View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1256_low_16 (Length: 318)

Name: NF1256_low_16
Description: NF1256
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1256_low_16
NF1256_low_16
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (100-265)||(15227762-15227927)
chr1 (98-265)||(5694342-5694509)
chr1 (97-265)||(29657791-29657959)
chr1 (98-262)||(38162871-38163035)
chr1 (97-257)||(12072068-12072228)
chr1 (105-265)||(51065746-51065906)
chr1 (105-256)||(3784720-3784871)
chr1 (97-256)||(24178470-24178629)
chr1 (107-270)||(30294374-30294537)
chr1 (105-266)||(17333281-17333440)
chr1 (105-266)||(47010021-47010182)
chr1 (98-265)||(18043183-18043350)
chr1 (109-264)||(19031814-19031969)
chr1 (105-263)||(9266728-9266886)
chr1 (97-271)||(42769982-42770156)
chr1 (98-237)||(48071503-48071642)
chr1 (97-232)||(3097679-3097814)
chr1 (109-263)||(47532671-47532824)
chr1 (97-263)||(48383111-48383277)
chr1 (97-266)||(38701934-38702099)
chr1 (110-266)||(45431311-45431467)
chr1 (108-271)||(14350271-14350432)
chr1 (97-262)||(13961232-13961396)
chr1 (101-238)||(51368810-51368947)
chr1 (105-240)||(35985644-35985779)
chr1 (105-232)||(36446356-36446482)
chr1 (105-232)||(43286750-43286877)
chr1 (97-264)||(45449243-45449410)
chr1 (110-265)||(50128170-50128325)
chr1 (110-232)||(6770370-6770492)
chr1 (107-265)||(8472912-8473070)
chr1 (108-263)||(41730336-41730494)
chr1 (97-263)||(30657628-30657788)
chr1 (97-232)||(29683215-29683351)
chr1 (105-225)||(38335197-38335317)
chr1 (98-204)||(29210434-29210540)
chr1 (109-237)||(12306950-12307077)
chr1 (107-263)||(23473464-23473620)
chr1 (107-232)||(52749632-52749757)
chr1 (105-263)||(30217788-30217946)
chr1 (102-266)||(15282516-15282675)
chr1 (121-231)||(37315300-37315409)
chr1 (128-257)||(52431632-52431761)
chr1 (97-263)||(28725905-28726072)
chr1 (105-267)||(3838773-3838935)
chr1 (172-240)||(19010710-19010778)
chr1 (105-265)||(26228221-26228366)
chr1 (123-225)||(37503260-37503361)
chr1 (110-200)||(39497340-39497430)
chr1 (97-263)||(38595752-38595919)
chr1 (104-206)||(14881036-14881125)
chr1 (104-186)||(35700728-35700809)
chr1 (99-179)||(39912363-39912443)
chr1 (97-268)||(52702141-52702312)
chr1 (97-151)||(19011108-19011162)
chr1 (106-192)||(28481873-28481954)
chr1 (98-257)||(30664173-30664333)
chr1 (212-264)||(29210529-29210581)
chr1 (105-257)||(39081829-39081980)
chr1 (108-257)||(33644341-33644490)
chr1 (109-157)||(10976008-10976056)
chr1 (105-237)||(49867457-49867590)
chr1 (191-264)||(10679629-10679702)
chr1 (121-210)||(16590269-16590356)
chr1 (202-263)||(39497728-39497789)
chr1 (212-264)||(21112680-21112732)
chr1 (212-264)||(21117422-21117474)
chr1 (183-266)||(11796968-11797050)
chr1 (139-169)||(19011061-19011091)
chr1 (191-263)||(23822523-23822593)
chr1 (226-267)||(48282855-48282896)
chr1 (206-273)||(28481973-28482038)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (97-263)||(46352654-46352820)
chr3 (100-273)||(48725294-48725467)
chr3 (109-256)||(858621-858768)
chr3 (97-256)||(49893351-49893510)
chr3 (97-263)||(272240-272406)
chr3 (97-266)||(52520701-52520870)
chr3 (98-265)||(4168204-4168371)
chr3 (105-263)||(10617284-10617442)
chr3 (97-265)||(39074439-39074606)
chr3 (98-267)||(40362576-40362745)
chr3 (98-265)||(43786892-43787059)
chr3 (98-257)||(41304026-41304183)
chr3 (97-265)||(18014692-18014860)
chr3 (105-271)||(43269731-43269897)
chr3 (107-251)||(2505379-2505523)
chr3 (105-231)||(41553972-41554098)
chr3 (134-263)||(6842676-6842805)
chr3 (97-254)||(53489833-53489990)
chr3 (105-264)||(11308210-11308368)
chr3 (98-265)||(42964247-42964414)
chr3 (105-263)||(7468439-7468595)
chr3 (109-257)||(22248918-22249066)
chr3 (101-264)||(2938039-2938202)
chr3 (97-262)||(49529269-49529435)
chr3 (105-258)||(42548123-42548275)
chr3 (105-256)||(28139337-28139488)
chr3 (100-230)||(13159920-13160050)
chr3 (98-232)||(20924013-20924147)
chr3 (129-267)||(33140937-33141075)
chr3 (100-254)||(24488389-24488543)
chr3 (105-265)||(50395561-50395720)
chr3 (109-242)||(38852246-38852382)
chr3 (109-230)||(29241669-29241790)
chr3 (105-254)||(50359195-50359344)
chr3 (105-225)||(2119459-2119577)
chr3 (98-231)||(52246603-52246737)
chr3 (109-257)||(41993626-41993773)
chr3 (102-232)||(50298976-50299106)
chr3 (125-204)||(2362880-2362958)
chr3 (115-232)||(31514829-31514945)
chr3 (152-224)||(52552549-52552620)
chr3 (100-158)||(2391630-2391688)
chr3 (100-158)||(2393391-2393449)
chr3 (121-217)||(21010041-21010133)
chr3 (101-232)||(25743833-25743964)
chr3 (105-162)||(52718195-52718252)
chr3 (109-264)||(51665714-51665870)
chr3 (97-156)||(23925300-23925359)
chr3 (222-264)||(53163911-53163953)
chr3 (139-176)||(6842605-6842642)
chr3 (108-168)||(16990728-16990789)
chr3 (134-169)||(6842636-6842671)
chr3 (133-263)||(36953115-36953243)
chr3 (110-232)||(53054834-53054958)
chr3 (107-137)||(2362831-2362861)
chr3 (213-265)||(2362948-2363000)
chr3 (226-266)||(23516590-23516630)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (105-264)||(13661836-13661995)
chr5 (105-264)||(34650832-34650991)
chr5 (97-265)||(11957965-11958133)
chr5 (97-263)||(10054353-10054518)
chr5 (105-267)||(35132550-35132711)
chr5 (97-266)||(8787359-8787528)
chr5 (105-265)||(35504239-35504398)
chr5 (108-263)||(21547394-21547549)
chr5 (98-257)||(6283583-6283742)
chr5 (99-273)||(9721598-9721771)
chr5 (110-266)||(40564401-40564557)
chr5 (117-240)||(12506336-12506459)
chr5 (111-240)||(11846106-11846235)
chr5 (98-204)||(19647717-19647823)
chr5 (97-204)||(10069989-10070095)
chr5 (100-209)||(13470174-13470283)
chr5 (98-265)||(10955972-10956139)
chr5 (105-231)||(20175255-20175381)
chr5 (110-263)||(40057340-40057493)
chr5 (105-225)||(39066973-39067094)
chr5 (104-232)||(31909658-31909781)
chr5 (139-266)||(4268624-4268750)
chr5 (97-189)||(4837277-4837369)
chr5 (109-225)||(19436876-19436990)
chr5 (105-226)||(39069409-39069527)
chr5 (109-185)||(2619635-2619711)
chr5 (101-265)||(1383271-1383437)
chr5 (98-263)||(31467740-31467906)
chr5 (108-257)||(14214055-14214205)
chr5 (105-174)||(6284823-6284892)
chr5 (205-257)||(10955957-10956009)
chr5 (212-256)||(19647684-19647728)
chr5 (104-257)||(30889436-30889590)
chr5 (226-266)||(5091899-5091939)
chr5 (121-168)||(5302374-5302422)
chr5 (124-208)||(22973732-22973815)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (100-265)||(20552954-20553119)
chr2 (97-265)||(31438666-31438834)
chr2 (97-263)||(30486230-30486396)
chr2 (97-265)||(27856394-27856562)
chr2 (97-264)||(22068319-22068485)
chr2 (97-263)||(32360869-32361035)
chr2 (98-263)||(31390033-31390198)
chr2 (97-257)||(561524-561684)
chr2 (105-265)||(4381823-4381983)
chr2 (109-271)||(34442525-34442686)
chr2 (97-263)||(44587922-44588088)
chr2 (103-264)||(26387063-26387224)
chr2 (105-265)||(3668111-3668271)
chr2 (105-265)||(22567630-22567790)
chr2 (98-270)||(22887771-22887943)
chr2 (109-273)||(8969397-8969561)
chr2 (100-242)||(6580212-6580354)
chr2 (101-239)||(13574053-13574191)
chr2 (108-264)||(35851749-35851906)
chr2 (100-255)||(38590883-38591037)
chr2 (105-262)||(2898099-2898256)
chr2 (105-257)||(43637192-43637343)
chr2 (97-239)||(1859182-1859324)
chr2 (100-266)||(28600990-28601155)
chr2 (108-242)||(32860133-32860266)
chr2 (109-266)||(5093537-5093693)
chr2 (108-262)||(27584769-27584922)
chr2 (108-230)||(5881248-5881374)
chr2 (109-256)||(25782840-25782984)
chr2 (99-267)||(4022475-4022642)
chr2 (105-226)||(11021259-11021380)
chr2 (105-204)||(26891722-26891821)
chr2 (100-210)||(38296200-38296310)
chr2 (109-230)||(25772142-25772264)
chr2 (98-268)||(34123022-34123189)
chr2 (98-263)||(39531845-39532008)
chr2 (121-210)||(15079012-15079100)
chr2 (107-232)||(29102314-29102439)
chr2 (121-225)||(10820528-10820630)
chr2 (128-232)||(15146683-15146786)
chr2 (97-263)||(31782565-31782732)
chr2 (121-274)||(29998979-29999131)
chr2 (121-263)||(20431482-20431624)
chr2 (127-263)||(26270034-26270170)
chr2 (146-257)||(44331841-44331952)
chr2 (191-263)||(45262024-45262096)
chr2 (97-210)||(44854393-44854506)
chr2 (97-263)||(28011951-28012121)
chr2 (121-168)||(30834456-30834504)
chr2 (108-174)||(30217652-30217719)
chr2 (108-139)||(43993185-43993216)
chr2 (123-263)||(20252787-20252928)
chr2 (101-155)||(44854333-44854387)
chr2 (152-200)||(43993204-43993252)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (100-263)||(34228705-34228868)
chr8 (98-264)||(27988499-27988664)
chr8 (98-264)||(28045801-28045966)
chr8 (98-265)||(4537742-4537909)
chr8 (105-256)||(2805267-2805418)
chr8 (98-264)||(168487-168653)
chr8 (105-250)||(37373233-37373378)
chr8 (105-270)||(42034974-42035139)
chr8 (109-257)||(16890486-16890634)
chr8 (108-263)||(16888544-16888699)
chr8 (97-263)||(16394061-16394227)
chr8 (109-271)||(36730476-36730637)
chr8 (97-266)||(29444137-29444306)
chr8 (97-262)||(30675574-30675738)
chr8 (105-263)||(11112667-11112825)
chr8 (105-242)||(33357150-33357287)
chr8 (105-264)||(9063051-9063210)
chr8 (105-256)||(21595874-21596025)
chr8 (110-255)||(7304526-7304671)
chr8 (102-263)||(9537824-9537985)
chr8 (97-257)||(9253908-9254067)
chr8 (105-263)||(20831553-20831711)
chr8 (98-274)||(32113929-32114106)
chr8 (97-265)||(13643032-13643199)
chr8 (97-265)||(13743457-13743624)
chr8 (97-266)||(4648214-4648383)
chr8 (101-242)||(12203878-12204019)
chr8 (101-242)||(12448306-12448447)
chr8 (99-263)||(43119239-43119402)
chr8 (105-239)||(16785114-16785248)
chr8 (108-257)||(28626799-28626947)
chr8 (106-257)||(42433550-42433700)
chr8 (116-266)||(3930230-3930380)
chr8 (105-263)||(40831305-40831463)
chr8 (107-220)||(10870382-10870495)
chr8 (140-257)||(39406905-39407020)
chr8 (110-263)||(29235268-29235421)
chr8 (109-182)||(9278244-9278317)
chr8 (111-204)||(34192809-34192902)
chr8 (109-199)||(17467635-17467725)
chr8 (149-230)||(24843312-24843393)
chr8 (108-182)||(10618049-10618123)
chr8 (128-216)||(22451835-22451922)
chr8 (105-217)||(22956734-22956845)
chr8 (123-265)||(2490155-2490297)
chr8 (105-154)||(12652658-12652707)
chr8 (97-249)||(39751485-39751638)
chr8 (105-273)||(40267949-40268118)
chr8 (204-266)||(10618125-10618187)
chr8 (131-209)||(30933376-30933453)
chr8 (105-273)||(18955721-18955892)
chr8 (123-217)||(36057897-36057992)
chr8 (105-144)||(36923782-36923821)
chr8 (97-265)||(43714186-43714354)
chr8 (104-254)||(39206212-39206363)
chr8 (171-238)||(14191035-14191102)
chr8 (221-263)||(9934557-9934599)
chr8 (109-265)||(42655275-42655431)
chr8 (224-274)||(43723722-43723772)
chr8 (97-164)||(33899108-33899177)
chr8 (121-208)||(4811602-4811689)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (98-265)||(23402159-23402326)
chr6 (97-274)||(392116-392293)
chr6 (97-265)||(32929506-32929674)
chr6 (99-265)||(26467122-26467288)
chr6 (97-265)||(4215715-4215883)
chr6 (97-257)||(2350672-2350832)
chr6 (97-265)||(27433512-27433680)
chr6 (109-276)||(12145104-12145271)
chr6 (105-263)||(3515794-3515952)
chr6 (107-257)||(32985199-32985349)
chr6 (105-263)||(7851159-7851317)
chr6 (105-263)||(18276612-18276773)
chr6 (108-240)||(29451138-29451270)
chr6 (98-232)||(1391209-1391343)
chr6 (102-264)||(2580977-2581139)
chr6 (105-263)||(35043918-35044074)
chr6 (98-264)||(12525740-12525906)
chr6 (105-270)||(1840240-1840405)
chr6 (109-265)||(13416958-13417116)
chr6 (105-255)||(11115106-11115253)
chr6 (107-265)||(25165411-25165569)
chr6 (105-250)||(5323428-5323573)
chr6 (108-265)||(28225252-28225408)
chr6 (119-235)||(961051-961167)
chr6 (105-257)||(3026015-3026167)
chr6 (105-204)||(20897976-20898075)
chr6 (105-204)||(34477609-34477708)
chr6 (109-265)||(29978264-29978419)
chr6 (108-214)||(21878396-21878502)
chr6 (109-263)||(34851849-34852003)
chr6 (97-238)||(23629601-23629742)
chr6 (118-263)||(31280362-31280501)
chr6 (109-256)||(9661018-9661165)
chr6 (108-194)||(34396596-34396682)
chr6 (99-176)||(13529477-13529554)
chr6 (108-264)||(34706751-34706908)
chr6 (212-264)||(34477568-34477620)
chr6 (108-261)||(1127846-1128000)
chr6 (187-242)||(22417303-22417358)
chr6 (191-270)||(34712118-34712197)
chr6 (146-257)||(22021733-22021844)
chr6 (121-168)||(10431780-10431827)
chr6 (180-230)||(28564338-28564388)
chr6 (212-256)||(20898064-20898107)
chr6 (201-257)||(34494276-34494332)
chr6 (226-271)||(1603989-1604034)
chr6 (110-186)||(11633951-11634028)
chr6 (99-148)||(14559944-14559993)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (98-264)||(33108672-33108837)
chr4 (97-274)||(32217065-32217241)
chr4 (97-265)||(18067877-18068045)
chr4 (97-265)||(29591209-29591377)
chr4 (97-263)||(54897328-54897494)
chr4 (97-266)||(7768958-7769127)
chr4 (98-263)||(43944528-43944692)
chr4 (97-256)||(789537-789696)
chr4 (97-265)||(16536068-16536236)
chr4 (99-265)||(4220217-4220382)
chr4 (97-263)||(4268822-4268988)
chr4 (101-231)||(19503137-19503267)
chr4 (105-254)||(47231881-47232030)
chr4 (97-265)||(50619106-50619273)
chr4 (104-263)||(12356271-12356430)
chr4 (107-265)||(36395129-36395287)
chr4 (100-265)||(4089165-4089330)
chr4 (97-271)||(43202376-43202549)
chr4 (105-262)||(28755648-28755803)
chr4 (98-273)||(3783488-3783666)
chr4 (97-265)||(32202479-32202646)
chr4 (105-233)||(52533815-52533943)
chr4 (100-263)||(6164117-6164279)
chr4 (97-263)||(15186263-15186423)
chr4 (107-230)||(39843937-39844060)
chr4 (98-265)||(55882705-55882870)
chr4 (101-265)||(37987959-37988123)
chr4 (100-263)||(54945780-54945941)
chr4 (105-232)||(42898775-42898904)
chr4 (109-254)||(53655887-53656032)
chr4 (100-257)||(54655883-54656039)
chr4 (99-230)||(24679676-24679806)
chr4 (97-263)||(5091612-5091776)
chr4 (105-243)||(31680483-31680621)
chr4 (111-232)||(46148973-46149094)
chr4 (96-263)||(30154163-30154329)
chr4 (127-230)||(30387167-30387270)
chr4 (108-204)||(54054579-54054675)
chr4 (142-264)||(16820917-16821039)
chr4 (141-263)||(39877247-39877371)
chr4 (103-204)||(42815135-42815237)
chr4 (105-241)||(50603255-50603392)
chr4 (129-238)||(31517217-31517327)
chr4 (105-219)||(49915187-49915301)
chr4 (105-204)||(46688264-46688368)
chr4 (128-239)||(41265510-41265620)
chr4 (121-232)||(53268764-53268874)
chr4 (105-257)||(1432554-1432700)
chr4 (108-231)||(52697083-52697205)
chr4 (108-264)||(28119905-28120062)
chr4 (156-267)||(53003952-53004063)
chr4 (191-257)||(292229-292295)
chr4 (152-220)||(8133782-8133850)
chr4 (105-271)||(16572479-16572646)
chr4 (97-265)||(34151140-34151309)
chr4 (99-169)||(50167613-50167681)
chr4 (107-208)||(17344714-17344814)
chr4 (191-254)||(28120058-28120121)
chr4 (121-254)||(6493708-6493841)
chr4 (121-265)||(8749794-8749941)
chr4 (191-264)||(37402758-37402830)
chr4 (212-265)||(54054664-54054717)
chr4 (153-263)||(5518886-5518993)
chr4 (121-239)||(20654719-20654838)
chr4 (226-274)||(789679-789727)
chr4 (194-222)||(39877370-39877398)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (97-263)||(29993487-29993653)
chr7 (98-264)||(34606282-34606448)
chr7 (97-263)||(24438497-24438663)
chr7 (113-263)||(24798403-24798553)
chr7 (97-243)||(47839512-47839658)
chr7 (97-265)||(34333304-34333471)
chr7 (96-271)||(30810674-30810849)
chr7 (97-257)||(18485981-18486141)
chr7 (105-263)||(5239313-5239471)
chr7 (97-271)||(12218429-12218602)
chr7 (100-257)||(1737003-1737159)
chr7 (102-257)||(13064882-13065038)
chr7 (108-263)||(4628597-4628752)
chr7 (105-262)||(5729374-5729531)
chr7 (106-242)||(45045799-45045935)
chr7 (98-262)||(11686324-11686489)
chr7 (105-232)||(43594067-43594194)
chr7 (108-255)||(47083086-47083232)
chr7 (105-231)||(8754617-8754743)
chr7 (108-264)||(42044293-42044448)
chr7 (109-264)||(23363166-23363321)
chr7 (105-232)||(28587937-28588064)
chr7 (100-257)||(47657003-47657157)
chr7 (105-263)||(525076-525233)
chr7 (105-239)||(7689224-7689358)
chr7 (107-269)||(46716668-46716830)
chr7 (109-265)||(18117175-18117330)
chr7 (108-257)||(28262062-28262206)
chr7 (97-204)||(34546373-34546480)
chr7 (109-238)||(33636484-33636613)
chr7 (103-262)||(23357711-23357867)
chr7 (105-201)||(27456175-27456271)
chr7 (98-201)||(37631604-37631707)
chr7 (127-265)||(37674104-37674240)
chr7 (107-231)||(29835735-29835860)
chr7 (101-264)||(36437401-36437562)
chr7 (108-267)||(38128322-38128482)
chr7 (108-210)||(18469993-18470094)
chr7 (122-263)||(22739868-22740010)
chr7 (121-242)||(18220692-18220812)
chr7 (97-263)||(6097356-6097523)
chr7 (108-231)||(4100557-4100679)
chr7 (101-232)||(3021915-3022038)
chr7 (105-208)||(4087651-4087752)
chr7 (152-211)||(47118041-47118100)
chr7 (139-219)||(13556474-13556553)
chr7 (127-217)||(20116940-20117029)
chr7 (97-266)||(30923985-30924157)
chr7 (97-264)||(34556891-34557057)
chr7 (98-265)||(19434514-19434681)
chr7 (97-239)||(32805558-32805701)
chr7 (106-169)||(18220625-18220688)
chr7 (108-174)||(18220527-18220593)
chr7 (107-264)||(6819946-6820100)
chr7 (288-318)||(32026717-32026747)
chr7 (288-318)||(32038854-32038884)
chr7 (105-164)||(34435752-34435813)
chr7 (98-146)||(22973619-22973667)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (100-265)||(6108-6273)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (97-265)||(53683-53851)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (97-271)||(116224-116398)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (97-263)||(14916-15082)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (105-264)||(22989-23148)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (97-263)||(68290-68456)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (110-263)||(40952-41105)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (109-265)||(857-1013)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (139-263)||(10772-10896)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (97-232)||(95616-95750)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (100-230)||(146938-147068)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (108-265)||(25750-25906)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (108-231)||(709-832)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (105-204)||(7956-8055)
scaffold0674 (212-264)||(7915-7967)
[»] scaffold0549 (2 HSPs)
scaffold0549 (105-204)||(7316-7415)
scaffold0549 (212-264)||(7404-7456)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (105-230)||(320-445)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (108-263)||(19585-19740)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (105-262)||(53358-53504)
scaffold0045 (98-248)||(50569-50719)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (109-266)||(69258-69414)
scaffold0050 (109-231)||(33714-33835)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (105-232)||(17502-17628)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (105-204)||(11029-11128)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (142-273)||(233918-234049)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (104-210)||(74526-74633)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (109-266)||(508984-509144)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (121-168)||(1415-1462)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (108-174)||(5070-5136)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (103-168)||(66424-66491)
[»] scaffold1372 (1 HSPs)
scaffold1372 (226-266)||(1237-1276)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Original strand, 15227762 - 15227927
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227762 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 15227861  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227862 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 15227927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 5694342 - 5694509
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5694342 ccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 5694441  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  5694442 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcaggaccctt 5694509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 29657791 - 29657959
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29657791 cccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 29657890  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29657891 ttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcaggaccctt 29657959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 262
Target Start/End: Original strand, 38162871 - 38163035
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38162871 ccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttt 38162970  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38162971 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacc 38163035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12072228 - 12072068
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12072228 cccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctt 12072129  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12072128 ttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 12072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51065906 - 51065746
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51065906 actggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 51065807  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  51065806 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccctt 51065746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3784871 - 3784720
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3784871 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacaattttcttttatggta 3784772  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3784771 ataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagc 3784720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24178629 - 24178470
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24178629 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaagcagtttcctt 24178530  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24178529 ttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagc 24178470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30294537 - 30294374
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30294537 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttctttttatggtaat 30294438  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  30294437 aattcccttttatggtatgcttaacctgtgctccggggacaccggttagcaggacccattattt 30294374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17333440 - 17333281
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17333440 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaacagtttccttttatgata 17333341  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17333340 atacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcaggacccttt 17333281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Original strand, 47010021 - 47010182
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47010021 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaacagtttccttttatggta 47010120  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  47010121 ataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccaggggcaccggttagcaggacccttt 47010182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 18043183 - 18043350
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18043183 ccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttt 18043282  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18043283 tatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 18043350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19031969 - 19031814
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19031969 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 19031870  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19031869 tttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcaggaccct 19031814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9266886 - 9266728
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9266886 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 9266787  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||    
T  9266786 ataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggttagcaggaccc 9266728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42770156 - 42769982
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  42770156 cccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcctt 42770057  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  42770056 ttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagaacccttaattta 42769982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 48071503 - 48071642
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48071503 ccggggtactggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttt 48071602  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgc 237  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48071603 tatggtaataattatcttttatagtatgcttaaccggtgc 48071642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 3097679 - 3097814
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3097679 cccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctt 3097778  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3097779 ttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacc 3097814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47532824 - 47532671
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  47532824 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat-gataataaagtcaaaaataatttccttttataataataa 47532726  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47532725 ttcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgaagacaccggttagcaagaccc 47532671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48383277 - 48383111
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48383277 cccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 48383178  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||| |||||||| |||||    
T  48383177 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcctcaggggcactggttagcaggaccc 48383111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38702099 - 38701934
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  38702099 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttctt 38702000  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38701999 ttatggtaataattc----ttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggacccttt 38701934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Original strand, 45431311 - 45431467
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45431311 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataat 45431410  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    || |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||| || ||||||||    
T  45431411 tctcttttatgatatacttaaccagtgccccagagactccggttatcaggacccttt 45431467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14350432 - 14350271
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14350432 ggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacaatttccttttatggtaata 14350333  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14350332 attccc-ttaatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagcaggacccttttttta 14350271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Original strand, 13961232 - 13961396
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13961232 cccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcatt 13961330  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||| ||||    
T  13961331 ttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtgctccaagggcaccggttagcaggacc 13961396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51368947 - 51368810
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51368947 gggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataataatgtcaaaaatagtttccttttat 51368848  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51368847 agtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgcc 51368810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35985779 - 35985644
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35985779 actgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtgaaaaacagtttccttttatggta 35985680  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcccc 240  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  35985679 ataattcccatttatagtatacttaaccagtgcccc 35985644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36446482 - 36446356
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36446482 actggttaagaatat-aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatagta 36446384  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36446383 ataattcccttttatggtatgtttaacc 36446356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 43286750 - 43286877
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43286750 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatagta 43286849  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43286850 ataattctcttttatggtatgcttaacc 43286877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45449410 - 45449243
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45449410 cccggggtattggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttcctt 45449311  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  45449310 ttatggtaataattgccttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcatcggttagcaggaccct 45449243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128170
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataat 50128226  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  50128225 tctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggttagcaggaccctt 50128170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 6770370 - 6770492
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6770370 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatgataataat 6770469  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  6770470 tcccttttatgatatgcttaacc 6770492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8473070 - 8472912
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  8473070 tggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataat 8472971  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  8472970 aattctcttttatggtatacttaaccagtgtcccgaggataccggttagcaggaccctt 8472912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 41730336 - 41730494
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41730336 ggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgata 41730435  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  41730436 ataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccagaagcactggttagcaggaccc 41730494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 30657628 - 30657788
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||      |    
T  30657628 cccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacag------t 30657721  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  30657722 ttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagcaggaccc 30657788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 29683215 - 29683351
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaa-aggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29683215 cccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttcat 29683314  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29683315 tttatagtaataattcacttttatggtatgcttaacc 29683351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 38335197 - 38335317
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  38335197 actggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgata 38335296  T
Q  205 ataattcccttttatggtatg 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  38335297 ataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Original strand, 29210434 - 29210540
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29210434 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttt 29210533  T
Q  198 tatggta 204  Q
    |||||||    
T  29210534 tatggta 29210540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 237
Target Start/End: Original strand, 12306950 - 12307077
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12306950 gttaatgatacgaaaaagaaaattatatg-tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattccttttatggtaataa 12307048  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgc 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12307049 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgc 12307077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23473620 - 23473464
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  23473620 tggttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaagtttaaagcagtttccttttatggtaat 23473521  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |||  || ||||||||||| |||||    
T  23473520 aatttctttttataatatgcttaacctgtgctccgagggtaccggttagcaggaccc 23473464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Original strand, 52749632 - 52749757
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| | |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  52749632 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttatggtaat 52749731  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  52749732 aattcctttttatggtatgtttaacc 52749757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 30217788 - 30217946
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaa--ggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||  || ||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30217788 actggctaaggatatgaaaaaaagggaattagagagtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatgg 30217887  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30217888 taataatttctttttatggtatgcttaa-cagtgcccc-gaggcacctgttagcaggaccc 30217946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15282675 - 15282516
Alignment:
Q  102 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||||    
T  15282675 ggtactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaaa----taatttatg 15282580  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||  |||||||    
T  15282579 ataataattccctattattgtatgcttaa-cagtgccctggaaacaccggttagcagaacccttt 15282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315300
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||    
T  37315409 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttg 37315311  T
Q  221 gtatgcttaac 231  Q
    |||||||||||    
T  37315310 gtatgcttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Original strand, 52431632 - 52431761
Alignment:
Q  128 aaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttcccttttatggtatgc 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  52431632 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttcctttttttggtatgc 52431730  T
Q  227 ttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  52431731 ttaaccagtgccccagggacaccggttagca 52431761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28726072 - 28725905
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  28726072 cccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cc 28725974  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28725973 ttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaagaccc 28725905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3838935 - 3838773
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||  |||||||| |    
T  3838935 actggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatggca 3838837  T
Q  205 ataa-ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||| | || |||||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  3838836 ataatttcctttttttagtatgcttaatcagtaccccgagggcaccagttagcataacccttta 3838773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010710
Alignment:
Q  172 taataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcccc 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgcccc 19010710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Original strand, 26228221 - 26228366
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||               ||||||    
T  26228221 actggttaaggagataaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaa---------------atggta 26228305  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  26228306 ataattcccttttatggtatgcttaactggtactccggggacaccggttagcatgaccctt 26228366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Original strand, 37503260 - 37503361
Alignment:
Q  123 aaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggt 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  37503260 aaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaattgtcttttttggt 37503358  T
Q  223 atg 225  Q
    |||    
T  37503359 atg 37503361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Original strand, 39497340 - 39497430
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  39497340 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaaataattttcttttat 39497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38595919 - 38595752
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  38595919 cccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cc 38595821  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38595820 ttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 38595752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14881125 - 14881036
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881125 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtt-------------tgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 14881039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35700809 - 35700728
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 186  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35700809 tactggttaaggatactaaaaaggaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaa 35700728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39912443 - 39912363
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaag 179  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39912443 cggggcactgattaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataaaaaag 39912363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52702312 - 52702141
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||| | || |     
T  52702312 cccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaaaaaaactt-ca 52702214  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttat 268  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  52702213 ttttatggtaataatttcctttttttgtatgcttaaccaatgcctcgga-gcaccgatttgcatgaccctttat 52702141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19011162 - 19011108
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcatt 151  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19011162 cccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 28481873 - 28481954
Alignment:
Q  106 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28481873 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattataca----gtaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaaat-aaaaacagttt 28481954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30664333 - 30664173
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||    
T  30664333 ccggggcattggttaaggataataaaaaagaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-cct 30664235  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||| |||| | |||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  30664234 tttatggtaagaatttcttttttttgtatgcttaaccagtgccccgtgggcaccggttagca 30664173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Original strand, 29210529 - 29210581
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29210529 ccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 29210581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Original strand, 39081829 - 39081980
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||  | |||| ||||||| ||||||| ||    
T  39081829 actggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-aatattaaaagcagtttcattttatgata 39081927  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||  ||||| |  ||||||||| | || || ||| || |||||||||||    
T  39081928 ataattttcttttttaatatgcttaatcagtacctcgggggtaccggttagca 39081980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33644490 - 33644341
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  33644490 ggttaaggctataaaaaagaaaattatataataattattgcattgaaaattgtgtaattaattcataaatatgtcatcaa-agtttccttttatgataat 33644392  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||   | |||| | |||||||||| | |||| |  | ||||||||||||||    
T  33644391 aaactcttttttttgtatgcttaatcggtgctctaggggcaccggttagca 33644341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10976056 - 10976008
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatt 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10976056 gttaaggatatgaaaaaggagattatatagtagttaatgcattaaaatt 10976008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 49867457 - 49867590
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaa-ttatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| | |||| |||||| ||    
T  49867457 actggttaatgatactaaaaaagaaagttatatagtaattaatgttttgaaattgtgtaattaatttacaa-aaagtcagaaaaaatttcattttatagt 49867555  T
Q  204 aat-aattcccttttatggtatgcttaacccgtgc 237  Q
    ||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  49867556 aataaattcccttttttgatatccataacccgtgc 49867590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 10679629 - 10679702
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10679629 ttccttttatggtaaaaatttcttttttttgtatgcttaacaggtgtcccgggggcaccggttagcatgaccct 10679702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16590356 - 16590269
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 210  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16590356 aaaaagaaaattatataacaattaatgtatt-aaattgtgtaattaatttataa-aatgtcagaaacaattttcttttatgataataatt 16590269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 39497728 - 39497789
Alignment:
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  39497728 gtaataatttccttttattgtatgcttaaccaatgccccagagactccggttagcaagaccc 39497789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21112732 - 21112680
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  21112732 ccttttatggtatgcttaactagtgccccgagggcaccggttagcaggaccct 21112680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21117474 - 21117422
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  21117474 ccttttatggtatgcttaacttgtgccccgagggcaccggttagcaggaccct 21117422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11797050 - 11796968
Alignment:
Q  183 aaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||  ||||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  11797050 aaaaaagtttcgttttatggtaataacttccttttttggtatccttaactagtgccccag-gacaccggttagcatgacccttt 11796968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19011091 - 19011061
Alignment:
Q  139 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011091 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 19011061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23822593 - 23822523
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23822593 ttccttttatggtaagaattt--tttttttgtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcatgaccc 23822523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48282896 - 48282855
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48282896 cttaaccagtgccccgggggcaccggttaacaagacccttta 48282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 28481973 - 28482038
Alignment:
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  28481973 taattcctttttatggtatgcttaacccgtaccc--ggggcaccggttagtaggaccctatctttatt 28482038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 46352654 - 46352820
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46352654 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcctt 46352753  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46352754 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 46352820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 273
Target Start/End: Original strand, 48725294 - 48725467
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48725294 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 48725393  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48725394 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggaccacgggttagcaggaccctttatttatt 48725467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 858621 - 858768
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  858621 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 858720  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  858721 tttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagc 858768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 49893351 - 49893510
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49893351 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaaacagtttcctt 49893450  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  49893451 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagc 49893510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 272240 - 272406
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  272240 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttcctt 272339  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  272340 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 272406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 52520701 - 52520870
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52520701 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 52520800  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52520801 ttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttt 52520870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 4168204 - 4168371
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4168204 ccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttt 4168303  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4168304 tatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcaggaccctt 4168371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10617442 - 10617284
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10617442 actgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggta 10617343  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10617342 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 10617284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 39074439 - 39074606
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39074439 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtc-aaaacagtttcctt 39074537  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  39074538 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccctt 39074606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40362745 - 40362576
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40362745 ccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttt 40362646  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  40362645 tatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggtaccgattagcaggacccttta 40362576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 43786892 - 43787059
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  43786892 ccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttccttt 43786991  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43786992 tatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 43787059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Original strand, 41304026 - 41304183
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41304026 ccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgt--aattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 41304123  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  41304124 tatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccccggagacaccggttagca 41304183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 18014692 - 18014860
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  18014692 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcctt 18014791  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18014792 ttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagcaagaccctt 18014860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43269897 - 43269731
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  43269897 actggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaacacagtttccttttatagta 43269798  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43269797 ataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaggaccctatattta 43269731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 2505379 - 2505523
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2505379 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaat 2505478  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccgg 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  2505479 aattcccttttatggtatgtttaaccagtgccctgggggcaccgg 2505523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41554098 - 41553972
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41554098 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 41553999  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||    
T  41553998 ataattattttttatggtatgcttaac 41553972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842805
Alignment:
Q  134 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  234 gtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  6842776 gtgccccgggggcagcggttagcaggaccc 6842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53489990 - 53489833
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  53489990 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 53489891  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  53489890 ttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgccccggtggcaccagtta 53489833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11308368 - 11308210
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11308368 actgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaaatcaaaaatagtttccttttatggta 11308269  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  11308268 ataatt-ccttttatggtatgcttaaccaatgccccaggggcaccgattagcaggaccct 11308210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42964414 - 42964247
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42964414 ccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttt 42964315  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | | | |||||||||||| |||||||    
T  42964314 tatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtgtctcagggacaccggttagcaggaccctt 42964247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 7468439 - 7468595
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  7468439 actggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgata 7468538  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7468539 ataa-tcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgga-gcaccggttagcaggaccc 7468595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 257
Target Start/End: Original strand, 22248918 - 22249066
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22248918 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataa 22249017  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | |||  || |||||||||||||    
T  22249018 ttcccttttatagtatgcttgaccaataccctagaagcaccggttagca 22249066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2938202 - 2938039
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2938202 gggtactggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatttcattttat 2938103  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  2938102 ggtaataattcacttttatggtatgcttaacgagtaccccgagggcaccggttagcaggaccct 2938039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49529435 - 49529269
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttc 193  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49529435 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacattttc 49529336  T
Q  194 cttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  49529335 cttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtg--ccgggggcaccggttagcaagacc 49529269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Original strand, 42548123 - 42548275
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  42548123 actgcttaaagatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatggta 42548222  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaa 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  42548223 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgg-gacaccggttagcaa 42548275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Original strand, 28139337 - 28139488
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28139337 actggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagattccttttatggta 28139436  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | || |||||||||||    
T  28139437 ataattcccttttatggtatacttaaacagtgctctgaagacaccggttagc 28139488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Original strand, 13159920 - 13160050
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13159920 ggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctatta 13160019  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13160020 cggtaataatttctttttatggtatgcttaa 13160050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 20924013 - 20924147
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20924013 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttccttt 20924112  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20924113 taaggtaataattctcttttatggtatacttaacc 20924147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 267
Target Start/End: Original strand, 33140937 - 33141075
Alignment:
Q  129 aattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgctt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33140937 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgctt 33141036  T
Q  229 aacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    || | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33141037 aatcagtaccccggaagcaccggttagcaagacctttta 33141075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 254
Target Start/End: Original strand, 24488389 - 24488543
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24488389 ggggcactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttcttttta 24488488  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||| ||||  ||||||||||    
T  24488489 tggtaataattctcttttatgatatgctgaactagtgctccgggagcaccggtta 24488543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50395720 - 50395561
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  50395720 actggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaagtc-aaaacaatttccttttatggta 50395622  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| | || | |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  50395621 ataattctcttttatgatatgattaatcagtacaccggagacaccgattagcaggaccctt 50395561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 38852246 - 38852382
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagt---taatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  38852246 gttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttattttatgataa 38852345  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38852346 taattcacttttatggtatgtttaacccgtgccccgg 38852382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Original strand, 29241669 - 29241790
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  29241669 gttaaggatatgaaaatggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataataa 29241768  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  29241769 ttccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50359344 - 50359195
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50359344 actggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgtggta 50359245  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50359244 ataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggtta 50359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 2119459 - 2119577
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2119459 actggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttat-gta 2119557  T
Q  205 ataattcccttttatggtatg 225  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  2119558 ataatt-ccttttatggtatg 2119577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Original strand, 52246603 - 52246737
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaac-agtttcctt 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||    
T  52246603 ccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttt 52246702  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52246703 ttatagtaataatttccttttatggtatgcttaac 52246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41993773 - 41993626
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  41993773 gttaagtatattaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataa 41993675  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||    
T  41993674 ttctcttttatggtatgcttaactagtaccctaaaggcaccggttagca 41993626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50299106 - 50298976
Alignment:
Q  102 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50299106 ggtactgattaaagatataaaaaggaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatg 50299007  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
     ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  50299006 ataataattcactcttatggtatacttaacc 50298976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Original strand, 2362880 - 2362958
Alignment:
Q  125 aggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2362880 aggaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatggta 2362958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Original strand, 31514829 - 31514945
Alignment:
Q  115 gatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccct 214  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||    
T  31514829 gatatgaaaaataaaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaattt-tttttatagtaataatttcct 31514927  T
Q  215 tttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  31514928 tttatagtatacttaacc 31514945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552620
Alignment:
Q  152 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtat 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtat-cttttatggtaataattctcttttatggtat 52552620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Original strand, 2391630 - 2391688
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattg 158  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2391630 ggggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2391688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 158
Target Start/End: Original strand, 2393391 - 2393449
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattg 158  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2393391 ggggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2393449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010133
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctttt 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21010041 aaaaaggaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataacttcctttt 21010133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 25743833 - 25743964
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  25743833 gggtaccgattaaggatactaaaaaaggaaattatatagtaattattgcattaaaaattgtgtaattaattcataa-aaagtcaaaatc-gtttcatttt 25743930  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25743931 ttagtaataatttccttttttggtatgcttaacc 25743964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 162
Target Start/End: Original strand, 52718195 - 52718252
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  52718195 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51665870 - 51665714
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaag-gaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaa--aaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||  ||||   ||| ||||||||||    
T  51665870 gttaaggataataaaaagagaaattatatattaattattgcattgaaaattgtttaattaattcataaataagtcaacgaaac---ttcattttatggta 51665774  T
Q  205 ataattcccttttatg-gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    | |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  51665773 agaatttccttttttctgtatgcttaacccgtgccccgg-gacaccggttagcatgaccct 51665714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Original strand, 23925300 - 23925359
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaat 156  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  23925300 cccggggaactggttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaat 23925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 264
Target Start/End: Original strand, 53163911 - 53163953
Alignment:
Q  222 tatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53163911 tatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 53163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 6842605 - 6842642
Alignment:
Q  139 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6842605 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16990789 - 16990728
Alignment:
Q  108 ggttaaggat-atgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 168  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  16990789 ggttaaggatgataaaaaaggaaattagataatagttattgcattaaaaatgtgtaattaat 16990728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 169
Target Start/End: Original strand, 6842636 - 6842671
Alignment:
Q  134 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6842636 tataatagttaattcattgaaattgtgtaattaatt 6842671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36953243 - 36953115
Alignment:
Q  133 atataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||    
T  36953243 atataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaatac-taaaaaagtcaaacat-gtttccttttatggtaatacttacctttt-tggcatccttaac 36953147  T
Q  232 ccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    | ||| | |  |||||||||||| || |||||    
T  36953146 cggtgtctccaaggcaccggttaacatgaccc 36953115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 53054834 - 53054958
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtt---aatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || ||| |||||   ||||    
T  53054834 ttaatgatatgaataatgaaattatatagtaattcttaatgcattgagattgtgtaatttatctataataaagccaaaaatag-ttcattttacaataat 53054932  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  53054933 aattctcttttatagtatgtttaacc 53054958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 137
Target Start/End: Original strand, 2362831 - 2362861
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362831 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 2362861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 2362948 - 2363000
Alignment:
Q  213 cttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  2362948 cttttatggtatgcttaatcagtgccccggaaacatcggttagcaggaccctt 2363000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 23516590 - 23516630
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23516590 cttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaacacccttt 23516630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Original strand, 13661836 - 13661995
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13661836 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatggta 13661935  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13661936 ataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 13661995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34650991 - 34650832
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34650991 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 34650892  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34650891 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 34650832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11958133 - 11957965
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958133 cccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 11958034  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  11958033 ttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccctt 11957965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10054518 - 10054353
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10054518 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtc-aaaacagtttcctt 10054420  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  10054419 ttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 10054353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Original strand, 35132550 - 35132711
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35132550 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttc-tttatggta 35132648  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35132649 ataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccttta 35132711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 8787359 - 8787528
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  8787359 cccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcctt 8787458  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8787459 ttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcaggacccttt 8787528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35504398 - 35504239
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  35504398 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttcccttttatggca 35504299  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  35504298 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtg-tccgggggcaccggttagcaggaccctt 35504239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21547549 - 21547394
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  21547549 ggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttaagttaata 21547450  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  21547449 attctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcaggaccc 21547394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Original strand, 6283583 - 6283742
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6283583 ccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttt 6283682  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  6283683 tatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccctaggggcaccggttagca 6283742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9721771 - 9721598
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9721771 cgggctactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctttt 9721672  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9721671 atgataataattcccttttatggtatgtttaattcatgcaccag-ggcaccggttagcatgacccattatttatt 9721598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40564557 - 40564401
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40564557 ttaaggatttgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataat 40564458  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    || ||||||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  40564457 tctcttttatggtatgcttaaccaataccccaagggcaccggttagcaggacccttt 40564401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 12506336 - 12506459
Alignment:
Q  117 tatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttt 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12506336 tatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatagtaataattctcttt 12506435  T
Q  217 tatggtatgcttaacccgtgcccc 240  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  12506436 tatggaatgcttaaccagtgcccc 12506459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Original strand, 11846106 - 11846235
Alignment:
Q  111 taaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  11846106 taaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagtagtttccttttatggtaataaat 11846205  T
Q  211 cccttttatggtatgcttaacccgtgcccc 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11846206 cccttttatagtatgcttaaccagtgcccc 11846235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19647823 - 19647717
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19647823 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcataaacagtttccttt 19647724  T
Q  198 tatggta 204  Q
    |||||||    
T  19647723 tatggta 19647717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 10069989 - 10070095
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10069989 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaacagtttcttt 10070087  T
Q  197 ttatggta 204  Q
    ||||||||    
T  10070088 ttatggta 10070095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 13470174 - 13470283
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13470174 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctttta 13470273  T
Q  200 tggtaataat 209  Q
    ||||||||||    
T  13470274 tggtaataat 13470283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 10955972 - 10956139
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatga-aaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    |||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  10955972 ccggggcactggttaagcataccataaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttataacaaagtcaaaaacaatttcctt 10956070  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  10956071 ttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagtaccccgaatgtaccggttagcaagaccctt 10956139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 20175255 - 20175381
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  20175255 actggttaaaaatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgata 20175354  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||    
T  20175355 ataattcccttttataatatgcttaac 20175381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Original strand, 40057340 - 40057493
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  40057340 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttcttttatagtaatatt 40057439  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||| | || |||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  40057440 tcccttttatgatgtgtttaaccagtgacctcgaggcaccggttagcaggaccc 40057493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39067094 - 39066973
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataat-agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39067094 actggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatggt 39066995  T
Q  204 aataattcccttttatggtatg 225  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  39066994 aataattctcttttatgttatg 39066973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Original strand, 31909658 - 31909781
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     || |    
T  31909658 tactggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaacagtttcc-----tgat 31909752  T
Q  204 aataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31909753 aataattttcttttatggtatgcttaacc 31909781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 4268624 - 4268750
Alignment:
Q  139 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |    
T  4268624 tagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataaaaaa-taaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacccgtgtc 4268722  T
Q  239 ccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    | || |||||||||||| | ||||||||    
T  4268723 cagggggcaccggttagtatgacccttt 4268750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 4837277 - 4837369
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag 189  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4837277 cccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaatacag 4837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19436990 - 19436876
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  19436990 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaagttaaaaatagttt-tttttatggtaataa 19436893  T
Q  209 ttcccttttatggtatg 225  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19436892 ttctcttttatggtatg 19436876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 39069409 - 39069527
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||   || ||||||| |||||||||||||||    
T  39069409 actggttaagggtatgaaaa-ggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattatataataat--tgtgaaaaacaatttccttttatggta 39069505  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgc 226  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  39069506 ataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2619711 - 2619635
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaa 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2619711 gttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaa 2619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1383437 - 1383271
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| || | || ||||||    
T  1383437 gggtactggttaaggataataagaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaaaaagtcaacaaaactt-cctttt 1383339  T
Q  199 atggtaataattcccttttatg-gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1383338 atggtaagaatttccttttttttgtatgcttaacccgtgtcccagaggcaccggttagcatgaccctt 1383271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 31467740 - 31467906
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    |||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||    
T  31467740 ccggggcaccggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-cct 31467838  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31467839 tttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccagggacaccggttagcaagaccc 31467906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14214205 - 14214055
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||||||||||||    
T  14214205 ggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaa 14214107  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
     |||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  14214106 gaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgtcccgggggcaccggttagca 14214055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 6284823 - 6284892
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 174  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6284823 actggttaaggatactaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10956009 - 10955957
Alignment:
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  10956009 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaacagttagca 10955957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19647728 - 19647684
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19647728 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagc 19647684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30889590 - 30889436
Alignment:
Q  104 tactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||| | ||||||||  ||||  ||||||| || |  |||||||||||    
T  30889590 tactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgaattgaaaattatttaattaatctataaataagtcaacaa-aacttccttttatg 30889492  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
     ||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  30889491 ataaaaatttcctttttttgtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagca 30889436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Original strand, 5091899 - 5091939
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5091899 cttaacctgtgccccgggggcaccggttaacaagacccttt 5091939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5302422 - 5302374
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5302422 aaaaaagaaattatataatagttattgtattgaaaattgtgtaattaat 5302374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 208
Target Start/End: Original strand, 22973732 - 22973815
Alignment:
Q  124 aaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || | |||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22973732 aaggaagttatatagtaactaatgaattaaaattgtgtaattaatttatca-aaagtataaaagagtttccttttatgataataa 22973815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Original strand, 20552954 - 20553119
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552954 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 20553053  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20553054 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 20553119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 31438666 - 31438834
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31438666 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 31438765  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  31438766 ttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggaccctt 31438834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 30486230 - 30486396
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  30486230 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagtttcctt 30486329  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30486330 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 30486396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27856562 - 27856394
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27856562 cccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 27856463  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  27856462 ttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccctt 27856394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22068485 - 22068319
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068485 cccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 22068387  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  22068386 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcaggaccct 22068319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32361035 - 32360869
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32361035 cccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 32360936  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32360935 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 32360869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 31390033 - 31390198
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31390033 ccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttt 31390132  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  31390133 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgctccgggggcaccgattagcaggaccc 31390198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 561684 - 561524
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  561684 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttcctt 561585  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  561584 ttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagca 561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Original strand, 4381823 - 4381983
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4381823 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 4381922  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  4381923 ataattccattttatggtatgcttaaccagtgccccgggagcactggttagcaggaccctt 4381983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34442686 - 34442525
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34442686 gttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataa 34442587  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34442586 ttcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcatcggttagcaggaccctttattta 34442525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 44587922 - 44588088
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44587922 cccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttcctt 44588021  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  44588022 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 44588088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26387224 - 26387063
Alignment:
Q  103 gtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26387224 gtacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgg 26387125  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || ||||||    
T  26387124 taataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttgggggcaccggttaacaggaccct 26387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3668271 - 3668111
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3668271 actggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 3668172  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3668171 ataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaagaccctt 3668111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Original strand, 22567630 - 22567790
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22567630 actggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatggta 22567729  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  22567730 ataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccaggggcaccggttagcaggaccctt 22567790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 270
Target Start/End: Original strand, 22887771 - 22887943
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22887771 ccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttt 22887870  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattt 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22887871 tatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagcatgacccattattt 22887943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8969561 - 8969397
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8969561 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatggtaataa 8969462  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    || |||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8969461 tttccttttatagtatgcttaactagtgcccctggggcaccggttagcagtaccctttatttatt 8969397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 6580212 - 6580354
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6580212 ggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttta 6580311  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6580312 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgg 6580354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13574191 - 13574053
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13574191 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 13574092  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13574091 ggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccc 13574053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35851906 - 35851749
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35851906 ggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttatggtaata 35851807  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgcc-ccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  35851806 attctcttttatggtatgcttaaccaatgcctcggggggcaccggttagcaggaccct 35851749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38591037 - 38590883
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38591037 ggggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctttta 38590938  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38590937 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatacccc-gaggcaccggttag 38590883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Original strand, 2898099 - 2898256
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  2898099 actggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttctatcata 2898198  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2898199 ataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcaggacc 2898256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Original strand, 43637192 - 43637343
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43637192 actggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatggta 43637291  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43637292 ataatttccttttacagtatgtttaacccgtgctccgg-ggcaccggttagca 43637343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 239
Target Start/End: Original strand, 1859182 - 1859324
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1859182 cccggggtaatggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctt 1859281  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1859282 ttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccc 1859324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 266
Target Start/End: Original strand, 28600990 - 28601155
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28600990 ggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttcttttta 28601088  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  28601089 tggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcactgggagcaccggttagcaggacccttt 28601155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Original strand, 32860133 - 32860266
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32860133 ggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat-gtaata 32860231  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32860232 attctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccgg 32860266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5093693 - 5093537
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  5093693 gttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcaatttccttttatgataataa 5093594  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    || |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  5093593 tttccttttatggtatgtttaactagtgccccgg-ggcaccggttaacaggacccttt 5093537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 27584769 - 27584922
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27584769 ggttaaggatatgaaaagggaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaata 27584868  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    |||| | || ||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  27584869 attctcattcatggtatacttaaccagtg-cccggaagcagcggttagcaggacc 27584922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 230
Target Start/End: Original strand, 5881248 - 5881374
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgc----attgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5881248 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaagagtttccttttatgat 5881347  T
Q  204 aataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5881348 aataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25782984 - 25782840
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  25782984 gttaagaatatgaaaaaggaaattatata---gttaatgcattgaaattgtgtaattattttataataaagtcaaaaacaattttcttttatgataataa 25782888  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||    
T  25782887 ttcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggggacatcggttagc 25782840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4022642 - 4022475
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4022642 cgggatactgattaagaatatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataataaagtcagaaacagtttcctttt 4022544  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  4022543 atgataataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcaggacctttta 4022475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11021380 - 11021259
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11021380 actgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgtggta 11021281  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11021280 ataattcccttttatggtatgc 11021259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26891821 - 26891722
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26891821 actgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatggta 26891722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 38296200 - 38296310
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38296200 ggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcttttta 38296299  T
Q  200 tggtaataatt 210  Q
    |||||||||||    
T  38296300 tggtaataatt 38296310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Original strand, 25772142 - 25772264
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataa-tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  25772142 gttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaataattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccctttatgataata 25772241  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  25772242 attcccttttatggtatacttaa 25772264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34123189 - 34123022
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34123189 ccggggtactggttgagcatactaaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagtttccttt 34123091  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttat 268  Q
    |||||| ||||||  ||||| |  ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  34123090 tatggtcataattttcttttttaatatgcttaa-cagtactccgga-gcaccggttagcataaccctttat 34123022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 39531845 - 39532008
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||    
T  39531845 ccggggtactgggtaaacatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttt 39531943  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||| |||  |||||  | ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  39531944 tatggtaat-attttctttttcgatatgcttaaccagtgtctcagaggcaccggttagcatgaccc 39532008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29102439 - 29102314
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29102439 tggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatagtaat 29102340  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  29102339 aattatcttttatgatatgtttaacc 29102314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 225
Target Start/End: Original strand, 10820528 - 10820630
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  10820528 aaaaaagaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataa-aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttg 10820625  T
Q  221 gtatg 225  Q
    |||||    
T  10820626 gtatg 10820630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 15146683 - 15146786
Alignment:
Q  128 aaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgct 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |    
T  15146683 aaattatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttttggtatgtt 15146781  T
Q  228 taacc 232  Q
    |||||    
T  15146782 taacc 15146786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31782732 - 31782565
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaag-gaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| || | |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |     
T  31782732 cccggggcacggattaaggataataaaaagagaaattatatattaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ct 31782634  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  31782633 ttttatggtaaaaatttcctttttttgtatgcttaacccgtgcctcgggggcaccggttagcatgaccc 31782565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29999131 - 29998979
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttat 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||  || || |    
T  29999131 aaaaagaaaattatataatagttcttgcattgaaaattgtgtaattaa-tactaaaaaagtcaaaaata-tttccttttatactaataattttctctttt 29999034  T
Q  220 ggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
     | ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29999033 agcatcattaactcgtgcaccgaaggcaccggttagcatgaccctttattaatta 29998979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 263
Target Start/End: Original strand, 20431482 - 20431624
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaat-tgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttat 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    || ||||||||||   |||  |||||||| |||||||| |||||| |    
T  20431482 aaaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaaaaaaagtcaaaagt-gttatcttttatgataataatttcctttttt 20431580  T
Q  220 ggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    || || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  20431581 ggcatacttaaccagtgccccggagacaccggtttgcatgaccc 20431624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 26270034 - 26270170
Alignment:
Q  127 gaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatg 225  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||||||||||||| |||| | |||| |  ||||    
T  26270034 gaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaaaaatttcttttttttatatg 26270132  T
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26270133 cttaacaggtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 26270170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 257
Target Start/End: Original strand, 44331841 - 44331952
Alignment:
Q  146 tgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggag 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||  |||||| ||||    
T  44331841 tgcattgaaacttgtgtaattaattcataaataagtcaacaaaa-tttccttttatggaaataaattcctttttttgtatgattaactagtgccctggag 44331939  T
Q  245 gcaccggttagca 257  Q
    ||||| |||||||    
T  44331940 gcaccagttagca 44331952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 45262024 - 45262096
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  45262024 ttccttttatggtaataatttcttttttttgtatgcttaacctttgtcccgggggcaccggttagcatgaccc 45262096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44854506 - 44854393
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || |  ||| |    
T  44854506 cccggggcactggttaaggataataaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaa-aacttcat 44854408  T
Q  196 tttatggtaataatt 210  Q
    |||||||||||||||    
T  44854407 tttatggtaataatt 44854393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28012121 - 28011951
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcatt-gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||  ||||||| || ||||||     
T  28012121 cccgggatactggttaaggatattaaaaaggaaaattatatagtaattattgcattcaaaattgtggaattaatctataaataagtcaacaa-agtttct 28012023  T
Q  195 ttttatggtaataattcc---cttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| ||| |||| |    |||| | |||||||||||  ||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  28012022 ttttatgataagaatttcgttttttttttgtatgcttaacgagtgccccagaggaaccggttatcatgaccc 28011951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30834504 - 30834456
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  30834504 aaaaaggaaattatataatagttattgcattgaaaactgtgtaattaat 30834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30217719 - 30217652
Alignment:
Q  108 ggttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30217719 ggttaaggatactaaaaaagaaaattatatagtatttattgcattgaaattgtgtaatcaatcgataa 30217652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 139
Target Start/End: Original strand, 43993185 - 43993216
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43993185 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataat 43993216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 263
Target Start/End: Original strand, 20252787 - 20252928
Alignment:
Q  123 aaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttcccttttatg 220  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||    || ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||    
T  20252787 aaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaatactaaaaaaaatcaaaaata-ttttcttttatgataataatttcctttttttg 20252885  T
Q  221 gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    | || |||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  20252886 gcatacttaaccaatgctccggaggcaccggtttgcatgaccc 20252928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 155
Target Start/End: Original strand, 44854333 - 44854387
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa 155  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44854333 gggtcctggttaaggataataaaaaggaaattatatattaattattgcattgaaa 44854387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 43993204 - 43993252
Alignment:
Q  152 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  43993204 gaaattatataattaattgataataaaatcaaaaatattttccttttat 43993252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 34228705 - 34228868
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34228705 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 34228804  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34228805 tggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34228868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27988664 - 27988499
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27988664 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttt 27988565  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27988564 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcaggaccct 27988499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28045966 - 28045801
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28045966 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttt 28045867  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28045866 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcaggaccct 28045801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4537909 - 4537742
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4537909 ccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 4537810  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4537809 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcaggaccctt 4537742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2805418 - 2805267
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2805418 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataataaagtcaaaagcagtttccttttatggta 2805319  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2805318 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagc 2805267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 168487 - 168653
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  168487 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttt 168586  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  168587 tatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccct 168653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 37373233 - 37373378
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37373233 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcgaaaacagttttcttttatggta 37373332  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccg 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37373333 ataattccctttcatggtatgcttaacccgtgtcccggagacaccg 37373378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42035139 - 42034974
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42035139 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggta 42035040  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  42035039 ataattcccttttatggtatgcttaacacgtgccccagagacaccggttagcgggaccctttattt 42034974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16890634 - 16890486
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890634 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 16890535  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  16890534 ttcctttttatggtatgcttaaccggtgcctccggggcaccggttagca 16890486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16888699 - 16888544
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888699 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 16888600  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16888599 attctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16888544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16394227 - 16394061
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394227 cccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 16394128  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16394127 ttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16394061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 271
Target Start/End: Original strand, 36730476 - 36730637
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36730476 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 36730575  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36730576 ttctcttttatagtatgcttaacctgtgcccc-gtggcaccggttagccagacccttttttta 36730637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29444306 - 29444137
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29444306 cccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctt 29444207  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  29444206 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccgattaacaggacccttt 29444137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30675738 - 30675574
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30675738 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 30675639  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  30675638 ttatggtaataatt-ccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacc 30675574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 11112667 - 11112825
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11112667 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgata 11112766  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  11112767 ataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcaggaccc 11112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33357287 - 33357150
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33357287 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 33357188  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33357187 ataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccgg 33357150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9063210 - 9063051
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9063210 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggta 9063111  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9063110 ataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaggaccct 9063051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Original strand, 21595874 - 21596025
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21595874 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 21595973  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  21595974 ttaattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacactggttagc 21596025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304526
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataat 7304572  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttag 255  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  7304571 tctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttag 7304526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9537985 - 9537824
Alignment:
Q  102 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||     
T  9537985 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttata 9537886  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  9537885 gtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcaggaccc 9537824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9254067 - 9253908
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9254067 cccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat-gataataaagtcaaaaacagtttcctt 9253969  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||||||    
T  9253968 ttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagca 9253908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20831711 - 20831553
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20831711 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatggta 20831612  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||| || | | |||||||||||| |||||    
T  20831611 ataattctcttttatggtatgcttaatcagtgctcccgggacaccggttagcaggaccc 20831553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 32113929 - 32114106
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttt-cctt 196  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32113929 ccggagtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccctt 32114028  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  32114029 ttatgataataattcccttttatagtatgtttaaccagtgctccagagccaccggttagcaggacccttattttatta 32114106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 13643032 - 13643199
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||    
T  13643032 cccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa-aaattcctt 13643130  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  13643131 ttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccctt 13643199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 13743457 - 13743624
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||    
T  13743457 cccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa-aaattcctt 13743555  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  13743556 ttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccctt 13743624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 4648214 - 4648383
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4648214 cccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcttt 4648313  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  4648314 tgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcttgggagcaccggttagcatgacccttt 4648383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 12203878 - 12204019
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12203878 gggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 12203977  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  12203978 gataataattcccttttatggtatgctgaaccagtgtcccgg 12204019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 242
Target Start/End: Original strand, 12448306 - 12448447
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12448306 gggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 12448405  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  12448406 gataataattcccttttatggtatgctgaaccagtgtcccgg 12448447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 43119239 - 43119402
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43119239 cggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagttttctttt 43119338  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  43119339 atggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccgg-ggcaccggttagcaggaccc 43119402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 16785114 - 16785248
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16785114 actggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttataata 16785213  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16785214 ataattctcttttatggtatgattaacccgtgccc 16785248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 257
Target Start/End: Original strand, 28626799 - 28626947
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28626799 ggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgataata 28626898  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||    
T  28626899 attcccttttatggtatgcttaatcagtgtccggga-gcaccggttagca 28626947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42433700 - 42433550
Alignment:
Q  106 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42433700 ctggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa 42433602  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  42433601 taatttccttttttggtatacttcatttgtgccccggaggcaccggttagca 42433550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3930380 - 3930230
Alignment:
Q  116 atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  3930380 atatgaaagaggaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttttgataataatttcctt 3930281  T
Q  216 ttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||| ||||||||    
T  3930280 ttatgatatgcttaaccagtgccccaggagcatcgattagcaggacccttt 3930230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 40831305 - 40831463
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40831305 actggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggta 40831404  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||  ||||||| |||||| ||| | || ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  40831405 ataattttcttttatagtatgcataatctgtaccctggagacaccggttagcaggaccc 40831463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Original strand, 10870382 - 10870495
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10870382 tggttaatgatataaaaaagaaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaat 10870481  T
Q  207 aattcccttttatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  10870482 aattcccttttatg 10870495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407020
Alignment:
Q  140 agttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgccc 39407004  T
Q  240 cggaggcaccggttagca 257  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  39407005 cg--ggcaccggttagca 39407020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Original strand, 29235268 - 29235421
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  29235268 ttaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataataaaatcaaaaataggttccttttatgataataat 29235367  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||||    
T  29235368 ttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcatgaccc 29235421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Original strand, 9278244 - 9278317
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtca 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9278244 gttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtca 9278317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 34192809 - 34192902
Alignment:
Q  111 taaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  34192809 taagaatatgaaaaaggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattttattttatggta 34192902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Original strand, 17467635 - 17467725
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17467635 gttaatgatatgaaaaaggaaattatgcagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaatcaaaaacaatttcctttta 17467725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843312
Alignment:
Q  149 attgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaa 24843312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 10618049 - 10618123
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtca 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618049 ggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataaagtca 10618123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 216
Target Start/End: Original strand, 22451835 - 22451922
Alignment:
Q  128 aaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttt 216  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  22451835 aaattatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatttccttt 22451922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Original strand, 22956734 - 22956845
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22956734 actggttaagagtataaaaaaggaa-tcatatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 22956832  T
Q  205 ataattccctttt 217  Q
    | |||||||||||    
T  22956833 aaaattccctttt 22956845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2490297 - 2490155
Alignment:
Q  123 aaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatgg 221  Q
    ||||| || |||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | || | ||||||||||| |||| |||||| | |    
T  2490297 aaagggaaatatatattaattattgcattgaaaattgtttaattaattcataaataagtcaacaaaactt-cattttatggtaaaaatttcctttttttg 2490199  T
Q  222 tatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  2490198 tatgcttaacccgtgcctcgggggcaccggttagcatgaccctt 2490155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 154
Target Start/End: Original strand, 12652658 - 12652707
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12652658 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39751638 - 39751485
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaa-ttatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  39751638 cccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattatttattgcattaaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-cc 39751540  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcacc 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  39751539 ttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcctcgggggcacc 39751485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Original strand, 40267949 - 40268118
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||   || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||||||||     
T  40267949 actggttaaggataataaaaagggaaattataggttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-ccttttatga 40268047  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  40268048 taataatttcctttttttgtatgtttaacccgtgccccaggagcaccagttaacatgaccctttatttatt 40268118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 266
Target Start/End: Original strand, 10618125 - 10618187
Alignment:
Q  204 aataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||    
T  10618125 aataattaccttttatggtatgcttaacccgtgtctccggggcaccggttagcaggacccttt 10618187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30933453 - 30933376
Alignment:
Q  131 ttatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  30933453 ttatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Original strand, 18955721 - 18955892
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||||||||||    
T  18955721 actggttaatgataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatgg 18955819  T
Q  203 taataattcccttttatg--gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    ||| ||||   |||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18955820 taagaattttttttttttttgtatgcttaacccatgccccgggggcaccggttagcatgaccctttttttatt 18955892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36057992 - 36057897
Alignment:
Q  123 aaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataa--agtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctttt 217  Q
    |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  36057992 aaaggaaattatattagagttaacg-attgaaattgtataattaatttataaaaagtagtcaaaaaaagttttcttttatgataataatttcctttt 36057897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36923821 - 36923782
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtta 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36923821 actgattaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtta 36923782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43714354 - 43714186
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  43714354 cccggggcactggtta-ggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-cc 43714257  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||| ||||   |||| | |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  43714256 ttttatggtaaaaatttattttttttgtatgcttaaccagtgcccccgggacaccggttagcatgaccctt 43714186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 39206212 - 39206363
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| || ||||||| || | ||||||||| ||||  ||||||| || | |||| |||||||    
T  39206212 tactagttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgtattgaaaattatttaattaattcataaataagtcaacaaaactttc-ttttatg 39206310  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
     ||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  39206311 ataaaaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgcccccggggcaccggtta 39206363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14191102 - 14191035
Alignment:
Q  171 ataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||    
T  14191102 ataataaaatcaaaaacagttttattttatgataataattctcttttatagtatttttaaccagtgcc 14191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 9934557 - 9934599
Alignment:
Q  221 gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9934557 gtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 9934599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42655431 - 42655275
Alignment:
Q  109 gttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || | ||||||  |||     
T  42655431 gttaaggataatgaaaaggtaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cattttataataag 42655333  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  42655332 aatttcctttttttgtatgcttaaccggtgccctgg-ggcaccggttagcatgaccctt 42655275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43723772 - 43723722
Alignment:
Q  224 tgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  43723772 tgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcagcacccaatatttatta 43723722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33899177 - 33899108
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaat 164  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  33899177 cccggggcactggttaagaatgataaaaaaggaaattatataataattattgaattgaaaattgtgtaat 33899108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 208
Target Start/End: Original strand, 4811602 - 4811689
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  || |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  4811602 aaaaagaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtataattaattcataaataaatcaacaa-agtttctttttatggtaataa 4811689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 23402159 - 23402326
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23402159 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttt 23402258  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23402259 tatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccctt 23402326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 392116 - 392293
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  392116 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 392215  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  392216 ttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttaatttatta 392293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32929674 - 32929506
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32929674 cccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 32929575  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32929574 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 32929506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26467288 - 26467122
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26467288 cggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttcctttt 26467189  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26467188 atggtaataattcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccctt 26467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 4215715 - 4215883
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4215715 cccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 4215814  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4215815 ttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccctt 4215883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Original strand, 2350672 - 2350832
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2350672 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttcctt 2350771  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2350772 ttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagca 2350832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 27433512 - 27433680
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  27433512 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcctt 27433611  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27433612 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 27433680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12145271 - 12145104
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12145271 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataa 12145172  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttattaat 276  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  12145171 tttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcaggacccataatatattaat 12145104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 3515794 - 3515952
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3515794 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggta 3515893  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  3515894 ataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 3515952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32985349 - 32985199
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32985349 tggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataat 32985250  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32985249 aattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 32985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7851317 - 7851159
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7851317 actggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 7851218  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||    
T  7851217 ataattcccttttatggtatgcttaactcgtgccctagagacaccggttagcaacaccc 7851159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18276773 - 18276612
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18276773 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 18276674  T
Q  205 ataattcccttttatgg---tatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18276673 ataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcaggaccc 18276612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29451270 - 29451138
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29451270 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataataaagtcaaacacagtttccttttatgataata 29451171  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgcccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29451170 attcccttttatggtatgcttaacccgtgcccc 29451138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1391343 - 1391209
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1391343 ccggggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttt 1391244  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1391243 tatgataataattcccttttatggtatgcttaacc 1391209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Original strand, 2580977 - 2581139
Alignment:
Q  102 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2580977 ggtactggttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatg 2581076  T
Q  202 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  2581077 gtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcaggaccct 2581139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 35043918 - 35044074
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35043918 actggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggta 35044016  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  35044017 ataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggttaacatgaccc 35044074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 12525740 - 12525906
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  12525740 ccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataataatgtcaaacacagtttcattt 12525839  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  12525840 tatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccccagggataccggttagcaggaccct 12525906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1840405 - 1840240
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1840405 actggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttcatggta 1840306  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattt 270  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  1840305 ataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccctagaaacaccggttagcaagacccttaattt 1840240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13417116 - 13416958
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaat---tgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13417116 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa 13417017  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  13417016 taattctcttttataatatgcttaaccagtg-cccggaggcaccggttagctggaccctt 13416958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11115253 - 11115106
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11115253 actggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttatggta 11115156  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttag 255  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  11115155 ataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccccgg-gacaccggttag 11115106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25165569 - 25165411
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25165569 tggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 25165470  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  25165469 aattctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggttagcaggaccctt 25165411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 5323428 - 5323573
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5323428 actgattaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggta 5323527  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  5323528 ataattcccttttatggtatgcgtaaccggtgccctggaggcaccg 5323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 28225252 - 28225408
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28225252 ggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaata 28225350  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||| | |||||||    
T  28225351 attcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccctt 28225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961167
Alignment:
Q  119 tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctttta 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctctttta 961150  T
Q  219 tggtatgcttaacccgt 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  961151 tggtatgcttaacccgt 961167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3026167 - 3026015
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  3026167 actggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttatcgta 3026068  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||    
T  3026067 ataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagca 3026015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 20897976 - 20898075
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20897976 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatggta 20898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34477708 - 34477609
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477708 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatggta 34477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 29978264 - 29978419
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29978264 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataataaagtcaaaaacagtttaattttatggtaataa 29978363  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  29978364 ttcccttttatgatatgcttaaccagcgccctgga-acaccggttagcaggaccctt 29978419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21878502 - 21878396
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21878502 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatggtaata 21878403  T
Q  208 attccct 214  Q
    |||||||    
T  21878402 attccct 21878396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34852003 - 34851849
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  34852003 gttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaataatttccttttatagtaataa 34851904  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| |||  |||| | ||||| |||||| |||||    
T  34851903 ttctcttttataatatgcttaaccagtgttccggtgacaccgattagcaggaccc 34851849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23629742 - 23629601
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  23629742 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataataaagtcaaaaacaatttcctt 23629643  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
    |||||  |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  23629642 ttatgacaataattttcttttatgttatacttaacccatgcc 23629601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 263
Target Start/End: Original strand, 31280362 - 31280501
Alignment:
Q  118 atgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctttt 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  31280362 atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataattc-----t 31280456  T
Q  218 atggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31280457 atggtatgcttaacgagtg-cccggaggcaccggttagcaggaccc 31280501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 9661018 - 9661165
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9661018 gttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaagttaaaagcagtttccttttatggtaataa 9661117  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||| ||||||  |||| |||| | || |||| ||| || ||||||||    
T  9661118 ttccattttataatatgtttaatcagtaccccagagtcatcggttagc 9661165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34396682 - 34396596
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34396682 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 34396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 13529477 - 13529554
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 176  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13529477 cggggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Original strand, 34706751 - 34706908
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||||||||||||    
T  34706751 ggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaa 34706849  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
     |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34706850 gaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaagaccct 34706908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34477620 - 34477568
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34477620 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccct 34477568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 261
Target Start/End: Original strand, 1127846 - 1128000
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | |||  |||||||||||    
T  1127846 ggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatttataaataagtcaacaaaactttt-ttttatggtaa 1127944  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagac 261  Q
     ||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  1127945 gaattttctttttttgtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagtaagac 1128000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417358
Alignment:
Q  187 cagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgccccgg 22417358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34712197 - 34712118
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattt 270  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34712197 ttccttttatggtaagaatttccattttttgtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcatgacgctttattt 34712118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 257
Target Start/End: Original strand, 22021733 - 22021844
Alignment:
Q  146 tgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggag 244  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||  |||||| ||||    
T  22021733 tgcattgaaacttgtgtaattaattcataaataagtcaacaaaa-tttccttttatggaaataaattcctttttttgtatgattaactagtgccctggag 22021831  T
Q  245 gcaccggttagca 257  Q
    ||||| |||||||    
T  22021832 gcaccagttagca 22021844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 10431780 - 10431827
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10431780 aaaaaagaaattatataatagttattacattgaaattgtgtaattaat 10431827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 28564338 - 28564388
Alignment:
Q  180 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||    
T  28564338 tcaaaaacagtttccttttatggtaataaattccttttttggtatccttaa 28564388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 256
Target Start/End: Original strand, 20898064 - 20898107
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20898064 ccttttatggtatgcttaacctgtgccccgg-ggcaccggttagc 20898107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Original strand, 34494276 - 34494332
Alignment:
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34494276 ggtaataattctcttttgttgtatgcttaaccaataccccggaggcaccggttagca 34494332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1604034 - 1603989
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1604034 cttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaacacccttttttta 1603989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Original strand, 11633951 - 11634028
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaa 186  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  11633951 ttaaggatactaaaaaagtaattatatagtagttattgcattgaaaattgtgtaattaatacataaaaatgtcaaaaa 11634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 14559944 - 14559993
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgc 148  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14559944 cggggaactgattaaagatatgaaaaaagaaaatatataatagttaatgc 14559993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33108837 - 33108672
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33108837 ccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 33108739  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33108738 tatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 33108672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 32217065 - 32217241
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  32217065 cccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttt-ttt 32217163  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32217164 ttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttaacaggaccctttatttatta 32217241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18068045 - 18067877
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  18068045 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcctt 18067946  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18067945 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 18067877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 29591209 - 29591377
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29591209 cccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 29591308  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29591309 ttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 29591377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 54897328 - 54897494
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  54897328 cccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttcctt 54897427  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  54897428 ttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcaggaccc 54897494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 7768958 - 7769127
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  7768958 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttcctt 7769057  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7769058 ttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacccttt 7769127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 43944528 - 43944692
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43944528 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttt 43944627  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  43944628 tatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagtg-cccgagggcaccggttagcaagaccc 43944692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 789696 - 789537
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  789696 cccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 789597  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  789596 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggttagc 789537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 16536068 - 16536236
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16536068 cccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 16536167  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16536168 ttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 16536236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Original strand, 4220217 - 4220382
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4220217 cggggtacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttctttt 4220316  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4220317 at-gtaataattcccttttatggtatgcttaacatgtgctccgtaggcaccggttagcatgaccctt 4220382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4268988 - 4268822
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4268988 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcttt 4268889  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  4268888 ttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 4268822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19503267 - 19503137
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503267 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 19503168  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503167 tgtaataattcccttttatggtatgcttaac 19503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47232030 - 47231881
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47232030 actggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgata 47231931  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  47231930 ataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtta 47231881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 50619106 - 50619273
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50619106 cccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtaaaaaacagtttcctt 50619205  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  50619206 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccagg-ggcaccggttagcgggaccctt 50619273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 12356271 - 12356430
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12356271 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgat 12356370  T
Q  204 aataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  12356371 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcaggaccc 12356430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Original strand, 36395129 - 36395287
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  36395129 tggttaaaaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataat 36395228  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  36395229 aattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccagttagcaggaccctt 36395287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Original strand, 4089165 - 4089330
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4089165 ggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttta 4089264  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  4089265 tggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcaccagttagcaggaccctt 4089330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43202549 - 43202376
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  43202549 cccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttctt 43202450  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43202449 ttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagtg-cccgggggcaccggttagcaggacccttttttta 43202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Original strand, 28755648 - 28755803
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  28755648 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagttagaaacagtttccttttatgata 28755747  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  28755748 atactt-ccttttatagtatgcttaacccatgcccc-gagacaccggttagcaggacc 28755803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3783666 - 3783488
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3783666 ccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttt 3783567  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgctta---acccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||    
T  3783566 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaagtactagtgccccgggagcaccggttaacaggaccctttttttatt 3783488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32202646 - 32202479
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32202646 cccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 32202547  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  || ||| |||||||| |||| || |||||||    
T  32202546 ttatgataataatt-ccttttatgatatgcttaatcaatgtcccagaggcaccagttaacaggaccctt 32202479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52533943 - 52533815
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52533943 actggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataattaattgataataaagtcgaaaacagtttccttttatggta 52533844  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaaccc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52533843 ataattcccttttatggtatgtttaaccc 52533815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 6164117 - 6164279
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6164117 ggggcactggttaaggatatcaaaa-gaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagcaaaaaacagtttcctttta 6164215  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||    
T  6164216 tggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcaggaccc 6164279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 15186263 - 15186423
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15186263 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 15186362  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||      ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  15186363 ttatggtaataattccattttatgg------taaccagtgccccgggggcaccggttaacaggaccc 15186423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 39843937 - 39844060
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843937 tggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 39844036  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  39844037 aattcctttttagggtatgcttaa 39844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 55882705 - 55882870
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55882705 ccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttt 55882803  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  55882804 tatggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcctcgggggcaccggttagtaggaccctt 55882870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 37987959 - 37988123
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37987959 gggtaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttccttttat 37988058  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  37988059 tgtaataattctcttttatagtatgcttaaccaatcccccgaaagcaccggttagtaggaccctt 37988123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54945941 - 54945780
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54945941 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgtttta 54945842  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  54945841 tggt-ataattcctttttatggtatacttaaccagtgctccgga-acaccggttagcaggaccc 54945780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42898904 - 42898775
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta--tgg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||    
T  42898904 actggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttctttttatgtgg 42898805  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42898804 taataattctcttttatggtatgcttaacc 42898775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53656032 - 53655887
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||    
T  53656032 gttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatggtaataa 53655933  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  53655932 tttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtta 53655887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 54656039 - 54655883
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  54656039 ggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttctttta 54655940  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  54655939 ggataataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccgg-ggcaccggttagca 54655883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24679806 - 24679676
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  24679806 cggggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacaatttcc-ttt 24679708  T
Q  199 atggtaataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24679707 atggtaataattctcttttatggtatgcttaa 24679676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5091776 - 5091612
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5091776 cccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcataaacagtttcctt 5091677  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  5091676 ttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgtccggga-gcaccggttagcaggaccc 5091612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31680621 - 31680483
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31680621 actggttaagggtatgaaaaagaaagttacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggta 31680522  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgga 243  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31680521 ataattcatttttatgatatgtttaacccgtgtcccgga 31680483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Original strand, 46148973 - 46149094
Alignment:
Q  111 taaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatt 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46148973 taagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataatt 46149072  T
Q  211 cccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  46149073 ctcttttatggtatgtttaacc 46149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30154329 - 30154163
Alignment:
Q  96 acccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  30154329 acccggggcactagttaag-atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttcct 30154231  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  30154230 tatatgataataattctcttttatggtgtgcttaaccagtgccccgaaaacatcggttagcaggaccc 30154163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30387270 - 30387167
Alignment:
Q  127 gaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30387270 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatgc 30387171  T
Q  227 ttaa 230  Q
    ||||    
T  30387170 ttaa 30387167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Original strand, 54054579 - 54054675
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54054579 ggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaacaatttccttttatggta 54054675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 264
Target Start/End: Original strand, 16820917 - 16821039
Alignment:
Q  142 ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16820917 ttaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccg 16821016  T
Q  242 gaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  16821017 ggggcaccggttagcaggaccct 16821039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877247
Alignment:
Q  141 gttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatgg--tatgcttaacccgtgcc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  239 ccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  39877271 ccggaggcacgggttagcaggaccc 39877247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Original strand, 42815135 - 42815237
Alignment:
Q  103 gtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttc-cttttatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42815135 gtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctcttttatg 42815234  T
Q  202 gta 204  Q
    |||    
T  42815235 gta 42815237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 241
Target Start/End: Original strand, 50603255 - 50603392
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-tttccttttatggt 203  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |    
T  50603255 actggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatgat 50603354  T
Q  204 aataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccg 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  50603355 aataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccg 50603392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Original strand, 31517217 - 31517327
Alignment:
Q  129 aattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagt-ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgct 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31517217 aattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgct 31517316  T
Q  228 taacccgtgcc 238  Q
    ||||| |||||    
T  31517317 taaccagtgcc 31517327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 49915187 - 49915301
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  49915187 actgattaaggatatgaaaaagaaatttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccttttataata 49915286  T
Q  205 ataattcccttttat 219  Q
    |||||| ||||||||    
T  49915287 ataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46688368 - 46688264
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaa-----ggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||||||||||||||||||||     | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46688368 actggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctttta 46688269  T
Q  200 tggta 204  Q
    |||||    
T  46688268 tggta 46688264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 41265510 - 41265620
Alignment:
Q  128 aaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgct 227  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |    
T  41265510 aaattatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtt 41265608  T
Q  228 taacccgtgccc 239  Q
    ||||| ||||||    
T  41265609 taaccagtgccc 41265620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268874
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||  ||||| ||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttg 53268862  T
Q  221 gtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||||||    
T  53268863 gtatgcttaacc 53268874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1432700 - 1432554
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||   |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||    
T  1432700 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatacattg----tg---aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatgata 1432609  T
Q  205 at--aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||||||||| || || | || |||||||||||||    
T  1432608 ataaaattctcttttataatatgcttaaccagtacctcagaagcaccggttagca 1432554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Original strand, 52697083 - 52697205
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||    
T  52697083 ggttaaggatatgaaaaacaaaattatatagtagttaatacattaaaattatataat-aatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaata 52697181  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||| |||||||| |||| |||||    
T  52697182 attctcttttatgatatgtttaac 52697205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28120062 - 28119905
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaag-gaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||||||||||||    
T  28120062 ggttaaggataataaaaagagaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaa 28119964  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
     |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28119963 gaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggagacaccggttagcatgaccct 28119905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003952
Alignment:
Q  156 ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttag 255  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccgggacaccggttag 53003964  T
Q  256 caagacccttta 267  Q
    || |||||||||    
T  53003963 caggacccttta 53003952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 292229 - 292295
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  292229 ttccttttatggtaaaaatttcctttttttgcatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 292295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133850
Alignment:
Q  152 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataattatcttttatg 8133850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16572646 - 16572479
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaag-gaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || | ||||||||    
T  16572646 actggttaaggataataaaaagagaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ctttttatgg 16572548  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||| |||| |||||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16572547 taagaatttcctttttttgtatacttaatcagtgccccgggggcaccggttagcatgaccttttattta 16572479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 34151140 - 34151309
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || | ||| |    
T  34151140 cccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaacttt-c 34151238  T
Q  195 ttttatggtaataa-ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  34151239 ttttatggtaagaattttcttttttttgtatgcttaacccgtgcccggga-gcaccggttagcatgaccctt 34151309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 50167613 - 50167681
Alignment:
Q  99 cggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 169  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167613 cggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatag--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 50167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17344814 - 17344714
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  17344814 tggttaagtataataaaaatgaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataa-aaatttaaaaaaagtttctttttatggtaat 17344716  T
Q  207 aa 208  Q
    ||    
T  17344715 aa 17344714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28120121 - 28120058
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28120121 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggtta 28120058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6493841 - 6493708
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttat 219  Q
    |||| |||||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  6493841 aaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaattttctttttt 6493743  T
Q  220 ggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggtta 254  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6493742 tgtatgcttaacacatgccccggaggcaccggtta 6493708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8749941 - 8749794
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttat 219  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||| || ||||| || |||||||||||| | |||||| |    
T  8749941 aaaaagaaaattttataataattattacattgaaaattgtgtaattaatctataaataagtcaacaa-agttttctattatggtaataaattcctttttt 8749843  T
Q  220 g---gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
        ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  8749842 ttttgtatgcttaacccgtgccccaagggcaccggttagcatgaccctt 8749794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37402830 - 37402758
Alignment:
Q  191 ttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37402830 ttccttttatggtaagaatttccttttttg-tatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcatgaccct 37402758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 265
Target Start/End: Original strand, 54054664 - 54054717
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  54054664 ccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttggcaggaccctt 54054717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5518993 - 5518886
Alignment:
Q  153 aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggt 252  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  5518993 aaattgtgtaattaatccacaa-aaagtcaaaaatattttc-ttttatggtaataattttctttt-tggcatccttaacctgtgccccgggggcactggt 5518897  T
Q  253 tagcaagaccc 263  Q
    ||||| |||||    
T  5518896 tagcatgaccc 5518886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 20654719 - 20654838
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttc-cttttatggtaataa-ttccctttt 217  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||||||| |||| ||||    
T  20654719 aaaaaggaaattatagagtagctattgcattgaaaattgtgtaattaatcaataa-aaagtcaaaaa-agtttcatttttttagtaataacttccttttt 20654816  T
Q  218 atggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
     |||||| ||||||| ||||||    
T  20654817 ttggtatccttaaccagtgccc 20654838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 789679 - 789727
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatttatta 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||    
T  789679 cttaacccgtgccccgggggcaccggttagcatttccctttttttatta 789727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39877398 - 39877370
Alignment:
Q  194 cttttatggtaataattcccttttatggt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39877398 cttttatggtaataattcccttttatggt 39877370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29993653 - 29993487
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  29993653 cccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaatttcctt 29993554  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  29993553 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggttagcaggaccc 29993487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 34606282 - 34606448
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34606282 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttt 34606381  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  34606382 tatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcaggaccct 34606448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 24438497 - 24438663
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24438497 cccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctt 24438596  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24438597 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 24438663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24798553 - 24798403
Alignment:
Q  113 aggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798553 aggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcc 24798454  T
Q  213 cttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  24798453 cttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcaggaccc 24798403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 47839512 - 47839658
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47839512 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 47839611  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgga 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  47839612 ttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgccccgga 47839658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 34333304 - 34333471
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34333304 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaa-cagtttcctt 34333402  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34333403 ttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 34333471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Original strand, 30810674 - 30810849
Alignment:
Q  96 acccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30810674 acccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttct 30810773  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||    
T  30810774 tttatggtaataattttcttttatggtatgtttaaccaatgccccaggggtaccggttagtaggacccttaattta 30810849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Original strand, 18485981 - 18486141
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18485981 cccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctt 18486080  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18486081 ttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggttagca 18486141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 5239313 - 5239471
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5239313 actggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttctttttatggta 5239412  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  5239413 ataattcccttttatggtatgcttaacttgtgcccccggggcactggttagcaggaccc 5239471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12218602 - 12218429
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  12218602 cccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaaataaaaaatagtttcctt 12218503  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  12218502 ttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgg-gacaccggttagcaggacccttaattta 12218429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Original strand, 1737003 - 1737159
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1737003 ggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagttaaaaacattttccattta 1737102  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1737103 tgataataatt-cattttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagca 1737159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13065038 - 13064882
Alignment:
Q  102 ggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtca-aaaacagtttccttttat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13065038 ggtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaacagtttccttttat 13064939  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  13064938 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctctaggggcaccggttagca 13064882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 4628597 - 4628752
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4628597 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataataaagtcagaaacagtttacttttatggtaata 4628696  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||| |||||    
T  4628697 attcccttttatggtatgcttaaccagtgccttaggggcaccggttagcaggaccc 4628752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Original strand, 5729374 - 5729531
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  5729374 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaataattttcttttatagta 5729473  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  5729474 ataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcctcggaggcacaggttagcaggacc 5729531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Original strand, 45045799 - 45045935
Alignment:
Q  106 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45045799 ctggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataa 45045898  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45045899 taattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgg 45045935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11686489 - 11686324
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag--tttcct 195  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |    
T  11686489 ccgggatactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttt 11686390  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  11686389 tttatggtaataattctcttttatgatatgcttaacctgt-acccggaggcaccggttagcaggacc 11686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43594194 - 43594067
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43594194 actggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctcttatgata 43594095  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43594094 ataattctcttttatggtatgcttaacc 43594067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 47083086 - 47083232
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47083086 ggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 47083185  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttag 255  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  47083186 attcccttttatgatatgtttaaccaatgctccgg-ggcaccggttag 47083232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8754743 - 8754617
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8754743 actggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttgttttatggta 8754644  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8754643 ataatttccttttatggtatgcttaac 8754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42044448 - 42044293
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42044448 ggttaaaggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttatggtaata 42044349  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42044348 attcccttttatggtatgtttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagcatgaccct 42044293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23363321 - 23363166
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23363321 gttaaggataagaaaaaggaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaatat 23363222  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |||||| ||||||    
T  23363221 ttctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgaaaacaccgattagcaggaccct 23363166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Original strand, 28587937 - 28588064
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28587937 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggta 28588036  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28588037 ataattcccttttatggtatgtttaacc 28588064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Original strand, 47657003 - 47657157
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  47657003 ggggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagttt--tttta 47657100  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||    
T  47657101 tggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgcctc-gaagcaccggttagca 47657157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 525233 - 525076
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  525233 actggttaaagatatgaaaaagaaaagtatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggta 525134  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||    
T  525133 ataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccgga-gcaccggttagcaggaccc 525076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7689358 - 7689224
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7689358 actgattaaggatataaaaaaggaaattttacagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggta 7689259  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7689258 ataattctcttttatggtatacttaaccagtgccc 7689224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Original strand, 46716668 - 46716830
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  46716668 tggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatattttccttttatgataat 46716767  T
Q  207 aattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttatt 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||   |||||||||| |||||| ||||    
T  46716768 aattcccttttatggtatgtttaaccggtgctccgaagatcccggttagcaggaccctgtatt 46716830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 18117175 - 18117330
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  18117175 gttaagtatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttatagtaataa 18117274  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| | |||||||    
T  18117275 tttcattttatggtatgcttaaccagtgccctgga-gcaccagttagtaggaccctt 18117330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 257
Target Start/End: Original strand, 28262062 - 28262206
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28262062 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttccttttatagtaata 28262156  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagca 257  Q
    ||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  28262157 attcttttttatggtatgcttaaccaatgccctggaagcaccggtcagca 28262206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34546480 - 34546373
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  34546480 cccgaggtaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagtaaagtcaaaaacagtttactt 34546381  T
Q  197 ttatggta 204  Q
    ||||||||    
T  34546380 ttatggta 34546373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 238
Target Start/End: Original strand, 33636484 - 33636613
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  33636484 gttaagaatatgaaaaagaaaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggtaataa 33636583  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  33636584 ttctattttatggtatgcttaaccagtgcc 33636613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23357867 - 23357711
Alignment:
Q  103 gtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |   || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  23357867 gtactcgttaaggatatgaaaaagaaaattgtatagtagttaatgcatttca---gtataattaatttataaaaaagtcaaaaacagtttccatttatga 23357771  T
Q  203 taataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23357770 taataattctcttctatgatatgcttaaccagtgccccggagacaccgattagcaagacc 23357711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27456271 - 27456175
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 201  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27456271 actggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 27456175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37631707 - 37631604
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37631707 ccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttt 37631608  T
Q  198 tatg 201  Q
    ||||    
T  37631607 tatg 37631604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674104
Alignment:
Q  127 gaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||   |||||||||||||    
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgatataattttttttttatggtatgc 37674141  T
Q  227 ttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||    
T  37674140 ttaaccagtgtcc--ggggcaccggttagcaggaccctt 37674104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29835860 - 29835735
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacag-tttccttttatggtaa 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||    
T  29835860 tggttaaagatatgaaaaaggaagttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaa 29835761  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||    
T  29835760 taattctattttatggtatgcttaac 29835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 36437401 - 36437562
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  36437401 gggtactggttaaggatactaaaaaggtaattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttcttttat 36437499  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    | |||||| | | |||| | |||| |||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||    
T  36437500 gataataacttctttttttagtatccttaaccc-tgtcccatgggcaccggttagcatgaccct 36437562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 38128322 - 38128482
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaa-ttatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||||||||||||    
T  38128322 ggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaaaactt-ccttttatggtaa 38128420  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttta 267  Q
     |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38128421 gaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgacccttta 38128482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18470094 - 18469993
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18470094 ggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga-aaagtcaaaaacagttacattttatggtaata 18469996  T
Q  208 att 210  Q
    |||    
T  18469995 att 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Original strand, 22739868 - 22740010
Alignment:
Q  122 aaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat-aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |     
T  22739868 aaaaggaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatggtaataattttattttttt 22739967  T
Q  221 gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||| |  ||||| | | || ||||||||||| |||||    
T  22739968 gtatgcttagctagtgcctccggggtaccggttagcatgaccc 22740010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220692
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatg 220  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||    
T  18220812 aaaaaggaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataaattccttttttg 18220714  T
Q  221 gtatgcttaacccgtgccccgg 242  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  18220713 gtatccttaatcggtgccccgg 18220692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 6097356 - 6097523
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| || | ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  6097356 cccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattatttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cc 6097454  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6097455 ttttatggtaagaatttcctttttttatatgcttaacccgtgccccggaggcactggttagcatgaccc 6097523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4100679 - 4100557
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||   |||||| |||||    
T  4100679 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagttt-tatttatgataata 4100581  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||    
T  4100580 attcatttttatagtatgcctaac 4100557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 3021915 - 3022038
Alignment:
Q  101 gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 200  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||       |||||||    
T  3021915 gggtacgggttaagcatattaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcataaa-------cttttat 3022006  T
Q  201 ggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  3022007 ggtaataatttcctcttttggtatgattaacc 3022038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 4087651 - 4087752
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||    
T  4087651 actggttaagcatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa-agtttcaaaaacagttt-cttttatggta 4087748  T
Q  205 ataa 208  Q
    ||||    
T  4087749 ataa 4087752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118041
Alignment:
Q  152 gaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattc 47118041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  139 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttat 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 217
Target Start/End: Original strand, 20116940 - 20117029
Alignment:
Q  127 gaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccctttt 217  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  20116940 gaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtagtaaatttttaa-aaggccaaaaacagttttcttttatgataataatttcctttt 20117029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30924157 - 30923985
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | || ||    
T  30924157 cccggggcacgggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattagtgcattgaaaattgtttaattaattcataaataagtcaacaaaactt-cc 30924059  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatg--gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |   |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  30924058 ttttatggtaagaatttcctttttttttgtatgcttaacgagtgccccgagggcaccagttagcatgacccttt 30923985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34557057 - 34556891
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | ||||     
T  34557057 cccggggcattggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactttc- 34556959  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  34556958 ttttagggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccc--ggggcaccggttagcatgaccct 34556891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Original strand, 19434514 - 19434681
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 195  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || |||    
T  19434514 ccggggcactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cct 19434612  T
Q  196 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19434613 tttatggtaagaattttctttttttgtatgcttaaccagtg-cccgggggcaccggtcagcatgaccctt 19434681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 239
Target Start/End: Original strand, 32805558 - 32805701
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||  ||||||| || | || ||    
T  32805558 cccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattaaaaattgtttaattaatccataaataagtcaacaaaactt-cc 32805656  T
Q  195 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccc 239  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32805657 ttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgccc 32805701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18220688 - 18220625
Alignment:
Q  106 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatt 169  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18220688 ctggttaagaatactaaaaaggaaattatatagtaattactgtattgaaattgtgtaattaatt 18220625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18220593 - 18220527
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 174  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18220593 ggttaaggatactaaaaagaaaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa 18220527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 264
Target Start/End: Original strand, 6819946 - 6820100
Alignment:
Q  107 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaat-tgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaa 205  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||| || || ||||  ||||||||||||   ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6819946 tggttaaggatgttaaaaag-aaattatacagtagttattgtatagaaaactgtgtaattaatac-taaaaaagtcaaaaat-gtttcattttatggtaa 6820042  T
Q  206 taattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||| |||||| | | || ||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  6820043 taattaccttttttagcatccttaaccagtgccctag-ggcaccggttagcatgaccct 6820100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32026747 - 32026717
Alignment:
Q  288 tgaaaataagtctacgtcactttagaagttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32026747 tgaaaataagtctacgtcactttagaagttc 32026717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32038884 - 32038854
Alignment:
Q  288 tgaaaataagtctacgtcactttagaagttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32038884 tgaaaataagtctacgtcactttagaagttc 32038854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34435813 - 34435752
Alignment:
Q  105 actggttaaggata-tgaaaaaggaaattatataatagttaatgcatt-gaaattgtgtaat 164  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  34435813 actggttcaggatactaaaaaaggaaattatataatagttattgcattaaaaattgtgtaat 34435752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 22973619 - 22973667
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaat 146  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22973619 ccggggcactggttaatgatataaaaaaagaaattatatagtagttaat 22973667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6273 - 6108
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6273 ggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataaagtcaaaaacagtttcctttta 6174  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6173 tggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 6108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53851 - 53683
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  53851 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcctt 53752  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53751 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 53683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 271
Target Start/End: Original strand, 116224 - 116398
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  116224 cccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcctt 116323  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctttattta 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  116324 ttatgataataattcccttttatggtatgtttaacccgtgccccagggataccggttagcagtaccctttattta 116398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Original strand, 14916 - 15082
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14916 cccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataataaagtcaaaaacagtttcctt 15015  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15016 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcactggttaacaggaccc 15082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 264
Target Start/End: Original strand, 22989 - 23148
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22989 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgtta 23088  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||||    
T  23089 ataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaaggacaccggttagcaagaccct 23148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 68456 - 68290
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  68456 cccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataataaagttaaaatcagtttcctt 68357  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  68356 ttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccgaaggcatcggttagcaggaccc 68290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 263
Target Start/End: Original strand, 40952 - 41105
Alignment:
Q  110 ttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 209  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40952 ttaagaatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataat 41051  T
Q  210 tcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  41052 ttccttttatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggaccc 41105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 857 - 1013
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  857 gttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaatttccttttatagtaataa 956  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||    | ||||||||||| ||||||||    
T  957 ttctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaaggacaccggttagccagaccctt 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10896
Alignment:
Q  139 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10772 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgcc 10871  T
Q  239 ccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
     ||| |||| ||||||||| |||||    
T  10872 tcgggggcagcggttagcaggaccc 10896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 95750 - 95616
Alignment:
Q  97 cccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctt 196  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  95750 cccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaagtc-aaaacagttttctt 95652  T
Q  197 ttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  95651 ttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 147068 - 146938
Alignment:
Q  100 ggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttta 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  147068 ggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctatta 146969  T
Q  200 tggtaataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  146968 cggtaataatttctttttatggtatgcttaa 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 25750 - 25906
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25750 ggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaata 25848  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccctt 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||| |||||| | |||||||    
T  25849 attcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccctt 25906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Original strand, 709 - 832
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  709 ggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaactgttttcttttatggtgata 808  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  809 attctcttttatggtatgcttaac 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7956
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatggta 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7967 - 7915
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7967 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccct 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 7316 - 7415
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7316 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttatggta 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Original strand, 7404 - 7456
Alignment:
Q  212 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7404 ccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggtaccggttagcaggaccct 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Original strand, 320 - 445
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  320 actggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataataaagtcaaaaacagtttccttctacggta 419  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaa 230  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  420 ataattctcttttatgatatgattaa 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19740 - 19585
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaata 207  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  19740 ggttaagcatatgaaaaaagaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttacgataata 19641  T
Q  208 attcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 263  Q
     ||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||||  | |||||||||| |||||    
T  19640 gttctcttttatgatatgattaatcagtgtcccggaaactccggttagcaggaccc 19585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 53504 - 53358
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||           ||    
T  53504 actggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatt-----------ta 53416  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacc 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53415 ataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggaggcaccggttagcaggacc 53358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 248
Target Start/End: Original strand, 50569 - 50719
Alignment:
Q  98 ccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttt 197  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  50569 ccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaatcaattttcttt 50668  T
Q  198 tatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcac 248  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||    
T  50669 tatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtgctccgggggcac 50719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 266
Target Start/End: Original strand, 69258 - 69414
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  69258 gttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaaggtaataa 69357  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| | ||||||||    
T  69358 tt-tcttttatggtatgcttaaccagtgcctcgggagcaccggttagaaggacccttt 69414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33835 - 33714
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 208  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33835 gttaagtatattaaaatggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aagataaaaaatagttttcttttatgctaataa 33737  T
Q  209 ttcccttttatggtatgcttaac 231  Q
    ||  || || || ||||||||||    
T  33736 ttttctcttttgatatgcttaac 33714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 17502
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17628 actgtttacggatatgaaaaagaaaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgata 17530  T
Q  205 ataattcccttttatggtatgcttaacc 232  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17529 ataattcctttttatggtatgtttaacc 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11128 - 11029
Alignment:
Q  105 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11128 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagtttcattttatggta 11029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 273
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234049
Alignment:
Q  142 ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccg 234017  T
Q  242 gaggcaccggttagcaagaccctttatttatt 273  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  234018 ggggcaccggttagcaggaccccttatttatt 234049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 74633 - 74526
Alignment:
Q  104 tactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatag-ttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 202  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||    
T  74633 tactgattaaagatatgaaaaaaaaaattatatagtaaattaatgtagtgaaattgtataattaattgataataaattaaaaaacaaatttcttttatgg 74534  T
Q  203 taataatt 210  Q
    ||||||||    
T  74533 taataatt 74526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 509144 - 508984
Alignment:
Q  109 gttaaggatatgaaaaa-ggaaattatataatagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 206  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||  || ||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| || | |||| |||||||||||     
T  509144 gttaaggataataaaaatggaaattatatgttaattattgaattgaaaattgtttaattaattcataaataagtcaacaaaactttc-ttttatggtaaa 509046  T
Q  207 aattcccttttatg--gtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    |||| |||||| |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  509045 aatttcctttttttttgtatgcttaaacggtgccccggaggcaccggttagcatgacccttt 508984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1462
Alignment:
Q  121 aaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1415 aaaaaagaaattatataatagttattgcattgaaattgtgtaattaat 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5136
Alignment:
Q  108 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 174  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5070 ggttaagaatattaaaaaaaaaattatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 66424 - 66491
Alignment:
Q  103 gtactggttaaggatatgaaaaag-gaaattatataatagttaatgcattg-aaattgtgtaattaat 168  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  66424 gtactagttaaggatacgaaaaaatgaagttatataatagttattgcattgaaaattgtgtaattaat 66491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1372 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1372
Description:

Target: scaffold1372; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1276 - 1237
Alignment:
Q  226 cttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaagacccttt 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1276 cttaacccgtgccccgg-ggcaccggttaacaagacccttt 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University