View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1258_low_1 (Length: 908)

Name: NF1258_low_1
Description: NF1258
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1258_low_1
NF1258_low_1
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (451-841)||(63103-63491)
scaffold0013 (14-288)||(63647-63921)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (34-282)||(28508408-28508656)
chr7 (451-841)||(28507767-28508156)
chr7 (14-280)||(11407571-11407837)
chr7 (55-192)||(46527394-46527531)
chr7 (55-203)||(10553603-10553751)
chr7 (523-739)||(6321315-6321529)
chr7 (456-791)||(11405499-11405832)
chr7 (106-226)||(41963371-41963491)
chr7 (535-738)||(41963780-41963983)
chr7 (21-93)||(13907811-13907883)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (14-280)||(26340-26606)
scaffold0097 (456-721)||(26816-27087)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (14-280)||(20722511-20722777)
chr2 (456-721)||(21832854-21833118)
chr2 (21-226)||(29901174-29901379)
chr2 (55-230)||(4173790-4173965)
chr2 (457-737)||(695209-695487)
chr2 (456-739)||(26391014-26391296)
chr2 (456-739)||(31501605-31501887)
chr2 (55-230)||(31502077-31502251)
chr2 (55-203)||(695708-695856)
chr2 (55-230)||(26390634-26390808)
chr2 (456-721)||(20722987-20723258)
chr2 (456-731)||(29901631-29901907)
chr2 (523-739)||(40613320-40613535)
chr2 (456-737)||(2120323-2120603)
chr2 (140-280)||(21832518-21832658)
chr2 (534-739)||(28652107-28652311)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (456-838)||(13826682-13827063)
chr3 (16-280)||(13827275-13827539)
chr3 (55-230)||(47867926-47868101)
chr3 (55-230)||(38110125-38110300)
chr3 (55-230)||(48163801-48163976)
chr3 (14-191)||(18907162-18907339)
chr3 (456-739)||(18907567-18907853)
chr3 (456-784)||(8559-8886)
chr3 (452-739)||(180785-181071)
chr3 (55-226)||(181277-181448)
chr3 (55-226)||(45033663-45033834)
chr3 (55-226)||(18943707-18943878)
chr3 (456-611)||(38110512-38110667)
chr3 (55-209)||(8174-8328)
chr3 (534-737)||(55150286-55150488)
chr3 (669-739)||(52560671-52560741)
chr3 (523-739)||(45034111-45034326)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (21-279)||(23714446-23714704)
chr8 (534-838)||(2870571-2870871)
chr8 (55-226)||(44116864-44117035)
chr8 (55-188)||(41268851-41268984)
chr8 (456-739)||(44116387-44116669)
chr8 (510-721)||(23713989-23714197)
chr8 (55-226)||(42096727-42096898)
chr8 (453-610)||(42096363-42096520)
chr8 (55-209)||(20478345-20478499)
chr8 (456-578)||(20477996-20478118)
chr8 (456-611)||(8317637-8317792)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (55-200)||(42056307-42056452)
chr1 (456-739)||(31386900-31387182)
chr1 (456-739)||(50914250-50914532)
chr1 (57-226)||(46193258-46193427)
chr1 (14-230)||(31386510-31386726)
chr1 (55-203)||(18241944-18242092)
chr1 (55-209)||(50913869-50914023)
chr1 (14-226)||(4912880-4913092)
chr1 (58-226)||(27106968-27107135)
chr1 (524-737)||(18242393-18242605)
chr1 (456-739)||(42464091-42464373)
chr1 (452-737)||(27106495-27106779)
chr1 (456-611)||(4912531-4912686)
chr1 (669-731)||(15292066-15292128)
chr1 (667-737)||(4912406-4912476)
chr1 (34-160)||(8645416-8645542)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (55-226)||(9039853-9040024)
chr5 (55-203)||(7252525-7252673)
chr5 (55-203)||(37981245-37981393)
chr5 (58-192)||(19875615-19875748)
chr5 (458-732)||(7252909-7253182)
chr5 (456-737)||(23066622-23066902)
chr5 (523-721)||(19876058-19876255)
chr5 (523-738)||(37980730-37980944)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (55-226)||(39389750-39389921)
chr4 (456-721)||(16357917-16358181)
chr4 (58-226)||(12025823-12025991)
chr4 (456-739)||(12025352-12025634)
chr4 (456-739)||(39389259-39389541)
chr4 (21-203)||(11868366-11868548)
chr4 (456-721)||(54602989-54603252)
[»] scaffold0850 (2 HSPs)
scaffold0850 (55-226)||(1175-1346)
scaffold0850 (456-572)||(4820-4936)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (21-182)||(23058458-23058619)
chr6 (456-739)||(5619690-5619972)
chr6 (57-226)||(5619312-5619481)
chr6 (461-611)||(33522909-33523059)
chr6 (667-731)||(19269231-19269295)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (456-721)||(22557-22821)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (55-201)||(19180-19326)
scaffold0184 (456-704)||(18699-18946)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (55-201)||(53518-53664)
scaffold0078 (456-704)||(53898-54145)
[»] scaffold1868 (2 HSPs)
scaffold1868 (55-230)||(572-747)
scaffold1868 (456-611)||(222-377)


Alignment Details
Target: scaffold0013 (Bit Score: 247; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 451 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 63491 - 63103
Alignment:
Q  451 cgcatggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactag 550  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  63491 cgcagggatggattttggagcattttccag-tccgtacccaaggaagcctaataagagccagaagccggagagaccatgtgccgggagatggcttactag 63393  T
Q  551 cagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcac 650  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  63392 cagagggcattcaattgtgcaccattaccgccgactcctagatcgcttagaggtggatgacgcgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcgc 63293  T
Q  651 ccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggcgctttgggtat 750  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  63292 ccttttcaga-ttatttgcacttactcacgatggctgatgtgcaggaaggagatggtgtaccatcatttacctgagcgggtgaagaggccctttgggtat 63194  T
Q  751 atgctggacatccccagacatccgccagatgtccttgagattcatgcggagatggtggctattgtgtccagagacccccgtctgtggtgct 841  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  63193 atactggacatccccagacatctgtcagatgtccctgagattcctgcggagatggtggctactgtgttcaaagaccctcgtctttggtgct 63103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 63921 - 63647
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  63921 agacgagggaggagctgctatagaggaataggagaaggagttggtgtctgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtatgctgttcactaacaaaac 63822  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  63821 aaatagacacatggacgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctatatgat 63722  T
Q  214 catctcgatgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaacatattca 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63721 catctcgatgattatgtccgtatgtgtaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaacatattca 63647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28508656 - 28508408
Alignment:
Q  34 gagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtga 133  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  28508656 gagagagataggaggaggcattggtatgtgaggagttttcttctatatctcatcggtagtgcgctgttcactaacaaaacgaacggacacatcaatgtga 28508557  T
Q  134 tatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgtccg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  28508556 tatatcttgattgtatggtggacttgaatgcgattgggaagtggtcatgggtagggatgaatttagcttacatgtatgattatcttaatgattttgtccg 28508457  T
Q  234 tatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaaca 282  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28508456 tctgtgtaacaagacgatggctggatgtgtgacccttcttatggtaaca 28508408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 451 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 28508156 - 28507767
Alignment:
Q  451 cgcatggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcgga-atgaccatgtgtcgggagatggcttacta 549  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| | | || | ||| ||| |||| |||| ||||||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28508156 cgcatgaatggattttggagcatttttcagattcatacccaagtaagtctaacaagatctggaaggcacatatg-ccatgtgccgggagatggcttacta 28508058  T
Q  550 gcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgca 649  Q
    | |||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||     
T  28508057 gaagagggcaaacaacggtgcaccattaccaccgactcctagatcgcatatgggtggatgacgcgaagtggtctacatatcatgatcacagagcggtgcg 28507958  T
Q  650 cccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggcgctttgggta 749  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||  ||||||||    
T  28507957 ccattttcagatt-atttgcacttactcaagatggctgatttgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctaagcgggtgaagaggcagtttgggta 28507859  T
Q  750 tatgctggacatccccagacatccgccagatgtccttgagattcatgcggagatggtggctattgtgtccagagacccccgtctgtggtgct 841  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  28507858 tatgcaggacatccccaaacatccgtcagatgtccctgagattcttgtggatatgatggctaatgtgttcaaagaaccccgtccgtggtgct 28507767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11407837 - 11407571
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||     
T  11407837 agacgagggaggagcggctggagagacatatgaggaggagttggtgtgtgaggagttttcttctttatctcgtcggtagtgcgttattcactaacaaaat 11407738  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
     |||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  11407737 gaacagagacatccacttgatatatcttgattgtatgacgcacttggatgctattgggaagtggtcatggggagggatgaccctagcttacctatatgat 11407638  T
Q  214 catctcgatgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaa 280  Q
     || | ||||||||||| ||| ||   || |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  11407637 tattttgatgattatgttcgtctgcttaacaagacgatggatggttgtgggacccttcttatggtaa 11407571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46527531 - 46527394
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  46527531 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgatgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcag 46527432  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatg 192  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46527431 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatg 46527394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Original strand, 10553603 - 10553751
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||  |    
T  10553603 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgttggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatttatcttgattgtatggctg 10553702  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    ||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  10553703 acttgcaggcgattgggaagtggtaatggggagggatggccttagctta 10553751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 6321529 - 6321315
Alignment:
Q  523 gaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtc 622  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  6321529 gaccatgtgctgggagatggcttactagcatagggcataatgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaagttttc 6321430  T
Q  623 tgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttact 722  Q
    | | |||| |||| | ||||  | ||| || ||||||  |||||  ||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||     
T  6321429 tacttatggtgatcacagagacgagca-ccatttcag-cttattgtcacgtactcgggatggctgatgtgcgagaaggagagggtgtaccgtcatttacc 6321332  T
Q  723 tgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  6321331 tgaacaggtaaagaggc 6321315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 11405832 - 11405499
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || ||||||||||||   ||   ||| |||||   ||||||||||||||| ||||    
T  11405832 ggatgtattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagctggaagctagagaaaccttgtgttacgagatggcttactagtagag 11405733  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  |||||| |||||| ||  || | | |||||||||||||||||| |  ||| ||  ||| | |||| |||| | ||||  |||  ||||||    
T  11405732 ggcatatagatgtgcaacattaccgcttacgc-tagatcgcttagaggtggataatttgaggttttctacttatggtgatcacagagaagtgtgcccttt 11405634  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggcgctttgggtatatgct 755  Q
    |||| ||  | |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||  |||| ||||||   ||||  | ||| |     
T  11405633 tcagcttc-tgtgcacttactcgagatggctgatgtgcgggtaggagagggtgtaccgtcatttacctgagagggtaaagaggaagtttgactttataca 11405535  T
Q  756 ggacatccccagacatccgccagatgtccttgagat 791  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  11405534 gtacatccccagacatccgtcagatatccctgagat 11405499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 41963371 - 41963491
Alignment:
Q  106 aacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatc 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| || |    
T  41963371 aacaaaacgaacagacacatcgacttgatacatcttgattgtatggcggacttgcaggcgattgagaagtggtcatggggagggatggccttagcatacc 41963470  T
Q  206 tgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    |||| ||  |||| |||||||    
T  41963471 tgtacgactatctagatgatt 41963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 535 - 738
Target Start/End: Original strand, 41963780 - 41963983
Alignment:
Q  535 ggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatga 634  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |  |  ||| | |||| |||    
T  41963780 ggagatggcttgctagcagatggcatactgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcagattttctacttatggtga 41963879  T
Q  635 taagagagcggtgcaccctttt-cagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtga 733  Q
    ||| |||| | | |   ||||| ||| || |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |    
T  41963880 taacagagagatacgttctttttcagctt-attgtcacttactcgggatggctgatgtgcaggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaa 41963978  T
Q  734 agagg 738  Q
    |||||    
T  41963979 agagg 41963983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13907883 - 13907811
Alignment:
Q  21 ggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagt 93  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13907883 ggaggagatgctggagagagatatgaggaggcagtggtgtgcgaggagttttcttctatatctcgtcggtagt 13907811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26606
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  26340 agacgagggaggagatgctggagagagatacgagaaggagttgttgtgtgaggagttttcttttatatcttgtcggtagtgcgttgttcactaacaaaac 26439  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
     |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26440 gaacagacacatcgacttggtatatcttgattgtatggtggacctgaatgcaattgggaagtgatcatggggagggatgaccttagcttacctatatgat 26539  T
Q  214 catctcgatgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaa 280  Q
     |||| ||||||||||| ||| || |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26540 tatcttgatgattatgttcgtctgggtgacaagacgatggctggttgtgtgacccttcttatggtaa 26606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Original strand, 26816 - 27087
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | | |||||   || ||||| |||||| ||||  |||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  26816 ggatggatttttgagcatttgtcaggtccgtacccagggaagaaaaacaagagttggaagccggagagaccatgtgcagggagatggattactaacagag 26915  T
Q  556 ggcatacaattgtgc-------accattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgc 648  Q
    |||||||| ||||||       |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||| | ||||   |||    
T  26916 ggcatacagttgtgcagtgtgtaccattaccgcctactccttgatcgcttagaggtgggtgatgtgtggtggtctacatatgatgatcatagagaaatgc 27015  T
Q  649 acccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
     ||||||||||  |||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  27016 gcccttttcag-cttattgtcacttactcgggataacttatgtgcgggaaggaaaaggtgtaccgtcatttac 27087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 280
Target Start/End: Original strand, 20722511 - 20722777
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  20722511 agacgagggaggagatgctggagagagatacgagaaggagttgttgtgtgaggagttttcttttatatcttgtcggtagtgcgttgttcactaacaaaac 20722610  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
     |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  20722611 gaacagacacatcgacttggtatatcttgattgtatggtggacctgaatgcaattgggaagtgatcatggggagggatgaccttagcttacctatatgat 20722710  T
Q  214 catctcgatgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaa 280  Q
     |||| ||||||||||| ||| || |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20722711 tatcttgatgattatgttcgtctgggtgacaagacgatggctggttgtgtgacccttcttatggtaa 20722777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Original strand, 21832854 - 21833118
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||   || ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  21832854 ggatgaattttggagcatttgccaggtccgtactcaaggaagaaaaacaagagttggaagccggaaagaccatgtgcggggagatgacttactaccagag 21832953  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| | |||| | |||| || ||    
T  21832954 ggcatacatttgtgcaccattatcgcgtactcctggatcgcttagaggtggatgaagtgaggtggtctacatatgatgatcacagagagatgcatccatt 21833053  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
    ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  21833054 tcag-cttattgtcacttactcgggatggcttatgtgcgggaagaagagggtgtactgtcatttac 21833118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 29901174 - 29901379
Alignment:
Q  21 ggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaa 120  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| |    
T  29901174 ggaggagatgctggagagagataggaggaggcagtggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgccggtagtgcgttgttcactaacaaaacgaacaga 29901273  T
Q  121 cacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcg 220  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |    
T  29901274 cacatcgacttgatatatcttgattgtatggcggacttgcaggcaattgggaagtgatcaaggggagggatgactttatcttacctgtacgattatctgg 29901373  T
Q  221 atgatt 226  Q
    ||||||    
T  29901374 atgatt 29901379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 4173790 - 4173965
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4173790 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaatagacacatcgacatgatatatcttgattgtatggtgg 4173889  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  4173890 acttgcagacgattgggaagtggtcatggggagggatggccttagcgtacctgtacgactatctggatgattatgt 4173965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 457 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 695487 - 695209
Alignment:
Q  457 gatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagg 556  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| ||| | |||||||   || |||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  695487 gatggattttagagtatttgccaggtctgtacccaaggaagaaaaacaagagctggacgtcggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcaaagg 695388  T
Q  557 gcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcaccctttt 656  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | |||| ||||||||  |||    
T  695387 gcatacagatgtgcatcattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagaggtgcaccaattt 695288  T
Q  657 cagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagag 737  Q
    |||  || | |||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  695287 cag-cttctgtgcacttactcgggatgactgatgtgc-ggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagag 695209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Original strand, 26391014 - 26391296
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || |||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26391014 ggatgaattttggagcatttaccaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagctggaagccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 26391113  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || |||||||||| |||||||||| | | ||  | | | |||| |||| | |||| | | | || ||     
T  26391114 ggcatactgatgtgcaccattaccgcttactacttgatcgcttagtggtggatgacgtcaggttttttacttatggtgatcacagagagatacgccattc 26391213  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  |||||  |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26391214 tcag-cttattgtcacttactcgggatggctagtgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 26391296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 31501887 - 31501605
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||||||||||   ||| |||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31501887 ggatggattttggagcatttgttaggtccttacccaaggaagcctaacccgaggtggaagccagagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 31501788  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||| | | | ||  |||   |||| |||| | ||||  |||||||| ||    
T  31501787 ggcataaagatgtgcaccattaccgcttacgcctggatcgcttggaggtggatgtcgtcatgttttctatttatggtgatcacagagacgtgcacccatt 31501688  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  || | |||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  31501687 tcag-cttctgtgcacttactcgggatgactcatgtgcgggaaggagagggtgtactgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 31501605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31502251 - 31502077
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |  |||||| ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  31502251 tggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggttttgcgttgttcactaacaaaacgaacagatacatcgacttgatatatcttgattgcatggcgg 31502152  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||||||    
T  31502151 acttgcaggcgattgagaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacct-tacgattatctggatgattatgt 31502077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 695856 - 695708
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  695856 tggtgtgtgaggagtttccttttatatctcgttggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcaacttgatatatcttgattgtatggcgg 695757  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  695756 acttgcaggcgattggaaagtggtcatggggagggatgaccttagctta 695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 26390634 - 26390808
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  26390634 tggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatgacgg 26390733  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||  |||| ||  |||| |||||||||||    
T  26390734 acttgcaggcgattgggaagtggtca-ggggagggatggccctagcttacatgtacgactatctagatgattatgt 26390808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Original strand, 20722987 - 20723258
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | | |||||   || ||||| |||||| ||||  |||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  20722987 ggatggatttttgagcatttgtcaggtccgtacccagggaagaaaaacaagagttggaagccggagagaccatgtgcagggagatggattactaacagag 20723086  T
Q  556 ggcatacaattgtgc-------accattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgc 648  Q
    |||||||| ||||||       |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||| | ||||   |||    
T  20723087 ggcatacagttgtgcagtgtgtaccattaccgcctactccttgatcgcttagaggtgggtgatgtgtggtggtctacatatgatgatcatagagaaatgc 20723186  T
Q  649 acccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
     ||||||||||  |||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  20723187 gcccttttcag-cttattgtcacttactcgggataacttatgtgcgggaaggaaaaggtgtaccgtcatttac 20723258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 456 - 731
Target Start/End: Original strand, 29901631 - 29901907
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctgga--agtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcag 553  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||| | ||  ||||  |   |||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  29901631 ggatggattttggagcctttgacaggtccgtacccaaggaagcctaacacgaagtggacaaaaaggagagaccatgtgctgggagatggattactagcag 29901730  T
Q  554 agggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcaccct 653  Q
    | ||||||||  |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||||| |||| | ||||  |||| ||||    
T  29901731 aaggcatacatatgtgcaacattaccgcctacttctggatcgcttagaggtggatgatgtgaggttttctacatatggtgatcacagagaagtgcgccct 29901830  T
Q  654 tttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggt 731  Q
    |||||   || | |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||    
T  29901831 tttca-ccttctgtgcacttactcgggatggctgatgtgcgagaaggagaaggtgtatcgtcatttacctgagcgggt 29901907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 523 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 40613535 - 40613320
Alignment:
Q  523 gaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtc 622  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||  |     
T  40613535 gaccatgtgctgggagatggcttactagcaaagggcataaatatgtgcaccattaccgcttacggctggatcgcttagaggtggatgatgtgaggttttg 40613436  T
Q  623 tgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttact 722  Q
    | | |||| |||| | | ||  |||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  40613435 tacttatggtgatcacatagatgtgcgcccttttcagcttt-tgtgcacttactcgggatggctgatgttcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacg 40613337  T
Q  723 tgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||| || || |||||||    
T  40613336 tgagcgtgtaaagaggc 40613320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 2120603 - 2120323
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || | |   |||| |  |||  |||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  2120603 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacagggagtggacgctggagagaccatgtgctaggagatggcttacaagcaaag 2120504  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    | |||| |  ||||||||||||| ||  || |||||||  ||| |||||||||||||| | ||  ||| | |||| |||| | ||||  |||||||| ||    
T  2120503 gacataaagatgtgcaccattaccgcttacgcctggattccttggaggtggatgacatcaggttttctacttatggtgatcacagagacgtgcacccatt 2120404  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagag 737  Q
     ||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  2120403 ccag-tttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagag 2120323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Original strand, 21832518 - 21832658
Alignment:
Q  140 ttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgtccgtatgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || |||||| ||||  |||||| | | ||| ||      
T  21832518 ttgattgtatggtggacttgtaggcgattgggaagtggtcatgggaagagatgaccttagcttacctatatgattatcttaatgattctattcgtttgaa 21832617  T
Q  240 caataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaa 280  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21832618 taacaagacgatggctggttgtgtgacccttcttacggtaa 21832658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 739
Target Start/End: Original strand, 28652107 - 28652311
Alignment:
Q  534 gggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatg 633  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |  ||||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||||| | | ||  ||| | |||| ||    
T  28652107 gggagatggcttacaagcaaaggacataaagatgtgcaccattaccgcttacgcctggatcgcttggaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtg 28652206  T
Q  634 ataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtga 733  Q
    || | ||||  |||||||| || |||  |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||||| |    
T  28652207 atcacagagacgtgcacccattccag-cttattgtcacttactcgagatggctaatgtgcgggaaggagagggtgttgcgtcatttacctgagcgggtaa 28652305  T
Q  734 agaggc 739  Q
    ||||||    
T  28652306 agaggc 28652311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 456 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 13827063 - 13826682
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||   || |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  13827063 ggatggattttggagcattttctaggttcgtacccaaggaagaaaaacaagagctggaagtcggagagaccatgtgcggggagatggcttgctaccagag 13826964  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  13826963 ggcatacagttgtgcaccattaccgctcacggctggatcgcttagaggtggatgatgtgaggtggtctatatatgatgatcaaagagagatgcacccttt 13826864  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggcgctttgggtatatgct 755  Q
    ||||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||| |||||||| ||| || || ||||||    |||| | ||| |     
T  13826863 tcag-cttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgagaaggagaggatgtaccgtcatttacctgagcgagttaagaggtagcttggctttataca 13826765  T
Q  756 ggacatccccagacatccgccagatgtccttgagattcatgcggagatggtggctattgtgtccagagacccccgtctgtggt 838  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||| |  | ||||||| |||||||||    
T  13826764 ggacatccccagacatccgtcagatgtccctgagatgcctaaggagatgttggctattgtattgatagaccccagtctgtggt 13826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13827539 - 13827275
Alignment:
Q  16 acgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaa 115  Q
    |||| ||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |  |||||| ||||||||| |    
T  13827539 acgagggaggaaatgctggagagaaataggaggaggagttggtgtgtgaggagttttcttttatatctcgttggtagtgcgttgttcactaacaaaacga 13827440  T
Q  116 acaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatca 215  Q
    ||| ||| || ||  || |||||||||||||||||   ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  13827439 acagacaaattgacttggtatatcttgattgtatgacagacttgaatgctatttggaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacctatatgatta 13827340  T
Q  216 tctcgatgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggtaa 280  Q
    |||  |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13827339 tctttatgattatgttcgtctgtgtaacaagacgatagctggttgtgtgacccttcttatggtaa 13827275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47868101 - 47867926
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47868101 tggtgtgtggagagttttcttctatatctcgtcggtagtgcgctgttcactaacaaaacgaacaaacacatcaacttgatatatcttgattgtatggcgg 47868002  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  47868001 acttgcaggtgattgtgaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacctgtacgattatctggatgattatgt 47867926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 38110125 - 38110300
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || | ||||||| ||||||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||    
T  38110125 tggtgtgtgaggagtttccttctatatttcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaatgaacagacacatcaacttgatatatcttgattgtatgacgg 38110224  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  38110225 acttgtaggcgattgggaagtggtcatgtggagggatgaccttagcttacctgtacgactatctggatgattatgt 38110300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 48163801 - 48163976
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  48163801 tggtgtatgaggagttttcttctatatctcgttggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 48163900  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||    
T  48163901 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatggccttagcgtacctgtacgactatctggatgattatgt 48163976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 18907162 - 18907339
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| | |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||    
T  18907162 agacgagggaggagctgcaggagagagttaggaggagacagtggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaac 18907261  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggat 191  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18907262 gaacatacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcggacttgcaggcgattcggaagtggtcatggggagggat 18907339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Original strand, 18907567 - 18907853
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   || |||   |||| | ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  18907567 ggatggattttggagcattttccaggtccatacccaaggaagaaaaacaaggagtggacgccggaaagaccatgtgctaggagatggcttactagtagag 18907666  T
Q  556 ggcatacaat----tgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacc 651  Q
    |||||| |      ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| | || | ||||  |||||||    
T  18907667 ggcatatatgctgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtcatcacagagacgtgcacc 18907766  T
Q  652 cttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    | |||||| || |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18907767 catttcagctt-attgtcacttactcgggatggctgatgtgcaggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 18907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 456 - 784
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8886
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||   || | |||||||| | ||||  | |||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  8559 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaagaaagaaaaacaggagctggacgccggagaggccatgtgctgggagatggcttacttccagag 8658  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | | || ||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | ||   |||| | |||| ||||| ||| ||    
T  8659 ggcatacagatgtgcaccattaccgcttattgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctacctacagtgatcacagagaggtgcgcccatt 8758  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggcgctttgggtatatgct 755  Q
    ||||  || | ||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||   |||  ||| | |     
T  8759 tcag-cttctgtgcacttactcggaatgggtgatgtgcaggaaggatagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggcagcttgtctatgtaca 8857  T
Q  756 ggacatccccagacatccgccagatgtcc 784  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8858 ggacattcccagacatctgccagatgtcc 8886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 452 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 181071 - 180785
Alignment:
Q  452 gcatggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagc 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||   || |||   |||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  181071 gcatggatgaattttggagcatttgtcaggtccgtacccaaggaagaaaaacaaggagtggacgtcggagagaccatgtgctgggagatggcttacatgc 180972  T
Q  552 agagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacc 651  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||| | |  |  ||| | |||| |||||| |||| | | | ||    
T  180971 aaagggcataaaaatgtgcaccattaccgcttacggcttgatcgcttagaggtggatgacgtcagattttctacttatggtgataacagagggatacgcc 180872  T
Q  652 cttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||||||  |||||  |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  180871 cttttcag-cttattgtcacttactcgggatgactgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 180785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 181448 - 181277
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  181448 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaatgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatgacgg 181349  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||  |||| |||||||    
T  181348 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggattgccttagcttacctgtacgactatctggatgatt 181277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 45033663 - 45033834
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  || ||||| |||||||||||| ||    
T  45033663 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttggtatattttgattgtatggcgg 45033762  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| |   |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| |||||||    
T  45033763 acttgcagacgattgggaagtggttatagggagggatgaccttagcgtacctgtacgactatctggatgatt 45033834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18943878 - 18943707
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    |||||| | ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  18943878 tggtgtgtgaggagtttgcttctatatctcgtcgattgtgtgttgttcacttacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 18943779  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||  |||| |||||||    
T  18943778 acttgcaggcgattgggatgtggtcatggggagggatggccttagcgtacctgtacgactatctggatgatt 18943707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 456 - 611
Target Start/End: Original strand, 38110512 - 38110667
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   |||| ||| |||||| || |  |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  38110512 ggatgaattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaataggagttggaagccgtagagaccatgtgctgggagatggctaactagaagag 38110611  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgac 611  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  38110612 ggcatacaaatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggttgatgac 38110667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 209
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8328
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  8174 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgatgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgcatggctg 8273  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgta 209  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||||    
T  8274 acttgcaggcgattgggaagttgtcaaggggagggatggttttagcttacctgta 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 534 - 737
Target Start/End: Original strand, 55150286 - 55150488
Alignment:
Q  534 gggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatg 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||  | | || ||||||||| ||||||||||| | | ||  ||| | |||| ||    
T  55150286 gggagatggcttactagcagagggcatactgatgtgcaccattaccgcttaatgcttgatcgcttaaaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtg 55150385  T
Q  634 ataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtga 733  Q
    || | ||||   ||||||| ||||||  || | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||| ||| ||||| |    
T  55150386 atcatagagacatgcacccatttcag-cttctgtgcacttactcgggatggctcatgtgcgggaaggagagggtgtatcgttatttacatgagcgggtaa 55150484  T
Q  734 agag 737  Q
    ||||    
T  55150485 agag 55150488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 669 - 739
Target Start/End: Original strand, 52560671 - 52560741
Alignment:
Q  669 cacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  52560671 cacttactcgggatggctgatgtgcaggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 52560741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 739
Target Start/End: Original strand, 45034111 - 45034326
Alignment:
Q  523 gaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtc 622  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |  ||||||||||||| ||  ||  || ||||||||| ||||||||||| | | ||  ||    
T  45034111 gaccgtgtgttgggagatagcttacaagcaaaggacataaagatgtgcaccattaccgctcacgacttgatcgcttaaaggtggatgacgtcaggttttc 45034210  T
Q  623 tgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttact 722  Q
    | | |||| |||| | |||| | | |||||||||||| || |||  |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||     
T  45034211 tacttatggtgatcacagagagatacacccttttcagctt-attgtcacttactcgggatgactgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtaatttacc 45034309  T
Q  723 tgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  45034310 tgagcgggtaaagaggc 45034326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23714704 - 23714446
Alignment:
Q  21 ggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaa 120  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||| |||| |    
T  23714704 ggaggagatgctggagagagatatgaggaggagttggtgtgtgaggatttttcttctatatctcgtcggtagtgcgttgttcactaacaaaacgaacaga 23714605  T
Q  121 cacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcg 220  Q
    |||||| |  | ||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||   |||| |    
T  23714604 cacatcaacttaatatatcttgactgtatggcagacttgcatgcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacctttatgggtatcttg 23714505  T
Q  221 atgattatgtccgtatgtgcaataagacgatggctggatgtgtgacgcttcttatggta 279  Q
    |||||||||| ||| ||   || |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  23714504 atgattatgttcgtctgaataacaagatgatggctgattgtgtgacccttcttatggta 23714446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 534 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 2870871 - 2870571
Alignment:
Q  534 gggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatg 633  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2870871 gggagatggcttactaccagagggcatatagttgtgcaccattaccgctcacggctggatcgcttagaggtgtatgacatgaagtggtctacatatgatg 2870772  T
Q  634 ataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcattta-cttgaacgggtg 732  Q
    || |  ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||| ||  || |||||| || ||| | || ||||||| ||||   |  |     
T  2870771 atcaccgagcggtgcacccttttcag-cttattaacacttactcgggatggctgatacgcgggaagg-gatggtgtgccgtcatttaccttg---gctta 2870677  T
Q  733 aagaggcgctttgggtatatgctggacatccccagacatccgccagatgtccttgagattcatgcggagatggtggctattgtgtccagagacccccgtc 832  Q
    ||||| |  ||||||| | | | ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |  ||||||| |||||| |||||  | |||||||||||    
T  2870676 aagagacagtttgggtttgtacaggacatccccatacatccgttagatgtccctgagattcctaaggagatgctggctactgtgttgaaagacccccgtc 2870577  T
Q  833 tgtggt 838  Q
    ||||||    
T  2870576 tgtggt 2870571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44117035 - 44116864
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| | || ||    
T  44117035 tggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaacatacacatcgacttgatatatcttgattgcacggcgg 44116936  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  44116935 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacttgtacgattatctggatgatt 44116864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Original strand, 41268851 - 41268984
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  41268851 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 41268950  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagg 188  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  41268951 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagg 41268984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 44116669 - 44116387
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||   | | |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44116669 ggatggattttggagcatttgccaggtccttacccaaggaagccaaacctggggtggaagccggagagaccatgtgttgggagatggcttactagcagag 44116570  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||  |  || ||||||||| |||||||||||| | ||||  ||| | |||| |||| | | ||  ||||| || ||    
T  44116569 ggcataaagatgtgcaccattaccgcttatgccaggatcgcttggaggtggatgacgtcaagttttctacttatggtgatcacatagacgtgcatccatt 44116470  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  || | |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  44116469 tcag-cttctgtgcacttactcgggatggctcatgttcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 44116387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 510 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 23714197 - 23713989
Alignment:
Q  510 tggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatg 609  Q
    |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23714197 tggaagccggacagaccatgtgcggggagatggcttactagcagagggcataaagttgtgcaccattaccgcctactcttggatcgcttagaggtggatg 23714098  T
Q  610 acatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggttt 709  Q
    |  |||  |||||| |||||||| || | |||  | | |  | |||||||  |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  23714097 atgtgagatggtctacatatgataatcacaga--gatacgtcattttcag-cttattgtcacttactcgggatgacttatgtgcgggaaggagagggtgt 23714001  T
Q  710 accatcatttac 721  Q
    ||| || |||||    
T  23714000 accgtcgtttac 23713989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42096898 - 42096727
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |     
T  42096898 tggtgtgtgaggggtttccttctatatctcgtcggttgcgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcga 42096799  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||    
T  42096798 acttgcaggcgattgggaagtgatcatggagagggatgaccttagcttacctgtacgactatctggatgatt 42096727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 42096520 - 42096363
Alignment:
Q  453 catggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagca 552  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||   || |||||||||||| | ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  42096520 catggatggattttgaagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagctggaagccagagagaccatgtgttgggaaatgacttactagca 42096421  T
Q  553 gagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatga 610  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  ||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  42096420 gagggcatacagatatgcaccattatcgcttactgcttgatcgcttagaggtggatga 42096363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20478499 - 20478345
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  20478499 tggtatgtcaggagtttccttctatatctcgttggtggtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggctg 20478400  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgta 209  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||    
T  20478399 acttgcaggcgattgggaagtggtcttggggagggatggccttagcttacctgta 20478345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20478118 - 20477996
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||   || |||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20478118 ggatggattttggagtatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagctggacgccggagagaccatgtgttgggagatggcttactagcagag 20478019  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattac 578  Q
    | |||||   |||||||||||||    
T  20478018 gccatactgatgtgcaccattac 20477996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 8317792 - 8317637
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||   |||| |   |||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  8317792 ggatggattttggagcatttgccaggtctgtacccaaggaagaaaaatagggagtggacgccggagagaccatgtgctgggagatggcttacaagcaaag 8317693  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgac 611  Q
    | |||| |  ||||||||||||| ||  || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  8317692 gacataaagatgtgcaccattaccgcttacgcctggatcacttggaggtggatgac 8317637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42056452 - 42056307
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  42056452 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtacgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 42056353  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagc 200  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42056352 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagc 42056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Original strand, 31386900 - 31387182
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31386900 ggatggattttggagcatttgtcaggtccttacccaaggaagcctaacccgaggtggaagccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 31386999  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  ||| ||||||||| ||  ||   |||||||||| |||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  |||||||| ||    
T  31387000 ggcataaagatgtccaccattaccgcttacgtatggatcgcttggaggtggatgacgttaggttttctacttatggtgatcacagagacgtgcacccatt 31387099  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| || || |||||||    
T  31387100 tcag-cttatgtgcacttactcgggatggctcatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgagtaaagaggc 31387182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Original strand, 50914250 - 50914532
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||   || ||||| |||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50914250 ggatgaattttggagcatttgccaggtccatacccaaggaagaaaaacaagagttggacgccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 50914349  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  |||||||| ||    
T  50914350 ggcatactgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagacgtgcacccatt 50914449  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  || | ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  50914450 tcag-cttctgtgcacttacccgggatggctcatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagaggc 50914532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46193427 - 46193258
Alignment:
Q  57 gtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggac 156  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  46193427 gtgtgtgaggagtttccttctatatcttgtcggttgtgcgctgttaactaacaaatcgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggctgac 46193328  T
Q  157 ttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  46193327 ttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatggccttagcttacctgtacgattatctggatgatt 46193258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 31386510 - 31386726
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |  ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||    
T  31386510 agacgagggaggagctgcaggagagaggcaggaggagggtgtggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggtcgtgcgctgttcactaacaaaac 31386609  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
     |||| ||||||| |  || ||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  31386610 gaacagacacatccacttgttatatcttgattgcatggcgaacttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttaacttacctgtacgat 31386709  T
Q  214 catctcgatgattatgt 230  Q
     |||| |||||||||||    
T  31386710 tatctggatgattatgt 31386726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Original strand, 18241944 - 18242092
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  18241944 tggtgtgtaaagagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggctg 18242043  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  18242044 acttgcaggagattgggaagtggtcatggggagggatggccttagctta 18242092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 209
Target Start/End: Original strand, 50913869 - 50914023
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  50913869 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgttggttgtgcgatgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggctg 50913968  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgta 209  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50913969 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacctgta 50914023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4913092 - 4912880
Alignment:
Q  14 agacgacggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaac 113  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |  ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||    
T  4913092 agacgagggaggagctgcaggagagaggcaggaggagggtgtggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaac 4912993  T
Q  114 aaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgat 213  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||  |||| |||    
T  4912992 gaacaaacacatcgacttaatatatcttgattgcatggcggacttgtaggcggttgggaagtggtcatgggaagggatgcccttagtttacatgtacgat 4912893  T
Q  214 catctcgatgatt 226  Q
     |||| |||||||    
T  4912892 tatctggatgatt 4912880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27107135 - 27106968
Alignment:
Q  58 tgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggact 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||    |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  27107135 tgtgtgaggagtttccttctatatctcgttggttgtgtgttgttcactaacaaaacaaacagacacatcgacttgatatatcttgattgcatggcggact 27107036  T
Q  158 tgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  27107035 tgcaggcgattggcaagtggtcatg-ggagggatgaccttatcttacctgttcgattatctggatgatt 27106968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 737
Target Start/End: Original strand, 18242393 - 18242605
Alignment:
Q  524 accatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtct 623  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||   |  ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||    
T  18242393 accatgtgctgggagatggcttactagtagagggcatactgatgtgcaccattaacacttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaagttttct 18242492  T
Q  624 gcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttactt 723  Q
     | |||| |||| | ||||  |||||||| ||||||  |||| |||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |    
T  18242493 acttatggtgatcacagagacgtgcacccatttcag-cttatgtgcacttacttgggatgactcatgtgcgggaaggagagggtgtactgtcatttacct 18242591  T
Q  724 gaacgggtgaagag 737  Q
    || ||||| |||||    
T  18242592 gagcgggtaaagag 18242605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 42464373 - 42464091
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||   | |  ||||| ||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  42464373 ggatgaattttggagcatttgccaggtccttacccaagggagcctaacccggggcggaagccggagagaccatgtgctgggagatgacttactagcagag 42464274  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  |||||||||| || ||  ||   |||||||||| |||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  ||||| || ||    
T  42464273 ggcataaagatgtgcaccatcaccgcttacgtatggatcgcttggaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcatagagacgtgcatccatt 42464174  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    |||| ||  | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||  |||| |||||||    
T  42464173 tcagcttc-tgtgcacttactcgggatggctcatgtgcgggaaggagatggtgtaccgtcatttacctgagtgggtaaagaggc 42464091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 452 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27106779 - 27106495
Alignment:
Q  452 gcatggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagc 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||   | | |||||| ||||  |||||| ||  |  |||||||||||||||    
T  27106779 gcatggatgaattttggagcatttgtcaggtccttacccaaggaagtctaacccggggtggaagccggagagaccatctgctgaaagatggcttactagc 27106680  T
Q  552 agagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacc 651  Q
    ||||| |||| |  | ||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  ||||| |    
T  27106679 agaggacataaagatatgcaccattaccgcttacgcatggatcgcttggaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagacgtgcatc 27106580  T
Q  652 cttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagag 737  Q
    | |||||| ||  | ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  27106579 catttcagcttc-tgtgcacgtactcgggatgactcatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgaacgggtaaagag 27106495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4912686 - 4912531
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||   | | |||||| ||||   ||||||||  ||||||||||||||||  ||||    
T  4912686 ggatggattttggagcatttgccaggtccttacccaaggaagcctaacccggggtggaagccggagataccatgtgctgggagatggcttactattagag 4912587  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgac 611  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  4912586 ggcataaagatgtgcaccattaccgcttacgcctagatcgcttggaggtgggtgac 4912531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 15292128 - 15292066
Alignment:
Q  669 cacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggt 731  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  15292128 cacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggt 15292066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 667 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 4912476 - 4912406
Alignment:
Q  667 tgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagag 737  Q
    |||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  4912476 tgcacttactcaggatgactcatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggtaaagag 4912406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 8645416 - 8645542
Alignment:
Q  34 gagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtga 133  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||| |||||||||||  ||||||| || ||  ||||  |||||| ||| || ||  ||||||||| ||| || |    
T  8645416 gagagagataggaggagggagtggtgtgttaggagttttctgatatatctcgttgggtgtacgttgttcactaataagacggacaaacacaccgaggtaa 8645515  T
Q  134 tatatcttgattgtatggtggacttga 160  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  8645516 taaatcttgagtgtatggtggacttga 8645542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9040024 - 9039853
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  9040024 tggtgtgtgaggagttttcttttatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 9039925  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||  |||| |||||||    
T  9039924 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatggccttagcgtacctgtacgactatctagatgatt 9039853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Original strand, 7252525 - 7252673
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||  |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  7252525 tggtgtgtgagaagtttccttctatatctcgtcggttgtgcactgtttactaacaaaatgaacagatacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 7252624  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7252625 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagctta 7252673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37981393 - 37981245
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  37981393 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgttggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggctg 37981294  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37981293 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagctta 37981245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Original strand, 19875615 - 19875748
Alignment:
Q  58 tgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggact 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19875615 tgtgtgatgagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatgg-ggact 19875713  T
Q  158 tgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatg 192  Q
    || | |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19875714 tgcaggcaattgggaagtggtcatggggagggatg 19875748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 458 - 732
Target Start/End: Original strand, 7252909 - 7253182
Alignment:
Q  458 atggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagaggg 557  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||   || ||||| |||||| ||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7252909 atggattttggagcatttggcaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagttggaagccggagagaccgtgtgttgtgagatggcttactagcagaggg 7253008  T
Q  558 catacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttc 657  Q
    || ||   |||||||||||||  |  ||| || ||||||||||||||||||||| | |  |  ||| | |||| |||| | |||| | | | || ||||     
T  7253009 cacactgatgtgcaccattaccacttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcagattttctacttatggtgatcacagagagatacgccattttt 7253108  T
Q  658 agatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtg 732  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||    
T  7253109 ag-cttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagggggtgtaccgtcatttacctgagcgggtg 7253182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 456 - 737
Target Start/End: Original strand, 23066622 - 23066902
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    | |||   |||| | ||||  |||||||||  | ||||||||||||  ||| ||    
T  23066622 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaacacaaggagtggacgccggagagaccatgtgctgcgagatggcttacatgcaaag 23066721  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||| |  |||| |||||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | |||| | | ||||||||    
T  23066722 ggcataaagatgtgtaccattaccgctcacggcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagagatacacccttt 23066821  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagag 737  Q
    | | | |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  23066822 taa-acttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccatcatttacctgagcgggtaaagag 23066902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 721
Target Start/End: Original strand, 19876058 - 19876255
Alignment:
Q  523 gaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtc 622  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||| | | | ||  |     
T  19876058 gaccatgtgctgggagatggcttactagcagagggcatattgatgtgcaccattaccgcgtactgcttgatcgcttagaggtggatgtcgtcaggttttt 19876157  T
Q  623 tgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
    | | |||| |||| | |||| | | | ||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19876158 tacttatggtgatcacagagagatacgcccttttca-acttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttac 19876255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 37980944 - 37980730
Alignment:
Q  523 gaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtc 622  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||| |  |||||| |||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||||| | | ||  ||    
T  37980944 gaccatgtgctgggagatggcttacaagcaaaggacataaagatgtgcatcattaccgcttacgtctggatcgctttgaggtggatgacgtcaggttttc 37980845  T
Q  623 tgcatatgatgataagagagcggtgcacccttttcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttact 722  Q
    | | |||| |||| | ||||  |||||||| || ||| || |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||     
T  37980844 tacttatggtgatcacagagacgtgcacccattccagctt-attgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacc 37980746  T
Q  723 tgaacgggtgaagagg 738  Q
    ||| || || ||||||    
T  37980745 tgagcgagtaaagagg 37980730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39389921 - 39389750
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  39389921 tggtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtgcgttgttcactaacaaaacgaacatacacatcgacttgatatatcttgattgtatcgcgg 39389822  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  |||| |||||||    
T  39389821 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggagggatggccttagcgtatctgtacgactatctggatgatt 39389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 16358181 - 16357917
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || | ||  |||||| | ||  |||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  16358181 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacacgaagtggaagcctgacagaccatgtgctaggagatggcttactagaagag 16358082  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| | ||||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  16358081 ggcatacagatgtgcagcattaccgcttacggctggatcgcttagaggtggatgatgtgaggttttctacttatgatgatcaaagagaagtgcgcccttt 16357982  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
    ||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  16357981 tcag-cttatgtgcacttaatcgggatggctgatgtgcgggaaggagaaggtgtaccgtcatttac 16357917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12025991 - 12025823
Alignment:
Q  58 tgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggact 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | | || | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12025991 tgtgtgaggagtttccttctatatctcgtagattgtgcgctgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcggact 12025892  T
Q  158 tgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    || | | |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||  |||| |||||||    
T  12025891 tgcaggcgattggaaagtggtcatggggagggatggccttagcttacctgtacgactatctggatgatt 12025823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12025634 - 12025352
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||   || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12025634 ggatggattttggagcctttgctaggtccgtacccaaggaagaaaaacaagagctggaagccggagagaccatgtgttgggagatggattactagcagag 12025535  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||| ||| ||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | |||| | | | ||||||    
T  12025534 ggcatactgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttaaagggggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagagatacgcccttt 12025435  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||| | |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| || | |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  12025434 tca-acttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaagaagagggtgtatcgtcatttacctgagcggataaagaggc 12025352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 39389541 - 39389259
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||   || |||   |||| | ||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  39389541 ggatggattttggagcatttgtcaggtccgtacccaaggaagaaaaacaaggagtggacgccggagagatcatgtgctgggagatggcttactagtaaag 39389442  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | | ||  |||   |||| |||| | |||| | | ||||||||    
T  39389441 ggcatactgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgcttagaggtggatgacgtcaggttttctagttatggtgatcacagagagatacacccttt 39389342  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  |||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  39389341 tcag-cttattgtcacttactcgggatggctgatgtgcgggaaggagaggatgtagcgtcatttacctgaacaggtaaagaggc 39389259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11868548 - 11868366
Alignment:
Q  21 ggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaa 120  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| | |||   |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| || |||| |    
T  11868548 ggaggagttgctaaagagagatagggggaggcagtggtgtgttaggagttttatcctatatctcgtcgggagtacgctgttcgctaacaagacgaacata 11868449  T
Q  121 cacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagctta 203  Q
    |||||| |  | |||||||| || |||||||||||| |||||  | | |||| |||||| || || || ||||| ||||||||    
T  11868448 cacatcaacatcatatatctggagtgtatggtggacctgaatacggtggggaggtggtcgtggggtggtatgacattagctta 11868366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 54603252 - 54602989
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || |||   |||| | ||||  |||||| ||  | |||||| ||||||||||||     
T  54603252 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacaaggagtggacgccggagagaccatatgctgagagatgacttactagcaga- 54603154  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    | |||||   ||||||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||||  | | ||  ||| |||||| |||| | ||||  |||||||| ||    
T  54603153 gacatactgatgtgcaccattaccggttactgcttgatcgcttagaggtggatgatgtcaggttttctacatatggtgatcacagagacgtgcacccatt 54603054  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
    ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| || |||||    
T  54603053 tcag-cttattgtgatttactcgggatggctgatgtgcgggaagaagagggtgtaccgtcgtttac 54602989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0850 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0850
Description:

Target: scaffold0850; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 1175 - 1346
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||| |  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  1175 tggtgtgtgaggagtttccttctatatctcgtcggttgtacgatgttcactaacaagaagaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggcgg 1274  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||| |||||||    
T  1275 acttgcaggcaattgggaagtggtcatggggagggatgaccttagcttacatgtacgattatctggatgatt 1346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0850; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 4820 - 4936
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4820 ggatggattttggagcattttccaggtccgtacccaaggaagaaaaataggagctggaagcctgagagaccatgtgctgggagatggcttactagaagag 4919  T
Q  556 ggcatacaattgtgcac 572  Q
    ||||||||  |||||||    
T  4920 ggcatacagatgtgcac 4936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 23058458 - 23058619
Alignment:
Q  21 ggaggagctgctagagagggataggagaaggagttggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaa 120  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||  |||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |    
T  23058458 ggaggagatgttagagagagataggaagaggcagtggtgtgtgaggtgttttcttctatatctcgtcggtagtacgttgttcactaacaaaacgaacaga 23058557  T
Q  121 cacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggacttgaatgtgattgggaagtggtcatg 182  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  23058558 cacatcgacttgatatatcttgattgtatggcggacttgcaggcgattgagaagtggtcatg 23058619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 739
Target Start/End: Original strand, 5619690 - 5619972
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||| ||   |||||||||||||||| ||||    
T  5619690 ggatggattttggagcatttatcaggtccgtacccaaggaagacaaacaagagctggaagccggagagaccatatgcttggagatggcttactagtagag 5619789  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | |||| | | || |||||    
T  5619790 ggcatactgatgtgcaccattaccgcttactgcttgatcgtttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcacagagagatacatccttt 5619889  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggtgaagaggc 739  Q
    ||||  |||||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||  |||| |||||||    
T  5619890 tcag-cttattgtcacttactcggaatggctgatgtgcgggaaggagagggtgtaccgtcatttacctgagtgggtaaagaggc 5619972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Original strand, 5619312 - 5619481
Alignment:
Q  57 gtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtggac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  | |    
T  5619312 gtgtgtgaggagttttcttctatatctcgtcggttgtacgctgttcactaacaaaatgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgtatggccggc 5619411  T
Q  157 ttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgatt 226  Q
    ||| |   ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||  ||||||||||||    
T  5619412 ttgcagacgattgagaagtggtcatggggagggatgaccttagtgtacctgtacgactatctcgatgatt 5619481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 461 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 33523059 - 33522909
Alignment:
Q  461 gattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagagggcat 560  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||   ||| |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33523059 gatttttgagcatttgccaggtttgtacccaaggaagcctaacccgaggtggaagccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagagggcat 33522960  T
Q  561 acaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgac 611  Q
    | |  |||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33522959 aaatatgtgcaccgttactgcttacggctggatcgcttagaggtggatgac 33522909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 667 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19269295 - 19269231
Alignment:
Q  667 tgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttacttgaacgggt 731  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  19269295 tgcacttactcgggatggatgatgtgcaggaatgagagggtgtaccgtcatttacctgagcgggt 19269231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 456 - 721
Target Start/End: Original strand, 22557 - 22821
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   || | ||  |||||| | ||  |||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  22557 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaaggaagaaaaacacgaagtggaagcctgacagaccatgtgctaggagatggcttactagaagag 22656  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| | ||||||||| | ||||  |||| ||||||    
T  22657 ggcatacagatgtgcagcattaccgcttacggctggatcgcttagaggtggatgatgtgaggttttctacttatgatgatcaaagagaagtgcgcccttt 22756  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagagggtttaccatcatttac 721  Q
    ||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  22757 tcag-cttatgtgcacttaatcgggatggctgatgtgcgggaaggagaaggtgtaccgtcatttac 22821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19326 - 19180
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  19326 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgatgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgcatggcgg 19227  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagct 201  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  19226 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggaggtatggccttagct 19180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 18946 - 18699
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||| | |||||||   || |||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18946 ggatggattttggagtatttgcaaggtcggtacccaaggaagaaaaacaagagctggacgccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 18847  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||  ||  ||| || |||| |||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  ||||| || ||    
T  18846 ggcatacttatgtgcaccattatcgcttactgcttgatctcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcatagagacgtgcatccatt 18747  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagag 704  Q
    ||||  || | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  18746 tcag-cttctgtgcacttactcgggatggctaatgtgcgggaaggagag 18699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 53518 - 53664
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  53518 tggtgtgtcaggagtttccttctatatctcgtcggttgtgcgatgttcactaacaaaacgaacagacacatcgacttgatatatcttgattgcatggcgg 53617  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagct 201  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  53618 acttgcaggcgattgggaagtggtcatggggaggtatggccttagct 53664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 704
Target Start/End: Original strand, 53898 - 54145
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||| | |||||||   || |||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53898 ggatggattttggagtatttgcaaggtcggtacccaaggaagaaaaacaagagctggacgccggagagaccatgtgctgggagatggcttactagcagag 53997  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgacatgaagtggtctgcatatgatgataagagagcggtgcacccttt 655  Q
    |||||||   ||||||||||||  ||  ||| || |||| |||||||||||||||| | | ||  ||| | |||| |||| | ||||  ||||| || ||    
T  53998 ggcatacttatgtgcaccattatcgcttactgcttgatctcttagaggtggatgacgtcaggttttctacttatggtgatcatagagacgtgcatccatt 54097  T
Q  656 tcagatttatttgcacttactcgcgatggcttatgtgcaggaaggagag 704  Q
    ||||  || | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  54098 tcag-cttctgtgcacttactcgggatggctaatgtgcgggaaggagag 54145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1868 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1868
Description:

Target: scaffold1868; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 747 - 572
Alignment:
Q  55 tggtgtgtgaggagttttcttctatatcttgtcggtagtacactgttcattaacaaaacaaacaaacacatcgatgtgatatatcttgattgtatggtgg 154  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||| || | |||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||    
T  747 tggtgtgttaggagattccttctatatctcgtcggttgtgcgctgttcactaacaaaacgaatagacacgtcgacttgatatatcttgattgcatggcgg 648  T
Q  155 acttgaatgtgattgggaagtggtcatgaggagggatgactttagcttatctgtatgatcatctcgatgattatgt 230  Q
    ||||  | | |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||  | |||||| |||| |||||||||||    
T  647 acttacaggcgattgggaagtggtcatggggaggtatggccttagcttacttttatgattatctggatgattatgt 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1868; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 456 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 377 - 222
Alignment:
Q  456 ggatggattttggagcattttccaggtccgtatctaaggaagcctaataagagctggaagtcggaatgaccatgtgtcgggagatggcttactagcagag 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||   || |||||||||| ||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  377 ggatggattttggagcatttgccaggtccgtacccaatgaagaaaaacaagagctggacgtcggagagaccacgtgctgggagatggcttactagcaggg 278  T
Q  556 ggcatacaattgtgcaccattactgccgactcctggatcgcttagaggtggatgac 611  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||  ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  277 ggcatattgatgtgcaccattaccgcttactgcttgattgcttagaggtggatgac 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University