View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12541_high_2 (Length: 312)

Name: NF12541_high_2
Description: NF12541
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12541_high_2
NF12541_high_2
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (153-305)||(30394164-30394317)
chr6 (1-152)||(15866670-15866821)
chr6 (1-152)||(15868482-15868633)
chr6 (1-152)||(33866189-33866340)
chr6 (1-152)||(33869336-33869487)
chr6 (26-152)||(24544733-24544859)
chr6 (50-144)||(14619061-14619155)
chr6 (52-144)||(14611223-14611315)
chr6 (50-145)||(32080076-32080169)
chr6 (100-152)||(30488623-30488675)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (1-153)||(37405439-37405591)
chr7 (27-141)||(34844169-34844283)
chr7 (27-129)||(21631243-21631345)
chr7 (46-137)||(21633196-21633287)
chr7 (54-145)||(21632958-21633049)
chr7 (54-145)||(29597970-29598061)
chr7 (46-145)||(21630993-21631096)
chr7 (65-129)||(3233054-3233118)
chr7 (54-152)||(9878120-9878218)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-153)||(3284592-3284744)
chr1 (1-152)||(3282891-3283042)
chr1 (1-152)||(9310502-9310653)
chr1 (1-152)||(9312119-9312270)
chr1 (21-152)||(902186-902317)
chr1 (71-153)||(33072899-33072981)
chr1 (64-152)||(5924777-5924865)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-141)||(6316-6456)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (1-151)||(39787050-39787200)
chr5 (54-145)||(21637131-21637222)
chr5 (64-141)||(20012925-20013002)
chr5 (55-88)||(33690010-33690043)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (27-152)||(5653163-5653288)
chr4 (24-152)||(51295276-51295404)
chr4 (1-144)||(23985864-23986006)
chr4 (50-140)||(24807562-24807652)
chr4 (64-141)||(52545105-52545182)
chr4 (9-148)||(18395638-18395776)
chr4 (54-150)||(42665075-42665171)
chr4 (1-129)||(3529163-3529288)
chr4 (54-152)||(18393689-18393787)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (27-145)||(20957729-20957847)
chr2 (27-87)||(20957557-20957617)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (64-152)||(58937-59025)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (64-152)||(19473683-19473771)
chr8 (64-152)||(19544608-19544696)
chr8 (64-152)||(19588000-19588088)
chr8 (70-153)||(14939672-14939755)
chr8 (64-141)||(31032006-31032083)
chr8 (64-152)||(950082-950170)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (54-139)||(8961-9046)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (54-152)||(9032695-9032793)
chr3 (64-129)||(25836524-25836589)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (78-147)||(28524-28593)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (100-152)||(15746-15798)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (100-141)||(39332-39373)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30394317 - 30394164
Alignment:
Q  153 ggatctttttgtttgctatgaacaaggacattgcttgaagaaacgatattaatcttgacattctatataacattttttatttgcttttcaagatctacgt 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30394317 ggatccttttgtttgctatgaacaaggacattgcttgaagaaacgatattaatcttgacattctatataacattttttatttgcttttcaagatctacgt 30394218  T
Q  253 tctctaagatattgatgttgcttgcatgttcattccactc-acaattcatctct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30394217 tctctaagatattgatgttgcttgcatgttcattccactcaacaatccatctct 30394164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 15866670 - 15866821
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15866670 taggaacactattgtactcattcattatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 15866769  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15866770 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 15866821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 15868482 - 15868633
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868482 taggaacactattgtactcattcattatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 15868581  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868582 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 15868633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 33866189 - 33866340
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33866189 taggaacactattgtactcattcactatcttttgttaaatctagtttactctcctatgggtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctc 33866288  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33866289 tttctagctgatcactatgatcttaatccttgggattccttgattactaaca 33866340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 33869336 - 33869487
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33869336 taggaacactattgtacgcattcactatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatggatatctcccacatgaatacacctatgctctc 33869435  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33869436 tttctagctgatcactatgatctttatctttgggattccttgattactaaca 33869487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 152
Target Start/End: Original strand, 24544733 - 24544859
Alignment:
Q  26 tatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatcttt 125  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24544733 tatcttttatcaaatctagtttactctactatgagtttctatgagtatctccctcatgagtactcttatgcttgctttcttgcttatcactatgatcttt 24544832  T
Q  126 atccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24544833 atccttgggattccatgattactaaca 24544859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 144
Target Start/End: Original strand, 14619061 - 14619155
Alignment:
Q  50 tctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgat 144  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14619061 tctcctatgagtctctatggttatctcccacatgaatactactatgctctctctctagttgatatctatcatttttatccttgggattccttgat 14619155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Original strand, 14611223 - 14611315
Alignment:
Q  52 tcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgat 144  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14611223 tcctatgagtctctatggttatctcccacatgaatactactatgctctctctctagctgatatctatgatctttatctttcagattccttgat 14611315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 32080076 - 32080169
Alignment:
Q  50 tctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgatt 145  Q
    ||||||||||||| || | | |||||| |||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32080076 tctcctatgagtctctgtagttatctctcacatgaatactactatgctctct--ctagctgatcactatgatctttatccatgggattccatgatt 32080169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 30488623 - 30488675
Alignment:
Q  100 ctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  30488623 ctttcttgctgattaatatgatctttatccttgagattccatgattagtaaca 30488675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37405591 - 37405439
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37405591 taggaacactattgtactcattcactatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctc 37405492  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37405491 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 37405439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Original strand, 34844169 - 34844283
Alignment:
Q  27 atcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatcttta 126  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34844169 atcttttatcaaatctagtttactctactatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctctttctagttgatcactatgatcttta 34844268  T
Q  127 tccttgggattcctt 141  Q
    |||||||||||||||    
T  34844269 tccttgggattcctt 34844283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21631345 - 21631243
Alignment:
Q  27 atcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatcttta 126  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21631345 atcttttatcaaatctagtttactctactatgagtcactatgggtatctcccacattaatacacctatgctctctttctagctgatcaatatgatcttta 21631246  T
Q  127 tcc 129  Q
    |||    
T  21631245 tcc 21631243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21633287 - 21633196
Alignment:
Q  46 ttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggatt 137  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21633287 ttactctactatgggtcactatgagtatctcccacatgaatacatctatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccctgggatt 21633196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21633049 - 21632958
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgatt 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21633049 ctatgagtcactatgtgtatctcccacatgaatacacctatgctctcttttcagctgatcactgtgatctttatccatgggattccatgatt 21632958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29598061 - 29597970
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgatt 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  29598061 ctatgagtctctatgggtatctcccacatgaatactcttatgctctctttcttgctgatcactatgacctttatccctgggattccatgatt 29597970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21631096 - 21630993
Alignment:
Q  46 ttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagct----gatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  21631096 ttactctactatgagtcactatgtgtatctcccacattaatagacctatgctctctttctagctgatcgatcactatgatctttatccctaggattccat 21630997  T
Q  142 gatt 145  Q
    ||||    
T  21630996 gatt 21630993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 3233054 - 3233118
Alignment:
Q  65 tatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatcc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  3233054 tatggatatctcccacatgaatactcttatgctctctttcttgctgatcactgtgacctttatcc 3233118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9878218 - 9878120
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  9878218 ctatgagtctctatagatatctcccacatgaatactattatgctctctttcttgctattcactataacatttatccttgagattccataatttctaaca 9878120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 3284592 - 3284744
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3284592 taggaacactattgtactcattcactatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctc 3284691  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3284692 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 3284744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 3282891 - 3283042
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3282891 taggaacactattgtactcattcactatcttttgttaaatctagtttactctcctataagtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctc 3282990  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3282991 tttctagttgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 3283042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 9310502 - 9310653
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9310502 taggaacactattgtactcattcattatcttttgttaaatctaatttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 9310601  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9310602 tttctagctgatcactatgatctttatccttgagattccttgattactaaca 9310653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 9312119 - 9312270
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312119 taggaacactattgtactcattcattatcttttgttaaatctagtttactctcccatgagtcactatgagtatctcccacatgaatacacatatgctctc 9312218  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312219 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 9312270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 902186 - 902317
Alignment:
Q  21 ttcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatga 120  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  902186 ttcattatcttttgttaaatctagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacctatgctctctttctaactgatcattatga 902285  T
Q  121 tctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  902286 tctttatccttggaatttcttgattactaaca 902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Original strand, 33072899 - 33072981
Alignment:
Q  71 tatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 153  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  33072899 tatctcccacatgaatactcttatgatctctttcttgctgatcattatgacctttatccctgagattccatgatgactaacag 33072981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5924865 - 5924777
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| | ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||    
T  5924865 ctatgagtatctcctatatgaatactcttatgcttgcttttttactgatcactatgatctttatccatcggatttcatgattagtaaca 5924777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 6316 - 6456
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6316 taggaacactattgtactcattcactatcttttgttaaatcaagtttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacatctatgctctc 6415  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6416 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 6456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 39787200 - 39787050
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39787200 taggaacactattttactcattcactgtcttttgttaaatctagtttactctcctataagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 39787101  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39787100 tttctagctgatcactatgatctttatccttgagattccttgattactaac 39787050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21637222 - 21637131
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgatt 145  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21637222 ctataagtctctatgggtatcttccacatgaatactcttatgttctctttcttactgatcattatgatctttatccatgggattccatgatt 21637131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20013002 - 20012925
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20013002 ctatgagtatctcccacatgagtactcttatgcttgctttcttggtgatcactatgatcttcatccttgggattcctt 20012925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 88
Target Start/End: Original strand, 33690010 - 33690043
Alignment:
Q  55 tatgagtcactatgggtatctcccacatgaatac 88  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33690010 tatgagtctctatgggtatctcccacatgaatac 33690043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5653288 - 5653163
Alignment:
Q  27 atcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatcttta 126  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5653288 atcttttatcaaatctagtttactctcctatgagtcactgtgggtatctcccacatgaatacacctatgctctctttctagctgatcactatgatcttta 5653189  T
Q  127 tccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5653188 tccttggcattccatgattactaaca 5653163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 152
Target Start/End: Original strand, 51295276 - 51295404
Alignment:
Q  24 actatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatct 123  Q
    |||| ||||| | ||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51295276 actaccttttatcaaatctagtttactctattatgagtcactatggatatctcccacatgaatacacctatgctctctttctagctgatcactatgatct 51295375  T
Q  124 ttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  51295376 ttatccttaggattccataattactaaca 51295404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 23985864 - 23986006
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |  | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||    
T  23985864 taggaacactattgtactcattcaccatcttttatcaaatctat-tgattctcctatgagtctctatggttatctcccacatgaatattactatgctctc 23985962  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgat 144  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23985963 tctctagctgatgtctatgatctttatccttgggattccttgat 23986006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 140
Target Start/End: Original strand, 24807562 - 24807652
Alignment:
Q  50 tctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcct 140  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24807562 tctcctatgagtctctatggatatctcccacatgaatactactatgctctctctctagctaatatctatgatctttatccttgggattcct 24807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52545182 - 52545105
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52545182 ctatgagtatctcccacatgagtactcttatgctcgctttcttgctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 52545105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18395776 - 18395638
Alignment:
Q  9 ctattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagc 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | ||| |  | ||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  18395776 ctattgtactcattcactatcttttatcatatctat-tcactatactatgagtctatatgagtatctcccacatgaatactcttatgctctctttcttgc 18395678  T
Q  109 tgatcactatgatctttatccttgggattccttgattact 148  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  18395677 taatcactatgacctttatccgtgggatttcatgattact 18395638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 42665075 - 42665171
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaa 150  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  42665075 ctatgagtttctatgggtatctcccagataaatactcttatgctctctttctagccgatcactatgacctttatccttagaatttcatgattactaa 42665171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3529288 - 3529163
Alignment:
Q  1 taggaacactattgtattcattcactatcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |  | | ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||   |||||||||    
T  3529288 taggaacactattgtactcattcattatcttttatcaaatctat-tgattctcctatgagtctctatggttattttccacatgaatactactatgctctc 3529190  T
Q  101 tttctagctgatcactatgatctttatcc 129  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3529189 t--ctagctgatcactatgacctttatcc 3529163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18393787 - 18393689
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  18393787 ctatgagtctctatgagtatctcatacataaatactcttatactctctttcttgatgatcactatgacatttatccctgagattccatgattacgaaca 18393689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 20957729 - 20957847
Alignment:
Q  27 atcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatcttta 126  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  20957729 atcttttgtcaaatctagtttactctactatgagtcactatgggtatctcccacatgaatactcttatgcactcttccttgctgatcactgtgaccttta 20957828  T
Q  127 tccttgggattccttgatt 145  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  20957829 tccctgggattccatgatt 20957847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 20957557 - 20957617
Alignment:
Q  27 atcttttgttaaatcaaggttactctcctatgagtcactatgggtatctcccacatgaata 87  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20957557 atcttttgtcaaatctagtttactctactatgagtcactatgggtatctcccacatgaata 20957617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 58937 - 59025
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  58937 ctatgagtatctcccacatgagtactcttatgcttgctttcttgctgatcactatgatctttatccttgggattccatgattactaaca 59025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 19473683 - 19473771
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19473683 ctatgagtatctcccacatgagtactcttattcttgctttcttgctgatcactatgatctttatccttgggattccatgattactaaca 19473771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 19544608 - 19544696
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19544608 ctatgagtatctcccacatgagtactcttattcttgctttcttgctgatcactatgatctttatccttgggattccatgattactaaca 19544696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19588088 - 19588000
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19588088 ctatgagtatctcccacatgagtactcttattcttgctttcttgctgatcactatgatctttatccttgggattccatgattactaaca 19588000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 14939672 - 14939755
Alignment:
Q  70 gtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaacag 153  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14939672 gtatcttctacatgagtactcatatgcttgctttcttgctgatcactatgatctttatccttaggattccatgattactaacag 14939755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31032083 - 31032006
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31032083 ctatgagtatctcccacatgagtactcttatgcttgctttcttgctgatcactatgatctttgtccttgggattcctt 31032006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 950170 - 950082
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||| |   |||||  |||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  950170 ctatgagtatcttctacatgaatacgcatatgattgttttctttctgatcactatgatctctatctctgggaatccatgattactaaca 950082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9046 - 8961
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcc 139  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  9046 ctatgagtccttatgggtatcttccacatgaatactcttatgttctctttcttgctgatcattataatctttatccctgagattcc 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9032793 - 9032695
Alignment:
Q  54 ctatgagtcactatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| | |||||||| ||||  |||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  9032793 ctatgagtttctatgggtatctcccacatgaatattcgtatgttctcttttttgctgatcattatgtactttatccctgggatttcatgataactaaca 9032695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 129
Target Start/End: Original strand, 25836524 - 25836589
Alignment:
Q  64 ctatgggtatctcccacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatcc 129  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  25836524 ctatgggcatctctcacatgaatactcttatgcaccctttcttgctgatcactttgacctttatcc 25836589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 28524 - 28593
Alignment:
Q  78 cacatgaatacacatatgctctctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattac 147  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  28524 cacatgaatactcttacgctctctttctttctgatcaatatgacctttatcctttggattccatgattac 28593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 15746 - 15798
Alignment:
Q  100 ctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattccttgattactaaca 152  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15746 ctttcttgctgattgctatgatctttatccttgagattccatgattactaaca 15798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 39332 - 39373
Alignment:
Q  100 ctttctagctgatcactatgatctttatccttgggattcctt 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39332 ctttcttgctgatcactatgatctttattcttgagattcctt 39373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University