View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12577_low_3 (Length: 460)

Name: NF12577_low_3
Description: NF12577
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12577_low_3
NF12577_low_3
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-448)||(50249-50696)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (1-440)||(16825217-16825656)
chr3 (6-437)||(12181099-12181530)
chr3 (1-440)||(35982933-35983372)
chr3 (6-440)||(17494399-17494836)
chr3 (1-440)||(14290470-14290909)
chr3 (12-440)||(12357476-12357904)
chr3 (6-440)||(31941655-31942089)
chr3 (6-440)||(31692128-31692562)
chr3 (1-440)||(12857434-12857873)
chr3 (3-439)||(11958121-11958557)
chr3 (1-310)||(17189256-17189565)
chr3 (3-439)||(16326647-16327085)
chr3 (6-440)||(18131290-18131724)
chr3 (19-439)||(16831484-16831904)
chr3 (1-310)||(24190186-24190494)
chr3 (3-439)||(10408721-10409157)
chr3 (3-439)||(47126697-47127133)
chr3 (33-419)||(16384342-16384728)
chr3 (3-439)||(28757072-28757508)
chr3 (6-424)||(15230371-15230789)
chr3 (6-424)||(15236239-15236657)
chr3 (245-440)||(11949107-11949302)
chr3 (51-295)||(13944921-13945165)
chr3 (51-295)||(8744378-8744622)
chr3 (6-334)||(13317512-13317840)
chr3 (165-399)||(2037014-2037248)
chr3 (165-399)||(2040755-2040989)
chr3 (1-103)||(2245610-2245712)
chr3 (165-399)||(14039539-14039773)
chr3 (1-256)||(12508503-12508758)
chr3 (163-262)||(15008684-15008783)
chr3 (1-263)||(12843052-12843314)
chr3 (57-263)||(16803952-16804158)
chr3 (6-263)||(15262549-15262806)
chr3 (201-263)||(23079166-23079228)
chr3 (132-263)||(11861272-11861403)
chr3 (54-169)||(15713061-15713176)
chr3 (132-263)||(23414870-23415001)
chr3 (54-168)||(3688954-3689068)
chr3 (51-157)||(6603757-6603863)
chr3 (54-152)||(10008627-10008725)
chr3 (54-152)||(10909237-10909335)
chr3 (201-263)||(15065990-15066052)
chr3 (47-89)||(23079012-23079054)
chr3 (12-97)||(10416994-10417079)
chr3 (347-428)||(13028640-13028721)
chr3 (40-89)||(15459410-15459459)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (12-448)||(14993088-14993524)
chr4 (6-440)||(15266899-15267333)
chr4 (1-375)||(18259629-18260003)
chr4 (1-436)||(15073486-15073921)
chr4 (3-439)||(20893155-20893591)
chr4 (6-351)||(16150848-16151193)
chr4 (6-351)||(16154994-16155339)
chr4 (3-439)||(3261506-3261942)
chr4 (3-439)||(11203944-11204380)
chr4 (3-424)||(7357406-7357827)
chr4 (1-439)||(29450247-29450685)
chr4 (6-427)||(44658581-44659002)
chr4 (1-287)||(8708953-8709239)
chr4 (30-259)||(13879413-13879642)
chr4 (51-295)||(51603552-51603796)
chr4 (51-295)||(53750230-53750474)
chr4 (12-304)||(27903644-27903936)
chr4 (65-263)||(14697401-14697599)
chr4 (132-263)||(13513650-13513781)
chr4 (29-263)||(8336-8570)
chr4 (1-91)||(14162942-14163032)
chr4 (54-152)||(14300485-14300583)
chr4 (201-263)||(18224123-18224185)
chr4 (34-263)||(18604302-18604531)
chr4 (201-263)||(16248326-16248388)
chr4 (29-258)||(15514-15743)
chr4 (48-148)||(19635548-19635648)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-448)||(12798201-12798645)
chr7 (1-440)||(19150124-19150563)
chr7 (1-440)||(20749523-20749962)
chr7 (66-431)||(15099365-15099730)
chr7 (1-440)||(14260943-14261382)
chr7 (6-424)||(16947174-16947592)
chr7 (3-439)||(13024458-13024894)
chr7 (6-440)||(13676564-13676992)
chr7 (1-423)||(12459758-12460180)
chr7 (33-439)||(14283103-14283509)
chr7 (1-310)||(11385126-11385435)
chr7 (3-439)||(21755526-21755962)
chr7 (3-439)||(26091497-26091933)
chr7 (6-439)||(26115292-26115725)
chr7 (60-439)||(40924573-40924952)
chr7 (60-439)||(49155415-49155794)
chr7 (3-439)||(13965367-13965803)
chr7 (49-297)||(14144917-14145165)
chr7 (1-406)||(12712360-12712765)
chr7 (51-295)||(18050700-18050944)
chr7 (1-424)||(12203497-12203920)
chr7 (1-235)||(13004783-13005017)
chr7 (6-256)||(15627820-15628070)
chr7 (51-263)||(17703224-17703436)
chr7 (1-183)||(14043064-14043246)
chr7 (1-183)||(14353094-14353276)
chr7 (51-263)||(16726210-16726422)
chr7 (34-263)||(11984281-11984510)
chr7 (132-263)||(9591653-9591784)
chr7 (54-152)||(15157832-15157930)
chr7 (54-149)||(13689441-13689536)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-448)||(5325-5771)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-448)||(63252-63679)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (1-448)||(62485-62932)
scaffold0053 (201-439)||(65211-65449)
scaffold0053 (6-180)||(65040-65214)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-421)||(1024-1444)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-421)||(7915-8335)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-445)||(34484-34923)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-440)||(70260-70699)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-440)||(21738818-21739257)
chr1 (1-448)||(22015527-22015974)
chr1 (1-448)||(21742334-21742781)
chr1 (6-440)||(19857443-19857877)
chr1 (3-439)||(24096399-24096835)
chr1 (1-440)||(20832683-20833121)
chr1 (5-439)||(21961197-21961631)
chr1 (3-376)||(38909610-38909983)
chr1 (3-439)||(31536781-31537217)
chr1 (3-439)||(52988911-52989346)
chr1 (3-439)||(48426043-48426479)
chr1 (30-423)||(20297569-20297962)
chr1 (51-439)||(20074541-20074929)
chr1 (60-439)||(37680219-37680598)
chr1 (30-262)||(18273114-18273346)
chr1 (1-263)||(16379409-16379671)
chr1 (6-289)||(20853547-20853830)
chr1 (132-263)||(21228469-21228600)
chr1 (6-183)||(21044941-21045118)
chr1 (1-88)||(20921929-20922016)
chr1 (54-168)||(16347433-16347547)
chr1 (54-168)||(16354081-16354195)
chr1 (201-263)||(24784839-24784901)
chr1 (54-152)||(51330330-51330428)
chr1 (132-261)||(17041929-17042057)
chr1 (108-152)||(19109793-19109837)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-439)||(4017-4455)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (6-439)||(29777-30210)
scaffold0067 (33-331)||(64347-64645)
scaffold0067 (12-331)||(48904-49223)
scaffold0067 (12-331)||(57938-58257)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-445)||(42845-43289)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (6-440)||(533-967)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-418)||(16811-17228)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (1-440)||(5592-6028)
scaffold0523 (29-440)||(11484-11895)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (6-440)||(601-1035)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (3-440)||(37091-37528)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-425)||(23274362-23274786)
chr2 (6-439)||(19716272-19716705)
chr2 (6-439)||(19720835-19721268)
chr2 (3-439)||(20848344-20848777)
chr2 (7-439)||(23097274-23097706)
chr2 (1-428)||(28350641-28351068)
chr2 (1-345)||(21901386-21901730)
chr2 (30-295)||(12577252-12577517)
chr2 (201-263)||(22462931-22462993)
chr2 (132-263)||(23116440-23116571)
chr2 (202-263)||(23205245-23205306)
chr2 (202-263)||(23676849-23676910)
chr2 (132-263)||(24817221-24817352)
chr2 (201-263)||(11351161-11351223)
chr2 (5-90)||(24817094-24817179)
chr2 (40-91)||(22742255-22742306)
chr2 (54-152)||(10871889-10871987)
chr2 (54-152)||(24265409-24265507)
chr2 (221-263)||(24657128-24657170)
chr2 (201-263)||(24704932-24704994)
chr2 (172-256)||(19647827-19647911)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (6-440)||(590-1029)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (6-440)||(5957-6390)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-448)||(43132-43579)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (6-385)||(153699-154078)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (6-440)||(23563065-23563499)
chr5 (3-439)||(23077799-23078235)
chr5 (1-269)||(21870170-21870438)
chr5 (1-269)||(21874450-21874718)
chr5 (3-439)||(20345320-20345756)
chr5 (3-439)||(22505717-22506153)
chr5 (1-376)||(14883883-14884258)
chr5 (57-439)||(25851110-25851492)
chr5 (33-295)||(17266258-17266520)
chr5 (1-428)||(43122516-43122943)
chr5 (6-424)||(21983074-21983492)
chr5 (18-287)||(23669822-23670091)
chr5 (1-260)||(21560917-21561176)
chr5 (165-399)||(16258092-16258326)
chr5 (165-287)||(22591811-22591933)
chr5 (165-287)||(22595366-22595488)
chr5 (1-263)||(23474426-23474688)
chr5 (201-263)||(18782346-18782408)
chr5 (1-152)||(21331881-21332032)
chr5 (54-152)||(22329835-22329933)
chr5 (29-263)||(26735648-26735882)
chr5 (12-97)||(20770518-20770603)
chr5 (12-97)||(20779293-20779378)
chr5 (168-289)||(22465138-22465259)
chr5 (12-101)||(28891845-28891934)
chr5 (37-97)||(22465330-22465390)
chr5 (60-263)||(23461203-23461406)
chr5 (30-89)||(25429826-25429885)
chr5 (54-152)||(14996687-14996785)
chr5 (54-148)||(19773304-19773398)
chr5 (201-263)||(23526283-23526345)
chr5 (54-152)||(27682348-27682446)
chr5 (201-262)||(20803830-20803891)
chr5 (6-91)||(21631296-21631381)
chr5 (63-152)||(27613696-27613785)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (5-440)||(19456010-19456445)
chr6 (5-440)||(19466155-19466590)
chr6 (1-440)||(25770831-25771270)
chr6 (1-439)||(18797678-18798116)
chr6 (6-440)||(19437989-19438423)
chr6 (6-439)||(14376776-14377209)
chr6 (1-440)||(21474587-21475010)
chr6 (69-440)||(24515337-24515708)
chr6 (1-423)||(10465703-10466125)
chr6 (1-310)||(21566846-21567155)
chr6 (1-440)||(19486149-19486588)
chr6 (1-424)||(34642440-34642864)
chr6 (6-376)||(24367451-24367821)
chr6 (1-287)||(8720560-8720846)
chr6 (1-287)||(16813780-16814066)
chr6 (6-304)||(15462459-15462757)
chr6 (1-263)||(30677879-30678141)
chr6 (1-235)||(19881588-19881822)
chr6 (1-263)||(23081587-23081849)
chr6 (6-263)||(18660083-18660340)
chr6 (29-257)||(25958636-25958864)
chr6 (54-152)||(5836139-5836237)
chr6 (6-289)||(20010361-20010645)
chr6 (201-263)||(21764976-21765038)
chr6 (1-90)||(23084680-23084769)
chr6 (54-152)||(2871713-2871811)
chr6 (47-89)||(22437207-22437249)
chr6 (221-263)||(27559044-27559086)
chr6 (108-259)||(22829351-22829499)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (75-452)||(71-448)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-439)||(51804-52242)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-331)||(4172-4496)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-440)||(21928617-21929056)
chr8 (1-439)||(19985370-19985808)
chr8 (3-424)||(31413687-31414108)
chr8 (33-424)||(22027465-22027856)
chr8 (18-436)||(22374062-22374480)
chr8 (29-425)||(28984115-28984511)
chr8 (3-422)||(29300581-29301000)
chr8 (49-439)||(22054053-22054443)
chr8 (1-439)||(16268377-16268815)
chr8 (1-439)||(20391276-20391714)
chr8 (30-428)||(6606651-6607049)
chr8 (54-263)||(22043193-22043402)
chr8 (6-263)||(22523876-22524133)
chr8 (6-90)||(21970709-21970793)
chr8 (6-90)||(22004239-22004323)
chr8 (201-263)||(30310497-30310559)
chr8 (132-263)||(32603511-32603642)
chr8 (45-263)||(22421090-22421308)
chr8 (6-152)||(22990522-22990668)
chr8 (51-148)||(18860055-18860152)
chr8 (132-263)||(15536749-15536880)
chr8 (201-263)||(21391214-21391276)
chr8 (201-263)||(21780540-21780602)
chr8 (54-148)||(22126168-22126262)
chr8 (27-88)||(3274646-3274707)
chr8 (1-170)||(21671974-21672143)
chr8 (6-90)||(21982112-21982196)
chr8 (6-90)||(21998598-21998682)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (6-440)||(1670-2104)
scaffold0034 (33-377)||(11651-11995)
scaffold0034 (6-289)||(70675-70958)
scaffold0034 (132-253)||(122020-122141)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-274)||(5615-5888)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (6-425)||(98301-98720)
scaffold0020 (1-440)||(176139-176578)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (1-440)||(1873-2310)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (6-440)||(39053-39485)
scaffold0010 (132-263)||(14753-14884)
scaffold0010 (1-263)||(5244-5506)
scaffold0010 (12-97)||(180563-180648)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (6-440)||(5205-5639)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-282)||(115934-116215)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (3-439)||(1202-1638)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (33-440)||(29679-30086)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (6-440)||(20966-21400)
scaffold0222 (6-424)||(205-623)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (6-382)||(12132-12506)
scaffold0261 (6-382)||(20312-20686)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (6-315)||(260-569)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-235)||(3222-3456)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (12-440)||(7190-7618)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (5-439)||(11130-11564)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (6-439)||(8767-9200)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (6-437)||(990-1421)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (6-440)||(9492-9924)
scaffold0243 (29-85)||(23686-23742)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (6-437)||(28003-28434)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (6-439)||(8180-8613)
scaffold0235 (6-439)||(18394-18827)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (6-328)||(319507-319829)
scaffold0004 (147-440)||(325859-326151)
scaffold0004 (168-419)||(200357-200608)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (6-440)||(2783-3211)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (6-440)||(8739-9173)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (3-439)||(1322-1758)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (240-440)||(12879-13079)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (6-440)||(4927-5361)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (6-440)||(54199-54633)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (6-424)||(164119-164537)
scaffold0023 (201-263)||(30487-30549)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (3-439)||(514068-514504)
scaffold0001 (6-90)||(442154-442238)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-448)||(5746-6193)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (12-439)||(614-1041)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-310)||(258-567)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (6-298)||(798-1090)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-310)||(1561-1870)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (39-439)||(9538-9938)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (39-439)||(30077-30477)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (6-376)||(15288-15658)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (33-439)||(263379-263785)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (33-439)||(203534-203940)
scaffold0003 (203-263)||(424637-424697)
scaffold0003 (60-152)||(424748-424840)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (39-439)||(40211-40611)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (3-391)||(251820-252208)
scaffold0009 (201-263)||(229765-229827)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (141-439)||(4998-5296)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (19-439)||(17215-17635)
scaffold0348 (60-427)||(4621-4988)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (60-439)||(41888-42267)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (33-346)||(6002-6315)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-403)||(22311-22708)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (3-253)||(33087-33337)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (3-424)||(66823-67244)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (3-439)||(518-954)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (3-372)||(23638-24007)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (3-289)||(1019-1305)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (198-440)||(764-1006)
scaffold0203 (6-157)||(3769-3920)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (6-331)||(53141-53466)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (251-440)||(12112-12301)
scaffold0165 (136-214)||(12322-12400)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (1-203)||(574-775)
scaffold0585 (198-279)||(3999-4080)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (30-263)||(16351-16584)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (216-424)||(30102-30310)
scaffold0088 (3-168)||(30334-30499)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (60-225)||(2198-2363)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (172-424)||(115730-115982)
scaffold0029 (12-97)||(93618-93703)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (163-428)||(1103-1368)
scaffold0609 (30-238)||(7911-8119)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (216-351)||(12038-12173)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (1-103)||(748-850)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-103)||(25949-26051)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (54-295)||(996-1237)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-263)||(7202-7464)
scaffold0270 (1-263)||(14332-14594)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-263)||(57327-57589)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (9-91)||(67-149)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-103)||(30741-30843)
scaffold0180 (170-286)||(30895-31011)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-257)||(104561-104817)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (342-440)||(19023-19121)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (206-439)||(11981-12214)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (7-263)||(1141-1397)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (48-263)||(240-455)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (132-259)||(3736-3863)
scaffold0130 (213-263)||(7704-7754)
scaffold0130 (51-91)||(7542-7582)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-263)||(18174-18436)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-263)||(216133-216395)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (1-190)||(20-208)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (3-128)||(17703-17828)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (27-263)||(13213-13449)
scaffold0282 (1-88)||(9835-9922)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (175-259)||(36161-36245)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-152)||(11468-11619)
[»] scaffold0605 (2 HSPs)
scaffold0605 (151-289)||(1583-1721)
scaffold0605 (36-101)||(1771-1836)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (201-263)||(10071-10133)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (201-263)||(208-270)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (201-263)||(13037-13099)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (201-263)||(17489-17551)
scaffold0044 (60-148)||(3865-3953)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (132-263)||(613-744)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (132-263)||(117-248)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (132-263)||(9195-9326)
scaffold0018 (5-90)||(9068-9153)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-91)||(5589-5679)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (201-263)||(11269-11331)
scaffold0177 (201-263)||(14954-15016)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (201-263)||(10152-10214)
scaffold0080 (201-263)||(12807-12869)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (29-263)||(48059-48293)
scaffold0075 (29-258)||(55212-55441)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (69-263)||(139391-139585)
scaffold0008 (225-263)||(179-217)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (30-91)||(2252-2313)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (6-91)||(15911-15996)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (6-190)||(468-652)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (202-261)||(445-504)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (60-263)||(5327-5530)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (132-263)||(36827-36958)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (201-263)||(13945-14007)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (6-128)||(2453-2575)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (201-263)||(369-431)
scaffold0273 (33-91)||(541-599)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (221-263)||(171447-171489)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (40-89)||(130-179)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (3-168)||(13769-13934)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (6-71)||(16241-16306)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (40-89)||(2732-2781)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (40-152)||(15351-15463)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (231-263)||(17920-17952)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (231-263)||(4498-4530)


Alignment Details
Target: scaffold0108 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50696 - 50249
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50696 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 50597  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50596 gcgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcatagatggaatgatgagaggaggcccaagaggaga 50497  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50496 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcaga 50397  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50396 aaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacccagcctaagaaggt 50297  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  50296 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaa 50249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 16825217 - 16825656
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16825217 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 16825316  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16825317 gcgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgcccctcctgacaagggtaagtagagattgaaagatgagaggaggcccaagatgaga 16825416  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  16825417 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaa 16825516  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16825517 aaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatcagtttgcagtgtacgcagcctaagaaggt 16825616  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16825617 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 16825656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12181530 - 12181099
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12181530 attggctatcagaaaataaggaacttctctgaattggtaagcggctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 12181431  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12181430 gaggcaagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagtagaggttaaatgatgagaggaggaccaagaggagagatgc 12181331  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12181330 tcctactgacattttttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagttgtggtcggaaagga 12181231  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12181230 cacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 12181131  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacg 437  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  12181130 ccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacg 12181099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35983372 - 35982933
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  35983372 gggctattggttatcataagataagaaatttttctgaattggtaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtga 35983273  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | ||||| |||||||| |||||| ||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35983272 gtgcagaggtaagggacagcagagttgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 35983173  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  35983172 gatgctcctactgtgattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacaga 35983073  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35983072 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcattgtacgcagcctaagaaggt 35982973  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  35982972 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaa 35982933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17494836 - 17494399
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17494836 attggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 17494737  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaac----aatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagag 201  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||  |    || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17494736 gagccaagggacaacaaagtcgttcgaagccatatagtgctcctgctggctgagaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagag 17494637  T
Q  202 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaa 301  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17494636 atgctcatactgagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgc-tcaggtgtggtcagaa 17494538  T
Q  302 aggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtt 401  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||    
T  17494537 aggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggtt 17494438  T
Q  402 aggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  17494437 aggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 17494399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 14290470 - 14290909
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  14290470 gggctattggttatcaaaagataagaaatttttctgaattggaaagcagttgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtga 14290569  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14290570 gcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 14290669  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  14290670 gatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacaga 14290769  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| || |   | || || || ||||| || ||| |||| | | |||||||||||||    
T  14290770 aaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcctaagaaggt 14290869  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14290870 tcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 14290909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Original strand, 12357476 - 12357904
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12357476 tatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggta 12357575  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    ||||||| |||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12357576 agggacatcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagtagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatactcctgc 12357675  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 311  Q
    ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12357676 tgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaca 12357775  T
Q  312 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 411  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  12357776 ttagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtg 12357875  T
Q  412 gcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  12357876 gtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 12357904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31942089 - 31941655
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31942089 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 31941990  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |  |||| ||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31941989 ggagcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgc 31941890  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  31941889 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggga 31941790  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||| ||  ||||||| || || | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31941789 cacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacgcagccgaagaaggttagga 31941690  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31941689 ctggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 31941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 31692128 - 31692562
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  31692128 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 31692227  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |  |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31692228 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgc 31692327  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    | || |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  31692328 ttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggttagaaggga 31692427  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31692428 cacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttagga 31692527  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  31692528 ctggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaa 31692562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 12857434 - 12857873
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||  |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12857434 gggccattggctaccaaaagataagaattttttttgatttggtgagtagctgtagaatctatgaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 12857533  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  12857534 gcgtagaggcaagggacagtagagtcgtccaaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacaaggactgaatgatgagaggaggcctaaaaggaga 12857633  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| | |||||   ||    
T  12857634 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaagggccacatgagtaatgtatgtgactgtgatgagaagaagtgtttccgatgtggaaaga 12857733  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||   ||| ||| || |||||| | || |||||||||||||| |   | || ||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||     
T  12857734 aaggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgtagtgcaggaagcctaagaaggc 12857833  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12857834 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 12857873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 11958121 - 11958557
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11958121 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcgggatttatgaggaagacacaaaagttcattacaaggtgatgagtgaga 11958220  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||   || || || ||||| |||||| |||| || || |||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  11958221 ggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagaatgaatgatgataggaggcttaagaggagaga 11958320  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  11958321 tgctcctgctgaaattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaa 11958420  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  11958421 ggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggcta 11958520  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  11958521 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 11958557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17189565 - 17189256
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17189565 gggctattggataccagaagatcagaaacttctttgagttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 17189466  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  17189465 ccgcagaggcaagggccagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctaacaagggaaagcagagatttaatgatgagaggaggtccaagaggaga 17189366  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17189365 gatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 17189266  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  17189265 aaggacacac 17189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 16326647 - 16327085
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  16326647 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 16326746  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||| || ||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16326747 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaaaaggtgaatgatgataggagacccaagaggagaga 16326846  T
Q  203 -tgctcctactgata-ttgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
     ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||    
T  16326847 ctgctcctgctgagacttgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaga 16326946  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  16326947 agggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggt 16327046  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  16327047 tagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgca 16327085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 18131290 - 18131724
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||  |||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  18131290 attgggtatcagaagataagaattttctctgatatggtgagtagctgtaggatatatgaagaagacactaaagctcattacaaagtgatgagtgaacgga 18131389  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || ||||| |||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18131390 gaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagagactgaataatgagaggaggcccaagaggagagatgc 18131489  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  ||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18131490 tcctgttgagattgattgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 18131589  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||| | |||| | ||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| || |  ||||||||||| |    
T  18131590 cacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatattagttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaa 18131689  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || |||||| || | ||| ||||||||    
T  18131690 ccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaa 18131724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Original strand, 16831484 - 16831904
Alignment:
Q  19 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 118  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16831484 agataagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 16831583  T
Q  119 acagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 218  Q
     ||||||| |   ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  16831584 gcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 16831683  T
Q  219 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 317  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   ||||      
T  16831684 gtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcg 16831782  T
Q  318 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 417  Q
    || || |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  16831783 gactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaagg 16831882  T
Q  418 tgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  16831883 tgtttgctttgactggtacgca 16831904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24190494 - 24190186
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  24190494 gggctattggataccagaagatcagaaacttctctgatttggtaagtagctgtagaatctatgaagaggacacgaaagctcattacaaggtgatgactga 24190395  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || ||||||||||  || |||||||||   |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24190394 ccgcagaggcaaggc-cagcagagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggtacaagaggaga 24190296  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24190295 gatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 24190196  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  24190195 aaggacacac 24190186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10409157 - 10408721
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||   |||||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  10409157 gctattggatatcagcagatcagagttttttctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 10409058  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  10409057 ggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 10408958  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  10408957 tgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 10408858  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  10408857 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 10408758  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  10408757 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 10408721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47127133 - 47126697
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  47127133 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgaga 47127034  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || ||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  47127033 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 47126934  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  47126933 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 47126834  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  47126833 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 47126734  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  47126733 gaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgca 47126697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 419
Target Start/End: Original strand, 16384342 - 16384728
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  16384342 tctgatttggtaagttgctgtaggatctatgaggaggacagcaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 16384441  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  16384442 agccatacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 16384541  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | |||||| ||||||||    
T  16384542 tggcgagaaagtccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtgg 16384640  T
Q  332 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtg 419  Q
     ||  |||| ||||| || |  || || || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16384641 tgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtg 16384728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28757508 - 28757072
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  28757508 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 28757409  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  28757408 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 28757309  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  28757308 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 28757209  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  28757208 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 28757109  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  || || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  28757108 gaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 28757072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15230789 - 15230371
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15230789 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15230690  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15230689 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15230590  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15230589 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15230490  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15230489 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15230390  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15230389 caggtggaaaggtgtttgc 15230371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15236657 - 15236239
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   |    
T  15236657 attggttatcagaagatcagacaattttctgagttggggagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagaaga 15236558  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |   ||| || |||||  |||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  15236557 ggaacaaaggccaacaaggtcgtcctaagccctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattaaatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgt 15236458  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||     
T  15236457 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaaggg 15236358  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | |||||||||||| |  ||    
T  15236357 catacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcaga 15236258  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15236257 caggtggaaaggtgtttgc 15236239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 440
Target Start/End: Original strand, 11949107 - 11949302
Alignment:
Q  245 ccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgc 344  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || ||  ||||||||    
T  11949107 ccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgc 11949206  T
Q  345 tacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    || |||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  11949207 tataactgcaatgaggaaggtcacatcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 11949302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13945165 - 13944921
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  13945165 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 13945066  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  13945065 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 13944966  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  13944965 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 13944921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 8744378 - 8744622
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  8744378 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 8744477  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  8744478 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 8744577  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8744578 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 8744622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 13317512 - 13317840
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||   |    
T  13317512 attggatatcagaagatcataaatttctcggagttggtgagcagttgtaggatatatgaggaggatacaaaggctcactataaggcgatgagcgagaaga 13317611  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |    ||||| ||    |||||    ||||| || ||||| |||||| |||| || || || | ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  13317612 ggaataagggccagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaatattaaatgatgagaggaggcctagggggagagatgc 13317711  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||     
T  13317712 tcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcaaaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcaaaaaggt 13317811  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtgggga 334  Q
    ||   |||||  ||||| |||||||||||    
T  13317812 catgttttagcggattgcaagcgtgggga 13317840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 399
Target Start/End: Original strand, 2037014 - 2037248
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  2037014 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 2037113  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaagg 364  Q
    |  | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | ||||||||    
T  2037114 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 2037213  T
Q  365 tcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 399  Q
    |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  2037214 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2037248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 399
Target Start/End: Original strand, 2040755 - 2040989
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  2040755 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 2040854  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaagg 364  Q
    |  | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | ||||||||    
T  2040855 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 2040954  T
Q  365 tcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 399  Q
    |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  2040955 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2040989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 2245610 - 2245712
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2245610 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctttaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 2245709  T
Q  101 gcg 103  Q
    |||    
T  2245710 gcg 2245712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14039773 - 14039539
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  14039773 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 14039674  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaagg 364  Q
    |  | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | ||||||||    
T  14039673 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 14039574  T
Q  365 tcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 399  Q
    |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  14039573 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 14039539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 12508503 - 12508758
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  12508503 gggccattggatatcagaagatctgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgagaaggatacgaaagctcattacaaggctatgagtga 12508602  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | | ||| ||| | || || ||||||  |||||| || ||||| || ||| | || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||  | ||      
T  12508603 gaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctccggctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaagaggcccataaagaag 12508702  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 256  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| |   ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12508703 gatactcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagaaaaaggtcataagagtaa 12508758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 15008684 - 15008783
Alignment:
Q  163 agcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 262  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15008684 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagagaggccacaagagtaatgtttg 15008783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 12843052 - 12843314
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||    
T  12843052 gggcaattggttaccagaagattcgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatga 12843151  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | || ||| || || |||||||||  |||||  |||||||| |||||| | || || || |||||| ||| |||||||| | |||| | || || |    
T  12843152 gcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagctttatagtgctcctgctgataagggcaaacagagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaa 12843251  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12843252 gatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 12843314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 263
Target Start/End: Original strand, 16803952 - 16804158
Alignment:
Q  57 atttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaaca 156  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||| | |    
T  16803952 atttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgata 16804051  T
Q  157 atggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 256  Q
    | || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  16804052 agggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 16804151  T
Q  257 tgtttgt 263  Q
    |||||||    
T  16804152 tgtttgt 16804158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15262806 - 15262549
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||  |||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  15262806 attggttactagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcgga 15262707  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
     |||||| |  ||||| ||||||  |||||| || |  || |||||| | || ||||| || ||| |||||||||||| |||||  |  |||| ||||||    
T  15262706 aaggcaaagatcaacaaagtcgtccaaagccttacaacgctcctgctgataagggtaaacaaagaatgaatgatgagaggaggcgtagaaggaaagatgc 15262607  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  |||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  15262606 tcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggctataagagtaatgcttgt 15262549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 23079166 - 23079228
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23079166 gatgctcctgctgtgattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 23079228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11861403 - 11861272
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |    
T  11861403 aagccctatagtgcccctgctgataaaggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctatttcaatt 11861304  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11861303 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11861272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Original strand, 15713061 - 15713176
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||     
T  15713061 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 15713160  T
Q  154 acaatggtaagcagag 169  Q
    | || || ||||||||    
T  15713161 ataaagggaagcagag 15713176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 23414870 - 23415001
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  23414870 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaact 23414969  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23414970 atggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23415001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3689068 - 3688954
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||     
T  3689068 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 3688969  T
Q  154 acaatggtaagcaga 168  Q
    |||| ||||| ||||    
T  3688968 acaagggtaaacaga 3688954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6603863 - 6603757
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  6603863 tgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 6603764  T
Q  151 ctaacaa 157  Q
    || ||||    
T  6603763 ctgacaa 6603757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10008725 - 10008627
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  10008725 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 10008627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10909335 - 10909237
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  10909335 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 10909237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15066052 - 15065990
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15066052 gatgctcctgctgcgattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15065990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 89
Target Start/End: Original strand, 23079012 - 23079054
Alignment:
Q  47 cagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23079012 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 23079054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 10416994 - 10417079
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10416994 tatcagaagatcagaattttctcagaactggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 10417079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 428
Target Start/End: Original strand, 13028640 - 13028721
Alignment:
Q  347 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||    
T  13028640 caactgcaaagaggaaggacatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaaggtgtttgcttta 13028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Original strand, 15459410 - 15459459
Alignment:
Q  40 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15459410 tggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatacaaagactcattacaag 15459459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 448
Target Start/End: Original strand, 14993088 - 14993524
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993088 tatcagaagataagaaacttttctgatttggtaagtagttgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 14993187  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14993188 agggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctac 14993287  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14993288 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 14993387  T
Q  312 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 411  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14993388 ttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtg 14993487  T
Q  412 gcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  14993488 gcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaa 14993524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15267333 - 15266899
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15267333 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttgataagtagctgcaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 15267234  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15267233 gaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 15267134  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15267133 tcctacgaatattgtttgcttcaagtgtgatgagaagggccataagagtaatgtttgtgacagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 15267034  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15267033 cacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttagga 15266934  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15266933 ccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaa 15266899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18260003 - 18259629
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18260003 gggctattggttactagaaaataagaaacttctctgatttagtaagtagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtgatgagtga 18259904  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |    
T  18259903 gcgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggaca 18259804  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18259803 gatgctcctactaatattgtttgctttaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 18259704  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagtt 375  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18259703 aaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagtt 18259629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15073921 - 15073486
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15073921 gggctatcggctaccaaaagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 15073822  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  15073821 gcgtagaggtaagggacagctgagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 15073722  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  15073721 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaaga 15073622  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| | | ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||  |||| | | ||||||||||||     
T  15073621 aaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggc 15073522  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtac 436  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  15073521 tctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtac 15073486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20893591 - 20893155
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  20893591 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggtaaacagttgcaggatttacaaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 20893492  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  20893491 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 20893392  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  20893391 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20893292  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || || || |||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  20893291 ggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatcagttcgcagtgtactgagccgaagaaggtta 20893192  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20893191 gaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 20893155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16151193 - 16150848
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16151193 attgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 16151094  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || |||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16151093 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 16150994  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16150993 tcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 16150894  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaact 351  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  16150893 cacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataact 16150848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16155339 - 16154994
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16155339 attgggtatcagaagatcatgaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 16155240  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || |||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16155239 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 16155140  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16155139 tcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 16155040  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaact 351  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  16155039 cacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataact 16154994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 3261506 - 3261942
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  3261506 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 3261605  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3261606 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 3261705  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  3261706 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 3261805  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  3261806 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 3261905  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  3261906 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 3261942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 11203944 - 11204380
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  11203944 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 11204043  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || ||| |||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11204044 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 11204143  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  11204144 tgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 11204243  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| | ||| | | || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  |||| || |||| ||    
T  11204244 ggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaaaaaggcta 11204343  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  11204344 gaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgca 11204380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7357827 - 7357406
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||  |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||     
T  7357827 gctattgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaagataatgagtgaga 7357728  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || | ||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  7357727 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 7357628  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  7357627 tgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 7357528  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  7357527 ggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 7357428  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    | ||  |||| |||||||||||    
T  7357427 gaactagtgggaaggtgtttgc 7357406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 29450247 - 29450685
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| |  || || |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29450247 gggctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtga 29450346  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | |||||| |||||||||    
T  29450347 gaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcctaagaggaga 29450446  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||    
T  29450447 gatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgataggaagtgtttcaggtgtggtcaga 29450546  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||  ||||| |  |||| ||||||      
T  29450547 agggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagac 29450646  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  29450647 tagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 29450685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 427
Target Start/End: Original strand, 44658581 - 44659002
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  44658581 attggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 44658680  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||  |||| || |||||||   ||  | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  44658681 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagatgggtcatgataggaggcccaagaggagagatgc 44658780  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  44658781 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 44658880  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  ||| ||||||| |||||  ||||| |  | || ||||||  ||| |    
T  44658881 cacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttcacagtgtcctgaaccgaagaagactagaa 44658980  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgcttt 427  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  44658981 ctggtggaaaggtgtttgcttt 44659002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8709239 - 8708953
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8709239 gggccattggttatcagaagattaggcaattttttgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggatatcaaagctcattacaaggttatgagtga 8709140  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   ||| || || ||  |||||   ||||  |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| | |    
T  8709139 gcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagctctatagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaata 8709040  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||||||||    
T  8709039 gatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgaaaagaagtgcttc 8708953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13879642 - 13879413
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  13879642 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 13879543  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      ||||| || ||||| |||| | |||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| |||    
T  13879542 cgaagccctacagtgctcctgatgacaaagggtagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgtttctactgagattgtttgttacaa 13879443  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13879442 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgt 13879413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 51603552 - 51603796
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  51603552 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 51603651  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  51603652 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 51603751  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  51603752 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 51603796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 53750230 - 53750474
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||      
T  53750230 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccga 53750329  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  53750330 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 53750429  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  53750430 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 53750474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27903936 - 27903644
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   ||    |    
T  27903936 tatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtaagatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaagaggaata 27903837  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    |||| ||    |||||    ||||| || | ||  |||||| |||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||      
T  27903836 agggccagagtagtcgcccgaagccctacaatgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgctcctgt 27903737  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  27903736 tgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaagg 27903644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14697599 - 14697401
Alignment:
Q  65 agaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaag 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||| | | ||||||||| || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || ||||||    
T  14697599 agaggataccaaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaag 14697500  T
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14697499 caaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctactgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 14697401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13513781 - 13513650
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||| | | || || ||||||||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  13513781 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 13513682  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  13513681 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 13513650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8570 - 8336
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  8570 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 8471  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||||| || ||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  8470 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctataaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 8371  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8370 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14163032 - 14162942
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  14163032 gggcaattggttaccagaagatccgaaatttttcagagctggtgagcagttgcaggatttatgaaaaggatactaaggctcactacaaggt 14162942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 14300485 - 14300583
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  14300485 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 14300583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 18224123 - 18224185
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18224123 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagtgtaatgtttgt 18224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 263
Target Start/End: Original strand, 18604302 - 18604531
Alignment:
Q  34 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  | | |||| | | || | ||||| || ||||||||    |    
T  18604302 ctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaaggttgttaatgagagga-agactaagggccagcagagtcgcccta 18604400  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    |||| |||| |||||||||| | || || ||||||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || ||    
T  18604401 agccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaactg 18604500  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18604501 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18604531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 16248326 - 16248388
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||| ||||| |||   |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16248326 gatgctccaactgagattacatgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 16248388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 15514 - 15743
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  15514 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgt 15613  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||| | || ||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  15614 cctaagacttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 15713  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 258  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15714 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 15743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19635648 - 19635548
Alignment:
Q  48 agttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgccc 147  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||| ||   |||||||| |||||||    
T  19635648 agttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagccgtacagtgccc 19635549  T
Q  148 c 148  Q
    |    
T  19635548 c 19635548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 12798201 - 12798645
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12798201 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtgatgagtga 12798300  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12798301 gcgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggctcaagaggaga 12798400  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12798401 gatgctcatactgatattgtttgtttcaagtgtgg---aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 12798497  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  12798498 aaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggc 12798597  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  12798598 taggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaa 12798645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19150563 - 19150124
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19150563 gggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 19150464  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19150463 gcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 19150364  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19150363 gatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 19150264  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  19150263 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggc 19150164  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||| |||||| || || ||||| || ||| ||||||||    
T  19150163 taggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaa 19150124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20749962 - 20749523
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20749962 gggctattggttatcaaaagataagaaacttttccgaattggtgagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 20749863  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20749862 gcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcccctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 20749763  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20749762 gatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtgtgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 20749663  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  20749662 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggc 20749563  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||| |||||| || || ||||| || ||| ||||||||    
T  20749562 taggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaa 20749523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 66 - 431
Target Start/End: Original strand, 15099365 - 15099730
Alignment:
Q  66 gaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagc 165  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  15099365 gaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgacgccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagc 15099464  T
Q  166 agagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtga 265  Q
    |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15099465 agaggttaaatgatgggaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtga 15099564  T
Q  266 ccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggt 365  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||    
T  15099565 tagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggt 15099664  T
Q  366 catatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaact 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15099665 catatcagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaact 15099730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 14260943 - 14261382
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14260943 gggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatcagtga 14261042  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14261043 gcgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagtagagactgaatgatgagaggaggcctaaggggaga 14261142  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
     ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  14261143 tatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgcgtcatcgagatgagaagaagtactttaggtgtagtcaga 14261242  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  14261243 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtttatgcagcctaagaaggt 14261342  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  14261343 taggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaa 14261382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Original strand, 16947174 - 16947592
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16947174 attgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaa 16947273  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | || |||||||| |||||||||   || || || |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16947274 ggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 16947373  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||    
T  16947374 tccagttgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaagga 16947473  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||| ||| |    
T  16947474 cacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaa 16947573  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    | ||||| || ||||||||    
T  16947574 ccggtgggaaagtgtttgc 16947592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 13024894 - 13024458
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  13024894 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 13024795  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   || || || ||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13024794 ggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 13024695  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||   || |||||| ||| || ||||||||||||  ||||    
T  13024694 tgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttatggtagatatgagaggaaatgtttcaggtgtggttagaaa 13024595  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  13024594 ggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggcta 13024495  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  13024494 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 13024458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13676992 - 13676564
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||      |    
T  13676992 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgtgt------a 13676899  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13676898 gaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 13676799  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  13676798 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggacagaaggga 13676699  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||| | || || ||||||||||| |    
T  13676698 cacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaa 13676599  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  13676598 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 13676564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12460180 - 12459758
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12460180 gggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 12460081  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | |||| |||| || ||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12460080 gaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggaga 12459981  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| ||    
T  12459980 gatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcaga 12459881  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  12459880 agggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggt 12459781  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttg 423  Q
     ||||| || || || |||||||    
T  12459780 caggaccggagggaaagtgtttg 12459758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 14283103 - 14283509
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||    |||||||| ||||||||    |    
T  14283103 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccga 14283202  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  14283203 agccgtatagtgcccctgctgataagggtaagcagagactcaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtg 14283302  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  14283303 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtgg 14283401  T
Q  332 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaact 431  Q
     ||  |||| || || |||| |||||| || |||||||||||  |  ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  14283402 tgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgact 14283501  T
Q  432 cgtacgca 439  Q
     |||||||    
T  14283502 ggtacgca 14283509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 11385126 - 11385435
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11385126 gggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatgatgagtga 11385225  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| || || |||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||| |||| || |||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11385226 gcggaggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggaga 11385325  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11385326 gatgctcctgctgagatagtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 11385425  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  11385426 aaggacacac 11385435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21755962 - 21755526
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||| | |||||||||     
T  21755962 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacatcaaagctcattacaagataatgagtgaga 21755863  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  21755862 ggaggggtaagggacaacaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaatatgagtgatgacatgaggcctaagaggagaga 21755763  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||     
T  21755762 tgctccctctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaag 21755663  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| || ||  ||||| |  |||| ||||||||||    
T  21755662 ggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagctcacagtgtcctgagccgaagaaggtta 21755563  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21755562 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 21755526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 26091497 - 26091933
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  26091497 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 26091596  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26091597 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 26091696  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  26091697 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 26091796  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  26091797 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 26091896  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  26091897 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 26091933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 26115292 - 26115725
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  26115292 attggatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 26115391  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | || |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26115392 ggggtaagggataacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 26115491  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  26115492 tccggctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 26115591  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| ||| |  ||||| |  | || ||||||  ||| |    
T  26115592 cacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaa 26115691  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  26115692 ctggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 26115725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 439
Target Start/End: Original strand, 40924573 - 40924952
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  40924573 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 40924672  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | |||||||   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40924673 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 40924772  T
Q  260 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 359  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  40924773 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 40924872  T
Q  360 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  40924873 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 40924952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 49155794 - 49155415
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  49155794 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 49155695  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | ||||||||  ||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49155694 gaaagcagaggatgggtgaggataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 49155595  T
Q  260 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 359  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  49155594 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 49155495  T
Q  360 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  49155494 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 49155415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 13965367 - 13965803
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||| || | |||||||||     
T  13965367 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgttggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccagataatgagtgaga 13965466  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13965467 ggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 13965566  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  13965567 tgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 13965666  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  13965667 ggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 13965766  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  13965767 gaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgca 13965803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14145165 - 14144917
Alignment:
Q  49 gttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  14145165 gttgcaggatctatgaggagggcaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 14145066  T
Q  149 tgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 248  Q
    |||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  14145065 tgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccatataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtatggcgagaaaggccac 14144966  T
Q  249 aagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 297  Q
    |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  14144965 aagagtaacgtttgt-accaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtc 14144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 12712360 - 12712765
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||   ||| ||| ||| |||| || || || || ||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12712360 gggccattggctatcagaagattagaactctttatgagttgataagtagctgcagaatctatgaggaagattcaaaggctcattccaaggtgatgagtga 12712459  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || || |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||   || || |||||  || ||||||||||||  || |||||| | |||    
T  12712460 acggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaagggaaga 12712559  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||  |||||  ||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12712560 gacactcctgttgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacaga 12712659  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | || |||   |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||||| |||  |||| || || |  ||||||||    
T  12712660 agggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatggggagggtcatatcaattctcagtgcactcaacggaagaaggt 12712759  T
Q  401 taggac 406  Q
    ||||||    
T  12712760 taggac 12712765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 18050700 - 18050944
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || ||||||||||| ||      
T  18050700 tgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgctccga 18050799  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || |||||||| || ||||| |||||    
T  18050800 ctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaa 18050899  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18050900 gagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 18050944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 12203497 - 12203920
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | | |||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||    
T  12203497 gggccattggttatcagaagatcaaacaattttctgagttagtgagtagctgtagaatctatgaggaggataccaaagttcattataaggttatgagtga 12203596  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |   ||   ||  || || ||  |||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  12203597 gaagaggaacagaggccagcaaggtcgtcctaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 12203696  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| |||| |||  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  12203697 gatgttcctgctgtgattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaaga 12203796  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||  || |||||||||| ||| |   | || ||||||||| | || ||| | || | | ||||||||||||     
T  12203797 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtgatgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggc 12203896  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    |  ||||||||| |||||||||||    
T  12203897 tcagacaggtggaaaggtgtttgc 12203920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13005017 - 13004783
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |   ||||||| ||| |||| || || || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13005017 gggccattggttatcagaagatcaggattctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtga 13004918  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || || |||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||  ||| || |||||  || ||||||||||||  || |||||| | |||    
T  13004917 acggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggcaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaagggaaga 13004818  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 235  Q
    ||  ||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  13004817 gacactcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 13004783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15628070 - 15627820
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||||||   |||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |    
T  15628070 attggatatcagaagatccaaaaaatttctgaattggtaagtagttgccggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagagga 15627971  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
     | | ||| | ||||| ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || ||||| || ||  ||||||||||||||||||| |  | || |||| |    
T  15627970 aaagtaagagtcaacaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgagaagaggcctagaaagaaagatac 15627871  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 256  Q
    |||| ||||  ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15627870 tcctgctgaagttgtttgctacaactgtggtgagaaaggccacaagagtaa 15627820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 263
Target Start/End: Original strand, 17703224 - 17703436
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || ||||||||||||     
T  17703224 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgccccta 17703323  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  17703324 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 17703423  T
Q  251 gagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||||||    
T  17703424 gagtaatgtttgt 17703436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14043246 - 14043064
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||    
T  14043246 gggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatga 14043147  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgaga 183  Q
    ||| | || ||| || ||||||||| ||  |||||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  ||||||||    
T  14043146 gcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgaga 14043064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14353276 - 14353094
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||    
T  14353276 gggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgatctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatga 14353177  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgaga 183  Q
    ||| | || ||| || ||||||||| ||  |||||| |||||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  ||||||||    
T  14353176 gcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgaga 14353094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 263
Target Start/End: Original strand, 16726210 - 16726422
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    || || || |||||||||     
T  16726210 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttaaagtgccccta 16726309  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  16726310 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaa 16726409  T
Q  251 gagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||||||    
T  16726410 gagtaatgtttgt 16726422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11984510 - 11984281
Alignment:
Q  34 ctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaa 133  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||    
T  11984510 ctgatttggttaacagttgtaggatctacgaagaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaa 11984411  T
Q  134 gccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgt 233  Q
    ||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| |   |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |||    
T  11984410 gccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgt 11984311  T
Q  234 ggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11984310 ggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11984281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9591784 - 9591653
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||| | | || || ||||||||| ||  |||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  9591784 aagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaact 9591685  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  9591684 gtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 9591653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 15157832 - 15157930
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  15157832 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 15157930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13689536 - 13689441
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccct 149  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||    
T  13689536 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgtacagtgcccct 13689441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5771 - 5325
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5771 gggctattggttatcagaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctacaagatttatgaagaggataccaaagctcattacaaagtgatgagtga 5672  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5671 gcatagagtcaagggacagcagagtcatcggaagccgtacagtgcccctactgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcc-aagaggaga 5573  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5572 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 5473  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  5472 aaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaagtc 5373  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  5372 taggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaa 5325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 63252 - 63679
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  63252 gggctattggttatgagaagataagaaacttttctgaattggtaagtagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 63351  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||                    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  63352 gcgtagaggcaaggtacagcagagtc--------------------cctgctgacaagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggaga 63431  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  63432 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgataaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcaga 63531  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  63532 aaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggt 63631  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  63632 taggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaa 63679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 62485 - 62932
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  62485 gggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgagttggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 62584  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  62585 gcgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 62684  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  62685 gatgctcctactgatattgtttaattcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 62784  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  62785 aagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaagt 62884  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  62885 taggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaa 62932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 439
Target Start/End: Original strand, 65211 - 65449
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  65211 gatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcaga 65310  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | | |||||||| | || ||  ||||||| || || |   | |||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||||||||    
T  65311 aaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggt 65410  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||| ||||| || |||| ||| || ||| |||||||    
T  65411 taggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgca 65449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 65040 - 65214
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  65040 attggttatcagaaaatcagaaatttctctgagttggtgagtagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaa 65139  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatg 180  Q
    |    || ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||    
T  65140 ggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcccctgctgataagggcaagcagagactgaatgatg 65214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 1024 - 1444
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1024 gggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 1123  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1124 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggaga 1223  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1224 gatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 1323  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1324 aaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggt 1423  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtt 421  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  1424 taggacaggtggtaaagtgtt 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8335 - 7915
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8335 gggctattggttattcgaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 8236  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8235 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctcctgctgacaagggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggaga 8136  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8135 gatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 8036  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8035 aaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggt 7936  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtt 421  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  7935 taggacaggtggtaaagtgtt 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34923 - 34484
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34923 attggttattagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 34824  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34823 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagctgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcaaaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 34724  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34723 tcctactgacattgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaagga 34624  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34623 cacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttagga 34524  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagt 445  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  34523 caggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagt 34484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 70699 - 70260
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  70699 gggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtga 70600  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  70599 gcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 70500  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  70499 gatgctcctactgagattatttgctttaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacaga 70400  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70399 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggt 70300  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  70299 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 70260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 21738818 - 21739257
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21738818 gggctattggctatcaaaaggtaaggaatttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 21738917  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21738918 ccgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagcgcccatgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 21739017  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21739018 ggtgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 21739117  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21739118 aaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacggagcctaagaaggt 21739217  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  21739218 taggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaa 21739257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 22015527 - 22015974
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22015527 gggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 22015626  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22015627 gcgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagaataaatgatgagaggaggccaaagaagaga 22015726  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22015727 gatgctcctacaaatattgtttgattcaagtgtggagaaaaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 22015826  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  22015827 aaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatattagtttgcagtgtacgcagccgaagaaggt 22015926  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22015927 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaa 22015974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 21742334 - 21742781
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21742334 gggctattggttatgagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 21742433  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||   || ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21742434 gcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctactgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 21742533  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21742534 gatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 21742633  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21742634 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggt 21742733  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  21742734 taggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaa 21742781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19857877 - 19857443
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19857877 attggctatcagaagattagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaagatctatgaagaggatactaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgca 19857778  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19857777 gaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 19857678  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19857677 ttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 19857578  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||| ||    
T  19857577 cacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatga 19857478  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  19857477 ccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 19857443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 24096399 - 24096835
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24096399 gctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgacgagtgagc 24096498  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24096499 gaagaagtaagggacaacagagtcgtcctaaaccttatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 24096598  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  24096599 tgctcctgttgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaa 24096698  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  24096699 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagccgaagaaggcta 24096798  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  24096799 gaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 24096835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 20832683 - 20833121
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20832683 gggctattggataccagaaaattagaaacttttcgaagttggtgagcagctgtagaatctatgaataagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 20832782  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgt--taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagagga 198  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||   | |||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20832783 ccgtagaggcaagggacagcagagtcgtcctaaa---catatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagagga 20832879  T
Q  199 gagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcg 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| || |||||||||||||     
T  20832880 gagatgctcctgttgatattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtca 20832979  T
Q  299 gaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaag 398  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||    
T  20832980 gaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaag 20833079  T
Q  399 gttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  20833080 gttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 20833121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21961631 - 21961197
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 104  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21961631 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgaattggtaaacagatgcataatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 21961532  T
Q  105 agaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 204  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| ||| || |||| || |||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21961531 agaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatg 21961432  T
Q  205 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21961431 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 21961332  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||     
T  21961331 acacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgccctgagccgaagaaggttaga 21961232  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21961231 actggtggaaaggtatttgctttgactggtacgca 21961197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 376
Target Start/End: Original strand, 38909610 - 38909983
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  38909610 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtggga 38909709  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   || || || ||||| |||||| |||| || ||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  38909710 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 38909809  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  38909810 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 38909909  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttc 376  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  38909910 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttc 38909983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 31536781 - 31537217
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  31536781 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagatgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 31536880  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  31536881 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 31536980  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |  || |||||||||||||||| |||     
T  31536981 tgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaag 31537080  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| ||||| |||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  31537081 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 31537180  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  31537181 gaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgca 31537217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 52989346 - 52988911
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||     
T  52989346 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaaa-taatgagtgaga 52989248  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| || | ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  52989247 ggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 52989148  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||     
T  52989147 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaag 52989048  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  | ||| |  | || ||||||||||    
T  52989047 ggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacaatgtcctgaaccgaagaaggtta 52988948  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  52988947 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 52988911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 48426479 - 48426043
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  48426479 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 48426380  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  48426379 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 48426280  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  48426279 tgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 48426180  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  48426179 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 48426080  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  48426079 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 48426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20297962 - 20297569
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||     
T  20297962 ttttctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtc 20297863  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      ||||| || ||||| ||| || |||| || || ||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  20297862 ctaagccttacagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaa 20297763  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 329  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||   ||| ||| || ||||||    
T  20297762 gtgtggtgagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgt 20297663  T
Q  330 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 423  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| |||||| |  || | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20297662 ggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttg 20297569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 439
Target Start/End: Original strand, 20074541 - 20074929
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctg 150  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || |||||  |||    
T  20074541 tgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctg 20074640  T
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    || |||| || |||||||   ||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20074641 ctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcttaagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaa 20074740  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaac 350  Q
    ||| |||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20074741 gagcaatgtttgtagtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaac 20074840  T
Q  351 ttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||| |  || |||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  20074841 tgcaatggagagggtcatatcaattcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgca 20074929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 37680598 - 37680219
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| || |||| |    
T  37680598 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaag 37680499  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37680498 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 37680399  T
Q  260 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 359  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |      
T  37680398 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatgga 37680299  T
Q  360 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |  |||| | ||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  37680298 gaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgca 37680219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18273346 - 18273114
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  18273346 ttttctgaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 18273247  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      ||||| || ||||| |||| | |||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  18273246 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgttacaa 18273147  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 262  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18273146 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 18273114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16379671 - 16379409
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||  | || ||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  16379671 gggcaattggttactagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagatgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 16379572  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||| ||||| | || || || |||||| | |||||||||| |||||| |  | || |    
T  16379571 gcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcctctgctgataagggcaaacagagagttaatgatgagaggaggccgagaaagaaa 16379472  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |  | |||| |||||||| |     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16379471 gatgttgttgctgagattgtttgctatgcttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgtttgt 16379409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 289
Target Start/End: Original strand, 20853547 - 20853830
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |    
T  20853547 attggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgagaaaa 20853646  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |    ||||| ||    |||||    ||||| || ||||| ||| ||||||| || || || |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||    
T  20853647 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgc 20853746  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
    ||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||    
T  20853747 tcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcag 20853830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 21228469 - 21228600
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  21228469 aagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaact 21228568  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21228569 gtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 21228600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 21044941 - 21045118
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| | || | |    
T  21044941 attggttaacagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaataagagga 21045040  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgaga 183  Q
     ||||||||| || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || || ||||| ||| | ||||||||||    
T  21045041 aaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggcaagcaaagagttaatgatgaga 21045118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20922016 - 20921929
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaa 88  Q
    |||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||| | || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20922016 gggcaattggatatcagaagatccgtaactttactgaactagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 20921929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 16347433 - 16347547
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||     
T  16347433 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16347532  T
Q  154 acaatggtaagcaga 168  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16347533 acaagggtaaacaga 16347547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Original strand, 16354081 - 16354195
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||     
T  16354081 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 16354180  T
Q  154 acaatggtaagcaga 168  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16354181 acaagggtaaacaga 16354195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 24784839 - 24784901
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24784839 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 51330330 - 51330428
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  51330330 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 51330428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Original strand, 17041929 - 17042057
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| |||||||||| |    
T  17041929 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttcaact 17042027  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 261  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17042028 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgttt 17042057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19109837 - 19109793
Alignment:
Q  108 ggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  19109837 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 19109793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 4017 - 4455
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4017 gggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagttgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtga 4116  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||   || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4117 gcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 4216  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4217 gatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaagactacaaaagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 4316  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4317 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggt 4416  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4417 taggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 4455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30210 - 29777
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30210 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 30111  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30110 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgt 30011  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  30010 tcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaaggga 29911  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29910 cacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 29811  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  29810 caggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgca 29777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Original strand, 64347 - 64645
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  64347 tctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 64446  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  64447 aaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtg 64546  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||||||    
T  64547 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtgg 64645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 48904 - 49223
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  48904 tatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggta 49003  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |    
T  49004 agggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgc 49103  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacac 310  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49104 tgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacac 49202  T
Q  311 tttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
      ||| | |||| ||||||||    
T  49203 actagctaattgcaagcgtgg 49223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 331
Target Start/End: Original strand, 57938 - 58257
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    |||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  57938 tatcagcagattagaattttctctgatttggtaagtcgttgcaggatatatgaggaggactcaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggta 58037  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    ||||||| |||||||||   || |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |    
T  58038 agggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggaaagcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgc 58137  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacac 310  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  58138 tgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacac 58236  T
Q  311 tttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
      ||| | |||| ||||||||    
T  58237 actagctaattgcaagcgtgg 58257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 43289 - 42845
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43289 gggctattggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaagatctatgatgaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtaa 43190  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43189 gcgccgaggcaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaaacagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 43090  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  43089 gatgctcctactgagataatttgtttcaagtgttgtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtagtcaga 42990  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  || |  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  42989 aaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaagat 42890  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  42889 taggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagt 42845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 533 - 967
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  533 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagtagctgcaggatttctgaggaagataccaaagctcattacaaggtgatgagtgaacata 632  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  633 gaggcaagggacagcaaagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaaggggaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 732  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  733 tcctacggacattgattgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaggga 832  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  833 cacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatcagttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttagga 932  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  933 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaa 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17228 - 16811
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17228 gggctattggctatcaatagataaggaatttttctgaattggtaagcagatgtagaatatatgaagagaataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 17129  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17128 gcgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgccgacaagggtaagcagaaactgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 17029  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17028 gatgctcctactgagattatttgtttcaagtgtggagagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 16929  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16928 aaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatattagttcgcagtgtacgcagactaagaaggt 16829  T
Q  401 taggacaggtggcaaggt 418  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16828 taggacaggtggcaaggt 16811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6028 - 5592
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6028 gggctattggctatcaaaagataaggaatttctctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggtgatgagtga 5929  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  5928 gcgcagaggtaagggacaacatagtcgtccgaagccgtatag---ccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcttaagaggaga 5832  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  5831 gatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcaga 5732  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5731 aaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggt 5632  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  5631 taggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaa 5592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 440
Target Start/End: Original strand, 11484 - 11895
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||    
T  11484 cttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgt 11583  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||||| || | ||| | |||| |||| || |||||||   ||  |||||| | || |||||||||||||||||| ||   ||| ||||| || | ||    
T  11584 cctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaagcccaagaggagagatgcaccagatgagattgtatgataca 11683  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 328  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||  | |||||    
T  11684 agtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcg 11783  T
Q  329 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |  ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||     
T  11784 tggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtacacagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttg 11883  T
Q  429 actcgtacgcaa 440  Q
    ||| ||||||||    
T  11884 actggtacgcaa 11895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 601 - 1035
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  601 attggttatcagaaaaaaagaaatttctctgatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacaacaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 700  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  701 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccgtataatgctcctgctgacaagggtaagaagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 800  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  801 tcctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 900  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  901 tacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttagga 1000  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  1001 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaa 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37528 - 37091
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| |||  || ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37528 gctattggatatcagaaaattagaaacttttatgagctgttaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaac 37429  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37428 gtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcttgccgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 37329  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
      |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37328 cactcctactgatattttttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaag 37229  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  37228 ggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggtta 37129  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  37128 ggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaa 37091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23274786 - 23274362
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23274786 gggctattggttatcagaaaataagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtga 23274687  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23274686 acgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggaga 23274587  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23274586 gatgctcctactgaaattgtttgcaacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacaga 23274487  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  |||| || || || ||||||||    
T  23274486 agggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgcacacaaccgaagaaggt 23274387  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgct 425  Q
    |||||| ||||| || |||||||||    
T  23274386 taggactggtggtaaagtgtttgct 23274362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 19716272 - 19716705
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19716272 attggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaa 19716371  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || | |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19716372 gaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 19716471  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19716472 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19716571  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  19716572 cacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaa 19716671  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  19716672 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 19716705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 19720835 - 19721268
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19720835 attggctatcagaagattagaaatttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacactaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaa 19720934  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || || || ||||||| || | |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19720935 gaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcccttgttgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 19721034  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19721035 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19721134  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  19721135 cacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaa 19721234  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  19721235 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 19721268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20848777 - 20848344
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  20848777 gctattggatatcaacagatcagaatcttttctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgaga 20848678  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||   |||||||||||||    
T  20848677 ggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggat--ccaagaggagaga 20848580  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  20848579 tgctcctgttgagattgtt-gctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20848481  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||    
T  20848480 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagacta 20848381  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  20848380 gaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 20848344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 439
Target Start/End: Original strand, 23097274 - 23097706
Alignment:
Q  7 ttggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtag 106  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||| || || || || || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23097274 ttggctatcagaagatcagaactttttctgagtttgtaagtagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggag 23097373  T
Q  107 aggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgct 206  Q
    ||| || | ||| |||||||     |||||||| |||||||||||| |||| || |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23097374 aggtaaagcacatcagagtctccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgct 23097473  T
Q  207 cctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggac 306  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23097474 cctgctgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatcagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggac 23097573  T
Q  307 acactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggac 406  Q
    |||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| |||||| |||| ||    
T  23097574 acacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaac 23097673  T
Q  407 aggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  23097674 tggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgca 23097706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28351068 - 28350641
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||| |  | |||    
T  28351068 gggccattggctatcagaagatcagacaattttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagtggatacgatagctcactataaggttagtaatga 28350969  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   |||||| || ||  |||||   ||||| |||||||| |||| | |||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  28350968 gcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtccgaagccctatagtgctcctgttgacaaaggggagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 28350869  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  28350868 gatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 28350769  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||     
T  28350768 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctcagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 28350669  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    |  | || |||| | |||||||||||||    
T  28350668 tcaggcaagtggaagggtgtttgcttta 28350641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21901730 - 21901386
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  21901730 gggccattggttaccaaaagatcagacaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaatctcattataaggttatgagtga 21901631  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |   ||   ||| || || ||  ||| |   ||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21901630 gaagaggaacaaaggccatcaaggtcatccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacagagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 21901531  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  21901530 gatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 21901431  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgct 345  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||    
T  21901430 aagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgct 21901386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12577517 - 12577252
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||| ||||| ||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||     
T  12577517 ttttctgatttggtgagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtc 12577418  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || || || ||    
T  12577417 ctaaaccgtatagtgccccggctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaa 12577318  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12577317 gtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 12577252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 22462931 - 22462993
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22462931 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 22462993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 23116440 - 23116571
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  23116440 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcagagattgtttgtttcaact 23116539  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23116540 gtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 23116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23205306 - 23205245
Alignment:
Q  202 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23205306 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23205245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23676910 - 23676849
Alignment:
Q  202 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23676910 atgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 23676849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 24817221 - 24817352
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  24817221 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 24817320  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  24817321 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 24817352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 11351161 - 11351223
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11351161 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11351223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 24817094 - 24817179
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24817094 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 24817179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 91
Target Start/End: Original strand, 22742255 - 22742306
Alignment:
Q  40 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22742255 tggtgagcagttgcaggatttacgaagaggataccaaggctcattacaaggt 22742306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10871987 - 10871889
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  10871987 aggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 10871889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24265507 - 24265409
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  24265507 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 24265409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 24657128 - 24657170
Alignment:
Q  221 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24657128 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 24657170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 24704932 - 24704994
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |||| |||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24704932 gatgttcctgctgagattatctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 24704994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19647911 - 19647827
Alignment:
Q  172 tgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 256  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||| ||| |||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19647911 tgaatgatgagaggaggcccataaagaaagatactcctaccgatgttgtttgtttccgatgtggagagaaaggtcacaagagtaa 19647827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 590 - 1029
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  590 attggctatcagagaataaggaacttctctaaattggtaaccagctgtaggatttatgaggaggacacgaaatctcattacaaggtgatgagtgaatgta 689  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  690 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtactcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 789  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  790 tcctatggatattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaagga 889  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcata-----tcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |     |||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  890 cacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcacatcagttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggt 989  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  990 taggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 1029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6390 - 5957
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6390 attggctatcagaaaataaggaacttctttgaattgggaagcagctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgca 6291  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6290 gaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctactgacaagggtaagca-aggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 6192  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6191 tcttactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaagga 6092  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || || |||||||||||||    
T  6091 cacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatattagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagga 5992  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||  |||||||    
T  5991 ccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaa 5957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43579
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43132 gggctattggttatcaaaagataaggaatttctcagatttggtaagcagctgtaggatatattaagaggataccaaatgtcattacaaggtgatgagtga 43231  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43232 gcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccaaaactgtatagtgctccttctaacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 43331  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  43332 gatgctcctaatgagattgtctgtttcaagtgtcgtgaaaagggccacaagagtaatgtgtgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacaga 43431  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |   | || || |||||||| || ||| |||| | | |||| ||||||||    
T  43432 aaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaaggt 43531  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  43532 tcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaa 43579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 154078 - 153699
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  154078 attggttatcagaagattagaaacttctctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggagacgaaagctcattacaaggtgatgggtgaacaaa 153979  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  153978 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 153879  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  153878 tcccactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaagccataagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 153779  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtac 385  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  153778 cacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcacattagttcgcagtgtac 153699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 23563065 - 23563499
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | | |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23563065 attggttatcagaagattagaaatttctttaatttggtaagtagctgcaggatttatgaggaggacactaaagctcattacaagatgatgagtgaacgta 23563164  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||   |||||||||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23563165 gaggtaagggacagaagagttgtccgaagccgtatagtgctcctgctgaaaaggataagcagaggttaaataatgagaggaggcccaagaggagagatgc 23563264  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23563265 tcctactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 23563364  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  ||| ||| |||||| |||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23563365 cacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttagga 23563464  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23563465 ctggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaa 23563499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 23077799 - 23078235
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  23077799 gctattgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaatgagtgaga 23077898  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23077899 ggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 23077998  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  23077999 tgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaa 23078098  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  23078099 ggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggcta 23078198  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  23078199 ggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgca 23078235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21870170 - 21870438
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21870170 gggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 21870269  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21870270 gcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggaga 21870369  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21870370 gatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21870438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21874450 - 21874718
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21874450 gggctattggctatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 21874549  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21874550 gcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggaga 21874649  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21874650 gatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccga 21874718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20345756 - 20345320
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| ||||| |  || || || |||||||| || || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  20345756 gctattgggtatcagcagatcagagtcttttctgagttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 20345657  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20345656 ggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 20345557  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  20345556 tgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 20345457  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    || |||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||  ||||| |  |||| ||||||| ||    
T  20345456 ggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggcta 20345357  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  20345356 gaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgca 20345320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22506153 - 22505717
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  22506153 gctattggatatcagcaaatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgaga 22506054  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  22506053 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 22505954  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||      
T  22505953 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatg 22505854  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||| ||||||||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  22505853 ggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggtta 22505754  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22505753 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 22505717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 14883883 - 14884258
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  14883883 gggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtga 14883982  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||| || |||| || ||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  14883983 gaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggaga 14884082  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  14884083 gatgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcaga 14884182  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttc 376  Q
    | || |||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  14884183 agggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttc 14884258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25851492 - 25851110
Alignment:
Q  57 atttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaaca 156  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||    
T  25851492 atttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgaca 25851393  T
Q  157 atggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaa 256  Q
    | || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25851392 aaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaa 25851293  T
Q  257 tgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaac 356  Q
    ||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| |  |||||||| |||||||| |||||||||| |||     
T  25851292 tgtttgtggtaaagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaat 25851193  T
Q  357 gaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |  || |||||||| |||||  ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  25851192 ggagagggtcatattagttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgca 25851110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 295
Target Start/End: Original strand, 17266258 - 17266520
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||   |    
T  17266258 tctgatttggtaagtcgctgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaaagggcatcagagtcgtccta 17266357  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||    
T  17266358 aaccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgttttaagtg 17266457  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17266458 tggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttgt-accgaggatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 17266520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43122943 - 43122516
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | || |||    
T  43122943 gggccattgggtaccaaaagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggttaggaatga 43122844  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   |||||| |||||   |||    ||||| || ||||| | || | |||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  43122843 gcggaggaacaagggtcaacaagatcggccgaagccctacagtgctcatgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 43122744  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| || | | || |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||    
T  43122743 gatgttcatgcagagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaaga 43122644  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | || ||  |  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43122643 aggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggt 43122544  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43122543 taggacaggtggcaaggtgtttgcttta 43122516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Original strand, 21983074 - 21983492
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |    
T  21983074 attggttatcaaaagatcagaaaattttctgaatttgtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagctcattataagtttatgagtgagcgga 21983173  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |   ||| || || ||  |||||   ||||| || ||||  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||     
T  21983174 ggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgttcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgt 21983273  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||| |  |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||||||     
T  21983274 tcctgctgagattgtttgctataggtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttcgcaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaaggg 21983373  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  |     
T  21983374 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagg 21983473  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21983474 caggtggaaaggtgtttgc 21983492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23670091 - 23669822
Alignment:
Q  18 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||  | || |||||| ||   |||||| |    
T  23670091 aagataagaaatttttctgaattggtgagcagctgtaggatttacgaggaggatacgaaagctcactataaggctaggaatgagcggaggaacaagggtc 23669992  T
Q  118 aacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 217  Q
    ||||  ||||    ||||| || ||||| |||| | |||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  23669991 aacaaggtcgaccgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgctcctgctgagat 23669892  T
Q  218 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  23669891 tgtttcctaccagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 23669822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 21560917 - 21561176
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  21560917 gggccattggttatcaaaagatcaggtaattttctaaattggtgagcagctgtagaatttatgaggaggatacgaaagcccgttataaggttatgagtga 21561016  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | ||   ||| || || ||  |||||   ||||| || |||||  ||||| |||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  21561017 gaggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctactgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 21561116  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtt 260  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21561117 gatgttcctgctgagattgtttgcttcaagtgtggtaagaagggccacaagagtaatgtt 21561176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 399
Target Start/End: Original strand, 16258092 - 16258326
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  16258092 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 16258191  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaagg 364  Q
    |  | || ||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||| | ||| |   | ||||||||    
T  16258192 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 16258291  T
Q  365 tcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 399  Q
    |||| | |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  16258292 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 16258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 22591811 - 22591933
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  22591811 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 22591910  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |  | || |||||||||||||||    
T  22591911 atggtgaggagaagaagtgcttc 22591933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 22595366 - 22595488
Alignment:
Q  165 cagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtg 264  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  22595366 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 22595465  T
Q  265 accgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |  | || |||||||||||||||    
T  22595466 atggtgaggagaagaagtgcttc 22595488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23474688 - 23474426
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| || || ||  |||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  23474688 gggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcagctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 23474589  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | | ||||||||| || || ||||||  |||||| || | ||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | || |    
T  23474588 gaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacattgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccagaaagaaa 23474489  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    || | |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23474488 gaagttgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 23474426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18782408 - 18782346
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18782408 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 18782346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21331881 - 21332032
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |  ||| |||    
T  21331881 gggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaggattgtgaatga 21331980  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    | | | |||||| || || |||||||||  |||||| || ||||| ||||||    
T  21331981 gaggaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctcctgct 21332032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 22329835 - 22329933
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22329835 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 22329933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Original strand, 26735648 - 26735882
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    |||||||||  |||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |  | | |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  26735648 cttttctgagctggtgagcagttgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgt 26735747  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
      |||||| || ||||| ||| || | || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  | || ||||||||||  ||| |||||||| | ||    
T  26735748 ccaaagccttacagtgctcctactgataaaggaaaacaaagagttaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctaca 26735847  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
      ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  26735848 cttgttgtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 26735882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20770603 - 20770518
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20770603 tatcagaagatcagaattttctcggaattggtgaggagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20779378 - 20779293
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20779378 tatcagaagatcagaattttctcggaattgttgagcagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgag 20779293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22465259 - 22465138
Alignment:
Q  168 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 267  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   ||    
T  22465259 agattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttatttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcatcc 22465160  T
Q  268 gagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
     |||||||||||| || |||||    
T  22465159 aagatgagaagaaatgtttcag 22465138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Original strand, 28891845 - 28891934
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgag 101  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| ||  | || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28891845 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagttgctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgag 28891934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22465390 - 22465330
Alignment:
Q  37 aattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22465390 aattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgag 22465330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23461406 - 23461203
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggc-aagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaat 158  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||| | || | ||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||| | ||     
T  23461406 tatgaagaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcgga-agactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataag 23461308  T
Q  159 ggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 258  Q
    || ||  ||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23461307 ggaaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggaaattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatg 23461208  T
Q  259 tttgt 263  Q
    |||||    
T  23461207 tttgt 23461203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25429885 - 25429826
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  25429885 ttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaag 25429826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 14996687 - 14996785
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  14996687 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 14996785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19773398 - 19773304
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  19773398 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 19773304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23526345 - 23526283
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  23526345 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 23526283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 27682348 - 27682446
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  27682348 aggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 27682446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20803891 - 20803830
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 262  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20803891 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttg 20803830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 91
Target Start/End: Original strand, 21631296 - 21631381
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    ||||| |||||||||||  | || |||| |||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21631296 attggatatcagaagatccgtaaattttatgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 21631381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27613785 - 27613696
Alignment:
Q  63 gaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||  | |  |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  27613785 gaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 27613696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19456445 - 19456010
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 104  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||     
T  19456445 tattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgc 19456346  T
Q  105 agaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19456345 agaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagata 19456246  T
Q  205 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19456245 ctcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaagg 19456146  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19456145 acacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttagg 19456046  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    || ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  19456045 accggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 19456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19466590 - 19466155
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 104  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||     
T  19466590 tattggctatcaaaagataagaaatttctcagagttagtaagcagctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgc 19466491  T
Q  105 agaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || || || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19466490 agaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaaaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagata 19466391  T
Q  205 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  19466390 ctcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaagg 19466291  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19466290 acacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttagg 19466191  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    || ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  19466190 accggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 19466155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25771270 - 25770831
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  25771270 gggctattggctaccaaaagataaggaatttttctgagttggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattatagagtgatgagtga 25771171  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25771170 gcgcagaggtaagggacaacagagtcgtccgtaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 25771071  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||   ||    
T  25771070 gatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagaataatttatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttcgatgtgggacga 25770971  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |   | || ||||||||||| || ||  |||| | | | ||||||||||     
T  25770970 aaggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggc 25770871  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  25770870 tctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaa 25770831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18798116 - 18797678
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18798116 gggctattggataccagaagatcagaaacttctctgagttggtaagtagctgcagaatctatgaagaggacacagaagctcattacaaggtgatgagtga 18798017  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18798016 ccgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagg 18797917  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||   |||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||| |||| || ||||||||||||| ||    
T  18797916 gatgctcctgtggatattgtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgcactaaagatgagcagaaatgtttcaggtgtggtcaga 18797817  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||  |||| || || || ||||||||    
T  18797816 agggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgcactcaaccaaagaaggt 18797717  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  18797716 tagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 18797678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19438423 - 19437989
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||  | |    
T  19438423 attgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaaggtagtgagtgaaagga 19438324  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19438323 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 19438224  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||     ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19438223 tcctgctgagatcgttcgttacaagtgtggtgagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatgagaataagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 19438124  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| ||  | |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  19438123 cacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagga 19438024  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  19438023 ctagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaa 19437989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 14376776 - 14377209
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14376776 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 14376875  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |  |||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  14376876 ggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggagacccaataggagagatgc 14376975  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  |||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14376976 tcctgttgatgttgtttgctacaagtgcggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 14377075  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14377076 cacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatcagttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaa 14377175  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  14377176 ccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgca 14377209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21475010 - 21474587
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21475010 gggctattggctactaaaagataaggaatttttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 21474911  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||                |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  21474910 gcg----------------cagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 21474827  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||    
T  21474826 gatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaaga 21474727  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |||||  |||| | | | ||||||||||     
T  21474726 aaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcaggaaacctaagaaggc 21474627  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21474626 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 21474587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 440
Target Start/End: Original strand, 24515337 - 24515708
Alignment:
Q  69 gatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcaga 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || || ||||    
T  24515337 gatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcagaggcaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaaacaga 24515436  T
Q  169 gattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccg 268  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  24515437 ggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaa 24515536  T
Q  269 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcat 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| |||||||||||     
T  24515537 agatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcac 24515636  T
Q  369 atcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||| || |||||| || | ||| ||||||||    
T  24515637 atcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaa 24515708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 10465703 - 10466125
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||   || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10465703 gggctatagggtatcagaagattagagttttctctgagttggtgagcagctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 10465802  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | || || |||||||| |||||||||   ||||| || | ||| | |||| |||| || ||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10465803 gaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctcttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggaga 10465902  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| ||    
T  10465903 gatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcaga 10466002  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  10466003 agggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggt 10466102  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttg 423  Q
     ||||| || || || |||||||    
T  10466103 caggaccggagggaaagtgtttg 10466125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 21566846 - 21567155
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566846 gggccattggctatcagaagatcaggactttttctgagttggtaagcagctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtga 21566945  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||| || |||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21566946 gcggaggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggaga 21567045  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21567046 gatgctcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 21567145  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  21567146 aaggacacac 21567155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 19486149 - 19486588
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19486149 gggccattggttatcagaagattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgagtga 19486248  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   ||| || || ||  ||||||  ||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  19486249 gcggaggaacaaaggccagcaaggtcgttcgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaaga 19486348  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| | |||||   ||    
T  19486349 gatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaaga 19486448  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||| || ||  |||  || || |||| ||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||     
T  19486449 aagggcatacgatagcggaatgcaagcatggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 19486548  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  | ||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  19486549 tcaggcaggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaa 19486588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 34642440 - 34642864
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||   ||||||| ||| |||| || || || || |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  34642440 gggccattggctatcaaaagatcagaactctttctgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaagggctcattacaaggtgatgagtga 34642539  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggccc-aagaggag 199  Q
     || || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||   || || |||||  || |||||||||| | ||| ||| ||| | ||    
T  34642540 acggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgctcctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgaaaggagaccccaagggaag 34642639  T
Q  200 agatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgg 299  Q
    |||  ||||| | || || ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  34642640 agacactcctgcggagatagtttgctttaagtgtggcgagaagggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacag 34642739  T
Q  300 aaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg 399  Q
    || || |||   |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||  |||| || || || |||||||    
T  34642740 aagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatcagttctcagtgcactcaaccgaagaagg 34642839  T
Q  400 ttaggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||    
T  34642840 ttaggaccggtgggaaagtgtttgc 34642864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24367821 - 24367451
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  24367821 attggatatcagcagatcagagtcttctatgagttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 24367722  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24367721 ggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 24367622  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    || |  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  24367621 tcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggt 24367522  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttc 376  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||    
T  24367521 cacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttc 24367451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 8720560 - 8720846
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | | ||  ||    
T  8720560 gggctattggttatcagaagataaggaacttttccgagttggtgagtagctgtaggatatatgaggaggataccaaagctcactacaagattaggaacga 8720659  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   |||||| |||||  |||||   || || || ||||| ||||  ||||| ||  | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8720660 gcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacctagattgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 8720759  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |||| ||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  8720760 gatgatcctgatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 8720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16814066 - 16813780
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | | || |||    
T  16814066 gggctattggttatcagaagataagaaacttttccgagttggtgagtagctacatgatatatgaggaggataccaaagctcactataagattaggaatga 16813967  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   |||||| |||||  |||||   || || || ||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  16813966 gcggaggaacaagggtcaacaaggtcgtccgaaaccctacagtgctcctgtaaacaaaggggaacagagattgaatgatgagaggagacctaagaggaga 16813867  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttc 287  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  16813866 gatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttc 16813780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15462757 - 15462459
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  15462757 attggatatcagaagatcaggattttctcggagttggtgagtagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagaaga 15462658  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |    ||||| ||    |||||    ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |  ||| |   |||||||  |    
T  15462657 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctgctaacaaaggcaaacagagattgaatgatgagaggcagcctagagggagagagac 15462558  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    ||||  |||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  15462557 tcctgttgatgttgtgtgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccagagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaagg 15462459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 30677879 - 30678141
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |  | ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  30677879 gggccattggatatcagaagatccgtcaattttctgaattagtgagcagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctaattacaaggttatgagtga 30677978  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| || || ||| | || |||| ||||  |||||| || |  || |||||| | ||  ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  | || |    
T  30677979 gcggaggggtaagagtcagcagaatcgtccaaagccttacaacgctcctgctgataaatgtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaa 30678078  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30678079 gatactcctgctgaggttgtttgctacaagtgtggtgagaagagccacaagagtaatgtttgt 30678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19881822 - 19881588
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||   |||| || ||| |||| || || || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19881822 gggccattggttatcagaagatcagaactctttccgagttgataagtagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtga 19881723  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
     || || ||||||| |||||| ||||||   |||||||| || |||||||||   || || |||||  || ||||||||||||  || |||||| | |||    
T  19881722 acggaggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcccctgctggtaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaagacccaagggaaga 19881623  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 235  Q
    ||  ||||| |||| || ||||| || ||||||||    
T  19881622 gacactcctgctgagatagtttgctttaagtgtgg 19881588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23081849 - 23081587
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | | |||||||||  | || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||    
T  23081849 gggcaattggttaccagaagattcgtaccttttctgagctagtgagcagttgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatga 23081750  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | || ||| || || |||||||||  |||||| || |||||  ||||| | || || ||||| ||| | |||||||||| | |||| | || || |    
T  23081749 gcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctgctgataaaggaaagcaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaa 23081650  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23081649 gatgctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 23081587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18660340 - 18660083
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||| | |    
T  18660340 attggatattagaagatccgtaacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggctgtgagtgagagga 18660241  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
     ||| ||| | || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || ||| |||||||  | |||||||||| | | |||||||||| |||       
T  18660240 aaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtgagcagagggttaatgatgagaggggacccaagaggaaagagaa 18660141  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||||||||| |   ||||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  18660140 tcctactgaagttgtttgttaccgatgtggagagaaatgtcacaagagtaatgcttgt 18660083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 257
Target Start/End: Original strand, 25958636 - 25958864
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |  |||  |||   ||||| || || || || ||||||    
T  25958636 cttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactagagctcactacaagatagtgaaagagaagagaggaaaagggcagcaaagtcgt 25958735  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
      |||||| |||||||| | || | || | ||  |||| ||| || ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25958736 ccaaagccttatagtgctcttgttgacgaaggggagcaaagactggatgatgagaggagacctaagagtagagatgctcctactgagattgtttgctaca 25958835  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 257  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  25958836 ggtgtggtaagaaaggccacaggagtaat 25958864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 5836139 - 5836237
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5836139 aggatttacgaagaggataccaaagctcactacaagactgtgaatgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgcccctgct 5836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 289
Target Start/End: Original strand, 20010361 - 20010645
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |    
T  20010361 attggatatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgagaaaa 20010460  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |    ||||| ||    |||||    ||||| || ||||| ||| ||||||| || || || |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||    
T  20010461 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacagtgctcctactaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgc 20010560  T
Q  206 tcctactgatattgt-ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
    ||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||   || |||||||||||| || |||||    
T  20010561 tcctgttgatgttgtattgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcag 20010645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21765038 - 21764976
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21765038 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 21764976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 23084680 - 23084769
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    |||| ||||| ||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23084680 gggccattgggtattagaagatccgtaatttttctgaactggtgagcagttgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 23084769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 2871713 - 2871811
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |  ||| |||| | |  |||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||    
T  2871713 aggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagtgaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgct 2871811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22437249 - 22437207
Alignment:
Q  47 cagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22437249 cagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaag 22437207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Original strand, 27559044 - 27559086
Alignment:
Q  221 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27559044 ttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgt 27559086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 259
Target Start/End: Original strand, 22829351 - 22829499
Alignment:
Q  108 ggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctc 207  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| | || || ||  ||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||       
T  22829351 ggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatg--- 22829447  T
Q  208 ctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  22829448 ctactgagattgtgtgtttcaattgtggtggaaaaggccacaaaagcaatgt 22829499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 75 - 452
Target Start/End: Original strand, 71 - 448
Alignment:
Q  75 aaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||   |||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| || |    
T  71 aaagctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtaaaatgctcctgctgacaagggtaagcagaggttaa 170  T
Q  175 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 274  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  171 atgatgagaggaggcccaagagcagagaggctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatga 270  T
Q  275 gaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  271 gaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagt 370  T
Q  375 tcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaacgag 452  Q
    ||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||    
T  371 tcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagttaacgag 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 52242 - 51804
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  52242 gggctattggttatcaaaagataaggaatatttctgaattggtaagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaggctcattataaagtgatgagtga 52143  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| |||   || | ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  52142 gcgcagaggtaagggacagcagagccgtccgaaactgtatagtgctcctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 52043  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  52042 gatgctcctactgagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtaaga 51943  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| ||| ||||   | || |||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  51942 aaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatattagttcacagtgtacgcagccaaagaaggt 51843  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  51842 tcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgca 51804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 331
Target Start/End: Original strand, 4172 - 4496
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4172 attggttatcagaaaataagaaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaa-ctcattacaaggtgatgagtgaacgta 4270  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4271 gaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtacactgctcctgctgacaagggtaagcagagtttaaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 4370  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4371 tcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaagga 4470  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  4471 cacacattagctgattgtaagcgtgg 4496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21929056 - 21928617
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21929056 gggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattggtaagcagctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 21928957  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||| |||| || || |||||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  21928956 gcgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 21928857  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  21928856 gatgctcctactgagattctttgtttcaagtgtggcgaaaagggccacgagagtaatgtaagtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacaga 21928757  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| || ||  | || | | |||| ||||||||    
T  21928756 aaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacaatgcaagaagcccaagaaggt 21928657  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  21928656 tcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaa 21928617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19985808 - 19985370
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19985808 gggccattggttatcaaaagataataaatttttctgatttggtaagcagttgtaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtga 19985709  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  19985708 gcgcagtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcggacaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaagaggaga 19985609  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||    
T  19985608 gatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtatttcagatgtggacaga 19985509  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    || ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||| || |   | || || || ||||| || ||  |||| | | |||||||||||||    
T  19985508 aatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagctcacagtgcaagaagcctaagaaggt 19985409  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  19985408 tcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgca 19985370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 424
Target Start/End: Original strand, 31413687 - 31414108
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | ||||||| ||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31413687 gctattgggtatcagaagattaaaattttctctaagttggtaaacagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaaatgatgagtgagc 31413786  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || || ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31413787 gaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagcgcccctgctgacaagggaaagcagagaatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 31413886  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  31413887 tgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaa 31413986  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||    
T  31413987 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagtcgaagaaggcta 31414086  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    | || ||||| || ||||||||    
T  31414087 gaaccggtgggaaagtgtttgc 31414108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 424
Target Start/End: Original strand, 22027465 - 22027856
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||   |    
T  22027465 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagatcattataaggtgatgagtgagcgaagtggtaagggacagcagagtcgtccta 22027564  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  22027565 aaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttacaagtg 22027664  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 332  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| | ||     
T  22027665 tggcgataaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagagggga 22027764  T
Q  333 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  22027765 gacgttgtttgctataactacaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgc 22027856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22374480 - 22374062
Alignment:
Q  18 aagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggac 117  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22374480 aagataaggaatttttctgatttggtgagtagctgtaggatctatcaggaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggac 22374381  T
Q  118 aacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatat 217  Q
    |  ||||||||   || ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||| | ||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||    
T  22374380 agtagagtcgtccgaaaccgtatagtgcccctgctgtcaaaggtaaacaaagacttaatgaggagaggaggcctaggaggagagattctcctactgagat 22374281  T
Q  218 tgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |    
T  22374280 tgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagct 22374181  T
Q  318 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 417  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  22374180 gattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaagg 22374081  T
Q  418 tgtttgctttaactcgtac 436  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  22374080 tgtttgctttgactggtac 22374062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28984511 - 28984115
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||    
T  28984511 cttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgt 28984412  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||||| || ||||| |||||  |||| || ||||||||  ||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  28984411 cctaagccttacagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagttgagattgtttgttaca 28984312  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || |||||    
T  28984311 agtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcg 28984212  T
Q  329 tggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgct 425  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| ||||||||||||    
T  28984211 tggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgct 28984115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Original strand, 29300581 - 29301000
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29300581 gctattgggtatcagaagattagagttttctctgagttagtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtaatgagtgaga 29300680  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||  ||||||||   || || || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29300681 ggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggggaga 29300780  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    || |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||   ||||||| | |||||| || |||||||||| || |    
T  29300781 tgttcccgctgaaattgtttgttttaagtgtggtgaaagaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgaaaggaagtgttttaggtgtggtcagaga 29300880  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  29300881 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggcta 29300980  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgttt 422  Q
    |||  ||||| || ||||||    
T  29300981 ggatcggtgggaaagtgttt 29301000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22054443 - 22054053
Alignment:
Q  49 gttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  22054443 gttgcaggatctgtgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22054344  T
Q  149 tgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccac 248  Q
    |||| | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22054343 tgctgataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgcttctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccac 22054244  T
Q  249 aagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctac 347  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |||| || ||     
T  22054243 aagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttat 22054145  T
Q  348 aacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  22054144 aactgcaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgca 22054053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 16268377 - 16268815
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||    
T  16268377 gggctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaatataatgagtga 16268476  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| | |||| |||| || |||||||   ||| |||||| | |||||| |||| ||||    
T  16268477 gaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcctaagaagaga 16268576  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16268577 gatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaga 16268676  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    | || || |   ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  |||| |||||||     
T  16268677 agggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaaggc 16268776  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  16268777 tagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgca 16268815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20391714 - 20391276
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20391714 gggccattgggtatcaaaagatcaggcaattttctgaattggtgagcagctgtagaatttatgaagaggataccaaagctcattataaggttatgagtga 20391615  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||   ||| || || ||  |||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||| |||    
T  20391614 gcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctcctgctgacaaagggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagagtaga 20391515  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||   |  | |||||||| ||||||||| | |||||   ||    
T  20391514 gatgttccttctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttccaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaaga 20391415  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||| || ||| |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||     
T  20391414 aagggcatactatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 20391315  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  20391314 tcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgca 20391276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 428
Target Start/End: Original strand, 6606651 - 6607049
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  | |||     
T  6606651 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggacgtc 6606750  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      ||||| || ||||  |||  | |||  ||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  6606751 cgaagccctacagtgttcctattgacagaggagagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaa 6606850  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgt 329  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || || ||  ||| ||| || ||||||    
T  6606851 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgt 6606950  T
Q  330 ggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    ||||| |||||||||| ||| |   | || ||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6606951 ggggatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 6607049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22043402 - 22043193
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || |||||||     ||||| |||||||||||| ||     
T  22043402 aggatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcaccctaagccttatagtgcccctactg 22043303  T
Q  154 acaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 253  Q
    |||| || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  |||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22043302 acaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccaactgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 22043203  T
Q  254 taatgtttgt 263  Q
    ||||||||||    
T  22043202 taatgtttgt 22043193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22524133 - 22523876
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22524133 attggttaccagaagatccgtaacttttccgagctggtgagcagttgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaa 22524034  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
     |||||| || || |||||||||  |||||| || |||||||||||| | || || || || ||| | |||||||||| | |||| | || || ||||||    
T  22524033 aaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctgctgataagggaaaacaaagagttaatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgc 22523934  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||  ||| ||||| || |  |  ||||| || |||||||||| |||||||| ||||    
T  22523933 tcctgttgagattgtgtgctatacttgtggcgagaaaggccacaggagtaatgcttgt 22523876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 21970709 - 21970793
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21970709 attggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21970793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 22004239 - 22004323
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22004239 attggttatcagaagattataaacttttctaagttggtgagtagctgtaggatttatgaagatgataccaaagctcattataagg 22004323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 30310497 - 30310559
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30310497 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 30310559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32603642 - 32603511
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||| ||   ||||| | | | || |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  32603642 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcgacctaagaagaaggatgctccttcggaaattgtttgtttcaact 32603543  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32603542 gtggtgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 32603511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 263
Target Start/End: Original strand, 22421090 - 22421308
Alignment:
Q  45 agcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtg 144  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||  |||||| || ||||    
T  22421090 agcagttgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtg 22421189  T
Q  145 cccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagg 244  Q
    | |||||||| || || || |||||| ||  |||||||| | |||| | || || ||||||| |   ||||||||| || |  |  |||||||| |||||    
T  22421190 ctcctgctaataagggcaaacagagaatggttgatgagaggcggcctaggaagaaagatgcttcggttgatattgtctgctatacttgtggtgagaaagg 22421289  T
Q  245 ccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  22421290 ccacaaaagtaatgcttgt 22421308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22990668 - 22990522
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  22990668 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaagatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgga 22990569  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
     |||||| || || || ||||||  |||||| || ||||| ||||||    
T  22990568 aaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgct 22990522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18860152 - 18860055
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  18860152 tgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 18860055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15536880 - 15536749
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || || ||||||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||| ||||||| || |    
T  15536880 aagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccttcggagattatttgttttaatt 15536781  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15536780 gtggcgaagaaggccacaagagtaatgtttgt 15536749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 21391214 - 21391276
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21391214 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21391276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 21780540 - 21780602
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21780540 gatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 21780602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 22126168 - 22126262
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  22126168 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 22126262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3274707 - 3274646
Alignment:
Q  27 aacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaa 88  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3274707 aacttttctgaactggtgagcagctgcagaatctatgaggaggatacaagagctcattacaa 3274646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21672143 - 21671974
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||| |  ||| |||    
T  21672143 gggcaattggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatgccaagactcattacaagattgtgaatga 21672044  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagaga 170  Q
    ||| |  | |||||| || |||||||||   ||||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||    
T  21672043 gcgaaaggccaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagaga 21671974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 21982112 - 21982196
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21982112 attggttatcagaagattataaacttttttaatttggtgagtagctgaaggatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21982196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 21998598 - 21998682
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  21998598 attggttatcagaagattataaacttttttgagttggtgagtagctgaagaatttatgaggatgataccaaagcccattataagg 21998682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 1670 - 2104
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || ||  | | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1670 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagcagcatgatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgca 1769  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| |||||| |||| || || |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1770 gaggtaagggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggatagatgc 1869  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1870 tcctgctgaaattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 1969  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  1970 cacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttagga 2069  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  2070 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 2104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 377
Target Start/End: Original strand, 11651 - 11995
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  11651 tctgatttggtaagcagctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataaggtgatgagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 11750  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    | || |||||||| |||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  11751 aaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagagacttaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagatcgtttgttacaagtg 11850  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 332  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||     
T  11851 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggt 11950  T
Q  333 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 377  Q
    ||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11951 gacattgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatcagttcg 11995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 70958 - 70675
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||   |    
T  70958 attgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtgagtagctgtatgatttatgaggaggatacaaaggctcactataaggtgatgagcgagaaga 70859  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |    ||||| ||    |||||    ||||| || | ||  |||||| |||| || || || |||||||||||||||| | |||| | | ||||||||||    
T  70858 ggaataagggtcagagtagtcgcccgaagccctacattgttcctgctgacaaaggaaaacaaagattgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgc 70759  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||| |||||    
T  70758 tcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaagatgagaagaagtgtttcag 70675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122141
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||  |||| |||  ||||||||| |    
T  122020 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaatt 122119  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  122120 gtggtgaaaaaggccacaagag 122141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 5615 - 5888
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5615 gggctattggttatcagaaaataataaacttctctgatttggtaagcagctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtga 5714  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5715 gcgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccaagaggaga 5814  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 274  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5815 gatgctcctactgatattgtttattacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatga 5888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 425
Target Start/End: Original strand, 98301 - 98720
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | |    
T  98301 attgggtatcagaagatcagaaacttttctgagttggtaagcagctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtaatgagtgaaagga 98400  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  98401 gaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgctcatgctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaagtggagagatgc 98500  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  98501 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 98600  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  98601 cacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagga 98700  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgct 425  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  98701 ctggtggtaaggtgtttgct 98720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 176578 - 176139
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  176578 gggccattggctaccaaaagataaggaacttttatgatttggtgagtagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtga 176479  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  176478 gcgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgccaacaaagttaaacagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 176379  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  176378 gatgctcctacagagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaaga 176279  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | ||| | ||||||     
T  176278 aaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggc 176179  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  176178 tctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 176139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2310 - 1873
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2310 gggctattggttatcagaagataagaaatttttctgaattagtaagcagctgtagaatctatgaagaggatacaaaagctcattataaagtgatgagtga 2211  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| |||||| |  ||||||||   || |||| ||||||  ||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  2210 gcgcagaggtaagggatagtagagtcgtccgaaaccgt-tagtgcttctgctgacaaaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggtga 2112  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  2111 gatgctcctactgaaattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacaga 2012  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||| || |   | || || || ||||| || ||| |||| | | |||| |||||| |    
T  2011 aaggacatactttagctgattgtaagcgt-gggatgttgtatgctataattgtgatgaagagggacatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaagtt 1913  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1912 tcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaa 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 39053 - 39485
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39053 attgggtaccagaagattagaa--ttttctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 39150  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   || || |||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39151 gaggtaagggacagcagagtcttcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 39250  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39251 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 39350  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  39351 cacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatcagttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttagga 39450  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  39451 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 39485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14753
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  14884 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatatgcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaagt 14785  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14784 gtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt 14753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5506 - 5244
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||  |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  5506 gggcaattggttactagaagatccgtaacttttctgagttggtgagcaattgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 5407  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | | ||||||||| || || ||||||  |||||| ||  |||| |||||| | || || || || ||| | |||||||||| |||||| |  | || |    
T  5406 gaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacggtgctcctgctgataagggcaaacaaagagttaatgatgagatgaggcctagaaagaaa 5307  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5306 gatgttgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 5244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 180563 - 180648
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  180563 tatcagaagatcagaattttctcagaaatggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 180648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5639 - 5205
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5639 attgggtatcagaagataagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 5540  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||| | || || || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5539 gaggtaaaggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgataagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccacgaggagagatgc 5440  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5439 tcctgctgagattgtttgctacaagtgcggcgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaagga 5340  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  5339 cacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttagga 5240  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  5239 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 116215 - 115934
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  116215 gggctattggttatcagaaaataagaaatttctctgatttggtaagcagctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtgatgagtga 116116  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||     
T  116115 gcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggtaagaagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagg 116016  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  116015 gatgctcctactgatattgtttgtttcatgtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatgagaagaagt 115934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 1202 - 1638
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1202 gctatagggtatcagaagatcagagtcttctctgagttggtaagcagctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 1301  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || || |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1302 ggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 1401  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| || ||| || || |||||||||  |||     
T  1402 tgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgtgaggaaatgttttaggtgtggttagaag 1501  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  1502 ggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactcagccgaagaaggtca 1601  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||| || || || |||||||| || ||| |||||||    
T  1602 ggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgca 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30086 - 29679
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  30086 tctgatttggtgagtagttgtagaatctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccga 29987  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||    
T  29986 aaccgtctagtgctcctgctgacaaaggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagatagtctatttcaagtg 29887  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggg 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||  ||| ||| || ||||||||     
T  29886 tggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggt 29787  T
Q  333 gacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactc 432  Q
    ||  ||||||||||||| |   | || ||||||||||| || ||| |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||     
T  29786 gatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactg 29687  T
Q  433 gtacgcaa 440  Q
    ||||||||    
T  29686 gtacgcaa 29679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21400 - 20966
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || || || || ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21400 attggctatcagaagataagaaatttctccgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 21301  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
     ||||||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||||| |||| || || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21300 aaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcccctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 21201  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    | || |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  21200 ttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaaggga 21101  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||| ||||| || | |||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |    
T  21100 cacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggagggccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaa 21001  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  21000 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 20966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Original strand, 205 - 623
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  205 attggctatcagaagataagaatcttctctgatttggtgagtagttgtaggatctacgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgaacgaa 304  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  305 gaggtaagggacaacagagtcaccctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcagatattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 404  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    |||| |||| || ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  405 tcctgctgagatcgtttgttacaaatgtggcaggaaaggccacaagagtgatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagg 503  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    |||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||     
T  504 acacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacagccgaagaaggttaga 603  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    || | ||| || ||||||||    
T  604 accgatgggaaagtgtttgc 623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Original strand, 12132 - 12506
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12132 attggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgta 12231  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||| | || ||||||   |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  12232 gaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatga 12331  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
       ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  12332 gggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaagga 12429  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtg 382  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12430 cacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Original strand, 20312 - 20686
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20312 attggttatcagaaaataagaaacttcactgatttggtaagcagctgtaggatttatgaggaggatacgaaagatcattacaaggtgatgagtgatcgta 20411  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    ||||||||||| | || ||||||   |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  20412 gaggcaagggatagcatagtcgtccgaagccgtacagtgctcctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatga 20511  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
       ||    ||  | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  20512 gggta--agtagagattgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaagga 20609  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtg 382  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20610 cacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtg 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 315
Target Start/End: Original strand, 260 - 569
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  260 attggttatcagaagattaaaaacttctctgatttggtaagcagttgcaggatttatgaggaggacaggaaagctcattacaaggtgatgagtaaacgta 359  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| || ||||||   |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  360 gaggtaagggacagcacagtcgtccgaagccgtatagtgctccttctgacaagggtaagcagaggttaaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgc 459  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  460 tcctatagatattgtttgtttcaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 559  T
Q  306 cacactttag 315  Q
    ||||| ||||    
T  560 cacacattag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3456 - 3222
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3456 gggctattggttatcaaaagataaggaacttttctgaattggtaagtacctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtgatgagtga 3357  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3356 gcgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggaga 3257  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtgg 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3256 gatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtgg 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7618 - 7190
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  7618 tatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagca 7519  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    | ||||| |||||||||   |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7518 aaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgc 7419  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 311  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7418 tgagattgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacact 7319  T
Q  312 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 411  Q
     ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||   | || || || ||||| || ||| | || | | |||| |||||| ||||||| ||||    
T  7318 ctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagaggggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtg 7219  T
Q  412 gcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | || ||||||||| ||||| | ||||||    
T  7218 gtaaagtgtttgctctaactggcacgcaa 7190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11130
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgt 104  Q
    |||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | ||||||||| |     
T  11564 tattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagg 11465  T
Q  105 agaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatg 204  Q
    || || ||||| || |||| ||||   ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  11464 aggggtaagggtcagcagattcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaaggaaagcagattttgaatgatgataggagtcctaagaggagagatg 11365  T
Q  205 ctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  11364 ctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaaggg 11265  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    |||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  11264 acacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatcagctcacagtgtactcagccgaagaaggctagg 11165  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    || || || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  11164 accggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgca 11130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 9200 - 8767
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||| || || |  || ||||| ||||| || ||| |||||||  ||||||||||||| || |    
T  9200 attgggtaccagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagtagctgcataatctatgaggaggacacgaaatctcattattaggtgatgagtgatcgaa 9101  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |  |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  9100 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaagctgaatgatgagagaagacccaagaggagagatgc 9001  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9000 tcctgatgagattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 8901  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || || || ||||||||||| |    
T  8900 cacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatcagttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagta 8801  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  8800 ccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 8767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 437
Target Start/End: Original strand, 990 - 1421
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  990 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 1089  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1090 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 1189  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  1190 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 1289  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| || ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  1290 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 1389  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacg 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1390 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacg 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 9492 - 9924
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || || |||||  |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |    
T  9492 attgggtatcagaagataagaatcttctctgagttggtgagtagctgcaggat--atgaggaggatactaaggctctttacaaggtgatgagtgaacgaa 9589  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || ||||| ||||||| |   || || |||||||| | |||| | || || ||||| ||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  9590 gaggtaaaggacagcagagtcatcctaaaccatatagtgctcttgctgataagggaaagcaaaggatgaatgatgagaggaggccaaacaggagagatgc 9689  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9690 tcctgctgatattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 9789  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||  |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||    
T  9790 cacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataagttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttagga 9889  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  9890 ctggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaa 9924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 23686 - 23742
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcatta 85  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23686 cttttctgagctggtaagcagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcatta 23742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 437
Target Start/End: Original strand, 28003 - 28434
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28003 attggttaccaaaagataaggaatttctctgatttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgca 28102  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28103 gaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgttgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgc 28202  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||   |||||||    
T  28203 tcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaagga 28302  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| || ||  |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  28303 cacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctga 28402  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacg 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28403 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacg 28434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8613
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8180 attgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgca 8279  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8280 ggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgc 8379  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    || |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  8380 tcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggg 8478  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||||||| |||| |  || || |||||||||||     
T  8479 acacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttaga 8578  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    || ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  8579 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 439
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18827
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18394 attgggtatcagaagatcaaaaacttctctgaattggtaagttgctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgca 18493  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18494 ggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgc 18593  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    || |  ||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  18594 tcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggg 18692  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagg 404  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||||||| |||| |  || || |||||||||||     
T  18693 acacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttaga 18792  T
Q  405 acaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    || ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  18793 accggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 18827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 319829 - 319507
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  319829 attgggtatcagaagataaagaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgataagtgatcgaa 319730  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  319729 ggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaggataagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 319630  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||  |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  319629 tcctgctgggattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 319530  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcg 328  Q
    ||||| |||| | ||||||||||    
T  319529 cacacattagctaattgtaagcg 319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 326151 - 325859
Alignment:
Q  147 cctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcc 246  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||| ||    
T  326151 cctgctaacaagggtaagcagaggctgaatgatgagaggaggcc-aataggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgagaaagacc 326053  T
Q  247 acaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgcta 346  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  ||||||| ||    
T  326052 acaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgtta 325953  T
Q  347 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
     |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  325952 taactgcaatgaagagggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaa 325859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 419
Target Start/End: Original strand, 200357 - 200608
Alignment:
Q  168 agattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgacc 267  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |      
T  200357 agattgaatgatgagaggagacctaagagaagagaagttcctaatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatg 200456  T
Q  268 gagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtca 367  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||   |||||| || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||    
T  200457 gtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtca 200556  T
Q  368 tatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtg 419  Q
    | | |||||| |||| | | ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||    
T  200557 tcttagttcgcagtgcaagaagcctaagagggttcaggcaggtggaaaggtg 200608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3211 - 2783
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||      |    
T  3211 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtgagtagctgcaggatatatgaagaagatactaaagctcattacaaggtgatgtgt------a 3118  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||  |||| ||||||| |   || ||||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3117 gaggtaaatgacagcagagtcatcctaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 3018  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||  ||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  3017 tcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaagatgagaagaagttcttcaggtgtggacagaaggga 2918  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  ||||| | || || ||||||||||| |    
T  2917 cacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaa 2818  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  2817 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 8739 - 9173
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||| | ||||  || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |    
T  8739 attgggtatcagaaggttagaattttctctgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagatactaaagctcatgacaaggttatgagtgaacgaa 8838  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || ||| | |||||| || | || || |||||||| |||||  |||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8839 gaggtaaaggatagcagagttgtcataaaccatatagtgctcctgcagacaagggaaagcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgc 8938  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    | || || | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8939 ttctgctaagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaagccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaagga 9038  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||  | |||||||||||||    
T  9039 cacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaacgaagaaggttagga 9138  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  9139 ccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaa 9173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 1322 - 1758
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||     
T  1322 gctattgggtatcagcagataagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaacataatgagtgaga 1421  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| |||| | ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  1422 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcataagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcctaagaggagaga 1521  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  1522 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 1621  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  1622 ggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcccgaaccgaagaaggtta 1721  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || || ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1722 gaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgca 1758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 240 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12879
Alignment:
Q  240 aaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattg 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  13079 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgacgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttg 12980  T
Q  340 tttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12979 tttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgca 12880  T
Q  440 a 440  Q
    |    
T  12879 a 12879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Original strand, 4927 - 5361
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||| || || || | ||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4927 attgggtatcagaagattagaattttctctgaattggtgagtagctgcatgatatatgaggaagacactaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 5026  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || ||| |  ||||||||   || || |||||||| |||||| |||| || ||||| ||  ||||| |||||| | |||| | ||||||||||||    
T  5027 gaggtaaaggaaagtagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggaaagcaaaggctgaataatgagaggtggcctaggaggagagatgc 5126  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5127 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaggga 5226  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| |    
T  5227 cacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatatcagttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaa 5326  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    | ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  5327 ccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 5361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 54633 - 54199
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  54633 attgggtatcagaagatcagaaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaa 54534  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |  |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||    
T  54533 ggagcaaaggacatcagagtcgtccaaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaggttgaatgatgagaggaggcccaatagatgaaatgc 54434  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    || | |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  54433 tcttgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaggga 54334  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || ||||||||||| ||   ||| || || || || ||||||||||    
T  54333 cacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttagga 54234  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  54233 ccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaa 54199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 424
Target Start/End: Original strand, 164119 - 164537
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  164119 attgggtatcagaagatcagaattttctccgagttggtgagtagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgaacgaa 164218  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| || ||||| |||||||||   ||  | || |||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  164219 gaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgcccctgctgacaagggaaaacagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagacgc 164318  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  164319 tcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaagga 164418  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||||| |    
T  164419 cacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatcagttcgcattatactcagccgaagaaggttagaa 164518  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    | ||||| || ||||||||    
T  164519 ccggtgggaaagtgtttgc 164537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 30487 - 30549
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  30487 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 30549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 514068 - 514504
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  514068 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 514167  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || ||| |||   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  514168 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 514267  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||     
T  514268 tgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 514367  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    |||||||  |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||  ||||| |  | || ||||||||||    
T  514368 ggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggtta 514467  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | || || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  514468 gaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 514504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 442238 - 442154
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  442238 attgggtatcataagattcgtaacttttctgaactggtgagcagctgtagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 442154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6193 - 5746
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  6193 gggccattggttatcaaaagataaggaatttctcggatttggtaagcagctttagaatatatgaagaggatacgaaagctcattataaagtgatgagtga 6094  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||   || ||||||||||| |||||| |||| || || ||||   |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  6093 gcgcagaggtaagggtcagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgacaaaggaaaacagatgctgaatgatgagaggaggcctaggaggaga 5994  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    ||||| |||| ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||    
T  5993 gatgcccctaatgagactgtctatttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgagataagaagaagtgtttcagatgtggacaga 5894  T
Q  301 aaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggt 400  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || || |   | || || || || || || |||||||| | | | |||||||||||    
T  5893 aaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggt 5794  T
Q  401 taggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaa 448  Q
    | | || ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  5793 tcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaa 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 614
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggca 111  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || || |    
T  1041 tatcagcagatcagaatcttctctgagttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggta 942  T
Q  112 agggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctac 211  Q
    ||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || ||| |||  |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |    
T  941 agggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttc 842  T
Q  212 tgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacact 311  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| |    
T  841 tgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaat 742  T
Q  312 ttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtg 411  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||  ||||| |  | || ||||||||||| || || |    
T  741 ttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataagttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggg 642  T
Q  412 gcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  641 gcaaggtgtttgcattgactggtacgca 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 258 - 567
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  258 gggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtga 357  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||| |||| || |||||  |  ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  358 gcggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtccccctgctgacaagggaaagcaacggctgaatgatgagagaagacccaagaggaga 457  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  458 gatgctcctactgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 557  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  558 aaggacacac 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1090 - 798
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1090 attgggtatcagaagattagaattttctctgagttggtgagtagctgcagaatatatgaggaggataataaggctcattacaaggtgatgagtgagcgca 991  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  990 gaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaagggtaagcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgc 891  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcg 298  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  890 tcctgctgagattgtttgctacaagtgtggctagaaaggccacaagagtaatgtctgtgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtggtcg 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 1561 - 1870
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561 gggccattggctatcagaagatcagaactttttctgagttggtaagcagctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtga 1660  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| || || |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||| || |||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1661 gcggaggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaagggaaagcaacgactgaatgatgagagaaggcccaagaggaga 1760  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcgga 300  Q
    |||||| || |||| ||  |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1761 gatgctactgctgaaataatttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcaga 1860  T
Q  301 aaggacacac 310  Q
    ||||||||||    
T  1861 aaggacacac 1870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 439
Target Start/End: Original strand, 9538 - 9938
Alignment:
Q  39 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgt 138  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  9538 ttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgt 9637  T
Q  139 atagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 238  Q
    | |||||||||||| | || ||||||| |||| | |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||    
T  9638 acagtgcccctgctgataagggtaagctgagacttaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcga 9737  T
Q  239 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacat 337  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |    
T  9738 gaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgt 9836  T
Q  338 tgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacg 437  Q
    ||| || || |||| |||||| ||  | ||||||||| |  |||| || | ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  9837 tgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacg 9936  T
Q  438 ca 439  Q
    ||    
T  9937 ca 9938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 439
Target Start/End: Original strand, 30077 - 30477
Alignment:
Q  39 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgt 138  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| | || || |||||| |||||| ||||   || || |    
T  30077 ttggtaagcagctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaacctt 30176  T
Q  139 atagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 238  Q
    | ||||| |||||| |||| || || ||||   |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  30177 acagtgctcctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtga 30276  T
Q  239 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 338  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||   ||||| ||| ||| || || |||||||||  |||||||||||   ||| ||| ||||||  ||||||||||    
T  30277 aaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagagataagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacatt 30376  T
Q  339 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgc 438  Q
    || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||||    
T  30377 gtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgc 30476  T
Q  439 a 439  Q
    |    
T  30477 a 30477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15658 - 15288
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15658 attgggtatcagaagatcagaaatttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggaaacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 15559  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
       |||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15558 tgagcaaaggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaagcgaaagcagaggttaaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 15459  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    |||| |||| ||| | || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15458 tcctgctgagattttctgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggacgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatg 15360  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttc 376  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || |||||||||||    
T  15359 acacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatcagttc 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 263785 - 263379
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  263785 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagttcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtctta 263686  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  263685 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtg 263586  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  263585 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 263487  T
Q  332 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaact 431  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||||| |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |||    
T  263486 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 263387  T
Q  432 cgtacgca 439  Q
     |||||||    
T  263386 ggtacgca 263379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 203940 - 203534
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   |    
T  203940 tctgatttggtaagtcgttgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtccta 203841  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||    
T  203840 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctggtgagatagtttgttttaagtg 203741  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  |||    
T  203740 tggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatgg 203642  T
Q  332 ggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaact 431  Q
     ||  |||| || || ||||  ||||| || || ||||||||| |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |||    
T  203641 tgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgact 203542  T
Q  432 cgtacgca 439  Q
     |||||||    
T  203541 ggtacgca 203534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 424697 - 424637
Alignment:
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  424697 tgctcctactgagattgtgtgcttcaactgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtttgt 424637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 424840 - 424748
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| || ||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||    
T  424840 tatgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacaatgcccctgct 424748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 40611 - 40211
Alignment:
Q  39 ttggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgt 138  Q
    ||||||||  |||| || || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||    
T  40611 ttggtaagtcgttgcagaatctataaagaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtatgggacaacagagtcgtcctaaaccgt 40512  T
Q  139 atagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtga 238  Q
    | |||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  |||||||| ||    
T  40511 acagtgcccctgctgacaagggaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggcga 40412  T
Q  239 aaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacatt 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||  ||||| |||||| | ||  ||    
T  40411 gaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgtt 40312  T
Q  339 gtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgc 438  Q
    || || || |||| |||||| || || ||||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  40311 gtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgc 40212  T
Q  439 a 439  Q
    |    
T  40211 a 40211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 252208 - 251820
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||     
T  252208 gctattaggtatcagaagattagaattttctctgaattggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgaga 252109  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||| | ||||   || || || ||||| ||||||  ||  || || || |   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  252108 ggaggggtaagggacaacataatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgccacaggaaaacataagatgaatgatgataggaggcccaagaggagaga 252009  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||   ||||||||| ||| || || |||||||||| ||||    
T  252008 tgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagctatgcttgtggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaaa 251909  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcc 391  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  251908 ggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactcagcc 251820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 229765 - 229827
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  229765 gatgctcctgcggagattgtttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 141 - 439
Target Start/End: Original strand, 4998 - 5296
Alignment:
Q  141 agtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaa 240  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||    
T  4998 agtgctcctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttaaaagagtgatgaaa 5097  T
Q  241 aaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgt 340  Q
    |||||||||| |  |||| |||||   || |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5098 aaggccacaaaaacaatgcttgtggtagaaatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgt 5197  T
Q  341 ttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||    
T  5198 ctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgca 5296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Original strand, 17215 - 17635
Alignment:
Q  19 agataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggaca 118  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17215 agattagaatcttctctgatttggtaaatcgttgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggaca 17314  T
Q  119 acagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatatt 218  Q
     |||||||||   || ||||| |||||||||||| |||| || || || ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||     
T  17315 gcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctgacaagggaaaacaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagata 17414  T
Q  219 gtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagtt 317  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||| ||||      
T  17415 gtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-accaaggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcg 17513  T
Q  318 gattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaagg 417  Q
    ||||  | |||||| ||  |||| || ||||| | |||||| || || ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||      
T  17514 gattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaa 17613  T
Q  418 tgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  17614 tgtttgctttgactggtacgca 17635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 427
Target Start/End: Original strand, 4621 - 4988
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| |||||||||  | |||| |    
T  4621 tatgaggaggacacaaaacctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgccccttttgacaagg 4720  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | ||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4721 gaaagcaaagactgaatgatgagaggaggccaaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggccagaaaggccacaagagtaatgt 4820  T
Q  260 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 359  Q
    ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||||    
T  4821 ttgtaccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgag 4920  T
Q  360 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttt 427  Q
    || || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  4921 gagggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcttt 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 42267 - 41888
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | || || ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  42267 tatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaag 42168  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | |||||||   ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42167 gaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 42068  T
Q  260 ttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgag 359  Q
    |||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |    
T  42067 ttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggg 41968  T
Q  360 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  41967 gaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgca 41888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 346
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6315
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaa 132  Q
    ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |    
T  6002 tctgatttggtaagtcattgcaggatttatgaggaggacaccaaagctcattataaagtgatgagtgaacgaagaggtaagggacaacagagtcgtccta 6101  T
Q  133 agccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtg 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   || || |||||||| |||||    
T  6102 agccgtacagtgcccctgctgacaagggtaagcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgtcgagatagtttgttttaagtg 6201  T
Q  233 tggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    ||| |||||||||||||||    
T  6202 tggcgagaaaggccacaagagtaacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtgg 6300  T
Q  332 ggacattgtttgcta 346  Q
     || ||||| |||||    
T  6301 cgatattgtatgcta 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22708 - 22311
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  22708 attgggtatcagaagataagaattttctctgatttggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattatatggtgatgagtgggcgaa 22609  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    | || ||||||||  |||||| |   || || || |||||||||||  |||| || || || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22608 ggggtaagggacagtagagtcttcctaaaccatacagtgcccctgccgacaaaggaaatcaaagactgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 22509  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    ||||  ||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22508 tcctgttgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgttt-ttactaaggatgagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaagg 22410  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttag 403  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||    
T  22409 acacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttag 22311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Original strand, 33087 - 33337
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33087 gctattgggtatcaaaagattagaattttctctgagttggtaagcagctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 33186  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||||||||   || || || ||||| |||||| |||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33187 gaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctcctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagaga 33286  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 253  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287 tgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 33337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 424
Target Start/End: Original strand, 66823 - 67244
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||   || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  66823 gctattgggtatcagcagatcagagtgttctctgatttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 66922  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||| | |||| || ||| |||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  66923 ggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgttgacaaaggaaagtagatgatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 67022  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| ||| || |||||||||||||  ||     
T  67023 tgctccttccgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagacatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaaaag 67122  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| | ||||   |||| |||| |||||    
T  67123 ggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgtagtgagccgaagagggtta 67222  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    | || ||||| || ||||||||    
T  67223 gaactggtggaaaagtgtttgc 67244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 439
Target Start/End: Original strand, 518 - 954
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| || || |||| | |||||||| | |||||| ||     
T  518 gctattgggtatcagcagattagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagtttattacaagataatgagttaga 617  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||  | |||| || |||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  618 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctattgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagaga 717  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  718 tgctccttctgagattgtttgttacaagtttggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagacgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaag 817  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggtta 402  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  || |||||||| |||||| ||||| |  | || ||||||||||    
T  818 ggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatattagttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggtta 917  T
Q  403 ggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    | ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  918 gaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgca 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 372
Target Start/End: Original strand, 23638 - 24007
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| |  || || || || |||||||| || || ||| ||||||| ||| | |||||||||     
T  23638 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataagattatgagtgaga 23737  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23738 ggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagaga 23837  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaa 302  Q
    |||||||  ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  23838 tgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaag 23937  T
Q  303 ggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 372  Q
    || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  23938 ggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggggaaggtcatatca 24007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 289
Target Start/End: Original strand, 1019 - 1305
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||     
T  1019 gctattgggtatcagcagatcagattcttctctgagttggtaaacagttgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgaga 1118  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagaga 202  Q
    | || || ||||||||  ||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1119 ggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagaga 1218  T
Q  203 tgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  1219 tgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagagatgagaggaagtgcttcag 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 198 - 440
Target Start/End: Original strand, 764 - 1006
Alignment:
Q  198 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 297  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  764 agagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcaagaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 863  T
Q  298 ggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaa 397  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||  |||||||||| || | |||    
T  864 agaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaa 963  T
Q  398 ggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  964 ggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaa 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 3769 - 3920
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3769 attgggtatcagaagatcaggaacttctctgaattggtaagtagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaa 3868  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaa 157  Q
    |  |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3869 ggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaa 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 331
Target Start/End: Original strand, 53141 - 53466
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  53141 attgggtatcaaaagattagaatcttctcggatttggtgagtagctgcaggatatatgaggaagacaccaaggctcattataaggtgatgagtgagcgaa 53240  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgc 205  Q
    |||  |||||||| ||   ||||   || || || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53241 gagataagggacatcaagttcgtcctaaaccatacagtgcccctgctgacaagggaaagcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgc 53340  T
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagg 304  Q
    || | |||  || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  53341 tcttgctgggatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgt-actaaggatgagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaagg 53439  T
Q  305 acacactttagttgattgtaagcgtgg 331  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||    
T  53440 acacatcctagttgattgcaagcgtgg 53466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 12112
Alignment:
Q  251 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaac 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12301 gagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaac 12202  T
Q  351 ttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  12201 tgtaatgaagaaggacatattagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaa 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12400 - 12322
Alignment:
Q  136 cgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactga 214  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12400 cgtatagtgctcctgctgacaaagataaacagaggctgaatgatgagaggaggccttagaggagagatgctcctactga 12322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 574 - 775
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  574 gggctattggctaccaaaagataaggaatttttcttaattagtgagcagctgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcac-ataaggtgatgagtga 672  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||   || ||||| ||||| |||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  673 gtgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtacagtgctcctgctgacaaaggtaaatagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggaga 772  T
Q  201 gat 203  Q
    |||    
T  773 gat 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Original strand, 3999 - 4080
Alignment:
Q  198 agagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaaga 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3999 agagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtttggtgaaaagggaaacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaaga 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Original strand, 16351 - 16584
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | || |||||||||     
T  16351 ttttctgaattggtgagaagttgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtc 16450  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
     |||||| |||||||| |||||| | || |||||||| ||  |||||||||||| |||||| |  | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||    
T  16451 caaagccttatagtgctcctgctgataaaggtaagcaaagggtgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaa 16550  T
Q  230 gtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16551 gtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 16584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 216 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30310 - 30102
Alignment:
Q  216 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 315  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||   |||    
T  30310 attgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgtggtagagatgagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctag 30211  T
Q  316 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaa 415  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  30210 ctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaa 30111  T
Q  416 ggtgtttgc 424  Q
    |||||||||    
T  30110 ggtgtttgc 30102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30499 - 30334
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||   |||||||||     
T  30499 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagacaatgagtgaga 30400  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcaga 168  Q
    | || ||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||    
T  30399 ggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaga 30334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2363 - 2198
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || ||||| ||||||||| || |||| |    
T  2363 tatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctactgacaaag 2264  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtt 225  Q
    | ||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2263 gaaagcaaaggttgaatgatgagaggaggcggaataggagagatgctcctgctgagatagtttgtt 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 115982 - 115730
Alignment:
Q  172 tgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgaga 271  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||  ||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |  |||    
T  115982 tgaatgatgagagaaggcccaagggaagagacactcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaaga 115883  T
Q  272 tgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| |||||||| || || || ||||| || | ||| | ||| |||||||||    
T  115882 tgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatatagtatgctataattgcaatggggagggtcatatc 115783  T
Q  372 agttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgc 424  Q
    |||||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  115782 agttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgc 115730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Original strand, 93618 - 93703
Alignment:
Q  12 tatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgag 97  Q
    ||||||||||| ||||  || || |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  93618 tatcagaagatcagaattttctcagaattggtgagtagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggtgatgag 93703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1103
Alignment:
Q  163 agcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1368 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 1269  T
Q  263 tgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaa 362  Q
      |  | || ||||||||||||||| | |||||   ||| || || ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||| ||| |   ||||  ||    
T  1268 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaataa 1169  T
Q  363 ggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 428  Q
    |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| |  | || |||| | |||||||||||||    
T  1168 ggtcatctcagttcacagtgtaagaagcctaagaaggctcaggcaagtggaagggtgtttgcttta 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8119 - 7911
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtt 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||| || ||  |||||     
T  8119 ttttctgaattggtgagtagttgtagaatttatgaggaggatacgaaggctcattataaggttaggagtgagcggaggaacaagggtcagcaaggtcgtc 8020  T
Q  130 aaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaa 229  Q
      ||||| || ||||| |||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  8019 cgaagccctacagtgctcctgttgacaaaggagagcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaa 7920  T
Q  230 gtgtggtga 238  Q
    |||||||||    
T  7919 gtgtggtga 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12173 - 12038
Alignment:
Q  216 attgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 315  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  12173 attgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttag 12074  T
Q  316 ttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaact 351  Q
     ||| || ||||||||||||||| | || |||||||    
T  12073 ctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaact 12038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 748 - 850
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  748 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 847  T
Q  101 gcg 103  Q
    |||    
T  848 gcg 850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26051 - 25949
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26051 gggccattggttatcagaagattagaaacttttctgagttggtgagtagctgtaggatttatgaggatgataccaaagctcattataaggtgatgagtga 25952  T
Q  101 gcg 103  Q
    |||    
T  25951 gcg 25949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 295
Target Start/End: Original strand, 996 - 1237
Alignment:
Q  54 aggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgcta 153  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   || |||||||||||||| |||     
T  996 aggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgaagagtgagcgaagaggtaagggacatcagaatcgtcctaaaccgtatagtgccccggctg 1095  T
Q  154 acaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 253  Q
    | || |||||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||  | |||| || |||| || || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  1096 ataagggtaagcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagaagggtgcttctgctgagatagtatgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagag 1195  T
Q  254 taatgtttgtgaccga-gatgagaagaagtgcttcaggtgtgg 295  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1196 taacgtttgt-accaaggatgagaagaagtgtttcagatgtgg 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7464 - 7202
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  7464 gggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 7365  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||   |||||| || ||||| |||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || |    
T  7364 gcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaa 7265  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  7264 gatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 7202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14594 - 14332
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  14594 gggcaattggttaccagaagatccgtaatttttctgagctggtgagcagttgcaggatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 14495  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||   |||||| || ||||| |||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || |    
T  14494 gcggaaaggcaagagtcagcaaagtcgaccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaa 14395  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  14394 gatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 14332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 57327 - 57589
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  57327 gggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 57426  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | |||||| || || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |  | || |    
T  57427 gcggaaaggcaaaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaa 57526  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||  ||| |||||||  |  |  ||||| || |||||||| |||||||||| ||||    
T  57527 gatgctcctgttgagattgtttactatacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgt 57589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 67
Alignment:
Q  9 ggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  149 ggttatcagaagattagaaatttttctgaattggtaagcagcagtaggatttatgaagaggatacgagagctcactataaggt 67  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 30741 - 30843
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30741 gggccattggttatcagaggattaggcaattttctgaattggtgagcagttgtagaatctacgaagaggataccaaagctcattacaaggttatgtgtga 30840  T
Q  101 gcg 103  Q
    |||    
T  30841 gcg 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 286
Target Start/End: Original strand, 30895 - 31011
Alignment:
Q  170 attgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccga 269  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  |     
T  30895 attgaatgatgagaggagaactaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggt 30994  T
Q  270 gatgagaagaagtgctt 286  Q
    |||||||||||||||||    
T  30995 gatgagaagaagtgctt 31011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 104817 - 104561
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||    
T  104817 gggcaattggttaccagaagatccgtactttttctgagctggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattgtgaatga 104718  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    ||| | || ||| || || |||||||||  |||||| |||||||| |||||| | || || || |||||| ||| |||||||| | |||| |  | || |    
T  104717 gcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctgctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaa 104618  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaat 257  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  104617 gatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaat 104561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 19023 - 19121
Alignment:
Q  342 tgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 440  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  19023 tgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12214 - 11981
Alignment:
Q  206 tcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaagga 305  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |  | |||||||| ||||||||  | |||||   ||||||     
T  12214 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtgatgagaaaaagtgctttcgatgtgggaagaaaggg 12115  T
Q  306 cacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttagga 405  Q
    || ||  |||  || || |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  ||    
T  12114 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaga 12015  T
Q  406 caggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca 439  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  12014 caggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgca 11981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1397
Alignment:
Q  7 ttggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtag 106  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||| || |||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||   |||||||| | |     
T  1141 ttggatatcagaagatcggtaacttttctaaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcatcacaaggctgtgagtgagaggaa 1240  T
Q  107 aggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgct 206  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| | || ||| |||||||  |||||||||||| | | |||||||||| |||   |    
T  1241 aggtaagagtcaacagaatcgtccaaagccttacagtactcctgctgataagggtgagcagagggtgaatgatgagaggggacccaagaggaaagagaat 1340  T
Q  207 cctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||  ||||||||| |   || || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1341 cctactgaagttgtttgttaccgatgaggagagaaaggtcacaagagtaatggttgt 1397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Original strand, 240 - 455
Alignment:
Q  48 agttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgccc 147  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||| |||||    
T  240 agttgtagaatctatgaagaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatattgccc 339  T
Q  148 ctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 247  Q
    ||||| | || || || || ||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  340 ctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctacggagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggcca 439  T
Q  248 caagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||| |||||||||    
T  440 caagagcaatgtttgt 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Original strand, 3736 - 3863
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||  ||| |||||||| | |||||    
T  3736 aagccctatagtgctcctgctgacaaggggaaacaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgtttctgttgagattgtttgctacaagt 3835  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||    
T  3836 gtggcgagaggggccacaagagtaatgt 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7754
Alignment:
Q  213 gatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7704 gatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 7754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 91
Target Start/End: Original strand, 7542 - 7582
Alignment:
Q  51 tgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7542 tgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggt 7582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18436 - 18174
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | ||||||| |||  |||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||| |||    
T  18436 gggcaattggttaccagaagatccgtaacttttttgagctggtgagtagttgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctgtgaatga 18337  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | | ||| || || ||  | ||||||  |||||| || | ||| |||||| | || |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |  | || |    
T  18336 gaggaaaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagccttacaatgctcctgctgataagggtaagcaaagagttaatgatgagaggaggccaagaaagaaa 18237  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||| || |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18236 gatgctactgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 18174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 216133 - 216395
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  || | |||||||| |  || |||||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  216133 gggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctgctgagcagttgcataatatatgagaaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 216232  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggaga 200  Q
    | | | ||||||||| || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||| | | |||||| |  | || |    
T  216233 gaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgataaaaggaggcctagaaagaaa 216332  T
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |  | |||| |||||||| | ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  216333 gatgatgttgctgagattgtttgctacacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 216395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 20
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  |||| |||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||| |||    
T  208 gggcaattggttaccagaaaatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcaaaatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttgtgaatga 109  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcc 190  Q
    | | | ||||||||  || || ||||||  |||||| || ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  108 gaggaaaggcaaggt-cagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcc 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17828 - 17703
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  17828 gctattgggtatcagcagatcagagtcttctctgagttggtaaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgaga 17729  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    | || || |||||||| |||||||||    
T  17728 ggaggggtaagggacagcagagtcgt 17703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Original strand, 13213 - 13449
Alignment:
Q  27 aacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtc 126  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||| |||| ||||  ||| |||| | | ||||||||| || || |||     
T  13213 aacttttctgagctggtgagcagttgtagaatatatgaggaagatactaaggctcgttacgaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtt 13312  T
Q  127 gttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgttt 226  Q
    ||  |||| | |  ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |  | || ||||| |  |||||| |||||||| |     
T  13313 gtccaaagtcttgcagtgctcctgctgataagggtaagcaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgttgttactgagattgtttgcta 13412  T
Q  227 caagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  13413 cacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgt 13449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 9835 - 9922
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaa 88  Q
    |||| ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9835 gggcaattggatatcagaagatccgtaactttactgaattagtgagcagttgcagaatctatgaagaggataccaaagcacattacaa 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36161
Alignment:
Q  175 atgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36245 atgatgagaggagacctaagagaagagatgcccctactaagattgtttgctacaggtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 36161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11619 - 11468
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||| |||    
T  11619 gggcaattggttaccagaagatccgtaacttttctgagctggtgagcagttgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatga 11520  T
Q  101 gcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgct 152  Q
    | | | ||||||||| || || ||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  11519 gaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctgct 11468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1721 - 1583
Alignment:
Q  151 ctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaa 250  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||||||    
T  1721 ctaacaaaggcaaacaaagattgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgttaagggccacaa 1622  T
Q  251 gagtaatgtttgtgaccgagatgagaagaagtgcttcag 289  Q
    |||||||| |||   || |||||||||||| || |||||    
T  1621 gagtaatgcttgcacccaagatgagaagaaatgtttcag 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1771
Alignment:
Q  36 gaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgag 101  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1836 gaattggtgagtagctgtagaatttatgaggaggatacaaaggctcattataaggtgatgagcgag 1771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 10071 - 10133
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10071 gatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 208
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  270 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 13037 - 13099
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13037 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17551 - 17489
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17551 gatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3953 - 3865
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccc 148  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||    
T  3953 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 3865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 613 - 744
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||||||||  |||| |||  ||||||||| |    
T  613 aagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaatt 712  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  713 gtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 117
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||| |    
T  248 aagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaatt 149  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  148 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9326
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||||| |  | || |||| || ||||||| |||||||| |  |  |    
T  9195 aagccttatagtgctcctgctgataagggtaaacaaagattgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactactactgagattgtttgctatactt 9294  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9295 gtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 9068 - 9153
Alignment:
Q  5 tattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaagg 90  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  9068 tattgggtatcagaagatccgttacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatactaaagctcattacaagg 9153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5679 - 5589
Alignment:
Q  1 gggctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  5679 gggccattggatatcagaagatccgtgacttttctgaactggtgagcagttgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggt 5589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 11269 - 11331
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11269 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 14954 - 15016
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14954 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 15016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 10152 - 10214
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10152 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 10214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 12807 - 12869
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12807 gatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgt 12869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48293 - 48059
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  48293 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgt 48194  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||||| || ||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  48193 cctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 48094  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48093 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 48059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 55212 - 55441
Alignment:
Q  29 cttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | || ||| || || |||||||||    
T  55212 cttttctgagttggtgagcagttgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagacaaaggtcagcagagtcgt 55311  T
Q  129 taaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttca 228  Q
       ||| | || ||||| |||||| | || ||||| |||||| ||  |||||||| | | || |  | || ||||||||||  ||| ||||| || |  |    
T  55312 cctaagacttacagtgctcctgctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctata 55411  T
Q  229 agtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 258  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55412 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 55441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 263
Target Start/End: Original strand, 139391 - 139585
Alignment:
Q  69 gatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcaga 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| ||||||||||||||| | || || || ||||    
T  139391 gatacaaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacaga 139490  T
Q  169 gattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    || ||   ||||| | | |||| |||| ||| ||| ||||  |||| |||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139491 gaatggtcgatgataggcggcctaagaagagggatactccagctgagattacttgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 139585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 179
Alignment:
Q  225 ttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  217 ttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2252
Alignment:
Q  30 ttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2313 ttttctgaattggtgagtagttgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggt 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15996 - 15911
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    |||||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  15996 attggttaccagaagatccgtaatttttctgagttggtgagcagttgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggt 15911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 468
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||| | |    
T  652 attggatatcaaaagatccgtaacttttctgaactggtgtgcagttgcagagtctatgaggaggatactaaagctcattacaaggctgtgagtgagagga 553  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcc 190  Q
     ||| ||||| || || |||||   |||||| || || || |||||| | || ||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  552 aaggtaagggtcagcaaagtcgcccaaagccttacagcgctcctgctgataagggtaaacaaagagtgaatgatgagaggaggcc 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 445
Alignment:
Q  202 atgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgttt 261  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  504 atgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5327
Alignment:
Q  60 tatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatg 159  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |    |||||| || ||||||||    ||||| |||||||||| |||| | || |    
T  5530 tatgatgaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttgctgataagg 5431  T
Q  160 gtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgt 259  Q
    | || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  5430 gcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaagggccataagagtaatgt 5331  T
Q  260 ttgt 263  Q
    ||||    
T  5330 ttgt 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36827
Alignment:
Q  132 aagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcagagattgaatgatgagaagaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagt 231  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || || || |||||| ||   ||||| | | |||| |||| ||  ||||||||| | || || || |||||||| |    
T  36958 aagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagatcgtctgtttcaatt 36859  T
Q  232 gtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36858 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 36827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 13945 - 14007
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13945 gatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgt 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2575 - 2453
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgta 105  Q
    |||||||| ||||||||  ||  |||||||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  2575 attggttaccagaagatccgagtcttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaa 2476  T
Q  106 gaggcaagggacaacagagtcgt 128  Q
      | |||||| ||||||||||||    
T  2475 aggccaagggtcaacagagtcgt 2453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 369
Alignment:
Q  201 gatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  431 gatgttcctgctgagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgt 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 541
Alignment:
Q  33 tctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggt 91  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  599 tctgagttggtgagcagttgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaaggt 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 171489 - 171447
Alignment:
Q  221 ttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171489 ttgttacaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 171447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Original strand, 130 - 179
Alignment:
Q  40 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  130 tggtgagcagttgcaggatttatgatgaggatactaaggctcattacaag 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 13769 - 13934
Alignment:
Q  3 gctattggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagc 102  Q
    |||||| | |||||| |||| |||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||||||     
T  13769 gctattagatatcagcagatcagagtcttctctgagttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaagataatgagtgaga 13868  T
Q  103 gtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgtatagtgcccctgctaacaatggtaagcaga 168  Q
    | || || |||||||| |||| ||||   ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||||    
T  13869 ggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcaga 13934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 71
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16306
Alignment:
Q  6 attggttatcagaagataagaaacttttctgaattggtaagcagttgtaggatttatgaagaggat 71  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  16241 attggttaccagaagattcgaaacttttctgagctggtgagcagttgcaggatttacgaggaggat 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2781 - 2732
Alignment:
Q  40 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaag 89  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  2781 tggtgagcagttgcaggatttatgaggaggatacaaagactcattacaag 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15463 - 15351
Alignment:
Q  40 tggtaagcagttgtaggatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgttaaaagccgta 139  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  ||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||    ||||| ||    
T  15463 tggtgagcagttgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagcctta 15364  T
Q  140 tagtgcccctgct 152  Q
    |||||||||||||    
T  15363 tagtgcccctgct 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 17920 - 17952
Alignment:
Q  231 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17920 tgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgt 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 4498 - 4530
Alignment:
Q  231 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4498 tgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University