View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12551_high_30 (Length: 246)

Name: NF12551_high_30
Description: NF12551
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12551_high_30
NF12551_high_30
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (1-231)||(3952-4182)
scaffold0264 (1-187)||(10851-11037)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-231)||(130501-130731)
scaffold0001 (1-172)||(138471-138642)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-231)||(21969128-21969358)
chr8 (1-231)||(27007794-27008024)
chr8 (1-231)||(27014937-27015167)
chr8 (1-231)||(28498288-28498518)
chr8 (1-231)||(12561918-12562148)
chr8 (1-231)||(22130886-22131116)
chr8 (1-231)||(45534550-45534780)
chr8 (1-231)||(26240279-26240509)
chr8 (1-231)||(25610989-25611220)
chr8 (1-231)||(27880764-27880995)
chr8 (1-231)||(28020945-28021176)
chr8 (1-231)||(22659771-22660001)
chr8 (1-231)||(8371530-8371760)
chr8 (54-231)||(21916524-21916701)
chr8 (1-227)||(2963217-2963441)
chr8 (1-184)||(36970070-36970253)
chr8 (1-216)||(6430740-6430952)
chr8 (3-230)||(18835151-18835374)
chr8 (1-231)||(20539674-20539905)
chr8 (1-37)||(21914358-21914394)
chr8 (60-131)||(8782188-8782259)
chr8 (1-33)||(21862195-21862227)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-231)||(18399899-18400129)
chr7 (1-231)||(18406883-18407113)
chr7 (1-231)||(48808773-48809003)
chr7 (1-231)||(15729546-15729776)
chr7 (1-231)||(19858917-19859147)
chr7 (1-231)||(30253933-30254163)
chr7 (4-231)||(8464797-8465024)
chr7 (1-231)||(2204346-2204577)
chr7 (1-231)||(18139615-18139847)
chr7 (1-231)||(19230682-19230913)
chr7 (1-231)||(41681250-41681480)
chr7 (1-231)||(10669179-10669408)
chr7 (1-231)||(47167136-47167365)
chr7 (1-230)||(18259402-18259630)
chr7 (1-231)||(28130357-28130586)
chr7 (1-231)||(34128370-34128598)
chr7 (1-227)||(19393705-19393930)
chr7 (14-231)||(15999791-16000007)
chr7 (15-231)||(14585976-14586191)
chr7 (18-231)||(2935846-2936056)
chr7 (60-231)||(24443604-24443772)
chr7 (2-231)||(22968746-22968975)
chr7 (1-231)||(3587705-3587934)
chr7 (60-230)||(15170307-15170476)
chr7 (1-223)||(42150363-42150577)
chr7 (1-73)||(22994103-22994176)
chr7 (23-229)||(31190722-31190926)
chr7 (3-94)||(24443932-24444024)
chr7 (188-246)||(25845736-25845796)
chr7 (188-246)||(25846155-25846215)
chr7 (1-29)||(48813797-48813825)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (1-231)||(16788866-16789096)
chr6 (1-231)||(1586385-1586615)
chr6 (1-231)||(13995220-13995450)
chr6 (1-231)||(18020118-18020348)
chr6 (1-231)||(22860165-22860395)
chr6 (1-231)||(27508624-27508855)
chr6 (1-231)||(27528210-27528441)
chr6 (1-231)||(14074275-14074505)
chr6 (1-231)||(8612712-8612940)
chr6 (1-231)||(5758758-5758986)
chr6 (1-155)||(13947549-13947704)
chr6 (1-216)||(17120741-17120953)
chr6 (1-231)||(20736605-20736834)
chr6 (1-231)||(19218227-19218454)
chr6 (1-101)||(14996907-14997007)
chr6 (1-231)||(22560461-22560692)
chr6 (23-231)||(21994406-21994613)
chr6 (60-225)||(4073432-4073595)
chr6 (98-131)||(10359410-10359443)
chr6 (189-231)||(10359326-10359368)
chr6 (138-227)||(23846668-23846755)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (1-231)||(31694-31924)
chr5 (1-231)||(24933583-24933813)
chr5 (1-231)||(12789940-12790170)
chr5 (1-231)||(23545717-23545947)
chr5 (1-231)||(25805662-25805892)
chr5 (1-231)||(20940822-20941052)
chr5 (1-231)||(31096611-31096841)
chr5 (1-231)||(22941045-22941275)
chr5 (1-231)||(7865711-7865939)
chr5 (1-231)||(12765271-12765499)
chr5 (1-231)||(12704155-12704383)
chr5 (3-231)||(26244900-26245127)
chr5 (1-231)||(9812014-9812242)
chr5 (1-231)||(5097447-5097676)
chr5 (12-231)||(39535271-39535489)
chr5 (1-231)||(20100520-20100747)
chr5 (1-227)||(26129974-26130201)
chr5 (1-86)||(31652208-31652294)
chr5 (188-231)||(31267939-31267982)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-231)||(2676808-2677038)
chr4 (1-231)||(15461292-15461522)
chr4 (1-231)||(15814816-15815046)
chr4 (1-231)||(18111320-18111550)
chr4 (1-231)||(20243732-20243962)
chr4 (1-231)||(26531408-26531638)
chr4 (1-231)||(18162957-18163187)
chr4 (1-231)||(3369300-3369530)
chr4 (1-231)||(4676260-4676490)
chr4 (1-231)||(17300236-17300466)
chr4 (1-231)||(34975346-34975576)
chr4 (1-231)||(5870207-5870443)
chr4 (1-187)||(38816508-38816694)
chr4 (1-231)||(1941520-1941749)
chr4 (1-230)||(9487347-9487575)
chr4 (1-160)||(11484265-11484424)
chr4 (1-231)||(11420812-11421041)
chr4 (1-231)||(30040751-30040980)
chr4 (72-230)||(4545948-4546104)
chr4 (74-231)||(19365389-19365544)
chr4 (18-231)||(19362229-19362435)
chr4 (187-231)||(32636465-32636509)
chr4 (1-43)||(4545908-4545950)
chr4 (1-130)||(23056437-23056567)
chr4 (60-169)||(9537816-9537926)
chr4 (60-221)||(39422426-39422585)
chr4 (60-225)||(56516093-56516255)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (1-231)||(21034033-21034263)
chr3 (1-231)||(12299706-12299936)
chr3 (1-231)||(15846813-15847043)
chr3 (1-231)||(55426816-55427046)
chr3 (1-231)||(14890186-14890416)
chr3 (1-231)||(20147831-20148062)
chr3 (1-227)||(21398587-21398813)
chr3 (1-230)||(25979006-25979234)
chr3 (1-230)||(11787383-11787611)
chr3 (1-199)||(28088013-28088211)
chr3 (2-230)||(15526552-15526777)
chr3 (1-231)||(14146817-14147046)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-231)||(30174172-30174402)
chr2 (1-231)||(24250309-24250539)
chr2 (1-231)||(24229492-24229722)
chr2 (1-231)||(19616231-19616460)
chr2 (1-231)||(24763834-24764063)
chr2 (1-231)||(15342280-15342509)
chr2 (2-94)||(29800224-29800317)
chr2 (4-170)||(21626480-21626647)
chr2 (1-131)||(28719170-28719302)
chr2 (3-121)||(18852167-18852286)
chr2 (189-236)||(28719053-28719100)
chr2 (188-231)||(29800449-29800492)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (1-231)||(9455911-9456141)
chr1 (1-231)||(20391516-20391746)
chr1 (1-231)||(42817266-42817496)
chr1 (1-231)||(20779922-20780152)
chr1 (1-231)||(47667751-47667981)
chr1 (1-231)||(22670534-22670764)
chr1 (1-231)||(19706716-19706946)
chr1 (1-231)||(28135000-28135230)
chr1 (1-231)||(43802642-43802872)
chr1 (1-231)||(22612282-22612517)
chr1 (1-231)||(35930377-35930607)
chr1 (1-155)||(22234827-22234981)
chr1 (84-231)||(633814-633959)
chr1 (3-231)||(8727463-8727692)
chr1 (10-181)||(26923675-26923846)
chr1 (2-231)||(21881653-21881882)
chr1 (60-222)||(29096580-29096739)
chr1 (190-230)||(16435837-16435877)
chr1 (5-83)||(16435649-16435728)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-231)||(119525-119755)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-231)||(15100-15330)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (1-231)||(8100-8330)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (1-221)||(1-225)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (24-231)||(1-208)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-182)||(19160-19341)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-187)||(40015-40201)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-231)||(67651-67880)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (4-230)||(45226-45451)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-231)||(8895-9135)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (1-231)||(11807-12035)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-132)||(18790-18921)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (1-161)||(961-1121)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-132)||(76355-76486)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-231)||(13226-13456)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-231)||(40265-40494)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (12-165)||(26413-26567)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (1-109)||(9564-9672)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (3-231)||(53571-53790)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-86)||(33927-34012)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (1-231)||(8528-8756)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-73)||(13788-13861)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (144-231)||(83292-83377)


Alignment Details
Target: scaffold0264 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4182 - 3952
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4182 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 4083  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4082 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 3983  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3982 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11037 - 10851
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11037 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatata 10938  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10937 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 130731 - 130501
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130731 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 130632  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130631 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 130532  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130531 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 130501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 138642 - 138471
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  138642 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatata 138543  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  138542 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 138471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21969128 - 21969358
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969128 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 21969227  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969228 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 21969327  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969328 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21969358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27008024 - 27007794
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008024 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 27007925  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007924 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 27007825  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007824 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27007794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27015167 - 27014937
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015167 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 27015068  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015067 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 27014968  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014967 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28498288 - 28498518
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498288 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 28498387  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498388 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 28498487  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28498488 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28498518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12561918 - 12562148
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561918 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 12562017  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562018 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 12562117  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562118 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12562148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22131116 - 22130886
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131116 tgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 22131017  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131016 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatttatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 22130917  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130916 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22130886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45534780 - 45534550
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534780 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 45534681  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534680 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 45534581  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45534580 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 45534550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26240279 - 26240509
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240279 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 26240378  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26240379 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaa 26240478  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26240479 gcgtcgagactattatgtatgaagactgatg 26240509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25610989 - 25611220
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25610989 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 25611088  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattctt-aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611089 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttagagaacgctattcttaaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 25611188  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611189 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25611220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27880995 - 27880764
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27880995 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatata 27880896  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27880895 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataa 27880796  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880795 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28021176 - 28020945
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28021176 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatata 28021077  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28021076 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataa 28020977  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020976 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28020945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22660001 - 22659771
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22660001 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatata 22659902  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22659901 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 22659802  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22659801 gcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 22659771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8371760 - 8371530
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8371760 tgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatata 8371661  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371660 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaataacactattcttaaatgtgtctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 8371561  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371560 gcatcgagactattatgtatgtagactgatg 8371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 21916524 - 21916701
Alignment:
Q  54 ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21916524 ataatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaa 21916623  T
Q  154 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916624 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21916701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2963441 - 2963217
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgtt-aataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2963441 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatatttatagtaatgtttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 2963342  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |  ||||||||||||    
T  2963341 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtattcgt-gtcaaa-ctttaatataatt--aggataataata 2963246  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagact 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2963245 aagcgtagagactattatgtatgtagact 2963217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 36970070 - 36970253
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36970070 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaataatat 36970169  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36970170 attatgtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttgttcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat 36970253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 6430740 - 6430952
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttatt-attgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430740 tgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttataatagatagttcgtgtaataata 6430839  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6430840 tattaagtgtgactta---atgagattacattatcataaataacactattcttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataata 6430934  T
Q  199 aagcgtcgagactattat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6430935 aagcgtcgagactattat 6430952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 18835151 - 18835374
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 101  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||   | | || |||||    
T  18835151 tatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgttataatgttaataaagttcttagaatagatagtt---gcagtagtatat 18835247  T
Q  102 taagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||  |  ||||||||||||    
T  18835248 taagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatctgtagtc-cagctttaatatggattga-aataataataaag 18835345  T
Q  202 cgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18835346 catcgagactattatgtatgtagactgat 18835374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20539905 - 20539674
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||    
T  20539905 tgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattataattgttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaat 20539807  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| | |||    |  ||||||||    
T  20539806 attaagtgtgacttaatcatgtgattacattaacataaagaacgttattcttaaatacatttgtagt-aaagctttaatgtaaattgggataataataat 20539708  T
Q  198 aaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  20539707 aaagcgcatagacgattatgtatgtagactgatg 20539674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 21914358 - 21914394
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21914358 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcac 21914394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8782259 - 8782188
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8782259 ttaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaaatgtgacttaatcatgggattacatta 8782188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 21862195 - 21862227
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatg 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21862195 tgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18399899 - 18400129
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399899 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18399998  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399999 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 18400098  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400099 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18406883 - 18407113
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406883 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18406982  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18406983 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 18407082  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407083 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48809003 - 48808773
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809003 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 48808904  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808903 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 48808804  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808803 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 48808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15729546 - 15729776
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729546 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 15729645  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729646 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 15729745  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729746 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15729776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19858917 - 19859147
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19858917 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtttaataatata 19859016  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19859017 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataacaaa 19859116  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859117 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19859147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30253933 - 30254163
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30253933 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 30254032  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254033 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagatcgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 30254132  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254133 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30254163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 8464797 - 8465024
Alignment:
Q  4 atcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatatta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464797 atcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatatta 8464896  T
Q  104 agtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464897 agtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcg 8464996  T
Q  204 tcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  8464997 acgagactattatgtatgtagactgatg 8465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2204346 - 2204577
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204346 tgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 2204445  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2204446 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataa 2204545  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204546 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2204577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18139847 - 18139615
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139847 tgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18139748  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaa--atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139747 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgttattcttaaatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 18139648  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139647 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18139615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19230682 - 19230913
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230682 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 19230781  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19230782 attaagtgtaacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaaacattaatatgaataaaggataataataa 19230881  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230882 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19230913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41681480 - 41681250
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41681480 tgtatcatgatttttattattgaataatatataacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttggaatagatagtttatgtaataatata 41681381  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41681380 ttaagtgtgacttaatcatgagattactttatcttatagaatgttattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 41681281  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41681280 gctttgagactattatgtatgtagactgatg 41681250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10669408 - 10669179
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669408 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 10669309  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10669308 aataagtgtgacttaatcatcagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aatcttt-atattaataaatgataataataa 10669211  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669210 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 10669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47167365 - 47167136
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47167365 tgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 47167266  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47167265 attaagtgtgactttatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 47167168  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47167167 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18259630 - 18259402
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18259630 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 18259531  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18259530 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattcttaaatgtatccatagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 18259433  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18259432 atcgtcgagagtattatgtatgttgactgat 18259402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28130357 - 28130586
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28130357 tgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatatttataataatgttaatgaagtccttataatagatagttcgtgtaataatat 28130456  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28130457 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaaaacgctattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataataa 28130554  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28130555 agcgtcgagactattatgcatgtagactgatg 28130586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34128370 - 34128598
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34128370 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatat 34128469  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  34128470 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagt-taagctttaatataatt--aggataataataa 34128566  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34128567 agcgtcgagattattatgtatgtagactgatg 34128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19393930 - 19393705
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  19393930 tgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattatatctgtagtaatgttaataaagtctctataatagatagttcatgtaatgatat 19393831  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||    
T  19393830 attaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaatgctattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgagt-tgggataattataa 19393733  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19393732 agcgtcgagactattatgtatgtagact 19393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 15999791 - 16000007
Alignment:
Q  14 ttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgact 112  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15999791 ttattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaattaagtacctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgact 15999890  T
Q  113 taatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacta 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  15999891 taatcatgagattacattaccttaaagaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactt 15999988  T
Q  213 ttatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15999989 ttatgtatgcagactgatg 16000007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 14585976 - 14586191
Alignment:
Q  15 tattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactt 113  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  14585976 tattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgactt 14586075  T
Q  114 aatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactat 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |    
T  14586076 aatcatgagattacattatcttaatgaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-tggaataataataaagcgtcgagacttt 14586173  T
Q  214 tatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14586174 tatgtatgcagactgatg 14586191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 2935846 - 2936056
Alignment:
Q  18 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2935846 tattaaataatatatgtcactcttcattatatttgttgtaatgttaataaagtccctagaataaatagttcatgtaattatatattaagtg--acttaat 2935943  T
Q  117 catgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 216  Q
    |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2935944 catgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgcgataataataaagcatcgagactgttat 2936041  T
Q  217 gtatgtagactgatg 231  Q
     ||||||||||||||    
T  2936042 ttatgtagactgatg 2936056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24443772 - 24443604
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||    
T  24443772 ttaataaagtccctataatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcacgagattacattaacataaagaacgatattcttaaatgtat 24443673  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||| |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24443672 ccgtag-ccaagctttaatataaat--gggatgataacaaagtgtaaagactattatgtatgtagactgatg 24443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 22968746 - 22968975
Alignment:
Q  2 gtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   |    
T  22968746 gtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatttgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaa 22968844  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||    
T  22968845 tattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattcttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgata 22968942  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22968943 aagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 22968975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3587705 - 3587934
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||    |||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| || | ||    
T  3587705 tgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattataattgttgtaagattaataaagtccatagaataggtagtttatgtgatgaaat 3587804  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||   || | |||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  3587805 attaactgtgacttaatcatgagattactttaacataaaaaacgttattcttaaatgaatctatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataa 3587902  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3587903 agcgtagagactattatgtatatagaccgatg 3587934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15170476 - 15170307
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||| |||    
T  15170476 ttaataaagtccataaaatagat-gttcatgtaatggaatattaagtgggacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatat 15170378  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaa---ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
      |||||||| ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15170377 ttgtagtcaa-gctttaatat--ataaattgggataataataaagcgtagagactattatatatgtagactgat 15170307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42150577 - 42150363
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-----taatgttaataaagtcc--ttagaatagatagttcgtgtaa 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |     |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||      
T  42150577 tgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatatttgtaggtagtaatgttaataaagcccctatagaatagatagttc-tgt-- 42150481  T
Q  94 taatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataa 193  Q
               |||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  42150480 -----------gtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattc-taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataa 42150395  T
Q  194 taataaagcgtcgagact--attatgtatgta 223  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42150394 taataaagcgtcgagactaaattatgtatgta 42150363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 22994103 - 22994176
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtcctt 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22994103 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtcctt 22994176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31190926 - 31190722
Alignment:
Q  23 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |      
T  31190926 aataatatatggcactttttattatatttgttgtaatgttaataaagtccccaga-tagatagttcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcgttt 31190828  T
Q  122 gattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 221  Q
    | ||||||||   || | |||  |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31190827 gcttacattaacataaataacattattattaaatatatccttagtc-aagctttagtataaat-tgggataataataaagcaccgagactattacgtatg 31190730  T
Q  222 tagactga 229  Q
    ||| ||||    
T  31190729 taggctga 31190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24444024 - 24443932
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24444024 tatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatatttgttataagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaat 24443932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25845796 - 25845736
Alignment:
Q  188 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 246  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25845796 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25845736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25846215 - 25846155
Alignment:
Q  188 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtc--catctcattgctc 246  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25846215 ggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctc 25846155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 48813797 - 48813825
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataata 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813797 tgtatcatgacttttattattgaataata 48813825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16788866 - 16789096
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788866 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 16788965  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16788966 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 16789065  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789066 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 16789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1586615 - 1586385
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586615 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 1586516  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586515 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 1586416  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586415 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 1586385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13995450 - 13995220
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995450 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 13995351  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995350 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 13995251  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995250 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 13995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18020348 - 18020118
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020348 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattcagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18020249  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020248 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattattttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 18020149  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020148 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22860395 - 22860165
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860395 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 22860296  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860295 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 22860196  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860195 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27508855 - 27508624
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27508855 tgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 27508756  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27508755 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgtataaaggataataataa 27508656  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508655 agcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27508624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27528441 - 27528210
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27528441 tgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 27528342  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27528341 attaagtgtgacttaatcatgaaattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 27528242  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27528241 agcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27528210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14074275 - 14074505
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14074275 tgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatata 14074374  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14074375 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactagtcttaaatgtatatgtagtcaaagctttaatatgaataaagtataataataaa 14074474  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14074475 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 14074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8612712 - 8612940
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612712 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattcatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 8612811  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  8612812 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataa 8612908  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612909 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5758986 - 5758758
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5758986 tgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatat 5758887  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  5758886 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacaatattattaaatgtatccgtagt-aaagctttaatataatt--aggataataataa 5758790  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5758789 agcgtcgagaatattatgtatgtagactgatg 5758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 13947549 - 13947704
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattg-aataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947549 tgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 13947648  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaat 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13947649 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaat 13947704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17120953 - 17120741
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17120953 tgtatcatgacttttattattgaataatatatg--actctttattatatttataataatgttaataaaatccctagaatagatagttcgtataataatat 17120856  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17120855 attaagtgtgacttagtcatgagattatattatcataaagaacgttattcttaaatgtatccattgtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 17120758  T
Q  200 agcgtcgagactattat 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  17120757 agcgtcgagactattat 17120741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20736834 - 20736605
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||    
T  20736834 tgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatatttgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtat 20736735  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||    
T  20736734 attaagtttgacttaatcatgagattacattaacataaagaacattattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaataagaa-ctgggataataataa 20736637  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20736636 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19218227 - 19218454
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  19218227 tgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattatatttgttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaat 19218326  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||  | |  ||||||||||||    
T  19218327 attaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcataaagaatgctattcttaaa-gcatcagtagtc-aagctttaatat--aaaggggataataataa 19218422  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19218423 agtgtagagactattatgtatgtagactgatg 19218454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 14996907 - 14997007
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996907 tgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttattatatttatataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 14997006  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  14997007 t 14997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22560692 - 22560461
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagat-aatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  22560692 tgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttattatatttattgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggat 22560593  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacatt-atattatagaacg--ctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataa 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| |   ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   |||||||||    
T  22560592 attaagtgtgactcaatcatgagatgacattaacatta-agaatgttttatccttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataa 22560496  T
Q  197 taaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22560495 taaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatg 22560461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21994406 - 21994613
Alignment:
Q  23 aataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21994406 aataatatatgatactctttattatacttgttgtaatattaataaagtcccaataatagatagttcgtgtaatggtatattaattgtgacttaatcatga 21994505  T
Q  122 gattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 221  Q
    ||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  21994506 gattacattaatataaagaacactattcttaaatgtatccatagtc-gagctttaatataaat-tggaataataataaagcgcaaagactattatatatg 21994603  T
Q  222 tagactgatg 231  Q
    ||||||||||    
T  21994604 tagactgatg 21994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 4073432 - 4073595
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||  |||||||||| ||||    
T  4073432 ttaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatggaaagaacattattcttaaaagtat 4073531  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4073532 ccgtagtcaaa-ctttaatataaat-caggataataataaaacgtagagactattatgtttgtaga 4073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10359443 - 10359410
Alignment:
Q  98 atattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359443 atattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 10359410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10359368 - 10359326
Alignment:
Q  189 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10359368 gataataataaagcgtagagactattatatatgtagagtgatg 10359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23846755 - 23846668
Alignment:
Q  138 agaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  23846755 agaacactattcttaaaagtatctgtagtcaaa-ctttaatataaattg-ggataataatatagtacagagactattatgtatgtagact 23846668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31694 - 31924
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31694 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 31793  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31794 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 31893  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31894 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24933813 - 24933583
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933813 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 24933714  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933713 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 24933614  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24933613 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24933583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12790170 - 12789940
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790170 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 12790071  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12790070 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 12789971  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12789970 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23545717 - 23545947
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545717 tgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 23545816  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545817 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 23545916  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545917 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 23545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25805892 - 25805662
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805892 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 25805793  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805792 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatatatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaa 25805693  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805692 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20940822 - 20941052
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940822 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataatgtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 20940921  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940922 ttaactgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 20941021  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941022 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 31096611 - 31096841
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096611 tgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 31096710  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096711 ttaagtgtgacttaatcatgggattacattatcttaaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 31096810  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096811 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31096841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22941045 - 22941275
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941045 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 22941144  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22941145 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaatgttattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatttgaataaaggataataataaa 22941244  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941245 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7865939 - 7865711
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865939 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatattcatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 7865840  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  7865839 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataa 7865743  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865742 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 7865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12765499 - 12765271
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12765499 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatat 12765400  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  12765399 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataa 12765303  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765302 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12765271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12704383 - 12704155
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12704383 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatat 12704284  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  12704283 attaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataa 12704187  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12704186 agcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 12704155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 26244900 - 26245127
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26244900 tatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttatatttatagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaataatatat 26244999  T
Q  102 taagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26245000 taagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaatgttattcttaaatgtatctgtaatc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaag 26245097  T
Q  202 cgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26245098 cgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26245127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9812242 - 9812014
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9812242 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgctaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatat 9812143  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  9812142 attaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattattaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataa 9812046  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9812045 agcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 9812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5097447 - 5097676
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  5097447 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattatatttatagtaatgttaataaagtccctggaatagatagttcatgtaatgatat 5097546  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  5097547 attaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatttgtagtc-aagttttaatatgaat-taggataataataa 5097644  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5097645 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 5097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 231
Target Start/End: Original strand, 39535271 - 39535489
Alignment:
Q  12 ttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtga 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  39535271 tttttttattaaataatatatgacactctttattatatttgttataatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaagtgtga 39535370  T
Q  111 cttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagac 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  39535371 cttaatcatgagattacattaccttaaagaacgatattcttaaatgtatccgtactcaaa-ctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcaagac 39535468  T
Q  211 tattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39535469 tattatgtatgtagactgatg 39535489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20100747 - 20100520
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||    |||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||   ||    
T  20100747 tgtatcatgacttttattattcaataatat--gacattctttattatatttgttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaat 20100650  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||    
T  20100649 attaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaataacgttattcttaaatgtattcgtagttaaa-ctttaatataaat-tgggataataataa 20100552  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20100551 agcgtcacgactattatgtatgtagactgatg 20100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26130201 - 26129974
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatt--atatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataat 97  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||       
T  26130201 tgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaatacttgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatgga 26130102  T
Q  98 atattaagtgtgacttaatcatgagattacatt-atattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataa 196  Q
    ||||| |||||||||||||| | | ||||| || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||    
T  26130101 atatttagtgtgacttaatcctaatattactttaacatta-agaacgctcttcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataaat-tgggataataa 26130005  T
Q  197 taaagcgtcgagactattatgtatgtagact 227  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26130004 taaagcgcagagaatattatgtatgtagact 26129974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31652294 - 31652208
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 86  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||    |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31652294 tgtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatttgttgtaagattaataaagtccctagaatagatagtt 31652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31267982 - 31267939
Alignment:
Q  188 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31267982 ggataacaataaagcgtggagactattatgtatgtagacggatg 31267939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2676808 - 2677038
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676808 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 2676907  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676908 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 2677007  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677008 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15461292 - 15461522
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461292 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 15461391  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461392 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 15461491  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461492 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15814816 - 15815046
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814816 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 15814915  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15814916 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 15815015  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815016 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15815046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18111550 - 18111320
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111550 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18111451  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111450 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 18111351  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111350 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18111320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20243732 - 20243962
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243732 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 20243831  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243832 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 20243931  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243932 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26531408 - 26531638
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531408 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 26531507  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531508 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 26531607  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531608 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26531638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18162957 - 18163187
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162957 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattacatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18163056  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163057 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 18163156  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18163157 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3369530 - 3369300
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369530 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 3369431  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3369430 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaa 3369331  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3369330 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4676490 - 4676260
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676490 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 4676391  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676390 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 4676291  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4676290 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 4676260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17300466 - 17300236
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17300466 tgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgaaataatata 17300367  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300366 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 17300267  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300266 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 17300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34975346 - 34975576
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34975346 tgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatggttcgtgtaataatata 34975445  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975446 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattcttaaatgtatttgtagtcaaagttttaatatgaataaaggataataataaa 34975545  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975546 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 34975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5870207 - 5870443
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta------ttatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870207 tgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatttttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 5870306  T
Q  95 aatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870307 aatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataat 5870406  T
Q  195 aataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5870407 aataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 5870443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 38816508 - 38816694
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816508 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 38816607  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816608 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 38816694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1941520 - 1941749
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941520 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 1941619  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1941620 attaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattcttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 1941717  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941718 agcgtcgagactattatgtatatagactgatg 1941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9487347 - 9487575
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487347 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagcccttagaatagatagttcgtgtaataatat 9487446  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9487447 attaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagatttaatatgaat-taggataataataa 9487544  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9487545 agcgttgagactattatgtatgttgactgat 9487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11484424 - 11484265
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11484424 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatata 11484325  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11484324 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatc 11484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11420812 - 11421041
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11420812 tgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattttttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtgcaatgatat 11420911  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  11420912 attaagtgtgatttaatcattagattacattaacataaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataa 11421009  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421010 agcttcgagactattatgtatgtagactgatg 11421041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30040980 - 30040751
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30040980 tgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatatttgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtat 30040881  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  30040880 attaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattcttaaatgtatctatagtc-aagcgttaatatgaat-tgggataataataa 30040783  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30040782 agcatcgagactattatgtatatagactgatg 30040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 4545948 - 4546104
Alignment:
Q  72 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4545948 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttagtcatgagaatactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagt-taag 4546046  T
Q  172 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4546047 ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 4546104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 19365389 - 19365544
Alignment:
Q  74 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 173  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19365389 agaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagct 19365487  T
Q  174 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||| |||   || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  19365488 ttaatataaat-tggggtaataataaagtgttgagactattatatacgtagactgatg 19365544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 19362229 - 19362435
Alignment:
Q  18 tattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 116  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    |||  | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||    
T  19362229 tattaaataatatatgacattctttattatatttgttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaagtgtgagttaat 19362328  T
Q  117 catgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattat 216  Q
    |||||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |       ||||||||| || | ||||||||||||    
T  19362329 catgagattacattaacgtaaggaacgcttttcttaaatgtatcagtagtc-aagctttaatataa-------ataataatacagtgccgagactattat 19362420  T
Q  217 gtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  19362421 gtatgtagattgatg 19362435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Original strand, 32636465 - 32636509
Alignment:
Q  187 aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32636465 aggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagactgatg 32636509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 4545908 - 4545950
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttta 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4545908 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23056567 - 23056437
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||| ||||||||   ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| | |     
T  23056567 tgtatcatgacttttattgttaattaaaataaggcattctttgttatattttctataaaattaataaagtccctagaatatatagttcaagtaatgagac 23056468  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacatt 130  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23056467 attaagtgagacttaatcgtaagattacatt 23056437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 169
Target Start/End: Original strand, 9537816 - 9537926
Alignment:
Q  60 ttaataaagtcct-tagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgta 158  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||  || | ||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  9537816 ttaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaatatcaagtgtgactctataaagagtttacattaacataaagaacgctattcttaaatgta 9537915  T
Q  159 tccgtagtcaa 169  Q
    |  ||||||||    
T  9537916 tatgtagtcaa 9537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39422585 - 39422426
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||   | |||||  | ||||||||| |||||||||||||   ||||  ||  |||||||||| ||||    
T  39422585 ttaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaaacgagacttaatcgtgagattacattaacatataagacattattcttaaaagtat 39422486  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 221  Q
      |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  39422485 ttgtagacaaa-ctttaatatgaattaagg-tagtaataaagcgtatagactattatttatg 39422426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 56516093 - 56516255
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||||||||||  ||||| | |||||   ||||||||  ||||||| || ||||    
T  56516093 ttaataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaacatatagaacattattcttgaa-gtat 56516191  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtaga 225  Q
    |  ||||| |||||||| | ||||| || |||| || |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  56516192 ctatagtc-aagctttattgtgaat-aacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtaga 56516255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21034033 - 21034263
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034033 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 21034132  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034133 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 21034232  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034233 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21034263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12299706 - 12299936
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299706 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 12299805  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12299806 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataaa 12299905  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12299906 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15847043 - 15846813
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847043 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaattccttagaatagatagttcgtgtaataatata 15846944  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846943 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattttcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 15846844  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846843 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15846813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 55426816 - 55427046
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426816 tgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 55426915  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55426916 ttaagtatgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 55427015  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55427016 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 55427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14890186 - 14890416
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890186 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 14890285  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890286 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtattcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 14890385  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14890386 gtgttgagactattatgtatgtagactgatg 14890416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20148062 - 20147831
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148062 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 20147963  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20147962 ttaagtgtaacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataa 20147863  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147862 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21398587 - 21398813
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21398587 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaattatata 21398686  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21398687 ttaattgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 21398786  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagact 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  21398787 gtgtcgagactattatgtatgtagact 21398813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25979234 - 25979006
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979234 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 25979135  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25979134 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 25979037  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25979036 agcgtcgagactattatgtatgttgactgat 25979006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11787383 - 11787611
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11787383 tgtatcatgacttttcttattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 11787482  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11787483 attaaatgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 11787580  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11787581 agcgtcgagactattatgtatgttgactgat 11787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 28088013 - 28088211
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28088013 tgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttagataatattaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatata 28088112  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28088113 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatagatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataa 28088211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 15526552 - 15526777
Alignment:
Q  2 gtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   |||    
T  15526552 gtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattatatttgttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaata 15526650  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15526651 ttaagggtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattcttaaatgcatatgtagtc-aagctttaatataaatga--gataataataaa 15526747  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15526748 gcgtagagactattatgtttgtagactgat 15526777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14146817 - 14147046
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  14146817 tgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatatttgttataagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaat 14146916  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattat-attatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| | || ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| || |||   |||||||||||    
T  14146917 attaagtgtgacttaatcatgaaactacattaacatta-acaaagctatttctaaatgtatctgtagtcaa-gctttaacataaattg-ggataataata 14147013  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14147014 aagcacagagactattatatatgtagactgatg 14147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30174172 - 30174402
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174172 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 30174271  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174272 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 30174371  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174372 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30174402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24250539 - 24250309
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250539 tgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 24250440  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250439 ttaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 24250340  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250339 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24250309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24229722 - 24229492
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24229722 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttaaataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatata 24229623  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229622 ttaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacattattcttaaatgtgtccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 24229523  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229522 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24229492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19616231 - 19616460
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  19616231 tgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactcttttataatatttgttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatgata 19616330  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||     
T  19616331 tattaagtgtgacttaatcataagattacattaacataaagaacactattcttaaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataat- 19616427  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19616428 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19616460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24764063 - 24763834
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  24764063 tgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatatttgttataatgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaatagtat 24763964  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||   || | |||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24763963 attaagcgtgacttaatcatgagattatattaacataaaaaacgatattcttaaatgcatctgtactc-aagctttaatatgaattga-gataataataa 24763866  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24763865 agcatcgagactattatttatgtagactgatg 24763834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15342509 - 15342280
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatg-ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||     ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||   ||    
T  15342509 tgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattataattcttgtatgattaataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaat 15342410  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||    
T  15342409 attaagtgtgatttaatcatgagattacattaccataaagaacactattctttaatgtatatgtagtc-aagatttaatataaat-tgggataataataa 15342312  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15342311 agcgtggagactattatgtatgtagattgatg 15342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 29800224 - 29800317
Alignment:
Q  2 gtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta-gataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29800224 gtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattataattattgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 29800317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 21626480 - 21626647
Alignment:
Q  4 atcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatatt 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||   ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||   | |||    
T  21626480 atcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatatttgttataagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacatt 21626579  T
Q  103 aagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaa 170  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||   || |||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  21626580 aagtaagacttaatcatgacattacattaacataaagaacaatattcttaaaagtatccgaagtcaaa 21626647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28719302 - 28719170
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactcttt-attatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| | || ||||| |||||| |||   |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||   |    
T  28719302 tgtatcatgacttttattattaaacaaaataagacattcttttattatacttattgtaaaattaataaagtccttagaatatatagttcatgtgatggaa 28719203  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28719202 cattaagtgtgacttaatcatgagattacatta 28719170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18852286 - 18852167
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 101  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||    |||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |  |    
T  18852286 tatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattatattttttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgt 18852187  T
Q  102 taagtgtgacttaatcatga 121  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18852186 taagtgtgacttaatcatga 18852167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28719100 - 28719053
Alignment:
Q  189 gataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgtccat 236  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28719100 gataataataaaacgtagagactattatgtatgtagactgatgaccat 28719053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 29800449 - 29800492
Alignment:
Q  188 ggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29800449 ggataataataaagcggaaagactattatgtatgtagactgatg 29800492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9455911 - 9456141
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9455911 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 9456010  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456011 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 9456110  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456111 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 9456141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20391746 - 20391516
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391746 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 20391647  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391646 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 20391547  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391546 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42817496 - 42817266
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817496 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 42817397  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817396 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 42817297  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817296 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 42817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20780152 - 20779922
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780152 tgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 20780053  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780052 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 20779953  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779952 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20779922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47667981 - 47667751
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47667981 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatata 47667882  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667881 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 47667782  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47667781 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22670764 - 22670534
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670764 tgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 22670665  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670664 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 22670565  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670564 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19706946 - 19706716
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19706946 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttaaacaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatata 19706847  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706846 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 19706747  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706746 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19706716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28135230 - 28135000
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135230 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 28135131  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135130 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatctttaagaacgctattattaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 28135031  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28135030 gcgtcgagacaattatgtatgtagactgatg 28135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43802872 - 43802642
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43802872 tgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaattatata 43802773  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802772 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 43802673  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802672 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 43802642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22612282 - 22612517
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaa-taatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22612282 tgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagaaagttcgtgtaataatat 22612381  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatc----cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612382 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatatatatattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataata 22612481  T
Q  196 ataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22612482 ataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 35930377 - 35930607
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35930377 tgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatata 35930476  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930477 ttaagtgcgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaaactttaatatgaataaaggataataataaa 35930576  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35930577 gcgtcgagactattatgtatatagactgatg 35930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22234981 - 22234827
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234981 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 22234882  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22234881 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaat 22234827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 633814 - 633959
Alignment:
Q  84 gttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  633814 gttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattaaattatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaa 633912  T
Q  184 taaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  633913 t-aaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 633959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 8727463 - 8727692
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttag-ataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 101  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||    
T  8727463 tatcataacatttactattaaataatatatggcactctttatcatacttgttataatgttaataaagtccctagaataaatt-ttcgtgtaattttatat 8727561  T
Q  102 taagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||   || |||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||    
T  8727562 taagtgtgactaaatcataagattactttaacataaagaacgttattctgaaatctatctgtagtcaaa-ctttaatatgaattgagataataataataa 8727660  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8727661 agcgtcgagactattatctatgtagactgatg 8727692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26923846 - 26923675
Alignment:
Q  10 acttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26923846 acttttattattaaataatatatgacactctttattatatttgtagtgatgttaataaagtttctagaatagatagttcgtgtaattgtatattgagtgt 26923747  T
Q  109 gacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatg 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26923746 gacttaatcattagattacattaacataaataatgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatg 26923675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21881882 - 21881653
Alignment:
Q  2 gtatcatgacttttattattgaataatatat--ggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||   |    
T  21881882 gtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatatttgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaa 21881784  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||    
T  21881783 tattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaattcttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgata 21881686  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  21881685 aagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 21881653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 29096580 - 29096739
Alignment:
Q  60 ttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtat 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||    | |||||  |||||||||| ||||    
T  29096580 ttaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcgtaagattacattaacaaaaagaactttattcttaaaagtat 29096679  T
Q  160 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgt 222  Q
      |||||| ||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29096680 atgtagtc-aagcttt-atatatatcga-gataataataaagcgtagagactattatgtatgt 29096739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 230
Target Start/End: Original strand, 16435837 - 16435877
Alignment:
Q  190 ataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16435837 ataataataaagcgtagagactaatatgtatgtagactgat 16435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 16435649 - 16435728
Alignment:
Q  5 tcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata-tttagataatgttaataaagtccttagaatagata 83  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16435649 tcatgacttttattattaaataaaatgagacattctttattatattttatataagattaataaagttcttagaatagata 16435728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 119525 - 119755
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119525 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 119624  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119625 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 119724  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  119725 gcgtcgagactattatgtacgtagactgatg 119755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15330 - 15100
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15330 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 15231  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 15131  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15130 gcatcgagactattatgtatgtagactgatg 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8100 - 8330
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttatataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 8199  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaa 8299  T
Q  201 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8300 gcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 225 - 1
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  225 tgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 126  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaa----atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataa 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125 ttaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataa 26  T
Q  197 taaagcgtcgagactattatgtatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25 taaagcgtcgagactattatgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  24 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1 ataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaataatgaga 100  T
Q  124 ttacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgta 223  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  101 ttacattatcttatagaacgctgttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataatggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtc 200  T
Q  224 gactgatg 231  Q
    ||||||||    
T  201 gactgatg 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19341 - 19160
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19341 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 19242  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19241 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 19160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40201 - 40015
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40201 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 40102  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 40015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 67880 - 67651
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67880 tgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 67781  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  67780 attaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattcttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataa 67683  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67682 agcgtcgagactattatgtatatagactgatg 67651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45451 - 45226
Alignment:
Q  4 atcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatatt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45451 atcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttacaatagatagttcttgtaataatatatt 45352  T
Q  103 aagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  45351 aagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatattaat-taggataataataaagc 45254  T
Q  203 gtcgagactattatgtatgtagactgat 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45253 gtcgagactattatgtatgttgactgat 45226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8895 - 9135
Alignment:
Q  1 tgtatcatg-acttttattatt-gaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagt-ccttagaatagatagttcgtgtaataat 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8895 tgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtaccttagaatagatagttcgtgtaataat 8994  T
Q  98 atattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatag-aacgctattctt-aaatgtatccgtagtc-aaagc-tttaatatgaat-aaaggata 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8995 atattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagtaacgctattcttaaaatgtatccgtagtcaaaagcttttaatatgaataaaaggata 9094  T
Q  193 at-aataaagcgt-cgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9095 ataaataaagcgtacgagactattatgtatgtagactgatg 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12035 - 11807
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12035 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 11936  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||    
T  11935 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatctgtagtc-aatctttaatataatt--aggataataataa 11839  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11838 agcgtcgaaactattatgtatgtagattgatg 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18921 - 18790
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18921 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 18822  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattat 18790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1121 - 961
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  1121 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttataatagatagtttttttaataatata 1022  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatcc 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1021 ttaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcttaaagaacgttattcttaaatgtatcc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 76355 - 76486
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76355 tgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 76454  T
Q  101 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76455 ttaagtgtgacttaatcatgagattacattat 76486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13456 - 13226
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgt-aataata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  13456 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatatttgtagtaatgctaataaagtccctagaatagatagttcatgtaaatgata 13357  T
Q  99 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   || | |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   |||||||||||    
T  13356 tattaagtgtgatttaatcatgagattacattaacataaaaaacagtattcttaaatgtatccatagtc-aagctttaatattaat-tgggataataata 13259  T
Q  199 aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13258 aagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatg 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40494 - 40265
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||  |||    
T  40494 tgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatattttttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtat 40395  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  40394 attaagtgtgacttaatcatgagaatacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaattga-gataataataa 40297  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40296 agcgccgagactattatgtatgtagactgatg 40265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26567
Alignment:
Q  12 ttttattattgaataatatatggcactctttattatatt--tagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattatattcgttg-taatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatcgtatattaagtgtg 26511  T
Q  110 acttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtag 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26512 acttaatcatgagattacattataataaagaacgttattcttaaatgtatcagtag 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 9564 - 9672
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9564 tgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatata 9663  T
Q  101 ttaagtgtg 109  Q
    |||||||||    
T  9664 ttaagtgtg 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 53571 - 53790
Alignment:
Q  3 tatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  53571 tatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattcgattcatagtaatgttaataaagtccctagagtaaatagttcatgtaatgatatat 53670  T
Q  102 taagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaag 201  Q
    ||||||||        ||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53671 taagtgtg--------atgagattacattaacataaagaacactattcttaaatgtatccgtattc-aagctttaatatgaat-taggataataataaag 53760  T
Q  202 cgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  53761 tgtcaagactattatgtatgtagattgatg 53790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34012 - 33927
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012 tgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatatttagataatgttaataaagtccttagaatagatagtt 33927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8756
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt-agataatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatat 99  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||   |     
T  8528 tgtatcgtgatttttattattaaataaaatgaggtattctttatgaaatttgatataatattaataaagtccttagaatatatagttcaagtaatgg-ac 8626  T
Q  100 attaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| |||  | |||| ||||||    
T  8627 attatgtgagacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattcttaaaagtatttgtagtc-aagttttaatataaattga-gatagtaataa 8724  T
Q  200 agcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8725 agcgtagagactaatatgtatgtagattgatg 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13861
Alignment:
Q  1 tgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtcctt 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13788 tgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtcctt 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 83377 - 83292
Alignment:
Q  144 ctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||  || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  83377 ctattcttaaaagtatccgtagtcgaaa-tttaatataaattgag-ataataataaagtgtatagactattatgtatgtagactgatg 83292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University