View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12580_low_25 (Length: 351)

Name: NF12580_low_25
Description: NF12580
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12580_low_25
NF12580_low_25
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (1-333)||(9905157-9905489)
chr2 (2-333)||(9770347-9770677)
chr2 (2-333)||(11402760-11403091)
chr2 (2-325)||(4212786-4213109)
chr2 (2-325)||(22957317-22957640)
chr2 (2-333)||(10269881-10270212)
chr2 (2-333)||(39177682-39178013)
chr2 (2-321)||(40225187-40225506)
chr2 (9-325)||(29247119-29247435)
chr2 (2-322)||(27224325-27224645)
chr2 (9-325)||(43085597-43085913)
chr2 (2-322)||(43348298-43348618)
chr2 (26-325)||(24335348-24335647)
chr2 (9-322)||(34797818-34798131)
chr2 (2-179)||(35255887-35256064)
chr2 (2-179)||(35266511-35266688)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-333)||(4995365-4995697)
chr4 (5-333)||(14847511-14847839)
chr4 (3-333)||(21999374-21999704)
chr4 (9-333)||(453525-453849)
chr4 (9-325)||(27822513-27822829)
chr4 (2-333)||(10748168-10748499)
chr4 (2-333)||(10961937-10962268)
chr4 (9-333)||(30934057-30934382)
chr4 (2-325)||(16258814-16259137)
chr4 (2-333)||(36021244-36021575)
chr4 (26-325)||(24025052-24025351)
chr4 (2-321)||(27659566-27659885)
chr4 (9-325)||(19951978-19952294)
chr4 (26-325)||(27190861-27191160)
chr4 (9-325)||(40467570-40467886)
chr4 (26-325)||(17921071-17921370)
chr4 (2-179)||(55752979-55753156)
chr4 (2-179)||(49510487-49510664)
chr4 (2-179)||(24643275-24643452)
chr4 (50-248)||(18760151-18760349)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (10-333)||(12245124-12245447)
chr3 (2-333)||(10633960-10634291)
chr3 (1-333)||(23760232-23760564)
chr3 (2-333)||(13124634-13124965)
chr3 (2-333)||(14468560-14468891)
chr3 (2-333)||(4746658-4746989)
chr3 (2-333)||(5873267-5873598)
chr3 (2-333)||(12293756-12294087)
chr3 (2-333)||(16426725-16427056)
chr3 (2-333)||(24391085-24391416)
chr3 (2-333)||(24662809-24663140)
chr3 (2-333)||(41686588-41686919)
chr3 (2-333)||(5624964-5625295)
chr3 (2-322)||(5513611-5513931)
chr3 (2-325)||(20680776-20681099)
chr3 (2-322)||(39375024-39375344)
chr3 (2-321)||(11279978-11280297)
chr3 (2-321)||(28321816-28322135)
chr3 (2-333)||(38197710-38198041)
chr3 (9-325)||(37869405-37869721)
chr3 (9-325)||(37877923-37878239)
chr3 (2-322)||(5544598-5544918)
chr3 (9-325)||(19781364-19781680)
chr3 (9-322)||(13380249-13380562)
chr3 (9-322)||(13390843-13391156)
chr3 (25-325)||(6217631-6217931)
chr3 (9-333)||(8777604-8777928)
chr3 (9-177)||(18486937-18487105)
chr3 (44-248)||(9990920-9991124)
chr3 (9-248)||(6497998-6498237)
chr3 (9-248)||(12185398-12185637)
chr3 (9-179)||(16388608-16388778)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (1-333)||(22450317-22450649)
chr6 (9-325)||(27375694-27376010)
chr6 (9-325)||(27466051-27466367)
chr6 (2-326)||(26867697-26868021)
chr6 (2-333)||(26028315-26028646)
chr6 (2-333)||(12724414-12724745)
chr6 (2-333)||(25790609-25790940)
chr6 (2-322)||(16951900-16952220)
chr6 (2-325)||(12857812-12858135)
chr6 (2-322)||(3664321-3664641)
chr6 (9-325)||(9120079-9120395)
chr6 (2-325)||(32969534-32969857)
chr6 (2-325)||(34814751-34815074)
chr6 (18-333)||(27496621-27496936)
chr6 (2-179)||(27344635-27344812)
chr6 (2-179)||(27405375-27405552)
chr6 (2-179)||(32308782-32308959)
chr6 (203-321)||(28566552-28566670)
chr6 (9-159)||(26024654-26024804)
chr6 (50-179)||(4633863-4633992)
chr6 (194-248)||(26036697-26036751)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (9-333)||(5223-5547)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (2-333)||(31841108-31841439)
chr5 (15-325)||(34779584-34779894)
chr5 (2-333)||(6983496-6983827)
chr5 (2-333)||(14037731-14038062)
chr5 (2-333)||(14560894-14561225)
chr5 (2-333)||(23303968-23304299)
chr5 (2-333)||(24574762-24575093)
chr5 (2-333)||(24590902-24591233)
chr5 (2-333)||(27467851-27468182)
chr5 (2-333)||(39493726-39494057)
chr5 (1-333)||(15996135-15996467)
chr5 (2-333)||(14449850-14450181)
chr5 (2-333)||(24819716-24820047)
chr5 (2-322)||(23369636-23369956)
chr5 (2-322)||(23704480-23704800)
chr5 (2-322)||(30230267-30230587)
chr5 (2-322)||(36585356-36585676)
chr5 (2-322)||(9343655-9343975)
chr5 (9-325)||(40398064-40398380)
chr5 (2-322)||(42050480-42050800)
chr5 (2-325)||(22154218-22154541)
chr5 (9-325)||(5293386-5293702)
chr5 (2-322)||(24815614-24815934)
chr5 (9-325)||(27606265-27606581)
chr5 (26-325)||(39360198-39360497)
chr5 (9-333)||(35223196-35223520)
chr5 (2-179)||(17614910-17615087)
chr5 (2-179)||(17726767-17726944)
chr5 (2-179)||(27045075-27045252)
chr5 (2-179)||(31356384-31356561)
chr5 (2-179)||(15766616-15766793)
chr5 (2-179)||(37732803-37732980)
chr5 (9-179)||(31445701-31445871)
chr5 (50-179)||(36695546-36695675)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (9-323)||(5291-5605)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (5-333)||(44347-44675)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-333)||(12733411-12733743)
chr1 (2-333)||(7510154-7510485)
chr1 (2-333)||(51653487-51653818)
chr1 (2-325)||(12620778-12621101)
chr1 (2-333)||(35398124-35398455)
chr1 (2-322)||(35645661-35645981)
chr1 (2-322)||(36244054-36244374)
chr1 (2-321)||(3174471-3174790)
chr1 (2-321)||(38097967-38098286)
chr1 (26-325)||(5647329-5647628)
chr1 (2-325)||(21866541-21866864)
chr1 (9-325)||(4170187-4170503)
chr1 (9-333)||(47615549-47615873)
chr1 (9-333)||(5836088-5836412)
chr1 (9-325)||(19181803-19182119)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (9-333)||(1497-1821)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (9-333)||(464623-464947)
chr7 (2-333)||(26397747-26398078)
chr7 (2-331)||(40049757-40050086)
chr7 (2-325)||(169805-170128)
chr7 (2-333)||(8009720-8010051)
chr7 (2-322)||(26693403-26693723)
chr7 (9-326)||(2713271-2713588)
chr7 (2-322)||(9088155-9088475)
chr7 (9-325)||(9436189-9436505)
chr7 (2-321)||(11008107-11008426)
chr7 (2-325)||(17957776-17958099)
chr7 (2-325)||(22092059-22092382)
chr7 (9-325)||(21000070-21000386)
chr7 (2-325)||(8620279-8620602)
chr7 (2-325)||(4214925-4215248)
chr7 (9-333)||(42868757-42869081)
chr7 (9-325)||(6874893-6875209)
chr7 (9-241)||(5688458-5688690)
chr7 (2-179)||(1990472-1990649)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (2-333)||(3356236-3356567)
chr8 (2-333)||(9344040-9344371)
chr8 (2-333)||(36295863-36296194)
chr8 (2-333)||(44484054-44484385)
chr8 (2-322)||(244749-245069)
chr8 (2-325)||(6154002-6154325)
chr8 (2-321)||(13696183-13696502)
chr8 (9-325)||(15788281-15788597)
chr8 (2-325)||(26114211-26114534)
chr8 (9-333)||(36080854-36081178)
chr8 (9-325)||(19131631-19131940)
chr8 (28-322)||(29079358-29079652)
chr8 (50-248)||(32085388-32085586)
chr8 (243-322)||(808109-808189)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (2-333)||(34055-34386)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (2-333)||(44561-44892)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (9-310)||(2074-2375)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (11-324)||(21277-21590)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (28-325)||(50558-50855)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (9-248)||(3985-4224)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (50-179)||(4279-4408)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (134-174)||(132365-132405)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9905489 - 9905157
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9905489 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttg 9905390  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9905389 gtgatctgcttcttcttagactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 9905290  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9905289 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgtacatccagatgatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 9905190  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9905189 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 9905157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9770677 - 9770347
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9770677 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 9770578  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  9770577 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtagg- 9770479  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9770478 tttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 9770379  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9770378 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 9770347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11403091 - 11402760
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11403091 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 11402992  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  11402991 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 11402892  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11402891 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 11402792  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11402791 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 11402760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 4212786 - 4213109
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4212786 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 4212885  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||||   ||||||||     
T  4212886 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcagattgtaggt 4212985  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4212986 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 4213085  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  4213086 cgcatatcagaatctagtttcttg 4213109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22957640 - 22957317
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22957640 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 22957541  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| | ||||||||     
T  22957540 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttctgattgtaggt 22957441  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22957440 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 22957341  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  22957340 cgcatatcagaatctagtttcttg 22957317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 10269881 - 10270212
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10269881 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 10269980  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||||    || || || ||||||      
T  10269981 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggctacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcagactgattttcttgttgtagct 10270080  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10270081 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 10270180  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10270181 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 10270212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39178013 - 39177682
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39178013 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 39177914  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  39177913 tgatctgcttctttttagattttctgtctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 39177814  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39177813 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatatggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 39177714  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39177713 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 39177682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 40225187 - 40225506
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40225187 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattattccttgg 40225286  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  40225287 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 40225386  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40225387 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 40225486  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  40225487 cgcatatcagaatctagttt 40225506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 29247119 - 29247435
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29247119 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 29247218  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     ||||| || ||||| | |||||||    
T  29247219 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaaacttatcttcttcttgtaagttttgtag 29247318  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29247319 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 29247418  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  29247419 cagaatctagtttcttg 29247435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 27224325 - 27224645
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27224325 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 27224424  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||| |   || || |  ||||||      
T  27224425 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaagctgattttctggttgtagct 27224524  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27224525 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 27224624  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27224625 tgcatatctgtatctagtttc 27224645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 43085597 - 43085913
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  43085597 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcgagatactcttccttggtgatctg 43085696  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  43085697 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaagcttatcttcttcttgtaagttttgtag 43085796  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43085797 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 43085896  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  43085897 cagaatctagtttcttg 43085913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 43348298 - 43348618
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  43348298 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttctgcaaggtattcttccttgg 43348397  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  43348398 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 43348497  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348498 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacattcaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 43348597  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43348598 tgcatatctgtatctagtttc 43348618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24335647 - 24335348
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24335647 gatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagccagatattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttc 24335548  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||| |     
T  24335547 tgcctttggccacaggcagatcaccaccatatatctcttcagggacatctttcaagatgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggc 24335448  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24335447 cctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 24335348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34798131 - 34797818
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34798131 gaatagtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagccgcatcttgagcaagatattcttccttggtgatctg 34798032  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||||  |||||||    
T  34798031 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtagcttttgtag 34797932  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34797931 aagtccaagatgtaggccctttgtacatccagtggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactaggtcagatattacatcagattcatgcatat 34797832  T
Q  309 ctgtatctagtttc 322  Q
    | | ||||||||||    
T  34797831 cagaatctagtttc 34797818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 35255887 - 35256064
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35255887 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 35255986  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35255987 tgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 35256064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 35266511 - 35266688
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35266511 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 35266610  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  35266611 tgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 35266688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4995697 - 4995365
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4995697 ctcctcaagaatggtggagatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 4995598  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4995597 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatccttcaggtcaatctttttcttgtagg 4995498  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4995497 atttgtagaattccatgatgaaagttctttgcacatccagaggatctttcttgcatatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 4995398  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4995397 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 4995365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14847839 - 14847511
Alignment:
Q  5 tcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14847839 tcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttcgttggtga 14847740  T
Q  105 tctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggattt 204  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||||| |||    
T  14847739 tctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggtttt 14847640  T
Q  205 gtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgc 304  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14847639 gtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgc 14847540  T
Q  305 atatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14847539 atatctgtatctagtttcttgcaagttga 14847511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 21999374 - 21999704
Alignment:
Q  3 cctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21999374 cctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggt 21999473  T
Q  103 gatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggat 202  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| |||| |   ||||| || ||||||  |    
T  21999474 gatctgcttcttcttagattttctgcctttgaccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatctttcaagctgatcttcttgttgtagctt 21999573  T
Q  203 ttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcat 302  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21999574 ttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcat 21999673  T
Q  303 gcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21999674 gcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 21999704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 453525 - 453849
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  453525 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctg 453624  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |   ||||| || ||||||  |||||||    
T  453625 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatctttcaagctgatcttcttgttgtagcttttgtag 453724  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  453725 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 453824  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  453825 ctgtatctagtttcttgcaagttga 453849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27822829 - 27822513
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27822829 gaatagtggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 27822730  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| | |||||||    
T  27822729 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagttaatcttcttcttgtaagttttgtag 27822630  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27822629 aagtccaagatgtaagtcatttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 27822530  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  27822529 cagaatctagtttcttg 27822513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10748499 - 10748168
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10748499 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 10748400  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  10748399 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 10748300  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10748299 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 10748200  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10748199 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 10748168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10962268 - 10961937
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10962268 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 10962169  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  10962168 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 10962069  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962068 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 10961969  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10961968 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 10961937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30934382 - 30934057
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934382 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctg 30934283  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcc-tttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgta 207  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |   ||||| || ||||||  ||||||    
T  30934282 cttcttcttagattttctgccctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatctttcaagctgatcttcttgttgtagcttttgta 30934183  T
Q  208 gaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcata 307  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934182 gaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcata 30934083  T
Q  308 tctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30934082 tctgtatctagtttcttgcaagttga 30934057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 16258814 - 16259137
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16258814 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 16258913  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  16258914 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 16259013  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  16259014 tttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 16259113  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  16259114 cgcatatcagaatctagtttcttg 16259137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 36021244 - 36021575
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36021244 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 36021343  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  36021344 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcactaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 36021443  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021444 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 36021543  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36021544 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 36021575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24025351 - 24025052
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24025351 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttc 24025252  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||| |     
T  24025251 tgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttctttttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggc 24025152  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24025151 cctttgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 24025052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 27659566 - 27659885
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27659566 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 27659665  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||   || || || ||||||      
T  27659666 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 27659765  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27659766 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 27659865  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27659866 tgcatatctgtatctagttt 27659885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19952294 - 19951978
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19952294 gaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctg 19952195  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  19952194 cttcttcttagactttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 19952095  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19952094 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatat 19951995  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  19951994 cagaatctagtttcttg 19951978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 27190861 - 27191160
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27190861 gatttttccttcttagctttctaatgcttctgagcacccttctcagtagcatcctcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttc 27190960  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||     
T  27190961 tgcctttggccacatgcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaagc 27191060  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27191061 cctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 27191160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40467886 - 40467570
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  40467886 gaatggtggaaatagatggtttttccttcttagctttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgatcag 40467787  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
     || |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  40467786 ttttttcttggattttctgcctttggccacaggcaatgcaccaccatacatctccttagggacgtctttcaagtcaatcttcttgttgtaagttttgtag 40467687  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40467686 aagtccatgatgtaaaccctttgcacatccaggggatctttcttgcaaatagggatgagatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 40467587  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  40467586 cagtatctagtttcttg 40467570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Original strand, 17921071 - 17921370
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17921071 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcatccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttagactttc 17921170  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   || || || ||||||| ||||||||| |||| |||||| |     
T  17921171 tgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatattctttttgtaggttttgtagaagtccaagatgtaggc 17921270  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17921271 tctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 17921370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55753156 - 55752979
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  55753156 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 55753057  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  55753056 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 55752979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 49510487 - 49510664
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49510487 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 49510586  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  49510587 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 49510664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 24643275 - 24643452
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24643275 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 24643374  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24643375 tgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 24643452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18760349 - 18760151
Alignment:
Q  50 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  18760349 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagtcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcac 18760250  T
Q  150 caccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |   || || |  |||||||||||||| || |||| ||| || | |||||| || |||| ||||||||    
T  18760249 caccatacatctggtcaggaacatccttcaagctgattttctgtttgtaggatttgtaaaaatccacgatatatgccctttgaacctccaagggatctt 18760151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 10 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12245447 - 12245124
Alignment:
Q  10 aatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgc 109  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245447 aatggtggtcaatgcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgc 12245348  T
Q  110 ttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtaga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12245347 ttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttcttgtaagacttgtaga 12245248  T
Q  210 attccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatc 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245247 attccatgatgaaagtcctttgcacatccagaggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatc 12245148  T
Q  310 tgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  12245147 tgtatctagtttcttgcaagttga 12245124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10634291 - 10633960
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10634291 tcctcatgaatagtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtatacttccttgg 10634192  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  10634191 tgatatgcttcttcttggattttctgcctttagccacaggcagagcaccactatacatttcatcagggacatccttcagatcaatcttcttattgtaggt 10634092  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10634091 tttgtagaagtccatgatgtaagccctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 10633992  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10633991 tgcatatttgtatctagtttcttgcaagttga 10633960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 23760232 - 23760564
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23760232 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttg 23760331  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||    
T  23760332 gtgatctgcttcttcttagattttctatctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatctttttgttgtagg 23760431  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
     ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760432 ttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 23760531  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23760532 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 23760564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 13124634 - 13124965
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13124634 tcctcaagaatggtggaaatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 13124733  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| |     
T  13124734 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtatgt 13124833  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13124834 tttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 13124933  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13124934 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 13124965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 14468560 - 14468891
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14468560 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctaagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 14468659  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| |     
T  14468660 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtatgt 14468759  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14468760 tttgtagaagtccaagatgtatgctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 14468859  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14468860 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 14468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 4746658 - 4746989
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4746658 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 4746757  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  4746758 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 4746857  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4746858 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 4746957  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4746958 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 4746989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5873598 - 5873267
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5873598 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 5873499  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  5873498 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 5873399  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5873398 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 5873299  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5873298 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 5873267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12294087 - 12293756
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12294087 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 12293988  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  12293987 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 12293888  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12293887 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 12293788  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12293787 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 12293756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16427056 - 16426725
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16427056 tcctcaagaatagtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 16426957  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  16426956 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 16426857  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16426856 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 16426757  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16426756 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 16426725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24391416 - 24391085
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24391416 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24391317  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  24391316 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 24391217  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24391216 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24391117  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24391116 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 24391085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 24662809 - 24663140
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24662809 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24662908  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  24662909 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 24663008  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663009 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24663108  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24663109 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 24663140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 41686588 - 41686919
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41686588 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 41686687  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  41686688 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 41686787  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41686788 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 41686887  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41686888 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 41686919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5625295 - 5624964
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5625295 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 5625196  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  5625195 tgatctgcttctttttagattttctgcctttgaccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 5625096  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5625095 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 5624996  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5624995 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 5624964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 5513611 - 5513931
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5513611 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 5513710  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  5513711 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 5513810  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5513811 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 5513910  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5513911 tgcatatctgtatctagtttc 5513931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20681099 - 20680776
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20681099 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 20681000  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  20680999 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 20680900  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  20680899 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 20680800  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     |||||||   |||||||||||||    
T  20680799 cgcatatcaaaatctagtttcttg 20680776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 39375024 - 39375344
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39375024 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 39375123  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  39375124 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 39375223  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39375224 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 39375323  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39375324 tgcatatctgtatctagtttc 39375344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11280297 - 11279978
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11280297 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 11280198  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||   || || || ||||||      
T  11280197 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 11280098  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11280097 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 11279998  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11279997 tgcatatctgtatctagttt 11279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28322135 - 28321816
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28322135 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 28322036  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  28322035 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 28321936  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28321935 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 28321836  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28321835 tgcatatctgtatctagttt 28321816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 38197710 - 38198041
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38197710 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 38197809  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||| |   || || || ||||||      
T  38197810 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaagctgattttcttgttgtagct 38197909  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38197910 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 38198009  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38198010 tgcatatctgtatctagtttcctgcaagttga 38198041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 37869405 - 37869721
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37869405 gaattgtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatattcttccttggtgatctg 37869504  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  37869505 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 37869604  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37869605 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 37869704  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
      |  ||||||||||||    
T  37869705 tagattctagtttcttg 37869721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 37877923 - 37878239
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37877923 gaattgtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatattcttccttggtgatctg 37878022  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  37878023 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 37878122  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37878123 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 37878222  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
      |  ||||||||||||    
T  37878223 tagattctagtttcttg 37878239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5544918 - 5544598
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5544918 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 5544819  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  5544818 tgatctgcttctatttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 5544719  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544718 cttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcaaatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 5544619  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5544618 tgcatatctgtatctagtttc 5544598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 19781364 - 19781680
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19781364 gaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctg 19781463  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  19781464 cttcttctttgattttctaccttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 19781563  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19781564 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 19781663  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  19781664 cagaatctagtttcttg 19781680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13380562 - 13380249
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13380562 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttgagcaagatattcttccttggtgatctg 13380463  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||||||||||    
T  13380462 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggatttgtag 13380363  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13380362 aagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactaggtcagatattgcatcagattcatgcatat 13380263  T
Q  309 ctgtatctagtttc 322  Q
    | | ||||||||||    
T  13380262 cagaatctagtttc 13380249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13391156 - 13390843
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13391156 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttgagcaagatattcttccttggtgatctg 13391057  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||||||||||    
T  13391056 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggatttgtag 13390957  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13390956 aagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactaggtcagatattgcatcagattcatgcatat 13390857  T
Q  309 ctgtatctagtttc 322  Q
    | | ||||||||||    
T  13390856 cagaatctagtttc 13390843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6217931 - 6217631
Alignment:
Q  25 agatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggacttt 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  6217931 agatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgatttt 6217832  T
Q  125 ctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaag 224  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||||| |    
T  6217831 ctgcctttggctacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagtcttgtagaagtccaagatgtagg 6217732  T
Q  225 tcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttctt 324  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6217731 ccctttgcacatccagaggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgattagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttctt 6217632  T
Q  325 g 325  Q
    |    
T  6217631 g 6217631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 8777604 - 8777928
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8777604 gaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 8777703  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   || || || ||||||| | |||||    
T  8777704 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatcctttaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 8777803  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8777804 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 8777903  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  8777904 ctgaatctagtttctggcaagttga 8777928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 18486937 - 18487105
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18486937 gaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 18487036  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatcctt 177  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18487037 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatcctt 18487105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9991124 - 9990920
Alignment:
Q  44 ttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggca 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  9991124 ttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgattggcttattcttggattttctgcctttggccactggca 9991025  T
Q  144 gagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccagggg 243  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| | | |||||| |||||||  ||    
T  9991024 aagcaccaccatacatttcctcaggaacatccttcaggtcaatcttcttgttgtaggatttgtaaaagtccatgatgaatgccctttgaacatccaaagg 9990925  T
Q  244 atctt 248  Q
    |||||    
T  9990924 atctt 9990920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6498237 - 6497998
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| |||| |||  | || || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  6498237 gaatggtggacattgcaggtttgacatttttagccttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgattgg 6498138  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  6498137 cttattcttggattttctgcctatggccactggcaaagcaccaccatacatttcgtcagggacatcctttaggtcaatcttcttgttgtaggatttgtaa 6498038  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    || ||||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||    
T  6498037 aagtccatgatgaattccctttgaacatccaagggatctt 6497998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 12185398 - 12185637
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || || || || ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| || || |||||||||||  |    
T  12185398 gaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgaacacccttctcagaatcatcaccagcaagatactcctccttggtgattgg 12185497  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||| |||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||| |   || || | |||||||| |||||||    
T  12185498 ctttttcttggatttcctgcctttgaccacaggcaaagcaccaccatacatctggtcaagaacatccttcaagctgattttctcattgtaggttttgtag 12185597  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  12185598 aagtccatgatgtatgccctttgaacatccaagggatctt 12185637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16388778 - 16388608
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  16388778 gaatggtgaaaatagctggtttttccttcttagcattctggtgcttttgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgatcag 16388679  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  16388678 ctttttcttggattttctgtctttggccacatgcaatgcaccaccatacatctggtcaggaacatccttca 16388608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22450649 - 22450317
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22450649 ctcctcaagaatggtggacatagcaggtttttccttcttggctttctgatgcttctaagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 22450550  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22450549 gtgatctgctttttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatccttcaggtcaatctttttcttgtagg 22450450  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22450449 atttgtagaattccatgatgaaagttctttgcacatccataggttctttcttgcatatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 22450350  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22450349 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 22450317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 27375694 - 27376010
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27375694 gaatagtggacattgcagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatattcttccttggtgatctg 27375793  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27375794 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcagggacatccttcaggtcaatcttcttgttgtaggttttgtag 27375893  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27375894 aagtccatgatgtaagccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatagggatgagatgagtgaccagatcagatatggcatcagattcatgcatat 27375993  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  27375994 cagtatctagtttcttg 27376010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 27466051 - 27466367
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27466051 gaatagtggacattgcagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatattcttccttggtgatctg 27466150  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27466151 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcagggacatccttcaggtcaatcttcttgttgtaggttttgtag 27466250  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27466251 aagtccatgatgtaagccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatagggatgagatgagtgaccagatcagatatggcatcagattcatgcatat 27466350  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | |||||||||||||||    
T  27466351 cagtatctagtttcttg 27466367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 26867697 - 26868021
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26867697 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 26867796  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   ||||| || ||||||      
T  26867797 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgatcttcttgttgtagct 26867896  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867897 tttgtagtagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 26867996  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26867997 tgcatatctgtatctagtttcttgc 26868021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 26028315 - 26028646
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26028315 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 26028414  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  26028415 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 26028514  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26028515 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 26028614  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26028615 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 26028646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12724745 - 12724414
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12724745 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 12724646  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  12724645 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 12724546  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12724545 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 12724446  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12724445 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 12724414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 25790609 - 25790940
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25790609 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 25790708  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  25790709 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 25790808  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25790809 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 25790908  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25790909 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 25790940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 16951900 - 16952220
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16951900 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 16951999  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  16952000 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 16952099  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16952100 tttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 16952199  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16952200 tgcatatctgtatctagtttc 16952220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 12857812 - 12858135
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12857812 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 12857911  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  12857912 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 12858011  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12858012 tttgtagaagtccaaaatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 12858111  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  12858112 cgcatatcagaatctagtttcttg 12858135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 3664321 - 3664641
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3664321 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 3664420  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  3664421 tgatctgcgtctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 3664520  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3664521 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 3664620  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3664621 tgcatatctgtatctagtttc 3664641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9120395 - 9120079
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9120395 gaatagtggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 9120296  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||| || ||||| | |||||||    
T  9120295 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcatggacatctttcaagctaatcttcttcttgtaagttttgtag 9120196  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9120195 aagtccaagatgtaagccctttgcacatcaaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 9120096  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  9120095 cagaatctagtttcttg 9120079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32969857 - 32969534
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32969857 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggttttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 32969758  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  32969757 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcaggaacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 32969658  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  32969657 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 32969558  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  32969557 cgcatatcagaatctagtttcttg 32969534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34815074 - 34814751
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34815074 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 34814975  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| | ||||||||     
T  34814974 tgatctgcttcttcttagattttctacctttggtcacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttctgattgtaggt 34814875  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34814874 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgtagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 34814775  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  34814774 cgcatatcagaatctagtttcttg 34814751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 333
Target Start/End: Original strand, 27496621 - 27496936
Alignment:
Q  18 acatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttctt 117  Q
    |||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27496621 acatagtagatttatccttcctggccttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcatcaagatattcttccttggtgatctgcttcttctt 27496720  T
Q  118 ggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatg 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    ||| || || ||||||| | ||||||| ||||      
T  27496721 ggactttctgcttttagccacaggcagagcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaaactaattttcttgttgtaggttgtgtagaagtccaga 27496820  T
Q  218 atgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatcta 317  Q
    ||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27496821 atgtatgccttttgaacatccaggggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgaagcta 27496920  T
Q  318 gtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||| ||||||    
T  27496921 gtttcttgcaagttga 27496936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 27344635 - 27344812
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27344635 tcctcaagaatggtggacatagcagattttacctttttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 27344734  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27344735 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 27344812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 27405375 - 27405552
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27405375 tcctcaagaatggtggacatagcagattttacctttttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 27405474  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27405475 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 27405552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32308959 - 32308782
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32308959 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaacttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 32308860  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  32308859 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccaaaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 32308782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 203 - 321
Target Start/End: Original strand, 28566552 - 28566670
Alignment:
Q  203 ttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcat 302  Q
    |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28566552 ttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatttaggggatctttcttgcatattgggatgtgatgagtgactagatcagttatgacatcagattcat 28566651  T
Q  303 gcatatctgtatctagttt 321  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28566652 gcatatctgtatctagttt 28566670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 26024654 - 26024804
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  26024654 gaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgattgg 26024753  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacat 159  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26024754 ctttttcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacat 26024804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 4633863 - 4633992
Alignment:
Q  50 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  4633863 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcac 4633962  T
Q  150 caccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4633963 caccatacatttggtcaggaacatccttca 4633992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Original strand, 26036697 - 26036751
Alignment:
Q  194 ttgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  26036697 ttgtaggttttgtagaagtccatgatgtatgccctttgaacatccaagggatctt 26036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 5223 - 5547
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5223 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctaatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatattcttccttggtgatctg 5322  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5323 cttcttcttggattttctgcctttagccacaggcaaagcaccaccatacatttcctcaaggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 5422  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccagaggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 5522  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  5523 ctgtatctagtttcttgcaagttga 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31841439 - 31841108
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31841439 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 31841340  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  31841339 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 31841240  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31841239 tttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 31841140  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31841139 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 31841108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34779894 - 34779584
Alignment:
Q  15 tggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  34779894 tggacattgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcctccttggtgatctgcttttt 34779795  T
Q  115 cttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattcc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  34779794 cttggactttctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagtcaatcttcttcttgtaagatttgtagaagtcc 34779695  T
Q  215 atgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  34779694 atgatgtaagtcctttgcacatccaggggattcttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatcagaat 34779595  T
Q  315 ctagtttcttg 325  Q
    |||||||||||    
T  34779594 ctagtttcttg 34779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6983827 - 6983496
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6983827 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 6983728  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  6983727 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 6983628  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6983627 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 6983528  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6983527 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 6983496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14038062 - 14037731
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14038062 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 14037963  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  14037962 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 14037863  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037862 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 14037763  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14037762 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 14037731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 14560894 - 14561225
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14560894 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 14560993  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  14560994 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 14561093  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561094 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 14561193  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14561194 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 14561225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23304299 - 23303968
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23304299 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 23304200  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  23304199 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 23304100  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23304099 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 23304000  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23303999 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 23303968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24575093 - 24574762
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24575093 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24574994  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  24574993 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 24574894  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24574893 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24574794  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24574793 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 24574762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 24590902 - 24591233
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24590902 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24591001  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  24591002 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 24591101  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24591102 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24591201  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24591202 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 24591233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27468182 - 27467851
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27468182 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 27468083  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  27468082 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggcttattttcttgttgtagct 27467983  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27467982 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 27467883  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27467882 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 27467851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 39493726 - 39494057
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39493726 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 39493825  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  39493826 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 39493925  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39493926 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 39494025  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39494026 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 39494057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 15996135 - 15996467
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15996135 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaaggtattattccttg 15996234  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||  |||      ||||| || ||||||     
T  15996235 gtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatatttctaactgatcttcttgttgtagc 15996334  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
     ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996335 ttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 15996434  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15996435 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 15996467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 14449850 - 14450181
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14449850 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 14449949  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  14449950 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 14450049  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14450050 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 14450149  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14450150 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 14450181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 24819716 - 24820047
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24819716 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24819815  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  24819816 tgatctgtttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 24819915  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24819916 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24820015  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24820016 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 24820047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23369956 - 23369636
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23369956 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 23369857  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  23369856 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 23369757  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23369756 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 23369657  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23369656 tgcatatctgtatctagtttc 23369636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23704800 - 23704480
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23704800 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 23704701  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  23704700 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 23704601  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704600 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 23704501  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23704500 tgcatatctgtatctagtttc 23704480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 30230267 - 30230587
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30230267 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 30230366  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  30230367 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 30230466  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30230467 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 30230566  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30230567 tgcatatctgtatctagtttc 30230587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 36585356 - 36585676
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36585356 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttgactttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 36585455  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  36585456 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 36585555  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36585556 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 36585655  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36585656 tgcatatctgtatctagtttc 36585676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9343975 - 9343655
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9343975 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 9343876  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  9343875 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 9343776  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343775 cttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 9343676  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9343675 tgcatatctgtatctagtttc 9343655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40398380 - 40398064
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40398380 gaatagtggacaaagttgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctg 40398281  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  40398280 cttcttctttgactttctgccttttgtcacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 40398181  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40398180 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 40398081  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  40398080 cagaatctagtttcttg 40398064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42050800 - 42050480
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42050800 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccaccttagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 42050701  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  42050700 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 42050601  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42050600 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 42050501  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42050500 tgcatatctgtatctagtttc 42050480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22154541 - 22154218
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22154541 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttctttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 22154442  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| | ||||||||     
T  22154441 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttctgattgtaggt 22154342  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22154341 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 22154242  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  22154241 cgcatatcagaatctagtttcttg 22154218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 5293386 - 5293702
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5293386 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 5293485  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |  |||||| || ||||| | |||||||    
T  5293486 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaagctaatcttcttcttgtaagttttgtag 5293585  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  5293586 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagattagatatggtatcagattcatgcatat 5293685  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  5293686 cagaatctagtttcttg 5293702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24815934 - 24815614
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24815934 tcctcaagaatggtagacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 24815835  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || ||  |||||      
T  24815834 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgctgtagct 24815735  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815734 cttgtagtagtccaagatgtaggctctctgcacatccagaggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 24815635  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24815634 tgcatatctgtatctagtttc 24815614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 27606265 - 27606581
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  27606265 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctt 27606364  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  27606365 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 27606464  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27606465 aagtccaagatgtaagccttttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatatgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 27606564  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  27606565 cagaatctagtttcttg 27606581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39360497 - 39360198
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39360497 gatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagccagatattcttccttggtgatctggttcttcttagactttc 39360398  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||| |     
T  39360397 tgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggc 39360298  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39360297 cctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 39360198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35223520 - 35223196
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  35223520 gaatggtggacatagcagttttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 35223421  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   || || || ||||||| | |||||    
T  35223420 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatcctttaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 35223321  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223320 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 35223221  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  35223220 ctgaatctagtttctggcaagttga 35223196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17615087 - 17614910
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17615087 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 17614988  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  17614987 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 17614910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17726944 - 17726767
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17726944 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 17726845  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  17726844 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 17726767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 27045075 - 27045252
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27045075 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 27045174  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27045175 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 27045252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31356561 - 31356384
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31356561 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 31356462  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  31356461 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 31356384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15766793 - 15766616
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15766793 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 15766694  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15766693 tgatctgcttcttcttagattttctacttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 15766616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 37732803 - 37732980
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37732803 tcctcaagaatggtggacatagcagattttaccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 37732902  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  37732903 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcaactcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 37732980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31445871 - 31445701
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31445871 gaatagtggacatagctggtttttccttcttagctttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgatcag 31445772  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  31445771 ctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaatgcaccaccatacatctggtcaggaacatccttca 31445701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36695675 - 36695546
Alignment:
Q  50 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  36695675 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcac 36695576  T
Q  150 caccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  36695575 caccatacatttggtcaggaacatccttca 36695546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 323
Target Start/End: Original strand, 5291 - 5605
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5291 gaatagtggacatagcagatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatattcttccttggtgatctg 5390  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  5391 cttcttcttggattttctgcctttggccacaggcaaggcaccaccatacatctcctcagggacatcgttcaagtcaatcttctttttgtaggatttgtag 5490  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5491 aattccatgatgtaagtcctttgcacctcccggggatctttcttgcaaatagggatgagatgtgtgaccagatcagatatggcatcagattcatgcatat 5590  T
Q  309 ctgtatctagtttct 323  Q
    | |||||||||||||    
T  5591 cagtatctagtttct 5605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44675 - 44347
Alignment:
Q  5 tcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44675 tcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttcgttggtga 44576  T
Q  105 tctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggattt 204  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||||| |||    
T  44575 tctgcttcttcttagattttctgcctttggccacagacagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggtttt 44476  T
Q  205 gtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgc 304  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44475 gtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgc 44376  T
Q  305 atatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44375 atatctgtatctagtttcttgcaagttga 44347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 12733411 - 12733743
Alignment:
Q  1 ctcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12733411 ctcctcacgaatggtggacatagcaaatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttg 12733510  T
Q  101 gtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||| |||| |   ||||| || ||||||     
T  12733511 gtgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttctgggatatctttcaagctgatcttcttgttgtagc 12733610  T
Q  201 atttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 300  Q
     ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12733611 ttttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattc 12733710  T
Q  301 atgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12733711 atgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 12733743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 7510154 - 7510485
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7510154 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 7510253  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  7510254 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 7510353  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7510354 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 7510453  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7510454 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 7510485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 51653818 - 51653487
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51653818 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccatctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 51653719  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  51653718 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 51653619  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51653618 cttgtagtagtccaagatgtaggccatctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 51653519  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51653518 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 51653487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12621101 - 12620778
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12621101 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 12621002  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||| || |||||||     
T  12621001 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaaactgatcttcttgttgtaggt 12620902  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12620901 tttgtagaagtccaagatgtaggccctttgtacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 12620802  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  12620801 cgcatatcagaatctagtttcttg 12620778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35398455 - 35398124
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35398455 tcctcaagaatggtggacatagcagatttatccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 35398356  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  35398355 tgatctgcttctttttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 35398256  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35398255 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 35398156  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35398155 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 35398124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35645981 - 35645661
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35645981 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 35645882  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  35645881 tgatctgcttctttttagagtttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 35645782  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35645781 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 35645682  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35645681 tgcatatctgtatctagtttc 35645661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36244374 - 36244054
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36244374 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 36244275  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  36244274 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 36244175  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36244174 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 36244075  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36244074 tgcatatctgtatctagtttc 36244054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 3174471 - 3174790
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3174471 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 3174570  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||   || || || ||||||      
T  3174571 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 3174670  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3174671 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 3174770  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3174771 tgcatatctgtatctagttt 3174790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 38097967 - 38098286
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38097967 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 38098066  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  38098067 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 38098166  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38098167 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 38098266  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38098267 tgcatatctgtatctagttt 38098286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5647628 - 5647329
Alignment:
Q  26 gatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttc 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5647628 gatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagccagatattcttccttggtgatctgcttcttctttgactttc 5647529  T
Q  126 tgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagt 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | ||||||||| |||| |||||| |     
T  5647528 tgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtagaagtccaagatgtaggc 5647429  T
Q  226 cctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5647428 cctttgcacatccagtggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatatcagaatctagtttcttg 5647329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 21866541 - 21866864
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21866541 tcctcaagaatggtggatagagttgatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 21866640  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   |||||   ||||||||     
T  21866641 tgatctgcttcttcctagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcagattgtaggt 21866740  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21866741 tttgtagaactccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 21866840  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  21866841 tgcatatcagaatctagtttcttg 21866864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 4170187 - 4170503
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  4170187 gaatagtggacaaagttgatttttctttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatactcttccttggtgatctg 4170286  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  4170287 cttcttctttgattttctgccttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcatggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtag 4170386  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4170387 aagttcaagatgtaggtcctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgattagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 4170486  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    |   |||||||||||||    
T  4170487 cataatctagtttcttg 4170503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47615873 - 47615549
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  47615873 gaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 47615774  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   || || || ||||||| | |||||    
T  47615773 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatcctttaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 47615674  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47615673 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 47615574  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  47615573 ctgaatctagtttctggcaagttga 47615549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 5836088 - 5836412
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  5836088 gaatggtggacatagcagttttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 5836187  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   || || || ||||||| | |||||    
T  5836188 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcagggacatcctttaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 5836287  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836288 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 5836387  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  5836388 ctgaatctagtttctggcaagttga 5836412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 19181803 - 19182119
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  19181803 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagtaagatactcttccttggtgatctg 19181902  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     ||||| || || || | |||||||    
T  19181903 cttcttctttgactttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaaacttatcttcttcttataagttttgtag 19182002  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19182003 aagtccaagatgcaagccctttgcacatccaggggatcctttttacagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 19182102  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  19182103 cagaatctagtttcttg 19182119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1821 - 1497
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821 gaatggtgaacatagcaggtttttctttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 1722  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |   || || |  ||||||| |||||||    
T  1721 cttcttcttggactttctacctttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctcaggaacatccttcaagctgattttctcgttgtaggttttgtag 1622  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1621 aagtccatgatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatatgaatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 1522  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  1521 ctgtatctagtttcttgcaagttga 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 464947 - 464623
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  464947 gaatggtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctg 464848  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |   ||||| || ||||||| |||||||    
T  464847 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggatatctttcaagctgatcttcttgttgtaggttttgtag 464748  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  464747 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 464648  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  464647 ctgtatctagtttcttgcaagttga 464623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26398078 - 26397747
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26398078 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 26397979  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  26397978 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 26397879  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26397878 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 26397779  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26397778 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 26397747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40050086 - 40049757
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40050086 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 40049987  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  40049986 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 40049887  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40049886 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 40049787  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40049786 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagtt 40049757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 169805 - 170128
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  169805 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 169904  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  169905 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 170004  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  170005 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 170104  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  170105 cgcatatcagaatctagtttcttg 170128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8010051 - 8009720
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8010051 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 8009952  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  8009951 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 8009852  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8009851 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgaacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 8009752  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8009751 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 8009720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26693723 - 26693403
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26693723 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 26693624  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  26693623 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 26693524  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26693523 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 26693424  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26693423 tgcatatctgtatctagtttc 26693403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2713588 - 2713271
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713588 gaatggtggacaatgcagatttttctttctgagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctg 2713489  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||| |   ||||| || ||||||  |||||||    
T  2713488 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaagctgatcttcttgttgtagcttttgtag 2713389  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
     | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713388 tagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 2713289  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgc 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2713288 ctgtatctagtttcttgc 2713271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 9088155 - 9088475
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9088155 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcatccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 9088254  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  9088255 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagtt 9088354  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9088355 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 9088454  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9088455 tgcatatctgtatctagtttc 9088475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 9436189 - 9436505
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9436189 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 9436288  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | |||||||    
T  9436289 cttcttctttgactttctgtctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagcttatcttcttcttgtaagttttgtag 9436388  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9436389 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 9436488  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  9436489 cagaatctagtttcttg 9436505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 11008107 - 11008426
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11008107 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 11008206  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  11008207 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 11008306  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008307 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 11008406  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11008407 tgcatatctgtatctagttt 11008426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17958099 - 17957776
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17958099 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 17958000  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||   ||||||||     
T  17957999 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcagattgtaggt 17957900  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| ||||||    || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17957899 tttgtagaagtccaagatgtagactctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 17957800  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  17957799 cgcatatcagaatctagtttcttg 17957776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 22092059 - 22092382
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22092059 tcctcaagaatggtggatagagttgatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 22092158  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||   ||||||||     
T  22092159 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcagattgtaggt 22092258  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22092259 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 22092358  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  22092359 tgcatatcagaatctagtttcttg 22092382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21000386 - 21000070
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21000386 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttttgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 21000287  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |  |||||| || ||||| | |||||||    
T  21000286 cttcttctttgactttctgcctttggccataggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaagctaatcttcttcttgtaagttttgtag 21000187  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21000186 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatccttcttgcaaatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 21000087  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  21000086 cagaatctagtttcttg 21000070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 8620279 - 8620602
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8620279 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 8620378  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||   ||||||||     
T  8620379 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttcagggacatctttcaagctgatcttcagattgtaggt 8620478  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  8620479 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 8620578  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     |||||||   |||||||||||||    
T  8620579 cgcatatcaaaatctagtttcttg 8620602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 4214925 - 4215248
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4214925 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttcattcttggttttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 4215024  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |   || || || |||||||     
T  4215025 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcaaggacatctttcaagctgatattcttgttgtaggt 4215124  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  4215125 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttgcagatggggatgtgatgagtgattagatcagatattgcatctgattca 4215224  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  4215225 cgcatatcagaatctagtttcttg 4215248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 42868757 - 42869081
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  42868757 gaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 42868856  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |   || || || ||||||| | |||||    
T  42868857 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcaggaacatccttcaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 42868956  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42868957 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 42869056  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  42869057 ctgaatctagtttctggcaagttga 42869081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6875209 - 6874893
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6875209 gaatagtggacaaagttgatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcactcttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctg 6875110  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| | ||||||     
T  6875109 cttcttctttgattttctgtcttttgccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagttttgtaa 6875010  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6875009 aagtccaagatgtaggccctttgcacatccaggggatccttcttccagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 6874910  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | |  ||||||||||||    
T  6874909 cagattctagtttcttg 6874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 5688458 - 5688690
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5688458 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 5688557  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||| || ||||| | |||||||    
T  5688558 cttcttctttgactttctgcctttagccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagctaatcttcttcttgtaagttttgtag 5688657  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccagg 241  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5688658 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccagg 5688690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 1990472 - 1990649
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1990472 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 1990571  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1990572 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagctcaccaccatacatttggtcaggaacatccttca 1990649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3356567 - 3356236
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3356567 tcctcaagaatggtggacatatcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccatctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 3356468  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  3356467 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 3356368  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3356367 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 3356268  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3356267 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 3356236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 9344040 - 9344371
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9344040 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 9344139  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  9344140 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 9344239  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344240 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 9344339  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9344340 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 9344371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 36295863 - 36296194
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36295863 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 36295962  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  36295963 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 36296062  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36296063 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 36296162  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36296163 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 36296194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 44484054 - 44484385
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44484054 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 44484153  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  44484154 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 44484253  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44484254 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 44484353  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44484354 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 44484385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 244749 - 245069
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  244749 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 244848  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  244849 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 244948  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244949 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 245048  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  245049 tgcatatctgtatctagtttc 245069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 6154002 - 6154325
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6154002 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttcttatgcttctgagcaccctcctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 6154101  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || |||||||     
T  6154102 tgatctgcttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcctcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggt 6154201  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  6154202 tttgtagaagtccaagatgtaggctctctgcacatccaggggatccttcttacagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatctgattca 6154301  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
T  6154302 cgcatatcagaatctagtttcttg 6154325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13696502 - 13696183
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13696502 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 13696403  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||   || || || ||||||      
T  13696402 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 13696303  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696302 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 13696203  T
Q  302 tgcatatctgtatctagttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13696202 tgcatatctgtatctagttt 13696183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15788597 - 15788281
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15788597 gaatagtggacattgcagatttttctttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagcagcatcttcagcaagatattcttccttggtgatctg 15788498  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||||| |||||||    
T  15788497 cttcttcttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttgttgtaggttttgtag 15788398  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15788397 aagtccaagatgtaggccctttgtacatctaggggatctttcttgcagatggggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattcatgcatat 15788298  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  15788297 cagaatctagtttcttg 15788281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 26114211 - 26114534
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  26114211 tcctctagaatagtggacaaagtagatttttccttcttaactttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcttcagcaagatattcttccttag 26114310  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |   ||||| || ||||| |     
T  26114311 tgatctgcttcttctttgattttctgcctttggccacaggcagatcaccaccatacatctcttcagggacatctttcaagctgatcttcttcttgtaagt 26114410  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26114411 tttgtagaagtccaagatgtaggccctttgcacatccagaggatccttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatattgcatcagattca 26114510  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  26114511 tgcatatcagaatctagtttcttg 26114534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 36080854 - 36081178
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  36080854 gaatggtggacatagcagatttttctttcatagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatactcttccttggtgatctg 36080953  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |   || || || ||||||| | |||||    
T  36080954 cttcttcttggactttctgcttttggccacaggcagagcaccaccatacatttcatcaggaacatccttcaagctgattttcttgttgtaggttgtgtag 36081053  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||  ||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36081054 aagtccaaaatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 36081153  T
Q  309 ctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||    
T  36081154 ctgaatctagtttctggcaagttga 36081178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 19131631 - 19131940
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19131631 gaatagtggacaatgctgatttttccttcttagctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaagatactcttccttggtgatctg 19131730  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||       ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     ||||| || ||||| | |||||||    
T  19131731 cttcttctttgactttctgcc-------acaggcaaatcaccaccatacatctcctcaggaacatctttcaaacttatcttcttcttgtaagttttgtag 19131823  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19131824 aagtccaagatgtaagccctttgcacatccaggggatcctttttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatggcatcagattcatgcatat 19131923  T
Q  309 ctgtatctagtttcttg 325  Q
    | | |||||||||||||    
T  19131924 cagaatctagtttcttg 19131940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 322
Target Start/End: Original strand, 29079358 - 29079652
Alignment:
Q  28 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 127  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  29079358 ttttgccttcttggctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttctttttagattttctg 29079457  T
Q  128 cctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcc 227  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||   |||||| | |  | |||||| | ||    
T  29079458 cctttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagctcttgtagtagtataagatgtaggccc 29079557  T
Q  228 tttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29079558 tctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttc 29079652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32085586 - 32085388
Alignment:
Q  50 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||    
T  32085586 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttccttggtgattggcttagtcttggatttcctgcctttggccacaggcaaagcac 32085487  T
Q  150 caccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |   || || |  || |||||||||||||| |||||||| || | |||||| || |||| ||||||||    
T  32085486 caccatacatctggtcaggaacatccttcaagctgattttctggttataggatttgtagaaatccatgatatatgccctttgaacctccaagggatctt 32085388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 808109 - 808189
Alignment:
Q  243 gatctttcttg-catatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttc 322  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  808109 gatctttcttggcatgtggggatgtgatgagtgactaaatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttc 808189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 34055 - 34386
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34055 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttagctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcatcttcagcaaggtattcttccttgg 34154  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||   || || || ||||||      
T  34155 tgatctgcttctttttagattttctgcctttggccacaggcagatcaccactatacatttcttctgggatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 34254  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255 cttgtagtagtccaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 34354  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34355 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 34386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44892 - 44561
Alignment:
Q  2 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44892 tcctcaagaatggtggacatagcagatttttccttctttgctttcttatgcttctgagcacccacctcagtagcattttcagcaaggtattcttccttgg 44793  T
Q  102 tgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtagga 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||| ||||||   || || || ||||||      
T  44792 tgatctgcttcttcttagattttctgcttttggccacaggcagatcaccaccatacatttcttctggaatatctttcaggctgattttcttgttgtagct 44693  T
Q  202 tttgtagaattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 301  Q
     |||||| | || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44692 cttgtagtagtctaagatgtaggccctctgcacatccaggggatctttcttgcagatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattca 44593  T
Q  302 tgcatatctgtatctagtttcttgctagttga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44592 tgcatatctgtatctagtttcttgcaagttga 44561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 2074 - 2375
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    |||||||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  2074 gaatggtgaaaatagctggtttttccttcttaactttctggtgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgatcag 2173  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  2174 ctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaaatcaccaccatacatctcctcagggacatctttcaagtcaatcttcttgttgtaagttttgtag 2273  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatat 308  Q
    || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2274 aagtccatgatgtaaaccctttgcacctccaggggatctttcttgcaaatagggatgagatgagtgaccagatcagatatggcatcagattcatgcatat 2373  T
Q  309 ct 310  Q
    ||    
T  2374 ct 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 21277 - 21590
Alignment:
Q  11 atggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgct 110  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  21277 atggtggacatagagggtttttcctttttggctctctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagctagatattcctctttggtgatctgct 21376  T
Q  111 tcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaa 210  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  21377 tcttctttgattttctacttttagccacaggcagagcaccaccatacatctcctctgggatatccttcaggtcaatcttcttgttgtatgttttgtagaa 21476  T
Q  211 ttccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatct 310  Q
     || |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | || | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21477 gtctatgatgtatgccctttgaacatccagaggatccttcttgcatatgtgtatctcattagagactagatcagatatgacatcagattcatgcatatca 21576  T
Q  311 gtatctagtttctt 324  Q
    | ||||||||||||    
T  21577 gaatctagtttctt 21590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50855 - 50558
Alignment:
Q  28 tttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctg 127  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||     
T  50855 tttttccttcttagctttctggtgcttctgagctcccttttcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgatcagctttctcttggattttcta 50756  T
Q  128 cctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtagaattccatgatgtaagtcc 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || || || | ||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  50755 cctttggccacaggcagtgcaccaccaaacatttcatcagggacatctttcaaatcaatcttcttgttataagttttgtagaagtccattatgtaaaccc 50656  T
Q  228 tttgcacatccaggggatctttcttgcatatagggatgtgatgagtgactagatcagatatgacatcagattcatgcatatctgtatctagtttcttg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  | |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  50655 tttgcacatccaggggatctttcttgcaaatggggatttgatgagtaatcaaatcagatattgcatcagattcatgcatgtcagtatctaatttcttg 50558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4224 - 3985
Alignment:
Q  9 gaatggtggacatagcagatttttccttcttggctttctgatgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctg 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  4224 gaatggtggacattgcaggtttgtcatttttagccttctggtgcttctgagcacctttctcagaagcatcaccagcaagatattcctccttggtgattgg 4125  T
Q  109 cttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatctttttattgtaggatttgtag 208  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||     
T  4124 ctttttcttggattttctgcctttggccacaggcaaagcaccaccatacatttcctcagggacatccttcaggtcaatcttcttgttgtaggttttgtaa 4025  T
Q  209 aattccatgatgtaagtcctttgcacatccaggggatctt 248  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||    
T  4024 aagtccatgatgtatgccctttgaacatccaaggggtctt 3985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 4279 - 4408
Alignment:
Q  50 tgcttctgagcacccttctcagtagcatcatcagcaaggtattcttccttggtgatctgcttcttcttggactttctgcctttagccacaggcagagcac 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  4279 tgcttctgagcacccttctcagaagcatcaccagcaagatattcttctttggtgattggcttagttttggacttcctgcctttggccacaggcaaagcac 4378  T
Q  150 caccatacatttcctcagggacatccttca 179  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4379 caccatacatttggtcaggaacatccttca 4408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 132405 - 132365
Alignment:
Q  134 gccacaggcagagcaccaccatacatttcctcagggacatc 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  132405 gccacaggcagagctcctccatacatttcctcaggaacatc 132365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University