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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF12598_low_13 (Length: 542)
Name: NF12598_low_13
Description: NF12598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF12598_low_13 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 526
Target Start/End: Original strand, 33520417 - 33520946
Alignment:
| Q |
1 |
gcaggcatgacaatgaatgagttactacatgatttcaaacggatagagtatcataaagcttaccttgcagctttgcttagagccatgaggtgagtgatga |
100 |
Q |
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| T |
33520417 |
gcaggcatgacaatgaatgatttactacatgatttcaaacggatagagtatcataaagcttaccttgcagctttgcttagagccatgaggtgagtgatga |
33520516 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
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| T |
33520517 |
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33520616 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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| T |
33520617 |
gccgatgtaagaggatacatggtatggtcattgtttgacaactttgaatggaatagtggatatgataaaaaatttggactttattatgtggatagacaga |
33520716 |
T |
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| Q |
301 |
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400 |
Q |
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| T |
33520717 |
cacttgaacggattcctaaactttcagttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagaagtatag |
33520816 |
T |
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| Q |
401 |
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496 |
Q |
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| T |
33520817 |
aagcaaatatgtaacaactgctgttgtctaagttattatttgaaaatgatcatgtaattcattctcaatattaattgataattgttaacaacatactatt |
33520916 |
T |
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| Q |
497 |
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526 |
Q |
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| T |
33520917 |
tattttattaagggaagtttatgtgaattt |
33520946 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 33495633 - 33495136
Alignment:
| Q |
5 |
gcatgacaatgaatgagttactacatgatttcaaacggatagagtatcataaagcttaccttgcagctttgcttagagccatgaggtgagtgatgatgaa |
104 |
Q |
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| T |
33495633 |
gcatgacaatgcatgatttactacatgatttcaaacggatagagtatcataaagcttaccttgcagctttgcttagagccataaggtgagtgatgatgaa |
33495534 |
T |
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| Q |
105 |
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204 |
Q |
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| T |
33495533 |
gacaaatatatgagtagcaaccttgttttttatgaatgtttttagttatagtttgtctgttgactgagactaaatttgattatgtgcagaaaaggtgcag |
33495434 |
T |
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| Q |
205 |
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304 |
Q |
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| T |
33495433 |
atgtaagaggatatatggtatggtcgttgtttgacaactttgaatggaatagtggatataatgtaagatttggattatattatgtggatagacagacact |
33495334 |
T |
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| Q |
305 |
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404 |
Q |
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| T |
33495333 |
tgaacgaattcctaaactttcagttgagtggttttctagtttcctcaacaatactagtgatgataccaacatagaagacttgagcaagcaatatagaagc |
33495234 |
T |
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| Q |
405 |
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499 |
Q |
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| T |
33495233 |
aaatatgtgacagcaactgctgttgtttaag---ttatttaaaactgatcatataatgaattgtcaatatcttgacaattgttaacaacatgctatttat |
33495137 |
T |
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