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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1254_high_62 (Length: 271)
Name: NF1254_high_62
Description: NF1254
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1254_high_62 |
 | |
|
| [»] chr4 (9 HSPs) |
| |
|
| [»] chr8 (3 HSPs) |
| |
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| [»] chr1 (1 HSPs) |
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| [»] chr7 (5 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (3 HSPs) |
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| [»] chr2 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] chr3 (1 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14174185 - 14173919
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174185 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
14174086 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174085 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
14173990 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173989 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
14173919 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14178939 - 14178673
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178939 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
14178840 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178839 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
14178744 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178743 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
14178673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 28606923 - 28607189
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606923 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
28607022 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607023 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
28607118 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607119 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
28607189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 28611685 - 28611951
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611685 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
28611784 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611785 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
28611880 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611881 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
28611951 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44161832 - 44161571
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44161832 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctctccactctcttacacaca |
44161735 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161734 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
44161639 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44161638 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctctacacaca |
44161571 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11104692 - 11104456
Alignment:
| Q |
25 |
accacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgt |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104692 |
accacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctccactctcttacacacaa-----agagatacaatatagtgt |
11104598 |
T |
|
| Q |
125 |
ttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctgga |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11104597 |
ttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatgatatccacccggtgtatttttcctacactctctgga |
11104498 |
T |
|
| Q |
225 |
tttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacaca |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104497 |
tttactcaacactctattttttctctcacacacttctacaca |
11104456 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 48826819 - 48827000
Alignment:
| Q |
5 |
cctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnn |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
48826819 |
cctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctcttcgctctct----tacacaca |
48826913 |
T |
|
| Q |
105 |
nnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgata |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826914 |
caagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata |
48827000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 48708181 - 48708256
Alignment:
| Q |
9 |
taatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
84 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708181 |
taatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctctc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 24726306 - 24726381
Alignment:
| Q |
17 |
agggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
92 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24726306 |
agggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct |
24726381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12930924 - 12930658
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930924 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
12930825 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930824 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
12930729 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930728 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
12930658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12935670 - 12935404
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935670 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
12935571 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935570 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
12935475 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935474 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
12935404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 92
Target Start/End: Original strand, 26504996 - 26505055
Alignment:
| Q |
33 |
acaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
92 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
26504996 |
acaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctct |
26505055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34907387 - 34907121
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907387 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
34907288 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907287 |
ca----agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
34907192 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907191 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
34907121 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 37040543 - 37040809
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37040543 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttctccactctctcacacaca |
37040642 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040643 |
ca----agagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccga |
37040738 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040739 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag |
37040809 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15290476 - 15290223
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290476 |
aaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattctctccactctcttacacaca |
15290377 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290376 |
ca----agagatacaatatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgaatgctattatttca--gcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
15290284 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
268 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290283 |
tgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactcta------ttctcacacacttctacacaca |
15290223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082002
Alignment:
| Q |
35 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgag |
134 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaa----agagatacaatatagtgtttctaatgag |
12082133 |
T |
|
| Q |
135 |
acctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaac |
234 |
Q |
| |
|
|| || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12082132 |
actcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaac |
12082034 |
T |
|
| Q |
235 |
actctatttttcttctcacacacttctacaca |
266 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12082033 |
actctaattttctgatcacacacttctacaca |
12082002 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12099247 - 12098988
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099247 |
aaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctccactctct----taca |
12099152 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
12099151 |
cgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatgatactcactcaa |
12099052 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca |
268 |
Q |
| |
|
| |||||| | | | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12099051 |
tctatttt--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttctacacaca |
12098988 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 2757370 - 2757418
Alignment:
| Q |
44 |
aaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
92 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757370 |
aaaatattccactatatttaaaaatattgcactattctctccactctct |
2757418 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 42911107 - 42911372
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911107 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctccactctctcacacaca |
42911205 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgg |
200 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42911206 |
ca----aaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatgatacccacccag |
42911301 |
T |
|
| Q |
201 |
tgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911302 |
tgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacag |
42911372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 29106992 - 29107249
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106992 |
aaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctcttacacaca |
29107091 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgata-cccacccg |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29107092 |
ca----agagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatgataccccaccca |
29107186 |
T |
|
| Q |
200 |
gtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctaca |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29107187 |
atgtatttttcccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctaca |
29107249 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 38997252 - 38997320
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
69 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997252 |
aaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8539433 - 8539165
Alignment:
| Q |
1 |
aaaccctctaatactgagggaaagaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnn |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8539433 |
aaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctccactctcttacacaca |
8539334 |
T |
|
| Q |
101 |
nnnnnnagagatacaatat---agtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacc |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8539333 |
ca----agagatacaatattatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagagatgatacccatc |
8539239 |
T |
|
| Q |
198 |
cggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8539238 |
cgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacag |
8539165 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302143
Alignment:
| Q |
108 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
208 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag |
271 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacag |
51302143 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 2100338 - 2100379
Alignment:
| Q |
28 |
acgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
69 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2100338 |
acggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 92
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100753
Alignment:
| Q |
62 |
aaagaatattacaatattctctccactctct |
92 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctccactctct |
2100753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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