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgagttagctgagttgacaaaacagttagaagatt 18224990  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  18224991 tgctcaagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtcaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 18225090  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  18225091 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 18225136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14848807 - 14849055
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |  || ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||||||| | || ||     
T  14848807 tgaattttcgattgatcttattccggatacaaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaataattagaa 14848906  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  14848907 gatttacttgagaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttagggagcgccgatattgctagttaaaaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 14849006  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  14849007 attatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttcc 14849055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23443621 - 23443427
Alignment:
Q  56 cgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgg 155  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  23443621 cgtatgtcagcttctgagttggctgaattgaagaaacagttagaagatttgcttgataaaaagtttgtaagaccaaatgtttcaccttgaggagcgccga 23443522  T
Q  156 tgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||| |  |||||||||| |||||||  |||||||| || || || ||  |  ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  23443521 tattgctaattaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgactatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccg 23443427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22632267 - 22632026
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| || || |    
T  22632267 ttttcgattgatcttgttcctggaatgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacagttagaagatt 22632168  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||    ||||||||| || || || ||    
T  22632167 tacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagtgtcggttttgttagtgaagaagaaagatg----catgagattgtgtattgacta 22632072  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  22632071 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 22632026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19634703 - 19634608
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  19634703 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagtcggag 19634608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 15290937 - 15291107
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| |||| |||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15290937 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtggttcaccgtggggtgctccaatgttgttggttaagaagaaagat 15291036  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgatta-ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | ||||| ||| ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  15291037 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatctg-cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 15291107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1189 - 1438
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1189 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttagcgtatgtcggcgtccgagttagttgaattgaagaaacagttggag 1288  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  1289 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtaccatgaggttatgcattt 1388  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1389 attatcgtcagttaaataaagtgacgataaagaacaggtatccatttccg 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5055 - 5304
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  5055 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggtaccttagcgtatgtcagcttccgagttggctaagttgaagaaacaattggag 5154  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  5155 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttttgcattg 5254  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5255 attatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 5304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9486 - 9735
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  9486 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggtaccttagcgtatgtcagcttccgagttggctaagttgaagaaacaattggag 9585  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  9586 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttttgcattg 9685  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9686 attatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 9735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 413 - 180
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  413 cttgttcctggaacgaagccggtgttgatggcaccttagcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatttgcttgagaaga 314  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  313 agttttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgattatcgtcacttgaa 214  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  213 caatgtgactatcaagaataggtatccacttccg 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42298 - 42049
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42298 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttggag 42199  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  42198 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 42099  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  42098 attaccgtcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccg 42049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 51059 - 51298
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  51059 attgaccttgttcctggaaagaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatttgcttg 51158  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||  || |    
T  51159 agaagaagtttgttagaccaattgtttcaccatggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagacggtagtatgagattatgtatcgattatcgtta 51258  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  51259 gttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 51298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11959098 - 11959347
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959098 tgaatttttaattgaccttgttccaggaacaaagctggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 11959197  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  11959198 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattg 11959297  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11959298 actaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 11959347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12358456 - 12358705
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12358456 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgccgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggac 12358555  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12358556 aactagcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgatggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 12358655  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12358656 attattgtcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 12358705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11949837 - 11950086
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11949837 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 11949936  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  11949937 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgtcggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattg 11950036  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11950037 actatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 11950086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12272538 - 12272289
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12272538 tgaattttcaatcgacattgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgttcgagttagctgagttgaagaaacagttgggg 12272439  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12272438 gacttgcttgataagaaatttgtaagacccagtgtttcaacttggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 12272339  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12272338 attattgtccgtttaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 12272289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17493846 - 17493658
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17493846 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 17493747  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgag 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17493746 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtactatgag 17493658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12180544 - 12180295
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12180544 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcactttatcgtatgtcgacgtccgagttggctgagttgaagaaatagttggag 12180445  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  12180444 gacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgttggttaagaagaatgatggtaccatgaggttattcattg 12180345  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12180344 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 12180295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16826210 - 16826459
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16826210 tgaattttcaattaaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggag 16826309  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || || |    
T  16826310 gacttgcttgataagaaatttgtgaaaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaagttgtgtatag 16826409  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16826410 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 16826459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31941103 - 31940854
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31941103 tgaattttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 31941004  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||||| |    
T  31941003 gacttgcttgataagaagtttgtaagacacagtgtttcatcgtggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggctgtgcattg 31940904  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31940903 actatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 31940854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12510412 - 12510661
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12510412 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaatccagtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctaagttgactgaattgaagaaacggttggag 12510511  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  12510512 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 12510611  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12510612 attaccgtcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccg 12510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18132275 - 18132524
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18132275 tgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 18132374  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  18132375 cacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgcctgtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattg 18132474  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||  || | ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18132475 tctatcgttaattgaataaagttacaattaagaacaggtatccacttccg 18132524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31693114 - 31693363
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31693114 tgaactttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgacgaaacagttggaa 31693213  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| ||||||  | ||||| |    
T  31693214 gacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgccgatatagttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggctgtgcattg 31693313  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31693314 actatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 31693363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24189504 - 24189255
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24189504 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcggcttctgagttagctgaattgaagaatcagttggaa 24189405  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||  ||||||| |    
T  24189404 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccgaatgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttagtaaagaaaaaggatggtagtatgaggctatgcattg 24189305  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24189304 actatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 24189255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10408164 - 10407920
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10408164 ttttcaatagaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgaattagctgagttgaagaaacagttggaggacc 10408065  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |||||    
T  10408064 tgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatagatta 10407965  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  10407964 ccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 10407920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14575186 - 14575021
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14575186 tgaattttcaattgactttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtatgcttccgaattagctgaattgaagaaacagttggag 14575087  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggtt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14575086 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttattggtt 14575021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15229803 - 15229554
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15229803 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 15229704  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  15229703 gatttacttgacaagaaatttgtaagaccgagagtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 15229604  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  15229603 attaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccg 15229554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15235671 - 15235422
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15235671 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 15235572  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  15235571 gatttacttgacaagaaatttgtaagaccgagagtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 15235472  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  15235471 attaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccg 15235422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47126144 - 47125896
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47126144 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 47126045  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||  || | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  47126044 gaactgttagataaaaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 47125945  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  47125944 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 47125896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14088851 - 14088624
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  14088851 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttg 14088752  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  14088751 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagt 14088652  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  14088651 tacgataaagaacagatatccgcttccg 14088624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 14291461 - 14291708
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||||     
T  14291461 tgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagatagctgagttaaagaaacagttggaa 14291560  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | || |    
T  14291561 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtgggaagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgagtatag 14291660  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14291661 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttc 14291708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17188574 - 17188325
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  17188574 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccgtaccatatgtcggcttctgagttagctgaattgaagaatcagttagaa 17188475  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||  |||||  ||||||| |    
T  17188474 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctttgttgttagtaaagaaaaaggatggtagtatgaggctatgcattg 17188375  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17188374 actatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 17188325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28756519 - 28756270
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28756519 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 28756420  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcacctt-ggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatc 199  Q
    ||| || | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||     
T  28756419 gacctgttagataaaaagtttgtaagacccagtgtttcaccttgggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtata 28756320  T
Q  200 gattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  28756319 gattaccgtcaattgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 28756270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 13318438 - 13318676
Alignment:
Q  8 tcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13318438 tcaattgatcttgttccaggaacgaagccagtgtcgctggcaccttatcgtatgtcgacgtctgagctagccgagttgaagaaacagttggaggacttgc 13318537  T
Q  108 ttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||       
T  13318538 ttgataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccatggggaacgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtgtgagattgtgcattgactatca 13318637  T
Q  208 tcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  13318638 tcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccact 13318676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 13970071 - 13970298
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  13970071 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttg 13970170  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||| ||||| |||||    
T  13970171 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtattgactaccgtcaattgaataaagt 13970270  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13970271 tacgataaagaacagatatccgcttccg 13970298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15714000 - 15714245
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15714000 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 15714099  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  15714100 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 15714199  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15714200 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15714245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13944220 - 13943975
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13944220 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 13944121  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  13944120 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 13944021  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  13944020 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 13943975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15587336 - 15587581
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15587336 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 15587435  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  15587436 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 15587535  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15587536 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15587581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41179718 - 41179473
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  41179718 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 41179619  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  41179618 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 41179519  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  41179518 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 41179473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44779443 - 44779198
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  44779443 ttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 44779344  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  44779343 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 44779244  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  44779243 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 44779198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3688129 - 3687884
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3688129 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 3688030  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  3688029 tgctcgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 3687930  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  3687929 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 3687884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5108551 - 5108800
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||     
T  5108551 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagctatctgagttgaagaaacagttggaa 5108650  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |    
T  5108651 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattg 5108750  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  5108751 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 5108800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 5422874 - 5423119
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5422874 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacaattggaggact 5422973  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  5422974 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 5423073  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  5423074 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 5423119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 8745323 - 8745568
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8745323 ttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 8745422  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||| || ||    
T  8745423 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggaagtatgaggttgtgcattgacta 8745522  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  8745523 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 8745568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10007786 - 10007541
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  10007786 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacggttggaagact 10007687  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  10007686 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 10007587  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  10007586 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 10007541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10908396 - 10908151
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10908396 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 10908297  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  10908296 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgatagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 10908197  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  10908196 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 10908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12888895 - 12888650
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12888895 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 12888796  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  12888795 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 12888696  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  12888695 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 12888650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15400461 - 15400706
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| || |    
T  15400461 ttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatccgagttgaagaaacagttggaagatt 15400560  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  15400561 tgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 15400660  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15400661 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15400706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16637959 - 16637714
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16637959 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 16637860  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  16637859 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 16637760  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16637759 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16637714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16694350 - 16694105
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  16694350 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtagatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 16694251  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  16694250 tgcttgaaaagaaatttgttagactaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 16694151  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||| || || |  || ||||| | |||||||||||||    
T  16694150 tcgtcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccg 16694105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 20059998 - 20060243
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20059998 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 20060097  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  20060098 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 20060197  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  20060198 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 20060243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24185376 - 24185131
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  24185376 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatt 24185277  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  24185276 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 24185177  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  24185176 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 24185131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 26791357 - 26791602
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26791357 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 26791456  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  26791457 tgcttgagaagaagtttgttagatcaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 26791556  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  26791557 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 26791602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43164861 - 43164616
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43164861 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 43164762  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  43164761 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 43164662  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  43164661 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 43164616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48427637 - 48427388
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  48427637 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 48427538  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |    
T  48427537 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattg 48427438  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  48427437 attatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 48427388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 250
Target Start/End: Original strand, 16804912 - 16805136
Alignment:
Q  26 ggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaa 125  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  16804912 ggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttggctaagttgaagaaacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgtta 16805011  T
Q  126 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||  |||||||||||||||| |     
T  16805012 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaac 16805111  T
Q  226 gataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     || ||||| |||||||||||||||    
T  16805112 tatcaagaataggtatccacttccg 16805136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 12844043 - 12844289
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  12844043 tgaattttcaattgatcttgtatcgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggctgagttgaagaaacaattagaa 12844142  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| |    
T  12844143 gatttgcttgataagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgcattg 12844242  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    | ||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12844243 actatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccactt 12844289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13254876 - 13254631
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||    
T  13254876 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctaagttgaagaaacagttggaagact 13254777  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  13254776 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 13254677  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  13254676 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 13254631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 15346189 - 15346434
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  15346189 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaagact 15346288  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  15346289 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 15346388  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15346389 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15346434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16378862 - 16379106
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16378862 ttttcgattgaccttgttccaggaataaagctggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagtt-gaagact 16378960  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||| || ||||| || ||    
T  16378961 tgcttgataagaagtttgttcgacccagtgtttcaccgtggggagtgcctgtgttgttggtgaagaaaaaggacagtagcatgaggttgtgcattgacta 16379060  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||    
T  16379061 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccg 16379106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 53382962 - 53383207
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  53382962 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggatt 53383061  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||| ||| | || || || |||||    
T  53383062 tgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtactatgcggttgtgtattgatta 53383161  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | | |||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  53383162 tcggccgttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 53383207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14579348 - 14579596
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||| || |||    
T  14579348 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttgactgagttgaagaaacaattagag 14579447  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| |    
T  14579448 gatttgcttgagaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgcccgttttgttagtaaagaagaaagatggcagtatgaggttatgcattg 14579547  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  |  ||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  14579548 attatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttcc 14579596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 15013697 - 15013945
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  15013697 gaattgtcgattgatcttattccaggtacaaagcctatgtcgatggcaccttaccatatgtcagcttcggaattagctgagttgaaaaagcagttagaag 15013796  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  15013797 atttgcttgaaaagaagtttgtaagaccgagtgtgtcaccttggggagcgctggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtataga 15013896  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | || | |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  15013897 tcaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 15013945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15261818 - 15261571
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| || || ||    
T  15261818 aattttcgattgaccttgttctaggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaaga 15261719  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||    
T  15261718 cttgcttgataagaagtttgcaagaccaaatgtttcacattggggagtgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgat 15261619  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||  | ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  15261618 tatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccg 15261571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6602922 - 6602745
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6602922 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggact 6602823  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  6602822 tgcttgaaaagaagtttgttaggccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggta 6602745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 10417984 - 10418223
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10417984 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 10418083  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  10418084 ataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaaaaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 10418183  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  10418184 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 10418223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15358263 - 15358024
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15358263 attgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatccgagttgaagaaacagttggaagatttgctcg 15358164  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||  | ||    
T  15358163 agaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgattatcgaca 15358064  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  15358063 gttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccg 15358024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12071160 - 12071009
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12071160 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 12071061  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 156  Q
    || |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12071060 tgtttgagaagaagtttgttaggccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 12071009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16754645 - 16754890
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  16754645 ttttctattgatcttgttcctggaacgacgtcggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatccgagttgaagaaacagttggaggact 16754744  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  16754745 tgctagaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcaggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 16754844  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16754845 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16754890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11888294 - 11888542
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||||  |||||  | || ||||||||||| || ||     
T  11888294 tgaattttcgattgatcttgttcctggtacgaagcatgtgtctatgacgccttaccatatgtcggcttctgagttgtccgagttgaagaaacaattagaa 11888393  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |    
T  11888394 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagtgccgattttgttagttaagaagaaagacggtagcatgaggttatgcattg 11888493  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  11888494 attatcgacagttgattaaagtaacgataaacaataggtatccacttcc 11888542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17492036 - 17491791
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || || || |    
T  17492036 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 17491937  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  17491936 tacttgagaaaaagtttgttagaccaagtttttcgccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 17491837  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | || |||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  17491836 tcgacatttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 17491791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18437330 - 18437085
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||| || ||     
T  18437330 tgaattttctattgatcttgttcttggaacgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaaaaaacaattagaa 18437231  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  18437230 gatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtaggatgagattgtgtattg 18437131  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    ||||  | ||||| |||||||| |  |||||||| | |||||||||    
T  18437130 attatcgacagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccact 18437085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Original strand, 16832461 - 16832570
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16832461 ttttcgattgaccttgttccgggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacggttggaagact 16832560  T
Q  105 tgcttgataa 114  Q
    ||||||||||    
T  16832561 tgcttgataa 16832570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 250
Target Start/End: Original strand, 16834554 - 16834693
Alignment:
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| || || || |||||| ||||    
T  16834554 ataagaagtttgttcgacccagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttattggtaaagaagaaggatggtagcctgaggttgtgtatagattaccgtca 16834653  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16834654 gttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccg 16834693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 14874512 - 14874597
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaa 90  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14874512 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaa 14874597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 247
Target Start/End: Original strand, 16327734 - 16327835
Alignment:
Q  146 ggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccac 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  16327734 ggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatagattaccgtcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccac 16327833  T
Q  246 tt 247  Q
    ||    
T  16327834 tt 16327835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15612225 - 15612055
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15612225 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 15612126  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  15612125 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 15612055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Original strand, 13304298 - 13304381
Alignment:
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgca 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13304298 agaaatttgtaagacccagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagattgtgca 13304381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 16327638 - 16327737
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327638 tgaatttttaattgaccttgatccaggaacaaagccggtgtcgatggcactataccgtatgtcagcttctgagttagccgaattgaagaaacaattggag 16327737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 13965370 - 13965540
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  13965370 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13965469  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  13965470 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 13965540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30139928 - 30139758
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  30139928 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 30139829  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  30139828 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 30139758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30149479 - 30149309
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  30149479 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 30149380  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  30149379 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 30149309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 192
Target Start/End: Original strand, 14874599 - 14874673
Alignment:
Q  118 atttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagatt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  14874599 atttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagtttttctagtgaagaagaaagatggtagcatgagatt 14874673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 15948488 - 15948658
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  15948488 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattaggccgagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 15948587  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || |  ||||| || ||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  15948588 ggaagtatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttcc 15948658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 8272391 - 8272512
Alignment:
Q  53 tatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgc 152  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  8272391 tatcggatgtctgcattggagttgggtgaaatgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctc 8272490  T
Q  153 cggtgttgttggttaagaagaa 174  Q
    | |||||| | |||||||||||    
T  8272491 cagtgttgctagttaagaagaa 8272512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17200756 - 17200616
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  17200756 tgaattgaagaagcagttagaagaattgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 17200657  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaa 219  Q
     | | ||| ||||| ||  | |||||  |||||||||||||    
T  17200656 tgaagcataagattgtgtgtggattatcgtcagttgaacaa 17200616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25768388 - 25768297
Alignment:
Q  131 agtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||    
T  25768388 agtgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgagattgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagt 25768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 6150871 - 6150981
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||  | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  6150871 tgaattaaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 6150970  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  6150971 ggaagcatgag 6150981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33937 - 33687
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33937 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaatccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 33838  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |    
T  33837 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggaagcgccagtgttgttggttaagaagaaggatggtagcttgaggttatgcattg 33738  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatga-taaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  33737 attatcgtcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccg 33687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9663 - 9414
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9663 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtttatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 9564  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  9563 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattg 9464  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9463 attatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 9414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Original strand, 1200 - 1442
Alignment:
Q  8 tcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1200 tcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 1299  T
Q  108 ttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||   | ||||| || ||  |    
T  1300 ttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcgccgtggggagcgcctatgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaccctgtgcattgactatcg 1399  T
Q  208 tcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1400 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccg 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 251222 - 250973
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  251222 tgaattttcaattgaccttattccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaagaaacagttggag 251123  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  251122 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattg 251023  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  251022 attaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 250973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5849 - 6096
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5849 tgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 5948  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  5949 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttactagtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattg 6048  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6049 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttc 6096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19338 - 19585
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19338 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtaaatggcacattaacgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 19437  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  19438 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 19537  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    | || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19538 actattgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttc 19585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14808 - 14559
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  14808 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgccggcgtccgaacttgctgaattgaagaaacagttggag 14709  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14708 aacttgcttgataataaatttgtaataccaagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgttggttaagaagaaggatggtaccatgaggttatgcattg 14609  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14608 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 14559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5758
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  5589 tgaattgaagaatcagttggaggagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgt-gggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 5687  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  5688 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 5758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29224 - 28975
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 29125  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |    
T  29124 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggcaacatgacgttatgcattg 29025  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  29024 attatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 28975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 49884 - 50129
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||     
T  49884 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaa 49983  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49984 gacttgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcg 50083  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    | ||  || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  50084 actatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccact 50129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 58918 - 59163
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||     
T  58918 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaa 59017  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  59018 gacttgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcg 59117  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    | ||  || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  59118 actatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccact 59163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 65306 - 65551
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||     
T  65306 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaa 65405  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  65406 gacttgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcg 65505  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    | ||  || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  65506 actatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccact 65551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5351 - 5102
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  5351 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgaacttgctgaattgaagaaatagttggag 5252  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5251 gacttgcttgataagaagtttgtaagacaaagtgtttcaccttggggagcgctggtgttgttggttaagaagaatgatggtaccatgaggttatgcattg 5152  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5151 attaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Original strand, 41812 - 42058
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| |||||  || ||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| ||  |||| || |    
T  41812 gaattttcgattgatgttattccagatacgaagcatgtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttcggaattagctgagttgaaaaagtagttagacg 41911  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||| | |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || || || ||    
T  41912 atttgttggataagaagtttgtgagatcgagtgtgtcaccttggggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaagttgtgtataga 42011  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    |||| | |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  42012 ttaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttc 42058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21722 - 21473
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21722 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 21623  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| |    
T  21622 gacttgcttgataagaagtttgttagacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattg 21523  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21522 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 21473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 250
Target Start/End: Original strand, 27055 - 27201
Alignment:
Q  104 ttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatt 203  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  27055 ttgcttgataagaagtttgtaaggccgagtgtgtcgccttggggagcgccggtgttattggttaaaaagaaagatggtagcatgaggttatgtatagatt 27154  T
Q  204 actgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || | |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  27155 accggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 27201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21953495 - 21953247
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21953495 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttcggagttagctgaattgaagaaacagttggag 21953396  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  21953395 gacctgttagataagaaatttgtaagacccaatgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcattg 21953296  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21953295 attaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcc 21953247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20296998 - 20296749
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20296998 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgcatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggaa 20296899  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  20296898 gacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 20296799  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20296798 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccg 20296749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22016518 - 22016733
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22016518 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcttaactgaagaaacagttggag 22016617  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  22016618 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 22016717  T
Q  201 attactgtcagttgaa 216  Q
    ||||  ||||||||||    
T  22016718 attatcgtcagttgaa 22016733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24097388 - 24097625
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24097388 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctaagttagctgaattgaagaaacagttggag 24097487  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24097488 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttca------------ccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcattg 24097575  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24097576 attaccgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 24097625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 20937841 - 20938084
Alignment:
Q  6 tttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggactt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20937841 tttcaattgaccttgttccaggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgttagcttccgagttagctgtattgaagaaacagttggaggattt 20937940  T
Q  106 gcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattac 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||     
T  20937941 gcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaataaggatggtagtatgaggttatgcattgactat 20938040  T
Q  206 tgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
     |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20938041 cgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcc 20938084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19856891 - 19856642
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||  | |||||||||||||||||||||||     
T  19856891 tgaattttcaattgaccttgttccaagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgaacttgctgaattgaagaaacagttggaa 19856792  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19856791 gacttacttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattg 19856692  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||   ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19856691 actatcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 19856642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48425490 - 48425242
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48425490 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 48425391  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  48425390 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 48425291  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  48425290 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 48425242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 52988358 - 52988110
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52988358 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 52988259  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  52988258 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 52988159  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  52988158 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 52988110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21739809 - 21740058
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21739809 tgaattttctatcgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagtgtccaagttagttgaattgaagaaacagttggag 21739908  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || || |    
T  21739909 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccgatgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgatgttgtgtatag 21740008  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  21740009 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 21740058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21743325 - 21743574
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21743325 tgaattttcaatcgatcttatgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaatagttggag 21743424  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  21743425 gacttgcttgataataaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 21743524  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  21743525 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 21743574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37679666 - 37679418
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37679666 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 37679567  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| | || || |    
T  37679566 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaaaaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 37679467  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  37679466 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 37679418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 31537770 - 31538018
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31537770 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaagcagttggag 31537869  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  31537870 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 31537969  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  31537970 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcc 31538018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41311141 - 41310894
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41311141 aattttcaatcgatcttgtgcctggaacgaagccggtgtccatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcttaattgaagaaacagttggagga 41311042  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||    
T  41311041 tttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgattcaccgtgggaagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagtttgtgtatagat 41310942  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||  ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  41310941 taccatcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 41310894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 20833677 - 20833922
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |  ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20833677 ttttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcatcttatcgtatgtcggcgtctgaacttgctgagttgaagaaacagttggaggact 20833776  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  20833777 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 20833876  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  20833877 tcgtcagtttaataaagttacaataaagaacagatatccacttccg 20833922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 38910599 - 38910847
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  38910599 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagttgagttgaagaagcagttggag 38910698  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||  || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  38910699 gatctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 38910798  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  38910799 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcc 38910847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 17042789 - 17043033
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17042789 gaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtttgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagagg 17042888  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || ||    
T  17042889 atttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattga 17042988  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
     ||  |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||    
T  17042989 ctatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccact 17043033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 77 - 250
Target Start/End: Original strand, 19660985 - 19661158
Alignment:
Q  77 gctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaagg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660985 gctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgataaaaagtttgtaagaccaagtgcgtcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaagg 19661084  T
Q  177 atggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19661085 atggtactatgaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 19661158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21839532 - 21839287
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21839532 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 21839433  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  21839432 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 21839333  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  21839332 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 21839287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 21862146 - 21862394
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  21862146 tgaatttttgattgatcttgttcctggaacgaagtcagtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagag 21862245  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||| | || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21862246 gatttgctttagaaaaagtttgttagaacaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgcattg 21862345  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  21862346 attatcgacagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttcc 21862394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 16348372 - 16348617
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16348372 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 16348471  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  16348472 tgctcgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 16348571  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16348572 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16348617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19108938 - 19108705
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19108938 cttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttgagaaga 19108839  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||  | ||||||||    
T  19108838 aatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgattatcgacagttgaa 19108739  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19108738 caaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 19108705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 21233508 - 21233753
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21233508 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcatcttatcgtatgtctgcttccgagttagctgaattgaagaaacagttagaagaat 21233607  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | || ||||||||  |||||| |||||| || || || || ||    
T  21233608 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggaacgccagttttgctagtgaagaagaaatatggtagcatgagtttgtgtattgacta 21233707  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  21233708 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 21233753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 20854543 - 20854782
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20854543 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcaccgtatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaagaaacagttggaggacttgcttg 20854642  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  20854643 ataagaagtttgtgagacccagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 20854742  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  20854743 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 20854782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16378671 - 16378433
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16378671 attgatcttgttccgagaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggctaagttgaagaaacagttagaggatttgcttg 16378572  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||| || || |||||| | ||    
T  16378571 ataagaagtttgtgagaccaagtgtttctccttggggagcgccgatattgttagttaaaaagaaagatggtagtatgaaattgtgtattgattaccgaca 16378472  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16378471 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 16378433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21832884 - 21832639
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21832884 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 21832785  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  21832784 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 21832685  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||  |||||||||||||||    
T  21832684 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccg 21832639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 22503066 - 22503311
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  22503066 ttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcaggttctgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 22503165  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||| ||||||||| || || |||||    
T  22503166 tgcttgagaagaagtttgtaagacccagtgtttcaccctggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaaaatggtagcatgagattgtgtattgatta 22503265  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      || ||||||| | ||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22503266 tcgtaagttgaatagagtaactatcaagaataggtatccacttccg 22503311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 33388806 - 33389051
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33388806 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 33388905  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  33388906 tgcttgagaaaaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 33389005  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  33389006 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 33389051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 51331269 - 51331515
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51331269 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 51331368  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttc-accttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatt 203  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || ||||    
T  51331369 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatt 51331468  T
Q  204 actgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  51331469 atcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 51331515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 50618171 - 50618420
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  50618171 tgaattttcaattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 50618270  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  50618271 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcacgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 50618370  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | |   |  ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  50618371 actgtcggtagttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccg 50618420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21751523 - 21751277
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |   | ||||||||||||||| |     
T  21751523 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcttgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttgg---agttgaagaaacagttgaaa 21751427  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || ||      
T  21751426 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcactttggggagcgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattt 21751327  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  21751326 attatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccg 21751277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20140669 - 20140420
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || |||    
T  20140669 tgaattttcgatcgatcttgttcctggaacgaagcctatgtccatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagag 20140570  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||  ||||  |||||||| |    
T  20140569 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtctcgccttggggagcgcccgttttgttggtaaagaagaaagacggtagtatgaagttatgcattg 20140470  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     |||  |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  20140469 cttatcgtcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 20140420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 41351445 - 41351622
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41351445 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggact 41351544  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    |||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  41351545 tgctcgaaaggaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggta 41351622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 22360017 - 22360266
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  22360017 tgaattttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtttctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 22360116  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||| ||||||||| || || |    
T  22360117 gatttacttgagaaaaagtttgttaaaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaaaatggtagcatgagattgtgtattg 22360216  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||    
T  22360217 actatcgtcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccg 22360266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 429893 - 430137
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || || ||      
T  429893 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatc 429992  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  429993 tccttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 430092  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||    
T  430093 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttcc 430137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 20829243 - 20829413
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  20829243 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 20829342  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  20829343 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 20829413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20927593 - 20927393
Alignment:
Q  48 caccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggg 147  Q
    |||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||| | |||| |||||| || || |||||    
T  20927593 caccgtatcggatgtctgcattagagttgggtgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattagacgaagtgtatctccgtgggg 20927494  T
Q  148 agcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
     || || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  | |||||||||    
T  20927493 tgctccagtgttgttggttaagaagaatgatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccactt 20927394  T
Q  248 c 248  Q
    |    
T  20927393 c 20927393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20527561 - 20527391
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||| |||| ||||| || || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  20527561 tgaattgcagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 20527462  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  20527461 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttcc 20527391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Original strand, 35930730 - 35930846
Alignment:
Q  133 tgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaag 232  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||    
T  35930730 tgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaag 35930829  T
Q  233 aacaggtatccacttcc 249  Q
    ||  |||||||||||||    
T  35930830 aatcggtatccacttcc 35930846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49705 - 49459
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49705 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccgatatcgatggcaccttaccgtatgtcagcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggag 49606  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  49605 gacttgcttgataagaaa-ttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtattg 49507  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| || ||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  49506 attaccgttagttgaataaagtgacgataaagattaggtatccacttc 49459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 64223 - 64469
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  64223 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttgaag 64322  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  64323 gacttgcttgataagaaatttgtaacaccaagtgtttcaccttggggagcgtcggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 64422  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  64423 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccactt 64469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31023 - 31272
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31023 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcaacttatgagttagctgaattgaagaaacagttggag 31122  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  31123 gatttgcttgataacaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattg 31222  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31223 attaccgtcaatttaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 31272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2657 - 2906
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657 tgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 2756  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||| |    
T  2757 gacttgctcgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgtcgatgttgttggttaagaagaaggacaatagcatgaggttatgcattg 2856  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  2857 actatcgtcaattgaacaaagttacaataaataacaggtatccacttccg 2906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 69962 - 69723
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  69962 attgatcttgttccgggaacgaaatcggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaagaaacagttggaggacttgcttg 69863  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||  ||||    
T  69862 ataagaagtttgtaagacctagtgtttcgccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagattgtgcattgactatcgtca 69763  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  69762 gttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccg 69723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21323423 - 21323672
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21323423 tgaattttcaattgaccttgttccatgaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 21323522  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  21323523 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgtattg 21323622  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  21323623 actatcgtcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccg 21323672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27357173 - 27356925
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27357173 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatagaaccataccgtatgtcagcttctgagttagctaaattgaagaaacagtttgag 27357074  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  27357073 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagattgtgcatag 27356974  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  27356973 attaccgtcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcc 27356925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16269368 - 16269617
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16269368 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcaacttctgagttagctgagttgaagaaacagttggaa 16269467  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  16269468 gacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 16269567  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16269568 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccg 16269617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19984817 - 19984570
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19984817 tgaattttcaattgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttactgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 19984718  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |    
T  19984717 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggtattgctggttaagaagaatgatggtagcatgaggttatgtatag 19984618  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  19984617 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttc 19984570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21928063 - 21927816
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21928063 aattttcaattgatcttgttcccagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctaaattgaagaaacagttggagga 21927964  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  21927963 cttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatagat 21927864  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21927863 taccgtcagctgaataaagtgatgataaagaataggtatccacttccg 21927816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 29301571 - 29301819
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29301571 gaattttcaatagaccttgttccgggtacaaagcctgtgtcgatggctccttaccgtatgtcggcgtctgagttagccgagttgaagaaacagttggagg 29301670  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29301671 acttacttgataagaaatttgtaaggccaagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaaaaaggatggtagcatgagattgtgcatcga 29301770  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  29301771 ttaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccg 29301819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Original strand, 31414663 - 31414862
Alignment:
Q  51 cttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagc 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31414663 cttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagt 31414762  T
Q  151 gccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31414763 gccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgaaattatgcattaattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccg 31414862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23657509 - 23657315
Alignment:
Q  56 cgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23657509 cgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaaaaaacaatttgaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgctgg 23657410  T
Q  156 tgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23657409 tgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgcattgattatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 23657315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22053499 - 22053251
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053499 tgaattttcaattgaccttgtcccaggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcatcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 22053400  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| |    
T  22053399 gactagcttgataagaagtttgttagacccaatgtttcaccgt-gggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattg 22053301  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22053300 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccg 22053251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28983548 - 28983300
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  28983548 tgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattggag 28983449  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  28983448 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactttgtatag 28983349  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  28983348 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 28983300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28988767 - 28988519
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  28988767 tgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattggag 28988668  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  28988667 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactttgtatag 28988568  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  28988567 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 28988519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19980588 - 19980355
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  19980588 cttgttcctggaacgaagcccgtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacggttagaagatttgcttgagaaga 19980489  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19980488 agtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgattaccgtcagttgaa 19980389  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19980388 caaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 19980355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22523183 - 22522935
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  22523183 tgaattttcgattgaccttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccatatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaa 22523084  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22523083 gatttgcttgataagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggcgagcgccagtattgctagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgcattg 22522984  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22522983 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttcc 22522935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 21164686 - 21164931
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  21164686 ttttctattgatcttattcctggaacggagccggtgtcgatggcaccttatcgtatatcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 21164785  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || || ||||||||    
T  21164786 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtatcgatta 21164885  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  21164886 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 21164931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22373506 - 22373257
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  || |  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22373506 tgaattttcaattgatcttgttcccggaacgaagccgctgtcgatggcaccttaccgtatgttggcgtctgagttagccgaattgatgaaacagttggag 22373407  T
Q  101 gacttgcttgataag-aaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatc 199  Q
    || || ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||     
T  22373406 gatttacttgatagggaaatttataagaccgagtgtttcaccttggggagcgctggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtata 22373307  T
Q  200 gattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  22373306 gattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttcc 22373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20390723 - 20390474
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20390723 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgatgctggtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggtgtctgagttagctgagttgaagaaacagttggaa 20390624  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || |    
T  20390623 gatttacttgacaagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatag 20390524  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
     |||| |||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  20390523 tttaccgtcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccg 20390474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22042460 - 22042215
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  22042460 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 22042361  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  22042360 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaacttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 22042261  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22042260 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22042215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 22118323 - 22118568
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22118323 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatcgcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 22118422  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  22118423 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 22118522  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22118523 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22118568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 30311292 - 30311537
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  30311292 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 30311391  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| |||| || ||||||||| || || || ||    
T  30311392 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatgatagcatgagattgtgtattgacta 30311491  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  30311492 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 30311537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 31568991 - 31569236
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31568991 ttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagact 31569090  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  31569091 tacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 31569190  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  31569191 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 31569236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32602781 - 32602537
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  32602781 gaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagatg 32602682  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||| ||| |||||| || || || ||    
T  32602681 atttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatagtagcatgaggttgtgtattga 32602582  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
     ||  |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||    
T  32602581 ctatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccact 32602537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15536016 - 15535771
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  15536016 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 15535917  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  15535916 tgctcgaaaataaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 15535817  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15535816 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 15535771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 22127107 - 22127352
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22127107 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatcgcaccttatcgtatttctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 22127206  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  22127207 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 22127306  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22127307 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22127352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18859210 - 18858965
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18859210 ttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 18859111  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  18859110 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 18859011  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||| |||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  18859010 tcggcagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 18858965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 22422036 - 22422285
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  22422036 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacgaagcttgtgtctatgacaccttaccgtatgtcgacttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 22422135  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || |    
T  22422136 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaagatggtagcataagattgtgtattg 22422235  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  22422236 actatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccg 22422285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 20016411 - 20016656
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20016411 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 20016510  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  20016511 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 20016610  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  20016611 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 20016656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22030736 - 22030491
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || || |    
T  22030736 ttttctattgatcttgttcctcgaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacggttagaagatt 22030637  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || | |||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  22030636 tgcttgagaataaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgtttttctagtgatgaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 22030537  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22030536 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22030491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 20394277 - 20394524
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |  |||||| |||| |||    
T  20394277 tgaattttcgattgatcttgttctgggtacgaagcttgtgtctatggcaccttatcgtatgtcgacttttgaattagctgagtgtaagaaatagttagag 20394376  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    || |    
T  20394377 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttggttatag 20394476  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  20394477 attaccggcaattgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttc 20394524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 17672170 - 17672416
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttcca-ggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggac 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  17672170 ttttctattgatcttgttccttggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagac 17672269  T
Q  104 ttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatt 203  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || ||||    
T  17672270 ttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatt 17672369  T
Q  204 actgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |  | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  17672370 atcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 17672416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19115037 - 19114856
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  19115037 tgaattttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaa 19114938  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  19114937 gacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggta 19114856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 22131201 - 22131434
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataaga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  22131201 cttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtctgcttccgagttagccgagttgaagaaacaattagaagatttgcttgaaaaga 22131300  T
Q  117 aatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaa 216  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||  ||||||||| || || || || |||||||||||    
T  22131301 aattcgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagacggtggcatgagattgtgtattgactattgtcagttgaa 22131400  T
Q  217 caaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22131401 caaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22131434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4984597 - 4984431
Alignment:
Q  83 ttgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4984597 ttgaagaaacagttggaggacctgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggta 4984498  T
Q  183 ccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      |||||| | || || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  4984497 gtatgagactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcc 4984431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 19482220 - 19482465
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19482220 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggaggact 19482319  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  19482320 tgctcgaaaggaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 19482419  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19482420 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 19482465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 22375597 - 22375845
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| || |||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  22375597 tgaattttcgattgatctaattccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttgccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 22375696  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  22375697 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtatttcaccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 22375796  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  |  ||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  22375797 attatcgatagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttcc 22375845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Original strand, 22060929 - 22061071
Alignment:
Q  107 cttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattact 206  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||      
T  22060929 cttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgattatc 22061028  T
Q  207 gtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22061029 gtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcc 22061071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22989682 - 22989434
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||  |||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  22989682 tgaattttcgattgacattgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaacttaccgtatgtcgacttctgagttggccgagttgaagaaacatttagaa 22989583  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22989582 gatttacttgataagatgtttgtaagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgatattatgcattg 22989483  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22989482 attatcgacggttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 22989434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21253577 - 21253390
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  21253577 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttttgagttggccgagttgaagaaacaattagaggatt 21253478  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagatt 192  Q
    |||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21253477 tgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgcttgtgaagaagaaagatggtagcatgagatt 21253390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 19864241 - 19864486
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||| | || |||||||    
T  19864241 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccctatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaataattagaggact 19864340  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  19864341 tgcatgagaaaaagtttgttagaccaagagtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 19864440  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |  |||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  19864441 tcgaaagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 19864486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 112
Target Start/End: Original strand, 22028431 - 22028535
Alignment:
Q  8 tcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22028431 tcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 22028530  T
Q  108 ttgat 112  Q
    |||||    
T  22028531 ttgat 22028535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23887616 - 23887418
Alignment:
Q  50 ccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggag 149  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||| ||||  |||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23887616 ccttaccgtatgttggcttctgagttggctgcgttgaagaaacagtaagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggag 23887517  T
Q  150 cgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
     |||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  23887516 tgccgattttgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttc 23887418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 22246577 - 22246825
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| || | || |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||  || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22246577 tgaattttcgattgatcttatttcgggtacgaagcatgtgtctatgacaccttaccgtatgtcaacttctgatttggctgagttgaagaaacagttagaa 22246676  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||  ||||| || || || |    
T  22246677 gatttgcttgataagatgtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattg 22246776  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | || ||||| || || | |||||||||  |||||||||||||    
T  22246777 attatcgacaattgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttcc 22246825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21392015 - 21392254
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21392015 attgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaagaaacaattagaggacttgcttg 21392114  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||  | ||    
T  21392115 agaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatgagattgtgtattgactatcgaca 21392214  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  21392215 gttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 21392254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21781341 - 21781580
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21781341 attgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaagaaacaattagaggacttgcttg 21781440  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||  | ||    
T  21781441 agaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatgagattgtgtattgactatcgaca 21781540  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  21781541 gttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 21781580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21786509 - 21786748
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21786509 attgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaagaaacaattagaggacttgcttg 21786608  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||  | ||    
T  21786609 agaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatgagattgtgtattgactatcgaca 21786708  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  21786709 gttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 21786748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 16875317 - 16875487
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||    
T  16875317 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgctggttaagaagaaagat 16875416  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  16875417 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttcc 16875487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 21848559 - 21848729
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||    
T  21848559 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcagaccaagtgtttcgccgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagat 21848658  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| |||||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||| ||||    
T  21848659 ggaagcatgaggttatgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttcc 21848729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 20650539 - 20650748
Alignment:
Q  41 tcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcac 140  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| | || ||  ||| ||| |    
T  20650539 tcgattgcaccgtatcggatgtctgcatcagagttggatgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaagaagtttatcaggccttgtgcttctc 20650638  T
Q  141 cttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggta 240  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || |  || |||||  ||||    
T  20650639 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggta 20650738  T
Q  241 tccacttccg 250  Q
    ||||||||||    
T  20650739 tccacttccg 20650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 21194762 - 21194863
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  21194762 tgaattgaagaagcagttagaagaattgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 21194861  T
Q  179 gg 180  Q
    ||    
T  21194862 gg 21194863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Original strand, 23155271 - 23155433
Alignment:
Q  86 aagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtacca 185  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| | ||    
T  23155271 aagaaacagttagaagaattgcttgagaagtagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttgtttaagaagaaagatggaagca 23155370  T
Q  186 tgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    |||| || ||  | ||||| || ||||||||||| || | ||| |||||  ||||||| ||||    
T  23155371 tgaggttgtgtgtggattattggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttc 23155433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 249
Target Start/End: Original strand, 24932122 - 24932216
Alignment:
Q  155 gtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||  | ||||| || |||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||||    
T  24932122 gtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattattggcagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttcc 24932216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36539 - 36292
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  36539 tgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagcctgtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgaacttgctgaattgaagaaacagttggag 36440  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  36439 aacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 36340  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    |||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36339 attattgtcaattgaataaggttacgataaacaacaggtatccacttc 36292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 60339 - 60090
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60339 tgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 60240  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  60239 gatttactagataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 60140  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  60139 attactgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccg 60090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 79548 - 79781
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79548 gaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcacattatcgtatgtcagcatctgaattagctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgata 79647  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||  |||||||    
T  79648 agaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagaatgagattgtgcattgactatcgtcagtt 79747  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  79748 gaacaaagttaccataaagaacaggtatccactt 79781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20344767 - 20344519
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20344767 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagtttctgagttagctgaattgaagaagcagttggag 20344668  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    
T  20344667 gacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggaggaccggtgttattggttaagaagaaggatggtagtatgagactatgcatag 20344568  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20344567 attaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcc 20344519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25850560 - 25850311
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25850560 tgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 25850461  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  25850460 gacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagattgtgtatag 25850361  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25850360 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccg 25850311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23564051 - 23564279
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  23564051 tgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaagaaatagttggag 23564150  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23564151 gtcttgcttgataagaaatttgtaagacaaagtgtttcaccatgggaagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgaggttatgcatcg 23564250  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgata 229  Q
    ||||| | |||||||| || |||| ||||    
T  23564251 attaccgacagttgaataaggttacgata 23564279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22505164 - 22504917
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22505164 tgaattttcaattgacctcgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 22505065  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  22505064 gacctgttggataagaaatttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcatcagtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcattg 22504965  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22504964 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttc 22504917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 37541264 - 37541512
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37541264 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggag 37541363  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  37541364 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 37541463  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  37541464 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 37541512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 22233803 - 22234052
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22233803 tgaattttcaatagaccttgttcccggaatgaagtcggtgtcgatgacaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 22233902  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  22233903 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 22234002  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |  || ||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  22234003 acaaccgtccgctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 22234052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 14884881 - 14885122
Alignment:
Q  8 tcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  14884881 tcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggaggacctat 14884980  T
Q  108 ttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactg 207  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  14884981 tagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactttgcatagattaccg 14885080  T
Q  208 tcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14885081 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 14885122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 249
Target Start/End: Original strand, 24796287 - 24796528
Alignment:
Q  8 tcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgc 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  24796287 tcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttggaggacctgt 24796386  T
Q  108 ttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactg 207  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||| |    
T  24796387 tagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatgagactttgcatagattaccg 24796486  T
Q  208 tcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24796487 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 24796528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23473728 - 23473482
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  23473728 aattttcgattgaccttgttccaggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaaga 23473629  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23473628 tttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattgat 23473529  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||  | || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23473528 tatcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 23473482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21561908 - 21562157
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21561908 tgaattttcaattgatcttgttctgggtacgaagcctgtgtcgatggagccttaccgtatgtcggcctctgaggtagctgagttgaagaaacagttggag 21562007  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || |    
T  21562008 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtatttcaccttggggagcgcaggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatag 21562107  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  21562108 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 21562157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Original strand, 23078789 - 23078946
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078789 gaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 23078888  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgtt 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23078889 acttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttgggaagcgtcggtgtt 23078946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 17267221 - 17267466
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17267221 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagatt 17267320  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  17267321 tgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctatgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattgacta 17267420  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  17267421 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 17267466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22137167 - 22136922
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  22137167 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagatt 22137068  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  22137067 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 22136968  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  22136967 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 22136922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 21984060 - 21984240
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21984060 tgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagccagtgtcgatggcaccttaccgtatgtcaacgtatgagttagctgagttgaagaaacaattggag 21984159  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggt 181  Q
    || || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21984160 gatttacttgataagaagattgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggt 21984240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22464426 - 22464187
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22464426 attgatcttgttctgggaacgaaaccagtgtcgatggcaccgtatcgtatgtccgcttctgaattagccgagttgaagaaacagttggaggacttgcttg 22464327  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  22464326 ataagaagtttgtaagacccaatgtttcgccgtggggagcgcctgtgttattggtgaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 22464227  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  22464226 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 22464187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 29473960 - 29474205
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29473960 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 29474059  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  29474060 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 29474159  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  29474160 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 29474205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 21337177 - 21337425
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  21337177 tgaattttcaattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 21337276  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |    
T  21337277 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaaatgtttcaccttggggagcgcctatattgctggttaagaagaaaaatggtagcatgagattgtgcattg 21337376  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21337377 attatcgacagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattcc 21337425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 14997626 - 14997871
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14997626 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 14997725  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  14997726 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 14997825  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14997826 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14997871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 22330774 - 22330951
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22330774 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 22330873  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  22330874 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaacaagaaagatggta 22330951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27520905 - 27520660
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  27520905 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttagaagact 27520806  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  27520805 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 27520706  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27520705 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27520660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 37289383 - 37289628
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37289383 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 37289482  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  37289483 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 37289582  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  37289583 tcgacagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 37289628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40711279 - 40711034
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40711279 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 40711180  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  40711179 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 40711080  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  40711079 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 40711034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 21676739 - 21676966
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21676739 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttattgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttagaggacttgctcgacaagaagtttg 21676838  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  21676839 taagaccaagtgttccaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagt 21676938  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || | ||||||| || ||||| ||||||    
T  21676939 tacggtaaagaatagatatccgcttccg 21676966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16359001 - 16358756
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16359001 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 16358902  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  16358901 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 16358802  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16358801 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16358756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18781613 - 18781368
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  18781613 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtccatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 18781514  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  18781513 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 18781414  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||| ||||    
T  18781413 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccg 18781368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19772459 - 19772214
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19772459 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 19772360  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  19772359 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgctggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 19772260  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  19772259 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 19772214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22350418 - 22350173
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  22350418 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatt 22350319  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  22350318 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 22350219  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||||    
T  22350218 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccg 22350173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 27683287 - 27683532
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27683287 ttttctattgatcttgtccttggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 27683386  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  27683387 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 27683486  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  27683487 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 27683532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34568993 - 34568748
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34568993 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 34568894  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  34568893 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 34568794  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  34568793 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 34568748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 27666377 - 27666619
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27666377 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 27666476  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  27666477 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 27666576  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||    
T  27666577 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 27666619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26736610 - 26736859
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  26736610 tgaattttcgattgatcttgttctgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctaagttggctgagttgaagaaacagttagaa 26736709  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||| |||||||  |||||||| || || |    
T  26736710 gatttgcttgataaaaagtttgtaagactaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtgaaggagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 26736809  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  26736810 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccg 26736859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28892835 - 28893074
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28892835 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtatcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 28892934  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  28892935 acaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 28893034  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  28893035 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 28893074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28921661 - 28921900
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28921661 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtatcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 28921760  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  28921761 acaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 28921860  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  28921861 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 28921900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27612853 - 27612676
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27612853 ttttctattgatcttgttcctggaatgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 27612754  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||    
T  27612753 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggta 27612676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41773341 - 41773096
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41773341 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 41773242  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| |||||||  ||| | || || || |||||    
T  41773241 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtaaaaaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattgatta 41773142  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  41773141 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 41773096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20823938 - 20823689
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||    
T  20823938 tgaattctcaattgatcttgttccaggaacgaaaccaatatcaatggcgccgtaccgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggag 20823839  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |    
T  20823838 gacttgcttgataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttgttggtgaaaaagaaagatgggagtatgaggttgtgcattg 20823739  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  20823738 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 20823689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20778388 - 20778153
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20778388 attgatcttgttccgggagcgaaactagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 20778289  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||  ||||    
T  20778288 ataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtaaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 20778189  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  20778188 gttgaacaaggttacaataaagaataggtatccact 20778153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25428936 - 25428687
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||| || ||  |||||||||| || |||    
T  25428936 tgaattttcgattgatcttgttcctagaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttggccgagctgaagaaacaattagag 25428837  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  25428836 gatttgcttgagaaaaagttggttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 25428737  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25428736 attatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccg 25428687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 705 - 819
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  705 tgaattttcaattgaccttgttccaggaaggaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaaaagttggag 804  T
Q  101 gacttgcttgataag 115  Q
    |||||||||||||||    
T  805 gacttgcttgataag 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466230
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  20465982 tgaattttcgattgatcttgtttcgggtacgaagcctgtgtctatgactccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagac 20466081  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||      
T  20466082 gatttacttgataagaagtttgtaaaaccgagtgtttcaccttggcgagcgccagtattgttagttaataagaaagatggtagcatgaggttatgcattt 20466181  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||| | |  |||||||| | ||||||||||||    
T  20466182 attatcgacagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttcc 20466230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21409636 - 21409388
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||| || |    
T  21409636 gaattttctattgaacttattccgggtacgaaacctgtttctatggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgggttgaaaaagcagttagaag 21409537  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  21409536 atttgcttgataaaaagtttgtaagaccgagtgtatcgccttggggagtgtcggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtataga 21409437  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||| |  ||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||| ||||    
T  21409436 ttaccggaagttgaataaagtgacaataaagaatagatatccacctccg 21409388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20803089 - 20802945
Alignment:
Q  12 ttgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttga 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  20803089 ttgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagctagctgagttgaagaaacaattagaagatttgcttga 20802990  T
Q  112 taagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggt 156  Q
     || || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  20802989 gaataattttgttagaccaagtgtttcatcttggagagcaccggt 20802945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 21935149 - 21935319
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  21935149 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 21935248  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  21935249 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 21935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23508091 - 23507921
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  23508091 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 23507992  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  23507991 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 23507921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24583617 - 24583447
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  24583617 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaaacagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 24583518  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  24583517 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 24583447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21625529 - 21625475
Alignment:
Q  125 agaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatg 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  21625529 agaccaagtgtttcatcttggggagcaccagtgttgttggtgaagaagaaagatg 21625475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 195
Target Start/End: Original strand, 21220542 - 21220597
Alignment:
Q  140 ccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatg 195  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21220542 ccttggggcgtgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagtatgaggttatg 21220597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20801737 - 20801668
Alignment:
Q  158 ttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatga 227  Q
    ||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20801737 ttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaatga 20801668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43514 - 43272
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43514 ttttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggaagact 43415  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| || ||    
T  43414 tgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgttggtattgttggtaaagaagaaggacagtagcatgaggttatgcattgacta 43315  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
      |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43314 tcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactt 43272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53647 - 53401
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  53647 tgaattttcaattgaccttgttccgggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 53548  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  53547 gacttgcttgataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattg 53448  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    | || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  53447 actattgtcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactt 53401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 151167 - 150922
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  151167 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgt----cggcgtccgaacttgctgagttgaagaaacagttggag 151072  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  151071 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattg 150972  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  150971 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 150922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 24237 - 24485
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| || ||     
T  24237 tgaattttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagatgaagaaacaattagaa 24336  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||  |||| ||| ||||| |    
T  24337 gattttcttgataagtagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccgatattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgatattgtgcattg 24436  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  24437 attattgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 24485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19952 - 19705
Alignment:
Q  3 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19952 aattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccataccgtatgtcggtgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggaaga 19853  T
Q  103 cttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  19852 cttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatagat 19753  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  19752 taccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 19705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 54115 - 54364
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  54115 tgaattttcaattaaccttgttccgggaacgatgccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaggaaacagttggaa 54214  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |    
T  54215 gacctgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgttttgccttggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagtatgaggttgtgcattg 54314  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  54315 attatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccg 54364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31381 - 31630
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| |||||||||||||| |||    
T  31381 tgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttagag 31480  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |    
T  31481 gacttgctcaacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattg 31580  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||| |||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  31581 actaccgtcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccg 31630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 99270 - 99515
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  99270 ttttcaattgaccttgctccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagact 99369  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||    
T  99370 tgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcacctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgatta 99469  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  99470 tcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccg 99515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 175588 - 175372
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||     |||    
T  175588 tgaattttcaattgatcttgatcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaacgtatgtcggcatccgagttagctgaattgaagaaac-----gag 175494  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  175493 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttgaggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 175394  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||| ||||| |||| |||||    
T  175393 attaccgtcagctgaataaagt 175372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1232 - 996
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1232 gaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaacagttagaagacttgcttgata 1133  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||  |||||||    
T  1132 agaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcataaggttgtgcattgattatcgtcagtt 1033  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1032 gaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8201 - 7965
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8201 gaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagttgaattgaagaaacagtttgaagacttgcttgata 8102  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||  |||||||    
T  8101 agaagtttgttagacccagtgtttcactgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcataaggttgtgcattgattatcgtcagtt 8002  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8001 gaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 7965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22227
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22463 gaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgata 22364  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||   ||||||    
T  22363 agaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttgttaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattgattatcatcagtt 22264  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22263 gaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccg 22227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39645 - 39409
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39645 gaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgata 39546  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| || ||||| || ||  |||| ||    
T  39545 agaagtttgttagacccagtgtttcactgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcacgaggttgtgcattgactatcgtcaatt 39446  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39445 gaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 39409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 18049 - 18292
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  18049 ttttcgattgatcttcttccacgaacgaagcctatgtctatgacatcttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaggatt 18148  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  18149 tgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggagagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 18248  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||    
T  18249 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttc 18292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 515057 - 515305
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  515057 tgaattttcaattgacctcattccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaa 515156  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  515157 gacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 515256  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  515257 attaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcc 515305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 452917 - 453166
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  452917 tgaattatcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtttgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttagag 453016  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || |    
T  453017 gacttgcttgataagaaatttgtaagatcgagtgtttcaccgtggggagtgccgatattgctggttaagaagaaggatggtagcacgaggttatgtatag 453116  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  453117 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 453166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 495620 - 495372
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || || ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| | || ||     
T  495620 tgaattttcgattgatctttttccgggtactaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaatatttagat 495521  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  495520 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgttgcaccgtggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattatgcattg 495421  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  495420 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 495372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 441290 - 441109
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||| | | ||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| ||     
T  441290 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcatgtgtctatgacgcattaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaatagttagaa 441191  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  441190 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttgggtagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggta 441109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 538 - 779
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538 tgaattttcaatagaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatagcaccataccgtacgtcagcttatgagttagctgaattgaagaaacagttggag 637  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  638 gacttgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccctggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcattg 737  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatc 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  738 attaccgttagttgaacaaagttacgataaagaaccggtatc 779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29534 - 29285
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29534 tgaattttcaattgatcttgttacaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgatttgaagaaacagttggag 29435  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |    
T  29434 gacctgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggggcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatag 29335  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  29334 attaccgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccg 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 18200 - 18436
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18200 gaccttgtcccaggaacgaagccggtgtcgatggcaacttattgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgata 18299  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||    
T  18300 agaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattgattatcgtcagtt 18399  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18400 gaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccg 18436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 5566 - 5802
Alignment:
Q  14 gaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5566 gaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaacagtcggaagacttgcttgata 5665  T
Q  114 agaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagtt 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || ||||| || ||  |||||||    
T  5666 agaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgtttgtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgactatcgtcagtt 5765  T
Q  214 gaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5766 gaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 5802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 40037 - 40285
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40037 tgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 40136  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || || |    
T  40137 gacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagactgtgtatag 40236  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  40237 attaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcc 40285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 45131 - 45380
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  45131 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcactttatcgtatgttagcttccgagttagctgaattaaagaagcagttggaa 45230  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |    
T  45231 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcattg 45330  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||| |||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||    
T  45331 actatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccg 45380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4515 - 4268
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4515 tgaattttcgattaaccttgttcc-ggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 4417  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  4416 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgctgatattgcttgttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 4317  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| | ||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  4316 attatcgacagttgaatagagtaacgataaagaataggtatccgcttcc 4268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2471 - 2222
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2471 tgaattttcaatcgatcatgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtacgtcggcgtctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 2372  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||      
T  2371 gatttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatat 2272  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2271 attaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 2222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4793 - 5042
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4793 tgaattttcaattgatcttgttccgggaatgaagccagtgtcgatggcaccttctcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattaaagaaacaattggag 4892  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || || |    
T  4893 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcccctgtattgttggttaagaagaaggatggtagtatgagattgtgtatag 4992  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  4993 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccg 5042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29127 - 28878
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29127 tgaatttgcaattgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggtgtccgagttagccgaattgaagaaacagttggag 29028  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |    
T  29027 gatttactggataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttagttaagaagaagggtggtagcatgagattgtgtatag 28928  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  28927 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccg 28878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11560 - 11311
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11560 tgaattttcaatcgaccttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttcgag 11461  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  11460 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcaccggtattgtcggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 11361  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| | || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  11360 attaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 11311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 1249 - 1485
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  1249 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttggctgaattgaagaatcagttggaa 1348  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||  ||||||| |    
T  1349 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggaagtatgaggctatgcattg 1448  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacag 237  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  1449 aatatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacag 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 853
Alignment:
Q  15 accttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataa 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1088 accttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcaatgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggaggatttacttgataa 989  T
Q  115 gaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttg 214  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||||    
T  988 gaaatttgtaagaccgaatgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatagattaatgtcagttg 889  T
Q  215 aacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  888 aataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccg 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 49581 - 49825
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49581 tgaattttcaattgatcttgtgcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagccgaattgaagaaacagttggag 49680  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  49681 gatttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttca--gtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 49778  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  49779 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatctactt 49825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 2
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  183 tgaattttcaattgaacttgttccaggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgcatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttggaa 84  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  83 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggta 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1976 - 2225
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1976 tgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaatccggtgtcgatggcactttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaagaaacagttggag 2075  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  2076 gacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttaaccgtggggagcgccagtatttttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 2175  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2176 attatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 2225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4781 - 4532
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4781 tgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagctgacttgaagaaacagttggag 4682  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| || || || |    
T  4681 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattattggttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatag 4582  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4581 attaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccg 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12396 - 12147
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396 tgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtctgcgtccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 12297  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  12296 gatttccttgataagaaatttataagaccgggtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 12197  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||   ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12196 attaccaacaactgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccg 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28989 - 29238
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28989 tgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaatccggtgtcgatggcactttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaagaaacagttggag 29088  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  29089 gacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttaaccgtggggagcgccagtatttttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 29188  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29189 attatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccg 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14723 - 14558
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14723 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 14624  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggtt 166  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14623 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgcctgtgttgttggtt 14558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5713 - 5465
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| || ||||||||  |||| ||| | ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||     
T  5713 tgaattttcgattgatattgttccgggtacgaagcctctgtctatgacgccttaccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaaaaaacaattagaa 5614  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  5613 gatttacttgagaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgctagataagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattg 5514  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  |  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  5513 attatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11563 - 11474
Alignment:
Q  161 ttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11563 ttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgattattgtcaattgaataaagttacgataaagaacatgtatccacttccg 11474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16714 - 16465
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16714 tgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgcctgagctagctgaattgaagaaacagttggag 16615  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |    
T  16614 gatttactggataagaaagttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtatag 16515  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  16514 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccagttccg 16465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 7643 - 7744
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| | || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||    
T  7643 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattaggccaagtgtttcaccgtggggtgctcccgtattgttggttaagaagaaagat 7742  T
Q  179 gg 180  Q
    ||    
T  7743 gg 7744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21451 - 21202
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||| |||||||||||||||| |    
T  21451 tgaattttcaattgaccttgtaccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggtg 21352  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||| |    
T  21351 gattttctcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggctatgcattg 21252  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  21251 actatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccg 21202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 9165 - 9412
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |  | ||||| |||||||||| ||||||     
T  9165 tgaattttcaattgacgttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtcctaacttgctgagttgaagaaacggttggaa 9264  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||  || ||||| |    
T  9265 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggttttgttggtaaagaaggaggatggtagtatgaagttgtgcattg 9364  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9365 actatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttc 9412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19379 - 19626
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |  | ||||| |||||||||| ||||||     
T  19379 tgaattttcaattgacgttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtcctaacttgctgagttgaagaaacggttggaa 19478  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||  || ||||| |    
T  19479 gacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggttttgttggtaaagaaggaggatggtagtatgaagttgtgcattg 19578  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    | ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19579 actatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttc 19626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11430 - 11181
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11430 tgaattttcaattgatcttattccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagctagctgagttgaagaaacagttggag 11331  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  11330 gatttacttgataagaagtttgtaagaccgagcgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtatag 11231  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  11230 attaccttcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 262822 - 262584
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  262822 ttttccattgaccttgttccgggaacaaagccgatgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcctctgagttagctgaattgaagaaaaagttggaagact 262723  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || ||  ||||    
T  262722 tgcttgataagaagtttgtttgacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatatatta 262623  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatcc 243  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  262622 ccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatcc 262584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3020 - 2775
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3020 ttttctattgatcttgttcctggaacaaagccagtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgaattgaagaaacagttggaggact 2921  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  2920 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 2821  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  2820 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16756 - 16511
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||      
T  16756 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagtttgaagatc 16657  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||| | ||||||||| || || || ||    
T  16656 tgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttggtagtgaagaagaaagatggaagcatgagattgtgtattgacta 16557  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  16556 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 16511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 325303 - 325057
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagtt-ggaggac 103  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  325303 ttttcaattgaccttgttacgggaacgaagccggcgtcgatggcaacgtatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacggtttggaagac 325204  T
Q  104 ttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatt 203  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| || |    
T  325203 ttgcttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgact 325104  T
Q  204 actgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |  || ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  325103 atcgttagttgaataaagttacaataaagaacaagtatccacttccg 325057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 201176 - 201421
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | || |||||||||||||||| ||| |    
T  201176 ttttcaatcgatcttgttccgggtacaaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcagcgtctgagttatcagagttgaagaaacagttggtggatt 201275  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || |||||    
T  201276 tacctgataagaattttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatagatta 201375  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  201376 ccgtcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccg 201421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9536 - 9291
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9536 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaggact 9437  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||| | ||||| || |||||    
T  9436 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattgatta 9337  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9336 tcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 9291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 13069 - 13216
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13069 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggag 13168  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggga 148  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13169 gtcttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggga 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21249 - 21395
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtc-gcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggag 21347  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggga 148  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21348 gtcttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggga 21395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Original strand, 13214 - 13289
Alignment:
Q  175 ggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13214 ggatggtagcctgaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 13289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Original strand, 21393 - 21468
Alignment:
Q  175 ggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21393 ggatggtagcctgaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 21468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24251
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  24002 tgaattttcgattgatcttgttccgggattgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttagctgaattgaagaaacaattagaa 24101  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  24102 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgtattg 24201  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24202 attatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccg 24251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 10055 - 10208
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  10055 tgaattttctattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgaattgaagaaataattacaa 10154  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccg 154  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10155 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccg 10208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 10602 - 10693
Alignment:
Q  158 ttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| | |||||  | |||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10602 ttgttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttcc 10693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 103827 - 103578
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  103827 tgaattttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 103728  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  103727 gatttacttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattg 103628  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  103627 attatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccg 103578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 4593 - 4840
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |   || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4593 tgaattttcaattgatcttgttctgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctaagctagctgagttgaagaaacagttggag 4692  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |    
T  4693 gatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttagggagcgccgatattgttggttaagaagaaagatggtatcatgaggttgtgcatag 4792  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttc 248  Q
    ||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||    
T  4793 attaccgtcaactgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttc 4840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9964 - 9719
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9964 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggaaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagact 9865  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  9864 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 9765  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9764 ccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 9719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Original strand, 10494 - 10731
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||| || || |    
T  10494 ttttcgattgaccttgttccgggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcatctgagttggctgaactgaagaaacagttagaagatt 10593  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||    
T  10594 tacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtcttaccgtggggagcgactgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtatagatta 10693  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatc 242  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10694 ccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatc 10731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 12915 - 13163
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  12915 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacgaagcctgtgtctataacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagaa 13014  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  13015 gatttgcttggtaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcacgttggggagcgccggttttgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattg 13114  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||    |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  13115 attatccgcagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttcc 13163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24649 - 24898
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  | ||     
T  24649 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctaagttgaagaaacaaatagaa 24748  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || || |    
T  24749 gatttgctcgagaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcctgtcttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgagattgtgtattg 24848  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | |||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24849 actatcgacagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccg 24898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 10476 - 10574
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttgga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10476 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttgga 10574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 28203 - 28420
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  28203 ttttctattgatcttgttcatggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 28302  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  28303 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtatcaatta 28402  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagt 222  Q
      ||||||||||||||||    
T  28403 tcgtcagttgaacaaagt 28420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25702 - 25466
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25702 attgatcttgttccgggaacgaaaccggtgtcgatggcaccgtatcgcatgtcagcttctgaattatccgagttgaagaaacagttggaggacttgcatg 25603  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||| || ||  ||||    
T  25602 ataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccatggggagcgcctgtgttgttggt---aaagaaggatggtagtatgagattgtgcattgactatcgtca 25506  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  25505 gttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccg 25466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 13832 - 14077
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  13832 ttttctattgatcttgttcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 13931  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  13932 tgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 14031  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
       |||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  14032 tcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 14077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40751 - 40506
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  40751 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaactatctgagttgaagaaatagttggaagact 40652  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  40651 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 40552  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  40551 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 40506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31480 - 31235
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || |    
T  31480 ttttctattgatcttgttcctggaacaaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaggtgagttgaagaaacagttagaagatt 31381  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  31380 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgccggttttattagtacagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgatta 31281  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| ||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  31280 tcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 31235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36946 - 36701
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || |    
T  36946 ttttctattgatcttgttcctggaacaaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaggtgagttgaagaaacagttagaagatt 36847  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  36846 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgccggttttattagtacagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgatta 36747  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||| ||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  36746 tcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 13601 - 13847
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  13601 ttttctattgatctagatcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 13700  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggga--gcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || ||     
T  13701 tgcttgaaaagaaatttgttaga-aaagtgtttcaccttggggagcgcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgac 13799  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||  ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  13800 tatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 13847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 10946 - 11192
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  10946 ttttctattgatcttgctcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 11045  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggga--gcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgat 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||| || ||| | || |||||||| ||||||| | ||||||| || || ||     
T  11046 tgcttgaaaagaaatttgttaga-aaagtgtttcaccttggggagcgcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcctgagattgtgtattgac 11144  T
Q  203 tactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||  ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  11145 tatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 11192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 54237 - 53988
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||| | || |||    
T  54237 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaaaaattagag 54138  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||| ||| || || |    
T  54137 gatttgctcgagaaaaagtttgttagaccacgtgtttcacctaggggagcgcccgttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgacattgtgtattg 54038  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  54037 actatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 53988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21843 - 21598
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21843 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaagact 21744  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||  |||| || |||||    
T  21743 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 21644  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  21643 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 21598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 37528 - 37773
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  37528 ttttctattgatcttgtacctggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctcagttgaagaaacagttagaagatt 37627  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||   ||||| || || ||||||||    
T  37628 tgcttgagaagaagtttgttcgaccaagtgttttaccttggggagcgccggttttgttcgtgaagaagaaagatggttgtatgaggttgtgtatcgatta 37727  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      |||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  37728 tcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccg 37773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23189 - 23059
Alignment:
Q  119 tttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || || |||||  | |||||||| |    
T  23189 tttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttagttaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtatagattatcgacagttgaata 23090  T
Q  219 aagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23089 aagtaacgataaagaataggtatccacttcc 23059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 25952 - 25840
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  25952 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaa 25853  T
Q  101 gacttgcttgata 113  Q
    || ||||||||||    
T  25852 gatttgcttgata 25840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2209 - 2458
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| | |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  2209 tgaattttcgattgatctggttccgggtacgaaccctgtgtctatgacaccttaccatatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 2308  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  2309 gatttacttgataagaagtttgtaagacgaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattg 2408  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2409 attatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccg 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 151627 - 151463
Alignment:
Q  86 aagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtacca 185  Q
    |||||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||    
T  151627 aagaaacaattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtatttcgccttgggtagcgccggttttgctggtgaagaagaaagatggtagca 151528  T
Q  186 tgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||| || || || || || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  151527 tgagattgtgtattgactattgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 151463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17534 - 17290
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  17534 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcatatgtccgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatt 17435  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||    
T  17434 tgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgatta 17335  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | || |||||||| || |  || ||||| ||||||| ||||||    
T  17334 tcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttcc 17290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 48240 - 48467
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  48240 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgttgagttgaagaaacagttagaggacttgctcgacaagaagtttg 48339  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  48340 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagt 48439  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||   ||||||| || ||||| ||||||    
T  48440 tacagtaaagaatagatatccgcttccg 48467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11066 - 10828
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11066 attgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtccgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttg 10967  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||  | ||    
T  10966 agaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgctggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgattatcgaca 10867  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
     |||||||| || |  || ||||| ||||||| ||||||    
T  10866 attgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttcc 10828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45676 - 45572
Alignment:
Q  78 ctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaagga 177  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||    
T  45676 ctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaaga 45577  T
Q  178 tggta 182  Q
    |||||    
T  45576 tggta 45572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 53323 - 53256
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcga 72  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53323 ttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcga 53256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 250
Target Start/End: Original strand, 9880 - 10011
Alignment:
Q  119 tttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  9880 tttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattgattatcgtcagttgaaca 9979  T
Q  219 aagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9980 aagttacgataaagaacaggtatccacttccg 10011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51412 - 51166
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  51412 tgaattttcaatcgatcttgtgcccagaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagctaaattgaagaaacaatttgaa 51313  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  51312 gatttacttgataagaaatatgtaagatcgagtgtttcactgtggggagcgccggtattgttgtttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatag 51213  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  51212 attaccgtcagctgaagaaagtgacgataaagaataggtatccactt 51166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31469 - 31298
Alignment:
Q  48 caccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggg 147  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  31469 caccttatcgtttatcagcttcagagttggccgaattgaagaaacaattagaagatttgcttgagaaaaagttttttagaccaagtttttcgccttgggg 31370  T
Q  148 agcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaa 219  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |||||  | |||||||||||    
T  31369 agcgccggttttgttagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaa 31298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4183 - 3935
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  4183 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacgaagcttgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagaa 4084  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||| | ||| |    
T  4083 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtacattg 3984  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | || ||  ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  3983 actattggtagttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttcc 3935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 9759 - 9907
Alignment:
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  9759 acttacttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattga 9858  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9859 ttatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 9907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 250
Target Start/End: Original strand, 17426 - 17574
Alignment:
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  17426 acttacttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattga 17525  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17526 ttatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccg 17574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5883
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5778 tgaattttcacttgaccttgttccaggagcgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 5877  T
Q  101 gacttg 106  Q
    ||||||    
T  5878 gacttg 5883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 110163 - 109983
Alignment:
Q  70 cgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaag 169  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  110163 cgagttagccgaattgaagaaacaattggaggagttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcatcgtggggagcgccggtgttatttgttaag 110064  T
Q  170 aagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  110063 aagaaggatggcagcacgaggttatgcattgattatcgtaagttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccg 109983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 52633 - 52777
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  52633 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagaat 52732  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggag 149  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52733 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggag 52777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 54842 - 54943
Alignment:
Q  148 agcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||||    
T  54842 agcgccgattttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtattgattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccactt 54941  T
Q  248 cc 249  Q
    ||    
T  54942 cc 54943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11409 - 11246
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11409 tgaattttcaattgaccttgttccgggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacagttggag 11310  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttgg 164  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11309 gacctgttagataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcaccggcgttgttgg 11246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 5594 - 5841
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |  || ||||||||||| || || |    
T  5594 gaattttcgattgatcttgttccaggaacaaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggtcgagttgaagaaacaattagaag 5693  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  5694 atttgctggataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtattga 5793  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||  | || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  5794 ttatcgacaattgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 3896 - 4123
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || | |||  | ||||| |||||||||||||| || ||  | || || ||||| ||||    
T  3896 ccaggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttagaagatctactcgacaagaagtttg 3995  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  3996 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattgactaccgtcagttgaataaagt 4095  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  4096 tacgataaagaacagatatccgcttccg 4123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4034 - 3788
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| || ||     
T  4034 tgaattttctattaatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttcagagttagcggagttgaagaaacaattagaa 3935  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  3934 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggcgaacgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 3835  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  3834 attatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactt 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 15709 - 15947
Alignment:
Q  12 ttgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttga 111  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15709 ttgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatcagagttgaagaaacagttggaagatttgcttga 15808  T
Q  112 taagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcag 211  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | || |||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||  | |||    
T  15809 gaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgattatcgacag 15908  T
Q  212 ttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  15909 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 15947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 243
Target Start/End: Original strand, 2656 - 2873
Alignment:
Q  26 ggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaa 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |    
T  2656 ggaacgaagccggtgtcgatggcacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctaagttgaagaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgtta 2755  T
Q  126 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||  ||||| || || || |||||  |||||||||||||||| |     
T  2756 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgtaagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaac 2855  T
Q  226 gataaagaacaggtatcc 243  Q
     || ||||| ||||||||    
T  2856 tatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 94598 - 94847
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||    
T  94598 tgaattctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggag 94697  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |    
T  94698 gacttgcttgacaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggggcgcccgtgttattggtaaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattg 94797  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  94798 actatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccg 94847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 115136 - 114912
Alignment:
Q  27 gaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaag 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  115136 gaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaatcagttagaggacttactcgacaagaagtttgtaag 115037  T
Q  127 accaagtgtttca-ccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttat 225  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| || || || || |||  ||||||||| |||||||     
T  115036 agcaagtgtttcacccgtggggagcgcctgtgttgctggcaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgtattgactaccatcagttgaataaagttac 114937  T
Q  226 gataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  114936 gataaagaacagatatcctcttccg 114912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 17774 - 18015
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  17774 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaagatt 17873  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||  ||||||| ||||||||| || || |||||    
T  17874 ttcctgagaagaaattttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagatagatggtagcatgagattgtgtattgatta 17973  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    |  ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||    
T  17974 ccatcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccact 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 58567 - 58368
Alignment:
Q  51 cttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagc 150  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  58567 cttatcgtatgtctgcttcctagttagctgagttgaagaaacagttagaagatttgctcgaaaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagc 58468  T
Q  151 gccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  58467 gccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 58368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 176049 - 176297
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  176049 tgaattttccattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatagcgtcttaccgtatgtcagcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggag 176148  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || || || |    
T  176149 gatttacttgataaaaagtttgtaagatcgagtgtttcacctt-gggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaaaatggtagcatgaggttgtgtatag 176247  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||  |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  176248 attactgtcacctgaataaagtggcgataaagaataggtatccacttccg 176297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Original strand, 313 - 540
Alignment:
Q  23 ccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| | || || || |||||| |||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  313 ccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgagcttgcagagttaaagaaatagttagaggatttactcgacaagaagtttg 412  T
Q  123 taagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagt 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||| ||||  |||| |||||    
T  413 taagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattgactaccgtcaactgaataaagt 512  T
Q  223 tatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  513 tacgataaagaacagatatccgcttccg 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 41209 - 41458
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || |||    
T  41209 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagag 41308  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||||| || || |    
T  41309 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttctgttagtgaagaagaaaaatggtatcatgagattgtgtattg 41408  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  41409 actatcgacagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccg 41458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8622 - 8373
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||  ||    
T  8622 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattaaag 8523  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  8522 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtctttcaccttggggagcgccggttctgttagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 8423  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8422 attatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 8373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24700 - 24590
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | ||| | || |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  24700 tgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggctgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 24601  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  24600 ggaagcatgag 24590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 20955
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  21200 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggcgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 21101  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||| | || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  21100 ttcttaagaaaaagtttgttagaccaactgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 21001  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | || |||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  21000 tcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 20955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36624 - 36379
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  36624 ttttctattgatcttgttcctggaatgaatcttgtgtctatggtaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 36525  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||| | || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  36524 ttcttaagaaaaagtttgttagaccaactgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 36425  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      | || |||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  36424 tcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccg 36379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 56357 - 56108
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  56357 tgaattttcaattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 56258  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  56257 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcacgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 56158  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | |   |  ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  56157 actgtcggtagttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccg 56108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41232 - 40986
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  41232 tgaattttcgattgattttattccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttacc--atgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacacttagaa 41135  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||||||  | |||||| || || |    
T  41134 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatttttctagttaagaagaaagatggtagtacgagattgtgtattg 41035  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  41034 actatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttcc 40986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 74952 - 74706
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  74952 tgaattttcgattgattttattccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttacc--atgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacacttagaa 74855  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||||||  | |||||| || || |    
T  74854 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatttttctagttaagaagaaagatggtagtacgagattgtgtattg 74755  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  74754 actatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttcc 74706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 8608 - 8718
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  8608 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 8707  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  8708 gggagcatgag 8718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 234
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  482 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagactgtgtctatgaaaccttatcatatgtcaacttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaa 383  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  382 gattttcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcacccgtgttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattatgcattg 283  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  282 attattgtcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttcc 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 483 - 731
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |  || ||||||||||| || |||    
T  483 tgaatttgctattgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggacgagttgaagaaacaattagag 582  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  583 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 682  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| | |||||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  683 attaccgacagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttcc 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1598 - 1350
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| |||| ||||| || ||||| || |    
T  1598 gaattttctatagatcttattccaggtacgaagcctgtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttcgaaattaactgagttgaaaaagcagttagaag 1499  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  1498 atttgctggataagaagtttgtaagaccgagtgtgtcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttttgtataga 1399  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||  | |||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||    
T  1398 ttatcggcagttgaacaaagtgacaataaattacaggtatccacttccg 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 114742 - 114990
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||     
T  114742 tgaatttttgattgatcttgttccgggtacgaagcttgtgtttatggcgccatatcgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaa 114841  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  114842 gatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggatcgtcggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 114941  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  114942 attatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 114990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38130 - 38004
Alignment:
Q  121 tgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  38130 tgtaagaccaagtgtttcaccttggggaacgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaa 38031  T
Q  221 gttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||    
T  38030 gttacaataaagaacaggtatccactt 38004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 6801 - 7039
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| || || || || ||||    
T  6801 attgaccttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttactgtatgtcagcttctgagttggttgagttgaagaaacaattagaagattttcttg 6900  T
Q  111 ataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtca 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| || || |||||  | ||    
T  6901 ataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcccgttttgttagtgaagaagaaagatggcagtatgagattgtgtattgattatcgaca 7000  T
Q  211 gttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  7001 gttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttcc 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 517 - 766
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  517 tgaattttctattgatcttgttcctagaacgaaggctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 616  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || || |    
T  617 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattg 716  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  717 attatcgacagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccg 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 15682 - 15931
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  15682 tgaattttcgattgatcttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 15781  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||  ||||| || || || |    
T  15782 gatttgcttgataagaagtttgtgagaccaagtgttccaccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatgctagtatgaggttgtgtattg 15881  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||  | |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  15882 attatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccg 15931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12309
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| || || || |    
T  12064 ttttctattgatcttgtccctggaacgaagctggtgtcgatgacaccttatcgtatgtctgcttccgagttagatgagttgaagaaacaattagaagatt 12163  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  12164 tgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgctagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 12263  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      ||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||    
T  12264 tcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccg 12309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7823 - 7574
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || |||    
T  7823 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagag 7724  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||||| |||||| || ||  | |    
T  7723 gatttacttgagaaaaagtttgttagacgaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagtgaagaggaaagatggtagcatgaggttgtgtgttg 7624  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  7623 actatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccg 7574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 250
Target Start/End: Original strand, 46838 - 46987
Alignment:
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |    
T  46838 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagtgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtacag 46937  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  46938 attaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccg 46987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 250
Target Start/End: Original strand, 55676 - 55800
Alignment:
Q  126 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttat 225  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  55676 gacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgctgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattgattaccgtcagttaaacaaagttat 55775  T
Q  226 gataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  55776 gataaagaacagatatccgcttccg 55800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14925 - 15173
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| || | || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||| |||| ||     
T  14925 tgaattttcgattgatcttatttcgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggcggagttgaagaaatagttagaa 15024  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  15025 gatttacttaataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 15124  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | | |||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||    
T  15125 attatcgacggttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttcc 15173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18250 - 18002
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  18250 tgaattttctattgatcttattcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 18151  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |  || |    
T  18150 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcacccgttttgttagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtttattg 18051  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  18050 attatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttcc 18002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 14183 - 14431
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| ||     
T  14183 tgaattttcgattgatcttgttcctggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaaaagttagaa 14282  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  14283 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggagagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 14382  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | || ||||| ||||| | ||||||||| |  |||||||||||    
T  14383 attatcgacacttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttcc 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3431 - 3253
Alignment:
Q  71 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaaga 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3431 gagttggctgaattgaagaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggaacgcccgtgttgttggttaaga 3332  T
Q  171 agaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||| || |||| |||||| ||||| || |||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3331 agaaagacggtagcatgaggttatgtattgattatcggcagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttcc 3253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 7363 - 7609
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  7363 tgaattttcgattgatattgttcctggaacgaagcctgtgtctgtgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 7462  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  7463 gatctgcttgagaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattg 7562  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
    | ||  | ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||    
T  7563 actatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactt 7609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 10866 - 11112
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||| || || |    
T  10866 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccgatgtcgatgaaaacttatcgtatgtctgcttccgagttagctgtgttgaagaatcagttagaagatt 10965  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  10966 tgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtatcgatta 11065  T
Q  205 ctgtcagttgaac-aaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
       |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  11066 acatcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccg 11112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Original strand, 8449 - 8594
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8449 ttttctattgatctagttcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgaattatctgagttgaagaaacagttggaagact 8548  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagc 150  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8549 tgtttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagc 8594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20840 - 20592
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  20840 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgcgtctatgacaccttatcgtatgccagcttctgagttggccgagttgaagaaacacttagaa 20741  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || || |    
T  20740 gatttgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatcttgttagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattg 20641  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  20640 actatcgacagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttcc 20592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 84225 - 84473
Alignment:
Q  2 gaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggagg 101  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| || || || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  84225 gaattttctattgatcttattccgggtacgaaacctgtttctatgacaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaagcagttagaag 84324  T
Q  102 acttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcga 201  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  84325 atttgtttgataagaagtttgtaaggccaagtgtgttgccttggggagcgccggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtataga 84424  T
Q  202 ttactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    |||  | |||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| |||||||    
T  84425 ttataggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccg 84473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 269125 - 268965
Alignment:
Q  86 aagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtacca 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |    
T  269125 aagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagta 269026  T
Q  186 tgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccact 246  Q
    |||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  269025 tgaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccact 268965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 803
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  1052 tgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaa 953  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| || || |    
T  952 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccagttttgttagtaaagaagaatgatagtagcatgagattgtgtattg 853  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    | ||  | ||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  852 actatcgacagctgaataaagtaacaataaagaataggtatccacttccg 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 250
Target Start/End: Original strand, 29624 - 29868
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || |    
T  29624 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaatcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagttgagttgaagaaacagttagaagatt 29723  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||  || || || ||    
T  29724 tgcttgagaag-aattcgttagaccaagtatttctccttggggagtgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagatcgtgtattgacta 29822  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
      || |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  29823 tcgttagttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccg 29868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3201 - 2953
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  3201 tgaattttcgattgatcttgttctgggaacgacgcctatgtctatgacaccttatcatatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaactagag 3102  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||| | |||||||  |||||||| || || |    
T  3101 gatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgatagtaaagaagtaagatggtagtatgagattgtgtattg 3002  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | |   | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  3001 actgtcggcagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 413
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || || ||      
T  657 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatc 558  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||    
T  557 tccttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 458  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||    
T  457 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttcc 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15070 - 14822
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||| | ||| ||  ||||||| |||||||| ||||  || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15070 tgaattttcgattgatcttattccaggtatgaagcctgcgtccattacaccttaccgtatgtcggcttctgatttggctgagttgaagaaacagttagaa 14971  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  14970 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgcggggagcactggtattactagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattg 14871  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  14870 attaccgtcaagtgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttcc 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6473 - 6225
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||||||||||  ||| | ||||| || |||||||| || ||     
T  6473 tgaattttcgattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtcagcttctgagctggctgagttaaagaaacatttagaa 6374  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  6373 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaacttggggagcgccggtatttctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 6274  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||     ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  6273 actatcaatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 6225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13603 - 13355
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||||||||||  ||| | ||||| || |||||||| || ||     
T  13603 tgaattttcgattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtcagcttctgagctggctgagttaaagaaacatttagaa 13504  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  13503 gatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaacttggggagcgccggtatttctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 13404  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||     ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  13403 actatcaatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 13355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 217124 - 217372
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||||  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  217124 tgaattttcgattgatcttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtatgcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaa 217223  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||  |||||||| || || |    
T  217224 gatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagtgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattg 217323  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  217324 attatcgacaattgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttcc 217372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 111615 - 111772
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || || |    
T  111615 ttttcgattgatcttgttccaggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaagatt 111714  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgtt 162  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  111715 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgtt 111772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17478 - 17230
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||  ||| | ||||| |||||||| ||||   ||||   ||| |||||||| ||| | ||     
T  17478 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtttatgactccttaccgtatgtcggcttcttagttgattgagttgaagaagcagctagaa 17379  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |  || |    
T  17378 gattttcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcaccggtattgttagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtttattg 17279  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    ||||  | |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17278 attatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 17230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 1105 - 1253
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||| || || |    
T  1105 ttttctattgattttgtccctggaacgaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttgactgagttgaagaaacagttagaagatt 1204  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205 tgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcc 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 249
Target Start/End: Original strand, 21918 - 22138
Alignment:
Q  29 acgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagac 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  21918 acgaagcctgtgtcaatggcgccttaccgtatgtcggcttctgaattagctgagttgaaaaagaatttggaagatttgcttgataagaagtttgtaatac 22017  T
Q  129 caagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || || || |||||| |  ||||||||||||| |  ||    
T  22018 cgagtgtttcaccttggggagcgccagtgttgctcgttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatagattaccggaagttgaacaaagtgacaat 22117  T
Q  229 aaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  22118 aaagaatagttatccacttcc 22138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6938 - 6690
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  |||||  | || |||||||||||||| ||     
T  6938 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttgaccgagttgaagaaacagttagaa 6839  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |    
T  6838 gatttactcaataagaagtttgtaacaccgagtgtttcaccttggggagtgccgatatttttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattg 6739  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  6738 actatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 8738 - 8986
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggag 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||  |||||  | || |||||||||||||| ||     
T  8738 tgaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctataacaccttaccgtatgtcggcttctgagttgaccgagttgaagaaacagttagaa 8837  T
Q  101 gacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcg 200  Q
    || || ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |    
T  8838 gatttactcaataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagccccgatatttttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattg 8937  T
Q  201 attactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    | ||  | |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  8938 actatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 8986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1386
Alignment:
Q  161 ttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||  | |||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  1474 ttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 84938 - 85180
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |  | || ||||||||| | || ||||| |    
T  84938 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagatgacagagttgaagaaaaaattagaggatt 85037  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgagattatgcatcgatta 204  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||| || || || ||    
T  85038 tgctcgagaagaagtttgtcagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagaatgagattgtgtattgacta 85137  T
Q  205 ctgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccactt 247  Q
      | ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||    
T  85138 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactt 85180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 182
Target Start/End: Original strand, 85612 - 85681
Alignment:
Q  113 aagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggta 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  85612 aagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattggtagtgaagaagaaagatggta 85681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 132271 - 132372
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||| | |||||| || |||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  132271 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaaacagtttattagaccacgtttttcgccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 132370  T
Q  179 gg 180  Q
    ||    
T  132371 gg 132372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 277 - 411
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| || || || |    
T  277 ttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagttgagttgaagaaacaattagaagatt 376  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttca 139  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  377 tgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4534
Alignment:
Q  50 ccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggag 149  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4672 ccttaccgcatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaggatttgcttgataaggagttcgtaagaccgagtgtttcaccttggggag 4573  T
Q  150 cgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatga 188  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4572 cgccggtgttactagttaagaagaaagatggtagcatga 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Original strand, 13 - 107
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttgga 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgga 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 13407 - 13577
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  13407 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13506  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
     | | |||||| |||||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||   ||||||||||||    
T  13507 agaagcatgaggttatgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttcc 13577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 735 - 565
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || || | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  735 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcaacttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 636  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  ||||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  635 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7677 - 7507
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || || | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  7677 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcaacttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 7578  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  ||||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  7577 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 7507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1255
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || || ||||||||||| || || ||      
T  1086 ttttcgattgatcttgttcctggaacaaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttatgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatc 1185  T
Q  105 tgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaa 174  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||    
T  1186 tacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgctggttttgctagtgaagaagaa 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 1403 - 1573
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||    
T  1403 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagat 1502  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || |  ||||| || ||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  1503 ggaagaatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttcc 1573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25918 - 25748
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||    
T  25918 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 25819  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  25818 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 25748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12259 - 12171
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaaca 93  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12259 ttttctattgatcttgttcctggaacgaaacttgtgtctatggaaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaaca 12171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 61 - 1
Alignment:
Q  1 tgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatg 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  61 tgaattttcaattgacctcgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 126489 - 126580
Alignment:
Q  17 cttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgct 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  126489 cttgttcccggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaggatttgct 126580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15432 - 15262
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  15432 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattagaccaagtatttcaccgtggagagctccagtgttgttggttaagaagaaagat 15333  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || |  ||||| || ||  | |||||  | ||||||||||| || | ||| |||||  |||||||||||||    
T  15332 ggaagtatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 15262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 10956 - 11126
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||| || || ||  |||| ||| | ||| | |||||||||||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||    
T  10956 tgaattgaagaaacagttagaagagttatttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagat 11055  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | || ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  11056 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcacttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttcc 11126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 25420 - 25508
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaaca 93  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || || |||||||||||    
T  25420 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaaca 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 1734 - 1904
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||| |||| || || |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||| |||    
T  1734 tgaattgaagaaatagttagaagagttgcttgagaagtagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtattgctggttaagaagaaagat 1833  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttcc 249  Q
    || | |||||  || ||  | |||||  |  ||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  1834 gggagcatgatgttgtgtgtggattatcggtagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttcc 1904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26851 - 26735
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||| | ||| | |  ||||||||| | || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26851 tgaattgaagaagcagttggaagagttgctcgagaagcagtttatcatgccaagtgttcctccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaggat 26752  T
Q  179 ggtaccatgagattatg 195  Q
    || | |||||| |||||    
T  26751 ggaagcatgaggttatg 26735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 616 - 445
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || ||| | ||| | || || | |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  616 tgaattgaagaaacagttagaagagttgctagagaagcagtttatcaggccgattgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 517  T
Q  179 ggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    || | |||||| || ||  | |||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  || |||||||||||    
T  516 gggagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccg 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 1441 - 1547
Alignment:
Q  5 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 104  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  1441 ttttcaaatgatcttgtacctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaagttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaggatt 1540  T
Q  105 tgcttga 111  Q
    |||||||    
T  1541 tgcttga 1547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 90024 - 89914
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||    
T  90024 tgaattgaagaaatagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtattgttggttaagaagaaagat 89925  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || ||||||||    
T  89924 ggaaccatgag 89914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 7848 - 7791
Alignment:
Q  11 attgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctt 68  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7848 attgatcttgttcctgaaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctt 7791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23485 - 23417
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttgggg 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  23485 tgaattgaagaatcagttggaggagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtgggg 23417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34607 - 34508
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| | ||| | ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||    
T  34607 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttg--aagcagtttattagaccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaaaaaagat 34510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1305
Alignment:
Q  173 aaggatggtaccatgagattatgcatcgattactgtcagttgaacaaagttatgataaagaacaggtatccacttccg 250  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  1382 aaggatggtagtatgagactgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccg 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4518 - 4435
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgtt 162  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| | |||| ||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  4518 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagactaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgtt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 180
Target Start/End: Original strand, 144462 - 144517
Alignment:
Q  125 agaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatgg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  144462 agaccaagtgtttcaccttggggaccagcagtgttgttggtgaagaagaaagatgg 144517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 189
Target Start/End: Original strand, 728 - 838
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||    
T  728 tgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgaaaagcagtttatcaggccgagtgtatctccgtggggtgctccagtgttattggttaagaagaaagat 827  T
Q  179 ggtaccatgag 189  Q
    || | ||||||    
T  828 ggaagcatgag 838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 7022 - 7123
Alignment:
Q  79 tgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggat 178  Q
    |||||||||||||||||  || || |||||||| ||| | ||| | || || |||||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||    
T  7022 tgaattgaagaaacagtcagaagagttgcttgagaagcattttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagat 7121  T
Q  179 gg 180  Q
    ||    
T  7122 gg 7123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University